JP6251451B2 - ハイスループット試料処理システムおよび使用方法 - Google Patents
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Description
[0009]いくつかの実施形態では、複数の非接触液体レベルセンサは、試料処理プレートの複数のウェルの各々において液体レベルを検出する。液体レベルは、例えば重量、光学、音響、静電容量またはレーザレベル送信機を用いる様々な方法で決定することができる。いくつかの実施形態では、液体レベルセンサは、1つまたは複数の音響センサ、重量センサ、圧力センサなどを含めた1つまたは複数の非接触センサを備える。いくつかの実施形態では、液体レベルセンサは、1つまたは複数の音響センサを備える。
[0014]いくつかの実施形態では、ハイスループット試料処理システムは、複数の試料を処理し、複数の試料は体液を含む。いくつかの実施形態では、複数の試料は、血液、唾液または血漿を含む。いくつかの実施形態では、試料容器は封止され、ピペットは容器のシールを貫通して複数の試料を抜き取るように構成される。いくつかの実施形態では、ハイスループット試料処理システムは磁気ビーズを使用して複数の試料からDNAを抽出する。
[0017]いくつかの実施形態では、ハイスループット試料処理方法は、複数の試料容器から複数の試料を抜き出すステップと、各試料を複数のウェルを含む試料処理プレートのウェルの中に分注するステップであって、各試料が異なるウェルに分注されるステップと、非接触流体分注デバイスを使用して試料処理プレートの複数のウェルの中に流体を分注するステップと、複数の非接触液体レベルセンサを使用して試料処理プレートの複数のウェルの各々における液体レベルを検出するステップと、複数の非接触混合デバイスを使用して複数の試料処理プレートを同時に混合するステップと、複数の吸引器を使用して試料処理プレートの複数のウェルから流体を取り出すステップと、廃棄物管理システムを使用して複数のウェルから取り出した流体を管理するステップとを含む。
[0022]ハイスループット試料処理方法の一部の実施形態では、廃棄物管理システムは、複数のウェルから取り出した流体を廃棄物容器の中に入れる。いくつかの実施形態では、廃棄物容器は真空下で作用する。一連の弁が含まれることで真空の適切な作用を確実にする。いくつかの実施形態では、廃棄物は重力を利用して取り出される。いくつかの実施形態では、廃棄物管理システムは複数のウェルから取り出した流体を廃棄物容器の中で漂白剤と混合し、この混合物をインキュベートする。いくつかの実施形態では、廃棄物管理システムは、複数のウェルから取り出した流体の量を決定するために1つまたは複数のセンサを備える。このようなセンサは、例えば音響センサ、重量センサ、圧力センサなどを含み得る。いくつかの実施形態では、廃棄物管理システムは、真空を用いて複数のウェルから取り出した流体の量を決定するために1つまたは複数の重量計を備える。
[0024]いくつかの実施形態では、ハイスループット試料処理方法は、試料を識別するためにバーコードスキャナによって試料容器の上を走査するステップを含む。
ハイスループット試料処理システム
[0046]いくつかの実施形態では、ハイスループット試料処理システムは、少なくとも1つの試料分注デバイス、非接触流体分注デバイス、非接触液体レベルセンサ、非接触流体吸引器、非接触処理ステーション、廃棄物管理システムおよび制御システムを含む。いくつかの実施形態では、ハイスループット試料処理システムの複数の同一の構成要素が使用される場合もある。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のプレート装填デバイス、非接触混合デバイス、非接触加熱デバイス、非接触インキュベートデバイス、非接触冷却デバイス、非接触凍結デバイス、非接触凍結乾燥デバイス、計量デバイスあるいはアッセイまたは測定デバイスがハイスループット試料処理システムに含まれる場合もある。いくつかの実施形態では、ロボットアーム、ベルト、そり(sled)または抽出装置を使用してハイスループット試料処理システムの1つのステーションからハイスループット試料処理システムの第2のステーションに試料処理プレートが移動される場合もある。
[0068]ステップ230において、非接触流体分注デバイスが、所定の量の流体を試料処理プレートの複数のウェルの中に分注することができる。その量の流体が試料に加えられた後で、試料処理プレートをこの工程の次のステップへと搬送することができる。
