JP2022524281A - TGFβのLTBP複合体特異的阻害剤およびその使用 - Google Patents
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Abstract
Description
この国際出願は、2019年1月30日に出願された米国仮出願番号62/798,927の利益および優先権を主張し、その内容は全体で参照により本明細書中に明白に援用される。
増殖因子の形質転換増殖因子β(TGFβ)スーパーファミリーは、制限されないが、細胞増殖の阻害、組織恒常性、細胞外マトリックス(ECM)再構築、内皮間葉転換、細胞遊走および浸潤、および免疫調整/抑制、ならびに間葉上皮転換を含む様々な生物学的プロセスを調節する、複数のシグナリングカスケードに関与する。ECM再構築に関して、TGFβシグナリングは、線維芽細胞集団およびECM沈着(例えば、コラーゲン)を増大させ得る。免疫系では、TGFβリガンドは、制御性T細胞の機能と、免疫前駆細胞の増殖および恒常性の維持を調整する。正常な上皮細胞では、TGFβは、強力な増殖インヒビターおよび細胞分化のプロモーターである。しかしながら、腫瘍が発生して進行すると、TGFβに対する負の増殖応答を失うことが多い。この状況においては、TGFβは、血管新生を刺激、間質環境を変更、および、局所および全身性の免疫抑制を誘導するその能力に起因して、腫瘍発生のプロモーターとなり得る。これらおよび他の理由から、TGFβは、複数の臨床的徴候(indication)に関する治療的標的となっている。複数のグループによって現在までになされた多くの試みにもかかわらず、TGFβ治療の臨床開発はチャレンジングである。
i)マウスLTBP1-proTGFβ1複合体と交差反応性である;
ii)マウスLTBP3-proTGFβ1複合体と交差反応性である;
iii)BLIによって測定した場合に<10nMのKDでマウスLTBP1-proTGFβ1複合体に結合する;
iv)BLIによって測定した場合に<10nMのKDでマウスLTBP3-proTGFβ1複合体に結合する;
v)同一のアッセイ条件下でヒトGARP-proTGFβ1複合体に結合する場合のKDよりも少なくとも50倍低いKDでヒトLTBP1-proTGFβ1複合体および/またはヒトLTBP3-TGFβ1複合体に結合する;
vi)ヒトLTBP1-proTGFβ1複合体および/またはヒトLTBP3-TGFβ1複合体への結合を測定するために用いられるのと同一のアッセイ条件下でBLIによって測定した場合に、ヒトGARP-proTGFβ1複合体への検出可能な結合を示さない;
vii)ヒトLTBP1-proTGFβ1複合体および/またはヒトLTBP3-TGFβ1複合体への結合を測定するために用いられるのと同一のアッセイ条件下でBLIによって測定した場合に、LRRC33-proTGFβ1複合体(例えば、ヒトLRRC33-proTGFβ1複合体)への検出可能な結合を示さない。
(viii)ヒトLTBP1-proTGFβ1複合体および/またはヒトLTBP3-TGFβ1複合体に結合したときに、≦5×10-4(1/s)の低い解離速度(kOFF)(例えば、適切なインビトロ結合/速度論アッセイによって、例えばBLIによって、例えば、Octetに基づくシステムによって測定);および/または
(ix)ヒトLTBP1-proTGFβ1および/またはヒトLTBP3-proTGFβ1複合体に結合したときに、≧45分の長い結合半減期(half-binding time)(t1/2)(例えば、SPRによって測定)。
a)アミノ酸配列FTFRSYVMHを含んでいるCDR-H1;
b)アミノ酸配列VISHEGS(X1)KYYADSVKGを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はLまたはGである;および
c)アミノ酸配列A(X1)PRIAARRGGFG(X2)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はV、RまたはLであり、X2はY、SまたはTである;
d)アミノ酸配列TRS(X1)G(X2)ID(X3)NYVQを含んでいるCDR-L1であって、ここで、X1はSまたはHであり、X2はN、L、SまたはAであり、X3はN、DまたはYである;
e)アミノ酸配列ED(X1)(X2)RPSを含んでいるCDR-L2であって、ここで、X1はN、FまたはAであり、X2はQ、IまたはVである;および
f)アミノ酸配列Q(X1)YD(X2)(X3)(X4)Q(X5)VVを含んでいるCDR-L3であって、ここで、X1はSまたはGであり、X2はS、F、Y、D、HまたはWであり、X3はN、DまたはSであり、X4はN、A、L、EまたはTであり、X5はG、R、AまたはLである。
アミノ酸配列FTFRSYVMH(配列番号166)を含んでいるCDR-H1;
アミノ酸配列VISHEGSLKYYADSVKG(配列番号167)を含んでいるCDR-H2;
アミノ酸配列ARPRIAARRGGFGY(配列番号168)を含んでいるCDR-H3;
アミノ酸配列TRSSGNIDNNYVQ(配列番号169)を含んでいるCDR-L1;
アミノ酸配列EDNQRPS(配列番号170)を含んでいるCDR-L2;および
アミノ酸配列QSYDYDTQGVV(配列番号171)を含んでいるCDR-L3。
a)アミノ酸配列GSIRSSSYYWGを含んでいるCDR-H1;
b)アミノ酸配列SISYSATTYYを含んでいるCDR-H2;
c)アミノ酸配列A(X1)DPSYDS(X2)AGM(X3)Vを含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はSまたはGであり、X2はAまたはIであり、X3はDまたはQである;
d)アミノ酸配列RAS(X1)(X2)IS(X3)YLNを含んでいるCDR-L1であって、ここで、X1はKまたはQであり、X2はVまたはSであり、X3はSまたはYである;
e)アミノ酸配列(X1)AS(X2)(X3)QSを含んでいるCDR-L2であって、ここで、X1はY、AまたはSであり、X2はSまたはNであり、X3はLまたはRである;
f)アミノ酸配列QQ(X1)(X2)D(X3)P(X4)Tを含んでいるCDR-L3であって、ここで、X1はSまたはGであり、X2はFまたはNであり、X3はWまたはFであり、X4はFまたはLである。
アミノ酸配列GSIRSSSYYWG(配列番号292)を含んでいるCDR-H1;
アミノ酸配列SISYSATTYY(配列番号293)を含んでいるCDR-H2;
アミノ酸配列AGDPSYDSIAGMQV(配列番号294)を含んでいるCDR-H3;
アミノ酸配列RASQSISSYLN(配列番号295)を含んでいるCDR-L1;
アミノ酸配列AASNLQS(配列番号296)を含んでいるCDR-L2;および
アミノ酸配列QQSFDWPLT(配列番号297)を含んでいるCDR-L3。
本開示がより容易に理解され得るように、特定の用語が最初に定義される。これらの定義は、本開示の残部に照らして、当業者によって理解されるように読まれるべきである。別段の定義がない限り、本明細書において用いられる全ての技術的および科学的用語は、当業者によって一般に理解されるのと同じ意味を有する。さらなる定義が、詳細な説明の全体にわたって示される。
哺乳類では、形質転換増殖因子-β(TGFβ)スーパーファミリーは、少なくとも33個の遺伝子産物で構成される。これらは、骨形成タンパク質(BMP)、アクチビン、増殖および分化因子(GDF)、ならびに、TGFβファミリーの3つのアイソフォーム:TGFβ1、TGFβ2、およびTGFβ3を含む。TGFβsは、細胞増殖の阻害、細胞外マトリックス(ECM)再構築、および免疫の恒常性のような様々なプロセスにおいて重要な役割を果たしていると考えられる。T細胞恒常性に関するTGFβ1の重要性は、TGFβ1-/-マウスが、3~4週しか生きず、強力な免疫活性化に起因して多臓器不全で死亡するという観察によって説明される(Kulkarni,A.B.,et al.,Proc Natl Acad Sci USA,1993.90(2):p.770-4;Shull,M.M.,et al.,Nature,1992.359(6397):p.693-9)。TGFβ2およびTGFβ3の役割は、それほど明らかではない。3つのTGFβアイソフォームは、別個の時間的および空間的発現パターンを有するが、それらは、同一の受容体、TGFβRIおよびTGFβRIIを通してシグナル伝達し、しかしながら場合によっては、例えばTGFβ2シグナリングについては、ベータグリカンのようなタイプIII受容体も必要である(Feng,X.H.and R.Derynck,Annu Rev Cell Dev Biol,2005.21:p.659-93;Massague,J.,Annu Rev Biochem,1998.67:p.753-91)。TGFβRI/IIのリガンド誘導性オリゴマー化は、SMAD転写因子のリン酸化をトリガーし、Col1a1、Col3a1、ACTA2、およびSERPINE1のような標的遺伝子の転写をもたらす(Massague,J.,J.Seoane,and D.Wotton,Genes Dev,2005.19(23):p.2783-810)。SMAD非依存性TGFβシグナリング経路は、例えば、Marfanマウスの癌または大動脈病変においても説明されている(Derynck,R.and Y.E.Zhang,Nature,2003.425(6958):p.577-84;Holm,T.M.,et al.,Science,2011.332(6027):p.358-61)。
安全性の観点から、アイソフォームにわたるTGFβの広範な阻害は観察される毒性の原因となり得るという認識が次第になされるようになり、それにより、今日までTGFβ阻害剤の開発が成功しなかったという事実が強調される。潜在的に危険な副作用を回避するために、複数のグループが、最近になって、アイソフォームの全てではないがサブセットを標的化し、なおいかつ有効性を維持している阻害剤を同定することに切り替えている。しかしながら、有効性の観点から、この分野の通説では、治療的効果を達成するためにTGFβの複数のアイソフォームを阻害することが有利であるとされていて、これに適合するために、「慎重に投与するレジメン」による毒性管理が解決策として示唆されている(Brennan et al.(2018)mAbs,10:1、1-17)。この前提と一致して、非常に多くのグループが、1つよりも多いアイソフォームを標的化するTGFβ阻害剤を開発している。これらは、TGFβ受容体の低分子量拮抗薬、例えば、ALK5拮抗薬、例えばガルニサーチブ(galunisertib)(LY2157299一水和物);3つのアイソフォームの全てを阻害するモノクローナル抗体(例えば中和抗体)(「pan-阻害剤」抗体)(例えば、WO2018/134681を参照);3つのアイソフォームのうちの2つを優先的に阻害するモノクローナル抗体(例えば、TGFβ1/2に対する抗体(例えばWO2016/161410)およびTGFβ1/3(例えばWO2006/116002);および、改変された分子(例えば、融合タンパク質)、例えばリガンド・トラップ(例えば、WO2018/029367;WO2018/129331およびWO2018/158727)を含む。同様に、αVβ6のようなインテグリンの阻害剤も、TGFβ1とTGFβ3の両方のインテグリン依存性活性化をブロックし、したがって、TGFβシグナリングのアイソフォーム非選択的阻害剤と考えられ得る。さらに、TGFβ1およびTGFβ2の両方に選択的に結合して中和する抗体(すなわち、TGFβ1/2阻害剤)の例は、XOMA089(またはNIS793)および変異体を含む(例えば、WO2016/161410を参照)。
哺乳類には、4つの公知のLTBP、LTBP1~4が存在し、それぞれ複数のスプライス変異を有する(Robertson,I.B.,et al.,Matrix Biol,2015.47:p.44-53)。LTBP2は、潜在型TGFβと関連しない唯一のLTBPである(Saharinen,J.and J.Keski-Oja,Mol Biol Cell,2000.11(8):p.2691-704)。LTBP1またはLTBP3と潜在型TGFβ1との間の関連性は十分に確認されているが、TGFβ提示におけるLTBP4の役割はあまり明らかでない。LTBP4と潜在型TGFβ1の複合体は、潜在的に、LTBP4のTGFβ結合ドメイン内の負に帯電したいくつかの残基の不存在に起因して、さらにより低効率で形成すると考えられる(Saharinen,J.and J.Keski-Oja,Mol Biol Cell,2000.11(8):p.2691-704;Chen,Y.,et al.,J Mol Biol,2005.345(1):p.175-86)。LTBP4S-/-マウスおよびLTBP4内にヌル突然変異を有するUrban-Rifkin-Davis症候群患者の両方とも、破壊された弾性の繊維集合体に悩まされる(Urban,Z.,et al.,Am J Hum Genet,2009.85(5):p.593-605;Dabovic,B.,et al.,J Cell Physiol,2015.230(1):p.226-36)。さらに、LTBP4S-/-マウスは、肺の中隔作成および弾性繊維形成の欠陥を有するが、潜在型TGFβ1と複合体を形成できないLTBP4を有するトランスジェニックマウスは、明白な表現型を有さない(Dabovic,B.,et al.,J Cell Physiol,2015.230(1):p.226-36)。LTBP4が、提示分子として機能することによって潜在型TGFβ1の調節に直接関与しているかどうかは明確でなく;そのかわり、LTBP4は、ECMにおける弾性の原線維の適切な形成に必要であり得て、その損失は、ECMにおける欠陥を通して潜在型TGFβ1活性化に間接的に影響する。
本発明は、マトリックスまたはECM関連のTGFβ活性を選択的に標的化する新規のTGFβ阻害剤を提供する。より具体的には、そのような阻害剤は、ECM環境内でTGFβ1の潜在型(例えば、proTGFβ1複合体)に特異的に結合して、ニッチにおける複合体からの成熟増殖因子の放出を防ぐ、TGFβ1活性化のアイソフォーム特異的、コンテキスト選択的阻害剤を含む。そのようなマトリックス標的化阻害剤は、ECM提示分子(すなわちLTBP1および/またはLTBP3)と関連するproTGFβ1に選択的に結合するという点でコンテキスト特異的である。したがって、LTBP1-proTGFβ1複合体および/またはLTBP3-proTGFβ1複合体内に存在するエピトープに結合することが可能なモノクローナル抗体およびそのフラグメントが本明細書中に開示されるが、そのエピトープは、GARP-proTGFβ1複合体および/またはLRRC33-proTGFβ1複合体内には存在しない。
LSTCKTIDMELVKRKRIEAIRGQILSKLRLASPPSQGEVPPGPLPEAVLALYNSTRDRVAGESAEPEPEPEADYYAKEVTRVLMVETHNEIYDKFKQSTHSIYMFFNTSELREAVPEPVLLSRAELRLLRLKLKVEQHVELYQKYSNNSWRYLSNRLLAPSDSPEWLSFDVTGVVRQWLSRGGEIEGFRLSAHCSCDSRDNTLQVDINGFTTGRRGDLATIHGMNRPFLLLMATPLERAQHLQSSRHRRALDTNYCFSSTEKNCCVRQLYIDFRKDLGWKWIHEPKGYHANFCLGPCPYIWSLDTQYSKVLALYNQHNPGASAAPCCVPQALEPLPIVYYVGRKPKVEQLSNMIVRSCKCS(配列番号9)
SLSTCSTLDMDQFMRKRIEAIRGQILSKLKLTSPPEDYPEPEEVPPEVISIYNSTRDLLQEKASRRAAACERERSDEEYYAKEVYKIDMPPFFPSENAIPPTFYRPYFRIVRFDVSAMEKNASNLVKAEFRVFRLQNPKARVPEQRIELYQILKSKDLTSPTQRYIDSKVVKTRAEGEWLSFDVTDAVHEWLHHKDRNLGFKISLHCPCCTFVPSNNYIIPNKSEELEARFAGIDGTSTYTSGDQKTIKSTRKKNSGKTPHLLLMLLPSYRLESQQTNRRKKRALDAAYCFRNVQDNCCLRPLYIDFKRDLGWKWIHEPKGYNANFCAGACPYLWSSDTQHSRVLSLYNTINPEASASPCCVSQDLEPLTILYYIGKTPKIEQLSNMIVKSCKCS(配列番号10)
SLSLSTCTTLDFGHIKKKRVEAIRGQILSKLRLTSPPEPTVMTHVPYQVLALYNSTRELLEEMHGEREEGCTQENTESEYYAKEIHKFDMIQGLAEHNELAVCPKGITSKVFRFNVSSVEKNRTNLFRAEFRVLRVPNPSSKRNEQRIELFQILRPDEHIAKQRYIGGKNLPTRGTAEWLSFDVTDTVREWLLRRESNLGLEISIHCPCHTFQPNGDILENIHEVMEIKFKGVDNEDDHGRGDLGRLKKQKDHHNPHLILMMIPPHRLDNPGQGGQRKKRALDTNYCFRNLEENCCVRPLYIDFRQDLGWKWVHEPKGYYANFCSGPCPYLRSADTTHSTVLGLYNTLNPEASASPCCVPQDLEPLTILYYVGRTPKVEQLSNMVVKSCKCS(配列番号11)
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYGISWVRQAPGQGLEWMGWISAYNGNTNYAQKLQGRVTMTTDTSTSTAYMELRSLRSDDTAVYYCARAPLGNFDSWGQGTMVTVSS(配列番号7)
NFMLTQPHSVSESPGKTVTISCTRSSGSIASNYVQWYQQRPGSSPTTVIYEDNQRPSGVPDRFSGSIDSSSNSASLTISGLKTEDEADYYCQSYDSSNHPVVFGGGTKLTVL(配列番号8)
QLQLQESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFNNYPIHWVRQAPGKGLEWVAVMSYDGINKYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARPRIAARRGGFDYWGQGTLVTVSS(配列番号88)
NFMLTQPHSVSESPGKTVTISCTRSSGNIDNNYVQWYQQRPGSSPTTVIYEDNQRPSGVPDRFSGSIDSSSNSASLTISGLKTEDEADYYCQSYDSDNQGVVFGGGTKLTVL(配列番号89)
QLQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGGSISSSSYYWGWIRQPPGKGLEWIGSISYSGSTYYNPSLKSRVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARDPSYDSIAGMDVWGQGTTVTVSS(配列番号106)
DIQLTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYAASNLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSFDFPFTFGGGTKVEIK(配列番号107)
QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFRSYVMHWVRQAPGKGLEWVAVISHEGSLKYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARPRIAARRGGFGYWGQGTLVTVSS(配列番号318)
NFMLTQPHSVSESPGKTVTISCTRSSGNIDNNYVQWYQQRPGSSPTTVIYEDNQRPSGVPDRFSGSIDSSSNSASLTISGLKTEDEADYYCQSYDYDTQGVVFGGGTKLTVL(配列番号319)
QLQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGGSIRSSSYYWGWIRQPPGKGLEWIGSISYSATTYYNPSLKSRVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCAGDPSYDSIAGMQVWGQGTTVTVSS(配列番号360)
DIQLTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYAASNLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSFDWPLTFGGGTKVEIK(配列番号361)
a)以下の条件で、CDR-H1:配列番号1
i.配列番号1の4位のトレオニン残基は、ヒスチジン、リジン、フェニルアラニン、またはグリシンで置換されてもよい;
ii.配列番号1の5位のセリン残基は、ロイシンで置換されてもよい;および/または、
iii.配列番号1の9位のセリン残基は、アラニンで置換されてもよい;
b)以下の条件で、CDR-H2:配列番号2
i.配列番号2の3位のセリン残基は、アスパラギン酸またはアスパラギンで置換されてもよい;
ii.配列番号2の5位のチロシン残基は、ヒスチジンで置換されてもよい;
iii.配列番号2の6位のアスパラギン残基は、セリンで置換されてもよい;
iv.配列番号2の8位のアスパラギン残基は、フェニルアラニン、ロイシン、アラニン、チロシン、アスパラギン酸、またはセリンで置換されてもよい;および/または、
v.配列番号2の10位のアスパラギン残基は、アスパラギン酸またはアラニンで置換されてもよい;
c)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H3:配列番号3。
a)以下の条件で、CDR-H1:配列番号1
i.配列番号1の4位のトレオニン残基は、ヒスチジン、リジン、フェニルアラニン、またはグリシンで置換されてもよい;
ii.配列番号1の5位のセリン残基は、ロイシンで置換されてもよい;および/または、
iii.配列番号1の9位のセリン残基は、アラニンで置換されてもよい;
b)以下の条件で、CDR-H2:配列番号2
i.配列番号2の3位のセリン残基は、アスパラギン酸またはアスパラギンで置換されてもよい;
ii.配列番号2の5位のチロシン残基は、ヒスチジンで置換されてもよい;
iii.配列番号2の6位のアスパラギン残基は、セリンで置換されてもよい;
iv.配列番号2の8位のアスパラギン残基は、フェニルアラニン、ロイシン、アラニン、チロシン、アスパラギン酸、またはセリンで置換されてもよい;および/または、
v.配列番号2の10位のアスパラギン残基は、アスパラギン酸またはアラニンで置換されてもよい;
c)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H3:配列番号3;
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L1:配列番号4;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L2:配列番号5;および、
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L3:配列番号6。
a)以下の条件で、CDR-H1:配列番号1
i.配列番号1の4位のトレオニン残基は、ヒスチジン、リジン、フェニルアラニン、またはグリシンで置換されてもよい;
ii.配列番号1の5位のセリン残基は、ロイシンで置換されてもよい;および/または、
iii.配列番号1の9位のセリン残基は、アラニンで置換されてもよい;
b)以下の条件で、CDR-H2:配列番号2
i.配列番号2の3位のセリン残基は、アスパラギン酸またはアスパラギンで置換されてもよい;
ii.配列番号2の5位のチロシン残基は、ヒスチジンで置換されてもよい;
iii.配列番号2の6位のアスパラギン残基は、セリンで置換されてもよい;
iv.配列番号2の8位のアスパラギン残基は、フェニルアラニン、ロイシン、アラニン、チロシン、アスパラギン酸、またはセリンで置換されてもよい;および/または、
v.配列番号2の10位のアスパラギン残基は、アスパラギン酸またはアラニンで置換されてもよい;
c)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H3:配列番号3;
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L1:配列番号4;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L2:配列番号5;および、
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L3:配列番号6。
a)以下の条件で、CDR-H1:配列番号94
i.配列番号94の2位のトレオニン残基は、アラニンで置換されてもよい;
ii.配列番号94の4位のアスパラギン残基は、アラニン、チロシン、アスパラギン酸、セリン、アルギニン、またはヒスチジンで置換されてもよい;
iii.配列番号94の5位のアスパラギン残基は、グルタミン、セリン、グリシン、リジン、グルタミン酸、アルギニン、またはヒスチジンで置換されてもよい;
iv.配列番号94の6位のチロシン残基は、アルギニンで置換されてもよい;
v.配列番号94の7位のプロリン残基は、グリシン、アラニン、ロイシン、セリン、アスパラギン、バリン、アスパラギン酸、またはグルタミンで置換されてもよい;
vi.配列番号94の8位のイソロイシン残基は、メチオニンまたはロイシンで置換されてもよい;および/または、
vii.配列番号94の9位のヒスチジン残基は、フェニルアラニン、チロシン、アスパラギン、またはセリンで置換されてもよい;
b)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H2:配列番号95;および
