JP7359785B2 - 二量体及びその使用 - Google Patents
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Description
本明細書に記載のあらゆる刊行物、特許及び特許の出願は、それぞれ単一の刊行物、特許又は特許の出願が具体的かつ個別的に参照として引用されているように、援用によりここに取り込まれる。
また、本開示は、二量体を提供する。上記の二量体は、それぞれが抗体Fcサブユニットを有する2本のポリペプチド鎖からなる。例えば、二量体は、それぞれが抗体Fcサブユニットを有すると共に、1本のポリペプチド鎖の抗体Fcサブユニットがもう1本のポリペプチド鎖の抗体Fcサブユニットと会合して二量体を形成することができる2本のポリペプチド鎖より構成されてよい。実施例において、二量体における2本のポリペプチド鎖が互いに融合せずに(例えば、ペプチドリンカー、もしくはペプチド結合を介する)単一のポリペプチド鎖になる。
別の態様では、本開示は、本開示に基づく二量体及び/又は免疫抱合体ならびに任意選択の薬学的に許容可能な賦形剤を含む医薬組成物を提供する。幾つかの場合において、上記の医薬組成物は、細胞又は組織(例えば、遺伝子工学の細胞又は組織)を含んでよく、本開示に基づく二量体及び/又は免疫抱合体ならびにその断片は、このような細胞又は組織に含まれてよい。
本開示に基づく二量体、免疫抱合体又は医薬組成物は、必要な被験者の疾患を治療するために用いられることができる。
別の態様では、本開示は、(I)二量体発現及び形成が達成される条件で本開示の宿主細胞を培養し、及び(ii)形成される二量体を採取することを含む、本開示に基づく二量体の作製方法を提供する。
以下、実施例について、当業者に本願の作製及び使用についてのすべての開示及び説明を提供するように記述するが、これは、発明者による特定の範囲を限定するものではなく、以下の試験がすべて又は唯一のものを示すという意味でもない。ここで、用いられる数(例えば、数量、温度など)の正確性の確保に力を尽くしたが、幾つかの試験エラー及び偏差を考慮すべきである。特に断らない限り、部は重量部、分子量は平均分子量、温度は摂氏度、圧力は大気圧又は大気圧に近いものを指す。標準的な略語、例えば、bp:1個又は複数個の塩基対、kb:1キロ又は数キロベース、pl:1又は数ピコリットル、s又はsec:1又は数秒、min:1又は数分間、h又はhr:1又は数時間、aa:1個又は複数個のアミノ酸、nt:1個又は複数個のヌクレオチド、i.m.:筋肉内、i.p.:腹腔内、s.c.:皮下などを使用してよい。
組換えDNA技術
Sambrookら、Molecular cloning: A laboratory manual; Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N. Y., 1989に記載のように、標準方法でDNAを操作する。製造元のマニュアルにしたがって、分子生物学試薬を利用する。Kabat, E. A.ら、(1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest、第5版、NIH Publication No. 91-3242において、ヒト免疫グロブリン軽鎖及び重鎖のヌクレオチド配列に関する一般的な情報が見出されている。
必要な遺伝子フラグメントは、適切なテンプレートのPCRを利用して作成されるか、又は自動遺伝子合成によって合成オリゴヌクレオチド及びPCR産物から合成される。このような遺伝子合成は、例えば(Life Technologies, Inc. Carlsbad, Calif.)及びGeneart AG (Regensburg, Germany)から購入してもよい。両サイドが単一制限エンドヌクレアーゼ切断部位である遺伝子フラグメントを、標準クローン性ベクター/シーケンシングベクターにクローンした。転換された細菌からプラスミドを精製すると共に、紫外スペクトルでその濃度を測定した。DNAシーケンシングによって、サブクローニング遺伝子断片のDNA配列を特定した。遺伝子フラグメントは、対応する発現ベクターへのサブクローニングを許容するように、適切な制限部位を持つように設計されている。
以下に記載のアミノ酸配列に従って、CTLA4に対して特異的である下記のISVDを組換えにより産生した。
以下に記載のアミノ酸配列にしたがって、以下のPD-L1に対して特異的であるISVDを組換えにより産生した。
