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JP5006380B2 - Novel α-galactosidase - Google Patents

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JP5006380B2
JP5006380B2 JP2009500177A JP2009500177A JP5006380B2 JP 5006380 B2 JP5006380 B2 JP 5006380B2 JP 2009500177 A JP2009500177 A JP 2009500177A JP 2009500177 A JP2009500177 A JP 2009500177A JP 5006380 B2 JP5006380 B2 JP 5006380B2
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Description

本発明は、新規なα−ガラクトシダーゼ、および、それらを用いたラフィノースの製造方法に関する。   The present invention relates to a novel α-galactosidase and a method for producing raffinose using them.

近年、食生活・社会生活が多様化する中で、健康に対する意識向上から消費者の食品や食品素材等への関心が高まっている。その中で、ラフィノースは、腸内細菌叢を改善する等の機能を有することが認められ、飲食品や医薬品、香粧品等あるいは、その原料として注目を浴びている。さらに最近では、免疫腑活作用やアトピー性皮膚炎に対してもラフィノースが有用であることが明らかとなってきている。   In recent years, with the diversification of eating habits and social life, consumers' interest in foods, food ingredients, etc. is increasing due to the improvement of health awareness. Among them, raffinose is recognized to have functions such as improving the intestinal microflora, and is attracting attention as a food and drink, pharmaceuticals, cosmetics, and the like, or a raw material thereof. More recently, it has become clear that raffinose is also useful for immune stimulating action and atopic dermatitis.

現在、ラフィノースは、ビート糖製造の際の副産物として回収されているが、ビート中のラフィノース含有量は0.1%程度に過ぎず、生産量は、主生産物である砂糖の生産量にも関わってくるため、ラフィノース増産には限界がある。   Currently, raffinose is recovered as a by-product in the production of beet sugar, but the raffinose content in beet is only about 0.1%, and the production amount is also the production of sugar, which is the main product. Because of this, there is a limit to increasing raffinose production.

従って、このような有用特性をもつラフィノースを安価かつ安定的に市場へ供給するために、天然物からの抽出品のみでなく、安価な原料からの合成品が求められている。   Therefore, in order to supply raffinose having such useful properties to the market at a low cost and stably, not only an extract from a natural product but also a synthetic product from an inexpensive raw material is required.

これまでに試みられている、ラフィノースの合成方法としては、α−ガラクトシダーゼによる触媒作用を利用した方法が挙げられ、スクロースをガラクトース受容体とし、メリビオースをガラクトース供与体として用いてラフィノースを得る方法(例えば、特許文献1、非特許文献1、非特許文献2参照)が報告されている。ガラクトース供与体としてはこの他にもp−ニトロフェニル−α−D−ガラクトピラノシドを利用する方法(例えば、非特許文献3参照)、ガラクチノールを利用する方法(例えば、特許文献2参照)、ガラクトビオースを利用する方法(例えば、特許文献3参照)などが報告されている。   Examples of methods for synthesizing raffinose that have been attempted so far include methods utilizing the catalytic action of α-galactosidase. Methods for obtaining raffinose using sucrose as a galactose acceptor and melibiose as a galactose donor (for example, Patent Document 1, Non-Patent Document 1, and Non-Patent Document 2) have been reported. In addition to this, as a galactose donor, a method using p-nitrophenyl-α-D-galactopyranoside (for example, see Non-Patent Document 3), a method using galactinol (for example, see Patent Document 2), A method using galactobiose (see, for example, Patent Document 3) has been reported.

また、安価なスクロースとガラクトースを原料として利用可能な例もいくつか報告されている。例えば、Pycnoporus cinnabarinus 由来のα−ガラクトシダーゼを使用して、ラフィノースを得る方法(例えば、非特許文献4参照)や、Mortierella vinacea由来のα−ガラクトシダーゼを利用してラフィノースを合成する方法が開示されている(例えば、非特許文献5参照)。   In addition, some examples in which inexpensive sucrose and galactose can be used as raw materials have been reported. For example, a method for obtaining raffinose using α-galactosidase derived from Pycnoporus cinnabarinus (for example, see Non-Patent Document 4) and a method for synthesizing raffinose using α-galactosidase derived from Mortierella vinacea are disclosed. (For example, refer nonpatent literature 5).

特許第2688854号Japanese Patent No. 2688854 特開平10−84973JP 10-84973 A 特公平8−24592Japanese Patent Publication 8-24592 Agric. Biol. Chem., 52(9), 2305-2311, 1988Agric. Biol. Chem., 52 (9), 2305-2311, 1988 Biosci. Biotech. Biochem., 59(4), 619-623, 1995Biosci. Biotech. Biochem., 59 (4), 619-623, 1995 Phytochemistry, 18, 35-38, 1979Phytochemistry, 18, 35-38, 1979 Nippon Shokuhin Kogyo Gakkaishi, 38(8), 722-728, 1991Nippon Shokuhin Kogyo Gakkaishi, 38 (8), 722-728, 1991 Carbohydr. Res., 185, 139-146, 1989Carbohydr. Res., 185, 139-146, 1989

α−ガラクトシダーゼによるラフィノース生成効率が良いことから、ラフィノース合成原料として、メリビオース、p−ニトロフェニル−α−D−ガラクトピラノシド、ガラクチノールやガラクトビオースを利用する例が報告されているが、これらの手法を用いた場合、使用される原料が高価であり、工業的なラフィノースの製造は困難であった。   Since raffinose production efficiency by α-galactosidase is good, examples using melibiose, p-nitrophenyl-α-D-galactopyranoside, galactinol and galactobiose as raffinose synthesis raw materials have been reported. When this method was used, the raw materials used were expensive, and industrial production of raffinose was difficult.

一方、Pycnoporus cinnabarinus 由来のα−ガラクトシダーゼを使用してラフィノースを得る方法や、Mortierella vinacea由来のα−ガラクトシダーゼを利用してラフィノースを合成する方法は、安価な原料であるスクロースとガラクトースを利用可能であるということから、工業性を考慮した場合非常に有利な方法である。しかしながら、これらのα−ガラクトシダーゼを利用した場合、生成物中に目的とするラフィノース以外の夾雑三糖が生成してしまうことから、最終製品からの夾雑三糖の分離が必要となり、さらに原料の浪費といった問題が生じてしまう。Pycnoporus cinnabarinus 由来のα−ガラクトシダーゼをラフィノース合成反応に用いた場合、生成オリゴ糖中のラフィノース含有率は40%、Mortierella vinacea由来のα−ガラクトシダーゼをラフィノース合成反応に用いた場合、生成オリゴ糖中のラフィノース含有率は60%と低く、従来の技術では酵素法によりラフィノースを選択的に製造することは不可能であった。   On the other hand, the method of obtaining raffinose using α-galactosidase derived from Pycnoporus cinnabarinus and the method of synthesizing raffinose using α-galactosidase derived from Mortierella vinacea can use sucrose and galactose which are inexpensive raw materials. Therefore, it is a very advantageous method in consideration of industrial properties. However, when these α-galactosidases are used, contaminated trisaccharides other than the target raffinose are produced in the product. Therefore, it is necessary to separate contaminated trisaccharides from the final product, and further waste of raw materials Such a problem will occur. When α-galactosidase derived from Pycnoporus cinnabarinus is used for the raffinose synthesis reaction, the raffinose content in the resulting oligosaccharide is 40%, and when α-galactosidase derived from Mortierella vinacea is used for the raffinose synthesis reaction, raffinose in the generated oligosaccharide The content is as low as 60%, and it has been impossible to selectively produce raffinose by an enzymatic method using conventional techniques.

本発明は、こうした状況のもとに、安価な原料を用い、選択的にラフィノースを合成することが可能な新規α−ガラクトシダーゼを提供するものであり、本酵素を用いた革新的なラフィノース製造方法を提供することを目的とするものである。   The present invention provides a novel α-galactosidase capable of selectively synthesizing raffinose using an inexpensive raw material under such circumstances, and an innovative method for producing raffinose using this enzyme Is intended to provide.

これらの課題を解決するため鋭意検討を重ねた結果、本発明者らは、ラフィノースを選択的に合成可能な新規酵素を発見し、目的ラフィノース以外の夾雑オリゴ糖の生成を抑制したラフィノースの製造方法を見出し、本発明を完成するに至った。   As a result of intensive studies to solve these problems, the present inventors have discovered a novel enzyme capable of selectively synthesizing raffinose, and a method for producing raffinose that suppresses the production of contaminating oligosaccharides other than the target raffinose. As a result, the present invention has been completed.

すなわち、本発明は以下の[1]〜[20]に示す新規なα−ガラクトシダーゼ及びラフィノースの製造方法などに関するものである。
[1] 下記の特性を有するα−ガラクトシダーゼ。
(1)作用:本酵素は、スクロースとガラクトースを原料とした脱水縮合反応において、生成オリゴ糖中のラフィノース含有率が0.5%以上のとき、ラフィノース合成選択率が65%以上という性質を有する。
(2)至適pH範囲:3.5〜5.0
(3)安定pH範囲:3.5〜10.0
(4)分子量:約80,000
[2] Bacillus coagulansに属する微生物に由来する、[1]に記載のα−ガラクトシダーゼ。
[3] Bacillus coagulansがBacillus coagulans AKC003株、AKC004株(FERM−ABP10948)、AKC005株、AKC006株のいずれかである[2]に記載のα−ガラクトシダーゼ。
[4] Bacillus coagulans AKC003株、AKC004株(FERM−ABP10948)、AKC005株、AKC006株のいずれかに属するBacillus coagulansおよびその変異体。
That is, the present invention relates to a novel α-galactosidase and raffinose production method shown in the following [1] to [20].
[1] α-Galactosidase having the following characteristics.
(1) Action: This enzyme has a property that the raffinose synthesis selectivity is 65% or more when the raffinose content in the resulting oligosaccharide is 0.5% or more in the dehydration condensation reaction using sucrose and galactose as raw materials. .
(2) Optimal pH range: 3.5-5.0
(3) Stable pH range: 3.5 to 10.0
(4) Molecular weight: about 80,000
[2] The α-galactosidase according to [1], which is derived from a microorganism belonging to Bacillus coagulans.
[3] The α-galactosidase according to [2], wherein Bacillus coagulans is any of Bacillus coagulans AKC003 strain, AKC004 strain (FERM-ABP10948), AKC005 strain, and AK006 strain.
[4] Bacillus coagulans belonging to any of Bacillus coagulans AKC003 strain, AKC004 strain (FERM-ABP10948), AKC005 strain, and AKC006 strain and mutants thereof.

[5] 下記(a)、(b)又は(c)の何れかのアミノ酸配列からなるα−ガラクトシダーゼ。
(a)配列番号2で表わされるアミノ酸配列;
(b)配列番号2で表されるアミノ酸配列において、1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、及び/又は付加されたアミノ酸配列であって、α−ガラクトシダーゼ活性を有するアミノ酸配:
(c)配列番号2に表されるアミノ酸配列に対して60%以上の相同性を有するアミノ酸配列であって、α−ガラクトシダーゼ活性を有するアミノ酸配列:
[6] 下記(a)、(b)又は(c)の何れかのアミノ酸配列からなるα−ガラクトシダーゼをコードするα−ガラクトシダーゼ遺伝子。
(a)配列番号2で表わされるアミノ酸配列;
(b)配列番号2で表されるアミノ酸配列において、1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、及び/又は付加されたアミノ酸配列であって、α−ガラクトシダーゼ活性を有するアミノ酸配:
(c)配列番号2に表されるアミノ酸配列に対して60%以上の相同性を有するアミノ酸配列であって、α−ガラクトシダーゼ活性を有するアミノ酸配列:
[7] 以下の(a)または(b)の塩基配列からなるα−ガラクトシダーゼ遺伝子。
(a)配列番号1で表される塩基配列;
(b)配列番号1で表される塩基配列において、1又は数個の塩基が欠失、置換、及び/又は付加された塩基配列であって、かつ、α−ガラクトシダーゼ活性を有するタンパク質をコードする塩基配列:
[5] α-galactosidase comprising the amino acid sequence of any one of (a), (b) and (c) below.
(A) the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2;
(B) an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted, and / or added in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 and having an α-galactosidase activity:
(C) an amino acid sequence having 60% or more homology with the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 and having an α-galactosidase activity:
[6] An α-galactosidase gene encoding α-galactosidase having the amino acid sequence of any one of (a), (b) and (c) below.
(A) the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2;
(B) an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted, and / or added in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 and having an α-galactosidase activity:
(C) an amino acid sequence having 60% or more homology with the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 and having an α-galactosidase activity:
[7] An α-galactosidase gene comprising the following base sequence (a) or (b):
(A) the base sequence represented by SEQ ID NO: 1;
(B) The base sequence represented by SEQ ID NO: 1 is a base sequence in which one or several bases are deleted, substituted, and / or added, and encodes a protein having α-galactosidase activity. Base sequence:

[8] [6]又は[7]に記載のα−ガラクトシダーゼ遺伝子を含む組換えベクター。
[9] [6]又は[7]に記載のα−ガラクトシダーゼ遺伝子又は[8]に記載の組み換えベクターを導入した形質転換体。
[10] [9]に記載の形質転換体を培養して得られるα−ガラクトシダーゼ。
[11] [1]〜[3]、[5]、又は[10]のいずれか一項に記載のα−ガラクトシダーゼを含む酵素組成物。
[12] α−グルコシダーゼ、β−グルコシダーゼ、β−ガラクトシダーゼ、セルラーゼ、キシラナーゼ、プロテアーゼ、ガラクタナーゼ、アラビナナーゼ、マンナナーゼ、ラムノガラクツロナーゼ、ポリガラクツロナーゼ、ペクチンメチルエステラーゼ、ペクチンリアーゼ、及びポリガラクツロン酸リアーゼから選択される少なくとも1種以上の成分をさらに含有する、[11]に記載の酵素組成物。
[13] [11]又は[12]のいずれかに記載の酵素組成物を含むラフィノース合成試薬。
[14] [1]〜[3]、[5]、又は[10]のいずれか一項に記載のα−ガラクトシダーゼ、[11]又は[12]に記載の酵素組成物、若しくは[13]に記載のラフィノース合成試薬を用いることを特徴とするラフィノースの製造方法。
[8] A recombinant vector comprising the α-galactosidase gene according to [6] or [7].
[9] A transformant introduced with the α-galactosidase gene according to [6] or [7] or the recombinant vector according to [8].
[10] α-galactosidase obtained by culturing the transformant according to [9].
[11] An enzyme composition comprising α-galactosidase according to any one of [1] to [3], [5], or [10].
[12] α-glucosidase, β-glucosidase, β-galactosidase, cellulase, xylanase, protease, galactanase, arabinanase, mannanase, rhamnogalacturonase, polygalacturonase, pectin methylesterase, pectin lyase, and polygalacturonic acid The enzyme composition according to [11], further comprising at least one component selected from lyase.
[13] A raffinose synthesis reagent comprising the enzyme composition according to any one of [11] and [12].
[14] The α-galactosidase according to any one of [1] to [3], [5], or [10], the enzyme composition according to [11] or [12], or [13] A method for producing raffinose, comprising using the described raffinose synthesis reagent.

