JP2022523742A - 二環式ピリジン組成物およびがんの治療にそれを使用する方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は2019年2月1日に出願された米国仮出願第62/800,239号の優先権の利益を主張するものであり、その内容は参照により全体が本明細書に組み込まれる。
がんとは別に、CDK8/19阻害剤は炎症関連疾患(米国特許出願公開第2014/0309224号、Porter,D.C.;Johnannessen, L., et al., Nat Chem Biol 2017, 13, 1102-1108);心血管系疾患(Hall, D., et al., JCI Insight 2017, 2;国際公開第2016/100782号、Roninson,I.B.);リボソーム病;造血幹細胞および/または前駆細胞の数の低下を特徴とする状態;ならびに骨同化作用障害(国際公開第2017/076968号、Flygare,J.)に有望である。
Qは硫黄、-NH-、または酸素から選択され得る。Xは-(CH2)n-から選択され得、nは0、1、または2から選択される。R4は水素、または飽和もしくは不飽和、分岐もしくは非分岐、置換もしくは非置換のC1-C6アルキルであり得る。R3は水素、シアノ、ハロ、置換もしくは非置換アミノ、置換もしくは非置換アミド;または置換もしくは非置換スルホンアミドから選択され得る。R2は水素、シアノ、ハロ、置換もしくは非置換アミノ、置換もしくは非置換アミド;または置換もしくは非置換スルホンアミドから選択され得る。R1は水素、シアノ、重水素化もしくは非重水素化ヒドロキシル、重水素化もしくは非重水素化カルボキシ、ハロ、置換もしくは非置換の重水素化もしくは非重水素化アミノ;置換もしくは非置換の重水素化もしくは非重水素化アミド;置換もしくは非置換の重水素化もしくは非重水素化スルホンアミド、飽和もしくは不飽和、分岐もしくは非分岐、置換もしくは非置換の重水素化もしくは非重水素化C1-C6アルキル、飽和もしくは不飽和、分岐もしくは非分岐、置換もしくは非置換の重水素化もしくは非重水素化C1-C6アルコキシルから選択され得る。いくつかの実施形態において、Qが硫黄であるとき、nは0であり、R4は水素であり、R3は-C(O)NH2であり、R2は-NH2であり、R1は重水素化ヒドロキシル、重水素化カルボキシ、置換もしくは非置換の重水素化アミノ;置換もしくは非置換の重水素化アミド;置換もしくは非置換の重水素化もしくは非重水素化スルホンアミド、飽和もしくは不飽和、分岐もしくは非分岐、置換もしくは非置換の重水素化C1-C6アルキル、飽和もしくは不飽和、分岐もしくは非分岐、置換もしくは非置換の重水素化C1-C6アルコキシルから選択される。いくつかの実施形態において、Qの少なくとも1つが硫黄でないとき、nは0でなく、R4は水素でなく、R3は-C(O)NH2でなく、R2は-NH2でなく、R1はシアノ、重水素化もしくは非重水素化ヒドロキシル、重水素化もしくは非重水素化カルボキシ、ハロ、置換もしくは非置換の重水素化もしくは非重水素化アミノ;置換もしくは非置換の重水素化もしくは非重水素化アミド;置換もしくは非置換の重水素化もしくは非重水素化スルホンアミド、飽和もしくは不飽和、分岐もしくは非分岐、置換もしくは非置換の重水素化もしくは非重水素化C1-C6アルキル、飽和もしくは不飽和、分岐もしくは非分岐、置換もしくは非置換の重水素化もしくは非重水素化C1-C6アルコキシルから選択される。特定の実施形態において、化合物は式
いくつかの実施形態において、R1は
本明細書に開示されている化合物は種々のがんを処置またはその進行を阻害する能力を示す。例えば、本明細書に開示されている化合物は前立腺がん、乳がん、および白血病に対してインビボで有効性を示した(実施例5および9)。
本明細書に開示されている化合物は有利なPK、いくつかの異なるがんに対するインビボ活性を、有利なキノームプロファイルと共に保有しているので、これらの化合物はCDK8/19活性と結合したがんの処置のための効果的なCDK8/19阻害剤である。
本明細書には、チエノピリジン、ピロロピリジン、およびフロピリジン化合物のような二環式ピリジン化合物が開示されている。化合物は式1
R3は水素、シアノ、ハロ、置換もしくは非置換アミノ、置換もしくは非置換アミドまたは置換もしくは非置換スルホンアミドから選択され得る。適切にはR3は-C(O)NH2のような置換または非置換アミドから選択され得る。
