JP7541534B2 - 改善された競合的リガンド結合アッセイ - Google Patents
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Description
本出願は、2019年5月13日出願の米国仮特許出願第62/846,872号および2019年6月11日出願の米国仮特許出願第62/859,914号の利益および優先権を主張するものであり、これらの両方は、参照によりそれらの全体が組み込まれる。
請求された発明を説明する文脈における(特に、特許請求の範囲の文脈における)「a」、「an」、「the」という用語、および同様の指示対象の使用は、本明細書で別段の指示がない限り、または文脈によって明らかに矛盾しない限り、単数形および複数形の両方を網羅するように解釈されるべきである。
試料中の抗薬物抗体(ADA)の検出、および任意選択で定量化のための改善されたアッセイが提供される。開示されるアッセイには、薬物捕捉アッセイフォーマットおよび薬物標的捕捉アッセイフォーマットが含まれる。生物学的治療薬の患者への投与に応答して生成されるADAの同定は、生物学的治療薬の製造および販売に関連する規制要件を満たし、かつ対象におけるADAの生成に起因して生じ得る潜在的な投与問題を同定するために重要である。
いくつかの実施形態において、薬物は、タンパク質薬物である。開示されたアッセイに好適なタンパク質薬物としては、抗体およびその抗原結合断片(抗体タンパク質薬物とも称される)が挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態において、抗体タンパク質薬物は、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、二重特異性抗体、三重特異性抗体、またはその抗原結合断片であり得る。代表的な抗体断片としては、Fab断片、F(ab’)2断片、単一特異性F(ab’)2断片、二重特異性F(ab’)2、三重特異性F(ab’)2、一価抗体、scFv断片、ダイアボディ、二重特異性ダイアボディ、三重特異性ダイアボディ、scFv-Fc、ミニボディ、IgNAR、v-NAR、hcIgG、またはvhHが挙げられるが、これらに限定されない。
図7Aは、代表的な薬物捕捉アッセイを示す。アッセイ100は、薬物の投与の前もしくは後、または薬物による処置中に試料が対象から得られるステップ101から開始する。この実施例では、薬物は、抗体である。ステップ101は、標的に結合した薬物、遊離中和抗体、およびタンパク質薬物抗体に結合した中和抗体を含有する試料を示す。ステップ102において、試料は、タンパク質薬物から中和抗体を分離するために、および任意選択でタンパク質薬物から標的を分離するために酸性化される。
別の実施形態は、標的捕捉アッセイを提供する。図7Bは、例示的な標的捕捉アッセイを示す。アッセイ200は、薬物の投与の前もしくは後、または薬物による処置中に試料が対象から得られるステップ201から開始する。この実施例では、薬物は、抗体である。ステップ201は、標的に結合した薬物、遊離中和抗体、薬物に結合した中和抗体、および任意選択で遊離標的を含有する試料を示す。この実施形態において、試料は、タンパク質薬物から中和抗体を分離するために、およびタンパク質薬物から標的を分離するために酸性化され、それによってステップ202に示される酸性化試料を生成する。
材料および方法
材料および試薬
別段の定めがない限り、すべての溶液をアッセイ緩衝液(1X PBS中1% BSA)中で調製した。Read Buffer T(4X)は、Meso Scale Discovery(MSD、Gaithersburg,Maryland)製であった。氷酢酸(17.4M)は、Thermo Fisher Scientific(Waltham,MA)製であった。ヒトおよびサル血清は、BioIVT(Westbury,NY)製であった。完全ヒトモノクローナル抗体薬物、完全ヒト競合的抗標的A抗体、組換えヒト標的、モノクローナル中和抗薬物抗体(陽性対照として使用される)、および抗ヒトモノクローナル抗体は、Regeneron(Tarrytown,NY)によって生成された。EZ-link Sulfo-NHS-LC-Biotin(Thermo Fisher Scientific)およびルテニウムNHSエステル(MSD)を用いた抗体および標的の標識化を、製造業者の指示に従って行った。