JP6559266B2 - ウイルスポリメラーゼを阻害するための組成物および方法 - Google Patents
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Description
式中、
式Iにより表される化合物が、
L1、L2、L3、L4、L5、およびL6の各々は、独立して、結合または−C(R0)2−O−リンカーであり;
R0は、各発生毎に独立して、Hまたは(C1〜C6)アルキルであり;
R1、R2、およびR3の各々は、独立して、H、アミノアシル、アミノチオニル、アシル、R10OC(O)−、ホスホリル、およびアミノホスホリルからなる群より選択され;あるいは、R1およびR2は一緒になって、またはR2およびR3は一緒になって、カルボニル、チオカルボニル、ホスホリル、および(C1〜C6)アルキルホスホリルからなる群より選択され;
R4、R5、およびR6の各々は、独立して、H、アシル、ホスホリル、アルキルチオ、R10OC(O)−、およびアミノアルキルからなる群より選択され;
R7はHであり;またはR6、R7、およびそれらが結合した窒素は一緒に、−N=CR20R21を表し;
R10は、各発生毎に独立して、H、(C1〜C6)アルキル、アリール、ヘテロアリール、アラルキル、およびヘテロアラルキルからなる群より選択され;
R20およびR21の各々は、独立して、H、アルキル、アミノ、アリール、ヘテロアリール、アラルキル、およびヘテロアラルキルからなる群より選択される。
R50は、H、(C1〜C6)アルキル、アリール、アリールアルキル、ヘテロアリール、ヘテロアラルキル、および−(CH2)mSC(=O)C(CH3)2CH2OHからなる群より選択され;
mは1または2であり;
R51はHまたは(C1〜C6)アルキルであり;
R52は、H、(C1〜C6)アルキル、アリール、アラルキル、ヘテロアリール、ヘテロアラルキル、および−CR60R61C(=O)OR62からなる群より選択され、式中、
R60およびR61の各々は、独立して、Hまたは(C1〜C6)アルキルであり;
R62は、H、(C1〜C6)アルキル、アリール、アラルキル、ヘテロアリール、ヘテロアラルキルからなる群より選択される。
ここに用いた「アルキル」という用語は、専門用語であり、直鎖アルキル基、分岐鎖アルキル基、シクロアルキル(脂環式)基、アルキル置換シクロアルキル基、およびシクロアルキル置換アルキル基を含む飽和脂肪族基を称する。特定の実施の形態において、直鎖または分岐鎖アルキルは、主鎖に約30以下の炭素原子(例えば、直鎖についてはC1〜C30、分岐鎖についてはC3〜C30)、あるいは、約20以下の炭素原子を有する。同様に、シクロアルキルは、その環構造に約3から約10の炭素原子、あるいは、その環構造に約5、6または7の炭素原子を有する。
(S)−((2R,3R,4S,5S)−5−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3,4−ジヒドロキシピロリジン−2−イル)メチル2−アミノ−3−メチルブタノエート;
(2S,3S)−((2R,3R,4S,5S)−5−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3,4−ジヒドロキシピロリジン−2−イル)メチル2−アミノ−3−メチルペンタノエート;
(S)−((2R,3R,4S,5S)−5−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3,4−ジヒドロキシピロリジン−2−イル)メチル2−アミノ−4−メチルペンタノエート;
(2S,2’S)−(2S,3S,4R,5R)−2−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−5−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−3,4−ジイルビス(2−アミノ−3−メチルブタノエート);
(S)−(2R,3R,4S,5S)−5−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−4−ヒドロキシ−2−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−3−イル2−アミノ−3−メチルブタノエート;
(S)−(2S,3S,4R,5R)−2−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−4−ヒドロキシ−5−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−3−イル2−アミノ−3−メチルブタノエート;および
その薬学的に許容される塩;
からなる群より選択される。
複素環およびヘテロアリールは、文献に報告されているような公知の方法から調製できる(a.Ring system handbook, published by American Chemical Society edition 1993 and subsequent supplements. :b.The Chemistry of Heterocyclic Compounds; Weissberger, A., Ed.; Wiley: New York, 1962. :c.Nesynov, E. P.; Grekov, A. P. The chemistry of 1,3,4-oxadiazole derivatives. Russ. Chem. Rev. 1964, 33, 508-515. :d.Advances in Heterocyclic Chemistry; Katritzky, A. R., Boulton, A. J., Eds.; Academic Press: New York, 1966. :e.In Comprehensive Heterocyclic Chemistry; Potts, K. T., Ed.; Pergamon Press: Oxford, 1984. :f.Eloy, F. A review of the chemistry of 1,2,4-oxadiazoles. Fortschr. Chem. Forsch. 1965, 4, pp 807-876. :g.Adv. Heterocycl. Chem. 1976. :h.Comprehensive Heterocyclic Chemistry; Potts, K. T., Ed.; Pergamon Press: Oxford, 1984. :i.Chem. Rev. 1961 61, 87-127. :j.1,2,4-Triazoles; John Wiley & Sons: New York, 1981; Vol 37)。合成中の官能基は、保護し、その後、脱保護する必要があるかもしれない。適切な保護基の例が、Protective Groups in Organic Synthesis, fourth edition, edited by Greene and Wut
sに見つけられる。
2本鎖(ds)RNAウイルス(ボルティモア分類の第3群)は、各々が1つ以上のウイルスタンパク質をコードする、1つから多くの異なるRNA分子を含有する。dsRNAの例にレオウイルス科がある。
エタノール(400mL)中の(2R,3R,4S,5S)−2−(アセトキシメチル)−1−(tert−ブトキシルカルボニル)−5−(4−クロロ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)ピロリジン−3,4−ジイルジアセテート(28c)(40g、78.29ミリモル)の透明な溶液に、−50℃でアンモニア(エタノールに対して35体積%)をパージした。この冷却溶液をオートクレーブ中に注意深く注ぎ入れ、100〜105℃で16時間に亘り加熱した。TLCで調査して、反応の完了を確認した。混合物を室温まで冷ませた。溶媒を蒸留して、濃い茶色の粘着性塊として、38gの(2S,3S,4R,5R)−2−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3,4−ジヒドロキシ−5−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(28f)を得た。
工程1:D−リボノラクトン(19b)の調製
機械式撹拌機、1Lの均圧添加漏斗、および効率凝縮器を備えた22Lの三口フラスコに、D−リボース(19a)(2.0kg、13.33モル)、固体の重炭酸ナトリウム(2.24kg、26.66モル)および水(12L)を入れた。この反応混合物を1時間に亘り室温で撹拌し、その時点で、固体のほとんどが消失した。この反応容器を氷浴に入れ、内部温度を5±1℃に維持した。この添加漏斗に臭素(710mL、13.86モル)を満たし、その臭素を、温度が5〜10℃に維持されるように約5mL/分の速度で、激しく撹拌されている水溶液に加えた。添加を完了したときに(約2.5時間)、得られたオレンジ色の溶液をさらに3時間に亘り撹拌した。この反応混合物に、オレンジ色が完全に消えるまで、固体の亜硫酸水素ナトリウム(〜75g)を少量ずつ加えた。この透明な水溶液を20Lの蒸発フラスコに移し、4時間の期間に亘り回転式蒸発器(80℃、10mmHg)で蒸発乾固させると、半固体の残留物が残った。この残留物にエチルアルコール(〜4L)を加え、1時間に亘り40℃で撹拌した。この混合物を冷却し、漏斗で濾過して、不溶性無機塩のほとんどを除去した。固体残留物をエチルアルコール(1L)で洗浄した。濾液を20Lの蒸発フラスコに移し、回転式蒸発器(50℃、10mmHg)で濃縮乾固すると、固体残留物が残った。この残留物にエチルアルコール(〜3L)を加え、このスラリーを12時間に亘り室温で撹拌した。その固体を濾過により収集し、エチルアルコール(750mL)で洗浄した。生成物のD−リボノラクトン(19b)を40℃で真空オーブン(0.1mmHg)内で乾燥させた。収量1.28kg(65%);M.P.77〜80℃;1H NMR (D2O) δ 4.72 (d, 1 H), 4.57 (t, 1 H), 4.42 (d, 1 H), 3.80 (m, 2 H)。
50Lのジャケット付き反応槽にD−リボノ−1,4−ラクトン(19b)(3.0kg、20.27モル)、および30LのACSグレードのアセトンを入れた。この反応混合物を1時間に亘り室温で撹拌した。この反応槽の内部温度を10℃に低下させ、反応混合物に濃硫酸(49mL)をゆっくりと加えた。硫酸の添加の際に、内部の反応温度をゆっくりと上昇させた。この反応混合物を2.5〜3時間に亘りこの温度で撹拌した。反応はTCL(TLC;9:1、塩化メチレン:メチルアルコール、Rf=0.75)により監視した。pHが中性となるまで固体の重炭酸ナトリウム(〜500g)を加えることによって、反応混合物を中和した。反応混合物を漏斗で濾過した。無機塩を含有する固体残留物をアセトン(3L)で洗浄した。濾液を20Lの蒸発フラスコに移し、蒸発乾固させて(50℃、10mmHg)、半固体の化合物を得た。この残留物を酢酸エチル(3L)中に採取し、回転式蒸発器において4時間に亘り室温で撹拌した。濾過により固体の2,3−O−イソプロピリデンD−リボノ−1,4−ラクトン(19c)を収集し、40℃で16時間に亘り真空オーブン(0.1mmHg)内で乾燥させた。収量:1.819kg(48%);MP136〜140℃;1H NMR (CDCl3) δ 4.8 (dd, 2 H), 4.6 (s, 1 H), 3.85 (dd, 2 H), 1.5 (s, 3 H), 1.4 (s, 3 H)。
50Lの反応槽内においてACSグレードのピリジン(20L)中の2,3−O−イソプロピリデンD−リボノ−1,4−ラクトン(19c)(4.3kg、22.96モル)の溶液を、完全に溶解するまで、15分間に亘り室温で撹拌した。この反応槽の内部温度を−15℃まで低下させ、その後、2時間の期間に亘り塩化メタンスルホニル(1.96L、25.26モル)をゆっくりと加えた。内部温度は0〜5℃に維持した。反応のTLCがSMを示さなくなるまで(TLC;7:3酢酸エチル:ヘキサン、Rf=0.85)、反応混合物を不活性雰囲気下で〜2時間に亘り0℃で撹拌した。反応が完了した際に、DCM(10L)を加え、3NのHCl(4回、pH=3)で抽出し、[各回に、DCM(5L)で水相を逆抽出た]、その後、迅速に飽和NaHCO3で洗浄した。有機画分を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、蒸発させて、シロップにした。収量:4.89kg(80%)。生成物の2,3−O−イソプロピリデン5−O−メタンスルホニルDリボノ−1,4−ラクトン(26a)は、さらに精製せずに、次の工程に持って行った;1H NMR (CDCl3) δ 4.8 (m, 3H), 4.5 (m, 2H), 3.08 (s, 3H), 1.5 (s, 3H), 1.4 (s, 3H)。
2,3−O−イソプロピリデン5−O−メタンスルホニルDリボノ−1,4−ラクトン(26a)(3.04kg、11.37モル)に水(10L)を加え、その後、固体のKOH(1.83kg、32.77モル)をゆっくりと加えた。(注意:この化合物は、固体のKOHの添加の際に溶液になる。KOHの添加中、反応は発熱性であり、よって、反応槽は氷浴に入れなければならない。)KOHの添加が完了する時までに、反応温度は45℃に到達した。この反応混合物を3時間に亘りほぼ室温(RT)で撹拌した。この溶液を氷浴中で再び冷却し、次いで、濃HCl溶液を使用して、pH=3(正確に)に酸性化した。反応混合物を蒸発させて、固体の茶色の残留物を得た。この残留物を1時間に亘り沸騰アセトン(〜5L)で2回かき混ぜ、有機物を静かに移した。次いで、残りの塩を最小量の水に溶かし、濃HCl(〜200mL)を使用して、pHを3に調節した。この水溶液を濃縮し、固体の残留物をアセントン(〜5L)で抽出した。この有機相を乾燥させ、濾過し、蒸発させて、2,3−O−イソプロピリデンLリキソノ−1,4−ラクトン(26b)の白色の針状結晶を得た。結晶化は、高温アセトン中で行っても差し支えない。収量:1.60kg(75%);1H NMR (D2O) δ 5.00 (m, 2H), 3.8 (m, 3H), 1.5 (s, 3H), 1.4 (s, 3H)。
機械式撹拌機を備えた22Lの三口フラスコに、2,3−O−イソプロピリデンLリキソノ−1,4−ラクトン(26b)(2.0kg、10.63モル)、DMAP(〜25g)、イミダゾール(1.60kg、23.40モル、2.2当量)を加え、1時間に亘りACSグレードのDMF(8L)中で撹拌した。氷浴を使用して、反応温度を0℃に低下させた。この反応混合物に、TBDMSCl(2.08kg、13.81モル、1.3当量)を2時間の期間に亘りゆっくりと加えた。この反応混合物を14時間に亘り不活性雰囲気下において室温で撹拌した。TLC(7:3、EtOAc:ヘキサン、Rf=0.80)により示されるように、反応が完了したときに、反応混合物を氷水に注ぎ入れ、EtOAc(×2)で抽出した。有機層を分離し、乾燥させ、濾過して、油性残留物を得た。この生成物を収容している反応槽を氷浴内に入れ、その後、ヘキサン(〜3L)を加えた。化合物がヘキサン中で結晶化した。結晶を濾過し、この結晶を最小量のヘキサンで洗浄し、その生成物を一晩、40℃の真空オーブンに入れて、2,3−O−イソプロピリデン5−O−tert−ブチルジメチルシリルLリキソノ−1,4−ラクトン(26c)3.01kg(93%)を得た;1H NMR (CDCl3) δ 4.8 (s, 2H), 4.5 (m, 1H), 3.9 (m, 2H), 1.5 (s, 3H), 1.4 (s, 3H), 0.9 (s, 9H), 0.0 (s, 6H)。
THF:MeOH(9:1 v/v混合物、15L)中の2,3−O−イソプロピリデン5−O−tert−ブチルジメチルシリルLリキソノ−1,4−ラクトン(26c)(3.00kg、9.93モル)の溶液を、完全な溶解が観察されるまで、0.5時間に亘り室温で撹拌した。反応槽の内部温度を−5℃に低下させた。水素化ホウ素ナトリウム(751g、19.86モル、2当量)を、その温度が15〜17℃を超えないように少量ずつ加えた。試薬の添加は、1時間の期間で完了した。この反応は、3時間の期間に亘り室温のままにし、次いで、18時間に亘りこの温度で撹拌を継続した。反応混合物はTLC(3:7、酢酸エチル:ヘキサン、Rf=0.15)により監視した。反応が完了したときに、この溶液をEtOAc(5L)で希釈し、1NのHCl溶液で洗浄した(2回)。有機層を水で洗浄し、乾燥させ、蒸発させて、油性残留物を得た。これに、〜3Lのヘキサンを加え、蒸発フラスコを氷浴中で冷却した。この溶液から結晶が激しく形成された。その結晶を濾過し、〜250mLのヘキサンで洗浄した。24時間に亘り40℃で真空オーブン内で乾燥させて、2−(tert−ブチルジメチルシラノキシ)−1−(5−ヒドロキシメチル−2,2−ジメチル−[1,3]ジオキソラノ−4−イル)−エタノール(26d)を得た。収量:2.32kg(77%);1H NMR (CDCl3) δ 4.2 (m, 2H), 3.7 (m, 5H), 1.5 (s, 3H), 1.4 (s, 3H), 0.9 (s, 9H), 0.0 (s, 6H)。
500mLの三口フラスコに、乾燥ピリジン(20mL)、触媒量のDMAPを入れ、その後、0℃で塩化メタンスルホニル(4.98mL、64.4ミリモル、4.0当量)を加えた。乾燥ピリジン(20mL)中に溶かした2−(tert−ブチルジメチルシラノキシ)−1−(5−ヒドロキシメチル−2,2−ジメチル−[1,3]ジオキソラノ−4−イル)−エタノール(26d)(5.0g、16.3ミリモル)を反応槽にゆっくりと加えた。この反応混合物をこの温度で4時間に亘り不活性雰囲気下において撹拌した。(TLC;1:9酢酸エチル:ヘキサン、Rf=0.85)。反応が完了したときに、1mLの水および100mLのEtOAcを加え、撹拌した。有機層を水で抽出し、乾燥させ、蒸発させて、メタンスルホン酸2−(tert−ブチルジメチルシライルオキシ)−1−1(5−メタンスルホニルオキシメチル−2,2−ジメチル−[1,3]ジオキソラノ−4−イル)−エチルエステル(26e)のシロップを得た。収量:8.7g(90%)。この原料を、さらに精製せずに次に工程に持って行った。
メタンスルホン酸2−(tert−ブチルジメチルシライルオキシ)−1−1(5−メタンスルホニルオキシメチル−2,2−ジメチル−[1,3]ジオキソラノ−4−イル)−エチルエステル(26e)(8.6g)に、生の(neat)ベンジルアミン(10mL)を加え、この反応混合物を48時間に亘り70℃に加熱した。TLC(4:1ヘキサン:EtOAc、Rf=0.68)は、反応が完了したことを示した。この反応混合物を冷却し、反応混合物にブラインを加えた。この反応混合物をジクロロメタンで抽出し、水で洗浄し、乾燥させ、蒸発させて、大量のアミン試薬を含有するシロップを得た。この残留物をトルエン中に取り出し、塩を沈殿させるように、それにドライアイス小片を加えた。固体を濾過し、濾液を蒸発させて、所望の生成物である5−O−tert−ブチルジメチルシリル−1,4−N−ベンジルイミノ−2,3−O−イソプロピリデン−D−リビトール(26f)(5.6g、92%)を得た。これを、さらに精製せずに、次の工程に直接持って行った。1H NMR (CDCl3) δ 7.2 - 7.4 (m, 5H), 4.65 (m, 1H), 4.55 (dd, 1H), 4.0 (d, 1H), 3.6 - 3.8 (m, 3H), 3.1 (dd, 1H), 3.0 (m, 1H), 2.75 (dd, 1H), 1.5 (s, 3H), 1.34 (s, 3H), 0.9 (s, 9H), 0.0 (s, 6H)。
