JP7405855B2 - 生理活性化合物 - Google Patents
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Description
本発明は、メリコペ・ラティフォリア(Melicope latifolia)の木の樹皮から単離された新規生理活性化合物、該化合物を含む組成物、およびその使用方法に関する。
M.ラティフォリア(以前はエウオーディア・ラティフォリア(Euodia latifolia)として知られる)は、柑橘類であるミカン科(Rutaceae)に属している。それは、東南アジアおよび太平洋の多くの国々で生育しており、それらの国々で伝統的な医薬品に使用されている。バヌアツのロー島では、M.ラティフォリアは園芸植物として持ち込まれたと記載されており、「ネヒネ(nehine)」と呼ばれている。葉の低温浸漬物が、咳の治療のために内服的に摂取されている(Bradacs、Maesら 2010);(Bradacs、Heilmannら 2011)。
・ ジクロロメタン抽出物は、培養中のヒト肺癌細胞株A548に対して14.2±0.89μg/mLのIC50値を有していた。
・ ジクロロメタンおよび酢酸エチル抽出物は、赤血球中の熱帯熱マラリア原虫(Plasmodium falciparum)に対して、それぞれ8.30±1.43および14.94±2.72μg/mLのIC50値を有していたが、同様の活性をヒト肺線維芽細胞(MRC-5SV2)に対して有しており、よって選択性指数は1であった。
・ ジクロロメタンおよび酢酸エチル抽出物は、トリパノソーマ・クルージイ(Trypanosoma cruzii)に対して、それぞれ6.55±0.79および7.64±0.26μg/mLのIC50値を有していたが、同様の活性をヒト肺線維芽細胞(MRC-5SV2)に対して有しており、よって選択性指数は1であった。
・ ジクロロメタン抽出物は、トリパノソーマ・ブルセイ(Trypanosoma brucei)に対して、8.28±0.62μg/mLのIC50値を有していたが、同様の活性をヒト肺線維芽細胞(MRC-5SV2)に対して有しており、よって選択性指数は1であった。
本発明は、M.ラティフォリアの木の樹皮から、本発明者らによってバラエノン(Balaenone)と命名された新規生理活性化合物を単離し、特定することに関する。
(a)M.ラティフォリアの樹皮をメタノールで抽出するステップと;
(b)ろ過した抽出物を、メタノール中で予め平衡化したPSDVBカラムに通すステップと;
(c)溶出液を等容量の水と合わせ、それを同じPSDVBカラムに通すステップと;
(d)該カラムを水で洗浄するステップと;
(e)吸着した抽出物の化合物を、i)水中20%アセトン(画分A)、ii)水中40%アセトン(画分B)、iii)水中60%アセトン(画分C)、iv)水中80%アセトン(画分D)、およびv)アセトン(画分E)で溶出するステップと;
(f)画分Cおよび/またはDを収集して、バラエノンの精製組成物を提供するステップと;
(g)任意選択により、画分Cおよび/またはDをシリカゲルフラッシュクロマトグラフィーによってさらに精製して、バラエノンのさらなる精製組成物を得るステップと;
を含む、バラエノンの精製組成物を得る工程を提供する。
(a)M.ラティフォリアの樹皮をメタノールで抽出するステップと;
(b)ろ過した抽出物を、メタノール中で予め平衡化したPSDVBカラムに通すステップと;
(c)溶出液を等容量の水と合わせ、それを同じPSDVBカラムに通すステップと;
(d)該カラムを水で洗浄するステップと;
(e)吸着した抽出物の化合物を、i)水中20%アセトン(画分A)、ii)水中40%アセトン(画分B)、iii)水中60%アセトン(画分C)、iv)水中80%アセトン(画分D)、およびv)アセトン(画分E)で溶出するステップと;
(f)画分Cおよび/またはDを収集して、バラエノンの精製組成物を提供するステップと;
(g)任意選択により、画分Cおよび/またはDをシリカゲルフラッシュクロマトグラフィーによってさらに精製して、バラエノンのさらなる精製組成物を得るステップと;