R2は水素、シアノ、ハロ、置換もしくは非置換アミノ、置換もしくは非置換アミド、または置換もしくは非置換スルホンアミドから選択され得る。適切には、R2は-NH2のような置換または非置換アミノから選択され得る。
R1は水素、シアノ、重水素化もしくは非重水素化ヒドロキシル、重水素化もしくは非重水素化カルボキシ、ハロ、置換もしくは非置換の重水素化もしくは非重水素化アミノ;置換もしくは非置換の重水素化もしくは非重水素化アミド;置換もしくは非置換の重水素化もしくは非重水素化スルホンアミド、飽和もしくは不飽和、分岐もしくは非分岐、置換もしくは非置換の重水素化もしくは非重水素化C1-C6アルキル、飽和もしくは不飽和、分岐もしくは非分岐、置換もしくは非置換の重水素化もしくは非重水素化C1-C6アルコキシルから選択され得る。
例示的な化合物には、制限なく、表6に開示される化合物がある。
いくつかの実施形態において、R1は
いくつかの実施形態において、Wは-(CH2)m-から選択され、mは1である。他の実施形態において、Wは-(CD2)m-から選択され、mは1である。
いくつかの実施形態において、R7およびR8は一緒になってオキソである。いくつかの実施形態において、R7およびR8は各々水素である。
いくつかの実施形態において、R5およびR6は各々メチルである。他の実施形態において、各々メチル-d3である。
いくつかの実施形態において、R5およびR6の一方は水素であり、他方はメチルである。他の実施形態において、R5およびR6の一方は重水素であり、他方はメチル-d3である。
いくつかの実施形態において、R5またはR6の少なくとも1つは重水素化もしくは非重水素化、飽和もしくは不飽和、分岐もしくは非分岐、置換もしくは非置換のC1-C6アルキルである。例示的な置換には、制限なく、ヒドロキシル置換、アミノ置換、またはカルバメート置換がある。
いくつかの実施形態において、R1は
いくつかの実施形態において、Wは-(CH2)m-から選択され、mは1である。他の実施形態において、Wは-(CD2)m-から選択され、mは1である。
いくつかの実施形態において、R7およびR8は一緒になってオキソである。他の実施形態において、R7およびR8は各々水素である。
いくつかの実施形態において、R9は水素、メチル、またはC(O)OC(CH3)である。
例示的なR1には、制限なく、(4-メチルピペラジン-1-イル)メチレン、4-メチルピペラジン-1-カルバルデヒド、ピペラジン-1-カルバルデヒド、またはtert-ブチル4-ホルミルピペラジン-1-カルボキシレートがある。
後記実施例で示されるように、二環式ピリジン化合物のいくつかは驚くべき程に良好なPKを有する。例えば、チエノピリジン15u、15u_D6、15w_D6、および604は医薬組成物の調製およびがんの処置での使用に適したPK特性を示す。実施例に示されるように、これらの化合物の静脈内および経口投与の結果、インビボマウスモデルにおいて高いC0およびCmax濃度、遅い排出、ならびに大きいAUCが得られる。
本明細書で使用されるとき、アスタリスク「*」またはプラス符号「+」は任意のラジカル基または置換基に対する結合の点を示すために使用され得る。
本発明で予期される用語「アルキル」には、そのあらゆる異性体形態の直鎖または分岐アルキル基、例えば本明細書でそれぞれC1-C12アルキル、C1-C10-アルキル、およびC1-C6-アルキルといわれる1~12、1~10、または1~6個の炭素原子の線状または分岐した基が含まれる。
用語「ハロアルキル」は、少なくとも1個のハロゲンで置換されたアルキル基を指す。例えば、-CH2F、-CHF2、-CF3、-CH2CF3、-CF2CF3、など。
本明細書で使用される用語「アルケニル」は少なくとも1個の炭素-炭素二重結合を有する不飽和の線状または分岐した炭化水素、例えば本明細書でそれぞれC2-C12-アルケニル、C2-C10-アルケニル、およびC2-C6-アルケニルといわれる2~12、2~10、または2~6個の炭素原子の線状または分岐した基を指す。
本明細書で使用される用語「アルキニル」は少なくとも1個の炭素-炭素三重結合を有する不飽和の線状または分岐した炭化水素、例えば本明細書でそれぞれC2-C12-アルキニル、C2-C10-アルキニル、およびC2-C6-アルキニルといわれる2~12、2~10、または2-6個の炭素原子の線状または分岐した基を指す。