c)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H3:配列番号96。
a)以下の条件で、CDR-H1:配列番号94
i.配列番号94の2位のトレオニン残基は、アラニンで置換されてもよい;
ii.配列番号94の4位のアスパラギン残基は、アラニン、チロシン、アスパラギン酸、セリン、アルギニン、またはヒスチジンで置換されてもよい;
iii.配列番号94の5位のアスパラギン残基は、グルタミン、セリン、グリシン、リジン、グルタミン酸、アルギニン、またはヒスチジンで置換されてもよい;
iv.配列番号94の6位のチロシン残基は、アルギニンで置換されてもよい;
v.配列番号94の7位のプロリン残基は、グリシン、アラニン、ロイシン、セリン、アスパラギン、バリン、アスパラギン酸、またはグルタミンで置換されてもよい;
vi.配列番号94の8位のイソロイシン残基は、メチオニンまたはロイシンで置換されてもよい;および/または、
vii.配列番号94の9位のヒスチジン残基は、フェニルアラニン、チロシン、アスパラギン、またはセリンで置換されてもよい;
b)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H2:配列番号95;
c)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H3:配列番号96;
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L1:配列番号97;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L2:配列番号98;および、
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L3:配列番号99。
a)以下の条件で、CDR-H1:配列番号94
i.配列番号94の2位のトレオニン残基は、アラニンで置換されてもよい;
ii.配列番号94の4位のアスパラギン残基は、アラニン、チロシン、アスパラギン酸、セリン、アルギニン、またはヒスチジンで置換されてもよい;
iii.配列番号94の5位のアスパラギン残基は、グルタミン、セリン、グリシン、リジン、グルタミン酸、アルギニン、またはヒスチジンで置換されてもよい;
iv.配列番号94の6位のチロシン残基は、アルギニンで置換されてもよい;
v.配列番号94の7位のプロリン残基は、グリシン、アラニン、ロイシン、セリン、アスパラギン、バリン、アスパラギン酸、またはグルタミンで置換されてもよい;
vi.配列番号94の8位のイソロイシン残基は、メチオニンまたはロイシンで置換されてもよい;および/または、
vii.配列番号94の9位のヒスチジン残基は、フェニルアラニン、チロシン、アスパラギン、またはセリンで置換されてもよい;
b)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H2:配列番号95;
c)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H3:配列番号96;
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L1:配列番号97;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L2:配列番号98;および、
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L3:配列番号99。
a)アミノ酸配列FTF(X1)(X2)YVMHを含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSまたはRであってもよく、X2はGまたはSであってもよい;
b)アミノ酸配列(X1)ISHEG(X2)(X3)KYYADSVKGを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はVまたはSであってもよく、X2はSまたはGであってもよく、X3はFまたはLであってもよい;および
c)アミノ酸配列(X1)(X2)P(X3)(X4)(X5)(X6)RRGG(X7)(X8)(X9)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はAまたはVであってもよく;X2はR、V、GまたはKであってもよく;X3はR、HまたはLであってもよく;X4はI、VまたはGであってもよく;X5はA、S、またはLであってもよく;X6はAまたはVであってもよく;X7はFまたはYであってもよく;X8はD、G、R、またはSであってもよく;X9はY、G、R、L、V、AまたはKであってもよい。
a)アミノ酸配列FTF(X1)(X2)YVMHを含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSまたはRであってもよく、X2はGまたはSであってもよい;
b)アミノ酸配列(X1)ISHEG(X2)(X3)KYYADSVKGを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はVまたはSであってもよく、X2はSまたはGであってもよく、X3はFまたはLであってもよい;
c)アミノ酸配列(X1)(X2)P(X3)(X4)(X5)(X6)RRGG(X7)(X8)(X9)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はAまたはVであってもよく、X2はR、V、GまたはKであってもよく、X3はR、HまたはLであってもよく、X4はI、VまたはGであってもよく、X5はA、S、またはLであってもよく、X6はAまたはVであってもよく、X7はFまたはYであってもよく、X8はD、G、R、またはSであってもよく、X9はY、G、R、L、V、AまたはKであってもよい;
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号97に示されるCDR-L1;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号98に示されるCDR-L2;および
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号99に示されるCDR-L3。
a)アミノ酸配列FTF(X1)(X2)YVMHを含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSまたはRであってもよく、X2はGまたはSであってもよい;
b)アミノ酸配列(X1)ISHEG(X2)(X3)KYYADSVKGを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はVまたはSであってもよく、X2はSまたはGであってもよく、X3はFまたはLであってもよい;
c)アミノ酸配列(X1)(X2)P(X3)(X4)(X5)(X6)RRGG(X7)(X8)(X9)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はAまたはVであってもよく、X2はR、V、GまたはKであってもよく、X3はR、HまたはLであってもよく、X4はI、VまたはGであってもよく、X5はA、S、またはLであってもよく、X6はAまたはVであってもよく、X7はFまたはYであってもよく、X8はD、G、R、またはSであってもよく、X9はY、G、R、L、V、AまたはKであってもよい;
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号97に示されるCDR-L1;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号98に示されるCDR-L2;および
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号99に示されるCDR-L3。
a)アミノ酸配列FTF(X1)(X2)YVMHを含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSまたはRであってもよく、X2はGまたはSであってもよい;
b)アミノ酸配列(X1)ISHEGS(X2)KYYADSVKGを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はVまたはSであってもよく;X2はFまたはLであってもよい;および
c)アミノ酸配列A(X1)PRI(X2)ARRGGFGYを含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はRまたはVであってもよく;X2はAまたはLであってもよい。
a)アミノ酸配列FTF(X1)(X2)YVMHを含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSまたはRであってもよく、X2はGまたはSであってもよい;
b)アミノ酸配列(X1)ISHEGS(X2)KYYADSVKGを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はVまたはSであってもよく;X2はFまたはLであってもよい;
c)アミノ酸配列A(X1)PRI(X2)ARRGGFGYを含んでいるCDR-であって、ここで、X1はRまたはVであってもよく;X2はAまたはLであってもよい;
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号97に示されるCDR-L1;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号98に示されるCDR-L2;および
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号99に示されるCDR-L3。
a)アミノ酸配列FTF(X1)(X2)YVMHを含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSまたはRであってもよく、X2はGまたはSであってもよい;
b)アミノ酸配列(X1)ISHEGS(X2)KYYADSVKGを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はVまたはSであり;X2はFまたはLである;
c)アミノ酸配列A(X1)PRI(X2)ARRGGFGYを含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はRまたはVであってもよく;X2はAまたはLであってもよい;
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号97に示されるCDR-L1;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号98に示されるCDR-L2;および
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号99に示されるCDR-L3。
a)以下の条件で、CDR-H1:配列番号100
i.配列番号100の4位のセリン残基はヒスチジンで置換されてもよい;
ii.配列番号100の7位のセリン残基はアラニンまたはグリシンで置換されてもよい;および/または、
iii.配列番号100の11位のグリシン残基はトレオニン、セリン、ヒスチジン、ロイシン、イソロイシン、アスパラギン、バリン、またはアラニンで置換されてもよい;
b)以下の条件で、CDR-H2:配列番号101
i.配列番号101の3位のセリン残基はアラニンで置換されてもよい;
ii.配列番号101の6位のグリシン残基はアラニンまたはセリンで置換されてもよい;および/または、
iii.配列番号101の7位のセリン残基はトレオニンで置換されてもよい;および
c)3、4、5または6個までのアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H3:配列番号102。
a)以下の条件で、CDR-H1:配列番号100
i.配列番号100の4位のセリン残基はヒスチジンで置換されてもよい;
ii.配列番号100の7位のセリン残基はアラニンまたはグリシンで置換されてもよい;および/または、
iii.配列番号100の11位のグリシン残基はトレオニン、セリン、ヒスチジン、ロイシン、イソロイシン、アスパラギン、バリン、またはアラニンで置換されてもよい;
b)以下の条件で、CDR-H2:配列番号101
i.配列番号101の3位のセリン残基はアラニンで置換されてもよい;
ii.配列番号101の6位のグリシン残基はアラニンまたはセリンで置換されてもよい;および/または、
iii.配列番号101の7位のセリン残基はトレオニンで置換されてもよい;および
c)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H3:配列番号102.
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L1:配列番号103;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L2:配列番号104;および、
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L3:配列番号105。
a)以下の条件で、CDR-H1:配列番号100
i.配列番号100の4位のセリン残基はヒスチジンで置換されてもよい;
ii.配列番号100の7位のセリン残基はアラニンまたはグリシンで置換されてもよい;および/または、
iii.配列番号100の11位のグリシン残基はトレオニン、セリン、ヒスチジン、ロイシン、イソロイシン、アスパラギン、バリン、またはアラニンで置換されてもよい;
b)以下の条件で、CDR-H2:配列番号101
i.配列番号101の3位のセリン残基はアラニンで置換されてもよい;
ii.配列番号101の6位のグリシン残基はアラニンまたはセリンで置換されてもよい;および/または、
iii.配列番号101の7位のセリン残基はトレオニンで置換されてもよい;
c)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H3:配列番号102;
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L1:配列番号103;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L2:配列番号104;および、
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L3:配列番号105。
a)アミノ酸配列G(X1)I(X2)S(X3)SYYW(X4)を含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSまたはPであってもよく、X2はS、HまたはRであってもよく、X3はSまたはGであってもよく、X4はG、I、NまたはVであってもよい;
b)アミノ酸配列SISYSA(X1)TYYNPSLKSを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はSまたはTであってもよい;および
c)アミノ酸配列(X1)(X2)D(X3)(X4)Y(X5)(X6)(X7)(X8)G(X9)(X10)(X11)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はAまたはVであってもよく;X2はR、SまたはGであってもよく、X3はP、Y、R、V、I、H、TまたはEであってもよく;X4はS、D、EまたはNであってもよく;X5はD、AまたはTであってもよく;X6はS、G、TまたはAであってもよく;X7はI、A、R、Q、またはVであってもよく;X8はA、E、K、GまたはTであってもよく;X9はMまたはIであってもよく;X10はD、L、Q、V、NまたはGであってもよく;X11はV、R、N、EまたはKであってもよい。
a)アミノ酸配列G(X1)I(X2)S(X3)SYYW(X4)を含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSまたはPであってもよく、X2はS、HまたはRであってもよく、X3はSまたはGであってもよく、X4はG、I、NまたはVであってもよい;
b)アミノ酸配列SISYSA(X1)TYYNPSLKSを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はSまたはTであってもよい;
c)アミノ酸配列(X1)(X2)D(X3)(X4)Y(X5)(X6)(X7)(X8)G(X9)(X10)(X11)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はAまたはVであってもよく;X2はR、SまたはGであってもよく、X3はP、Y、R、V、I、H、TまたはEであってもよく;X4はS、D、EまたはNであってもよく;X5はD、AまたはTであってもよく;X6はS、G、TまたはAであってもよく;X7はI、A、R、Q、またはVであってもよく;X8はA、E、K、GまたはTであってもよく;X9はMまたはIであってもよく;X10はD、L、Q、V、NまたはGであってもよく;X11はV、R、N、EまたはKであってもよい;
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L1:配列番号103;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L2:配列番号104;および
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L3:配列番号105。
a)アミノ酸配列G(X1)I(X2)S(X3)SYYW(X4)を含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSまたはPであってもよく、X2はS、HまたはRであってもよく、X3はSまたはGであってもよく、X4はG、I、NまたはVであってもよい;
b)アミノ酸配列SISYSA(X1)TYYNPSLKSを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はSまたはTであってもよい;
c)アミノ酸配列(X1)(X2)D(X3)(X4)Y(X5)(X6)(X7)(X8)G(X9)(X10)(X11)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はAまたはVであってもよく、X2はR、SまたはGであってもよく、X3はP、Y、R、V、I、H、TまたはEであってもよく、X4はS、D、EまたはNであってもよく、X5はD、AまたはTであってもよく、X6はS、G、TまたはAであってもよく、X7はI、A、R、Q、またはVであってもよく、X8はA、E、K、GまたはTであってもよく、X9はMまたはIであってもよく、X10はD、L、Q、V、NまたはGであってもよく、X11はV、R、N、EまたはKであってもよい;
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号103に示されるCDR-L1;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号104に示されるCDR-L2;および
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号105に示されるCDR-L3。
a)アミノ酸配列G(X1)I(X2)SSSYYW(X3)を含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSまたはPであってもよく;X2はHまたはRであってもよく;X3はG、IまたはNであってもよい;
b)アミノ酸配列SISYSA(X1)TYYNPSLKSを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はSまたはTであってもよい;および
c)アミノ酸配列A(X1)D(X2)SYD(X3)(X4)AGM(X5)(X6)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はR、SまたはGであってもよく、X2はPまたはVであってもよく、X3はSまたはAであってもよく、X4はA、R、IまたはVであってもよく、X5はD、Q、またはGであってもよく、X6はVまたはRであってもよい。
a)アミノ酸配列G(X1)I(X2)SSSYYW(X3)を含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSまたはPであってもよく;X2はHまたはRであってもよく;X3はG、IまたはNであってもよい;
b)アミノ酸配列SISYSA(X1)TYYNPSLKSを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はSまたはTであってもよい;
c)アミノ酸配列A(X1)D(X2)SYD(X3)(X4)AGM(X5)(X6)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はR、SまたはGであってもよく、X2はPまたはVであってもよく、X3はSまたはAであってもよく、X4はA、R、IまたはVであってもよく、X5はD、Q、またはGであってもよく、X6はVまたはRであってもよい;
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L1:配列番号103;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L2:配列番号104;および
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L3:配列番号105。
a)アミノ酸配列G(X1)I(X2)SSSYYW(X3)を含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSまたはPであってもよく;X2はHまたはRであってもよく;X3はG、IまたはNであってもよい;
b)アミノ酸配列SISYSA(X1)TYYNPSLKSを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はSまたはTであってもよい;
c)アミノ酸配列A(X1)D(X2)SYD(X3)(X4)AGM(X5)(X6)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はR、SまたはGであってもよく、X2はPまたはVであってもよく、X3はSまたはAであってもよく、X4はA、R、IまたはVであってもよく、X5はD、Q、またはGであってもよく、X6はVまたはRであってもよい;
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L1:配列番号103;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L2:配列番号104;および
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L3:配列番号105。
a)アミノ酸配列FTFRSYVMHを含んでいるCDR-H1;
b)アミノ酸配列VISHEGS(X1)KYYADSVKGを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はLまたはGである;および
c)アミノ酸配列A(X1)PRIAARRGGFG(X2)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はV、RまたはLであり、X2はY、SまたはTである;
d)アミノ酸配列TRS(X1)G(X2)ID(X3)NYVQを含んでいるCDR-L1であって、ここで、X1はSまたはHであり、X2はN、L、SまたはAであり、X3はN、DまたはYである;
e)アミノ酸配列ED(X1)(X2)RPSを含んでいるCDR-L2であって、ここで、X1はN、FまたはAであり、X2はQ、IまたはVである;および
f)アミノ酸配列Q(X1)YD(X2)(X3)(X4)Q(X5)VVを含んでいるCDR-L3であって、ここで、X1はSまたはGであり、X2はS、F、Y、D、HまたはWであり、X3はN、DまたはSであり、X4はN、A、L、EまたはTであり、X5はG、R、AまたはLである。
a)アミノ酸配列G(X1)I(X2)S(X3)SYYW(X4)を含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSであってもよく、X2はS、HまたはRであってもよく、X3はSまたはGであってもよく、X4はG、I、NまたはVであってもよい;
b)アミノ酸配列SISYS(X1)(X2)TYYを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はGまたはAであってもよく、X2はSまたはTであってもよい;
c)アミノ酸配列A(X1)DPSYDS(X2)AGM(X3)Vを含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はR、SまたはGであってもよく、X2はAまたはIであってもよく、X3はDまたはQであってもよい;
d)アミノ酸配列RAS(X1)(X2)IS(X3)YLNを含んでいるCDR-L1であって、ここで、X1はKまたはQであってもよく、X2はVまたはSであってもよく、X3はSまたはYであってもよい;
e)アミノ酸配列(X1)AS(X2)(X3)QSを含んでいるCDR-L2であって、ここで、X1はY、AまたはSであってもよく、X2はSまたはNであってもよく、X3はLまたはRであってもよい;
