JP5721638B2 - コンジュゲート分子 - Google Patents
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Description
(i)一又は複数の検出可能な物質、
(ii)少なくとも二つの物質で、その各々がペルオキシダーゼ活性を有する酵素の基質となりうるもの
を含む水溶性コンジュゲートであって、
ここで、標識(i)とペルオキシダーゼ基質の部分(ii)が同じ化学物質ではなく、
ここで、標識(i)とペルオキシダーゼ基質の部分(ii)がリンカーを介して結合され、該リンカーが少なくとも30の連続的に連結された原子の少なくとも一つの線状鎖を含む化合物であり、上記線状鎖は少なくとも30の連続的に連結された原子の距離だけ分離した少なくとも二つの分岐点を含み;
ここで、標識(i)とペルオキシダーゼ基質の部分(ii)は少なくとも30の連続的に連結された原子によってコンジュゲート分子において分離され、
ここで、二つの隣接するペルオキシダーゼ基質部分は30未満の連続的に連結された原子によって互いから分離されているコンジュゲートに関する。
[上式中、
R1は−H、−O−X、N(X)2又は−S−Xであり;
R2は−H、−O−X、−N(X)2、又は−S−Xであり、
R3は−H、−OH、−NH2又は−SHであり;
R4は−H、−O−X、−N(X)2、又は−S−Xであり、
R5は−H、−O−X、N(X)2、又は−S−Xであり、
R6は−CON(X)2、又はCO−Xであり、
ここで、
Hは水素であり;
Oが酸素であり、
Sが硫黄であり、
Nが窒素であり、
XがH、アルキル又はアリールである]
を有する。
一実施態様では、ペルオキシダーゼ基質の部分は、フェルラ酸、ケイ皮酸、アミノケイ皮酸、コーヒー酸、シナピン、又はチロシンの残基である。
一実施態様では、ペルオキシダーゼ酵素の基質となりうる部分の少なくとも二つはチロシン残基である。
[上式中、R1及びR2はNH及びOから選択され、R3はメチル、エチル、プロピル、CH2OCH2、及び(CH2OCH2)2から選択される]の2の反復を含み、3以下の連続的に反復するエチルオキシ基を有する。
一実施態様では、ペルオキシダーゼ活性を持つ酵素は西洋わさびペルオキシダーゼである。
更に、一態様における本発明は、試料中のペルオキシダーゼ活性の検出方法において、
I. ペルオキシダーゼ活性を有すると思われる試料を、
a)請求項1から10の何れかに記載の化合物
b)3,3’ジアミノベンジジン、及び
c)過酸化物化合物
を含有する水溶液中でインキュベートし、それによって化合物の沈殿物を形成し;
II. 試料中の化合物の沈殿物を検出し、それによって試料中のペルオキシダーゼ活性を検出する
ことを含んでなる方法に関する。
一実施態様では、本発明の方法は、5mMを越える過酸化水素と0.25mMから6mMの3,3’ジアミノベンジジンを含有する本発明のコンジュゲート分子の水溶液、又は3,3’ジアミノベンジジンの量が1.5mMを越える溶液を使用する。
幾つかの実施態様における本発明のコンジュゲート化合物は交換可能に「コンジュゲート」又は「レポーター分子」と称される。
本発明は、次の特徴を共有するコンジュゲート分子(交換可能に「コンジュゲート」と称される)の大きな群に関する:
1. コンジュゲート分子は、ペルオキシダーゼ酵素の基質、好ましくはHRP基質となりうる二以上の物質と水溶性リンカー化合物を介して互いに結合している一又は複数の標識を含む水溶性分子である;
2. ペルオキシダーゼ基質部分は、上記分子の一部分のコンジュゲート分子中において、それらが2,5nmを越えない距離だけ互いに分離している、例えば30未満の相互連結された炭素原子の鎖又は炭素、窒素、硫黄及び/又は酸素のようなヘテロ原子の鎖だけ、好ましくは5−20原子を越える鎖だけコンジュゲートの分子内で分離しているという点で「濃縮」されている;
3. 検出可能な標識はペルオキシダーゼ基質部分から少なくとも30の連続敵に相互連結された原子だけ離れた距離にある、つまり2.5nmを越えて、好ましくは3nmを越えた距離にある;
4. リンカーは、好ましくは、少なくとも30の連続的に連結された原子の少なくとも一つの線状鎖を含むポリマーを含み;好ましくはここで二つの連続する炭素に酸素又は窒素原子が続く;
5. コンジュゲートは環境中にペルオキシダーゼ活性を有している酵素の不在下で過酸化物化合物及び3,3’−ジアミノベンジジン(DAB)を含む水溶液から沈殿しない。
6. コンジュゲートは環境中にペルオキシダーゼ活性を有している酵素の存在下で過酸化物化合物を含むが3,3’−ジアミノベンジジン(DAB)を含まない水溶液から沈殿しない。
7. コンジュゲートは環境中にペルオキシダーゼ活性を有している酵素の存在下で過酸化物化合物と3,3’−ジアミノベンジジン(DAB)を含む水溶液から沈殿する。
これらの特徴を以下に詳細に記載し、これらの特徴を有する幾つかのコンジュゲート分子を実施例において例証する。
(i)一又は複数の検出可能な物質(交換可能に「標識」と称される)、
(ii)少なくとも二つの物質で、その各々がペルオキシダーゼ活性を有する酵素の基質となりうるもの(かかる物質は「ペルオキシダーゼ基質」又は「ペルオキシダーゼ基質の部分」と称される)
を含む水溶性コンジュゲートであって、
ここで、標識(i)とペルオキシダーゼ基質の部分(ii)が同じ化学物質ではなく、
ここで、標識(i)とペルオキシダーゼ基質の部分(ii)がリンカーを介して結合され、該リンカーが少なくとも30の連続的に連結された原子の少なくとも一つの線状鎖を含む化合物であり、上記線状鎖は少なくとも30の連続的に連結された原子の距離だけ分離した少なくとも二つの分岐点を含み;
ここで、標識(i)とペルオキシダーゼ基質の部分(ii)は少なくとも30の連続的に連結された原子によってコンジュゲート分子において分離され、
ここで、二つの隣接するペルオキシダーゼ基質部分は30未満の連続的に連結された原子によって互いから分離されているコンジュゲートに関する。
「検出可能な物質」なる用語は、(i)検出可能な発色性、蛍光性、発光性又は放射性シグナルを生じうるか、又は(ii)例えば抗体、核酸配列、核酸配列アナログ配列、ハプテン、抗原、レセプター、レセプターリガンド、酵素等のシグナルを検出することができる特異的結合対のメンバーである物質に関する。
(Y)n-(B1)L(B2)-(Z)m
[上式中、
Yはペルオキシダーゼ活性を持つ酵素の基質となりうる部分であり;
Zは検出可能な標識であり;
Lはリンカーであり
B1及びB2は分岐点であり、
ここで、
nは2から150の整数であり、かつ
mは1から150の整数である]
によって表すことができる。
[上式中、
R1は−H、−O−X、N(X)2又は−S−Xであり;
R2は−H、−O−X、−N(X)2、又は−S−Xであり、
R3は−H、−OH、−NH2又は−SHであり;
R4は−H、−O−X、−N(X)2、又は−S−Xであり、
R5は−H、−O−X、N(X)2、又は−S−Xであり、
R6は−CON(X)2、又はCO−Xであり、
ここで、
Hは水素であり、
Oは酸素であり、
Sは硫黄であり、
Nは窒素であり、
XはH、アルキル又はアリールである]
を有している。
好ましい一実施態様では、コンジュゲートは2から4の同一又は異なった残基Yを含む。
好ましい一実施態様では、Yはアミノ酸チロシンの残基又はその誘導体でありうる。コンジュゲートは、2から4のチロシン残基、又はそれ以上のチロシン残基を含みうる。
ここで、R1及びR2はNH及びOから選択され、R3がメチル、エチル、プロピル、CH2OCH2、及び(CH2OCH2)2から選択され、連続反復エチルオキシ基が3以下である。得られたコンジュゲートは一つの検出可能な標識(又は以下に記載されるような一を越える検出可能な標識)で更にコンジュゲートされ得、又はそれは(一又は数個のそのようなレポーターが結合されうる)水溶性ポリマー、例えばデキストランでコンジュゲートされうる。
コンジュゲート分子当たりの検出可能な標識の数は変動しうる。ある実施態様では、コンジュゲート分子当たり1から3、例えば1、2又は3の標識が好ましい場合がある。好ましい実施態様では、そのようなコンジュゲートは一つの検出可能な標識を含む。一実施態様では、式(II)の2から4の残基Y又は2から4のチロシンと一つのシグナル標識を含むコンジュゲート分子が好ましい場合がある。ある実施態様では、コンジュゲートは3を越える標識、例えば4〜150の標識をコンジュゲート分子当たりに含みうる。
の分子の二以上の残基を含む化合物であり、ここで、R1及びR2はNH及びOから選択され、R3はメチル、エチル、プロピル、CH2OCH2、及び(CH2OCH2)2から選択され、連続的に反復するエチルオキシ基は3を越えない。
