JP4505749B2 - Bcl−2の発現抑制をするオリゴ二本鎖RNAとそれを含有する医薬組成物 - Google Patents
Bcl−2の発現抑制をするオリゴ二本鎖RNAとそれを含有する医薬組成物 Download PDFInfo
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Description
Tuschlらの研究グループがショウジョウバエの細胞抽出液を用いたin vitro系で、加えたdsRNAが21から23塩基対のdsRNAに分解されていることを見いだし、それらの分解されたRNAが標的であるmRNAの配列認識のガイドとして働く仲介物質であることが示唆された(例えば、P.D.Zamoreら、“Cell”、2000年3月31日、101巻、1号、p.25−33を参照)。そして、実際に化学合成した21から22塩基の二本鎖のRNAを上記の反応系に添加することにより、標的mRNAが切断されることが確かめられた。Tuschlらのグループは、このようなRNAiによるタンパク質発現抑制活性を有する短い二本鎖のRNAを、siRNA(short interfering RNA)と名づけた(例えば、S.M.Elbashirら、“Genes & Development”、2001年1月15日、15巻、2号、p.188−200を参照)。またsiRNAは、それを構成するそれぞれのRNA鎖の3’末端に2〜3塩基の一本鎖の状態で存在する部分、すなわち、いわゆる突出部を有するものが上記の反応系で強いタンパク質発現抑制活性をもつことが報告されている。さらにTuschlらのグループは、siRNAが上記のインターフェロン応答の問題なしに、分化した哺乳動物細胞においても配列特異的な遺伝子発現抑制活性を示すことを報告した(例えば、国際公開第01/75164 A2号パンフレット、およびS.M.Elbashirら、“Nature”、2001年5月24日、411巻、p.494−498を参照)。したがって、siRNAを用いることで、哺乳動物においても、RNAiを利用した標的遺伝子のノックダウンによる、標的遺伝子がコードするタンパク質の発現抑制を行うことが可能となった。
[図2]図2aおよびbは、オリゴ二本鎖RNAとしてB717、B043およびB533をA431細胞内にトランスフェクションして24時間培養した後の、その細胞におけるbcl−2 mRNA量(図2a)および構成的発現遺伝子であるGADPHのmRNA量(図2b)をRT−PCRにより準定量した結果を示す。図2cは、B717、B043およびB533を終濃度10nMでA431細胞内にトランスフェクションして72時間培養した後の、その細胞におけるBcl−2タンパク質の発現をウエスタンブロッティングにより評価した結果を示す。
[図3]図3は、オリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制活性の評価をウエスタンブロッティングで行った結果を示す。上段は終濃度3nMで、下段は終濃度10nMでA431細胞内にトランスフェクションして72時間培養した後の結果である。
[図4]図4は、オリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制活性の評価をウエスタンブロッティングで行った結果を示す。上段は終濃度3nMで、下段は終濃度10nMでA431細胞内にトランスフェクションして72時間培養した後の結果である。
[図5]図5は、選択したオリゴ二本鎖RNAの細胞増殖に対する効果をセルカウンティングアッセイにより評価した結果を示す。細胞はA431細胞を用い、オリゴ二本鎖RNAをトランスフェクションした後、6日間培養した後の細胞数を測定した。縦軸は、オリゴ二本鎖RNAをトランスフェクションしていないA431細胞の細胞数を100%としたときの、それぞれのオリゴ二本鎖RNAをトランスフェクションしたときの細胞数の割合を示す。横軸は、トランスフェクションしたときの終濃度を示す。
[図6]図6は、オリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制活性の評価をウエスタンブロッティングで行った結果を示す。オリゴ二本鎖RNAの終濃度3nMおよび10nMでA431細胞内にトランスフェクションして72時間培養した後の結果である。
[図7]図7は、A549細胞移植後100日までのマウスの生存数を示す。●は対照群、○はオリゴ二本鎖RNA B717を週1回投与した群、および、▲はオリゴ二本鎖RNA B717を週3回投与した群の結果である。
[図8]図8は、A549細胞移植後100日までのマウスの生存数を示す。細い線は対照群、太い線はオリゴ二本鎖RNA B043を投与した群の結果である。
[図9]図9は、A549細胞移植後69日までのマウスの生存数を示す。細い線は対照群、点線はオリゴ二本鎖RNA B043を1mg/kg体重で投与した群、グレーの線はオリゴ二本鎖RNA B043を3mg/kg体重で投与した群、および太い線はオリゴ二本鎖RNA B043を10mg/kg体重で投与した群の結果である。
[図10]図10は、A549細胞移植後69日までのマウスの生存数を示す。細い線は対照群、太い線はオリゴ二本鎖RNA B043を週5回の頻度で計12回投与した群、および点線はオリゴ二本鎖RNA B043を週5回の頻度で計5回投与した群の結果である。なお、点線は太い線と重なっている。
[図11]図11は、PC−3細胞移植後36日までのマウスの腫瘍体積を示す。◆は対照群、□はオリゴ二本鎖RNA B043を投与した群、▲はオリゴ二本鎖RNA B717を投与した群の結果である。
