JP6087426B2 - 微生物のランタン含有濃縮剤 - Google Patents
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Description
本出願は、2012年6月5日に出願された米国特許仮出願第61/655,601号の利益を主張するものであり、その開示の全容を本明細書に参照として援用する。
微生物の濃縮剤、濃縮剤を含む物品、及び微生物を濃縮するためのプロセスを提供する。
微生物汚染による感染が大きな問題となっている。このため、様々な臨床試料、食品試料、環境試料、及び他の種類の試料中の微生物の存在についてアッセイすることにより、存在する微生物を特定及び/又は定量化することがしばしば望まれるか又は必要とされる。特定の微生物の存在を検出する能力は、分析される試料中の微生物の濃度にしばしば依存する。
微生物(例えば、細菌株、真菌、酵母、原生動物、ウイルス、及び細菌の芽胞)の非特異的濃縮に適した新規な濃縮剤が望まれており、本明細書において提供されるものである。更に、本濃縮剤を含む物品、及び本濃縮剤を使用して微生物を濃縮する方法が提供される。本濃縮剤は、ランタン及び炭酸塩の両方を含有する。
特に断らない限り、試薬はすべて、シグマ・アルドリッチ社(Sigma-Aldrich)又はブイ・ダブリュー・アール社(VWR)より標準製品として購入した。
試料は、ゼロバックグラウンドの石英インサート上で直接調べた。反射幾何学データを、Philips垂直回折計、銅Kα線、及び散乱放射の比例検出器レジストリを用いてサーベイスキャンの形で収集した。回折計に、可変入射ビームスリット、固定回折ビームスリット、及びグラファイト回折ビームモノクロメータを取り付けた。サーベイスキャンは、0.04度のステップサイズ及び4秒の滞留時間を用いて5〜80度(2θ)で行った。X線発生器は45kV及び35mAに設定した。粉末回折ファイル(PDF)を、回折パターンに観察される反射に基づき、試料中に存在する相の同定に使用した。
試料を、アルミニウムスタブ上に貼着された両面カーボンテープ上に装填した。装填された試料を、スパッターコーター(テッド・ペラ社(Ted Pella, Inc.)(カリフォルニア州アーバイン)より販売されるSEMコーティングユニットPS3)を用いてAu/Pdでコーティングすることにより、イメージングの際の帯電効果を抑制した。コーティングした試料は、以下のイメージング条件:20kV及び作動距離(W.D.)17mmで、ジェー・イー・オー・エル・ユー・エス・エー社(JEOL USA, Inc.)(マサチューセッツ州ピーボディ)より販売されるJEOL JSM−6400走査電子顕微鏡を使用して2次電子モードでイメージングした。
元素分析に使用した器具は、パーキンエルマー(Perkin Elmer)社のOptima 8300誘導結合プラズマ(ICP)光学放射分光光度計であった。試料は、0、0.2、0.5、及び1.0パーツ・パー・ミリオン(ppm)のランタンを含有する酸マッチングした基準溶液を用いて生成した外部検量線に対して分析した。0.5ppmの品質管理基準を使用して、分析中の検量線の精度を監視した。0.5ppmスカンジウム溶液をサンプル及び基準とともに測定して、内部基準として用いた。一般的な分析では、10ミリグラム(mg)の試料をポリプロピレン遠心チューブ中に0.01mg単位で秤量し、2体積%の硝酸水溶液で溶解した。固形物が完全に分解した時点で、溶液を脱イオン水で50mLにまで希釈した。分析に先立ち、溶液を更に体積で100倍に希釈して、ランタン濃度を線形検量範囲内とした。
LECOモデル932 CHNS元素分析装置を使用して、燃焼により炭素の重量比率(%)について試料を分析した。試料は、少なくとも3重で測定し、結果を標準偏差とともに各実験の測定値の平均として報告した。試料の分析に先立って、スルファメタジン基準を用いた検量線を生成した。特に断らない限り、炭素の絶対標準偏差は、±0.5重量%未満であった。炭素の検出限界は、0.50重量%であった。