上記スペーサーに結合されそれによって分離される複数の標識は一つのYヘッド又は幾つかのYヘッドに適切なリンカー、例えばデキストランのような複数の結合を可能にする水溶性ポリマーでコンジュゲートされうる。ある実施態様では、幾つかのYヘッドはそのようなポリマーを介して幾つかのZテールにコンジュゲートされうる。
標識のZテール配置は、(1)標識間を親水性スペーサー分子によって分離されている複数の疎水性標識を含むコンジュゲートは水溶液への良好な溶解度のままであり、(2)標識は結合剤がコンジュゲートを検出するために使用される場合に結合剤により接近可能であるという利点を有している。
好ましい一実施態様では、線状ポリマーは、二つの連続した炭素原子に、酸素又は窒素から選択されるヘテロ原子が続く原子鎖、例えば以下に記載のリンカー、又はポリエチレングリコール等を含む。
好ましい一実施態様では、リンカーはデキストラン又はデキストランを含む混合ポリマーである。
の分子の二以上の残基を含む化合物であり、
ここで、R1及びR2はNH及びOから選択され、R3はメチル、エチル、プロピル、CH2OCH2、及び(CH2OCH2)2から選択され、連続的に反復するエチルオキシ基は3を越えない。
の一又は複数の単位を含み、ここで、nは1から10の整数であり、(B)は分岐点である。この式のL分子及びその合成は、出典明示によりここに援用される国際公開第2007/015168号に詳細に記載されている。
L30反復、例えばL60(2×L30反復)、L90(3×L30反復)、L150(5×L30反復)を含む例示的なコンジュゲートは実施例に記載し、図1(3)に示す。
本発明のコンジュゲート分子は、有利には、試料中のペルオキシダーゼ活性の検出に使用されうる。
ペルオキシダーゼ酵素、例えば西洋わさびペルオキシダーゼは本発明のコンジュゲート分子を基質として使用し、他の基質3,3’ジアミノベンジジン及び過酸化物化合物の存在下でコンジュゲートの水溶性分子を水不溶性に転換する。これは、コンジュゲート固体支持体の沈殿物(沈着物)の形成として観察され得、又はそれは清澄な溶液の濁りとして検出され得、沈殿物は溶液中に懸濁する。ペルオキシダーゼ酵素が固体支持体に固定される場合には、沈着物の形成はペルオキシダーゼ活性を含むこの支持体の部位に向かう。固体支持体上の沈着物又は溶液中の懸濁沈殿物は、例えば眼での観察によって直接的に、又は検出手段の使用によって、例えば沈殿したコンジュゲート分子の検出可能な標識を検出することによって、検出されうる。
一態様では、本発明は、試料中のペルオキシダーゼ活性の検出方法において、
I. ペルオキシダーゼ活性を有すると思われる試料を、
d)本発明のコンジュゲート
a)3,3’ジアミノベンジジン、及び
b)過酸化物化合物
を含有する水溶液中でインキュベートし、それによって化合物の沈殿物を形成し;
II. 試料中の化合物の沈殿物を検出し、それによって試料中のペルオキシダーゼ活性を検出する
ことを含んでなる方法に関する。
a.ペルオキシダーゼ活性を有する一又は複数の結合剤と共に標的を含むと思われる試料をインキュベートし、ここで、上記一又は複数の結合剤はひょうてきに直接的又は間接的に結合可能で、その少なくとも一つがペルオキシダーゼ活性を含む一又は複数の結合剤及び標的を含む複合体を形成し;
b.(i)の試料を。
i.3,3’ジアミノベンジジン、
ii.過酸化物化合物、及び
iii.コンジュゲート
を含有する水溶液中でインキュベートし
c.沈着したコンジュゲートを検出し、それによって標的を検出する
工程を含んでなる方法に関する。
本発明の検出方法の実施態様を以下に検討する。
「試料」なる用語は、残りの材料がどのようであるか又はどのようにあるべきかを示すある量の材料を意味し、例えば生物学的、化学的、環境的材料の試料、例えば体組織の試料、食物の試料、土壌の試料である。一実施態様では、試料は生物学的試料である。
1.懸濁細胞及び/又は細胞片を含む試料、例えば血液試料、クローン化細胞懸濁物、体組織ホモジネート等;
2.動物の身体の無傷の又は損傷した細胞、体組織、スメア又は液又は腫瘍の試料、例えば生検試料;これは新鮮な組織試料か、又は保存された組織試料、例えばホルマリンで固定されパラフィン包埋された組織試料でありうる;
3.生きた生物体の試料、例えば動物、植物、細菌、真菌等を含む媒体の試料;
4.ウイルス粒子、その細片、又はウイルス産物、例えばウイルス核酸、タンパク質、ペプチド等を含む体スメア;
5.細胞小器官を含む試料;
6.天然又は組換え生物学的分子を含む試料、例えば血漿試料、条件細胞培養培地等。
「標的」なる用語は、特定の物理的及び機能的特徴によって特徴付けることができる(試料中に存在すると思われる)興味ある物を意味する。本発明の文脈において、「標的」なる用語は、その物の個々の単一の各単位ではなく、試料中に存在するその物の実質的に類似の実体の全プールに関する。本文脈において、「実質的に類似」なる用語は、プールの全ての実体が標的としてそれらを認識可能にする特徴を有していることを意味する。例えば、一実施態様では、標的は、試料中に存在するタンパク質で試料中のそのタンパク質の全ての分子を含むものであり得;他の実施態様では、標的は分子複合体又は構造で試料中のその種の全ての分子複合体又は分子構造を含むものであり得;他の実施態様では、標的はウイルス粒子又は細菌で試料のウイルス粒子又は細菌の全集団を含むものでありうる。よって、標的なる用語は試料中の特定の一種の複数の単位に関する。よって、ここに記載された方法は、標的の個々の単一単位、例えば単一分子を可視化するのではなく、分子標的の複数の単一単位、つまり試料中の標的分子の全プールを可視化することに関することが理解される。
化学的及び環境試料の標的は異なった汚染物質、毒素、戦争物質、分子ライブラリーのメンバー、有毒な産業廃棄物等でありうる。
好ましい一実施態様では、標的は癌に関連する生物学的マーカー、例えば遺伝子又はその癌関連産物、例えばホルモン及び増殖因子及びそのレセプター、細胞接着分子シグナル伝達分子、細胞周期調節分子等の核酸及びポリペプチド、例えば群:PDGF、VEGF、TGF、HGF、FGF又はEGF、そのレセプター及びシグナル伝達分子、遺伝子及びその産物で、JAK/STAT経路又はAkt1/PKB細胞生存経路、又は5−FU経路に関連したもの、エストロゲンレセプターERとその遺伝子(ERS1)等である。
一実施態様では、標的は試料中に存在するペルオキシダーゼ酵素である。
本発明の文脈における「標的部位」なる用語は、標的及びペルオキシダーゼ活性を含む固体支持体の部位又は固体試料、例えば固形組織試料の部位を意味する。一実施態様では、標的部位は、ペルオキシダーゼ活性で標識された例えば分子、ウイルス、微生物等の標的を含む試料の部位又は固体支持体の部位であり得、つまり標的はそれ自体はペルオキシダーゼ活性を有していないが、上記活性は標的に直接的に又は間接的に関連していた。ペルオキシダーゼ活性は、上記標的に対するペルオキシダーゼ酵素の部分の直接的なコンジュゲーションを介して標的に関連されうる(本発明の文脈における「部分」は、分子の機能的部分、例えば上記ペルオキシダーゼの酵素活性を可能にするペルオキシダーゼ酵素の一部を意味する)。あるいは、ペルオキシダーゼ活性は標的に間接的に、例えばペルオキシダーゼ活性含有結合剤の標的への結合を介して、関連させられうる。
本発明によれば、コンジュゲート分子は、コンジュゲートが環境中の標的分子の存在をその標識に関連するシグナルを直接的又は間接的に発することにより本発明の条件下でレポートする点で標的を検出することを可能にする。
ある実施態様では、試料、標的、標的部位、沈着コンジュゲートは異なった媒体中でインキュベートされうる。
「インキュベートする」なる用語は、試料又は標的又は結合剤との標的の複合体が、
所定の期間、媒体中に、例えば標的と特異的に相互作用する特定の試薬、例えば標的に直接的に又は間接的に結合可能な結合剤等を含有する媒体中に維持されることを意味する。該期間は10秒から3分まで変動し得、又はより長い期間、例えば5−10分、10−20分、40−60分、1−2時間又はそれ以上、例えば一晩続く。インキュベーションは、異なった実施態様、例えば検出される標的分子のタイプ及び/又は検出に使用される結合剤及び/又はレポーターのタイプ等に応じて、異なった温度で実施されうる。ある実施態様では、「インキュベートする」なる用語は、試料が特異的結合剤を欠く媒体中でインキュベートされる条件で通常使用され、試料から特定の薬剤を除去するのに役立つ「洗浄」なる用語と交換可能に使用されうる。
