JP4106041B2 - エプスタイン−バールウイルスに関連するペプチド及び核酸配列 - Google Patents
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Description
a)遊離カルボキシル基と別の保護された反応基とを有する化合物(アミノ酸、ペプチド)を、縮合剤の存在下で、遊離アミノ基と別の保護された反応基とを含む化合物(アミノ酸、ペプチド)と縮合させる;
b)活性化カルボキシル基と別の遊離もしくは保護された反応基とを含む化合物(アミノ酸、ペプチド)を、遊離アミノ基と別の遊離もしくは保護された反応基とを含む化合物(アミノ酸、ペプチド)と縮合させる。
カルボキシル基の活性化は特に、カルボキシル基を、酸ハロゲン化物、アジ化物、無水物、イミダゾリド(imidazolide)又は活性化エステル、例えばN−ヒドロキシ−スクシンイミド、n−ヒドロキシ−ベンゾトリアゾールもしくはp−ニトロフェニルエステルに変換することによって実施し得る。
本発明を、以下の実施例によりさらに説明されよう。
細胞培養及び細胞抽出物
P3HR1−誘導細胞系HH514.c16をローラーボトル内で懸濁培養として増殖し、Middeldorp及びHerbrink(J.Virol.Meth.,21,113−146,1988)により記載の如く正確に20ng/ml 12−テトラデカノホルボール−13−アセテート(TPA)及び3mM 酪酸ナトリウムを使用する、VCA−及びEA−発現を誘導した。EA−抗原のみを選択的に発現するために、誘導した細胞培養に0.5mM ホスホノ酢酸を添加することにより、ウイルス性DNAポリメラーゼをブロックした。
モノクローナル抗体を産生するために、BALB/cマウスをVCA−誘導HH514細胞の核画分(F.Wielaardら.,J.Virol.Meth.,21,105−115,1988)または、これらの細胞若しくは代替的発現系由来の十分に精製した蛋白質で免疫感作した。ハイブリドーマが標準プロトコルにより産生し、上清を標準EBV免疫蛍光試験及び、VCA−誘導HH514細胞由来の抗原抽出物を含むイムノブロット片上で分析した(Middledorp及びHerbrink,J.Virol.Meth.,21,133−146,1988)。
抗VCA−p18抗体を、Robinson及びMillerの方法(The herpesviruses,vol.1,151−192,1991,Publ.Plenum Publishing Corp.New York)を少し変形することによりヒトEBV−陽性血清から精製した。概略すると、10%アクリルアミドゲル中で電気泳動分離後、蛋白質をPVDF−膜(Millipore Corporation,Bedford,USA)上にブロットし、VCA−p18に対応するPVDF−膜上の領域を切り出し、アフィニティーマトリックスとして使用した。ストリップへの抗体の非特異的な結合は、ブロッキング溶液[リン酸緩衝塩水pH7.4(PBS)中、5% 乾燥粉末ミルク、4% ウマ血清]中で一晩インキュベーションすることにより防止した。その後、希釈したヒト血清(ブロック溶液中1:25)中でストリップを2時間インキュベートした。0.05% Tween−20を含むPBSで3回洗浄後、連続2回のインキュベーションに於ける結合抗体を0.1M グリシン、pH2.7で溶離した。溶離液を1M Tris/HCl(pH9.0)の1/20容量で中和した。最後に、溶離液をPBSに対して透析し、アリコート中−20℃で貯蔵した。
HH514.c16細胞のRNA精製
Maniatisら(Molecular cloning:A laboratory manual;Cold Spring Harbor Laboratory,New York,1982)により記載の如く、グアニジニウム/CsCl法により誘導したHH514.c16細胞から全RNAを単離した。ポリ(A+)RNAの精製を、Ausubelら[Current protocols in molecular biology(1991)Greene Publishing Associates,John Wiely&Sons,New York]に記載の如くオリゴ(dT)クロマトグラフィー(Pharmacia,Inc.,Piscataway N.Y.)で実施した。
