JP4968595B2 - 細胞の状態判別手法及び細胞観察の画像処理装置 - Google Patents
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Description
具体的な活性度導出処理に先立ち、時刻tに撮影された画像(説明の便宜上、第1画像という)、及び第1画像よりも所定時間前の時刻t−1に撮影された画像(同様に、第2画像という)について、画像内に含まれる細胞Oの最外輪郭を抽出する。図4は、最外輪郭抽出処理の様子を示す模式図であり、撮像装置55c(54c)により取得された画像(a)に対し、(b)に示すように細胞の最も外側の輪郭を抽出する。最外輪郭抽出処理には、例えば、分散フィルタを施したのち二値化させる手法や、動的輪郭方(SnakesやLevel Set法など)などが挙げられる。上記所定時間は、観察視野内の細胞の運動状況に応じて設定され、細胞の運動が比較的活発な場合には10分〜1時間程度、生細胞の運動が比較的低調な場合には30分〜2時間程度の時間が設定される。
次に、対応づけられた各細胞について、第1画像の細胞の像(第1像という)と、第2画像の細胞の像(第2像という)の、画像平面上における回転角度姿勢(細胞の方位角方向)を揃える。その具体的手法として、対応づけられた各細胞、例えば、O1とO1´について、図心(重心)を通る軸廻りの断面二次モーメント(慣性モーメント)を算出し、第1像の断面二次モーメントI1と第2像の断面二次モーメントI2との相関値が最大となる角度位置で第1像と第2像の細胞の回転角度姿勢を揃える手法を提案する。細胞の輪郭形状が円形に近い場合には、第1像または第2像を一定角度ずつ回転させながら二つの像の相関を計算し、相関値が最大となる角度で揃えられる。
ここで、相関計算の対象となる観察細胞が生細胞の場合には、図6に例示するように、時間の経過とともに形状だけでなく内部構造もOx→Ox´のように変化する。そのため、第1像と第2像の相関値はさほど大きな値にはならない。一方、観察細胞がゴミや細胞の屍骸などの場合には、図7に例示するように、時間が経過してもOy→Oy´のように外形及び内部構造がほとんど変化しない。そのため回転角度姿勢を揃えた第1像と第2像の相関値は大きく、1に近い値となる。
次に、回転角度姿勢が揃えられた観察細胞の第1像及び第2像について、細胞内部構造のテクスチャ特徴量を算出する。ここで、細胞内部のテクスチャ特徴は、すでに公知の種々の指標を用いることができ、例えば以下のようなものがあげられる。すなわち、(1)輝度値の分散、(2)微分の総和、(3)上下、左右、回転対称性(相関値)、(4)方向成分(ガボールフィルタなど)、(5)テクスチャ解析などである。
細胞内(最外輪郭内部)の輝度値のばらつきをみることで、値が大きければばらつきがあることから細胞内の組織の強度を知ることができる。例えば細胞内の顆粒の増減や、核の数や大きさ、密度によるムラといった組織の総和として概算ができる。
細胞内の輝度の空間方向に対する微分(縦、横、斜め方向の輝度値の差分、Sobel Filterなども含む)により、細胞内組織のエッジ強度を算出でき、総和によって細胞内の顆粒の増減や核の数や大きさを知ることができる。分散と異なり、密度によるムラに影響しづらく、光学的なムラを除外できる。
細胞内の組織の空間的な移動や偏り度合いを知ることができる。例えば細胞内の核が端に寄っており、時間とともに核が移動した場合に、対称性相関値の値が下がることになる。核の移動だけでなく輝度ムラ(組織の密度)の変化なども含まれる。細胞の形状によって上下、左右、回転の各対称性相関値を算出する。
線分などを抽出する代表的なフィルタであるガボールフィルタなど、縦と横で抽出する空間周波数(バンドパスの帯域)の異なるフィルタを用いて細胞内の線分を抽出し、その総和を特徴量とする。ガボールフィルタは縦方向、横方向、斜め方向など方位に応じてフィルタを用意し、各方向に対する感度を特徴量とする。微分はハイパスフィルタであるのに対して、ガボールフィルタはバンドパスフィルタであり、組織の太さがある構造を抽出する。
