[go: up one dir, main page]
More Web Proxy on the site http://driver.im/

JP2024512074A - 免疫調節剤 - Google Patents

免疫調節剤 Download PDF

Info

Publication number
JP2024512074A
JP2024512074A JP2023558898A JP2023558898A JP2024512074A JP 2024512074 A JP2024512074 A JP 2024512074A JP 2023558898 A JP2023558898 A JP 2023558898A JP 2023558898 A JP2023558898 A JP 2023558898A JP 2024512074 A JP2024512074 A JP 2024512074A
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
resin
dmf
hydrogen
atoms
alkyl
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
JP2023558898A
Other languages
English (en)
Inventor
エックス チャオ,ジェニファー
マイケル エイ ポス,
チャン,ユンフイ
パトリック アレン,マーティン
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Bristol Myers Squibb Co
Original Assignee
Bristol Myers Squibb Co
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Bristol Myers Squibb Co filed Critical Bristol Myers Squibb Co
Publication of JP2024512074A publication Critical patent/JP2024512074A/ja
Pending legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K7/00Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
    • C07K7/04Linear peptides containing only normal peptide links
    • C07K7/08Linear peptides containing only normal peptide links having 12 to 20 amino acids
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K7/00Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
    • C07K7/50Cyclic peptides containing at least one abnormal peptide link
    • C07K7/54Cyclic peptides containing at least one abnormal peptide link with at least one abnormal peptide link in the ring
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/54Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an organic compound
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/54Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an organic compound
    • A61K47/542Carboxylic acids, e.g. a fatty acid or an amino acid
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/54Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an organic compound
    • A61K47/548Phosphates or phosphonates, e.g. bone-seeking
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02Immunomodulators
    • A61P37/04Immunostimulants
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Medicinal Preparation (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Abstract

本開示は、PD-1/PD-L1およびPD-L1/CD80のタンパク質/タンパク質相互作用を阻害し、したがって、がんおよび感染症を含む様々な疾患の改善に有用である、新規な大環状ペプチドを提供する。

Description

関連出願の相互参照
本出願は、2021年3月24日に出願された米国仮出願第63/165,455号に対する優先権を主張し、その全体が参照により組み込まれる。
電子提出された配列表への参照
本出願とともにファイルされ、電子的に提出されたASCIIテキストファイル(名称:3338_281PC01_Seqlisting_ST25;サイズ:5,923バイト;作成日:2022年3月23日)の配列表の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
技術分野
本開示は、PD-L1に結合し、PD-L1とPD-1およびCD80との相互作用を阻害することができる大環状化合物を提供する。これらの大環状化合物は、インビトロで免疫調節効果を示すため、がんや感染症を含むさまざまな疾患を治療するための治療薬候補となる。
タンパク質プログラム細胞死(Programed Death 1)(PD-1)は、CD28、CTLA-4、ICOSおよびBTLAを含む受容体のCD28ファミリーの阻害性メンバーである。PD-1は、活性化したB細胞、T細胞、および骨髄細胞で発現される。
PD-1タンパク質は、Ig遺伝子スーパーファミリーの一部である55kDaのI型膜貫通タンパク質である。PD-1には、膜近位免疫受容体チロシン阻害モチーフ(ITIM)と膜遠位チロシンベーススイッチモチーフが含まれている。PD-1は、構造的にCTLA-4と類似しているが、CD80 CD86(B7-2)結合に重要なMYPPYモチーフを欠いている。PD-1の2つのリガンド、PD-L1(B7-H1)およびPD-L2(b7-DC)が同定されている。PD-1を発現するT細胞の活性化は、PD-L1またはPD-L2を発現する細胞との相互作用によりダウンレギュレーションされることが示されている。PD-L1およびPD-L2は両方とも、PD-1に結合するB7タンパク質ファミリーのメンバーであるが、他のCD28ファミリーのメンバーには結合しない。PD-L1リガンドは、さまざまなヒトのがんに豊富に含まれている。PD-1とPD-L1の間の相互作用は、腫瘍浸潤リンパ球の減少、T細胞受容体媒介性増殖の減少、および癌細胞による免疫回避をもたらす。免疫抑制は、PD-1とPD-L1の局所的相互作用を阻害することで反転でき、PD-1とPD-L2の相互作用もブロックされると、その効果は相加的になる。
PD-L1は、CD80と相互作用することも示されている。発現する免疫細胞に対するPD-L1/CD80の相互作用は、阻害性であることが示されている。この相互作用を遮断すると、この阻害性相互作用がなくなることが示されている。
PD-1を発現するT細胞がそのリガンドを発現する細胞と接触すると、増殖、サイトカイン分泌、および細胞傷害を含む、抗原性刺激への応答における機能的活性が低下する。PD-1/PD-L1またはPD-L2の相互作用は、感染症や腫瘍の治癒中、またはそれ自体の発症中に免疫応答をダウンレギュレートする。腫瘍疾患や慢性感染症において生じるものなどの慢性抗原刺激により、T細胞は、PD-1発現レベルが上昇し、慢性抗原に対する活性が機能不全になる。これは「T細胞の疲弊」(T cell exhaustion)と称される。B細胞も、PD-1/PDリガンドの抑制と「疲弊」(exhaustion)を示す。
PD-L1に対する抗体を使用したPD-1/PD-L1ライゲーションの遮断は、多くの系においてT細胞活性化を回復および増強することが示されている。進行がん患者は、PD-L1に対するモノクローナル抗体による治療から恩恵を受ける。腫瘍および慢性感染症の前臨床動物モデルでは、モノクローナル抗体によるPD-1/PD-L1経路の遮断により免疫応答が強化され、腫瘍の拒絶反応または感染の制御がもたらされることが示されている。PD-1/PD-L1遮断による抗腫瘍免疫療法は、組織学的に異なる多数の腫瘍に対する治療免疫応答を増強することができる。
PD-1/PD-L1相互作用の干渉は、慢性感染を伴う系においてT細胞活性の増強を引き起こす。PD-L1を遮断すると、色素性リンパ球性脈絡髄膜炎ウイルス感染マウスのウイルスクリアランスが改善され、免疫力が回復した。HIV-1に感染したヒト化マウスは、CD4+T細胞のウイルス枯渇およびウイルス血症に対する防御の強化を示す。PD-L1に対するモノクローナル抗体を介してPD-1/PD-L1を遮断すると、HIV患者のT細胞にin vitroでの抗原特異的機能を回復させることができる。
PD-L1/CD80相互作用の遮断も免疫を刺激することが示されている。PD-L1/CD80相互作用の遮断によって生じる免疫刺激は、さらなるPD-1/PD-L1またはPD-1/PD-L2の相互作用の遮断と組み合わせることで強化されることが示されている。
免疫細胞表現型の変化は、敗血症性ショックにおける重要な因子であると仮説が立てられている。これらには、PD-1およびPD-L1のレベルの増加が含まれる。PD-1およびPD-L1のレベルが増加した敗血症性ショック患者の細胞は、T細胞のアポトーシスのレベルの増加を示す。PD-L1に対する抗体は、免疫細胞のアポトーシスのレベルを低下させることができる。さらに、PD-1発現が欠如しているマウスは、野生型マウスよりも敗血症性ショック症状に対して耐性がある。研究により、抗体を使用してPD-L1の相互作用を遮断すると、不適切な免疫応答が抑制され、疾患の兆候が改善されることが明らかになっている。
慢性抗原に対する免疫応答を増強することに加えて、PD-1/PD-L1経路の遮断は、慢性感染症における治療ワクチン接種を含むワクチン接種に対する応答を増強することも示されている。
PD-1経路は、慢性感染症および腫瘍疾患の慢性抗原刺激から生じるT細胞の疲弊における重要な阻害性分子である。PD-L1タンパク質の標的化によるPD-1/PD-L1相互作用の遮断は、腫瘍または慢性感染症におけるワクチン接種に対する応答の強化を含め、in vitroおよびin vivoでの抗原特異的T細胞免疫機能を回復することが示されている。したがって、PD-L1とPD-1またはCD80との相互作用を遮断する薬剤が望まれている。
本開示は、PD-1/PD-L1およびCD80/PD-L1、タンパク質/タンパク質相互作用を阻害し、それにより、がんおよび感染症を含む様々な疾患の改善に有用である大環状化合物を提供する。
第1の実施形態において、本開示は、式(I)
Figure 2024512074000001
(I)

[式中、
Aは、
Figure 2024512074000002
から選択され;
ここで、
Figure 2024512074000003
は、カルボニル基への結合点を示し、
Figure 2024512074000004
は、窒素原子への結合点を示し;
nは、0または1であり;
mは、1または2であり;
uは、0または1であり;
wは、0、1、または2であり;
は、水素、アミノ、ヒドロキシ、およびメチルから選択され;
14およびR15は、独立して、水素およびメチルから選択され;
16aは、水素およびC-Cアルキルから選択され;
16は、
-(C(R17a-X-R30、-(C(R17a17))0-2-X’-R30、-(C(R17a171-2C(O)NR16am’-X’-R30
-C(R17aC(O)N(R16a)C(R17a-X’-R31、-(C(R17a17))1-2C(O)N(R16a)C(R17a-X’-R31
-C(R17a[C(O)N(R16a)C(R17aw’-X-R31、-C(R17a171-2[C(O)N(R16a)C(R17a171-2w’-X’-R31
-(C(R17a)(R17)C(O)NR16an’-H、;および、
-(C(R17a)(R17)C(O)NR16am’-C(R17a)(R17)-CO
から選択され;
ここで、PEGq’スペーサーは、R16の任意の部分に挿入されてもよく(q’は、PEGスペーサー内の-(CHCHO)-ユニットの数である)、
ここで、w’は、2または3であり;
n’は、1~6であり;
m’は、0~5であり;
q’は、1~20であり;
Xは、1~172個の原子の鎖であり、その原子は、窒素、炭素および酸素から選択され、該鎖は、-NHC(O)-、-NHC(O)NH-、および-C(O)NH-から選択される、1、2、3または4個の基をその中に埋め込まれて含んでいてもよく;該鎖は、-COH、-C(O)NH、-CHC(O)NH、および-(CH1-2COHから独立して選択される1~6個の基で任意に置換されていてもよく;
X’は、1~172個の原子の鎖であり、その原子は、炭素および酸素から選択され、該鎖は、-NHC(O)-、-NHC(O)NH-、および-C(O)NH-から選択される、1、2、3または4個の基をその中に埋め込まれて含んでいてもよく;該鎖は、-COH、-C(O)NH、および-(CH1-2COHから独立して選択される1~6個の基で任意に置換されていてもよく、ただし、X’は、非置換のPEG以外であり;
30は、-SOH、-S(O)OH、および-P(O)(OH)から選択され;
31は、-S(O)OH、-S(O)OH、および-P(O)(OH)から選択され;
各R17aは、水素、C-Cアルキル、-CHOH、-CHCOH、-(CHCOHから独立して選択され;
各R17は、水素、-CH、(CH、-(CHNH、-X-R31、-(CHCOH、-CHOH、CHC≡CH、および-(CH-トリアゾリル-X-R35から独立して選択され、ここで、zは、1~6であり、R35は、-SOH、-S(O)OH、および-P(O)(OH)から選択され;ただし、少なくとも1つのR17は、水素、-CH、または-CHOH以外であり;
ただし、R30、R31、またはR35の少なくとも1つは存在し;
、R、R、およびRは、それぞれ独立して、水素およびメチルから選択され;
、R、R、R、R、R、R、R、R、R10、R11、R12、およびR13は、天然アミノ酸側鎖および非天然アミノ酸側鎖から独立して選択されるか、または、以下に説明するように対応する隣接するR基と環を形成し;
は、メチルであるか、または、RとRは、それらが結合している原子と一緒になって、アゼチジン、ピロリジン、モルホリン、ピペリジン、ピペラジン、およびテトラヒドロチアゾールから選択される環を形成し;ここで、各環は、アミノ、シアノ、メチル、ハロ、およびヒドロキシから独立して選択される1~4個の基で任意に置換されていてもよく、
は、水素またはメチルであるか、または、RとRは、それらが結合している原子と一緒になって、アゼチジン、ピロリジン、モルホリン、ピペリジン、ピペラジン、およびテトラヒドロチアゾールから選択される環を形成してもよく;ここで、各環は、アミノ、シアノ、メチル、ハロ、ヒドロキシ、およびフェニルから独立して選択される1~4個の基で任意に置換されていてもよく;
は、水素またはメチルであるか、または、RとRは、それらが結合している原子と一緒になって、アゼチジン、ピロリジン、モルホリン、ピペリジン、ピペラジン、およびテトラヒドロチアゾールから選択される環を形成してもよく、ここで、各環は、アミノ、任意にハロ基で置換されていてもよいベンジル、ベンジルオキシ、シアノ、シクロヘキシル、メチル、ハロ、ヒドロキシ、任意にメトキシ基で置換されていてもよいイソキノリニルオキシ、任意にハロ基で置換されていてもよいキノリニルオキシ、およびテトラゾリル、から独立して選択される1~4個の基で任意に置換されていてもよく;ここで。ピロリジンおよびピペリジン環は、シクロヘキシル、フェニル、または、インドール基に任意に縮合されていてもよく;および、
は、メチルであるか、または、RとR12は、それらが結合している原子と一緒になって、アゼチジンおよびピロリジンから選択される環を形成し、ここで、各環は、アミノ、シアノ、メチル、ハロ、およびヒドロキシから独立して選択される1~4個の基で任意に置換されていてもよい。]
で示される化合物、またはその薬学的に許容される塩、を提供する。
第1の実施形態の第1の態様において、本開示は、
Aが、
Figure 2024512074000005
である、式(I)の化合物、またはその薬学的に許容される塩を提供する。
第1の実施形態の第2の態様において、
mは1であり、wは0であり;および、
14、R15、およびR16aは、それぞれ水素である。
第1の実施形態の第3の態様において、
16は、-(C(R17a-X-R30、-(C(R17a17))0-2-X’-R30、および-(C(R17a171-2C(O)NR16am’ -X’-R30から選択される。
第1の実施形態の第4の態様において、
各R17aは、水素、-COH、および-CHCOHから選択され;
Xは、8~46個の原子の鎖であり、その原子は、炭素および酸素から選択され、該鎖は、1、2、または3個の-NHC(O)-、C(O)NH基をその中に埋め込まれて含んでいてもよく;該鎖は、-COH、-C(O)NH、-CHC(O)NH、および-CHCOHから独立して選択される1または2個の基で任意に置換されていてもよく;および、
30は、-SOH、および-P(O)(OH)から選択される。
第1の実施形態の第5の態様において、本開示は、
Aは、
Figure 2024512074000006
であり;
mおよびwは、1であり;
14、R15、およびR16aは、それぞれ水素であり;および、
16は、-C(R17aC(O)N(R16a)C(R17a-X’-R31、および-(C(R17a17))1-2C(O)N(R16a)C(R17a-X’-R31から選択される、
式(I)の化合物、またはその薬学的に許容される塩を提供する。
第1の実施形態の第6の態様において、
各R17aは、水素、-COH、および-CHCOHから選択され;
X’は、8~48個の原子の鎖であり、その原子は、炭素および酸素から選択され、該鎖は、1、2、または3個の-NHC(O)-または-C(O)NH-基をその中に埋め込まれて含んでいてもよく;該鎖は、-COH、-C(O)NH、-CHC(O)NH、および-CHCOHから独立して選択される1または2個の基で任意に置換されていてもよく;ただし、X’は、非置換PEG以外であり、および、
30は、-SOH、および-P(O)(OH)から選択される。
第1の実施形態の第7の態様において、本開示は、
Aは、
Figure 2024512074000007
であり;
mは1であり、wは0であり;
14、R15、およびR16aは、それぞれ水素であり;および、
16は、-C(R17a[C(O)N(R16a)C(R17aw’-X-R31、および-C(R17a171-2[C(O)N(R16a)C(R17a171-2w’-X’-R31から選択される、
式(I)の化合物、またはその薬学的に許容される塩を提供する。
第1の実施形態の第8の態様において、
各R17aは、水素、-COH、および-CHCOHから選択され;
Xは、8~48個の原子の鎖であり、その原子は、炭素および酸素から選択され、該鎖は、1、2、または3個の-NHC(O)-または-C(O)NH-基をその中に埋め込まれて含んでいてもよく;該鎖は、-COH、-C(O)NH、-CHC(O)NH、および-CHCOHから独立して選択される1または2個の基で任意に置換されていてもよく;および、
31は、-SOH、および-P(O)(OH)から選択される。
第1の実施形態の第9の態様において、本開示は、
Aは、
Figure 2024512074000008
であり;
mは1であり、wは0であり;
14、R15、およびR16aは、それぞれ水素であり、および、
16は、-(C(R17a)(R17)C(O)NR16an’-Hである、
式(I)の化合物、またはその薬学的に許容される塩を提供する。
第1の実施形態の第10の態様において、
各R17aは、水素であり;
各R17は、水素、-CH、(CH、-(CHNH、-X-R31
-(CHCOH、-CHOH、CHC≡CH、および-(CH-トリアゾリル-X-R35から選択され;ただし、少なくとも1つのR17は、水素、-CH、または-CHOH以外であり、ただし、少なくとも1つのR31またはR35は、存在し;
zは、1~4であり;
31は、-SOH、および-P(O)(OH)から選択され;
Xは、7~155個の原子の鎖であり、その原子は、炭素および酸素から選択され、該鎖は、1、2、または3個の-NHC(O)-または-C(O)NH-基をその中に埋め込まれて含んでいてもよく;該鎖は、-COH、-C(O)NH、-CHC(O)NH、および-CHCOHから独立して選択される1または2個の基で任意に置換されていてもよく;および、
35は、-SOH、および-P(O)(OH)から選択される。
第1の実施形態の第11の態様において、本開示は、
Aは、
Figure 2024512074000009
であり;
mは1であり、wは0であり;
14、R15、およびR16aは、それぞれ水素であり;
16は、-(CR17a)(R17)C(O)NR16am’-C(R17a)(R17)-COHである、
式(I)の化合物、またはその薬学的に許容される塩を提供する。

第1の実施形態の第12の態様において、
m’は、0~3であり;
各R17aは、水素であり;
各R17は、水素、-CH、(CH、-(CHNH、-X-R31
-(CHCOH、-CHOH、CHC≡CH、および-(CH-トリアゾリル-X-R35から選択され;ただし、少なくとも1つのR17は、水素、-CH、または-CHOH以外であり;ただし、少なくとも1つのR31またはR35は、存在し;
zは、1~4であり;
31は、-SOH、および-P(O)(OH)から選択され;
Xは、10~60個の原子の鎖であり、その原子は、炭素および酸素から選択され、該鎖は、1、2、または3個の-NHC(O)-、-C(O)NH-基をその中に埋め込まれて含んでいてもよく;該鎖は、-COH、-C(O)NH、-CHC(O)NH、および-CHCOHから独立して選択される1または2個の基で任意に置換されていてもよく、および、
35は、-SOH、および-P(O)(OH)から選択される。
第1の実施形態の第13の態様において、本開示は、
は、フェニルC-Cアルキルであり、ここで、フェニル部分は、ヒドロキシル、ハロ、またはメトキシで任意に置換されていてもよく;Rは、C-Cアルキルであるか、または、RとRは、それらが結合している原子と一緒になってピペリジン環を形成し;Rは、NR(C-Cアルキル)、NRカルボニルC-Cアルキル、またはカルボキシC-Cアルキルであり;RとRは、それらが結合している原子と一緒になってピロリジン環を形成し;Rは、ヒドロキシC-Cアルキル、イミダゾリルC-Cアルキル、またはNR(C-Cアルキル)であり;Rは、カルボキシC-Cアルキル、NRカルボニルC-Cアルキル、NR(C-Cアルキル)、またはC-Cアルキルであり;RとRは、それらが結合している原子と一緒になって、任意にヒドロキシで置換されていてもよいピロリジン環を形成し;RおよびR10は、ベンゾチエニルまたはインドリルC-Cアルキルであり、これは、カルボキシC-Cアルキルで任意に置換されていてもよく;Rは、ヒドロキシC-Cアルキル、アミノC-Cアルキル、または、C-Cアルキルであり;R11は、C-CアルコキシC-Cアルキル、またはC-Cアルキルであり;R12は、C-Cアルキル、またはヒドロキシC-Cアルキルであり;および、R13は、C-Cアルキル、カルボキシC-Cアルキル、または-(CHNHC(NH)NHである、
式(I)の化合物、またはその薬学的に許容される塩を提供する。
第1の実施形態の第14の態様において、本開示は、
Aは、
Figure 2024512074000010
であり;
mは1であり、wは0であり;
14およびR15は、それぞれ水素であり;
16aは、水素またはメチルであり;
は、メチルであるか、または、RとRは、それらが結合している原子と一緒になって、アゼチジン、ピロリジン、モルホリン、ピペリジン、ピペラジン、およびテトラヒドロチアゾールから選択される環を形成し;ここで、各環は、アミノ、シアノ、メチル、ハロ、ヒドロキシ、およびフェニルから独立して選択される1または2個の基で任意に置換されていてもよく;および、
は、メチルであるか、または、RとRは、それらが結合している原子と一緒になって、アゼチジン、ピロリジン、モルホリン、ピペリジン、ピペラジン、およびテトラヒドロチアゾールから選択される環を形成し;ここで、各環は、アミノ、任意にハロ基で置換されていてもよいベンジル、ベンジルオキシ、シアノ、シクロヘキシル、メチル、ハロ、ヒドロキシ、任意にメトキシ基で置換されていてもよいイソキノリニルオキシ、任意にハロ基で置換されていてもよいキノリニルオキシ、およびテトラゾリルから独立して選択される1または2個の基で置換されていてもよく;ここで、ピロリジン環およびピペリジン環は、任意にシクロヘキシル、フェニル、またはインドール基に縮合されていてもよい、
式(I)の化合物、またはその薬学的に許容される塩を提供する。
第2の実施形態において、本開示は、式(II)
Figure 2024512074000011
(II)

