JP2022526881A - 抗tnf抗体組成物を産生するための方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、2018年12月7日付で作成された「JBI6054USPSP1SEQLIST.TXT」というファイル名のASCII形式の配列表としてEFS-Webを介して電子的に提出され、25,155バイトのサイズを有する配列表を含む。EFS-Webを介して提出された配列表は、本明細書の一部であり、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
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Sequences of Proteins of Immunological Interest,U.S.Dept.Health(1983)があり、各々は、参照により全体が本明細書に組み込まれる。
いくつかの他の哺乳類細胞株の利用可能性にもかかわらず、現在生産されている組換え治療タンパク質の大部分は、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞で作成されている(Jayapal KPら、Recombinant protein therapeutics from CHO cells-20 years and counting.Chem.Eng.Prog.2007年;103:40-47、Kunert R、Reinhart D.Advances in recombinant antibody manufacturing.Appl Microbiol Biotechnol.2016年;100(8):3451-61)。それらの強みは、例えば、付着細胞又は懸濁液中での堅牢な増殖、無血清及び化学的に定義された培地への適応性、高い生産性、及び治療用組換えタンパク質産生に対する法的な承認の確立された歴史が挙げられる。これらはまた、遺伝子改変が非常に受入容易であり、細胞トランスフェクション、組換えタンパク質発現、クローン選択の方法は十分に特徴付けられる。CHO細胞はまた、ヒトに適合する翻訳後修飾を提供することができる。本明細書で使用するとき、「CHO細胞」としては、例えば、CHO-DG44、CHO-Kl、CHO-M、CHO-S、CHO GSノックアウト、並びにこれらの改変及び誘導体が挙げられるが、これらに限定されない。
配列番号1、2及び3の重鎖可変CDR領域の全て並びに/又は配列番号4、5及び6の軽鎖可変CDR領域の全てを含む本発明の単離された抗体は、任意の好適なポリヌクレオチドによってコードされる本明細書で開示される抗体のアミノ酸配列、又は任意の単離又は調製された抗体を含む。好ましくは、ヒト抗体又は抗原結合断片は、ヒトTNFに結合し、それにより、タンパク質の少なくとも1つの生物学的活性を部分的又は実質的に中和する。少なくとも1つのTNFタンパク質又は断片の少なくとも1つの生物学的活性を部分的に又は好ましくは実質的に中和する抗体又はその特定された部分若しくは変異体は、タンパク質又は断片に結合し、それによりTNFのTNF受容体への結合を通して、又は他のTNF依存性若しくは介在性機序を通して介在される活性を阻害することができる。本明細書で使用された場合、用語「中和抗体」は、アッセイに応じて約20~120%、好ましくは少なくとも約10、20、30、40、50、55、60、65、70、75、80、85、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100%又はそれ以上、TNF依存性活性を阻害し得る抗体を指す。TNF依存性活性を阻害する抗TNF抗体の能力は、好ましくは、本明細書に記載されかつ/又は当該技術分野において既知の、少なくとも1つの好適なTNFタンパク質又は受容体アッセイによって評価される。本発明のヒト抗体は、任意のクラス(IgG、IgA、IgM、IgE、IgDなど)又はアイソタイプのものであってもよく、κ又はλ軽鎖を含み得る。一実施形態において、ヒト抗体は、IgG重鎖又は規定された断片、例えば、IgG1、IgG2、IgG3又はIgG4のうちの少なくとも1つのアイソタイプを含む。このタイプの抗体は、本明細書に記載され及び/又は当該技術分野において既知の、少なくとも1つのヒト軽鎖(例えば、IgG、IgA)及びIgM(例えば、γ1、γ2、γ3、4γ)導入遺伝子を含む、トランスジェニックマウス又は他のトランスジェニック非ヒト哺乳動物を用いることによって調製され得る。別の実施形態において、抗ヒトTNFヒト抗体は、IgG1重鎖及びIgG1軽鎖を含む。
典型的な哺乳類発現ベクターは、mRNAの転写の開始を媒介する少なくとも1つのプロモーター要素、抗体コード配列、並びに転写の終結及び転写物のポリアデニル化に必要なシグナルを含む。付加的な要素には、エンハンサー、コザック配列並びにRNAスプライシングのためのドナー及びアクセプター部位に隣接している介在配列が含まれる。高効率の転写は、SV40からの初期及び後期プロモーター、レトロウイルス、例えば、RSV、HTLVI、HIVIからの長末端反復(LTRS)、及びサイトメガロウイルス(CMV)の初期プロモーターで達成することができる。しかしながら、細胞要素を使用することもできる(例えば、ヒトアクチンプロモーター)。本発明の実施において使用するのに好適な発現ベクターは、例えば、pIRES1neo、pRetro-Off、pRetro-On、PLXSN若しくはpLNCX(Clonetech Labs,Palo Alto,CA)、pcDNA3.1(+/-)、pcDNA/Zeo(+/-)又はpcDNA3.1/Hygro(+/-)(Invitrogen)、PSVL及びPMSG(Pharmacia,Uppsala,Sweden)、pRSVcat(ATCC(登録商標)37152)、pSV2dhfr(ATCC(登録商標)37146)並びにpBC12MIなどのベクターを含む。使用することができる哺乳類の宿主細胞には、ヒトHela293、H9及びJurkat細胞、マウスNIH3T3及びC127細胞、Cos1、Cos7及びCV1、ウズラQC1-3細胞、マウスL細胞及びチャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞が含まれる。
CHO細胞における発現に一般的に使用される1つのベクターは、pC4である。プラスミドpC4は、プラスミドpSV2-dhfr(ATCC(登録商標)37146)の誘導体である。このプラスミドは、SV40初期プロモーターの制御下でマウスDHFR遺伝子を含有する。これらのプラスミドでトランスフェクトされる、ジヒドロ葉酸活性を欠くチャイニーズハムスター卵巣細胞又はその他の細胞は、化学療法剤メトトレキサートを補充した選択的培地(例えば、α-MEM、Life Technologies、Gaithersburg、MD)中で細胞を増殖させることによって選択することができる。メトトレキサート(MTX)に耐性の細胞におけるDHFR遺伝子の増幅は、十分に文書化される(例えば、F.W.Alt,et al.,J.Biol.Chem.253:1357-1370(1978)、J.L.Hamlin and C.Ma,Biochem.et Biophys.Acta 1097:107-143(1990)、及びM.J.Page and M.A.Sydenham,Biotechnology 9:64-68(1991)を参照する)。増大したMTX濃度において成長した細胞は、DHFR遺伝子の増幅の結果として、標的酵素であるDHFRの過剰生成により、薬物に対する耐性を発達させる。第2の遺伝子がDHFR遺伝子に連結されている場合、通常、共増幅され、過剰発現される。このアプローチを使用して、増幅遺伝子(複数可)の1,000を超えるコピーを有する細胞株を開発することができることが、当該技術分野において知られている。続いて、メトトレキサートを回収する際、宿主細胞の1つ以上の染色体(複数可)に組み込まれた増幅遺伝子を含有する細胞株が得られる。