例として、本開示における以下の二量体を産生した:aPDL1.9-aCTLA4.34-Fc、aPDL1.9-L-aCTLA4.34-Fc、aCTLA4.34-aPDL1.9-Fc、aCTLA4.34-L-aPDL1.9-Fc、aPDL1.6-aCTLA4.34-Fc、aPDL1.m3-aCTLA4.34-Fc、及びaPDL1.9-aCTLA4.13-Fc。
対照として、非機能的な単一ドメインポリペプチド(野生型又はダブルノックアウトマウスが共に機能なし)であり、配列番号37で表されるアミノ酸配列を有するdAbを調製した。
以上の実施例1.3及び実施例1.4に記載のaPDL1.9-aCTLA4.34-Fc、aPDL1.9-L-aCTLA4.34-Fc、aCTLA4.34-aPDL1.9-Fc、aCTLA4.34-L-aPDL1.9-Fc、aPDL1.6-aCTLA4.34-Fc、aPDL1.m3-aCTLA4.34-Fc、aPDL1.9-aCTLA4.13-Fc、aPDL1.9-dAb-Fc、dAb-aCTLA4.34-Fc、aPDL1.6-dAb-Fc、aPDL1.m3-dAb-Fc又はdAb-aCTLA4.13-Fcをコードする核酸配列を、発現ベクターpCDNA4 (Invitrogen, Cat V86220)にクローンして、それぞれ対応する組換え発現ベクターを得た。
・2.1方法
2.1.1 ELISAによる可溶性CTLA4への結合親和性の測定
CTLA4-muFc (マウスFcにおけるN端に融合されたヒトCTLA4細胞外領域であって、そのアミノ酸配列が配列番号52で表される)で96ウエルプレートを被覆した。濃度の異なる試料及び対照分子を加えた。HRP標識ヤギ抗ヒトFc抗体は、検出に用いられた。TMBによる発色後、マイクロプレートリーダーにおいて450/650nmの波長でプレートを読み取った。
ヒトPD-L1-muFc (マウスFcにおけるN端に融合されたアミノ酸配列が配列番号53で表されるヒトPD-L1細胞外領域)を用いた。濃度の異なる試料及び対照分子を加えた。HRP標識ヤギ抗ヒトFc抗体は、検出に用いられた。TMBによる発色後、マイクロプレートリーダーにおいて450/650nmの波長でプレートを読み取った。
ヒトPD-L1-huFc (マウスFcにおけるN端に融合されたアミノ酸配列が配列番号54で表されるヒトPD-L1細胞外領域)を用いた。濃度の異なる試料と対照分子を加えた。次に、CTLA4-muFcは、結合された試料の検出に用いられ、次に、HRP標識ヤギ抗マウスFc抗体は、二次抗体として用いられた。TMBによる発色後、マイクロプレートリーダーにおいて450/650nmの波長でプレートを読み取った。
Biacore X100による測定を行った。試料を希釈して、3 nMの濃度でプロテインAセンサーチップ表面上に固定化した。CTLA4含有溶液を希釈して、それぞれ800 nM、400 nM、200 nM、100 nM及び50 nMの濃度に調製した。又は、PD-L1-muFcを利用する場合、100nM、33.3nM、11.1nM、3.70nM、1.23nMに希釈した。結合、解離及び再生を行った後、結合動力学定数(KD)を測定する。
Fortebio’s Octet K2プラットフォームで測定を行った。試料を10μg/mlの濃度に希釈して、バイオセンサーで捕獲した。PD-L1含有溶液を希釈して、それぞれ50nM、25nM、12.5nM、6.25nM及び3.125nMの濃度に調製した。標準化(基準)、結合、解離及び再生過程を行った後、動力学定数(KD)が得られた。
A375-hPD-L1細胞とのインビトロ結合
試料を希釈して、それぞれ0.091μM、0.27μM、0.82μM、2.45μM、7.41μM、22.22μM、66.67μM、及び200μMの濃度に調製した。A375-hPD-L1細胞(ヒトPD-L1タンパク質定常発現A375細胞株であって、ヒトPD-L1発現カセットをA374細胞株に安定的に形質移入することによって産生された)の密度を4×106個の細胞/mlに調節した。結合及び洗浄過程を行った後、フローサイトメトリー解析のために、試料を積み込むことによって、蛍光強度中央値(MFI)を測定した。
試料を2 μM(1 2 μMの原液から調製)に希釈し、次に、希釈緩衝液により5倍連続に希釈した。HEK293-CTLA4細胞(ヒトCTLA4タンパク質一過性発現HEK293細胞株であって、ヒトCTLA4発現カセットをHEK293細胞株に一過性的に形質移入することによって産生された)の密度を4×106個の細胞/mlに調節した。結合及び洗浄過程を行った後、濃度勾配を合計8個測定した。