[式中、
Aは、
Figure 2024512074000012
から選択され;
ここで、
nは、0または、1である。
14およびR15は、独立して、水素およびメチルから選択され;
16aは、水素およびC-Cアルキルから選択され;
16は、
-(C(R17a-X-R30、-(C(R17a17))0-2-X’-R30、-(C(R17a171-2C(O)NR16am’-X’-R30
-C(R17aC(O)N(R16a)C(R17a-X’-R31、-(C(R17a17))1-2C(O)N(R16a)C(R17a-X’-R31
-C(R17a[C(O)N(R16a)C(R17aw’-X-R31、-C(R17a171-2[C(O)N(R16a)C(R17a171-2w’-X’-R31
-(C(R17a)(R17)C(O)NR16an’-H;および、
-(C(R17a)(R17)C(O)NR16am’-C(R17a)(R17)-CO
から選択され;
ここで、PEGq’スペーサーは、R16の任意の部分に挿入されてもよく(q’は、PEGスペーサー内の-(CHCHO)-ユニットの数である)、
ここで、w’は、2または3であり;
n’は、1~6であり;
m’は、0~5であり;
q’は、1~20であり;
Xは、1~172個の原子の鎖であり、その原子は、炭素および酸素から選択され、該鎖は、-NHC(O)-、-NHC(O)NH-、および-C(O)NHから選択される、1、2、3、または4個の基をその中に埋め込まれて含んでいてもよく;該鎖は、-COH、-C(O)NH、-CHC(O)NH、および-CHCOHから独立して選択される1~6個の基で任意に置換されていてもよく、
X’は、1~172個の原子の鎖であり、その原子は、炭素および酸素から選択され、該鎖は、-NHC(O)-、-NHC(O)NH-、および-C(O)NHから選択される、1、2、3または4個の基をその中に埋め込まれて含んでいてもよく;該鎖は、-COH、-C(O)NH、および-CHCOHから独立して選択される1~6個の基で任意に置換されていてもよく、ただし、X’は、非置換のPEG以外であり;
30は、-SOH、-S(O)OH、および-P(O)(OH)から選択され;
31は、-SOH、-S(O)OH、そして、-P(O)(OH)であり;
各R17aは、水素、C-Cアルキル、-CHOH、-CHCOH、-(CHCOHから独立して選択され;
各R17は、水素、-CH、(CH、-(CHNH、-X-R31、-(CHCOH、-CHOH、CHC≡CH、および-(CH-トリアゾリル-X-R35から選択され、ここで、zは、1~6であり、R35は、-S(O)OH、-S(O)OH、および-P(O)(OH)から選択され;ただし、少なくとも1つのR17は、水素、-CH、または-CHOH以外であり;
ただし、R30、R31、またはR35の少なくとも1つは、存在し;R、R、R、R、R、およびRは、水素であり;
およびRは、メチルであり;
は、水素およびメチルから選択され;
、R、R、R、R、R、R、R、R、R10、R11、およびR12は、天然アミノ酸側鎖および非天然アミノ酸側鎖から独立して選択されるか、または、以下に説明するように対応する隣接するR基と環を形成し;
は、水素およびメチルから選択されるか、または、RとRは、それらが結合している原子と一緒になって、アゼチジン、ピロリジン、モルホリン、ピペリジン、ピペラジン、およびテトラヒドロチアゾールから選択される環を形成し;ここで、各環は、アミノ、シアノ、メチル、ハロ、ハロメチル、およびヒドロキシから独立して選択される1~4個の基で任意に置換されていてもよく;
は、水素およびメチルから選択されるか、または、RとRは、それらが結合している原子と一緒になって、アゼチジン、ピロリジン、モルホリン、ピペリジン、ピペラジン、およびテトラヒドロチアゾールから選択される環を形成し;ここで、各環は、アミノ、シアノ、メチル、ハロ、ハロメチル、およびヒドロキシから独立して選択される1~4個の基で任意に置換されていてもよく;
は、水素およびメチルから選択されるか、または、RとRは、それらが結合している原子と一緒になって、アゼチジン、ピロリジン、モルホリン、ピペリジン、ピペラジン、およびテトラヒドロチアゾールから選択される環を形成し;ここで、各環は、アミノ、シアノ、メチル、ハロ、ハロメチル、およびヒドロキシから独立して選択される1~4個の基で任意に置換されていてもよく、および、
は、水素およびメチルから選択されるか、または、RとRは、それらが結合している原子と一緒になって、アゼチジン、ピロリジン、モルホリン、ピペリジン、ピペラジン、およびテトラヒドロチアゾールから選択される環を形成し;ここで、各環は、アミノ、シアノ、メチル、ハロ、ハロメチル、およびヒドロキシから独立して選択される1~4個の基で任意に置換されていてもよい。]
で示される化合物、またはその薬学的に許容される塩を提供する。
第2の実施形態の第1の態様において、本開示は、
Aは、
Figure 2024512074000013
であり;
nは、0であり;
16は、-(CR17a)(R17)C(O)NR16am’-C(R17a)(R17)-COHであり;
各R16aは、水素であり;
m’は、2、3、または4であり;
各R17aは、水素であり;
各R17は、水素、-(CHNH、-X-R31、および-CHC≡CHから独立して選択され;
zは、4であり;
Xは、26~155個の原子の鎖であり、その原子は、炭素および酸素から選択され、該鎖は、1、2、または3個の-NHC(O)-または-C(O)NH-基をその中に埋め込まれて含んでいてもよく;該鎖は、-COH、-C(O)NH、-CHC(O)NH、および-CHCOHから独立して選択される1または2個の基で任意に置換されていてもよく、および、
31は、-S(O)OH、そして、-P(O)(OH)である、
式(II)の化合物、またはその薬学的に許容される塩を提供する。
第3の実施形態において、本開示は、それを必要とする対象における免疫応答を増強、刺激、および/または増加させる方法であって、治療有効量の式(I)の化合物またはその薬学的に許容される塩を対象に投与することを含む方法を提供する。第3の実施形態の第1の態様において、前記方法は、式(I)の化合物またはその薬学的に許容される塩の前、後、またはそれと同時に追加の薬剤を投与することをさらに含む。第2の態様において、追加の薬剤は、抗菌剤、抗ウイルス剤、細胞毒性物質、および/または免疫応答修飾物質である。
第4の実施形態において、本開示は、それを必要とする対象におけるがん細胞の成長、増殖、または転移を阻害する方法であって、治療有効量の式(I)の化合物またはその薬学的に許容される塩を対象に投与することを含む方法を提供する。第4の実施形態の第1の態様において、がんは、黒色腫、腎細胞癌、扁平上皮非小細胞肺癌(NSCLC)、非扁平上皮NSCLC、結腸直腸癌、去勢抵抗性前立腺癌、卵巣癌、胃癌、肝細胞癌、膵臓癌、頭頸部の扁平上皮癌、食道癌、消化管癌、乳癌、および血液悪性腫瘍から選択される。
第5の実施形態において、本開示は、それを必要とする対象における感染症を治療する方法であって、治療有効量の式(I)の化合物またはその薬学的に許容される塩を対象に投与することを含む方法を提供する。第5の実施形態の第1の態様において、感染症は、ウイルスによって引き起こされる。第2の態様において、ウイルスは、HIV、A型肝炎、B型肝炎、C型肝炎、ヘルペスウイルス、およびインフルエンザから選択される。
第6の実施形態において、本開示は、それを必要とする対象における敗血症性ショックを治療する方法であって、治療有効量の式(I)の化合物またはその薬学的に許容される塩を対象に投与することを含む方法を提供する。
第7の実施形態において、本開示は、それを必要とする対象における免疫応答を増強、刺激、および/または増加させる方法であって、治療有効量の式(II)の化合物またはその薬学的に許容される塩を対象に投与することを含む方法を提供する。第7の実施形態の第1の態様において、前記方法は、式(II)の化合物またはその薬学的に許容される塩の前、後、またはそれと同時に追加の薬剤を投与することをさらに含む。第2の態様において、追加の薬剤は、抗菌剤、抗ウイルス剤、細胞毒性物質、および/または免疫応答修飾物質である。第3の態様において、追加の薬剤は、HDAC阻害剤である。第4の形態において、追加の薬剤は、TLR7および/またはTLR8アゴニストである。別の形態において、追加の薬剤は、STING、NLRP3、またはDGK剤である。
第8の実施形態において、本開示は、それを必要とする対象におけるがん細胞の成長、増殖、または転移を阻害する方法であって、治療有効量の式(II)の化合物またはその薬学的に許容される塩を対象に投与することを含む方法を提供する。第8の実施形態の第1の態様において、がんは、黒色腫、腎細胞癌、扁平上皮非小細胞肺癌(NSCLC)、非扁平上皮NSCLC、結腸直腸癌、去勢抵抗性前立腺癌、卵巣癌、胃癌、肝細胞癌、膵臓癌、頭頸部の扁平上皮癌、食道癌、消化管癌、乳癌、および血液悪性腫瘍から選択される。
第9の実施形態において、本開示は、それを必要とする対象における感染症を治療する方法であって、治療有効量の式(II)の化合物またはその薬学的に許容される塩を対象に投与することを含む方法を提供する。第9の実施形態の第1の態様において、感染症は、ウイルスによって引き起こされる。第2の態様において、ウイルスは、HIV、A型肝炎、B型肝炎、C型肝炎、ヘルペスウイルス、およびインフルエンザから選択される。
第10の実施形態において、本開示は、それを必要とする対象における敗血症性ショックを治療する方法であって、治療有効量の式(II)の化合物またはその薬学的に許容される塩を対象に投与することを含む方法を提供する。
式(I)の化合物において、R側鎖が、メチルで置換された環の一部である場合、メチル基は、大環状親構造の一部である炭素を含む、環内の任意の置換可能な炭素原子上にあってもよいことが理解される。
以下の基が各R位置で好ましい。アミノ酸は、D-またはL-の立体化学のいずれであってもよく、本開示の他の箇所に記載されているように置換されていてもよい。
式(I)の化合物において、好ましいRは、フェニルアラニン、チロシン、3-チエン-2-イル、4-メチルフェニルアラニン、4-クロロフェニルアラニン、3-メトキシフェニルアラニン、イソトリプトファン、3-メチルフェニルアラニン、1-ナフチルアラニン、3,4-ジフルオロフェニルアラニン、4-フルオロフェニルアラニン、3,4-ジメトキシフェニルアラニン、3,4-ジクロロフェニルアラニン、4-ジフルオロメチルフェニルアラニン、2-メチルフェニルアラニン、2-ナフチルアラニン、トリプトファン、4-ピリジニル、4-ブロモフェニルラニン、3-ピリジニル、4-トリフルオロメチルフェニルアラニン、4-カルボキシフェニルアラニン、4-メトキシフェニルアラニン、ビフェニルアラニン、および3-クロロフェニルアラニン;および2,4-ジアミノブタン、の側鎖から選択される。
式(I)の化合物において、Rが環の一部ではない場合、好ましいRは、アラニン、セリン、およびグリシンの側鎖から選択される。
式(I)の化合物において、好ましいRは、アスパラギン、アスパラギン酸、グルタミン酸、グルタミン、セリン、オルニチン(Orn)、リジン、ヒスチジン、トレオニン、ロイシン、アラニン、Dap、およびDabの側鎖から選択される。
式(I)の化合物において、Rが環の一部ではない場合、好ましいRは、バリン、アラニン、イソロイシン、およびグリシンの側鎖から選択される。
式(I)の化合物において、好ましいRは、ヒスチジン、アスパラギン、Dap、Dap(COCH)、セリン、グリシン、Dab、Dab(COCH)、アラニン、リジン、アスパラギン酸、アラニン、および3-チアゾリルアラニンの側鎖から選択される。
式(I)の化合物において、好ましいRは、ロイシン、アスパラギン酸、アスパラギン、グルタミン酸、グルタミン、セリン、リジン、3-シクロヘキサン、トレオニン、オルニチン、Dab、アラニン、アルギニン、およびOrn(COCH)の側鎖から選択される。
式(I)の化合物において、Rが環の一部ではない場合、好ましいRは、グリシン、Dab、セリン、リジン、アルギニン、オルニチン、ヒスチジン、アスパラギン、グルタミン、アラニン、およびDab(C(O)シクロブタン)の側鎖から選択される。
式(I)の化合物において、好ましいRは、トリプトファン、および1,2-ベンズイソチアゾリニルアラニンの側鎖から選択される。
式(I)の化合物において、好ましいRは、セリン、ヒスチジン、リジン、オルニチン、Dab、トレオニン、リジン、グリシン、グルタミン酸、バリン、Dap、アルギニン、アスパラギン酸、およびチロシンの側鎖から選択される。
式(I)の化合物において、好ましいR10は、任意に置換されていてもよいトリプトファン、ベンズイソチアゾリルアラニン、1-ナフチルアラニン、メチオニンの側鎖から選択される。
式(I)の化合物において、好ましいR11は、ノルロイシン、ロイシン、アスパラギン、フェニルアラニン、メチオニン、エトキシメタン、アラニン、トリプトファン、イソロイシン、フェニルプロパン、グルタミン酸、ヘキサン、およびヘプタンの側鎖から選択される。
式(I)の化合物において、R12が環の一部ではない場合、好ましいR12は、ノルロイシン、アラニン、エトキシメタン、メチオニン、セリン、フェニルアラニン、メトキシエタン、ロイシン、トリプトファン、イソロイシン、グルタミン酸、ヘキサン、ヘプタン、およびグリシンの側鎖から選択される。
式(I)の化合物において、好ましいR13は、アルギニン、オルニチン、アラニン、Dap、Dab、ロイシン、アスパラギン酸、グルタミン酸、セリン、リジン、トレオニン、シクロプロピルメタン、グリシン、バリン、イソロイシン、ヒスチジン、および2-アミノブタンの側鎖から選択される。
別の実施形態において、本開示は、第1の態様の範囲内の例示された例から選択される化合物、またはその薬学的に許容される塩、互変異性体または立体異性体を提供する。
別の実施形態において、第1の態様の範囲内の化合物の任意のサブセットリストから選択される化合物が提供される。
別の実施形態において、下記:
Figure 2024512074000014
1001