ランタン/炭酸塩含有物質(濃縮剤1)を、ビーカー内で、等量の10重量%の硝酸ランタン(La(NO3)3・6H2O)の水溶液を、6重量%の重炭酸ナトリウム(NaHCO3)の水溶液に、マグネチックスターラーバーで絶えず攪拌しながら滴下することにより調整した。重炭酸塩の添加開始から数分後、明白色の固体が溶液から沈殿した。この固体を真空濾過してから、濾紙(ワットマン濾紙5番)を装着したブフナー漏斗内で脱イオン水により洗浄した。固体を室温の空気中で一晩乾燥して、ランタンを含有する濃縮剤1を得た。この物質(濃縮剤1)のX線回折分析により、鉱物であるカルキンサイト(PDF:6−0076)と構造が類似した相の存在が示された。濃縮剤1の走査電子顕微鏡(SEM)イメージングによれば、粒子は、板状の形態を有していた。個々の小板は、厚さが数百nmであり、平面の寸法は数ミクロンであった。これらの小板は、数十μmまでの粒径のより大きな粒子に凝集する傾向を示した。炭素含量は、5.39重量%であった。ランタン含量は、49.3重量%であった。ランタンに対する炭素の重量比は、0.109であった。
実施例1で調製した濃縮剤1を、箱形炉(カーボライト社(Carbolite LTD)(英国、ホープバレー)より販売されるCarbolite RHF 1500炉)内で室温から300℃まで30分かけて昇温した後、300℃の石英ボート内で1時間、空気中で焼結した。得られた白色粉末(濃縮剤2)をX線解析で分析したところ、炭酸ランタンの存在(PDF:6−0076及び/又は4−010−3609)を示した。X線解析パターンは、(200)及び(400)平面に沿った強い配向を、また、無秩序かつ/又は小粒化されたオキシ炭酸ランタン相(PDF:48−1113)に帰着されるブロードな反射群を示した。濃縮剤2の走査電子顕微鏡(SEM)イメージングによれば、この物質は、実施例1で調製した濃縮剤1と同様の板状の形態を有していた。このような板状の形態は、X線回折分析で観察された強い配向効果と符合するものである。炭素含量は、6.73±0.16重量%であった。ランタン含量は、57.9±0.8重量%であった。ランタンに対する炭素の重量比は、0.116±0.003であった。
実施例1で調製した濃縮剤1を、箱形炉(カーボライト社(Carbolite LTD)(英国、ホープバレー)より販売されるCarbolite RHF 1500炉)内で室温から550℃まで60分かけて昇温した後、550℃の石英ボート内で1時間、空気中で焼結した。得られた白色粉末(比較例1)は、X線解析により示されるように、オキシ炭酸ランタン(PDF:48−1113)を含有することが示された。この物質のSEMイメージングは、実施例2で調製した物質と同様の形態及び大きさを示した。炭素含量は、2.88±0.03重量%であった。ランタン含量は、72.3重量%であった。ランタンに対する炭素の重量比は、0.040±0.0004であった。
濃縮剤3は、市販の炭酸ランタン水和物(La2(CO3)3・xH2O)であった。X線回折によれば、この物質は、ランタナイト(La2(CO3)3・8H2O)(PDF:4−010−3609)を含有していた。走査電子顕微鏡(SEM)イメージングによれば、濃縮剤4は、板状の形態を有していた。個々の小板は、一般的に厚さ1μmよりも厚く、平面の寸法は数十ミクロンであった。これらの小板は、数十μmまでの粒径のより大きな粒子に凝集する傾向を示した。炭素含量は、5.31±0.12重量%であった。ランタン含量は、44±1重量%であった。ランタンに対する炭素の重量比は、0.121±0.004であった。
実施例3で述べた濃縮剤3を、箱形炉(カーボライト社(Carbolite LTD)(英国、ホープバレー)より販売されるCarbolite RHF 1500炉)内で室温から300℃まで30分かけて昇温した後、300℃の石英ボート内で1時間、空気中で焼結した。得られた白色粉末(濃縮剤4)は、濃縮剤1と同様のX線回折パターンを有していた。走査電子顕微鏡(SEM)イメージングによれば、形態及び微小構造は濃縮剤3と同様であった。炭素含量は、7.15±0.12重量%であった。ランタン含量は、57.7±0.3重量%であった。ランタンに対する炭素の重量比は、0.124±0.002であった。
実施例3で述べた濃縮剤3を、箱形炉(カーボライト社(Carbolite LTD)(英国、ホープバレー)より販売されるCarbolite RHF 1500炉)内で室温から550℃まで60分かけて昇温した後、550℃の石英ボート内で1時間、空気中で焼結した。X線回折によれば、得られた白色粉末(比較例2)はオキシ炭酸ランタン(PDF:48−1113)を含有していた。この物質の走査電子顕微鏡(SEM)イメージングにより、この物質が濃縮剤3と同様の形態及び大きさを有することが示された。炭素含量は、2.86±0.04重量%であった。ランタン含量は、72.3±0.8重量%であった。ランタンに対する炭素の重量比は、0.040±0.001であった。