図2Aは、本開示における二量体と可溶性ヒトCTLA4との結合を示した。これは、CTLA4に対して特異的であるISVDが二量体におけるN端にあるか、PD-L1に対して特異的であるISVDが二量体におけるN端にあるかにかかわらず、例えば、EC50値で表されるようなかなりの結合親和性が観察されたことが分かる。同様に、CTLA4に対して特異的であるISVDとPD-L1とに対して特異的であるISVDの間に、短いリンカー(例えば、GAP)又は長いリンカー(例えば、GGGGSGGGGSGGGGS)が使われる場合に、かなりの結合親和性が観察された。aPDL1.9-aCTLA4.34-Fc、aCTLA4.34-aPDL1.9-Fc、aPDL1.9-L-aCTLA4.34-Fc及びaCTLA4.34-L-aPDL1.9-FcのEC50値は、約40 ng/mLであった。
3.1方法
・3.1.1PD-L1のPD-L1又はCD80への結合に対する遮断効果
競合的ELISAにより、PD-L1とCD80との結合に対する本開示に係る二量体の遮断能を評価した。
競合的ELISAにより、CTLA4とCD80又はCD86との結合に対する本開示に係る二量体の遮断能を評価した。
図3Aは、PD-L1とPD-1との結合に対する本開示に係る二量体の遮断能を示した。これは、二量体におけるN末端にCTLA4に対して特異的であるISVDがあるか、二量体におけるN末端にPD-L1に対して特異的であるISVDがあるかにかかわらず、例えばIC50値で示されるような同様の遮断能が観察されたことが分かる。同様に、CTLA4に対して特異的であるISVDとPD-L1に対して特異的であるISVDとの間に、短いリンカー(例えば、GAP)又は長いリンカー(例えば、GGGGSGGGGSGGGGS)が使われた場合に、同様の遮断能が観察された。
4.1 方法
例えば、PBMC細胞によりIL-2を分泌するような、刺激免疫反応における本開示に係る二量体のインビトロ活性を検出した。つまり、PBMCは、異なる健康なドナーから分離され、それぞれ200ng/mlの濃度のブドウ球菌エンテロトキシンB(SEB)と共に飼育された。濃度の異なる(0.015nM、0.15nM、1.5nM又は15nM)本開示に係る二量体又は対照分子を加えた。5日飼育後、上清を採取して、Human IL-2 Duo Set ELISAキットでIL-2のレベルを解析した。
図4A~4Hは、本開示に係る二量体が添加されているSEBの刺激によるPBMCのIL-2分泌を示した。X座標は添加された二量体又は対照分子の濃度、Y座標は分泌されたIL-2の濃度を示した。
5.1 方法
・5.1.1 375-PD-L1細胞及びヒトPMBCにより転移される異種移植動物モデルにおける二量体の抗腫瘍効果の評価
本開示における二量体の抗腫瘍効果を評価するために、aA375-hPD-L1/hPBMC異種移植マウスモデルを用いた。ヒトPD-L1(A375-hPD-L1と称される)によりヒト悪性黒色腫細胞株A375を安定に形質移入し、担癌異種移植片モデルに用いた。つまり、A375-hPD-L1細胞を、健康なヒトPBMCと4:1の割合で混合させ、次に、NSGマウスに皮下に接種した。腫瘍接種後2~3時間、0.1 mg/kg、0.3 mg/kg、1 mg/kg、3 mg/kg、10 mg/kg、又は30 mg/kgの用量で週に2回、マウスに本開示における二量体(例えば、aPDL1.9-aCTLA4.34-Fc)を腹腔内投与した。所定の時点で腫瘍体積を測定した。
本開示における二量体は、マウスPD-L1又はマウスCTLA4と交差反応しないため、本実施例において、マウスCTLA4及びPD-L1遺伝子が対応するヒト遺伝子に置換されることでヒト化ダブルノックイン(KI)マウスを作成するようなダブルノックインマウスモデルを用いている。なお、マウスPD-L1をヒトPD-L1により置換することによって、マウス結腸がんMC38-hPD-L1細胞株(ヒトPD-L1タンパク質定常発現MC38細胞株であって、ヒトPD-L1発現カセットをMC38細胞株に安定に形質移入することによって産生された)を構築した。ダブルKI C57BL/6マウスの右前腹部にMC38-hPD-L1腫瘍細胞(3×105)を皮下に接種した。平均腫瘍の大きさが約60~80 mm3になると、担癌動物を、3群の1群にランダムに入れた。週に2回マウスに本開示における二量体(例えば、aPDL1.9-aCTLA4.34-Fc)又は対照免疫グロブリン(IVIG)を、合計5回静脈内投与した。