Figure 2024512074000015
1002

Figure 2024512074000016
1003

Figure 2024512074000017
1004

Figure 2024512074000018
1005

Figure 2024512074000019
1006

Figure 2024512074000020
1007

Figure 2024512074000021
1008

Figure 2024512074000022
1009

または
Figure 2024512074000023
1010

で示される化合物、またはその薬学的に許容される塩、が提供される。
別の態様において、本開示は、それを必要とする対象における免疫応答を増強、刺激、および/または増加させる方法であって、治療有効量の式(I)または式(II)の化合物またはその薬学的に許容される塩を対象に投与することを含む方法を提供する。
別の態様において、本開示は、対象においてPD-L1とPD-1および/またはCD80との相互作用を遮断する方法であって、治療有効量の式(I)または式(II)の化合物またはその薬学的に許容される塩を対象に投与することを含む方法を提供する。
別の態様において、本開示は、それを必要とする対象における免疫応答を増強、刺激、および/または増加させる方法であって、治療有効量の式(I)または式(II)の化合物またはその薬学的に許容される塩を対象に投与することを含む方法を提供する。第2の態様の第1の実施形態において、前記方法は、式(I)の化合物、式(I)の化合物、またはその薬学的に許容されるその塩の、前に、後に、または同時に、追加の薬剤を投与することをさらに含む。第2の実施形態において、追加の薬剤は、抗菌剤、抗ウイルス剤、細胞毒性剤、TLR7アゴニスト、TLR8アゴニスト、HDAC阻害剤、STING、NLRP3またはDGK剤、および免疫応答修飾剤から選択される。
別の態様において、本開示は、それを必要とする対象におけるがん細胞の成長、増殖、または転移を阻害する方法であって、治療有効量の式(I)または式(II)の化合物またはその薬学的に許容される塩を対象に投与することを含む方法を提供する。第3の態様の第1の実施形態において、がんは、黒色腫、腎細胞癌、扁平上皮非小細胞肺癌(NSCLC)、非扁平上皮NSCLC、結腸直腸癌、去勢抵抗性前立腺癌、卵巣癌、胃癌、肝細胞癌、膵臓癌、頭頸部の扁平上皮癌、食道癌、消化管癌、乳癌、および血液悪性腫瘍から選択される。
別の態様において、本開示は、それを必要とする対象における感染症を治療する方法であって、治療有効量の式(I)または式(II)の化合物またはその薬学的に許容される塩を対象に投与することを含む方法を提供する。第4の態様の第1の実施形態において、感染症は、ウイルスによって引き起こされる。第2の実施形態において、ウイルスは、HIV、A型肝炎、B型肝炎、C型肝炎、ヘルペスウイルス、およびインフルエンザから選択される。
別の態様において、本開示は、それを必要とする対象における敗血症性ショックを治療する方法であって、治療有効量の式(I)または式(II)の化合物またはその薬学的に許容される塩を対象に投与することを含む方法を提供する。
別の態様において、本開示は、対象においてPD-L1とPD-1および/またはCD80との相互作用を遮断する方法であって、治療有効量の式(I)または式(II)の化合物またはそれらの薬学的に許容される塩を対象に投与することを含む方法を提供する。
特に断りのない限り、満たされていない原子価を有する原子は、その原子価を満たすのに十分な水素原子を有するものとみなされる。
単数形「a」、「an」、および「the」は、文脈上別の指示がない限り、複数の指示対象を含む。
本明細書で使用される「または」という用語は、論理的論理和(すなわち、および/または)であり、「いずれか」、「そうでない場合」、「代替的に」との用語、および同様の効果を持つ文言などで明示的に示されない限り、排他的論理和を示すものではない。
本明細書で使用される「アルキル」という用語は、例えば、1~12個の炭素原子、1~6個の炭素原子、および1~4個の炭素原子を含む、分枝鎖および直鎖の両方の飽和脂肪族炭化水素基を意味する。アルキル基の例としては、これに限定されるものではないが、メチル(Me)、エチル(Et)、プロピル(例えば、n-プロピルおよびi-プロピル)、ブチル(例えば、n-ブチル、i-ブチル、sec-ブチル、およびt-ブチル)、ペンチル(例えば、n-ペンチル、イソペンチル、ネオペンチル)、n-ヘキシル、2メチルペンチル、2-エチルブチル、3-メチルペンチル、および4-メチルペンチルが挙げられる。記号「C」の後の下付き文字に数字が表示される場合、その下付き文字は特定の基に含まれ得る炭素原子の数をより具体的に定義する。例えば、「C1-4アルキル」は、1~4個の炭素原子を有する直鎖および分枝鎖のアルキル基を表す。
本明細書で使用される「シクロアルキル」という用語は、飽和環炭素原子から1個の水素原子を除去することによって非芳香族単環式または多環式炭化水素分子から誘導される基を意味する。シクロアルキル基の代表的な例としては、これに限定されるものではないが、シクロプロピル、シクロペンチル、およびシクロヘキシルが挙げられる。記号「C」の後の下付き文字に数字が表示される場合、その下付き文字は、特定のシクロアルキル基に含まれ得る炭素原子の数をより具体的に定義する。例えば、「C3-6シクロアルキル」は、3~6個の炭素原子を有するシクロアルキル基を表す。
「ヒドロキシアルキル」という用語には、1つ以上のヒドロキシル基で置換された分枝鎖および直鎖の両方の飽和アルキル基が含まれる。例えば、「ヒドロキシアルキル」として、-CHOH、-CHCHOH、およびC1-4ヒドロキシアルキルが挙げられる。
本明細書で使用される「アリール」という用語は、芳香族環を含む分子から、芳香族環に結合している1つの水素を除去することによって誘導される原子団の基を意味する。アリール基の代表的な例としては、これに限定されるものではないが、フェニルおよびナフチルが挙げられる。アリール環は、非置換であってもよく、あるいは原子価が許す限り1つ以上の置換基を含んでいてもよい。
本明細書で使用される「ハロ」および「ハロゲン」という用語は、F、Cl、Br、またはIを意味する。
本発明における芳香族環は、-N-、-S-、および-O-から選択される0~3個のヘテロ原子を含み得る。これらには、以下で定義されるヘテロアリール基も含まれる。
「ヘテロアリール」という用語は、少なくとも1つの環に少なくとも1つのヘテロ原子(O、SまたはN)を有する、置換および非置換の芳香族の5員または6員単環式基および9員または10員二環式基を意味し、前記ヘテロ原子含有環は、好ましくは、O、Sおよび/またはNから独立して選択される1、2、または3個のヘテロ原子を有する。ヘテロ原子を含むヘテロアリール基の各環は、1または2個の酸素または硫黄原子および/または1~4個の窒素原子を含むことができ、ただし、各環のヘテロ原子の総数は4個以下であり、各環は少なくとも1つの炭素原子を有する。二環式基を作る縮合環が芳香族であり、炭素原子のみを含む環の場合がある。窒素原子および硫黄原子は任意に酸化されてもよく、窒素原子は任意に四級化されてもよい。二環式ヘテロアリール基には芳香族環のみが含まれていなければならない。ヘテロアリール基は、任意の環の任意の利用可能な窒素または炭素原子において結合することができる。ヘテロアリール環系は、非置換であってもよく、または1つ以上の置換基を含んでいてもよい。
単環式ヘテロアリール基の例としては、ピロリル、ピラゾリル、ピラゾリニル、イミダゾリル、オキサゾリル、イソオキサゾリル、チアゾリル、チアジアゾリル、イソチアゾリル、フラニル、チオフェニル、オキサジアゾリル、ピリジニル、ピラジニル、ピリミジニル、ピリダジニル、およびトリアジニルが挙げられる。
二環式ヘテロアリール基の例としては、インドリル、ベンゾチアゾリル、ベンゾジオキソリル、ベンゾオキサゾリル、ベンゾチエニル、キノリニル、テトラヒドロイソキノリニル、イソキノリニル、ベンズイミダゾリル、ベンゾピラニル、インドリジニル、ベンゾフラニル、クロモニル、クマリニル、ベンゾピラニル、シンノリニル、キノキサリニル、インダゾリル、およびピロロピリジルが挙げられる。
本明細書で使用される「またはその薬学的に許容される塩」という語句は、少なくとも1つの化合物、または少なくとも1つのその化合物の塩、またはそれらの組み合わせを意味する。例えば、「式(I)の化合物またはその薬学的に許容される塩」には、これに限定されるものではないが、式(I)の化合物、2つの式(I)の化合物、式(I)の化合物の薬学的に許容される塩、式(I)の化合物および式(I)の化合物の1つ以上の薬学的に許容される塩、ならびに、式(I)の化合物の2つ以上の薬学的に許容される塩、が含まれる。
本明細書で使用される「有害事象」または「AE」は、医療処置の使用に関連する、任意の好ましくない、一般に意図されていない、さらには望ましくない兆候(検査所見の異常を含む)、症状、または疾患である。例えば、有害事象は、治療に応じた免疫系の活性化または免疫系細胞(例えば、T細胞)の増殖に関連している可能性がある。医療処置には1つ以上のAEが関連する可能性があり、各AEの重症度レベルは同じであるか異なり得る。「有害事象を変える」ことができる方法への言及は、異なる治療計画の使用に関連する1つ以上のAEの発生率および/または重症度を減少させる治療計画を意味する。
本明細書で使用される「過剰増殖性疾患」とは、細胞増殖が正常レベルを超えて増加している状態を意味する。例えば、過剰増殖性疾患または障害には、悪性疾患(例えば、食道癌、結腸癌、胆道癌)および非悪性疾患(例えば、アテローム性動脈硬化症、良性過形成、および良性前立腺肥大)が含まれる。
「免疫応答」という用語は、例えば、リンパ球、抗原提示細胞、食細胞、顆粒球、および可溶性高分子の作用であって、侵入病原体、病原体に感染した細胞または組織、癌性細胞、あるいは、自己免疫または病的炎症の場合においては正常なヒトの細胞または組織に対する、選択的損傷、破壊、または人体からの排除をもたらす作用を意味する。
「プログラム死リガンド1」、「プログラム細胞死リガンド1」、「PD-L1」、「PDL1」、「hPD-L1」、「hPD-LI」、および「B7-H1」という用語は、交換可能に使用され、ヒトPD-L1の変異体、アイソフォーム、種相同体、およびPD-L1と少なくとも1つの共通エピトープを有する類似体が含まれる。完全なPD-L1配列は、GENBANK(登録商標)Accession No.NP_054862において確認することができる。
「プログラム死1」、「プログラム細胞死1」、「タンパク質PD-1」、「PD-1」、「PD1」、「hPD-1」、および「hPD-1」という用語は、交換可能に使用され、ヒトPD-1の変異体、アイソフォーム、種相同体、および、PD-1と少なくとも1つの共通エピトープを有する類似体が含まれる。完全なPD-1配列は、GENBANK(登録商標)Accession No.U64863において確認することができる。
「治療する」という用語は、疾患、障害、または病気を阻害すること、すなわち、その発症を阻止すること;および、(iii)疾患、障害、または病気を緩和すること、すなわち、疾患、障害、および/または病気の、および/または、疾患、障害、および/または病気に関連する症状の、退行を引き起こすこと、を意味する。
本開示は、本化合物中に存在する原子のすべての同位体を含むことを意図する。同位体には、同じ原子番号を有するが質量数が異なる原子が含まれる。一般的な例として、これに限定されるものではないが、水素の同位体としては、重水素および三重水素が挙げられる。炭素の同位体には、13Cおよび14Cが含まれる。本開示の同位体標識化合物は、一般に、当業者に知られている従来の技術によって、または本明細書に記載のものと類似のプロセスによって、他の方法で使用される非標識試薬の代わりに適切な同位体標識試薬を使用して、調製することができる。このような化合物は、例えば生物学的活性を測定する際の標準物質や試薬など、さまざまな用途に使用できる可能性がある。安定同位体の場合、そのような化合物は、生物学的、薬理学的、または薬物動態学的な特性を有利に改変する可能性がある。
本明細書に記載される主題の追加の態様は、リガンド結合アッセイの開発のため、あるいは、インビボでの吸着、代謝、分布、受容体結合または占有、もしくは化合物配置のモニタリングのための、放射性標識リガンドとしての開示された化合物の使用である。例えば、本明細書に記載の大環状化合物は、放射性同位体を使用して調製することができ、得られた放射性標識化合物を、結合アッセイの開発または代謝研究に使用することができる。あるいは、同様の目的のために、本明細書に記載の大環状化合物は、当業者に知られている方法を使用する触媒トリチウム化によって放射性標識形態に変換することができる。
本開示の大環状化合物は、当業者に知られている方法を使用して、放射性トレーサーを添加することによって、PET造影剤として使用することもできる。
当業者であれば、アミノ酸には、次の一般構造:
Figure 2024512074000024
によって表される化合物が含まれることを知っており、ここで、RおよびR’は本明細書で論じた通りである。特に断りのない限り、本明細書で使用される「アミノ酸」という用語は、単独でまたは別の基の一部として、限定されるものではないが、「α」炭素と呼ばれる同じ炭素に結合したアミノ基およびカルボキシル基を含み、Rおよび/またはR’は、水素を含む天然または非天然の側鎖であり得る。「α」炭素における絶対的な「S」配置は、一般に「L」または「天然」配置と呼ばれる。「R」と「R’」(プライム)の置換基の両方が水素である場合、アミノ酸はグリシンであり、キラルではない。
特に指定しない限り、本明細書に記載されるアミノ酸は、D-またはL-立体化学であり得、本開示の他の箇所に記載されるように置換され得る。立体化学が特定されていない場合、本開示は、PD-1とPD-L1および/またはCD80とPD-L1の間の相互作用を阻害する能力を有するすべての立体化学異性体形態またはその混合物を包含することが理解されるべきである。化合物の個々の立体異性体は、キラル中心を含む商業的に入手可能な出発物質から合成的に行うこと、または、エナンチオマー生成物の混合物を調製し、その後にジアステレオマー混合物へ変換し、その後に分離または再結晶、クロマトグラフィー技術などで分離すること、またはキラルクロマトグラフィーカラムでのエナンチオマーを直接分離することによって、調製することができる。特定の立体化学の出発化合物は商業的に入手可能であるか、または当技術分野で知られている技術によって製造および分取することができる。
本開示の特定の化合物は、分離可能であり得る異なる安定な立体配座形態で存在することができる。例えば立体障害や環のひずみなどにより、非対称な単結合の周りの回転が制限されることによるねじれの非対称性により、異なる配座異性体の分離が可能になる可能性がある。本開示には、これらの化合物の各立体配座異性体およびそれらの混合物が含まれる。
本開示の特定の化合物は、分子のプロトンがその分子内の異なる原子に移動する現象によって生成される化合物である互変異性体として存在することができる。「互変異性体」という用語はまた、平衡状態で存在し、ある異性体から別の異性体に容易に変換される2つ以上の構造異性体のものを意味する。本明細書に記載される化合物のすべての互変異性体は、本開示内に含まれる。
本開示の医薬化合物は、1つ以上の薬学的に許容される塩を含むことができる。「薬学的に許容される塩」とは、親化合物の所望の生物学的活性を保持し、望ましくない毒性作用を与えない塩を意味する(例えば、Berge, S.M. et al., J. Pharm. Sci., 66:1-19 (1977)を参照)。塩は、本明細書に記載の化合物の最終的な単離および精製中に得ることができ、あるいは、化合物の遊離塩基官能基を適切な酸と個別に反応させることによって、または化合物の酸性基を適切な塩基と反応させることによって得ることができる。酸付加塩としては、塩酸、硝酸、リン酸、硫酸、臭化水素酸、ヨウ化水素酸、亜リン酸などの非毒性の無機酸に由来するもの、ならびに、脂肪族モノカルボン酸およびジカルボン酸、フェニル置換アルカン酸、ヒドロキシアルカン酸、芳香族酸、脂肪族および芳香族スルホン酸などの非毒性の有機酸に由来するものが挙げられる。塩基付加塩としては、ナトリウム、カリウム、マグネシウム、カルシウムなどのアルカリ土類金属に由来するもの、ならびに、N,N’-ジベンジルエチレンジアミン、N-メチルグルカミン、クロロプロカイン、コリン、ジエタノールアミン、エチレンジアミン、プロカインなどの非毒性有機アミンに由来するものが挙げられる。
本明細書に記載の治療剤の投与には、これに限定されるものではないが、治療有効量の治療剤の投与が含まれる。本明細書で使用される「治療有効量」という用語は、これに限定されるものではないが、本明細書に記載のPD-1/PD-L1結合阻害剤を含む組成物の投与によって治療可能な症状を治療するための治療剤の量を意味する。その量は、検出可能な治療効果または改善効果を示すのに十分な量である。効果には、これに限定されるものではないが、例えば、本明細書に列挙される症状の治療が含まれ得る。対象に対する正確な有効量は、対象の大きさおよび健康状態、治療される病気の性質および範囲、治療する医師の推奨、および投与のために選択される治療薬または治療薬の組み合わせに依存する。したがって、正確な有効量を事前に指定することは有用ではない。
別の態様において、本開示は、本開示の大環状化合物を使用して対象における腫瘍細胞の増殖を阻害する方法に関する。本明細書で実証されるように、本開示の化合物は、PD-L1に結合することができ、PD-L1とPD-1との間の相互作用を破壊し、PD-L1と既知の抗PD-1モノクローナル抗体との結合と競合して、PD-1との相互作用を遮断し、CMV特異的T細胞のIFNγ分泌を促進し、HIV特異的T細胞のIFNγ分泌を促進することができる。結果として、本開示の化合物は、免疫応答を改変すること、がんまたは感染症などの疾患を治療すること、防御的自己免疫応答を刺激すること、または抗原特異的免疫応答を刺激すること(例えば、目的の抗原とともにするPD-L1阻害化合物の同時投与により)に有用である。
医薬組成物
別の態様において、本開示は、組成物、例えば、薬学的に許容される担体と一緒に製剤化された、本開示内に記載される化合物の1つまたは組み合わせを含む、医薬組成物、を提供する。本開示の医薬組成物は、併用療法で、すなわち、他の薬剤と組み合わせて投与することもできる。例えば、併用療法には、少なくとも1つの他の抗炎症剤または免疫抑制剤と組み合わせた大環状化合物が含まれ得る。併用療法で使用できる治療薬の例は、以下の本開示の化合物の使用に関する欄でより詳細に説明される。
本明細書で使用される「薬学的に許容される担体」としては、生理学的に適合するあらゆる溶媒、分散媒、コーティング剤、抗菌剤および抗真菌剤、等張剤および吸収遅延剤などが挙げられる。いくつかの実施形態において、担体は、静脈内、筋肉内、皮下、非経口、脊髄または表皮の投与(例えば、注射または注入による)に適している。投与経路に応じて、活性化合物を物質でコーティングして、化合物を不活性化する可能性のある酸の作用やその他の自然条件から化合物を保護することができる。
本開示の医薬組成物はまた、薬学的に許容される抗酸化剤を含むことができる。薬学的に許容される抗酸化剤の例としては、(1)水溶性抗酸化剤、例えば、アスコルビン酸、塩酸システイン、重硫酸ナトリウム、メタ重亜硫酸ナトリウム、亜硫酸ナトリウムなど;(2)油溶性抗酸化剤、例えば、パルミチン酸アスコルビル、ブチル化ヒドロキシアニソール(BHA)、ブチル化ヒドロキシトルエン(BHT)、レシチン、没食子酸プロピル、α-トコフェロールなど;および、(3)金属キレート剤、例えば、クエン酸、エチレンジアミン四酢酸(EDTA)、ソルビトール、酒石酸、リン酸など、が挙げられる。
本開示の医薬組成物は、当技術分野で知られている様々な方法のうちの1つ以上を用いて、1つ以上の投与経路を介して投与することができる。当業者に理解されるように、投与経路および/または投与様式は、所望の結果に応じて変化するであろう。いくつかの実施形態において、本開示の大環状化合物の投与経路として、静脈内、筋肉内、皮内、腹腔内、皮下、脊髄または他の非経口投与経路、例えば注射または注入によるもの、が挙げられる。本明細書で使用される「非経口投与」という語句は、通常は注射による、経腸および局所投与以外の投与様式を意味し、これに限定されるものではないが、静脈内、筋肉内、動脈内、くも膜下腔内、嚢内、眼窩内、心臓内、皮内、腹腔内、経気管、皮下、表皮下、関節内、被膜下、くも膜下、脊髄内、硬膜外、および胸骨内(intrasternal)の注射および注入が挙げられる。
滅菌注射液は、必要に応じて、上に列挙した成分の1つまたは組み合わせとともに、必要な量の活性化合物を適切な溶媒に配合し、続いて滅菌精密濾過することによって、調製することができる。一般に、分散液は、塩基性分散媒および上に列挙したものからの必要な他の成分を含有する滅菌ビヒクルに活性化合物を配合することによって調製される。滅菌注射用溶液を調製するための滅菌粉末の場合、いくつかの調製方法は、活性成分に、事前に滅菌濾過されたその溶液からの任意の追加の所望の成分を加えた粉末を得る真空乾燥および凍結乾燥(フリーズドライ)である。
本開示の医薬組成物に使用され得る適切な水性および非水性の担体の例としては、水、エタノール、ポリオール(例えば、グリセロール、プロピレングリコール、ポリエチレングリコールなど)、およびそれらの適切な混合物、オリーブ油などの植物油、オレイン酸エチルなどの注射可能な有機エステル、が挙げられる。適切な流動性は、例えば、レシチンなどのコーティング材料の使用、分散液の場合には必要な粒子サイズの維持、および界面活性剤の使用によって、維持することができる。
これらの組成物はまた、保存剤、湿潤剤、乳化剤および分散剤などの補助剤を含有することもできる。微生物の存在の防止は、上記の滅菌手順と、例えば、パラベン、クロロブタノール、フェノールソルビン酸などの様々な抗菌剤および抗真菌剤の添加の両方によって確実に行うことができる。また、糖、塩化ナトリウムなどの等張剤を組成物に含ませることも望ましい場合がある。さらに、モノステアリン酸アルミニウムやゼラチンなどの吸収を遅らせる薬剤を含ませることによって、注射可能な医薬形態の吸収を延長させることができる。
薬学的に許容される担体として、滅菌水溶液または分散液、および滅菌注射用溶液または分散液を即時調製するための滅菌粉末が挙げられる。薬学的に活性な物質のためのそのような媒体および薬剤の使用は、当技術分野で知られている。従来の媒体または薬剤が活性化合物と不適合である場合を除き、本開示の医薬組成物においてそれらの使用が企図される。補助的な活性化合物を組成物に配合することもできる。
治療用組成物は、典型的には、製造および保管の条件下で無菌かつ安定でなければならない。組成物は、溶液、マイクロエマルション、リポソーム、または高薬物濃度に適した他の規則構造として、製剤化することができる。担体は、例えば、水、エタノール、ポリオール(例えば、グリセロール、プロピレングリコール、および液体ポリエチレングリコールなど)、およびそれらの適切な混合物を含む、溶媒または分散媒であり得る。適切な流動性は、例えば、レシチンなどのコーティング剤の使用、分散の場合には必要な粒子サイズの維持、および界面活性剤の使用によって、維持することができる。多くの場合、組成物中に、等張剤、例えば、糖、マンニトール、ソルビトールなどの多価アルコール、または塩化ナトリウムを含ませることが望ましいであろう。注射可能な組成物の持続的な吸収は、吸収を遅らせる薬剤、例えばモノステアリン酸塩およびゼラチンを組成物中に含ませることによってもたらすことができる。
あるいは、本開示の化合物は、局所、表皮または粘膜投与経路、例えば、鼻腔内、経口、経膣、直腸、舌下または局所などの非経口以外の経路(non-parenteral route)を介して投与することができる。
本明細書で企図される任意の医薬組成物は、例えば、許容される適切な経口製剤を介して経口的に送達され得る。経口製剤の例としては、これに限定されるものではないが、例えば、錠剤、トローチ、飴(lozenge)、水性および油性懸濁液、分散性粉末または顆粒、エマルション、ハードカプセルおよびソフトカプセル、液体カプセル、シロップ、およびエリキシル剤が挙げられる。経口投与を目的とした医薬組成物は、経口投与を目的とした医薬組成物を製造するための当該技術分野で知られている任意の方法に従って製造することができる。薬学的に口当たりのよい製剤を提供するために、本開示に係る医薬組成物は、甘味剤、香味料、着色剤、粘滑剤、抗酸化剤、および保存剤から選択される少なくとも1つの薬剤を含むことができる。
錠剤は、例えば、少なくとも1つの式(I)の化合物および/または少なくとも1つのその薬学的に許容される塩を、錠剤の製造に適した少なくとも1つの非毒性の薬学的に許容される賦形剤と混合することによって、製造することができる。賦形剤の例としては、これに限定されるものではないが、例えば、不活性希釈剤、例えば、炭酸カルシウム、炭酸ナトリウム、ラクトース、リン酸カルシウム、およびリン酸ナトリウムなど;造粒剤および崩壊剤、例えば、微結晶セルロース、クロスカルメロースナトリウム、コーンスターチ、およびアルギン酸など;結合剤、例えば、デンプン、ゼラチン、ポリビニルピロリドン、およびアカシアなど;および、滑沢剤、例えば、ステアリン酸マグネシウム、ステアリン酸、およびタルクなど、が挙げられる。さらに、錠剤は、コーティングしなくてもよく、あるいは、不快な味の薬剤の不快な味をマスキングするため、または、胃腸管内での有効成分の崩壊と吸収を遅らせて、有効成分の効果をより長い時間、持続させるために、既知の技術によってコーティングすることもできる。水溶性味マスキング材料の例としては、これに限定されるものではないが、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、およびヒドロキシプロピルセルロースが挙げられる。時間遅延材料の例としては、これに限定されるものではないが、エチルセルロース、およびセルロースアセテートブチレートが挙げられる。
ハードゼラチンカプセルは、例えば、少なくとも1つの式(I)の化合物および/または少なくとも1つのその塩を、例えば、炭酸カルシウム;リン酸カルシウム;およびカオリンなどの少なくとも1つの不活性固体希釈剤と混合することによって、製造することができる。
ソフトゼラチンカプセルは、例えば、少なくとも1つの式(I)の化合物および/または少なくとも1つのその薬学的に許容される塩を、少なくとも1つの水溶性担体、例えば、ポリエチレングリコールなど;および、少なくとも1つの油媒体、例えば、ピーナッツ油、流動パラフィン、およびオリーブ油など、と混合することによって、製造することができる。
水性懸濁液は、例えば、少なくとも1つの式(I)の化合物および/または少なくとも1つのその薬学的に許容される塩を、水性懸濁液の製造に適した少なくとも1つの賦形剤と混合することによって、製造することができ、これには、これに限定されるものではないが、例えば、懸濁剤、例えば、カルボキシメチルセルロースナトリウム、メチルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、アルギン酸ナトリウム、アルギン酸、ポリビニルピロリドン、トラガカントガム、およびアカシアガムなど;分散剤または湿潤剤、例えば、天然に存在するホスファチド、例えば、レシチンなど;アルキレンオキシドと脂肪酸との縮合生成物、例えば、ポリオキシエチレンステアレート;エチレンオキシドと長鎖脂肪族アルコールとの縮合生成物、例えば、ヘプタデカチレンオキシセタノールなど;エチレンオキシドと、脂肪酸およびヘキシトールから誘導される部分エステルとの縮合生成物、例えば、ポリオキシエチレンソルビトールモノオレエートなど;エチレンオキシドと、脂肪酸およびヘキシトール無水物から誘導される部分エステルとの縮合生成物、例えば、ポリエチレンソルビタンモノオレートなどが挙げられる。水性懸濁液は、少なくとも1つの保存剤、例えば、p-ヒドロキシ安息香酸エチルおよびp-ヒドロキシ安息香酸n-プロピルなど;少なくとも1つの着色剤;少なくとも1つの香味剤;および/または少なくとも1つの甘味料、これに限定されるものではないが、例えば、スクロース、サッカリン、およびアスパルテーム、を含有することもできる
油性懸濁液は、例えば、少なくとも1つの式(I)の化合物および/または少なくとも1つのその薬学的に許容される塩を、例えば、ラッカセイ油、ゴマ油、ココナッツオイルなどの植物油で、または、例えば、流動パラフィンなどの鉱油で、懸濁することによって、製造することができる。油性懸濁液は、例えば、蜜蝋、硬質パラフィン、およびセチルアルコールなどの少なくとも1つの増粘剤を含有することもできる。口当たりのよい油性懸濁液を提供するために、本明細書においてすでに上記に記載した少なくとも1つの甘味剤および/または少なくとも1つの香味剤を油性懸濁液に添加することができる。油性懸濁液は、これに限定されるものではないが、例えば、ブチル化ヒドロキシアニソールおよびα-トコフェロールなどの抗酸化剤を含めた、少なくとも1つの保存剤をさらに含むことができる。
分散性粉末および顆粒は、例えば、少なくとも1つの式(I)の化合物および/または少なくとも1つのその薬学的に許容される塩を、少なくとも1つの分散剤および/または湿潤剤、少なくとも1つの懸濁剤、および/または少なくとも1つの保存剤と混合することによって、製造することができる。適切な分散剤、湿潤剤、および懸濁剤はすでに上記に記載されている。保存剤の例としては、これに限定されるものではないが、例えば、アスコルビン酸などの抗酸化剤が挙げられる。さらに、分散性の粉末および顆粒は、これに限定されるものではないが、例えば、甘味剤、香味剤、および着色剤を含めた少なくとも1つの賦形剤を含むこともできる。
少なくとも1つの式(I)の化合物および/または少なくとも1つのその薬学的に許容される塩のエマルションは、例えば、水中油型エマルションとして、製造することができる。式(I)の化合物を含むエマルションの油相は、既知の成分から既知の方法で構成することができる。油相は、これに限定されるものではないが、例えばオリーブ油およびラッカセイ油などの植物油;例えば流動パラフィンなどの鉱物油;およびそれらの混合物、によって提供され得る。この相は乳化剤のみを含むことができるが、一方、少なくとも乳化剤を含まない、脂肪もしくは油、または脂肪と油の両方との混合物を含むことができる。適切な乳化剤としては、これに限定されるものではないが、例えば、大豆レシチンなどの天然リン脂質、脂肪酸およびヘキシトール無水物から誘導されるエステルまたは部分エステル、例えば、モノレイン酸ソルビタン、および、部分エステルとエチレンオキシドとの縮合生成物、例えば、ポリオキシエチレンソルビタンモノオレエートなど、が挙げられる。いくつかの実施形態において、親水性乳化剤は、安定剤として作用する親油性乳化剤と一緒に含まれる。油と脂肪の両方を含むことが望ましい場合もある。乳化剤は、安定剤の有無にかかわらず、いわゆる乳化ワックスを構成し、ワックスは、油および脂肪とともに、クリーム製剤の油性分散相を形成するいわゆる乳化軟膏基剤を構成する。エマルションはまた、甘味剤、香味剤、保存剤、および/または酸化防止剤を含有することもできる。本開示の製剤に使用するのに適した乳化剤および乳化安定剤として、ツイーン60、スパン80、セトステアリルアルコール、ミリスチルアルコール、モノステアリン酸グリセリル、ラウリル硫酸ナトリウム、ジステアリン酸グリセリルの単独またはワックスとの併用、または当技術分野でよく知られている他の材料が挙げられる。
活性化合物は、インプラント、経皮パッチ、およびマイクロカプセル化送達システムを含む放出制御製剤など、化合物を急速な放出から保護する担体を用いて、製造することができる。エチレン酢酸ビニル、ポリ無水物、ポリグリコール酸、コラーゲン、ポリオルトエステル、およびポリ乳酸などの生分解性、生体適合性のポリマーを使用することができる。このような製剤を製造するための多くの方法は、特許がなされているか、または当業者に一般的に知られている。例えば、Robinson, J.R., ed., Sustained and Controlled Release Drug Delivery Systems, Marcel Dekker, Inc., New York (1978) を参照されたい。
治療組成物は、当技術分野で知られている医療装置を用いて投与することができる。例えば、一実施形態において、本開示の治療組成物は、米国特許第5,399,163号、第5,383,851号、第5,312,335号、第5,064,413号、第4,941,880号、第4,790,824号、または第4,596,556号に開示される装置などの無針皮下注射装置(needleless hypodermic injection device)を用いて投与することができる。本開示において有用なよく知られたインプラントおよびモジュールの例としては、以下が挙げられる:米国特許第4,487,603号、これは、制御された速度で薬剤を分配するための埋め込み型マイクロ注入ポンプを開示し;米国特許第4,486,194号、これは、皮膚を通して薬剤を投与するための治療装置を開示し;米国特許第4,447,233号、これは、正確な注入速度で薬剤を送達するための薬剤注入ポンプを開示し;米国特許第4,447,224号、これは、継続的な薬物送達のための可変流量の埋め込み型注入装置を開示し;米国特許第4,439,196号、これは、複数のチャンバー区画を有する浸透圧薬物送達システムを開示し;米国特許第4,475,196号、これは、浸透圧薬物送達システムを開示している。これらの特許は、参照により本明細書に組み込まれる。他の多くのそのようなインプラント、送達システム、およびモジュールは、当業者に知られている。
特定の実施形態において、本開示の化合物は、インビボで適切な分布を確保するように製剤化することができる。例えば、血液脳関門(BBB)は、多くの親水性の高い化合物を排除する。本開示の治療用化合物は、(所望する場合)BBBを通過することを確実にするために、例えばリポソームで製剤化され得る。リポソームの製造方法については、例えば、米国特許第4,522,811号、第5,374,548号、および第5,399,331号を参照されたい。リポソームは、特定の細胞または器官に選択的に輸送する1つ以上の部分を含むことができ、それにより標的薬物送達を増強することができる(例えば、Ranade, V.V., J. Clin. Pharmacol., 29:685 (1989)を参照)。標的化部分の例として、葉酸またはビオチン(例えば、Lowら、米国特許第5,416,016号を参照);マンノシド(Umezawa et al., Biochem. Biophys. Res. Commun., 153:1038 (1988));大環状化合物(Bloeman, P.G. et al., FEBS Lett., 357:140 (1995); Owais, M. et al., Antimicrob. Agents Chemother., 39:180 (1995));界面活性プロテインA受容体(Briscoe et al., Am. J. Physiol., 1233:134 (1995)); p120 (Schreier et al., J. Biol. Chem., 269:9090 (1994)); Keinanen, K. et al., FEBS Lett., 346:123 (1994); Killion, J.J. et al., Immunomethods 4:273 (1994)も参照)、が挙げられる
1.ペプチド合成
本開示の大環状ペプチドは、当技術分野で知られている方法によって製造することができ、例えば、化学的に、無細胞系における組換えで、または細胞内における組換えで合成することができ、または、生物源から単離することができる。本開示の大環状ペプチドの化学合成は、段階的固相合成、ペプチド断片の立体配座補助再ライゲーションによる半合成、クローン化ペプチドまたは合成ペプチドセグメントの酵素的ライゲーション、およびケミカルライゲーションを含む、当技術分野で認識されている様々な方法を用いて、行うことができる。本明細書に記載の大環状ペプチドおよびその類似体を合成する好ましい方法は、様々な固相技術を用いた化学合成であり、例えば、Chan, W.C. et al, eds., Fmoc Solid Phase Synthesis, Oxford University Press, Oxford (2000); Barany, G. et al, The Peptides: Analysis, Synthesis, Biology, Vol. 2 : "Special Methods in Peptide Synthesis, Part A", pp. 3-284, Gross, E. et al, eds., Academic Press, New York (1980); Atherton, E., Sheppard, R. C. Solid Phase Peptide Synthesis: A Practical Approach, IRL Press, Oxford, England (1989); および Stewart, J. M. Young, J. D. Solid-Phase Peptide Synthesis, 2nd Edition, Pierce Chemical Co., Rockford, IL (1984) に記載されている。好ましい戦略は、α-アミノ基を一時的に保護するための9-フルオレニルメチルオキシカルボニル基(Fmoc)に基づいたものであって、アミノ酸側鎖を一時的に保護するためのtert-ブチル基(tBu)と組み合わせたものである(例えば、Atherton, E. et al, "The Fluorenylmethoxycarbonyl Amino Protecting Group", in The Peptides: Analysis, Synthesis, Biology, Vol. 9 : "Special Methods in Peptide Synthesis, Part C", pp. 1-38, Undenfriend, S. et al, eds., Academic Press, San Diego (1987)を参照)。
ペプチドは、ペプチドのC末端から開始して、不溶性ポリマー支持体(「樹脂」とも称される)上で段階的に合成することができる。合成は、アミドまたはエステル結合の形成を通じてペプチドのC末端アミノ酸を樹脂に付加することによって開始される。これにより、結果として得られるペプチドがそれぞれC末端アミドまたはカルボン酸として最終的に放出するのが可能になる。
合成に使用されるC末端アミノ酸および他のすべてのアミノ酸は、α-アミノ保護基が合成中に選択的に除去され得るように、それらのα-アミノ基および側鎖官能基(存在する場合)が異なる保護性で保護されていることを要する。アミノ酸のカップリングは、そのカルボキシル基を活性エステルとして活性化し、樹脂に付加されたN末端アミノ酸のブロックされていないα-アミノ基と反応させることによって行われる。α-アミノ基の脱保護とカップリングの一連の操作は、ペプチド配列全体が組み立てられるまで繰り返される。その後、通常は副反応を制限する適切なスカベンジャーの存在下で、側鎖官能基の脱保護とともに同時にペプチドを樹脂から放出する。得られたペプチドは最終的に逆相HPLCによって精製される。
最終ペプチドの前駆体として求められるペプチジル樹脂の合成には、商業的に入手可能な架橋ポリスチレンポリマー樹脂(Novabiochem, San Diego, CA; Applied Biosystems, Foster City, CA)が使用される。好ましい固体支持体は以下の通りである:4-(2’,4’-ジメトキシフェニル-Fmoc-アミノメチル)-フェノキシアセチル-p-メチルベンズヒドリルアミン樹脂(RinkアミドMBHA樹脂);9-Fmoc-アミノ-キサンテン-3-イルオキシ-メリフィールド樹脂(シーバーアミド樹脂);4-(9-Fmoc)アミノメチル-3,5-ジメトキシフェノキシ)バレリルアミノメチル-メリフィールド樹脂(PAL樹脂)、C末端カルボキサミド用、が挙げられる。最初のおよびそれに続くアミノ酸のカップリングは、DIC/HOBt、HBTU/HOBt、BOP、PyBOPから、または、DIC/6-Cl-HOBt、HCTU、DIC/HOAtまたはHATUから、それぞれ生成される、HOBt、6-Cl-HOBt、またはHOAt活性エステルを使用して行うことができる。好ましい固体支持体は、保護されたペプチドフラグメントのための、2-クロロトリチルクロリド樹脂、および9-Fmoc-アミノ-キサンテン-3-イルオキシ-メリフィールド樹脂(シーバーアミド樹脂)である。最初のアミノ酸を2-クロロトリチルクロリド樹脂にロードするには、ジクロロメタンおよびDIEA中でFmoc保護アミノ酸を樹脂と反応させるのが最も効果的である。必要に応じて、アミノ酸を可溶化するために少量のDMFを添加してもよい。
本明細書に記載されるペプチド類似体の合成は、CEM Liberty Microwave synthesizer、または、Protein Technologies,Inc. Prelude(6チャンネル)、または、Symphony(12チャンネル)、または、Symphony X(24チャンネル) synthesizerなどの、シングルまたはマルチチャンネルのペプチド合成装置を用いて行うことができる。
有用なFmocアミノ酸誘導体を以下に示す。

固相合成で使用される直交保護アミノ酸(Orthogonally Protected Amino Acid)の例
Figure 2024512074000025
それぞれのペプチドのペプチジル樹脂前駆体は、任意の標準の手順を用いて切断および脱保護することができる(例えば、King, D.S. et al, Int. J. Peptide Protein Res., 36:255-266 (1990)を参照)。望ましい方法では、スカベンジャーとしてTIS、およびジスルフィド還元剤としてDTTまたはTCEPの存在下において、TFAを使用する。典型的には、ペプチジル樹脂を、TFA/TIS/DTT(95:5:1~97:3:1)(v:v:w)(1~3mL/100mgのペプチジル樹脂)中で、室温で1.5~3時間、撹拌する。次いで、使用した樹脂を濾過し、TFA溶液を冷却し、EtO溶液を加える。遠心分離し、エーテル層をデカントすること(3回)によって沈殿物を収集する。得られた粗ペプチドは、分取HPLCによる精製のために、DMF、またはDMSO、またはCHCN/HOに直接再溶解されるか、次のステップに直接使用される。
所望の純度を有するペプチドは、例えば、Waters Model 4000、またはShimadzu Model LC-8A液体クロマトグラフィーによる、分取HPLCを用いた精製によって得ることができる。粗ペプチドの溶液を、YMC S5 ODS(20×100mm)カラムに注入し、どちらも0.1%TFAで緩衝したMeCNを含む水の溶出液を用いて、流速14~20mL/minによってリニアグラジエントで溶出し、217または220nmのUV吸収によってモニタリングする。精製されたペプチドの構造は、エレクトロスプレーMS分析によって確認することができる。
本明細書で参照される非天然アミノ酸のリストを以下に提供する。
Figure 2024512074000026
Figure 2024512074000027
以下の略語は、実施例および本明細書の他の箇所で使用される。
Figure 2024512074000028

