JP6818797B2 - 強靭なt細胞用のpr13.5プロモータ及び抗体応答 - Google Patents
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Description
本発明は、Pr13.5プロモータを含む又はそれから成る単離核酸を包含する。本発明の文脈内で、「Pr13.5プロモータ」は、配列番号1と少なくとも95%の同一性を有する少なくとも40塩基の核酸配列の少なくとも1コピーを含む。従って、「Pr13.5プロモータ」は、様々な実施態様において、MVAヌクレオチド配列、合成配列、又はMVA以外のポックスウイルス由来の類似のポックスウイルス配列を言い得る。好ましくは、Pr13.5プロモータは、配列番号1と少なくとも96%、97%、98%、99%又は100%の同一性を有する少なくとも40塩基の核酸配列の少なくとも1コピーを含む。核酸配列は、好ましくは、40、41、42、43、44又は45塩基長である。
グループ(UWGCG)より入手可能な、GAPコンピュータープログラム・バージョン6.0を用いて配列情報を比較することによって決定され得る。GAPプログラムの好ましいデフォルトパラメータは以下を含む:(1)ヌクレオチドの(同一性について1の値、非同一性について0の値を含む)単一の比較マトリックス、及びSchwartz and Dayhoff, eds., Atlas of Protein Sequence and Structure, National Biomedical Research Foundation, pp. 353−358, 1979によって記載された、Gribskov及びBurgess, Nucl. Acids Res. 14: 6745, 1986の重み付け比較マトリックス;(2)各ギャップについて3.0のペナルティ、各ギャップ中の各シンボルについて追加の0.10のペナルティ;そして、(3)エンド・ギャップについてはペナルティ無し。当業者によって使用される、配列比較についての他のプログラムを使用できる。
TAAAAATAGAAACTATAATCATATAATAGTGTAGGTTGGTAGTATTGCTCTTGTGACTAGAGACTTTAGTTAAGGTACTGTAAAAATAGAAACTATAATCATATAATAGTGTAGGTTGGTAGTA (配列番号2)。
本発明は、非相同性核酸配列に作動可能に連結されたPr13.5プロモータを含む組換えポックスウイルスベクターであって、内因性ウイルスPr13.5プロモータに非相同性核酸配列を作動可能に連結するように非相同性核酸配列がポックスウイルスの13.5ORFに挿入される組換えポックスウイルスベクターを包含する。別の実施態様では、非相同性核酸配列は、Pr13.5プロモータに連結され、13.5 ORF以外のゲノムの部位に挿入される。
本発明は、本発明に従う組換えポックスウイルスベクター、好ましくはMVAウイルスを含むキットを提供する。本キットは、ヒトを含む哺乳動物にウイルスを投与するための教示と共に、組換えポックスウイルスベクター、好ましくはMVAウイルスの少なくとも1、2、3、4もしくはそれ以上の容器又はバイアルを含み得る。教示は、組換えウイルスが、特定の時点(すなわち、先の投与後の少なくとも4週、少なくとも6週、少なくとも8週)に1又は複数(すなわち、2、3、4、5、6等)投薬量で、哺乳動物、好ましくはヒトに投与されることを示し得る。好ましくは、教示は、組換えウイルスが、少なくとも1、少なくとも2、少なくとも3又は少なくとも4投薬量で、哺乳動物、好ましくはヒトに投与されることを示す。
本発明は、宿主においてCD8 T細胞及び/又は抗体応答を誘導する方法を包含する。好ましい実施態様では、本方法は、Pr13.5プロモータを含む組換えポックスウイルス、好ましくはMVAの少なくとも1、2、3、4又は5回免疫を、ヒトを含む哺乳動物に投与することを含む。