f)アミノ酸配列QQ(X1)(X2)D(X3)P(X4)Tを含んでいるCDR-L3であって、ここで、X1はSまたはGであってもよく、X2はFまたはNであってもよく、X3はWまたはFであってもよく、X4はFまたはLであってもよい。
本明細書において開示される新規の抗体およびその抗原結合フラグメント(例えば、Fab)は、高い結合特性によって特徴付けられる。抗体およびフラグメントは、LTBP1-TGFβ1複合体および/またはLTBP3-TGFβ1複合体(大きな潜在型複合体(LLC)としても知られる)に選択的に結合することが可能である。組換えで生産された、精製されたタンパク質複合体を、抗原(例えば、抗原複合体)として用いて、適切なインビトロ結合アッセイにおいて、抗原複合体に結合する抗体の能力をスクリーニング、評価、または確認してよい。かかるアッセイは当技術分野でよく知られており、限定されないが:BLIに基づくアッセイ(例えばOctet(登録商標))およびSPRに基づくアッセイ(例えばBiacore)を含む。
本開示の一部の態様は、単離されたポリペプチドに関する。例えば、一実施態様では、本発明は、表5に提供されるCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、またはCDRL3、またはそれらの組み合わせを含む単離されたポリペプチドを提供する。例示的な一実施態様では、単離されたポリペプチドは、表5に提供されるCDRH1、CDRH2、およびCDRH3を含むことができる。他の実施態様では、単離されたポリペプチドは、表5に提供されるCDRL1、CDRL2、およびCDRL3を含むことができる。一部の実施態様では、ポリペプチドは、表5に提供されるCDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2、またはCDRL3、またはそれらの組み合わせのいずれか1つにおける対応するCDR領域と比較して、6、5、4、3、2、または1個までのアミノ酸残基変動を含むことができる。一実施態様では、本発明は、配列番号7を含む単離されたポリペプチドを提供する。別の実施態様では、本発明は、配列番号8を含む単離されたポリペプチドを提供する。別の実施態様では、本発明は、配列番号7および配列番号8を含む単離されたポリペプチドを提供する。この実施態様では、配列番号7および配列番号8は、リンカーペプチドによって連結することができてもよい。一部の実施態様では、ポリペプチドは、重鎖可変ドメインである。一部の実施態様では、ポリペプチドは、配列番号7と少なくとも75%(例えば、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%)同一である。一部の実施態様では、ポリペプチドは、軽鎖可変ドメインである。一部の実施態様では、ポリペプチドは、配列番号8と少なくとも75%(例えば、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%)同一である。
一部の実施態様では、本開示の抗体、その抗原結合部分、および/または組成物は、核酸分子によってコードされてよい。かかる核酸分子は、制限されずに、DNA分子、RNA分子、ポリヌクレオチド、オリゴヌクレオチド、mRNA分子、ベクター、プラスミドなどを含む。一部の実施態様では、本開示は、本開示の化合物および/または組成物をコードする核酸分子を発現するようにプログラムまたは生産された細胞を含んでよい。
本分野は、本開示の抗体、またはその抗原結合フラグメントを取得するために用いられ得る様々な技術および方法に精通している。例えば、抗体は、組換えDNA方法、ハイブリドーマ技術、ファージまたは酵母ディスプレイ技術、トランスジェニック動物(例えば、XenoMouse(登録商標))またはそれらの何らかの組み合わせを用いて生産することができる。
本明細書中に記載の一部の方法では、特定の抗原(例えば、LTBP1-TGFβ1複合体および/またはLTBP3-TGFβ1複合体)を用いて、非ヒト動物(「宿主」)、例えば、齧歯類、例えば、マウス、ハムスター、またはラットに免疫付与することができる。一実施態様では、非ヒト動物はマウスである。別の実施態様では、宿主はラクダ類であってよい。
一部の実施態様では、抗体を作製または同定する方法またはプロセスは、抗体またはそのフラグメント(例えば、scFv)を発現するタンパク質発現ライブラリー、例えば、ファージ、酵母、またはリボソーム・ディスプレイ・ライブラリーをスクリーニングするステップを含む。例えば、ヒトコンビナトリアル抗体またはscFvフラグメントのライブラリーを、ファージまたは酵母上に合成することができ、それから、そのライブラリーを、目的の抗原またはその抗体結合部分を用いてスクリーニングして、抗原に結合するファージまたは酵母を単離して、そこから抗体または免疫反応性フラグメントを取得してよい(Vaughanら、1996、PMID:9630891;Sheetsら、1998、PMID:9600934;Boderら、1997、PMID:9181578;Pepperら、2008、PMID:18336206)。
本発明の抗体またはフラグメントは、好ましくは完全ヒト抗体またはヒト化抗体である。したがって、由来が何であれ、当該方法は、1つまたは複数の抗体またはそのフラグメントをヒト化するステップを含んでよく、ここでヒト抗体配列は、当該分野で公知の分子工学技術を用いて作製され得て、本明細書中に記載の発現系および宿主細胞内に導入され得ることが理解されよう。そのような非天然の組換えによって生産されたヒト抗体(および対象組成物)は、本開示の教示と完全に適合し、本発明の範囲内に明白に含まれる。特定の選択態様では、本発明のLTBP1-TGFβ1複合体結合および/またはLTBP3-TGFβ1複合体結合抗体は、組み換えによって生産されたヒト抗体を含む。
一部の実施態様では、上述の方法によって生産される抗体は、中程度の親和性(約106~107M-1のKa)であってよい。したがって、抗体またはそのフラグメントは、必要に応じて、最適化の一部として親和性成熟のプロセスに供されてよい。用語「親和性成熟」は、当業者によって容易に理解される意味を有する。手短には、候補抗体またはフラグメントのアミノ酸配列(しばしば「親(parent)」と呼ばれる)をさらに改変して、特定の抗原に対して改善された結合プロファイルを達成することを指す。典型的に、親の抗体および親和性成熟の相対物(しばしば「子孫(progeny)」または「子(offspring)」と呼ばれる)は、同一のエピトープを保持する。適切なインビトロ結合アッセイが、親和性成熟プロセス中の適切なステップ(単数または複数)において、改善された結合物質(binder)に関するスクリーニングのために行なわれてよい。任意選択で、一部の実施態様では、機能性アッセイ(例えば、細胞に基づく効能アッセイ)が、所望の機能を確認するために行なわれてもよい。
本開示の抗体、またはその抗原結合部分は、制限されないが、酵素、補欠分子族、蛍光材料、発光材料、生物発光材料、放射性材料、陽電子放出金属、非放射性常磁性金属イオン、およびLTBP1-TGFβ1複合体またはLTBP3-TGFβ1複合体の検出および/または単離のための親和性標識を含む、検出可能な標識または検出可能な部分によって改変されてよい。検出可能な物質または部分は、本開示のポリペプチドに直接的に、または、適切な技術を用いて中間体(例えばリンカーなど(例えば、切断可能なリンカー))を通して間接的に、連結またはコンジュゲートされてよい。適切な酵素の非限定的な例は、ホースラディッシュペルオキシダーゼ、アルカリフォスファターゼ、β-ガラクトシダーゼ、グルコースオキシダーゼ、またはアセチルコリンエステラーゼを含み;適切な補欠分子族複合体の非限定的な例は、ストレプトアビジン/ビオチンおよびアビジン/ビオチンを含み;適切な蛍光材料の非限定的な例は、ビオチン、ウンベリフェロン、フルオレセイン、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、ジクロロトリアジニルアミンフルオレセイン、塩化ダンシル、またはフィコエリトリンを含み;発光材料の例は、ルミノールを含み;生物発光材料の非限定的な例は、ルシフェラーゼ、ルシフェリン、およびエクオリンを含み;適切な放射性材料の例は、放射性金属イオン、例えば、α-エミッターまたは他の放射性同位体、例えば、ヨウ素(131I、125I、123I、121I)、炭素(14C)、硫黄(35S)、トリチウム(3H)、インジウム(115mIn、113mIn、112In、111In)、およびテクネチウム(99Tc、99mTc)、タリウム(201Ti)、ガリウム(68Ga、67Ga)、パラジウム(103Pd)、モリブデン(99Mo)、キセノン(133Xe)、フッ素(18F)、153Sm、Lu、159Gd、149Pm、140La、175Yb、166Ho、90Y、47Sc、86R、188Re、142Pr、105Rh、97Ru、68Ge、57Co、65Zn、85Sr、32P、153Gd、169Yb、51Cr、54Mn、75Se、およびスズ(113Sn、117Sn)を含む。検出可能な物質は、LTBP1-TGFβ1複合体および/またはLTBP3-TGFβ1複合体に特異的に結合する本開示の抗体に直接的に、または、適切な技術を用いて中間体(例えばリンカーなど)を介して間接的に、連結またはコンジュゲートされてよい。検出可能な物質にコンジュゲートされた本明細書において提供される任意の抗体は、本明細書中に記載のものなどの任意の適切な診断アッセイに用いてよい。
一部の実施態様では、本開示の方法は、対象における特定の部位へ、本明細書中に開示される抗体、またはその抗原結合部分を標的化するための1つまたは複数の標的化薬剤の使用であって、そのような薬剤(単数または複数)を目的のニッチに濃縮または局在化させる目的のための使用を含む。一部の実施態様では、かかる標的化は、LTBP1-TGFβ1複合体および/またはLTBP3-TGFβ1複合体からの成熟TGFβ放出の調整を達成し得る。例えば、LTBP1-TGFβ1およびLTBP3-TGFβ1複合体は、典型的に、細胞外マトリックスに局在化する。したがって、一部の実施態様では、本明細書中に開示される抗体は、LTBP1-TGFβ1およびLTBP3-TGFβ1複合体が存在する部位へ抗体を局在化させる目的のために細胞外マトリックス標的化薬剤にコンジュゲートすることができる。そのような実施態様では、抗体の選択的標的化は、LTBP1-TGFβ1および/またはLTBP3-TGFβ1複合体の選択的な調整へと導く。一部の実施態様では、抗体の選択的標的化は、LTBP1-TGFβ1および/またはLTBP3-TGFβ1複合体の選択的阻害へと導く(例えば、線維症を治療する目的のため)。一部の実施態様では、細胞外マトリックス標的化薬剤は、ヘパリン結合剤、マトリックスメタロプロテイナーゼ結合剤、リシルオキシダーゼ結合ドメイン、フィブリリン結合剤、ヒアルロン酸結合剤、およびその他を含む。
組織病理学、毒物学
上述のように、全てのTGFβアイソフォーム、すなわち、TGFβ1、TGFβ2およびTGFβ3に拮抗する公知のpan-阻害剤は、複数の哺乳類種にわたって様々な毒性を引き起こすことが証明されている。最も顕著な公知の毒性は、心血管系の毒性(例えば弁膜症)および上皮過形成、皮膚病変、炎症および出血を含む。より具体的には、文献に報告されるpan-TGFβ阻害剤(例えば、TGFβRの小分子拮抗薬および非選択的中和抗体)と関連する観察される毒性の一部は、以下を含む。
サイトカインは、正常な免疫応答において重要な役割を果たしているが、免疫系が過剰活性にトリガーされると、サイトカイン産生の正のフィードバック・ループが「サイトカイン・ストーム」または高サイトカイン血症へと導く可能性があり、その状況においては、過剰なサイトカイン産生が、臓器、特に肺および腎臓を損傷させ得る免疫応答を引き起こし、死さえもたらす。そのような状態は、血清中の著しく高い炎症促進性サイトカインによって特徴付けられる。歴史的に、健常者における抗-CD28モノクローナル抗体TGN1412の第1相試験は、炎症促進性サイトカインの予期されない全身性および迅速な誘導によって生じる生命を脅かす「サイトカイン・ストーム」応答をもたらした(Suntharalingam G et al.N Engl J Med.2006 Sep 7;355(10):1018-28)。この出来事は、T細胞の薬理学刺激と関連する潜在的危険性の高い意識を刺激した。
本発明は、ヒトおよび非ヒト対象における投与に適切な薬品として用いられる医薬組成物をさらに提供する。LTBP1-TGFβ1複合体および/またはLTBP3-TGFβ1複合体に選択的に結合する1つまたは複数の抗体は、薬学的に許容できる担体(賦形剤)(例えばバッファーを含む)とともに処方または混合されて、医薬組成物を形成することができる。かかる製剤は、TGFβシグナリングまたはその調節不全を伴う疾患または障害の治療のために用いられ得る。一部の実施態様では、TGFβシグナリングと関連するそのような疾患または障害は、1つまたは複数のコンテキストを含み、すなわち、TGFβは、特定のタイプ(単数または複数)の提示分子と関連する。一部の実施態様では、そのようなコンテキストは、細胞型特異的および/または組織特異的な様式で生じる。一部の実施態様では、例えば、TGFβシグナリングのそのようなコンテキスト依存性の作用は、部分的に、GARP、LRRC33、LTBP1および/またはLTBP3を介して仲介される。
本明細書中に記載の、LTBP1/3-TGFβ1複合体に選択的に結合する阻害剤、例えば、抗体およびその抗原結合部分は、LTBP1またはLTBP3と関連するTGFβ1活性の調整が所望である多種多様の適用において用いることができる。
出願人は、限定されないが、がんおよび線維症を含む、TGFβ1調節不全を伴う様々な疾患および障害を治療するのに有用であり得る、TGFβ1のいわゆる「コンテキスト非依存性(context-independent)」阻害剤を以前に説明した(例えば:PCT/US2017/021972およびPCT/US2018/012601を参照)。伝統的なTGFβ1拮抗薬とは異なり、これらのコンテキスト非依存性TGFβ1阻害剤は、TGFβ1アイソフォームを選択的に標的化することが可能である。しかしながら、TGFβ1アイソフォームによって駆動される多面的な生物学的機能の範囲内で、コンテキスト非依存性阻害剤は、組織特異的(したがって、コンテキスト特異的)proTGFβ1複合体を区別せず、したがって、そのような阻害剤は、結合することによって任意の提示分子-proTGFβ1複合体からの成熟増殖因子の放出および活性化を阻害することができる。
本発明は、LTBP1関連および/またはLTBP3関連TGFβのコンテキスト特異的阻害剤を含む。かかる阻害剤はしたがって、ECM関連の潜在型TGFβ複合体(例えば、LTBP1-proTGFβ1および/またはLTBP3-proTGFβ1)を特異的に標的化することが可能であり、それにより、疾患環境、例えば、線維化組織における潜在型複合体からの成熟TGFβ増殖因子の放出を阻害する。かかる阻害剤は、GARP-proTGFβ1複合体に対する有意な結合活性を示さず、それにより、不要な全身性免疫の調整を最小化させる。かかる抗体は、ECMの異常な再構築および/または剛性のようなECM調節不全を伴う状態の治療での使用に有利であり得る。
TGFβの、その潜在型複合体からの活性化は、力依存性の様式でインテグリンによって、および/または、プロテアーゼによってトリガーされ得る。証拠は、限定されないが、Ser/Thrプロテアーゼ、例えば、トロンビン、カリクレイン、ケモトリプシン、エラスターゼ、プラスミン、ならびに、ADAM10およびADAM17のようなADAMファミリーの亜鉛メタロプロテアーゼ、ならびに、MMP-2、MMP-9およびMMP-13のようなMMPファミリーを含む特定のクラスのプロテアーゼが、プロセスに関与し得ることを示唆している。MMP-2は、基底膜の最も大量の構成要素であるコラーゲンIVを分解し、ECM関連のTGFβ1調節において役割を果たし得るという可能性を高める。MMP-9は、腫瘍進行、血管新生、間質再構築および転移において中心的な役割を果たすと考えられている。したがって、ECMにおけるTGFβ1のプロテアーゼ依存性の活性化は、がん治療に重要であり得る。
細胞外マトリックスは、細胞を取り囲む細胞分泌ネットワークであり、主にプロテオグリカンおよび繊維状タンパク質からなり、その最も多くがコラーゲンである。本明細書において開示される新規の抗体は、細胞外マトリックス調節不全と関連する疾患の治療において用いられ得る。細胞外マトリックス調節不全と関連する疾患は、典型的に筋線維芽細胞によって駆動される病理であり、がん、線維症、および心血管系の疾患を含む(例えば、Lampi and Reinhart-King (2018)「Targeting extracellular matrix stiffness to attenuate disease: From molecular mechanisms to clinical trials」Sci Tarnsl Med 10(422):eaao0475に概説される)。線維性状態の進行は、ECM内に沈着するマトリックス構成要素のレベルの増大および/またはECMの維持/再構築を伴う。TGFβ1は、少なくとも部分的にこのプロセスに寄与する。このことは、例えば、コラーゲンのようなECM構成要素の沈着の増大が、ECMの機械的物性(例えば、マトリックス/基材の剛性)を変更させ得るという観察によって支持され、この現象はTGFβ1シグナリングと関連する。本明細書中に記載のもののようなTGFβ1の阻害剤は、ECMの変更を伴う疾患の進行、例えば線維症に対抗するために、このプロセスをブロックするために用いられ得る。そのような阻害剤のLTBPアームは、LTBP1および/またはLTBP3によって提示されるECM関連pro/潜在型TGFβ複合体を直接的にブロックすることができ、それにより、疾患ニッチにおける複合体からの増殖因子の活性化/放出を防止する。一部の実施態様では、本明細書中に記載のもののようなアイソフォーム特異的TGFβ1阻害剤は、ECM剛性を正常化させて、インテグリン依存性シグナリングが関与する疾患を治療し得る。一部の実施態様では、インテグリンは、α11鎖、β1鎖、または両方を含む。
EMT(上皮間葉転換)は、固い結合を有する上皮細胞を、間葉の特性(表現型)に変える、例えば細胞間の接触を緩めるプロセスである。そのプロセスは、複数の正常な生物学的プロセス、ならびに、胚形成、創傷治癒、がん転移および線維症を含む病理学的状況において観察される(例えば、Shiga et al.(2015)「Cancer-Associated Fibroblasts:Their Characteristics and Their Roles in Tumor Growth.」Cancers,7:2443-2458に概説される)。一般に、EMTシグナルは主にTGFβによって誘導されると考えられる。多くのタイプのがんは、例えば、間葉表現型へ向かう細胞の分化転換を伴うと考えられ(例えばCAF)、それは、より不良な予後と相関する。したがって、本明細書中に記載のもののようなTGFβ1のLTBP特異的阻害剤は、EMTによって開始または駆動される疾患を治療するために用いられ得る。実際に、本明細書において例示されるデータは(例えば、図12および13)、そのような阻害剤が、α-SMA、Col1(I型コラーゲン)、およびFN(フィブロネクチン)のようなCAFマーカーのインビボでの発現を抑制する能力を有することを示す。
線維性状態の進行は、ECM内に沈着するマトリックス構成要素のレベルの増大および/またはECMの維持/再構築を伴う。TGFβ1は、少なくとも部分的にこのプロセスに寄与する。このことは、例えば、コラーゲンのようなECM構成要素の沈着の増大が、ECMの機械的物性(例えば、マトリックス/基材の剛性)を変更させ得るという観察によって支持され、この現象はTGFβ1シグナリングと関連する。この概念を確認するために、本発明者らは、proTGFβおよびLTBP1でトランスフェクトされて所定の剛性(例えば、5kPa、15kPaまたは100kPa)を有するシリコン系の基材上で増殖された一次線維芽細胞における、TGFβのインテグリン依存性活性化に影響を与えるマトリックス剛性の役割を評価した。より高い剛性を有するマトリックスはTGFβ1活性化を高め、これは、結合してそれによりLTBP1/3と関連するTGFβ1活性化を阻害することが可能な抗体、およびその抗原結合部分によって抑制され得る。これらの観察は、TGFβ1が、ECM特性(例えば剛性)に影響を及ぼし、その結果、疾患進行を反映するTGFβ1活性化をさらに誘導し得ることを示唆する。したがって、本明細書中に記載のもののようなLTBP1-TGFβ1および/またはLTBP3-TGFβ1の複合体に選択的に結合する抗体、およびその抗原結合部分は、ECMの変更を伴う疾患進行、例えば、線維症、腫瘍増殖、浸潤、転移および線維増生に対抗するために、このプロセスをブロックするために用いられ得る。そのような阻害剤は、LTBP1および/またはLTBP3によって提示されるECM関連pro/潜在型TGFβ複合体を直接的にブロックし、それにより、疾患ニッチにおける複合体からの増殖因子の活性化/放出を防止することができる。
物理的損傷(damage)/外傷(trauma)、毒性物質、および/または感染に起因する組織損傷(injury)または慢性の損傷(insult)に応答して、線維芽細胞、いくつかの異なるタイプの免疫細胞、および常在性の上皮および内皮細胞を含むいくつかの細胞型を含む自然な修復プロセスが始まる。しかしながら、チェックされないままの場合、このプロセスは、細胞外マトリックス(ECM)の過剰な蓄積および線維症をもたらし得て、その結果、組織機能の進行性の喪失および臓器不全をもたらし得る(Caja et al.,Int.J.Mol.Sci.2018,19,1294)。
i)脂肪肝の指標(BMI、腹囲、血清トリグリセリド、およびγ-グルタミルトランスフェラーゼ(GGT);
ii)肝臓脂肪症の指標(血清アスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ(AST):アラニンアミノトランスフェラーゼ(ALT)比、BMI、性別、および真性糖尿病の存在);
i)NAFLD肝臓脂肪スコア(血清ALT、HDLコレステロール、トリグリセリド(triglicerides)、ヘモグロビンA1cおよび白血球カウント);
ii)SteatoTest(BioPredictive)(以下の血清レベル:総ビリルビン、GGT、α2-マクログロビン、ハプトグロビン、ALT、アポリポタンパク質AI、総コレステロール、トリグリセリド、グルコース(年齢および性別に合わせる)およびBMI);および
iii)NAFLDリッジスコア(以下の血清レベル:ALT、HDLコレステロール、トリグリセリド、ヘモグロビンA1c、白血球カウント、および併存症データ(および高血圧の存在))。
i)アポトーシスマーカー、例えば、CK18フラグメント、総サイトケラチンおよびsFAS;
ii)炎症性マーカー、例えば、CRP、TNF、IL-8、およびCXCL10;
iii)脂質酸化産物、例えば、11-HETE、9-HODE、13-HODE、12-oxo-ODE、LA-13-HODE(oxNASHscore)、および11,12-diHETrE;
iv)リソソーム酵素、例えば、カテプシンD;および
v)組み合わせのパネル、例えば、NASHTest(BioPredictive)およびNASH診断パネル(真性糖尿病の存在、性別、BMI、ならびに、トリグリセリド、CK18フラグメント、および総CK18の血清レベルを含む)。
TGFβが、筋肉の恒常性、修復、および再生において重要な役割を果たすことを示す証拠が蓄積している。LTBP関連TGFβシグナリングを選択的に調整する本明細書中に記載のモノクローナル抗体のような薬剤は、より広範に作用するTGFβ阻害剤と関連する毒性を伴わずに、例えば、慢性/遺伝性筋ジストロフィー、眼/外眼筋の先天性線維症、および急性筋損傷において、損傷した筋線維を治療するのに効果的であり得る。
本明細書において開示される方法を実施するために、有効量の上述の医薬組成物を、適切な経路、例えば静脈内投与を介して、例えばボーラスとして、または長年にわたる連続的なインフュージョンによって、筋肉内、腹腔内、脳脊髄内、皮下、関節内、関節滑液嚢内、髄腔内、経口、吸入または局所経路によって、治療を必要とする対象(例えばヒト)へ投与することができる。線維症および/または代謝状態の治療で用いられる場合、好ましくは、TGFβ阻害剤は皮下投与される。ジェット噴霧器および超音波噴霧器を含む液体製剤用の市販される噴霧器は、投与に有用である。液体製剤を直接噴霧することができ、および、凍結乾燥粉末を再構成後に噴霧することができる。あるいは、LTBP1-TGFβ複合体および/またはLTBP3-TGFβ複合体に選択的に結合する阻害剤、例えば、抗体、またはその抗原結合部分は、フッ化炭素製剤および定量吸入器を用いてエアロゾル化することができ、または、凍結乾燥および破砕された粉体として吸入することができる。
TGFβの阻害剤は、アイソフォーム非選択的阻害剤およびアイソフォーム選択的阻害剤を含み、前者は公知のTGFβ阻害剤/拮抗薬の大部分である。アイソフォーム非選択的阻害剤の中には、pan-阻害剤(TGFβ1/2/3阻害剤)、TGFβ1/2阻害剤およびTGFβ1/3阻害剤がある。アイソフォーム選択的阻害剤は、1つのアイソフォームに選択的に結合する中和抗体およびアイソフォーム選択的な様式で潜在型proTGFβ複合体を標的化する活性化阻害剤を含む。活性化阻害剤のクラスは、コンテキスト非依存性およびコンテキスト選択的阻害剤を含む。例えば、LTBP1/3、GARP、またはLRRC33によって提示されたpro/潜在型TGFβ1に結合し、提示分子複合体からの成熟TGFβ1の放出を阻害する、アイソフォーム特異的、コンテキスト非依存性TGFβ1阻害剤も記載されている(例えば、WO2017/156500、WO2020/014473およびWO2020/014460を参照)。前述の出願のそれぞれの内容全体は、参照により本明細書中に援用される。GARP-TGFβ1複合体に選択的に結合してGARPのコンテキストにおいて提示されるTGFβ1の活性化を阻害するコンテキスト特異的抗体が、近年のWO2018/013939に記載されている。