試料分注デバイス
[0080]試料分注デバイスは、複数の試料容器から試料処理プレートの複数のウェルに複数の試料を移動させることができる。分注された試料はその後、ハイスループット試料処理システムによって継続して処理することができ、その一方で追加の試料が新たな試料処理プレート内に分注される。いくつかの実施形態では、試料分注デバイスは、試料移動デバイス、1つまたは複数の注射器型のピペット(および/または蠕動ポンプ、遠心ポンプ、マイクロ環状ポンプなどの他の分注デバイス)、試料ガードならびに洗浄ステーションを備える。いくつかの実施形態では、試料分注デバイスは、試料処理プレートを装填し直すための試料装填デバイスを備える。いくつかの実施形態では、試料分注デバイスはバーコードスキャナを備える。
非接触流体分注デバイス
[0099]非接触流体分注デバイスは、既にウェルの中にある流体に接触することなく、ハイスループット試料処理システムの作動において試料処理プレートの複数のウェルの中に流体を分注することができる。いくつかの実施形態において、分注される流体の量は、制御システムによって制御され、所定であっても、これ以前の液体レベルを決定したことに応答して制御システムによって決定されてもよい。いくつかの実施形態において非接触流体分注デバイスは、バーコードスキャナを備え、これは試料処理プレート上のバーコードを読み取り、試料処理プレートのその場所を制御システムに送信する。いくつかの実施形態では、一度試料がシステムによって最初に走査されるとシステムはさらなる走査作業なしで各試料の場所を決定することができるため、バーコードスキャナは、工程のこの時点で使用されない場合もある。非接触流体分注デバイスは、例えば使用されるアッセイおよび/または抽出方法に基づいて流体を分注することができる。
非接触処理ステーション
[00104]先に知られる試料処理システムは、使い捨てのピペットの先端を使用して試料を繰り返し吸引し、分注する、あるいは試料内に配置される使い捨てのロッドまたは磁気攪拌バーによって攪拌することによって試料を処理または混合していた。このような接触手段を使用して試料を処理することはかなりの固体廃棄物が生じることになり、このような固体廃棄物は適切に廃棄するおよび/または処理する必要がある。本明細書に記載されるようなハイスループット試料処理システムの一部の実施形態は故に、1つまたは複数の非接触処理ステーションを使用して試料を混合する、またはそうでなければ試料を処理する。非接触処理ステップ、例えば非接触混合処理は、処理中の試料を混合するのに磁気攪拌バー、使い捨てロッドまたは繰り返しの溶液の吸引および分注を使用しない。このような試料を処理する非接触の方法は、先に知られる処理システムに比べて廃棄物を有意に削減することになる。
[00116]いくつかの実施形態では、選択されたタイプの第3の非接触処理ステーションが使用可能でない場合(あるいは使用可能な選択されたタイプの非接触処理ステーションがない場合)、制御システムは、ステップ750において別の処理ステーションが使用可能になるまで試料処理プレートを待機入れ子に移動させることができる。
非接触液体レベルセンサシステム
[00117]いくつかの実施形態では、非接触液体レベルセンサシステムは、1つまたは複数の非接触液体レベルセンサを備える。いくつかの実施形態では、非接触液体レベルセンサを使用して試料処理プレートのウェルの中の液体の量を決定することができる。いくつかの実施形態では、一列の非接触液体レベルセンサがハイスループット試料処理システム内で使用されて、試料処理プレート内の複数のウェルの中の液体レベルを同時に決定する場合もある。いくつかの実施形態では、液体レベルは、ウェルの中の液体の量、センサからのおおよそのメニスカス距離、ウェルの頂部からのおおよそのメニスカス距離、またはウェルの底部からのおおよそのメニスカス距離として測定される。いくつかの実施形態では、ウェルの中の液体レベルを知ることは、非接触流体分注システムが所望される流体の量を分注し、かつ非接触吸引システムが所望される流体の量を吸引することを保証するためにシステムの監視作業にとって重要である。これはウェルがあふれるのを最小限にし、一貫性を保証するのを助けることができる。
非接触流体吸引器
