JP6519056B2 - 膵腫瘍の検出方法、抗体及び膵腫瘍検出用キット - Google Patents
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Description
本発明の第一の実施形態は、抗APOA2抗体(抗APOA2タンパク質末端抗体及び抗APOA2タンパク質非末端抗体を含む)、及びその断片である。
本明細書において「APOA2タンパク質」とは、各生物種APOA2タンパク質が該当するが、好ましくはヒト由来のAPOA2タンパク質(GenBankアクセッションNo.NP_001634.1)である。具体的には、配列番号1、2又は3に示されるヒト由来の野生型APOA2タンパク質のバリアントが含まれ、さらに、それらの天然変異体、及びそれらの断片も含む。
本発明において、抗APOA2タンパク質末端抗体を作製する場合には、まず免疫原(抗原)としてのAPOA2タンパク質のバリアントを調製する。本発明において免疫原として使用可能なAPOA2タンパク質のバリアントは、例えば、配列番号1〜3のいずれかに示されるアミノ酸配列を有するAPOA2タンパク質若しくはその変異体又はそれらのポリペプチド断片、あるいはそれらと他のペプチド(例えば、シグナルペプチド、標識ペプチド等)との融合ポリペプチドが挙げられる。免疫原としてのAPOA2タンパク質のバリアントは、例えば、配列番号1〜3のいずれかのアミノ酸配列情報を利用して、当技術分野で公知の手法、例えば固相ペプチド合成法等により合成することができる。例えば、以下の方法によって調製することができる。
以下で、配列番号1〜3のいずれかで示される組み換え型APOA2タンパク質(組み換え型APOA2タンパク質のバリアント)の調製について詳述する。
APOA2タンパク質の各種バリアントの発現に用いるベクターとしては、宿主微生物で自律的に増殖し得るファージ又はプラスミドを使用することができる。例えば、プラスミドとしては、大腸菌由来のプラスミド(pET30a、pGEX6p、pUC118、pUC119、pUC18、pUC19等)、枯草菌由来のプラスミド(pUB110、pTP5等)、酵母由来のプラスミド(YEp13、YEp24、YCp50等)が挙げられる。また、ファージとしては、λファージ(λgt11、λZAP等)が挙げられる。さらに、ワクシニアウイルス等の動物ウイルス、バキュロウイルス等の昆虫ウイルスベクターも用いることができる。
得られたAPOA2タンパク質のバリアント発現ベクターを、その発現ベクターを発現し得る宿主中に導入して、APOA2タンパク質のバリアント発現形質転換体を得る。使用する宿主については、使用したベクターに適する宿主であって、APOA2タンパク質のバリアントを発現できるものであれば特に限定されるものではない。例えば、細菌(大腸菌(例えば、エシェリヒア・コリ:Escherichia coli)、枯草菌(例えば、バチルス・サブチリス:Bacillus subtilis)等)、酵母、昆虫細胞、動物細胞(COS細胞、CHO細胞(Journal of immunology、1998、Vol.160、3393−3402))等が好適に用いられる。細菌への前記ベクターの導入方法は、細菌に該ベクターを導入する公知の方法であれば特に限定されない。例えば、ヒートショック法、カルシウムイオンを用いる方法、エレクトロポレーション法等が挙げられる。これらの技術は、いずれも当該分野で公知であり、様々な文献に記載されている。例えば、Green &Sambrook、2012、Molecular Cloning: A Laboratory Manual Fourth Ed.、Cold Spring Harbor Laboratory Press、Cold Spring Harbor、New Yorkを参照されたい。また、動物細胞の形質転換には、リポフェクチン法(PNAS、1989、Vol.86、6077;PNAS、1987、Vol.84、7413)、エレクトロポレーション法、リン酸カルシウム法(Virology、1973、Vol.52、456−467)、DEAE−Dextran法等が好適に用いられる。