「結合剤」なる用語は、標的に直接的又は間接的に結合しうる分子を示し、ここで、「直接的」なる用語は、結合剤が標的に対して親和性を有しており、標的を特異的に認識し、それと相互作用し、それに結合しうることを意味し、「間接的」なる用語は、結合剤は標的に対して特異的な親和性を有していないが、標的に関連する物質とそのような親和性を有しており、該物質に特異的に結合可能であることを意味する。標的に直接結合可能である結合剤はここでは「第一結合剤」と言う。標的に間接的に結合可能な結合剤はここでは「第二結合剤」と言う。第一結合剤は典型的には試料に接触させるために使用される。試料中に存在すると思われる標的に特異的に結合する分子から構成されうる。第二結合剤は、第一結合剤に結合する分子でありうる。
本発明に係る第一、第二及び更なる結合剤は特異的結合対のメンバーでありうる。
二次抗体は、ここで使用される場合、一次抗体又は標的部位に沈着したハプテン、又は一次抗体又は他の結合剤に直接的もしくは間接的に結合されたハプテンに特異的に結合する抗原結合ドメインを有する抗体を意味する。
三次抗体は、ここで使用される場合、二次抗体又は二次抗体に結合されたハプテン又は二次抗体にコンジュゲートされたポリマーに結合されたハプテン、又は標的部位に沈着したハプテンに特異的に結合する抗原結合ドメインを有する抗体を意味する。
場合によっては、抗体は、二次抗体及び三次抗体の両方として機能しうる。
他の実施態様では、結合剤は、非免疫特異的結合対、例えば相補的ヌクレオチド配列対、又は相互親和性を有する二つの核酸アナログ分子の対のメンバーでありうる。
核酸配列は化学的に又は細胞中で組換え的に生産されうる(例えばSambrook等 (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2版 Cold Spring Harbor Pressを参照)。ある実施態様では、結合剤はペプチド核酸(PNA)からなる。ペプチド核酸は、通常DNA及びRNA内に存在するデオキシリボース又はリボース糖骨格がペプチド骨格で置き換えられた核酸分子である。PNAの作製方法は、当該分野で知られている(例えば、Nielson、2001、Current Opinion in Biotechnology 12:16を参照)(出典明示によりここに援用される)。他の実施態様では、結合剤はロックド核酸(LNA)からなる(Sorenson 等 2003、Chem. Commun. 7(17):2130)。
試料中の標的の検出に使用される抗体の量は、抗体、標的、又は試料に非常に依存する。従って、この量は、各特定の場合に個々に定められなければならず、これは当業者に知られた常套手順である。しかしながら、本発明による標的の検出に使用される抗体の量を定めるならば、殆どの現在の免疫検出法によって必要とされる量と比較して1000倍まででありうる。標的に関連するシグナルの多重増幅の可能性、つまり最初に本発明のレポーターの沈着の工程において、ついで沈着したレポーターの標識工程においての増幅により、本発明の検出方法は、一次結合剤の親和性、つまり標的への親和性にあまり依存しないものになるが、これは標的への結合剤の弱い結合が検出されうるためである。
「ペルオキシダーゼ活性」なる用語は、次式の反応を触媒する酵素活性に関する:
ROOR’+電子供与体(2e−)+2H+→ROH+R’OH
ペルオキシダーゼ活性を有する酵素はここでは「ペルオキシダーゼ」又は「ペルオキシダーゼ活性を持つ酵素」と呼ばれる。多くのペルオキシダーゼに対して、最適な基質は過酸化水素であるが、他のものは有機過酸化物のような有機ヒドロペルオキシドでより活性である。電子供与体の性質は酵素の構造に非常に依存し、例えば西洋わさびペルオキシダーゼ(HRP)/EC1.11.1.7)は電子供与体及び受容体の双方として広範な有機化合物を使用することができる。HRPは接近可能な活性部位を有しており、多くの化合物が反応部位に達しうる。
標的を含む試料は異なったインキュベーション媒体中でインキュベートされうる。
「インキュベーション媒体」なる用語は、本文脈においては、溶液の特定の化合物と試料間で所望の反応が起こることを可能にするために所定の時間(ここでは「インキュベーション時間」と称される)試料が維持される特定の化合物を含む溶液を意味する。
インキュベーション媒体中において試料を維持する/インキュベートする時間、つまりインキュベート時間は、およそ3秒からおよそ3分、例えば約10秒、20秒、30秒、1分、2分等、例えば3−10分、10−20分、20−40分、40−60分、1−2時間又はそれ以上、例えば一晩と実施態様に応じて変動しうる。一実施態様では、検出手順の全工程におけるインキュベート時間は同じ期間を持ち得、つまり、インキュベーション毎に1分、2分、3分、5分、10分等々が続きうる。他の実施態様では、インキュベート時間は一工程と他の工程とで変動し得、例えば結合剤を含む媒体中での試料のインキュベートは1分続き得、3’,3−ジアミノベンジジン(DAB)、レポーター、及び過酸化物化合物を含有する媒体中での試料のインキュベートは2分続き得、レポーター沈着物の検出のための媒体中での試料のインキュベートは5分続きうる等である。
ある実施態様では、第一インキュベーション媒体は、イオンキレート剤(例えばエチレンジアミン四酢酸(EDTA)又はエチレンジアミンヒドロキシフェニル酢酸型キレート剤(EDHPA)等)を含みうる。キレート剤の量は、約10−6から約10−2Mまで変化しうる。
一実施態様では、沈着媒体は、
(i)レポーター;
(ii)過酸化物化合物、及び
(iii)3,3’-ジアミノベンジジン(DAB)
を含む、約4から約9の範囲のpHを有する緩衝水性媒体である。
(i)レポーター及び
(ii)過酸化物化合物
を含む、約4から約9の範囲のpHを有する緩衝水性媒体である。
媒体は、有機又は無機塩を更に含みうる。
有機塩は、例えば酢酸ナトリウム、酢酸アンモニウム又はイミダゾール塩、例えばイミダゾール塩酸塩等から選択されうる。
(i)有機調整剤(有機モディファイアー)、及び/又は
(ii)酵素増強剤(酵素エンハンサー)、及び/又は
(iii)鉄キレート剤、及び/又は
(iv)洗浄剤、及び/又は
(v)抗菌剤
を更に含みうる。
一実施態様では、本発明は内因性ペルオキシダーゼ活性をクエンチさせるための媒体に関する。この種の媒体は当該分野で常套的に使用されているこの目的に適した任意の媒体でありうる。
一実施態様では、本発明は本発明のコンジュゲート分子を含む組成物に関する。「本発明のコンジュゲート分子を含む組成物」なる用語は、例えば実施例の表1に述べられているような、本発明のコンジュゲート分子の合成の中間体を含む組成物をまた含む。
一実施態様では、組成物は本発明のコンジュゲート分子を含む水溶液である。本発明のコンジュゲート分子を含む水溶液の非限定的な例は実施例において上述した媒体でありうる。
一実施態様では、本発明のレポーターを含む組成物は本発明のキットオブパーツの一部である。
本発明のキットオブパーツは試料中の標的を検出するためのキットオブパーツである。
本発明の方法は多様なアッセイ形式で多様な試料中の非常に多様な標的を検出するのに適しているので、本発明のキットオブパーツは多くの異なったアイテムを含みうるが、本発明の全てのキットオブパーツは本発明のコンジュゲート分子を含む組成物を含む。次は本発明のキットオブパーツの幾つかの非限定的な例示的実施態様である。
(i)上述のものの何れかのようなコンジュゲートを含む組成物;及び
(ii)標的に直接的又は間接的に結合可能な一又は複数の結合剤で、結合剤はここに記載された任意の結合剤でありうるもの
を含みうる。
(i)上述のものの何れかのようなコンジュゲート;及び
(ii)DABを含む水組成物
を含みうる。
(i)コンジュゲート、又はコンジュゲートを含む組成物;場合によっては
(ii)DABを含む水組成物;
(iii)レポーターの検出可能な標識に特異的に結合可能な結合剤
を含みうる。
他の実施態様では、キットオブパーツは、
(i)上記実施態様のアイテム又は全てのアイテムのいずれか
(ii)レポーター沈着物の可視化手段
を含みうる。
特に一実施態様では、本発明のキットオブパーツの結合剤は、抗体又はその誘導体でありうるか又はこれらを含みうる。一実施態様では、抗体結合剤は抗体のF(ab)’1断片でありうるか又はそれを含みうる。F(ab)’1は一実施態様ではマウス抗体のものであり得、他の実施態様では、ウサギ抗体のものであり得、他の実施態様では、ブタ抗体又はヤギ抗体でありうる。述べた抗体種は本発明の結合剤として使用するのに適した抗体の単なる非限定的な例である。一実施態様では、抗体は酵素の部分、又は上述の検出可能な標識の何れか、例えばハプテンで標識される。結合剤は西洋わさびペルオキシダーゼHRP又は大豆ペルオキシダーゼ(SP)の少なくとも一部分を含みうる。一実施態様では、結合剤はHRP又はSPの二つの部分を含む。