[15] Bacillus coagulansに属する微生物を培養して得た微生物触媒を利用することを特徴とするラフィノースの製造方法。
[16] Bacillus coagulans AKC003株、AKC004株(FERM−ABP10948)、AKC005株、AKC006株のいずれかに属するBacillus coagulans及び/又はその変異体を培養して得た微生物触媒を利用することを特徴とするラフィノースの製造方法。
[17] [9]に記載の形質転換体を培養して得た微生物触媒を利用することを特徴とするラフィノースの製造方法。
[15] A method for producing raffinose, comprising using a microbial catalyst obtained by culturing a microorganism belonging to Bacillus coagulans.
[16] A microbial catalyst obtained by culturing Bacillus coagulans and / or a mutant thereof belonging to any one of Bacillus coagulans AKC003 strain, AKC004 strain (FERM-ABP10948), AKC005 strain, and AK006 strain is used. A method for producing raffinose.
[17] A method for producing raffinose, comprising using a microbial catalyst obtained by culturing the transformant according to [9].

[18] 生成オリゴ糖中のラフィノース含有率が65%以上である、[14]〜[17]のいずれかに記載のラフィノースの製造方法。
[19] 原料としてスクロース及びガラクト−スを用いる、[14]〜[18]のいずれかに記載のラフィノースの製造方法。
[20] 原料中のスクロース濃度が30%(w/v)〜90%(w/v)であり、原料中のガラクトース濃度が2%(w/v)〜45%(w/v)である、[19]に記載のラフィノースの製造方法。
[18] The method for producing raffinose according to any one of [14] to [17], wherein the raffinose content in the generated oligosaccharide is 65% or more.
[19] The method for producing raffinose according to any one of [14] to [18], wherein sucrose and galactose are used as raw materials.
[20] The sucrose concentration in the raw material is 30% (w / v) to 90% (w / v), and the galactose concentration in the raw material is 2% (w / v) to 45% (w / v). [19] The method for producing raffinose according to [19].

本発明を用いることにより、ラフィノースを選択的に製造することが可能である。   By using the present invention, raffinose can be selectively produced.

以下、本発明について具体的に説明する。
本発明のα−ガラクトシダーゼは、Bacillus coagulansに属する微生物に由来するものであり、当該微生物としては、Bacillus coagulansに属する微生物であればどのようなものを用いてもよく、ラフィノースを選択的に合成可能なα−ガラクトシダーゼを発現する任意の微生物を用いることができる。好ましくは、Bacillus coagulans AKC-003株, AKC-004株, AKC-005株, AKC-006株が挙げられる。また、本発明における微生物は、Bacillus coagulansに属する微生物を親株として得られる変異株であってもかまわない。Bacillus coagulans AKC-003株, AKC-004株, AKC-005株, AKC-006株はそれぞれ、2006年(平成18年)11月14日に独立行政法人産業技術総合研究所特許生物寄託センター(日本国茨城県つくば市東一丁目1番地1 中央第6)に寄託されている。受託番号は以下の通りである。なお、AKC-004株は、2008年(平成20年)1月30日に、受領番号FERM−ABP10948、及び受託番号FERM−BP10948として国際寄託に移管されている。
AKC-003株(FERM P−21091)
AKC-004株(FERM P−21092;FERM−ABP10948;FERM−BP10948)
AKC-005株(FERM P−21093)
AKC-006株(FERM P−21094)
Hereinafter, the present invention will be specifically described.
The α-galactosidase of the present invention is derived from a microorganism belonging to Bacillus coagulans, and any microorganism belonging to Bacillus coagulans may be used as the microorganism, and raffinose can be selectively synthesized. Any microorganism that expresses any α-galactosidase can be used. Preferably, Bacillus coagulans AKC-003 strain, AKC-004 strain, AKC-005 strain, and AKC-006 strain are mentioned. In addition, the microorganism in the present invention may be a mutant obtained by using a microorganism belonging to Bacillus coagulans as a parent strain. The Bacillus coagulans AKC-003, AKC-004, AKC-005, and AKC-006 strains were registered on November 14, 2006 (National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, Japan) It is deposited in 1st, 1-chome, Higashi 1-chome, Tsukuba City, Ibaraki Prefecture. The accession numbers are as follows. The AKC-004 strain was transferred to the international deposit on January 30, 2008 as receipt number FERM-ABP10948 and deposit number FERM-BP10948.
AKC-003 strain (FERM P-21091)
AKC-004 strain (FERM P-21092; FERM-ABP10948; FERM-BP10948)
AKC-005 strain (FERM P-21093)
AKC-006 strain (FERM P-21094)

本発明のα−ガラクトシダーゼは、下記の特性を有する。
(1)作用:本酵素は、スクロースとガラクトースを原料とした脱水縮合反応において、生成オリゴ糖中のラフィノース含有率が0.5%以上のとき、ラフィノース合成選択率が65%以上という性質を有する。
(2)至適pH範囲:3.5〜5.0
(3)安定pH範囲:3.5〜10.0
(4)分子量:約80,000
The α-galactosidase of the present invention has the following characteristics.
(1) Action: This enzyme has a property that the raffinose synthesis selectivity is 65% or more when the raffinose content in the resulting oligosaccharide is 0.5% or more in the dehydration condensation reaction using sucrose and galactose as raw materials. .
(2) Optimal pH range: 3.5-5.0
(3) Stable pH range: 3.5 to 10.0
(4) Molecular weight: about 80,000

本発明の酵素の具体例としては、基質特異性及び金属イオンの影響として、以下の性質を有するものが挙げられる。
基質特異性:p−ニトロフェニル−α−D−ガラクトピラノシドを基質とした場合、分解活性は最も高く、次いでメリビオース、次いでラフィノースの順である。一方、p−ニトロフェニル−β−D−ガラクトピラノシド、ラクトース、スクロースは分解しない。
金属イオンの影響:カリウム、カルシウム、マグネシウム、クロム、マンガン、コバルト、鉄(II)、鉄(III)イオンをそれぞれ添加した場合、活性の低下は見られない。一方、ニッケル、亜鉛イオンをそれぞれ添加した場合、活性の低下が見られ、銅イオンを添加した場合に最も活性が低下する。
さらに本発明の酵素の具体例としては、下記の特性を有するものでもよい。
(5)(正反応の)至適温度範囲:35〜50℃
(6)安定温度範囲:45℃まで安定である。
Specific examples of the enzyme of the present invention include those having the following properties due to substrate specificity and influence of metal ions.
Substrate specificity: When p-nitrophenyl-α-D-galactopyranoside is used as a substrate, the degradation activity is the highest, followed by melibiose and then raffinose. On the other hand, p-nitrophenyl-β-D-galactopyranoside, lactose and sucrose are not decomposed.
Effect of metal ions: When potassium, calcium, magnesium, chromium, manganese, cobalt, iron (II), and iron (III) ions are added, no decrease in activity is observed. On the other hand, when nickel and zinc ions are added, the activity decreases, and when copper ions are added, the activity decreases most.
Further, specific examples of the enzyme of the present invention may have the following characteristics.
(5) Optimal temperature range (for positive reaction): 35-50 ° C
(6) Stable temperature range: Stable up to 45 ° C.

本発明に用いる微生物の培養方法としては、通常の通気攪拌培養あるいは固体培養が用いられ、一般的に行われている微生物の培養方法が適応できる。培地としては、当該微生物が良好に生育し且つ、微生物中のα−ガラクトシダーゼを順調に生産するために必要な炭素源、窒素源、無機塩、必要な栄養源等を含有する合成培地または天然培地が挙げられる。例えば、炭素源としては、グルコース、グリセロール、スクロース、ガラクトース、ラクトース、メリビオース、ラフィノース、スタキオース、セロビオース、エルロース、有機酸、澱粉、オリーブ油、大豆油等を用いることができる。窒素源としては、例えば、硫安、硝安、尿素、アミノ酸、アミン類、アンモニア、各種無機酸や有機酸のアンモニウム塩、その他含窒素化合物、ペプトン、トリプトン、ポリペプトン、肉エキス、酵母エキス、綿実粕、コーンスティープリカー、および大豆粕等があげられる。また、無機塩類としては、第一リン酸カリウム、第二リン酸カリウム、リン酸マグネシウム、硫酸マグネシウム、塩化ナトリウム、硫酸マンガン、硫酸銅、硫酸鉄、炭酸カルシウム等が用いられる。微生物の生育性の点から、培養温度は25〜80℃が好ましく、より好ましくは40〜65℃、さらに好ましくは40〜55℃である。また、培地のpHは広範囲で選択可能であり、微生物の生育性の点からpH3.0〜9.0が好ましく、より好ましくはpH3.5〜8.5、さらに好ましくはpH4.0〜8.0である。   As a method for culturing microorganisms used in the present invention, ordinary aeration and agitation cultures or solid cultures are used, and generally used microorganism cultivation methods can be applied. As the medium, a synthetic medium or a natural medium containing the carbon source, nitrogen source, inorganic salt, necessary nutrient source, etc. necessary for the microorganism to grow well and to smoothly produce α-galactosidase in the microorganism. Is mentioned. For example, as a carbon source, glucose, glycerol, sucrose, galactose, lactose, melibiose, raffinose, stachyose, cellobiose, erulose, organic acid, starch, olive oil, soybean oil and the like can be used. Examples of nitrogen sources include ammonium sulfate, ammonium nitrate, urea, amino acids, amines, ammonia, ammonium salts of various inorganic and organic acids, other nitrogen-containing compounds, peptone, tryptone, polypeptone, meat extract, yeast extract, cottonseed meal , Corn steep liquor, and soybean meal. Moreover, as inorganic salts, primary potassium phosphate, dibasic potassium phosphate, magnesium phosphate, magnesium sulfate, sodium chloride, manganese sulfate, copper sulfate, iron sulfate, calcium carbonate and the like are used. From the viewpoint of the growth of microorganisms, the culture temperature is preferably 25 to 80 ° C, more preferably 40 to 65 ° C, still more preferably 40 to 55 ° C. The pH of the medium can be selected in a wide range, and is preferably pH 3.0 to 9.0, more preferably pH 3.5 to 8.5, and still more preferably pH 4.0 to 8. from the viewpoint of the growth of microorganisms. 0.

本発明のα−ガラクトシダーゼの分離・精製は、例えば以下のようにして実施することができる。   Separation and purification of the α-galactosidase of the present invention can be carried out, for example, as follows.

Bacillus coagulans AKC−004株を上記の培地で培養し、得られた培養液を、遠心分離、濾過等の公知の手段により菌体と濾液とに分離する。 Bacillus coagulans AKC-004 strain is cultured in the above medium, and the obtained culture solution is separated into cells and filtrate by known means such as centrifugation and filtration.

こうして得られた菌体にはα−ガラクトシダーゼが含まれており、リゾチームや超音波破砕機、フレンチプレス等を用いて菌体の破砕を行うことでα−ガラクトシダーゼの粗抽出液を得る。培養条件等により、α−ガラクトシダーゼの活性が培養上清に含まれる場合、培養上清をそのまま、または濃縮等の操作を加え、α−ガラクトシダーゼの粗抽出液として次の精製に用いることもできる。   The bacterial cells thus obtained contain α-galactosidase, and a crude extract of α-galactosidase is obtained by crushing the bacterial cells using lysozyme, an ultrasonic crusher, a French press or the like. When the activity of α-galactosidase is contained in the culture supernatant depending on the culture conditions or the like, the culture supernatant can be used as it is or after being subjected to an operation such as concentration as a crude extract of α-galactosidase for the next purification.

上記のようにして得られる粗抽出液を、通常のタンパクの精製法、例えば、イオン交換クロマトグラフィー、疎水性クロマトグラフィー、ゲル濾過クロマトグラフィー、ハイドロキシアパタイトクロマトグラフィー、塩析等を組み合わせて分画することによって、α−ガラクトシダーゼを精製することができる。   The crude extract obtained as described above is fractionated by combining ordinary protein purification methods such as ion exchange chromatography, hydrophobic chromatography, gel filtration chromatography, hydroxyapatite chromatography, and salting out. Thus, α-galactosidase can be purified.

上記の操作の順は特に問わず、各操作は1回、または2回以上行ってもよい。また、それぞれのカラムに試料を通液する前に、透析等によって試料液を適当な緩衝液に交換しておくことが望ましい。さらにそれぞれの段階で試料液を濃縮しても良い。   The order of the above operations is not particularly limited, and each operation may be performed once or twice or more. In addition, it is desirable to exchange the sample solution with an appropriate buffer by dialysis or the like before passing the sample through each column. Further, the sample solution may be concentrated at each stage.

精製の各段階においては、分画された各フラクション中に含まれるα−ガラクトシダーゼ活性を測定し、活性の高いフラクションを集めて次の段階に供試することが望ましい。   In each step of purification, it is desirable to measure α-galactosidase activity contained in each fractionated fraction, collect fractions with high activity, and use them in the next step.

α−ガラクトシダーゼ活性を測定する方法としては、例えば、6mMのp−ニトロフェニル−α−D−ガラクトピラノシドを含むpH5.0の100mM酢酸ナトリウム緩衝液450μLに酵素液150μLを混合し、40℃で5〜30分間程度反応させた後、1Mの炭酸ナトリウム水溶液1mLに添加して酵素を失活させ、反応を停止する。得られた溶液の着色度を波長420nmの吸収を測定し、各濃度のp−ニトロフェノールで作製した検量線を用いて濃度を算出する。また、酵素活性の単位は上記条件下で1分間に1μmolのp−ニトロフェノールを遊離させる酵素量を1Uとして表示する。   As a method for measuring α-galactosidase activity, for example, 150 μL of an enzyme solution is mixed with 450 μL of 100 mM sodium acetate buffer having a pH of 5.0 containing 6 mM p-nitrophenyl-α-D-galactopyranoside, and 40 ° C. Then, the reaction is stopped by adding to 1 mL of 1 M aqueous sodium carbonate solution to deactivate the enzyme. The degree of coloring of the obtained solution is measured for absorption at a wavelength of 420 nm, and the concentration is calculated using a calibration curve prepared with p-nitrophenol at each concentration. The unit of enzyme activity is expressed as 1 U of the amount of enzyme that liberates 1 μmol of p-nitrophenol per minute under the above conditions.