続いて、上記作製した形質転換体を培養する。形質転換体を培地で培養する方法は、宿主の培養に用いられる通常の方法に従って行われる。例えば、細菌を宿主とする場合、培地は、細菌が資化し得る炭素源、窒素源、無機塩類等を含有し、かつ生育、増殖可能なものであれば、特に限定はしない。天然培地、合成培地のいずれを用いることもできる。より具体的な例としては、LB培地が挙げられるが、もちろんこれに限定はされない。また、形質転換体の培養を選択的に行うために、必要に応じてアンピシリンやテトラサイクリン等の抗生物質を培地に添加してもよい。培養は、通常、通気攪拌培養等の好気的条件下、37℃で6〜24時間行う。培養期間中、pHは中性付近に保持することが好ましい。pHの調整は、無機又は有機酸、アルカリ溶液等を用いて行う。形質転換体がCHO細胞等の動物細胞である場合には、Gibco社製DMEM培地に1×105細胞/mLとなるように宿主細胞を接種し、37℃の5%CO2インキュベータにて培養すればよい。培養中は必要に応じてアンピシリンやテトラサイクリン等の抗生物質を培地に添加してもよい。
培養後、APOA2タンパク質のバリアントが菌体内又は細胞内に生産される場合には、菌体又は細胞を回収して破砕することによりタンパク質を抽出することができる。また、APOA2タンパク質のバリアントが菌体外又は細胞外に生産される場合には、培養液をそのまま使用するか、遠心分離等により菌体又は細胞を除去し、上清を使用すればよい。その後、一般的なタンパク質の精製方法、例えば硫酸アンモニウム沈殿、ゲル濾過、イオン交換クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー等を単独で、又は適宜組合せて用いることにより、前記培養物中からAPOA2タンパク質のバリアントを単離精製することができる。APOA2タンパク質のバリアントが得られたか否かは、SDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動等により確認すればよい。
1−3−1.抗APOA2モノクローナル抗体及びハイブリドーマ作製方法
本発明の抗APOA2モノクローナル抗体を産生するハイブリドーマは、以下に記載する方法によって作製することができる。ただし、本方法に限定されるものではなく、当該分野で公知の他のあらゆる方法で作製することもできる。
APOA2タンパク質を構成するアミノ酸配列のうち、配列番号1、2又は3で示されるAPOA2タンパク質のいずれかのC末端領域と特異的に結合する抗APOA2タンパク質末端モノクローナル抗体を作製するには、APOA2タンパク質のバリアント若しくはAPOA2タンパク質のバリアントのC末端領域を含むペプチドを免疫原としてモノクローナル抗体を作製し、その後、配列番号1〜3のいずれかで示されるAPOA2タンパク質自体若しくはAPOA2タンパク質のバリアントのC末端領域を含むペプチドを用いてAPOA2タンパク質の特定のバリアントにのみ結合する抗体をスクリーニングすればよい。例えば、抗APOA2−ATQ末端モノクローナル抗体については、配列番号1で示されるAPOA2−ATQタンパク質のC末端領域と特異的に結合し、配列番号2又は3で示されるAPOA2タンパク質のバリアントとは結合しないか、又はほとんどしないことを指標にスクリーニングできる。また、抗APOA2−AT末端モノクローナル抗体については、配列番号2で示されるAPOA2−ATタンパク質のC末端領域と特異的に結合し、配列番号1又は3で示されるAPOA2タンパク質のバリアントとは結合しないか、又はほとんどしないことを指標にスクリーニングできる。
前記1−2で得られた免疫原である組換え型APOA2タンパク質を、緩衝液に溶解して免疫原溶液を調製する。この際、免疫を効果的に行うために、必要であればアジュバントを添加してもよい。アジュバントの例としては、市販の完全フロイントアジュバント(FCA)、不完全フロイントアジュバント(FIA)等が挙げられ、これらを単独で又は混合して用いてもよい。
(1)免疫動物からの抗体産生細胞の回収と細胞融合