コンジュゲート沈着物の可視化のための手段は、沈着コンジュゲートに関連する特定の検出可能な標識の可視化に適している任意の手段である。コンジュゲート沈着物の可視化手段の実施態様は、標的の酵素標識化のための試薬、例えばHRP又はアルカリホスファターゼのような酵素、それらの基質及び基質溶液、コンジュゲートの標識に関連するシグナルの増強のための手段、例えばここに記載されたもの以外の増幅溶液を含む。
本発明の方法は非常に多様なアッセイ形式で実施されうる。そのようなアッセイ形式の幾つかの非限定的実施態様を以下に記載する。
細胞懸濁液の細胞に含まれる標的分子は、任意の適当なアッセイ形式、例えば、フローサイトメトリー(FC)、又はELISA、又は免疫組織化学(IHC)、又はインサイツハイブリダイゼーション(ISH)において上述の方法を用いて検出されうる。
別の実施態様では、生物学的試料は、体組織の切片でありうる。このような試料の細胞の標的分子又は構造は、典型的にはIHC又はISHを使用して検出される。
IHCアッセイ形式で標的の検出を実施する前に、予備検出手順が実施されることになる。これは、組織の切断及びトリミング、固定、脱水、パラフィン浸潤、薄片への切断、ガラススライド上へのマウント、ベーキング、脱パラフィン化、再水和、抗原回復、ブロック工程、一次抗体の適用、洗浄、二次抗体−酵素コンジュゲートの適用、及び洗浄の工程を含みうる。
固定剤は、細胞及び組織を再生可能な状態及び生存しているような様式で保存するために必要とされる。これを達成するため、組織塊、切片又はスメアを、固定剤液中に浸漬するか、又はスメアの場合は、乾燥させる。固定剤が細胞及び組織を安定化させ、それによりそれらを処理及び染色技術の苛酷さから保護する。
固定組織中での特異的認識を容易にするため、しばしば、被検物の前処理によって標的、すなわち、対象の生物学的マーカーを回復又はマスク除去し、大部分の標的の反応性を増大させることが必要である。この手順は、「抗原回復」、「標的回復」又は「エピトープ回復」、「標的アンマスキング」又は「抗原アンマスキング」と称される。抗原回復(抗原アンマスキング)の広範な概説は、Shi等 1997, J Histochem Cytochem, 45(3):327に見出すことができる。
加えて、信号雑音比は、異なった物理的方法、例えば、真空及び超音波の適用、又は試薬のインキュベーション前もしくはインキュベーション中での切片の凍結及び解凍によって増大されうる。
a) 第一生物学的マーカーに特異的な第一結合剤と、第一の検出可能な標識を含む第一レポーターを使用して工程(i)及び(ii)を実施する工程;
b) 第二生物学的マーカーに特異的な第二結合剤と、第二の検出可能な標識を含む第二レポーターを使用して工程(i)及び(ii)を実施する工程;
c) 沈着した第一レポーターを検出し、それによって第一生物学的マーカーを検出する工程;
d) 沈着した第二レポーターを検出し、それによって第二生物学的マーカーを検出する工程
を含みうる。
該方法は広範囲の温度内で、例えば+4℃から+60℃の間隔、例えば+10℃から+40℃、例えば室温で、実施されうる。
略号
MBHA 4−メチルベンズヒドリルアミン
NMP N−メチルピロリドン
HATU 2−(1h−7−アザベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート;メテンアンミニウム
DIPEA ジイソプロピルエチルアミン
DCM ジクロロメタン
TFA トリフルオロ酢酸
TFMSA トリフルオロメチルスルホン酸
Fer フェルラ酸
Flu フルオレセイン
Tyr チロシン
Lys リシン
Dex デキストラン
HPLC 高速液体クロマトグラフィー
equi. 当量
L30 1,10,16,25−テトラアザ−4,7,13,19,22,28−ヘキサオキサ−11,15,26,30−テトラオキソ−トリアコンタン
L60,L90,L120,L150−qが2、3、4又は5の式(L30)qのポリマー
CIZ 2−クロロZ=2クロロベンジルオキシカルボニル
FITC フルオレセインイソチオシアネート
HRP 西洋わさびペルオキシダーゼ
PNA−X 異なった置換基がPNA骨格(N−(2−アミノエチル)−グリシン)の中央の窒素にカップリングしたもの
A アデニン−9−酢酸,
C シトシン−1−酢酸,
D 2,6−ジアミノプリン−9−酢酸,
G グアニン−9−酢酸,
Gs 6−チオグアニン−9−酢酸,
P 2−ピリミジノン−1 酢酸,
T チミン−1−酢酸,
Us 2−チオウラシル−1−酢酸.
Dpr 2,3 ジアミノ−プロピオン酸,
Caf コーヒー酸,
Sin シナピン酸,
DNP ジニトロフェニル,
Acin 4−アミノ−ケイ皮酸,
Phe フェニルアラニン,
Tyr チロシン,
Trp トリプトファン,
Lys リジン,
Cys システイン,
βアラ βアラニン、N,N二酢酸
1.固相化学のみ。
2.固相と、ついで一つの溶液相工程。
3.固相と、ついで二つの溶液相工程。
4.固相と、ついで二つの溶液相工程。
5.固相と、ついで4つの溶液相工程。
6.アミノ及びβアラ無水物中間体間の溶液相カップリング。
7.一つの置換基とのデキストランコンジュゲート。
8.二つの置換基とのデキストランコンジュゲート。
D19185: Boc−(Lys(2−Cl−Z))3−L150−Lys(Fmoc)は固相で調製される。Fmoc基を除去した後、上述のようにして蛍光標識する。中間体NH2−((Lys(NH2))3−L150−Lys(Flu)は樹脂からの切断により生じる。それをジエチルエーテルで沈殿させ、TFAに溶解させ、沈殿後にNMPに溶解させ、DIPEAで塩基性にする。この溶液を、HATU及びDIPEAによって活性化されるNMP中の等容量の0.2Mのフェルラ酸と混合する。10分後、標識化が完了し、10%の濃度になるまで5分間、エチレンジアミンを添加して粗生成物を更に「スクラブ」する。ジエチルエーテルでの沈殿化後、生成物を更にTFAに溶解させ、ジエチルエーテルで3回沈殿させて、低分子量の細片を除去する。エチレンジアミンでの「スクラブ」の前において、質量分析は、二種の付加物(及びその組み合わせ)を示す:+(176)nは余分なフェルラ酸(他のフェルラ酸とフルオレセインへのフェノールエステル)及び+98(同様に未保護のフェノール基へのN,N’−テトラメチルウロニウム付加物)を示す。これらはエチレンジアミン処理によって完全に除去され、活性エステル及びフェルラ酸オリゴマーは同様に分解される。
D19185の合成法は図1に示す。
0328−018: Sin−Lys(Sin)−Lys(Sin)−L150−Lys(Flu)をD19185として調製した。固相合成にに従って、シナピン酸標識化を溶液中で実施した。
D20086: L30リンカーを使用して、D19112と同じようにして調製した。
D20120: L30リンカーと追加的にグルタミン酸残基を使用して、D19112と同じようにして調製した。Boc−Glu(O−ベンジル)を固相合成に使用してグルタミン酸残基を構築した。
に相当していた。
その中間生成物を、TFA:TFMSA:チオアニソール:m−クレゾール(6:2:1:1、1.5mLで1時間)を用いて樹脂から切断し、ジエチルエーテルで沈殿させ、TFAに再懸濁させ、ジエチルエーテルで沈殿させ、NMPに再懸濁させ、再びジエチルエーテルで沈殿させた。それを100μLのDIPEAで塩基性にし、0.9equiのHATU及び2equiのDIPEAで前もって活性化させた0.5mLの0.3Mフェルラ酸に直接溶解させた。10分後、粗生成物をジエチルエーテルで沈殿させ、900μLのNMP及び100μLのエチレンジアミンに再溶解させた。2分後、生成物をジエチルエーテルで沈殿させた。TFAに再懸濁させ、ジエチルエーテルで沈殿させ、水中の22%アセトニトリル(8.2mL)に溶解させ、RP−HPLC精製に供した。
収量8μmol、MS実験値3582(M+Na)、Fer−Lys(Fer)−Lys(Fer)−L150−Lysに対する理論値3558.784(DNP)
収量19μmol、MS実験値3749、Fer−Lys(Fer)−Lys(Fer)−L150−Lys(Flu)に対する理論値3750.998
D19037: D19037を固相合成法によりD19112と同様にして調製した後、フェルラ酸溶液で標識した。MS実験値3447
収量2μmol、MS実験値10666。
ヤギ抗マウス−Dex70−HRP(D18033/D18175)