DyNAbeads(商標)Antibody Coupling Kitは、Thermo Fisher Scientific製であった。薬物特異的タンパク質試薬を磁気DyNAbeads(登録商標)に、製造業者の指示(30μgタンパク質/1mgビーズ)に従って結合した。Multi-array(登録商標)High Bind Avidin 96 Wellプレートは、MSD製であった。Trizma塩基(1.5M)は、Sigma(St Louis,MO)製であった。洗浄液は、KPL Inc.製であった。
マイクロプレートウォッシャー(ELx405)は、BioTek Instruments(Winooski,VT)製であり、マイクロプレートシェーカーは、VWR(Radnor,PA)製であった。QuickPlex SQ 120リーダーは、MSD製であり、SoftMax(登録商標)Proアプリケーションは、Molecular Devices(Sunnyvale,CA)製であった。
試料を300mMの酢酸中で1:5に希釈し、室温(RT)で60分間インキュベートした。30mgの薬物特異的タンパク質結合DyNAbeads(登録商標)を、500mMのトリス溶液(試料/QCの1プレートに十分、約0.6mgのビーズ/試料)中に再懸濁した。次いで、酸性化された試料を、タンパク質結合DyNAbeads(登録商標)を含有する1% BSA、500mMのトリス溶液中で1:2(1:20の合計最終希釈)に希釈した(1時間、700rpm)。試料を磁石に当て、ビーズをチューブ/ウェル壁上に収集させ、上清を別個のチューブ/プレートに移した。
プールされたヒト血清を陰性対照(NC)として使用した。マイクロタイタープレートを洗浄し、5% BSAで室温において1時間遮断した。REGN-A薬物のアッセイを薬物捕捉フォーマットで構成し、REGN-B薬物のアッセイを標的捕捉フォーマットで構成した(図1)(Wu,B.W.,et al.,GG,Shankar G:Competitive Ligand-Binding Assays for the Detection of Neutralizing Antibodies.In:Detection and Quantification of Antibodies to Biopharmaceuticals:Practical and Applied Considerations,M.G.Tovey(Ed).John Wiley&Sons,Inc.,Hoboken,NJ,USA.(2011))。両方の構成において、標識された薬物(ビオチンまたはルテニウム)を、アビジンコーティングされたアッセイプレートに添加する前に、溶液中の血清試料(薬物枯渇のある場合またはない場合)とインキュベートする。薬物捕捉フォーマットでは、ルテニウム標識された標的を後続のステップで添加し、標的捕捉フォーマットでは、ビオチン化された標的を最初に、ストレプトアビジンコーティングされたマイクロプレートに予め結合する。
試料およびQC(薬物枯渇のある場合またはない場合)を、50μg/mLの抗標的遮断抗体を含有する10ng/mLのBio-REGN-Aアッセイ緩衝液と、室温で振盪しながら(400rpm)90分間インキュベートした。次いで、アッセイプレートを洗浄し、酸性化/中和された試料およびQCを添加した(50μL、2時間室温)。ルテニウム標識された組換え標的を、アッセイ緩衝液中2μg/mLでアッセイプレートに、振盪しながら(50μL、400rpm)室温で1時間添加した。
ビオチン化された組換え標的を、アッセイ緩衝液中2μg/mLでアッセイプレートに、振盪しながら(50μL、400rpm)室温で1時間添加し、洗浄した。試料およびQC(薬物枯渇のある場合またはない場合)を、アッセイ緩衝液中20ng/mLでルテニウム標識された薬物と、振盪しながら(50μL、400rpm)室温で2時間インキュベートした。次いで、溶液をアッセイプレートに添加した(50μL、400rpm)。