概要。ヒト重鎖及び軽鎖免疫グロブリン遺伝子を含有するトランスジェニックマウスを使用して、1つ以上のTNF媒介性疾患の処置のための、TNF作用を阻害するために治療的に使用することができる高親和性の完全ヒトモノクローナル抗体を生成する。重鎖及び軽鎖両方のヒト可変及び定常領域抗体導入遺伝子を含有する(CBA/JxC57/BL6/J)F2ハイブリッドマウスをヒト組換えTNFで免疫する(Taylor et al.,Intl.Immunol.6:579-591(1993)、Lonberg,et al.,Nature 368:856-859(1994)、Neuberger,M.,Nature Biotech.14:826(1996)、Fishwild,et al.,Nature Biotechnology 14:845-851(1996))。いくつかの融合物が完全ヒトTNF反応性IgGモノクローナル抗体の1つ以上のパネルを生み出した。完全ヒト抗TNF抗体を更に特徴付けする。全てはIgG1κである。かかる抗体は、およそ1×109~9×1012の親和性定数を有することが分かった。これらの完全ヒトモノクローナル抗体の予期せぬ高親和性により、それらはTNF関連疾患、病態、又は障害における治療用途のための好適な候補となる。
動物。ヒト抗体を発現し得るトランスジェニックマウスは、当該技術分野において既知であり、(例えば、GenPharm International,San Jose,CA、Abgenix,Freemont,CAなどから)市販されており、これはヒト免疫グロブリンを発現するが、マウスIgM又はIgκを発現しない。例えば、かかるトランスジェニックマウスは、V(D)J結合、重鎖クラススイッチ及び体細胞突然変異を受けてヒト配列免疫グロブリンのレパートリーを生成する、ヒト配列導入遺伝子を含有する(Lonberg,et al.,Nature 368:856-859(1994))。軽鎖導入遺伝子は、例えば、部分的に、生殖系列ヒトVκ領域のほぼ半分を含む酵母人工染色体クローンに由来し得る。加えて、重鎖導入遺伝子は、ヒトμ及びヒトγ1の両方(Fishwild,et al.,Nature Biotechnology 14:845-851(1996))並びに/又はγ3定常領域をコードすることができる。適切な遺伝子型系統由来のマウスを免疫付与及び融合プロセスにおいて使用して、TNFに対する完全ヒトモノクローナル抗体を生成することができる。
抗体の結合特徴は、例えば、TNF捕捉EIA及びBIAcore技術を使用して好適に評価することができる。精製されたヒトTNF抗体の段階的濃度は、上述のように、アッセイにおいて、2μg/mLのTNFでコーティングされたEIAプレートへの結合について評価することができる。その後、相対結合効率を示す片対数プロットとしてODを表すことができる。
抗ヒトTNFモノクローナル抗体の生成。いくつかの融合を行い、ヒトTNFに特異的な数十の抗体を生み出す各融合物を15のプレート(1440ウェル/融合物)に播種する。これらのうち、いくつかは、ヒト及びマウスIg鎖の組み合わせからなることが分かる。残りのハイブリドーマは、ヒト重鎖及び軽鎖のみからなる抗TNF抗体を分泌(secret)する。ヒトハイブリドーマの全てがIgG1κであることが予想される。
いくつかの融合は、ヒトTNFで免疫化されるヒト可変及び定常領域抗体導入遺伝子を含有するハイブリッドマウスからの脾細胞を利用して行われる。IgG1κアイソタイプのいくつかの完全ヒトTNF反応性IgGモノクローナル抗体のセットを生成する。完全ヒト抗TNF抗体を更に特徴付けする。生成された抗体のうちのいくつかは、1×109~9×1012の親和性定数を有する。これらの完全ヒトモノクローナル抗体の予期せぬ高親和性により、それらはTNF依存疾患、病態又は関連状態における治療用途に好適なものとなる。
概要。重鎖及び軽鎖両方のヒト可変及び定常領域抗体導入遺伝子を含有する(CBA/JxC57BL/6J)F2ハイブリッドマウス(1~4)を組換えヒトTNFαで免疫化した。GenTNVと命名された1つの融合が、固定化された組換えヒトTNFαに結合する完全ヒトIgG1κモノクローナル抗体を8つ生み出した。特定直後、8つの細胞株は、更に特徴付けするためにMolecular Biologyに譲渡された。これらMabは配列が完全にヒトであるため、それらはヒトにおけるcA2(Remicade)よりも免疫原性が低いと予想される。
動物。ヒト免疫グロブリンを発現するが、マウスIgM又はIgκを発現しないトランスジェニックマウスは、GenPharm Internationalにより開発されてきた。これらのマウスは、V(D)J結合、重鎖クラススイッチ及び体細胞突然変異を受けて抗原特異的ヒト免疫グロブリン(1)のレパートリーを生成する、機能性ヒト抗体導入遺伝子を含有する。軽鎖導入遺伝子は、部分的に、生殖系列ヒトVκ遺伝子座のほぼ半分を含む酵母人工染色体クローンに由来する。いくつかのVH遺伝子に加えて、重鎖(HC)導入遺伝子は、ヒトμ及びヒトγ1(2)、並びに/又はγ3定常領域の両方をコードする。本明細書に記載されるモノクローナル抗体を生成するための免疫付与及び融合プロセスにおいて、HCo12/KCo5遺伝子型系統由来のマウスを使用した。
GenTNV融合は、Centocorで調製された組換えヒトTNFαで免疫化されたヒト可変及び定常領域抗体導入遺伝子を含有するハイブリッドマウスからの脾細胞を利用して行われた。IgG1κアイソタイプの8つの完全ヒトTNFα反応性IgGモノクローナル抗体を生成した。更なる特徴付け及び開発のために、親細胞株をMolecular Biologyグループに移した。これらの新しいヒト抗体のうちの1つは、Remicadeと比較して、免疫原性及びアレルギー型合併症が減少する潜在的な利益を有して、抗炎症に有用である可能性がある。
Taylor,et al.,International Immunology 6:579-591(1993)。
Lonberg,et al.,Nature 368:856-859(1994)。
Neuberger,M.Nature Biotechnology 14:826(1996)。
Fishwild,et al.,Nature Biotechnology 14:845-851(1996)。
Scallon,et al.,Cytokine 7:759-770(1995)。
概要。TNV表記の8つのヒトモノクローナル抗体(mAb)のパネルは、明らかに高結合活性で固定化されたヒトTNFαに結合することが認められた。8つのmAbのうちの7つは、組換えTNF受容体へのヒトTNFαの結合を効率的に遮断することを示した。7つのmAbをコードするDNAの配列分析は、全てのmAbがヒトV領域を有していることを確認した。DNA配列は、3対のmAbが互いに同一であり、そのため8つのmAbの元のパネルがTNV14、TNV15、TNV148、及びTNV196で表される4つの別個のmAbのみを含有していることも明らかにした。mAbの推定アミノ酸配列の分析及びインビトロTNFα中和データの結果に基づいて、mAb TNV148及びTNV14を更なる研究のために選択した。