[図12]図12は、オリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制活性の評価をウエスタンブロティングで行った結果を示す。上段は終濃度100nMで、下段は終濃度10nMでA431細胞内にトランスフェクションしたものの結果を表す。
[図13]図13は、オリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制活性の評価をウエスタンブロティングで行った結果を示す。上段は終濃度10nMで、下段は終濃度3nMでA431細胞内にトランスフェクションしたものの結果を表す。
[図14]図14は、オリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制活性の評価をウエスタンブロティングで行った結果を示す。上段は終濃度100nMで、下段は終濃度10nMでA431細胞内にトランスフェクションしたものの結果を表す。
[図15]図15は、オリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制活性の評価をウエスタンブロティングで行った結果を示す。上段は終濃度100nMで、下段は終濃度10nMでA431細胞内にトランスフェクションしたものの結果を表す。
[図16]図16は、オリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制活性の評価をウエスタンブロティングで行った結果を示す。上段は終濃度100nMで、下段は終濃度10nMでA431細胞内にトランスフェクションしたものの結果を表す。
[図17]図17は、オリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制活性の評価をウエスタンブロティングで行った結果を示す。上段は終濃度10nMで、下段は終濃度3nMでA431細胞内にトランスフェクションしたものの結果を表す。
[図18]図18は、オリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制活性の評価をウエスタンブロティングで行った結果を示す。上段は終濃度100nMで、下段は終濃度10nMでA431細胞内にトランスフェクションしたものの結果を表す。
本発明者らは、bcl−2 mRNAの配列として、遺伝子データベースに登録されているものを比較検討したところ、GenBankアクセッション番号BC027258として登録されているbcl−2の完全長mRNAの配列がコンセンサスであることを確認した。このGenBankアクセッション番号BC027258の塩基配列(配列番号197)に基づいて、一次、二次、三次スクリーニングを行い、Bcl−2タンパク質の発現を抑制する活性を有する、オリゴ二本鎖RNAを選択した。
センス鎖
アンチセンス鎖
B436:
センス鎖
アンチセンス鎖
B469:
センス鎖
アンチセンス鎖
B533:
センス鎖
アンチセンス鎖
B614:
センス鎖
アンチセンス鎖
B631:
センス鎖
アンチセンス鎖
B717:
センス鎖
アンチセンス鎖
本発明のオリゴ二本鎖RNAは、細胞にトランスフェクションしたとき、Bcl−2タンパク質の発現を、当該オリゴ二本鎖RNAが存在しない場合に比べて抑制することができる。アンチセンスDNAを用いたBcl−2タンパク質の発現抑制においては、一般的にアンチセンスDNAを数百nMから数十μMの濃度で必要とするのと比較して、本発明のオリゴ二本鎖RNAは、数nM〜数百nMの濃度でも、細胞にトランスフェクションした後、24時間以上、例えば72時間培養した段階でBcl−2タンパク質発現をオリゴ二本鎖RNAが存在しない場合と比較して抑制することができる。望ましくは、オリゴ二本鎖RNAを3〜10nMの濃度でA431細胞(上皮癌細胞)にトランスフェクションした後、72時間培養した段階でBcl−2タンパク質発現をオリゴ二本鎖RNAが存在しない場合と比較して抑制することができる。
B037−25:
センス鎖:
アンチセンス鎖:
B038−25:
センス鎖:
アンチセンス鎖:
B039−25:
センス鎖:
アンチセンス鎖:
B040−25:
センス鎖:
アンチセンス鎖:
B041−25:
センス鎖:
アンチセンス鎖:
B042−25:
センス鎖:
アンチセンス鎖:
B043−25:
センス鎖:
アンチセンス鎖:
B430−25:
センス鎖:
アンチセンス鎖:
B463−25:
センス鎖:
アンチセンス鎖:
B527−25:
センス鎖:
アンチセンス鎖:
B608−25:
センス鎖:
アンチセンス鎖:
B625−25:
センス鎖:
アンチセンス鎖:
B711−25:
センス鎖:
アンチセンス鎖:
本発明のオリゴ二本鎖RNAは、細胞にトランスフェクションしたとき、当該オリゴ二本鎖RNAが存在しない場合に比べて、Bcl−2タンパク質の発現を抑制することができる。アンチセンスDNAを用いたBcl−2タンパク質の発現抑制においては、一般的にアンチセンスDNAを数百nMから数十μMの濃度で必要とするのと比較して、本発明のオリゴ二本鎖RNAは、数nM〜数百nMの濃度でも、細胞にトランスフェクションした後、24時間以上、例えば72時間培養した段階で、オリゴ二本鎖RNAが存在しない場合と比較して、Bcl−2タンパク質発現を抑制することができる。望ましくは、オリゴ二本鎖RNAを3〜10nMの濃度でA431細胞(上皮癌細胞)にトランスフェクションした後、72時間培養した段階でオリゴ二本鎖RNAが存在しない場合と比較して、Bcl−2タンパク質発現を抑制することができる。