Figure 2024512074000029
実施例0001-固相ペプチド合成とペプチドの環化
本実施例に記載の手順、記載されている全体または一部を使用して、表1(後述)に示す大環状ペプチドを合成した。
スキーム1:チオエーテル大環状ペプチドに使用される一般的な合成方法
固相ペプチド合成(SPPS)および大環状化の一般的なプロトコル
Symphonyペプチド合成装置(Protein Technology Inc.、アリゾナ州ツーソン)、Preludeペプチド合成装置(Protein Technology Inc.、アリゾナ州ツーソン)、またはSymphony Xペプチド合成装置(Protein Technology Inc.、アリゾナ州ツーソン)において、Fmoc-Pra-OH(0.100mmol)を予めロードしたクロロトリチル樹脂を、CHCl、次いでDMFで、穏やかにNの流下で混合しながら膨潤させた。溶媒を排出し、次の方法を用いて最初のアミノ酸をカップリングした。30秒ごとに穏やかにN流で撹拌しながら、20%ピペリジンのDMF溶液で樹脂を2回洗浄することによって、樹脂で支持されたビルディングブロックからFmoc基を除去した。樹脂をDMFで5~6回洗浄した。次いで、Fmoc-Gly-OH(0.2MのDMF溶液)を加え、続いてカップリング活性化剤(すなわち、HATU(Chem-Impex Int’l、0.4MのDMF溶液))および塩基(すなわち、N-メチルモルホリン(Aldrich、0.8MのDMF液)を加えた。反応混合物を穏やかな窒素流で1~2時間撹拌した。試薬を反応容器から排出し、樹脂をDMFで5~6回洗浄した。次いで、得られた樹脂に支持されたFmoc保護ジペプチドを順次に脱保護し、3番目のアミノ酸などとのカップリングを繰り返して、目的の樹脂支持生成物を得た。
緩やかな窒素流下、20%ピペリジンのDMF溶液で樹脂を2回洗浄することにより、N末端からFmoc基を除去した。樹脂をDMFで洗浄した(5~6回)。ペプチド-樹脂を、無水クロロ酢酸(0.2MのDMF液)で処理し、続いてNMM(0.8MのDMF液)で処理した。この反応を繰り返した。すべての試薬および溶媒を排出した後、樹脂をDMFおよびDCMで洗浄し、乾燥させた。
LCMS分析を、樹脂から切り出したペプチドのアリコートに対して実施した(分析量を室温で少量のTFA/TIS/DTT(96:4:1)溶液で処理して、目的の直鎖の配列の形成を確認した)。
ペプチドは、TFA/TIS/DTT(96:4:1)溶液で1.5時間処理すると全体的に脱保護され、樹脂から切断された。樹脂を濾過により除去し、少量の切断カクテルで洗浄し、合わせた濾液を冷却したEtOに加えた。溶液を0℃に冷却して、ペプチドを溶液から沈殿させた。スラリーを遠心分離して固体をペレット化し、上清をデカントした。新しいEtOを加え、このプロセスを3回繰り返して固体を洗浄した。風乾した固体に、DIEA/DMF(DMF40~45mL中にDIEA1~3mL)の溶液、または0.1MのNHHCO/アセトニトリル(1/1~3/1(v/v))の溶液を加えて、溶液のpHを8よりも大きくした。溶液を16~72時間撹拌し、LCMSによってモニタリングした。反応溶液を分取逆相HPLCで精製し、目的の生成物を得た。
一般的な分析プロトコルおよび合成方法
分析データ
質量分析:「ESI-MS(+)」は、正イオンモードで実施されるエレクトロスプレーイオン化質量分析を意味し、「ESI-MS(-)」は、負イオンモードで実施されるエレクトロスプレーイオン化質量分析を意味し、「ESI-HRMS(+)」は、正イオンモードで実施される高分解能エレクトロスプレーイオン化質量分析を意味し、「ESI-HRMS(-)」は、負イオンモードで実施される高分解能エレクトロスプレーイオン化質量分析を意味する。検出された質量は、「m/z」単位指定に従って報告される。正確な質量が1000を超える化合物は、多くの場合、2価または3価のイオンとして検出される。
粗物質を分取LC/MSにより精製した。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。
LC/MS分析条件A
カラム:Waters Acquity UPLC BEH C18、2.1×50mm、1.7μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、10mM酢酸アンモニウム含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、10mM酢酸アンモニウム含有;温度:50℃;グラジエント:3分間で0~100%B、その後100%Bで0.75分間保持;流速:1.0mL/分;検出:220nmのUV。
LC/MS分析条件B
カラム:Waters Acquity UPLC BEH C18、2.1×50mm、1.7μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.1%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.1%トリフルオロ酢酸含有;温度:50℃;グラジエント:3分間で0~100%B、その後100%Bで0.75分間保持;流速:1.0mL/分;検出:220nmのUV。
LC/MS分析条件C
カラム:Waters Acquity UPLC BEH C18、2.1×50mm、1.7μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、10mM酢酸アンモニウム含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、10mM酢酸アンモニウム含有;温度:70℃;グラジエント:3分間で0~100%B、その後100%Bで2.0分間保持;流速:0.75mL/分;検出:220nmのUV。
LC/MS分析条件D
カラム:Waters Acquity UPLC BEH C18、2.1×50mm、1.7μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.1%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.1%トリフルオロ酢酸含有;温度:70℃;グラジエント:3分間で0~100%B、その後100%Bで2.0分間保持;流速:0.75mL/分;検出:220nmのUV。
LC/MS分析条件E
カラム:Kinetex XB C18、3.0×75mm、2.6μm粒子;移動相A:10mMギ酸アンモニウムの水:アセトニトリル(98:2);移動相B:10mMギ酸アンモニウムの水:アセトニトリル(02:98);グラジエント:4分間で20~100%B、その後100%Bで0.6分間保持;流速:1.0mL/分;検出:254nmのUV。
LC/MS分析条件F
カラム:Ascentis Express C18、2.1×50mm、2.7μm粒子;移動相A:10mM酢酸アンモニウムの水:アセトニトリル(95:5);移動相B:10mM酢酸アンモニウムの水:アセトニトリル(05:95);温度:50℃;グラジエント:3分間で0~100%B;流速:1.0mL/分;検出:220nmのUV。
LC/MS分析条件G
カラム:X Bridge C18、4.6×50mm、5μm粒子;移動相A:0.1%TFA水;移動相B:アセトニトリル、温度:35℃;グラジエント:4分間で5~95%B;流速:4.0mL/分;検出:220nmのUV。
LC/MS分析条件H
カラム:X Bridge C18、4.6×50mm、5μm粒子;移動相A:10mMのNHOAc;移動相B:メタノール、温度:35℃;グラジエント:4分間で5~95%B;流速:4.0mL/分;検出:220nmのUV。
LC/MS分析条件I
カラム:X Bridge C18、4.6×50mm、5μm粒子;移動相A:10mMのNHOAc;移動相B:アセトニトリル、温度:35℃;グラジエント:4分間で5~95%B;流速:4.0mL/分;検出:220nmのUV。
LC/MS分析条件J
カラム:Waters Acquity UPLC BEH C18、2.1×50mm、1.7μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;温度:70℃;グラジエント:1.5分間で0~100%B、その後100%Bで2.0分間保持;流速:0.75mL/分;検出:254nmのUV。
LC/MS分析条件K
カラム:Waters Acquity UPLC BEH C18、2.1×50mm、1.7μm粒子;移動相A:100%水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:100%アセトニトリル、0.05%トリフルオロ酢酸含有;温度:50℃;グラジエント:1.0分間で2~98%B、その後98%Bで1.0~1.5分間保持;流速:0.80mL/分;検出:220nmのUV。
LC/MS分析条件L
カラム:Waters Acquity UPLC BEH C18、2.1×50mm、1.7μm粒子;緩衝液:10mM酢酸アンモニウム;移動相A:緩衝液とCHCN(95/5);移動相B:緩衝液:ACN(5:95);温度:50℃;グラジエント:2.0分間で20~98%B、その後100%Bで0.2分間保持;流速:0.70mL/分;検出:220nmのUV。
LC/MS分析条件M
カラム:Waters Acquity UPLC BEH C18、3.0×50mm、1.7μm粒子;移動相A:95%水および0.1%トリフルオロ酢酸含有の5%水;移動相B:95%アセトニトリルおよび0.1%トリフルオロ酢酸含有の5%水;温度:50℃;グラジエント:2.0分間で20~100%B、その後100%Bで2.0~2.3分間保持;流速:0.7mL/分;検出:220nmのUV。
LC/MS分析条件N
カラム:Waters Acquity UPLC BEH C18、2.1×50mm、1.7μm粒子;移動相A:100%水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:100%アセトニトリル、0.05%トリフルオロ酢酸含有;温度:50℃;グラジエント:5.0分間で2~98%B、その後98%Bで5.0~5.5分間保持;流速:0.80mL/分;検出:220nmのUV。
LC/MS分析条件O
カラム:Waters Acquity UPLC BEH C18、2.1×50mm、1.7μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;温度:50℃;グラジエント:2分間で2%~98%B、その後98%Bで0.5分間保持;流速:0.8mL/分;検出:220nmのUV。
LC/MS分析条件P
カラム:Waters Acquity UPLC BEH C18、2.1×50mm、1.7μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;温度:50℃;グラジエント:3分間で0%~100%B、その後100%Bで0.5分間保持;流速:1.0mL/分;検出:220nmのUV。
LC/MS分析条件Q
カラム:Waters Acquity UPLC BEH C18、2.1×50mm、1.7μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;温度:50℃;グラジエント:1分間で0%~100%B、その後100%Bで0.5分間保持;流速:1.0mL/分;検出:220nmのUV。
LC/MS分析条件R
カラム:Waters Acquity UPLC BEH C18、2.1×50mm、1.7μm粒子;緩衝液:10mM酢酸アンモニウム;移動相A:緩衝液とCHCN(95/5);移動相B:緩衝液:ACN(5:95);温度:50℃;グラジエント:1分間で0%~100%B、その後100%Bで0.5分間保持;流速:1.0mL/分;検出:220nmのUV。
LC/MS分析条件S
カラム:Waters Acquity UPLC BEH C18、2.1×50mm、1.7μm粒子;移動相A:100%水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:100%アセトニトリル、0.05%トリフルオロ酢酸含有;グラジエント:1.6分間で2~98%B、その後98%Bで0.2分間保持;流速:0.80mL/分;検出:220nmのUV。
LC/MS分析条件T
カラム:Waters Acquity UPLC BEH C18、2.1×50mm、1.7μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;グラジエント:2.6分間で2%~98%B、その後98%Bで0.4分間保持;流速:0.8mL/分;検出:220nmのUV。
LC/MS分析条件U
カラム:Waters Acquity UPLC BEH C18、2.1×50mm、1.7μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、10mM酢酸アンモニウム含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、10mM酢酸アンモニウム含有;グラジエント:3分間で30~100%B、その後100%Bで0.75分間保持;流速:1.0mL/分;検出:220nmのUV。
一般的な手順
Prelude(プレリュード)法
全ての操作は、Preludeペプチド合成装置(Protein Technologies)を用いて自動化して実施した。特に断りのない限り、すべての手順は底部にフリットを備えた45mLポリプロピレン反応容器で実施した。反応容器は、容器の底部と上部の両方を介してPreludeペプチド合成装置に接続されている。DMFおよびDCMは容器の上部から加えることができ、これは容器の側面を均等に洗い流す。残りの試薬は反応容器の底部から加えられ、フリットを通過して樹脂と接触する。すべての溶液は反応容器の底部から除去される。「定期的な撹拌」とは、底部フリットを通過するNガスの短いパルスを意味し、パルスは約5秒続き、30秒ごとに発生する。アミノ酸溶液は、通常、調製から2週間を超えて使用しない。HATU溶液は、調製後7~14日以内に使用した。
シーバーアミド樹脂=9-Fmoc-アミノキサンテン-3-イルオキシ-ポリスチレン樹脂、ここで、「3-イルオキシ」は、ポリスチレン樹脂への結合の位置およびタイプを表す。使用される樹脂は、シーバー(Sieber)リンカー(窒素においてFmoc保護)を有するポリスチレンであり、100-200メッシュ、1%DVB、0.71mmol/gローディングである。
Rink=(2,4-ジメトキシフェニル)(4-アルコキシフェニル)メタンアミン、ここで、「4-アルコキシ」は、ポリスチレン樹脂への結合の位置およびタイプを表す。使用される樹脂は、リンク(Rink)リンカー(窒素においてFmoc保護)を有するメリフィールド(Merrifield)ポリマー(ポリスチレン)であり、100-200メッシュ、1%DVB、0.56mmol/gローディングである。
2-クロロトリチルクロリド樹脂(2-クロロトリフェニルメチルクロリド樹脂)、50-150メッシュ、1%DVB、1.54mmol/gローディング。Fmoc-グリシン-2-クロロトリチルクロリド樹脂、200-400メッシュ、1%DVB、0.63mmol/gローディング。
PL-FMP樹脂:(4-ホルミル-3-メトキシフェノキシメチル)ポリスチレン。
使用される一般的なアミノ酸を以下に列挙し、括弧内に側鎖保護基を示す:
Fmoc-Ala-OH;Fmoc-Arg(Pbf)-OH;Fmoc-Asn(Trt)-OH;Fmoc-Asp(tBu)-OH;Fmoc-Bip-OH;Fmoc-Cys(Trt)-OH;Fmoc-Dab(Boc)-OH;Fmoc-Dap(Boc)-OH;Fmoc-Gln(Trt)-OH;Fmoc-Gly-OH;Fmoc-His(Trt)-OH;Fmoc-Hyp(tBu)-OH;Fmoc-Ile-OH;Fmoc-Leu-OH;Fmoc-Lys(Boc)-OH;Fmoc-Nle-OH;Fmoc-Met-OH;Fmoc-[N-Me]Ala-OH;Fmoc-[N-Me]Nle-OH;Fmoc-Orn(Boc)-OH,Fmoc-Phe-OH;Fmoc-Pro-OH;Fmoc-Sar-OH;Fmoc-Ser(tBu)-OH;Fmoc-Thr(tBu)-OH;Fmoc-Trp(Boc)-OH;Fmoc-Tyr(tBu)-OH;Fmoc-Val-OH、およびそれらに対応するD-アミノ酸。
「Prelude法」の手順は、0.100mmolスケールで実施される実験を表しており、ここで、スケールは、SieberまたはRinkまたは2-クロロトリチルまたはPL-FMP樹脂の量によって決定される。このスケールは、上記のシーバーアミド樹脂の約140mgに相当する。すべての手順は、記載されている量をスケールの倍数で調整することで、0.100mmolスケールからスケールダウンまたはスケールアップできる。アミノ酸カップリングの前に、すべてのペプチド合成シーケンスは、以下で「樹脂膨潤手順」として説明する樹脂膨潤手順から開始した。アミノ酸の第一級アミンN末端へのカップリングには、以下に説明する「シングルカップリング手順」を使用した。第二級アミンのN末端、またはArg(Pbf)-およびD-Arg(Pbf)-のN末端へのアミノ酸のカップリングには、下記の「ダブルカップリング手順」を使用した。
樹脂膨潤手順
45mLのポリプロピレン固相反応容器に、シーバーアミド樹脂(140mg、0.100mmol)を加えた。樹脂を次のように2回洗浄(膨潤)した。反応容器に、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え「DMFトップ洗浄」し、混合物を10分間定期的に撹拌した後、フリットを通して溶媒を排出した。
シングルカップリング手順
前のステップからの樹脂を含む反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80、v/v、5.0mL)を加えた。混合物を5.0分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。反応容器にピペリジン:DMF(20:80、v/v、5.0mL)を加えた。混合物を5.0分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。樹脂を次のように連続して6回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(6.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に1.0分間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中0.2M、5.0mL、10当量)、次いで、HATU(DMF中0.4M、2.5mL、10当量)、最後にNMM(DMF中0.8M、2.5mL、20当量)を加えた。混合物を60~120分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように連続して4回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に1.0分間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。得られた樹脂を次のステップで直接使用した。
ダブルカップリング手順
前のステップからの樹脂を含む反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80、v/v、5.0mL)を加えた。混合物を5.0分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。反応容器にピペリジン:DMF(20:80、v/v、5.0mL)を加えた。混合物を5.0分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。樹脂を次のように連続して6回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(6.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に1.0分間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中0.2M、5.0mL、10当量)、次いで、HATU(DMF中0.4M、2.5mL、10当量)、最後にNMM(DMF中0.8M、2.5mL、20当量)を加えた。混合物を1~1.5時間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように連続して2回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に1.0分間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中0.2M、5.0mL、10当量)、次いで、HATU(DMF中0.4M、2.5mL、10当量)、最後にNMM(DMF中0.8M、2.5mL、20当量)を加えた。混合物を1~1.5時間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように連続して4回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に1.0分間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。得られた樹脂を次のステップで直接使用した。
シングルカップリングの手動添加手順A
前のステップからの樹脂を含む反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80、v/v、5.0mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。反応容器にピペリジン:DMF(20:80、v/v、5.0mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。樹脂を次のように連続して6回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応を一時停止した。反応容器を開け、DMF(1~2mL)液の非天然アミノ酸(2~4当量)を、容器の底を機器に取り付けたまま、容器の上部からピペットを使用して手動で加え、次いで、容器を閉じた。自動プログラムを再開し、HATU(DMF中0.4M、1.3mL、4当量)、およびNMM(DMF中1.3M、1.0mL、8当量)を順次加えた。混合物を2~3時間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように連続して5回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。得られた樹脂を次のステップで直接使用した。
シングルカップリングの手動添加手順B
前のステップからの樹脂を含む反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80、v/v、5.0mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。反応容器にピペリジン:DMF(20:80、v/v、5.0mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。樹脂を次のように連続して6回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応を一時停止した。反応容器を開け、DMF(1~1.5mL)液の非天然アミノ酸(2~4当量)を、容器の底を機器に取り付けたまま、容器の上部からピペットを使用して手動で加え、続いて、HATU(2~4当量、非天然アミノ酸と同じ当量)を手動で加え、次いで、容器を閉じた。自動プログラムを再開し、NMM(DMF中1.3M、1.0mL、8当量)を順次加えた。混合物を2~3時間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように連続して5回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。得られた樹脂を次のステップで直接使用した。
ペプトイドのインストール(50μmol)手順
前のステップからの樹脂を含む反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80、v/v、4.0mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。反応容器にピペリジン:DMF(20:80、v/v、4.0mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。樹脂を次のように連続して6回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に60秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応容器にブロモ酢酸(DMF中0.4M、2.0mL、16当量)、次いで、DIC(DMF中0.4M、2.0mL、16当量)を加えた。混合物を1時間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように連続して5回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応容器にアミン(DMF中0.4M、2.0mL、16当量)を加えた。混合物を1時間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように連続して5回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。得られた樹脂を次のステップで直接使用した。
無水クロロ酢酸カップリング
前のステップからの樹脂を含む反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80、v/v、5.0mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。反応容器にピペリジン:DMF(20:80、v/v、5.0mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。樹脂を次のように連続して6回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(6.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に1分間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応容器に無水クロロ酢酸溶液(DMF中0.4M、5.0mL、20当量)、次いで、N-メチルモルホリン(DMF中0.8M、5.0mL、40当量)を加えた。混合物を15分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように2回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(6.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に1分間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応容器に無水クロロ酢酸溶液(DMF中0.4M、5.0mL、20当量)、次いで、N-メチルモルホリン(DMF中0.8M、5.0mL、40当量)を加えた。混合物を15分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように連続して5回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(6.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に1分間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。樹脂を次のように連続して4回洗浄した。洗浄ごとに、DCM(6.0mL)を容器の上部から加え、得られた混合物を定期的に1分間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。次いで、樹脂を窒素流で10分間乾燥させた。得られた樹脂を次のステップで直接使用した。
Symphony(シンフォニー)法
全ての操作は、12チャンネルのSymphonyペプチド合成装置(Protein Technologies)を用いて自動化して実施した。特に断りのない限り、すべての手順は底部にフリットを備えた25mLポリプロピレン反応容器内で実施した。反応容器は、容器の底部と上部の両方を介してSymphonyペプチド合成装置に接続されている。DMFおよびDCMは容器の上部から加えることができ、容器の側面を均等に洗い流す。残りの試薬は反応容器の底部から加えられ、フリットを通過して樹脂と接触する。すべての溶液は反応容器の底部から除去される。「定期的な撹拌」とは、底部フリットを通過するNガスの短いパルスを意味し、パルスは約5秒続き、30秒ごとに発生する。アミノ酸溶液は、通常、調製から2週間を超えて使用しない。HATU溶液は、調製後7~14日以内に使用した。
シーバーアミド樹脂=9-Fmoc-アミノキサンテン-3-イルオキシ-ポリスチレン樹脂、ここで、「3-イルオキシ」は、ポリスチレン樹脂への結合の位置およびタイプを表す。使用される樹脂は、シーバー(Sieber)リンカー(窒素においてFmoc保護)を有するポリスチレンであり、100-200メッシュ、1%DVB、0.71mmol/gローディングである。
Rink=(2,4-ジメトキシフェニル)(4-アルコキシフェニル)メタンアミン、ここで、「4-アルコキシ」は、ポリスチレン樹脂への結合の位置およびタイプを表す。使用される樹脂は、リンク(Rink)リンカー(窒素においてFmoc保護)を有するメリフィールド(Merrifield)ポリマー(ポリスチレン)であり、100-200メッシュ、1%DVB、0.56mmol/gローディングである。
2-クロロトリチルクロリド樹脂(2-クロロトリフェニルメチルクロリド樹脂)、50-150メッシュ、1%DVB、1.54mmol/gローディング。
PL-FMP樹脂:(4-ホルミル-3-メトキシフェノキシメチル)ポリスチレン。
Fmoc-グリシン-2-クロロトリチルクロリド樹脂、200-400メッシュ、1%DVB、0.63mmol/gローディング。
使用される一般的なアミノ酸を以下に列挙し、括弧内に側鎖保護基を示す:
Fmoc-Ala-OH;Fmoc-Arg(Pbf)-OH;Fmoc-Asn(Trt)-OH;Fmoc-Asp(tBu)-OH;Fmoc-Bip-OH;Fmoc-Cys(Trt)-OH;Fmoc-Dab(Boc)-OH;Fmoc-Dap(Boc)-OH;Fmoc-Gln(Trt)-OH;Fmoc-Gly-OHFmoc-Gly-OH;Fmoc-His(Trt)-OH;Fmoc-Hyp(tBu)-OH;Fmoc-Ile-OH;Fmoc-Leu-OH;Fmoc-Lys(Boc)-OH;Fmoc-Nle-OH;Fmoc-Met-OH;Fmoc-[N-Me]Ala-OH;Fmoc-[N-Me]Nle-OH;Fmoc-Orn(Boc)-OH,Fmoc-Phe-OH;Fmoc-Pro-OH;Fmoc-Sar-OH;Fmoc-Ser(tBu)-OH;Fmoc-Thr(tBu)-OH;Fmoc-Trp(Boc)-OH;Fmoc-Tyr(tBu)-OH;Fmoc-Val-OH、およびそれらに対応するD-アミノ酸。
「Symphony法」の手順は、0.05mmolスケールで実施される実験を表しており、ここで、スケールは、樹脂に結合したSieberまたはRinkまたはクロロトリチルリンカーまたはPL-FMPの量によって決定される。このスケールは、上記のSieber樹脂の約70mgに相当する。すべての手順は、記載されている量をスケールの倍数で調整することで、0.05mmolスケールからスケールアップできる。
アミノ酸カップリングの前に、すべてのペプチド合成シーケンスは、以下で「樹脂膨潤手順」として説明する樹脂膨潤手順から開始した。アミノ酸の第一級アミンN末端へのカップリングには、以下に説明する「シングルカップリング手順」を使用した。第二級アミンのN末端、またはArg(Pbf)-およびD-Arg(Pbf)-のN末端へのアミノ酸のカップリングには、下記の「ダブルカップリング手順」を使用した。
樹脂膨潤手順
25mLのポリプロピレン固相反応容器に、樹脂(0.05mmol)を加えた。樹脂を次のように洗浄(膨潤)した。反応容器にDMF(2.0~3.0mL、1~2回)を加え、混合物を10分間定期的に撹拌した後、フリットを通して溶媒を排出した。場合によっては、樹脂を次のように洗浄(膨潤)した。反応容器にCHCl(3~5mL、2回)を加え、混合物を30分間定期的に撹拌し、フリットを通して溶媒を排出した。次いで、DMF(2.0~3.0mL、1~6回)を加え、混合物を2~10分間定期的に撹拌した後、フリットを通して溶媒を排出した。
シングルカップリング手順
前のステップからの樹脂を含む反応容器に、DMF(2.5~3.75mL)を3回加え、その際、混合物を30秒間撹拌した後、各回フリットを通して溶媒を排出した。樹脂にピペリジン:DMF(20:80、v/v、3.0~3.75mL)を加えた。混合物を5.0分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。反応容器にピペリジン:DMF(20:80、v/v、3.0~3.75mL)を加えた。混合物を5.0分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。場合によっては、脱保護ステップが3回実施された。樹脂を次のように連続して6回洗浄した。洗浄ごとに、DMF(2.5~3.75mL)を容器に加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中0.2M、2.0~2.5mL、8~10当量)、次いで、HATU(DMF中0.4M、1.0~1.25mL、8~10当量)、最後にNMM(DMF中0.8M、1.0~1.25mL、20当量)を加えた。混合物を30~120分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように連続して6回洗浄した。洗浄ごとに、DMF(2.5~3.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。得られた樹脂を次のステップで直接使用した。
シングルカップリングの手動添加手順
前のステップからの樹脂を含む反応容器に、DMF(3.0~3.75mL)を3回加え、その際、混合物を30秒間撹拌した後、各回フリットを通して溶媒を排出した。樹脂にピペリジン:DMF(20:80、v/v、3.0~3.75mL)を加えた。混合物を5.0分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。反応容器にピペリジン:DMF(20:80、v/v、3.0~3.75mL)を加えた。混合物を5.0分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。混合物を5.0分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。樹脂を次のように連続して6回洗浄した。洗浄ごとに、DMF(3.0~3.75mL)を容器に加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応容器に、予め混合したアミノ酸(2.0~5.0当量)およびHATU(DMF中0.4M、2.0~5.0当量)、次いで、NMM(DMF中0.8M、4.0~10.0当量)を、アミノ酸、HATUおよびNMMのモル比、1:1:2で、加えた。混合物を2~6時間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように連続して4回洗浄した。洗浄ごとに、DMF(3.75mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。得られた樹脂を次のステップで直接使用した。
ダブルカップリング手順
前のステップからの樹脂を含む反応容器に、DMF(2.5~3.75mL)を3回加え、その際、混合物を30秒間撹拌した後、各回フリットを通して溶媒を排出した。反応容器にピペリジン:DMF(20:80、v/v、3.0~3.75mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。反応容器にピペリジン:DMF(20:80、v/v、3.0~3.75mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。樹脂を次のように連続して6回洗浄した。洗浄ごとに、DMF(3.0~3.75mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中0.2M、2.0~2.5mL、8~10当量)、次いで、HATU(DMF中0.4M、1.0~1.25mL、10当量)、最後にNMM(DMF中0.8M、1.0~1.25mL、16~20当量)を加えた。混合物を1時間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂をDMF(3.0~3.75mL)で2回洗浄し、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、各回フリットを通して溶液を排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中0.2M、2.0~2.5mL、8~10当量)、次いで、HATU(DMF中0.4M、1.0~1.25mL、8~10当量)、最後にNMM(DMF中0.8M、1.0~1.25mL、16~20当量)を加えた。混合物を1~2時間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように連続して6回洗浄した。洗浄ごとに、DMF(3.0~3.75mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。得られた樹脂を次のステップで直接使用した。
ペプトイドのインストール(50μmol)手順
前のステップからの樹脂を含む反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80、v/v、3.75mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。反応容器にピペリジン:DMF(20:80、v/v、3.75mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。樹脂を次のように連続して6回洗浄した。洗浄ごとに、DMF(3.75mL)を容器に加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応容器にブロモ酢酸(DMF中0.4M、2.5mL、10当量)、次いで、DIC(DMF中0.4M、2.5mL、10当量)を加えた。混合物を60分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように連続して2回洗浄した。洗浄ごとに、DMF(3.75mL)を容器に加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応容器にアミン(DMF中0.4M、2.5mL、10当量)を加え、混合物を60分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように連続して5回洗浄した。洗浄ごとに、DMF(3.75mL)を容器に加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。得られた樹脂を次のステップで直接使用した。
無水クロロ酢酸カップリング
前のステップからの樹脂を含む反応容器に、DMF(3.0~3.75mL)を3回加え、その際、混合物を30秒間撹拌した後、各回フリットを通して溶媒を排出した。前のステップからの樹脂を含む反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80、v/v、3.0~3.75mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。反応容器にピペリジン:DMF(20:80、v/v、3.0~3.75mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。樹脂を次のように連続して6回洗浄した。洗浄ごとに、DMF(3.0~3.75mL)を容器の上部から加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応容器に無水クロロ酢酸溶液(DMF中0.4M、3.0~3.75mL、30当量)、次いで、NMM(DMF中0.8M、2.5mL、40当量)を加えた。混合物を15分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように1回洗浄した。DMF(5.0~6.25mL)を容器の上部から加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応容器に無水クロロ酢酸溶液(DMF中0.4M、3.75mL、30当量)、次いで、NMM(DMF中0.8M、2.5mL、40当量)を加えた。混合物を15分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように連続して6回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(2.5mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。樹脂を次のように連続して4回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDCM(2.5mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。得られた樹脂を、窒素流を使用して10分間乾燥させた後、次のステップで直接使用した。
Symphony X(シンフォニーX)法
全ての操作は、Symphony Xペプチド合成装置(Protein Technologies)を用いて自動化して実施した。特に断りのない限り、すべての手順は底部にフリットを備えた45mLポリプロピレン反応容器で実施した。反応容器は、容器の底部と上部の両方を介してSymphony Xペプチド合成装置に接続されている。DMFおよびDCMは容器の上部から加えることができ、容器の側面を均等に洗い流す。残りの試薬は反応容器の底部から加えられ、フリットを通過して樹脂と接触する。すべての溶液は反応容器の底部から除去される。「定期的な撹拌」とは、底部フリットを通過するNガスの短いパルスを意味し、パルスは約5秒続き、30秒ごとに発生する。「シングルショット」添加モードとは、シングルショットファルコンチューブに含まれるすべての溶液(通常は5mL未満の任意の体積)を添加することを意味する。アミノ酸溶液は、通常、調製から2週間を超えて使用しない。HATU溶液は、調製後14日以内に使用した。
シーバーアミド樹脂=9-Fmoc-アミノキサンテン-3-イルオキシ-ポリスチレン樹脂、ここで、「3-イルオキシ」は、ポリスチレン樹脂への結合の位置およびタイプを表す。使用される樹脂は、シーバー(Sieber)リンカー(窒素においてFmoc保護)を有するポリスチレンであり、100-200メッシュ、1%DVB、0.71mmol/gローディングである。
Rink=(2,4-ジメトキシフェニル)(4-アルコキシフェニル)メタンアミン、ここで、「4-アルコキシ」は、ポリスチレン樹脂への結合の位置およびタイプを表す。使用される樹脂は、リンク(Rink)リンカー(窒素においてFmoc保護)を有するメリフィールド(Merrifield)ポリマー(ポリスチレン)であり、100-200メッシュ、1%DVB、0.56mmol/gローディングである。
2-クロロトリチルクロリド樹脂(2-クロロトリフェニルメチルクロリド樹脂)、50-150メッシュ、1%DVB、1.54mmol/gローディング。Fmoc-グリシン-2-クロロトリチルクロリド樹脂、200-400メッシュ、1%DVB、0.63mmol/gローディング。
PL-FMP樹脂:(4-ホルミル-3-メトキシフェノキシメチル)ポリスチレン。
使用される一般的なアミノ酸を以下に列挙し、括弧内に側鎖保護基を示す:
Fmoc-Ala-OH;Fmoc-Arg(Pbf)-OH;Fmoc-Asn(Trt)-OH;Fmoc-Asp(tBu)-OH;Fmoc-Bip-OH;Fmoc-Cys(Trt)-OH;Fmoc-Dab(Boc)-OH;Fmoc-Dap(Boc)-OH;Fmoc-Gln(Trt)-OH;Fmoc-Gly-OH;Fmoc-His(Trt)-OH;Fmoc-Hyp(tBu)-OH;Fmoc-Ile-OH;Fmoc-Leu-OH;Fmoc-Lys(Boc)-OH;Fmoc-Nle-OH;Fmoc-Met-OH;Fmoc-[N-Me]Ala-OH;Fmoc-[N-Me]Nle-OH;Fmoc-Orn(Boc)-OH,Fmoc-Phe-OH;Fmoc-Pro-OH;Fmoc-Sar-OH;Fmoc-Ser(tBu)-OH;Fmoc-Thr(tBu)-OH;Fmoc-Trp(Boc)-OH;Fmoc-Tyr(tBu)-OH;Fmoc-Val-OH、およびそれらに対応するD-アミノ酸。
「Symphony X法」の手順は、0.050mmolスケールで実施される実験を表しており、このスケールは、樹脂に結合したSieberまたはRinkまたは2-クロロトリチルまたはPL-FMPの量によって決定される。このスケールは、上記のSieberアミド樹脂の約70mgに相当する。すべての手順は、記載されている量をスケールの倍数で調整することで、0.050mmolを超えたり下回ったりするスケールにすることができる。アミノ酸カップリングの前に、すべてのペプチド合成シーケンスは、以下で「樹脂膨潤手順」として説明する樹脂膨潤手順から開始した。アミノ酸の第一級アミンN末端へのカップリングには、以下に説明する「シングルカップリング手順」を使用した。第二級アミンのN末端、またはArg(Pbf)-およびD-Arg(Pbf)-またはD-LeuのN末端へのアミノ酸のカップリングには、以下に説明する「ダブルカップリング手順」または「シングルカップリング2時間手順」を使用した。特に断りのない限り、自動合成の最後のステップは、「クロロアセチル無水物のインストール」と呼ばれるアセチル基のインストールである。すべての合成は、「標準的な最終すすぎおよび乾燥の手順」として説明されている、最終のすすぎおよび乾燥のステップで終了する。
樹脂膨潤手順
45mLのポリプロピレン固相反応容器に、シーバーアミド樹脂(70mg、0.050mmol)を加えた。樹脂を次のように3回洗浄(膨潤)した。反応容器に、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え「DMFトップ洗浄」し、混合物を3分間定期的に撹拌した後、フリットを通して溶媒を排出した。
シングルカップリング手順
前のステップからの樹脂を含む反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80、v/v、4.0mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。反応容器にピペリジン:DMF(20:80、v/v、4.0mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。樹脂を次のように連続して6回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中0.2M、2.0mL、8当量)、次いで、HATU(DMF中0.4M、1.0mL、8当量)、最後にNMM(DMF中0.8M、1.0mL、16当量)を加えた。混合物を1~2時間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように連続して5回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。得られた樹脂を次のステップで直接使用した。
シングルカップリング4当量手順
前のステップからの樹脂を含む反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80、v/v、4.0mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。反応容器にピペリジン:DMF(20:80、v/v、4.0mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。樹脂を次のように連続して6回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中0.2M、1.0mL、4当量)、次いで、HATU(DMF中0.2M、1.0mL、4当量)、最後にNMM(DMF中0.8M、1.0mL、16当量)を加えた。混合物を1~2時間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように連続して5回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。得られた樹脂を次のステップで直接使用した。
ダブルカップリング手順
前のステップからの樹脂を含む反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80、v/v、4.0mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。反応容器にピペリジン:DMF(20:80、v/v、4.0mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。樹脂を次のように連続して6回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中0.2M、2.0mL、8当量)、次いで、HATU(DMF中0.4M、1.0mL、8当量)、最後にNMM(DMF中0.8M、1.0mL、16当量)を加えた。混合物を1時間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように連続して2回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中0.2M、2.0mL、8当量)、次いで、HATU(DMF中0.4M、1.0mL、8当量)、最後にNMM(DMF中0.8M、1.0mL、16当量)を加えた。混合物を1~2時間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように連続して5回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。得られた樹脂を次のステップで直接使用した。
ダブルカップリング4当量手順
前のステップからの樹脂を含む反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80、v/v、4.0mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。反応容器にピペリジン:DMF(20:80、v/v、4.0mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。樹脂を次のように連続して6回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中0.2M、1.0mL、4当量)、次いで、HATU(DMF中0.2M、1.0mL、4当量)、最後にNMM(DMF中0.8M、1.0mL、16当量)を加えた。混合物を1時間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように連続して2回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応容器に、アミノ酸(DMF中0.2M、1.0mL、4当量)、次いで、HATU(DMF中0.2M、1.0mL、4当量)、最後にNMM(DMF中0.8M、1.0mL、16当量)を加えた。混合物を1~2時間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように連続して5回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。得られた樹脂を次のステップで直接使用した。
シングルカップリングの手動添加手順A
前のステップからの樹脂を含む反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80、v/v、4.0mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。反応容器にピペリジン:DMF(20:80、v/v、4.0mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。樹脂を次のように連続して6回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応を一時停止した。反応容器を開け、DMF(1~1.5mL)液の非天然アミノ酸(2~4当量)を、容器の底を機器に取り付けたまま、容器の上部からピペットを使用して手動で加え、次いで、容器を閉じた。自動プログラムを再開し、HATU(DMF中0.4M、1.0mL、8当量)、およびNMM(DMF中0.8M、1.0mL、16当量)を順次加えた。混合物を2~3時間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように連続して5回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。得られた樹脂を次のステップで直接使用した。
シングルカップリングの手動添加手順B
前のステップからの樹脂を含む反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80、v/v、4.0mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。反応容器にピペリジン:DMF(20:80、v/v、4.0mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。樹脂を次のように連続して6回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応を一時停止した。反応容器を開け、DMF(1~1.5mL)液の非天然アミノ酸(2~4当量)を、容器の底を機器に取り付けたまま、容器の上部からピペットを使用して手動で加え、続いて、HATU(2~4当量、非天然アミノ酸と同じ当量)を手動で加え、次いで、容器を閉じた。自動プログラムを再開し、NMM(DMF中0.8M、1.0mL、16当量)を順次加えた。混合物を2~3時間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように連続して5回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。得られた樹脂を次のステップで直接使用した。
シングルカップリングの手動添加手順C
前のステップからの樹脂を含む反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80、v/v、4.0mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。反応容器にピペリジン:DMF(20:80、v/v、4.0mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。樹脂を次のように連続して6回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応を一時停止した。反応容器を開け、HATU(非天然アミノ酸に対して等モル量)およびNMM(4~8当量)を含むDMF(1~1.5mL)液の非天然アミノ酸(2~4当量)を、容器の底を機器に取り付けたまま、容器の上部からピペットを使用して手動で加えた。自動プログラムを再開し、混合物を2~3時間定期的に撹拌し、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように連続して5回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。得られた樹脂を次のステップで直接使用した。
シングルカップリングの手動添加手順D
前のステップからの樹脂を含む反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80、v/v、4.0mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。反応容器にピペリジン:DMF(20:80、v/v、4.0mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。樹脂を次のように連続して6回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応を一時停止した。反応容器を開け、DIC(非天然アミノ酸に対して等モル量)含むDMF(1×1.5mL)液の非天然アミノ酸(2~4当量)、およびHOAt(非天然アミノ酸に対して等モル量)を、容器の底部を機器に取り付けたまま、容器の上部からピペットを使用して手動で加えた。自動プログラムを再開し、混合物を2~3時間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように連続して5回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(5.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。得られた樹脂を次のステップで直接使用した。
ペプトイドのインストール(50μmol)手順
前のステップからの樹脂を含む反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80、v/v、3.0mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。反応容器にピペリジン:DMF(20:80、v/v、3.0mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。樹脂を次のように連続して6回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(3.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応容器にブロモ酢酸(DMF中0.4M、1.0mL、8当量)、次いで、DIC(DMF中0.4M、1.0mL、8当量)を加えた。混合物を1時間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように連続して2回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(4.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応容器にアミン(DMF中0.4M、2.0mL、16当量)を加えた。混合物を1時間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように連続して5回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(3.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。得られた樹脂を次のステップで直接使用した。
無水クロロ酢酸カップリング
前のステップからの樹脂を含む反応容器に、ピペリジン:DMF(20:80、v/v、3.0mL)を加えた。混合物を3.5分間または5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。反応容器にピペリジン:DMF(20:80、v/v、3.0mL)を加えた。混合物を5分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。樹脂を次のように連続して6回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(3.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応容器に無水クロロ酢酸溶液(DMF中0.4M、2.5mL、20当量)、次いで、N-メチルモルホリン(DMF中0.8M、2.0mL、32当量)を加えた。混合物を15分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように2回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(3.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に1.0分間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。反応容器に無水クロロ酢酸溶液(DMF中0.4M、2.5mL、20当量)、次いで、N-メチルモルホリン(DMF中0.8M、2.0mL、32当量)を加えた。混合物を15分間定期的に撹拌し、次いで、フリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を次のように連続して5回洗浄した。洗浄ごとに、容器の上部からDMF(3.0mL)を加え、得られた混合物を定期的に1.0分間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。得られた樹脂を次のステップで直接使用した。
最終のすすぎと乾燥の手順
前のステップからの樹脂を次のように連続して6回洗浄した。洗浄ごとに、DCM(5.0mL)を容器の上部から加え、得られた混合物を定期的に30秒間撹拌した後、フリットを通して溶液を排出した。次いで、窒素流を使用して樹脂を10分間乾燥させた。得られた樹脂を次のステップで直接使用した。
一般的な脱保護、環化、N-メチル化、クリック、スズキの手順
全体的脱保護法A
特に断りのない限り、すべての操作は手動で行われた。「全体的脱保護法」(Global Deprotection Method)の手順では、0.050mmolスケールで実施される実験について説明する。ここで、スケールは、Sieber、Rink、Wang、クロロトリチルの樹脂、またはPL-FMP樹脂の量によって決まる。この手順は、記載されている量をスケールの倍数で調整することにより、0.05mmolスケールを超えるスケールにすることができる。50mLのFalconチューブに、樹脂および2.0×5.0mLの切断カクテル(TFA:TIS:DTT、v/v/w=95:5:1)を加えた。個々の直鎖ペプチドごとに使用される切断カクテルの量は変化する。一般に、ペプチドの側鎖に存在する保護基の数が多いほど、より多くの量の切断カクテルが必要になる。混合物を室温で1~2時間、通常は約1.5時間、振盪した。懸濁液に35~50mLの冷えたジエチルエーテルを加えた。混合物を激しく混合すると、かなりの量の白色固体が沈殿した。混合物を3~5分間遠心分離し、次いで、溶液をデカントして固体から除き、廃棄した。固体をEtO(30×40mL)に懸濁し、次いで、混合物を3~5分間遠心分離し、次いで、溶液をデカントして固体から除き、廃棄した。最後に、固体をEtO(30~40mL)に懸濁し、混合物を3~5分間遠心分離し、溶液をデカントして固体から除き、廃棄して、窒素流下および/またはハウスバキューム下で乾燥させた後、切断された樹脂とともに白色からオフホワイトの固体として、粗ペプチドを得た。粗製物を同日に環化ステップに使用した。
全体的脱保護法B
特に断りのない限り、すべての操作は手動で行われた。「全体的脱保護法」(Global Deprotection Method)の手順では、0.050mmolスケールで実施される実験について説明する。ここで、スケールは、Sieber、Rink、Wang、クロロトリチルの樹脂、またはPL-FMP樹脂の量によって決まる。この手順は、記載されている量をスケールの倍数で調整することにより、0.05mmolスケールを超えるスケールにすることができる。30mlのbio-radポリプレップクロマトグラフィーカラムに、樹脂および2.0~5.0mLの切断カクテル(TFA:TIS:HO:DTT、v/v/w=94:3:3:1)を加えた。個々の直鎖ペプチドごとに使用される切断カクテルの量は変化する。一般に、ペプチドの側鎖に存在する保護基の数が多いほど、より多くの量の切断カクテルが必要になる。混合物を室温で1~2時間、通常は約1.5時間、振盪した。該酸性溶液を40mLの冷えたジエチルエーテル中に排出し、樹脂を0.5mLのTFA溶液で2回洗浄した。混合物を3~5分間遠心分離し、溶液をデカントして固体から除き、廃棄した。固体をEtO(35mL)に懸濁し、次いで、混合物を3~5分間遠心分離し、溶液をデカントして固体から除き、廃棄した。最後に、固体をEtO(35mL)に懸濁し、混合物を3~5分間遠心分離し、そして、溶液をデカントして固体から除き、廃棄して、窒素流下および/またはハウスバキューム下で乾燥させた後、白色からオフホワイトの固体として、粗ペプチドを得た。粗製物を同日に環化ステップに使用した。
環化法A
特に断りのない限り、すべての操作は手動で行われた。「環化法A」の手順では、0.05mmolスケールで実施される実験について説明する。ここで、スケールは、ペプチドの生成に使用された、Sieber、Rink、クロロトリチル、Wang、またはPL-FMPの樹脂の量によって決まる。このスケールは、この手順で使用されるペプチドの量の直接の決定に基づくものではない。この手順は、記載されている量をスケールの倍数で調整することにより、0.05mmolスケールを超えるスケールにすることができる。全体的な脱保護からの粗ペプチド固体を室温で50mL遠心分離管内のDMF(30~45mL)に溶解し、その溶液にDIEA(1.0~2.0mL)を加え、反応混合物のpH値を8かそれ以上にした。次いで、溶液を室温で、数時間、一晩、または2~3日間振盪させた。反応溶液をspeedvacまたはgenevac EZ-2で濃縮乾燥し、次いで、粗残渣をDMFまたはDMF/DMSO(2mL)に溶解した。濾過後、この溶液を単一化合物の逆相HPLC精製に供して、目的の環状ペプチドを得た。
環化法B
特に断りのない限り、すべての操作は手動で行われた。「環化法B」の手順では、0.05mmolスケールで実施される実験について説明する。ここで、スケールは、ペプチドの生成に使用された、Sieber、Rink、クロロトリチル、Wang、またはPL-FMPの樹脂の量によって決まる。このスケールは、この手順で使用されるペプチドの量の直接の決定に基づくものではない。この手順は、記載されている量をスケールの倍数で調整することにより、0.05mmolスケールを超えるスケールにすることができる。50mL遠心分離管内の粗ペプチド固体を、CHCN/0.1M重炭酸アンモニウム水溶液(1:1、v/v、30~45mL)に溶解した。次いで、溶液を室温で数時間振盪させた。反応溶液をpH試験紙とLCMSでチェックし、0.1M重炭酸アンモニウム水溶液(5~10mL)を加えるとpHを8以上に調整することができた。LCMSにおける線状ペプチドの消失に基づいて反応が完了した後、反応物をspeedvacまたはgenevac EZ-2で濃縮乾燥した。得られた残渣にCHCN:HO(2:3、v/v、30mL)を加え、speedvacまたはgenevac EZ-2で濃縮乾燥した。この手順を繰り返した(通常は2回)。次いで、得られた粗固体をDMFまたはDMF/DMSOまたはCHCN/HO/ギ酸に溶解した。濾過後、溶液を単一化合物の逆相HPLC精製に供して、目的の環状ペプチドを得た。
樹脂上のN-メチル化の方法A
Bio-Radチューブ内の樹脂(50μmol)にCHCl(2mL)を加え、室温で5分間振盪した。2-ニトロベンゼン-1-スルホニルクロリド(44.3mg、200μmol、4当量)を加え、続いて、2,4,6-トリメチルピリジン(0.040mL、300μmol、6当量)を加えた。反応物を室温で2時間振盪した。溶媒を排出し、樹脂をCHCl(5mL×3)、DMF(5mL×3)、次いでTHF(5mL×3)ですすいだ。樹脂にTHF(1mL)を加えた。トリフェニルホスフィン(65.6mg、250μmol、5当量)、メタノール(0.020mL、500μmol、10当量)、およびアゾジカルボン酸ジエチルまたはDIAD(0.040mL、250μmol、5当量)を加えた。混合物を室温で2~16時間振盪した。反応を繰り返した。トリフェニルホスフィン(65.6mg、250μmol、5当量)、メタノール(0.020mL、500μmol、10当量)、およびアゾジカルボン酸ジエチルまたはDIAD(0.040mL、250μmol、5当量)を加えた。混合物を室温で1~16時間振盪した。溶媒を排出し、樹脂をTHF(5mL×3)およびCHCl(5mL×3)で洗浄した。樹脂を風乾し、次のステップで直接使用した。樹脂をDMF(2mL)中で振盪した。2-メルカプトエタノール(39.1mg、500μmol)を加え、続いて、DBU(0.038mL、250μmol、5当量)を加えた。反応物を1.5時間振盪した。溶媒を排出した。樹脂をDMFで洗浄した(4回)。風乾し、次のステップで直接使用した。
樹脂上のN-メチル化の方法B(Turner, R.A. et al, Org. Lett., 15(19):5012-5015 (2013))
特に断りのない限り、すべての操作は手動で行われた。「樹脂上のN-メチル化の方法A」の手順では、0.100mmolスケールで実施される実験について説明する。ここで、スケールは、ペプチドの生成に使用された樹脂に結合した、SieberまたはRinkリンカーの量によって決まる。このスケールは、この手順で使用されるペプチドの量の直接の決定に基づくものではない。この手順は、記載されている量をスケールの倍数で調整することにより、0.10mmolスケールを超えるスケールにすることができる。樹脂を25mLのフリットシリンジに移した。樹脂にピペリジン:DMF(20:80、v/v、5.0mL)を加えた。混合物を3分間振盪し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。樹脂をDMF(4.0mL)で3回洗浄した。反応容器にピペリジン:DMF(20:80、v/v、4.0mL)を加えた。混合物を3分間振盪し、次いで、フリットを通して溶液を排出した。樹脂をDMF(4.0mL)で3回、DCM(4.0mL)で3回、順次洗浄した。樹脂をDMF(2.0mL)およびトリフルオロ酢酸エチル(0.119ml、1.00mmol)、1,8-ジアザビシクロ[5.4.0]ウンデカ-7-エン(0.181ml、1.20mmol)に懸濁した。混合物をシェーカー上に60分間置いた。フリットを通して溶液を排出した。樹脂をDMF(4.0mL)で3回、DCM(4.0mL)で3回、順次洗浄した。樹脂を乾燥THF(2.0mL)で3回洗浄して、残留水を除去した。オーブンで乾燥させた4.0mLバイアルに、THF(1.0mL)およびトリフェニルホスフィン(131mg、0.500mmol)および乾燥した4Åモレキュラーシーブ(20mg)を加えた。溶液を樹脂に移し、アゾジカルボン酸ジイソプロピル(0.097mL、0.5mmol)をゆっくりと加えた。樹脂を15分間撹拌した。フリットを通して溶液を排出し、樹脂を乾燥THF(2.0mL)で3回洗浄して、残留水を除去した。オーブンで乾燥させた4.0mLバイアルに、THF(1.0mL)、トリフェニルホスフィン(131mg、0.50mmol)および乾燥4Åモレキュラーシーブ(20mg)を加えた。溶液を樹脂に移し、アゾジカルボン酸ジイソプロピル(0.097mL、0.5mmol)をゆっくりと加えた。樹脂を15分間撹拌した。フリットを通して溶液を排出した。樹脂をDMF(4.0mL)で3回、DCM(4.0mL)で3回、順次洗浄した。樹脂をエタノール(1.0mL)およびTHF(1.0mL)に懸濁し、水素化ホウ素ナトリウム(37.8mg、1.000mmol)を加えた。混合物を30分間撹拌し、排出した。樹脂をDMF(4.0mL)で3回、DCM(4.0mL)で3回、順次洗浄した。
樹脂上のN-アルキル化の手順の方法A
アルキル化の基に対応するアルコール(0.046g、1.000mmol)、トリフェニルホスフィン(0.131g、0.500mmol)、およびDIAD(0.097mL、0.500mmol)を含んだ3mLのTHF溶液を、ノシル化樹脂(nosylated resin)(0.186g、0.100mmol)に加え、反応混合物を室温で16時間撹拌した。樹脂をTHF(5mL)で3回洗浄し、上記の手順を1~3回繰り返した。反応の進行は、50μLのTISを含んだ1mLのTFA溶液で1.5時間処理した少量の樹脂サンプルのTFA微小切断によってモニタリングした。
樹脂上のN-アルキル化の手順の方法B
ノシル化樹脂(0.100mmol)をN-メチルピロリドン(NMP)(3mL)で3回洗浄した。NMP(3mL)、臭化アルキル(20当量、2.000mmol)、およびDBU(20当量、0.301mL、2.000mmol)の溶液を樹脂に加え、反応混合物を室温で16時間撹拌した。樹脂をNMP(3mL)で洗浄し、上記の手順をもう一度繰り返した。反応の進行は、50μLのTISを含んだ1mLのTFA溶液で1.5時間処理した少量の樹脂サンプルのTFA微小切断によってモニタリングした。
N-ノシレート形成手順
コリジン(10当量)のDCM(2mL)溶液を樹脂に加え、続いて、Nos-Cl(8当量)のDCM(1mL)溶液を加えた。反応混合物を室温で16時間撹拌した。樹脂をDCM(4mL)で3回、DMF(4mL)で3回洗浄した。DCMとDMFの交互洗浄を3回繰り返し、続いて、4回のDCM洗浄(4mL)を最終1セット行った。
N-ノシレート除去手順
樹脂(0.100mmol)を、DMF(3mL)の3回洗浄、およびNMP(3mL)の3回洗浄で、膨潤させた。NMP(3mL)、DBU(0.075mL、0.500mmol)、および2-メルカプトエタノール(0.071mL、1.000mmol)の溶液を樹脂に加え、反応混合物を室温で5分間撹拌した。濾過し、NMP(3mL)で洗浄した後、樹脂を、NMP(3mL)、DBU(0.075mL、0.500mmol)、および2-メルカプトエタノール(0.071mL、1.000mmol)の溶液で、室温で5分間、再処理した。樹脂を、NMP(3mL)で3回、DMF(4mL)で4回、DCM(4mL)で4回洗浄し、Symphonyペプチド合成装置での配列アセンブリの完了のため、Symphony反応容器に戻した。
PL-FMP樹脂上にアミンをプレロードするための一般的手順
PL-FMP樹脂(Novabiochem、1.00mmol/g置換)を室温でDMF(20mL/mmol)によって膨潤させた。溶媒を排出し、10mlのDMFを加え、続いて、アミン(2.5mmol)および酢酸(0.3mL)を反応容器に加えた。10分間撹拌した後、トリアセトキシヒドロホウ酸ナトリウム(2.5mmol)を加えた。反応物を一晩撹拌した。樹脂を、DMF(1回)、THF/HO/AcOH(6:3:1)(2回)、DMF(2回)、DCM(3回)で洗浄し、乾燥させた。得られたアミンがプレロードされたPL-FMP樹脂は、次の方法で確認することができる。上記の樹脂100mgを取り、DCM(2mL)中で塩化ベンゾイル(5当量)およびDIEA(10当量)と室温で0.5時間反応させた。樹脂をDMF(2回)、MeOH(1回)、およびDCM(3回)で洗浄した。次いで、サンプルを40%TFA/DCM(1時間)で切断した。生成物を収集し、HPLCおよびMSによって分析した。収集したサンプルを乾燥させ、重量を測定して樹脂ローディング(担持)を計算した。
Cl-トリチル樹脂上にFmoc-アミノ酸をプレロードするための一般手順
フリットを備えたガラス反応容器に、2-クロロ-クロロトリチル樹脂メッシュ50-150(1.54ミリ当量(meq)/グラム、1.94グラム、3.0mmol)を加え、DCM(5mL)中で5分間膨潤させた。酸(3.00mmol、1.0当量)のDCM(5mL)溶液を樹脂に加え、続いて、DIEA(2.61ml、15.00mmol、5.0当量)を加えた。反応物を室温で60分間振盪した。DIEA(0.5mL)およびメタノール(3mL)を加え、反応物をさらに15分間振盪した。フリットを通して反応溶液を濾過し、樹脂を、DCM(4×5mL)、DMF(4×5mL)、DCM(4×5mL)、ジエチルエーテル(4×5mL)ですすぎ、窒素流を使用して乾燥させた。樹脂ローディング量は以下のようにして決定できる。
樹脂のサンプル(13.1mg)を20%ピペリジン/DMF(v/v、2.0mL)で、振盪しながら10分間処理した。この溶液1mLを25.0mLメスフラスコに移し、メタノールで総量25.0mLに希釈した。20%ピペリジン/DMFのブランク溶液(v/v、1.0mL)をメスフラスコでメタノールにより25.0mLに希釈した。UVを301nmに設定した。ブランク溶液で吸光度をゼロにし、その後、サンプル溶液を読み取ると、吸光度は1.9411であった。樹脂のローディング量は、0.6736mmol/g((1.9411/20mg)×6.94=0.6736)と測定された。
樹脂上のクリック反応の方法A
この手順は、0.050mmolスケールで実施される実験について説明する。記載されている量をスケールの倍数で調整することにより、0.050mmolスケールを超えたり、下回ったりするスケールにすることができる。アルキン含有樹脂(各50μmol)をBio-Radチューブに移し、DCM(2×5mL×5分)、次いで、DMF(2×5mL×5分)で膨潤させた。200mlのボトルに、以下のものを30倍量入れた:アスコルビン酸(ビタミンC、0.026g、0.150mmol)、ビス(2,2,6,6-テトラメチル-3,5-ヘプタンジオナト)銅(II)(10.75mg、0.025mmol)、DMF(1.5mL)、2,6-ルチジン(0.058mL、0.50mmol)およびTHF(1.5mL)、続いて、DIEA(0.087ml、0.50mmol)、および、実施例で使用される対応するアジド(1.0~2.0当量)。すべてが溶液になるまで混合物を撹拌した。上記のBio-Radチューブ内のDMFを排出し、上記のクリック溶液(各3mL)を各Bio-Radチューブに加えた。チューブをオービタルシェーカー上で一晩振盪した。フリットを通して溶液を排出した。樹脂をDMF(3×2mL)およびDCM(3×2mL)で洗浄した。
樹脂上のクリック反応の方法B
この手順は、0.050mmolスケールで実施される実験について説明する。記載されている量をスケールの倍数で調整することにより、0.050mmolスケールを超えたり、下回ったりするスケールにすることができる。アルキン含有樹脂(各50μmol)をBio-Radチューブに移し、DCM(2×5mL×5分)、次いで、DMF(2×5mL×5分)で膨潤させた。別のボトルで、4.0mLのDMSOに窒素を15分間バブリングした。DMSOにヨウ化銅(9.52mg、0.050mmol、1.0当量)(超音波処理)、ルチジン(58μL、0.500mmol、10.0当量)およびDIEA(87uL、0.050mmol、10.0当量)を加えた。溶液を再度窒素でパージした。フリットを通してDCMを排出した。別のバイアル中で、アスコルビン酸(8.8mg、0.050mmol、1.0当量)を水(600μL)に溶解した。溶液中に窒素を10分間バブリングした。カップリングパートナーをチューブ内に分配し(0.050mmol~0.10mmol、1.0~2.0当量)、続いて、DMSO銅および塩基溶液、最後にアスコルビン酸水溶液を分配した。溶液を窒素ブランケットで覆い、蓋をした。チューブをロータリーミキサー上に16時間置いた。フリットを通して溶液を排出した。樹脂をDMF(3×2mL)およびDCM(3×2mL)で洗浄した。
樹脂上のスズキ反応の手順
Bio-Radチューブに、4-ブロモ-フェニルアラニン側鎖を含むN末端Fmoc保護直鎖状ポリペプチドの乾燥Rink樹脂50μmolを入れた。樹脂をDMF(2×5mL)で膨潤させた。これに、p-トリルボロン酸(0.017g、0.125mmol)、リン酸カリウム(0.2mL、0.400mmol)のDMF溶液(2mL)を加え、続いて、触媒[1,1’-ビス(ジ-tert-ブチルホスフィノ)]フェロセン]ジクロロパラジウム(II)[PdCl(dtbpf)](3.26mg、5.00μmol)を加えた。チューブを室温で一晩振盪した。溶液を排出し、樹脂を、DMF(5×3mL)で洗浄し、続いて、DCM(2×3mL)、次にDMF(2×3mL)、次いでDCM(5×3mL)で交互に洗浄した。少量の樹脂サンプルを、235μLのTISを含む1mlのTFA液を使用して、室温で1時間マイクロ切断した。樹脂の残りは、ペプチドカップリングまたはN末端のクロロ酢酸キャッピングの次のステップで使用した。
液相クリック反応の方法A
20mlのシンチレーションバイアルに、必要な量の100倍のアスコルビン酸ナトリウム(ナトリウム(R)-2-((S)-1,2-ジヒドロキシエチル)-4-ヒドロキシ-5-オキソ-2,5-ジヒドロフラン-3-オレート)、および硫酸銅(II)五水和物(CuSO:アスコルビン酸ナトリウムのモル比:1:3~1:5)を加えた。反応物を水で希釈した。この溶液を室温で1~10分間振盪した。得られた黄色がかったスラリーをそれぞれの反応物に加えた。
アルキンおよびアジド(1.0~2.0当量)を含むバイアルに、必要な量の上記銅溶液(CuSO:アルキンの0.3~1.0当量)を加えた。混合物を室温で1~3時間振盪し、LC/MSによって進行をモニタリングした。必要に応じて、追加量のアジドまたは銅溶液を加えて、トリアゾールの形成を促進することができる。完了後、混合物をCHCN:NHCO水溶液(v/v、1:1)で希釈し、濾過し、同日に逆相HPLC精製により精製した。
液相クリック反応の方法B
CuSOおよびアスコルビン酸ナトリウムのストック溶液を、乾燥した1:2~1:3モル比の硫酸銅(II)五水和物およびアスコルビン酸ナトリウムを、硫酸銅五水和物に関して0.1~0.3Mの濃度に希釈することによって、調製した。ペプチドアルキンのDMF溶液(0.05~0.1M)に、実施例で使用される対応するアジド(1.0~2.0当量)を加え、続いて、上記の新たに調製した銅溶液(0.03~1.0当量)を加えた。混合物を室温で撹拌し、LCMSでモニタリングした。必要に応じて、追加量のアジドまたは銅溶液を加えて、トリアゾールの形成を促進することができる。完全に変換した後、混合物を希釈し、濾過し、同日に逆相HPLCにより精製した。
一般的な精製手順
粗製物質を、以下の条件を使用して分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×19mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;グラジエント:特定の割合のBで0分間保持し、その後20~30分間かけてBを前記割合からより高い割合に直線的に増加させ、その後100%Bで0分間保持する;流量:20~40mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSおよびUVシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、エバポレーションにより乾燥させた。直交(orthogonal)分析データに基づいて材料が純粋でない場合は、以下の条件で分取LC/MSによってさらに精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;グラジエント:特定の割合のBで0分間保持し、その後20~30分間かけてBを開始割合から直線的に増加させ、その後100%Bで0分間保持する;流量:20~40mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収率と純度を測定した。
あるいは、初期分析データに基づいて、以下の条件を使用して分取LC/MSによって粗製物質を精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有:移動相B:95:5のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;グラジエント:特定の割合のBで0分間保持し、その後20分間かけてBを開始割合から直線的に増加させ、その後100%Bで0分間保持する;流量:40mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、エバポレーションにより乾燥させた。直交分析データに基づいて材料が純粋でない場合は、以下の条件を使用して分取LC/MSによってさらに精製した。カラム:XBridge C18、200mm×19mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;グラジエント:特定の割合のBで0分間保持し、その後20分間かけてBを前記割合からより高い割合に直線的に増加させ、その後100%Bで0分間保持する;流量:20mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSおよびUVシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、エバポレーションにより乾燥させた。生成物の収率と純度を測定した。
非天然アミノ酸の合成
(S)-2-((((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)-3-(1-(2-(tert-ブトキシ)-2-オキソエチル)-1H-インドール-3-イル)プロパン酸の製造
スキーム
Figure 2024512074000031