本発明に従う組換えポックスウイルス、好ましくは、MVAは、ヒトを含みそして免疫不全ヒトさえ含む幅広い範囲の哺乳動物の治療のために使用され得る。従って、本発明はまた、医薬組成物、及びヒトを含む哺乳動物において免疫応答を誘導するためのワクチンを提供する。
本発明の組換えMVAによる免疫は、強靭なCD8 T細胞応答を誘導し得る。好ましい実施態様では、第1、第2、第3、第4、第5等の免疫後に、組換えMVAは、哺乳動物、好ましくはヒトにおいて、コードされた抗原に対して強靭なCD8 T細胞応答を誘導し、それは、MVAベクターによってコードされた免疫優性ウイルスCD8 T細胞エピトープ、例えばTSYKFESV(配列番号5)に対するCD8 T細胞応答よりも高い。好ましくは、第2、第3、第4、第5等の免疫後に、免疫優性T細胞応答は、哺乳動物、好ましくはヒトにおいて、コードされた抗原に対して誘導される。好ましくは、第2、第3、第4、第5等の免疫後に、組換えMVAは、コードされた抗原に対する哺乳動物、好ましくはヒトにおけるCD8 T細胞応答を誘導し、それは、総CD8 T細胞の少なくとも10%、15%、20%、25%、30%又は35%である。好ましくは、第2、第3、第4、第5等の免疫後に、組換えMVAは、コードされた抗原に対する哺乳動物、好ましくはヒトにおけるCD8 T細胞応答を、単回投与後にコードされた抗原に対する応答と比較して、少なくとも2、3、4、5又は10倍(すなわち、総CD8 T細胞の少なくとも1%〜2%、3%、4%、5%又は10%)増加させるか、あるいは、コードされた抗原に対する哺乳動物、好ましくはヒトにおけるT細胞応答を、ウイルス抗原(例えば、B8R)のT細胞応答と比較して、少なくとも2、3、4、5又は10倍増加させる。好ましくは、組換えMVAは、コードされた抗原に対する哺乳動物、好ましくはヒトにおけるCD8 T細胞応答を、単回投与後にウイルス抗原(例えば、B8R)に対するT細胞応答と比較して、少なくとも2、3、4、5又は10倍生じる。最も好ましくは、コードされた抗原に対する哺乳動物、好ましくはヒトにおけるCD8 T細胞応答は、2、3、4又は5回等の免疫により、ウイルス後期抗原(例えば、B8R)に対する応答よりも高度に増加する。
なお、本願は、特許請求の範囲に記載の発明に関するものであるが、他の態様として以下も包含し得る。
1.ヒトにおける新生抗原に対する強靭なCD8 T細胞応答を誘発する方法であって、組換え改変ワクシニアアンカラ(MVA)ウイルスの1又はそれ以上の投与をヒトに投与することを含み、
組換えMVAが新生抗原をコードするヌクレオチド配列に作動可能に連結したPr13.5プロモータを含み、
Pr13.5プロモータが、配列番号1と少なくとも95%の同一性を有する少なくとも40塩基の核酸配列の少なくとも1コピーを含む、方法。
2.前記Pr13.5プロモータが配列番号1と少なくとも98%の同一性を有する少なくとも40塩基の核酸配列の少なくとも1コピーを含む、上記1に記載の方法。
3.前記Pr13.5プロモータが配列番号1と少なくとも100%の同一性を有する少なくとも40塩基の核酸配列の少なくとも1コピーを含む、上記1に記載の方法。
4.前記Pr13.5プロモータが配列番号1と少なくとも95%の同一性を有する少なくとも31ヌクレオチドの第2ヌクレオチド配列の少なくとも1コピーを含む、上記1に記載の方法。
5.前記Pr13.5プロモータが配列番号1と少なくとも95%の同一性を有する少なくとも31ヌクレオチドの第2ヌクレオチド配列の少なくとも1コピーを含む、上記2に記載の方法。
6.前記Pr13.5プロモータが配列番号1と少なくとも95%の同一性を有する少なくとも31ヌクレオチドの第2ヌクレオチド配列の少なくとも1コピーを含む、上記3に記載の方法。