を含む工程によって得られる、バラエノンの精製組成物を提供する。
本発明をこれより添付の図を参照して説明する。
5.1 定義
「含む(comprising)」という用語は、本明細書で使用される場合、「少なくとも部分的になる(consisting at least in part of)」ことを意味する。「含む」という用語を含む本明細書および特許請求の範囲において各文を解釈するとき、この用語に先行されるもの(1つまたは複数)以外の特徴物も存在し得る。「含む(comprise)」および「含む(comprises)」などの関連する用語は、同様に解釈されるものとする。
本発明者らは、M.ラティフォリアの木の樹皮の抽出物から新規生理活性化合物を単離した。この木の種は、Applelhansによって実施されたメリコペ種の系統発生解析において、M.ラティフォリアの標本の中にDNAフィンガープリントを配置するDNAフィンガープリント解析によって特定された(Appelhans、Wenら 2014)。
溶媒抽出、逆相クロマトグラフィー、順相シリカゲルクロマトグラフィーなどを含めた天然物の化学の標準的な技法を利用する種々の方法を使用して、バラエノンをその原材料から単離し、精製することができる。
この抽出方法では、M.ラティフォリアの幹樹皮を、メタノール(2×)で18~24時間抽出する。両方の抽出物をろ過し、メタノール中で予め平衡化したPSDVBのベッド(2回目の抽出物、その後1回目の抽出物)に通す。この工程からの溶出液を合わせ、等容量の水で希釈し(水中50%メタノール)、同じPSDVBカラムに通す。この工程をさらなる等量の水で繰り返し(水中25%メタノールにする)、同じPSDVBカラムに通す。このとき吸着した抽出物を含有しているこのカラムを、水で洗浄し(3×カラム容積)、その後一回分量のi)水中20%アセトン(画分A)、ii)水中40%アセトン(画分B)、iii)水中60%アセトン(画分C)、iv)水中80%アセトン(画分D)、およびv)アセトン(画分E)で洗浄する。
M.ラティフォリアの幹樹皮を、メタノール(2×)で18~24時間抽出する。両方の抽出物を合わせ、真空下で濃縮乾固し、水不混和性有機溶媒(例えばジクロロメタン)中で戻し、水で分配する。無水硫酸マグネシウムを使用して有機層を乾燥し、真空下で濃縮乾固する。濃縮した有機層を、石油エーテル中酢酸エチルの勾配(0~100%)を使用するシリカゲル上のフラッシュクロマトグラフィーによって精製する。この場合、バラエノンは石油エーテル中20~25%酢酸エチルから溶出する。
(a)M.ラティフォリアの樹皮をメタノールで抽出するステップと;
(b)ろ過したメタノール抽出物を、メタノール中で予め平衡化したPSDVBカラムに通すステップと;
(c)溶出液を等容量の水と合わせ、それを同じPSDVBカラムに通すステップと;
(d)該カラムを水で洗浄するステップと;
(e)吸着した抽出物の化合物を、i)水中20%アセトン(画分A)、ii)水中40%アセトン(画分B)、iii)水中60%アセトン(画分C)、iv)水中80%アセトン(画分D)、およびv)アセトン(画分E)で溶出するステップと;
(f)画分Cおよび/またはDを収集して、バラエノンの精製組成物を提供するステップと;
(g)任意選択により、画分Cおよび/またはDをシリカゲルフラッシュクロマトグラフィーによってさらに精製して、バラエノンのさらなる精製組成物を得るステップと;
を含む、バラエノンまたはバラエノンの精製組成物を得る工程を提供する。
(a)M.ラティフォリアの樹皮をメタノールで抽出するステップと;
(b)ろ過したメタノール抽出物を、メタノール中で予め平衡化したPSDVBカラムに通すステップと;
(c)溶出液を等容量の水と合わせ、それを同じPSDVBカラムに通すステップと;
(d)該カラムを水で洗浄するステップと;
(e)吸着した抽出物の化合物を、i)水中20%アセトン(画分A)、ii)水中40%アセトン(画分B)、iii)水中60%アセトン(画分C)、iv)水中80%アセトン(画分D)、およびv)アセトン(画分E)で溶出するステップと;
(f)画分Cおよび/またはDを収集して、バラエノンの精製組成物を提供するステップと;