ステップ1
0℃の、(S)-ベンジル 2-(((ベンジルオキシ)カルボニル)アミノ)-3-(1H-インドール-3-イル)プロパノエート(25.0g、58.3mmol)、および炭酸セシウム(20.9g、64.2mmol)のDMF(200mL)溶液に、2-ブロモ酢酸tert-ブチル(9.36mL、64.2mmol)を加えた。溶液を18時間撹拌しながらゆっくりと室温まで温めた。反応混合物を氷水:1NのHCl(1:1)水溶液に注ぎ、次いで、EtOAcで抽出した。有機層をブラインで洗浄し、収集し、MgSOで乾燥させ、濾過し、次いで、真空下で濃縮した。得られた固体をフラッシュクロマトグラフィー(330gのカラム、20カラム容量にわたる0~50%EtOAc:Hex)に付して、(S)-ベンジル 2-(((ベンジルオキシ)カルボニル)アミノ)-3-(1-(2-(tert-ブトキシ)-2-オキソエチル)-1H-インドール-3-イル)プロパノエートを白色固体として得た(29.6g、93%)。
ステップ2
(S)-ベンジル 2-(((ベンジルオキシ)カルボニル)アミノ)-3-(1-(2-(tert-ブトキシ)-2-オキソエチル)-1H-インドール-3-イル)プロパノエート(29.6g、54.5mmol)、およびPd-C(1.45g、1.36mmol)のMeOH(200mL)液の混合物に、室温で10分間、Hをバブリングした。次いで、変換をLCMSによってモニタリングしながら、混合物をHの加圧下で撹拌した。48時間後、反応混合物を珪藻土で濾過し、蒸発処理により、粗製の(S)-2-アミノ-3-(1-(2-(tert-ブトキシ)-2-オキソエチル)-1H-インドール-3-イル)プロパン酸(17.0g)を得て、これをさらに精製することなくステップ3に用いた。
ステップ3
(S)-2-アミノ-3-(1-(2-(tert-ブトキシ)-2-オキソエチル)-1H-インドール-3-イル)プロパン酸(5.17g、16.2mmol)、および重炭酸ナトリウム(6.8g、81mmol)のアセトン:水(50.0mL:100mL)溶液に、(9H-フルオレン-9-イル)メチル(2,5-ジオキソピロリジン-1-イル)カーボネート(5.48g、16.2mmol)を加えた。混合物を一晩撹拌すると、LCMS分析により完全な変換が示された。激しく撹拌した混合物を、1NのHCl水溶液をゆっくり加えることにより酸性化した。酸性化のあと、混合物をDCM(150mL)で希釈し、次いで、単離した有機相を、水、続いてブラインで洗浄した。有機層を収集し、硫酸ナトリウムで乾燥し、真空下で濃縮して、粗生成物を得た。粗物質をシリカゲルクロマトグラフィー(330gカラム、20~80%のEtOAc:Hex、20カラム、25容量)で精製して、(S)-2-((((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)アミノ)-3-(1-(2-(tertブトキシ)-2-オキソエチル)-1H-インドール-3-イル)プロパン酸を白色泡状物として得た(7.26g、83%)。
1H NMR (500 MHz, methanol-d4) δ 7.80 (d, J=7.6 Hz, 2H), 7.67 - 7.60 (m, 2H), 7.39 (t, J=7.5 Hz, 2H), 7.32 - 7.22 (m, 3H), 7.18 (td, J=7.6, 0.9 Hz, 1H), 7.08 (td, J=7.5, 0.9 Hz, 1H), 7.04 (s, 1H), 4.54 (dd, J=8.4, 4.9 Hz, 1H), 4.36 - 4.23 (m, 2H), 4.23 - 4.14 (m, 1H), 30 3.43 - 3.35 (m, 2H), 3.25 - 3.09 (m, 1H), 1.55 - 1.38 (m, 9H). ESI-MS(+) m/z = 541.3 (M + H).
(S)-2-((((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)アミノ)-3-(4-(2-(tert-ブトキシ)-2-オキソエトキシ)フェニル)プロパン酸の製造
スキーム
Figure 2024512074000032