精製されたα−ガラクトシダーゼの精製度の確認や分子量の測定は、電気泳動やゲル濾過クロマトグラフィー等によって行うことができる。また、酵素学的性質は、反応温度あるいは反応pHを変化させて酵素活性を測定し、あるいは種々の酵素阻害剤や金属イオン等を反応液に添加し、残存活性を測定することによって検討すればよい。さらにα−ガラクトシダーゼを種々のpH条件下又は温度条件下に一定時間さらした後に酵素活性を測定することにより、安定pH範囲及び安定温度範囲を調べることができる。また、基質濃度を変化させて反応を行うことで、各基質に対するα−ガラクトシダーゼのミカエリス定数 (Km)、最大速度(Vmax)を求めることもできる。Confirmation of the degree of purification and molecular weight measurement of the purified α-galactosidase can be performed by electrophoresis, gel filtration chromatography, or the like. Enzymatic properties can be examined by measuring the enzyme activity by changing the reaction temperature or pH, or by adding various enzyme inhibitors or metal ions to the reaction solution and measuring the residual activity. Good. Furthermore, the stable pH range and the stable temperature range can be examined by measuring the enzyme activity after exposing α-galactosidase to various pH conditions or temperature conditions for a certain period of time. Further, by carrying out the reaction while changing the substrate concentration, the Michaelis constant (K m ) and the maximum velocity (V max ) of α-galactosidase for each substrate can be obtained.

本発明のα−ガラクトシダーゼ遺伝子の取得は、例えば以下のように行うことができる。
Bacillus coagulans AKC−004株を上記の培地で培養し、得られた培養液を、遠心分離、濾過等の公知の手段により菌体と濾液とに分離する。上記のようにして得られた菌体についてリゾチームや超音波破砕機、フレンチプレス等を用いた菌体の破砕を行い、染色体DNAを単離する。上記のようにして得られた染色体DNAを種々の制限酵素で消化し、DNA断片を得る。上記のようにして得られた染色体DNA断片を用いて、ショットガンクローニングやインバースPCR法等を利用した公知の手段によりα−ガラクトシダーゼ遺伝子の全長、またはその一部を含むDNA断片を取得する。ここで得られたα−ガラクトシダーゼ遺伝子を含むDNA断片の塩基配列をDNAシークエンサー等を利用した公知の方法で解析し、その塩基配列を明らかにする。また、α−ガラクトシダーゼ遺伝子の部分的な塩基配列のみが明らかになった場合、その塩基配列を基に再度α−ガラクトシダーゼ遺伝子を含むDNA断片を取得することもできる。また、この操作を繰り返すことで、α−ガラクトシダーゼ遺伝子全長の塩基配列を明らかにすることも可能である。上記のようにして解読したα−ガラクトシダーゼ遺伝子の塩基配列を基に、PCR法や制限酵素を用いた公知の方法によって、α−ガラクトシダーゼ遺伝子の全長を含むDNA断片を得ることができる。上記のようにして解読したα−ガラクトシダーゼ遺伝子の塩基配列から、α−ガラクトシダーゼのアミノ酸配列を決定することができる。
The α-galactosidase gene of the present invention can be obtained, for example, as follows.
Bacillus coagulans AKC-004 strain is cultured in the above medium, and the obtained culture solution is separated into cells and filtrate by known means such as centrifugation and filtration. The microbial cells obtained as described above are crushed using lysozyme, an ultrasonic crusher, a French press or the like, and chromosomal DNA is isolated. The chromosomal DNA obtained as described above is digested with various restriction enzymes to obtain DNA fragments. Using the chromosomal DNA fragment obtained as described above, a DNA fragment containing the full-length α-galactosidase gene or a part thereof is obtained by known means using shotgun cloning, inverse PCR, or the like. The base sequence of the DNA fragment containing the α-galactosidase gene obtained here is analyzed by a known method using a DNA sequencer or the like to clarify the base sequence. Further, when only a partial base sequence of the α-galactosidase gene is clarified, a DNA fragment containing the α-galactosidase gene can be obtained again based on the base sequence. It is also possible to clarify the full-length base sequence of the α-galactosidase gene by repeating this operation. Based on the base sequence of the α-galactosidase gene decoded as described above, a DNA fragment containing the full length of the α-galactosidase gene can be obtained by a known method using a PCR method or a restriction enzyme. The amino acid sequence of α-galactosidase can be determined from the base sequence of the α-galactosidase gene decoded as described above.

配列番号2に本発明のα−ガラクトシダーゼのアミノ酸配列を例示するが、このアミノ酸配列からなるタンパク質がα-ガラクトシダーゼ活性を有する限り、当該アミノ酸配列において少なくとも1個のアミノ酸に欠失、置換、付加等の変異が生じてもよく、あるいは当該アミノ酸配列に対して60%以上の相同性を有するアミノ酸配列であってもよい。即ち、本発明のα−ガラクトシダーゼは、下記(a)、(b)又は(c)の何れかのアミノ酸配列からなるα−ガラクトシダーゼである。
(a)配列番号2で表わされるアミノ酸配列;
(b)配列番号2で表されるアミノ酸配列において、1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、及び/又は付加されたアミノ酸配列であって、α−ガラクトシダーゼ活性を有するアミノ酸配:
(c)配列番号2に表されるアミノ酸配列に対して60%以上の相同性を有するアミノ酸配列であって、α−ガラクトシダーゼ活性を有するアミノ酸配列:
The amino acid sequence of the α-galactosidase of the present invention is exemplified in SEQ ID NO: 2, but as long as the protein comprising this amino acid sequence has α-galactosidase activity, at least one amino acid in the amino acid sequence is deleted, substituted, added, etc. Or an amino acid sequence having 60% or more homology with the amino acid sequence. That is, the α-galactosidase of the present invention is an α-galactosidase consisting of any of the following amino acid sequences (a), (b) or (c).
(A) the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2;
(B) an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted, and / or added in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 and having an α-galactosidase activity:
(C) an amino acid sequence having 60% or more homology with the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 and having an α-galactosidase activity:

さらに本発明によれば、下記(a)、(b)又は(c)の何れかのアミノ酸配列からなるα−ガラクトシダーゼをコードするα−ガラクトシダーゼ遺伝子。
(a)配列番号2で表わされるアミノ酸配列;
(b)配列番号2で表されるアミノ酸配列において、1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、及び/又は付加されたアミノ酸配列であって、α−ガラクトシダーゼ活性を有するアミノ酸配:
(c)配列番号2に表されるアミノ酸配列に対して60%以上の相同性を有するアミノ酸配列であって、α−ガラクトシダーゼ活性を有するアミノ酸配列:
Furthermore, according to this invention, the alpha-galactosidase gene which codes the alpha-galactosidase which consists of an amino acid sequence in any one of following (a), (b) or (c).
(A) the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2;
(B) an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted, and / or added in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 and having an α-galactosidase activity:
(C) an amino acid sequence having 60% or more homology with the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 and having an α-galactosidase activity:

上記(b)における「1又は数個のアミノ酸」とは、一般的には1〜50個のアミノ酸、好ましくは1〜30個のアミノ酸、より好ましくは1〜20個のアミノ酸、さらに好ましくは1〜10個のアミノ酸、特に好ましくは1〜5個のアミノ酸を意味する。   The “one or several amino acids” in the above (b) is generally 1 to 50 amino acids, preferably 1 to 30 amino acids, more preferably 1 to 20 amino acids, still more preferably 1 Means 10 to 10 amino acids, particularly preferably 1 to 5 amino acids.

上記(c)における「60%以上の相同性を有するアミノ酸配列」とは、一般的には、60%以上、好ましくは70%以上、さらに好ましくは80%以上、さらに好ましくは90%以上、さらに好ましくは95%以上、特に好ましくは99%以上の相同性を有するアミノ酸配列を意味する。   The “amino acid sequence having 60% or more homology” in the above (c) is generally 60% or more, preferably 70% or more, more preferably 80% or more, more preferably 90% or more, Preferably, it means an amino acid sequence having a homology of 95% or more, particularly preferably 99% or more.

本発明のα−ガラクトシダーゼ遺伝子の具体例としては、以下の(a)または(b)の塩基配列からなるα−ガラクトシダーゼ遺伝子を挙げることができる。
(a)配列番号1で表される塩基配列;
(b)配列番号1で表される塩基配列において、1又は数個の塩基が欠失、置換、及び/又は付加された塩基配列であって、かつ、α−ガラクトシダーゼ活性を有するタンパク質をコードする塩基配列:
Specific examples of the α-galactosidase gene of the present invention include the α-galactosidase gene comprising the following base sequence (a) or (b).
(A) the base sequence represented by SEQ ID NO: 1;
(B) The base sequence represented by SEQ ID NO: 1 is a base sequence in which one or several bases are deleted, substituted, and / or added, and encodes a protein having α-galactosidase activity. Base sequence:

上記(b)における「1又は数個の塩基」とは、一般的には1〜150個の塩基、好ましくは1〜90個の塩基、より好ましくは1〜60個の塩基、さらに好ましくは1〜30個の塩基、さらに好ましくは1〜20個の塩基、さらに好ましくは1〜15個の塩基、さらに好ましくは1〜10個の塩基、特に好ましくは1〜5個の塩基を意味する。   The “one or several bases” in the above (b) is generally 1 to 150 bases, preferably 1 to 90 bases, more preferably 1 to 60 bases, still more preferably 1 -30 bases, more preferably 1-20 bases, more preferably 1-15 bases, more preferably 1-10 bases, particularly preferably 1-5 bases.

本発明のα−ガラクトシダーゼ遺伝子は公知の遺伝子操作手段により、本来の反応を触媒する性質を損なわないペプチドの変異をなしてもよく、このような変異体遺伝子は、本発明のα−ガラクトシダーゼ遺伝子から遺伝子工学的手法により作製される人工変異遺伝子を意味し、この人工変異遺伝子は部位特異的変異法や、目的遺伝子の特定DNA断片を人工変異DNAで置換するなどの種々なる遺伝子工学的方法を使用して得られる。即ち、α−ガラクトシダーゼ中のアミノ酸に欠失、置換、付加等の変異を生じさせる方法としては、PCR法、エラープローンPCR法、DNAシャッフリング法やキメラ酵素を作製する手法等の公知の方法が利用できる。   The α-galactosidase gene of the present invention may be mutated in a peptide that does not impair the property of catalyzing the original reaction by known genetic manipulation means. Such a mutant gene is derived from the α-galactosidase gene of the present invention. Means an artificially mutated gene created by genetic engineering techniques. This artificially mutated gene uses site-specific mutation methods and various genetic engineering methods such as replacing specific DNA fragments of the target gene with artificially mutated DNA. Is obtained. That is, known methods such as PCR, error-prone PCR, DNA shuffling, and methods for producing chimeric enzymes are used as methods for generating mutations such as deletion, substitution, and addition in amino acids in α-galactosidase. it can.

上記のようにして得られたα−ガラクトシダーゼの構造遺伝子を完全に含むDNA断片を大腸菌用発現ベクター、例えばpBluescriptII KS(+)のマルチクローニングサイトに挿入、連結して、新たな組換えプラスミドを構築することができる。このプラスミドベクターは大腸菌内で外来遺伝子として連結された遺伝子を効率的に発現できるlacプロモーターが導入されており、組換えプラスミドを大腸菌に導入して得られる形質転換体を培養することでα−ガラクトシダーゼの大量発現が可能になる。   The DNA fragment completely containing the α-galactosidase structural gene obtained as described above is inserted into an expression vector for E. coli, for example, pBluescriptII KS (+), and ligated to construct a new recombinant plasmid. can do. In this plasmid vector, a lac promoter capable of efficiently expressing a gene linked as a foreign gene in E. coli is introduced, and α-galactosidase is obtained by culturing a transformant obtained by introducing the recombinant plasmid into E. coli. Can be expressed in large quantities.

また、上記以外にも種々の宿主微生物、ベクターを利用したα−ガラクトシダーゼの大量発現は可能であり、例えばBrevibacillus choshinensisの形質転換体を培養することで、α−ガラクトシダーゼの大量発現が可能である。より詳細には、本発明のα−ガラクトシダーゼ遺伝子を組み込むベクターとしては、宿主微生物体内で自律的に増殖しうるファージまたはプラスミドから遺伝子組み換え用として構築されたものが適しており、ファージベクターとしては、例えば、エシェリヒア・コリに属する微生物を宿主微生物とする場合にはλgt・λC、λgt・λBなどが使用できる。また、プラスミドベクターとしては、例えば、エシェリヒア・コリを宿主微生物とする場合には、プラスミドpET−3a、pET−11a、pET−32aなどのpETベクター(Novagen)またはpBR322、pBR325、pACYC184、pUC12、pUC13、pUC18、pUC19、pUC118、pIN I、BluescriptKS+、枯草菌を宿主とする場合にはpWH1520、pUB110、pKH300PLK、放線菌を宿主とする場合にはpIJ680、pIJ702、酵母特にサッカロマイセス・セルビシエを宿主とする場合にはYRp7、pYC1、YEp13などが使用できる。このようなベクターを、本発明のα−ガラクトシダーゼ遺伝子の切断に使用した制限酵素で生成するDNA末端と、同じ末端を生成する制限酵素で切断してベクター断片を作成し、本発明のα−ガラクトシダーゼ遺伝子断片とベクター断片とを、DNAリガーゼ酵素により常法に従って結合させて本発明のα−ガラクトシダーゼ遺伝子をコードするDNAを目的のベクターに組み込むことができる。   In addition to the above, a large amount of α-galactosidase can be expressed using various host microorganisms and vectors. For example, a large amount of α-galactosidase can be expressed by culturing a transformant of Brevibacillus choshinensis. More specifically, as the vector incorporating the α-galactosidase gene of the present invention, those constructed for gene recombination from phages or plasmids that can autonomously grow in the host microorganism are suitable. For example, when a microorganism belonging to Escherichia coli is used as a host microorganism, λgt · λC, λgt · λB, and the like can be used. Moreover, as a plasmid vector, for example, when Escherichia coli is used as a host microorganism, pET vectors (Novagen) such as plasmids pET-3a, pET-11a, and pET-32a, or pBR322, pBR325, pACYC184, pUC12, pUC13 , PUC18, pUC19, pUC118, pIN I, BluescriptKS +, pWH1520, pUB110, pKH300PLK when Bacillus subtilis is the host, pIJ680, pIJ702, when using actinomycetes as the host, and yeast, especially Saccharomyces cerevisiae YRp7, pYC1, YEp13, etc. can be used. Such a vector is cleaved with a restriction enzyme that produces the same end as the DNA end produced by the restriction enzyme used for cleaving the α-galactosidase gene of the present invention to produce a vector fragment, and the α-galactosidase of the present invention is prepared. The gene fragment and the vector fragment can be combined with a DNA ligase enzyme according to a conventional method to incorporate the DNA encoding the α-galactosidase gene of the present invention into the target vector.