様々な疾患状態におけるTGFβ1シグナル伝達パスウェイの異常な活性化は、複数のマーカーの遺伝子発現の変更と関連することが観察されている。これらの遺伝子発現マーカー(例えばmRNAによって測定される)は、限定されないが:Serpine1(PAI-1をコードする)、MCP-1(CCL2としても知られる)、Col1a1、Col3a1、FN1、TGFβ1、CTGF、ACTA2(α-SMAをコードする)、SNAI1(E-カドヘリン(Cdh1)を下方調節することにより、線維症および転移においてEMTを駆動する)、MMP2(EMTと関連するマトリックスメタロプロテアーゼ)、MMP9(EMTと関連するマトリックスメタロプロテアーゼ)、TIMP1(EMTと関連するマトリックスメタロプロテアーゼ)、FOXP3(Treg誘導のマーカー)、CDH1(TGFβによって下方調節されるEカドヘリン(上皮細胞のマーカー))、および、CDH2(TGFβによって上方調節されるNカドヘリン(間葉系細胞のマーカー))を含む。興味深いことに、これらの遺伝子の多くは、様々なタイプの臓器線維症を含む疾患状態の様々なセットにおいて、ならびに、骨髄線維症を含む多くのがんにおいて、役割を果たすことが含意される。実際に、線維性状態と、異常な細胞増殖、腫瘍形成および転移との間の病態生理学的関連が示唆されている。例えば、Cox and Erler (2014)Clinical Cancer Research 20(14):3637-43「Molecular pathways:connecting fibrosis and solid tumor metastasis」;Shiga et al.(2015)Cancers 7:2443-2458「Cancer-associated fibroblasts: their characteristics and their roles in tumor growth」;Wynn and Barron(2010)Semin. Liver Dis. 30(3): 245-257「Macrophages:master regulators of inflammation and fibrosis」を参照し、その内容は参照により本明細書中に援用される。特定の理論によって拘束されることを望まずに、本開示の発明者らは、TGFβ1シグナリング経路が、実際にこれらの広範な病理間の重要な関連であり得ると考える。
本開示は、インビボでTGFβ1阻害によって利益を受け得る対象を治療するための併用療法として用いられる、医薬組成物および関連方法をさらに包含する。任意のこれらの実施態様では、かかる対象は、少なくとも1つのTGFβ1阻害剤、例えば、本明細書に記載の抗体またはその抗原結合部分を含む第1の組成物を、同一または重複する疾患または臨床状態を治療することが意図される少なくとも1つのさらなる治療を含む第2の組成物とともに含む、併用療法を受け得る。第1および第2の組成物は両方とも、同一の細胞標的、または別個の細胞標的に対して作用し得る。一部の実施態様では、第1および第2の組成物は、疾患または臨床状態の症候または態様の同一または重複するセットを治療または緩和し得る。一部の実施態様では、第1および第2の組成物は、疾患または臨床状態の症候または態様の別個のセットを治療または緩和し得る。一例であるが提供すると、第1の組成物は、TGFβ1シグナリングと関連する疾患または症状を治療し得て、一方で、第2の組成物は、同一の疾患と関連する炎症または線維症などを治療し得る。かかる併用療法は、互いとともに施されてよい。併用療法の文脈における語句「とともに」は、第1の療法の治療的効果が、併用療法を受ける対象において、第2の療法の治療的効果と時間的および/または空間的に重複することを意味する。したがって、併用療法は、同時的な投与のための単一製剤、または療法の連続的投与のための別個の製剤として、処方され得る。
一部の実施態様では、本明細書において提供される方法および組成物は、対象から得られたサンプルにおけるLTBP1-TGFβ1複合体および/またはLTBP3-TGFβ1複合体を検出する方法に関する。本明細書において用いられる「対象」は、個々の生物、例えば、個々の哺乳類を指す。一部の実施態様では、対象はヒトである。一部の実施態様では、対象は非ヒト哺乳類である。一部の実施態様では、対象は非ヒト霊長類である。一部の実施態様では、対象は齧歯類である。一部の実施態様では、対象はヒツジ、ヤギ、ウシ、家禽、ネコ、またはイヌである。一部の実施態様では、対象は、脊椎動物、両生類、爬虫類、魚類、昆虫、ハエ、または線虫である。一部の実施態様では、対象は研究動物である。一部の実施態様では、対象は、遺伝学的に操作された、例えば、遺伝学的に操作された非ヒト対象である。対象は、いずれの性別および任意の進行ステージであってよい。一部の実施態様では、対象は、患者または健常者である。
TGFβの活性化(および、抗体のようなTGFβ試験阻害剤によるその阻害)は、当技術分野で知られている任意の適切な方法によって測定され得る。例えば、インテグリンによって仲介されるTGFβの活性化は、本明細書においてさらに詳細に説明されるように、「CAGA12」ルシフェラーゼアッセイのような細胞に基づくアッセイにおいて使用することができる。そのようなアッセイシステムは、以下の構成要素:i)TGFβの由来(組み換え、内因性またはトランスフェクト);ii)インテグリンの由来(組み換え、内因性、またはトランスフェクト);およびiii)TGFβ活性化に応答するレポーターシステム、例えば、TGFβに応答して、シグナルを読み出し可能なアウトプット(例えば、CAGA12細胞または他のレポーター細胞株におけるルシフェラーゼ活性)に変換することが可能な、TGFβ受容体を発現している細胞を含んでよい。一部の実施態様では、レポーター細胞株は、TGFβ応答性プロモーター(例えば、PAI-1プロモーター)の制御下のレポーター遺伝子(例えば、ルシフェラーゼ遺伝子)を含む。一部の実施態様では、感受性を与える特定のプロモーターエレメントが、レポーターシステム内に取り込まれてよい。一部の実施態様では、そのようなプロモーターエレメントは、CAGA12エレメントである。アッセイにおいて用いられ得るレポーター細胞株は、例えば、Abe et al.(1994)Anal Biochem.216(2):276-84に記載されており、参照により本明細書中に援用される。一部の実施態様では、前述のアッセイ構成要素のそれぞれは、同じ由来(例えば、同じ細胞)から提供される。一部の実施態様では、前述のアッセイ構成要素のうちの2つは同じ由来から提供され、第3のアッセイ構成要素は異なる由来から提供される。一部の実施態様では、全ての3つのアッセイ構成要素は異なる由来から提供される。例えば、一部の実施態様では、インテグリンおよび潜在型TGFβ複合体(proTGFβおよび提示分子)は、同一の由来(例えば、同一のトランスフェクトされた細胞株)からアッセイのために提供される。一部の実施態様では、インテグリンおよびTGFは、別個の由来(例えば、2つの異なる細胞株、精製されたインテグリンおよびトランスフェクトされた細胞の組み合わせ)からアッセイのために提供される。1つまたは複数のアッセイ構成要素の由来として細胞が用いられる場合、アッセイのそのような構成要素は、細胞に内因性であってよく、細胞内に安定的に発現されてよく、一時的にトランスフェクトされてよく、またはそれらの任意の組み合わせであってよい。
本開示は、TGFβ関連の徴候と関連する疾患/障害を緩和させる使用のためのキットも提供する。そのようなキットは、LTBP1-TGFβ1複合体および/またはLTBP3-TGFβ1複合体に選択的に結合する阻害剤、例えば、抗体、またはその抗原結合部分、例えば、本明細書中に記載される任意のものを含んでいる1つまたは複数のコンテナーを含んでよい。
TGFβ1阻害療法を含む治療的方法は、TGFβ1徴候の診断および/またはそのような療法に反応する可能性がある患者の選択を含んでよい。さらに、TGFβ1阻害剤を受ける患者は、治療の治療的効果について監視されてよく、それは典型的に、状態を示すものであって治療の前および後に測定され得る(例えばアッセイされ得る)1つまたは複数の適切なパラメーターの測定、および、治療と関連するパラメーター変化の評価を含む。例えば、そのようなパラメーターは、患者から回収された生物学的サンプル中に存在するバイオマーカーのレベルを含んでよい。バイオマーカーは、RNAに基づいてよく、タンパク質に基づいてよく、細胞に基づいてよく、および/または組織に基づいてよい。例えば、特定の疾患状態において過剰発現される遺伝子は、疾患または療法に対する応答を診断および/または監視するためのバイオマーカーとして働き得る。疾患関連の細胞集団の細胞表面タンパク質は、バイオマーカーとして働き得る。そのような方法は、特定の疾患の程度を示す疾患パラメーターの直接的な測定を含んでよい。血清/血液サンプル、生検、およびイメージングのような任意の適切なサンプリング方法を用いてよい。
本発明は、スクリーニング方法、生産方法およびhLTBP1-proTGFβ1複合体および/またはhLTBP3-proTGFβ1複合体に結合して遅い速度で解離する抗体またはそのフラグメントの製造プロセス、ならびに、医薬組成物およびそれを含んでいる関連するキットを包含する。
SR-AB1をコントロールとして用いた。SR-AB1は、提示分子と関係なく潜在型TGFβ1に結合する(図2Aを参照)。
潜在型TGFβ2またはTGFβ3への検出可能な結合がなく潜在型TGFβ1プロドメインに結合し、インテグリンによって仲介される潜在型TGFβ1の活性化をインビトロでコンテキスト依存性によって阻害するアイソフォーム特異的阻害剤を同定するために、新規の機能性アッセイが必要であった。本発明以前、LTBPにのみ結合するアイソフォーム特異的TGFβ1抗体を検出することのできるアッセイは利用可能でなかった。特に、以前のアッセイ形式は、内因性提示分子によって提示されるproTGFβ1の活性化と、外因性LTBPによって提示されるproTGFβ1の活性化との間を区別することができなかった。インテグリン発現細胞を直接トランスフェクトすることにより、本明細書において開示される新規のアッセイは、内因性の提示因子(presenter)-proTGFβ1活性と外来性LTBP-proTGFβ1活性との間のウインドウを確立する。LTBP-proTGFβ1複合体は細胞外マトリックス内に埋め込まれているので、アッセイプレートコーティングもまた、アッセイの重要な構成要素である。ECMタンパク質フィブロネクチンでコーティングされた高結合プレートの使用は、LTBPアッセイをより強く(robust)させた。換言すれば、本開示以前、proTGFβ1トランスフェクションと、LTBP1/3+proTGFβ1の共トランスフェクションとの間に、アッセイ・ウインドウは存在しなかった。本発明以前、唯一利用可能なアッセイ形式は、トリプル共培養システム:トランスフェクタント(潜在型TGFβ提示細胞)+インテグリン発現細胞(アクチベーター)+CAGA細胞(レポーター)であった。最初の2つの細胞集団を組み合わせて、インテグリン発現細胞を、TGFβおよび提示分子とともに直接トランスフェクトすることにより、LTBP-proTGFβ1活性化に関するウインドウを本明細書において確立した。
図3Aに示されるアッセイについて、以下のプロトコルを開発した。このアッセイは、インテグリン細胞による細胞外マトリックス(LTBPによって提示される)活性化に最適である。
・ MvLu1-CAGA12細胞(クローン4A4)
・ SW480/β6細胞(クローン1E7)(αVサブユニットは高レベルで内因的に発現され;β6サブユニットは安定的に過剰発現される)
・ Costarの白い壁の(white walled)TC処理96ウェルアッセイプレート#3903
・ Greiner Bio-One High Bindingの白いμclear96ウェルアッセイプレート#655094
・ ヒトフィブロネクチン(Corning#354008)
・ P200マルチチャネル・ピペット
・ それぞれに関して滅菌フィルターチップを有する、P20、P200、およびP1000ピペット
・ 滅菌マイクロチューブおよびラック
・ 滅菌試薬リザーバー
・ 0.4%トリパンブルー
・ 2mL、5mL、10mL、および25mL滅菌ピペット
・ 組織培養処理100mmまたは150mmプレート
・ 70%エタノール
・ Opti-MEM還元血清培地(Life Tech#31985-070)
・ リポフェクタミン3000(Life Tech#L3000015)
・ Bright-Gloルシフェラーゼアッセイ試薬(Promega#E2620)
・ 0.25%トリプシン+0.53mM EDTA
・ proTGFb1発現プラスミド、ヒト(SR005)
・ LTBP1S発現プラスミド、ヒト(SR044)
・ LTBP3発現プラスミド、ヒト(SR117)
・ LRRC32(GARP)発現プラスミド、ヒト(SR116)
・ LRRC33発現プラスミド、ヒト(SR386)
・ BioTek Synergy H1プレートリーダー
・ TCフード
・ ベンチトップ遠心分離機
・ CO2インキュベーター37℃ 5%CO2
・ 37℃水/ビーズバス
・ プラットフォーム・シェイカー
・ 顕微鏡
・ 血球計数器/countess
・ CAGA12 4A4細胞:ルシフェラーゼ遺伝子発現を駆動する、CAGA12合成プロモーターで安定的にトランスフェクトされた、MvLu1細胞(ミンク肺上皮細胞)の誘導体
・ DMEM-0.1%BSA:アッセイ培地;基礎培地はDMEM(Gibcoカタログ番号11995-065)であり、培地は、0.1%w/vに希釈されたBSA、ペニシリン/ストレプトマイシン、および4mMグルタミンも含む
・ D10:DMEM 10% FBS,P/S,4mMグルタミン、1% NEAA、1X GlutaMAX(Gibcoカタログ番号35050061)
・ SW480/β6培地:D10+1000μg/mL G-418
・ CAGA12(4A4)培地:D10+0.75μg/mLピューロマイシン
0日目に、トランスフェクションのために細胞を蒔いた。SW480/β6(クローン1E7)細胞をトリプシンで分離させて、ペレット化した(200×gでスピン5分)。細胞ペレットをD10培地中に再懸濁させて、生存細胞(/ml)を数えた。細胞を、5.0e6細胞/12ml/100mm TCディッシュで蒔いた。CAGA12細胞については、細胞をT75フラスコあたり100万の密度で継代培養して、3日目にアッセイのために用いた。培養は、37℃および5%CO2でインキュベートした。
このアッセイから得られたデータは、細胞上清におけるTGFβ活性を反映した(図3A)。具体的には、SW480/β6細胞を、LTBP1/3およびproTGFβ1でバルク・トランスフェクトして、上述のようにフィブロネクチン上に蒔いた。生データ単位は、相対発光量(RLU)であった。図3Aは、LTBP1-proTGFβ1および/またはLTBP3-proTGFβ1のトランスフェクションは、TGFβ活性化シグナルを誘導するが、proTGFβ1単独では誘導しないことを示す。
図3Bに示されるアッセイのために、以下のプロトコルを開発した。このアッセイ、すなわち「ダイレクト-トランスフェクション」プロトコルは、インテグリン細胞による細胞表面に提示されたTGFβ1(GARPまたはLRRC33提示因子(presenter))活性化に最適である。LN229細胞は、インテグリンαVβ8を発現する(αVβ6を発現するように改変されたSW480b6細胞株とは対照的である)。
・ MvLu1-CAGA12細胞(クローン4A4)
・ LN229細胞株(高レベルの内因性αVβ8インテグリン)
・ Costarの白い壁のTC処理96ウェルアッセイプレート#3903
・ Greiner Bio-One High Bindingの白いμclear96ウェルアッセイプレート#655094
・ ヒトフィブロネクチン(Corning#354008)
・ P200マルチチャネル・ピペット
・ それぞれに関して滅菌フィルターチップを有するP20、P200、およびP1000ピペット
・ 滅菌マイクロチューブおよびラック
・ 滅菌試薬リザーバー
・ 0.4%トリパンブルー
・ 2mL、5mL、10mL、および25mL滅菌ピペット
・ 組織培養処理100mmまたは150mmプレート
・ 70%エタノール
・ Opti-MEM還元血清培地(Life Tech#31985-070)
・ リポフェクタミン3000(Life Tech#L3000015)
・ Bright-Gloルシフェラーゼアッセイ試薬(Promega#E2620)
・ 0.25%トリプシン+0.53mM EDTA
・ proTGFb1発現プラスミド、ヒト(SR005)
・ LTBP1S発現プラスミド、ヒト(SR044)
・ LTBP3発現プラスミド、ヒト(SR117)
・ LRRC32(GARP)発現プラスミド、ヒト(SR116)
・ LRRC33発現プラスミド、ヒト(SR386)
・ BioTek Synergy H1プレートリーダー
・ TCフード
・ ベンチトップ遠心分離機
・ CO2インキュベーター37℃ 5%CO2
・ 37℃水/ビーズバス
・ プラットフォーム・シェイカー
・ 顕微鏡
・ 血球計数器/countess
・ CAGA12 4A4細胞:ルシフェラーゼ遺伝子発現を駆動する、CAGA12合成プロモーターで安定的にトランスフェクトされた、MvLu1細胞(ミンク肺上皮細胞)の誘導体
・ DMEM-0.1%BSA:アッセイ培地;基礎培地はDMEM(Gibcoカタログ番号11995-065)であり、培地は、0.1%w/vに希釈されたBSA、ペニシリン/ストレプトマイシン、および4mMグルタミンも含む
・ D10:DMEM 10% FBS,P/S,4mMグルタミン、1% NEAA、1X GlutaMAX(Gibcoカタログ番号35050061)
・ CAGA12(4A4)培地:D10+0.75ug/mLピューロマイシン
0日目に、トランスフェクションのためにインテグリン発現細胞を蒔いた。細胞をトリプシンで分離して、ペレット化した(200×gでスピン5分)。細胞ペレットをD10培地中に再懸濁させて、生存細胞(/ml)を数えた。細胞を0.1e6細胞/mlに希釈して、アッセイプレート中にウェルあたり100μl蒔いた(ウェルあたり10,000細胞)。CAGA12細胞については、T75フラスコあたり150万の密度で継代培養して、2日目のアッセイのために用いた。培養を、37℃および5%CO2でインキュベートした。
図6は、SR-AB1が、インテグリンによるTGFβ1の大きな潜在型複合体(LLC)のコンテキスト非依存性阻害剤であることを示すグラフである。このアッセイでは、SW480/β6細胞をアッセイウェル内にフィブロネクチンを伴わずに蒔いて、実施例2における上記プロトコルに本質的に説明されるように、GARP-proTGFβ1またはLRRC33-proTGFβ1でそれぞれ直接トランスフェクトした。LTBP1によるTGFβ1の活性化を評価するために、LN229細胞を、フィブロネクチンで事前コーティングされたアッセイウェル内に蒔いて、実施例2において上記プロトコルに本質的に説明されるように、LTBP1-proTGFβ1で直接トランスフェクトした。SR-AB1は、提示分子と関係なくTGFβのインテグリン活性化を阻害することが示された。
SR-AB2を、異なるTGFβ提示分子への結合に関する特異性についてさらに分析および試験するために選択した。はじめに、ELISAアッセイを行なって、以下のように複合体特異性を試験した。
・ ニュートラアビジン・コーティング由来のソリッドの白い96ウェルプレート(96ウェルプレートSOP)
・ ビオチン化抗原
・ Maine Biotechnology Services抗-His抗体MAB230P
・ Jackson ImmunoResearch LaboratoriesペルオキシダーゼAffinipureヤギα-ヒトFCγ
・ フラグメント特異的。カタログ番号109-035-008。
・ Jackson ImmunoResearch Laboratories Affinipureヤギα-マウスFCγフラグメント特異的。
・ カタログ番号115-035-008
・ QuantaBlu ELISA基材(Pierce Biotechカタログ番号15162)
・ マルチチャネル・ピペット
・ P200チップ
・ テーブルトップ超遠心分離機
・ 1.5mL遠心分離管
・ 0.5mL遠心分離管
・ P1000
・ P1000チップ
・ P200
・ P10
・ P10チップ
・ 15mLファルコンチューブ
・ 50mLファルコンチューブ
・ Biotek ELx 405 Select CWプレートウォッシャー
・ マルチドロップ
・ BioTek Synergy H1プレートリーダー
・ 洗浄バッファー:TBS(トリス緩衝生理食塩水;50mM Tris-Cl、150mM NaCl、pH7.6)(0.05% Tween-20を含む。)BSAは粘りがあり自動化プレートウォッシャーシステムとともに用いるべきでないので、手動(ハンド)洗浄のために0.1% BSAを添加する。
・ サンプルバッファー:TBS(トリス緩衝生理食塩水;50mM Tris-Cl、150mM NaCl、pH7.6)(0.05% Tween-20および0.1% BSAを含む)。
・ ELISA 3Xプロトコル:Biotek ELx 405 Select CWプレートウォッシャーに対する洗浄プロトコル。200μLの洗浄バッファーで洗浄する。洗浄をさらに2回繰り返す。仕様:3サイクル。振とうさせない。ウェルあたり200μLを分注。分注流量設定7(範囲1~10)。分注高さ15.24mm。水平x分注位置0mm。水平y分注位置0mm。吸引高さ3.048mm。水平x吸引位置1.372mm。水平吸引y位置0.452mm。吸引速度3.4mm/秒。吸引遅延0ミリ秒。最後の洗浄で十字線(Crosswire)吸引。十字線高さ3.048mm。十字線水平x位置:-1.829mm。十字線水平y位置:-0.457mm。
事前コーティングおよび事前ブロックされた96ウェルプレートを4℃から取り出す。0.1% Tween-20を含む1×PBS pH7.4 1%BSAをプレートから捨てて、ペーパータオルと並べられたStyrofoamパッド上にプレートを力強く叩く。96ウェルプレートがまだ準備されていない場合は、96ウェルプレートのニュートラアビジン・コーティングのプロトコルを用いてそれを準備する。具体的には、1つのニュートラアビジンによってコーティングされたプレートに関し、1mg/mLのニュートラアビジンストック溶液の上部から5μLを取り出して、それを、10mLの1×カーボネートバッファーpH9.4中に希釈する。ファルコンチューブを逆さにすることによって混合する。マルチチャネル・ピペットを用いて、Corning高結合96ウェルアッセイプレートの各ウェル内に100μLを入れて、96ウェルプレートを4℃で一晩インキュベートする。96ウェルプレートをウェルあたり200μLの洗浄バッファーで洗浄して、このステップをさらに2回繰り返す。プレートは合計3回洗浄すべきである。ウェルあたり200μLの1%BSA(PBS中、pH7.4)を用いてプレートをブロッキングして、プレートを37℃で1時間または4℃で一晩インキュベートする。
図7Aは、SR-AB2がLTBP-proTGFβ1複合体にのみ結合し;proTGFβ1またはLTBP1単独には結合しないことをELISAによって示す。図7Aは、SR-AB2が、GARP-proTGFβ1に結合しないことをELISAによって示す。
500nMのヒトLTBP1-proTGFb1複合体を、1μMの各試験抗体とともに事前インキュベートした。一晩のインキュベーション後、LTBP1-proTGFβ1+一次抗体を、抗-ヒトIgG Fcキャプチャー(AHC)センサーチップに固定化された二次抗体に対する結合に関して試験した(67nM)。LTBP1-proTGFβ1+一次抗体を調べる(seeing)前に、センサーチップをネガティブコントロール抗体(HuNeg)でブロックした。
結合速度論のパラメーターを決定するためのインビトロ結合アッセイに関する適切な方法は、Octetのようなバイオレイヤー干渉法(BLI)に基づくアッセイ、およびBiacoreシステムのような表面プラズモン共鳴(SPR)に基づくアッセイを含む(例えば:http://www.biophysics.bioc.cam.ac.uk/wp-content/uploads/2011/02/Biacore_assay_handbook.pdfを参照)。
・ 96ウェル黒ポリプロピレンプレート
・ AHC Octetチップ(抗-ヒトIgG Fcキャプチャーチップ)(ForteBio)
・ 10×速度論バッファー(ForteBio)(PBS中、1×に希釈)
・ reiner Bio-One96ウェル・ハーフ領域マイクロプレート(VWRカタログ番号82050-044)
注意:Octet実験中の各ウェル内の容量は100uLである。シェイク速度1000rpmを全てのアッセイステップに用いる。
プレウェットチップ:
・ バイオセンサーは、実験を開始する前に少なくとも10分間、1×速度論バッファー(1×KB)中でプレウェットさせなければならない。これは、Octetの内側またはベンチ上で行なうことができる。
ローディング:
・ チップは、ローディング前に1分間、1×KB中でベースライン化される。
・ AHCチップに、1μg/mL(約7nM)の濃度で3分間、抗体をローディングする。いずれか1つのセンサーが1ナノメートルの応答に到達した場合にローディングが止まるようにリミットを設定する。
・ ローディング後1分間、バッファー中でチップをベースライン化する。この時間のあいだ、抗体はチップから解離すべきでない。
抗原関連性:
・ 様々な提示分子との複合体におけるTGFβ1は、1×KB中、100nMの単一濃度で固定化抗体と関連付けられた。
抗体解離:
・ 1×KB中での解離は、3分間行なわれた。
ForteBioデータ分析ソフトウェア8.2を用いたデータ分析:
・ 手順:Y軸をベースラインの最後の5秒に並べて、解離と並べてインターステップ補正を行ない、Savitzky-Golayフィルタリングを行なう.