用語「シクロアルキレン」はシクロアルキル基のジラジカルを指す。
用語「アミン」および「アミノ」は当技術分野で認められており、非置換および置換アミンの両方を指し、置換基には、例えば、アルキル、シクロアルキル、ヘテロシクリル、アルケニル、およびアリールが含まれ得る。適切には、アミノは非置換(unsubtitued)(すなわち、-NH2)または式-NHRもしくは-NRR’の置換アミノであり得、式中のRおよびR’はC1-C12アルキルまたはC1-C6アルキル、例えばメチルまたはエチルから独立に選択される。
用語「アルコキシル」または「アルコキシ」は当技術分野で認められており、酸素基が結合している上記定義のアルキル基を指す。代表的なアルコキシル基にはメトキシ、エトキシ、tert-ブトキシなどがある。
「エポキシド」は、通例2個の炭素原子を含む3原子の環を有し、その形状が二等辺三角形に近い環状エーテルである。エポキシドは二重結合(double bound)の酸化により生成することができ、その二重結合の炭素原子が酸素原子と共にエポキシドを形成する。
本明細書で使用される用語「カルボキシアミド」は基-C(O)NRR’を指し、ここでRおよびR’は同一でも異なってもよい。RおよびR’は独立にアルキル、アリール、アリールアルキル、シクロアルキル、ホルミル、ハロアルキル、ヘテロアリール、またはヘテロシクリルであり得る。適切には、カルボキシアミドは-C(O)NRR’を含み得、ここでRおよびR’はC1-C12アルキルまたはC1-C6アルキル、例えばメチルまたはエチルから独立に選択される。
本明細書で使用される用語「アミド(amide)」または「アミド(amido)」は-R1C(O)N(R2)-、-R1C(O)N(R2)R3-、-C(O)NR2R3、または-C(O)NH2の形態の基をいい、ここでR1、R2およびR3は各々独立にアルコキシ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アミド、アミノ、アリール、アリールアルキル、カルバメート、シクロアルキル、エステル、エーテル、ホルミル、ハロゲン、ハロアルキル、ヘテロアリール、ヘテロシクリル、水素、ヒドロキシル、ケトン、またはニトロである。適切には、アミドは-C(O)NR2R3を含み得、ここでR2およびR3は水素またはC1-C12アルキルまたはC1-C6アルキルから独立に選択される。適切にはR2およびR3は水素、メチル、またはエチルから独立に選択され得る。
本明細書で使用される用語「スルホンアミド(sulonamido)」は-R1C(S)2N(R2)-、-R1C(S)2N(R2)R3-、-C(S)2NR2R3、または-C(S)2NH2の形態の基をいい、ここでR1、R2およびR3は各々独立にアルコキシ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アミド、アミノ、アリール、アリールアルキル、カルバメート、シクロアルキル、エステル、エーテル、ホルミル、ハロゲン、ハロアルキル、ヘテロアリール、ヘテロシクリル、水素、ヒドロキシル、ケトン、またはニトロである。適切には、スルホンアミドは-C(S)2NR2R3を含み得、ここでR2およびR3は水素またはC1-C12アルキルまたはC1-C6アルキルから独立に選択される。適切にはR2およびR3は水素、メチル、またはエチルから独立に選択され得る。
本明細書に開示されている方法で利用される化合物は、(a)治療有効量の1種または複数の本明細書に開示されている化合物、および(b)1種または複数の薬学的に許容される担体、賦形剤、または希釈剤を含む医薬組成物として製剤化し得る。医薬組成物は約0.1~2000mg(好ましくは約0.5~500mg、より好ましくは約1~100mg)の範囲の化合物を含み得る。医薬組成物は約0.1~100mg/kg体重(好ましくは約0.5~20mg/kg体重、より好ましくは約0.1~10mg/kg体重)の1日用量で化合物を提供するように投与され得る。いくつかの実施形態において、医薬組成物が患者に投与された後(例えば、投与後約1、2、3、4、5、または6時間後)、作用部位での化合物の濃度は約1nM~100μMである。