EtOH(15mL)中の5−O−tert−ブチルジメチルシリル−1,4−N−ベンジルイミノ−2,3−O−イソプロピリデン−D−リビトール(26f)(5.93g、15.74ミリモル)にPd/C(50mg)を加え、5時間に亘り、またはTLC(3:2、ヘキサン:EtOAc、Rf=0.18)が、反応が完了したことを示すまで、反応を80psi(約52kPa)で水素化した。この反応混合物をCeliteで濾過し、このCeliteパッドをEtOH(25mL)で洗浄した。濾液をMilliporeフィルタ(0.25μm)に通して、微量の触媒を除去し、蒸発させて、シロップとして5−O−tert−ブチルジメチルシリル−1,4−イミノ−2,3−O−イソプロピリデン−D−リビトール(20a)を得た。収量:3.5g(75%−段階);1H NMR (CDCl3) δ 4.65 (m, 2H), 3.60 (dd, 2H), 3.24 (t, 1H), 3.00 (d, 2H), 1.5 (s, 3H), 1.34 (s, 3H), 0.9 (s, 9H), 0.0 (s, 6H)。
トルエン(470mL)中の5−O−tert−ブチルジメチルシリル−1,4−イミノ−2,3−O−イソプロピリデン−D−リビトール(20a)(94g、327ミリモル)の溶液を、60から90分間の期間に亘り17から23℃でトルエン(470mL)中のN−クロロスクシンイミドの懸濁液(54.6g、408.8ミリモル)に加えた。この反応混合物を1時間に亘り17から23℃で撹拌し、−3から3℃に冷却し、さらに1時間に亘り撹拌した。スクシンイミド副生成物を濾過により除去し、濾過した溶液を、臭化テトラブチルアンモニウム(10.53g、32.7ミリモル)を含有する60%の水酸化カリウム溶液(458g、305mLの水中8175ミリモル)に直接加えた。この反応混合物を17時間に亘り−5から5℃で撹拌した。次いで、水(700mL)をこの二相混合物に加えて、無機沈殿物を溶かし、トルエン生成物溶液を、酢酸アンモニウム緩衝液(pH〜4.5)で緩衝したブライン溶液(700mL)で洗浄し、硫酸マグネシウムに循環させ、次いで、硫酸マグネシウムを反応槽に装填することによる乾燥前にトリエチルアミンで安定化させた。トルエン中の(3aR,4R,6aS)−4−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−2,2−ジメチル−4,6a−ジヒドロ−3aH−[1,3]ジオキソロ[4,5−c]ピロール(20b)を含有する乾燥溶液を、次に工程のために、直ちにそのまま使用する。
N2雰囲気下で、無水アニソール(1.7L)が入った22Lの三口丸底フラスコに、6−メトキシ−N−(ベンジルオキソメチル)−9−デアザヒポキサンチン(27f)(271.0g、0.775モル)を加えた。この混合物が均質になるまで(≒45℃)、この混合物をおだやかに加熱した。この混合物を周囲温度まで冷却し、無水エーテル(2.9L)を加えた。この反応フラスコを冷却浴に入れ、ドライアイス/アセトンを使用して−70℃に冷却した。約−20℃で、微細な白色固体として、臭化物が沈殿し始めた。この懸濁液に、内部温度が−50℃未満に維持されるように、滴下漏斗により1.2時間の期間に亘りnBuLi(1.6N、486mL、0.778モル)を加えた。最後の添加後、TLC(30%EtOAc/ヘキサン)分析は、2%未満の臭化物しか残留しなかったことを示した。内部温度を−50℃未満に維持しながら、トルエン中の(3aR,4R,6aS)−4−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−2,2−ジメチル−4,6a−ジヒドロ−3aH−[1,3]ジオキソロ[4,5−c]ピロール(20b)(183g、0.642モル)を添加漏斗を介して15分間の期間で加えた。反応混合物は淡い琥珀色であった。この反応フラスコを冷却浴から取り出し、暖まらせた。反応混合物を−2℃まで暖まらせ、TLC(40%EtOAc/ヘキサン、エールリッヒ試薬により視覚化)は、(3aR,4R,6aS)−4−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−2,2−ジメチル−4,6a−ジヒドロ−3aH−[1,3]ジオキソロ[4,5−c]ピロール(20b)の残留を示さなかった。H2O(2L)で反応を停止させ、エーテルで抽出した(2×2L)。混合有機層を乾燥させ(MgSO4)、真空下で濃縮して(60℃の高真空を使用してアニソールを除去した)、1S−5−O−tert−ブチルジメチルシリル−1,4−ジデオキシ−1−C−[(4−メチオキシピロロ[3,2−d]ピリミジン−9−N−(ベンジルオキソメチル)−7−イル)]−1,4−イミノ−2,3−O−イソプロピリデン−D−リビトール(26g)を得た。これは次の工程に使用するのに適していた。収量284g(79%)。少量(5g)の粗製混合物を、フラッシュカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、ヘキサン中0〜40%の酢酸エチルによる溶出)により精製して、オレンジ色のシロップ(3.4g)として1S−5−O−tert−ブチルジメチルシリル−1,4−ジデオキシ−1−C−[(4−メチオキシピロロ[3,2−d]ピリミジン−9−N−(ベンジルオキソメチル)−7−イル)]−1,4−イミノ−2,3−O−イソプロピリデン−D−リビトール(26g)を得た;1H NMR (DMSO-d6) δ 0.02 (s, 3 H), 0.03 (s, 3 H), 0.8 (s, 9 H), 1.25 (s, 3 H), 1.48 (s, 3 H), 3.11-3.20 (m, 1 H), 3.60-3.71 (m, 2 H), 4.05 (s, 3 H), 4.26 (d, 1 H, J = 4.7 Hz), 4.49 (s, 2 H), 4.52-4.56 (m, 1 H), 4.81-4.85 (m, 1 H), 5.71 (s, 2 H), 7.21-7.32 (m, 5 H), 7.80 (s, 1 H), 8.40 (s, 1 H); 13C NMR (CDCl3) δ -5.46, -5.43, 18.30, 25.53, 25.88, 27.63, 53.43, 61.59, 62.54, 66.14, 70.14, 76.93, 82.32, 86.40, 114.43, 116.22, 116.56, 127.67, 127.93, 128.43, 130.55, 136.93, 149.61, 149.82, 156.16; IR 3420, 1610 cm-1; MS (ES+) m/z 555.3; 分析値: C29H42N4O5Siについて計算: C, 62.79; H, 7.63; N, 10.10; 実測値: C, 62.95; H, 7.59; N, 9.95。
粗製1S−5−O−tert−ブチルジメチルシリル−1,4−ジデオキシ−1−C−[(4−メチオキシピロロ[3,2−d]ピリミジン−9−N−(ベンジルオキソメチル)−7−イル)]−1,4−イミノ−2,3−O−イソプロピリデン−D−リビトール(26g)(275g、0.496モル)をCH2Cl2(1.4L)中に採取し、氷/水浴中で5℃に冷却した。この冷却混合物に、反応混合物の温度を10℃未満に維持するように、4回に分けてBoc2O(168.5g、0.772モル)を加えた。30分後、TLC(40%酢酸エチル/ヘキサン)は、出発材料が残っていないことを示した。この粗製混合物をSiO2(700g)上に吸収させ、フラッシュクロマトグラフィー(シリカゲル1.5kg、ヘキサン中10%の酢酸エチルで溶出)により精製した。適切な画分を貯留し、真空中で濃縮して、黄色のシロップとして1S−N−tert−ブトキシカルボニル−5−O−tert−ブチルジメチルシリル−1,4−ジデオキシ−1−C−[(4−メチオキシピロロ[3,2−d]ピリミジン−9−N−(ベンジルオキソメチル)−7−イル)]−1,4−イミノ−2,3−O−イソプロピリデン−D−リビトール(26h)(272g、84%)を得た;1H NMR (CDCl3) δ 0.02 (s, 3 H), 0.03 (s, 3 H), 0.82 (s, 9 H), 1.31-1.58 (m, 15 H) 2.05-2.09 (m, 1 H); 3.58-3.80 (m, 2 H), 4.08 (s, 3 H), 4.17-4.32 (m, 1 H), 4.44 (s, 2 H), 4.84-5.71 (m, 4 H), 7.19-7.33 (m, 5 H), 7.46 (s, 1 H), 8.51 (s, 1 H); 13C NMR (CDCl3) δ -5.31, -5.20, 14.10, 14.20, 18.32, 21.01, 22.64, 25.56, 25.93, 27.46, 28.46, 31.58, 53.44, 60.34, 62.48, 70.08, 76.96, 79.84, 111.69, 115.89, 127.67, 127.93, 128.43, 136.90, 148.62, 149.90, 154.38, 156.19; IR 1692, 1608 cm-1; MS (ES+) m/z 655.3; 分析値: C34H50N4O7Siについて計算: C, 62.43; H, 7.65; N, 8.56; 実測値: C, 62.79; H, 7.89; N, 8.47。
チャコール上の水酸化パラジウム(120g、50%の湿式)を2Lに三角フラスコに入れた。20Lのポリドラムにメタノール(7.60kg)を秤量して入れた。このメタノールの0.80kgを使用して、水酸化パラジウム触媒が入った三角フラスコに移し、この三角フラスコを旋回させて、均質な混合物を調製した。次いで、この懸濁液を、窒素でパージした20Lの水素化槽に注ぎ入れた。チャコール上の残留した水酸化パラジウムをメタノール(25mL)で三角フラスコから水素化槽に注ぎ入れた。1S−N−tert−ブトキシカルボニル−5−O−tert−ブチルジメチルシリル−1,4−ジデオキシ−1−C−[(4−メチオキシピロロ[3,2−d]ピリミジン−9−N−(ベンジルオキソメチル)−7−イル)]−1,4−イミノ−2,3−O−イソプロピリデン−D−リビトール(26h)(380g)を10Lのポリドラムに入れ、その後、20Lのポリドラムから1.32kgのメタノールを入れた。この1S−N−tert−ブトキシカルボニル−5−O−tert−ブチルジメチルシリル−1,4−ジデオキシ−1−C−[(4−メチオキシピロロ[3,2−d]ピリミジン−9−N−(ベンジルオキソメチル)−7−イル)]−1,4−イミノ−2,3−O−イソプロピリデン−D−リビトール(26h)のメタノール溶液を20Lの水素化槽に入れた。20Lのポリドラムの残りを濯ぎ液として10Lのポリドラムを通じてこの槽に入れた。メタノール中のアンモニア溶液(7.0M、0.68kg)を10Lのポリドラムに計り取り、水素化槽に移した。この槽を水素ガスで5バール(500kPa)に加圧し、その内容物を撹拌によって35℃に加熱した。これらの反応条件は、必要に応じて、水素を補給しながら、20時間に亘り維持した。この後、HPLC分析は、約2%の出発材料が残留したことを示し、これは、反応が十分に完了したことを示唆した。その槽の内容物を20Lのポリドラムに移し、次いで、Celite床に通して濾過した。この作業中にフィルタの漏斗に窒素をパージし、メタノール(1.50kg)を使用して、濾過ケークを洗浄した。濾液および洗浄液を回転式蒸発器に移し、減圧下で0.48kgの質量まで濃縮した。この回転式蒸発器のフラスコにメタノール(2.50kg)を加え、その溶液を一定質量(0.340kg、ほぼ定量的収率)まで濃縮した。追加のメタノール(1.0kg)を生成物の(3aR,4R,6S,6aS)−tert−ブチル4−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−6−(4−メトキシ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−2,2−ジメチルジヒドロ−3aH−[1,3]ジオキソロ[4,5−c]ピロール−5(4H)−カルボキシレート(26i)に加えて、次の工程に使用するための溶液を調製した。
(3aR,4R,6S,6aS)−tert−ブチル4−(((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)−6−(4−メトキシ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−2,2−ジメチルジヒドロ−3aH−[1,3]ジオキソロ[4,5−c]ピロール−5(4H)−カルボキシレート(26i)の溶液をメタノールで希釈して、2.5Lの全体積にし、機械式撹拌機、還流冷却器および内部温度計を備えた5Lの多口の丸底フラスコに入れた。油浴を使用して、この溶液を加熱すると同時に、濃塩酸(37%、2.18Lまたは2.62kg)を40分間で入れた(この期間中に内部温度が43℃から58℃に上昇した)。さらに6時間に亘り加熱を継続し、内部温度が68℃に到達し、その時点で、溶液を室温まで冷ませ、さらに15時間に亘り撹拌した。この茶色の溶液を回転式蒸発器で1.5〜2.0Lの体積まで濃縮し、次いで、水(0.5L)を加えた。この懸濁液を先の5Lのフラスコに戻し、加熱して、固体を再度溶かした。これは、追加の水(0.5L)を加えた後に50℃で行った。チャコール(95g)を加え、この懸濁液を1時間に亘り50℃で撹拌した。このチャコールは、Celiteパッドに通す濾過によって除去し、水(約1.0L)で洗浄した。今ではある程度脱色された濾液と洗浄液を回転式蒸発器で0.95Lの体積に濃縮した。この周囲温度の溶液を10Lのフラスコに移し、撹拌しながら氷浴中で冷却した。エタノール(7.90L)をこの溶液に少しずつ入れ、生成物を結晶化させた。さらに2時間に亘り撹拌し、内部温度を5℃に低下させた。固体生成物を窒素シール下で濾過により収集し、予め冷却したエタノールで洗浄した(3×250mL)。この生成物を30分間に亘りフィルタの漏斗で引いて乾燥させ、次いで、乾燥トレイに移した。この生成物を70℃で一晩オーブン乾燥させて、オフホワイト色の固体(101.2g、58%)として7−((2S,3S,4R,5R)−3,4−ジヒドロキシ−5−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−2−イル)−3H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−4(5H)−オン塩酸塩(26j)を得た。この7−((2S,3S,4R,5R)−3,4−ジヒドロキシ−5−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−2−イル)−3H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−4(5H)−オン塩酸塩(26j)(101.2g)を20Lのジャケット付き槽に入れた。水(1.52L)を加え、固体が溶けるまで懸濁液を撹拌した。濃塩酸(37%、63.6mL)を入れ、この溶液を25℃で撹拌した。一旦均質になったら、この溶液をポリドラムに流し入れ、その槽を水(506mL)できれいに濯いだ。浄化工程として、7−((2S,3S,4R,5R)−3,4−ジヒドロキシ−5−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−2−イル)−3H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−4(5H)−オン塩酸塩(26j)の溶液を、ポリプロピレン製フィルタ漏斗上の濾紙に通して濾過し、次いで、前記槽に戻した。洗浄液も同様に濾過し、次いで、この槽に戻した。この溶液を45分間に亘り約15℃で撹拌した。15分間に亘り、この撹拌溶液にエタノール(1.0L)を加えた。7−((2S,3S,4R,5R)−3,4−ジヒドロキシ−5−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−2−イル)−3H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−4(5H)−オン塩酸塩(26j)種結晶(2.0g)を加えて、結晶化を誘発した。70分後、エタノール(1.0L)を加え、この懸濁液をさらに19.5時間に亘り15℃で撹拌した。この懸濁液に追加のエタノール(8.0L)を加え、15℃での撹拌をさらに5時間に亘り継続した。ジャケットの温度を0℃に設定し、撹拌をさらに2時間に亘り継続した。この時点で、懸濁液をポリドラムに流し入れ、ポリプロピレン製フィルタ漏斗内の濾紙に通して濾過した。濾過ケークを冷却したエタノールで洗浄し(1.0Lと、次いで、0.5L)、30分間にフィルタの漏斗上で引いて乾燥させた。次いで、この固体を乾燥トレイに移し、70℃で一晩オーブン乾燥して、オフホワイト色の固体(176.9g、87%の回収率)として7−((2S,3S,4R,5R)−3,4−ジヒドロキシ−5−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−2−イル)−3H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−4(5H)−オン塩酸塩(26j)を得た。
