JP7173173B2 - ヒトt細胞白血病ウイルス1型(htlv-1)関連疾患の診断方法 - Google Patents
ヒトt細胞白血病ウイルス1型(htlv-1)関連疾患の診断方法 Download PDFInfo
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Description
[1] 被検者から採取した血液試料中のマーカータンパク質の量を測定する手順、ここで前記マーカータンパク質は表1及び表2に示すタンパク質から選択されるいずれか1以上である、と、
測定値が所定の基準値以上又は以下である場合に、前記被検者がヒトT細胞白血病ウイルス1型(HTLV-1)関連疾患についての確定診断前である場合においては前記被検者がHTLV-1関連疾患に罹患している又は発症する可能性が高いと判定し、前記被検者がHTLV-1関連疾患についての確定診断後である場合においては当該被検者におけるHTLV-1関連疾患が寛解している又は寛解する可能性が高いと判定する、手順と、
を含むHTLV-1関連疾患の診断方法。
[1A] 被検者から採取した血液試料中のマーカータンパク質の量を測定する手順、ここで前記マーカータンパク質は表1及び表2に示すタンパク質から選択されるいずれか1以上である、と、
測定値が所定の基準値以上又は以下である場合に、前記被検者がヒトT細胞白血病ウイルス1型(HTLV-1)キャリア又はHTLV-1関連疾患の寛解者である場合においては前記被検者がHTLV-1関連疾患に罹患している又は発症する可能性が高いと判定し、前記被検者がHTLV-1関連疾患の患者である場合においては当該被検者におけるHTLV-1関連疾患が寛解している又は寛解する可能性が高いと判定する、手順と、を含むHTLV-1関連疾患の診断方法。
[2] 前記HTLV-1関連疾患が、成人T細胞白血病(ATL)である、[1]の診断方法。
[2A] 前記マーカータンパク質が、表1の7, 9, 10, 17, 20, 21, 22, 25, 28, 33, 37, 39, 42, 43, 44, 46, 47, 48, 49, 56, 57, 59, 61, 62, 64, 65, 66, 67, 70, 73, 74, 75, 77, 79, 80, 81, 82, 88, 89, 92, 93, 94, 95, 97, 99, 100, 101, 102, 103, 106, 108, 112, 115, 120, 121, 123, 124, 125, 126, 128, 129, 131, 139, 141, 155, 156, 161, 164, 165, 167, 170, 172, 173, 174, 175, 181, 185, 187, 189, 195, 198, 199, 200, 203, 205, 207, 209, 211, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 230, 231, 232, 235, 236, 238, 240, 241, 242, 243, 244, 246, 247, 250, 251, 252, 253, 256, 259, 260, 269, 270, 271, 274, 279, 288, 289, 294, 296, 299, 300, 302, 306, 307, 309, 317, 318, 322, 327, 330, 331, 332, 339, 343, 345, 346, 347, 350, 357, 359, 364, 366, 373, 374, 375, 378, 382, 387, 390, 393, 394, 399, 400, 401, 405, 411, 418, 425, 427, 431, 438, 440, 446, 447, 450, 451, 452, 456, 460, 476, 477, 480, 481, 487, 504, 511, 524, 531, 534, 542, 548, 551, 552, 555, 573, 584, 586, 594, 606, 609, 621, 629番のタンパク質から選択されるいずれか1以上であり、
前記被検者が、HTLV-1キャリア又はHTLV-1関連疾患の寛解者であるときに、前記測定値の前記基準値以上への増加又は以下への減少が、該被検者のHTLV-1関連疾患の罹患又は発症可能性を示し、