発泡剤の例は発泡性カップル、例えば有機酸および炭酸塩または重炭酸塩である。適切な有機酸には、例えば、クエン酸、酒石酸、リンゴ酸、フマル酸、アジピン酸、コハク酸、およびアルギン酸および無水物および酸塩がある。適切な炭酸塩および重炭酸塩には、例えば、炭酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、炭酸カリウム、重炭酸カリウム、炭酸マグネシウム、炭酸グリシンナトリウム、炭酸L-リジン、および炭酸アルギニンがある。或いは、発泡性カップルの重炭酸ナトリウム成分のみが存在してもよい。
本明細書に開示されている方法で利用される化合物は当技術分野で周知の慣用の手順に従って活性成分を標準的な薬剤担体または希釈剤と組み合わせることにより調製される慣用の剤形として投与し得る。これらの手順は所望の製剤に適当な成分を混合し、造粒および圧縮し、または溶解することを含み得る。
経口投与に適応させた医薬組成物はカプセルもしくは錠剤、粉末もしくは顆粒、水性もしくは非水性液体中の溶液もしくは懸濁液、食べられる泡もしくはホイップ、または水中油型液体エマルションもしくは油中水型液体エマルションのような別々の単位として提示され得る。
局所投与用に適応させた医薬組成物は軟膏、クリーム、懸濁液、ローション、粉末、溶液、ペースト、ゲル、含侵包帯、噴霧液、エアロゾルまたは油として製剤化され得、適当な慣用の添加剤、例えば保存料、薬剤の浸透を助ける溶媒および軟膏およびクリーム中の皮膚軟化剤を含有し得る。
口中への局所投与用に適応させた医薬組成物にはトローチ剤、トローチ(pastille)およびマウスウォッシュがある。
直腸投与用に適応させた医薬組成物は座薬または浣腸剤として提示され得る。
担体が固体である鼻投与用に適応させた医薬組成物には嗅ぎ薬が服用されるように(すなわち、鼻の近くに保たれた粉末の容器から鼻腔を通した迅速な吸入により)投与されるある粒度(例えば、20~500μmの範囲)を有する粗い粉末が含まれる。鼻腔用スプレーまたは点鼻薬として投与される担体が液体である適切な製剤には活性成分の水性または油性溶液がある。
膣投与用に適応させた医薬組成物はペッサリー、タンポン、クリーム、ゲル、ペースト、泡または噴霧製剤として提示され得る。
非経口投与用に適応させた医薬組成物は、製剤を意図する受容者の血液と等張にする酸化防止剤、緩衝剤、静菌剤および溶質を含有し得る水性および非水性の無菌注射溶液、ならびに懸濁剤および増粘剤を含み得る水性および非水性の無菌懸濁液を含む。製剤は単位用量または多用量容器、例えば密封アンプルおよびバイアルに入れて提示され得、使用直前に無菌の液体担体、例えば注射用の水の添加を必要とするのみであるフリーズドライ(凍結乾燥)状態で保存し得る。即時注射溶液および懸濁液は無菌の粉末、顆粒および錠剤から調製し得る。
上に示したように、化合物の薬学的に許容される塩が考えられ、これも開示されている方法で利用し得る。本明細書で使用される用語「薬学的に許容される塩」は生体に対して実質的に非毒性の化合物の塩を指す。典型的な薬学的に許容される塩には、本明細書に開示されている化合物と薬学的に許容される鉱酸もしくは有機酸または有機もしくは無機塩基との反応により調製される塩がある。かかる塩は酸付加および塩基付加塩として知られている。熟練した読者には分かるように、本明細書に開示されている化合物のほとんどまたはすべてが塩を形成することができ、薬剤の塩は多くの場合遊離の酸または塩基より容易に結晶化され精製されるので一般的に使用される。
塩基付加塩には無機塩基、例えばアンモニウムまたはアルカリもしくはアルカリ土類金属水酸化物、炭酸塩、重炭酸塩、などに由来するものがある。かかる塩を調製する際に有用な塩基には水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、水酸化アンモニウム、炭酸カリウム、炭酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、重炭酸カリウム、水酸化カルシウム、炭酸カルシウム、などがある。
化合物の薬学的に許容されるエステルおよびアミドも本明細書に開示されている組成物および方法に使用することができる。適切なエステルの例にはアルキル、アリール、およびアラルキルエステル、例えばメチルエステル、エチルエステル、プロピルエステル、ドデシルエステル、ベンジルエステル、などがある。適切なアミドの例には非置換アミド、一置換アミド、および二置換アミド、例えばメチルアミド、ジメチルアミド、メチルエチルアミド、などがある。