免疫動物から得た抗体産生細胞とミエローマ細胞との細胞融合を行うことで、APOA2タンパク質の特定の領域を特異的に認識するモノクローナル抗体を生産するハイブリドーマを作製することができる。抗体産生細胞としては、脾臓細胞、リンパ節細胞、末梢血細胞等が挙げられるが、脾臓細胞又は局所リンパ節細胞が好ましい。抗体産生細胞と融合させるミエローマ細胞としては、一般に入手可能なマウス等由来の株化細胞を使用することができる。使用する細胞株としては、薬剤選択性を有し、未融合の状態ではHAT選択培地(ヒポキサンチン、アミノプテリン、チミンを含む)で生存できず、抗体産生細胞と融合した状態でのみ生育できる性質を有するものが好ましい。また、株化細胞は、免疫動物と同種系の動物に由来するものが好ましい。ミエローマ細胞の具体例としては、BALB/cマウス由来のヒポキサンチン・グアニン・ホスホリボシル・トランスフェラーゼ(HGPRT)欠損細胞株である、P3X62−Ag.8株(ATCCTIB9)、P3X63−Ag.8.U1株(JCRB9085)、P3/NSI/1−Ag4−1株(JCRB0009)、P3x63Ag8.653株(JCRB0028)又はSP2/0−Ag14株(JCRB0029)等が挙げられる。
細胞融合処理後の細胞から目的とする抗APOA2モノクローナル抗体を産生するハイブリドーマを選別する方法としては、細胞懸濁液を、例えば、ウシ胎児血清含有RPMI1640培地等で適当に希釈後、96ウェルマイクロタイタープレート上に2×106個/ウェル程度播種し、各ウェルに選択培地を加え、以後適当に選択培地を交換して培養を行う。培養温度は20〜40℃、好ましくは約37℃である。ミエローマ細胞がHGPRT欠損株又はチミジンキナーゼ(TK)欠損株のものである場合には、ヒポキサンチン・アミノプテリン・チミジンを含む選択培地(HAT培地)を用いることにより、抗体産生細胞とミエローマ細胞のハイブリドーマのみを選択的に生育、増殖させることができるため、選択培地で培養開始後約10日前後から生育してくる細胞をハイブリドーマとして選択することができる。
本発明におけるハイブリドーマは、マウスを用いて腹水化することにより抗体生産に用いることができる。具体的には、ハイブリドーマを作製する際の融合パートナーに用いた細胞の由来のマウスや、ヌードマウスの腹腔内にハイブリドーマを接種し、腹水を適宜採取することにより、抗体を含む腹水液を回収することができる。より具体的には、SP2/0細胞を融合パートナーとしたハイブリドーマを、プリスタン接種後10日間を経たBALB/cマウスの腹腔中に接種することにより、抗体を含む腹水液を回収できる。
本発明の抗体又はその断片は、当該抗体のアミノ酸配列をコードするcDNA配列を利用して、組換えDNA操作によって得ることもできる。
得られた抗APOA2モノクローナル抗体が特異的に認識するAPOA2タンパク質のバリアントの種類については、該タンパク質の遺伝子をもとにPCR反応等を用いて各種のAPOA2タンパク質のバリアント遺伝子を作製し、該遺伝子から得られるAPOA2タンパク質の各種バリアントとモノクローナル抗体の結合性を解析することにより決定できる。
抗APOA2ポリクローナル抗体は、当該技術分野で公知の方法によって作製することができる。以下に、例として、APOA2タンパク質の特定のバリアントのみと特異的に結合する抗APOA2タンパク質末端抗体の取得法を具体的に示す。
抗APOA2タンパク質末端ポリクローナル抗体を作製するためには、まず、特定のAPOA2タンパク質のバリアント配列上の少なくとも6アミノ酸以上の長さを持つC末端断片、例えば配列番号28又は29で示されるペプチドを緩衝液に溶解して免疫原溶液を調製する。必要であれば、免疫を効果的に行うためにアジュバントを添加してもよい。アジュバントの例としては、市販の完全フロイントアジュバント(FCA)、不完全フロイントアジュバント(FIA)等が挙げられ、これらを単独で又は混合して用いることができる。
(1)ペプチド固定化カラムの作製