グラム陰性細菌である大腸菌(E. coli)のストリーク培養物を用いて、3mLのDI水中、マクファーランド標準液0.5を調製した。108CFU/mLを含む、得られた細菌ストック液を吸着緩衝液中で連続希釈して、懸濁液1mL当たり103個の微生物を有する細菌懸濁液を得た。
実施例5は、体積1.0mLの微生物懸濁液1を、10mgの実施例2で調製した濃縮剤2が入れられた、ベクトン・ディキンソン社(Becton Dickinson)(ニュージャージー州、フランクリンレイクス)よりBD Falconの商品名で市販される、ラベルが貼られた滅菌5mLポリプロピレンチューブに加えることにより調製した。捕捉効率を表1に示す。
濃縮剤2の代わりに10mgの比較例1を使用した点以外は実施例5と同様にして比較例3を調製した。捕捉効率を表1に示す。
濃縮剤2の代わりに10mgの実施例3で述べた濃縮剤3を使用した点以外は実施例5と同様にして実施例6を調製した。捕捉効率を表1に示す。
濃縮剤2の代わりに10mgの実施例4で調製した濃縮剤4を使用した点以外は実施例5と同様にして実施例7を調製した。捕捉効率を表1に示す。
濃縮剤2の代わりに10mgの比較例2を使用した点以外は実施例5と同様にして比較例4を調製した。捕捉効率を表1に示す。
濃縮剤2の代わりに10mgの酸化ランタン(La2O3)を使用した点以外は実施例5と同様にして比較例C5を調製した。捕捉効率を表1に示す。
濃縮剤2の代わりに10mgの塩化ランタン(LaCl3)を使用した点以外は実施例5と同様にして比較例C6を調製した。捕捉効率を表1に示す。
10mgの塩化ランタンを1mLの濾過滅菌したDI水に加えて10mg/mL溶液(40mmol分散液)を調製することにより比較例C7を調製した。次いで、この分散液5μLを滅菌5mLチューブ内で1mLの微生物懸濁液1に加えた。比較例C7の塩化ランタン濃度は、細菌懸濁液1mL当たり0.2mmolであった。捕捉効率を表1に示す。
1.0mLの微生物懸濁液1を、ベクトン・ディキンソン社(BectonDickinson)(ニュージャージー州、フランクリンレイクス)よりBD Falconの商品名で市販される、ラベルが貼られた滅菌5mLポリプロピレンチューブに加えることによりコントロール試料を調製した。濃縮剤は加えなかった。1つのコントロール試料は、大腸菌1mL当たり130CFUを含み、別のコントロール試料は、大腸菌1mL当たり135CFUを含んでいた。
捕捉効率(%)=((捕捉)/(コントロール))×100
大腸菌の捕捉効率の結果を表1に示す。効率の標準偏差は、特に断らない限りは10%未満である。
グラム陽性細菌である黄色ブドウ球菌(S. aureus)のストリーク培養物を用いて、3mLのDI水中、マクファーランド標準液0.5を調製した。108CFU/mLを含む、得られた細菌ストック液を吸着緩衝液中で連続希釈して、懸濁液1mL当たり103個の微生物を有する細菌懸濁液を得た。
実施例8は、体積1.0mLの微生物懸濁液2を、10mgの実施例2で調製した濃縮剤2が入れられた、ベクトン・ディキンソン社(Becton Dickinson)(ニュージャージー州、フランクリンレイクス)よりBD Falconの商品名で市販される、ラベルが貼られた滅菌5mLポリプロピレンチューブに加えることにより調製した。捕捉効率を表2に示す。
濃縮剤2の代わりに10mgの比較例1を使用した点以外は実施例8と同様にして比較例C8を調製した。捕捉効率を表2に示す。
濃縮剤2の代わりに10mgの実施例3で述べた濃縮剤3を使用した点以外は実施例8と同様にして実施例9を調製した。捕捉効率を表2に示す。
濃縮剤2の代わりに10mgの実施例4で述べた濃縮剤4を使用した点以外は実施例8と同様にして実施例10を調製した。捕捉効率を表2に示す。
濃縮剤2の代わりに10mgの比較例2を使用した点以外は実施例8と同様にして比較例C9を調製した。捕捉効率を表2に示す。
濃縮剤2の代わりに10mgの酸化ランタン(La2O3)を使用した点以外は実施例8と同様にして比較例C10を調製した。捕捉効率を表2に示す。