さらに、本明細書に開示されている方法は化合物またはその塩、エステル、および/またはアミドの溶媒和物形態を用いて実施してもよい。溶媒和物形態としてはエタノール溶媒和物、水和物、などが挙げられ得る。
記載されている組成物は対象を処置するのに有用である。本明細書で使用されるとき、用語「処置する」または「処置すること」は各々、一時的または永久的に症状を緩和し、結果として起こる症状の原因を排除し、および/またはその名前の疾患もしくは障害の結果として起こる症状の出現を防止するかもしくは遅くし、またはその進行もしくは重症度を逆転させることを意味する。したがって、本明細書に開示されている方法は治療的および予防的投与の両方を包含する。
典型的な1日用量は本処置方法に使用される各々の化合物を約0.01mg/kg~約100mg/kg(例えば約0.05mg/kg~約50mg/kgおよび/または約0.1mg/kg~約25mg/kg)含有し得る。
組成物は単位投薬形態に製剤化することができ、各投薬量は約1~約500mgの各々の化合物を個別にまたは単一の単位投薬形態中に、例えば約5~約300mg、約10~約100mg、および/または約25mg含有する。用語「単位投薬形態」は患者に対する単一の投薬量として適した物理的に別々の単位を指し、各々の単位は所望の治療効果を生じるように計算された所定量の活性物質を適切な薬剤担体、希釈剤、または賦形剤と共に含有する。
本開示の方法はアンドロゲン遮断療法に応答しない対象を処置するのに有用であり得る。いくつかの前立腺がん、例えばCRPCはアンドロゲン遮断療法に応答しなかったりまたは抵抗性になったりし得る。実施例に示されるように、15uはCRPCの前立腺腫瘍の増殖を抑制する際に有効である。その結果、15uはアンドロゲン遮断療法を以前に受けている対象またはアンドロゲン遮断療法に応答しない対象に投与し得る。
本開示の方法はまた現在アンドロゲン遮断療法を受けている対象を処置するのにも有用であり得る。実施例に示されるように、15uは抗アンドロゲンと共に投与されたときCRPCの前立腺腫瘍の増殖を抑制するのに有効である。その結果、15uは現在アンドロゲン遮断療法を受けている対象に投与し得る。
いくつかの実施形態において、CDK8/19に関連する疾患は乳がん、適切には転移性乳がんである。
記載されている組成物はCDK8および/またはCDK19を阻害するのに有用である。本明細書で使用されるとき、「CDK8を阻害する」または「CDK19を阻害する」とは、何らかの適切なメカニズム、例えば競合的結合により、それぞれCDK8またはCDK18の活性を阻害することを意味する。CDK8および/またはCDK19を阻害する方法は本明細書に記載されている化合物または組成物のいずれかをCDK8またはCDK19と接触させることを含み得る。阻害の程度は本明細書中の実施例で教示されるアッセイ、例えば本発明で利用するサービスプロバイダによって使用されるアッセイ条件により測定され得る。これらのアッセイの結果は一般に本明細書中で、化合物が存在しない対照を用いて対照のパーセント(POC)として表される。或いは、結果はIC50として表され得る。いくつかの実施形態において、POCは本明細書に記載されている組成物の化合物のいずれかの有効量に対して35%未満、適切には30%、25%、20%、15%、10%、5%、または1%未満である。いくつかの実施形態において、IC50は2000nM、1500nM、1000nM、750nM、500nM、250nM、200nM、150nM、100nM、75nM、50nM、40nM、30nM、または25nM未満である。
他に規定したり、または文脈により指示されたりしない限り、用語「a」、「an」、および「the」は「1または複数」を意味する。例えば、「a molecule」は「1または複数の分子」を意味すると解釈するべきである。
本明細書で使用されるとき、「約」、「およそ」、「実質的に」、および「かなり」は当業者により理解され、ある程度使用されている文脈によって変化する。使用されている文脈から考えて当業者に明らかでない用語が使用されていれば、「約」および「およそ」は特定の用語のプラスマイナス≦10%を意味し、「実質的に」および「かなり」は特定の用語のプラスマイナス>10%を意味する。
本明細書で引用されているすべての参考文献、例えば刊行物、特許出願、および特許は参照により、各々の参考文献が個別にかつ明確に参照により組み込まれると示されており、その全体が本明細書中に記載されているのと同程度に本明細書に組み込まれる。