7.前記Pr13.5プロモータが配列番号1と少なくとも98%の同一性を有する少なくとも31ヌクレオチドの第2ヌクレオチド配列の少なくとも1コピーを含む、上記1に記載の方法。
8.前記Pr13.5プロモータが配列番号1と少なくとも100%の同一性を有する少なくとも31ヌクレオチドの第2ヌクレオチド配列の少なくとも1コピーを含む、上記1に記載の方法。
9.前記Pr13.5プロモータが配列番号1と少なくとも100%の同一性を有する少なくとも31ヌクレオチドの第2ヌクレオチド配列の少なくとも1コピーを含む、上記2に記載の方法。
10.前記Pr13.5プロモータが配列番号1と少なくとも100%の同一性を有する少なくとも31ヌクレオチドの第2ヌクレオチド配列の少なくとも1コピーを含む、上記3に記載の方法。
11.前記Pr13.5プロモータが配列番号1と少なくとも100%の同一性を有する少なくとも40ヌクレオチドのヌクレオチド配列の2コピーを含む、上記1に記載の方法。
12.前記Pr13.5プロモータが配列番号2を含む、上記1に記載の方法。
13.新生抗原をコードするヌクレオチド配列に作動可能に連結したPr13.5プロモータを含む組換え改変ワクシニアアンカラ(MVA)ウイルスであって、
Pr13.5プロモータが配列番号1と少なくとも95%の同一性を有する少なくとも40塩基の核酸配列の少なくとも1コピーを含む、組換え改変ワクシニアアンカラ(MVA)ウイルス。
14.前記Pr13.5プロモータが配列番号1と少なくとも98%の同一性を有する少なくとも40塩基の核酸配列の少なくとも1コピーを含む、上記13に記載の組換えMVA。
15.前記Pr13.5プロモータが配列番号1と少なくとも100%の同一性を有する少なくとも40塩基の核酸配列の少なくとも1コピーを含む、上記13に記載の組換えMVA。
16.前記Pr13.5プロモータが配列番号1と少なくとも95%の同一性を有する少なくとも31ヌクレオチドの第2ヌクレオチド配列の少なくとも1コピーを含む、上記13に記載の組換えMVA。
17.前記Pr13.5プロモータが配列番号1と少なくとも95%の同一性を有する少なくとも31ヌクレオチドの第2ヌクレオチド配列の少なくとも1コピーを含む、上記14に記載の組換えMVA。
18.前記Pr13.5プロモータが配列番号1と少なくとも95%の同一性を有する少なくとも31ヌクレオチドの第2ヌクレオチド配列の少なくとも1コピーを含む、上記15に記載の組換えMVA。
19.前記Pr13.5プロモータが配列番号1と少なくとも98%の同一性を有する少なくとも31ヌクレオチドの第2ヌクレオチド配列の少なくとも1コピーを含む、上記13に記載の組換えMVA。
20.前記Pr13.5プロモータが配列番号1と少なくとも100%の同一性を有する少なくとも31ヌクレオチドの第2ヌクレオチド配列の少なくとも1コピーを含む、上記13に記載の組換えMVA。
21.前記Pr13.5プロモータが配列番号1と少なくとも100%の同一性を有する少なくとも31ヌクレオチドの第2ヌクレオチド配列の少なくとも1コピーを含む、上記14に記載の組換えMVA。
22.前記Pr13.5プロモータが配列番号1と少なくとも100%の同一性を有する少なくとも31ヌクレオチドの第2ヌクレオチド配列の少なくとも1コピーを含む、上記15に記載の組換えMVA。
23.前記Pr13.5プロモータが配列番号1と少なくとも100%の同一性を有する少なくとも40ヌクレオチドのヌクレオチド配列の2コピーを含む、上記13に記載の組換えMVA。
24.前記Pr13.5プロモータが配列番号2を含む、上記13に記載の組換えMVA。
25.新生抗原をコードするヌクレオチド配列に作動可能に連結したPr13.5プロモータを含む組換えポックスウイルスであって、
Pr13.5プロモータが配列番号1と少なくとも95%の同一性を有する少なくとも40塩基の核酸配列の少なくとも1コピーを含む、組換えポックスウイルス。