[00120]ハイスループット試料処理システムのいくつかの実施形態では、非接触流体吸引器を使用して試料処理プレートの複数のウェルから流体を吸引することができる。いくつかの実施形態では、非接触流体吸引器は、1つまたは複数の吸引ノズルと、廃棄物管理システムに流体接続された廃棄物導管とを備える。いくつかの実施形態では、非接触流体吸引器はまた、吸引ノズルを下げるためのデバイス、試料処理プレートを持ち上げるためのデバイスまたは磁性のベースを備える場合もある。いくつかの実施形態では、非接触流体吸引器は、非接触流体吸引ステップの前、その間、またはその後、試料処理プレートの試料ウェルの液体レベルの決定を可能にするように構成された非接触液体レベルセンサに隣接されてよい。
廃棄物管理システム
[00128]いくつかの実施形態では、ハイスループット試料処理システムからの液体廃棄物は、1つまたは複数の廃棄物導管を介して廃棄物管理システムに搬送され、そこでそれは処理され廃棄することができる。いくつかの実施形態では、廃棄物導管は、耐腐食材、例えばポリテトラフルオロエチレンなどを含む。いくつかの実施形態では、液体廃棄物は、試料分注デバイスにおける洗浄用のピペット先端から生じる場合、非接触流体吸引器から吸引された流体から生じる場合、試料処理プレートのウェルが溢れるなど試料処理作業において生じる可能性のあるこぼれた流体から生じる場合、またはポンプのプライミングの流体から生じる場合がある。いくつかの実施形態では、廃棄物管理システムは、一日当たりおよそ10リットルを超える、一日当たりおよそ20リットルを超える、一日当たりおよそ40リットルを超える、一日当たりおよそ60リットルを超える、一日当たりおよそ100リットルを超える、一日当たりおよそ200リットルを超える、一日当たりおよそ500リットルを超える、一日当たりおよそ1000リットルを超える液体廃棄物を処理し廃棄することができる。
例示の実施形態
[00136]本発明は、以下の実施形態によってさらに記載される。
[00141]実施形態5.実施形態1〜4または本明細書の任意の例示の実施形態の別の一実施形態では、液体レベルセンサは非接触である。
[00143]実施形態7.実施形態1〜6または本明細書の任意の例示の実施形態の別の一実施形態では、ハイスループット試料処理は追加のプレートを試料分注デバイス内に自動的に装填するためのプレート装填デバイスを備える。
[00145]実施形態9.実施形態1〜8または本明細書の任意の例示の実施形態の別の一実施形態では、ハイスループットシステムは、磁気ビーズを使用して複数の試料からDNAを抽出する。
[00147]実施形態11.実施形態1〜10または本明細書の任意の例示の実施形態の別の一実施形態では、試料分注デバイスは、複数の再使用可能な注射器型のピペットを備える。
[00150]実施形態14.実施形態1〜13または本明細書の任意の例示の実施形態の別の一実施形態では、試料容器は封止され、ピペットは容器のシールを貫通して複数の試料を抜き取るように構成される。
[00152]実施形態16.実施形態1〜15または本明細書の任意の例示の実施形態の別の一実施形態では、廃棄物管理システムは、複数のウェルから取り出した流体を廃棄物容器の中に入れる。
[00154]実施形態18.実施形態1〜17または本明細書の任意の例示の実施形態の別の一実施形態では、廃棄物管理システムは複数のウェルから取り出した流体を廃棄物容器の中で漂白剤と混合し、この混合物をインキュベートする。
[00158]実施形態22.実施形態1〜21または本明細書の任意の例示の実施形態の別の一実施形態では、複数の処理ステーションは、1つまたは複数の加熱または冷却デバイスを備える。
[00164]実施形態28.実施形態24〜27または本明細書の任意の例示の実施形態の別の一実施形態では、方法は、磁気ビーズを使用した複数の試料からのDNAの抽出を含む。
[00166]実施形態30.実施形態29または本明細書の任意の例示の実施形態の別の一実施形態では、ピペットは再使用可能なピペットの先端を備える。
[00169]実施形態33.実施形態24〜31または本明細書の任意の例示の実施形態の別の一実施形態では、液体レベルセンサは1つまたは複数の音響センサを含む。
[00172]実施形態36.実施形態24〜35または本明細書の任意の例示の実施形態の別の一実施形態では、廃棄物管理システムは複数のウェルから取り出した流体を廃棄物容器の中で漂白剤と混合し、この混合物をインキュベートする。
[00178]実施形態42.実施形態40から41または本明細書の任意の例示の実施形態の別の一実施形態では、これらの命令は、磁気ビーズを使用した複数の試料からのDNAの抽出のための命令を含む。
[00180]実施形態44.実施形態43または本明細書の任意の例示の実施形態の別の一実施形態では、ピペットは再使用可能なピペットの先端を備える。