ステップ1
(S)-ベンジル 2-(((ベンジルオキシ)カルボニル)アミノ)-3-(4-ヒドロキシフェニル)プロパノエート(70g、173mmol)、およびKCO(35.8g、259mmol)の冷却したDMF(350mL)撹拌溶液に、tert-ブチル-2-ブロモアセテート(30.6mL、207mmol)を滴下して加え、得られた混合物を室温で一晩撹拌した。反応混合物を10%ブライン溶液(1000mL)で希釈し、酢酸エチル(2×250mL)で抽出した。合わせた有機層を、水(500mL)、飽和ブライン溶液(500mL)で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、無色のガム状物を得た。粗化合物を、溶離剤として20%酢酸エチルを含む石油エーテルを使用するフラッシュカラムクロマトグラフィーによって精製して、白色固体(78g、85%)を得た。
ステップ2
(S)-ベンジル 2-(((ベンジルオキシ)カルボニル)アミノ)-3-(4-(2-(tert-ブトキシ)-2-オキソエトキシ)フェニル)プロパノエート(73g、140mmol)を、MeOH(3000mL)に溶解し、窒素で5分間パージした。上記のパージした混合物に、Pd/C(18g、16.91mmol)を加え、3kgの水素圧下で15時間撹拌した。反応混合物を珪藻土床(セライト(登録商標))を通して濾過し、メタノール(1000mL)で洗浄した。濾液を真空下で濃縮して、白色固体(36g、87%)を得た。
ステップ3
(S)-2-アミノ-3-(4-(2-(tert-ブトキシ)-2-オキソエトキシ)フェニル)プロパン酸(38g、129mmol)、および重炭酸ナトリウム(43.2g、515mmol)の水(440mL)撹拌溶液に、ジオキサン(440mL)に溶解したFmoc-OSu(43.4g、129mmol)を滴下して加え、得られた混合物を室温で一晩撹拌した。反応混合物を1.5NのHCl(200mL)および水(500mL)で希釈し、酢酸エチル(2×250mL)で抽出した。合わせた有機層を、水(250mL)、飽和ブライン溶液(250mL)で洗浄し、NaSOで乾燥し、濾過し、濃縮して、淡黄色ガム状物を得た。粗化合物を、溶離剤として6%MeOHを含むクロロホルム液を使用するカラムクロマトグラフィーによって精製して、淡緑色のガム状物を得た。このガム状物をさらに石油エーテルでトリチュレーションして、オフホワイトの固体を得た(45g、67%)。
1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 12.86 - 12.58 (m, 1H), 7.88 (d, J=7.5 Hz, 2H), 7.73 - 7.61 (m, 3H), 7.58 - 7.47 (m, 1H), 7.44 - 7.27 (m, 4H), 7.18 (d, J=8.5 Hz, 2H), 6.79 (d, J=8.5 Hz, 2H), 4.57 (s, 2H), 4.25 - 4.10 (m, 4H), 3.34 (br s, 3H), 3.02 (dd, J=13.8, 4.3 Hz, 1H), 2.81 (dd, J=14.1, 10.5 Hz, 1H), 1.41 (s, 9H).
リンカー/テール合成
(2S)-4-[(35-アジド-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33-ウンデカオキサペンタトリアコンタン-1-イル)カルバモイル]-2-(16-スルホヘキサデカンアミド)ブタン酸の製造 (IUPAC)
(4, N-PEG11-γGlu-FSA16)
スキーム

ステップ1
16-メルカプトヘキサデカン酸(5.3g、18.37mmol)を、撹拌子を備えた500ml丸底フラスコに加えた。ギ酸(172ml、4485mmol)を加え、続いて、過酸化水素(12.3ml、120mmol)を滴下して加えた。混合懸濁液を空気に開放して6時間撹拌した。サンプル上に窒素を一晩かけて穏やかに流した。16時間後、生成物はきれいな白色の粉末となった。6時間ポンプを作動させた後、そのまま使用した。6.18gの化合物1を単離した。LCMS分析条件O:保持時間=1.30分;ESI-MS(+) m/z 337.0(M+1)
還元的後処理を伴う精緻なチオール酸化工程:16-メルカプトヘキサデカン酸(5.07g、17.57mmol)を含んだギ酸(176ml)の撹拌スラリーに、過酸化水素(11.76ml、115mmol)を、添加漏斗(約5~10分以上)によって滴下して加えた。これを室温で6時間撹拌した。過酸化物テストストリップは、反応物表面上で陽性反応を示すが、濃い青色である。これは反応溶液に浸すと、黄色に変わった(カラースケールには記載されていない)。LCMSは、目的の生成物が存在し、検出可能な量の出発物質がないことを示す(プログラムされたMW値、UVシグナルなし、AAは+/-イオンモード)。反応液を氷浴で冷却し、マニホールドに2方向窒素導入アダプターを取り付けた。ストッパーを取り付け、シリンジを介してストッパーを通してジメチルスルフィド(3.90ml、52.7mmol)を滴下し始めた(約1mL/分)。ストリップでテストし、表面上が陽性、表面下が黄色である。残りのジメチルスルフィド(0.715ml、9.67mmol)をゆっくりと加え始め、テストストリップでモニタリングした。全ての添加が近づくと、テストストリップは反応溶液の上に何も表示されなくなり、浸すと陽性反応が得られた。硫化物が約0.1mL残ると、ストリップは色を示さなくなり、色が変化しなくなった。氷浴を取り外し、1時間撹拌した。週末にかけて強い窒素気流下で濃縮した。高真空で48時間真空濃縮し、7.63gを単離した。生成物の構造と一致するNMRは、残留溶媒(主にDMSOおよび水、微量のジメチルスルフィド)を示した。残留溶媒を考慮して、名目上w%を75%で使用した。
ステップ2
Fmoc-Glu-OtBu(1.640g、3.86mmol)、およびPFTU(1.651g、3.86mmol)の乾燥混合物をDMF(15ml)で希釈した。窒素下で撹拌しながら、DIEA(1.347ml、7.71mmol)をシリンジによりゆっくり加えた。1時間撹拌した後、定量化して移動するため最小限のDMFを使用して、35-アジド-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33-ウンデカオキサペンタトリアコンタン-1-アミン(2.0g、3.50mmol)を加えた。室温で1.5時間撹拌した後、反応物を10%LiClでクエンチし、EtOAcで1回抽出した。得られた濃縮物を、90/10のDCM/MeOHで溶出する順相ISCOによって精製した。得られた油を10mlのDCMで希釈し、次いで、15mlのTFAで処理した。3/4時間後、反応物を濃縮乾燥し、85/15のDCM/MeOHで溶出するISCOクロマトグラフィーによって精製した。3.20gの生成物を化合物2として単離した。LCMS分析条件O:保持時間=1.40分;ESI-MS(+) m/z 923.08(M+1)
ステップ3
クロロトリチル樹脂(4334mg、13.88mmol)を、DCMで5回洗浄し、次いで、DCM(20mL)で希釈した。次いで、この溶液に前記2(3200mg、3.47mmol)を加え、続いて、DIEA(4.85mL、27.8mmol)を加えた。反応物はすぐにブドウ色になり、1.5時間振盪させた。次いで、樹脂を20mlの9:1のメタノール/ヒューニッヒ塩基溶液で希釈し、素早く濾過し、3回のDCMおよび3回のDMFで洗浄した。次いで、得られた茶紫色の樹脂を20%ピペリジン/DMFで2回処理してFmoc基を脱保護し、DMFで5回洗浄し、そのまま使用した。樹脂は黄色になった。20%HFIPA/DCMで樹脂のアリコートを切断した。LCMSは、目的の生成物を載せた樹脂3を示す。LCMS分析条件O:保持時間=0.83分;ESI-MS(+) m/z 700.08(M+1)
ステップ4
樹脂3(5.74g、2.87mmol)を、DMFで5回洗浄し、次いで、DMF(40mL)で希釈した。次いで、この溶液に、前記1(1.642g、4.88mmol)およびHATU(1.855g、4.88mmol)のDMF(40mL)溶液を加え、続いて、N-メチルモルホリン(2.52mL、22.96mmol)を加えた。反応物を16時間振とうし、次いで、5回のDMFおよび5回のDCMで洗浄した。20%HFIPA/DCMの30分間の処理により、生成物を樹脂から切断した。排液し、濃縮して、2.92gの生成物4を得た。
LCMS分析条件O:保持時間=1.30分;ESI-MS(+) m/z 1019.08 (M+1)。
1H NMR (400 MHz, DMSO) δ 1.25 (s, 22H), 1.50 (m, 2H), 1.80 (m, 2H), 1.90 (m, 2H), 2.10 (m, 5H), 2.38 (m, 2H), 3.20 (m, 2H), 3.40 (m, 2H), 3.50 (m, 40H), 3.60 (m, 2H), 4.20 (m, 1H), 5.20 (m, 1H), 8.10 (s, 1H), 12.50 (m, 1H).
収率(4ステップ):96%。
(S)-1-アジド-37-オキソ-40-(11-スルホウンデカンアミド)-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33-ウンデカオキサ-36-アザヘンテトラコンタン-41-酸 (6) の製造
ステップ1
11-メルカプトウンデカン酸(5.0g、22.90mmol)を、撹拌子を備えた500ml丸底フラスコに加えた。ギ酸(214mL、5587mmol)を加え、続いて、過酸化水素(15.32mL、150mmol)を滴下して加えた。混合懸濁液を空気に開放して6時間撹拌した。反応混合物上に窒素を穏やかに吹き込んだ。16時間後、生成物はきれいな白色粉末となった。6時間ポンプを作動させた後、そのまま使用した。6.10gの化合物5を単離した。LCMS分析条件P:保持時間=1.03分;ESI-MS(+) m/z 267.0(M+1)
ステップ2
樹脂3(4.00g、2.00mmol)を、DMFで5回洗浄し、次いで、DMF(40mL)で希釈した。次いで、この溶液に、前記5(0.906g、3.40mmol)およびHATU(1.293g、3.40mmol)のDMF(40mL)溶液を加え、続いて、N-メチルモルホリン(1.759mL、16.00mmol)を加えた。反応物を16時間振とうし、次いで、5回のDMFおよび5回のDCMで洗浄した。20%HFIPA/DCMで30分間処理して、生成物を樹脂から切り離した。溶液を排出し、濃縮して、3.12gの生成物6を得た。LCMS分析条件P:保持時間=1.29分;ESI-MS(+) m/z 949.0(M+1)。収率(4ステップ):96%。
14-メルカプトテトラデカン酸の製造
スキーム

ステップ1
DMF(34.1ml)に溶解したPDC(10.26g、27.3mmol)を、14-ブロモテトラデカン-1-オール(2.0g、6.82mmol)のDMF(34.1ml)液に加えた。得られた混合物を室温で一晩撹拌すると、出発アルコールの大部分が消費された。水を加え、得られた混合物をCHClで抽出した。有機相をブラインで洗浄し、MgSOで乾燥させ、真空下で濃縮して、粗製の14-ブロモテトラデカン酸を得て、それをそのまま次のステップに用いた。
1H NMR (499 MHz, CHLOROFORM-d) δ 3.55 - 3.27 (m, 2H), 2.49 - 2.17 (m, 2H), 1.97 - 1.77 (m, 2H), 1.71 - 1.56 (m, 2H), 1.49 - 1.11 (m, 18H).
ステップ2
14-ブロモテトラデカン酸(2.096g、6.82mmol)、およびチオウレア(0.880g、11.56mmol)のエタノール(42.6ml)液混合物を、窒素雰囲気下で1日還流した。混合物を室温まで冷却し、減圧下で溶媒を蒸発させた。残渣をNaOH(20mL、7.5mol/L)とともにさらに6時間加熱した。混合物をHCl(1mol/L)で注意深く酸性化した。有機層を分離した。水相をCHClで抽出した。合わせた有機層をブラインで洗浄し、MgSOで乾燥させ、真空下で濃縮して、14-メルカプトテトラデカン酸を得て、これをそのまま次のステップに用いた。
1H NMR (499 MHz, CHLOROFORM-d) δ 2.76 - 2.66 (m, 1H), 2.58 - 2.50 (m, 1H), 2.41 - 2.34 (m, 2H), 1.72 - 1.60 (m, 4H), 1.42 - 1.23 (m, 18H).
下記の化合物を、前述と同じ手順に従って製造した。
Figure 2024512074000036

Figure 2024512074000037

Figure 2024512074000038

Figure 2024512074000039

Figure 2024512074000040

Figure 2024512074000041

Figure 2024512074000042
FPA16テールの合成
(S)-1-アジド-37-オキソ-40-(16-ホスホノヘキサデカンアミド)-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33-ウンデカオキサ-36-アザヘンテトラコンタン-41-酸の製造
(3, N-PEG11-γGlu-FPA16、A2323-456,457,459)

ステップ1
Fmoc-Glu-OtBu(2.0g、4.70mmol)、およびPFTU(2.214g、5.17mmol)の乾燥混合物をDMF(15ml)で希釈した。窒素下で撹拌しながら、DIEA(1.806ml、10.34mmol)をシリンジによりゆっくり加えた。室温で1時間撹拌した後、定量化して移動するために最小限のDMFを使用して、35-アジド-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33-ウンデカオキサペンタトリアコンタン-1-アミン(2.68g、4.70mmol)を加えた。
室温で16時間撹拌した後、反応を10%LiClでクエンチし、EtOAcで1回抽出した。得られた濃縮物を、90/10のDCM/MeOHで溶出する順相ISCOにより精製した。得られた油を10mLのDCMで希釈し、次いで、15mLのTFAで処理した。3/4時間後、反応物を濃縮乾燥し、90/10のDCM/MeOHで溶出するISCOクロマトグラフィーにより精製して、3.9gの化合物1の生成物を得た。分析条件P:保持時間=1.79分;ESI-MS(+) m/z 922.3(M+1)。
ステップ2
クロロトリチル樹脂(5282mg、16.92mmol)を、DCMで5回洗浄し、次いで、DCM(20mL)で希釈した。次いで、この溶液に前記1(3900mg、4.23mmol)を加え、続いて、DIEA(5.91mL、33.8mmol)を加えた。反応物はすぐにブドウ色になり、1.5時間振盪させた。次いで、樹脂を20mLの9:1のメタノール/ヒューニッヒ塩基溶液で希釈し、素早く濾過し、3回のDCMおよび3回のDMFで洗浄した。次いで、得られた茶紫色の樹脂を20%ピペリジン/DMFで2回処理してFmoc基を脱保護し、DMFで5回洗浄し、そのまま使用した。樹脂は黄色になった。20%HFIPA/DCMで樹脂のアリコートを切断した。LCMSは、目的の生成物を載せた樹脂2を示す。分析条件P:保持時間=1.16分;ESI-MS(+) m/z 700.3(M+1)。
ステップ3
樹脂2(1.0g、0.5mmol)を、DMFで5回洗浄し、次いで、DMF(40mL)で希釈した。次いで、この溶液に、16-ホスホノヘキサデカン酸(0.336g、1.000mmol)およびHATU(0.380g、1.000mmol)のDMF(40mL)溶液を加え、続いて、N-メチルモルホリン(0.440mL、4.00mmol)を加えた。反応物を16時間振とうし、次いで、5回のDMFおよび5回のDCMで洗浄した。20%HFIPA/DCMで30分間の処理により、生成物を樹脂から切り離した。それを排液し、濃縮して、0.50gの生成物3を得た。分析条件P:保持時間=1.73分;ESI-MS(+) m/z 1018.4(M+1)。収率(3ステップ):84%。
15-スルホペンタデカン酸の製造
Figure 2024512074000044