4PL回帰モデルを使用して、SoftMax Proで薬物耐容性(DT)および薬物干渉値を計算した。NAbアッセイで試験した疾患個体からの薬物未投与の血清試料からのデータの統計分析によって、カットポイントを決定した。分析に使用した統計的方法は、業界の慣行に基づいた(Shankar,G.,et al.,J Pharm Biomed Anal,48(5):1267-1281(2008)、Gupta,S.,et al.,J Immunol Methods,321(1-2):1-18(2007))。
サル血清試料を、示された濃度の薬物Aでスパイクし、次いで、薬物枯渇手順、または対照として、標的結合ビーズを添加しない同じ処理ステップに供した。次いで、得られた血清試料上清を酸性化し(300mMの酢酸)、中和した後、抗ヒトIg、カッパ軽鎖特異的mAbでコーティングしたマイクロプレートに添加した。薬物Aレベルを、ビオチン化抗ヒトFc特異的mAbおよびNeutrAvidin-HRPによって発生したアッセイシグナルで検出した。
2つの異なるmAb薬物のCLB NAbアッセイを行い、様々な異なるパラメータについて最適化し、フォーマット、感度、およびDTを含んだ。薬物Aについては、薬物捕捉アッセイを行い、薬物Bについては、標的捕捉方法を行った(図1A~1B)。遊離薬物がNAbの非存在下で偽陽性応答を生じさせず抗標的結合タンパク質の添加によって標的干渉が最小限に抑えられ得るため、薬物捕捉CLB NAbアッセイフォーマットが概して好ましい。しかしながら、薬物Bについてのルテニウム標識された組換え標的は、ビオチン-薬物の非存在下であってもプレートに付着したため、標的捕捉フォーマットが選択された。両方のフォーマットにおいて、NAbの非存在下で、標識された薬物は、標識された標的に結合し、アッセイにおいてシグナルを発生させる。NAbの存在下では、標識された薬物への標識された標的の結合が阻害され、アッセイシグナルの低減をもたらす。したがって、アッセイシグナルは、試料中のNAbの量に反比例する(Wu,B.W.,et al.,Competitive Ligand-Binding Assays for the Detection of Neutralizing Antibodies.In:Detection and Quantification of Antibodies to Biopharmaceuticals:Practical and Applied Considerations,Michael G.Tovey(Eds).John Wiley&Sons,Inc.,Hoboken,NJ,USA.(2011))。
材料および方法
実施例Iを参照されたい。
初期実験は、ストレプトアビジンビーズに結合したビオチン-薬物を使用して、試料からADA(およびNAb)を抽出した。しかしながら、CLB NAbアッセイでは、最大感度を達成するために低い標識された薬物濃度が必要である(Hu,J.et al.,J Immunol Methods,419:1-8(2015)、Wu,B.W.,et al.,Competitive Ligand-Binding Assays for the Detection of Neutralizing Antibodies.In:Detection and Quantification of Antibodies to Biopharmaceuticals:Practical and Applied Considerations,Michael G.Tovey(Eds).John Wiley&Sons,Inc.,Hoboken,NJ,USA.(2011))。したがって、濃縮ステップからアッセイステップに移されたビオチン-薬物が干渉し得る。図2Aのデータは、NAb濃縮ステップで使用されるビオチン化薬物がNAbアッセイステップにキャリーオーバーされ、アッセイシグナルの約5倍の増加をもたらすことを実証する。実際、NAbアッセイにおいてビオチン-薬物が添加されていなくても、濃縮ステップからのビオチン-薬物のキャリーオーバーは、実質的なアッセイシグナルを発生させるのに十分であった(図示せず)。
材料および方法
実施例Iを参照されたい。
結合タンパク質の量を低減するか、または洗浄ステップを増加させる試みは、これらのタンパク質がNAbアッセイに移された後に、それらからの干渉を十分に最小限に抑えることができなかった。キャリーオーバーからの干渉を軽減するために、NAbアッセイの各々について異なるアプローチを行った。
材料および方法
実施例Iを参照されたい。