・ 分析:1:1フィッティングモデルを使用する。フィッティングは、ローカルおよびフルである。(ローカルは、各抗体が別個に評価されることを示し、フルは、会合および解離の両方が考慮されることを示す)曲線をフィットさせて、そして報告を保存し/データをエクスポートする。
図11は、LTBP複合体特異的抗体SR-AB10、SR-AB2、およびSR-AB13に関する結合プロファイルおよび親和性データを示す。注目すべきことに、SR-AB13は、proTGFβ1と複合化したヒトLTBP1およびヒトLTBP3の両方に結合し、SR-AB2およびSR-AB10は、TGFβ1と複合体化したヒトLTBP1に特異的に結合する。
LTBP複合体特異的抗体SR-AB10およびSR-AB13を、親和性成熟/最適化の最初のラウンドに選択して(すなわち、本明細書中に記載のH1/H2 CDRシャッフリング/多様化)、特定の子孫抗体(SR-AB14およびSR-AB15)を、LN229細胞を用いて、TGFβ活性を阻害するそれらの能力に関して評価した。図12Aおよび12Bに示されるアッセイに関して、実施例2におけるアッセイIIの改変版である以下のプロトコルを用いた。
・ MvLu1-CAGA12細胞(クローン4A4)
・ LN229細胞株(高レベルの内因性αVβ8インテグリン)
・ Costarの白い壁のTC処理96ウェルアッセイプレート#3903
・ Greiner Bio-One High Bindingの白いμclear96ウェルアッセイプレート#655094
・ ヒトフィブロネクチン(Corning#354008)
・ P200マルチチャネル・ピペット
・ それぞれに関して滅菌フィルターチップを有するP20、P200、およびP1000ピペット
・ 滅菌マイクロチューブおよびラック
・ 滅菌試薬リザーバー
・ 0.4%トリパンブルー
・ 2mL、5mL、10mL、および25mL滅菌ピペット
・ 組織培養処理100mmまたは150mmプレート
・ 70%エタノール
・ Opti-MEM還元血清培地(Life Tech#31985-070)
・ リポフェクタミン3000(Life Tech#L3000015)
・ Bright-Gloルシフェラーゼアッセイ試薬(Promega#E2620)
・ 0.25%トリプシン+0.53mM EDTA
・ proTGFb1発現プラスミド、ヒト
・ LTBP1S発現プラスミド、ヒト
・ PerkinElmer EnVisionプレートリーダー
・ TCフード
・ ベンチトップ遠心分離機
・ CO2インキュベーター37℃ 5%CO2
・ 37℃水/ビーズバス
・ プラットフォーム・シェイカー
・ 顕微鏡
・ 血球計数器/countess
・ CAGA12 4A4細胞:ルシフェラーゼ遺伝子発現を駆動する、CAGA12合成プロモーターで安定的にトランスフェクトされた、MvLu1細胞(ミンク肺上皮細胞)の誘導体
・ DMEM-0.1%BSA:アッセイ培地;基礎培地はDMEM(Gibcoカタログ番号11995-065)であり、培地は、0.1%w/vに希釈されたBSA、ペニシリン/ストレプトマイシン、および4mMグルタミンも含む
・ D10:DMEM 10% FBS,P/S,4mMグルタミン、1% NEAA、1X GlutaMAX(Gibcoカタログ番号35050061)
・ CAGA12(4A4)培地:D10+0.75ug/mLピューロマイシン
・ 常に滅菌安全キャビネット内で作業し、滅菌技術を常時用いるべきである。
・ 全ての培地を調製し、全ての材料を滅菌し、開始前に材料を安全キャビネット内に移動させる。
・ 増殖培地は、37℃に温めるべきである。
・ このアッセイ中のほとんどすべてのステップに、逆ピペッティング技術を用いる。
・ proTGFβ1のLTBP提示に依拠するアッセイは、トランスフェクションのために細胞を蒔く前に4時間~一晩、フィブロネクチンによるアッセイプレートの事前コーティングを要する。
このアッセイから得られたデータは、細胞上清におけるTGFβ活性を反映した。図12Aは、TGFβ活性によって測定して、SR-AB14(最適化SR-AB10)の改善された効能を示すグラフである。注目すべきことに、SR-AB14活性は、コンテキスト非依存性抗体SR-AB1と同様である。このアッセイは、LTBP1を過剰発現させずに行なわれたものであり、したがって、内因性提示分子の存在下でのTGFβの活性化を測定する。図12Bは、TGFβ活性によって測定される、SR-AB15(最適化SR-AB13)の改善された効能を示すグラフである。このアッセイは、過剰発現されたヒトLTBP1-proTGFβ1の存在下で行なわれた。注目すべきことに、SR-AB14活性は、コンテキスト非依存性抗体SR-AB1と同様である。
親和性成熟/最適化の第1ラウンドによるLTBP複合体特異的抗体(SR-AB14、SR-AB16、SR-AB17、SR-AB18、SR-AB19)を、親和性成熟/最適化の第2ラウンド(すなわち、本明細書中に記載のCDR-H3突然変異誘発)に選択し、特定の子孫抗体(SR-AB20、SR-AB21、SR-AB22、SR-AB23、SR-AB24、SR-AB25、SR-AB26、SR-AB27、SR-AB28、およびSR-AB29)を、様々なproTGFβ1構築物に結合するそれらの能力について評価した。最適化抗体の結合親和性を、実施例6において本質的に記載される、ヒトLTBP1-proTGFβ1、ヒトLTBP3-proTGFb1、マウスLTBP1-proTGFβ1、マウスLTBP3-proTGFb1、およびGARP-proTGFβ1複合体に対してOctetによって測定した。手短には、試験抗体を抗-ヒトFcキャプチャーバイオセンサー(AHC)(ForteBio(登録商標))の表面に固定化して、それから、100nMの単一濃度で様々なTGFβ1複合体に対して結合を試験して、結合親和性を評価した。抗原を、3分間会合させた後に5分解離させた。速度論バッファー(ForteBio(登録商標))を、実験全体を通して用い、それぞれの抗体抗原ペアについて1:1フィッティングモデルを用いてKDを決定した。
親和性成熟/最適化の第2ラウンドによるLTBP複合体特異的抗体を、親和性成熟/最適化の第3ラウンド(すなわち、本明細書中に記載の軽鎖最適化)に選択して、特定の子孫抗体を、様々なproTGFβ1構築物にそれらが結合する能力について評価した。
Biacore 8Kシステムを用いて、試験抗体の一価結合親和性および抗原結合に関する速度論パラメーターを決定した。抗原複合体に対する、FabフラグメントSR-AB42-HuFab、SR-AB63-HuFabおよびSR-AB43-HuFabの会合および解離の反応速度を測定した。得られたka、kdおよびKDを以下に提供する。手短には、Biacore 8K(GE Healthcare)を用いて表面プラズモン共鳴によって結合速度論を評価した。ビオチン化キャプチャー抗原をチップに固定化した(10nM、約200RUローディング)。ビオチンキャプチャーセンサーチップを用いて、ビオチン化抗原をキャプチャーした。10、5、2.5、1.25、および0.6nMの濃度でのFabを、キャプチャーされた抗原の上に注入した。0nMを参照として用いた。GARPおよびLRRC33に対するLTBP抗体の親和性を、より高い濃度のFab(100、50、25、12.5、6.25nM)を用いて確認した。0nMを参照として用いた。それぞれの分析物の濃度が別個のサイクルにおいて注入され、センサーチップ表面がそれぞれのサイクル後に再生される場合、マルチサイクル速度論を用いた。全てのアッセイは、調製されたばかりの1×HBS-EP+バッファー(10mM HEPES、150mM NaCl、3mM EDTA、0.05% Tween20、pH7.4)中で行なわれた。データを、1:1結合モデルに対して全体的にフィットさせて速度論パラメーターを得た。0nMの分析物の濃度に関するセンサーグラムを参照として用いた。
親和性成熟/最適化の第1ラウンドによるLTBP複合体特異的抗体(すなわち、SR-AB14、SR-AB16、SR-AB17、SR-AB18、SR-AB19)を、親和性成熟/最適化の第2ラウンドに選択して(すなわち、本明細書中に記載のCDR-H3突然変異誘発)、特定の子孫抗体(SR-AB20、SR-AB21、SR-AB22、SR-AB23、SR-AB24、SR-AB25、SR-AB26、SR-AB27、SR-AB28、およびSR-AB29)を、LN229細胞を用いて、TGFβ活性を阻害するそれらの能力に関して評価した。図13A、13B、14A、および14Bに示されるアッセイに関して、実施例2におけるアッセイIIの改変版である以下のプロトコルを用いた。
・ MvLu1-CAGA12細胞(クローン4A4)
・ LN229細胞株(高レベルの内因性αVβ8インテグリン)
・ Costarの白い壁のTC処理96ウェルアッセイプレート#3903
・ Greiner Bio-One High Bindingの白いuclear96ウェルアッセイプレート#655094
・ ヒトフィブロネクチン(Corning#354008)
・ P200マルチチャネル・ピペット
・ それぞれに関して滅菌フィルターチップを有するP20、P200、およびP1000ピペット
・ 滅菌マイクロチューブおよびラック
・ 滅菌試薬リザーバー
・ 0.4%トリパンブルー
・ 2mL、5mL、10mL、および25mL滅菌ピペット
・ 組織培養処理100mmまたは150mmプレート
・ 70%エタノール
・ Opti-MEM還元血清培地(Life Tech#31985-070)
・ リポフェクタミン3000(Life Tech#L3000015)
・ Bright-Gloルシフェラーゼアッセイ試薬(Promega#E2620)
・ 0.25%Tryspin+0.53mM EDTA
・ proTGFb1発現プラスミド、ヒト
・ proTGFb1発現プラスミド、マウス
・ LTBP1S発現プラスミド、マウス
・ PerkinElmer EnVisionプレートリーダー
・ TCフード
・ ベンチトップ遠心分離機
・ CO2インキュベーター37C 5% CO2
・ 37C水/ビーズバス
・ プラットフォーム・シェイカー
・ 顕微鏡
・ 血球計数器/countess
・ CAGA12 4A4細胞:ルシフェラーゼ遺伝子発現を駆動する、CAGA12合成プロモーターで安定的にトランスフェクトされた、MvLu1細胞(ミンク肺上皮細胞)の誘導体
・ DMEM-0.1%BSA:アッセイ培地;基礎培地はDMEM(Gibcoカタログ番号11995-065)であり、培地は、0.1%w/vに希釈されたBSA、ペニシリン/ストレプトマイシン、および4mMグルタミンも含む
・ D10:DMEM 10% FBS,P/S,4mMグルタミン、1% NEAA、1X GlutaMAX(Gibcoカタログ番号35050061)
・ CAGA12(4A4)培地:D10+0.75ug/mLピューロマイシン
・ 常に滅菌安全キャビネット内で作業し、滅菌技術を常時用いるべきである。
・ 全ての培地を調製し、全ての材料を滅菌し、開始前に材料を安全キャビネット内に移動させる。増殖培地は、37℃に温めるべきである。
・ このアッセイ中のほとんどすべてのステップに、逆ピペッティング技術を用いる。
このアッセイから得られたデータは、細胞上清におけるTGFβ活性を反映した。図13Aおよび13Bは、TGFβ活性によって測定した、抗体SR-AB20、SR-AB21、SR-AB22、およびSR-AB23(SR-AB10ファミリー抗体)の改善された効能を示すグラフである。図13Aのアッセイは、LTBP1を過剰発現させずに行われ、したがって、内因性提示分子の存在下でのTGFβの活性化を測定する。図13Bのアッセイは、過剰発現されたミューリンLTBP1-proTGFβ1を用いて行なわれた。注目すべきことに、抗体SR-AB22およびSR-AB23は、両方のアッセイにおいて、コンテキスト非依存性抗体SR-AB1と同様(またはそれよりも大きな)活性を示す。
親和性成熟/最適化の第3および第4ラウンドからのLTBP複合体特異的抗体を、LN229細胞を用いて、TGFβ活性を阻害するそれらの能力に関して評価した。アッセイは、実施例10に記載されたプロトコルを用いて行なわれた。
好ましい生物物理学的特性を示す抗体は、開発における成功率が増大する。親和性成熟/最適化の第3および第4ラウンドによるLTBP複合体特異的抗体を、凝集傾向および多特異性について評価した。図17は、バキュロウイルス(BV)粒子に対するSR-AB結合を示す酵素結合免疫吸着測定法(ELISA)の結果を示す。図18は、アフィニティ捕獲自己相互作用ナノ粒子分光法(AC-SINS)アッセイの結果を示す。このアッセイは、抗体がそれ自身と相互作用する可能性を試験する。それは、抗-Fc抗体でコーティングされた金ナノ粒子を用いる。抗体の希釈溶液が添加されると、それらは、Fcでコーティングされた金ビーズ上に急速に固定化される。これらの抗体が続いて互いに相互作用する場合は、より短い原子間距離および分光法によって検出することのできるプラズモン波長の増大をもたらす。
コリン欠乏高脂肪食(CDHFD)は、非アルコール性脂肪性肝炎(NASH)の食事によって誘導される確立されたモデルである。このモデルでは、雄C57BL/6Jマウスに、コリン欠損、0.1%メチオニン、高脂肪食を12週間与える。CDHFDの開始の3~6週間後、線維症を進行させるプロセスの活性化が、α-平滑筋アクチン(α-SMA)タンパク質(肝星細胞の活性化に関するマーカー)の発現増大、およびコラーゲン合成および沈着の増大を反映する組織ヒドロキシプロリン含有量の上昇を通して検出され得る(Matsumoto et.al,Int J Exp Pathol.2013 Apr;94(2):93-103)。
アミノ酸プロリンのヒドロキシル化によって生産されるヒドロキシプロリンは、原線維コラーゲンの主な構成要素に関するシグネチャーアミノ酸であり、タンパク質のおよそ13.5%を含む。ヒドロキシプロリンは、線維症の重症度の重要な診断指標として働く。CDHFDを与えられた動物は、肝臓組織内のヒドロキシプロリン(HYP)の増大を示す。図19に示されるように、SR-AB42およびSR-AB31による処置は、CDHFDの動物における肝臓組織内のHYP(μg/mg組織)の増大を阻害した。
ミューリンCol4a3-/-モデルは、常染色体劣性アルポート症候群の確立された遺伝的モデルである。アルポートマウスは、機能性コラーゲン4A3遺伝子が欠損しており(Col4A3-/-)、したがって、α3、α4、およびα5鎖を必要とする正常なIV型コラーゲン三量体を形成できない。Col4a3-/-マウスは、間質線維症および管状萎縮を含むヒト患者における腎線維化と一致する腎臓における線維症を発症し、Col4a3-/-マウスは、マウスの遺伝的背景に応じて8~30週齢で末期ステージの腎疾患(ESRD)を発症する。Col4a3-/-マウスにおける腎臓病理の構造的および機能的徴候は、ESRDへの進行と合わせて、Col4a3-/-マウスを、腎線維症を理解するための理想的なモデルにさせる。以前の報告は、このプロセスにおけるTGFβシグナリング経路の重要性を指摘し、TGFβ1およびTGFβ3の公知のアクチベーターであるαVβ6インテグリンの阻害剤、または、TGFβリガンド・トラップのいずれかによる治療は、アルポートマウスにおける腎線維症および炎症を防止することが報告されている(Hahm et al.(2007)The American Journal of Pathology,170(1):110-125)。
TGFβ受容体活性化は、Smad2/3のリン酸化を含む細胞内イベントの下流シグナリングカスケードを導くことが十分に証明されている。したがって、SR-AB42およびSR-AB63処置がTGFβシグナリングを阻害する能力を、製造元の説明書に従ってELISA(Cell Signaling Technologies)によってアッセイされるSmad2/3の相対的リン酸化レベルを測定することによって、腎臓溶解サンプルにおいて評価した。図20Aは、アルポートマウスモデルにおける、リン酸化-対-総(リン酸化および非リン酸化)Smad2/3の相対比(pSMAD2/3:tSMAD2/3)を示すグラフである。図20Bは、ELISAによって決定されるリン酸化SMAD2/3(pSMAD2/3)の量を示すグラフであり、図20Cは、ELISAによって決定される総SMAD2/2(tSMAD2/3)タンパク質の量を示すグラフである。図20Bおよび図20Cによって示されるように、pSMADの減少は、図20Aに示される比の変化に寄与している。単一用量のSR-AB42またはSR-AB63は、全腎臓溶解物においてpSmad2/3シグナリングを有意に阻害するのに十分であり、SR-AB42およびSR-AB63による効率的な標的結合およびアルポートモデルにおけるLTBP複合体特異的阻害がpSmadレベルを減少させることを示した。
pro-ドメインの4位のシステイン残基がセリン残基で置換されている改変されたproTGFβ1複合体(proTGFβ1 C4S)(WO2014/182676に記載)を用いて、C4S抗原への抗体結合をOctetによって評価した。サイクル2抗体を固定化して、3抗原に対して試験した。以下の表に示されるように、LTBP-1 proTGFβ1抗原(表23)およびproTGFβ1C4S抗原への強い抗体結合が観察され(表24)、一方で、LRRC33 proTGFβ1抗原への結合は観察されなかった(表25)。
図21は、リード・サイクル3(lead cycle 3)抗体が、LTBP-TGFβ3アッセイにおいて阻害を示さないことを示すグラフである。TGFβ3アッセイは、実施例10におけるアッセイと同様に行なわれるが、proTGFβ1の代わりにproTGFβ3がトランスフェクトされる。このアッセイはLN229細胞株における内因性提示分子に依拠するので、LTBP構築物はトランスフェクトされない。
肝臓は、TGFβ1およびTGFβ3の両方を発現する。CDHFDモデルにおける両方のアイソフォームの阻害が肝臓の線維症をさらに和らげるかどうか調べるために、CDHFDマウスを、強力なTGFβ1選択的活性化阻害剤(ヒトLTBP1およびLTBP3複合体のコンテキストにおいてTGFβ1の活性化を阻害する)およびTGFβ3選択的活性化阻害剤を単独または組み合わせて用いて処置した。TGFβ3阻害剤で処置されたマウスにおいて、PSR分析およびさらなる組織病理学分析によって証明されるように疾患の悪化が観察された(図22)。12週において、例えば、試験の終わりに、TGFβ1選択的活性化阻害剤を受けた動物は、IgGによって処置された動物(ネガティブコントロール)と比較して有意に少ない線維症を示した。対照的に、TGFβ3選択的阻害剤で処置された動物は、およそ12%PSRの陽性領域で、有意により多い線維症を示した。TGFβ3選択的阻害剤およびTGFβ1選択的阻害剤の両方の組み合わせを受けた動物は、中間レベルの線維症を示し、TGFβ1選択的活性化阻害剤の抗線維形成効果がTGFβ3阻害によって和らげられることが示唆された。
親和性成熟/最適化の第3ラウンドによるLTBP複合体特異的抗体を、親和性成熟/最適化の第4ラウンド(すなわち、本明細書中に記載の軽鎖最適化)のために選択し、特定の子孫抗体を、様々なproTGFβ1構築物に結合するそれらの能力について評価した。
・ 96ウェルプレート-Greinerbio-one REF 650101
・ マイクロプレートFoils-GE Healthcare-カタログ番号28-9758-16
・ Biotin CAPture Kit GE Healthcare製品番号28920233
・ Biacoreランニング・バッファー-(20×溶液として供給、Milli-Q水中に希釈、TEKnovaカタログ番号H8022)
これらの実験は、方法「Biotin CAPtureキットを用いた多サイクル速度論/親和性」を用いて、Biacore 8Kを使用して行われた。
本発明は様々な実施態様を包含する。非限定的な例を以下に挙げる:
a)以下の条件で、CDR-H1:配列番号94:
i.配列番号94の2位のトレオニン残基は、アラニンで置換されてもよい;
ii.配列番号94の4位のアスパラギン残基は、アラニン、チロシン、アスパラギン酸、セリン、アルギニン、またはヒスチジンで置換されてもよい;
iii.配列番号94の5位のアスパラギン残基は、グルタミン、セリン、グリシン、リジン、グルタミン酸、アルギニン、またはヒスチジンで置換されてもよい;
iv.配列番号94の6位のチロシン残基は、アルギニンで置換されてもよい;
v.配列番号94の7位のプロリン残基は、グリシン、アラニン、ロイシン、セリン、アスパラギン、バリン、アスパラギン酸、またはグルタミンで置換されてもよい;
vi.配列番号94の8位のイソロイシン残基は、メチオニンまたはロイシンで置換されてもよい;および/または、
vii.配列番号94の9位のヒスチジン残基は、フェニルアラニン、チロシン、アスパラギン、またはセリンで置換されてもよい;
b)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H2:配列番号95;
c)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H3:配列番号96;
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L1:配列番号97;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L2:配列番号98;および、
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L3:配列番号99
のうちの少なくとも3個を含む、抗体、またはその抗原結合フラグメント。
a)アミノ酸配列FTF(X1)(X2)YVMHを含んでいるCDR-H1であって、X1はSまたはRであってもよく、X2はGまたはSであってもよい;
b)アミノ酸配列(X1)ISHEG(X2)(X3)KYYADSVKGを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はVまたはSであってもよく、X2はSまたはGであってもよく、X3はFまたはLであってもよい;および
c)アミノ酸配列(X1)(X2)P(X3)(X4)(X5)(X6)RRGG(X7)(X8)(X9)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はAまたはVであってもよく、X2はR、V、GまたはKであってもよく、X3はR、HまたはLであってもよく、X4はI、VまたはGであってもよく、X5はA、S、またはLであってもよく、X6はAまたはVであってもよく、X7はFまたはYであってもよく、X8はD、G、R、またはSであってもよく、X9はY、G、R、L、V、AまたはKであってもよい
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号97に示されるCDR-L1;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号98に示されるCDR-L2;および
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号99に示されるCDR-L3
のうちの少なくとも3個を含む。
a)CDR-H2において、X2はSであり;および
b)CDR-H3において、X1はAであり、X2はRまたはVであり、X3はRであり、X4はIであり、X5はAまたはLであり、X6はAであり、X7はFであり、X8はGであり、X9はYである。
配列番号88と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を有する重鎖可変領域;および
配列番号89と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域を含む。
a)以下の条件で、CDR-H1:配列番号100:
i.配列番号100の4位のセリン残基はヒスチジンで置換されてもよい;
ii.配列番号100の7位のセリン残基はアラニンまたはグリシンで置換されてもよい;および/または、
iii.配列番号100の11位のグリシン残基はトレオニン、セリン、ヒスチジン、ロイシン、イソロイシン、アスパラギン、バリン、またはアラニンで置換されてもよい;
b)以下の条件で、CDR-H2:配列番号101:
i.配列番号101の3位のセリン残基はアラニンで置換されてもよい;
ii.配列番号101の6位のグリシン残基はアラニンまたはセリンで置換されてもよい;および/または、
iii.配列番号101の7位のセリン残基はトレオニンで置換されてもよい;
c)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H3:配列番号102;
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L1:配列番号103;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L2:配列番号104;および、
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L3:配列番号105
のうちの少なくとも3個を含む。
g)アミノ酸配列G(X1)I(X2)S(X3)SYYW(X4)を含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSまたはPであってもよく、X2はS、HまたはRであってもよく、X3はSまたはGであってもよく、X4はG、I、NまたはVであってもよい;
h)アミノ酸配列SISYSA(X1)TYYNPSLKSを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はSまたはTであってもよい;
i)アミノ酸配列(X1)(X2)D(X3)(X4)Y(X5)(X6)(X7)(X8)G(X9)(X10)(X11)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はAまたはVであってもよく、X2はR、SまたはGであってもよく、X3はP、Y、R、V、I、H、TまたはEであってもよく、X4はS、D、EまたはNであってもよく、X5はD、AまたはTであってもよく、X6はS、G、TまたはAであってもよく、X7はI、A、R、Q、またはVであってもよく、X8はA、E、K、GまたはTであってもよく、X9はMまたはIであってもよく、X10はD、L、Q、V、NまたはGであってもよく、X11はV、R、N、EまたはKであってもよい;
j)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L1:配列番号103;
k)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L2:配列番号104;および
l)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L3:配列番号105
のうちの少なくとも3個を含む。
g)CDR-H1において、X2はHまたはRであり、X3はSであり、X4はG、IまたはNである;および
h)CDR-H3において、X1はAであり、X3はPまたはVであり、X4はSであり、X5はDであり、X6はSまたはAであり、X7はA、R、IまたはVであり、X8はAであり、X9はMであり、X10はD、Q、またはGであり、X11はVまたはRである。
CDR-H1:配列番号100;
CDR-H2:配列番号101;
CDR-H3:配列番号102;
CDR-L1:配列番号103;
CDR-L2:配列番号104;および、
CDR-L3:配列番号105
から選択される少なくとも3個のCDRを含む(それぞれのCDRに関して1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい)、実施態様6~8.1のいずれか1つに係る抗体、またはその抗原結合フラグメント。
i)可変重鎖領域は、配列番号106と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含み;および/または、
ii)可変の軽鎖可変領域は、配列番号107と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含む。
i)配列番号106と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を有する可変重鎖領域;および、
ii)配列番号107と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域を含む。
a)アミノ酸配列FTFRSYVMHを含んでいるCDR-H1;
b)アミノ酸配列VISHEGS(X1)KYYADSVKGを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はLまたはGである;および
c)アミノ酸配列A(X1)PRIAARRGGFG(X2)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はV、RまたはLであり、X2はY、SまたはTである;
d)アミノ酸配列TRS(X1)G(X2)ID(X3)NYVQを含んでいるCDR-L1であって、ここで、X1はSまたはHであり、X2はN、L、SまたはAであり、X3はN、DまたはYである;
e)アミノ酸配列ED(X1)(X2)RPSを含んでいるCDR-L2であって、ここで、X1はN、FまたはAであり、X2はQ、IまたはVである;および
f)アミノ酸配列Q(X1)YD(X2)(X3)(X4)Q(X5)VVを含んでいるCDR-L3であって、ここで、X1はSまたはGであり、X2はS、F、Y、D、HまたはWであり、X3はN、DまたはSであり、X4はN、A、L、EまたはTであり、X5はG、R、AまたはLである
を含む、抗体、またはその抗原結合フラグメント。
CDR-L2において、X1はNまたはFであり、X2はQまたはVである;および
CDR-L3において、X1はSまたはGであり、X2はS、Y、DまたはWであり、X3はDまたはSであり、X4はN、LまたはTであり、X5はG、R、AまたはLである、
実施態様41に係る抗体、またはその抗原結合フラグメント。
CDR-L2において、X1はNであり、X2はQまたはVである;および
CDR-L3において、X1はSまたはGであり、X2はS、YまたはWであり、X3はDであり、X4はNまたはTであり、X5はG、RまたはAである、
実施態様45に係る抗体、またはその抗原結合フラグメント。
a)CDR-H1は配列番号166のアミノ酸配列を含み;
b)CDR-H2は配列番号167のアミノ酸配列を含み;
c)CDR-H3は配列番号168のアミノ酸配列を含み;
d)CDR-L1は配列番号169のアミノ酸配列を含み;
e)CDR-L2は配列番号170のアミノ酸配列を含み;および
f)CDR-L3は配列番号171のアミノ酸配列を含む。
配列番号319と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域を含む、実施態様40~50のいずれか1つに係る抗体、またはその抗原結合フラグメント。
g)アミノ酸配列G(X1)I(X2)S(X3)SYYW(X4)を含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSであってもよく、X2はS、HまたはRであってもよく、X3はSまたはGであってもよく、X4はG、I、NまたはVであってもよい;