水:メタノールの混合物(1:1、10.4L)中の7−((2S,3S,4R,5R)−3,4−ジヒドロキシ−5−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−2−イル)−3H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−4(5H)−オン(26j)の懸濁液(446.19g、1.47モル)に、室温でトリエチルアミン(621mL、4.42モル、3.0当量)を加え、その後、(Boc)2O(987g、4.53モル、3.1当量)を加えた。この反応混合物は、(Boc)2Oの添加後、透明な着色溶液となり、内部温度が28℃から33℃へとわずかに上昇した。この溶液は、1時間の撹拌後に、いくらか濁り始めた。この溶液を室温で一晩撹拌した。固体生成物を濾過により収集し、水(5.0L)で洗浄し、50℃で高真空において乾燥させて、オフホワイト色の固体として(2R,3R,4S,5S)−tert−ブチル3,4−ジヒドロキシ−2−(ヒドロキシメチル)−5−(4−オキソ−4,5−ジヒドロ−3H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)ピロリジン−1−カルボキシレート(28a)(482g、89%)を得た;1H NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ 11.92 (s, 2H), 7.81 (s, 1H), 7.32 (d, J = 22.7 Hz, 1H), 5.73 - 5.20 (m, 1H), 5.05 - 4.91 (m, 1H), 4.87 - 4.76 (m, 1H), 4.74 - 4.49 (m, 1H), 4.33 - 4.17 (m, 1H), 4.09 - 3.86 (m, 2H), 3.64 - 3.48 (m, 2H), 1.39 - 1.00 (m, 9H); MS (ES+) 755.1 (2M+Na), (ES-) 731.7 (2M-1); 分析値: C16H22N4O6について計算: C, 52.45; H, 6.05; N, 15.29; 実測値: C, 52.24; H, 6.02; N, 15.05。
ピリジン(740mL、9.21モル、7当量)中の(2R,3R,4S,5S)−tert−ブチル3,4−ジヒドロキシ−2−(ヒドロキシメチル)−5−(4−オキソ−4,5−ジヒドロ−3H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)ピロリジン−1−カルボキシレート(28a)(482g、1.32モル、1.0当量)の懸濁液に、室温でDMAP(3.22g、26.32ミリモル、0.02当量)および無水酢酸(435mL、4.61ミリモル、3.5当量)を加えた。無水酢酸を添加した際に、内部温度が上昇し始め、そのため、氷水浴の冷却が必要であった。無水酢酸を全て添加したら、温度は67℃に上昇し、次いで、室温まで低下した。反応が25℃に到達した後、氷水浴を取り除いた。この懸濁液は透明な溶液を生じなかったが、淡い色の懸濁液が観察された。この反応混合物を15時間に亘り室温で撹拌して、不透明な溶液が生成された。生じたアリコートは、出発材料がなく、TLC(9:1 クロロホルム:メタノール)により2つしか主要なスポットがないことを示し、MSは、生成物およびテトラアセチル化生成物についての(493.0、M+1)に2つの主要なピークを示す(M+1=535)。この反応混合物を3.0Lのクロロホルムで希釈し、10分間に亘り撹拌し、次いで、2.0Lの脱イオン水を加えた。水相と有機相の界面に、蝋状の白色の未知の生成物が形成された。この未知の生成物は、分配を行った後に水相中に残留した。有機相を分離し、2.0Lの水で再び洗浄した。これらの混合水層を1.0Lのクロロホルムで逆抽出した。混合有機相を2.0NのHCl水溶液(2×1.0L)、水(2×1.0L)、飽和重炭酸ナトリウム(2×1.0L)およびブライン(2×1.0L)で洗浄した。有機層をMgSO4で乾燥させ、濾過し、真空下と50〜55℃の水浴で濃縮乾固した。蒸留液が見られなくなったら真空を高真空油ポンプに切り換えて、緻密なシロップ状生成物を得た。丸底フラスコを14時間に亘り高真空下において、残留ピリジンを最小にした。微細な白色固体となった固体の泡と(2R,3R,4S,5S)−2−(アセトキシメチル)−1−(tert−ブトキシカルボニル)−5−(4−オキソ−4,5−ジヒドロ−3H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)ピロリジン−3,4−ジイル−ジアセテート(28b)の緻密な残留物の組合せが得られた(715、収率110%)。この百分率は、テトラアセチル化化合物の量を反映している。この生成物は、次の工程にそのまま使用するのに十分に純粋であった。分析用サンプルは、フラッシュカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、ヘキサン中の0〜100%酢酸エチル/メタノール(9:1)による溶出)を使用して混合物を精製して、白色固体として(2R,3R,4S,5S)−2−(アセトキシメチル)−1−(tert−ブトキシカルボニル)−5−(4−オキソ−4,5−ジヒドロ−3H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)ピロリジン−3,4−ジイル−ジアセテート(28b)を得ることによって、調製した;1H NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ12.13 (s, 1H, D2O 交換可能), 11.98 (s, 1H, D2O 交換可能), 7.82 (s, 1H), 7.29 (s, 1H), 5.76 (s, 1H), 5.37 (t, J = 4.5 Hz, 1H), 4.99 (s, 1H), 4.55 (dd, J = 11.3, 6.6 Hz, 1H), 4.34 (d, J = 8.3 Hz, 1H), 4.03 (q, J = 7.1 Hz, 1H), 2.01 (d, J = 12.6 Hz, 9H), 1.23 (dd, J = 39.9, 32.8 Hz, 9H); MS (ES+) 493.0 (M+1); (ES-) 526.7 (M+Cl); 分析値: C22H28N4O9について計算: C, 53.65; H, 5.73; N, 11.38; 実測値: C, 53.18; H, 5.89; N, 11.10。
アセトニトリル(2.75L)中の(2R,3R,4S,5S)−2−(アセトキシメチル)−1−(tert−ブトキシカルボニル)−5−(4−オキソ−4,5−ジヒドロ−3H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)ピロリジン−3,4−ジイル−ジアセテート(28b)の溶液に、室温で、塩化ベンジルトリエチルアンモニウム(575g、2.5モル、2.0当量)、ジメチルアニリン(240mL、1.9モル、1.5当量)を加え、その後、POCl3(706mL、7.58モル、6.0当量)を加えた。透明な薄黄色の溶液が得られた。この反応混合物を80℃までゆっくりと加熱し、10分間に亘りこの温度に保持した。9:1のクロロホルム:メタノール中のTLCは、反応が98%超完了したことを示した。この黒色の均質溶液を50.0℃に冷却し、真空下(水浴70〜73℃)で濃縮して、POCl3を除去した;残留物を、蒸留液が見られなくなるまで、高真空油ポンプ下に置いた。この残留物を3.0Lのクロロホルム中に溶かし、中性pHが得られるまで、飽和重炭酸ナトリウム水溶液で注意深く迅速に洗浄した。その有機層を分離し、水(2L)、ブライン(2L)で洗浄し、MgSO4で乾燥させ、濾過し、真空中で濃縮乾固した(50〜53℃で水浴)。(2R,3R,4S,5S)−2−(アセトキシメチル)−1−(tert−ブトキシカルボニル)−5−(4−クロロ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)ピロリジン−3,4−ジイル−ジアセテート(28c)の黒色生成物を、精製せずに次の工程にそのまま使用した。分析用サンプルは、フラッシュカラムクロマトグラフィー(シリカゲル12g、ヘキサン中の0〜50%の酢酸エチル/メタノール(9:1)による溶出)を使用して0.5gを精製することにより調製し、得られた関連生成物をエーテル/ヘキサン中に溶かし、一晩放置し、形成された結晶(301mg)を濾過により収集して、白色固体として(2R,3R,4S,5S)−2−(アセトキシメチル)−1−(tert−ブトキシカルボニル)−5−(4−クロロ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)ピロリジン−3,4−ジイル−ジアセテート(28c)を得た;1H NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ 12.55 (s, 1H, D2O 交換可能), 8.65 (s, 1H), 7.87 (bs, 1H), 5.79 (bs, 1H), 5.44 (t, J = 4.0 Hz, 1H), 5.10 (bs, 1H), 4.56 (dd, J = 11.5, 6.8 Hz, 1H), 4.38 (dd, J = 11.4, 4.1 Hz, 1H), 4.08 (bs, 1H), 2.07 (s, 3H), 2.00 (s, 6H), 1.38 (s, 4H), 1.13 (s, 5H); MS (ES+) 510.865 (M+1), (ES-) 508.717 (M-1); 分析値: C22H27ClN4O8について計算: C, 51.72; H, 5.33; Cl, 6.94; N, 10.97; 実測値: C, 51.91; H, 5.32; Cl, 6.76; N, 10.90。
DMF(1.5L)中の(2R,3R,4S,5S)−2−(アセトキシメチル)−1−(tert−ブトキシカルボニル)−5−(4−クロロ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)ピロリジン−3,4−ジイル−ジアセテート(28c)(622g、1.26モル、1.0当量)の溶液に、ナトリウムアジド(411g、6.32モル、5当量)を加え、10時間に亘り60℃で撹拌しながら加熱し、その時点で、反応が完了した(9:1のクロロホルム:メタノールおよび1:1のヘキサン:酢酸エチル中のTLC)。この反応混合物を25℃に冷却し、氷(2L)中に放出し、クロロホルム(2×1L)で抽出した。これらのクロロホルム層を混ぜ合わせ、水(2×2L)、ブライン(2L)で洗浄し、乾燥させ、濾過し、真空下(水浴70〜80℃)で濃縮して、黒色のスラッジを得た。このスラッジの精製は、カラムクロマトグラフィー(987gの黒色スラッジ、8×30インチカラム、半分のシリカゲル、溶出プロファイルヘキサン:酢酸エチル;9:1(40.0L);7:3(20.0L);6:4(20.0L);1:1(20L);4:6(20.0L)および2:8(20.0L))により行った。適切な画分を貯留し、真空下(水浴50.0℃)で濃縮して、緻密な赤みがかったハチミツ様生成物として、(2R,3R,4S,5S)−2−(アセトキシメチル)−5−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−1−(tert−ブトキシカルボニル)ピロリジン−3,4−ジイル−ジアセテート(28d)(407.05g、2工程で収率62.3%)として得た。分析用サンプルは、フラッシュカラムクロマトグラフィー(ヘキサン中の0〜100%の酢酸エチル)による混合物の精製により調製して、オレンジ色の固体として(2R,3R,4S,5S)−2−(アセトキシメチル)−5−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−1−(tert−ブトキシカルボニル)ピロリジン−3,4−ジイル−ジアセテート(28d)を得た。1H NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ 13.08 (d, J = 155.6 Hz, 1H, D2O 交換可能), 9.86 (s, 1H), 7.61 (d, J = 76.8 Hz, 1H), 5.78 (t, J = 4.5 Hz, 1H), 5.41 (t, J = 4.3 Hz, 1H), 5.21 (s, 1H), 4.55 (dd, J = 11.4, 6.4 Hz, 1H), 4.41 (dd, J = 11.4, 3.9 Hz, 1H), 4.07 (d, J = 16.5 Hz, 1H), 2.06 (s, 3H), 2.01 (d, J = 9.9 Hz, 6H), 1.23 (dd, J = 39.8, 32.7 Hz, 9H); MS (ES+) 518.0 (M+1), 540 (M+23); (ES-) 516.4 (M-1); 分析値: C22H27N7O8について計算: C, 51.06; H, 5.26; N, 18.95; 実測値: C, 50.97; H, 5.30; N, 18.62。
(2R,3R,4S,5S)−2−(アセトキシメチル)−5−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−1−(tert−ブトキシカルボニル)ピロリジン−3,4−ジイル−ジアセテート(28d)を以下のように3つの異なるバッチで還元した。
バッチ1:(2R,3R,4S,5S)−2−(アセトキシメチル)−5−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−1−(tert−ブトキシカルボニル)ピロリジン−3,4−ジイル−ジアセテート(28e)(81.5g、165.8ミリモル)に、室温で、無水メタノール(370mL)を加え、その後、NaOMe(ナトリウムメトキシド、メタノール中25質量%の溶液、4.49g、20.76ミリモル)を加えた。TLC(クロロホルム:メタノール9:1)が全ての出発材料が反応したことを示すまで、この反応混合物を室温で撹拌した。
工程1:3−アミノ−1H−ピロール−2,4−ジカルボン酸ジメチル(27b)の調製
メタノール(3.6L)中のアミノマロン酸ジエチル(370.4g、1.75モル)の溶液に、室温で、一度にNaOMeの5.4M溶液(975mL、5.25モル)を加えた(反応混合物は薄茶色であった)。この反応混合物に、(エトキシメチレン)シアノ酢酸エチル(27a)(296g、1.75モル)を3回で加えた(添加中にそれほど温度変化は観察されなかった〜1℃の変化、反応の色は、薄茶色から濃茶色に変化した)。この反応混合物を48時間に亘り還流しながら加熱した(出発材料の消失を調査するために、ヘキサン中50%の酢酸エチルのTLC分析を行った)。この反応混合物は、pH6までAcOH(210mL、3.5モル)の添加により中和した。この反応混合物を真空下で濃縮して、茶色の残留物を得た。その残留物を水(3L)でトリチュレートし、濾過、水(500mL)とヘキサンで洗浄した。これを48時間に亘り空気乾燥し、60℃で真空オーブン乾燥させて、茶色の固体として3−アミノ−1H−ピロール−2,4−ジカルボン酸ジメチル(27b)287g(83%)を得た。これを次の工程のそのまま使用した。
エタノール(2.8L、2mL/ミリモル)中の3−アミノ−1H−ピロール−2,4−ジカルボン酸ジメチル(27b)(286g、1.44モル)および酢酸ホルムアミジン(451g、4.33モル)の混合物を一晩、還流しながら加熱した。この反応混合物は、最初は均質ではなかったが、数時間の還流後に、均質になり、濃茶色になってようである(溶液から固体が沈殿し始めると、撹拌が難しくなる)。アリコート(ヘキサン中50%の酢酸エチル)のTLC分析により、まだいくらかの未反応の出発材料が存在したことが示された。反応混合物を、さらに24時間に亘り還流しながら加熱し続け、室温まで冷却した。得られた固体を濾過により収集し、水とヘキサンで洗浄し、真空下で乾燥させて、薄茶色の固体として3H,5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−4−オン(27c)(223g、80%)を得た。この材料を、精製せずにそのまま使用した。
2NのKOH(1.35L、2.7モル)中の3H,5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−4−オン(22a)(130.4g、0.675モル)の混合物を40時間に亘り穏やかに還流しながら加熱した。この反応混合物を60℃に冷却し、氷酢酸(162mL、2.7モル)でpH6に注意深く中和した(脱炭酸による泡立ちが観察され、反応混合物の色は黒色であった)。この反応混合物を室温まで冷却し、得られた固体を濾過により収集し、水(2×250mL)で洗浄し、空間乾燥し、P2O5上で高真空により乾燥させて、黒灰色の固体(145g、159%)として生成物を得た。この生成物のNMRは、多くの酢酸またはその塩を示し、よって、収率は高くなる(TLCは、溶媒系としてCMA−80を使用して、ベースラインのいくらかの生成物に加えて清浄な生成物を示す)。この生成物を水(400mL)でトリチュレートし、泡立ちがなくなりかつpHが7〜8程度になるまで、飽和NaHCO3水溶液で中和した。黒灰色の固体を濾過により収集し、水で洗浄し、48時間に亘り空気乾燥して、67.62g(74%)の生成物を得た。この生成物を、エタノール還流温度で真空乾燥させて、黒灰色の粉末として3H,5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−4−オン(22a)を得た;分析的に純粋なサンプルのMP>250℃;1H NMR (360 MHz, DMSO-d6) δ 12.05 (s, D2O 交換可能, 1H), 11.82 (s, D2O 交換可能, 1H), 7.77 (s, 1H), 7.36 (s, 1H), 6.35 (s, 1H)。 13C-NMR (DMSO-d6) 153.88, 144.80, 141.66, 127.51, 117.92, 103.10; IR (KBr) 3107, 3030 および 1674 cm-1; MS (ES+) 136.2 (M+1); 分析値: C6H5N3Oについて計算: C, 53.33; H, 3.73; N, 31.10; 実測値: C, 53.38; H, 3.77; N, 31.11。
3H,5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−4−オン(22a)(31.08g、230ミリモル)のサンプルに、窒素雰囲気下でオキシ塩化リン(60mL、644モル、2.8当量)を加えた。この混合物を1時間に亘り還流しながら加熱し、その際中に、その反応は黒色に均質となった。その反応を氷水浴中で冷却し、次いで、撹拌しながら氷片(775mL)中に注ぎ入れた。この水溶液のpHを、混合物を継続して冷却しながら、濃NH4OH(225mL)で〜pH8にゆっくりと調節した。得られた沈殿物を真空濾過により収集し、水で洗浄した。その固体を乾燥トレイに移し、110℃で真空乾燥させて、濃灰色の固体として4−クロロピロロ[3,2−d]ピリミジン(27d)(31.48g、89%)を得た。分析用サンプルは、カラムクロマトグラフィー(シリカゲル、EtOAc−ヘキサン、35:65)と、その後の関連画分の蒸発によって得た。EtOAc−MeOHによる固体のトリチュレーションにより、オフホワイト色の固体として4−クロロピロロ[3,2−d]ピリミジン(27d)を得た、MP>150℃;1H NMR (DMSO-d6) δ 12.43 (s, D2O 交換可能, 1H), 8.61 (s, 1H), 7.97 (dd, J = 2.8, 2.8 Hz; D2O dまで崩壊したら交換(exchange collapse to d), 1H), 6.72 (dd, J = 1.7, 3.5 Hz; D2O dまで崩壊したら交換, 1H). 13C-NMR (DMSO-d6) 151.30, 149.58, 142.12, 134.83, 124.32, 102.70; IR (neat) 3128, 3078, 2979, 1621 cm-1; MS (ES+) 154.01 (100 %, M+1) および 156.01 (33 %); 分析値: C6H4N3Clについて計算: C, 46.93; H, 2.63; N, 27.36; Cl, 23.09; 実測値: C, 47.10; H, 2.79; N, 27.15; Cl, 22.93。