試薬及び細胞。TRIZOL試薬はGibco BRLから購入した。プロテイナーゼKはSigma Chemical Companyから得た。逆転写酵素はLife Sciences,Inc.から得た。Taq DNAポリメラーゼはPerkin Elmer Cetus又はGibco BRLのいずれかから得た。制限酵素はNew England Biolabsから購入した。QIA quick PCR Purification KitはQiagenから得た。QuikChange Site-Directed Mutagenesis KitはStratageneから購入した。Wizardプラスミドミニプレップキット及びRNasinはPromegaからであった。OptiplatesはPackardから得た。125IodineはAmershamから購入した。カスタムオリゴヌクレオチドはKeystone/Biosource Internationalから購入した。この作業で使用したオリゴヌクレオチドの名称、識別番号、及び配列を表2に示す。
オリゴヌクレオチド5’14s及びHuH-J6によりコード化されるアミノ酸を配列の上に示す。「M」アミノ酸残基は翻訳開始コドンを表す。オリゴヌクレオチド5’14s及びHuH-J6の下線付き配列は、それぞれ、BsiWI及びBstBI制限部位を示す。HuH-J6の斜線はエクソン/イントロン境界に対応する。配列がマイナス鎖に対応するオリゴヌクレオチドは、3’-5’配向で書かれていることに留意する。
L28ベクター又はpBCベクターは、初期のAb cDNAクローンを表す。これらのプラスミドのインサートは、中間プラスミドを作製するために不完全な12B75系ベクターに移された。1つの追加の移動工程により、線形化された後に細胞に導入されたか、又は細胞のトランスフェクション前にmAb遺伝子インサートを精製するために使用されたかのいずれかであった最終発現プラスミドがもたらされた。ND=実施せず。
組換え受容体へのTNF結合の阻害。
ハイブリドーマ細胞上清に含有される8つのTNV mAbが、受容体へのTNFα結合を阻害することができるかどうかを決定するために、簡単な結合アッセイが行われた。ヒトIgGの標準ELISA分析により、それぞれの細胞上清におけるTNV mAbの濃度を最初に決定した。次に、組換えp55TNF受容体/IgG融合タンパク質p55-sf2をEIAプレート上にコーティングし、様々な量のTNV mAbの存在下で、125I標識TNFαをp55受容体に結合させた。図1に示すように、8つのTNV mAbのうちの1つ(TNV122)を除く全てが、p55受容体へのTNFαの結合を効率的に遮断した。実際、TNV mAbは、陰性対照ハイブリドーマ上清にスパイクされたcA2陽性対照mAbよりもTNFα結合を阻害するのにより有効であるように見えた。これらの結果は、TNV mAbが細胞系アッセイ及びインビボでTNFαの生物活性を遮断するであろう可能性が高く、したがって、追加の分析が必要であることを示すと解釈された。
RNAがヒトmAbをコードすることの確認。
受容体結合アッセイにおいてTNFα遮断活性を示した7つのTNV mAb(TNV14、TNV15、TNV32、TNV86、TNV118、TNV148、及びTNV196)を特徴付ける際の最初の工程として、これらのmAbを産生する7つのハイブリドーマ細胞株から全RNAを単離した。次に、各RNA試料を使用して、各mAbの完全なシグナル配列、完全な可変領域配列、及び定常領域配列の一部を含むヒト抗体重鎖又は軽鎖cDNAを調製した。次に、これらのcDNA生成物をPCR反応で増幅させ、最初に断片をクローニングすることなくPCR増幅DNAを直接配列決定した。配列決定した重鎖cDNAは、マウスに存在する5つのヒト生殖系列遺伝子のうちの1つであるDP-46と>90%同一であった(図2)。同様に、配列決定した軽鎖cDNAは、マウスに存在するヒト生殖系列遺伝子のうちの1つと100%又は98%のいずれかと同一であった(図3)。これらの配列結果は、cDNAに転写され配列決定されたRNA分子がヒト抗体重鎖及びヒト抗体軽鎖をコード化したことを確認した。可変領域がシグナル配列コード配列の5’端にマッピングされるオリゴヌクレオチドを使用してPCR増幅されたため、シグナル配列の最初の数個のアミノ酸は元のTNV翻訳生成物の実際の配列ではない可能性があるが、組換えTNV mAbの実際の配列を表すことに留意するべきである。
各mAbの重鎖及び軽鎖両方の可変領域全体のcDNA配列の分析は、TNV32がTNV15と同一であり、TNV118がTNV14と同一であり、TNV86がTNV148と同一であることを明らかにした。受容体結合アッセイの結果は、DNA配列分析と一致していた、即ち、TNV86及びTNV148の両方が、TNF結合の遮断においてTNV118及びTNV14の両方よりも約4倍良好であった。したがって、後続の作業は、4つの固有のTNV mAbである、TNV14、TNV15、TNV148、及びTNV196にのみ焦点を当てた。
DNA配列結果は、4つのTNV mAbの重鎖をコードする遺伝子が全て互いに高度に相同であり、全てが同じ生殖系列遺伝子DP-46に由来するように見えることを明らかにした(図2)。加えて、重鎖CDR3配列の各々は非常に類似し、同じ長さのものであるため、そしてそれらが全てJ6エクソンを使用するため、それらは明らかに、単一のVDJ遺伝子再配列事象から生じ、この後に各mAbを固有のものにする体細胞変化が続いた。DNA配列分析は、4つのmAbにおいて2つの別個の軽鎖遺伝子のみが存在したことを明らかにした(図3)。TNV14及びTNV15における軽鎖可変領域コード配列は、互いに同一であり、ヒトκ鎖のVg/38 Kファミリーの代表的な生殖系列配列と同一である。TNV148及びTNV196軽鎖コード配列は、互いに同一であるが、2つのヌクレオチド位置での生殖系列配列が異なる(図3)。
rTNV148Bトランスフェクション2からの、産生が最高の653親株のうちの10(使用済24ウェル培養物において5~10:g/mLを産生)をサブクローニングして、産生がより高い細胞株についてスクリーニングし、より均質な細胞集団を調製した。親株2.320、2.320-17、及び2.320-20のサブクローンのうちの2つは、使用済24ウェル培養物において約50:g/mlを産生し、これは、それらの親株に対して5倍の増加であった。サブクローニングした株2.320-17及び2.320-20の2回目のサブクローニングがもたらした。
rTNV14トランスフェクション3からの生成が最高のSp2/0親株のうちの3つを1回サブクローニングした。サブクローン3.27-1は、産生が19:g/mlであり、使用済の24ウェル培養物において最も高い生産体であることが分かった。この細胞株をC476Aと表記した(表5)。
元のクローン名の最初の1桁は、細胞株がどのトランスフェクションに由来するかを示す。本明細書に報告されるCコード細胞株の全てが制限酵素で線形化された重鎖及び軽鎖全プラスミドでのトランスフェクションに由来した。