本発明は、本発明のオリゴ二本鎖RNAと当該オリゴ二本鎖RNAを細胞内に移行させるのに有効な担体との複合体を含むことを特徴とする医薬組成物を提供する。本発明の医薬組成物はBcl−2タンパク質の過剰発現が原因となっている疾患、アポトーシスの促進が所望される疾患、または血液学的悪性疾患などの治療および/または予防のために用いることができる。これらの疾患は、具体的には、リンパ腫及び白血病の両方を含む血液学的悪性疾患、および固形腫瘍、例えば、肝臓癌、皮膚癌、乳癌、肺癌、消化器癌、前立腺癌、子宮癌、膀胱癌などである。
i)オリゴ二本鎖RNAの調製
オリゴ二本鎖RNAを構成する核酸の合成は、自動核酸合成装置を用いた標準的なホスホアミダイト法による固相合成で行った。合成は、Dharmacon社(米国 コロラド州)又は日本バイオサービス(埼玉県)に合成を依頼するか、または本発明者らが行った。
スクリーニングにおける評価は、オリゴ二本鎖RNAを担体と共に各種癌細胞に導入し、タンパク質の発現量をウエスタンブロッティングで定量することにより、および、mRNAの量をRT−PCR(Reverse transcription−polymerase chain reaction)により準定量することにより行った。
担体として2−O−(2−ジエチルアミノエチル)カルバモイル−1,3−O−ジオレオイルグリセロールと精製卵黄レシチンを含むリポソームAを用い、オリゴ二本鎖RNAとの複合体を調製した。オリゴ二本鎖RNA1重量部に対してリポソームA16重量部を混合して複合体を調製した。以下に、オリゴ二本鎖RNAの終濃度10μMの複合体溶液、2mlの調製について示す。ただし、オリゴ二本鎖RNA複合体の濃度は、オリゴ二本鎖RNAが完全に二本鎖形成していると仮定したときに複合体に含まれているオリゴ二本鎖RNAのモル濃度で示している。
上記のオリゴ二本鎖RNA−リポソーム複合体を用いてオリゴ二本鎖RNAが細胞内にトランスフェクションされることで、Bcl−2タンパク質の発現が抑制されるかどうかをウエスタンブロッティングによりBcl−2タンパク質の量の変化を評価することで評価した。
オリゴ二本鎖RNAのトランスフェクションによるBcl−2タンパク質発現抑制作用はmRNAの発現抑制に起因するかどうかを調べるため、bcl−2のmRNAの発現量をRT−PCRによる準定量により評価した。
Bcl−2タンパク質をコードするmRNAの配列として、登録されているものを比較検討したところ、GenBankアクセッション番号BC027258として登録されているbcl−2の完全長mRNAの配列がコンセンサスであることを確認した。このGenBankアクセッション番号BC027258の塩基配列(以下、bcl−2 mRNAという:配列番号197)に基づいて、後述の実施例に示す一次、二次、三次スクリーニングにより、Bcl−2タンパク質の発現を抑制する活性を有するオリゴ二本鎖RNAを探索した。
一次スクリーニングにおけるオリゴ二本鎖RNAのプールは、bcl−2 mRNAのORF(Open Reading Frame)内から、9塩基毎に始まる19塩基のセンス鎖RNAと、その相補鎖であるアンチセンス鎖RNAを二重鎖形成部として含むオリゴ二本鎖RNAで構成されるものとした。ただし、BLASTサーチの結果、用いるオリゴ二本鎖RNA中に、bcl−2 mRNA以外のmRNAについての連続17塩基以上の相補配列が存在する場合には、適宜、1ないし2塩基シフトさせ、bcl−2 mRNA以外のmRNAとの相補配列が16塩基以下の配列を使用した。
センス鎖
アンチセンス鎖
B433:
センス鎖
アンチセンス鎖
B469:
センス鎖
アンチセンス鎖
B539:
センス鎖
アンチセンス鎖
B622:
センス鎖
アンチセンス鎖
B631:
センス鎖
アンチセンス鎖
B703:
センス鎖
アンチセンス鎖
B717:
センス鎖
アンチセンス鎖
B721:
センス鎖
アンチセンス鎖
Bcl−2タンパク質発現抑制活性の高かった9つのオリゴ二本鎖RNA(B037、B433、B469、B539、B622、B631、B703、B717およびB721)についてRT−PCRによるbcl−2のmRNA量を評価した。その結果を図1に示す。図中、縦軸は、陰性対照としてGL3(ホタルルシフェラーゼ)の発現を抑制するオリゴ二本鎖RNAをA431細胞にトランスフェクションした後、24時間培養した細胞のbcl−2 mRNA量を1としたときの、それぞれのオリゴ二本鎖RNA同様にトランスフェクションした後のbcl−2 mRNA量の割合を示す。一次スクリーニングで得られた9つのオリゴ二本鎖RNAをトランスフェクションした細胞のすべてにおいて、陰性対照と比較してbcl−2のmRNA量の減少が観察された。また、以後の実験においては、陽性対照のオリゴ二本鎖RNAとしてB717を用いることにした。
二次スクリーニングのオリゴ二本鎖RNAのプールは、一次スクリーニングで高いBcl−2タンパク質発現抑制活性の見られたB717以外の8つのオリゴ二本鎖RNA(B037、B433、B469、B539、B622、B631、B703およびB721)、および、それらのセンス鎖の5’末端がbcl−2 mRNAにおいて該当する塩基を中心としてそれぞれ上流側および下流側に3塩基および6塩基ずらした位置から始まる19塩基のセンス鎖RNAとその相補鎖RNAを二重鎖形成部として含むオリゴ二本鎖RNAから構成されるものとした。ただし、BLASTサーチの結果、用いるオリゴ二本鎖RNA中に、bcl−2 mRNA以外のmRNAについての連続17塩基以上の相補配列が存在する場合には、適宜、1ないし2塩基シフトさせ、bcl−2 mRNA以外のmRNAとの相補配列が16塩基以下の配列を使用した。