ビーズステップからキャリーオーバーしたタンパク質による干渉の低減は、特定の薬物除去試薬を選択するための重要な基準であった。ビーズに結合したタンパク質を用いた薬物除去の効率を試験するために、NAb陰性試料中の薬物干渉およびNAb陽性試料中のDTの2つのセットの実験を実施した。薬物Bの標的捕捉アッセイにおける薬物干渉を試験するために、薬物をNAb陰性試料にスパイクし、薬物枯渇ステップのある場合およびない場合のアッセイで試験した。抗イディオタイプmAb結合ビーズを用いた薬物除去ステップの追加は、対照と比較して、偽陽性応答を生じさせるために必要な薬物の濃度をほぼ50倍上昇させた(2μg/mL~93μg/mL、図4A)。
材料および方法
データは、薬物枯渇前処理ステップが、陽性対照として使用されるマウスモノクローナル抗薬物抗体に基づいてDTを改善したことを実証する。ヒト抗薬物抗体でこの研究結果を確認するために、薬物A(複数回投与)を用いた臨床試験からの25個の試料を選択して、薬物枯渇ステップのある場合およびない場合の薬物捕捉NAbアッセイで試験した
すべての試料は、ADA陽性であり、すべては、500~15000ng/mLの検出可能な薬物レベルを有した。これらすべての試料中の治療濃度は、薬物枯渇ステップなしの方法のDTよりも高かった。薬物Aに対するADA応答は、全体的にかなり低く(図示せず)、検出可能な薬物を有した唯一のADA陽性試料は、低い力価応答(最小希釈または1希釈高い)を有した。
実施形態1
試料中の薬物に対する抗薬物抗体を検出するための方法であって、
前記試料を酸性条件下で一定期間インキュベートして、酸性化試料を生成することと、
前記酸性化試料を、前記薬物の標的を含むpH緩衝液と組み合わせて、標的:薬物複合体を生成し、ここで、前記薬物の前記標的は選別可能な標識で標識されていることと、
前記選別可能な標識を使用して前記試料から前記標的:薬物複合体を除去して、枯渇試料を生成することと、
前記枯渇試料を、抗標的遮断試薬またはその抗原結合断片およびビオチン化薬物とインキュベートして、アッセイ試料を生成することと、
前記アッセイ試料を、アビジンコーティングされた固体支持体上でインキュベートすることと、
任意で、前記アッセイ試料とのインキュベーション後に、前記固体支持体を洗浄することと、
前記薬物の標識された標的を前記固体支持体に添加することと、
任意で、前記固体支持体を洗浄して、未結合の標識された標的を除去することと、
前記固体支持体に結合した前記ビオチン化薬物に結合した標識された標的からの検出可能なシグナルを測定し、ここで、対照試料と比較した前記固体支持体からのシグナルの量の減少が、前記試料中の抗薬物抗体の存在を示すことと、
を含む、方法。
実施形態2
前記抗薬物抗体が、前記薬物に特異的に結合する中和抗体を含む、実施形態1に記載の方法。
実施形態3
前記薬物が、抗体もしくはその抗原結合断片または融合タンパク質である、実施形態1または2に記載の方法。
実施形態4
前記抗体が、モノクローナル抗体、二重特異性抗体、Fab断片、F(ab’) 2 断片、単一特異性F(ab’) 2 断片、二重特異性F(ab’) 2 、三重特異性F(ab’) 2 、一価抗体、scFv断片、ダイアボディ、二重特異性ダイアボディ、三重特異性ダイアボディ、scFv-Fc、ミニボディ、IgNAR、v-NAR、hcIgG、またはvhHである、実施形態3に記載の方法。
実施形態5
前記酸性条件が、約2.0~約4.0のpHを含む、実施形態1に記載の方法。
実施形態6
前記酸性条件が、1~3のpHを含む、実施形態1に記載の方法。
実施形態7
前記選別可能な標識が、磁気標識を含む、実施形態1に記載の方法。
実施形態8
前記磁気標識が、常磁性標識または超常磁性標識である、実施形態7に記載の方法。
実施形態9
前記磁気標識が、金属粒子、金属マイクロ粒子、金属ナノ粒子、金属ビーズ、磁性ポリマー、均一ポリスチレン球状ビーズ、または超常磁性球状ポリマー粒子である、実施形態7または8に記載の方法。
実施形態10
前記抗標的遮断試薬その抗原結合断片が、前記タンパク質薬物の前記標的に特異的に結合する、実施形態1に記載の方法。
実施形態11
前記方法の薬物耐容性が、非枯渇試料と比較して枯渇試料中で少なくとも10倍大きい、実施形態1に記載の方法。
実施形態12
前記方法が、前記タンパク質薬物の投与の少なくとも29日後に対象から採取した薬物含有試料中のNAbを肯定的に同定する、実施形態1に記載の方法。