10のMOI(TCID50/細胞)で、MVA−BNによってHeLa細胞を感染させ、感染後2及び8時間に総RNAを調製した。様々なMVA ORFに特異的なプライマーを作製し、これらのORFをコードするMVA RNAの代表的なPCR産物を作製するためにRACE−PCR(FirstChoice(登録商標)RLM−RACE Kit, Life Technologies, ダルムシュタット, ドイツ)を使用した。転写開始部位を同定するために、PCR産物をシークエンスした。この情報に基づいて、これらのORFをコードするRNAについてプロモータを同定した。卵アルブミン(OVA)遺伝子:MVA13.5(CVA022;WR018)、MVA050L(E3L;WR059)、MVA022L(K1L;WR032)、及びMVA170R(B3R;WR185)の発現を駆動するために、MVAコンストラクト(Baur等, Journal of Virology, Vol. 84 (17): 8743−8752 (2010))に、以下のORF用のMVAプロモータを挿入した。
MOI 10でのMVA組換えウイルスによるHeLa細胞の感染は、氷上で1時間、風邪ウイルス付着を用いて行った。付着後、細胞を洗浄し、ゼロ時間(0時間)時点で収集するか、あるいは、他の時点のための収集のために37℃でインキュベートした。0.5、1、2、4及び8時間p.i.(感染後)に試料を収集した。細胞をホモジナイズし、総RNAを抽出した。このRNAは消化されたDNアーゼであり、cDNAはオリゴ(dT)プライミングを用いて合成した。得られたcDNA調製物は、OVA及びアクチンcDNAの同時増幅のためのTaqman型qPCR反応における鋳型として使用した。試料をApplied Biosystem製のAB7500サイクラーでランした。結果を図3に示す。
10% FCSを含むDMEMでHeLa細胞を培養した。組換えMVAウイルスの10のMOI(10TCID50/細胞)でHeLa細胞を感染した1、2、4、6、8及び24時間p.i.(感染後)に感染された細胞を収集し、固定し、透過処理を行った。各試料について、細胞の半分は、ウサギ抗ニワトリOVA抗体を用いてOVAタンパク質について染色し、細胞の残り半分は、ウサギ抗VACVポリクローナル抗体を用いてMVA抗原について染色した。FACSCaliburフローサイトメトリアナライザ(BD Biosciences)及びFlowJoソフトウェアを用いて、試料を分析した。結果を図4に示す。
試験にはマウス群(C57/Bl6)を使用した。各群は、計3回の免疫を受けた。PBS−注射群は、免疫応答のコントロールとして機能した。試験中、免疫応答の分析のために、血液は尾の血管から採取した。
約100〜120μlの血液/マウスをFACS/ヘパリン緩衝液に集めた。PBMCはRBC溶解緩衝液で赤血球を溶解することによって調製した。PBMCは、次いで、抗CD8α−FITC、CD44−PerCPCy5.5、及びMHCクラスIデキストラマーの各々のH−2Kb結合ペプチド、SIINFEKL(配列番号4)又はTSYKFESV(配列番号5)と複合化されたMHCクラスIデキストラマーを用いて、OVA−及びB8R−特異的CD8 T細胞のための単一反応で同時染色した。MHCクラスI SIINFEKL−デキストラマー(配列番号4)はPEで標識し、TSYKFESV−デキストラマー(配列番号5)はAPCで標識した。BD Biosciences BD LSR II装置上でフローサイトメトリによって、染色した細胞を分析した。1試料当たり1万個のCD8+ T細胞を取得した。結果を図5〜6に示す。
Claims (14)
- 組換え改変ワクシニアアンカラ(MVA)ウイルスをヒトに1回またはそれ以上投与することを含むヒトにおける新生抗原に対する強靭なCD8 T細胞応答の誘発に使用するための組換え改変ワクシニアアンカラ(MVA)ウイルスであって、