細胞株の成長特徴をより慎重に特徴付けし、大規模でmAb生成レベルを決定するために、T75培養物を使用して成長曲線分析を行った。結果は、細胞株の4つのC466シリーズの各々が1.0×106~1.25×106細胞/mlのピーク細胞密度及び110~140:g/mLの最大mAb蓄積レベルに達したことを示した(図7)。対照的に、生成が最高のSp2/0サブクローンC467Aは、2.0×106細胞/mLのピーク細胞密度及び25:g/mLの最大mAb蓄積レベルに達した(図7)。成長曲線分析は、rTNV14-生成細胞株C476Aに対して行われなかった。
ヒトTNFαに対する8つのヒトmAbの初期パネルから、タンパク質配列及びTNF中和効力を含むいくつかの基準に基づいて、TNV148B並びにTNV14が好ましいものとして選ばれた。100:g/mL超のrTNV148B及び19:g/mL超のrTNV14を産生する細胞株を調製した。
約4週齢のTg197研究マウスを性別及び体重に基づき9つの処置群のうちの1つに割り当て、DulbeccoのPBS(D-PBS)、又は1mg/kg若しくは10mg/kgのいずれかの本発明の抗TNF抗体(TNV14、TNV148、又はTNV196)の単回腹腔内ボーラス投与で処置した。
約4週齢のTg197研究マウスを体重に基づき8つの処置群のうちの1つに割り当て、対照品(D-PBS)、又は3mg/kgの抗体(TNV14、TNV148)(0週目)の腹腔内ボーラス投与で処置した。注射は1、2、3、及び4週目に全ての動物において繰り返された。群1~6は、試験品の有効性に関して評価された。群7及び8の動物から得られた血清試料は、2、3及び4週目のTNV14又はTNV148の免疫応答誘導及び薬物動態クリアランスに関して評価された。
約4週齢のTg197研究マウスを性別及び体重に基づき6つの処置群のうちの1つに割り当て、3mg/kg又は5mg/kgのいずれかの抗体(cA2又はTNV148)の単回腹腔内ボーラス投与で処置した。この研究は、D-PBS及び10mg/kgのcA2対照群を利用した。
TNV148(ハイブリドーマ細胞に由来する)及びrTNV148B(トランスフェクトした細胞に由来する)の単回腹腔内投与の有効性を比較するために。約4週齢のTg197研究マウスを性別及び体重に基づき9つの処置群のうちの1つに割り当て、Dulbecco=S PBS(D-PBS)又は1mg/kgの抗体(TNV148、rTNV148B)の単回腹腔内ボーラス投与で処置した。
ゴリムマブのバックグラウンド
抗TNFα剤を用いた治療は炎症性関節炎の治療に成功裏に使用されてきたが、初期の抗TNFα剤は安全性、投与計画、費用及び/又は免疫原性に関して限界がある。いくつかの限界に対処するために、SIMPONI(登録商標)(ゴリムマブ)と表される完全ヒト抗抗TNFα mAbが開発された。ゴリムマブ(CNTO148及びrTNV148Bとしても既知である)は、免疫グロブリンG1(IgG1)重鎖アイソタイプ(G1m[z]アロタイプ)及びκ軽鎖アイソタイプを有する完全ヒトモノクローナル抗体である。ゴリムマブは、配列番号36を含む重鎖(HC)及び配列番号37を含む軽鎖(LC)を有する。ゴリムマブの分子量は、149,802~151,064ダルトンの範囲である。
強直性脊椎炎(AS)を対象としたゴリムマブ皮下(SC)投与のグローバル無作為化二重盲検プラセボ対照第3相試験(試験C0524T09)において、ゴリムマブは、強直性脊椎炎(AS)に罹患した被験者における徴候及び症状、身体機能、健康関連の生活の質(HRQOL)の改善に有効であることが実証された。更に、安全性分析では、SCゴリムマブは一般的に良好に忍容されることが示され、また他の抗TNFα剤で観察されたものと同様の安全性プロファイルを示された。
SIMPONI(登録商標)(ゴリムマブ)は、連続的な細胞の灌流培養、続いて精製を含む9段階のプロセスで製造される。製造プロセスの概要は、図18に示される。
段階1
前培養及び増殖
Simponi(ゴリムマブ)の産生における第1の段階は、ゴリムマブのHC及びLC配列を発現するトランスフェクトされたSp2/0細胞のワーキングセルバンク(WCB)バイアルからの前培養の開始並びに培養フラスコ、使い捨て培養バッグ、及び50又は200Lの播種用バイオリアクターにおける細胞培養物の増殖である。500又は1000Lの産生用バイオリアクターへの接種に必要な細胞密度及び体積が得られるまで細胞を培養する。プロセス内管理とプロセス監視試験を含む前培養と増殖ステップを示す段階1のフロー図を図19に示す。
WCBからのクライオバイアルを解凍し、6mM L-グルタミン、0.5mg/Lミコフェノール酸、2.5mg/Lヒポキサンチン、及び50mg/Lキサンチンを添加した既知組成培地(CD-A培地)で播種密度0.2~0.4×106個生存細胞(VC)/mLに希釈する。解凍時の培養物生存率は≧50%なければならない。初期の継代は、温度とCO2が制御された加湿CO2インキュベータ内の培養フラスコで維持される。培養物を、0.6×106個VC/mLの最小細胞密度が得られるまで2~3日間インキュベートする。
バイオリアクター産生
製造プロセスにおける第2の段階は、500L又は1000Lの産生用バイオリアクターにおける、細胞の灌流培養である。オルタネーティング・タンジェンタル・フロー(ATF)中空糸の細胞保持装置を介して細胞を保持しながら、産生用バイオリアクターから細胞培養物の透過液(permeate)(回収物)を回収し、培養物には新鮮な培地を補充する。500L又は1000Lの産生用バイオリアクタープロセスを示すフロー図を図20に示す。
500L又は1000Lの産生用バイオリアクターの接種は、50又は200Lの播種用バイオリアクターの内容物を、6mMのL-グルタミン、0.5mg/Lのミコフェノール酸、2.5mg/Lのヒポキサンチン、及び50mg/Lのキサンチンを添加した既知組成培地(CDH-A培地)を含む500又は1000Lの産生用バイオリアクターに移すことによって行う。移される体積は、≧0.3×106個生存細胞(VC)/mLの播種密度をもたらすのに十分なものでなければならない。培養物を34.0~38.0℃の温度、6.80~7.40のpH及び10~80%の溶存酸素濃度で維持する。生存細胞密度(VCD)、培養物生存率、バイオバーデン、及び免疫グロブリンG(IgG)濃度の測定のために、500又は1000Lの生産用プロセス全体を通してサンプリングを行う。
生存細胞密度(VCD)と生存率を決定する方法
総細胞数/ml、生存細胞/ml(VCD)、及び%生存率は、典型的には、メーカー提供のプロトコル、ソフトウェア、及び試薬を使用し、Beckman CoulterVi-CELL-XR細胞生存率アナライザーで決定される。代替的には、CEDEX自動細胞カウントシステムも使用される。しかし、VCD及び%生存率を決定するための他の方法、例えば、血球計及びトリパンブルー排除を使用することは当業者によく知られることにも注意すべきである。
ゴリムマブの生物活性(効力)の測定は、TNFαによって誘発される細胞毒性からWEHI 164細胞(オーストラリア、メルボルンのWalter and Eliza Hall Instituteから入手したマウスBALB/c線維肉腫細胞)を保護するゴリムマブの能力に基づくinvitroアッセイで行われる。各アッセイプレートは、500ng/mL(6回繰り返し)のゴリムマブ試験品とゴリムマブ参照標準の100μL段階希釈液を含む。次にTNFαを添加し、プレートをインキュベートする。中和及びインキュベーション後、WEHI 164細胞をマイクロタイタープレートに添加し、続いて別のインキュベーションステップを行う。その後、代謝基質(生細胞の指標)を添加し、変換された基質を分光光度法で測定する。