プラスミドを移入する宿主微生物としては、組み換えDNAが安定かつ自律的に増殖可能であればよく、例えば宿主微生物がエシェリヒア・コリに属する微生物の場合、エシェリヒア・コリ BL21、エシェリヒア・コリ BL21(DE3)、エシェリヒア・コリ BL21trxB、エシェリヒア・コリ Rosetta(DE3)、エシェリヒア・コリ Rosetta、エシェリヒア・コリ Rosetta(DE3)pLysS、エシェリヒア・コリ Rosetta(DE3)pLacl、エシェリヒア・コリ RosettaBlue、エシェリヒア・コリ Rosetta−gami、エシェリヒア・コリ Origami、エシェリヒア・コリ Origami、エシェリヒア・コリ Tuner、エシェリヒア・コリ DH1、エシェリヒア・コリ JM109、エシェリヒア・コリ W3110、エシェリヒア・コリC600などが利用できる。また、微生物宿主がバチラス属に属する微生物の場合、バチラス・サチリス、バチラス・メガテリウムなど、放線菌に属する微生物の場合、ストレプトマイセス・リビダンス TK24など、サッカロマイセス・セルビシエに属する微生物の場合、サッカロマイセス・セルビシエ INVSC1などが使用できる。   As the host microorganism for transferring the plasmid, it is sufficient that the recombinant DNA can be stably and autonomously propagated. For example, when the host microorganism is a microorganism belonging to Escherichia coli, Escherichia coli BL21, Escherichia coli BL21 (DE3), Escherichia coli BL21trxB, Escherichia coli Rosetta (DE3), Escherichia coli Rosetta, Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS, Escherichia coli Rosetta (DE3) pLac, Escherichia coli Luis et Kori Origami, Escherichia coli Origami, Escherichia coli Tuner, Escherichia coli DH1, Escherry Hia coli JM109, Escherichia coli W3110, Escherichia coli C600, etc. can be used. Further, when the microorganism host is a microorganism belonging to the genus Bacillus, Bacillus subtilis, Bacillus megaterium, etc., a microorganism belonging to actinomycetes, Streptomyces lividans TK24, etc., a microorganism belonging to Saccharomyces cerevisiae, Saccharomyces cerevisiae INVSC1 can be used.

また、形質転換微生物により本発明のα−ガラクトシダーゼを製造するに当たっては、該形質転換微生物を栄養培地で培養して菌体内または培養液中に本発明のα−ガラクトシダーゼを産生せしめ、培養終了後、得られた培養物を濾過または遠心分離などの手段により菌体を採集し、次いでこの菌体を機械的方法またはリゾチームなどの酵素的方法で破壊し、又、必要に応じてEDTA及び/または適当な界面活性剤などを添加して本発明のα−ガラクトシダーゼの水溶液を濃縮するか、または濃縮することなく硫安分画、ゲル濾過、アフィニティークロマトグラフィー等の吸着クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィーにより処理して、純度の良い本発明のα−ガラクトシダーゼを得ることができる。   In producing the α-galactosidase of the present invention using a transformed microorganism, the transformed microorganism is cultured in a nutrient medium to produce the α-galactosidase of the present invention in the cells or in the culture solution. The obtained culture is collected by means of filtration or centrifugation, and then the cells are destroyed by a mechanical method or an enzymatic method such as lysozyme, and if necessary, EDTA and / or appropriate The aqueous solution of the α-galactosidase of the present invention is concentrated by adding a suitable surfactant or the like, or it is processed by adsorption chromatography such as ammonium sulfate fractionation, gel filtration, affinity chromatography, or ion exchange chromatography without concentration. Thus, the α-galactosidase of the present invention having good purity can be obtained.

形質転換微生物の培養条件はその栄養生理的性質を考慮して培養条件を選択すればよく、通常多くの場合は、液体培養で行うが、工業的には深部通気撹拌培養を行うのが有利である。培地の栄養源としては、微生物の培養に通常用いられるものが広く使用されうる。培養温度は微生物が発育し、本発明のα−ガラクトシダーゼを生産する範囲で適宜変更し得るが、エシェリヒア・コリの場合、好ましくは、10から45℃程度、さらに好ましくは20から30℃程度である。培養条件は、条件によって多少異なるが、本発明のα−ガラクトシダーゼが最高収量に達する時期を見計らって適当な時期に培養を終了すればよく、エシェリヒア・コリの場合、通常は12から48時間程度である。培地pHは菌が発育し、本発明のα−ガラクトシダーゼを生産する範囲で適宜変更し得るが、エシェリヒア・コリの場合、好ましくはpH6から8程度である。   Culture conditions for transformed microorganisms may be selected in consideration of their nutritional physiological properties. Usually, liquid culture is used in many cases, but industrially, deep aeration and agitation culture is advantageous. is there. As a nutrient source for the medium, those commonly used for culturing microorganisms can be widely used. The culture temperature can be appropriately changed within the range in which microorganisms grow and produce the α-galactosidase of the present invention. In the case of Escherichia coli, it is preferably about 10 to 45 ° C, more preferably about 20 to 30 ° C. . The culture conditions vary somewhat depending on the conditions, but the culture should be terminated at an appropriate time in anticipation of the time when the α-galactosidase of the present invention reaches the maximum yield. In the case of Escherichia coli, it is usually about 12 to 48 hours. is there. The pH of the medium can be appropriately changed within the range in which the bacteria grow and produce the α-galactosidase of the present invention, but in the case of Escherichia coli, the pH is preferably about 6 to 8.

本発明によれば、前述の酵素を用いるに際しては、本発明の酵素の作用を阻害しないかぎり、特別に精製程度等は限定されず、精製された本発明の酵素の他、その酵素含有物を用いてもよい。   According to the present invention, when using the enzyme described above, the degree of purification is not particularly limited unless the action of the enzyme of the present invention is inhibited. It may be used.

本発明によれば、上記した本発明のα−ガラクトシダーゼを含む酵素組成物が提供される。上記酵素組成物には、例えば、α−グルコシダーゼ、β−グルコシダーゼ、β−ガラクトシダーゼ、セルラーゼ、キシラナーゼ、プロテアーゼ、ガラクタナーゼ、アラビナナーゼ、マンナナーゼ、ラムノガラクツロナーゼ、ポリガラクツロナーゼ、ペクチンメチルエステラーゼ、ペクチンリアーゼ、及びポリガラクツロン酸リアーゼから選択される少なくとも1種以上の成分をさらに含有せしめることができる。   According to the present invention, an enzyme composition comprising the above-described α-galactosidase of the present invention is provided. Examples of the enzyme composition include α-glucosidase, β-glucosidase, β-galactosidase, cellulase, xylanase, protease, galactanase, arabinanase, mannanase, rhamnogalacturonase, polygalacturonase, pectin methylesterase, pectin It may further contain at least one component selected from lyase and polygalacturonic acid lyase.

本発明によれば、上記した酵素組成物を含むラフィノース合成試薬が提供される。   According to the present invention, a raffinose synthesis reagent comprising the enzyme composition described above is provided.

本発明において微生物触媒としては、Bacillus coagulans AKC−004株のほかに、上記形質転換体を用いることができる。本発明においてラフィノース製造に利用する微生物触媒としては通常行われる培養方法によって得られる微生物そのものを利用することができ、α−ガラクトシダーゼを微生物から精製する必要はない。また、場合によっては、微生物培養液、微生物培養上清を利用することもできる。一方、培養法により得られた微生物は必要に応じて、水や緩衝液等で洗浄した後、利用することもできる。例えば、培養した微生物の培養液、または遠心分離、バッファーによる洗浄等により得た微生物懸濁液、微生物または微生物の処理物(例えば微生物の破砕物等)を懸濁または溶解させた水溶液、あるいは微生物または微生物処理物を包括法、架橋法、又は担体結合法によって固定化したものを用いることができる。固定化する際の固定化担体の例としては、ガラスビーズ、シリカゲル、ポリウレタン、ポリアクリルアミド、ポリビニルアルコール、カラギーナン、アルギン酸等が挙げられるが、これらに限定されるものではない。 In the present invention, as the microbial catalyst, in addition to the Bacillus coagulans AKC-004 strain, the above transformant can be used. In the present invention, as a microbial catalyst used for producing raffinose, a microorganism itself obtained by a usual culture method can be used, and it is not necessary to purify α-galactosidase from the microorganism. In some cases, a microorganism culture solution or a microorganism culture supernatant can be used. On the other hand, the microorganisms obtained by the culturing method can be used after washing with water or a buffer as required. For example, a culture solution of a cultured microorganism, a microorganism suspension obtained by centrifugation, washing with a buffer, an aqueous solution in which a microorganism or a processed microorganism product (for example, crushed microorganisms) is suspended or dissolved, or a microorganism Alternatively, a product obtained by immobilizing a processed microorganism product by a comprehensive method, a crosslinking method, or a carrier binding method can be used. Examples of the immobilization carrier used for immobilization include, but are not limited to, glass beads, silica gel, polyurethane, polyacrylamide, polyvinyl alcohol, carrageenan, alginic acid and the like.

本発明によれば、上記した本発明のα−ガラクトシダーゼ又はα−ガラクトシダーゼを含む酵素組成物、ラフィノース合成試薬又は微生物触媒を用いたラフィノースの製造方法が提供される。原料としては、例えばスクロース及びガラクト−スを用いることができる。原料としてスクロースとガラクト−スを利用する際には例えば、α−ガラクトシダーゼによる脱水縮合反応を利用する性質上、原料濃度は高い方が好ましいが、ガラクトース濃度が高くなりすぎるとガラクトース分子間の縮合によりスクロースとガラクトース間の脱水縮合反応が抑制されるため、スクロース濃度は30%(w/v)〜90%(w/v)にするのが好ましく、より好ましくは35%(w/v)〜80%(w/v)さらに好ましくは40%(w/v)〜70%(w/v)が好ましい。ガラクトース濃度は2%(w/v)〜45%(w/v)にするのが好ましく、より好ましくは、5%(w/v)〜35%(w/v)にするのが好ましく、さらに好ましくは7%(w/v)〜30%(w/v)が好ましい。また、原料中のスクロースとガラクトースが共に可溶であるような濃度に調製することが好ましい。   According to this invention, the manufacturing method of raffinose using the enzyme composition containing the alpha-galactosidase or alpha-galactosidase of the above-mentioned this invention, a raffinose synthesis reagent, or a microbial catalyst is provided. For example, sucrose and galactose can be used as the raw material. When sucrose and galactose are used as raw materials, for example, due to the property of utilizing a dehydration condensation reaction with α-galactosidase, the raw material concentration is preferably high, but if the galactose concentration is too high, condensation between galactose molecules Since the dehydration condensation reaction between sucrose and galactose is suppressed, the sucrose concentration is preferably 30% (w / v) to 90% (w / v), more preferably 35% (w / v) to 80 % (W / v), more preferably 40% (w / v) to 70% (w / v) is preferable. The galactose concentration is preferably 2% (w / v) to 45% (w / v), more preferably 5% (w / v) to 35% (w / v), Preferably, 7% (w / v) to 30% (w / v) is preferable. In addition, it is preferable to prepare such a concentration that both sucrose and galactose in the raw material are soluble.

本発明のα−ガラクトシダーゼ又はα−ガラクトシダーゼを含む酵素組成物又は酵素組成物を含むラフィノース合成試薬又は微生物触媒を用いてラフィノースを製造する際の反応温度は、反応速度や酵素の安定性の点から、好ましくは10〜90℃、より好ましくは20〜70℃であり、さらに好ましくは30〜60℃である。反応pHは広範囲で調整可能であり、酵素の安定性の点から、好ましくはpH2.0〜10.0、より好ましくはpH3.0〜7.5、さらに好ましくは3.5〜6.0である。反応時間は酵素の使用量によっても異なるが、工業的利用を考慮した際、好ましくは通常20分〜200時間、より好ましくは、6〜80時間である。しかしながら、本発明は以上の反応条件や反応形態に限定されるものではなく、適宜選択することができる。   The reaction temperature when producing raffinose using the α-galactosidase or the enzyme composition containing α-galactosidase of the present invention, or a raffinose synthesis reagent containing the enzyme composition or a microbial catalyst is determined from the viewpoint of reaction rate and enzyme stability. The temperature is preferably 10 to 90 ° C, more preferably 20 to 70 ° C, and still more preferably 30 to 60 ° C. The reaction pH can be adjusted over a wide range, and preferably from pH 2.0 to 10.0, more preferably from pH 3.0 to 7.5, still more preferably from 3.5 to 6.0 from the viewpoint of enzyme stability. is there. Although reaction time changes also with the usage-amount of an enzyme, when industrial utilization is considered, Preferably it is 20 minutes-200 hours, More preferably, it is 6-80 hours. However, the present invention is not limited to the above reaction conditions and reaction forms, and can be appropriately selected.

本発明において、α−ガラクトシダーゼ又はα−ガラクトシダーゼを含む酵素組成物又は酵素組成物を含むラフィノース合成試薬を用いたラフィノース合成反応中、ラフィノースが反応溶液中に0.5%以上蓄積された時点における生成オリゴ糖中のラフィノース含有率を65%以上に向上することができ、より好ましい条件では80%以上に向上することができる。本発明における高い生成オリゴ糖中のラフィノース含有率は、ラフィノースが反応溶液中に0.75%以上、さらには1.0%以上蓄積された時点においても達成可能である。   In the present invention, α-galactosidase or an enzyme composition containing α-galactosidase, or a raffinose synthesis reaction using a raffinose synthesis reagent containing an enzyme composition, the production at the time when 0.5% or more of raffinose is accumulated in the reaction solution The raffinose content in the oligosaccharide can be improved to 65% or more, and can be improved to 80% or more under more preferable conditions. The raffinose content in the high production oligosaccharide in the present invention can be achieved even when raffinose is accumulated in the reaction solution by 0.75% or more, further 1.0% or more.