組換えMVAが新生抗原をコードするヌクレオチド配列に作動可能に連結したPr13.5プロモータを含み、
Pr13.5プロモータが、配列番号1と少なくとも95%の同一性を有する少なくとも40塩基の核酸配列の少なくとも1コピー、および配列番号1と少なくとも95%の同一性を有する少なくとも31ヌクレオチドの第2のヌクレオチド配列の少なくとも1コピーを含み、
前記プロモータが、単回の免疫後に、プロモータが配列番号6によって示されるPrSプロモータによって置き換えられた対応のMVAコンストラクトで生成されるよりも少なくとも1.5倍多い新生抗原特異的CD8 T細胞を生成する、組換え改変ワクシニアアンカラ(MVA)ウイルス。 - 前記Pr13.5プロモータが配列番号1と少なくとも98%の同一性を有する少なくとも40塩基の核酸配列の少なくとも1コピーを含む、請求項1に記載のMVA。
- 前記Pr13.5プロモータが配列番号1と100%の同一性を有する少なくとも40塩基の核酸配列の少なくとも1コピーを含む、請求項1または2に記載のMVA。
- 前記Pr13.5プロモータが配列番号1と少なくとも98%の同一性を有する少なくとも31ヌクレオチドの第2ヌクレオチド配列の少なくとも1コピーを含む、請求項1〜3のいずれか1つに記載のMVA。
- 前記Pr13.5プロモータが配列番号1と100%の同一性を有する少なくとも31ヌクレオチドの第2ヌクレオチド配列の少なくとも1コピーを含む、請求項1〜3のいずれか1つに記載のMVA。
- 前記Pr13.5プロモータが配列番号1と100%の同一性を有する少なくとも40ヌクレオチドのヌクレオチド配列の2コピーを含む、請求項1に記載のMVA。
- 前記Pr13.5プロモータが配列番号2を含む、請求項1に記載のMVA。
- 新生抗原をコードするヌクレオチド配列に作動可能に連結したPr13.5プロモータを含む組換え改変ワクシニアアンカラ(MVA)ウイルスであって、
Pr13.5プロモータが配列番号1と少なくとも95%の同一性を有する少なくとも40塩基の核酸配列の少なくとも1コピー、および配列番号1と少なくとも95%の同一性を有する少なくとも31ヌクレオチドの第2のヌクレオチド配列の少なくとも1コピーを含み、
前記プロモータが、単回の免疫後に、プロモータが配列番号6によって示されるPrSプロモータによって置き換えられた対応のMVAコンストラクトで生成されるよりも少なくとも1.5倍多い新生抗原特異的CD8 T細胞を生成する、組換え改変ワクシニアアンカラ(MVA)ウイルス。 - 前記Pr13.5プロモータが配列番号1と少なくとも98%の同一性を有する少なくとも40塩基の核酸配列の少なくとも1コピーを含む、請求項8に記載の組換えMVA。
- 前記Pr13.5プロモータが配列番号1と100%の同一性を有する少なくとも40塩基の核酸配列の少なくとも1コピーを含む、請求項8または9に記載の組換えMVA。
- 前記Pr13.5プロモータが配列番号1と少なくとも98%の同一性を有する少なくとも31ヌクレオチドの第2ヌクレオチド配列の少なくとも1コピーを含む、請求項8〜10のいずれか1つに記載の組換えMVA。
- 前記Pr13.5プロモータが配列番号1と100%の同一性を有する少なくとも31ヌクレオチドの第2ヌクレオチド配列の少なくとも1コピーを含む、請求項8〜10のいずれか1つに記載の組換えMVA。
- 前記Pr13.5プロモータが配列番号1と100%の同一性を有する少なくとも40ヌクレオチドのヌクレオチド配列の2コピーを含む、請求項8に記載の組換えMVA。
- 前記Pr13.5プロモータが配列番号2を含む、請求項8に記載の組換えMVA。
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