センス鎖
アンチセンス鎖
B043:
センス鎖
アンチセンス鎖
B436:
センス鎖
アンチセンス鎖
B469:
センス鎖
アンチセンス鎖
B533:
センス鎖
アンチセンス鎖
B616:
センス鎖
アンチセンス鎖
B631:
センス鎖
アンチセンス鎖
これらのうち、B043およびB533のオリゴ二本鎖RNAをトランスフェクションした細胞のbcl−2のmRNA量をRT−PCRにより評価した結果を図2aに示す。図中、縦軸は、陰性対照としてGL3(ホタルルシフェラーゼ)の発現を抑制するオリゴ二本鎖RNAをA431細胞にトランスフェクションした後、24時間培養した細胞のmRNA量を1としたときの、それぞれのオリゴ二本鎖RNAで同様にトランスフェクションした際のmRNA量を示す。いずれのオリゴ二本鎖RNAをトランスフェクションした細胞においても、陰性対照と比較してbcl−2のmRNA量の減少が観察された(図2a)。さらに、陽性対照であるB717のオリゴ二本鎖RNAをトランスフェクションしたときよりもbcl−2 mRNA量は減少していた(図2a)。一方、ハウスキーピング遺伝子GAPDHのmRNA量には影響が見られなかった(図2b)。また、A431細胞に、B043およびB533のそれぞれのオリゴ二本鎖RNAをトランスフェクションした後、72時間培養した細胞中のBcl−2タンパク質の発現量を、ウエスタンブロッティングにより評価した結果を示す写真を図2cに示す。オリゴ二本鎖RNAを10nMでトランスフェクションした際には、選択されたオリゴ二本鎖RNAはBcl−2タンパク質の発現を顕著に抑制することが観察された(図2c上段)。一方、コントロールであるActinタンパク質の量には影響が見られなかった(図2c下段)。
三次スクリーニングのオリゴ二本鎖RNAのプールは、二次スクリーニングで高いBcl−2タンパク質発現抑制活性のみられた4つのオリゴ二本鎖RNA(B037、B043、B533、およびB616)および、そのセンス鎖の5’末端がbcl−2 mRNAにおいて該当する塩基を中心として上流側、下流側ともに3塩基程度の範囲で1塩基ごとにずらした位置から始まる19塩基のセンス鎖RNAとその相補鎖RNAを二重鎖形成部として含むオリゴ二本鎖RNAから構成されるものとした。ただし、合成収率が低下するであろうと予測できるほどGC含量の高い配列はスクリーニングの対象から除いた。
センス鎖
アンチセンス鎖
B533:
センス鎖
アンチセンス鎖
B614:
センス鎖
アンチセンス鎖
これらの3つのオリゴ二本鎖RNA(B043、B533およびB614)は、10nMでトランスフェクションした際にはBcl−2タンパク質の発現をほぼ完全に抑制し、さらに3nMでトランスフェクションしてもBcl−2タンパク質の発現を有意に抑制していることが明らかとなった(図3および図4)。
表1に、一次から三次スクリーニングの過程で、タンパク質発現抑制活性の認められたオリゴ二本鎖RNAを一覧にして示す。
選択したオリゴ二本鎖RNAを、癌細胞にトランスフェクションした場合の細胞増殖の抑制能を、セルカウンティングアッセイを用いて評価した。
96穴プレートにA431細胞(上皮癌細胞)を5×102cells/wellで播種し、10%FBS含有DMEM培地(Sigma、D6046)中で24時間培養した。培養プレートから培地を吸引し、135μlの10%FBS含有DMEM培地を添加した。そこに、10%マルトース水溶液中で混合したオリゴ二本鎖RNA/リポソームA複合体(重量比はオリゴ二本鎖RNA:リポソームA=1:16)溶液を15μl添加し、終量を150μlとした。CO2インキュベーター内で6日間培養した。Cell Counting Kit−8溶液(DOJINDO)を15μlずつ添加し、CO2インキュベーター内で呈色反応を2時間行った。マイクロプレートリーダーを用い、450nm(参照波長は595nm)の吸光度を測定した。オリゴ二本鎖RNAをトランスフェクションしていないA431細胞の細胞数を100%としたときの相対的な細胞数の割合を生細胞率として評価した。陰性対照としては、ホタルルシフェラーゼmRNAのオリゴ二本鎖RNAをトランスフェクションした細胞を用いた。陽性対照としてはBcl−2タンパク質の発現を抑制するオリゴ二本鎖RNAの一つであるB717でトランスフェクションした細胞を用いた。Bcl−2タンパク質発現抑制活性を有するオリゴ二本鎖RNAとしては、B043およびB533について評価した。
結果を図5に示す。どちらのオリゴ二本鎖RNAもトランスフェクションの際の濃度が1nM程度で細胞数が減少し始め、10nMになると細胞数が20%程度に減少した。したがって、本発明のオリゴ二本鎖RNAはBcl−2タンパク質の発現を抑制した結果、細胞増殖を抑える効果を発揮することが明らかとなった。
実施例3 一塩基変異オリゴ二本鎖RNAの効果
i)一塩基変異の効果
オリゴ二本鎖RNAの変異が及ぼす影響を調べるため、一塩基変異体を調製し、実施例1に示したウエスタンブロッティングによりそのオリゴ二本鎖RNAとしての活性を評価した。
センス鎖
アンチセンス鎖
B533−18U:
センス鎖
アンチセンス鎖
B717−10U:
センス鎖
アンチセンス鎖
B043−15AはB043のセンス鎖5’末端から15番目の塩基対C−GをA−Uに、B533−18UはB533のセンス鎖5’末端から18番目の塩基対C−GをU−Aに、およびB717−10UはB717のセンス鎖5’末端から10番目の塩基対A−UをU−Aに、それぞれ変換した一塩基変異体である。
ii)一塩基変異の位置の効果