APOA2タンパク質のC末端領域ペプチド、及びAPOA2タンパク質のC末端領域ペプチドのC末端にアミド基を付加したペプチドをそれぞれ固定化したアフィニティーカラムを作製する。詳しい方法は「抗ペプチド抗体実験プロトコール」、第2版、秀潤社に記載されている。アフィニティーカラムに使用する担体は、ホルミルセルロファインやCNBrアガロースのように、担体上の官能基をペプチドのアミノ基へ結合可能なもの、若しくは担体に共有結合させたマレイミド基を介して、ペプチド配列上のシステイン残基へ結合可能なものなどが利用可能である。また、固定化するペプチドの長さは、APOA2タンパク質のC末端を含む限り、6アミノ酸以上、好ましくは10アミノ酸以上、好ましくは18アミノ酸以上、より好ましくは30アミノ酸以上である。
抗APOA2タンパク質末端ポリクローナル抗体は、前記抗血清からペプチド固定化アフィニティーカラムを用いて精製することができる。例えば、前記抗血清を適切な緩衝液で希釈し、抗血清に含まれるIgG抗体を、APOA2タンパク質のC末端領域ペプチドを固定化したアフィニティーカラムに吸着させ、この吸着画分を回収する。続いて、C末端をアミド化したAPOA2タンパク質ペプチドを固定化したアフィニティーカラムを用いて、ペプチドのC末端領域以外への結合性を示すイムノグロブリンを吸着除去する。最終的に、この非吸着画分を特定のAPOA2タンパク質のバリアントを特異的に認識する抗APOA2タンパク質末端ポリクローナル抗体として取得する。
本発明の第二の態様は、膵腫瘍、すなわち膵臓癌又は膵良性腫瘍をインビトロで検出する方法に関する。本発明は、2種のAPOA2タンパク質のバリアント、すなわちAPOA2−ATQタンパク質及びAPOA2−ATタンパク質の両方、若しくはどちらか一方の血中量が健常者よりも膵腫瘍患者で有意に低下する知見に基づき、それぞれのAPOA2タンパク質のバリアントのC末端領域を特異的に認識する末端抗体(抗APOA2タンパク質末端抗体)又はその断片と、C末端領域以外の領域のアミノ酸配列を認識する抗APOA2タンパク質抗体(抗APOA2タンパク質非末端抗体)又はその断片を使用して、前記2種のAPOA2タンパク質のバリアントを測定することを特徴とする。さらに、測定した2種のAPOA2タンパク質のバリアントの測定値を用いた多変量解析により、膵腫瘍を検出する方法を特徴とする。
「膵腫瘍検出用マーカー測定工程」とは、被験体由来の体液中に存在する膵腫瘍検出用マーカー、すなわち、APOA2−ATQタンパク質及びAPOA2−ATタンパク質からなる、2種のAPOA2タンパク質のバリアントの量をインビトロで測定する工程である。
「罹患決定工程」とは、前記膵腫瘍検出用マーカー測定工程で測定されたタンパク質の量に基づいてインビトロで膵臓癌又は膵良性腫瘍の罹患を決定(又は評価)する工程である。測定された膵腫瘍検出用マーカー、すなわち、被験体の体液試料中におけるAPOA2タンパク質のバリアントの量(APOA2−ATQタンパク質及びAPOA2−ATタンパク質の量)を測定して、膵腫瘍の検出を行い、膵腫瘍の罹患の有無を決定し、又は罹患の可能性を評価する。本工程は、さらに第1工程〜第3工程の3つの工程で構成される。以下、それぞれの工程について詳細に説明する。
膵腫瘍への罹患の有無を決定し又は罹患の可能性を評価するための分析法としては、ロジスティック回帰分析を用いて判別式を得る方法を使用できる。
数式1:a x (APOA2−ATQ) + b x (APOA2−AT) + d
数式2:a x (APOA2−ATQ) + b x (APOA2−AT)+ c x (APOA2−
ATQ) x (APOA2−AT) +d
数式3:c x (APOA2−ATQ) x (APOA2−AT) + d
(数式1〜3において、a,b,c,dはゼロでない任意の実数、(APOA2−ATQ)はAPOA2−ATQタンパク質の測定値、(APOA2−AT)はAPOA2−AT
タンパク質の測定値である。)
本発明の第三の態様は、膵腫瘍検出用キットである。
(a)APOA2−ATQタンパク質のC末端領域を認識する抗体産生細胞の作製