また一般的に、微生物そのものを用いたラフィノース合成反応では、夾雑酵素の影響により生成オリゴ糖中のラフィノース含有率が低いのに対し、本発明の微生物触媒を用いたラフィノース合成反応では、生成オリゴ糖中のラフィノース含有率は高い。   In general, in the raffinose synthesis reaction using microorganisms itself, the raffinose content in the produced oligosaccharide is low due to the influence of contaminating enzymes, whereas in the raffinose synthesis reaction using the microbial catalyst of the present invention, the produced oligosaccharide is produced. The raffinose content in it is high.

本発明において得られる生成オリゴ糖中のラフィノース含有率は以下の方法により測定される。
ラフィノース合成反応終了後、反応液を25倍希釈して、99℃で10分間保持することで反応を停止した。反応停止後、遠心分離により微生物を除去し、得られた反応溶液を高速液体クロマトグラフィー(HPLC)を用いて定量した。測定には、Thermoelectron社製 Hypercarbカラム、検出器はRIを用いた。生成オリゴ糖中のラフィノース含有率は、HPLC分析チャートに検出された各々のピーク面積比から(ラフィノースのピーク面積)/(生成オリゴ糖のピーク面積)×100により算出した。
The raffinose content in the product oligosaccharide obtained in the present invention is measured by the following method.
After completion of the raffinose synthesis reaction, the reaction solution was diluted 25 times and held at 99 ° C. for 10 minutes to stop the reaction. After the reaction was stopped, microorganisms were removed by centrifugation, and the resulting reaction solution was quantified using high performance liquid chromatography (HPLC). For measurement, a Hypercarb column manufactured by Thermoelectron was used, and RI was used as a detector. The raffinose content in the produced oligosaccharide was calculated from (the peak area of raffinose) / (the peak area of the produced oligosaccharide) × 100 from the ratio of each peak area detected on the HPLC analysis chart.

本発明の方法により製造されるラフィノースを精製、分離する方法としては、一般的に用いられている精製処理方法を利用することができる。すなわち、例えば、遠心分離、MF膜やUF膜等による膜処理、フィルタープレス等により微生物触媒を除き、陽イオン交換クロマトグラフィーや陰イオン交換クロマトグラフィー等のクロマト処理や透析等の脱塩処理により緩衝液や培地等から持ち込まれる塩類等を除去し、さらに、陽イオン交換クロマトグラフィー、陰イオン交換クロマトグラフィー、高速液体クロマトグラフィー、活性炭クロマトグラフィー等のクロマト処理や溶解度の差等を利用した結晶化処理、その他の常法に従ってラフィノースを分離、精製することができる。クロマト処理はこれらの方法を単独で用いても良いし、組み合わせて用いても良く、移動層方式や擬似移動層方式、多成分分離擬似移動層方式、多成分分離循環方式等を適宜利用することができる。これらのラフィノースの精製、分離処理方法は、バッチ式で行っても良いしカラムを利用するなどして連続的に行っても良い。   As a method for purifying and separating raffinose produced by the method of the present invention, a commonly used purification method can be used. That is, for example, centrifugation, MF membrane or UF membrane treatment, filter press etc. removes the microbial catalyst, and buffering by chromatographic treatment such as cation exchange chromatography or anion exchange chromatography or desalting treatment such as dialysis. Removes salts, etc. brought in from liquids and culture media, and further uses cation exchange chromatography, anion exchange chromatography, high performance liquid chromatography, activated carbon chromatography, etc., and crystallization treatment using differences in solubility, etc. The raffinose can be separated and purified according to other conventional methods. For chromatographic treatment, these methods may be used alone or in combination, and a moving bed method, a pseudo moving bed method, a multi-component separation pseudo moving bed method, a multi-component separation and circulation method, etc. may be used appropriately Can do. These raffinose purification and separation treatment methods may be carried out batchwise or continuously using a column.

以下、実施例により具体的に説明するが、本発明はこれらの実施例により何ら限定されるものではない。   Hereinafter, although an example explains concretely, the present invention is not limited at all by these examples.

実施例1
Bacillus coagulans AKC−004株(受託番号FERM P−21092(FERM−ABP10948に移管):寄託機関; 独立行政法人産業技術総合研究所特許生物寄託センター)をTBAB(Tryptose Blood Agar Base)プレート (Difco)で、55℃、1日間培養してコロニーを形成させた。
Example 1
Bacillus coagulans AKC-004 strain (Accession No. FERM P-21092 (transferred to FERM-ABP10948): Depository Organization; National Institute of Advanced Industrial Science and Technology Patent Organism Depositary Center) on TBAB (Tryptose Blood Agar Base) plate (Difco) The cells were cultured at 55 ° C. for 1 day to form colonies.

pH7.2に調整した表1に示す培地30mLを150mL容の三角フラスコに入れ、上記プレートからコロニーを白金耳で植菌し、50℃で、25時間、180rpmで回転振盪培養を行い、これをジャー培養のシードとした。   Place 30 mL of the medium shown in Table 1 adjusted to pH 7.2 into a 150 mL Erlenmeyer flask, inoculate the colony from the plate with a platinum loop, and perform rotary shaking culture at 180 rpm at 50 ° C. for 25 hours. It was used as a seed for jar culture.

Figure 0005006380
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次に、pH7.2に調整した表1に示す培地6Lを10L容のジャーファーメンターに入れ、上記のジャー培養のシード15mLを移植し、50℃で、48時間、200rpm、0.2vvmで通気攪拌培養を行った。   Next, 6 L of the medium shown in Table 1 adjusted to pH 7.2 was placed in a 10 L jar fermenter, and 15 mL of the jar culture seed was transplanted, and aerated at 50 ° C. for 48 hours at 200 rpm and 0.2 vvm. Stirring culture was performed.

次いでこの培養液を、4℃で、10,000g×30分間遠心分離して上清を除去し、菌体を回収した。得られた菌体のα−ガラクトシダーゼの活性を測定した結果、261Uであった。   Subsequently, this culture broth was centrifuged at 10,000 g × 30 minutes at 4 ° C. to remove the supernatant, and the cells were collected. It was 261U as a result of measuring the activity of (alpha) -galactosidase of the obtained microbial cell.

この菌体を、50mM Tris−HCl、20mM EDTA、50mM グルコースを含むLysis緩衝液(pH8.0)で懸濁し150mLにした。この懸濁液を4℃で、10,000g×30分間遠心分離して上清を除去し、菌体を回収した。   This microbial cell was suspended in a Lysis buffer (pH 8.0) containing 50 mM Tris-HCl, 20 mM EDTA, and 50 mM glucose to make 150 mL. The suspension was centrifuged at 10,000 g × 30 minutes at 4 ° C., the supernatant was removed, and the cells were collected.

Lysis緩衝液で洗浄後の菌体を上記Lysis緩衝液に再度懸濁し、150mLとした。これに0.02%のリゾチーム(Sigma社製 卵白由来)を添加して、37℃で、13時間、120rpmで振盪し、菌体破砕を行った。   The cells after washing with the Lysis buffer were resuspended in the Lysis buffer to 150 mL. 0.02% lysozyme (derived from Sigma egg white) was added thereto, and the cells were shaken at 37 ° C. for 13 hours at 120 rpm to disrupt the cells.

菌体破砕後の溶液を、4℃で、10,000g×30分間遠心分離して菌体残渣を除去し、上清を回収した。   The solution after disrupting the cells was centrifuged at 10,000 g × 30 minutes at 4 ° C. to remove cell residues, and the supernatant was collected.

この上清に硫酸アンモニウムを加えて37.5%飽和とし、4℃で一夜放置して沈殿を生じさせた。この沈殿を、4℃で、10,000g×30分間遠心分離して除去し、上清を回収した。   Ammonium sulfate was added to the supernatant to achieve 37.5% saturation, and the mixture was left at 4 ° C. overnight to cause precipitation. This precipitate was removed by centrifugation at 10,000 g × 30 minutes at 4 ° C., and the supernatant was recovered.

この上清に硫酸アンモニウムを加えて54.5%飽和とし、4℃で一夜放置して沈殿を生じさせた。この沈殿を、4℃で、10,000g×30分間遠心分離して回収し、pH7.0の20mMリン酸緩衝液に溶解させ、4℃で、一夜、上記と同じリン酸緩衝液に対して透析した。   Ammonium sulfate was added to the supernatant to obtain 54.5% saturation, and the mixture was left at 4 ° C. overnight to cause precipitation. This precipitate was collected by centrifugation at 10,000 g × 30 minutes at 4 ° C., dissolved in 20 mM phosphate buffer at pH 7.0, and overnight at 4 ° C. against the same phosphate buffer. Dialyzed.

透析により得られた上清を、前記と同じリン酸バッファーで平衡化した「DEAE Sepharose FF」(GEヘルスケア バイオサイエンス株式会社)に吸着させた後、0〜0.4Mの塩化ナトリウムを含有するpH7.0の20mMリン酸緩衝液の濃度勾配法によって酵素を溶出させた。   The supernatant obtained by dialysis is adsorbed to “DEAE Sepharose FF” (GE Healthcare Bioscience Co., Ltd.) equilibrated with the same phosphate buffer as described above, and contains 0 to 0.4 M sodium chloride. The enzyme was eluted by a gradient method of 20 mM phosphate buffer at pH 7.0.

上記で溶出した活性画分を集め、平均分画分子量10,000の限外濾過膜を用いて濃縮し、2Mの塩化ナトリウムを含有するpH7.0の20mMリン酸緩衝液で平衡化した「HiTrap Phenyl FF (high sub)」(GEヘルスケア バイオサイエンス株式会社)に吸着させた後、2.0〜0Mの塩化ナトリウムを含有するpH7.0の20mMリン酸緩衝液の濃度勾配法によって酵素を溶出させた。   The active fractions eluted above were collected, concentrated using an ultrafiltration membrane with an average molecular weight cut-off of 10,000, and equilibrated with 20 mM phosphate buffer at pH 7.0 containing 2 M sodium chloride. After adsorbing to Phenyl FF (high sub) "(GE Healthcare Bioscience Co., Ltd.), the enzyme was eluted by a concentration gradient method of 20 mM phosphate buffer with pH 7.0 containing 2.0 to 0 M sodium chloride. I let you.

上記で溶出した活性画分を集め、平均分画分子量10,000の限外濾過膜を用いて濃縮し、pH7.0の20mMリン酸緩衝液で平衡化した「MonoQ 5/50 GL」(GEヘルスケア バイオサイエンス株式会社)に吸着させた後、0〜0.4Mの塩化ナトリウムを含有するpH7.0の20mMリン酸緩衝液の濃度勾配法によって酵素を溶出させた。   The active fraction eluted above was collected, concentrated using an ultrafiltration membrane having an average molecular weight cut off of 10,000, and equilibrated with 20 mM phosphate buffer having a pH of 7.0, “MonoQ 5/50 GL” (GE Then, the enzyme was eluted by a concentration gradient method of 20 mM phosphate buffer having a pH of 7.0 containing 0 to 0.4 M sodium chloride.

上記で溶出した活性画分を集め、平均分画分子量10,000の限外濾過膜を用いて濃縮し、pH7.0の20mMリン酸バッファーで平衡化した「HiLoad 16/60 Superdex 200」(GEヘルスケア バイオサイエンス株式会社)に充填した後、同様の緩衝液で溶出を行った。   The active fractions eluted above were collected, concentrated using an ultrafiltration membrane with an average molecular weight cut off of 10,000, and equilibrated with 20 mM phosphate buffer having a pH of 7.0, “HiLoad 16/60 Superdex 200” (GE (Healthcare Bioscience Co., Ltd.) was used for elution with the same buffer.

上記で溶出した活性画分を集め、平均分画分子量10,000の限外濾過膜を用いて濃縮し、精製α−ガラクトシダーゼとした。活性収率は15%で、活性は270U/mLであった。   The active fractions eluted above were collected and concentrated using an ultrafiltration membrane having an average fractional molecular weight of 10,000 to obtain purified α-galactosidase. The activity yield was 15% and the activity was 270 U / mL.

実施例2
実施例1で得られた精製α−ガラクトシダーゼを用いて、その作用に関する実験を行った。
Example 2
Using the purified α-galactosidase obtained in Example 1, an experiment on its action was performed.

(1)至適pH範囲
各pHの100mM緩衝液に溶解させた6mMのp−ニトロフェニル−α−D−ガラクトピラノシド150μLに、100倍希釈した本発明の精製酵素液50μLを混合し、40℃で5分間反応させた。反応後、遊離されたp−ニトロフェノールを定量することで活性を測定し、最大活性を100とする相対活性を求めた。この結果を図1に示す。なお、使用した緩衝液は、グリシン−HCl緩衝液(pH2.5〜3.5)、酢酸ナトリウム緩衝液(pH3.5〜6.0)、リン酸ナトリウム緩衝液(pH6.0〜8.5)、グリシン−NaOH緩衝液(pH8.5〜10.0)である。
(1) Optimum pH range 50 μL of the purified enzyme solution of the present invention diluted 100 times is mixed with 150 μL of 6 mM p-nitrophenyl-α-D-galactopyranoside dissolved in 100 mM buffer at each pH, The reaction was carried out at 40 ° C. for 5 minutes. After the reaction, the activity was measured by quantifying the liberated p-nitrophenol, and the relative activity with the maximum activity of 100 was determined. The result is shown in FIG. The buffers used were glycine-HCl buffer (pH 2.5 to 3.5), sodium acetate buffer (pH 3.5 to 6.0), and sodium phosphate buffer (pH 6.0 to 8.5). ), Glycine-NaOH buffer (pH 8.5 to 10.0).

(2)安定pH範囲
pH4.0〜10.0の範囲で10mMの緩衝液を用いて、各pHで45℃、140分間の加熱処理を行い、その残存活性を測定し、前記と同様に最大活性を100とする相対活性を求めた。この結果を図2に示す。なお、使用した各pHの緩衝液の種類は前記のものと同様である。
(2) Stable pH range Using a 10 mM buffer in the range of pH 4.0 to 10.0, heat treatment at 45 ° C. for 140 minutes at each pH, and measuring the residual activity, Relative activity with activity set to 100 was determined. The result is shown in FIG. In addition, the kind of buffer solution of each pH used is the same as the above-mentioned thing.