全RNA(10μg)をグリオキサール(P.S.Thomas,Methods in Enzymology,100,255−266,1983)により変性し、アガロースゲル上で電気泳動した。臭化エチジウム染色後、分離したRNAをニトロセルロース上に真空−ブロットした。3時間プレハイブリダイゼーション後、フィルタを、[α−32P]−標識(Amersham,Bristol,UK)されたランダムプライマー型の若しくはニックトランスレーションされたDNAプローブと42℃で一晩ハイブリダイズした。ハイブリダイゼーション溶液は、50%ホルムアミド、5×SSPE、5×Denhardts溶液[0.1%(w/v)ポリビニルピロリドン、0.1%(w/v)BSA、0.1%(w/v)Ficoll]、0.2mgの超音波処理サケ精子DNA/ml及び0.5% SDSからなる。続いて、ブロットを洗浄し、増感板を使用してX線フィルム(Eastman Kodak Co.,Rochester,N.Y.,USA)に対して露光した。
ポリ(A+)−選択RNA5μgを水酸化メチル水銀で変性した。cDNA合成ではオリゴ(dT)またはヘキサヌクレオチドのいずれかでプライマーを処理した。第1及び第2のストランド合成方法は、Gubler及びHoffman(Gene,25,263−269,1983)に記載の方法と同一であった。EcoRI−メチル化、EcoRI−リンカー付加及びEcoRI消化後、改質したcDNAを、Maniatisらに記載のセファロースCL4B(Pharmacia製)クロマトグラフィーによりサイズ選択した。0.5kB〜3.0kBの種々のサイズのcDNAを、ホスファターゼで処理したλgt11−アームに結合し、次いで、Packageneキット(Promega,San Diego,USA)を使用するin vitroパッケージングを実施した。
オリゴ(dT)プライマー処理ライブラリーの組換体ファージを全部で1×104及びヘキサヌクレオチドプライマー処理ライブラリーの組換体5×105を、アフィニティー精製したヒト抗p18抗体またはモノクローナル抗体EBV.OT41Aとの免疫学的反応性に関してスクリーニングした(Maniatisら参照)。免疫反応性のプラークを、製造業者(Promega)により記載の如く、各々アルカリホスファターゼ結合抗ヒトまたは抗マウスIgGで検出した。
ヌクレオチド配列分析
反復プラークリフティング及び免疫スクリーニングにより精製した陽性プラークのインサートDNAを、その5’−末端に制限部位を含むλgt11フランキング配列のプライマーを使用するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)により増幅した。好適な制限酵素で消化した後、DNA−フラグメントをpGEM−4Z中にサブクローン化し、Sangerら(Proc.Natl.Acad.Sci.,USA,74,5463−5467,1977)の方法の変形を使用する配列キット(Pharmacia,Uppsala,Sweden)を使用して両側から配列決定した。
配列の配置
Wisconsin大学、遺伝学コンピュータグループのソフトウエアプログラム(Gribshovら,Nucl.Acid res.,14.327−334,1986)を使用して、配列を、EMBL−配列データベースに寄託してあるEBV−B95−8プロトタイプ(Baerら.,Nature 310,207−211,1984)の公知配列と一直線に配置した。
E.coli中のBFRF3及びBdRF1のクローニング及び発現
EBVゲノムによってコードされる読み取り枠(ORFs)、BFRF3及びBdRF1を、ターゲットとしてHH514.c16培養上清から蔗糖密度勾配遠心分離により単離したウイルス粒子から精製したウイルスDNAを使用するPCRにより増幅した。その5’−末端に制限部位を含むプライマーの各セットを、LacZ遺伝子の5’末端の第5コドンに配置されている発現ベクターpMLB1113(PBR322の誘導体)(Zagurski及びBerman,Gene,27,183−101,1984)のEcoRI−HindIII部位の増幅フラグメントをクローニングするために使用した。これらの構築物から発現した蛋白質は、β−ガラクトシダーゼの最初の5アミノ酸、その後に続く、β−ガラクトシダーゼの残りに該蛋白質のC−末端で結合した組換体蛋白質からなる。非融合蛋白質を同様に構築したが、但し、挿入物の3’末端に停止コドンを挿入した。
形質転換したE.coli培養物を、1mM IPTG(イソプロピル−β−D−チオガラクトピラノシド)を添加して誘導した。2時間で、誘導後の細菌細胞を遠心分離により収集し、SDS−PAGEサンプル緩衝液に懸濁させ、次いでイムノブロッティングにより分析した。