13.7nmolのジビニルスルホンで活性化させた70kDAのMWのデキストランを、600μLのバッファー(100mMのNaCl、25mMのNaHCO3,pH9.5)中で、602nmolのHRPと3時間30℃で反応させた。ついで、105μLの水中41.1nmolのヤギ抗マウスF(ab)2抗体を添加し、反応を更に16時間継続した。30分間の70μLの0.165Mシステインの添加によって反応混合物をクエンチし、100mMのNaCl、10mMのHEPES,pH7.2中スーパーデックス200上で生成物を精製した。溶出した生成物は、ヤギ抗マウス(GaM)及びHRP(dex:GaM:HRP比=1:1:1)を含むデキストランコンジュゲートであった。
10nmolのジビニルスルホンで活性化させた70kDAのMWのデキストラン及び440nmolのHRPを、400μLのバッファー(100mMのNaCl、25mMのNaHCO3,pH9.5)中で3時間、30℃で反応させた。ついで、80μLの水中30nmolの抗マウスF(ab)2抗体を添加し、反応を更に40℃で90分間継続した。30分間の50μLの0.165Mシステインの添加によって反応混合物をクエンチし、100mMのNaCl、10mMのHEPES,pH7.2中スーパーデックス200上で生成物を精製した。溶出した生成物は、デキストランと抗FITC及びHRP(Dex/抗FITC/HRP比=1/2/9)のコンジュゲートであった。
10nmolのジビニルスルホンで活性化させた70kDAのMWのデキストラン;440nmolのHRP及び25nmolのF(ab)2抗FITCを、374μLのバッファー(100mMのNaCl、25mMのNaHCO3,pH9.5)中で16、30℃で反応させた。30分間の50μLの0.165Mシステインの添加によって反応混合物をクエンチし、100mMのNaCl、10mMのHEPES,pH7.2中スーパーデックス200上で生成物を精製した。溶出した生成物は、抗FITC及びHRPを含むデキストランコンジュゲートであった(比1:1:1)。
ポリクローナルウサギ抗FITC IgG抗体を37℃で4時間、ペプシンで消化させ、スーパーデックス200での精製を施してペプシン及びFc断片を除去した。
F(ab’)2断片を0.2Mのリン酸ナトリウム,pH6.0中の5 mMのEDTAに対して更に透析した。その溶液をアミコン・ウルトラスピンカラムで25g/Lのタンパク質濃度まで濃縮した。6.0mLの上記溶液(150mgのF(ab’)2)に、共に水中の487μLの50mg/mL DTT及び423μLの56mM 2−メルカプトエタノールを加えた。反応混合物を室温で穏やかに40分間攪拌し、直後に0.2Mのリン酸ナトリウム,pH6.0中の5mMのEDTAを用いてPD−10カラムで精製し、118mgのF(ab’)1を8.0mLのバッファー中に回収した。
250mgのHRP(Servac)を2.5mLの0.15m NaCL、0.05Mのリン酸カリウムpH8に溶解させ、同バッファーに対して透析した。透析後、酵素溶液を濃縮し、40mg/mLの濃度に調節した。3.21mLの128.6mg HRP溶液に860μLの15mg/mL SMCCを加え、室温で暗所で反応を30分進行させた。SMCC活性化HRP酵素を、0.15mのNaCL、0.05Mのリン酸カリウムpH8を用いてPD−10カラムで精製した。126.9mgを7.9mL中に回収した。
8.0mLのF(ab’)1に6.25mLのSMCC活性化HRP溶液を加え、全体積を、0.15mのNaCL、0.05Mのリン酸カリウム,pH8を用いて43.8mLに調節した。酵素と抗体断片間の反応を室温で暗所にて210分間実施した。ついで、室温で15分間、343μLの水中の25mg/mLのシステアミンを添加して反応をクエンチさせ、反応混合物を一晩冷やして保存し、精製を待った。試料を8mLまで濃縮し、4分割してスーパーデックス200カラムに適用し、150mMのNaCL、50mMのTris,pH7.6で溶出させた。生成物は最初のピークで流れ、未反応の抗体及び酵素のピークが続いた。100mgのコンジュゲートを数画分で単離した。280nm/403nmでのUV測定は0.8から1.2の抗体酵素比を示した。
ヤギ抗マウスF(ab’)1−HRPを、DTT及びメルカプトエタノールでのF(ab’)2の還元とSMCC活性化HRPへのカップリングによってウサギ抗FITC F(ab’)1−HRPとして調製した。ウサギ抗FITC F(ab’)1−HRPの場合のように、12 当量のSMCCをHRP活性化に使用し、1:1モル比のF(ab’)1及びHRPを使用した。
ヤギ抗マウスF(ab’)1−HRPを、DTT及びメルカプトエタノールでのF(ab’)2の還元とSMCC 活性化HRPへのカップリングによってウサギ抗FITC F(ab’)1−HRPとして調製した。ウサギ抗FITC F(ab’)1−HRPの場合のように、12当量のSMCCをHRP活性化に使用し、1:1モル比のF(ab’)1及びHRPを使用した。
IHCを、ガラススライドに負荷したホルマリン固定パラフィン包埋組織の試料で実施した。3−5ミクロンの組織切片を切り取り、べークし、使用まで4℃で保存した。ついで、キシレン(2×5分);99%エタノール(2×2分);70%エタノール(2×2分)及び最後に水によってパラフィンを除去した。スライドを標的回収溶液,pH9、(DAKO S2367)中に入れ、ついで電子レンジ(10分間煮沸)で加熱した。その後、スライドを冷却し、ついで洗浄バッファー(DAKO S3006)に移した。該手順の後に5分間の3%過酸化水素での内因性ペルオキシダーゼ活性のブロック工程を続け、ついで、再びスライドを洗浄バッファー中に移し、ついで、様々な条件下で染色した。染色手順とその結果は以下に詳細に記載する(実験1−10)。スライド間の変動を最小限にするため、各比較実験を、同日中に連続して切り取った切片を用いて実施した。特異的シグナル並びにバックグラウンドシグナルを0〜4のスコア段階を使用してスコア化したが、そこでは、0は全く染色なし、1−弱い染色、2−中程度の染色、3−強い染色、4−非常に強い染色を表す。本発明の染色手順の結果を評価するための比較「標準」染色として参照Envision Flex(DAKO K8010)染色を製造者の推奨に従って実施し、簡潔には、スライドを、
2.S0809(DAKO)に希釈した一次抗体(以下の抗体表を参照)と共に、20分;
3.Envision Flex HRP(DAKO DM807)と共に20分、又はEnvision Flexマウスリンカー(DAKO DM804)と共に15分(表1中「リンク」を付した抗体のみ)
4.DM803(DAKO)で1:50で希釈したEnvision Flex DAB色素原(DAKO DM807)と共に2×5分
連続してインキュベートした。
スライドを連続してインキュベートした:
1. 一次抗体80秒(「Link」抗体では300秒)
2. ヤギ抗マウスF(ab’)−HRP、20nM、80秒
3. コンジュゲートD19185 1200nM+5.6mM DAB、200秒
4. 抗FITC F(ab’)−HRP、100nM、140秒
5. 5.6mM DAB、200秒。
一次抗体を抗体表(上記)に示したように抗体希釈剤S0809(DAKO)で希釈した。
ヤギ抗マウスHRP及び抗FITC−HRPを、0.4%のカゼイン、2%のBSA、2%のPEG3000、0.1%のプロクリン、0.05%の4−アミノアンチピリン、0.1%のTween−20、100mMのNaCl、10mMのTris,pH8.0を含むバッファー(ABCPTバッファー)で希釈した。
工程3のコンジュゲートD19185(Fer4−L305−Flu1)及びDABと工程5のDABを、50mMのイミダゾール−HCl,pH7.4、5.6mMの過酸化水素、0.1%のTween−20の水溶液で希釈した。
工程間の洗浄は、室温でそれぞれ2分、S0809(工程3の後は、S0809又は10mMのCHES,pH9、0.1%のTween−20で)で実施した。
該方法を、12の異なったヒト組織:扁桃腺、肝臓、乳房癌、カルチノイド、結腸癌、メラノーマ、前立腺、小脳、腎臓、膵臓に対して表の15の異なった抗体を使用して試験した。対応する組織について実施された本発明の方法及びEnvision Flex法による組織染色の全体強度は同じであった;色相並びに高及び低発現標的の染色強度(高/低バランス)はまた同一であったが、本方法による染色はより鮮明(つまり、よりシャープで明瞭)であるように見えた。例えば結腸癌のような小さい細胞構造を含む幾つかの組織では、細胞質染色は本方法を使用した場合に僅かに鮮明さが少なかった。抗体希釈剤単独で、つまり抗体なしに処理したスライドは、染色がないことが証明され、つまり双方の方法による染色は特異的であった。
実験は、同じ希釈で、しかし有意に短いインキュベーション時間(つまり、15倍短い)同じ抗体を使用すると、本発明の染色方法では、Envision Flex染色と同じパターンと品質の染色を生じることを示している。