APOA2−ATQタンパク質のC末端領域の配列である配列番号29で示されるアミノ酸配列からなるペプチドは、水に対して難溶性であり、抗原性も低いため、N末端側に、3つのアルギニン残基を付加することで親水性を付与し、さらにそのN末端にシステイン残基を付加したペプチドを合成した。続いて、Maleimide−Activated Ovalbumin(ピアス社製)を用いて、前記ペプチドのシステイン残基に、OVAタンパク質を結合させた。これを免疫原とし、免疫原が1匹当たり100μgとなるように、マウス(BALB/c)に2週間間隔で腹腔内投与を行った。免疫の初回から4回目までは、前記免疫原溶液に、さらにSigma Adjuvant System(シグマ社製)を混合し、投与した。4回目の投与の後、ELISA法により、マウスの血清中の抗体価の測定を行った。
RPMI1640培地中で、前記(a)でマウスから得た抗体産生細胞と、SP2/0(マウスミエローマ)細胞を1:10の割合で混合し、80%ポリエチレングリコールの存在下にて融合反応を行った。続いて、HAT培地にて約1週間培養し、ハイブリドーマを選別した。
次に、HAT培地で選択されたハイブリドーマから、組換え型ヒト由来のAPOA2−ATQタンパク質又はAPOA2−ATタンパク質に対する結合活性の違いを指標として、APOA2−ATQタンパク質のC末端領域を特異的に認識する抗体の選抜を行った。前記(a)と同様にELISA法にてスクリーニングを行った結果、クローン7F2とクローン6G2の2種のハイブリドーマを取得した。モノクローナル抗体をコードする遺伝子の配列解析の結果、7F2のCDR配列は配列番号4〜9、6G2のCDR配列は配列番号10〜15、で示されるアミノ酸配列であることが明らかとなった。
実施例1で取得した抗APOA2−ATQ末端モノクローナル抗体7F2又は6G2を用いて、ELISA法によるAPOA2−ATQタンパク質の検出を行った。組換え型ヒト由来、APOA2−ATQタンパク質、APOA2−ATタンパク質又はAPOA2−Aタンパク質を、PBS溶液で1μg/mLに調製した後、イムノプレートマキシソープのウェルに100μLずつ入れ、一晩固相化した。翌日、前記溶液を廃棄し、ブロッキングバッファーA溶液400μLを添加して1時間室温で静置した。ウェル内の溶液を廃棄後、PBS−T400μLを添加して洗浄し、希釈液(1%NP40、50mM トリス塩酸、150mM NaCl、1mM EDTA、1%BSA、pH8.0)で0.2μg/mLに希釈した抗体7F2又は6G2を100μL添加して2時間室温で反応させた。ウェル内の溶液を廃棄後、PBS−Tによる洗浄を行った後、希釈液で5000倍希釈したPolyclonal Rabbit Anti−Mouse Immunoglobulins/HRP100μLを添加して、1時間室温で反応させた。PBS−Tにて洗浄後、TMB溶液100μLを添加して酵素反応を行った。その後、0.5N硫酸溶液100μLを添加して反応を停止させ、450nmの吸光度を測定した。
実施例1で取得した抗APOA2−ATQ末端モノクローナル抗体クローン7F2、クローン6G2と、前記「1−4.抗APOA2ポリクローナル抗体の作製」(方法の詳細は「抗ペプチド抗体実験プロトコール」、第2版、秀潤社に記載)に記載した方法を用いて取得した抗APOA2−ATQ末端ポリクローナル抗体の計3種の抗体について、抗原に対する特異性を評価した。本実験では、クローン7F2、クローン6G2、及び抗APOA2−ATQ末端ポリクローナル抗体のPOD標識体を用いた。抗体のPOD標識化は、PEROXIDASE LABELING KIT−SH(DOJINDO社製)を用いて行った。
APOA2−ATタンパク質のC末端領域を特異的に認識する抗APOA2−AT末端ポリクローナル抗体を用いて、ELISA法によるAPOA2−ATタンパク質の検出を行った。
抗APOA2−AT末端ポリクローナル抗体は、前記「1−4.抗APOA2ポリクローナル抗体の作製」(方法の詳細は「抗ペプチド抗体実験プロトコール」、第2版、秀潤社に記載)に記載した方法を用いて取得した。免疫原は、配列番号28で示されるAPOA2−ATタンパク質のC末端領域を示すペプチドのN末端にシステイン残基を付加し、さらにキャリアータンパク質であるKLHと結合させたものを用いた。この免疫原をウサギに対して1週間間隔で投与を行った。4回目の投与の後、前記実施例1と同様に、ELISA法によりウサギ血清中の抗体価の測定を行った。その結果、充分な抗体価の上昇を見出したため、最終免疫の日から1週間後に抗血清を回収した。