実施例1に概説した手順で得られたタンパク質の免疫反応性をイムノブロット分析によって試験した。このために、VCAで誘導されたHH514.c16細胞、あるいは、BFRF3−もしくはBdRF1−β−ガラクトシダーゼ融合タンパク質またはβ−ガラクトシダーゼ単独を発現する大腸菌の全細胞タンパク質を、SDS−PAGEによって分離し、ニトロセルロースにブロットした。これらのブロットから調製したストリップを個別の血清及び抗体の調製物と共にインキュベートした。
イムノブロット手順は基本的に、Middeldorp及びHerbrink(J.Virol.Meth.、21、p133〜159、1988)の記載の手順に従って行なった。この手順を以下に要約する。SDS−PAGEタンパク質をニトロセルロースフィルター(0.2μ、Schleicher & Schuell、Den Bosch、オランダ)に移した。ブロッキングバッファ(Tris緩衝塩水(TBS)中の4%粉末ドライミルク、5%ウマ血清)と共に室温(RT)で少なくとも1時間のインキュベーションを行なうことによって、フィルターに対する抗体の非特異的結合を阻害した。ヒト血清をブロッキングバッファによって適当な希釈度に希釈し、少なくとも1時間インキュベートした。ブロットまたはストリップをTBS+0.05% Tween−20(TBSt)で3回洗浄し、アルカリ性ホスファターゼ(AP)に結合した抗ヒトIgG抗体(Promega)、またはHRPに結合した抗マウスIgGもしくは抗ラットIgG(Organon Teknika Cappel、Boxtel、オランダ)をブロッキングバッファに適当に希釈した溶液に添加した。更にインキュベーション及び洗浄処理した後、APの基質としてニトロブルーテトラゾリウム(NBT)及び5−ブロモ−4−クロロ−インドリルホスフェート(BCIP)を用い、HRPの基質として4−クロロ−ナフトールを用いて、ブロットを発色させた。
1.β−Galに対するマウスモノクローナル抗体(Promega);
2.天然ウイルスキャプシドタンパク質(EBV.OT41A)で免疫感作することによって増強したVCA−P40に対するマウスモノクローナル抗体;
3.ウイルスVCA−P18の特異的イムノアフィニティ精製によって得られたウイルスVCA−P18に単一特異性のヒト抗体;
4−5.ヒトEBV−血清陰性の血清;
6−16.ウイルスVCA−P18及びVCA−P40に対して異なる相対反応性を有するヒトEBV−血清陽性の血清。
本発明の代替ペプチド及び対応する天然ウイルスタンパク質の免疫化学的一致は、(1種または複数の)天然ウイルスタンパク質を含むイムノブロットに反応性のヒト血清に、種々の濃度の本発明のペプチドを予め吸収させると、このブロットにおいて対応天然ウイルスタンパク質に対する特異的抗体反応性が消失することによって証明できる。この方法によれば、免疫化学的一致を証明できるだけでなく、イムノブロット上のウイルスタンパク質の免疫反応性が単一種の(主要)タンパク質種に対する抗体結合によって媒介されるという確実な証拠も得られる。
レーン1:0μg BFRF3−β−ガラクトシダーゼ;
レーン2:0.01μg BFRF3−β−ガラクトシダーゼ;
レーン3:0.1μg BFRF3−β−ガラクトシダーゼ;
レーン4:0.5μg BFRF3−β−ガラクトシダーゼ;
レーン5:1μg BFRF3−β−ガラクトシダーゼ。
ペプチド合成及びイムノスクリーニング(PEPSCAN)
12個のアミノ酸(AA)の長さを有し且つORF BFRF3及びBdRF1のアミノ酸配列の11個のアミノ酸がオーバーラップしたペプチドを、Geijsenらによって最初に記載された化学的に活性化したポリエチレンピン上に全自動固相ペプチド合成法(Proc.Nat.Acad.Sci.、アメリカ、83、3998〜4002、1984)によって合成した。健康なEBV血清陽性のドナーから採取した15の血清を用い、EBV特異的抗体に対する免疫反応性を、Middeldorp及びMeloenによって記載された方法(J.Virol.meth.、21、147〜159、1988)で決定した。VCA−p18配列に由来の12個のアミノ酸から成るペプチドのPEPSCAN分析の結果を図4に示す。X軸の数字は、分析した12量体(12−mer)ペプチドの各々のVCA−p18配列上の初期位置を示す。BFRF3読取枠にコードされたVCA−p18タンパク質の12量体ペプチドに対して反応性を有していたヒト血清のパーセンテージを図4のY軸に示す。同一組のピンに対するEBV−血清陰性のヒト血清の平均反応性を上回る標準偏差の3倍を陽性反応と定義する。図4から、3つの免疫支配性ドメインを定義できる:ドメインI;AA120〜140、ドメインII:AA152〜155、ドメインIII:AA159〜165(これらの数字はまたPEPSCANに使用した12量体ペプチドの初期位置を示す)。表1は、この試験に使用した個々の血清の各々に対して最も反応性の大きいペプチドを詳細に示している。表1の第1レーンは、個々の血清の番号を示す。第2レーンは、ドメインIの内部の最も反応性の大きいペプチドのPEPSCAN OD450値(450nmの光学密度)を示す。このペプチドはレーン3に示されている。レーン4及び5はドメインII及びIIIに対する同様のデータを示す。