(g)任意選択により、石油エーテル中酢酸エチルの勾配(0~100%)を使用するシリカゲルフラッシュクロマトグラフィーによって画分Cおよび/またはDをさらに精製して、バラエノンを得るステップと、
(h)3:1の石油エーテル/ジエチルエーテルのイソクラティック混合物を使用するシリカゲルフラッシュクロマトグラフィーでトランス-およびシス-バラエノンを分離してトランス-バラエノンおよびシス-バラエノンを得るステップと;
を含む、トランス-バラエノンおよび/もしくはシス-バラエノンまたはそれらの精製組成物を得る工程を提供する。
一態様では、本発明は、バラエノンの精製組成物を提供する。一実施形態では、本発明は、上で定義した工程によって得られる精製組成物を提供する。
実施例4に見られるように、純粋なバラエノンとバラエノンを含む精製組成物は、両方とも抗菌活性を実証する。
態様1
式(X)の、単離された生理活性化合物
式(Xa)の、単離された生理活性化合物
式(Xb)の、単離された生理活性化合物
(a)M.ラティフォリア(M.latifolia)の樹皮をメタノールで抽出するステップと;
(b)ろ過した抽出物を、メタノール中で予め平衡化したPSDVBカラムに通すステップと;
(c)溶出液を等容量の水と合わせ、それを同じPSDVBカラムに通すステップと;
(d)前記カラムを水で洗浄するステップと;
(e)吸着した抽出物の化合物を、i)水中20%アセトン(画分A)、ii)水中40%アセトン(画分B)、iii)水中60%アセトン(画分C)、iv)水中80%アセトン(画分D)、およびv)アセトン(画分E)で溶出するステップと;
(f)画分Cおよび/またはDを収集して、態様1に記載の化合物の精製組成物を提供するステップと;
(g)任意選択により、画分Cおよび/またはDをシリカゲルフラッシュクロマトグラフィーによってさらに精製して、態様1に記載の化合物を得るステップと;
を含む、態様1に記載の化合物または態様1に記載の化合物の精製組成物を得る方法。
態様5
(a)M.ラティフォリアの樹皮をメタノールで抽出するステップと;
(b)ろ過したメタノール抽出物を、メタノール中で予め平衡化したPSDVBカラムに通すステップと;
(c)溶出液を等容量の水と合わせ、それを同じPSDVBカラムに通すステップと;
(d)前記カラムを水で洗浄するステップと;
(e)吸着した抽出物の化合物を、i)水中20%アセトン(画分A)、ii)水中40%アセトン(画分B)、iii)水中60%アセトン(画分C)、iv)水中80%アセトン(画分D)、およびv)アセトン(画分E)で溶出するステップと;
(f)画分Cおよび/またはDを収集して、バラエノンの精製組成物を提供するステップと;
(g)任意選択により、石油エーテル中酢酸エチルの勾配(0~100%)を使用するシリカゲルフラッシュクロマトグラフィーによって画分Cおよび/またはDをさらに精製して、バラエノンを得るステップと、
(h)バラエノンのジアステレオ異性体をシリカゲルフラッシュクロマトグラフィーで分離して、態様2または態様3に記載の化合物を得るステップと;
を含む、態様2または態様3に記載の化合物を得るための方法。
態様6
態様1から3のいずれかに記載の化合物の精製組成物。
態様7
少なくとも60、65、70、75、80、85、90、95、96、97、98、または99wt%の態様1から3のいずれかに記載の化合物を含む、態様6に記載の精製組成物。
態様8
少なくとも95wt%の態様1から3のいずれかに記載の化合物を含む、態様7に記載の精製組成物。
態様9
約2wt%未満のハルホルジンを含む、態様6~8のいずれかに記載の精製組成物。
態様10
態様1から3のいずれかに記載の化合物と、1つまたは複数の医薬として許容される賦形剤とを含む、医薬組成物。
態様11
態様6から9のいずれかに記載の精製組成物と、1つまたは複数の医薬として許容される賦形剤とを含む、医薬組成物。
態様13
細菌感染症の治療を必要とする対象において細菌感染症を治療する方法であって、前記対象に治療的有効量の態様1から3のいずれかに記載の化合物を投与することを含む、方法。
態様14