濃縮剤2の代わりに10mgの塩化ランタン(LaCl3)を使用した点以外は実施例8と同様にして比較例C11を調製した。捕捉効率を表2に示す。
10mgの塩化ランタンを1mLの濾過滅菌したDI水に加えて10mg/mL溶液(40mmol分散液)を調製することにより比較例C12を調製した。次いで、この分散液5μLを滅菌5mLチューブ内で1mLの微生物懸濁液2に加えた。比較例C12の塩化ランタン濃度は、細菌懸濁液1mL当たり0.2mmolであった。捕捉効率を表2に示す。
1.0mLの微生物懸濁液2を、ベクトン・ディキンソン社(BectonDickinson)(ニュージャージー州、フランクリンレイクス)よりBD Falconの商品名で市販される、ラベルが貼られた滅菌5mLポリプロピレンチューブに加えることによりコントロール試料を調製した。濃縮剤は加えなかった。1つのコントロール試料は、黄色ブドウ球菌1mL当たり140CFUを含み、別のコントロール試料は、黄色ブドウ球菌1mL当たり195CFUを含んでいた。
大腸菌のストリーク培養物を用いて、3mLの濾過滅菌水中、マクファーランド標準液0.5を調製した。1×108CFU/mLを含む、得られた細菌ストック液を水で連続希釈して、約100CFU/mLを有する細菌懸濁液を得た。この細菌懸濁液を100mLの水道水で1:1000に希釈することによって全体で約10CFUの濃度を有する微生物懸濁液を与えることにより、希釈懸濁液を調製した。体積1mLの吸着緩衝液及び100mLの希釈微生物懸濁液を、ブイ・ダブリュー・アール社(VWR)より入手した滅菌250mLポリプロピレン製円錐底遠心チューブに加えた。
30.0gの繊維1、6.0gの繊維2、4.5gの繊維3、及び3.0gの繊維4を、4Lの冷たい水道水と、4Lのブレンダー(ブイ・ダブリュー・アール社(VWR Co.)(ペンシルベニア州ラドナー)より販売されるWaring商業用耐久型ブレンダー、モデル37BL84)内で、中速で90秒間混合することにより繊維プレミックスを調製した。この混合物を、ニット(nits)又は凝塊のない繊維の均一な分散について調べ、凝塊がすべて細かくなるように必要なだけ更にブレンドした。次いで、1Lの繊維プレミックスを1Lステンレス鋼ビーカーに加え、インペラミキサー(サーモ・フィッシャー・サイエンティフィック社(ThermoFisher Scientific)(マサチューセッツ州ウォルサム)より販売されるFisher Scientific Stedfast攪拌器モデルSL2400)で速度設定4として5分間混合した。次いで、1.0gのラテックスバインダーを50mLビーカー内で約25mLの水道水に分散し、混合物に加えた。ビーカーを更に約25mLの水道水ですすぎ、これを混合物に加えて約2分間混合した。同様にして、0.5gの凝集剤を約25mLの水道水に分散し、混合下で混合物に加えた後、ビーカーから更に約25mLのすすぎ水を加えた。ラテックスバインダーが溶液から繊維上に析出し、プレミックスの液相は濁った状態からほぼ透明に変化した。次いで、実施例2で調製した5.0gの濃縮剤2を加え、ボルテックスミキサーで1分間混合した。
10.0gの濃縮剤2を加えた点以外は実施例12の手順に従って多孔質マトリックスを調製した。
リステリア・モノサイトゲネス(L. monocytogenes)のストリーク培養物を用いて、3mLのBHIブロス中、マクファーランド標準液0.5を調製した。約108CFU/mLを含む、得られた細菌ストック液をBHIブロス中で連続希釈して、約103CFU/mLを有する細菌懸濁液を得た。
直径14mmの円形片を実施例12の物品から打ち抜き、フィルターホルダー(Swinnex)に挿入した。3mLシリンジを使用して1.5mLの微生物懸濁液3をフィルターホルダー内の円形試料上に加えた。フィルターホルダーを容器に被せて濾液を回収し、約15秒間で濾過を完了した。捕捉効率を表3に示す。
実施例12の代わりに実施例13の物品から円形片を打ち抜いた点以外は実施例14に述べたのと同様の手順に従って実施例15を調製し、濾過した。捕捉効率を表3に示す。