h)アミノ酸配列SISYS(X1)(X2)TYYを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はGまたはAであってもよく、X2はSまたはTであってもよい;
i)アミノ酸配列A(X1)DPSYDS(X2)AGM(X3)Vを含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はR、SまたはGであってもよく、X2はAまたはIであってもよく、X3はDまたはQであってもよい;
j)アミノ酸配列RAS(X1)(X2)IS(X3)YLNを含んでいるCDR-L1であって、ここで、X1はKまたはQであってもよく、X2はVまたはSであってもよく、X3はSまたはYであってもよい;
k)アミノ酸配列(X1)AS(X2)(X3)QSを含んでいるCDR-L2であって、ここで、X1はY、AまたはSであってもよく、X2はSまたはNであってもよく、X3はLまたはRであってもよい;
l)アミノ酸配列QQ(X1)(X2)D(X3)P(X4)Tを含んでいるCDR-L3であって、ここで、X1はSまたはGであってもよく、X2はFまたはNであってもよく、X3はWまたはFであってもよく、X4はFまたはLであってもよい、
を含む、抗体、またはその抗原結合フラグメント。
a)CDR-H1において、X1はSであり、X2はSまたはRであり、X3はSであり、X4はGである;
b)CDR-H2において、X1はGまたはAであり、X2はSまたはTである;
c)CDR-H3において、X1はR、SまたはGであり、X2はAまたはIであり、X3はDまたはQである;
d)CDR-L1において、X1はKまたはQであり、X2はVまたはSであり、X3はSまたはYである;
e)CDR-L2において、X1はY、AまたはSであり、X2はSまたはNであり、X3はLまたはRである;および
f)CDR-L3において、X1はSまたはGであり、X2はFまたはNであり、X3はWまたはFであり、X4はFまたはLである。
a)CDR-H1は、アミノ酸配列GSIRSSSYYWGを含む;
b)CDR-H2は、アミノ酸配列SISYSATTYYを含む;
c)CDR-H3において、X1はSまたはGであり、X2はAまたはIであり、X3はDまたはQである;
d)CDR-L1において、X1はKまたはQであり、X2はVまたはSであり、X3はSまたはYである;
e)CDR-L2において、X1はY、AまたはSであり、X2はSまたはNであり、X3はLまたはRである;および
f)CDR-L3において、X1はSまたはGであり、X2はFまたはNであり、X3はWまたはFであり、X4はFまたはLである。
g)CDR-H1は配列番号292のアミノ酸配列を含み;
h)CDR-H2は配列番号293のアミノ酸配列を含み;
i)CDR-H3は配列番号294のアミノ酸配列を含み;
j)CDR-L1は配列番号295のアミノ酸配列を含み;
k)CDR-L2は配列番号296のアミノ酸配列を含み;および
l)CDR-L3は配列番号297のアミノ酸配列を含む。
配列番号361と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域を含む、実施態様54~58のいずれか1つに係る抗体、またはその抗原結合フラグメント。
a)線維性障害は、慢性炎症を含む;
b)対象は、免疫抑制によって利益を受ける;
c)対象は、自己免疫疾患を有するか、または発症するリスクがある;
d)対象は、同種移植片移植のための候補者である;および/または、
e)対象は、同種移植片移植を受けたことがある。
対象は、初期相中に負荷用量を受けて、その後に、後続相中に維持用量を受ける、実施態様93に係る使用のための組成物。
i)LTBP1-proTGFβ1および/またはLTBP3-proTGFβ1を含む少なくとも1つの抗原を提供するステップ、
ii)ステップ(i)の少なくとも1つの抗原に特異的に結合する抗体またはフラグメントの第1のプールを選択して、それにより、LTBP1-proTGFβ1および/またはLTBP3-proTGFβ1の特異的な結合物質(binder)を提供するステップ;
iii)TGFβ1の活性化を阻害する抗体またはフラグメントの第2のプールを選択して、それにより、TGFβ1活性化の特異的阻害剤を産生するステップ;および
iv)抗体の第1のプールおよび抗体の第2のプール内に存在する抗体またはフラグメントを医薬組成物に処方して、それにより、上記抗体またはフラグメントを含む組成物を作製するステップを含む。
免疫細胞関連TGFβ1よりもマトリックス関連TGFβ1を優先的に阻害する抗体またはその抗原結合フラグメントを選択するステップ;
抗体を発現する細胞を含む細胞培養物において抗体を産生するステップ(細胞培養物は250L以上の容量を有する)、
細胞培養物から抗体を精製するステップをさらに含んでもよい;および
さらに、精製された抗体を医薬組成物に処方するステップを含んでもよい。
i)(CDR-H1)配列番号94、(CDR-H2)配列番号95、および(CDR-H3)配列番号96の少なくとも3個の重鎖CDR配列を含む抗体またはフラグメントを提供するステップ;および
ii)ステップ(i)の抗体またはフラグメントを親和性成熟および/または最適化に供して、それにより、親和性成熟および/または最適化抗体またはフラグメントを提供するステップを含む。
i)(CDR-H1)配列番号100、(CDR-H2)配列番号101、および(CDR-H3)配列番号102の少なくとも3個のCDR配列を含む抗体またはフラグメントを提供するステップ;および
ii)ステップ(i)の抗体またはフラグメントを親和性成熟および/または最適化に供して、それにより、親和性成熟および/または最適化抗体またはフラグメントを提供するステップを含む。
i)(CDR-H1)配列番号108、(CDR-H2)配列番号109、および(CDR-H3)配列番号110の少なくとも3個の重鎖CDR配列を含む抗体またはフラグメントを提供するステップ、および
ii)ステップ(i)の抗体またはフラグメントを親和性成熟および/または最適化に供して、それにより、親和性成熟および/または最適化抗体またはフラグメントを提供するステップを含む。
i)(CDR-H1)配列番号116、(CDR-H2)配列番号117、および(CDR-H3)配列番号118の少なくとも3個の重鎖CDR配列を含む抗体またはフラグメントを提供するステップ、および
ii)ステップ(i)の抗体またはフラグメントを親和性成熟および/または最適化に供して、それにより、親和性成熟および/または最適化抗体またはフラグメントを提供するステップを含む。
a)以下の可変重鎖および/または可変軽鎖配列またはそれらの変異体を含む:
i)可変重鎖配列
QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFRSYVMHWVRQAPGKGLEWVAVISHEGSLKYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAVPRIAARRGGFGYWGQGTLVTVSS
または
QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFRSYVMHWVRQAPGKGLEWVAVISHEGSLKYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARPRIAARRGGFGYWGQGTLVTVSS
ここで変異体は、対応する可変重鎖配列と少なくとも85%同一、90%同一、または95%同一であってもよい。
ii)可変軽鎖配列
NFMLTQPHSVSESPGKTVTISCTRSSGNIDNNYVQWYQQRPGSSPTTVIYEDNQRPSGVPDRFSGSIDSSSNSASLTISGLKTEDEADYYCQSYDSDNQGVVFGGGTKLTVL
または
NFMLTQPHSVSESPGKTVTISCTRSSGNIDNNYVQWYQQRPGSSPTTVIYEDNQRPSGVPDRFSGSIDSSSNSASLTISGLKTEDEADYYCQSYDSDNQGVVFGGGTKLTVL
ここで変異体は、対応する可変軽鎖配列と少なくとも85%同一、90%同一、または95%同一であってもよい;
b)以下の可変重鎖CDR配列またはそれらの変異体を有する:
i)FTFRSYVMHのCDR-H1であって、1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい;
ii)VISHEGSLKYYADSVKGのCDR-H2であって、1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい;および/または;
iii)AVPRIAARRGGFGYまたはARPRIAARRGGFGYのCDR-H3であって、1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい;および/または;
c)以下の可変軽鎖CDR配列またはそれらの変異体を有する:
i)TRSSGNIDNNYVQのCDR1-L1であって、1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい;
ii)EDNQRPSのCDR-L2であって、1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい;および/または;
iii)QSYDSDNQGVVのCDR-L3であって、1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい。
その抗体は、成熟TGFβ1、成熟TGFβ2または成熟TGFβ3に結合せず、
その抗体は、完全ヒトまたはヒト化抗体、またはその抗原結合フラグメントであり、
その抗体は、以下:
CDR-H1:配列番号100;
CDR-H2:配列番号101;
CDR-H3:配列番号102;
CDR-L1:配列番号103;
CDR-L2:配列番号104;および、
CDR-L3:配列番号105から選択される少なくとも3個のCDRを含み、CDRのそれぞれについて、3個までのアミノ酸変更を含んでもよい。
その抗体は、成熟TGFβ1、成熟TGFβ2または成熟TGFβ3に結合せず、
その抗体は、完全ヒトまたはヒト化抗体、またはその抗原結合フラグメントであり、
その抗体は、以下の6個のCDR:
a)以下の条件で、CDR-H1:配列番号100:
i.配列番号100の4位のセリン残基はヒスチジンで置換されてもよい;
ii.配列番号100の7位のセリン残基はアラニンまたはグリシンで置換されてもよい;および/または、
iii.配列番号100の11位のグリシン残基はトレオニン、セリン、ヒスチジン、ロイシン、イソロイシン、アスパラギン、バリン、またはアラニンで置換されてもよい;
b)以下の条件で、CDR-H2:配列番号101:
i.配列番号101の3位のセリン残基はアラニンで置換されてもよい;
ii.配列番号101の6位のグリシン残基はアラニンまたはセリンで置換されてもよい;および/または、
iii.配列番号101の7位のセリン残基はトレオニンで置換されてもよい;
c)3個までのアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H3:配列番号102;
d)3個までのアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L1:配列番号103;
e)3個までのアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L2:配列番号104;および、
f)3個までのアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L3:配列番号105
のうちの少なくとも3個を含む。
その抗体は、成熟TGFβ1、成熟TGFβ2または成熟TGFβ3に結合せず、
その抗体は、完全ヒトまたはヒト化抗体、またはその抗原結合フラグメントであり、
その抗体は、配列番号106と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を有する重鎖可変領域を含み;および/または、
その抗体は、配列番号107と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を有する可変の軽鎖可変領域を含む。
配列番号106と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を有する重鎖可変領域;および
配列番号107と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域を含む。
その抗体は、成熟TGFβ1、成熟TGFβ2または成熟TGFβ3に結合せず、
その抗体は、完全ヒトまたはヒト化抗体、またはその抗原結合フラグメントであり、
ここで抗体は、以下の6個のCDR:
a)以下の条件で、CDR-H1:配列番号94:
i.配列番号94の2位のトレオニン残基は、アラニンで置換されてもよい;
ii.配列番号94の4位のアスパラギン残基は、アラニン、チロシン、アスパラギン酸、セリン、アルギニン、またはヒスチジンで置換されてもよい;
iii.配列番号94の5位のアスパラギン残基は、グルタミン、セリン、グリシン、リジン、グルタミン酸、アルギニン、またはヒスチジンで置換されてもよい;
iv.配列番号94の6位のチロシン残基は、アルギニンで置換されてもよい;
v.配列番号94の7位のプロリン残基は、グリシン、アラニン、ロイシン、セリン、アスパラギン、バリン、アスパラギン酸、またはグルタミンで置換されてもよい;
vi.配列番号94の8位のイソロイシン残基は、メチオニンまたはロイシンで置換されてもよい;および/または、
vii.配列番号94の9位のヒスチジン残基は、フェニルアラニン、チロシン、アスパラギン、またはセリンで置換されてもよい;
b)6個までのアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H2:配列番号95;
c)3個までのアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H3:配列番号96;
d)3個までのアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L1:配列番号97;
e)3個までのアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L2:配列番号98;および、
f)3個までのアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L3:配列番号99
のうちの少なくとも3個を含む。
その抗体は、成熟TGFβ1、成熟TGFβ2または成熟TGFβ3に結合せず、
その抗体は、完全ヒトまたはヒト化抗体、またはその抗原結合フラグメントであり、
その抗体は、配列番号88と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を有する重鎖可変領域を含み;および/または、
その抗体は、配列番号89と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を有する可変の軽鎖可変領域を含む。
配列番号88と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を有する重鎖可変領域;および
配列番号89と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域を含む。
その抗体は、成熟TGFβ1、成熟TGFβ2または成熟TGFβ3に結合せず、
その抗体は、完全ヒトまたはヒト化抗体、またはその抗原結合フラグメントであり、
その抗体は、以下の6個のCDR:
a)以下の条件で、CDR-H1:配列番号1:
i.配列番号1の4位のトレオニン残基は、ヒスチジン、リジン、フェニルアラニン、またはグリシンで置換されてもよい;
ii.配列番号1の5位のセリン残基は、ロイシンで置換されてもよい;および/または、
iii.配列番号1の9位のセリン残基は、アラニンで置換されてもよい;
b)以下の条件で、CDR-H2:配列番号2:
i.配列番号2の3位のセリン残基は、アスパラギン酸またはアスパラギンで置換されてもよい;
ii.配列番号2の5位のチロシン残基は、ヒスチジンで置換されてもよい;
iii.配列番号2の6位のアスパラギン残基は、セリンで置換されてもよい;
iv.配列番号2の8位のアスパラギン残基は、フェニルアラニン、ロイシン、アラニン、チロシン、アスパラギン酸、またはセリンで置換されてもよい;および/または、
v.配列番号2の10位のアスパラギン残基は、アスパラギン酸またはアラニンで置換されてもよい;
c)3個までのアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H3:配列番号3;
d)3個までのアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L1:配列番号4;
e)3個までのアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L2:配列番号5;および、
f)3個までのアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L3:配列番号6
のうちの少なくとも3個を含む。
その抗体は、成熟TGFβ1、成熟TGFβ2または成熟TGFβ3に結合せず、
その抗体は、完全ヒトまたはヒト化抗体、またはその抗原結合フラグメントであり、
その抗体は、配列番号7と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を有する重鎖可変領域を含み;および/または、
その抗体は、配列番号8と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を有する可変の軽鎖可変領域を含む。
a)線維性障害は、慢性炎症を含む;
b)対象は、免疫抑制によって利益を受ける;
c)対象は、自己免疫疾患を有するか、または発症するリスクがある;
d)対象は、同種移植片移植のための候補者である;および/または、
e)対象は、同種移植片移植を受けたことがある。
対象は、初期相中に負荷用量を受けて、その後に、後続相中に維持用量を受ける。
i)LTBP1-proTGFβ1および/またはLTBP3-proTGFβ1を含む少なくとも1つの抗原を提供するステップ、
ii)ステップ(i)の少なくとも1つの抗原に特異的に結合する抗体またはフラグメントの第1のプールを選択して、それにより、LTBP1-proTGFβ1および/またはLTBP3-proTGFβ1の特異的な結合物質(binder)を提供するステップ;
iii)TGFβ1の活性化を阻害する抗体またはフラグメントの第2のプールを選択して、それにより、TGFβ1活性化の特異的阻害剤を産生するステップ;および
iv)抗体の第1のプールおよび抗体の第2のプール内に存在する抗体またはフラグメントを医薬組成物に処方して、それにより、抗体またはフラグメントを含む組成物を作製するステップを含む。
抗体またはフラグメントの第1のプールから、GARP-proTGFβ1、LRRC33-proTGFβ1、成熟TGFβ1、GARP-proTGFβ2、LRRC33-proTGFβ2、成熟TGFβ2、GARP-proTGFβ3、LRRC33-proTGFβ3、成熟TGFβ3、またはそれらの任意の組み合わせに結合する任意の抗体またはフラグメントを除去するステップをさらに含む。
ステップ(ii)および/または(iii)において選択された抗体またはフラグメントのアイソフォーム特異性を決定または確認するステップをさらに含む。
ヒトおよび齧歯類抗原に対して交差反応性である抗体またはフラグメントを選択するステップをさらに含む。
抗体の第1のプールおよび抗体の第2のプール内に提供される(that is presented)抗体またはフラグメントの、完全ヒトまたはヒト化抗体またはフラグメントを産生するステップをさらに含む。
抗体の第1のプールおよび抗体の第2のプール内に存在する抗体またはフラグメントを親和性成熟および/または最適化に供して、それにより親和性成熟および/または最適化抗体またはフラグメントを提供するステップをさらに含む。
i)(CDR-H1)配列番号1、(CDR-H2)配列番号2、および(CDR-H3)配列番号3の少なくとも3個のCDR配列を含む抗体またはフラグメントを提供するステップ;および
ii)ステップ(i)の抗体またはフラグメントを親和性成熟および/または最適化に供して、それにより、親和性成熟および/または最適化抗体またはフラグメントを提供するステップを含む。
i)(CDR-H1)配列番号94、(CDR-H2)配列番号95、および(CDR-H3)配列番号96の少なくとも3個のCDR配列を含む抗体またはフラグメントを提供するステップ;および
ii)ステップ(i)の抗体またはフラグメントを親和性成熟および/または最適化に供して、それにより、親和性成熟および/または最適化抗体またはフラグメントを提供するステップを含む。
i)(CDR-H1)配列番号100、(CDR-H2)配列番号101、および(CDR-H3)配列番号102の少なくとも3個のCDR配列を含む抗体またはフラグメントを提供するステップ;および
ii)ステップ(i)の抗体またはフラグメントを親和性成熟および/または最適化に供して、それにより、親和性成熟および/または最適化抗体またはフラグメントを提供するステップを含む。
i)配列番号7に示されるアミノ酸配列を有する重鎖可変領域を含む抗体またはフラグメントを提供するステップ;および
ii)ステップ(i)の抗体またはフラグメントを親和性成熟および/または最適化に供して、それにより、親和性成熟および/または最適化抗体、またはフラグメントを提供するステップを含む。
i)配列番号88に示されるアミノ酸配列を有する重鎖可変領域を含む抗体またはフラグメントを提供するステップ;および
ii)ステップ(i)の抗体またはフラグメントを親和性成熟および/または最適化に供して、それにより、親和性成熟および/または最適化抗体またはフラグメントを提供するステップを含む。
i)配列番号106に示されるアミノ酸配列を有する重鎖可変領域を含む抗体またはフラグメントを提供するステップ;および
ii)ステップ(i)の抗体またはフラグメントを親和性成熟および/または最適化に供して、それにより、親和性成熟および/または最適化抗体またはフラグメントを提供するステップを含む。
この国際出願は、2019年1月30日に出願された米国仮出願番号62/798,927の利益および優先権を主張し、その内容は全体で参照により本明細書中に明白に援用される。
[配列表]
本出願はASCII形式で電子的に提出された配列表を含み、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。2020年5月13日に作成された当該ASCIIコピーは127036-03020_SL.txtという名称で、サイズは376,831バイトである。
a)アミノ酸配列FTFRSYVMH(配列番号166)を含んでいるCDR-H1;
b)アミノ酸配列VISHEGS(X1)KYYADSVKGを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はLまたはGである(配列番号366);および
c)アミノ酸配列A(X1)PRIAARRGGFG(X2)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はV、RまたはLであり、X2はY、SまたはTである(配列番号367);
d)アミノ酸配列TRS(X1)G(X2)ID(X3)NYVQを含んでいるCDR-L1であって、ここで、X1はSまたはHであり、X2はN、L、SまたはAであり、X3はN、DまたはYである(配列番号368);
e)アミノ酸配列ED(X1)(X2)RPSを含んでいるCDR-L2であって、ここで、X1はN、FまたはAであり、X2はQ、IまたはVである(配列番号369);および
f)アミノ酸配列Q(X1)YD(X2)(X3)(X4)Q(X5)VVを含んでいるCDR-L3であって、ここで、X1はSまたはGであり、X2はS、F、Y、D、HまたはWであり、X3はN、DまたはSであり、X4はN、A、L、EまたはTであり、X5はG、R、AまたはLである(配列番号370)。
a)アミノ酸配列GSIRSSSYYWG(配列番号292)を含んでいるCDR-H1;
b)アミノ酸配列SISYSATTYY(配列番号293)を含んでいるCDR-H2;
c)アミノ酸配列A(X1)DPSYDS(X2)AGM(X3)Vを含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はSまたはGであり、X2はAまたはIであり、X3はDまたはQである(配列番号371);
d)アミノ酸配列RAS(X1)(X2)IS(X3)YLNを含んでいるCDR-L1であって、ここで、X1はKまたはQであり、X2はVまたはSであり、X3はSまたはYである(配列番号389);
e)アミノ酸配列(X1)AS(X2)(X3)QSを含んでいるCDR-L2であって、ここで、X1はY、AまたはSであり、X2はSまたはNであり、X3はLまたはRである(配列番号390);
f)アミノ酸配列QQ(X1)(X2)D(X3)P(X4)Tを含んでいるCDR-L3であって、ここで、X1はSまたはGであり、X2はFまたはNであり、X3はWまたはFであり、X4はFまたはLである(配列番号391)。
a)以下の条件で、CDR-H1:配列番号94(以下の置換を含む配列番号94は、配列番号399として開示される)
i.配列番号94の2位のトレオニン残基は、アラニンで置換されてもよい;
ii.配列番号94の4位のアスパラギン残基は、アラニン、チロシン、アスパラギン酸、セリン、アルギニン、またはヒスチジンで置換されてもよい;
iii.配列番号94の5位のアスパラギン残基は、グルタミン、セリン、グリシン、リジン、グルタミン酸、アルギニン、またはヒスチジンで置換されてもよい;
iv.配列番号94の6位のチロシン残基は、アルギニンで置換されてもよい;
v.配列番号94の7位のプロリン残基は、グリシン、アラニン、ロイシン、セリン、アスパラギン、バリン、アスパラギン酸、またはグルタミンで置換されてもよい;
vi.配列番号94の8位のイソロイシン残基は、メチオニンまたはロイシンで置換されてもよい;および/または、
vii.配列番号94の9位のヒスチジン残基は、フェニルアラニン、チロシン、アスパラギン、またはセリンで置換されてもよい;
b)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H2:配列番号95;および
c)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H3:配列番号96。
a)以下の条件で、CDR-H1:配列番号94(以下の置換を含む配列番号94は、配列番号399として開示される)
i.配列番号94の2位のトレオニン残基は、アラニンで置換されてもよい;
ii.配列番号94の4位のアスパラギン残基は、アラニン、チロシン、アスパラギン酸、セリン、アルギニン、またはヒスチジンで置換されてもよい;
iii.配列番号94の5位のアスパラギン残基は、グルタミン、セリン、グリシン、リジン、グルタミン酸、アルギニン、またはヒスチジンで置換されてもよい;
iv.配列番号94の6位のチロシン残基は、アルギニンで置換されてもよい;
v.配列番号94の7位のプロリン残基は、グリシン、アラニン、ロイシン、セリン、アスパラギン、バリン、アスパラギン酸、またはグルタミンで置換されてもよい;
vi.配列番号94の8位のイソロイシン残基は、メチオニンまたはロイシンで置換されてもよい;および/または、
vii.配列番号94の9位のヒスチジン残基は、フェニルアラニン、チロシン、アスパラギン、またはセリンで置換されてもよい;
b)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H2:配列番号95;
c)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H3:配列番号96;
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L1:配列番号97;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L2:配列番号98;および、
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L3:配列番号99。
a)以下の条件で、CDR-H1:配列番号94(以下の置換を含む配列番号94は、配列番号399として開示される)
i.配列番号94の2位のトレオニン残基は、アラニンで置換されてもよい;
ii.配列番号94の4位のアスパラギン残基は、アラニン、チロシン、アスパラギン酸、セリン、アルギニン、またはヒスチジンで置換されてもよい;
iii.配列番号94の5位のアスパラギン残基は、グルタミン、セリン、グリシン、リジン、グルタミン酸、アルギニン、またはヒスチジンで置換されてもよい;
iv.配列番号94の6位のチロシン残基は、アルギニンで置換されてもよい;
v.配列番号94の7位のプロリン残基は、グリシン、アラニン、ロイシン、セリン、アスパラギン、バリン、アスパラギン酸、またはグルタミンで置換されてもよい;
vi.配列番号94の8位のイソロイシン残基は、メチオニンまたはロイシンで置換されてもよい;および/または、
vii.配列番号94の9位のヒスチジン残基は、フェニルアラニン、チロシン、アスパラギン、またはセリンで置換されてもよい;
b)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H2:配列番号95;
c)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H3:配列番号96;
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L1:配列番号97;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L2:配列番号98;および、
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L3:配列番号99。
a)アミノ酸配列FTF(X1)(X2)YVMHを含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSまたはRであってもよく、X2はGまたはSであってもよい(配列番号392);
b)アミノ酸配列(X1)ISHEG(X2)(X3)KYYADSVKGを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はVまたはSであってもよく、X2はSまたはGであってもよく、X3はFまたはLであってもよい(配列番号393);および