細菌感染症の治療を必要とする対象において細菌感染症を治療する方法であって、前記対象に治療的有効量の態様6から9のいずれかに記載の精製組成物を投与することを含む、方法。
態様15
前記細菌感染症がグラム陽性菌感染症である、態様13または態様14に記載の方法。
本明細書において、特許明細書、他の外部文書、または他の情報源が言及される場合、これは概して本発明の特徴を考察するための背景を提供することを目的としている。特に明示しない限り、そのような外部文書への言及は、そのような文書、またはそのような情報源が、いかなる法域であっても、先行技術であること、または当技術分野での技術常識の一部を形成することを承認するものと解釈されるべきではない。
一般的実験法
光学回転は、Rudolph Research Analytical Autopol IV旋光計で測定した。UV/可視スペクトルは、Molecular Devices SpectraMax M3分光光度計で記録した。NMR実験値は、Bruker 500MHz分光計で、1Hおよび13C核に対してそれぞれ500MHzおよび125MHzで操作して取得した。正確な質量は、溶媒送出用にAgilent 1260 HPLCシステムを備え、正イオンモードでのエレクトロスプレーイオン化源を利用する、Agilent 6530 Q-TOF質量分析計を使用して決定した。フラッシュクロマトグラフィーは、Buechi Reveleris X2分取クロマトグラフィーシステムで行った。
M.ラティフォリアの新鮮凍結幹樹皮(100g)を小片に切断し(約2cm3)、200mLのメタノール中に18時間浸漬した。メタノール(1回目の抽出物)をろ過し、樹皮材料をさらなる200mLのメタノール中に18時間浸漬した。このメタノール(2回目の抽出物)をろ過し、100mLのPSDVB(HP-20、Supelco)カラムに、流量を2mL/分に制限しながら重力で通した。
M.ラティフォリアの幹樹皮(600g、新鮮凍結)をメタノール(2×1.2L)で一晩抽出し、ろ過した。2回目および1回目の抽出物を、メタノール中で予め平衡化した500mLのPSDVBのベッドに通した。このステップからの溶出液を合わせたものを水で続けて希釈し(2×容積)、同じカラムに戻して通し、メタノール/水の最終溶液濃度が25%になるまで行った。このカラムを水で洗浄し(1.5L、ローディング溶出液と一緒に収集)、次いで、1.5Lの分量のi)20%アセトン/水、ii)40%アセトン/水、iii)60%アセトン/水、iv)80%アセトン/水、およびv)アセトンで溶出した。
実施例1に記載する工程に従って得られたバラエノン濃厚化画分をプールし、3:1石油エーテル/ジエチルエーテルのイソクラティック混合物を使用して、シリカゲルのクロマトグラフィーにかけた(10×150mm、10μ、流量5mL/分)。トランス-バラエノン(式(Xa)の化合物)が12.4分で溶出し、一方、シス-バラエノン(式(Xb)の化合物)は15.2分で溶出した。
トランス-バラエノンは、光学活性な無色の油状物として提示される([α]20 D+171)。7の不飽和度を必要とするC15H18O2の分子式は、高分解能質量分析から得られた(m/z 231.1383[M+H]+、計算値231.1380)。トランス-バラエノンの13C NMRスペクトルは、必要とされる15の共鳴をすべて含有している。13C、DEPT、およびHSQC NMR実験の解析から、15個の炭素がさらに3個のメチル(δC 23.2、10.7、9.2)、3個のメチレン(δC 42.0、26.6、34.3)、3個のメチン(∂C 137.8、48.4、42.1)、および6個の非プロトン化炭素(δC 209.2、164.8、156.6、135.9、120.4、118.7)に分類されることが確認された。提示された分子式によって必要とされる18個のすべての水素は炭素に結合しており、それによって交換可能なプロトンが存在しないことが示される。NMRデータは、表2に要約されている。