参照標準:
・各中和曲線は、3つのアッセイプレートのCells+TNFα対照の平均OD値の40%以内の下部プラトー、3つのアッセイプレートの細胞のみ対照の平均OD値の25%以内の上部プラトー、及びプラトー間の線形部分を持つS字型曲線でなければならない。
・各曲線の勾配は≧0.7と≦3.5でなければならない。
・各曲線のr2値は≧0.97でなければならない。
・全ての複製ED50値は、≧2ng/mL及び≦20ng/mLでなければならない。
・平均ED50値(n=6)のRSDは≦20%以下でなければならない。
・TNFα細胞毒性曲線は、下部プラトー、上部プラトー、及びプラトー間の線形部分を持つS字型曲線を示さなければならない。
・適合した曲線ごとに、勾配は≦2.0でなければならない。
・TNFα細胞毒性曲線のr2値は≧0.97でなければならない。
・1.68ng/mLのTNFα濃度でのOD値は、0.1から0.4の間に収まるべきである。
・OD範囲(細胞+TNF対照と細胞のみ対照の平均OD値の差)は各プレートで≧0.68でなければならない。
・細胞のみ対照の平均OF値(n=6)は各プレートで≧0.75でなければならない。細胞のみ対照のRSDは≦20%でなければならない。
・l細胞+TNFα対照の平均OD値(n=6)は各プレートで≦0.50でなければならない。また、TNFα対照のRSDは≦20%でなければならない。
・各中和曲線は、3つのアッセイプレートの細胞+TNFα対照の平均OD値の40%以内の下部プラトー、3つのアッセイプレートの細胞のみ対照の平均OD値の25%以内の上部プラトー、及びプラトー間の線形部分を持つS字型曲線でなければならない。
・各曲線の勾配は≧0.7と≦3.5でなければならない。
・各曲線のr2値は≧0.97でなければならない。
・平均ED50比値(n=6)のRSDは≦25%でなければならない。
・試験品と参照標準曲線の平均勾配比は≧0.8と≦1.2であり、それにより、試験品と参照標準曲線の勾配値が同等(20%以下の差)であることが保証される。
・試験品中和曲線の平均上限漸近線値は、参照標準のそれと10%以上異ならない(平均上限漸近線値の差は≦10%)。
・試験品中和曲線の平均下限漸近線値は、参照標準のそれと15%以上異ならない(平均下限漸近線値の差は≦15%)。
ゴリムマブのオリゴ糖プロファイル
ゴリムマブは、アスパラギン306の各重鎖の単一部位でN-グリコシル化される。これらのN-結合型オリゴ糖構造は、アスパラギン残基の第一級アミンを介してタンパク質に結合した二分岐オリゴ糖構造のグループのいずれでもかまわないが、ゴリムマブでは、主にガラクトースとシアル酸の不均一性を伴うビアンテンナルコアフコシル化種で構成される。個々のオリゴ糖種は、アシアロ、アガラクトコアフコシル化二分岐グリカンである「G0F」、アシアロ、モノガラクトコアフコシル化二分岐グリカンである「G1F」、及びアシアロ、ジガラクトコアフコシル化二分岐グリカンである「G2F」を含む。ゴリムマブのグリコシル化は、製造の段階9でプロセス内管理として監視され、総中性オリゴ糖、総荷電オリゴ糖、及び個々の中性オリゴ糖種G0F、G1F、及びG2Fの仕様が設定される。ゴリムマブIgGの主要なN-結合型オリゴ糖種のいくつかの概略図を図21に示す。これらの酵素プロセスにおけるいくつかの二価カチオン(例えば、Mn2+及びCu2+)の役割を含む、グリコシル化成熟プロセスにおけるいくつかの酵素の役割も示される。
ゴリムマブのN-結合型オリゴ糖組成は、Chemstation/Chemstoreソフトウェアを備えたAgilent1100/1200シリーズHPLCシステムを使用した蛍光検出を備えた順相陰イオン交換HPLC方法で決定される。グリカンの相対量を定量するために、まず、N-グリカナーゼ(PNGase F)を用いて、還元及び変性された試験物質からN-結合オリゴ糖を切断する。放出されたグリカンは、アントラニル酸を使用して標識され、0.45μmナイロンフィルタを使用した濾過によって精製され、蛍光検出を備えた順相陰イオン交換HPLCによって分析される。HPLCクロマトグラムは、サンプル中に存在するN-結合オリゴ糖を同定及びその相対量を定量するために使用することができるマップとして機能する。グリカンは、オリゴ糖標準との共溶出と、広範な特性評価からの過去の結果に従った保持時間によって同定される。ゴリムマブ参照標準の代表的なHPLCクロマトグラムを図22に示す。
1. オリゴ糖標準のG0FピークとG2Fピークの間の分解能(USP)は3.0以上でなければならない。
2. オリゴ糖標準のG0Fピークの理論プレート数(接線法)は5000以上でなければならない。
3. ゴリムマブ参照標準の総グリカンピーク面積は、事前にラベル付けされたG0Fの主要なグリカンピーク面積の1.5倍以上でなければならない。
4. 参照標準グリカンのピークがスケール外の場合、参照標準はより少ない注入量で再注入される。
5. ゴリムマブ参照標準のG0Fピークの保持時間は、オリゴ糖標準のG0F保持時間の0.4分間以内でなければならない。
・方法ブランクには、ゴリムマブに割り当てられたオリゴ糖ピークと共溶出する検出可能なピークがあってはならない。
・各試験品の総グリカンピーク面積は、事前にラベル付けされたG0F標準の主要なグリカンピーク面積の1.5倍以上でなければならない。
・グリカン試料のピークがスケール外の場合、その試料は、事前にラベル付けされたG0F、オリゴ糖標準、方法ブランク、及び通常の量の参照標準と共に、より少ない注入量で再注入される。
・各試験品のG0Fピークの保持時間は、オリゴ糖標準のG0Fピークの保持時間の0.4分間以内でなければならない。
・アッセイが許容基準を満たさない場合、アッセイは無効になる。
IdeS-RMA(IRMA)法では、Genovis AB(SKU:A0-FR1-050)から入手可能なStreptococcus pyogenes(IdeS)のIgG分解酵素であるFabRICATOR(登録商標)で免疫グロブリンG(IgG)を酵素処理した後、還元質量分析(RMA)によって主要なグリコフォームを区別し得る。例えば、米国特許第7,666,582号も参照する。還元質量分析(RMA)は、抗体のジスルフィド結合の還元と、それに続く抗体の重鎖とそれに結合したグリカン部分のインタクトな質量分析を含む。一部の抗体は、ピログルタミン酸の形成やカルボキシル化などのN末端修飾が存在するため、かなりの不均質性を示す。その結果、ジスルフィド還元と重鎖の質量測定により、デコンボリューションされたピークの複雑なパターンが生じる。したがって、いくつかの用途では、抗体断片のタンパク質分解生成は、ジチオスレイトール(DTT)などの還元剤を使用した軽鎖及び重鎖の生成よりも望ましい。伝統的に、パパインとペプシンは抗体断片を生成するために使用されるが、これらは全て面倒なプロセスである。ペプシンによるIgGの切断には、広範な最適化が必要であり、低酸性pHで行われる。パパインには活性剤が必要であり、反応条件に応じてF(ab’)2とFabの両方を取得できるため、断片のプールが不均質になる。これらの欠点は、新規酵素であるFabRICATOR(登録商標)を使用することで回避できる。切断手順は非常に高速でシンプルであり、重要なことに最適化は必要がない。中性pHで実行され、正確なF(ab’)2及びFc断片が生成される。ペプシンやパパインのような他のタンパク質分解酵素に一般的に関連するように、それ以上の分解や過剰消化は観察されない。重要なことに、FabRICATOR(登録商標)は重鎖のジスルフィド架橋のC末端のみを切断するため、還元ステップは不要であり、無傷のF(ab’)2と2つの残留Fcフラグメントが得られる。