組換え型ヒト由来、APOA2−ATタンパク質、APOA2−ATQタンパク質、又はAPOA2−Aタンパク質を、PBS溶液で1μg/mLに調製した後、イムノプレートマキシソープのウェルに100μLずつ入れ、一晩固相化した。翌日、前記溶液を廃棄し、ブロッキングバッファーA溶液400μLを添加して1時間室温で静置した。ウェル内の溶液を廃棄後、400μLのPBS−Tを添加して洗浄し、希釈液で0.2μg/mLに希釈した上記抗APOA2−AT末端ポリクローナル抗体を100μL添加して2時間室温で反応させた。ウェル内の溶液を廃棄後、PBS−Tによる洗浄を行った後、希釈液で10000倍希釈したAnti−Rabbit IgG,HRP−Linked F(ab’)2 Fragment Donkey(GEヘルスケア社製)100μLを添加して、1時間室温で反応させた。PBS−Tにて洗浄後、TMB溶液100μLを添加して酵素反応を行った。その後、0.5N硫酸溶液100μLを添加して反応を停止させ、450nmの吸光度を測定した。
前記実施例1に記載の方法を用いて、APOA2タンパク質のC末端領域以外のアミノ酸配列を認識する抗体を作製した。
国立がんセンター中央病院において、インフォームドコンセントを得て、膵臓癌患者と健常者各40名から採取した血漿から、特許第5200246号公報に記載された実験1と同様の手法に従い、SELDI−QqTOF−MS(surface−enhanced laser desorption/ionization high−resolution performance hybrid quadrupole time of flight mass spectrometry)法を用いて、17252(m/z)の質量を有するペプチドピークのイオン強度を測定した。
前記比較例1と同様の血漿を対象に、APOA2−ATQタンパク質のC末端領域を特異的に認識する前記抗APOA2−ATQ末端モノクローナル抗体7F2とAPOA2−ATタンパク質のC末端領域を特異的に認識する前記抗APOA2−AT末端ポリクローナル抗体のPOD標識体を用いたサンドイッチELISA法により、APOA2タンパク質二量体(APOA2−ATQ/AT)の検出を試みた。
前記比較例1と同様の血漿を対象に、前記抗APOA2−ATQ末端モノクローナル抗体7F2のPOD標識体と、APOA2タンパク質のC末端領域以外の部位を認識する抗APOA2タンパク質非末端ポリクローナル抗体(FITZGERALD社)を用いたサンドイッチELISA法により、APOA2−ATQタンパク質の測定を行った。
前記比較例1と同様の血漿を対象に、前記抗APOA2−AT末端ポリクローナル抗体と前記抗APOA2タンパク質非末端ポリクローナル抗体のPOD標識体を用いたサンドイッチELISA法により、APOA2−ATタンパク質の測定を行った。抗APOA2タンパク質非末端ポリクローナル抗体のPOD標識化、及びサンドイッチELISAについては、前記比較例3と同様に行った。血漿の希釈倍率は6000倍とした。
図9に、前記比較例3と比較例4で得られたAPOA2―ATQタンパク質とAPOA2―ATタンパク質の測定値の積をプロットし、健常者と膵臓癌患者の判別を行った結果を示す。本手法はAUC値=0.906を示し、前記比較例1の質量分析法と比べても優れており、高い膵臓癌判別精度を示すことが確かめられた。
国立がんセンター中央病院において、インフォームドコンセントを得て、膵臓癌患者244名と健常者109名から採取した血漿を対象に、前記実施例6の手法に従い、2種の血中APOA2タンパク質のバリアント(APOA2―ATQタンパク質とAPOA2―ATタンパク質)の測定を行った。さらに、組換え型ヒト由来タンパク質APOA2−ATQタンパク質とAPOA2−ATタンパク質の抗原溶液を標品として、血漿中の前記2種のタンパク質濃度を算出した。
前記実施例7で得られた測定値の統計解析処理により、膵臓癌判別精度が高い判別式を得ることが可能である。以下の統計処理を行い、前記比較例1と同様の質量分析法を用いた膵臓癌判別法との比較を行った。