チエノピリジン誘導体は細胞ベースアッセイにおいてCDK8/19活性を阻害する。
NFκB活性アッセイ。細胞ベースアッセイを使用してチエノピリジン誘導体によるCDK8/19活性の阻害を測定した。このアッセイは、NFκBに駆動される転写におけるCDK8/19の役割に基づいて(Li et al., Characterizing CDK8/19 Inhibitors through a NFκB-Dependent Cell-Based Assay, Cells 2019, 8(10), 1208)、293細胞においてNFκB依存性プロモーターからの蛍ルシフェラーゼレポーターの発現に対するCDK8/19の影響を測定する。レンチウイルスベクターpHAGE-NFKB-TA-LUC-UBC-dTomato-W(Addgene #49335)を293細胞に導入し、TNFα処置の際にルシフェラーゼ発現の最も強い誘導を示すクローン細胞株を樹立し、レポーター細胞株として使用した。NFκB阻害のCDK8/19依存性の対照として、同じレポーター構築物をCDK8およびCDK19の両方のCRISPR/CAS9ノックアウトを有する293細胞にも導入した。
図1Cおよび表1は、親293由来レポーター細胞株におけるNFκBレポーターアッセイで測定された様々なチエノピリジンに対するIC50値を、マウス骨髄間質細胞株ST2における骨芽細胞への分化のインジケーターであるアルカリホスファターゼ(ALPase)に対する効果に基づいてSaito(2013)により同じ化合物に対して測定された細胞に基づく活性値と比較する。後者の効果はALPase活性を対照の200%に高める濃度であるEC200として表される。CDK8/19 NFkBアッセイにおけるIC50値はALPase EC200値(図1B)と極めて強く相関しており、ALPase効果が十中八九CDK8/19阻害を介して仲介されることを示している。
チエノピリジン誘導体のキノームプロファイリング。
表2は、2000nM濃度でのKINOMEscan(商標)部位特異的競合結合アッセイにより測定された15u_D6および15uのキノームプロファイルを示す。キナーゼ活性部位に結合し、直接的に(立体的に)または間接的に(アロステリックに)固定化リガンドに対するキナーゼ結合を防止する化合物は、固体支持体上に捕獲されるキナーゼの量を低減する。逆に、キナーゼに結合しない試験分子は固体支持体上に捕獲されるキナーゼの量に対して影響しない。スクリーニング「ヒット」は結合したDNA標識を検出する定量的な精密超高感度qPCR方法を使用することにより試験対対照試料において捕獲されるキナーゼの量を測定することによって確認される。同様に、試験化合物-キナーゼ相互作用に対する解離定数(Kd)は固体支持体上に捕獲されるキナーゼの量を試験化合物濃度の関数として測定することによって計算される。アッセイ技術の詳細な説明はFabian, M.A. et al. A small molecule-kinase interaction map for clinical kinase inhibitors. Nat. Biotechnol. 23, 329-336 (2005)に見出し得る。
%Ctrl=100×(TS-CPOS)/(CNEG-CPOS)(eqn 1)
ここで、TSは試験化合物のシグナルであり、CPOSは陽性対照シグナル(0%Ctrl)であり、CNEGはDMSO陰性対照シグナル(100%Ctrl)である。
チエノピリジン誘導体の薬物動態。
薬物動態(PK)アッセイ。マウス薬物動態(PK)を測定するために、チエノピリジン誘導体を5%デキストロースに溶かし、雌FVBマウスで異なる投薬条件で投与し、様々な時点で血液試料を集め、血清中の化合物濃度をLC/MS/MSにより測定した。
このPK分析は、試験したチエノピリジン誘導体のうちの1つである15uが極めて魅力的なPK特性を示し、非常に高いバイオアベイラビリティおよび経口投与後の安定性を有していることを立証した。
15uおよび15wの重水素化された誘導体の薬物動態プロファイル