4℃に冷却した無水THF(1.0L)中の予洗したNaHの懸濁液(20g、500ミリモル、1.25当量、60%の油分散、ヘキサンにより2回洗浄)に、H2ガスの発生が制御されるように10〜15分間に亘りN2雰囲気下で撹拌しながら注意深く、4−クロロピロロ[3,2−d]ピリミジン(27d)(61.4g、400ミリモル)を何回かに分けて加えた。約1時間後、ガスの発生が止まり、4℃で45分間に亘りベンジルクロロメチルエーテル(61mL、440ミリモル、1.1当量)を滴下した。得られた混合物を周囲温度まで暖まらせ、1時間に亘りかき混ぜた。反応混合物を4℃に冷却し、ナトリウムメトキシド(93mL、メタノール中5.4Mの溶液、500ミリモル)で注意深く急冷した。混合物を一晩で周囲温度まで暖まらせ、氷酢酸(30mL、500ミリモル)でpH6に中和した。この混合物を濃縮し、残留物を水(2×400mL)でトリチュレートした。水層を他の容器に移し、残留物を真空中で乾燥させた。残留物を酢酸エチル(250mL)中に採取し、沸騰させて還流し、波形濾紙に通して濾過した。残留物を酢酸エチル(2×100mL)と共に沸騰させ、濾過した(後に残った残留物は、望ましくない化合物であり、ヘキサン中50%の酢酸エチルのTLC分析において動かない)。濾液を混ぜ合わせ、250mLに真空下で濃縮し、一晩冷蔵庫内に保持した。得られた茶色の結晶を濾過により収集し、氷冷酢酸エチル/ヘキサン(2×100mL)で洗浄し、真空内で乾燥させて、橙褐色の固体として6−メトキシ−N−(ベンジルオキシメチル)−9−デアザヒポキサンチン(27e)(46.64g、43%)を得た。分析用サンプルは、酢酸エチルからの再結晶化により調製した;MP123〜127℃;1H NMR (DMSO-d6) δ 8.44 (s, 1H), 7.86 (d, J = 3.1 Hz, 1 H), 7.31 - 7.22 (m, 5 H), 6.62 (d, J = 3.6 Hz, 1 H), 5.75 (s, 2 H), 4.49 (s, 2 H), 4.05 (s, 3 H); 13C-NMR (DMSO-d6) 156.11, 151.59, 150.09, 137.82, 134.80, 128.53, 127.87, 127.77, 114.99, 103.08, 77.55, 69.95, 53.73; IR (KBr) 1602 cm-1; MS (ES+) 269.97 (M+1); 分析値: C15H15N3O2について計算: C, 66.90; H, 5.61; N, 15.60; 実測値: C, 67.09; H, 5.60; N, 15.60。
4℃に冷却されたN2雰囲気下にあるジクロロメタン(225mL)中の6−メトキシ−N−(ベンジルオキシメチル)−9−デアザヒポキサンチン(27e)(59.81g、222ミリモル)の溶液(均質な反応混合物)に、反応温度が15℃未満のままであるように何回かに分けてNBS(40.3g、224モル、1.01当量)を加えた。この混合物を15分間に亘り0℃で撹拌し、15分間で室温まで暖まらせた(ヘキサン中50%の酢酸エチルのTLC分析)。この反応混合物を真空濾過して、不溶性のスクシンイミドを除去した。濾液を水(2×250mL)とブライン(200mL)で洗浄し、乾燥させ(Na2SO4)、濾過し、真空内で濃縮して、薄茶色の固体として生成物を得た。その固体を、酢酸エチル(200mL)の沸騰により溶かし、ヘキサン(200mL)で希釈した。この溶液を沸騰させて還流し、非常に迅速に高温濾過した(固体の晶出を避けるために)。次いで、濾液を沸騰させ、200mLずつヘキサンを加えた(1600mLの全体積のヘキサン)。この高温溶液を必要に応じて、他に移して、不溶性の残留物を除去した(生成物は、ヘキサン中10%の酢酸エチル中に可溶性である)。高温濾液を室温まで冷ませ、次いで、一晩、冷蔵庫内に保持した。得られた固体を濾過により収集し、ヘキサンで洗浄し、室温で真空内において乾燥させて、薄黄色の固体として6−メトキシ−N−(ベンジルオキシメチル)−9−ブロモ−9−デアザヒポキサンチン(27f)(59.6g、77%)を得た:MP 103〜108℃;1H NMR (DMSO-d6) δ 8.51 (s, 1H), 8.12 (s, 1H), 7.31 - 7.22 (m, 5H), 5.74 (s, 2H), 4.52 (s, 2H), 4.07 (s, 3H). 13C-NMR (DMSO-d6) 156.19, 150.66, 148.14, 137.59, 133.45, 128.38, 127.80, 127.67, 115.02, 90.90, 77.79, 70.25, 54.07; IR (KBr) 3078, 1602, 1542 cm-1; MS (ES+) 348.27 (100 %), 350.28 (98 %); 分析値: C15H14N3O2Brについて計算: C, 51.74; H
, 4.05; N, 12.07; 実測値: C, 51.72; H, 4.04; N, 12.06。
TFA(10mL)中の(3aS,4S,6R,6aR)−tert−ブチル4−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−6−(((2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノイル)オキシ)メチル)−2,2−ジメチルジヒドロ−3aH−[1,3]ジオキソロ[4,5−c]ピロール−5(4H)−カルボキシレート(30e)(600mg、1ミリモル)の溶液を1時間に亘り室温で撹拌し、真空下で濃縮乾固した。その残留物を10mLのAcOH中に溶かし、BCl3の溶液(3.6mL、3.6ミリモル、ジクロロメタン中1M)を加え、4分間に亘り室温で撹拌し、水(5mL)で急冷した。反応混合物を濃縮乾固した。残留物を凍結乾燥して、白色の固体として、(S)−((2R,3R,4S,5S)−5−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3,4−ジヒドロキシピロリジン−2−イル)メチル2−アミノ−3−メチルブタノエート塩酸塩(30f)(400mg、76%)を得た;1H NMR (300 MHz, DMSO-d6/D2O) δ 8.64 (s, 1H), 8.21 (s, 1H), 4.83 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 4.63 - 4.49 (m, 3H), 4.27 - 4.19 (m, 1H), 3.94 (d, J = 4.8 Hz, 1H), 3.82 - 3.70 (m, 1H), 2.33 - 2.18 (m, 1H), 0.99 (d, J = 6.9 Hz, 6H); MS (ES+) 365.1 (M+1); 分析値: C16H27Cl3N6O4.3HCl.2.5H2Oについて計算: C, 37.17; H, 6.07; Cl, 20.16; N, 16.09; 実測値: C, 37.04; H, 6.22; Cl, 20.50; N, 16.20。
アセトン(2mL)中の(3aS,4S,6R,6aR)−tert−ブチル4−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−6−(((2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノイル)オキシ)メチル)−2,2−ジメチルジヒドロ−3aH−[1,3]ジオキソロ[4,5−c]ピロール−5(4H)−カルボキシレート(30e)(0.151g、0.25ミリモル)の溶液に、濃硫酸(18N、0.139mL、2.5ミリモル)を加え、一晩、室温で撹拌した。反応混合物を他に移し、残留物にアセトン(10mL)を加え、沸騰させ、室温まで冷却した。得られた固体を濾過により収集して、白色の固体として、((2R,3R,4S,5S)−5−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3,4−ジヒドロキシピロリジン−2−イル)メチル2−アミノ−3−メチルブタノエート硫酸塩(30f)を得た;1H NMR (300 MHz, D2O) δ 8.42 (s, 1H), 8.04 (s, 1H), 5.05 (d, J = 8.1 Hz, 1H), 4.79 (d, J = 4.9 Hz, 1H), 4.62 (dd, J = 12.6, 7.5 Hz, 1H), 4.55 (t, J = 5.2 Hz, 1H), 4.20 - 4.08 (m, 3H), 2.45 - 2.28 (m, 1H), 1.06 (t, J = 7.3 Hz, 6H)。
MTBE(2.5mL)中の(3aS,4S,6R,6aR)−tert−ブチル4−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−6−(((2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノイル)オキシ)メチル)−2,2−ジメチルジヒドロ−3aH−[1,3]ジオキソロ[4,5−c]ピロール−5(4H)−カルボキシレート(30e)(0.302g、0.5ミリモル)の溶液に、水(0.046mL)およひ濃硫酸(0.138mL、5.00ミリモル)を加え、15分後にMTBE(2.5mL)を加え、4時間に亘り室温で撹拌した。TBDMEを他に移し、水(0.5mL)を加え、撹拌して、固体を溶かし、次いで、エタノール(9.5mL)を加え、2時間に亘り激しく撹拌した。得られた微細な固体を濾過により収集し、エタノールで洗浄して、白色の固体として((2R,3R,4S,5S)−5−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3,4−ジヒドロキシピロリジン−2−イル)メチル2−アミノ−3−メチルブタノエート硫酸塩(30f)(0.288g、収率103%)を得た;1H NMR (300 MHz, DMSO-d6/D2O) δ 8.26 (s, 1H), 7.81 (s, 1H), 4.67 (d, J = 6.7 Hz, 1H), 4.59 - 4.41 (m, 3H), 4.27 (t, J = 5.6 Hz, 1H), 3.91 (d, J = 4.6 Hz, 1H), 3.81 - 3.69 (m, 1H), 2.28 - 2.10 (m, 1H), 0.97 (d, J = 6.9 Hz, 6H)。
MTBE(2.5mL)中の(3aS,4S,6R,6aR)−tert−ブチル4−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−6−(((2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノイル)オキシ)メチル)−2,2−ジメチルジヒドロ−3aH−[1,3]ジオキソロ[4,5−c]ピロール−5(4H)−カルボキシレート(30e)(0.302g、0.5ミリモル)の溶液に、水(0.138mL)およひ濃硫酸(0.138mL、5.00ミリモル)を加え、15分後にMTBE(2.5mL)を加え、4時間に亘り室温で撹拌した。TBDMEを他に移し、エタノール(9.5mL)を加え、2時間に亘り撹拌し、濾過により固体を収集し、真空下で乾燥させて、((2R,3R,4S,5S)−5−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3,4−ジヒドロキシピロリジン−2−イル)メチル2−アミノ−3−メチルブタノエート硫酸塩(30f)の白色固体(0.160g、0.285ミリモル、収率57.1%)を得た。
工程1:(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−クロロ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3,4−ジヒドロキシ−5−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(30a)の調製
メタノール(200mL)中に溶かした(2R,3R,4S,5S)−2−(アセトキシメチル)−1−(tert−ブトキシカルボニル)−5−(4−クロロ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)ピロリジン−3,4−ジイルジアセテート(28c)(25.8g、50.5ミリモル)の溶液に、室温で、メタノール中25質量%のナトリウムメトキシド(3.6mL、16.66ミリモル)を加えた。この反応混合物を一晩室温で撹拌した。この反応混合物を濃縮乾固し、600gのカラムで精製して、無色の泡として、(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−クロロ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3,4−ジヒドロキシ−5−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(30a)(17.7g、46ミリモル、収率91%)を得た;1H NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ 12.34 (s, 1H), 8.62 (s, 1H), 7.94 (s, 1H), 5.40 - 5.02 (m, 2H), 4.96 - 4.70 (m, 2H), 4.41 - 4.25 (m, 1H), 4.13 - 3.93 (m, 2H), 3.69 - 3.51 (m, 2H), 1.35 (s, 3H), 1.01 (s, 6H); MS (ES+) 384.9 (M+1), 792.6 (2M+Na); (ES-) 382.6 (M-1)。
アセトン(400mL)中の(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−クロロ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3,4−ジヒドロキシ−5−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(30a)(16.3g、42.4ミリモル)の溶液に、2,2−ジメトキシプロパン(11.17mL、89ミリモル)および4−メチルベンゼンスルホン酸水和物(0.41g、2.12ミリモル)を加えた。この反応混合物を一晩、室温で撹拌した。この反応混合物をTEA(590μL、4.24ミリモル)で反応停止させ、濃縮乾固した。残留物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(シリカゲル500g)により精製して、無色の泡として(3aS,4S,6R,6aR)−tert−ブチル4−(4−クロロ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−6−(ヒドロキシメチル)−2,2−ジメチルジヒドロ−3aH−[1,3]ジオキソロ[4,5−c]ピロール−5(4H)−カルボキシレート(30b)(10.7g、25.2ミリモル、収率59.5%)を得た;1H NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ 12.45 (s, 1H), 8.67 (s, 1H), 7.81 (s, 1H), 5.09 (d, J = 36.7 Hz, 3H), 4.82 (d, J = 5.7 Hz, 1H), 4.00 (s, 1H), 3.53 (s, 1H), 3.34 (s, 1H), 1.47 (s, 3H), 1.40 (bs, 4H), 1.29 (bs, 4H), 1.20 (bs, 4H); MS (ES+) 426.9 (M+1); 422.6 (M-1)。
DMF(30mL)中の(3aS,4S,6R,6aR)−tert−ブチル4−(4−クロロ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−6−(ヒドロキシメチル)−2,2−ジメチルジヒドロ−3aH−[1,3]ジオキソロ[4,5−c]ピロール−5(4H)−カルボキシレート(30b)(5.1g、12ミリモル)の溶液にナトリウムアジド(3.9g、60ミリモル)を加え、得られた溶液を4時間に亘り80℃で撹拌した。この反応混合物を真空内で濃縮して、DMFのほとんどを除去し、得られた残留物をクロロホルムに溶かした。有機層を水で洗浄し、MgSO4で乾燥させ、真空内において濃縮して、(3aS,4S,6R,6aR)−tert−ブチル4−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−6−(ヒドロキシメチル)−2,2−ジメチルジヒドロ−3aH−[1,3]ジオキソロ[4,5−c]ピロール−5(4H)−カルボキシレート(30c)(5g、97%)を得た;1H NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ 13.22 (bs, 1H), 9.87 (s, 1H), 7.69 - 7.47 (m, 1H), 5.28 (m, 1H), 5.05 (m, 2H), 4.81 (d, J = 5.9, 1H), 4.06 - 3.91 (m, 1H), 3.57 (m, 1H), 3.51 - 3.38 (m, 1H), 1.48 (s, 3H), 1.41-1.23 (bs, 9H), 1.30 (s, 3H); MS (ES+) 454 (M+Na), 863.1 (2M+1), 885.2 (2M+Na); (ES-) 429.7 (M-1)。