目的変数として、膵臓癌患者を「1」、健常者を「0」と定義し、前記(1)で得られた2種のAPOA2タンパク質のバリアント(APOA2―ATQタンパク質とAPOA2―ATタンパク質)の血中濃度を説明変数として、ロジスティック回帰分析を行い、判別式を算出した。表1に、得られた判別式における、AUC値、症例データの判別成績(感度、特異度)の算出結果を示す。この中で、早期の膵臓癌(ステージI)の判別性能が良かったのは、前記実施例6と同様、2種のタンパク質の濃度(APOA2−ATQタンパク質とAPOA2−ATタンパク質)の積を説明変数とした判別式を構築した場合であった。APOA2―ATQタンパク質とAPOA2―ATタンパク質の各検体の測定値を、この判別式に入力し得られた判別値を用いて、健常者と膵臓癌患者(ステージIとII)を判別した際のROC曲線を図11(A)に示す。図11(B)は、前記質量分析法により測定したAPOA2−ATQ/ATタンパク質二量体の量を用いて、健常者と膵臓癌患者を判別した際のROC曲線である。また、表2に、膵臓癌の各ステージにおける判別性能を比較した結果を示す。表2において、膵臓癌のステージはUICCのステージ分類に従い、ステージIは、UICCのステージ分類におけるIA、IBを指し、ステージIIは、UICCのステージ分類におけるIIA、IIBを指す。表2において、「ELISA法」は、ELISA法により得られた2種のタンパク質(APOA2−ATQタンパク質とAPOA2−ATタンパク質)の量の積を説明変数とする判別式を用いた場合の解析結果を示し、「質量分析法」は、質量分析法により得られたAPOA2タンパク質二量体(APOA2−ATQ/AT)の量を用いた場合の解析結果を示す。本手法は、前記質量分析法と比較して、極めて高い感度で早期膵臓癌を検出可能であることが確認された。
APOA2による健常者と各種膵良性腫瘍患者の判別を行い、CA19−9との判別性能の比較を行った。
APOA2とCA19−9を組み合わせた膵臓癌と膵良性腫瘍の判別を行った。まず、前記実施例8及び9に記載の方法を用いて、APOA2により、膵良性腫瘍、早期膵臓癌(ステージI、II)、及び膵臓癌(全ステージ)の検出を行い、いずれかが検出された罹患者の人数をAPOA2の陽性数として算出した。次に、APOA2陽性の患者について、前記実施例9に記載の方法を用いてCA19−9による判別を行い、CA19−9の基準値を上回った数としてCA19−9の陽性数を算出した。さらに、APOA2陽性数に占めるCA19−9陽性数の割合を算出した。これらの結果を表4に示す。
APOA2とDU−PAN−2を組み合わせた膵臓癌と膵良性腫瘍の判別を行った。CA19−9の代わりにDU−PAN−2を用い、前記実施例10に記載の方法と同様にして判別を行った。被験体の体液試料中におけるDU−PAN−2の量は、免疫学的方法により測定した。通常、DU−PAN−2により健常者と膵臓癌患者の判別を行う際、判別の基準値は150(U/mL)であり、DU−PAN−2の量が基準値以下である場合は健常者、基準値を上回る場合は膵臓癌患者であると判別される(臨床検査データブック 2013−2014、高久史麿監修、医学書院、p.637−638)。本実施例では、DU−PAN−2について、この基準値を使用して判別を行った。その結果を表5に示す。
Claims (13)
- 被験体の体液試料中におけるAPOA2タンパク質のバリアントの量を測定して膵臓癌又は膵良性腫瘍を検出する方法であって、
(A)配列番号1で示されるアミノ酸配列からなるAPOA2−ATQタンパク質のC末端領域と特異的に結合する抗APOA2−ATQ末端抗体と、該C末端領域以外のアミノ酸配列と結合する抗APOA2−ATQ非末端抗体とを用いて、試料中のAPOA2−ATQタンパク質の量を測定する第1の工程、
(B)配列番号2で示されるアミノ酸配列からなるAPOA2−ATタンパク質のC末端領域と特異的に結合する抗APOA2−AT末端抗体と、該C末端領域以外のアミノ酸配列と結合する抗APOA2−AT非末端抗体とを用いて、試料中のAPOA2−ATタンパク質の量を測定する第2の工程、