オリゴ二本鎖RNAの変異の位置が活性に及ぼす影響を調べるため、B533のオリゴ二本鎖RNAについて変異の位置の異なる一塩基変異体を7種類調製し、実施例1にその方法を示したウエスタンブロッティングによりそのオリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制活性を評価した。
B533
センス鎖
アンチセンス鎖
B533−2A:
センス鎖
アンチセンス鎖
B533−5U:
センス鎖
アンチセンス鎖
B533−8U:
センス鎖
アンチセンス鎖
B533−10A:
センス鎖
アンチセンス鎖
B533−12U:
センス鎖
アンチセンス鎖
B533−15U:
センス鎖
アンチセンス鎖
B533−18U:
センス鎖
アンチセンス鎖
結果は表2に示した。
実施例4 21塩基よりも短いオリゴ二本鎖RNAの活性
オリゴ二本鎖RNAを構成する核酸の塩基数および3’末端もしくは5’末端の突出部の塩基数が、Bcl−2タンパク質発現抑制活性に対して及ぼす影響を検討した。B533の二重鎖形成部の一部を含む、それぞれ16から21塩基のセンス鎖およびアンチセンス鎖、を用いた。これらの核酸を以下の表3に示すようにそれぞれ組み合わせて、二重鎖形成部が16から19塩基対、および、3’末端の突出部が0塩基から3塩基もしくは5’末端の突出部が1塩基から2塩基であるオリゴ二本鎖RNAを用意した。これらのオリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制活性について、実施例1にその方法を記したウエスタンブロッティングにより評価した。
実施例5 一部DNA置換体の効果
オリゴ二本鎖RNAを構成するリボヌクレオチドの一部のデオキシリボヌクレオチドへの置換が、オリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制活性に影響を与えるか否かを、一部DNA置換体オリゴ二本鎖RNAを用いて評価した。
実施例6 3’突出部の修飾の効果
スクリーニングにおいては3’突出部としてdTdTを用いたが、このdTdTを2’−メトキシエチル体に変換したとき、オリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制活性に及ぼす影響を検討した。
実施例7 平滑末端型オリゴ二本鎖RNAの効果
オリゴ二本鎖RNAを構成する3’末端突出部の有無が、オリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制活性に及ぼす影響を検討した。3’末端突出部を除いた18塩基対および19塩基対からなる平滑末端型オリゴ二本鎖RNAを用いて評価を行った。具体的に検討したオリゴ二本鎖RNAおよびその結果を表5に示す。これらのオリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制活性について、実施例1にその方法を記したウエスタンブロッティングにより評価した。
実施例8 オリゴ二本鎖RNAを用いたin vivoでの効果(1)
ヌードマウス(BALB/c、nu/nu、オス、5週齢)の脾臓にA549細胞(106細胞/マウス)を移植し、10分後に脾臓を摘出した。移植6日後から45日後まで、実施例1で示した方法で調製したbcl−2オリゴ二本鎖RNA B717(配列番号77および158)を含むオリゴ二本鎖RNA/リポソームA複合体(重量比;オリゴ二本鎖RNA:リポソームA=1:16)を、週1回(計6回)または週3回(計18回)の頻度で静脈内投与した。1回当たりの投与量は、オリゴ二本鎖RNAとして10mg/kg体重とした。対照群には週3回、10%マルトース溶液を投与した(計18回)。図7に移植後100日までの生存数を示す。
実施例9 オリゴ二本鎖RNAを用いたin vivoでの効果(2)
ヌードマウス(BALB/c、nu/nu、オス、5週齢)の脾臓にA549細胞(106細胞/マウス)を移植し、10分後に脾臓を摘出した。移植6日後から44日後まで、実施例1で示した方法で調製したbcl−2オリゴ二本鎖RNA B043(配列番号11および92)を含むオリゴ二本鎖RNA/リポソームA複合体(重量比;オリゴ二本鎖RNA:リポソームA=1:16)を、週2回(計12回)の頻度で静脈内投与した。1回当たりの投与量は、オリゴ二本鎖RNAとして10mg/kg体重とした。対象群には週2回、10%マルトース溶液を投与した(計12回)。図8に移植後100日までの生存数を示す。
実施例10 オリゴ二本鎖RNAを用いたin vivoでの効果(3) −用量依存性−
ヌードマウス(BALB/c、nu/nu、オス、5週齢)の脾臓にA549細胞(106細胞/マウス)を移植し、10分後に脾臓を摘出した。移植6日後から44日後まで、実施例1で示した方法で調製したbcl−2オリゴ二本鎖RNA B043(配列番号11および92)を含むオリゴ二本鎖RNA/リポソームA複合体(重量比;オリゴ二本鎖RNA:リポソームA=1:16)を、週2回(計12回)の頻度で静脈内投与した。1回当たりの投与量は、オリゴ二本鎖RNAとしてそれぞれ1mg/kg体重、3mg/kg体重、10mg/kg体重とした。対象群には週2回、10%マルトース溶液を投与した(計12回)。その結果を図9に示す。
実施例11 オリゴ二本鎖RNAを用いたin vivoでの効果(4) −連続投与スケジュ ールの検討−