実施形態13
前記試料が、前記インキュベーションまたは洗浄ステップ中に撹拌される、実施形態1に記載の方法。
実施形態14
前記標識された標的が、フルオロフォア、化学発光プローブ、電気化学発光プローブ、量子ドット、希土類遷移金属、金金属粒子、銀金属粒子、またはそれらの組み合わせで標識されている、実施形態1に記載の方法。
実施形態15
前記標識が、ルテニウムを含む、実施形態14に記載の方法。
実施形態16
試料中の薬物に対する抗薬物抗体を検出するための方法であって、
前記試料を酸性条件下で一定期間インキュベートして、タンパク質複合体の解離を促進し、それによって酸性化試料を生成することと、
前記酸性化試料を、前記薬物に特異的な標識された非遮断抗イディオタイプ抗体を含むpH緩衝液と組み合わせて、非遮断抗イディオタイプ抗体:薬物複合体を生成し、ここで、前記標識された非遮断抗イディオタイプ抗体が選別可能な標識で標識されており、pHが4.0~5.5に上昇することと、
前記選別可能な標識を使用して前記試料から前記非遮断抗イディオタイプ抗体:薬物複合体を除去して、枯渇試料を生成することと、
前記枯渇試料を、標識されたタンパク質薬物と約7.0のpHでインキュベートして、アッセイ試料を生成することと、
標的コーティングされた固体支持体上で前記アッセイ試料をインキュベートし、ここで、前記標識された薬物が、前記標的に特異的に結合することと、
任意で、前記アッセイ試料とのインキュベーション後に前記固体支持体を洗浄して、未結合の標識された薬物を除去することと、
前記標的コーティングされた固体支持体に結合した標識された薬物からの検出可能なシグナルを測定し、ここで、対照試料と比較したシグナルの量の減少が、前記試料中の抗薬物抗体の存在を示すことと、
を含む、方法。
実施形態17
前記抗薬物抗体が、前記薬物に特異的に結合する中和抗体を含む、実施形態16に記載の方法。
実施形態18
前記薬物が、抗体もしくはその抗原結合断片または融合タンパク質である、実施形態16または17に記載の方法。
実施形態19
前記抗体が、モノクローナル抗体、二重特異性抗体、Fab断片、F(ab’) 2 断片、単一特異性F(ab’) 2 断片、二重特異性F(ab’) 2 、三重特異性F(ab’) 2 、一価抗体、scFv断片、ダイアボディ、二重特異性ダイアボディ、三重特異性ダイアボディ、scFv-Fc、ミニボディ、IgNAR、v-NAR、hcIgG、またはvhHである、実施形態18に記載の方法。
実施形態20
前記酸性条件が、遊離標的干渉を最小限に抑えるために4.5~5.0のpHを含む、実施形態16に記載の方法。
実施形態21
前記酸性条件が、2.0~4.0のpHを含む、実施形態16に記載の方法。
実施形態22
前記選別可能な標識が、磁気標識を含む、実施形態16に記載の方法。
実施形態23
前記磁気標識が、常磁性標識または超常磁性標識である、実施形態22に記載の方法。
実施形態24
前記磁気標識が、金属粒子、金属マイクロ粒子、金属ナノ粒子、金属ビーズ、磁性ポリマー、均一ポリスチレン球状ビーズ、または超磁性球状ポリマー粒子である、実施形態22または23に記載の方法。
実施形態25
前記標識された薬物が、フルオロフォア、化学発光プローブ、電気化学発光プローブ、放射性同位体、量子ドット、希土類遷移金属、金粒子、銀粒子、またはそれらの組み合わせで標識されている、実施形態16に記載の方法。
実施形態26
前記標識が、ルテニウムを含む、実施形態16に記載の方法。
実施形態27
前記方法の薬物耐容性が、非枯渇試料と比較して枯渇試料中で少なくとも10倍大きい、実施形態16に記載の方法。
実施形態28
前記方法が、前記タンパク質薬物の投与の少なくとも29日後に対象から採取した試料中のNAbを肯定的に同定する、実施形態16に記載の方法。
実施形態29
前記試料が、前記インキュベーションまたは洗浄ステップ中に撹拌される、実施形態16に記載の方法。
実施形態30
リードタンパク質薬物を同定するための方法であって、
1つ以上の薬物候補を対象に投与することと、
前記対象から得られた試料上で、実施形態1または実施形態16のいずれか一項に記載の方法を実施することと、
ADAをほとんどまたは全く生成しないタンパク質薬物候補を選択することと、
を含む、方法。