スライドを連続してインキュベートした:
1. 一次抗体、140秒(「Link」抗体では300秒)
2. ヤギ抗マウスF(ab’)−HRP(D19150)、30nM、200秒
3. コンジュゲートD19059 1200nM+2.8mM DAB、200秒
4. 抗FITC F(ab’)−HRP(D19142)、150nM、140秒
5. 2.8mM DAB、200秒。
一次抗体を上の抗体表に示したよりも10倍多い抗体希釈剤S0809(DAKO)(「Link」抗体に対しては5倍多い)で希釈した。
二次抗体、コンジュゲート及びDABのための溶媒、及び洗浄バッファーは、実験1におけるものとした。
該方法を、Envision Flexのインキュベーション時間よりも約9倍短いインキュベーション時間を使用して、同じ12の異なったヒト組織(上記)に対して同じ15の異なった抗体で試験した。染色パターンと品質の双方とも、実験1の染色と本質的に同一であった。工程1で抗体希釈剤単独で処理されたコントロールスライドにはバックグラウンドはなかった。
実験は、本発明に係る方法による特定の標的の検出感度は、Envision Flex法によるよりも少なくとも10倍高いことを示している(Envision Flex法は実験1におけるように、つまり如何なる変更もなしに実施した)。この実験は、工程2の沈着溶液及び工程5の染色溶液(5.6mMの代わりに2.8mM)中のDABの減少した濃度は染色結果に影響を及ぼさないことをまた示している。
スライドを連続してインキュベートした:
1. 抗体表に示したよりも45倍に希釈した抗サイトケラチン(クローンAE1/A3、Dakoカタログ番号M3515)、20分
2. ヤギ抗マウスF(ab’)−HRP(D19150)、30nM、5分
3. コンジュゲートD19185 1200nM+2.8mM DAB、200秒
4. 抗FITC F(ab’)−HRP(D19142)、150nM、140秒
5. 2.8mM DAB、200秒。
一次抗体を表(上記)に示したよりも45倍多い抗体希釈剤S0809(DAKO)(「Link」抗体に対しては5倍多い)で希釈した。二次抗体、コンジュゲート及びDABのための溶媒、及び洗浄バッファーは、実験1におけるものとした。
得られた染色は、(同じインキュベーション時間を使用し)45×高い濃度の抗サイトケラチンを用いたEnvision Flex染色と本質的に同一であった。工程1で(抗体なしで)S0809で処理されたコントロールスライドにはバックグラウンドはなかった。
実験は、(上記の表において推奨されているものと比較して)抗体の45倍の余分の希釈が染色強度に関して最適であり、つまり本方法の感度がEnvision Flex法の感度よりも少なくとも45倍高いことを示している。この実験は工程2の沈着溶液及び工程5の染色溶液(5.6mMの代わりに2.8mM)中のDABの減少した濃度は染色結果に影響を及ぼさないことをことをまた確認している。
スライドを連続してインキュベートした:
1. 推奨された(上記表参照)よりも1000倍多く希釈された抗サイトケラチン(クローンAE1/A3、Dakoカタログ番号M3515)、20分
2. ヤギ抗マウスF(ab’)−HRP(D19150)、30nM、5分
3. コンジュゲートD19185 1200nM+(1.4から2.8mMのDAB)、200秒
4. 抗FITC F(ab’)−HRP(D19142)、150nM、140秒
5. 2.8mM DAB、5分。
6. 2.8mM DAB、5分。
二次抗体、コンジュゲート及びDABのための溶媒、及び洗浄バッファーは、実験1におけるものとした。
工程3の沈着バッファー中の2.8mMのDABでの染色強度はEnvision Flex染色よりも更に弱かった。しかしながら、扁桃腺及び結腸上皮、乳癌細胞質、肝内胆汁管及び腎細胞において高度に発現された標的はこのプロトコルでは尚も中程度に(+2)染色された。2.8mMから1.4mMへの工程3の沈着溶液中のDAB濃度の減少は、染色強度を有意に増加させたが減少した鮮明さが犠牲になっている。高度の発現試料は強く染色され(+3)、殆どの中程度の発現試料は中程度に染色された(+2)。しかしながら、低発現組織は、弱く染色されるか全く染色されなかった(0から+1)。
工程3において2.8mMのDABでは、工程1における抗体なしでバッファーで処理されたコントロールスライドではバックグラウンドはなかったが、工程4における1.4mMのDABを伴う増加したレベルの増幅では、工程1においてS0809で処理されたコントロールスライドには幾らかのバックグラウンド染色が出現した。工程2における処理溶液からヤギ抗マウスHRPが省かれている更なるコントロール実験は、バックグラウンドが主としてこのコンジュゲートから付随したが、次の工程ではない、つまりDADの存在下でのコンジュゲートの沈着及び最終DAB染色ではないことを示している。
該実験は、本方法のシグナル増幅系が強いので、推奨されたよりも1000倍大熊で抗体試薬を希釈することが可能になるのに、染色の品質は尚も変わらないことを示している。
スライドを連続してインキュベートした:
1. 一次抗体(表に従って希釈)、80秒(「Link」抗体では300秒)
2. ヤギ抗マウスF(ab’)−HRP(D19150)、50nM、140秒
3. コンジュゲート D19059 1000nM+5.8mM DAB、80秒
4. 抗FITC F(ab’)−HRP(D19142)、150nM、140秒
5. 5.6mM DAB、80秒。
工程3のコンジュゲートD19185+DAB及び工程5のDABの双方を、50mMのイミダゾール−HCl,pH7.4、56mMのH2O2、0.1%のTween(つまり、H2O2 の濃度が実験1−4と比較して10倍高かった)の水溶液に希釈した。
該方法を12の異なったヒト組織に対して15の異なった抗体で実施した(実験1のように)。
染色の結果は、強度に関してはEnvision Flex染色と同様であったが、低発現標的は強さが僅かに少なかった。工程1における抗体なしで処理されたコントロールスライドにはバックグラウンドはなかった。色相は僅かに異なっていた:Envision FLEXの淡い褐色かた暗褐色ではなく、一般に灰色から黒であった。工程5における増加した時間(200秒)、減少したDAB(2.8mM)及び減少した過酸化水素(5.8mM)でのコントロール実験は典型的な褐色の色相が生じており、色相は主に最終(染色)工程によって決定されることを示している。
このプロトコルは非常に鮮明な染色を生じた:結腸及び結腸癌試料の小細胞構造は非常に区別でき明瞭に見られた;膜染色はシャープであった;強く染色された細胞質の領域は非常に明瞭な青色の核と対比してシャープに限られていた;中程度に染色された核は、Envision FLEXによって生成された均一な染色を含む見えない微細な核内詳細を示した。
工程3及び5における減少したインキュベーション時間での手作業のコントロール実験は、染色強度が、過酸化水素濃度が高い(56mM)場合にこれらの工程においてインキュベーション時間を30秒を越えて延長することにより増加しないことを示した。
スライドを連続してインキュベートした:
1. 一次抗体80秒(「Link」抗体では300秒)
2. ヤギ抗マウスF(ab’)−HRP(D19150)、50nM、140秒
3. コンジュゲートD19059 1000nM+5.8mM DAB、80秒
4. 抗FITC F(ab’)−HRP(D19142)、150nM、140秒
5. 2.8mM DAB、300秒。
コンジュゲート及びDAB(工程3)を、50mMのイミダゾール−HCl,pH7.4、56mMの過酸化水素、0.1%のTweenの水溶液に希釈した。工程5において、DABは50mMのイミダゾール−HCl,pH7.4、5.6mMの過酸化水素、0.1%のTweenに希釈した。
該方法を12の異なったヒト組織に対して15の異なった抗体で実施した(実験1のように)。
高発現標的の染色の結果はEnvision Flex染色(強度に関して)と同様であったが、低発現標的は有意により強く染色され、Envision FLEXで染色されなかった(+0)細胞構造は中程度に染色された:抗BCL−6は乳癌中の核の大きな割合を中程度に染色し、これに対してEnvision FLEXでのこれらの領域の染色は弱く;抗エストロゲンレセプターでの染色レベルは Envision FLEXと比較して乳癌において有意に増加し;結腸上皮細胞の抗癌胎児抗原染色はEnvision FLEX法の場合よりも強く堅牢であり;抗シナプトフィジンの弱い染色から中程度の染色が12全ての組織において観察される一方、Envision FLEXでは非常に弱い染色が観察されるか染色は観察されなかった。高発現構造は一般に強く染色されたが、過剰染色ではなく、シャープであった。一次抗体なしのコントロールスライドには染色が全くなかった。