ヌードマウス(BALB/c、nu/nu、オス、5週齢)の脾臓にA549細胞(106細胞/マウス)を移植し、10分後に脾臓を摘出した。移植5日後から10日後まで、または移植5日後から20日後まで、実施例1で示した方法で調製したbcl−2オリゴ二本鎖RNA B043(配列番号11および92)を含むオリゴ二本鎖RNA/リポソームA複合体(重量比;オリゴ二本鎖RNA:リポソームA=1:16)を、週5回(計5回または12回)の頻度で静脈内投与した。1回当たりの投与量は、オリゴ二本鎖RNAとして10mg/kg体重とした。対象群には週5回、10%マルトース溶液を投与した(計12回)。その結果を図10に示す。
実施例12 オリゴ二本鎖RNAを用いた局所投与効果
ヌードマウス(BALB/c、nu/nu、オス、5週齢)の右脇腹皮下に、100μLのPBSに懸濁した2.5×106個のPC−3細胞を移植した。移植7日後から18日後まで、実施例1で示した方法で調製したbcl−2オリゴ二本鎖RNA B043(配列番号11および92)またはB717(配列番号77および158)を含むオリゴ二本鎖RNA/リポソームA複合体(重量比;オリゴ二本鎖RNA:リポソームA=1:16)を、週5回(計10回)の頻度で癌周辺部の皮下へ投与した。1回当たりの投与量は、オリゴ二本鎖RNAとして0.1mg/マウスとした。対象群には週5回、10%マルトース溶液を投与した(計10回)。腫瘍体積は、腫瘍を楕円体とみなし、「体積=短径×短径×長径÷2」の式により求めた。その結果を図11に示す。
実施例13 スクリーニングで得られたbcl−2オリゴ二本鎖RNAの周辺配列のBcl−2 タンパク質抑制活性の評価
二次スクリーニングの結果、高いBcl−2タンパク質発現抑制活性のみられた4つのオリゴ二本鎖RNA(B436、B469、B533、B631)の周辺配列、およびB717(スクリーニングの際、陽性対照として用いたオリゴ二本鎖RNA)の周辺配列を有するオリゴ二本鎖RNAについてのBcl−2タンパク質発現抑制活性を、実施例1に示したウエスタンブロッティングにより評価した。B436、B469、B553、B631、またはB717の周辺配列を有するオリゴ二本鎖RNAは、B436、B469、B553、またはB631オリゴ二本鎖RNAのセンス鎖の5’末端がbcl−2 mRNAにおいて該当する塩基を中心として上流側または下流側に1ないし3塩基ずらした位置から始まる19塩基のセンス鎖RNAとその相補鎖RNAを二重鎖形成部として含むオリゴ二本鎖RNAから構成される。B436、B469、B553、B631およびB717の周辺配列の具体的な塩基配列は以下の表6に示す。
実施例14 その他のオリゴ二本鎖RNAについてのBcl−2タンパク質発現抑制活性 の評価
以下の表7にその配列を具体的に示したオリゴ二本鎖RNA(B521、B557、B584、B635、B734、B735、B736)について、実施例1に示したウエスタンブロッティングによりBcl−2タンパク質発現抑制活性を評価した。結果を表7に示す。
i)オリゴ二本鎖RNAの調製
オリゴ二本鎖RNAを構成する核酸の合成は、自動核酸合成装置を用いた標準的なホスホアミダイト法による固相合成で行った。合成は、Dharmacon社(米国 コロラド州)又は日本バイオサービス(埼玉県)に合成を依頼するか、または本発明者が行った。
Bcl−2タンパク質発現抑制活性の評価は、オリゴ二本鎖RNAを担体と共に各種癌細胞に導入し、タンパク質の発現量をウエスタンブロッティングにより評価した。
担体として2−O−(2−ジエチルアミノエチル)カルバモイル1,3−O−ジオレオイルグリセロールと精製卵黄レシチンを含むリポソームAを用い、オリゴ二本鎖RNAとの複合体を調製した。オリゴ二本鎖RNA1重量部に対してリポソームA16重量部を混合して複合体を調製した。以下に、オリゴ二本鎖RNAの終濃度10μMの複合体溶液、2mlの調製について示す。ただし、オリゴ二本鎖RNA複合体の濃度は、オリゴ二本鎖RNAが完全に二本鎖形成していると仮定したときに複合体に含まれているオリゴ二本鎖RNAのモル濃度で示している。
上記のオリゴ二本鎖RNA−リポソーム複合体を用いて本発明に係るオリゴ二本鎖RNAが細胞内にトランスフェクションされることで、Bcl−2タンパク質の発現が抑制されるかどうかをウエスタンブロッティングによりBcl−2タンパク質の量の変化を評価することで評価した。
相補鎖部分が25塩基対であるオリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制活 性の評価
Bcl−2タンパク質発現抑制活性の評価に用いたオリゴ二本鎖RNAは、GenBankアクセッション番号BC027258の塩基配列(以下、bcl−2 mRNAという:配列番号197)に基づいて、以下のオリゴ二本鎖RNAを用意した。
実施例16 オリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制活性の評価(2)
本発明者は、他の部分における相補鎖部分が25塩基対であるオリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制活性に及ぼす影響を検討した。具体的に検討したオリゴ二本鎖RNAは、B430−25、B463−25、B527−25、B608−25、B625−25およびB711−25のオリゴ二本鎖RNAである。これらのオリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制活性について、実施例15にその方法を記したウエスタンブロティングにより評価した。
実施例17 相補鎖部分が25塩基対であるオリゴ二本鎖RNA3’末端の突出部の 効果
オリゴ二本鎖RNAを構成する3’末端の突出部のdTdTであるデオキシリボヌクレオチドを二重鎖形成部に続いてbcl−2 mRNAと相補鎖を形成しうる配列である突出部を有するオリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制活性に影響を与えるか否かを、評価した。