その後、該被検者が、HTLV-1関連疾患の患者であるときに、前記測定値の前記基準値以下への減少又は以上への増加が、該被検者のHTLV-1関連疾患からの寛解又は寛解可能性を示す、[1]又は[2]の診断方法。
[2B] 前記マーカータンパク質が、表1の7, 9, 10, 17, 20, 21, 22, 25, 28, 33, 37, 39, 42, 43, 44, 46, 47, 48, 49, 56, 57, 59, 61, 62, 64, 65, 66, 67, 70, 73, 74, 75, 77, 79, 80, 81, 82, 88, 89, 92, 93, 94, 95, 97, 99, 100, 101, 102, 103, 106, 108, 112, 115, 120, 121, 123, 124, 125, 128, 129, 131, 139, 141, 155, 156, 161, 164, 165, 167, 172, 173, 174, 175, 181, 185, 187, 189, 195, 198, 199, 200, 203, 205, 207, 209, 211, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 230, 231, 232, 236, 238, 240, 241, 242, 243, 244, 246, 247, 250, 251, 252, 253, 256, 259, 260, 269, 271, 274, 279, 288, 289, 294, 296, 299, 300, 302, 306, 307, 309, 317, 318, 322, 327, 330, 331, 332, 339, 343, 345, 346, 347, 350, 357, 359, 364, 366, 373, 374, 375, 378, 382, 387, 390, 393, 394, 399, 400, 401, 405, 411, 418, 425, 427, 431, 438, 440, 446, 447, 450, 451, 452, 456, 460, 476, 477, 480, 481, 487, 504, 511, 524, 531, 534, 542, 548, 551, 552, 555, 573, 584, 586, 594, 606, 609, 629番のタンパク質から選択されるいずれか1以上であり、
前記被検者がHTLV-1キャリア又はHTLV-1関連疾患の寛解者であるときに、前記測定値の前記基準値以上への増加が、該被検者のHTLV-1関連疾患の罹患又は発症可能性を示し、
その後、該被検者がHTLV-1関連疾患の患者であるときに、前記測定値の前記基準値以下への減少が、該被検者のHTLV-1関連疾患からの寛解又は寛解可能性を示す、[2A]の診断方法。
[2C] 前記マーカータンパク質が、表1の126, 170, 235, 270, 621番のタンパク質から選択されるいずれか1以上であり、
前記被検者が、HTLV-1キャリア又はHTLV-1関連疾患の寛解者であるときに、前記測定値の前記基準値以下への減少が、該被検者のHTLV-1関連疾患の罹患又は発症可能性を示し、
その後、該被検者が、HTLV-1関連疾患の患者であるときに、前記測定値の前記基準値以上への増加が、該被検者のHTLV-1関連疾患からの寛解又は寛解可能性を示す、[2A]の診断方法。
[3] 前記被検者が、HTLV-1キャリアであり、該被検者のHTLV-1関連疾患の罹患又は発症可能性を判定する、[1]又は[2]の診断方法。
[4] 前記マーカータンパク質が、表1の1-61,63-482番のタンパク質から選択されるいずれか1以上である、[3]の診断方法。
[4A] 前記マーカータンパク質が、表1の1-61,63-482番のタンパク質から選択されるいずれか1以上であり、
前記被検者が、HTLV-1キャリア又はHTLV-1関連疾患の寛解者であり、
前記測定値の前記基準値以上への増加又は以下への減少が、該被検者のHTLV-1関連疾患の罹患又は発症可能性を示す、[1]又は[2]の診断方法。
[5] 前記マーカータンパク質が、表1の1-61,63-333番のタンパク質から選択されるいずれか1以上である、[3]又は[4A]の診断方法。
[6] 前記マーカータンパク質が、表1の1番及び/又は2番のタンパク質である、[3]又は[4A]の診断方法。