・H:ヘキソース(マンノース、グルコース、ガラクトース)
・Man5:マンノース5
・N:N-アセチルヘキソサミン(N-アセチルグルコサミン及びN-アセチルガラクトサミン)
・F:フコース
・S:シアル酸(N-アセチルノイラミン酸(NANA)及びN-グリコリルノイラミン酸(NGNA))
・G0:アシアロ-アガラクト-アフコシル化二分岐オリゴ糖
・G0F:アシアロ-アガラクト-フコシル化二分岐オリゴ糖
・G1:アシアロ-モノガラクトシル化-脱フコシル化二分岐オリゴ糖
・G1F:アシアロ-モノガラクトシル化-フコシル化二分岐オリゴ糖
・G2:アシアロ-ジガラクトシル化-アフコシル化二分岐オリゴ糖
・G2F:アシアロ-ジガラクトシル化-フコシル化二分岐オリゴ糖
・GlcNAc:N-アセチル-D-グルコサミン
・Lys:リジン
・-Lys:切断された重鎖(C末端のリジン残基は存在しない)
・+Lys:C末端リジンを含む重鎖
・ppm:百万分率
・Thermo Scientific Q Exactive(Plus)質量分析計
・Agilent 1200HPLCシステム
・アプライドバイオシステムズPOROSR2/10 2.1mmD×100mmLカラム
・Thermo Scientific Q ExactiveTuneソフトウェア
・Thermo Scientific Protein Deconvolutionソフトウェア
・0.01mgの計量が可能な分析天びん
・ボルテックスミキサー、任意の適切なモデル
・水浴又は加熱ブロック、任意の適切なモデル
・校正済み温度計-10~110℃、任意の適切なモデル
・校正済みピペット
・マイクロ遠心分離機、任意の適切なモデル
試料のIdeS分解
・試料(50μgIgGに等しい)。
・1μl(50ユニット)のIdeS酵素を50μgのIgGに添加し、短時間ボルテックスし、スピンダウンし、37℃で30分間インキュベートする(100μlあたり5000ユニットのストック酵素。1ユニットの酵素が1μgのIgGを37℃で30分間で完全に消化する)
・試料をスピンダウンしてLC-MSバイアルに移し、試料バイアルをAgilent1200オートサンプラーにロードする。
溶液の調製
・移動相A(超純水中の0.1%ギ酸(FA))-1LのHPLC移動相ボトルに999mLの超純水を添加し、1mLのFAを添加して撹拌する。この溶液はRTで2ヶ月間保存できる。
・移動相B(0.1%FA、99.9%アセトニトリル)-1LのHPLC移動相ボトルに999mLのアセトニトリルを添加し、1mLのFAを添加して撹拌する。この溶液はRTで2ヶ月間保存できる。
・カラム:アプライドバイオシステムズPOROS R2/10 2.1mmD×100mmL
・カラム温度:60℃
・オートサンプラー温度:4℃
・流量:300μL/分間
・注入量:5μL
・移動相A:超純水中の0.1%FA
・移動相B:アセトニトリル中の0.1%FA
スキャンパラメータ:
・スキャンタイプ:フルMS
・スキャン範囲:700~3500m/z
・断片化:インソースCID 35.0eV
・分解能:17500
・極性:正
・ロックマス:オン、m/z 445.12002
・AGCターゲット:3e6
・最大注射時間:250
・シースガス流量:32
・補助ガス流量:7
・スイープガス流量:0
・スプレー電圧(|kV|):4.20
・キャピラリー温度(℃):280
・SレンズRFレベル:55.0
・ヒーター温度(℃):80
検出された各グリカン種の相対含有量は、デコンボリューションされた質量スペクトルの分析に基づいて記録される。図23は、Sp2/0細胞で産生されたゴリムマブのIRMA分析の代表的なデコンボリューションされた質量スペクトルを示す。IRMA分析によって決定された主な構造は、例えば、Man 5(H5N2)、G0(H3N4)、G0F(H3N4F1)、G1F-GlcNAc(H4N3F1)、H5N3 G1(H4N4)、H5N3F1、G1F(H4N4F1)、G2(H5N4)、G2F(H5N4F1)、G1FS(H4N4F1S1)、H6N4F1、G2FS(H5N4F1S1)、H7N4F1、H6N4F1S1、G2FS2(H5N4F1S2)を含む.これらの各構造のパーセンテージが監視される。測定されたピーク強度は、正規化後の各構造のパーセンテージ(割り当てられた合計の%)を表す。観測された質量が100ppmの質量偏差閾値の外側にあるグリカンは、計算(例:*G1F-GlcNAc-Lys、*H5N3-Lys、*G1-Lys、*H5N3F1-Lys、及び*G2-Lys)に含まれない。前述のように、これらはアスタリスク(”*”)で示される。また、Man5-Lysは強度が非常に低いため、スペクトルで常に検出されるとは限らないが、存在する場合は考慮され、計算に含まれる。グリカンのパーセンテージは、末端リジンがある場合とない場合のFc断片の両方のアイソフォームで検出されたものとして計算され、例えば、パーセンテージG0Fは(%G0F-Lys+%G0F+Lys)である。重鎖アイソフォームの1つのみで検出された構造は、二重アスタリスク(”**”)、例えば、**G1F-GlcNAc+Lys、**H5N3+Lys、**G1+Lys、**H5N3F1+Lys、**G2+Lys、**G2FS-Lys、**H6N4F1S1-Lys、**G2FS2-Lys、**H6N4F1-Lys、**H7N4F1-Lysで示される。これらの構造の大多数は存在量が少なく、強度の高い隣接するピークから分離できないか、方法の検出能力を下回る。
脱アミド化
脱アミド化、異性化、環化などの環状イミド介在反応は、タンパク質の一般的な分解経路を構成する。反応は主にタンパク質鎖のアスパラギンで起こるが、グルタミン、アスパラギン酸、グルタミン酸でも観察される(Aswad,D.W.(1995).Deamidation and isoaspartate formation in peptides and proteins.Boca Raton,CRC Press)。一般的に観察される副産物は、アスパラギン酸、イソアスパラギン酸、グルタミン酸、及び安定な環状イミドを含む。
脱アミド化法では、Lys Cペプチドマッピングを使用し、HCAsn43及びLCAsn93での脱アミド化に関連する天然ペプチド及び脱アミド化ペプチドを分離及び定量する。この方法では、逆相HPLCカラムで200μgのタンパク質を脱塩し、試料マトリックスを除去する。続いて、試験品の単一試料を還元(ジチオスリエトール)し、アルキル化(ヨードアセトアミド)し、エンドプロテイナーゼLys Cを使用して37℃で4時間消化する。消化後、Lys C酵素はトリフルオロ酢酸を使用して不活性化され、得られたペプチドはC18逆相HPLCカラム(2.1mm×250mm、約20μg注入)で、0.1%トリフルオロ酢酸を含む水とアセトニトリルの勾配で分離される。
・システム適合性は、ゴリムマブ参照標準(RS)の注入による試験品分析の前に評価され、適切な試料前処理、操作、及びカラム分離効率(分解能)が保証される。
・RS注入のクロマトグラムは、ゴリムマブ標準物質の代表的なクロマトグラムと視覚的に類似する必要がある。クロマトグラムが視覚的に類似しない場合は、HPLC分析、酵素消化、又はその両方が失敗し、アッセイを繰り返す必要がある。