ステップ1
脱炭酸ハロゲン化:40mLの耐圧バイアルに、16-(tert-ブトキシ)-16-オキソヘキサデカン酸(512mg、1.495mmol)、ジメチル2-ブロモマロネート(0.555mL、3.74mmol)、[Ir(dF(CF)ppy)(dtbbpy)]PF(33.5mg、0.030mmol)、および炭酸セシウム(487mg、1.495mmol)を加えた。撹拌子を加え、混合物をクロロベンゼン(29.9mL)で希釈し、蓋をし、窒素を10分間バブリングした。容器をパラフィルムで密封し、一晩撹拌しながら青色LEDストリップライト(最大λ約450、ライトから約1~2cm、ファンあり)を照射した。バイアルを遠心分離し、半透明の溶液をデカントした。反応混合物を真空下で濃縮し、フラッシュクロマトグラフィー(0~10%EtOAc/ヘプタン、15~20分間)により精製した。画分を、KMnO染色によるTLC染色によってモニタリングし、生成物を含む画分を収集し、濃縮して、324.4mgの15-ブロモペンタデカン酸tert-ブチルを得た。
1H NMR (499 MHz, CHLOROFORM-d) δ 3.41 (t, J=6.9 Hz, 2H), 2.21 (t, J=7.6 Hz, 2H), 1.86 (dt, J=14.6, 7.1 Hz, 2H), 1.59 (br d, J=7.4 Hz, 2H), 1.45 (s, 9H), 1.44 - 1.39 (m, 2H), 1.36 - 1.20 (m, 18H).
ステップ2
チオールの形成および酸化:上記の15-ブロモペンタデカン酸tert-ブチルの物質(292mg、0.774mmol)を、14-メルカプトテトラデカン酸の製造のためのチオール化手順(ステップ1)に従って処理して、219mgの生成物(tBuエステルと遊離カルボン酸の混合物として)を得た。次いで、粗混合物を16-スルホペンタデカン酸の製造手順に従って酸化して、241mgの15-スルホペンタデカン酸の生成物を得た。
1H NMR (499 MHz, METHANOL-d4) δ 4.93 (s, 5H), 2.88 - 2.79 (m, 2H), 2.35 - 2.24 (m, 2H), 1.83 - 1.74 (m, 2H), 1.64 - 1.56 (m, 2H), 1.47 - 1.39 (m, 2H), 1.37 - 1.27 (m, 18H).
アルキン中間体の合成
以下は、液相合成で使用されるPra中間体の詳細な例である。
INT-1001の製造
Figure 2024512074000045
INT-1001は、実施例0001の製造について記載した、以下の一般手順から構成される一般的な合成手順に従って製造した。45mLのポリプロピレン固相反応容器に、100μmolスケールでFmoc-Pra-OHを予めロードした2-クロロトリチル樹脂を加え、反応容器をSymphony Xペプチド合成装置に置いた。次いで、以下の手順を順番に実施した。
「Symphony X 樹脂膨潤手順」に従った;
「Symphony X シングルカップリング手順」に従い、Fmoc-Cys(Trt)-OHを使用した;
「Symphony X シングルカップリング手順」に従い、Fmoc-Leu-OHを使用した;
「Symphony X シングルカップリング手順」に従い、Fmoc-N-Me-Nle-OHを使用した;
「Symphony ダブルカップリング手順」に従い、Fmoc-N-Me-Nle-OHを使用した;
「Symphony ダブルカップリング手順」に従い、Fmoc-Trp(1-CHCOOtBu)-OHを使用した;
「Symphony X シングルカップリング手順」に従い、Fmoc-Dab(Boc)-OHを使用した;
「Symphony X シングルカップリング手順」に従い、Fmoc-Trp(Boc)-OHを使用した;
「Symphony X シングルカップリング手順」に従い、Fmoc-Hyp(OtBu)-OHを使用した;
「Symphony X シングルカップリング手順」に従い、Fmoc-Leu-OHを使用した;
「Symphony X シングルカップリング手順」に従い、Fmoc-Dap(Boc)-OHを使用した;
「Symphony X シングルカップリング手順」に従い、Fmoc-Pro-OHを使用した;
「Symphony ダブルカップリング手順」に従い、Fmoc-Asn(Trt)-OHを使用した;
「Symphony X シングルカップリング手順」に従い、Fmoc-N-Me-Ala-OHを使用した;
「Symphony ダブルカップリング手順」に従い、Fmoc-Tyr(OtBu)-OHを使用した;
「Symphony X 無水クロロ酢酸カップリング手順」に従った。
あるいは、「Symphony X 4当量シングルカップリング手順」または「Symphony X 4当量ダブルカップリング手順」をペプチド伸長の各ステップに使用した。
あるいは、上記の線形配列は、以下の一般的な手順から構成されるPrelude合成装置でアセンブルされた:「Prelude樹脂膨潤手順」、「Preludeシングルカップリング手順」または「Preludeダブルカップリング手順」(ここで、各カップリング反応には、4~5当量のアミノ酸および90~120分のカップリング時間を使用した)、および「Prelude無水クロロ酢酸カップリング手順」。
「全体的脱保護法A」に従い;
「環化法A」に従った。
粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×19mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;グラジエント:20%Bで0分間保持、25分間かけて20~60%B、その後100%Bで0分間保持;流量:20mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。この物質を、以下の条件で分取LC/MSによってさらに精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;グラジエント:17%Bで0分間保持、20分間かけて17~57%B、その後100%Bで0分間保持;流量:40mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は25.4mgで、LCMS分析による推定純度は100%であった。
分析条件A:保持時間=1.58分;ESI-MS(+) m/z [M+H]1+:1926.25。
分析条件B:保持時間=1.69分;ESI-MS(+) m/z [M+2H]2+:963.98。
INT-1001に記載したのと同様の手順および上記の一般的な手順に従って、下記のアルキン化合物を合成した。
INT-1002の製造
Figure 2024512074000046

INT-1002は、INT-1001の製造について記載した一般的な合成手順に従って、Fmoc-Pra-OHを予めロードしたクロロトリチル樹脂を50μmolスケールで使用して製造した。粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;グラジエント:14%Bで0分間保持、20分間かけて14~54%B、その後100%Bで0分間保持;流量:45mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。この物質を、以下の条件で分取LC/MSによってさらに精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;グラジエント:16%Bで0分間保持、20分間かけて16~56%B、その後100%Bで4分間保持;流量:40mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は3.1mgで、LCMS分析による推定純度は100%であった。
分析条件A:保持時間=1.55分;ESI-MS(+) m/z [M+2H]2+:1021.2。
INT-1003の製造
Figure 2024512074000047

INT-1003は、INT-1001の製造について記載した一般的な合成手順に従って、Fmoc-Pra-OHを予めロードしたクロロトリチル樹脂を50μmolスケールで使用して製造した。粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;グラジエント:25%Bで0分間保持、20分間かけて25~65%B、その後100%Bで0分間保持;流量:45mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。この物質を、以下の条件で分取LC/MSによってさらに精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;グラジエント:30%Bで0分間保持、20分間かけて30~70%B、その後100%Bで2分間保持;流量:40mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は11.6mgで、LCMS分析による推定純度は97%であった。
分析条件B:保持時間=1.99分;ESI-MS(+) m/z [M+2H]2+:1069.4。
INT-1004の製造
Figure 2024512074000048

INT-1004は、INT-1001の製造について記載した一般的な合成手順に従って、Fmoc-Pra-OHを予めロードしたクロロトリチル樹脂を50μmolスケールで使用して製造した。粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×19mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;グラジエント:26%Bで0分間保持、25分間かけて26~66%B、その後100%Bで0分間保持;流量:20mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は11.2mgで、LCMS分析による推定純度は92.8%であった。
分析条件B:保持時間=1.81、2.02分;ESI-MS(+) m/z [M+2H]2+:1077。
INT-1005の製造
Figure 2024512074000049

INT-1005は、INT-1001の製造について記載した一般的な合成手順に従って、Fmoc-Pra-OHを予めロードしたクロロトリチル樹脂を50μmolスケールで使用して製造した。粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;グラジエント:25%Bで0分間保持、20分間かけて25~65%B、その後100%Bで0分間保持;流量:45mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は22.4mgで、LCMS分析による推定純度は100%であった。
分析条件A:保持時間=1.87分;ESI-MS(+) m/z [M+2H]2+:1084.4。
INT-1006の製造
Figure 2024512074000050

INT-1006は、INT-1001の製造について記載した一般的な合成手順に従って、Fmoc-Pra-OHを予めロードしたクロロトリチル樹脂を50μmolスケールで使用して製造した。粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、10mM酢酸アンモニウム含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、10mM酢酸アンモニウム含有;グラジエント:25%Bで0分間保持、20分間かけて25~65%B、その後100%Bで0分間保持;流量:45mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は18.9mgで、LCMS分析による推定純度は100%であった。
分析条件A:保持時間=1.71分;ESI-MS(+) m/z [M+2H]2+:1084。
INT-1007の製造
Figure 2024512074000051

INT-1007は、INT-1001の製造について記載した一般的な合成手順に従って、Fmoc-Pra-OHを予めロードしたクロロトリチル樹脂を50μmolスケールで使用して製造した。粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;グラジエント:23%Bで0分間保持、20分間かけて23~63%B、その後100%Bで0分間保持;流量:45mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は26.8mgで、LCMS分析による推定純度は99%であった。
分析条件B:保持時間=2.23分;ESI-MS(+) m/z [M+2H]2+:1077.2。
INT-1008の製造
Figure 2024512074000052

INT-1008は、INT-1001の製造について記載した一般的な合成手順に従って、Fmoc-Pra-OHを予めロードしたクロロトリチル樹脂を50μmolスケールで使用して製造した。粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;グラジエント:23%Bで0分間保持、20分間かけて23~63%B、その後100%Bで0分間保持;流量:45mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は24.9mgで、LCMS分析による推定純度は96.9%であった。
分析条件B:保持時間=2.25分;ESI-MS(+) m/z [M+2H]2+:1077.4。
INT-1009の製造
Figure 2024512074000053

INT-1009は、INT-1001の製造について記載した一般的な合成手順に従って、Fmoc-Pra-OHを予めロードしたクロロトリチル樹脂を50μmolスケールで使用して製造した。粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×19mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;グラジエント:38%Bで0分間保持、20分間かけて38~78%B、その後100%Bで0分間保持;流量:20mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は36.5mgで、LCMS分析による推定純度は100%であった。
分析条件B:保持時間=2.21分;ESI-MS(+) m/z [M+2H]2+:1055.4。
INT-1010の製造
Figure 2024512074000054

INT-1010は、INT-1001の製造について記載した一般的な合成手順に従って、Fmoc-Pra-OHを予めロードしたクロロトリチル樹脂を50μmolスケールで使用して製造した。粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;グラジエント:26%Bで0分間保持、20分間かけて26~66%B、その後100%Bで0分間保持;流量:45mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は26.3mgで、LCMS分析による推定純度は100%であった。
分析条件A:保持時間=1.92分;ESI-MS(+) m/z [M+2H]2+:1055.3。
INT-1011の製造
Figure 2024512074000055

INT-1011は、INT-1001の製造について記載した一般的な合成手順に従って、Fmoc-Pra-OHを予めロードしたクロロトリチル樹脂を50μmolスケールで使用して製造した。粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;グラジエント:24%Bで0分間保持、20分間かけて24~64%B、その後100%Bで0分間保持;流量:45mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は17.7mgで、LCMS分析による推定純度は96.9%であった。
分析条件B:保持時間=2.13分;ESI-MS(+) m/z [M+2H]2+:1055.8。
INT-1012の製造
Figure 2024512074000056

INT-1012は、INT-1001の製造について記載した一般的な合成手順に従って、Fmoc-Pra-OHを予めロードしたクロロトリチル樹脂を50μmolスケールで使用して製造した。粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×19mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;グラジエント:38%Bで0分間保持、25分間かけて38~78%B、その後100%Bで0分間保持;流量:20mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は16.1mgで、LCMS分析による推定純度は98.9%であった。
分析条件B:保持時間=2.18分;ESI-MS(+) m/z [M+2H]2+:1020.1。
INT-1013の製造
Figure 2024512074000057

INT-1013は、INT-1001の製造について記載した一般的な合成手順に従って、Fmoc-Pra-OHを予めロードしたクロロトリチル樹脂を50μmolスケールで使用して製造した。粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;グラジエント:19%Bで0分間保持、20分間かけて19~59%B、その後100%Bで0分間保持;流量:45mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は20.2mgで、LCMS分析による推定純度は96.3%であった。
分析条件A:保持時間=1.53分;ESI-MS(+) m/z [M+2H]2+:1006.2。
INT-1014の製造
Figure 2024512074000058

INT-1014は、INT-1001の製造について記載した一般的な合成手順に従って、Fmoc-Pra-OHを予めロードしたクロロトリチル樹脂を50μmolスケールで使用して製造した。粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;グラジエント:14%Bで0分間保持、20分間かけて14~54%B、その後100%Bで0分間保持;流量:45mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。
この物質を、以下の条件で分取LC/MSによりさらに精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;グラジエント:14%Bで0分間保持、20分間かけて14~54%B、その後100%Bで2分間保持;流量:40mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は10.7mgで、LCMS分析による推定純度は100%であった。
分析条件A:保持時間=1.5分;ESI-MS(+) m/z [M+2H]2+:1014。
INT-1015の製造
Figure 2024512074000059

INT-1015は、INT-1001の製造について記載した一般的な合成手順に従って、Fmoc-Pra-OHを予めロードしたクロロトリチル樹脂を50μmolスケールで使用して製造した。粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;グラジエント:14%Bで0分間保持、20分間かけて14~54%B、その後100%Bで0分間保持;流量:45mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。この物質を、以下の条件で分取LC/MSによってさらに精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;グラジエント:16%Bで0分間保持、20分間かけて16~56%B、その後100%Bで2分間保持;流量:35mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は9.1mgで、LCMS分析による推定純度は100%であった。
分析条件A:保持時間=1.55分;ESI-MS(+) m/z [M+2H]2+:1021.1。
INT-1016の製造
Figure 2024512074000060

INT-1016は、INT-1001の製造について記載した一般的な合成手順に従って、Fmoc-Pra-OHを予めロードしたクロロトリチル樹脂を50μmolスケールで使用して製造した。粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;グラジエント:19%Bで0分間保持、20分間かけて19~59%B、その後100%Bで0分間保持;流量:45mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は38.6mgで、LCMS分析による推定純度は93%であった。
分析条件A:保持時間=1.53分;ESI-MS(+) m/z [M+2H]2+:1028.4。
INT-1017の製造
Figure 2024512074000061

INT-1017は、INT-1001の製造について記載した一般的な合成手順に従って、Fmoc-Pra-OHを予めロードしたクロロトリチル樹脂を50μmolスケールで使用して製造した。粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;グラジエント:19%Bで0分間保持、20分間かけて19~59%B、その後100%Bで0分間保持;流量:45mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は38.3mgで、LCMS分析による推定純度は90%であった。
分析条件A:保持時間=1.52分;ESI-MS(+) m/z [M+2H]2+:1028。
INT-1018の製造
Figure 2024512074000062

INT-1018は、INT-1001の製造について記載した一般的な合成手順に従って、Fmoc-Pra-OHを予めロードしたクロロトリチル樹脂を50μmolスケールで使用して製造した。粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;グラジエント:19%Bで0分間保持、20分間かけて19~59%B、その後100%Bで0分間保持;流量:45mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は22.7mgで、LCMS分析による推定純度は92.6%であった。
分析条件A:保持時間=1.43分;ESI-MS(+) m/z [M+2H]2+:1021.4。
INT-1019の製造
Figure 2024512074000063

INT-1019は、INT-1001の製造について記載した一般的な合成手順に従って、Fmoc-Pra-OHを予めロードしたクロロトリチル樹脂を50μmolスケールで使用して製造した。粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;グラジエント:20%Bで0分間保持、20分間かけて20~60%B、その後100%Bで0分間保持;流量:45mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は23.6mgで、LCMS分析による推定純度は91.2%であった。
分析条件B:保持時間=1.59分;ESI-MS(+) m/z [M+3H]3+:681。
INT-1020の製造
Figure 2024512074000064

INT-1020は、INT-1001の製造について記載した一般的な合成手順に従って、Fmoc-Pra-OHを予めロードしたクロロトリチル樹脂を50μmolスケールで使用して製造した。粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;グラジエント:21%Bで0分間保持、20分間かけて21~61%B、その後100%Bで0分間保持;流量:45mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は31.1mgで、LCMS分析による推定純度は98.1%であった。
分析条件B:保持時間=1.63分;ESI-MS(+) m/z [M+H]:1997.3。
INT-1021の製造
Figure 2024512074000065

INT-1021は、INT-1001の製造について記載した一般的な合成手順に従って、Fmoc-Pra-OHを予めロードしたクロロトリチル樹脂を50μmolスケールで使用して製造した。粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;グラジエント:20%Bで0分間保持、20分間かけて20~60%B、その後100%Bで0分間保持;流量:45mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。この物質を、以下の条件で分取LC/MSによってさらに精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;グラジエント:15%Bで0分間保持、20分間かけて15~55%B、その後100%Bで2分間保持;流量:40mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は12mgで、LCMS分析による推定純度は100%であった。
分析条件B:保持時間=1.62分;ESI-MS(+) m/z [M+2H]2+:999.3。
INT-1022の製造
Figure 2024512074000066

INT-1022は、INT-1001の製造について記載した一般的な合成手順に従って、Fmoc-Pra-OHを予めロードしたクロロトリチル樹脂を50μmolスケールで使用して製造した。粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;グラジエント:21%Bで0分間保持、20分間かけて21~61%B、その後100%Bで0分間保持;流量:45mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。この物質を、以下の条件で分取LC/MSによってさらに精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;グラジエント:18%Bで0分間保持、20分間かけて18~58%B、その後100%Bで2分間保持;流量:40mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は11mgで、LCMS分析による推定純度は98.3%であった。
分析条件A:保持時間=1.59分;ESI-MS(+) m/z [M+H]:1996.9。
INT-1023の製造
Figure 2024512074000067

INT-1023の線形配列を、Fmoc-Pra-OHを予めロードしたクロロトリチル樹脂を使用して、前述の合成手順に従って製造した(スキーム1を参照)。スキーム1の線形配列樹脂Aを切断し、「全体的脱保護法A」を使用して全体的に脱保護し、続いて「環化法A」を使用して環化した。粗生成物を逆相HPLCにより精製した。生成物の収量は30.4mgで、LCMS分析による推定純度は95.1%であった。
分析条件A:保持時間=1.53分;ESI-MS(+) m/z [M+H]:1983.8。
最終化合物の合成
以下は、液相クリック反応によって合成される最終の化合物に関する詳細な例である。
実施例1001
Figure 2024512074000068

化合物は、一般手順「液相クリックの方法A」に従って合成した。20mlシンチレーションバイアルに、100倍量の必要な量のナトリウム(R)-2-((S)-1,2-ジヒドロキシエチル)-4-ヒドロキシ-5-オキソ-2,5-ジヒドロフラン-3-オレート(0.987mg、4.89μmol)、および硫酸銅(II)五水和物(0.622mg、2.492μmol)を加えた。反応物を水(10mL)で希釈した。この溶液を室温で1~10分間振盪した。得られた黄色がかったスラリーを反応物に加えた。
INT-1001(24mg、12.0μmol)を含むバイアルに、tBuOH/水(v/v、1:1、1mL)、および(S)-1-アジド-37-オキソ-40-(16)-スルホヘキサデカンアミド)-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33-ウンデカオキサ-36-アザヘンテトラコンタン-41-酸(N-Peg11-γGlu-FSA16、16.49mg、0.016mmol)を加え、続いて、上記の銅溶液100μLを加えた。混合物を室温で1時間振盪し、LC/MSによって進行をモニタリングした。完了後、混合物をCHCN:重炭酸アンモニウム水溶液(v/v、1:1)で希釈し、濾過し、単一化合物の精製に供した。
粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×19mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;グラジエント:26%Bで0分間保持、20分間かけて26~66%B、その後100%Bで0分間保持;流量:20mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は8.8mgで、LCMS分析による推定純度は99%であった。
分析条件A:保持時間=1.55分;ESI-MS(+) m/z [M+3H]3+:982.10。
分析条件B:保持時間=1.87分;ESI-MS(+) m/z [M+3H]3+:981.98。
実施例1001と同様の手順に従って、下記の実施例1002~1006および1009の化合物を得た。
実施例1002の製造
Figure 2024512074000069

実施例1002は、12μmolスケールで製造した。粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×19mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;グラジエント:25%Bで0分間保持、20分間かけて25~65%B、その後100%Bで0分間保持;流量:20mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は5.6mgで、LCMS分析による推定純度は97.8%であった。
分析条件2:保持時間=1.6分;ESI-MS(+) m/z 2+:1006.2。
実施例1003の製造
Figure 2024512074000070

実施例1003は、10.3μmolスケールで製造した。粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;グラジエント:22%Bで0分間保持、20分間かけて22~62%B、その後100%Bで0分間保持;流量:45mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は7mgで、LCMS分析による推定純度は91.1%であった。
分析条件1:保持時間=1.54分;ESI-MS(+) m/z 2+:1530.1。
実施例1004の製造
Figure 2024512074000071

実施例1004は、9.9μmolスケールで製造した。粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×19mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;グラジエント:16%Bで0分間保持、20分間かけて16~56%B、その後100%Bで0分間保持;流量:20mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は3.7mgで、LCMS分析による推定純度は91.8%であった。
分析条件2:保持時間=1.76分;ESI-MS(+) m/z 2+:1015.3。
実施例1005の製造
Figure 2024512074000072

実施例1005は、8μmolスケールで製造した。粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×19mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;グラジエント:25%Bで0分間保持、20分間かけて25~65%B、その後100%Bで0分間保持;流量:20mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は6.7mgで、LCMS分析による推定純度は98.9%であった。
分析条件1:保持時間=1.54分;ESI-MS(+) m/z 2+:1515.1。
実施例1006の製造
Figure 2024512074000073

実施例1006は、10.6mmolスケールで製造した。粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;グラジエント:25%Bで0分間保持、20分間かけて25~65%B、その後100%Bで0分間保持;流量:45mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせ、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は1.5mgで、LCMS分析による推定純度は91%であった。
分析条件A:保持時間=1.49分;ESI-MS(+) m/z [M+2H]2+:1367.3。
実施例1007の製造
Figure 2024512074000074
INT-1023の線形アルキン中間体物質(299mg、100μmol)を、N-Peg11-γGlu-FPA16を用いた「樹脂上のクリック反応の方法A」に供し、続いて、「全体的脱保護法A」および「環化法A」を行った。
粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;グラジエント:25%Bで0分間保持、20分間かけて25~65%B、その後100%Bで0分間保持;流量:45mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。この物質を、以下の条件で分取LC/MSによってさらに精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;グラジエント:15%Bで0分間保持、20分間かけて15~55%B、その後100%Bで0分間保持;流量:45mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は2.8mgで、LCMS分析による推定純度は100%であった。
分析条件A:保持時間=1.75分;ESI-MS(+) m/z [M+3H]3+:1001.3。
分析条件B:保持時間=1.82分;ESI-MS(+) m/z [M+3H]3+:1001.3。
実施例1008の製造
Figure 2024512074000075

実施例1008は、100μmolスケールで、実施例1007と同様の手順に従って、INT-1023の線形配列から出発して、N-Peg11-γGlu-FSA16を用いた「樹脂上のクリック反応の方法A」を行い、続いて、「全体的脱保護法A」および「環化法A」を行って、製造した。
粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;グラジエント:24%Bで0分間保持、20分間かけて24~64%B、その後100%Bで0分間保持;流量:45mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。この物質を、以下の条件で分取LC/MSによってさらに精製した。カラム:XBridge C18、200mm×30mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;グラジエント:20%Bで0分間保持、20分間かけて20~60%B、その後100%Bで0分間保持;流量:45mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は3mgで、LCMS分析による推定純度は98.2%であった。
分析条件B:保持時間=1.83分;ESI-MS(+) m/z [M+3H]3+:1001.08。
実施例1009の製造
Figure 2024512074000076

実施例1009は、50μmolスケールで、実施例1007に記載の手順に従って、INT-1023の線形配列から出発して、(S)-4-アジド-2-(14-スルホテトラデカンアミド)ブタン酸を用いた「樹脂上のクリック反応の方法A」を行い、続いて「全体的脱保護法A」および「環化法A」を行って、製造した。
クリックケミストリーは、樹脂結合キャップされた線状ペプチドAに対して0.05mmolスケールで実施した。Bio Radチューブ内の樹脂AをDCM(3×5mL)で洗浄し、次いで、DMF(4×5mL)で洗浄した。樹脂に、ビス(2,2,6,6-テトラメチル-3,5-ヘプタンジオナト)銅(II)(10.75mg、0.025mmol)、ビタミンC(0.026g、0.150mmol)、2,6-ルチジン(0.058ml、0.500mmol)、DIEA(0.087ml、0.500mmol)、THF(1.500mL)、およびDMF(1.5mL)を含む溶液を加えた。上記溶液を、(S)-4-アジド-2-(14-スルホテトラデカンアミド)ブタン酸(0.037g、0.085mmol)を入れた秤量したバイアルに加えた。得られた溶液を樹脂に加えた。チューブに蓋をし、シェーカーテーブル上で一晩振盪した。溶液を排出し、樹脂をDMF(6×5ml)、次いで、DCM(3×5mL)で洗浄した。樹脂を95%TFA、2.5%TISおよび2.5%DTT(5mL)で処理し、室温で1時間振盪した。溶液を、冷却した35mLのEtOを含む50mLのFalconチューブに排出した。得られた白色沈殿物を遠心分離機(3×4分×300RPM)により収集し、エーテル層を廃棄した。ペレットを室温で1時間風乾した。これをDMF(30ml)に溶解し、DIEA(1mL)を加えた。反応混合物を室温で6時間振盪した。反応物をGenevacで濃縮した。得られたサンプルを2mlのDMFに溶解し、精製に供した。
粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×19mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;グラジエント:18%Bで0分間保持、25分間かけて18~60%B、その後100%Bで0分間保持;流量:20mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は4.2mgで、LCMS分析による推定純度は89%であった。LC/MS分析を使用して最終純度を決定した。インジェクション1の条件:カラム:Waters XBridge C18、2.1mm×50mm、1.7μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、10mM酢酸アンモニウム含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、10mM酢酸アンモニウム含有;温度:50℃;グラジエント:3分間かけて0%Bから100%B、その後100%Bで0.50分間保持;流量:1mL/分。検出:MSおよびUV(220nm)。インジェクション1の結果(分析条件A):純度:88.8%;測定質量:ESI-MS(+) m/z [M+2H]2+ 1210.10;保持時間:1.5分。インジェクション2の条件:カラム:Waters XBridge C18、2.1mm×50mm、1.7μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.1%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.1%トリフルオロ酢酸含有;温度:50℃;グラジエント:3分間で0%Bから100%B、その後100%Bで0.50分間保持;流量:1mL/分。検出:MSおよびUV(220nm)。インジェクション2の結果(分析条件B):純度:98.1%。測定質量:ESI-MS(+) m/z [M+2H]2+ 1209.80;保持時間:1.74分。
実施例1010の製造
Figure 2024512074000077