該実験は、沈着溶液中の過酸化水素の高(56mM)濃度と染色溶液中の「通常」(5.6mM)の組合せが強力なシグナル増幅系をもたらし、広いダイナミックレンジで発現される抗原の非常に速い感度があり特異的な検出を可能にする。
スライドを連続してインキュベートした:
1. 一次抗体80秒(「Link」抗体では300秒)
2. ヤギ抗マウスF(ab’)−HRP(D19150)、20nM、80秒
3. コンジュゲートD19059 3.0μM+2.8mM DAB、200秒
4. 抗DNP F(ab’)−AP、100nM、5300秒
5. LPRリキッドパーマネントレッド(DAKO K3468)、300秒。
全ての工程の溶媒と洗浄バッファーは実験1におけるものとした。
該方法を12の異なったヒト組織に対して15の異なった抗体で実施した(実験1のように)。
染色の外観は、赤い色相であるが、DABでのEnvision Flex染色と同様であった。色相は強いピンク(低発現標的)から深紅(中発現標的)を経てワインレッドの赤(高発現標的)及び黒に近い赤(非常に高発現の標的)までの範囲であり、良好なダイナミックレンジを与えた。工程1における抗体なしのコントロールスライドではバックグラウンドはなかった。
該実験は、本発明の増幅系が広いダイナミックレンジで発現される抗原の検出ではLPRのような「感度の少ない」色素原の有益な使用をもたらすことを示している。
スライドを連続してインキュベートした:
1. 抗体S0809(DAKO)で1:1に希釈された一次抗体及びヤギ抗マウスF(ab’)−HRP(D19150)のプレミックス、30秒。
2. コンジュゲートD19185 10μM+DAB 280μM+56mM H2O2、30秒。
工程2の溶媒は、50mMのイミダゾール−HCl,pH7.4、5.6mMの過酸化水素、0.1%のTweenの水溶液であった。
該方法を12の異なったヒト組織に対して15の異なった抗体で実施した(実験1のように)。
このプロトコルは、抗原の特異的な明るい緑色の蛍光染色を生じ、本発明に係るコンジュゲートの沈着の機序自体が標的に関連するシグナルの強力で特異的な増幅をもたらす。
実験9は本発明の異なったコンジュゲート分子及び結合剤を評価する。
プロトコル:
全てのスライドに同じプロトコルを施した:
1. S0809で1:50に希釈された抗サイトケラチン(クローンAE1/A3、Dakoカタログ番号M3515)、1分;
2. ABCPTバッファー*)中のヤギ抗マウス結合剤(表3)、2分;
3. 50 mMのイミダゾール−HCL,pH7.4、58mMの過酸化水素、5.8mMのDAB中のコンジュゲート(表3)、1分
4. ABCPTバッファー*)中の抗FITC−HRP結合剤(表3),2分
5. 50mMのイミダゾール−HCL,pH7.4、58mMの過酸化水素中の5.8mMのDAB、1分
6. ヘマトキシリンでの対比染色、5分
*) ABCPTバッファー:0.1%の4−アミノアンチプリン、0.2%のプロクリン2%のBSA、0.2%のカゼイン、2%のPEG、0.1%のTween20、0.1MのNaCL、10mMのHEPES,pH7.2
ヤギ抗マウスHRPコンジュゲート: F(ab)1−HRP1コンジュゲートD19150(スライド1及び29)を、平均でコンジュゲート当たり1.4抗体及び10 HRP酵素(スライド2−6)を有する抗体−デキストラン−HRPコンジュゲートD18175と比較した。コンジュゲートD18175におけるHRP酵素の更に多くの数にかかわらず、スライド2の染色強度はスライド1及び29よりもほんの僅かにより強かった。スライド3はスライド1及び27と同じほど強く染色され、D18175の濃度が減少するスライド4−6は漸次的に強さが少なくなる染色になった。非特異的なバックグラウンド染色は虫垂平滑筋組織の試料のスライド2−5に存在していたが、スライド1及び29には観察されなかった。同様に、スライド1及び29に存在していない折り畳み組織の非特異的染色はスライド2−6に観察された。
これは、標的に結合する結合剤当たりのHRPの存在量は特異的シグナルの増幅を増加させず、むしろノイズシグナルを生じることを示している。
これは、沈着コンジュゲートに結合しない結合剤当たりのHRPの存在量は特異的シグナルの増幅を増加させず、むしろノイズシグナルを生じることを示している。
D17157(一つのフェルラ酸、一つのフルオレセイン、スライド12−14);
D19037(二つのフェルラ酸、一つのフルオレセイン、スライド15−17);
D19112(3つのフェルラ酸、一つのフルオレセイン、スライド18−20);
D19185(4つのフェルラ酸、一つのフルオレセイン、スライド1、29及び21−23);
D18126(6つのフェルラ酸、3つのフルオレセイン、スライド24−26);及び
D18090(101のフェルラ酸と72のフルオレセインを持つデキストランンジュゲート)。
実験10はコンジュゲート沈着媒体におけるDAB及びH2O2の濃度の影響を実証している。
プロトコル:
全てのスライドに同じプロトコルを施した:
1. S0809で1:200に希釈した抗サイトケラチン(クローンAE1/A3、Dakoカタログ番号M3515)、1分又は3分
2. ABCPTバッファー中のヤギ抗マウス(D19150)、2分
3. 50mMのイミダゾール−HCL,pH7.4中の1μMのコンジュゲートD19185で、変動するDAB及びH2O2(表4)、1分又は3分。
4. ABCPTバッファー中の150nMの抗FITC−HRP(D19142)、2分。
5. 50mMのイミダゾール−HCL,pH7.4、58mMの過酸化水素中、5.5 mMのDAB、1分。
6. ヘマトキシリンでの対比染色、5分。
染色の強度:染色の強度に関しては、コンジュゲート沈着溶液中の高いDAB濃度程、強さが少ない染色を生じるという明瞭な傾向が観察された、つまり5.5mMのDAB<2.8mMのDAB<1.4mMのDAB。しかしながら、増加した強度はまた染色の鮮明度の減少と相関していた。これは、結腸癌の小細胞構造において特に見られた。全ての組織にわたって対比染色された青い核は、低濃度でよりも高DAB濃度で処理されたスライドにおいてより区別でき明瞭であった。
高DAB及び高H2O2の存在下でインキュベートされたスライド(スライド1−3(1分)及びスライド6−8(3分))は同一に見え、またスライド11及び12は対応してスライド16及び17と同一に見えた。他方、スライド28−30(低DAB、低H2O2、3分)は、スライド23−25(低DAB、低H2O2、1分)よりも有意に強い染色であった。時間の増加によるこの亢進は肝臓及び膵臓中の低発現標的の場合に最も明白であった。
実験10及び11は、広い範囲の結合剤、コンジュゲート及び反応条件を使用することができることを証明している。「最適」であるものは意図された用途に依存するが、典型的なパターンを有する速く鮮明なIHC染色、つまりEnvision Flexシステムによって生じる典型的な染色(DAKO、K8010)に似た染色を得るためには、次の組み合わせが推奨されうる:
(1) より小さいF(ab)1−HRP1コンジュゲートは、工程2における一次抗体の認識(D19150)、並びに工程4におけるコンジュゲートの認識(D19142)の双方となると、より大きなデキストランコンジュゲートよりも良好な信号雑音比をもたらす。
(2) 領域内で近接して離間している2から4のペルオキシダーゼ基質を含む、つまり2つの隣接するペルオキシダーゼ基質間の距離が2.5nm未満で、例えば2つ並べたリジンのサイズに等しい第一領域と、単一の検出可能な部分を含む第二の領域をその分子内に有し、これら二つの領域が2.5nmを越える距離、例えば3−20nmだけ該コンジュゲート分子内で分離しているコンジュゲートが本発明の最も効率的なコンジュゲートであり、つまり、それらは標的部位の周りに正確に沈着され、つまり、結果的にバックグラウンド染色及び/又は鮮明度の減少を生じる非特異的な沈着が避けられる。そのようなコンジュゲートの例は、4つのフェルラ酸残基、L150リンカーによって分離した1つのフルオレセインを含むD19185(D19185の構造は図1(3)に示される)でありうる。
(3) 効率的なコンジュゲートD19112及びD19185と組み合わせて低バックグラウンド結合剤D19150及びD19142を使用すると、広い範囲の条件にわたって非常に強く速いバックグラウンドのない特異的なシグナル増幅をもたらしうる。