[7] 前記基準値が、HTLV-1キャリア群あるいは健常者群(HTLV-1キャリアでない)の血液試料での測定値の平均値、中央値又は最頻値である、[3]-[6]のいずれかの診断方法。
[8] 前記被検者が、HTLV-1関連疾患の患者であり、該被検者のHTLV-1関連疾患からの寛解又は寛解可能性を判定する、[1]又は[2]の診断方法。
[9] 前記マーカータンパク質が、表2の1-633番のタンパク質から選択されるいずれか1以上である、[8]の診断方法。
[9A] 前記マーカータンパク質が、表2の1-633番のタンパク質から選択されるいずれか1以上であり、
前記被検者が、HTLV-1関連疾患の患者であり、
前記測定値の前記基準値以上への増加又は以下への減少が、該被検者のHTLV-1関連疾患からの寛解又は寛解可能性を示す、[1]又は[2]の診断方法。
[10] 前記マーカータンパク質が、表2の1-440番のタンパク質から選択されるいずれか1以上である、[8]又は[9A]の診断方法。
[11] 前記基準値が、HTLV-1関連疾患群の血液試料での測定値の平均値、中央値又は最頻値である、[8]-[10]のいずれかの診断方法。
[12] 前記血液試料が、血漿である、[1]-[11]のいずれかの診断方法。
[13A] 表1の7, 9, 10, 17, 20, 21, 22, 25, 28, 33, 37, 39, 42, 43, 44, 46, 47, 48, 49, 56, 57, 59, 61, 62, 64, 65, 66, 67, 70, 73, 74, 75, 77, 79, 80, 81, 82, 88, 89, 92, 93, 94, 95, 97, 99, 100, 101, 102, 103, 106, 108, 112, 115, 120, 121, 123, 124, 125, 126, 128, 129, 131, 139, 141, 155, 156, 161, 164, 165, 167, 170, 172, 173, 174, 175, 181, 185, 187, 189, 195, 198, 199, 200, 203, 205, 207, 209, 211, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 230, 231, 232, 235, 236, 238, 240, 241, 242, 243, 244, 246, 247, 250, 251, 252, 253, 256, 259, 260, 269, 270, 271, 274, 279, 288, 289, 294, 296, 299, 300, 302, 306, 307, 309, 317, 318, 322, 327, 330, 331, 332, 339, 343, 345, 346, 347, 350, 357, 359, 364, 366, 373, 374, 375, 378, 382, 387, 390, 393, 394, 399, 400, 401, 405, 411, 418, 425, 427, 431, 438, 440, 446, 447, 450, 451, 452, 456, 460, 476, 477, 480, 481, 487, 504, 511, 524, 531, 534, 542, 548, 551, 552, 555, 573, 584, 586, 594, 606, 609, 621, 629番のタンパク質から選択されるいずれか1以上のタンパク質の検出試薬を含む、[13]の診断キット。
[13B] 表1の7, 9, 10, 17, 20, 21, 22, 25, 28, 33, 37, 39, 42, 43, 44, 46, 47, 48, 49, 56, 57, 59, 61, 62, 64, 65, 66, 67, 70, 73, 74, 75, 77, 79, 80, 81, 82, 88, 89, 92, 93, 94, 95, 97, 99, 100, 101, 102, 103, 106, 108, 112, 115, 120, 121, 123, 124, 125, 128, 129, 131, 139, 141, 155, 156, 161, 164, 165, 167, 172, 173, 174, 175, 181, 185, 187, 189, 195, 198, 199, 200, 203, 205, 207, 209, 211, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 230, 231, 232, 236, 238, 240, 241, 242, 243, 244, 246, 247, 250, 251, 252, 253, 256, 259, 260, 269, 271, 274, 279, 288, 289, 294, 296, 299, 300, 302, 306, 307, 309, 317, 318, 322, 327, 330, 331, 332, 339, 343, 345, 346, 347, 350, 357, 359, 364, 366, 373, 374, 375, 378, 382, 387, 390, 393, 394, 399, 400, 401, 405, 411, 418, 425, 427, 431, 438, 440, 446, 447, 450, 451, 452, 456, 460, 476, 477, 480, 481, 487, 504, 511, 524, 531, 534, 542, 548, 551, 552, 555, 573, 584, 586, 594, 606, 609, 629番のタンパク質から選択されるいずれか1以上のタンパク質の検出試薬を含む、[13A]の診断キット。
[13C] 表1の126, 170, 235, 270, 621番のタンパク質から選択されるいずれか1以上のタンパク質の検出試薬を含む、[13A]の診断キット。
[14] 表1の1-61,63-482番のタンパク質及び表2の1-633番のタンパク質から選択されるいずれか1以上のタンパク質の検出試薬を含む、[13]の診断キット。
[15] 表1の1-61,63-333番のタンパク質及び表2の1-440番のタンパク質から選択されるいずれか1以上のタンパク質の検出試薬を含む、[13]の診断キット。
[16] 表1の1番又は2番のタンパク質の検出試薬を含む、[13]の診断キット。
[17] 前記HTLV-1関連疾患が、成人T細胞白血病(ATL)である、[13]-[16]のいずれかの診断キット。
[18] 前記検出試薬が、前記タンパク質に特異的に結合する抗体、核酸又はアプタマーである、[13]-[17]のいずれかの診断キット。
[20] 前記HTLV-1関連疾患が、成人T細胞白血病(ATL)である、[19]の使用。
被検者から採取した血液試料中のマーカータンパク質の量を測定する手順、ここで前記マーカータンパク質は表1に示すタンパク質(ただし、62番のタンパク質を除く)から選択されるいずれか1以上である、と、
測定値が所定の基準値以上又は以下である場合に、前記被検者を治療対象として選択する手順と、
選択された治療対象に、化学療法及び/又は非化学療法を適用する手順と、を含む方法。
[22] 前記被検者が、HTLV-1キャリアである、[21]の方法。
[23] 前記HTLV-1関連疾患が、成人T細胞白血病(ATL)である、[22]の方法。
[24] 前記非化学療法が、がんワクチン療法である、[21]-[23]のいいずれかの方法。
被検者から採取した血液試料中のマーカータンパク質の量を測定する手順、ここで前記マーカータンパク質は表2に示すタンパク質から選択されるいずれか1以上である、と、
測定値が所定の基準値以上又は以下である場合に、前記被検者に対する化学療法及び/又は非化学療法の適用を増強、減弱、中断又は終了する手順と、を含む方法。
[26] 前記被検者が、HTLV-1関連疾患の患者である、[25]の方法。
[27] 前記HTLV-1関連疾患が、成人T細胞白血病(ATL)である、[25]の方法。
[28] 前記非化学療法が、がんワクチン療法である、[25]-[27]のいずれかの方法。
[28A] HTLV-1関連疾患の治療方法であって、