(C)第1の工程で得たAPOA2−ATQタンパク質の量の測定値と第2の工程で得たAPOA2−ATタンパク質の量の測定値とを予め設定したロジスティック回帰式に入力して得た被験体の判別値が、健常体の判別値と比較して統計学的に有意に差があるときに被験体が膵臓癌又は膵良性腫瘍に罹患していると決定する第3の工程、
を含む膵臓癌又は膵良性腫瘍の検出方法。 - APOA2−ATQタンパク質及びAPOA2−ATタンパク質の前記C末端領域が、それぞれC末端を含む6以上の連続したアミノ酸を含む配列からなる、請求項1に記載の検出方法。
- 前記ロジスティック回帰式が、APOA2−ATQタンパク質の前記測定値、及び/又はAPOA2−ATタンパク質の前記測定値、及び/又はAPOA2−ATQタンパク質の前記測定値とAPOA2−ATタンパク質の前記測定値の積を変数として含む、請求項1又は2に記載の検出方法。
- 前記ロジスティック回帰式から得た被験体の判別値が、健常体の判別値の3分の2以下である、請求項3に記載の方法。
- 前記第3の工程において、膵臓癌又は膵良性腫瘍に罹患していると決定された被験体について、当該被験体の体液試料中における膵臓癌マーカーCA19−9又はDU−PAN−2の量を測定し、その測定値が、所定の基準値を超える場合には、その被験体は膵臓癌に罹患していると決定し、当該基準値以下である場合には、その被験体は膵良性腫瘍に罹患していると決定する第4の工程をさらに含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の検出方法。
- 前記体液試料が、血液、血漿又は血清である、請求項1〜5のいずれか一項に記載の検出方法。
- 前記膵臓癌が早期膵臓癌である請求項1〜6のいずれか一項に記載の検出方法。
- 被験体試料中のAPOA2タンパク質のバリアント量を測定するための組み合わせ抗体であって、
配列番号1で示されるアミノ酸配列からなるAPOA2−ATQタンパク質のC末端領域と特異的に結合する抗APOA2−ATQ末端抗体又はその断片、
配列番号2で示されるアミノ酸配列からなるAPOA2−ATタンパク質のC末端領域と特異的に結合する抗APOA2−AT末端抗体又はその断片、及び
配列番号1〜3のいずれかで示されるアミノ酸配列からなるAPOA2タンパク質のC末端領域以外のアミノ酸配列を認識する抗APOA2タンパク質非末端抗体又はその断片
を含む前記組み合わせ抗体。 - 前記抗APOA2−ATQ末端抗体は、
重鎖のCDR1、CDR2及びCDR3が、それぞれ配列番号4、5及び6で示されるアミノ酸配列からなり、かつ、
軽鎖のCDR1、CDR2及びCDR3が、それぞれ配列番号7、8及び9で示されるアミノ酸配列からなる、
モノクローナル抗体である、請求項8に記載の組み合わせ抗体。 - 前記抗APOA2−ATQ末端抗体は、
重鎖のCDR1、CDR2及びCDR3が、それぞれ配列番号10、11及び12で示されるアミノ酸配列からなり、かつ、
軽鎖のCDR1、CDR2及びCDR3が、それぞれ配列番号13、14及び15で示されるアミノ酸配列からなる、
モノクローナル抗体である、請求項8に記載の組み合わせ抗体。 - 前記抗APOA2タンパク質非末端抗体は、
重鎖のCDR1、CDR2及びCDR3が、それぞれ配列番号16、17及び18で示されるアミノ酸配列からなり、かつ、
軽鎖のCDR1、CDR2及びCDR3が、それぞれ配列番号19、20及び21で示されるアミノ酸配列からなる、
モノクローナル抗体である、請求項8に記載の組み合わせ抗体。 - 前記抗APOA2タンパク質非末端抗体は、
重鎖のCDR1、CDR2及びCDR3が、それぞれ配列番号22、23及び24で示されるアミノ酸配列からなり、かつ、
軽鎖のCDR1、CDR2及びCDR3が、それぞれ配列番号25、26及び27で示されるアミノ酸配列からなる、
モノクローナル抗体である、請求項8に記載の組み合わせ抗体。 - 請求項8〜12に記載の組み合わせ抗体を1組以上含む、膵臓癌又は膵良性腫瘍の検出用キット。
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