トランス-バラエノン(Xa):無色油状物;[α]20 D+171(c 0.5、CHCl3);UV(MeOH)λmax/nm(logε)244(3.99)、280(3.80);NMR(CDCl3、500MHz)表2参照;HRESIMS m/z 231.1383[M+H]+、C15H19O2についての計算値、231.1380。
M.ラティフォリア樹皮の粗(1回目のメタノール)抽出物および実施例1に概説する精製工程を使用して得られた5つのクロマトグラフィー画分を、TLCバイオオートグラフィー試験に供して、抗菌活性を定性的に測定した。
黄色ブドウ球菌(Staphylococcus aureus)、表皮ブドウ球菌(Staphylococcus epidermidis)、枯草菌
検査したグラム陰性菌(2):
緑膿菌(Pseudomonas aeruginosa)、大腸菌(Escherichia coli)
黄色ブドウ球菌および表皮ブドウ球菌に関する結果を図8および9に示す。どの抽出物も緑膿菌に対して活性でないことが見出された。
本発明の化合物および組成物は、抗生物質としての用途を有する。当業者であれば、上の説明が実例として提供されるに過ぎず、本発明がそれらに限定されないことを理解するであろう。
Claims (11)
- (a)M.ラティフォリア(M.latifolia)の樹皮をメタノールで抽出するステップと;
(b)ろ過した抽出物を、メタノール中で予め平衡化したPSDVBカラムに通すステップと;
(c)溶出液を等容量の水と合わせ、それを同じPSDVBカラムに通すステップと;
(d)前記カラムを水で洗浄するステップと;
(e)吸着した抽出物の化合物を、i)水中20%アセトン(画分A)、ii)水中40%アセトン(画分B)、iii)水中60%アセトン(画分C)、iv)水中80%アセトン(画分D)、およびv)アセトン(画分E)で溶出するステップと;
(f)画分Cおよび/またはDを収集して、請求項1に記載の化合物の精製組成物を提供するステップと;
(g)任意選択により、画分Cおよび/またはDをシリカゲルフラッシュクロマトグラフィーによってさらに精製して、請求項1に記載の化合物を得るステップと;
を含む、請求項1に記載の化合物または請求項1に記載の化合物の精製組成物を得る方法。 - (a)M.ラティフォリアの樹皮をメタノールで抽出するステップと;
(b)ろ過したメタノール抽出物を、メタノール中で予め平衡化したPSDVBカラムに通すステップと;
(c)溶出液を等容量の水と合わせ、それを同じPSDVBカラムに通すステップと;
(d)前記カラムを水で洗浄するステップと;
(e)吸着した抽出物の化合物を、i)水中20%アセトン(画分A)、ii)水中40%アセトン(画分B)、iii)水中60%アセトン(画分C)、iv)水中80%アセトン(画分D)、およびv)アセトン(画分E)で溶出するステップと;
(f)画分Cおよび/またはDを収集して、バラエノンの精製組成物を提供するステップと;
(g)任意選択により、石油エーテル中酢酸エチルの勾配(0~100%)を使用するシリカゲルフラッシュクロマトグラフィーによって画分Cおよび/またはDをさらに精製して、バラエノンを得るステップと、
(h)バラエノンのジアステレオ異性体をシリカゲルフラッシュクロマトグラフィーで分離して、請求項2または請求項3に記載の化合物を得るステップと;
を含む、請求項2または請求項3に記載の化合物を得るための方法。 - 請求項1から3のいずれか一項に記載の化合物の精製組成物。
- 少なくとも60、65、70、75、80、85、90、95、96、97、98、または99wt%の請求項1から3のいずれか一項に記載の化合物を含む、請求項6に記載の精製組成物。
- 少なくとも95wt%の請求項1から3のいずれか一項に記載の化合物を含む、請求項7に記載の精製組成物。
- 約2wt%未満のハルホルジンを含む、請求項6~8のいずれか一項に記載の精製組成物。
- 請求項1から3のいずれか一項に記載の化合物と、1つまたは複数の医薬として許容される賦形剤とを含む、医薬組成物。
- 請求項6から9のいずれか一項に記載の精製組成物と、1つまたは複数の医薬として許容される賦形剤とを含む、医薬組成物。
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