実施例1010は、44μmolスケールで、実施例1001の手順に従って、「樹脂上のクリック反応の方法A」を用いて、INT-1023とN-Peg3-γGlu-FSA12とを反応させて製造した。
粗物質を、以下の条件で分取LC/MSにより精製した。カラム:XBridge C18、200mm×19mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.05%トリフルオロ酢酸含有;グラジエント:20%Bで0分間保持、20分間かけて20~60%B、その後100%Bで0分間保持;流量:20mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。この物質を、以下の条件で分取LC/MSによってさらに精製した。カラム:XBridge C18、200mm×19mm、5μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、酢酸アンモニウム含有;グラジエント:13%Bで0分間保持、20分間かけて13~53%B、その後100%Bで0分間保持;流量:20mL/分;カラム温度:25℃。画分の収集はMSシグナルによって開始された。目的の生成物を含む画分を合わせて、遠心蒸発により乾燥させた。生成物の収量は17.0mgで、LCMS分析による推定純度は98%であった。LC/MS分析を使用して最終純度を決定した。インジェクション1の条件:カラム:Waters XBridge C18、2.1mm×50mm、1.7μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、10mM酢酸アンモニウム含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、10mM酢酸アンモニウム含有;温度:50℃;グラジエント:3分間で0%Bから100%B、その後100%Bで0.50分間保持;流量:1mL/分。検出:MSおよびUV(220nm)。
インジェクション1(分析条件A)の結果:純度:99.2%;測定質量:865.80;保持時間:1.46分。インジェクション2の条件:カラム:Waters XBridge C18、2.1mm×50mm、1.7μm粒子;移動相A:5:95のアセトニトリル:水、0.1%トリフルオロ酢酸含有;移動相B:95:5のアセトニトリル:水、0.1%トリフルオロ酢酸含有;温度:50℃;グラジエント:3分間で0%Bから100%B、その後100%Bで0.50分間保持;流量:1mL/分。検出:MSおよびUV(220nm)。インジェクション2(分析条件B)の結果:純度:97.7%。測定質量:1297.60;保持時間:1.66分。
ホモジニアス時間分解蛍光(HTRF)結合アッセイを用い、PD-1のPD-L1への結合に対して大環状ペプチドが競合する能力を試験する方法
本開示の大環状ペプチドがPD-L1に結合する能力を、PD-1/PD-L1ホモジニアス時間分解蛍光(HTRF)結合アッセイを用いて調べた。
方法
可溶性PD-L1への可溶性PD-1の結合についてのホモジニアス時間分解蛍光(HTRF)アッセイによる。可溶性PD-1および可溶性PD-L1は、膜貫通領域を除去し、異種配列、具体的には、ヘキサヒスチジンエピトープタグ(His)またはヒト免疫グロブリンG配列(Ig)のFc部分、に融合する、カルボキシル末端切断(トランケーション)を有するタンパク質を表す。すべての結合試験は、0.1%(w/v)ウシ血清アルブミンおよび0.05%(v/v)Tween-20を添加したdPBSからなるHTRFアッセイバッファー中で実施した。PD-1-Ig/PD-L1-His結合アッセイのため、阻害剤を、PD-L1-His(最終10nM)とともに4μlのアッセイバッファー中で15分間プレインキュベートし、続いて、PD-1-Ig(最終20nM)の1μlのアッセイバッファーを加え、さらに15分間インキュベートした。ヒト、カニクイザル、マウス、またはその他の種に由来するPD-L1融合タンパク質を使用した。HTRF検出は、ユーロピウムクリプテート標識抗Igモノクローナル抗体(最終1nM)およびアロフィコシアニン(APC)標識抗Hisモノクローナル抗体(最終20nM)を使用して行った。抗体をHTRF検出バッファーで希釈し、5μlを結合反応液の上に分注した。反応物を30分間平衡化させ、EnVision蛍光光度計を使用してシグナル(665nm/620nm比)を測定した。PD-1-Ig/PD-L2-His(それぞれ20nMおよび5nM)、CD80-His/PD-L1-Ig(それぞれ100nMおよび10nM)、および、CD80-His/CTLA4-Ig(それぞれ10nMおよび5nM)間の追加の結合アッセイが確立された。
ビオチン化化合物No.71(構造についてはWO2014/151634の212ページのExample 72を参照)とヒトPD-L1-Hisとの間の結合/競合の試験を以下のように実施した。大環状ペプチド阻害剤を、4μlのアッセイバッファー中でPD-L1-His(最終10nM)とともに60分間プレインキュベートし、続いて、ビオチン化化合物No.71(最終0.5nM)を含む1μlのアッセイバッファーを加えた。結合を30分間平衡化させた後、ユウロピウムクリプテート標識ストレプトアビジン(最終2.5pM)およびAPC標識抗His(最終20nM)を含む5μlのHTRFバッファーを加えた。反応物を30分間平衡化し、EnVision蛍光光度計を使用してシグナル(665nm/620nm比)を測定した。
組換えタンパク質。C末端ヒトIgエピトープタグ[hPD-1(25-167)-3S-IG]を有するカルボキシル切断型ヒトPD-1(アミノ酸25~167)、および、C末端Hisエピトープタグ[hPD-L1(19-239)-タバコ静脈斑点ウイルス(tobacco vein mottling virus)プロテアーゼ切断部位(TVMV)-His]を有するヒトPD-L1(アミノ酸18~239)を、HEK293T細胞で発現させ、組換えタンパク質Aアフィニティークロマトグラフィー、およびサイズ排除クロマトグラフィーによって、連続的に精製した。ヒトPD-L2-His(Sino Biologicals)、CD80-His(Sino Biologicals)、CTLA4-Ig(RnD Systems)はすべて商業的供給源から入手した。
組換えヒトPD-1-Igの配列
(配列番号:1)
組換えヒトPD-L1-TVMV-His(PD-L1-His)の配列
(配列番号:2)
293T-hPD-L1細胞結合ハイコンテントスクリーニングアッセイ(CBA)
フィコエリトリン(PE)を、ヒトPD-1-IgのIgエピトープタグに共有結合させ、蛍光標識されたPD-1-Igを、ヒトPD-L1を安定的に過剰発現するヒト胎児腎臓細胞株(293T)(すなわち293T-hPD-L1)との結合試験に使用した。簡単に説明すると、2×10個の293T-hPD-L1細胞を、10%ウシ胎児血清を添加した20μlのDMEMの384ウェルプレートに播種し、一晩培養した。125nlの化合物を細胞に加え、続いて、5μlのPE標識PD-1-Ig(最終0.5nM)を加え、10%ウシ胎児血清を添加したDMEMで希釈し、その後、37℃で1時間インキュベートした。細胞を100μlのdPBSで3回洗浄し、続いて、10μg/mlのHoechst 33342を含むdPBS液の4%パラホルムアルデヒド30μlによって、室温で30分間固定した。細胞を100μlのdPBSで3回洗浄し、最後に15μlのdPBSを加えた。データを、Cell Insight NXT High Content Imagerおよび関連ソフトウェアを使用して収集および処理した。
表1に、PD-1/PD-L1ホモジニアス時間分解蛍光(HTRF)結合アッセイ、および293T-hPD-L1細胞結合ハイコンテントスクリーニングアッセイで測定された本開示の代表的な実施例のIC50値を記載する。
Figure 2024512074000080
本開示は、前述した例示的な実施例に限定されるものではなく、その本質的な特質から逸脱することなく他の特定の形態で具体化できることは、当業者には明らかであろう。したがって、実施例はあらゆる点で例示的であり限定的ではないとみなされ、前述の実施例ではなく添付の特許請求の範囲を参照することが望ましく、したがって、特許請求の範囲の均等の意味および範囲内に入るすべての変更は、特許請求の範囲に包含されることを意図している。
式(I)の化合物は、PD-1/PD-L1相互作用の阻害剤としての活性を有し、したがって、PD-1/PD-L1相互作用に関連する疾患または欠損症の治療に使用することができる。PD-1/PD-L1相互作用の阻害を介して、本開示の化合物は、感染症、例えば、HIV、敗血症性ショック、A型、B型、C型、またはD型肝炎、および、がんなどを治療するために使用することができる。
要約および概要の欄ではなく、詳細な説明の欄が特許請求の範囲を解釈するために使用されることを意図していることを理解されたい。要約および概要の欄は、発明者によって企図された本開示のすべてではないが、1つまたは複数の例示的な実施形態を説明することができ、したがって、いかなる方法でも本開示および添付の特許請求の範囲を限定することを意図するものではない。
本開示は、特定の機能の実施およびそれらの関係を示す機能構成要素(ブロック)を利用して上記で説明されている。これらの機能構成要素の境界は、説明の便宜のために、本明細書では任意に定義されている。指定された機能とその関係が適切に実施される限り、代替の境界を定義することができる。
特定の実施形態の前述の説明は、本開示の一般的な性質を十分に明らかにするものであり、他者は、当業者の知識を適用することによって、本開示の一般的な概念から逸脱することなく、過度の実験を行うことなく、そのような特定の実施形態を様々な適用に容易に改変および/または適合させることができる。したがって、そのような適合および改変は、本明細書に提示された教示および指針に基づいて、開示された実施形態の均等物の意味および範囲内にあることが意図される。ここに記載の用語または表現は説明を目的とするものであり、限定を目的とするものではないため、本明細書の用語または表現は、教示および指針に照らして、当業者によって解釈されるべきであることを理解されたい。
本開示の範囲および幅は、上述の例示的な実施形態のいずれによっても限定されるべきではなく、添付の特許請求の範囲およびその均等範囲に従ってのみ定義されるべきである。

Claims (19)

  1. 式(I)
    Figure 2024512074000081
    (I)

    [式中、
    Aは、
    Figure 2024512074000082
    から選択され;
    ここで、
    Figure 2024512074000083
    は、カルボニル基への結合点を示し、
    Figure 2024512074000084
    は、窒素原子への結合点を示し;
    nは、0または1であり;
    mは、1または2であり;
    uは、0または1であり;
    wは、0、1、または2であり;
    は、水素、アミノ、ヒドロキシ、およびメチルから選択され;
    14およびR15は、独立して、水素およびメチルから選択され;
    16aは、水素およびC-Cアルキルから選択され;
    16は、
    -(C(R17a-X-R30、-(C(R17a17))0-2-X’-R30、-(C(R17a171-2C(O)NR16am’-X’-R30
    -C(R17aC(O)N(R16a)C(R17a-X’-R31、-(C(R17a17))1-2C(O)N(R16a)C(R17a-X’-R31
    -C(R17a[C(O)N(R16a)C(R17aw’-X-R31、-C(R17a171-2[C(O)N(R16a)C(R17a171-2w’-X’-R31
    -(C(R17a)(R17)C(O)NR16an’-H、;および、
    -(C(R17a)(R17)C(O)NR16am’-C(R17a)(R17)-CO
    から選択され;
    ここで、PEGq’スペーサーは、R16の任意の部分に挿入されてもよく(q’は、PEGスペーサー内の-(CHCHO)-ユニットの数である)、
    ここで、w’は、2または3であり;
    n’は、1~6であり;
    m’は、0~5であり;
    q’は、1~20であり;
    Xは、1~172個の原子の鎖であり、その原子は、n:
    炭素および酸素から選択され、該鎖は、-NHC(O)-、-NHC(O)NH-、および-C(O)NH-から選択される、1、2、3または4個の基をその中に埋め込まれて含んでいてもよく;該鎖は、-COH、-C(O)NH、-CHC(O)NH、および-(CH1-2COHから独立して選択される1~6個の基で任意に置換されていてもよく;
    X’は、1~172個の原子の鎖であり、その原子は、炭素および酸素から選択され、該鎖は、-NHC(O)-、-NHC(O)NH-、および-C(O)NH-から選択される、1、2、3または4個の基をその中に埋め込まれて含んでいてもよく;該鎖は、-COH、-C(O)NH、および-(CH1-2COHから独立して選択される1~6個の基で任意に置換されていてもよく、ただし、X’は、非置換のPEG以外であり;
    30は、-SOH、-S(O)OH、および-P(O)(OH)から選択され;
    31は、-S(O)OH、-S(O)OH、および-P(O)(OH)から選択され;
    各R17aは、水素、C-Cアルキル、-CHOH、-CHCOH、-(CHCOHから独立して選択され;
    各R17は、水素、-CH、(CH、-(CHNH、-X-R31、-(CHCOH、-CHOH、CHC≡CH、および-(CH-トリアゾリル-X-R35から独立して選択され、ここで、zは、1~6であり、R35は、-SOH、-S(O)OH、および-P(O)(OH)から選択され;ただし、少なくとも1つのR17は、水素、-CH、または-CHOH以外であり;
    ただし、R30、R31、またはR35の少なくとも1つは存在し;
    、R、R、およびRは、それぞれ独立して、水素およびメチルから選択され;
    、R、R、R、R、R、R、R、R、R10、R11、R12、およびR13は、天然アミノ酸側鎖および非天然アミノ酸側鎖から独立して選択されるか、または、以下に説明するように対応する隣接するR基と環を形成し;
    は、メチルであるか、または、RとRは、それらが結合している原子と一緒になって、アゼチジン、ピロリジン、モルホリン、ピペリジン、ピペラジン、およびテトラヒドロチアゾールから選択される環を形成し;ここで、各環は、アミノ、シアノ、メチル、ハロ、およびヒドロキシから独立して選択される1~4個の基で任意に置換されていてもよく;
    は、水素またはメチルであるか、または、RとRは、それらが結合している原子と一緒になって、アゼチジン、ピロリジン、モルホリン、ピペリジン、ピペラジン、およびテトラヒドロチアゾールから選択される環を形成してもよく;ここで、各環は、アミノ、シアノ、メチル、ハロ、ヒドロキシ、およびフェニルから独立して選択される1~4個の基で任意に置換されていてもよく;
    は、水素またはメチルであるか、または、RとRは、それらが結合している原子と一緒になって、アゼチジン、ピロリジン、モルホリン、ピペリジン、ピペラジン、およびテトラヒドロチアゾールから選択される環を形成してもよく;ここで、各環は、アミノ、任意にハロ基で置換されていてもよいベンジル、ベンジルオキシ、シアノ、シクロヘキシル、メチル、ハロ、ヒドロキシ、任意にメトキシ基で置換されていてもよいイソキノリニルオキシ、任意にハロ基で置換されていてもよいキノリニルオキシ、およびテトラゾリル、から独立して選択される1~4個の基で任意に置換されていてもよく;ここで、ピロリジンおよびピペリジン環は、シクロヘキシル、フェニル、または、インドール基に任意に縮合されていてもよく;および、
    は、メチルであるか、または、RとR12は、それらが結合している原子と一緒になって、アゼチジンおよびピロリジンから選択される環を形成し、ここで、各環は、アミノ、シアノ、メチル、ハロ、およびヒドロキシから独立して選択される1~4個の基で任意に置換されていてもよい。]
    で示される化合物、またはその薬学的に許容される塩。
  2. Aが、
    Figure 2024512074000085
    であり;
    mが1であり、wが0であり;および、
    14、R15、およびR16aが、それぞれ水素である、
    請求項1に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
  3. 16が、-(C(R17a-X-R30、-(C(R17a17))0-2-X’-R30、および-(C(R17a171-2C(O)NR16am’ -X’-R30から選択され;
    各R17aが、水素、-COH、および-(CH1-2COHから選択され;
    Xが、8~46個の原子の鎖であり、その原子は、炭素および酸素から選択され、該鎖は、1、2、または3個の-NHC(O)-、C(O)NH基をその中に埋め込まれて含んでいてもよく;該鎖は、-COH、-C(O)NH、-CHC(O)NH、および-CHCOHから独立して選択される1または2個の基で任意に置換されていてもよく;および、
    30が、-SOH、および-P(O)(OH)から選択される、
    請求項1または2に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
  4. Aが、
    Figure 2024512074000086
    であり;
    mが1であり、wが0であり;
    14、R15、およびR16aが、それぞれ水素であり;
    16が、-C(R17aC(O)N(R16a)C(R17a-X’-R31、および-(C(R17a17))1-2C(O)N(R16a)C(R17a-X’-R31から選択され;
    各R17aが、水素、-COH、および-CHCOHから選択され;
    X’が、8~48個の原子の鎖であり、その原子は、炭素および酸素から選択され、該鎖は、1、2、または3個の-NHC(O)-または-C(O)NH-基をその中に埋め込まれて含んでいてもよく;該鎖は、-COH、-C(O)NH、-CHC(O)NH、および-CHCOHから独立して選択される1または2個の基で任意に置換されていてもよく;ただし、X’は、非置換PEG以外であり;および、
    30は、-SOH、および-P(O)(OH)から選択される、
    請求項1~3のいずれか1項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
  5. Aが、
    Figure 2024512074000087
    であり;
    mが1であり、wが0であり;
    14、R15、およびR16aが、それぞれ水素であり;
    16が、-C(R17a[C(O)N(R16a)C(R17aw’-X-R31、および-C(R17a171-2[C(O)N(R16a)C(R17a171-2w’-X’-R31から選択され;
    各R17aが、水素、-COH、および-CHCOHから選択され;
    Xが、8~48個の原子の鎖であり、その原子は、炭素および酸素から選択され、該鎖は、1、2、または3個の-NHC(O)-または-C(O)NH-基をその中に埋め込まれて含んでいてもよく;該鎖は、-COH、-C(O)NH、-CHC(O)NH、および-CHCOHから独立して選択される1または2個の基で任意に置換されていてもよく;および、
    31が、-SOH、および-P(O)(OH)から選択される、
    請求項1~3のいずれか1項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
  6. Aが、
    Figure 2024512074000088
    であり;
    mが1であり、wが0であり;
    14、R15、およびR16aが、それぞれ水素であり;
    16が、-(C(R17a)(R17)C(O)NR16an’-Hであり;
    各R17aが、水素であり;
    各R17が、水素、-CH、(CH、-(CHNH、-X-R31
    -(CHCOH、-CHOH、CHC≡CH、および-(CH-トリアゾリル-X-R35から選択され;ただし、少なくとも1つのR17は、水素、-CH、または-CHOH以外であり、ただし、少なくとも1つのR31またはR35は、存在し;
    zが、1~4であり;
    31が、-SOH、および-P(O)(OH)から選択され;
    Xが、7~155個の原子の鎖であり、その原子は、炭素および酸素から選択され、該鎖は、1、2、または3個の-NHC(O)-または-C(O)NH-基をその中に埋め込まれて含んでいてもよく;該鎖は、-COH、-C(O)NH、-CHC(O)NH、および-CHCOHから独立して選択される1または2個の基で任意に置換されていてもよく;および、
    35が、-SOH、および-P(O)(OH)から選択される、
    請求項1~3のいずれか1項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
  7. Aが、
    Figure 2024512074000089
    であり;
    mが1であり、wが0であり;
    14、R15、およびR16aが、それぞれ水素であり;
    16が、-(CR17a)(R17)C(O)NR16am’-C(R17a)(R17)-COHであり;
    m’が、0~3であり;
    各R17aが、水素であり;
    各R17が、水素、-CH、(CH、-(CHNH、-X-R31
    -(CHCOH、-CHOH、CHC≡CH、-(CH-トリアゾリル-X-R35;および
    Figure 2024512074000090
    から選択され;
    ただし、少なくとも1つのR17は、水素、-CH、または-CHOH以外であり、ただし、少なくとも1つのR31またはR35は、存在し;
    zが、1~4であり;
    31が、-SOH、および-P(O)(OH)から選択され;
    Xが、10~60個の原子の鎖であり、その原子は、炭素および酸素から選択され、該鎖は、1、2、または3個の-NHC(O)-、-C(O)NH-基をその中に埋め込まれて含んでいてもよく;該鎖は、-COH、-C(O)NH、-CHC(O)NH、および-CHCOHから独立して選択される1または2個の基で任意に置換されていてもよく;および、
    35が、-SOH、および-P(O)(OH)から選択される、
    請求項1~3のいずれか1項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
  8. が、フェニルC-Cアルキルであり、ここで、フェニル部分は、ヒドロキシル、ハロ、またはメトキシで任意に置換されていてもよく;
    が、C-Cアルキルであるか、または、RとRは、それらが結合している原子と一緒になってピペリジン環を形成し;
    が、NR(C-Cアルキル)、NRカルボニルC-Cアルキル、またはカルボキシC-Cアルキルであり;
    とRは、それらが結合している原子と一緒になってピロリジン環を形成し;
    が、ヒドロキシC-Cアルキル、イミダゾリルC-Cアルキル、またはNR(C-Cアルキル)であり、
    が、カルボキシC-Cアルキル、NRカルボニルC-Cアルキル、NR(C-Cアルキル)、またはC-Cアルキルであり;
    とRは、それらが結合している原子と一緒になって、任意にヒドロキシで置換されていてもよいピロリジン環を形成し;
    およびR10は、ベンゾチエニルまたはインドリルC-Cアルキルであり、これはカルボキシC-Cアルキルで任意に置換されていてもよく;
    が、ヒドロキシC-Cアルキル、アミノC-Cアルキル、またはC-Cアルキルであり;
    11が、C-CアルコキシC-Cアルキル、またはC-Cアルキルであり;
    12が、C-Cアルキル、またはヒドロキシC-Cアルキルであり;および、
    13が、C-Cアルキル、カルボキシC-Cアルキル、または-(CHNHC(NH)NHである、
    請求項1~7のいずれか1項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
  9. Aが、
    Figure 2024512074000091
    であり;
    mが1であり、wが0であり;
    14およびR15が、それぞれ水素であり;
    16aが、水素またはメチルであり;
    が、メチルであるか、または、RとRは、それらが結合している原子と一緒になって、アゼチジン、ピロリジン、モルホリン、ピペリジン、ピペラジン、およびテトラヒドロチアゾールから選択される環を形成し;ここで、各環は、アミノ、シアノ、メチル、ハロ、ヒドロキシ、およびフェニルから独立して選択される1または2個の基で任意に置換されていてもよく;
    が、メチルであるか、または、RとRは、それらが結合している原子と一緒になって、アゼチジン、ピロリジン、モルホリン、ピペリジン、ピペラジン、およびテトラヒドロチアゾールから選択される環を形成し;ここで、各環は、アミノ、任意にハロ基で置換されていてもよいベンジル、ベンジルオキシ、シアノ、シクロヘキシル、メチル、ハロ、ヒドロキシ、任意にメトキシ基で置換されていてもよいイソキノリニルオキシ、任意にハロ基で置換されていてもよいキノリニルオキシ、およびテトラゾリルから独立して選択される1または2個の基で置換されていてもよく;ここで、ピロリジン環およびピペリジン環は、任意にシクロヘキシル、フェニル、またはインドール基に縮合されていてもよく;そして、ピロリジンでもよい、
    請求項1に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
  10. 下記:
    Figure 2024512074000092
    1001

    Figure 2024512074000093
    1002

    Figure 2024512074000094
    1003

    Figure 2024512074000095
    1004

    Figure 2024512074000096
    1005

    Figure 2024512074000097
    1006

    Figure 2024512074000098
    1007

    Figure 2024512074000099
    1008

    Figure 2024512074000100
    1009

    または
    Figure 2024512074000101

    で示される化合物、またはその薬学的に許容される塩。
  11. 請求項1~9のいずれか1項に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩、および薬学的に許容される担体、を含む、医薬組成物。
  12. 請求項10に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩、および薬学的に許容される担体を、含む、医薬組成物。
  13. 必要とする対象における免疫応答を増強、刺激、および/または増加させる方法であって、治療有効量の請求項1~10のいずれか1項に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩を対象に投与することを含む、方法。
  14. 必要とする対象におけるがん細胞の成長、増殖、または転移を阻害する方法であって、治療有効量の請求項1~10のいずれか1項に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩を対象に投与することを含む、方法。
  15. がんが、黒色腫、腎細胞癌、扁平上皮非小細胞肺癌(NSCLC)、非扁平上皮NSCLC、結腸直腸癌、去勢抵抗性前立腺癌、卵巣癌、胃癌、肝細胞癌、膵臓癌、頭頸部の扁平上皮癌、食道癌、消化管癌、乳癌、および血液悪性腫瘍、から選択される、請求項14に記載の方法。
  16. 必要とする対象における感染症を治療する方法であって、治療有効量の請求項1~10のいずれか1項に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩を対象に投与することを含む、方法。
  17. 感染症が、ウイルスによって引き起こされる、請求項16に記載の方法。
  18. 必要とする対象における敗血症性ショックを治療する方法であって、治療有効量の請求項1~10のいずれか1項に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩を対象に投与することを含む、方法。
  19. 対象においてPD-L1とPD-1および/またはCD80との相互作用を遮断する方法であって、治療有効量の請求項1~10のいずれか1項に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩を対象に投与することを含む、方法。
JP2023558898A 2021-03-24 2022-03-24 免疫調節剤 Pending JP2024512074A (ja)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US202163165455P 2021-03-24 2021-03-24
US63/165,455 2021-03-24
PCT/US2022/021760 WO2022204412A1 (en) 2021-03-24 2022-03-24 Immunomodulators

Publications (1)

Publication Number Publication Date
JP2024512074A true JP2024512074A (ja) 2024-03-18

Family

ID=81580355

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2023558898A Pending JP2024512074A (ja) 2021-03-24 2022-03-24 免疫調節剤

Country Status (6)

Country Link
US (1) US20240199701A1 (ja)
EP (1) EP4314012A1 (ja)
JP (1) JP2024512074A (ja)
KR (1) KR20230160321A (ja)
CN (1) CN117157306A (ja)
WO (1) WO2022204412A1 (ja)

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN116178214B (zh) * 2022-12-08 2024-03-26 吉尔生化(上海)有限公司 一种n-(9-芴甲氧羰基)-谷氨酸-1-叔丁酯的制备方法
CN118084734A (zh) * 2024-04-17 2024-05-28 成都海杰亚医药科技有限公司 一种o-[2-[[叔丁氧羰基]氨基]乙基]-n-[芴甲氧羰基]-l-酪氨酸的制备方法

Family Cites Families (22)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4475196A (en) 1981-03-06 1984-10-02 Zor Clair G Instrument for locating faults in aircraft passenger reading light and attendant call control system
US4447233A (en) 1981-04-10 1984-05-08 Parker-Hannifin Corporation Medication infusion pump
US4439196A (en) 1982-03-18 1984-03-27 Merck & Co., Inc. Osmotic drug delivery system
US4522811A (en) 1982-07-08 1985-06-11 Syntex (U.S.A.) Inc. Serial injection of muramyldipeptides and liposomes enhances the anti-infective activity of muramyldipeptides
US4447224A (en) 1982-09-20 1984-05-08 Infusaid Corporation Variable flow implantable infusion apparatus
US4487603A (en) 1982-11-26 1984-12-11 Cordis Corporation Implantable microinfusion pump system
US4486194A (en) 1983-06-08 1984-12-04 James Ferrara Therapeutic device for administering medicaments through the skin
US4596556A (en) 1985-03-25 1986-06-24 Bioject, Inc. Hypodermic injection apparatus
US5374548A (en) 1986-05-02 1994-12-20 Genentech, Inc. Methods and compositions for the attachment of proteins to liposomes using a glycophospholipid anchor
MX9203291A (es) 1985-06-26 1992-08-01 Liposome Co Inc Metodo para acoplamiento de liposomas.
US4941880A (en) 1987-06-19 1990-07-17 Bioject, Inc. Pre-filled ampule and non-invasive hypodermic injection device assembly
US4790824A (en) 1987-06-19 1988-12-13 Bioject, Inc. Non-invasive hypodermic injection device
US5108921A (en) 1989-04-03 1992-04-28 Purdue Research Foundation Method for enhanced transmembrane transport of exogenous molecules
US5312335A (en) 1989-11-09 1994-05-17 Bioject Inc. Needleless hypodermic injection device
US5064413A (en) 1989-11-09 1991-11-12 Bioject, Inc. Needleless hypodermic injection device
US5383851A (en) 1992-07-24 1995-01-24 Bioject Inc. Needleless hypodermic injection device
EP2696897A2 (en) * 2011-04-11 2014-02-19 Yeda Research and Development Co. Ltd. Albumin binding probes and drug conjugates thereof
US9308236B2 (en) 2013-03-15 2016-04-12 Bristol-Myers Squibb Company Macrocyclic inhibitors of the PD-1/PD-L1 and CD80(B7-1)/PD-L1 protein/protein interactions
CN105451776B (zh) * 2013-08-15 2020-04-17 诺和诺德股份有限公司 Glp-1衍生物及其用途
US9856292B2 (en) * 2014-11-14 2018-01-02 Bristol-Myers Squibb Company Immunomodulators
JP7206222B2 (ja) * 2017-06-23 2023-01-17 ブリストル-マイヤーズ スクイブ カンパニー Pd-1のアンタゴニストとして作用する免疫調節剤
WO2019005623A1 (en) * 2017-06-30 2019-01-03 Adepthera Llc PEPTIDE ANALOGS

Also Published As

Publication number Publication date
CN117157306A (zh) 2023-12-01
WO2022204412A1 (en) 2022-09-29
US20240199701A1 (en) 2024-06-20
KR20230160321A (ko) 2023-11-23
EP4314012A1 (en) 2024-02-07

Similar Documents

Publication Publication Date Title
EP3271373B1 (en) Immunomodulators
CN110997698B (zh) 充当pd-1拮抗剂的免疫调节剂
CN110267971B (zh) 免疫调节剂
US11492375B2 (en) Cyclic peptide immunomodulators
EP3233887B1 (en) Immunomodulators
CN107001424B (zh) 免疫调节剂
US9879046B2 (en) Macrocyclic inhibitors of the PD-1/PD-L1 and CD80(B7-1)/PD-L1 protein/protein interactions
CN107207568B (zh) 免疫调节剂
CN107108697B (zh) 免疫调节剂
JP2024512074A (ja) 免疫調節剤
JP2022533233A (ja) 免疫調整剤
EP4419540A1 (en) Immunomodulators
JP2024540950A (ja) 免疫調節剤