B037−25センス鎖の系統:
(1) B037−25 sense:
(2) B037SSOH25 sense:
B037−25アンチセンス鎖の系統:
(1)B037−25 antisense:
(2)B037SSOH25 antisense:
具体的に検討したオリゴ二本鎖RNAおよびその結果を表10に示す。これらのオリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制活性について、実施例15に記載したウエスタンブロティングにより評価した。
実施例18 相補鎖部分が25塩基対である平滑末端型オリゴ二本鎖RNAの効果
オリゴ二本鎖RNAを構成する核酸の3’末端突出部の有無が、オリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制活性に及ぼす影響を検討した。3’末端突出部を除いた25塩基対からなる平滑末端型オリゴRNAを用いて評価を行った。具体的に検討したオリゴ二本鎖RNAおよびその結果を表11に示す。これらのオリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制活性について、実施例15にその方法を記したウエスタンブロティングにより評価した。
オリゴ二本鎖RNAを構成するセンス鎖のリボヌクレオチド全部をデオキシリボヌクレオチドに置換することによって、オリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制活性が影響を受けるか否かを、センス鎖の全部がDNAであるオリゴ二本鎖RNAを用いて評価した。
B037−25センス鎖の系統:
(1) B037−25 sense
(2) B037DNA25 sense:
B037センス鎖のすべての塩基をデオキシリボヌクレオチドとした核酸(UはTとした)。
B038−25センス鎖の系統:
(1) B038−25 sense:
(2) B038DNA25 sense:
B038センス鎖のすべての塩基をデオキシリボヌクレオチドとした核酸(UはTとした)。
B039−25センス鎖の系統:
(1) B039−25 sense:
(2) B039DNA25 sense:
B039センス鎖のすべての塩基をデオキシリボヌクレオチドとした核酸(UはTとした)。
B040−25センス鎖の系統:
(1) B040−25 sense:
(2) B040DNA25 sense:
B040センス鎖のすべての塩基をデオキシリボヌクレオチドとした核酸(UはTとした)。
B041−25センス鎖の系統:
(1) B041−25 sense:
(2) B041DNA25 sense:
B041センス鎖のすべての塩基をデオキシリボヌクレオチドとした核酸(UはTとした)。
B042−25センス鎖の系統:
(1) B042−25 sense:
(2) B042DNA25 sense:
B042センス鎖のすべての塩基をデオキシリボヌクレオチドとした核酸(UはTとした)。
B043−25センス鎖の系統:
(1) B043−25 sense:
(2) B043DNA25 sense:
B043センス鎖のすべての塩基をデオキシリボヌクレオチドとした核酸(UはTとした)。
具体的に検討したオリゴ二本鎖RNAおよびその結果を表12に示す。これらのオリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制活性について、実施例15に記載したウエスタンブロティングにより評価した。
実施例20 センス鎖一部DNA置換体の効果
オリゴ二本鎖RNAを構成するセンス鎖のリボヌクレオチドの一部をデオキシリボヌクレオチドに置換することによって、オリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制活性が影響を受けるか否かを、一部DNA置換体RNAを用いて評価した。
B037−25センス鎖の系統:
(1) B037−25 sense
(2) B037DNA25 sense:
B037センス鎖のすべての塩基をデオキシリボヌクレオチドとした核酸(UはTとした)。
(3) B037−25−dC−S sense:
B037センス鎖のリボヌクレオチドのC塩基をすべてデオキシリボヌクレオチドとした核酸。
(4) B037−25−dG−S sense:
B037センス鎖のリボヌクレオチドのG塩基をすべてデオキシリボヌクレオチドとした核酸。
(5) B037−25−dGC−S sense:
B037センス鎖のリボヌクレオチドのG塩基およびC塩基をすべてデオキシリボヌクレオチドとした核酸。
(6) B037−25−10D sense:
B037センス鎖の3’末端の10塩基をデオキシリボヌクレオチドとした核酸(UはTとした)。
(7) B037−25−14D sense:
B037センス鎖の3’末端の14塩基をデオキシリボヌクレオチドとした核酸(UはTとした)。
(8) B037−25−18D sense:
B037センス鎖の3’末端の18塩基をデオキシリボヌクレオチドとした核酸(UはTとした)。
B037−25アンチセンス鎖の系統:
(1) B037−25 antisense
上記B037−25センス鎖の系統から選ばれるセンス鎖およびB037−25アンチセンス鎖の対を評価に用いるオリゴ二本鎖RNAとした。
実施例21 リン酸ジエステル結合部分が全てホスホロチオエート体の効果