実施例4に記載の手順と同様にしてヒト血清に対するPEPSCAN分析を行なって、モノクローナル抗体によって検出された直鎖状エピトープの位置を作図した。
t−BOC化学を用いた標準固相合成によって合成ペプチドを調製した。
ペプチド1:H2N−GVPRRQRAIDKRQRA−COOH;
ペプチド2:H2N−GQPHDTAPRGARKKQ−COOH;
ペプチド3:H2N−AVDTGSGGGGQPHDTAPRGARKKQ−COOH;
ペプチド4:H2N−STAVAQSATPSVSSSISSLRAATSGATAAA−COOH;
ペプチド5:ペプチド4のC末端及びペプチド3のN末端の外部(extra)システイン残基を用いS−S−架橋によって結合させたペプチド4と3との結合ペプチド。
実施例6に示すようなアミノ酸配列を有している結合ペプチド5を用い、種々のサブクラスのヒト血清免疫グロブリンに対す反応性をELISAによって試験した(実施例6に記載の手順)。全ての場合に、実施例6と全く同様に結合ペプチド5を固相に使用した。1:100に希釈した血清を使用して実施例6に記載したように抗体反応性を検出した。結果を図9〜11に示す。IgG反応性を阻害するために、製造業者の指示通りにGull−Sorb(Gull Laboratories Inc.、Salt Lake City、Utah、米国)をヒト血清に予め吸収させ、このヒト血清中でIgM反応性を検出した。ヒトIgMのH鎖に特異的なHRP標識ヒツジ抗ヒトIgM抗体によってIgM抗体を検出した。
Claims (10)
- 配列番号2もしくは配列番号4のアミノ酸配列から成るか、または配列番号2もしくは配列番号4のアミノ酸配列の1個もしくは数個のアミノ酸が欠失もしくは置換されているアミノ酸配列または配列番号2もしくは配列番号4のアミノ酸配列に1個もしくは数個のアミノ酸が付加されもしくは挿入されているアミノ酸配列から成り、配列番号2または配列番号4のアミノ酸配列から成るポリペプチドを認識する抗体に対して免疫化学的に反応する抗原を含む、抗エプスタイン−バーウイルス抗体を検出するための試薬。
- 前記抗原が配列番号2もしくは配列番号4のアミノ酸配列の連続した複数アミノ酸が欠失されたアミノ酸配列から成る、請求項1に記載の試薬。
- 配列番号5または配列番号6のアミノ酸配列から成る抗原を含む、抗エプスタイン−バーウイルス抗体を検出するための試薬。
- 配列番号5のアミノ酸配列が配列番号6のアミノ酸配列に連結されたアミノ酸配列から成る抗原を含む、抗エプスタイン−バーウイルス抗体を検出するための試薬。
- 配列番号2、配列番号4、配列番号5若しくは配列番号6のアミノ酸配列から成るか、又は、配列番号5のアミノ酸配列が配列番号6のアミノ酸配列に連結されたアミノ酸配列から成る抗原に対して免疫化学的に反応するモノクローナル抗体。
- European Collection of Animal Cell Cultures (ECACC), Porton Down(英国)にそれぞれ寄託番号93020412、93020413または93020414として寄託されたハイブリドーマ細胞系により生産される請求項5に記載の抗体。
- エプスタイン−バーウイルスに対して請求項6に記載の抗体と同一の反応性を有する、請求項5に記載の抗体。
- 請求項5から7のいずれか一項に記載の抗体を生産することができるハイブリドーマ細胞系。
- European Collection of Animal Cell Cultures (ECACC), Porton Down(英国)にそれぞれ寄託番号93020412、93020413または93020414として寄託された、請求項8に記載のハイブリドーマ細胞系。
- 請求項5から7のいずれか一項に記載の抗体を含む免疫化学的試薬。
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