[00183]実施形態47.実施形態24〜31または本明細書の任意の例示の実施形態の別の一実施形態では、液体レベルセンサは1つまたは複数の音響センサを含む。
[00186]実施形態50.実施形態40〜49または本明細書の任意の例示の実施形態の別の一実施形態では、廃棄物管理システムは複数のウェルから取り出した流体を廃棄物容器の中で漂白剤と混合し、この混合物をインキュベートする。
[00192]本出願は、本テキストおよび図面においていくつかの数を示す範囲を開示している。開示される数を示す範囲全体を通して本発明を実施することができることから、開示される数を示す範囲は元来、たとえ正確な範囲の限定が明細書において一語一句たがわず述べられていないとしても、開示される数を示す範囲におけるいずれの範囲または値もサポートする。
Claims (26)
- 複数の試料容器から複数の試料を抜き取り、各試料を複数のウェルを備える試料処理プレートのウェルの中に分注するための試料分注デバイスであって、各試料が異なるウェルの中に分注され、各ウェル内の前記試料がメニスカスを有する試料分注デバイスと、
前記試料処理プレートの前記複数のウェルの中に流体を分注するための非接触流体分注デバイスであって、前記非接触流体分注デバイスは前記ウェル内に既にある液体に接触することなく前記試料処理プレートの複数のウェルに流体を分注するように構成される、非接触流体分注デバイスと、
前記試料処理プレートの前記複数のウェルの各々における液体レベルを検出するための複数の非接触液体レベルセンサであって、前記非接触液体レベルセンサは前記ウェル内に既にある液体に接触することなく前記液体レベルを決定するように構成される、非接触液体レベルセンサと、
前記試料処理プレートの前記複数のウェルから流体を取り出すための複数の吸引器であって、前記吸引器は流体吸引ノズルの先端および試料メニスカスからほぼ等距離を維持するように構成され、さらに、前記吸引器は廃棄物管理システムと接続される、吸引器と、
前記複数の試料処理プレートを同時に処理するための複数の非接触処理ステーションであって、前記非接触処理ステーションは、環状攪拌機、サーモ攪拌機、磁気ステーション、水浴、加熱ブロック、冷却ブロック、大気インキュベータ、およびそれらの組み合わせから選択される、非接触処理ステーションと、
前記複数のウェルから取り出した流体を管理するための廃棄物管理システムと、
ハイスループット試料処理システムにおける複数のプレートの処理作業を同時に制御するための制御システムであって、前記制御システムは前記センサ、前記分注デバイス、前記吸引器、および前記処理ステーションと作動可能に接続され、前記分注デバイスおよび前記吸引器が各ウェルの前記試料メニスカスに接触せず、前記吸引器によって提供される吸引力が液体を前記吸引器内に引き込むのに十分な強度であるように、前記分注デバイスおよび前記吸引器を動的に制御するようにプログラムされる、制御システムと
を備えるハイスループット試料処理システム。 - 前記制御システムは、さらに、前記システムにおける他のプレートの場所または状況に応じて、前記複数の試料処理プレートからのプレートの処理作業を動的に制御するように構成される、請求項1に記載のハイスループット試料処理システム。
- 追加の試料処理プレートを前記試料分注デバイス内に自動的に装填するためのプレート装填デバイスをさらに備える、請求項1に記載のハイスループット試料処理システム。
- 前記試料分注デバイスは複数の注射器型のピペットを備える、請求項1に記載のハイスループット試料処理システム。
- 前記ピペットは再使用可能なピペットの先端を備える、請求項4に記載のハイスループット試料処理システム。
- 前記試料分注デバイスは、前記再使用可能なピペットの先端を自動的に洗浄する洗浄ステーションを備える、請求項5に記載のハイスループット試料処理システム。
- 前記洗浄ステーションは漂白液を含むように構成される、請求項6に記載のハイスループット試料処理システム。
- 前記液体レベルセンサは1つまたは複数の音響センサを含む、請求項1に記載のハイスループット試料処理システム。
- 前記廃棄物管理システムは廃棄物容器を有し、さらに、前記廃棄物管理システムは、前記複数のウェルから取り出した前記流体を重力又は吸引力を使用して前記廃棄物容器の中に入れるように構成され、さらに、前記廃棄物容器は、滅菌液を有することができる、請求項1に記載のハイスループット試料処理システム。
- 前記廃棄物容器は真空下で作用するように構成される、請求項9に記載のハイスループット試料処理システム。