(3)至適温度範囲
pH4.5の酢酸ナトリウム緩衝液に溶解させた4.7mMのp−ニトロフェニル−α−D−ガラクトピラノシド190μLに、20倍希釈した本発明の精製酵素液10μLを混合し、20〜60℃の範囲で5分間反応させた。反応後、遊離されたp−ニトロフェノールを定量することで活性を測定し、最大活性を100とする相対活性を求めた。この結果を図3に示す。
(3) Optimal temperature range 10 μL of the purified enzyme solution of the present invention diluted 20-fold in 190 μL of 4.7 mM p-nitrophenyl-α-D-galactopyranoside dissolved in a sodium acetate buffer solution of pH 4.5 Were mixed and reacted in the range of 20 to 60 ° C. for 5 minutes. After the reaction, the activity was measured by quantifying the liberated p-nitrophenol, and the relative activity with the maximum activity of 100 was determined. The result is shown in FIG.

(4)安定温度範囲
pH4.5の100mM酢酸ナトリウム緩衝液を用いて、30〜55℃の各温度で20分間加熱処理を行い、その残存活性を測定し、前記と同様に最大活性を100とする相対活性を求めた。この結果を図4に示す。
(4) Stable temperature range Using a 100 mM sodium acetate buffer with a pH of 4.5, heat treatment is carried out at each temperature of 30 to 55 ° C. for 20 minutes, the residual activity is measured, and the maximum activity is set to 100 as described above. Relative activity was determined. The result is shown in FIG.

(5)分子量
分離ゲル濃度が10%の「レディーゲルJ」(日本バイオ・ラッド ラボラトリーズ株式会社)を用いるSDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動により、分子量を求めた。この結果を図5に示す。分子量は約80,000であり、アミノ酸配列から推定される分子量83,122とほぼ一致した。
(5) Molecular Weight Molecular weight was determined by SDS-polyacrylamide gel electrophoresis using “Ready Gel J” (Nippon Bio-Rad Laboratories, Inc.) having a separation gel concentration of 10%. The result is shown in FIG. The molecular weight was about 80,000, which almost coincided with the molecular weight 83,122 estimated from the amino acid sequence.

(7)基質特異性
10mMの各種基質を含むpH4.5の100mM酢酸ナトリウム緩衝液150μLに100倍希釈した本発明の精製酵素液50μLを混合し、40℃で20分間反応させた。ただし、p−ニトロフェニル−α−D−ガラクトピラノシドを基質に用いた反応では、反応時間を5分間とした。反応後、遊離されたp−ニトロフェノールの定量、あるいは「Shodex SUGAR」(昭和電工株式会社)カラムを用いた高速液体クロマトグラフィーによる分析から分解された基質の定量を行い、最大活性を100とした各基質に対する相対活性を求めた。この結果を表2に示す。また、そのなかで基質となり得たものについて、反応速度を測定した結果を表3に示す。
(7) Substrate specificity 50 μL of the purified enzyme solution of the present invention diluted 100-fold was mixed with 150 μL of pH 4.5 100 mM sodium acetate buffer containing 10 mM of various substrates, and reacted at 40 ° C. for 20 minutes. However, in the reaction using p-nitrophenyl-α-D-galactopyranoside as a substrate, the reaction time was 5 minutes. After the reaction, the released p-nitrophenol was quantified, or the substrate decomposed from the analysis by high-performance liquid chromatography using a “Shodex SUGAR” (Showa Denko) column, and the maximum activity was set to 100. The relative activity for each substrate was determined. The results are shown in Table 2. In addition, Table 3 shows the results of measuring the reaction rate of those that could serve as substrates.

Figure 0005006380
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(8)阻害因子
pH4.5の酢酸ナトリウム緩衝液に溶解させた6mMのp−ニトロフェニル−α−D−ガラクトピラノシドに各種金属イオンを終濃度1mMとなるように添加して150μLとし、100倍希釈した本発明の精製酵素液50μLを混合し、40℃で20分間反応させた。反応後、遊離されたp−ニトロフェノールを定量することで活性を測定し、最大活性を100とする相対活性を求めた。この結果を表4に示す。
(8) Inhibitory factor Various metal ions were added to 6 mM p-nitrophenyl-α-D-galactopyranoside dissolved in pH 4.5 sodium acetate buffer to a final concentration of 1 mM to 150 μL, 50 μL of the purified enzyme solution of the present invention diluted 100 times was mixed and reacted at 40 ° C. for 20 minutes. After the reaction, the activity was measured by quantifying the liberated p-nitrophenol, and the relative activity with the maximum activity of 100 was determined. The results are shown in Table 4.

Figure 0005006380
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実施例3
実施例1記載の精製α−ガラクトシダーゼ0.5Uを分取し、1.5mL容ポリプロピレン製チューブに入れた200μLの糖液(pH5.0の100mM酢酸ナトリウム緩衝液にスクロース73%、ガラクトース12%を含む)に添加、混合し、60℃、1,200rpmで反応を行った。反応開始から45時間後に反応液のうち20μLを採取し、480μL蒸留水で希釈を行った後、99℃で10分間処理することで酵素を熱失活させた。熱失活後の希釈糖液を常温に戻した後、「Hypercarb」(Thermoelectron社製)カラムを用いた高速液体クロマトグラフィーで分析を行った。その結果を図6に示す。生成オリゴ糖中のラフィノース含有率は82%であり、反応液中のラフィノース濃度は1.67重量%であった。
Example 3
The purified α-galactosidase 0.5 U described in Example 1 was collected, and 200 μL of sugar solution (pH 5.0, 100 mM sodium acetate buffer solution containing 73% sucrose and 12% galactose in a polypropylene tube). The mixture was added and mixed, and the reaction was performed at 60 ° C. and 1,200 rpm. After 45 hours from the start of the reaction, 20 μL of the reaction solution was collected, diluted with 480 μL distilled water, and then treated at 99 ° C. for 10 minutes to inactivate the enzyme. The diluted sugar solution after heat inactivation was returned to room temperature and then analyzed by high performance liquid chromatography using a “Hypercarb” (Thermoelectron) column. The result is shown in FIG. The raffinose content in the produced oligosaccharide was 82%, and the raffinose concentration in the reaction solution was 1.67% by weight.

実施例4
(1)染色体DNAの調製
常法に従ってBacillus coagulans AKC−004株の染色体DNAを調製した。実施例1記載の方法で取得したBacillus coagulans AKC−004株の培養液60mLを、遠心分離して菌体を回収した。得られた菌体をLysisバッファー(50mM Tris−HCl(pH 8.0)、20mM EDTA、50mM グルコース)に懸濁し、よく洗浄した。遠心分離して菌体を回収した後、Lysisバッファーに再懸濁し、これにリゾチームを加え37℃で45分間インキュベートした。次いでSDSとRNaseを添加し、37℃で45分間インキュベートした。その後Proteinase Kを添加し、50℃で60分間穏やかに振盪した。ここで得られた溶液をフェノール−クロロホルム、クロロホルムで処理後、エタノール沈殿し、析出した核酸をガラスピペットに巻きつけて回収した。この核酸を70%エタノールで洗浄後、乾燥し、TEに再溶解した。この操作により、約1mgの染色体DNAを調製した。
Example 4
(1) Preparation of chromosomal DNA Chromosomal DNA of Bacillus coagulans AKC-004 strain was prepared according to a conventional method. 60 mL of the culture solution of Bacillus coagulans AKC-004 obtained by the method described in Example 1 was centrifuged to recover the cells. The obtained cells were suspended in Lysis buffer (50 mM Tris-HCl (pH 8.0), 20 mM EDTA, 50 mM glucose) and washed thoroughly. The cells were collected by centrifugation, then resuspended in Lysis buffer, added with lysozyme, and incubated at 37 ° C. for 45 minutes. Then SDS and RNase were added and incubated at 37 ° C. for 45 minutes. Proteinase K was then added and gently shaken at 50 ° C. for 60 minutes. The solution obtained here was treated with phenol-chloroform and chloroform and then precipitated with ethanol, and the precipitated nucleic acid was collected by winding it around a glass pipette. The nucleic acid was washed with 70% ethanol, dried and redissolved in TE. By this operation, about 1 mg of chromosomal DNA was prepared.

(2)α−ガラクトシダーゼ遺伝子の単離
上記(1)において調製した染色体DNAから、α−ガラクトシダーゼ遺伝子断片を増幅するためのPCRプライマーを設計、合成した。プライマーの設計は公知の数種の微生物由来α−ガラクトシダーゼ遺伝子のアライメント結果を基に行い、センスプライマーは5'-GAAGTITACGGITTYAGYYTTGTITACAGYGG-3'(配列番号3)の配列を有するオリゴDNAを、アンチセンスプライマーは5'-CCAAACCAICCRTCRTCIARIACRAA-3' (配列番号4)の配列を有するオリゴDNAをそれぞれ合成した。なお、配列中、Iはイノシン、YはC又はT、RはA又はGを示す。ここで得られたPCRプライマーを用い、上記(1)において調製した染色体DNAを鋳型としてPCR法によるα−ガラクトシダーゼ遺伝子断片の増幅を行い、380塩基対からなるα−ガラクトシダーゼ遺伝子断片を取得した。ここで得られた遺伝子断片の塩基配列を、DNAシークエンサーを用いて解析した。
(2) Isolation of α-galactosidase gene PCR primers for amplifying an α-galactosidase gene fragment were designed and synthesized from the chromosomal DNA prepared in (1) above. The primer was designed based on the alignment results of several known microorganism-derived α-galactosidase genes. The sense primer was an oligo DNA having a sequence of 5′-GAAGTITACGGITTYAGYYTTGTITACAGYGG-3 ′ (SEQ ID NO: 3), and the antisense primer was Oligo DNAs having the sequence of 5′-CCAAACCAICCRTCRTCIARIACRAA-3 ′ (SEQ ID NO: 4) were respectively synthesized. In the sequences, I represents inosine, Y represents C or T, and R represents A or G. Using the PCR primer obtained here, the α-galactosidase gene fragment was amplified by PCR using the chromosomal DNA prepared in (1) above as a template to obtain an α-galactosidase gene fragment consisting of 380 base pairs. The base sequence of the gene fragment obtained here was analyzed using a DNA sequencer.

解析の結果得られたα−ガラクトシダーゼ遺伝子断片の塩基配列をもとに、α−ガラクトシダーゼ遺伝子全長を含むDNA断片を取得するために、インバースPCR用PCRプライマーを設計、合成した。センスプライマーは5'-TGATCAACAACTGGGAAAGCGACCT-3' (配列番号5)の配列を有するオリゴDNAを、アンチセンスプライマーは5'-GAACTGGTCCTGCTGCACAATTCC-3' (配列番号6)の配列を有するオリゴDNAをそれぞれ合成した。次に、インバースPCRに用いる鋳型を調製した。上記(1)において調製した染色体DNAを制限酵素HindIIIで消化した後、得られたDNA断片をT4 DNA Ligaseを用いて自己環化し、インバースPCRの鋳型とした。この鋳型に対し、上記のように合成したインバースPCR用プライマーを用いて、PCR法によるα−ガラクトシダーゼ遺伝子を含むDNA断片の増幅を行い、α−ガラクトシダーゼ遺伝子の全配列を含む4500塩基対からなるPCR産物を取得した。   Based on the base sequence of the α-galactosidase gene fragment obtained as a result of the analysis, an inverse PCR PCR primer was designed and synthesized in order to obtain a DNA fragment containing the full length of the α-galactosidase gene. An oligo DNA having the sequence 5′-TGATCAACAACTGGGAAAGCGACCT-3 ′ (SEQ ID NO: 5) was synthesized as the sense primer, and an oligo DNA having the sequence 5′-GAACTGGTCCTGCTGCACAATTCC-3 ′ (SEQ ID NO: 6) was synthesized. Next, a template used for inverse PCR was prepared. After digesting the chromosomal DNA prepared in (1) above with the restriction enzyme HindIII, the obtained DNA fragment was self-circulated using T4 DNA ligase and used as a template for inverse PCR. A PCR fragment consisting of 4500 base pairs including the entire sequence of the α-galactosidase gene is obtained by amplifying a DNA fragment containing the α-galactosidase gene by PCR using the inverse PCR primer synthesized as described above. Acquired the product.

(3)塩基配列の解析
DNAシークエンサーを用いて、(2)で得られたPCR産物からα−ガラクトシダーゼ遺伝子の塩基配列を決定した。その結果、配列番号1に示す5’末端からのDNA塩基配列を有する2190塩基対のα−ガラクトシダーゼの構造遺伝子を解読した。この配列はこれまで見出されていない新規な遺伝子であった。また、このDNA塩基配列より類推されるBacillus coagulans AKC−004株が生産するα−ガラクトシダーゼは730個のアミノ酸からなり、配列番号2に示すようなN末端からのアミノ酸配列を有していた。データベース検索の結果、このアミノ酸配列はGeobacillus stearothermophilus由来α−ガラクトシダーゼ(AgaN)と57%、Geobacillus stearothermophilus由来α−ガラクトシダーゼ(AgaA)と56%、Geobacillus stearothermophilus由来α−ガラクトシダーゼ(AgaB)と56%、Lactococcus raffinolactis由来α−ガラクトシダーゼと56%の相同性を有し、新規なα−ガラクトシダーゼをコードしていることが明らかになった。
(3) Analysis of base sequence The base sequence of the α-galactosidase gene was determined from the PCR product obtained in (2) using a DNA sequencer. As a result, the 2190 base pair α-galactosidase structural gene having the DNA base sequence from the 5 ′ end shown in SEQ ID NO: 1 was decoded. This sequence was a novel gene not found so far. The α-galactosidase produced by the Bacillus coagulans AKC-004 strain inferred from this DNA base sequence was composed of 730 amino acids and had an amino acid sequence from the N-terminus as shown in SEQ ID NO: 2. As a result of database search, this amino acid sequence was found to be 57% of α-galactosidase (AgaN) derived from Geobacillus stearothermophilus, α-galactosidase (AgaA) and 56% derived from Geobacillus stearothermophilus (AgaN), 56%, It was found that it has 56% homology with the derived α-galactosidase and encodes a novel α-galactosidase.