(4) 任意の伝統的なIHC染色に(どの点でも)取って代わるIHC染色は、工程3において高過酸化水素と高DABを使用することにより鮮明度の増加を容認してシグナル強度の強さをわざと犠牲にして調製され得、つまり該方法は、より短いプロトコル時間、より少ない結合剤の量、標的検出のより広いダイナミックレンジ、より良好な信号雑音比、高発現及び非常に低発現の双方の標的に対するより高いシグナル強度、及び染色の鮮明度の増加をもたらす。
(5)幾つかの特殊な用途に対しては、他のコンジュゲート又はインキュベーション条件(上記の(1)から(3)ではなく)を使用することができる。これは、大きなデキストランコンジュゲートD18090を使用して染色された実験10、スライド27及び28によって例証されうる:これらのスライドは高発現標的を含む組織であり、それらは過剰染色されている(+4)。これは、イエス/ノーの結果が所望される場合又はつまり一次抗体からの弱いバックグラウンドを抑制することが望ましい場合に使用できる。逆に、実験11のスライド28−30によって例証されるように、低DAB(1.4mM)、低過酸化水素(5.8mM及び15mM)(1.5mMの過酸化水素,スライド30の場合には延長された反応時間と組み合わせて)を有利に使用して、高発現標的を過剰染色することなく低発現標的の染色を向上させることができる。
インキュベーション後の加熱が(米国特許第5863748号;同第5688966号;同第5767287号;同第5731158号;同第5583001号、同第5196306、同第6372937号又は同第6593100号(上で検討した)及びBobrow MN等(1989) J Immunol Methods 125:279-285;及びBobrow MN等(1992) J Immunol Methods 150:45-49)に記載された)チラミドシグナル増幅を有意に改善することが報告されている(Volante M.等(2000) J Histochem Cytochem 48:1583-1585)。実験12は、本発明の方法に従ってのリキッドパーマネントレッドでの染色の結果についての沈着後加熱の条件を評価する。
1.マウス抗サイトケラチン(希釈1:50)
2.マウス抗CD20(希釈1:200)
3.マウス抗BCL6(希釈1:75)
1. 一次抗体、1分(1、2)又は5分(3)、
2. ヤギ抗マウスF(ab’)−HRP(D19150)、ABCPTバッファー中40nM、1分;
3. 室温でS3006(DAKO)で洗浄、2分
4. 沈着媒体:コンジュゲートD21030 100nM+0.8mM DAB+5.8mM H2O2、1分
5. 室温でS3006で2分洗浄、又はマイクロ波オーブンで5分煮沸
6. 抗FITC F(ab’)−AP、ABCPTバッファー中100nM、3分
7. 室温でS3006で洗浄、2分
8. LPR、5分。
1. 一次抗体、1分(1、2)又は5分(3)、
2. ヤギ抗マウスF(ab’)−HRP(D19150)、ABCPTバッファー中40nM、1分;
3. 室温でS3006(DAKO)で洗浄,5分
4. コンジュゲートD21030 1μM+2.8mM DAB+5.8mM H2O2、1分
5. 室温でS3006で5分洗浄、又はマイクロ波オーブンで5分煮沸
6. 抗FITC F(ab’)−AP、ABCPTバッファー中100nM、3分
7. 室温でS3006で洗浄、5分
8. LPR、5分。
3つの異なった抗体で試行された12全てのスライドは+0.5から+3の範囲で染色された。「高」対「低」DABプロトコルの結果、及び「高温」対「低温」プロトコルの結果の評価は、CD20の高発現マーカーに対して、顕著であるが、高DAB(+2.5)又は低DAB(+3)の存在下及び室温での洗浄、又は高DAB及び高温(+2)対低DAB及び高温(+1.5)下で染色強度に少しの差が明らかになった。同じであるが更により有意な差(高DAB+2、低DAB+3;室温洗浄)が、標的が低く発現されている試料中(特に肝臓及び腎臓試料中)のサイトケラチンに対して観察された。煮沸洗浄の効果はDAB濃度の効果よりも更により明らかに見えたが、それはサイトケラチンの低発現のこれらの組織の染色強度に特徴的な低下(+1.5(低DAB)から+0.5(高DAB))を生じさせているためである。
BCL6では高プロトコル及び低プロトコル間に殆ど差がないが、再び、煮沸洗浄を受けるスライドは室温で洗浄されたものよりも強度が顕著に少なかった。
Claims (21)
- (i)一又は複数の検出可能な標識、
(ii)少なくとも二つの物質を含み、その各々がペルオキシダーゼ活性を有する酵素の基質となりうるものである、ペルオキシダーゼ基質の部分
を含む水溶性コンジュゲートであって、
ここで、標識(i)とペルオキシダーゼ基質の部分(ii)が同じ化学物質ではなく、
ここで、標識(i)とペルオキシダーゼ基質の部分(ii)がリンカーを介して結合され、該リンカーが少なくとも30の連続的に連結された原子の少なくとも一つの線状鎖を含む化合物であり、上記線状鎖は少なくとも30の連続的に連結された原子の距離だけ分離した少なくとも二つの分岐点を含み;
ここで、標識(i)とペルオキシダーゼ基質の部分(ii)は少なくとも30の連続的に連結された原子によってコンジュゲート分子において分離され、
ここで、二つの隣接するペルオキシダーゼ基質部分は30未満の連続的に連結された原子によって互いから分離されているコンジュゲート(ただし、(His) 6 −GFP−EK−(Tyr) 5 を除く)。 - 部分が、フェルラ酸、ケイ皮酸、アミノケイ皮酸、コーヒー酸、又はシナピン酸の残基である請求項2に記載のコンジュゲート。
- ペルオキシダーゼ酵素の基質となりうる部分の少なくとも二つがチロシン残基である請求項1に記載のコンジュゲート。
- ペルオキシダーゼ酵素の基質となりうる複数の部分の数が2から4である請求項1、2、3又は4に記載のコンジュゲート。
- コンジュゲートがペルオキシダーゼ酵素の基質となりうる2から4の部分と一つの検出可能な標識を含み、上記部分と標識が一つの線状ポリマーを介して互いに連結され、上記部分と上記標識が、ポリマー鎖の少なくとも30の連続的に連結された原子によって相互に分離されたポリマーの二つの分岐点に結合された請求項1から6の何れかに記載のコンジュゲート。
- リンカーがデキストランポリマーと少なくとも一の第一及び少なくとも一の第二線状ポリマーを含み、上記少なくとも一の第一ポリマーがペルオキシダーゼ酵素基質となりうる2から4の部分にコンジュゲートされ、少なくとも一の上記第二ポリマーが一又は複数の検出可能な標識にコンジュゲートされ、上記少なくとも一の第一及び少なくとも一の第二ポリマーがデキストランにコンジュゲートされる請求項1から6の何れかに記載のコンジュゲート。
- 少なくとも一の第二ポリマーが二以上の標識を含み、上記二以上の標識の各々間の分子距離が少なくとも30の連続的に連結された原子である請求項8に記載のコンジュゲート。
- 検出可能な標識が蛍光物質又は特異的結合対のメンバーである請求項1から9の何れかに記載のコンジュゲート。
- ペルオキシダーゼ活性を持つ酵素が西洋わさびペルオキシダーゼである請求項1から10の何れかに記載のコンジュゲート。
- 請求項1から11の何れかに記載のコンジュゲートを含む組成物。
- 試料中のペルオキシダーゼ活性を有する標的の検出のためのキットオブパーツであって、請求項1〜11のいずれかに記載のコンジュゲートまたは請求項12に記載の組成物を含む、キットオブパーツ。
- 試料中のペルオキシダーゼ活性を有する標的の検出方法において、
III.
e)請求項1から11の何れかに記載のコンジュゲート
f)3,3’ジアミノベンジジン、及び
g)過酸化物化合物
を含む水溶液中で試料をインキュベートし、それによってコンジュゲートの沈殿物を形成し;
IV. 試料中の化合物の沈殿物を検出し、それによって試料中のペルオキシダーゼ活性を検出する
ことを含んでなる方法。 - 水溶液(i)が5mMを越える過酸化水素と0.25mMから6mMの3,3’ジアミノベンジジンを含有する請求項14に記載の方法。
- 3,3’ジアミノベンジジンの量が1.5mMを越える請求項14に記載の方法。
- ペルオキシダーゼ活性が西洋わさびペルオキシダーゼを含む試料にて検出される請求項14に記載の方法。
- 西洋わさびペルオキシダーゼが標的であり、又は標的に直接的に又は間接的に結合している請求項17に記載の方法。
- 標的がポリペプチド、核酸、炭水化物、脂質又はその誘導体、分子複合体、粒子、真核生物又は原核生物細胞又は微生物である請求項18に記載の方法。
- 試料が、生物学的試料、環境試料、又は化学的試料である請求項14から19の何れかに記載の方法。
- 試料が固体支持体に固定される請求項20に記載の方法。
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