・HC 1-59 Asp43及びHC 1-58 Asp43ペプチドピークの分解能は1.1以上である必要がある(SOPの代表的なクロマトグラムで同定される)。分解能が≧1.1でない場合は、分解能の失敗の原因を修正し、実行を繰り返す必要がある。
・ゴリムマブ試験品の試料は、手順の最初と最後にRSで囲む必要がある。
・ゴリムマブ試験品の試料は、RSで囲む必要がある。
・実行の開始時と終了時のLC Asn93脱アミド化の結果は、5.8%以下(現在の仕様)である必要があり、それらの差は0.9%以下である必要がある。
・分析の開始時と終了時のHC isoAsp43の結果は、30%以下である必要があり、それらの差は2.0%以下である必要がある。
キャピラリー等電点電気泳動(cIEF)は、全体の電荷又は等電点(pI)に基づいてタンパク質を分離する。この方法は、ゴリムマブの電荷ベースのアイソフォームの分布を監視するために使用される。ゲルベースのIEF手順とは異なり、cIEFは存在する荷電種の定量的測定を提供する。更に、cIEFは、ゲルベースの方法と比較し、分解能、感度、及び再現性が向上する。cIEF手順では、ゴリムマブの4~6の電荷ベースのアイソフォームがほぼベースラインの分解能で分離されるが、IEFゲル分析では、4~5の種のみが部分的な分解能で分離される。C、1、2、及び3とラベル付けされた4つの主要なピークとBとラベル付けされた1つの微小ピークを持つSp2/0細胞で発現したゴリムマブの代表的なcIEFエレクトロフェログラムを図27示す。cIEFピークと負電荷/シアル化度の減少との一般的な関係を表す図も示される。
有効な結果を得るには、cIEF手順の実行中に次のシステム適合性とアッセイの許容基準が適用される。
1.システム適合性標準では、4つのpIマーカーピークがはっきりと見える必要がある。真ん中の2つのピーク(pI 8.7及びpI 9.0マーカー)は、USP方法による分解能係数(R)≧5.0を使用し、ベースラインで解決する必要がある。
2.2つのpIマーカーピーク(pI 7.6及びpI 9.5)は、ブランク、CPB対照、CPB処理RS、及びCPB処理済み試料で観察する必要がある。
3.ブランクの分析領域では、pI 7.6とpI 9.5のマーカーピークの間にピークがあってはない。
4.CPB対照の分析領域では、pI 7.6とpI 9.5のマーカーピークの間にピークがあってはない。
5.オートサンプラーのトレイ温度は、全ての注射で8℃以下に維持する必要がある。この基準はAlcottオートサンプラーに固有であり、試料温度を10.5℃以下に維持するために、機器認定の一環として、新しいタイプのオートサンプラーに対して再確立する必要がある。
6.ラボの周囲の室温は、アッセイ全体を通して30℃以下に維持する必要がある。
7.重複注入のエレクトロフェログラムは、互いに類似する必要がある(基準8及び9で定義されるとおり)。重複のエレクトロフェログラムが類似しないように見える場合、その試料のデータは無効であると見なされる。
8.CPB処理済みRSの場合、ピークC、1、2、及び3を観察する必要がある。ピーク1、2、及び3のpI範囲は、8.6~9.4である必要がある。ピーク1、2、及び3のピーク高さの合計は≧15,000である必要がある。
9.CPB処理済み試料の場合、ピークC、1、2、及び3を観察する必要がある。ピーク1、2、及び3のpI範囲は、8.6~9.4である必要がある。ピーク1、2、及び3のピークのピーク高さの合計は≧15,000である必要がある。
10.試験品の試料は、アッセイの開始時と終了時にRSで囲む必要がある。
11.CPB処理済みRSの最後の注射は、親溶液の添加から3時間以内に完了する必要がある。
12.実行開始時のRSのピーク3の面積パーセントは、16.1~19.5%である必要がある。これらの値はRSロット08G31AAに固有であり、認定手順の一環として、RSの新しいロットごとに新しい範囲が確立される。
13.実行終了時のRSのピーク3の面積パーセントは、15.4~19.2%である必要がある。これらの値はRSロット08G31AAに固有であり、認定手順の一環として、RSの新しいロットごとに新しい範囲が確立される。
14.実行開始時のRSと実行終了時のRS結果のピーク3結果の面積パーセントの差は、0.5%以下である必要がある。
Sp2/0細胞で産生されたゴリムマブの参照cIEFプロファイルは、代表的なエレクトロフェログラムに示されるように、C、1、2、及び3とラベル付けされた4つの主要なピークと微小ピークBを含む(図27)。微小ピークAも時々観察される。ゴリムマブの場合、cIEFプロファイルの変動の主な原因は、重鎖アスパラギン43(HC Asn43)の脱アミド化と異性化である。cIEFの塩基性ピーク3は、脱アミド化されないHC Asn43及び脱アミド化された重鎖イソアスパラギン酸43(HC isoAsp43)を表し、より酸性のピークは、脱アミド化されたHC Asp43及びシアル化の程度を表す。様々なcIEFピークの予測される同一性を表9に示す。
上記のように、ゴリムマブの脱アミド化のための別の部位はLC Asn93である。LC Asn93がゴリムマブのCDRにあることを考えると、その部位の修飾が抗原結合と抗TNF抗体の活性に影響を与えるか否かを理解することが重要である。LC Asn93の脱アミド化により、比較的安定した環化中間体が形成され、脱アミド化アッセイでcycAsn93として検出される。LC Asn93の脱アミド化が効力にどのように影響するかを理解するために、%LC cycAsn93を変化させたゴリムマブのいくつかの異なるバッチの効力に対して%LC cycAsn93をプロットすることによって相関分析を実行した(図28)。結果は、-0.782(p<0.0001)のピアソン二変量相関係数と統計的に有意な相関を示した。相関関係の証拠は因果関係を証明しないが、CDR内のLC Asn93の位置と組み合わせると、結果はLC Asn93の環化が効力に影響を与えることを示唆する。相関分析(図28)と臨床試験で認定されたデータに基づき、LC Asn93脱アミド化全体の脱アミド化許容基準が確立された。これらのデータは、2018年7月10日に提出され米国特許出願第62/695859号に示される。代替的には、効力の結果(生物活性アッセイ)は、LC Asn93脱アミド化の代理測定としても役立ち、即ち、効力が著しく高いことは、LC Asn93脱アミド化が限られることを示唆する。
大規模な商業産生中に、製造管理戦略は、DS及びDPの生物活性(効力)、オリゴ糖プロファイル、脱アミド化、及び/又は他の特性に関して、治療用タンパク質の一貫した原薬(DS)及び医薬品(DP)の特性を維持するために開発される。例えば、治療用抗体ゴリムマブの場合、製造プロセスの段階9で、製剤化されたバルク(FB)のプロセス内管理として、HC Asn43脱アミド化の合計%とLC Asn93脱アミド化の合計%が監視される。規制当局は、一貫性があり、安全で効果的な製品を確保するために、特定のロットリリース仕様を順守する必要があるため、これらの管理措置が必要である。