(4)α−ガラクトシダーゼ遺伝子の発現プラスミドベクターの構築及び形質転換
(3)で得られたα−ガラクトシダーゼ遺伝子の配列を基に、α−ガラクトシダーゼ遺伝子のSD配列、構造遺伝子、終始コドンを含む領域を増幅するためのPCRプライマーを設計・合成した。PCRプライマーの設計は(2)で得られた4500塩基対からなるPCR産物の塩基配列を基に行い、センスプライマーは5'-TAAGGTAAAGCAGATGTGCCATT-3' (配列番号7)の配列を有するオリゴDNAを、アンチセンスプライマーは5'-TTACTCGTACACCGCCTC-3' (配列番号8)の配列を有するオリゴDNAをそれぞれ合成した。(2)で得られた4500塩基対からなるPCR産物を鋳型として、合成したPCRプライマーを用いてPCR法による増幅を行い、2325塩基対からなるPCR産物を取得した。ここで得られたPCR産物を平滑末端化、リン酸化した。
制限酵素EcoRVで消化後に脱リン酸化したpBluescriptII KS(+)ベクターに、上記で得られた平滑末端化、リン酸化したPCR産物を連結し、新たなプラスミドベクターpBlue/agaAを構築した。このプラスミドベクターには大腸菌中で外来遺伝子として連結された遺伝子を効率的に転写できるlacプロモーターが導入されており、α−ガラクトシダーゼを効率的に発現・製造させることができる。得られたプラスミドベクターを、塩化カルシウム法で調製した大腸菌JM109株のコンピテントセルにヒートショック法で形質転換し、組換え微生物を作製した。
(4) Construction and transformation of expression plasmid vector of α-galactosidase gene Based on the sequence of α-galactosidase gene obtained in (3), a region containing the SD sequence of α-galactosidase gene, the structural gene, and the start codon. PCR primers for amplification were designed and synthesized. The PCR primer was designed based on the base sequence of the PCR product consisting of 4500 base pairs obtained in (2), and the sense primer was an oligo DNA having the sequence of 5′-TAAGGTAAAGCAGATGTGCCATT-3 ′ (SEQ ID NO: 7). As antisense primers, oligo DNAs having a sequence of 5′-TTACTCGTACACCGCCTC-3 ′ (SEQ ID NO: 8) were respectively synthesized. Using the PCR product consisting of 4500 base pairs obtained in (2) as a template, amplification by the PCR method was performed using the synthesized PCR primers, and a PCR product consisting of 2325 base pairs was obtained. The PCR product obtained here was blunt-ended and phosphorylated.
The blunt-ended and phosphorylated PCR product obtained above was ligated to the pBluescriptII KS (+) vector that had been digested with the restriction enzyme EcoRV and dephosphorylated to construct a new plasmid vector pBlue / agaA. This plasmid vector is introduced with a lac promoter capable of efficiently transcribing a gene linked as a foreign gene in E. coli, so that α-galactosidase can be efficiently expressed and produced. The obtained plasmid vector was transformed into a competent cell of E. coli strain JM109 prepared by the calcium chloride method by the heat shock method to produce a recombinant microorganism.

(5)形質転換体の培養及びα−ガラクトシダーゼの発現
(4)で作製した組換え大腸菌JM109−pBlue/agaAを100mg/Lのアンピシリンを含む30mLのLB培地で37℃で24時間、振盪培養した。培養後、組換え大腸菌を遠心分離して回収した。菌体は100mM酢酸ナトリウム緩衝液(pH5.0)で洗浄後、同緩衝液に再懸濁し、超音波破砕機で破砕した。この破砕液のα−ガラクトシダーゼ活性を、前記の方法で測定したところ、19.9U/培養液(mL)であった。
(5) Culture of transformant and expression of α-galactosidase Recombinant Escherichia coli JM109-pBlue / agaA prepared in (4) was subjected to shaking culture at 37 ° C. for 24 hours in 30 mL LB medium containing 100 mg / L ampicillin. . After culturing, the recombinant E. coli was collected by centrifugation. The cells were washed with 100 mM sodium acetate buffer (pH 5.0), resuspended in the same buffer, and crushed with an ultrasonic crusher. The α-galactosidase activity of this crushed liquid was measured by the above-mentioned method and found to be 19.9 U / culture liquid (mL).

実施例5
実施例4記載の組換え体を培養して得られたα−ガラクトシダーゼ1.0Uを分取し、1.5mL容ポリプロピレン製チューブに入れた200μLの糖液(pH5.0の100mM酢酸ナトリウム緩衝液にスクロース73%、ガラクトース12%を含む)に添加、混合し、60℃、1,200rpmで反応を行った。反応開始から16時間後に反応液のうち20μLを採取し、480μL蒸留水で希釈を行った後、99℃で10分間処理することで酵素を熱失活させた。熱失活後の希釈糖液を常温に戻した後、「Hypercarb」(Thermoelectron社製)カラムを用いた高速液体クロマトグラフィーで分析を行った。その結果を図7に示す。生成オリゴ糖中のラフィノース含有率は82%であり、反応液中のラフィノース濃度は1.20重量%であった。
Example 5
The α-galactosidase 1.0 U obtained by culturing the recombinant described in Example 4 was fractionated, and 200 μL of sugar solution (100 mM sodium acetate buffer solution, pH 5.0) placed in a 1.5 mL polypropylene tube. And 73% sucrose and 12% galactose), and the mixture was reacted at 60 ° C. and 1,200 rpm. After 16 hours from the start of the reaction, 20 μL of the reaction solution was collected, diluted with 480 μL distilled water, and then treated at 99 ° C. for 10 minutes to inactivate the enzyme. The diluted sugar solution after heat inactivation was returned to room temperature and then analyzed by high performance liquid chromatography using a “Hypercarb” (Thermoelectron) column. The result is shown in FIG. The raffinose content in the produced oligosaccharide was 82%, and the raffinose concentration in the reaction solution was 1.20% by weight.

実施例6
Bacillus coagulans AKC-004株(受託番号FERM P−21092(FERM−ABP10948に移管):寄託機関; 独立行政法人産業技術総合研究所特許生物寄託センター)をTBAB(Tryptose Blood Agar Base)プレート (Difco)で、55℃、1日間培養してコロニーを形成させる。その1白金耳を表1に記載の培地30mLを150mL容三角フラスコに分注したものに接種して、55℃、150rpmで2日間培養した。
Example 6
Bacillus coagulans AKC-004 strain (Accession No. FERM P-21092 (transferred to FERM-ABP10948): Depository Organization; National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, Patent Biological Deposit Center) on TBAB (Tryptose Blood Agar Base) plate (Difco) Incubate at 55 ° C for 1 day to form colonies. One platinum loop was inoculated into a 30 mL medium flask of Table 1 dispensed into a 150 mL Erlenmeyer flask and cultured at 55 ° C. and 150 rpm for 2 days.

本培養2日後、培養菌体10mL分を15mL容チューブに回収した。培養液を回収した15mL容チューブを10000rpmで遠心後、上清を除去した。次に、100mM酢酸Na buffer (pH5.0)を1mL添加し、再懸濁した後、懸濁液を2mL容ポリプロピレン製チューブに移した。再度、チューブを遠心し、上清を除去した後、糖液(pH5.0の100mM酢酸ナトリウム緩衝液にスクロース62.5%、ガラクトース12.5%を含む)を300μL添加し、菌体をボルテックスミキサーでよく懸濁させ、糖合成反応をスタートした。本糖合成反応は反応温度60℃、回転数1200rpmで行った。糖合成反応開始16h後に、反応液40μLを回収し、蒸留水960μLとよく混合し、99℃で10分間酵素の熱失活を行った。本希釈糖液を常温に戻した後、「Hypercarb」(Thermoelectron社製)カラムを用いた高速液体クロマトグラフィーで分析を行った結果を図8に示した。生成オリゴ糖中のラフィノース含有率は80%であった(反応液中のラフィノース濃度は0.70重量%)。   Two days after the main culture, 10 mL of cultured cells were collected in a 15 mL tube. The 15 mL tube from which the culture solution was collected was centrifuged at 10,000 rpm, and the supernatant was removed. Next, 1 mL of 100 mM Na acetate buffer (pH 5.0) was added and resuspended, and then the suspension was transferred to a 2 mL polypropylene tube. After centrifuging the tube again and removing the supernatant, 300 μL of sugar solution (containing 62.5% sucrose and 12.5% galactose in 100 mM sodium acetate buffer at pH 5.0) was added, and the cells were vortexed. Suspended well and started the sugar synthesis reaction. The sugar synthesis reaction was performed at a reaction temperature of 60 ° C. and a rotation speed of 1200 rpm. After 16 hours from the start of the sugar synthesis reaction, 40 μL of the reaction solution was recovered, mixed well with 960 μL of distilled water, and the enzyme was heat-inactivated at 99 ° C. for 10 minutes. FIG. 8 shows the results of analysis by high performance liquid chromatography using a “Hypercarb” (manufactured by Thermoelectron) column after returning the diluted sugar solution to room temperature. The raffinose content in the produced oligosaccharide was 80% (the raffinose concentration in the reaction solution was 0.70% by weight).

実施例7
Bacillus coagulans AKC-003株(受託番号FERM P−21091:寄託機関; 独立行政法人産業技術総合研究所特許生物寄託センター)をTBAB(Tryptose Blood Agar Base)プレート (Difco)で、55℃、1日間培養してコロニーを形成させる。その1白金耳を表1に記載の培地30mLを150mL容三角フラスコに分注したものに接種して、55℃、150rpmで2日間培養した。
Example 7
Bacillus coagulans AKC-003 strain (Accession number FERM P-21091: Depositary institution; National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, Patent Biological Deposit Center) is cultured on a TBAB (Tryptose Blood Agar Base) plate (Difco) at 55 ° C for 1 day To form colonies. One platinum loop was inoculated into a 30 mL medium flask of Table 1 dispensed into a 150 mL Erlenmeyer flask and cultured at 55 ° C. and 150 rpm for 2 days.

本培養2日後、培養菌体10mL分を15mL容チューブに回収した。培養液を回収した15mL容チューブを10000rpmで遠心後、上清を除去した。次に、100mM酢酸Na buffer (pH5.0)を1mL添加し、再懸濁した後、懸濁液を2mL容ポリプロピレン製チューブに移した。再度、チューブを遠心し、上清を除去した後、糖液(pH5.0の100mM酢酸ナトリウム緩衝液にスクロース62.5%、ガラクトース12.5%を含む)を300μL添加し、菌体をボルテックスミキサーでよく懸濁させ、糖合成反応をスタートした。本糖合成反応は反応温度60℃、回転数1200rpmで行った。糖合成反応開始38h後に、反応液40μLを回収し、蒸留水960μLとよく混合し、99℃で10分間酵素の熱失活を行った。本希釈糖液を常温に戻した後、「Hypercarb」(Thermoelectron社製)カラムを用いた高速液体クロマトグラフィーで分析を行ったところ、生成オリゴ糖中のラフィノース含有率は80%であった(反応液中のラフィノース濃度は0.76重量%)。   Two days after the main culture, 10 mL of cultured cells were collected in a 15 mL tube. The 15 mL tube from which the culture solution was collected was centrifuged at 10,000 rpm, and the supernatant was removed. Next, 1 mL of 100 mM Na acetate buffer (pH 5.0) was added and resuspended, and then the suspension was transferred to a 2 mL polypropylene tube. After centrifuging the tube again and removing the supernatant, 300 μL of sugar solution (containing 62.5% sucrose and 12.5% galactose in 100 mM sodium acetate buffer at pH 5.0) was added, and the cells were vortexed. Suspended well and started the sugar synthesis reaction. The sugar synthesis reaction was performed at a reaction temperature of 60 ° C. and a rotation speed of 1200 rpm. After 38 hours from the start of the sugar synthesis reaction, 40 μL of the reaction solution was collected and mixed well with 960 μL of distilled water, and the enzyme was heat-inactivated at 99 ° C. for 10 minutes. After returning the diluted sugar solution to room temperature, analysis was performed by high performance liquid chromatography using a “Hypercarb” (Thermoelectron) column, and the raffinose content in the resulting oligosaccharide was 80% (reaction). The raffinose concentration in the liquid is 0.76% by weight).

実施例8
Bacillus coagulans AKC-005株(受託番号FERM P−21093:寄託機関; 独立行政法人産業技術総合研究所特許生物寄託センター)をTBAB(Tryptose Blood Agar Base)プレート (Difco)で、55℃、1日間培養してコロニーを形成させる。その1白金耳を表1に記載の培地30mLを150mL容三角フラスコに分注したものに接種して、55℃、150rpmで2日間培養した。
Example 8
Bacillus coagulans AKC-005 strain (Accession number FERM P-21093: Depositary institution; National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, Patent Biological Deposit Center) was cultured on TBAB (Tryptose Blood Agar Base) plate (Difco) at 55 ° C for 1 day To form colonies. One platinum loop was inoculated into a 30 mL medium flask of Table 1 dispensed into a 150 mL Erlenmeyer flask and cultured at 55 ° C. and 150 rpm for 2 days.

本培養2日後、培養菌体10mL分を15mL容チューブに回収した。培養液を回収した15mL容チューブを10000rpmで遠心後、上清を除去した。次に、100mM酢酸Na buffer (pH5.0)を1mL添加し、再懸濁した後、懸濁液を2mL容ポリプロピレン製チューブに移した。再度、チューブを遠心し、上清を除去した後、糖液(pH5.0の100mM酢酸ナトリウム緩衝液にスクロース62.5%、ガラクトース12.5%を含む)を300μL添加し、菌体をボルテックスミキサーでよく懸濁させ、糖合成反応をスタートした。本糖合成反応は反応温度60℃、回転数1200rpmで行った。糖合成反応開始38h後に、反応液40μLを回収し、蒸留水960μLとよく混合し、99℃で10分間酵素の熱失活を行った。本希釈糖液を常温に戻した後、「Hypercarb」(Thermoelectron社製)カラムを用いた高速液体クロマトグラフィーで分析を行ったところ、生成オリゴ糖中のラフィノース含有率は91%であった(反応液中のラフィノース濃度は0.32重量%)。   Two days after the main culture, 10 mL of cultured cells were collected in a 15 mL tube. The 15 mL tube from which the culture solution was collected was centrifuged at 10,000 rpm, and the supernatant was removed. Next, 1 mL of 100 mM Na acetate buffer (pH 5.0) was added and resuspended, and then the suspension was transferred to a 2 mL polypropylene tube. After centrifuging the tube again and removing the supernatant, 300 μL of sugar solution (containing 62.5% sucrose and 12.5% galactose in 100 mM sodium acetate buffer at pH 5.0) was added, and the cells were vortexed. Suspended well and started the sugar synthesis reaction. The sugar synthesis reaction was performed at a reaction temperature of 60 ° C. and a rotation speed of 1200 rpm. After 38 hours from the start of the sugar synthesis reaction, 40 μL of the reaction solution was collected and mixed well with 960 μL of distilled water, and the enzyme was heat-inactivated at 99 ° C. for 10 minutes. After returning the diluted sugar solution to room temperature, analysis was performed by high performance liquid chromatography using a “Hypercarb” (Thermoelectron) column. As a result, the raffinose content in the resulting oligosaccharide was 91% (reaction). The raffinose concentration in the liquid is 0.32% by weight).