- 前記廃棄物管理システムは前記複数のウェルから取り出した前記流体を前記廃棄物容器の中で漂白剤と混合し、混合物をインキュベートするように構成される、請求項9に記載のハイスループット試料処理システム。
- 前記廃棄物管理システムは前記複数のウェルから取り出した流体の量を決定するために1つまたは複数の重量計を備える、請求項1に記載のハイスループット試料処理システム。
- 前記試料容器上のバーコードを使用して試料を識別するように構成されるバーコードスキャナを備える、請求項1に記載のハイスループット試料処理システム。
- 請求項1に記載されたハイスループット試料処理システムに備えられ、前記ハイスループット試料処理システムによって生成された廃棄物を処理するための廃棄物管理システムであって、
重力ベースの液体廃棄物投入口と、
真空ベースの液体廃棄物投入口と、
少なくとも一つの液体廃棄物容器に作動可能に接続された滅菌流体容器と、
前記各投入口から液体廃棄物を交互に受け入れ、前記液体廃棄物を前記滅菌流体容器からの滅菌流体によって処理し、処理後の前記液体廃棄物を廃棄する前に所定の時間にわたって前記液体廃棄物における前記滅菌流体をインキュベートするように構成された2つ以上の液体廃棄物容器と、
1つまたは複数の前記液体廃棄物容器によって収集された液体廃棄物の量を決定するための1つまたは複数の重量計と、を備える、廃棄物管理システム。 - ハイスループット試料処理方法であって、
試料分注デバイスを使用して、複数の試料容器から複数の試料を抜き取るステップと、
前記試料分注デバイスを使用して各試料を分注するステップであって、各試料は複数のウェルを備えた試料処理プレートのウェルに分注され、各試料が異なるウェルの中に分注され、各ウェル内の前記試料がメニスカスを有する、ステップと、
非接触流体分注デバイスを使用して前記試料処理プレートの複数のウェルの中に流体を分注するステップと、
複数の非接触液体レベルセンサを使用して前記試料処理プレートの複数のウェルの各々における液体レベルを検出するステップと、
複数の非接触混合デバイスを使用して複数の試料処理プレートを同時に混合するステップと、
複数の吸引器を使用して前記試料処理プレートの前記複数のウェルから流体を取り出すステップであって、前記吸引器の流体吸引ノズルが試料メニスカスから一定の距離を維持する、ステップと、
廃棄物管理システムを使用して前記複数のウェルから取り出した流体を管理するステップと、を含み、
前記ハイスループット試料処理方法のステップは、制御システムによってスケジュール設定され且つ連携され、
前記制御システムは、前記試料分注デバイスおよび前記吸引器が各ウェルの前記試料メニスカスに接触せず、前記吸引器によって提供される吸引力が液体を前記吸引器内に引き込むのに十分な強度であるように、前記分注デバイスおよび前記吸引器を動的に制御するようにプログラムされる、ハイスループット試料処理方法。 - 前記制御システムを使用して、他のプレートの場所または状況に応じてプレートの処理作業を動的に制御するステップを含む、請求項15に記載の方法。
- プレート装填デバイスを使用して、追加のプレートを前記試料分注デバイス内に自動的に装填するステップをさらに含む、請求項15に記載の方法。
- 前記複数の試料は、血液、血漿または唾液を含む、請求項15に記載の方法。
- 前記方法は、前記試料処理プレートの前記複数のウェル内に配置された磁気ビーズを使用した前記複数の試料からのDNAの抽出を含む、請求項15に記載の方法。
- 前記試料は複数の注射器型のピペットを使用して分注される、請求項15に記載の方法。
- 前記液体レベルセンサは1つまたは複数の音響センサを含む、請求項15に記載の方法。
- 前記廃棄物管理システムは、前記複数のウェルから取り出した前記流体を廃棄物容器の中に入れるように構成される、請求項15に記載の方法。
- 前記廃棄物管理システムは前記複数のウェルから取り出した前記流体を前記廃棄物容器の中で漂白剤と混合し、前記混合物をインキュベートするように構成される、請求項15に記載の方法。
- 前記廃棄物管理システムは、前記複数のウェルから取り出した流体の量を決定するために1つまたは複数の重量計を備える、請求項15に記載の方法。
- 前記複数の非接触混合デバイスは1つまたは複数の環状攪拌機を備える、請求項15に記載の方法。
- 前記試料を識別するために前記試料容器上でバーコードスキャナを走査させるステップを含む、請求項15に記載の方法。
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