被検者から採取した血液試料中のマーカータンパク質の量を測定する手順、ここで前記マーカータンパク質は表1の7, 9, 10, 17, 20, 21, 22, 25, 28, 33, 37, 39, 42, 43, 44, 46, 47, 48, 49, 56, 57, 59, 61, 62, 64, 65, 66, 67, 70, 73, 74, 75, 77, 79, 80, 81, 82, 88, 89, 92, 93, 94, 95, 97, 99, 100, 101, 102, 103, 106, 108, 112, 115, 120, 121, 123, 124, 125, 126, 128, 129, 131, 139, 141, 155, 156, 161, 164, 165, 167, 170, 172, 173, 174, 175, 181, 185, 187, 189, 195, 198, 199, 200, 203, 205, 207, 209, 211, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 230, 231, 232, 235, 236, 238, 240, 241, 242, 243, 244, 246, 247, 250, 251, 252, 253, 256, 259, 260, 269, 270, 271, 274, 279, 288, 289, 294, 296, 299, 300, 302, 306, 307, 309, 317, 318, 322, 327, 330, 331, 332, 339, 343, 345, 346, 347, 350, 357, 359, 364, 366, 373, 374, 375, 378, 382, 387, 390, 393, 394, 399, 400, 401, 405, 411, 418, 425, 427, 431, 438, 440, 446, 447, 450, 451, 452, 456, 460, 476, 477, 480, 481, 487, 504, 511, 524, 531, 534, 542, 548, 551, 552, 555, 573, 584, 586, 594, 606, 609, 621, 629番のタンパク質から選択されるいずれか1以上である、と、
測定値が所定の基準値以上又は以下である場合に、前記被検者を治療対象として選択する手順と、
選択された治療対象に、化学療法及び/又は非化学療法を適用する手順と、
その後、測定値が所定の基準値以下又は以上となった場合に、前記被検者に対する化学療法及び/又は非化学療法の適用を増強、減弱、中断又は終了する手順と、を含む方法。
[28B] 前記被検者が、HTLV-1関連疾患の患者である、[28A]の方法。
[28C] 前記HTLV-1関連疾患が、成人T細胞白血病(ATL)である、[28A]の方法。
[28D] 前記非化学療法が、がんワクチン療法である、[28A]-[28C]のいずれかの方法。
被検者から採取した血液試料中のマーカータンパク質の量を測定する手順、ここで前記マーカータンパク質は表2に示すタンパク質から選択されるいずれか1以上である、と、
測定値が所定の基準値以上又は以下である場合に、前記治療が有効であると決定する手順と、
を含む、方法。
[30] 前記被検者が、HTLV-1関連疾患の患者である、[29]の方法。
[31] 前記HTLV-1関連疾患が、成人T細胞白血病(ATL)である、[30]の方法。
[32] 前記治療が、化学療法及び/又は非化学療法である、[29]-[31]のいずれかの方法。
[33] 前記非化学療法が、がんワクチン療法である、[32]の方法。
本発明に係るHTLV-1関連疾患の診断方法は以下の手順(1)(2)を含む。
(1)被検者から採取した血液試料中のマーカータンパク質の量を測定する手順(測定手順)。
(2)測定値が所定の基準値以上又は以下である場合に、前記被検者がHTLV-1関連疾患についての確定診断前である場合においては前記被検者がHTLV-1関連疾患に罹患している又は発症する可能性が高いと判定(発症診断)し、前記被検者がHTLV-1関連疾患についての確定診断後である場合においては当該被検者におけるHTLV-1関連疾患が寛解している又は寛解する可能性が高いと判定(寛解診断)する手順(判定手順)。
本発明において、「発症」には、初回の発症のみならず、寛解後の再発による発症も含まれるものとする。また、「寛解」には、初回の寛解のみならず、再発後の再寛解も含まれるものとする。したがって、手順(2)は、以下のように規定することもできる。
(2)測定値が所定の基準値以上又は以下である場合に、前記被検者がHTLV-1キャリア又はHTLV-1関連疾患の寛解者(HTLV-1罹患歴を有する者)である場合においては前記被検者がHTLV-1関連疾患に罹患している又は発症する可能性が高いと判定し、前記被検者がHTLV-1関連疾患の患者である場合においては当該被検者におけるHTLV-1関連疾患が寛解している又は寛解する可能性が高いと判定する。