上記の明細書において、本発明がその特定の実施形態に関連して説明されており、多くの詳細が例示の目的のために提示されてきたが、本発明が、追加の実施形態を受け入れる余地があること、および本明細書に記載される詳細の一部が、本発明の基本原則から逸脱することなくかなり変動し得ることは、当業者には明らかであろう。
Claims (18)
- 試料中のタンパク質薬物に対する抗薬物抗体を検出するための方法であって、
前記試料を酸性条件下で一定期間インキュベートして、酸性化試料を生成することと、
前記酸性化試料を、前記薬物の標的を含むpH緩衝液と組み合わせて、標的:薬物複合体を生成し、ここで、前記薬物の前記標的は選別可能な標識で標識されていることと、
前記選別可能な標識を使用して前記試料から前記標的:薬物複合体を除去して、枯渇試料を生成することと、
前記枯渇試料を、抗標的遮断試薬またはその抗原結合断片およびビオチン化薬物とインキュベートして、アッセイ試料を生成することと、
前記アッセイ試料を、アビジンコーティングされた固体支持体上でインキュベートすることと、
前記薬物の標識された標的を前記固体支持体に添加することと、
前記固体支持体に結合した前記ビオチン化薬物に結合した標識された標的からの検出可能なシグナルを測定し、ここで、対照試料と比較した前記固体支持体からのシグナルの量の減少が、前記試料中の抗薬物抗体の存在を示すことと、
を含む、方法。 - 前記抗薬物抗体が、前記薬物に特異的に結合する中和抗体を含む、請求項1に記載の方法。
- 前記薬物が、抗体もしくはその抗原結合断片または融合タンパク質である、請求項1または2に記載の方法。
- 前記抗体が、モノクローナル抗体、二重特異性抗体、Fab断片、F(ab’)2断片、単一特異性F(ab’)2断片、二重特異性F(ab’)2、三重特異性F(ab’)2、一価抗体、scFv断片、ダイアボディ、二重特異性ダイアボディ、三重特異性ダイアボディ、scFv-Fc、ミニボディ、IgNAR、v-NAR、hcIgG、またはvhHである、請求項3に記載の方法。
- 前記酸性条件が、約2.0~約4.0のpHを含む、請求項1に記載の方法。
- 前記酸性条件が、1~3のpHを含む、請求項1に記載の方法。
- 前記選別可能な標識が、磁気標識を含む、請求項1に記載の方法。
- 前記磁気標識が、常磁性標識または超常磁性標識である、請求項7に記載の方法。
- 前記磁気標識が、金属粒子、金属マイクロ粒子、金属ナノ粒子、金属ビーズ、磁性ポリマー、均一ポリスチレン球状ビーズ、または超常磁性球状ポリマー粒子である、請求項7または8に記載の方法。
- 前記抗標的遮断試薬またはその抗原結合断片が、前記タンパク質薬物の前記標的に特異的に結合する、請求項1に記載の方法。
- 前記方法の薬物耐容性が、非枯渇試料と比較して枯渇試料中で少なくとも10倍大きい、請求項1に記載の方法。
- 前記方法が、前記タンパク質薬物の投与の少なくとも29日後に対象から採取した薬物含有試料中の中和抗体(NAb)を肯定的に同定する、請求項1に記載の方法。
- 前記試料が、前記インキュベーションまたは洗浄ステップ中に撹拌される、請求項1に記載の方法。
- 前記標識された標的が、フルオロフォア、化学発光プローブ、電気化学発光プローブ、量子ドット、希土類遷移金属、金金属粒子、銀金属粒子、またはそれらの組み合わせで標識されている、請求項1に記載の方法。
- 前記標識が、ルテニウムを含む、請求項14に記載の方法。
- リードタンパク質薬物を同定するための方法であって、
1つ以上の薬物候補が投与された対象から得られた試料上で、請求項1に記載の方法を実施することと、
前記固体支持体に結合した前記ビオチン化薬物に結合した前記標識された標的からの前記検出可能なシグナルにそれぞれ応じた、抗薬物抗体(ADA)陽性と薬物濃度とに基いて、より高い割合の、対照試料と比較した前記固体支持体からの前記検出可能なシグナルを生成し、これによってより少ないADAの存在を示すタンパク質薬物候補を選択することと、
を含む、方法。 - 前記アッセイ試料とのインキュベーション後に、前記固体支持体を洗浄することをさらに含む、請求項1に記載の方法。
- 前記固体支持体を洗浄して、未結合の標識された標的を除去することをさらに含む、請求項1に記載の方法。
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