DMF(20mL)中の(3aS,4S,6R,6aR)−tert−ブチル4−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−6−(ヒドロキシメチル)−2,2−ジメチルジヒドロ−3aH−[1,3]ジオキソロ[4,5−c]ピロール−5(4H)−カルボキシレート(30c)(1.088g、2.5ミリモル)および(S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタン酸(L−Bocバリン、0.543g、2.5ミリモル)の溶液に、EDCI(1.198g、6.25ミリモル)およびDMAP(92mg、0.75ミリモル)を加えた。この反応混合物を10日間に亘り室温で撹拌し、水(60mL)で反応停止させ、酢酸エチル(3×50mL)で抽出した。有機層を混ぜ合わせ、水(2×50mL)、ブラインで洗浄し、乾燥させ、真空内で濃縮した。得られた残留物をフラッシュカラムクロマトグラフィーにより2回精製して、白色の固体として(3aS,4S,6R,6aR)−tert−ブチル4−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−6−((((S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノイル)オキシ)メチル)−2,2−ジメチルジヒドロ−3aH−[1,3]ジオキソロ[4,5−c]ピロール−5(4H)−カルボキシレート(30d)(0.75g、47%)を得た;1H NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ 13.30 (s, 1H), 9.88 (s, 1H), 7.60 (s, 1H), 7.10 (s, 1H), 5.34 (s, 1H), 5.20 (dd, J = 5.7, 1.5 Hz, 1H), 4.82 (d, J = 5.8 Hz, 1H), 4.34 - 4.14 (m, 2H), 3.80 (dd, J = 8.0, 5.9 Hz, 1H), 3.34 (s, 1H), 1.97 - 1.84 (m, 1H), 1.47 (s, 3H), 1.43-1.31(m, 21H), 0.80 (dd, J = 6.9, 5.2 Hz, 6H); MS (ES-) 629.1 (M-1); IR (KBr) 2315 cm-1。
メタノール(20mL)中の(3aS,4S,6R,6aR)−tert−ブチル4−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−6−((((S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノイル)オキシ)メチル)−2,2−ジメチルジヒドロ−3aH−[1,3]ジオキソロ[4,5−c]ピロール−5(4H)−カルボキシレート(30d)(0.72g、1.19ミリモル)の溶液にPd/C(200mg、C上5質量%)を加え、2時間に亘り窒素雰囲気下で水素化した。Celiteに通す濾過によって触媒を除去し、濾液を真空内において濃縮した。得られた残留物をカラムで精製して、白色の固体として、(3aS,4S,6R,6aR)−tert−ブチル4−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−6−((((S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノイル)オキシ)メチル)−2,2−ジメチルジヒドロ−3aH−[1,3]ジオキソロ[4,5−c]ピロール−5(4H)−カルボキシレート(30e)(600mg、83%)を得た。1H NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ 11.97 (s, 1H), 10.87 (s, 1H), 8.09 (s, 1H), 7.36 (s, 1H), 6.78 (s, 2H), 5.30 - 5.22 (m, 1H), 5.19 - 5.07 (m, 1H), 4.88 (d, J = 5.9 Hz, 1H), 4.18 - 4.07 (m, 2H), 3.87 - 3.79 (m, 1H), 3.44 (qd, J = 7.0, 5.1 Hz, 1H), 2.01 - 1.92 (m, 1H), 1.44 - 1.32 (m, 21H), 1.28 (s, 3H), 0.82 (d, J = 6.7 Hz, 6H); MS (ES+) 605.1 (M+1)。
HCl・2.25H2O・2B(OH)3について計算: C, 31.84; H, 6.21; Cl, 16.59; N, 13.11; 実測値: C, 31.99; H, 6.13; Cl, 16.33; N, 12.80。
工程1:(3aS,4S,6R,6aR)−tert−ブチル4−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−6−((((2S,3S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルペンタノイル)オキシ)メチル)−2,2−ジメチルジヒドロ−3aH−[1,3]ジオキソロ[4,5−c]ピロール−5(4H)−カルボキシレート(31a)の調製
DMF(20mL)中の(3aS,4S,6R,6aR)−tert−ブチル4−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−6−(ヒドロキシメチル)−2,2−ジメチルジヒドロ−3aH−[1,3]ジオキソロ[4,5−c]ピロール−5(4H)−カルボキシレート(30c)(1.079g、2.5ミリモル)、(2S,3S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルペンタン酸(Boc−L−イソロイシン)(0.578g、2.5ミリモル)の溶液に、N1−((エチルイミノ)メチレン)−N3,N3−ジメチルプロパン−1,3−ジアミン塩酸塩(EDCI、1.20g、6.25ミリモル)およびN,N−ジメチルピリジン−4−アミン(DMAP、0.092g、0.75ミリモル)を加えた。この反応混合物を5日間に亘り室温で撹拌し、1NのHCl水溶液(5.00mL)および水(60mL)で反応停止させた。この反応混合物を酢酸エチル(3×50mL)で抽出した。有機層を混ぜ合わせ、水(2×25mL)、ブラインで洗浄し、乾燥させ、真空内において濃縮した。得られた残留物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、25g、ヘキサン中の0〜100%の酢酸エチルで溶出)により精製して、白色の固体として(3aS,4S,6R,6aR)−tert−ブチル4−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−6−((((2S,3S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルペンタノイル)オキシ)メチル)−2,2−ジメチルジヒドロ−3aH−[1,3]ジオキソロ[4,5−c]ピロール−5(4H)−カルボキシレート(31a)(0.683g、収率42%)を得た;1H NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ 13.29 (s, 1H, D2O 交換可能), 9.86 (s, 1H), 7.59 (s, 1H), 7.11 (d, J = 7.0 Hz, 1H), 5.32 (s, 1H), 5.20 (d, J = 5.8 Hz, 1H), 4.81 (d, J = 5.7 Hz, 1H), 4.28 (bs, 2H), 4.08 - 3.93 (m, 1H), 3.90 - 3.77 (m, 1H), 1.62 (s, 1H), 1.52 - 1.21 (m, 26H), 0.84 - 0.66 (m, 6H); MS (ES+) 645.2 (M+1), 667.2 (M+Na), (ES-) 643.1 (M-1)。
メタノール(20mL)中の(3aS,4S,6R,6aR)−tert−ブチル4−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−6−((((2S,3S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルペンタノイル)オキシ)メチル)−2,2−ジメチルジヒドロ−3aH−[1,3]ジオキソロ[4,5−c]ピロール−5(4H)−カルボキシレート(31a)(0.625g、0.969ミリモル)の溶液に、炭素上の(10%)パラジウム(206mg)を加え、3.5時間に亘り60psi(約410kPa)で水素化した。TLC分析は、(1:1ヘキサン中の酢酸エチル/メタノール(9:1))反応が完了したことを示した。触媒を、Celiteに通す濾過により除去し、濾液を真空内において濃縮した。得られた残留物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(シリカゲル12g、ヘキサン中の0〜100%の酢酸エチル/メタノール(9:1)で溶出)により精製して、白色の固体として(3aS,4S,6R,6aR)−tert−ブチル4−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−6−((((2S,3S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルペンタノイル)オキシ)メチル)−2,2−ジメチルジヒドロ−3aH−[1,3]ジオキソロ[4,5−c]ピロール−5(4H)−カルボキシレート(31b)(0.418g、収率70%)を得た;1H NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ 10.86 (bs, 1H, D2O 交換可能), 8.09 (s, 1H), 7.36 (d, J = 2.8 Hz, 1H), 7.14 (s, 1H), 6.77 (s, 2H), 5.25 (s, 1H), 5.14 (bs, 1H), 4.88 (d, J = 5.9 Hz, 1H), 4.18 (s, 1H), 4.05 (s, 3H), 3.90 (s, 1H), 1.68 (bs, 1H), 1.42 (s, 3H), 1.38 (s, 18H), 1.28 (s, 3H), 1.17 (s, 1H), 0.78 (m, 6H); MS (ES+) 619.2 (M+1), (ES-) 653.2 (M+Cl); 分析値: C30H46N6O8・0.25H2Oについて計算: C, 57.82; H, 7.52; N, 13.48, 実測値: C, 57.56; H, 7.42; N, 13.40。
工程1:(3aS,4S,6R,6aR)−tert−ブチル4−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−6−((((S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−4−メチルペンタノイル)オキシ)メチル)−2,2−ジメチルジヒドロ−3aH−[1,3]ジオキソロ[4,5−c]ピロール−5(4H)−カルボキシレート(32a)の調製
DMF(20mL)中の(3aS,4S,6R,6aR)−tert−ブチル4−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−6−(ヒドロキシメチル)−2,2−ジメチルジヒドロ−3aH−[1,3]ジオキソロ[4,5−c]ピロール−5(4H)−カルボキシレート(30c)(1.088g、2.52ミリモル)および(S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−4−メチルペンタン酸(Boc−L−ロイシン)(0.583g、2.52ミリモル)の溶液に、N1−((エチルイミノ)メチレン)−N3,N3−ジメチルプロパン−1,3−ジアミン塩酸塩(EDCI、1.21g、6.30ミリモル)およびN,N−ジメチルピリジン−4−アミン(DMAP、0.092g、0.757ミリモル)を加えた。この反応混合物を96時間に亘り室温で撹拌し、水(60mL)で反応停止させ、EtOAc(3×50mL)で抽出した。混ぜ合わされた有機層を水(2×50mL)、ブライン(50mL)で洗浄し、MgSO4で乾燥し、真空内において濃縮乾固した。得られた残留物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(シリカゲル25g)により精製して、白色の固体として(3aS,4S,6R,6aR)−tert−ブチル4−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−6−((((S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−4−メチルペンタノイル)オキシ)メチル)−2,2−ジメチルジヒドロ−3aH−[1,3]ジオキソロ[4,5−c]ピロール−5(4H)−カルボキシレート(32a)(633mg、収率39%)を得た;1H NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ 13.28 (s, 1H), 9.86 (s, 1H), 7.56 (s, 1H), 7.19 (d, J = 7.4 Hz, 1H), 5.31 (s, 1H), 5.16 (d, J = 6.8 Hz, 1H), 4.80 (d, J = 5.8 Hz, 1H), 4.23 (s, 2H), 3.86 (t, J = 11.4 Hz, 1H), 1.39 (m, 27H), 0.86 (dd, J = 11.7, 6.0 Hz, 1H), 0.75 (dd, J = 13.6, 6.5 Hz, 6H); MS (ES+) 645.1
9(M+1), 667.17 (M+Na); (ES-) 643.20(M-1), 679.18 (M+Cl)。
メタノール(20mL)中の(3aS,4S,6R,6aR)−tert−ブチル4−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−6−((((S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−4−メチルペンタノイル)オキシ)メチル)−2,2−ジメチルジヒドロ−3aH−[1,3]ジオキソロ[4,5−c]ピロール−5(4H)−カルボキシレート(32a)(584mg、0.91ミリモル)の溶液に、炭素上の10%パラジウム(193mg)を加え、2時間に亘り50psi(約350kPa)で水素化した。この触媒を、Celiteに通して濾過し、濾液を真空内において濃縮した。得られた残留物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、4g)により精製して、白色の固体として(3aS,4S,6R,6aR)−tert−ブチル4−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−6−((((S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−4−メチルペンタノイル)オキシ)メチル)−2,2−ジメチルジヒドロ−3aH−[1,3]ジオキソロ[4,5−c]ピロール−5(4H)−カルボキシレート(32b)(300mg、収率53.5%)を得た;1H NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ 10.86 (s, 1H, 交換可能), 8.09 (d, J = 5.0 Hz, 1H), 7.34 (d, J = 2.4 Hz, 1H), 7.22 (s, 1H), 6.78 (s, 2H, 交換可能), 5.23 (d, J = 5.3 Hz, 1H), 5.14 (s, 1H), 4.87 (d, J = 5.7 Hz, 1H), 4.22-4.05 (m, 3H), 3.99-3.86 (m, 1H), 3.17 (d, J = 5.2 Hz, 1H), 1.55 (dd, J = 12.5, 6.0 Hz, 1H), 1.46-1.34 (m, 22H), 1.28 (s, 3H), 0.81 (dd, J = 9.1, 6.7 Hz, 6H); MS (ES+) 619.13(M+1), 642.15 (M+Na); (ES-) 617.18(M-1), 653.27 (M+Cl); 分析値: C30H44N8O8・0.5H2Oについて計算: C, 57.40; H, 7.55; N, 13.39; 実測値: C, 57.46; H, 7.53; N, 13.13。
工程1:(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−クロロ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3,4−ジヒドロキシ−5−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(34a)
メタノール(200mL)中の(2R,3R,4S,5S)−2−(アセトキシメチル)−1−(tert−ブトキシルカルボニル)−5−(4−クロロ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)ピロリジン−3,4−ジイルジアセテート(28c)(25.8g、50.5ミリモル)の溶液に、室温でメタノール中25質量%のナトリウムメトキシド(3.6mL、16.66ミリモル)を加えた。この反応混合物を一晩室温で撹拌した。この反応混合物を真空内において濃縮乾固し、フラッシュカラムクロマトグラフィー(シリカゲル600g)により精製して、無色の泡として(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−クロロ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3,4−ジヒドロキシ−5−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(34a)(17.7g、収率91%)を得た;1H NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ 12.34 (s, 1H), 8.62 (s, 1H), 7.94 (s, 1H), 5.40 - 5.02 (m, 2H), 4.96 - 4.70 (m, 2H), 4.41 - 4.25 (m, 1H), 4.13 - 3.93 (m, 2H), 3.69 - 3.51 (m, 2H), 1.35 (s, 3H), 1.01 (s, 6H); MS (ES+) 384.9 (M+1), 792.6 (2M+Na); (ES-) 382.6 (M-1)。