実施例に記述されるように、本発明者らは、ATL患者の血液試料において、HTLV-1キャリアの血液試料に比して、有意に存在量が変化しているタンパク質(以下「マーカータンパク質」と称する)として表1に示すタンパク質を同定している。被検者から採取した血液試料中のこれらのマーカータンパク質の量に基づけば、HTLV-1関連疾患に罹患している又は発症する可能性が高い被検者を同定することが可能である。
例えばPA法(ゼラチン粒子凝集法)、CLEIA法(化学発光酵素免疫測定法)又はウェスタンブロット法により血中の抗HTLV-1抗体の有無を検出することによりHTLV-1キャリアを選別できる。
また、例えばサザン法によりHTLV-1のゲノムへの挿入の有無を検出することによりHTLV-1キャリアを選別することもできる。
マーカータンパク質は、好ましくは表1の1-61,63-482番のタンパク質から選択されるいずれか1以上であり、より好ましくは1-61, 63-333番のタンパク質から選択されるいずれか1以上であり、さらに好ましくは1番及び/又は2番のタンパク質である。
マーカータンパク質は、好ましくは表2の1-633番のタンパク質から選択されるいずれか1以上であり、より好ましくは1-440番のタンパク質から選択されるいずれか1以上である。
「完全長タンパク質」は、インビボで発現されるのと同じ天然型アミノ酸配列を含有するタンパク質又はその変異体をいう。断片は、完全長タンパク質のうちの一部のアミノ酸配列であって、例えば5-10、11-20、21-30、31-40、または41-50アミノ酸長であり、51アミノ酸長以上であってもよい。
抗体は、モノクローナルであってもポリクローナルであってもよく、IgG、IgM、IgA、IgD及びIgEから選択される任意のクラスであってよい。
これらの検出試薬の調製方法は当技術分野において公知である。また、適切な検出試薬は商業的にも入手可能である。
検出試薬は、好ましくは、市販の蛍光分析装置で検出するのに適した励起波長及び発光波長を有する蛍光物質が標識される。蛍光物質としては、フィコエリトリン(PE)、フルオレセインイソチオシアネート(FITC)、ローダミン(RH)、テキサスレッド(TX)、Cy3、ヘキスト33258、および4',6-ジアミジノ-2-フェニルインドール(DAPI)等が挙げられる。
蛍光標識された検出試薬を用いる場合、まず検出試薬を固相に結合させる。次に、固相に血液試料を接触させて反応させた後、必要に応じて洗浄を行う。検出試薬を介して固相に保持されたマーカータンパク質の蛍光標識から生じる蛍光を検出することにより、その信号強度に基づいてタンパク質量を決定できる。
さらに、例えばSomaLogic社が提供するSOMAscanなどのタンパク質受託測定サービスを利用して測定することもできる。
本手順では、測定手順(1)で得られた測定値を所定の基準値と比較し、測定値が基準値以上又は以下である場合に、被検者がHTLV-1関連疾患についての確定診断前(HTLV-1キャリア又はHTLV-1関連疾患の寛解者)である場合においては被検者がHTLV-1関連疾患に罹患している又は発症する可能性が高いと判定(発症診断)し、前記被検者がHTLV-1関連疾患についての確定診断後(HTLV-1関連疾患の患者)である場合においては当該被検者におけるHTLV-1関連疾患が寛解している又は寛解する可能性が高いと判定(寛解診断)する。
これらのATL患者において有意に存在量が増加しているマーカータンパク質に関しては、当該マーカータンパク質の量が基準値以上、好ましくは基準値よりもプラス1-5%、より好ましくは6-10%、さらに好ましくは11-25%、最も好ましくは26-50%増加している場合に、被検者がHTLV-1関連疾患に罹患している又は発症する可能性が高いと判定される。基準値よりも大きく増加している程、判定の確度は向上するため、所望により基準値プラス51%以上、100%以上、150%以上、あるいは200%以上の増加を指標としてもよい。
これらのATL患者において有意に存在量が減少しているマーカータンパク質に関しては、当該マーカータンパク質の量が基準値以下、好ましくは基準値よりもマイナス1-5%、より好ましくは6-10%、さらに好ましくは11-25%、最も好ましくは26-50%減少している場合に、被検者がHTLV-1関連疾患に罹患している又は発症する可能性が高いと判定される。基準値よりも大きく減少している程、判定の確度は向上するため、所望により基準値マイナス51%以上、100%以上、150%以上、あるいは200%以上の減少を指標としてもよい。