実施例14及び15で得られた各濾液から100μLの体積をMOXプレート上に接種した。100μLの濾過しない微生物懸濁液3をMOXプレート上に接種することによりコントロールを調製した。実施例14及び15からの円形物品を、各濾過の後で表面を滅菌したピンセットを使用してフィルターホルダーから取り出し、100μLのバターフィールド緩衝液とともにMOXプレート上に置いた。すべてのプレートを37℃で18〜20時間インキュベートした。コロニーをマニュアルでカウントした。
捕捉効率(%)=100−濾過効率
捕捉効率の結果を表3に示す。
大腸菌のストリーク培養物を用いて、3mLの滅菌DI水中、マクファーランド標準液0.5を調製した。1×108CFU/mLを含む、得られた細菌ストック液をDI水で連続希釈して、約105CFU/mLを有する細菌懸濁液を得た。
LRV=(Log10(コントロールカウント))−(Log10(濾液カウント))
YPD寒天プレートからのサッカロマイセス・セレヴィシエ(Saccharomycescerevisiae)のストリーク培養物を用いて、最寄りの小売業者より購入したビール(アルコール4.3%のミケロブ(Michelob)ゴールデンライトドラフトビール)3mL中、マクファーランド標準液0.5を調製した。約106CFU/mLを含む、得られた酵母ストック液をビールで連続希釈して103CFU/mLを含む酵母懸濁液を得た。この試料をコントロール酵母懸濁液と呼ぶものとする。この懸濁液の1:100希釈液を100mLのビール中に接種して10CFU/mLとすることにより、酵母添加(spiked)ビール試料を調製した。この試料を、酵母添加ビールコントロール又は微生物懸濁液4と呼ぶものとする。
直径14mmの円形片を実施例12から打ち抜き、フィルターホルダー(Swinnex)に挿入した。20mLシリンジを用いて、微生物懸濁液4(100mL)をフィルターホルダーに5つのバッチで加えた。試料の全体が多孔質マトリックス/濃縮剤を通過した後、表面を滅菌したピンセットで円形片を空の滅菌1.5mLポリプロピレンマイクロ遠心チューブ(ブイ・ダブリュー・アール社(VWR)、カタログ番号89000−028)に移した。これを実施例17とする。
ATPシグナル率(%)=(補正後のRLU/103CFUコントロールからのRLU)×100
結果を表4に示す。
99mLのバターフィールド緩衝液及び最寄りの食料品店より購入した牛挽肉試料11g(脂肪分15%)をストマッカーバッグに加え、製造者の指示に従って、230rpmの速度で30秒間、ストマッカーで処理することにより、牛挽肉試料を調製した。
以下のようにして実施例20を調製した。最寄りの食料品店より購入した豆乳(脂肪分4.5g)11mLを99mLのバターフィールド緩衝液と攪拌することにより豆乳試料を調製した。10mLの試料を、10mLシリンジにより、フィルターホルダー(Swinnex)内の実施例12の14mm円形片に加えた。シリンジをフィルターホルダーの入口ポートに嵌め込み、試料全体がマトリックスを通過するまで、シリンジのプランジャーを用いて試料に陽圧を加えた。濾液の体積及び濾過時間を表6に示す。
Claims (6)
- 微生物を濃縮するためのプロセスであって、
(a)ランタン/炭酸塩含有物質の複数の粒子を含む濃縮剤を提供する工程であって、前記濃縮剤の、ランタンに対する炭素の重量比が少なくとも0.05である、工程と、
(b)前記微生物を含む液体試料を提供する工程と、
(c)前記濃縮剤を前記液体試料と接触させる工程と、
(d)前記微生物を前記濃縮剤と結合させて、結合した微生物を形成する工程と、を含む、プロセス。 - 前記結合した微生物が生存状態にある、請求項1に記載のプロセス。
- 前記濃縮剤が多孔質マトリックスを更に含み、
前記複数の粒子が、前記多孔質マトリックスの表面上に分散されるか、前記多孔質マトリックスの全体にわたって分散されるか、又は前記多孔質マトリックスの表面上及び全体にわたって分散される、請求項1又は2に記載のプロセス。 - 前記濃縮剤が、炭酸ランタン、オキシ炭酸ランタン、水酸化炭酸ランタン、又はこれらの混合物を含む、請求項1〜3のいずれか一項に記載のプロセス。
- (a)ランタン/炭酸塩含有物質の複数の粒子を含む濃縮剤であって、ランタンに対する炭素の重量比が少なくとも0.05である、濃縮剤と、
前記濃縮剤に結合した微生物と、を含む物品。 - 前記微生物が生存状態にある、請求項5に記載の物品。
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