DMF(80mL)中の(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−クロロ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3,4−ジヒドロキシ−5−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(34a)(4g、10.39ミリモル)の溶液に、ナトリウムアジド(3.38g、52.0ミリモル)を加え、10時間に亘り80℃で撹拌しながら加熱した。この反応を25℃に冷却し、氷中に放り込み、酢酸エチルで抽出した。この酢酸エチル層を分離し、水、ブラインで洗浄し、乾燥させ、濾過し、真空内において濃縮乾固した(水浴50℃)。得られた粗残留物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(シリカゲル120g、クロロホルム中の0〜100%のメタノールによる溶出)により精製して、白色の固体として(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3,4−ジヒドロキシ−5−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(34b)(1.28g、収率31%)を得た;1H NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ 13.05 (bs, 1H, D2O 交換可能), 9.84 (s, 1H), 7.81 (m, 1H), 5.13 (m, 1H), 5.05 - 4.83 (m, 3H, D2O 交換可能), 4.24 (m, 1H), 4.09 (m, 1H), 4.03 (m, 1H), 3.59 (m, 2H), 1.38 (s, Bocについて4H) および1.05 (s, Bocについて5H); MS (ES+) 782.8 (2M+1), (ES-) 389.6 (M-1)。
ピリジン(5.0mL、62.06ミリモル)中の(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3,4−ジヒドロキシ−5−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(34b)(1.0g、2.55ミリモル)の溶液に、クロロトリフェニルメタン(0.85g、3.07ミリモル)を加えた。得られた混合物を4時間に亘り50℃で撹拌し、その時点で、反応は完了した(9:1のクロロホルム:メタノール中のTLC)。反応混合物を25℃に冷却し、氷水(80mL)中に放り込み、酢酸エチル(100mL、2×60mL)で抽出した。有機層を混ぜ合わせ、水、ブラインで洗浄し、乾燥させ、濾過し、真空内において濃縮して、オフホワイト色の固体を得た。この固体をn−ヘキサン中5%のEtOAcでトリチュレートし、濾過により収集して、薄黄色の固体として(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3,4−ジヒドロキシ−5−((トリチルオキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(35a)(1.47g、収率90.74%)を得た;1H NMR (300 MHz, DMSO-d6, 370 K) δ 12.82 (s, 1H), 9.48 (s, 1H), 7.44 (s, 1H), 7.36 (d, J = 8.0 Hz, 5H), 7.29 − 7.19 (m,9H), 4.96 (d, J = 4.6 Hz, 1H), 4.72 (d, J = 5.3 Hz, 1H), 4.59 (d, J = 5.0 Hz, 1H), 4.54 - 4.46 (m, 1H), 4.38 - 4.30 (m, 1H), 4.08 - 3.99 (m, 1H), 3.93 - 3.84 (m, 1H), 3.46 (dd, J = 9.1, 6.4 Hz, 1H), 3.37 (dd, J = 9.2, 4.2 Hz, 1H), 1.19 (s, 9H); MS (ES+) 655.85 (M+Na), (ES-) 632.55 (M-1). IR (KBr) 2133 cm-1。
方法1:
DMF(10mL)中の(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3,4−ジヒドロキシ−5−((トリチルオキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(35a)(1g、1.578ミリモル)の溶液に、室温でN1−((エチルイミノ)メチレン)−N3,N3−ジメチルプロパン−1,3−ジアミン塩酸塩(EDCI、0.756g、3.95ミリモル)およびN,N−ジメチルピリジン−4−アミン(DMAP、0.193g、1.578ミリモル)を加えた。この反応混合物を室温で一晩撹拌した。TLC分析(メタノール中10%のクロロホルム)は、いくらかの未反応の(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3,4−ジヒドロキシ−5−((トリチルオキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(35a)を示した。この反応を水(50mL)で停止させ、酢酸エチルで抽出した(3×100mL)。有機層を混ぜ合わせ、水、ブライン(100mL)で洗浄し、乾燥させ、濾過し、真空内において濃縮した。得られた粗残留物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(シリカゲル40g)により精製して:
白色の固体として、2−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3,4−ジヒドロキシ−5−((トリチルオキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(35a)(196mg、19.6%);
白色の固体として、(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3−(((S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノイル)オキシ)−4−ヒドロキシ−5−((トリチルオキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(39a)(511mg、38.9%);1H NMR (300 MHz, DMSO-d6, 370K) δ 12.86 (s, 1H), 9.39 (s, 1H), 7.47 (s, 1H), 7.38 (d, J = 7.9 Hz, 6H), 7.31 - 7.18 (m, 9H), 6.57 (d, J = 7.3 Hz, 1H), 5.46 (s, 1H), 5.05 (d, J = 6.2 Hz, 1H), 4.94 (d, J = 6.3 Hz, 1H), 4.78 - 4.69 (m, 1H),4.13 - 4.05 (m, 2H), 3.53 - 3.36 (m, 2H), 2.19 - 2.04 (m, 1H), 1.42 (s, 9H), 1.17 (s, 9H), 0.92 (t, J = 6.7 Hz, 6H); IR (KBr) 2133 cm-1; MS (ES-) 831.1 (M-1);
白色の固体として、(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−4−(((S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノイル)オキシ)−3−ヒドロキシ−5−((トリチルオキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(39b)(250mg、19%);1H NMR (300 MHz, DMSO-d6, 370K) δ12.84 (s, 1H), 9.49 (s, 1H), 7.51 (s, 1H), 7.36 - 7.28 (m, 6H), 7.25 -7.17 (m, 9H), 6.48 (d, J = 7.6 Hz, 1H), 5.81 - 5.71 (m, 1H), 5.22 (d, J = 4.2 Hz, 1H), 5.00 (d, J = 6.0 Hz, 1H), 4.71 (t, J = 8.1 Hz, 1H), 3.91 (m, 2H), 3.56 - 3.32 (m, 2H), 2.10 - 2.00 (m, 1H),1.32 (s, 9H), 1.22 (s, 9H), 0.88 (dd, J = 6.6, 3.4 Hz, 6H); IR (KBr) 2134 cm-1; MS (ES-) 831.1(M-1);および
白色の固体として、(2S,2’S)−(2S,3S,4R,5R)−2−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−1−(tert−ブトキシカルボニル)−5−((トリチルオキシ)メチル)ピロリジン−3,4−ジイルビス(2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノエート)(38a)(18mg、1.1%);1H NMR (300 MHz, DMSO, 370K) δ 12.94 (s, 1H, N-H), 9.38 (s, 1H), 7.54 (s, 1H), 7.38- 7.14 (m, 15H), 6.51 (s, 1H, N-H), 6.37 (s, 1H, N-H), 5.97 (d, J = 17.2 Hz, 1H), 5.76 (s, 1H), 5.22 (t, J = 11.3 Hz, 1H), 4.19 - 3.98 (m, 2H), 3.91 (d, J = 5.3 Hz, 1H), 3.55 (d, J = 18.8 Hz, 1H), 3.35 (m, 1H), 2.06 (m, 2H), 1.37 (s,, 9H), 1.24 (s, 9H), 1.21 (s, 9H), 0.94 - 0.78 (m, 12H);
を得た。
DMF(10mL)中の(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3,4−ジヒドロキシ−5−((トリチルオキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(35a)(1.0g、1.58ミリモル)および(S)−2−(tert−ブトキシカルボニルアミノ)−3−メチルブタン酸(L−Bocバリン、0.720g、3.31ミリモル)の溶液に、室温でN1−((エチルイミノ)メチレン)−N3,N3−ジメチルプロパン−1,3−ジアミン塩酸塩(EDCI、0.756g、3.95ミリモル)およびN,N−ジメチルピリジン−4−アミン(DMAP、0.193g、1.578ミリモル)を加えた。この反応混合物を室温で一晩撹拌し、水(30mL)で反応停止させた。この反応混合物を酢酸エチルで抽出した(3×60mL)。有機層を混ぜ合わせ、水、ブライン(50mL)で洗浄し、乾燥させ、濾過し、真空内で濃縮した。粗残留物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(シリカゲル25g、ヘキサン中0〜50%の酢酸エチルで溶出)により精製して、白色の固体として、(2S,2’S)−(2S,3S,4R,5R)−2−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−1−(tert−ブトキシカルボニル)−5−((トリチルオキシ)メチル)ピロリジン−3,4−ジイルビス(2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノエート)(38a)(670mg、収率42.1%)と、それに加え、白色の泡として、(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3−(((S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノイル)オキシ)−4−ヒドロキシ−5−((トリチルオキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(39a)および(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−4−(((S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノイル)オキシ)−3−ヒドロキシ−5−((トリチルオキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(39b)の混合物(610mg、47.9%);MS (ES-) 831.5 (M-1);
を得た。
エタノール(25mL)中の(2S,2’S)−(2S,3S,4R,5R)−2−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−1−(tert−ブトキシカルボニル)−5−((トリチルオキシ)メチル)ピロリジン−3,4−ジイルビス(2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノエート)(38a)(964mg、0.934ミリモル)の溶液に、Pd/C(10%)(150mg)を加え、50psi(約350kPa)で一晩水素化した。この触媒を、Celiteのパッドに通す濾過により除去し、濾液を真空内において濃縮した。得られた残留物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(シリカゲル4g、ヘキサン中(酢酸エチル/メタノール、9:1)により溶出、0〜100%)により精製して、白色の固体として(2S,2’S)−(2S,3S,4R,5R)−2−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−1−(tert−ブトキシカルボニル)−5−((トリチルオキシ)メチル)ピロリジン−3,4−ジイルビス(2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノエート)(38b)(765mg、収率81%)を得た;1H NMR (300 MHz, DMSO-d6, 370K) δ 10.61 (s, 1H, N-H), 7.86 (d, J = 2.2 Hz, 1H), 7.37 - 7.17 (m, 16H), 6.38 (m, 2H, N-H), 6.30 (s, 2H, N-H), 6.16 (t, J = 5.1 Hz, 1H), 5.87 (t, J = 3.8 Hz, 1H), 5.06 (d, J = 5.9 Hz, 1H), 4.12 - 4.00 (m, 2H), 3.98 - 3.86 (m, 1H), 3.78 (dd, J = 9.7, 6.9 Hz, 1H), 3.20 (m, 1H), 2.05 (m, 2H), 1.40 (s, 9H), 1.31 (s, 9H), 1.23 (d, J = 2.0 Hz, 9H), 0.90-0.80 (m, 12H); 分析値: C55H71N7O11.H2Oについて計算: C, 64.50; H, 7.18; N, 9.57; 実測値: C, 64.36; H, 7.11; N, 9.38。
(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3−(((S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノイル)オキシ)−4−ヒドロキシ−5−((トリチルオキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(39d)および(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−4−(((S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノイル)オキシ)−3−ヒドロキシ−5−((トリチルオキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(39e)から
アセトン(15mL)中の(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3−(((S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノイル)オキシ)−4−ヒドロキシ−5−((トリチルオキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(39d)および(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−4−(((S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノイル)オキシ)−3−ヒドロキシ−5−((トリチルオキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(39e)の溶液に、9Mの硫酸(0.512mL、4.61ミリモル)を加え、室温で一晩撹拌した。溶媒をデカンテーションし、白色の固体をアセトンで洗浄し、再びデカンテーションする前に、30分間に亘り撹拌した。同じ手法を3〜4回繰り返し、得られた固体を濾過により収集し、アセトンで洗浄し、35℃で真空内において乾燥させ、白色の固体の硫酸塩(500mg、1.081ミリモル、収率97%)として、(S)−(2R,3R,4S,5S)−5−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−4−ヒドロキシ−2−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−3−イル2−アミノ−3−メチルブタノエート(35e)および(S)−(2S,3S,4R,5R)−2−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−4−ヒドロキシ−5−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−3−イル2−アミノ−3−メチルブタノエート(34f)の混合物を得た。フラッシュカラムクロマトグラフィー(233mgのサンプル混合物CMA−80中0〜100%のCMA−50によるシリカゲル溶出)を使用した精製により、白色の固体として、(S)−(2R,3R,4S,5S)−5−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−4−ヒドロキシ−2−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−3−イル2−アミノ−3−メチルブタノエート(35e)および(S)−(2S,3S,4R,5R)−2−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−4−ヒドロキシ−5−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−3−イル2−アミノ−3−メチルブタノエート(34f)の混合物(74mg、48%)を得た;1H NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ [8.08 (s, 0.65H), 8.07 (s, 0.35H) 1H], [7.49 (s, 0.35H), 7.48 (s, 0.65H) 1H], [5.09 (t, J = 6.4 Hz, 0.35H), 5.01 (dd, J = 5.7, 3.7 Hz, 0.65H) 1H], [4.35 (d, J = 6.7 Hz, 0.35H), 4.21 (d, J = 5.6 Hz, 0.35H), 4.18 (d, J = 5.7 Hz, 0.65H), 4.14 - 4.09 (m, 1.65H) 3H], [3.63 - 3.48 (m, 1H) 1H], [3.25 (d, J = 5.1 Hz, 0.7H), 3.20 - 3.10 (m, 1.3H) 2H], [2.05 - 1.82 (m, 1H)], [0.93 (d, J = 6.8 Hz, 1.95H), 0.88 (d, J = 6.8 Hz, 1.95H), 0.81 (d, J = 6.9 Hz, 1.05H), 0.77 (d, J = 6.8 Hz, 1.05H) 6H]; MS (ES+) 365.0 (M+1)。