c)アミノ酸配列(X1)(X2)P(X3)(X4)(X5)(X6)RRGG(X7)(X8)(X9)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はAまたはVであってもよく;X2はR、V、GまたはKであってもよく;X3はR、HまたはLであってもよく;X4はI、VまたはGであってもよく;X5はA、S、またはLであってもよく;X6はAまたはVであってもよく;X7はFまたはYであってもよく;X8はD、G、R、またはSであってもよく;X9はY、G、R、L、V、AまたはKであってもよい(配列番号394)。
a)アミノ酸配列FTF(X1)(X2)YVMHを含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSまたはRであってもよく、X2はGまたはSであってもよい(配列番号392);
b)アミノ酸配列(X1)ISHEG(X2)(X3)KYYADSVKGを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はVまたはSであってもよく、X2はSまたはGであってもよく、X3はFまたはLであってもよい(配列番号393);
c)アミノ酸配列(X1)(X2)P(X3)(X4)(X5)(X6)RRGG(X7)(X8)(X9)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はAまたはVであってもよく、X2はR、V、GまたはKであってもよく、X3はR、HまたはLであってもよく、X4はI、VまたはGであってもよく、X5はA、S、またはLであってもよく、X6はAまたはVであってもよく、X7はFまたはYであってもよく、X8はD、G、R、またはSであってもよく、X9はY、G、R、L、V、AまたはKであってもよい(配列番号394);
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号97に示されるCDR-L1;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号98に示されるCDR-L2;および
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号99に示されるCDR-L3。
a)アミノ酸配列FTF(X1)(X2)YVMHを含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSまたはRであってもよく、X2はGまたはSであってもよい(配列番号392);
b)アミノ酸配列(X1)ISHEG(X2)(X3)KYYADSVKGを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はVまたはSであってもよく、X2はSまたはGであってもよく、X3はFまたはLであってもよい(配列番号393);
c)アミノ酸配列(X1)(X2)P(X3)(X4)(X5)(X6)RRGG(X7)(X8)(X9)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はAまたはVであってもよく、X2はR、V、GまたはKであってもよく、X3はR、HまたはLであってもよく、X4はI、VまたはGであってもよく、X5はA、S、またはLであってもよく、X6はAまたはVであってもよく、X7はFまたはYであってもよく、X8はD、G、R、またはSであってもよく、X9はY、G、R、L、V、AまたはKであってもよい(配列番号394);
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号97に示されるCDR-L1;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号98に示されるCDR-L2;および
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号99に示されるCDR-L3。
a)アミノ酸配列FTF(X1)(X2)YVMHを含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSまたはRであってもよく、X2はGまたはSであってもよい(配列番号392);
b)アミノ酸配列(X1)ISHEGS(X2)KYYADSVKGを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はVまたはSであってもよく;X2はFまたはLであってもよい(配列番号382);および
c)アミノ酸配列A(X1)PRI(X2)ARRGGFGYを含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はRまたはVであってもよく;X2はAまたはLであってもよい(配列番号383)。
a)アミノ酸配列FTF(X1)(X2)YVMHを含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSまたはRであってもよく、X2はGまたはSであってもよい(配列番号392);
b)アミノ酸配列(X1)ISHEGS(X2)KYYADSVKGを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はVまたはSであってもよく;X2はFまたはLであってもよい(配列番号382);
c)アミノ酸配列A(X1)PRI(X2)ARRGGFGYを含んでいるCDR-であって、ここで、X1はRまたはVであってもよく;X2はAまたはLであってもよい(配列番号383);
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号97に示されるCDR-L1;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号98に示されるCDR-L2;および
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号99に示されるCDR-L3。
a)アミノ酸配列FTF(X1)(X2)YVMHを含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSまたはRであってもよく、X2はGまたはSであってもよい(配列番号392);
b)アミノ酸配列(X1)ISHEGS(X2)KYYADSVKGを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はVまたはSであり;X2はFまたはLである(配列番号382);
c)アミノ酸配列A(X1)PRI(X2)ARRGGFGYを含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はRまたはVであってもよく;X2はAまたはLであってもよい(配列番号383);
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号97に示されるCDR-L1;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号98に示されるCDR-L2;および
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号99に示されるCDR-L3。
a)以下の条件で、CDR-H1:配列番号100(以下の置換を含む配列番号100は、配列番号400として開示される)
i.配列番号100の4位のセリン残基はヒスチジンで置換されてもよい;
ii.配列番号100の7位のセリン残基はアラニンまたはグリシンで置換されてもよい;および/または、
iii.配列番号100の11位のグリシン残基はトレオニン、セリン、ヒスチジン、ロイシン、イソロイシン、アスパラギン、バリン、またはアラニンで置換されてもよい;
b)以下の条件で、CDR-H2:配列番号101(以下の置換を含む配列番号101は、配列番号401として開示される)
i.配列番号101の3位のセリン残基はアラニンで置換されてもよい;
ii.配列番号101の6位のグリシン残基はアラニンまたはセリンで置換されてもよい;および/または、
iii.配列番号101の7位のセリン残基はトレオニンで置換されてもよい;および
c)3、4、5または6個までのアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H3:配列番号102。
a)以下の条件で、CDR-H1:配列番号100(以下の置換を含む配列番号100は、配列番号400として開示される)
i.配列番号100の4位のセリン残基はヒスチジンで置換されてもよい;
ii.配列番号100の7位のセリン残基はアラニンまたはグリシンで置換されてもよい;および/または、
iii.配列番号100の11位のグリシン残基はトレオニン、セリン、ヒスチジン、ロイシン、イソロイシン、アスパラギン、バリン、またはアラニンで置換されてもよい;
b)以下の条件で、CDR-H2:配列番号101(以下の置換を含む配列番号101は、配列番号401として開示される)
i.配列番号101の3位のセリン残基はアラニンで置換されてもよい;
ii.配列番号101の6位のグリシン残基はアラニンまたはセリンで置換されてもよい;および/または、
iii.配列番号101の7位のセリン残基はトレオニンで置換されてもよい;および
c)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H3:配列番号102.
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L1:配列番号103;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L2:配列番号104;および、
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L3:配列番号105。
a)以下の条件で、CDR-H1:配列番号100(以下の置換を含む配列番号100は、配列番号400として開示される)
i.配列番号100の4位のセリン残基はヒスチジンで置換されてもよい;
ii.配列番号100の7位のセリン残基はアラニンまたはグリシンで置換されてもよい;および/または、
iii.配列番号100の11位のグリシン残基はトレオニン、セリン、ヒスチジン、ロイシン、イソロイシン、アスパラギン、バリン、またはアラニンで置換されてもよい;
b)以下の条件で、CDR-H2:配列番号101(以下の置換を含む配列番号101は、配列番号401として開示される)
i.配列番号101の3位のセリン残基はアラニンで置換されてもよい;
ii.配列番号101の6位のグリシン残基はアラニンまたはセリンで置換されてもよい;および/または、
iii.配列番号101の7位のセリン残基はトレオニンで置換されてもよい;
c)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H3:配列番号102;
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L1:配列番号103;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L2:配列番号104;および、
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L3:配列番号105。
a)アミノ酸配列G(X1)I(X2)S(X3)SYYW(X4)を含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSまたはPであってもよく、X2はS、HまたはRであってもよく、X3はSまたはGであってもよく、X4はG、I、NまたはVであってもよい(配列番号395);
b)アミノ酸配列SISYSA(X1)TYYNPSLKSを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はSまたはTであってもよい(配列番号396);および
c)アミノ酸配列(X1)(X2)D(X3)(X4)Y(X5)(X6)(X7)(X8)G(X9)(X10)(X11)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はAまたはVであってもよく;X2はR、SまたはGであってもよく、X3はP、Y、R、V、I、H、TまたはEであってもよく;X4はS、D、EまたはNであってもよく;X5はD、AまたはTであってもよく;X6はS、G、TまたはAであってもよく;X7はI、A、R、Q、またはVであってもよく;X8はA、E、K、GまたはTであってもよく;X9はMまたはIであってもよく;X10はD、L、Q、V、NまたはGであってもよく;X11はV、R、N、EまたはKであってもよい(配列番号397)。
a)アミノ酸配列G(X1)I(X2)S(X3)SYYW(X4)を含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSまたはPであってもよく、X2はS、HまたはRであってもよく、X3はSまたはGであってもよく、X4はG、I、NまたはVであってもよい(配列番号395);
b)アミノ酸配列SISYSA(X1)TYYNPSLKSを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はSまたはTであってもよい(配列番号396);
c)アミノ酸配列(X1)(X2)D(X3)(X4)Y(X5)(X6)(X7)(X8)G(X9)(X10)(X11)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はAまたはVであってもよく;X2はR、SまたはGであってもよく、X3はP、Y、R、V、I、H、TまたはEであってもよく;X4はS、D、EまたはNであってもよく;X5はD、AまたはTであってもよく;X6はS、G、TまたはAであってもよく;X7はI、A、R、Q、またはVであってもよく;X8はA、E、K、GまたはTであってもよく;X9はMまたはIであってもよく;X10はD、L、Q、V、NまたはGであってもよく;X11はV、R、N、EまたはKであってもよい(配列番号397);
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L1:配列番号103;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L2:配列番号104;および
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L3:配列番号105。
a)アミノ酸配列G(X1)I(X2)S(X3)SYYW(X4)を含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSまたはPであってもよく、X2はS、HまたはRであってもよく、X3はSまたはGであってもよく、X4はG、I、NまたはVであってもよい(配列番号395);
b)アミノ酸配列SISYSA(X1)TYYNPSLKSを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はSまたはTであってもよい(配列番号396);
c)アミノ酸配列(X1)(X2)D(X3)(X4)Y(X5)(X6)(X7)(X8)G(X9)(X10)(X11)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はAまたはVであってもよく、X2はR、SまたはGであってもよく、X3はP、Y、R、V、I、H、TまたはEであってもよく、X4はS、D、EまたはNであってもよく、X5はD、AまたはTであってもよく、X6はS、G、TまたはAであってもよく、X7はI、A、R、Q、またはVであってもよく、X8はA、E、K、GまたはTであってもよく、X9はMまたはIであってもよく、X10はD、L、Q、V、NまたはGであってもよく、X11はV、R、N、EまたはKであってもよい(配列番号397);
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号103に示されるCDR-L1;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号104に示されるCDR-L2;および
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号105に示されるCDR-L3。
a)アミノ酸配列G(X1)I(X2)SSSYYW(X3)を含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSまたはPであってもよく;X2はHまたはRであってもよく;X3はG、IまたはNであってもよい(配列番号384);
b)アミノ酸配列SISYSA(X1)TYYNPSLKSを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はSまたはTであってもよい(配列番号396);および
c)アミノ酸配列A(X1)D(X2)SYD(X3)(X4)AGM(X5)(X6)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はR、SまたはGであってもよく、X2はPまたはVであってもよく、X3はSまたはAであってもよく、X4はA、R、IまたはVであってもよく、X5はD、Q、またはGであってもよく、X6はVまたはRであってもよい(配列番号385)。
a)アミノ酸配列G(X1)I(X2)SSSYYW(X3)を含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSまたはPであってもよく;X2はHまたはRであってもよく;X3はG、IまたはNであってもよい(配列番号384);
b)アミノ酸配列SISYSA(X1)TYYNPSLKSを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はSまたはTであってもよい(配列番号396);
c)アミノ酸配列A(X1)D(X2)SYD(X3)(X4)AGM(X5)(X6)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はR、SまたはGであってもよく、X2はPまたはVであってもよく、X3はSまたはAであってもよく、X4はA、R、IまたはVであってもよく、X5はD、Q、またはGであってもよく、X6はVまたはRであってもよい(配列番号385);
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L1:配列番号103;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L2:配列番号104;および
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L3:配列番号105。
a)アミノ酸配列G(X1)I(X2)SSSYYW(X3)を含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSまたはPであってもよく;X2はHまたはRであってもよく;X3はG、IまたはNであってもよい(配列番号384);
b)アミノ酸配列SISYSA(X1)TYYNPSLKSを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はSまたはTであってもよい(配列番号396);
c)アミノ酸配列A(X1)D(X2)SYD(X3)(X4)AGM(X5)(X6)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はR、SまたはGであってもよく、X2はPまたはVであってもよく、X3はSまたはAであってもよく、X4はA、R、IまたはVであってもよく、X5はD、Q、またはGであってもよく、X6はVまたはRであってもよい(配列番号385);
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L1:配列番号103;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L2:配列番号104;および
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L3:配列番号105。
a)アミノ酸配列FTFRSYVMHを含んでいるCDR-H1(配列番号166);
b)アミノ酸配列VISHEGS(X1)KYYADSVKGを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はLまたはGである(配列番号366);および
c)アミノ酸配列A(X1)PRIAARRGGFG(X2)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はV、RまたはLであり、X2はY、SまたはTである(配列番号367);
d)アミノ酸配列TRS(X1)G(X2)ID(X3)NYVQを含んでいるCDR-L1であって、ここで、X1はSまたはHであり、X2はN、L、SまたはAであり、X3はN、DまたはYである(配列番号368);
e)アミノ酸配列ED(X1)(X2)RPSを含んでいるCDR-L2であって、ここで、X1はN、FまたはAであり、X2はQ、IまたはVである(配列番号369);および
f)アミノ酸配列Q(X1)YD(X2)(X3)(X4)Q(X5)VVを含んでいるCDR-L3であって、ここで、X1はSまたはGであり、X2はS、F、Y、D、HまたはWであり、X3はN、DまたはSであり、X4はN、A、L、EまたはTであり、X5はG、R、AまたはLである(配列番号370)。
a)アミノ酸配列G(X1)I(X2)S(X3)SYYW(X4)を含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSであってもよく、X2はS、HまたはRであってもよく、X3はSまたはGであってもよく、X4はG、I、NまたはVであってもよい(配列番号386);
b)アミノ酸配列SISYS(X1)(X2)TYYを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はGまたはAであってもよく、X2はSまたはTであってもよい(配列番号398);
c)アミノ酸配列A(X1)DPSYDS(X2)AGM(X3)Vを含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はR、SまたはGであってもよく、X2はAまたはIであってもよく、X3はDまたはQであってもよい(配列番号387);
d)アミノ酸配列RAS(X1)(X2)IS(X3)YLNを含んでいるCDR-L1であって、ここで、X1はKまたはQであってもよく、X2はVまたはSであってもよく、X3はSまたはYであってもよい(配列番号389);
e)アミノ酸配列(X1)AS(X2)(X3)QSを含んでいるCDR-L2であって、ここで、X1はY、AまたはSであってもよく、X2はSまたはNであってもよく、X3はLまたはRであってもよい(配列番号390);
f)アミノ酸配列QQ(X1)(X2)D(X3)P(X4)Tを含んでいるCDR-L3であって、ここで、X1はSまたはGであってもよく、X2はFまたはNであってもよく、X3はWまたはFであってもよく、X4はFまたはLであってもよい(配列番号391)。
a)以下の条件で、CDR-H1:配列番号94(以下の置換を含む配列番号94は、配列番号399として開示される):
i.配列番号94の2位のトレオニン残基は、アラニンで置換されてもよい;
ii.配列番号94の4位のアスパラギン残基は、アラニン、チロシン、アスパラギン酸、セリン、アルギニン、またはヒスチジンで置換されてもよい;
iii.配列番号94の5位のアスパラギン残基は、グルタミン、セリン、グリシン、リジン、グルタミン酸、アルギニン、またはヒスチジンで置換されてもよい;
iv.配列番号94の6位のチロシン残基は、アルギニンで置換されてもよい;
v.配列番号94の7位のプロリン残基は、グリシン、アラニン、ロイシン、セリン、アスパラギン、バリン、アスパラギン酸、またはグルタミンで置換されてもよい;
vi.配列番号94の8位のイソロイシン残基は、メチオニンまたはロイシンで置換されてもよい;および/または、
vii.配列番号94の9位のヒスチジン残基は、フェニルアラニン、チロシン、アスパラギン、またはセリンで置換されてもよい;
b)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H2:配列番号95;
c)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H3:配列番号96;
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L1:配列番号97;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L2:配列番号98;および、
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L3:配列番号99
のうちの少なくとも3個を含む、抗体、またはその抗原結合フラグメント。
a)アミノ酸配列FTF(X1)(X2)YVMHを含んでいるCDR-H1であって、X1はSまたはRであってもよく、X2はGまたはSであってもよい(配列番号392);
b)アミノ酸配列(X1)ISHEG(X2)(X3)KYYADSVKGを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はVまたはSであってもよく、X2はSまたはGであってもよく、X3はFまたはLであってもよい(配列番号393);および
c)アミノ酸配列(X1)(X2)P(X3)(X4)(X5)(X6)RRGG(X7)(X8)(X9)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はAまたはVであってもよく、X2はR、V、GまたはKであってもよく、X3はR、HまたはLであってもよく、X4はI、VまたはGであってもよく、X5はA、S、またはLであってもよく、X6はAまたはVであってもよく、X7はFまたはYであってもよく、X8はD、G、R、またはSであってもよく、X9はY、G、R、L、V、AまたはKであってもよい(配列番号394)
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号97に示されるCDR-L1;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号98に示されるCDR-L2;および
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、配列番号99に示されるCDR-L3
のうちの少なくとも3個を含む。
a)以下の条件で、CDR-H1:配列番号100(以下の置換を含む配列番号100は、配列番号400として開示される):
i.配列番号100の4位のセリン残基はヒスチジンで置換されてもよい;
ii.配列番号100の7位のセリン残基はアラニンまたはグリシンで置換されてもよい;および/または、
iii.配列番号100の11位のグリシン残基はトレオニン、セリン、ヒスチジン、ロイシン、イソロイシン、アスパラギン、バリン、またはアラニンで置換されてもよい;
b)以下の条件で、CDR-H2:配列番号101(以下の置換を含む配列番号101は、配列番号401として開示される):
i.配列番号101の3位のセリン残基はアラニンで置換されてもよい;
ii.配列番号101の6位のグリシン残基はアラニンまたはセリンで置換されてもよい;および/または、
iii.配列番号101の7位のセリン残基はトレオニンで置換されてもよい;
c)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H3:配列番号102;
d)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L1:配列番号103;
e)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L2:配列番号104;および、
f)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L3:配列番号105
のうちの少なくとも3個を含む。
g)アミノ酸配列G(X1)I(X2)S(X3)SYYW(X4)を含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSまたはPであってもよく、X2はS、HまたはRであってもよく、X3はSまたはGであってもよく、X4はG、I、NまたはVであってもよい(配列番号395);
h)アミノ酸配列SISYSA(X1)TYYNPSLKSを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はSまたはTであってもよい(配列番号396);
i)アミノ酸配列(X1)(X2)D(X3)(X4)Y(X5)(X6)(X7)(X8)G(X9)(X10)(X11)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はAまたはVであってもよく、X2はR、SまたはGであってもよく、X3はP、Y、R、V、I、H、TまたはEであってもよく、X4はS、D、EまたはNであってもよく、X5はD、AまたはTであってもよく、X6はS、G、TまたはAであってもよく、X7はI、A、R、Q、またはVであってもよく、X8はA、E、K、GまたはTであってもよく、X9はMまたはIであってもよく、X10はD、L、Q、V、NまたはGであってもよく、X11はV、R、N、EまたはKであってもよい(配列番号397);
j)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L1:配列番号103;
k)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L2:配列番号104;および
l)1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L3:配列番号105
のうちの少なくとも3個を含む。
a)アミノ酸配列FTFRSYVMH(配列番号166)を含んでいるCDR-H1;
b)アミノ酸配列VISHEGS(X1)KYYADSVKGを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はLまたはGである(配列番号366);および
c)アミノ酸配列A(X1)PRIAARRGGFG(X2)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はV、RまたはLであり、X2はY、SまたはTである(配列番号367);
d)アミノ酸配列TRS(X1)G(X2)ID(X3)NYVQを含んでいるCDR-L1であって、ここで、X1はSまたはHであり、X2はN、L、SまたはAであり、X3はN、DまたはYである(配列番号368);
e)アミノ酸配列ED(X1)(X2)RPSを含んでいるCDR-L2であって、ここで、X1はN、FまたはAであり、X2はQ、IまたはVである(配列番号369);および