実施例9
Bacillus coagulans AKC-006株(受託番号FERM P−21094:寄託機関; 独立行政法人産業技術総合研究所特許生物寄託センター)をTBAB(Tryptose Blood Agar Base)プレート (Difco)で、55℃、1日間培養してコロニーを形成させる。その1白金耳を表1に記載の培地30mLを150mL容三角フラスコに分注したものに接種して、55℃、150rpmで2日間培養した。
Example 9
Bacillus coagulans AKC-006 strain (Accession No. FERM P-21094: Depositary Institution; National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, Patent Biological Deposit Center) is cultured on TBAB (Tryptose Blood Agar Base) plate (Difco) at 55 ° C for 1 day To form colonies. One platinum loop was inoculated into a 30 mL medium flask of Table 1 dispensed into a 150 mL Erlenmeyer flask and cultured at 55 ° C. and 150 rpm for 2 days.

本培養2日後、培養菌体10mL分を15mL容チューブに回収した。培養液を回収した15mL容チューブを10000rpmで遠心後、上清を除去した。次に、100mM酢酸Na buffer (pH5.0)を1mL添加し、再懸濁した後、懸濁液を2mL容ポリプロピレン製チューブに移した。再度、チューブを遠心し、上清を除去した後、糖液(pH5.0の100mM酢酸ナトリウム緩衝液にスクロース62.5%、ガラクトース12.5%を含む)を300μL添加し、菌体をボルテックスミキサーでよく懸濁させ、糖合成反応をスタートした。本糖合成反応は反応温度60℃、回転数1200rpmで行った。糖合成反応開始38h後に、反応液40μLを回収し、蒸留水960μLとよく混合し、99℃で10分間酵素の熱失活を行った。本希釈糖液を常温に戻した後、「Hypercarb」(Thermoelectron社製)カラムを用いた高速液体クロマトグラフィーで分析を行ったところ、生成オリゴ糖中のラフィノース含有率は76%であった(反応液中のラフィノース濃度は0.86重量%)。   Two days after the main culture, 10 mL of cultured cells were collected in a 15 mL tube. The 15 mL tube from which the culture solution was collected was centrifuged at 10,000 rpm, and the supernatant was removed. Next, 1 mL of 100 mM Na acetate buffer (pH 5.0) was added and resuspended, and then the suspension was transferred to a 2 mL polypropylene tube. After centrifuging the tube again and removing the supernatant, 300 μL of sugar solution (containing 62.5% sucrose and 12.5% galactose in 100 mM sodium acetate buffer at pH 5.0) was added, and the cells were vortexed. Suspended well and started the sugar synthesis reaction. The sugar synthesis reaction was performed at a reaction temperature of 60 ° C. and a rotation speed of 1200 rpm. After 38 hours from the start of the sugar synthesis reaction, 40 μL of the reaction solution was collected and mixed well with 960 μL of distilled water, and the enzyme was heat-inactivated at 99 ° C. for 10 minutes. After returning the diluted sugar solution to room temperature, analysis was performed by high performance liquid chromatography using a “Hypercarb” (Thermoelectron) column, and the raffinose content in the resulting oligosaccharide was 76% (reaction). The raffinose concentration in the liquid is 0.86% by weight).

本発明を用いることにより、安価な原料を用い、選択的にラフィノースを製造する方法を提供することができる。   By using the present invention, a method for selectively producing raffinose using an inexpensive raw material can be provided.

図1は、Bacillus coagulans AKC−004菌体から精製したα−ガラクトシダーゼの至適pH範囲(実施例2)を示す。FIG. 1 shows the optimum pH range (Example 2) of α-galactosidase purified from Bacillus coagulans AKC-004 cells. 図2は、Bacillus coagulans AKC−004菌体から精製したα−ガラクトシダーゼの安定pH範囲(実施例2)を示す。FIG. 2 shows the stable pH range of α-galactosidase purified from Bacillus coagulans AKC-004 cells (Example 2). 図3は、Bacillus coagulans AKC−004菌体から精製したα−ガラクトシダーゼの至適温度範囲(実施例2)を示す。FIG. 3 shows the optimum temperature range of α-galactosidase purified from Bacillus coagulans AKC-004 cells (Example 2). 図4は、Bacillus coagulans AKC−004菌体から精製したα−ガラクトシダーゼの安定温度範囲(実施例2)を示す。FIG. 4 shows the stable temperature range of α-galactosidase purified from Bacillus coagulans AKC-004 cells (Example 2). 図5は、Bacillus coagulans AKC−004菌体から精製したα−ガラクトシダーゼのSDS−PAGE(実施例2)の結果を示す。FIG. 5 shows the results of SDS-PAGE (Example 2) of α-galactosidase purified from Bacillus coagulans AKC-004 cells. 図6は、Bacillus coagulans AKC−004株から精製したα−ガラクトシダーゼ用いた糖合成(実施例3)の反応液をHPLC分析した結果を示す。FIG. 6 shows the results of HPLC analysis of a reaction solution for sugar synthesis (Example 3) using α-galactosidase purified from Bacillus coagulans AKC-004. 図7は、組換え大腸菌JM109株から得られたα−ガラクトシダーゼを用いた糖合成(実施例5)の反応液をHPLC分析した結果を示す。FIG. 7 shows the result of HPLC analysis of a reaction solution for sugar synthesis (Example 5) using α-galactosidase obtained from recombinant Escherichia coli JM109 strain. 図8は、Bacillus coagulans AKC−004株を培養して得た微生物触媒を用いた糖合成(実施例3)の反応液をHPLC分析した結果を示す。FIG. 8 shows the results of HPLC analysis of a reaction solution for sugar synthesis (Example 3) using a microbial catalyst obtained by culturing Bacillus coagulans AKC-004 strain.

Claims (17)

Bacillus coagulansに属する微生物に由来する、下記の特性を有するα−ガラクトシダーゼ。
(1)作用:本酵素は、スクロースとガラクトースを原料とした脱水縮合反応において、生成オリゴ糖中のラフィノース含有率が0.5%以上のとき、ラフィノース合成選択率が65%以上という性質を有する。
(2)至適pH範囲:3.5〜5.0
(3)安定pH範囲:3.5〜10.0
(4)分子量:約80,000
An α-galactosidase derived from a microorganism belonging to Bacillus coagulans having the following characteristics.
(1) Action: This enzyme has a property that the raffinose synthesis selectivity is 65% or more when the raffinose content in the resulting oligosaccharide is 0.5% or more in the dehydration condensation reaction using sucrose and galactose as raw materials. .
(2) Optimal pH range: 3.5-5.0
(3) Stable pH range: 3.5 to 10.0
(4) Molecular weight: about 80,000
Bacillus coagulansがBacillus coagulans AKC003株(FERM P−21091)、AKC004株(FERM BP−10948)、AKC005株(FERM P−21093)、AKC006株(FERM P−21094)のいずれかである請求項1記載のα−ガラクトシダーゼ。Bacillus coagulans are Bacillus coagulans AK003 (FERM P-21091) , AK004 (Ferm BP-10948 ), AKC005 (FERM P-21093) , and AK006 ( strain FERM P-21094) . α-galactosidase. 下記(a)、(b)又は(c)の何れかのアミノ酸配列からなるα−ガラクトシダーゼ。
(a)配列番号2で表わされるアミノ酸配列;
(b)配列番号2で表されるアミノ酸配列において、1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、及び/又は付加されたアミノ酸配列であって、α−ガラクトシダーゼ活性を有するアミノ酸配:
(c)配列番号2に表されるアミノ酸配列に対して80%以上の同一性を有するアミノ酸配列であって、α−ガラクトシダーゼ活性を有するアミノ酸配列:
Α-galactosidase comprising the amino acid sequence of any of the following (a), (b) or (c).
(A) the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2;
(B) an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted, and / or added in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 and having an α-galactosidase activity:
(C) an amino acid sequence having 80% or more identity to the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2, and having an α-galactosidase activity:
下記(a)、(b)又は(c)の何れかのアミノ酸配列からなるα−ガラクトシダーゼをコードするα−ガラクトシダーゼ遺伝子。
(a)配列番号2で表わされるアミノ酸配列;
(b)配列番号2で表されるアミノ酸配列において、1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、及び/又は付加されたアミノ酸配列であって、α−ガラクトシダーゼ活性を有するアミノ酸配:
(c)配列番号2に表されるアミノ酸配列に対して80%以上の同一性を有するアミノ酸配列であって、α−ガラクトシダーゼ活性を有するアミノ酸配列:
The alpha-galactosidase gene which codes the alpha-galactosidase which consists of an amino acid sequence in any one of following (a), (b) or (c).
(A) the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2;
(B) an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted, and / or added in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 and having an α-galactosidase activity:
(C) an amino acid sequence having 80% or more identity to the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2, and having an α-galactosidase activity:
以下の(a)または(b)の塩基配列からなるα−ガラクトシダーゼ遺伝子。
(a)配列番号1で表される塩基配列;
(b)配列番号1で表される塩基配列において、1又は数個の塩基が欠失、置換、及び/又は付加された塩基配列であって、かつ、α−ガラクトシダーゼ活性を有するタンパク質をコードする塩基配列:
An α-galactosidase gene comprising the following base sequence (a) or (b):
(A) the base sequence represented by SEQ ID NO: 1;
(B) The base sequence represented by SEQ ID NO: 1 is a base sequence in which one or several bases are deleted, substituted, and / or added, and encodes a protein having α-galactosidase activity. Base sequence:
請求項4又は5に記載のα−ガラクトシダーゼ遺伝子を含む組換えベクター。A recombinant vector comprising the α-galactosidase gene according to claim 4 or 5 . 請求項4又は5に記載のα−ガラクトシダーゼ遺伝子又は請求項に記載の組み換えベクターを導入した形質転換体。A transformant into which the α-galactosidase gene according to claim 4 or 5 or the recombinant vector according to claim 6 has been introduced. 請求項記載の形質転換体を培養して得られるα−ガラクトシダーゼ。Α-galactosidase obtained by culturing the transformant according to claim 7 . 請求項1、2、3、又は8のいずれか一項に記載のα−ガラクトシダーゼを含む酵素組成物。An enzyme composition comprising the α-galactosidase according to any one of claims 1, 2, 3, and 8 . α−グルコシダーゼ、β−グルコシダーゼ、β−ガラクトシダーゼ、セルラーゼ、キシラナーゼ、プロテアーゼ、ガラクタナーゼ、アラビナナーゼ、マンナナーゼ、ラムノガラクツロナーゼ、ポリガラクツロナーゼ、ペクチンメチルエステラーゼ、ペクチンリアーゼ、及びポリガラクツロン酸リアーゼから選択される少なくとも1種以上の成分をさらに含有する、請求項記載の酵素組成物。Selected from α-glucosidase, β-glucosidase, β-galactosidase, cellulase, xylanase, protease, galactanase, arabinanase, mannanase, rhamnogalacturonase, polygalacturonase, pectin methylesterase, pectin lyase, and polygalacturonic acid lyase The enzyme composition according to claim 9 , further comprising at least one component. 請求項9又は10のいずれかに記載の酵素組成物を含むラフィノース合成試薬。A raffinose synthesis reagent comprising the enzyme composition according to claim 9 . 原料としてスクロース及びガラクト−スを用い、請求項1、2、3、又は8のいずれか一項に記載のα−ガラクトシダーゼ、請求項9又は10に記載の酵素組成物、若しくは請求項11に記載のラフィノース合成試薬を用いることを特徴とするラフィノースの製造方法。The sucrose and galactose are used as a raw material, The α-galactosidase according to any one of claims 1, 2, 3, or 8 , the enzyme composition according to claim 9 or 10 , or the claim 11 A method for producing raffinose, which comprises using a raffinose synthesis reagent. 原料としてスクロース及びガラクト−スを用い、Bacillus coagulansに属する微生物を培養して得た微生物触媒を利用することを特徴とするラフィノースの製造方法。A method for producing raffinose, characterized by using a microbial catalyst obtained by culturing microorganisms belonging to Bacillus coagulans using sucrose and galactose as raw materials. 原料としてスクロース及びガラクト−スを用い、Bacillus coagulans AKC003株(FERM P−21091)、AKC004株(FERM BP−10948)、AKC005株(FERM P−21093)、AKC006株(FERM P−21094)のいずれかに属するBacillus coagulansを培養して得た微生物触媒を利用することを特徴とするラフィノースの製造方法。Using sucrose and galactose as raw materials, Bacillus coagulans AKC003 strain (FERM P-21091) , AKC004 strain ( FERM BP-10948 ), AKC005 strain (FERM P-21093) , AK006 strain (FERM P-21094) A method for producing raffinose, comprising using a microbial catalyst obtained by culturing Bacillus coagulans belonging to the above. 原料としてスクロース及びガラクト−スを用い、請求項に記載の形質転換体を培養して得た微生物触媒を利用することを特徴とするラフィノースの製造方法。A method for producing raffinose, characterized in that sucrose and galactose are used as raw materials and a microbial catalyst obtained by culturing the transformant according to claim 7 is used. 生成オリゴ糖中のラフィノース含有率が65%以上である、請求項12〜15のいずれかに記載のラフィノースの製造方法。The method for producing raffinose according to any one of claims 12 to 15 , wherein the raffinose content in the produced oligosaccharide is 65% or more. 原料中のスクロース濃度が30%(w/v)〜90%(w/v)であり、原料中のガラクトース濃度が2%(w/v)〜45%(w/v)である、請求項12〜16のいずれかに記載のラフィノースの製造方法。The sucrose concentration in the raw material is 30% (w / v) to 90% (w / v), and the galactose concentration in the raw material is 2% (w / v) to 45% (w / v). The manufacturing method of raffinose in any one of 12-16 .
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