本開示における二量体の抗腫瘍効果は、図5A及び図5Bで表される。X座標は濃度の異なる二量体を投与後の日付、Y座標は測定された腫瘍体積を示す。
6.1 方法
Sprague Dawleyラットにおける単回用量薬動態学検討
8匹Sprague Dawley (SD)ラットに、10 mg/kgの単回用量の本開示における二量体(例えば、aPDL1.9-aCTLA4.34-Fc)を静脈内投与した。ラット血清における二量体の濃度を監視するために、一連の時点で血液試料を注射後29日目までに取得した。
Cmaxは、投与後速やかに約305.15±19.34 μg/mlの二量体になり、しかも、平均T1/2は、約142.59±29.89時間であって、平均AUC (0-384h)は、約10.58±0.68h*mg/mlであって、平均MRTは、127.86±20.75時間であった。その他の薬動態学パラメータは表3に、濃度-時間カーブは図6に示された。
Na125Iで本開示における二量体(例えばaPDL1.9-aCTLA4.34-Fc)又は対照分子(例えば、dAb-aCTLA4.34-Fc)を標識し、次に、PD10カラムで精製し、0.02 mol/Lのリン酸塩緩衝液を用いて、pH 7.4で洗浄し、標識分子の放射性を検出した。以上の実施例5のように、腫瘍細胞をマウスに注射し、腫瘍体積が約100~200 mm3になると、マウスを、3匹を1群として2群にランダムに分けて、1群を本開示における二量体(例えば、aPDL1.9-aCTLA4.34-Fc)の投与に用いて、もう1群を対照分子(例えば、dAb-aCTLA4.34-Fc)の投与に用いた。
ヒト以外の霊長類動物(例えば、カニクイザル)から本開示に係る二量体の安全性及び毒性を検出した。サルに本開示における二量体(例えば、aPDL1.9-aCTLA4.34-Fc)を投与すると、すべての治療群(100mg/kg/週と高く、150mg/kg/週のイピリムマブ及び150mg/kg/週のニボルマブの組み合わせの投与に該当する)に医薬品に関連する結腸炎が共に観察されなかった。 しかしながら、サルにイピリムマブ及びニボルマブを併用投与する場合(3mg/kg/週のイピリムマブ及び10mg/kg/週のニボルマブを併用投与するか、又は10mg/kg/週のイピリムマブ及び50mg/kg/週のニボルマブを併用投与する場合)、すべての治療群に治療に関連する下痢が見出されると共に、高用量群(10mg/kg/週のイピリムマブ及び50mg/kg/週のニボルマブの組み合わせ)における1匹のサルが、投与後23日目に急性胃拡張で死亡したことを発見した。このサルは、下痢及び体重減が続くことを観察した。すべての治療群について、治療に関連する結腸変化を観察した。
末期固形腫瘍に罹患しているヒト患者から、本開示における二量体(例えば、aPDL1.9-aCTLA4.34-Fc)の安全性、耐性、薬物動態学及び治療効果を検出した。
Claims (25)
- 2本のポリペプチド鎖からなる二量体であって、前記2本のポリペプチド鎖中のそれぞれが抗体Fcサブユニットを含有し、PD-L1に対して特異的である免疫グロブリン単一可変ドメイン(ISVD)、およびCTLA4に対して特異的であるISVDの両方を含有し、
前記PD-L1に対して特異的であるISVDは、それぞれ配列番号3、4及び5で表されるアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3を含有し、
前記CTLA4に対して特異的であるISVDは、それぞれ配列番号17、18及び19で表されるアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3を含有し、
前記2本のポリペプチド鎖の両方について、PD-L1に特異的な前記ISVDは、直接又はリンカーを介して、CTLA4に特異的な前記ISVDに融合される、
二量体。 - 前記2本のポリペプチド鎖中の1本または2本に対して、
PD-L1に対して特異的である前記ISVDが、直接又はリンカーを介して、CTLA4に対して特異的である前記ISVDに融合され、および
CTLA4に対して特異的である前記ISVDが、直接又はリンカーを介して、前記抗体Fcサブユニットに融合される、
請求項1に記載の二量体。 - 前記2本のポリペプチド鎖中の1本または2本の両方に対して、
PD-L1に対して特異的である前記ISVDが、直接又はリンカーを介して、CTLA4に対して特異的である前記ISVDに融合され、および
PD-L1に対して特異的である前記ISVDが、直接又はリンカーを介して、前記抗体Fcサブユニットに融合される、