f)アミノ酸配列Q(X1)YD(X2)(X3)(X4)Q(X5)VVを含んでいるCDR-L3であって、ここで、X1はSまたはGであり、X2はS、F、Y、D、HまたはWであり、X3はN、DまたはSであり、X4はN、A、L、EまたはTであり、X5はG、R、AまたはLである(配列番号370)
を含む、抗体、またはその抗原結合フラグメント。
g)アミノ酸配列G(X1)I(X2)S(X3)SYYW(X4)を含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSであってもよく、X2はS、HまたはRであってもよく、X3はSまたはGであってもよく、X4はG、I、NまたはVであってもよい(配列番号386);
h)アミノ酸配列SISYS(X1)(X2)TYYを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はGまたはAであってもよく、X2はSまたはTであってもよい(配列番号398);
i)アミノ酸配列A(X1)DPSYDS(X2)AGM(X3)Vを含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はR、SまたはGであってもよく、X2はAまたはIであってもよく、X3はDまたはQであってもよい(配列番号387);
j)アミノ酸配列RAS(X1)(X2)IS(X3)YLNを含んでいるCDR-L1であって、ここで、X1はKまたはQであってもよく、X2はVまたはSであってもよく、X3はSまたはYであってもよい(配列番号389);
k)アミノ酸配列(X1)AS(X2)(X3)QSを含んでいるCDR-L2であって、ここで、X1はY、AまたはSであってもよく、X2はSまたはNであってもよく、X3はLまたはRであってもよい(配列番号390);
l)アミノ酸配列QQ(X1)(X2)D(X3)P(X4)Tを含んでいるCDR-L3であって、ここで、X1はSまたはGであってもよく、X2はFまたはNであってもよく、X3はWまたはFであってもよく、X4はFまたはLであってもよい(配列番号391)、
を含む、抗体、またはその抗原結合フラグメント。
a)CDR-H1は、アミノ酸配列GSIRSSSYYWG(配列番号292)を含む;
b)CDR-H2は、アミノ酸配列SISYSATTYY(配列番号293)を含む;
c)CDR-H3において、X1はSまたはGであり、X2はAまたはIであり、X3はDまたはQである;
d)CDR-L1において、X1はKまたはQであり、X2はVまたはSであり、X3はSまたはYである;
e)CDR-L2において、X1はY、AまたはSであり、X2はSまたはNであり、X3はLまたはRである;および
f)CDR-L3において、X1はSまたはGであり、X2はFまたはNであり、X3はWまたはFであり、X4はFまたはLである。
a)以下の可変重鎖および/または可変軽鎖配列またはそれらの変異体を含む:
i)可変重鎖配列
QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFRSYVMHWVRQAPGKGLEWVAVISHEGSLKYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAVPRIAARRGGFGYWGQGTLVTVSS(配列番号114)
または
QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFRSYVMHWVRQAPGKGLEWVAVISHEGSLKYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARPRIAARRGGFGYWGQGTLVTVSS(配列番号318)
ここで変異体は、対応する可変重鎖配列と少なくとも85%同一、90%同一、または95%同一であってもよい。
ii)可変軽鎖配列
NFMLTQPHSVSESPGKTVTISCTRSSGNIDNNYVQWYQQRPGSSPTTVIYEDNQRPSGVPDRFSGSIDSSSNSASLTISGLKTEDEADYYCQSYDSDNQGVVFGGGTKLTVL(配列番号89)
または
NFMLTQPHSVSESPGKTVTISCTRSSGNIDNNYVQWYQQRPGSSPTTVIYEDNQRPSGVPDRFSGSIDSSSNSASLTISGLKTEDEADYYCQSYDSDNQGVVFGGGTKLTVL(配列番号89)
ここで変異体は、対応する可変軽鎖配列と少なくとも85%同一、90%同一、または95%同一であってもよい;
b)以下の可変重鎖CDR配列またはそれらの変異体を有する:
i)FTFRSYVMH(配列番号166)のCDR-H1であって、1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい;
ii)VISHEGSLKYYADSVKG(配列番号167)のCDR-H2であって、1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい;および/または;
iii)AVPRIAARRGGFGY(配列番号110)またはARPRIAARRGGFGY(配列番号168)のCDR-H3であって、1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい;および/または;
c)以下の可変軽鎖CDR配列またはそれらの変異体を有する:
i)TRSSGNIDNNYVQ(配列番号169)のCDR1-L1であって、1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい;
ii)EDNQRPS(配列番号170)のCDR-L2であって、1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい;および/または;
iii)QSYDSDNQGVV(配列番号113)のCDR-L3であって、1つまたは複数のアミノ酸変更を含んでもよい。
その抗体は、成熟TGFβ1、成熟TGFβ2または成熟TGFβ3に結合せず、
その抗体は、完全ヒトまたはヒト化抗体、またはその抗原結合フラグメントであり、
その抗体は、以下の6個のCDR:
a)以下の条件で、CDR-H1:配列番号100(以下の置換を含む配列番号100は、配列番号400として開示される):
i.配列番号100の4位のセリン残基はヒスチジンで置換されてもよい;
ii.配列番号100の7位のセリン残基はアラニンまたはグリシンで置換されてもよい;および/または、
iii.配列番号100の11位のグリシン残基はトレオニン、セリン、ヒスチジン、ロイシン、イソロイシン、アスパラギン、バリン、またはアラニンで置換されてもよい;
b)以下の条件で、CDR-H2:配列番号101(以下の置換を含む配列番号101は、配列番号401として開示される):
i.配列番号101の3位のセリン残基はアラニンで置換されてもよい;
ii.配列番号101の6位のグリシン残基はアラニンまたはセリンで置換されてもよい;および/または、
iii.配列番号101の7位のセリン残基はトレオニンで置換されてもよい;
c)3個までのアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H3:配列番号102;
d)3個までのアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L1:配列番号103;
e)3個までのアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L2:配列番号104;および、
f)3個までのアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L3:配列番号105
のうちの少なくとも3個を含む。
その抗体は、成熟TGFβ1、成熟TGFβ2または成熟TGFβ3に結合せず、
その抗体は、完全ヒトまたはヒト化抗体、またはその抗原結合フラグメントであり、
ここで抗体は、以下の6個のCDR:
a)以下の条件で、CDR-H1:配列番号94(以下の置換を含む配列番号94は、配列番号399として開示される):
i.配列番号94の2位のトレオニン残基は、アラニンで置換されてもよい;
ii.配列番号94の4位のアスパラギン残基は、アラニン、チロシン、アスパラギン酸、セリン、アルギニン、またはヒスチジンで置換されてもよい;
iii.配列番号94の5位のアスパラギン残基は、グルタミン、セリン、グリシン、リジン、グルタミン酸、アルギニン、またはヒスチジンで置換されてもよい;
iv.配列番号94の6位のチロシン残基は、アルギニンで置換されてもよい;
v.配列番号94の7位のプロリン残基は、グリシン、アラニン、ロイシン、セリン、アスパラギン、バリン、アスパラギン酸、またはグルタミンで置換されてもよい;
vi.配列番号94の8位のイソロイシン残基は、メチオニンまたはロイシンで置換されてもよい;および/または、
vii.配列番号94の9位のヒスチジン残基は、フェニルアラニン、チロシン、アスパラギン、またはセリンで置換されてもよい;
b)6個までのアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H2:配列番号95;
c)3個までのアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-H3:配列番号96;
d)3個までのアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L1:配列番号97;
e)3個までのアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L2:配列番号98;および、
f)3個までのアミノ酸変更を含んでもよい、CDR-L3:配列番号99
のうちの少なくとも3個を含む。
Claims (59)
- ヒトLTBP1-proTGFβ複合体および/またはヒトLTBP3-proTGFβ複合体に特異的に結合し、ヒトGARP-proTGFβ複合体には結合しない、単離された抗体であって、
前記抗体は、成熟TGFβ1、成熟TGFβ2または成熟TGFβ3に結合せず、
前記抗体は、完全ヒトまたはヒト化抗体、またはその抗原結合フラグメントであり、
前記抗体は、以下の6個のCDR:
a)以下の条件で、CDR-H1:配列番号94:
i.配列番号94の2位のトレオニン残基は、アラニンで置換されてもよい;
ii.配列番号94の4位のアスパラギン残基は、アラニン、チロシン、アスパラギン酸、セリン、アルギニン、またはヒスチジンで置換されてもよい;
iii.配列番号94の5位のアスパラギン残基は、グルタミン、セリン、グリシン、リジン、グルタミン酸、アルギニン、またはヒスチジンで置換されてもよい;
iv.配列番号94の6位のチロシン残基は、アルギニンで置換されてもよい;
v.配列番号94の7位のプロリン残基は、グリシン、アラニン、ロイシン、セリン、アスパラギン、バリン、アスパラギン酸、またはグルタミンで置換されてもよい;
vi.配列番号94の8位のイソロイシン残基は、メチオニンまたはロイシンで置換されてもよい;および/または、
vii.配列番号94の9位のヒスチジン残基は、フェニルアラニン、チロシン、アスパラギン、またはセリンで置換されてもよい;
b)6個までのアミノ酸変更を含む、CDR-H2:配列番号95;
c)3個までのアミノ酸変更を含む、CDR-H3:配列番号96;
d)3個までのアミノ酸変更を含む、CDR-L1:配列番号97;
e)3個までのアミノ酸変更を含む、CDR-L2:配列番号98;および、
f)3個までのアミノ酸変更を含む、CDR-L3:配列番号99
のうちの少なくとも3個を含む、
抗体。 - ヒトLTBP1-proTGFβ複合体および/またはヒトLTBP3-proTGFβ複合体に特異的に結合し、ヒトGARP-proTGFβ複合体には結合しない、単離された抗体であって、
前記抗体は、成熟TGFβ1、成熟TGFβ2または成熟TGFβ3に結合せず、
前記抗体は、完全ヒトまたはヒト化抗体、またはその抗原結合フラグメントであり、
前記抗体は、配列番号88と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を有する重鎖可変領域を含む;および/または、
前記抗体は、配列番号89と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を有する可変の軽鎖可変領域を含む、
抗体。 - 以下の6個のCDR:
a)アミノ酸配列FTF(X1)(X2)YVMHを含んでいるCDR-H1であって、ここで、X1はSまたはRであり、X2はGまたはSである;
b)アミノ酸配列(X1)ISHEG(X2)(X3)KYYADSVKGを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はVまたはSであり、X2はSまたはGであり、X3はFまたはLである;および
c)アミノ酸配列(X1)(X2)P(X3)(X4)(X5)(X6)RRGG(X7)(X8)(X9)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はAまたはVであり、X2はR、V、GまたはKであり、X3はR、HまたはLであり、X4はI、VまたはGであり、X5はA、S、またはLであり、X6はAまたはVであり、X7はFまたはYであり、X8はD、G、R、またはSであり、X9はY、G、R、L、V、AまたはKである
d)3個までのアミノ酸変更を含む、配列番号97に示されるCDR-L1;
e)3個までのアミノ酸変更を含む、配列番号98に示されるCDR-L2;および
f)3個までのアミノ酸変更を含む、配列番号99に示されるCDR-L3
のうちの少なくとも3個を含む、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 請求項3に記載の抗体、またはその抗原結合フラグメントであって、
b)CDR-H2において、X2はSであり;および
c)CDR-H3において、X1はAであり、X2はRまたはVであり、X3はRであり、X4はIであり、X5はAまたはLであり、X6はAであり、X7はFであり、X8はGであり、X9はYである、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 請求項1から4のいずれか一項に記載の抗体であって、
前記抗体は、配列番号88と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を有する重鎖可変領域;および
配列番号89と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域を含む、
抗体。 - 請求項3から5のいずれか一項に記載の抗体、またはその抗原結合フラグメントであって、
前記の3個までのアミノ酸変更は、2個までのアミノ酸変更を含む、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 先行する請求項のいずれか一項に記載の抗体、またはその抗原結合フラグメントであって、
6個のCDR全てを含む、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 先行する請求項のいずれか一項に記載の抗体であって、
前記抗体は、ヒトLTBP1-TGFβ1複合体に特異的である、
抗体。 - 先行する請求項のいずれか一項に記載の抗体であって、
前記抗体は、ヒトLTBP3-TGFβ1複合体に特異的である、
抗体。 - 先行する請求項のいずれか一項に記載の抗体であって、
前記抗体は、ヒトLTBP1-TGFβ1複合体およびヒトLTBP3-TGFβ1複合体に特異的である、
抗体。 - 以下の6個のCDR:
a)アミノ酸配列FTFRSYVMHを含んでいるCDR-H1;
b)アミノ酸配列VISHEGS(X1)KYYADSVKGを含んでいるCDR-H2であって、ここで、X1はLまたはGである;および
c)アミノ酸配列A(X1)PRIAARRGGFG(X2)を含んでいるCDR-H3であって、ここで、X1はV、RまたはLであり、X2はY、SまたはTである;
d)アミノ酸配列TRS(X1)G(X2)ID(X3)NYVQを含んでいるCDR-L1であって、ここで、X1はSまたはHであり、X2はN、L、SまたはAであり、X3はN、DまたはYである;
e)アミノ酸配列ED(X1)(X2)RPSを含んでいるCDR-L2であって、ここで、X1はN、FまたはAであり、X2はQ、IまたはVである;および
f)アミノ酸配列Q(X1)YD(X2)(X3)(X4)Q(X5)VVを含んでいるCDR-L3であって、ここで、X1はSまたはGであり、X2はS、F、Y、D、HまたはWであり、X3はN、DまたはSであり、X4はN、A、L、EまたはTであり、X5はG、R、AまたはLである
を含む、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 請求項11に記載の抗体、またはその抗原結合フラグメントであって、
CDR-H3において、X1はRまたはLである、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 請求項12に記載の抗体、またはその抗原結合フラグメントであって、
CDR-L3において、X2はYである、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 請求項13に記載の抗体、またはその抗原結合フラグメントであって、
CDR-L3において、X3はDであり、X4はTである、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 請求項13に記載の抗体、またはその抗原結合フラグメントであって、
CDR-L3において、X3はDであり、X4はNであり、X5はAである、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 請求項12に記載の抗体、またはその抗原結合フラグメントであって、
CDR-L1において、X1はSまたはHであり、X2はNまたはAであり、X3はN、DまたはYである;
CDR-L2において、X1はNまたはFであり、X2はQまたはVであり;および
CDR-L3において、X1はSまたはGであり、X2はS、Y、DまたはWであり、X3はDまたはSであり、X4はN、LまたはTであり、X5はG、R、AまたはLである、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 請求項16に記載の抗体、またはその抗原結合フラグメントであって、
CDR-L1において、X1はSであり、X2はNであり、X3はNまたはYであり;
CDR-L2において、X1はNであり、X2はQまたはVであり;および
CDR-L3において、X1はSまたはGであり、X2はS、YまたはWであり、X3はDであり、X4はNまたはTであり、X5はG、RまたはAである、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 請求項17に記載の抗体、またはその抗原結合フラグメントであって、
CDR-L3において、X1はSであり、X2はSまたはYであり、X3はDであり、X4はNまたはTであり、X5はG、RまたはAである、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 請求項18に記載の抗体、またはその抗原結合フラグメントであって、
CDR-L3において、X1はSであり、X2はYであり、X3はDであり、X4はNまたはTであり、X5はGまたはAである、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 請求項19に記載の抗体、またはその抗原結合フラグメントであって、
CDR-L3において、X1はSであり、X2はYであり、X3はDであり、X4はTであり、X5はGである、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 請求項16から20のいずれか一項に記載の抗体、またはその抗原結合フラグメントであって、
a)CDR-H1は配列番号166のアミノ酸配列を含み;
b)CDR-H2は配列番号167のアミノ酸配列を含み;
c)CDR-H3は配列番号168のアミノ酸配列を含み;
d)CDR-L1は配列番号169のアミノ酸配列を含み;
e)CDR-L2は配列番号170のアミノ酸配列を含み;および
f)CDR-L3は配列番号171のアミノ酸配列を含む、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 請求項11から21のいずれか一項に記載の抗体、またはその抗原結合フラグメントであって、
配列番号318と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を有する重鎖可変領域;および
配列番号319と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域を含む、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 請求項11から22のいずれか一項に記載の抗体、またはその抗原結合フラグメントであって、
配列番号318に示される重鎖可変領域配列および配列番号319に示される軽鎖可変領域配列を有する抗体と競合または交差競合する、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - ヒトLTBP1-TGFβ1複合体およびヒトLTBP3-TGFβ1複合体に選択的に結合し、配列番号318に示される重鎖可変領域配列および配列番号319に示される軽鎖可変領域配列を有する抗体と競合または交差競合する、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 請求項11から24のいずれか一項に記載の抗体、またはその抗原結合フラグメントであって、
ヒトLTBP1-proTGFβ1複合体およびヒトLTBP3-TGFβ1複合体への結合を測定するために用いられるのと同一のアッセイ条件下でBLIによって測定した場合に、ヒトGARP-proTGFβ1複合体への検出可能な結合を示さない、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 請求項11から25のいずれか一項に記載の抗体、またはその抗原結合フラグメントであって、
同一のアッセイ条件下でヒトGARP-proTGFβ1複合体に結合する場合のKDよりも少なくとも50倍低いKDでヒトLTBP1-proTGFβ1複合体および/またはヒトLTBP3-TGFβ1複合体に結合する、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 請求項11から26のいずれか一項に記載の抗体、またはその抗原結合フラグメントであって、
ヒトLTBP1-proTGFβ1複合体およびヒトLTBP3-TGFβ1複合体への結合を測定するために用いられるのと同一のアッセイ条件下でBLIによって測定した場合に、LRRC33-proTGFβ1複合体への検出可能な結合を示さない、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 請求項11から27のいずれか一項に記載の抗体、またはその抗原結合フラグメントであって、
抗体、またはその抗原結合フラグメントは、SPRによって測定した場合に、hLTBP1-proTGFβ1およびhLTBP3-proTGFβ1複合体のそれぞれについて、少なくとも45分の一価の結合半減期(half-binding-time)(t1/2)を有する、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 請求項28に記載の抗体、またはその抗原結合フラグメントであって、
SPRによって測定した場合に、hGARP-proTGFβ1およびhLRRC33-proTGFβ1複合体のそれぞれについて、5分未満の一価t1/2を有する、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 先行する請求項のいずれか一項に記載の抗体、またはその抗原結合フラグメントであって、
バイオレイヤー干渉法(BLI)によって測定した場合に、<5nMのKDでヒトLTBP1-proTGFβ1複合体およびヒトLTBP3-TGFβ1複合体に結合し、それは<1nMであってもよい、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 先行する請求項のいずれか一項に記載の抗体、またはその抗原結合フラグメントであって、
マウスLTBP1-proTGFβ1と交差反応性である、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 先行する請求項のいずれか一項に記載の抗体、またはその抗原結合フラグメントであって、
マウスLTBP3-proTGFβ1と交差反応性である、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 先行する請求項のいずれか一項に記載の抗体、またはその抗原結合フラグメントであって、
バイオレイヤー干渉法(BLI)によって測定した場合に、<10nMのKDでマウスLTBP1-proTGFβ1複合体に結合する、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 先行する請求項のいずれか一項に記載の抗体、またはその抗原結合フラグメントであって、
バイオレイヤー干渉法(BLI)によって測定した場合に、<10nMのKDでマウスLTBP3-proTGFβ1複合体に結合する、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 先行する請求項のいずれか一項に記載の抗体、またはその抗原結合フラグメントであって、
ヒトおよびミューリンLTBP1-proTGFβ1およびLTBP3-proTGFβ1複合体と、それぞれ<5nMのKDで交差反応し、またはそれは<1nMであってもよい、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 先行する請求項のいずれか一項に記載の抗体、またはその抗原結合フラグメントであって、
前記抗体はIgG4またはIgG1サブタイプであり、ここで、前記抗体はヒトIgG4サブタイプであってもよく、IgG1様ヒンジを生じさせるSerからProへの主鎖置換を含んでもよい、
抗体、またはその抗原結合フラグメント。 - 先行する請求項のいずれか一項に記載の抗体および薬学的に許容できる賦形剤を含む、
医薬組成物。 - 請求項37に記載の医薬組成物であって、
静脈内投与または皮下投与のために調製される、
医薬組成物。 - 請求項37または38の医薬組成物を含んでいる複数回投与バイアルを含む、
組成物。 - 請求項37または38の医薬組成物を含んでいる単回投与シリンジを含む組成物であって、
前記シリンジが、使い捨てシリンジであってもよい、
組成物。 - ヒト対象における線維性状態の治療のための方法での使用のための請求項37から40のいずれか一項に記載の組成物であって、
前記治療は、線維性障害を治療するのに効果的な量での前記対象への前記組成物の投与を含む、
組成物。 - 請求項41に記載の使用のための組成物であって、
前記線維性障害が臓器線維症である、
組成物。 - 請求項42に記載の使用のための組成物であって、
前記臓器線維症が進行性臓器線維症である、
組成物。 - 請求項42または43に記載の使用のための組成物であって、
前記臓器線維症は、腎線維症、肝線維症、肺線維症、心臓線維症、膵臓線維症、皮膚線維症、強皮症、筋線維症、子宮線維症および子宮内膜症からなる群より選択される、
組成物。 - 請求項44に記載の使用のための組成物であって、
前記肺線維症が特発性肺線維症(IPF)である、
組成物。 - 請求項44に記載の使用のための組成物であって、
前記対象が慢性腎疾患(CKD)を有する、
組成物。 - 請求項44に記載の使用のための組成物であって、
前記肝線維症は非アルコール性脂肪性肝炎(NASH)と関連する、
組成物。 - 請求項41から47のいずれか一項に記載の使用のための組成物であって、
前記抗体が0.1~30mg/kgの投薬量で前記対象に投与される、
組成物。 - 請求項48に記載の使用のための組成物であって、
前記抗体が、1週間に2回、1週間に1回、2週間ごとに1回、3週間ごとに1回、1ヶ月に1回、または隔月で投与される、
組成物。 - 請求項48に記載の使用のための組成物であって、
治療的レジメンは、治療の初期相(initial phase)および治療の後続相(subsequent phase)を含み、ここで前記対象は、前記初期相中に負荷用量(loading dose)を受け、その後に、前記後続相中に維持用量(maintenance dose)を受ける、
組成物。 - 請求項50に記載の使用のための組成物であって、
前記負荷用量は2~30mg/kgであり、前記維持用量は0.1~20mg/kgである、
組成物。 - 請求項50または51に記載の使用のための組成物であって、
前記負荷用量は、前記対象へ1週間に2回または1週間に1回投与される、
組成物。 - 請求項50から52のいずれか一項に記載の使用のための組成物であって、
前記維持用量は、前記対象へ2~8週間ごとに1回投与される、
組成物。 - 請求項41から53のいずれか一項に記載の使用のための組成物であって、
前記方法は、前記対象から回収された生物学的サンプルにおけるTGFβ1、LTBP1またはLTBP3の発現を試験または確認するステップをさらに含む、
組成物。 - ヒトLTBP1-proTGFβ複合体および/またはヒトLTBP3-proTGFβ複合体に特異的に結合する抗体、またはその抗原結合フラグメントを含む、請求項37から40のいずれか一項の組成物を作製するための方法であって、
前記方法は、
i)少なくとも45分のt1/2でヒトLTBP1-proTGFβ複合体および/またはヒトLTBP3-proTGFβ複合体から解離する抗体またはその抗原結合フラグメントを選択するステップ、および、
ii)前記抗体またはフラグメントを医薬組成物に処方して、それにより、前記抗体またはフラグメントを含む組成物を作製するステップ、
を含む、
方法。 - 請求項55の方法であって、
細胞に基づくアッセイによって測定した場合に、<5nMのIC50を有する抗体または抗原結合フラグメントを選択するステップをさらに含み、それは<2nMであってもよい、
方法。 - 請求項55または56の方法であって、
インビボ前臨床モデルにおける有効性を確認するステップをさらに含み、
ここで前記前臨床モデルは、肝線維症モデル、腎線維症モデル、または心臓線維症モデルであってもよい、
方法。 - 請求項55から57のいずれか一項の方法であって、
前記方法は、ヒトおよび齧歯類の抗原に対して交差反応性である抗体またはフラグメントを選択するステップをさらに含む、
方法。 - 請求項55から58のいずれか一項の方法であって、
前記方法は、抗体の第1のプールおよび抗体の第2のプール内に存在する抗体またはフラグメントを親和性成熟および/または最適化に供して、それにより親和性成熟および/または最適化抗体またはフラグメントを提供するステップをさらに含む、
方法。
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