すなわち、ATL患者の血漿において、HTLV-1キャリアの血漿に比して、有意に存在量が増加しているマーカータンパク質に関しては、当該マーカータンパク質の量の経時的な増加(例えば、基準値未満の値から基準値超過の値への増加)を認める場合、被検者がHTLV-1関連疾患に罹患している又は発症する可能性がより高いと判定される。経時的な増加が急激である場合には、被検者の急性転化を診断できる可能性がある。
また、ATL患者の血漿において、HTLV-1キャリアの血漿に比して、有意に存在量が減少しているマーカータンパク質に関しては、当該マーカータンパク質の量の経時的な減少(例えば、基準値超過の値から基準値未満の値への減少)を認める場合、被検者がHTLV-1関連疾患に罹患している又は発症する可能性がより高いと判定される。経時的な減少が急激である場合には、被検者の急性転化を診断できる可能性がある。
これらのATL寛解者において有意に存在量が増加しているマーカータンパク質に関しては、当該マーカータンパク質の量が基準値以上、好ましくは基準値よりもプラス1-5%、より好ましくは6-10%、さらに好ましくは11-25%、最も好ましくは26-50%増加している場合に、被検者のHTLV-1関連疾患が寛解している又は寛解する可能性が高いと判定される。基準値よりも大きく増加している程、判定の確度は向上するため、所望により基準値プラス51%以上、100%以上、150%以上、あるいは200%以上の増加を指標としてもよい。
これらのATL寛解者において有意に存在量が減少しているマーカータンパク質に関しては、当該マーカータンパク質の量が基準値以下、好ましくは基準値よりもマイナス1-5%、より好ましくは6-10%、さらに好ましくは11-25%、最も好ましくは26-50%減少している場合に、被検者のHTLV-1関連疾患が寛解している又は寛解する可能性が高いと判定される。基準値よりも大きく減少している程、判定の確度は向上するため、所望により基準値マイナス51%以上、100%以上、150%以上、あるいは200%以上の減少を指標としてもよい。
すなわち、ATL寛解者の血漿において、ATL患者の血漿に比して、有意に存在量が増加しているマーカータンパク質に関しては、当該マーカータンパク質の量の経時的な増加(例えば、基準値未満の値から基準値超過の値への増加)を認める場合、被検者のHTLV-1関連疾患が寛解している又は寛解する可能性がより高いと判定される。さらに、この間に該被検者がHTLV-1関連疾患に対する治療を受けていた場合には、マーカータンパク質の量の有意な減少は当該治療の有効性を示す。
また、ATL寛解者の血漿において、ATL患者の血漿に比して、有意に存在量が減少しているマーカータンパク質に関しては、当該マーカータンパク質の量の経時的な減少(例えば、基準値超過の値から基準値未満の値への減少)を認める場合、被検者のHTLV-1関連疾患が寛解している又は寛解する可能性がより高いと判定される。さらに、この間に該被検者がHTLV-1関連疾患に対する治療を受けていた場合には、マーカータンパク質の量の有意な減少は当該治療の有効性を示す。
特に教師データを用いた判別分析によるものが好ましい。2群(例えば、本発明のHTLV-1キャリア群とATL患者群)の判別を行う場合、線形判別分析で十分である場合も多い。
しかし、線形判別分析は各群の母分散が等しいとの仮定に基づくことからその適用に制約がある。したがって、より複雑なデータを用いて判別を行う場合は、非線形判別分析や機械学習による判別分析を用いることが望ましい。非線形判別分析としては、マハラノビス距離による判別分析が挙げられる。機械学習による判別分析としてはk近傍法、ナイーブベイズ分類器、決定木、ニューラルネットワーク、サポートベクターマシン、さらにバギング法、ブースティング法、ランダムフォレスト法といった集団学習が挙げられる。このような手法はパターン認識の分野において発展しており、その知見を本発明においても応用することができる。
また教師データを用いない解析手法である、主成分分析、階層クラスタリング、非階層クラスタリング、自己組織化マップといった手法を用いても、HTLV-1関連疾患の罹患状態が既知である被検者データと共に解析を行うことによって判別方法とすることもできる。