ゴリムマブのcIEFプロファイルの変動の主な原因が重鎖アスパラギン43(HC Asn43)の脱アミド化であることを認識した後、その変動を排除するための作業が開始される。その作業の1つの態様は、ゴリムマブの製造中のプロセスの製造動作範囲(MOR)を確立し、以前の臨床試験で認定されたHC Asn43の総脱アミド化の制限内にDPが79%以下であることを保証することであった。確立されたMORは、ゴリムマブのcIEFプロファイルに対するHC Asn43脱アミド化の影響も考慮し、cIEF仕様内でリリースされたDS及びDPバッチが22ケ月の貯蔵寿命の間仕様内にとどまるようにされた。これらのデータは、2018年7月10日に提出され米国特許出願第62/695859号に示される。第2の戦略は、ゴリムマブの重鎖(HC)のアミノ酸43にアスパラギン残基(Asn、N)の代わりにアスパラギン酸残基(Asp、D)を導入することにより、ソースでの変動を排除することであった。その変異体は、本明細書ではゴリムマブHC N43D(HC N43D)と呼ばれる。ゴリムマブとゴリムマブHC N43Dの配列比較を以下に示す。
ゴリムマブ
重鎖アスパラギン(Asn、N)43(HC N43)は、以下の配列番号36に下線が引かれ太字で示される。各重鎖CDR(HCDR)及び軽鎖CDR(LCDR)は、ゴリムマブの重鎖及び軽鎖(Kabatにより定義)に下線が引かれている。HC N43は、HCDR1とHCDR2の間の重鎖フレームワーク領域2(HFR2)に位置することに注意する。フレームワーク領域は、抗体の可変領域の高度に保存された領域であり、成熟抗体のCDR領域の発現及び安定化中に適切なタンパク質フォールディングを提供し、変異は抗体の結合特性に影響を与える可能性がある(vchinnikov et al.Role of framework mutations and antibody flexibility in the evolution of broadly neutralizing antibodies.eLife.2018;7:e33038)。
重鎖アスパラギン酸(Asp、D)43(HC N43D)は、以下の配列番号38に下線が引かれ、太字で示される。
クローニング
Sp2/0ネズミ骨髄腫細胞は、もともとオランダのライデンにあるライデン大学の病理検査室から入手したものであった。細胞をダルベッコ改変培地(DMEM)、10%ウシ胎児血清(FBS)、2mM L-グルタミン、25mM 4-(2-ヒドロキシエチル)ピペラジン-1-エタンスルホン酸(HEPES)、50μg/mLゲンタマイシン、50μM 2-メルカプトエタノール(2-ME)、2mMピルビン酸ナトリウムで増殖させた。10バイアルのResearch Cell Bank(RCB)を95%FBS、5%ジメチルスルホキシド(DMSO)で凍結させた。RCBのバイアルを解凍し、細胞をDMEM、10%FBS、2mM Lグルタミンで増殖させ、MBCB-1と呼ばれる64バイアルRCBを確立するために使用された。MBCB-1のバイアルは、既知組成培地に適合され、C463Aと呼ばれた。
ゴリムマブの大規模産生と同様に、ゴリムマブHC N43Dの前培養、細胞増殖、及び細胞産生は、小規模産生のために段階1及び2で実行される。段階1では、前培養は、ゴリムマブHC N43DのHC及びLC配列(それぞれ配列番号38及び配列番号37)を発現するトランスフェクトされたSp2/0細胞の単一細胞バンクバイアルから開始され、細胞は培養フラスコで増殖される。細胞は、10L産生バイオリアクターの接種に必要な細胞密度と容量が得られるまで培養される。段階2では、細胞培養は10L産生バイオリアクターで流加培養モードで実行される。15日間のバイオリアクターの実行期間中、培養物には必要に応じて濃縮グルコースベース及びアミノ酸ベースの飼料が供給される。産生バイオリアクターの実行が完了すると、細胞培養物が精製されてバイオマスが除去され、更に処理するために濾過される。
ゴリムマブHC N43Dの小規模産生のための精製ステップは、小規模産生のために段階8のウイルス濾過ステップが省略されたことを除き、大規模製造プロセスと同じであった。簡単に言えば、小規模産生の場合、細胞培養物からのゴリムマブHC N43Dの精製は、アフィニティ及びイオン交換クロマトグラフィのステップと、潜在的なウイルス汚染を不活化又は除去する(溶媒/洗浄剤処理及びウイルス除去)ステップとの組み合わせによって段階3~7で実行される。段階3では、回収及び/又はプールされた回収物を、プロテインAアフィニティクロマトグラフィを使用して清澄化及び精製する。得られた直接生成物捕獲(DPC)溶出液は、更なる処理まで凍結される。段階4で、解凍後、DPC溶出液を濾過し、プールし、その後、段階5でトリ-n-ブチルホスファート(TNBP)及びポリソルベート80(PS80)で処理して、存在する可能性があり脂質エンベロープを有する任意のウイルスを不活性化する。
表10に示すように、HC Asn43(HC N43)をHC Asp43(HC N43D)に置き換えることと一致するcIEFピークパーセンテージのシフト、及びHC N43での脱アミド化の排除を除き、ゴリムマブとゴリムマブHC N43D変異体にはわずかな違いしかない。最も重要なことは、生物活性の違いがゴリムマブの大規模な商業産生の許容基準の範囲内にあることである。更に、観察された違いは、処理の違い(即ち、大規模な商業産生と小規模産生)が原因であり得た。したがって、HC N43D変異による悪影響はなく、ゴリムマブHC N43Dはゴリムマブに匹敵すると結論付けられる。
したがって、上記のように、HC Asn43の脱アミド化によって引き起こされるゴリムマブの変動を排除するための成功した戦略が実施された。戦略は、ゴリムマブの重鎖(HC)のアミノ酸43にアスパラギン残基(Asn、N)の代わりにアスパラギン酸残基(Asp、D)を導入することであった。ゴリムマブHC N43Dはクローン化され、発現され、精製され、ゴリムマブHC N43Dの特性は、ゴリムマブに匹敵する生物活性及び他の特性を持つことを示した。組換え抗TNF抗体であるゴリムマブHC N43Dは、配列番号38のアミノ酸配列を含む重鎖(HC)と、配列番号37のアミノ酸配列を含む軽鎖(LC)とを備える。
Claims (8)
- 配列番号38のアミノ酸配列を含む重鎖(HC)及び配列番号37のアミノ酸配列を含む軽鎖(LC)を含む組換え抗TNF抗体をコードする単離された核酸分子。
- 請求項1に記載の核酸分子を含む、ベクター又は組換え真核宿主細胞。
- 前記真核宿主細胞が、COS-1細胞、COS-7細胞、HEK293細胞、BHK21細胞、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞、BSC-1細胞、Hep G2細胞、P3X63Ag8.653(653)細胞、Sp2/0細胞、HeLa細胞、骨髄腫細胞、及びリンパ腫細胞からなる群から選択される、請求項2に記載の組換え真核宿主細胞。
- 前記真核宿主細胞がSp2/0細胞である、請求項3に記載の組換え真核宿主細胞。
- 配列番号38のアミノ酸配列を含む重鎖(HC)及び配列番号37のアミノ酸配列を含む軽鎖(LC)を含む組換え抗TNF抗体を産生する方法であって、
a.前記抗TNF抗体分子が発現されるような条件下で、請求項2~4のいずれか一項に記載の組換え真核宿主細胞を培養するステップと、
b.前記組換え抗TNF抗体を回収するステップと
を含む、前記方法。 - 配列番号38のアミノ酸配列を含む重鎖(HC)及び配列番号37のアミノ酸配列を含む軽鎖(LC)を含む組換え抗TNF抗体であって、請求項5に記載の方法によって産生される、組換え抗TNF抗体。
- 前記抗TNF抗体がTNFアルファ(TNFα)の活性を阻害する、請求項6に記載の組換え抗TNF抗体。
- 請求項6に記載の組換え抗TNF抗体を含む、医薬組成物。
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