リボヌクレオチド全部をデオキシリボヌクレオチドに置換し、すべてのリン酸ジエステル結合をホスホロチオエート結合に変換したセンス鎖を有するオリゴ二本鎖RNAを用いて、オリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制活性に与える影響を評価した。
B037−25センス鎖の系統:
(1) B037−25 sense
(2) B037DNA25 sense:
B037センス鎖のすべての塩基をデオキシリボヌクレオチドとした核酸(UはTとした)。
(3) B037DNA25PS sense:
B037センス鎖のすべての塩基をデオキシリボヌクレオチドとし、リン酸ジエステル結合は全てホスホロチオエートである核酸(UはTとした)。
B037−25アンチセンス鎖の系統:
(1) B037−25 antisense
具体的に検討したオリゴ二本鎖RNAおよびその結果を表14に示す。これらのオリゴ二本鎖RNAのBcl−2タンパク質発現抑制作用については、実施例15に記載したウェスタンブロッティングにより評価した。
Claims (15)
- 配列番号11および配列番号92の各塩基配列の3’末端から2塩基のチミンヌクレオチド(dT)を除いた塩基配列からなるRNAの対、配列番号43及び配列番号124の各塩基配列の3’末端から2塩基のチミンヌクレオチド(dT)を除いた塩基配列からなるRNAの対、ならびに、配列番号55および配列番号136の各塩基配列の3’末端から2塩基のチミンヌクレオチド(dT)を除いた塩基配列からなるRNAの対、からなる群より選ばれるいずれか1つのRNAの対で形成される二重鎖形成部を含むオリゴ二本鎖RNA。
- オリゴ二本鎖RNAであって、配列番号11および配列番号92の各塩基配列の3’末端から2塩基のチミンヌクレオチド(dT)を除いた塩基配列からなるRNAの対、配列番号43及び配列番号124の各塩基配列の3’末端から2塩基のチミンヌクレオチド(dT)を除いた塩基配列からなるRNAの対、ならびに、配列番号55および配列番号136の各塩基配列の3’末端から2塩基のチミンヌクレオチド(dT)を除いた塩基配列からなるRNAの対、からなる群より選ばれるいずれか1つのRNAの対において、少なくとも一方のRNAの塩基配列中に、1ないし複数の欠失、置換、挿入、または付加したヌクレオチドを含む二重鎖形成部を含み、かつBcl−2タンパク質発現抑制活性を保持する、前記オリゴ二本鎖RNA。
- オリゴ二本鎖RNAであって、配列番号11および配列番号92の各塩基配列の3’末端から2塩基のチミンヌクレオチド(dT)を除いた塩基配列からなるRNAの対、配列番号43及び配列番号124の各塩基配列の3’末端から2塩基のチミンヌクレオチド(dT)を除いた塩基配列からなるRNAの対、ならびに、配列番号55および配列番号136の各塩基配列の3’末端から2塩基のチミンヌクレオチド(dT)を除いた塩基配列からなるRNAの対、からなる群より選ばれるいずれか1つのRNAの対において、該RNAの対の一方を構成するリボヌクレオチドの一部もしくは全部、または該RNAの対の少なくとも一方のRNAを構成するリボヌクレオチドの一部が、デオキシリボヌクレオチドないし修飾ヌクレオチドで置換されている二重鎖形成部を含み、かつBcl−2タンパク質発現抑制活性を保持する、前記オリゴ二本鎖RNA。
- 二重鎖形成部の少なくとも一方のRNAの3’末端または5’末端に突出部としてヌクレオチドを1ないし4塩基付加した、請求項1から3のいずれか1項に記載のオリゴ二本鎖RNA。
- 3’末端または5’末端に突出部として付加した1ないし4塩基のヌクレオチドがデオキシリボヌクレオチドである、請求項4に記載のオリゴ二本鎖RNA。
- 3’末端に突出部として付加したヌクレオチドが2塩基のチミンヌクレオチド(dT)である、請求項4に記載のオリゴ二本鎖RNA。
- 少なくとも一方のRNAのヌクレオチドを構成するリボースまたはリン酸バックボーンの少なくとも一部が修飾されている、請求項1から6のいずれか1項に記載のオリゴ二本鎖RNA。
- リボースまたはリン酸バックボーンの修飾が、リボースの2’水酸基をH、OR、R、R’OR、SH、SR、NH2、NHR、NR2、N3、CN、F、Cl、Br、およびIから選択される置換基に置換する修飾(Rはアルキルまたはアリールを、およびR’はアルキレンを示す)、リボースを4’チオ体とする修飾、ならびに、リン酸バックボーンの修飾はホスホロチオエート体、ホスホロジチオエート体、アルキルホスホネート体、またはホスホロアミデート体とする修飾、から選択される1または複数の修飾からなる、請求項7に記載のオリゴ二本鎖RNA。
- オリゴ二本鎖RNAを細胞内に移行させるのに有効な担体と請求項1から8のいずれか1項に記載のオリゴ二本鎖RNAとの複合体を含むことを特徴とする、医薬組成物。
- オリゴ二本鎖RNAを細胞内に移行させるのに有効な担体が、カチオン性担体である、請求項9に記載の医薬組成物。
- 請求項1から8のいずれか1項に記載のオリゴ二本鎖RNAを生成するための核酸を含む医薬組成物。
- Bcl−2タンパク質の発現抑制が所望される疾患の治療および/または予防のための請求項9から11のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- アポトーシスの促進が所望される疾患の治療および/または予防のための、請求項12に記載の医薬組成物。
- 癌の治療および/または予防のための請求項12に記載の医薬組成物。
- 血液学的悪性疾患の治療および/または予防のための請求項12に記載の医薬組成物。
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