(6aR,8S,9S,9aR)−tert−ブチル8−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−9−(((S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノイル)オキシ)−2,2,4,4−テトライソプロピルテトラヒドロ−[1,3,5,2,4]トリオキサジシロシノ[7,6−b]ピロール−7(8H)−カルボキシレート(34e)から
アセトン(10mL)中の(6aR,8S,9S,9aR)−tert−ブチル8−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−9−(((S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノイル)オキシ)−2,2,4,4−テトライソプロピルテトラヒドロ−[1,3,5,2,4]トリオキサジシロシノ[7,6−b]ピロール−7(8H)−カルボキシレート(34e)の溶液に、室温で濃硫酸(50%水溶液、1.16mL、10.44ミリモル)を加え、18時間に亘り撹拌した。この反応混合物をアセトン(30mL)で希釈し、撹拌した。アセトンをデカンテーションし、この操作を2回繰り返した。分離した固体を濾過により収集し、真空内において乾燥させ、白色の固体として、(S)−(2R,3R,4S,5S)−5−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−4−ヒドロキシ−2−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−3−イル2−アミノ−3−メチルブタノエート(35e)および(S)−(2S,3S,4R,5R)−2−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−4−ヒドロキシ−5−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−3−イル2−アミノ−3−メチルブタノエート硫酸塩(34f)の混合物(0.4g、68%)を得た。この固体をフラッシュカラムクロマトグラフィー(シリカゲル4g、CMA−80中0〜100%のCMA−50による溶出)により精製して、(S)−(2R,3R,4S,5S)−5−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−4−ヒドロキシ−2−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−3−イル2−アミノ−3−メチルブタノエート(35e)および(S)−(2S,3S,4R,5R)−2−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−4−ヒドロキシ−5−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−3−イル2−アミノ−3−メチルブタノエート(34f)の混合物を得た;NMR分析は、化合物35eおよび34fの混合物を示す;MS (ES+) 365.1 (M+1), (ES-) 362.9 (M-1)。
方法1:
(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3−(((S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノイル)オキシ)−4−ヒドロキシ−5−((トリチルオキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(39a)から
エタノール(50mL)中の(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3−(((S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノイル)オキシ)−4−ヒドロキシ−5−((トリチルオキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(39a)(1.319g、1.584ミリモル)の溶液に、10%のPd/C(200mg)を加え、8時間に亘り50psi(約350kPa)で水素化した。この触媒を、Celiteのパッドに通す反応混合物の濾過により除去した。その濾液を真空内において濃縮し、得られた残留物をフラッシュカラムクロマトグラフィーにより精製して、白色の固体として、(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3−(((S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノイル)オキシ)−4−ヒドロキシ−5−((トリチルオキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(39d)および(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−4−(((S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノイル)オキシ)−3−ヒドロキシ−5−((トリチルオキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(39e)の3:2混合物(NMRにより分析した)(945mg、1.171ミリモル、収率74.0%)を得た;MS (ES+) 806.9 (M+1); (ES-) 805.0 (M-1), 841.2 (M+Cl)。
(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−4−(((S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノイル)オキシ)−3−ヒドロキシ−5−((トリチルオキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(39b)から
エタノール(25mL)中の(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−4−(((S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノイル)オキシ)−3−ヒドロキシ−5−((トリチルオキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(39b)(634mg、0.761ミリモル)の溶液に、10%のPd/C(100mg)を加え、8時間に亘り50psi(約350kPa)で水素化した。この触媒を、Celiteのパッドに通す反応混合物の濾過により除去した。その濾液を真空内において濃縮し、得られた残留物をフラッシュカラムクロマトグラフィーにより精製して、白色の固体として、(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3−(((S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノイル)オキシ)−4−ヒドロキシ−5−((トリチルオキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(39d)および(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−4−(((S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノイル)オキシ)−3−ヒドロキシ−5−((トリチルオキシ)メチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(39e)の3:2混合物(474mg、0.587ミリモル、収率77%)を得た;NMRスペクトルは、化合物39aからの手法を飼養して得られた生成物と一致する;MS (ES+) 806.9 (M+1); (ES-) 805.7 (M-1)。
工程1:(6aR,8S,9S,9aR)−tert−ブチル8−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−9−ヒドロキシ−2,2,4,4−テトライソプロピルテトラヒドロ−[1,3,5,2,4]トリオキサジシロシノ[7,6−b]ピロール−7(8H)−カルボキシレート(34c)の調製
DMF(25mL)中の(2S,3S,4R,5R)−tert−ブチル2−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−3,4−ジヒドロキシ−5−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−1−カルボキシレート(34b)(5g、12.78ミリモル)の撹拌溶液に、N,N−ジメチルピリジン−4−アミン(DMAP、0.078g、0.639ミリモル)、1H−イミダゾール(3.48g、51.1ミリモル)および1,3−ジクロロ−1,1,3,3−テトライソプロピルジシロキサン(4.63mL、14.05ミリモル)を加えた。この反応混合物を室温で一晩撹拌し、水(300mL)で希釈した。分離した固体を濾過により収集し、水で洗浄した。この固体をフラッシュカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、ヘキサン中0から35%の酢酸エチルによる溶出)により精製して、白色の固体として、(6aR,8S,9S,9aR)−tert−ブチル8−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−9−ヒドロキシ−2,2,4,4−テトライソプロピルテトラヒドロ−[1,3,5,2,4]トリオキサジシロシノ[7,6−b]ピロール−7(8H)−カルボキシレート(34c)(5.02g、収率62.0%)を得た;1H NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ 13.26 (s, 1H, D2O 交換可能), 9.85 (s, 1H), 7.49 (s, 1H), 5.52 (d, J = 3.2 Hz, 1H, D2O 交換可能), 5.10 (s, 1H), 4.63 - 4.24 (m, 2H), 4.18 - 3.82 (m, 1H), 3.67 (dt, J = 8.2, 2.9 Hz, 1H), 1.37 (d, J = 45.1 Hz, 10H), 1.08 - 0.99 (m, 14H), 0.86 (m, 14H); MS (ES+) 633.9 (M+1); (ES-) 632.2 (M-1); 分析値: C28H47N7O6Si2について計算: C, 53.05; H, 7.47; N, 15.47; 実測値: C, 53.00; H, 7.55; N, 15.15。
DMF(20mL)中の(6aR,8S,9S,9aR)−tert−ブチル8−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−9−ヒドロキシ−2,2,4,4−テトライソプロピルテトラヒドロ−[1,3,5,2,4]トリオキサジシロシノ[7,6−b]ピロール−7(8H)−カルボキシレート(34c)(2g、3.16ミリモル)の撹拌溶液に、(S)−2−(tert−ブトキシカルボニルアミノ)−3−メチルブタン酸(L−Bocバリン、1.03g、4.73ミリモル)を加え、0℃に冷却した。0℃で、N1−((エチルイミノ)メチレン)−N3,N3−ジメチルプロパン−1,3−ジアミン塩酸塩(EDCI、1.51g、7.89ミリモル)およびN,N−ジメチルピリジン−4−アミン(DMAP、0.385g、3.16ミリモル)を加え、室温で一晩反応させた。この反応混合物を水(100mL)で希釈し、酢酸エチルで抽出した(2×100mL)。酢酸エチル層を混ぜ合わせ、水(2×50mL)、ブライン(50mL)で洗浄し、乾燥させ、濾過し、真空内において濃縮した。得られた残留物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(シリカゲル80g、ヘキサン中酢酸エチル0から35%による溶出)により精製して、白色の固体として、(6aR,8S,9S,9aR)−tert−ブチル8−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−9−(((S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノイル)オキシ)−2,2,4,4−テトライソプロピルテトラヒドロ−[1,3,5,2,4]トリオキサジシロシノ[7,6−b]ピロール−7(8H)−カルボキシレート(34d)(2.1g、80%)を得た;1H NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ 13.40 (s, 1H, D2O 交換可能), 9.85 (d, J = 5.7 Hz, 1H), 7.57 (s, 1H), 7.23 (d, J = 8.2 Hz, 1H), 5.84 (d, J = 3.7 Hz, 1H), 5.24 (d, J = 10.7 Hz, 1H), 4.82 - 4.58 (m, 1H), 4.41 (d, J = 12.4 Hz, 1H), 4.03 - 3.93 (m, 2H), 3.67 (s, 1H), 2.08 (dt, J = 13.5, 6.8 Hz, 1H), 1.49 - 1.33 (m, 18H), 1.15 - 0.67 (m, 35H); MS (ES+) 856.0 (M+Na), 832.4 (M-1). 分析値: C38H64N8O9Si2について計算: C, 54.77; H, 7.74; N, 13.45; 実測値: C, 54.86; H, 7.78; N, 13.13。
エタノール(50mL)中の炭素上パラジウム(10%、0.262g)の懸濁液に、(6aR,8S,9S,9aR)−tert−ブチル8−(4−アジド−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−9−(((S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノイル)オキシ)−2,2,4,4−テトライソプロピルテトラヒドロ−[1,3,5,2,4]トリオキサジシロシノ[7,6−b]ピロール−7(8H)−カルボキシレート(34d)(2.05g、2.46ミリモル)を加え、12時間に亘り60psi(約410kPa)で水素化した。触媒を、Celiteのパッドに通す濾過により除去し、濾液を真空内において濃縮した。得られた残留物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(シリカゲル25g、クロロホルム中の0〜100%のCMA80で溶出)により精製して、白色の固体として(6aR,8S,9S,9aR)−tert−ブチル8−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−9−(((S)−2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)−3−メチルブタノイル)オキシ)−2,2,4,4−テトライソプロピルテトラヒドロ−[1,3,5,2,4]トリオキサジシロシノ[7,6−b]ピロール−7(8H)−カルボキシレート(34e)(1.9g、収率96%)を得た;1H NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ 10.94 (s, 1H, D2O 交換可能), 8.05 (s, 1H), 7.46 - 7.30 (m, 1H), 7.17 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 6.82 (s, 2H, D2O 交換可能), 5.86 (d, J = 4.0 Hz, 1H), 5.16 (d, J = 25.0 Hz, 1H, D2O 交換可能), 5.00 (d, J = 8.2 Hz, 1H), 4.17 (dd, J = 12.2, 5.1 Hz, 1H), 3.98 - 3.88 (m, 1H), 3.61 (s, 1H), 2.16 - 1.92 (m, 1H), 1.41 (bs, 18H), 1.01 - 0.83 (m, 35H); MS (ES+) 806.921 (M+1), 830.1 (M+Na), (ES-) 805.289 (M-1), 842.0 (M+Cl)。
健康な週齢8から10週の雄のSprague−Dawleyラットを無作為に対照グループと実験グループに割り当てた、グループ当たりN=4。全ての動物は、標準様式で飼育し、給餌した。実験の日に、全ての動物を隔離し、代謝ケージ内で投薬前に約15時間に亘り断食させた。対照薬物と実験薬物の投薬の2時間後に、餌を動物に戻した。水は不断に与えた。投与の直前に、対照化合物(2S,3S,4R,5R)−2−(4−アミノ−5H−ピロロ[3,2−d]ピリミジン−7−イル)−5−(ヒドロキシメチル)ピロリジン−3,4−ジオール二塩酸塩(12i)を水に溶かして、1mg/mLの濃度を達成した。実験化合物30fも同様に水に溶かして、当量濃度(化合物12iに関して1mg/mL)を達成した。各動物の体重測定後、全ての対照動物に、0時間で、経口強制飼養により10mg/kg体重の化合物12iを投与した一方で、全ての実験動物に、0時間で経口強制飼養により10mg/kg体重の化合物30fを投与した。逐次血液サンプルを、0時間、15分後、30分後、1時間後、2時間後、4時間後、8時間後、12時間後、24時間後に得た。全てのサンプルを微小遠心管に移し、3分間に亘り14,000rpmで遠心分離した。各管からの血漿を取りだし、予めラベルを貼った微小遠心管に移し、分析するまで貯蔵のためにサンプルが−80℃の冷凍庫に移されるまで、ドライアイス上に置いた。次いで、個々のサンプルを化合物12iについて分析した。血漿濃度対時間のデータを、WinNonlinソフトウェアプログラムを使用した非コンパートメント手法により分析した。薬物動態パラメータのTmax、Cmax、T1/2、AUC(0-last)、AUC(0-inf)、MRT(0-inf)、並びに血漿および肝臓濃度対時間のプロファイルのグラフを得た。これらの結果が図1に示されている。