[治療手順(3)]
本発明に係るHTLV-1関連疾患の診断方法は、上述の手順(2)でHTLV-1関連疾患に罹患している又は発症する可能性が高いと判定された被検者に対する治療方法に応用され得る。該治療方法は、以下の手順(3)を含む。
(3)選択された治療対象に、化学療法及び/又は非化学療法を適用する手順(治療手順)。
また、マーカータンパク質の量の経時的変化が大きいかあるいは急激であり、HTLV-1関連疾患に罹患している又は発症する可能性がより高いと判定された治療対象あるいは急性転化の可能性がある治療対象には、多剤併用化学療法と併用してあるいはこれに替えて、同種造血幹細胞移植、T細胞療法、がんワクチン療法及びサイトカイン療法などの高度療法を開始する。
がんワクチン療法には、ペプチドワクチンあるいは樹状細胞ワクチンなどを適用できる。
これらの療法には、免疫チェックポイント阻害薬が組み合わせて用いられ得る。
HTLV-1キャリア40名、ATL患者40名及びATL寛解者5名の血漿中のタンパク質量を測定し、比較した。
HTLV-1キャリア(以下「キャリア群」と称する)の血漿、ATL患者(以下「患者群」と称する)及びATL寛解者(以下「寛解群」と称する)の血漿は、琉球大学の沖縄バイオインフォメーションバンク(ATL/HTLV-1バイオバンク)から提供を受けた。
遊離させたビオチン標識タンパク質-SOMAmer試薬複合体及び未結合のSOMAmer試薬を、第2のストレプトアビジン被覆ビーズとインキュベートし、ビオチン標識タンパク質-SOMAmer試薬複合体を第2のストレプトアビジン被覆ビーズに結合させた。ビーズを洗浄して、未結合のSOMAmer試薬を除去した。ビオチン標識タンパク質-SOMAmer試薬複合体を結合する第2のストレプトアビジン被覆ビーズから変性条件下でSOMAmer試薬を遊離させた。
SOMAmer試薬をDNAマイクロアレイにハイブリダイズさせ、SOMAmer試薬中のシアニン3から蛍光を検出した。検出された蛍光強度値を標準化及び較正し、相対蛍光単位(RFU)としてタンパク質量を決定した。
なお、62番のタンパク質Nectin-like protein 2(UniProt ID: Q9BY67)は、ATL患者から採取した白血病細胞で特異的に発現する遺伝子として特許文献1に報告されているTSLC1タンパク質と同一であった。
番号334-482のタンパク質の増加又は減少はp値が0.01未満であった。
番号483-631のタンパク質の増加又は減少はp値が0.05未満であった。
番号441-633のタンパク質の増加又は減少はp値が0.01未満であった。
番号634-790のタンパク質の増加又は減少はp値が0.05未満であった。
これらのタンパク質は、キャリア群と患者群を鑑別するための発症マーカーとしても、患者群と寛解群を鑑別するための寛解マーカーとしても利用できる可能性があり、ATLの診断のために特に有用なマーカーとなり得る。
Claims (6)
- 被検者から採取した血液試料中のマーカータンパク質の量を測定する手順、ここで前記マーカータンパク質は表1に示す1番のタンパク質である、と、
前記被検者がヒトT細胞白血病ウイルス1型(HTLV-1)キャリア又はHTLV-1関連疾患の寛解者である場合においては、測定値が所定の基準値以上である場合に、前記被検者がHTLV-1関連疾患に罹患している又は発症する可能性が高いことを示し、前記被検者がHTLV-1関連疾患の患者である場合においては、測定値が所定の基準値以下である場合に、当該被検者におけるHTLV-1関連疾患が寛解している又は寛解する可能性が高いことを示す、手順と、を含む前記被検者におけるHTLV-1関連疾患の罹患又は発症可能性の決定のための方法。 - 前記HTLV-1関連疾患が、成人T細胞白血病(ATL)である、請求項1に記載の方法。
- 前記被検者が、HTLV-1キャリア又はHTLV-1関連疾患の寛解者であり、
前記測定値の前記基準値以上への増加が、該被検者のHTLV-1関連疾患の罹患又は発症可能性を示す、請求項1又は2に記載の方法。 - 前記血液試料が、血漿である、請求項1-3のいずれか一項に記載の方法。
- 表1に示す1番のタンパク質の検出試薬を含む、HTLV-1関連疾患の診断キット。
- HTLV-1関連疾患の診断のための、表1に示す1番のタンパク質の使用。
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