請求項1又は2に記載の二量体。 - 前記抗体Fcサブユニットは、IgG Fcサブユニットに由来する、
請求項1~3のいずれか1項に記載の二量体。 - PD-L1に対して特異的である前記ISVDは、ヒトPD-L1 N末端IgVドメインに結合することができる、
請求項1~4のいずれか1項に記載の二量体。 - PD-L1に対して特異的である前記ISVDは、SEQ ID NO:64で表されるアミノ酸配列を有するヒトPD-L1 N末端IgVドメインの残基I54、Y56、E58、Q66、および/またはR113に結合することができる、
請求項1~5のいずれか1項に記載の二量体。 - PD-L1に対して特異的である前記ISVDは、さらに、SEQ ID NO:64で表されるアミノ酸配列を有するヒトPD-L1 N末端IgVドメインの残基D61、N63、V68、M115、S117、Y123、および/またはR125に結合することができる、
請求項6に記載の二量体。 - PD-L1に対して特異的である前記ISVDは、SEQ ID NO:6、13、14、および15のいずれかで表されるアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインを含む、
請求項1~7のいずれか1項に記載の二量体。 - PD-L1に対して特異的である前記ISVDは、SEQ ID NO:6で表されるアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインを含む、
請求項1~8のいずれか1項に記載の二量体。 - CTLA4に対して特異的である前記ISVDは、SEQ ID NO:20、および30~32のいずれかで表されるアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインを含む、
請求項1~9のいずれか1項に記載の二量体。 - CTLA4に対して特異的である前記ISVDは、SEQ ID NO:20で表されるアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインを含む、
請求項1~10のいずれか1項に記載の二量体。 - 前記2本のポリペプチド鎖中の1本または2本の両方は、SEQ ID NO:40~43のいずれかで表されるアミノ酸配列を有する、
請求項1~11のいずれか1項に記載の二量体。 - 前記2本のポリペプチド鎖中の1本または2本の両方は、SEQ ID NO:40で表されるアミノ酸配列を有する、
請求項1~12のいずれか1項に記載の二量体。 - 請求項1~13のいずれか1項に記載の二量体を含む、免疫抱合体。
- 請求項1~13のいずれか1項に記載の二量体をコードする、1種または複数種の単離される核酸。
- 請求項15に記載の1種または複数種の単離される核酸を含む、1種または複数種のベクター。
- 請求項15に記載の1種または複数種の単離される核酸もしくは請求項16に記載の1種または複数種のベクターを含む、単離される宿主細胞。
- 請求項1~13のいずれか1項に記載の二量体を作製する方法であって、
(i)前記二量体発現および形成が達成される条件で、請求項17に記載の宿主細胞を培養し、および
(ii)前記形成された二量体を採取することを含む、
方法。 - 下記(1)及び(3)又は(2)及び(3)を含む、医薬組成物:
(1)有効量の請求項1~13のいずれか1項に記載の二量体、
(2)請求項14に記載の免疫抱合体、
(3)薬学的に許容可能な賦形剤。 - 必要な被験者に対してがんを治療するために用いられる、
請求項1~13のいずれか1項に記載の二量体、請求項14に記載の免疫抱合体、または請求項19に記載の医薬組成物。 - 前記がんが、固形腫瘍、血液がん、および/またはリンパ腫を含有する、請求項20に記載する医薬組成物。
- 前記がんが、メラノーマ、結腸がん、乳がん、頸部がん、卵巣がん、腎臓がん、肺がん、膵臓がん、腹膜がん、および/または子宮がんを含有する、請求項20または21に記載する医薬組成物。
- 前記がんが、非小細胞肺がん(NSCLC)、トリプルネガティブ乳がん(TNBC)、および/または腎細胞がん(RCC)を含有する、請求項20~22の何れかに記載する医薬組成物。
- 被験者に対して、0.3~30mg/kgの用量で投与される事を特徴とする、請求項20~23のいずれかに記載の医薬組成物。
- 被験者に対して、静脈投与される事を特徴とする、請求項20~24のいずれかに記載の医薬組成物。
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