材料および方法:Cero−76細胞(アフリカミドリザルの腎臓細胞)は、アメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション(バージニア州、マナッサス所在のATCC)から得た。これらの細胞を、5%のウシ胎児血清(FBS、Hyclone社)を添加した最小必須培地(0.15%のNaHCO3を含むMEM;米国ユタ州ローガン所在のHyclone Laboratories社)に定期的に移した。化合物を評価するときに、血清を2.5%の最終濃度に希釈し、ゲンタマイシンを50μg/mLの最終濃度となるように試験媒質に加えた。麻疹ウイルス(MV)のシカゴ株を疾病対策センター(ジョージア州アトランタ所在)から得た。
細胞変性効果阻害アッセイ(視覚的アッセイ)
細胞を、適切な細胞濃度で、0.2mL/ウェルで、96ウェルの平底組織培養プレート(ニューヨーク州コーニング所在のCorning Glass Works社)に播種し、細胞単層を得るために、37℃で一晩インキュベーションした。その単層を作り上げたときに、成長培地をデカンテーションし、試験化合物の様々な希釈物を各ウェルに加えた(3ウェル/希釈、0.1mL/ウェル)。化合物希釈培地を細胞およびウイルス対照のウェル(0.1mL/ウェル)に加えた。試験培地中で希釈されたウイルスを、0.1mL/ウェルで、化合物試験ウェル(3ウェル/化合物の希釈)およびウイルス対照ウェル(6ウェル)に加えた。ウイルス(ウイルスMOI=0.001)を、化合物の約5分後に加えた。ウイルスを含まない試験培地を、0.1mL/ウェルで、全ての毒性対照ウェル(2ウェル/各試験化合物の希釈)および細胞対照ウェル(6ウェル)に加えた。ウイルス対照ウェルが適正な細胞変性効果(CPE)測定値(80〜100%の細胞破壊)を有するまで、5%のCO2、95%の空気の雰囲気を含む加湿インキュベータ内において37℃でインキュベーションした。これを、ウイルスに応じて、ウイルスの細胞への曝露後の4〜11日間に亘り行った。次いで、細胞をCPEについて顕微鏡で調査し、これを、0(正常な細胞)から4(最大、100%、CPE)まで採点した。毒性対照ウェルにおける細胞を、細胞毒性に寄与する形態変化について、顕微鏡で観察した。この細胞毒性(細胞破壊および/または形態変化)も、100%細胞毒性、80%細胞毒性、60%細胞毒性、40%細胞毒性、20%細胞毒性、および0(正常な細胞)と採点した。50%有効量(EC50)および50%細胞毒性量(IC50)は、それぞれ、ウイルスCPEデータおよび毒性対照データの回帰分析により計算した。試験した各化合物に関する選択指数(SI)は、式:SI=CC50/EC50を使用して計算した。
NR取り込みは、Smee等(Virol. Methods 2002, 106: 71-79; ここに全て引用する)の発見に基づく抗ウイルス薬物を評価するための染料定量方法として選択した。このアッセイを上述したのと同じCPE阻害試験プレートに行って、目視観測によって、阻害剤活性および細胞毒性を検証した。NRアッセイは、Barnard等(Antiviral Chem. Chernother. 2001, 12:220-231;ここに全てを引用する)により記載されているようなCavenaugh等の改良方法(Invest. New Drugs 1990, 8:347-354;ここに全てを引用する)を使用して行った。手短に言えば、CPE阻害アッセイからCPEについて採点したプレートの各ウェルから培地を取り除き、そのプレートの各ウェルに0.034%のNRを加え、このプレートを暗所において37℃で2時間に亘りインキュベーションした。次いで、NR溶液をウェルから取り除いた。濯ぎ(時々、細胞がプレートから落ちて、ニュートラルレッドの誤った低い値を生じる)および吸引乾固後に、Sorensonクエン酸緩衝剤で緩衝された無水エタノールを使用して、残りの染料を暗所において室温で30分間に亘り細胞から抽出した。540nm/405nmでの吸光度をマイクロプレートリーダー(Opsys MR(商標)、米国バージニア州シャンティリー所在のDynex Technologies社)で読んだ。吸光度値は未処理の対照の百分率として表し、EC50、CC50およびSIは、上述したように計算した。
ウイルス収量低下アッセイは、実質的に先に記載したように、細胞培養50%感染用量(CCID50)を使用して行った(Antimicrob. Agents Chemother. 1992, 3:1837-1842;ここに全てを引用する)。手短に言えば、各ウェルからの上清を、Vero−76細胞を含む96ウェルプレートの三連続のウェルに逐次希釈した。プレートを6日間に亘りインキュベーションし、次いで、ウイルス誘発CPEを調べた。ウイルス収量力価の定量は、ReedおよびMuenchの終端方法によるものであった(Am. J. Hyg. 1938, 27:493-498;ここに全てを引用する)。EC90値は、ウイルス収量の90%を阻害するまたはウイルス力価を常用対数で1減少させるのに必要な濃度を推測するために線形回帰を使用して計算した。
麻疹ウイルスは、化合物12iにより強く阻害された(表1)。麻疹ウイルスに対するEC50値は、それぞれ、視覚アッセイおよびNRアッセイにより、0.6および1.4μg/mLであった。この化合物は、視覚またはNRアッセイのいずれにおいても細胞毒性を持たなかった(IC50>100)。したがって、両方のアッセイによる選択指数は、化合物12iが麻疹ウイルス(MV)に対して高活性であることを示唆した。MVに対する強力な阻害活性をウイルス収量低下アッセイにより確認し、EC90=0.36μg/mLであり、感染細胞において生成されたウイルスが常用対数で1の低下を示した。
化合物12iは、極力で選択的な阻害活性を示した。ウイルス収量低下アッセイにより、化合物12iは、MVの強力な阻害剤でもあった(EC90=0.37μg/mL)。それゆえ、化合物12iは、多くのRNAウイルスの強力な阻害剤であることが分かり、化合物12iは、選択されたRNAウイルスの広域スペクトル阻害剤としてのさらなるインビトロおよびインビボの評価を保証することを示唆している。
材料および方法:
細胞およびウイルス
アフリカミドリザル腎臓細胞(MA−104)をWhitaker MA Bioproducts社(米国メリーランド州、ウォーカーズビル所在)から得た。ベロ細胞(アフリカミドリザルの肝臓細胞)、喉頭細胞のヒト癌(A−59)、およびメイディン・ダービーイヌ腎臓細胞の全ては、アメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション(バージニア州、マナッサス所在のATCC)から得た。A−549細胞は、0.15%のNaHCO3が添加されたダルベッコ最小必須培地(DMEM)(米国ユタ州、ローガン所在のHyclone Laboratories社)に、10%ウシ胎児血清(FBS、Hyclone社)を添加した培地中で培養した。残留する細胞は、5%ウシ胎児血清(FBS、Hyclone社)を添加した最小必須培地(0.15%のNaHCO3を含むMEM;米国ユタ州ローガン所在のHyclone Laboratories社)中で定期的に移した。
細胞変性効果阻害アッセイ(視覚的アッセイ)
細胞を、適切な細胞濃度で、0.2mL/ウェルで、96ウェルの平底組織培養プレート(ニューヨーク州コーニング所在のCorning Glass Works社)に播種し、細胞単層を得るために、37℃で一晩インキュベーションした。その単層を作り上げたときに、成長培地をデカンテーションし、試験化合物の様々な希釈物を各ウェルに加えた(3ウェル/希釈、0.1mL/ウェル)。化合物希釈培地を細胞およびウイルス対照のウェル(0.1mL/ウェル)に加えた。試験培地中で希釈されたウイルスを、0.1mL/ウェルで、化合物試験ウェル(3ウェル/化合物の希釈)およびウイルス対照ウェル(6ウェル)に加えた。ウイルス(ウイルスMOI=0.001)を、化合物の約5分後に加えた。ウイルスを含まない試験培地を、0.1mL/ウェルで、全ての毒性対照ウェル(2ウェル/各試験化合物の希釈)および細胞対照ウェル(6ウェル)に加えた。ウイルス対照ウェルが適正な細胞変性効果(CPE)測定値(80〜100%の細胞破壊)を有するまで、5%のCO2、95%の空気の雰囲気を含む加湿インキュベータ内において37℃でインキュベーションした。これを、ウイルスに応じて、ウイルスの細胞への曝露後の4〜11日間に亘り行った。次いで、細胞をCPEについて顕微鏡で調査し、これを、0(正常な細胞)から4(最大、100%、CPE)まで採点した。毒性対照ウェルにおける細胞を、細胞毒性に寄与する形態変化について、顕微鏡で観察した。この細胞毒性(細胞破壊および/または形態変化)も、100%細胞毒性、80%細胞毒性、60%細胞毒性、40%細胞毒性、20%細胞毒性、および0(正常な細胞)と採点した。50%有効量(EC50)および50%細胞毒性量(IC50)は、それぞれ、ウイルスCPEデータおよび毒性対照データの回帰分析により計算した。試験した各化合物に関する選択指数(SI)は、式:SI=CC50/EC50を使用して計算した。
NR取り込みは、Smee等(前出)の発見に基づく抗ウイルス薬物を評価するための染料定量方法として選択した。このアッセイを上述したのと同じCPE阻害試験プレートに行って、目視観測によって、阻害剤活性および細胞毒性を検証した。NRアッセイは、Barnard等(前出)により記載されているようなCavenaugh等の改良方法(前出)を使用して行った。手短に言えば、CPE阻害アッセイからCPEについて採点したプレートの各ウェルから培地を取り除き、そのプレートの各ウェルに0.034%のNRを加え、このプレートを暗所において37℃で2時間に亘りインキュベーションした。次いで、NR溶液をウェルから取り除いた。濯ぎ(時々、細胞がプレートから落ちて、ニュートラルレッドの誤った低い値を生じる)および吸引乾固後に、Sorensonクエン酸緩衝剤で緩衝された無水エタノールを使用して、残りの染料を暗所において室温で30分間に亘り細胞から抽出した。540nm/405nmでの吸光度をマイクロプレートリーダー(Opsys MR(商標)、米国バージニア州シャンティリー所在のDynex Technologies社)で読んだ。吸光度値は未処理の対照の百分率として表し、EC50、CC50およびSIは、上述したように計算した。
化合物12iは、試験した全てのインフルエンザウイルスに対して強力な活性を示した。化合物12iは、インフルエンザウイルス複製の強力な阻害剤であることが分かり、化合物12iは、全てのインフルエンザウイルスを含む、選択されたRNAウイルスの広域スペクトル阻害剤として効果的であることを示唆している。
化合物12iの抗ウイルス活性を、いくつかのウイルスにおいてインビトロで評価した。マールブルグ(フィロウイルス科)、フニンCandid 1(アレナウイルス科)、ビキンデ(アレナウイルス科)、チクングニア181/25(トガウイルス科)、およびワクシニア(ポックスウイルス科)に対するEC50値は、約10μg/mLから約300μg/mL超までに及んだ。
メイディン・ダービーイヌ腎臓(MDCK)細胞をインフルエンザウイルスのH3N2(A/ビクトリア/3/75)ウイルスに感染させ、72時間に亘り化合物12iおよびペラミビルの様々な組合せで治療した。ニュートラルレッド染料取り込みアッセイを使用して、細胞変性効果を決定した。そのデータが表3に示されている。
週齢6〜8週のBALB/cマウスをH3N2ウイルス(A/ビクトリア/3/75)に順応させた。感染の1時間前から開始して5日間に亘り、筋肉(IM)注射により、一日一回、0、30、100、および300mg/kg/日の用量を与えた。N=50動物数。全ての動物を16日間に亘り追跡した。端点は、致死率、脂肪までの平均日数、および体重減少を含んだ。
週齢6〜8週のBALB/cマウスをH3N2ウイルス(A/ビクトリア/3/75)に順応させた。経口により、一日一回、0、30、100、および300mg/kg/日の用量を与えた。N=60動物数。全ての動物を16日間に亘り追跡した。端点は、致死率、脂肪までの平均日数、および体重減少を含んだ。H3N2 A/Vic/3/75インフルエンザウイルスに感染したマウスにおける体重減少への経口投与された化合物12iの効果が表5に示されている。経口により与えられた化合物12iは、インフルエンザウイルスに感染したマウスにおいて、生存率と体重減少を改善した。
雌のBALB/cマウス(N=30)に、100mg/kgで化合物12iを経口投与した。マウスは、t=0.17、0.5、1.0、3、6、および24時(時点当たり各5匹のマウス)で眼窩後副鼻腔を通じて採血し、遠心分離し、血漿を−80℃で貯蔵した。血漿薬物レベルは、LC/MS/MS分析により測定した。
週齢8〜12週のC57BL/6マウス(グループ当たりN=10、4グループ−1匹が生理食塩水治療グループおよび3匹が薬物治療グループ)に、化合物12iを腹腔内、筋肉内、および経口(300mg/kg/日、一日二回)により投与した。感染の4時間前から始めて8日間の治療。マウスに順応したエボラウイルス(ザイール)抗原投与を腹腔内により行った。死亡率および体重を感染後14日間に亘り監視した。
週齢8〜12週のC57BL/6マウスに、化合物12iを筋肉内、および経口により投与した。研究対象は6グループに分けた(グループ当たりN=10匹)。グループ1は生理食塩水対照であり;グループ2には150mg/kgの化合物12iを投薬し(経口、一日二回);グループ3には250mg/kgの化合物12iを投薬し(経口、一日二回);グループ4には、150mg/kgの化合物12iを投薬した(筋肉内、一日二回)。グループ5は、生理食塩水で治療した未感染のマウスであり(経口、一日二回);グループ6は、250mg/kgの化合物12iで治療した未感染のマウスであった(経口、一日二回)。治療は、感染の4時間前から始まり、9日間であった。マウスに順応したエボラウイルス(ザイール)の抗原投与は、腹腔内により行った(1,000pfu)。致死率および体重を感染後の14日間亘り監視した。
黄熱病ウイルス(ヒメネス(Jimenez)株)を、ハムスター当たり20 CCID50(〜6.25×LC50)で、雌のシリアンゴールデンハムスター(99g)に腹腔内注射した。グループは以下のように分けた:1)化合物12iを、始まりの−4時間に投与した(N=15);2)化合物12iを、始まりの1dpi(感染後の日数)に投与した(N=10);3)化合物12iを、始まりの2dpiに投与した(N=10);4)化合物12iを3dpiに投与した(N=10);5)化合物12iを4dpiに投与した(N=10);6)リバビリンを始まりの−4時間に投与した(N=10);7)生理食塩水ビヒクルを始まりの−4時間に投与した(N=16);8)未感染のハムスターに化合物12iを、始まりの−4時間に投与した(N=3);9)未感染のハムスターに生理食塩水ビヒクルを始まりの−4時間に投与した(N=3);および10)未感染の未治療の正常な対照(N=3)。治療投与量は、7日間に亘り100mg/kg、腹腔内、一日二回であった。研究の端点は21日目の致死率であり、体重は、0、3、5および6日目に測定し;血清および肝臓ウイルス力価(4日目、−4時間で化合物12i、および−4時間でビヒクル)、および6日目にALTおよびAST。
1000pfuのマウスに順応したMARV−Ravnを抗原投与した(腹腔内)週齢10〜12週のBALB/cマウスに、化合物12iを筋肉内投与した。この研究を10グループに分けた(グループ当たりN=10)。投薬計画、経路、および用量が、表7に示されている。化合物12iを、投与前に0.9%の生理食塩水中に溶かし、健康状態および体重を、感染後の14日間に亘り監視した。
以下は、ヒトへの治療的または予防的使用のための、本発明の化合物(「化合物X」)を含有する代表的な薬の剤形を説明するものである。
Claims (9)
- 下記の化合物、並びにその薬学的に許容される塩からなる群より選択される、化合物。
- 下記式により表される化合物またはその薬学的に許容される塩である、請求項1記載の化合物。
- 請求項1または2に記載の化合物を含む、ウイルスの複製を阻害するための医薬組成物。
- 請求項1または2に記載の化合物を含む、ウイルス感染を治療するための医薬組成物。
- 前記ウイルスルが、RNAウイルスからなる群より選択される、請求項3または4に記載の医薬組成物。
- 前記ウイルスが、オルソミクソウイルス科、パラミクソウイルス科、アレナウイルス科、ブニヤウイルス科、フラビウイルス科、フィロウイルス科、トガウイルス科、ピコルナウイルス科、およびコロナウイルス科からなる群より選択される、請求項5に記載の医薬組成物。
- 前記ウイルスが、アデノウイルス、ライノウイルス、A型肝炎ウイルス、C型肝炎ウイルス、ポリオウイルス、麻疹ウイルス、エボラウイルス、コクサッキーウイルス、ウエストナイルウイルス、天然痘ウイルス、黄熱病ウイルス、デング熱ウイルス、A型インフルエンザウイルス、B型インフルエンザウイルス、ラッサ熱ウイルス、リンパ球性脈絡髄膜炎ウイルス、フニンウイルス、マチュポウイルス、グアナリトウイルス、ハンタウイルス、リフトバレー熱ウイルス、ラ・クロスウイルス、カリフォルニア脳炎ウイルス、クリミア・コンゴウイルス、マールブルグ・ウイルス、日本脳炎ウイルス、キャサヌール森林病ウイルス、ベネズエラウマ脳炎ウイルス、東部ウマ脳炎ウイルス、西部ウマ脳炎ウイルス、重症急性呼吸器症候群(SARS)ウイルス、パラインフルエンザウイルス、呼吸器合胞体ウイルス、プンタトロウイルス、タカリベウイルス、およびピキンデウイルスからなる群より選択される、請求項3または4に記載の医薬組成物。
- 前記ウイルスが、エボラウイルス、黄熱病ウイルス、マールブルグ・ウイルス、A型インフルエンザウイルス、およびB型インフルエンザウイルスからなる群より選択される、請求項7に記載の医薬組成物。
- 前記ウイルスが、アデノウイルス、デング熱ウイルス、マールブルグ・ウイルス、A型インフルエンザウイルス、B型インフルエンザウイルス、フニンウイルス、麻疹ウイルス、パラインフルエンザウイルス、ピキンデウイルス、プンタトロウイルス、呼吸器合胞体ウイルス、ライノウイルス、リフトバレー熱ウイルス、SARSウイルス、タカリベウイルス、ベネズエラウマ脳炎ウイルス、ウエストナイルウイルス、および黄熱病ウイルスからなる群より選択される、請求項7に記載の医薬組成物。
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