一般的なテクスチャ解析とは、輝度ヒストグラムや空間的な同時生起行列、フーリエ変換(空間周波数のスペクトル強度)など、前記までのシンプルな特徴量と違い、より詳細なテクスチャパターンを解析するものであり、これらの行列や分布をそのまま扱った多次元特徴量である。これらの相関値を算出することによって、より詳細な情報をとらえることができる。
以上、生細胞の活性度の導出及び判断手法について説明したが、以降では培養観察システムBSの画像処理装置100において実行される画像解析の具体的なアプリケーションについて、図11を併せて参照しながら説明する。ここで、図11は生細胞判別の画像処理を実行する画像処理装置100の概要構成を示すブロック図である。なお、上記判断手法により求められる図1あるいは図10に示した時系列の変化グラフを、本明細書において「細胞活性グラフ」といい、符号Gaで示す。
O(O1,O2,O3…,O1´,O2´,O3´…) 観察細胞
5 観察ユニット 6 制御ユニット
54 マクロ観察系 54c 撮像装置
55 顕微観察系 55c 撮像装置
61 CPU 62 ROM
63 RAM 100 画像処理装置
120 画像解析部 130 出力部
Claims (7)
- 撮像装置により所定時間を隔てて観察細胞が撮影された第1画像及び第2画像を順次取得し、
前記第1画像における前記観察細胞と前記第2画像における前記観察細胞との画像平面上の回転角度姿勢を揃え、
回転角度姿勢が揃えられた前記第1画像における前記観察細胞内部のテクスチャ特徴量と前記第2画像における前記観察細胞内部のテクスチャ特徴量との相関値または差分を順次算出して、
算出された前記相関値または前記差分の時系列変化に基づいて前記観察細胞における細胞の活性度を判別することを特徴とする細胞の状態判別手法。 - 前記差分が減少傾向の場合に前記細胞の活性度が低下していると判断し、前記差分が増加傾向の場合に前記細胞の活性度が上昇していると判断することを特徴とする請求項1に記載の細胞の状態判別手法。
- 前記相関値が増加傾向の場合に前記細胞の活性度が低下していると判断し、前記相関値が減少傾向の場合に前記細胞の活性度が上昇していると判断することを特徴とする請求項1に記載の細胞の状態判別手法。
- 細胞を撮影する撮像装置と、前記撮像装置により撮影された画像を取得して前記画像を解析する画像解析部と、前記画像解析部による解析結果を出力する出力部とを備え、
前記画像解析部は、
前記撮像装置により所定時間を隔てて観察細胞が撮影された第1画像及び第2画像を順次取得し、前記第1画像における前記観察細胞と前記第2画像における前記観察細胞との画像平面上の回転角度姿勢を揃え、回転角度姿勢が揃えられた前記第1画像における前記観察細胞内部のテクスチャ特徴量と前記第2画像における前記観察細胞内部のテクスチャ特徴量との相関値または差分を順次算出して、算出された前記相関値または前記差分の時系列の変化状態を導出し、
前記出力部が、前記画像解析部により導出された前記相関値または前記差分の時系列の変化状態を出力するように構成したことを特徴とする細胞観察の画像処理装置。 - 前記画像解析部は、前記相関値または前記差分の時系列の変化状態に基づいて前記観察細胞における細胞の活性度を判別し、
前記出力部が、前記画像解析部により判別された前記細胞の活性度の良否を出力するように構成したことを特徴とする請求項4に記載の細胞観察の画像処理装置。 - 前記画像解析部は、前記差分が減少傾向の場合に前記細胞の活性度が低下していると判断し、前記差分が増加傾向の場合に前記細胞の活性度が上昇していると判断することを特徴とする請求項5に記載の細胞観察の画像処理装置。
- 前記画像解析部は、前記相関値が増加傾向の場合に前記細胞の活性度が低下していると判断し、前記相関値が減少傾向の場合に前記細胞の活性度が上昇していると判断することを特徴とする請求項5に記載の細胞観察の画像処理装置。
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