15uおよび15wの重水素化された誘導体のPKを決定するために、8~12週齢の雌CD-1マウスを溶液中経口経管栄養により30mg/kgの15uもしくは15u-D6または16もしくは18mg/kgの15w、15w-D2、15w-D6で処置した。血液試料(70~100μL)を血清分離のためのBDMicrotainer採血管に様々な時点(投与後1、2、6、8時間)で、ヘパリン処理したミクロヘマトクリット毛細管を用いて麻酔した動物の後眼窩静脈から集めた。化合物特異的なMRM(15u:439~394;15u-D6:445~394;15w:453~436;15w-D2:455~438;15w-D6:459~442)を用いて薬剤濃度を決定するためにLCMSMSのために血清試料を処理した。薬剤濃度を時点に対してプロットしてGraphPadソフトウエアでPK曲線を生成させ、投薬後最初の8時間以内のAUC(曲線下面積)をExcelソフトウエアで計算して非重水素化および重水素化された化合物のPKプロファイルを比較した。これら2つのPK研究は、ジメチルアミン基の水素を重水素で置換すると(D6誘導体)、15uに対するPKを少し改善し(図5A)、15wに対するPKを大いに改善した(図5B)ことを示している。D6と対照的に、D2誘導体は15wのPKを改善しなかった(図5B)。
去勢抵抗性前立腺がんにおける15uのインビボ効果
CDK8/19阻害は、前立腺がんの最も一般的なマーカーであるPSAを含めてある種のアンドロゲン受容体(AR)誘導遺伝子の発現、および去勢抵抗性前立腺がん(CRPC)の増殖を低減する。図6A-6Cは、様々な濃度の3つのCDK8/19阻害剤、チエノピリジン誘導体15uおよび15w、ならびにセネキシンBの、FBSを補った慣習の培地中で4日処置した後CRPC細胞株C4-2の細胞培養上清でのPSA発現に対する効果を示している。3つの阻害剤はすべてPSA発現を抑制し、IC50値は15uに対して27.6nM、15wに対して15.7nM、セネキシンBに対して255nMであった。
15uおよび15wの混合物(実施例3でPK研究に使用したのと同じ混合物)のC4-2細胞によるPSA発現に対するインビボ効果を、C4-2異種移植片を有する雄NSGマウス(初期の血清PSAレベルに基づいてグループ分け)を4日間毎日30mg/kgで4日経口投与して処置した後分析した。血清中PSAタンパク質レベルおよび腫瘍内PSA mRNAレベルは両方共15uおよび15wの混合物での処置により強く減少した(図6D-6F)。15uおよび15wの大幅に異なるPKを考えると(実施例3)、PSAに対する効果は15uにより仲介されたように見える。
乳がん転移に対する15uの効果。
4T1は、肺への転移性が高いネズミトリプルネガティブ乳がん(TNBC)細胞株である。このモデルにおける肺転移に対するCDK8の効果は図8A-8Cに示されている研究で示された。CDK8標的shRNAを使用して4T1細胞におけるCDK8発現をほとんど完全にノックダウンした(図8A;これらの細胞は検出可能なCDK19タンパク質を発現しない)。親およびCDK8-ノックダウン4T1細胞(n=10)を乳房脂肪体に同所性に注射し、17日後に原発性腫瘍を切除した。手術後、すべてのマウスが最終的に肺転移で死んだ。原発性腫瘍の質量はCDK8ノックダウンの腫瘍増殖に対する有意な影響を示さなかった(図8B)。しかしながら、CDK8の損失はマウスの生存率の強い増大と関連していた(図8C)。
このモデルによるもう1つ別の研究において、親4T1細胞により形成された腫瘍を切除し、マウスを2つの群にランダム化し(図8F、n=8)、セネキシンB((Liang、2018)に記載されている1回の経口用量50mg/kgと組み合わせて薬を加えた食物(350ppm)に入れて投与)で処置したか、または対照食物およびビヒクルを与えた。セネキシンB処置は統計的に有意であるが適度な生存率の増加を提供した(図8G)。
去勢抵抗性前立腺がんにおける併用した15uおよびエンザルタミドによる処置のインビボ効果
CRPCにおける15uおよび抗アンドロゲンエンザルタミドの組合せ効果をネズミMYC-Cap-CRモデルで分析した。MYC-CaP-CR細胞(Ellis L. et al., 2012. Prostate 72(6):587-591)を、AR応答性プロモーターからMYCを発現する遺伝子操作されたMYC-CaP細胞から去勢抵抗性について選択した(Watson PA, et al., 2005. Cancer Res 65(24):11565-11571)。これらの細胞における去勢抵抗性はAR変異体、例えば22rv1におけるAR-V7(Olson BM, et al., 2017. Cancer immunology research 5(12):1074-1085)ではなく全長ARの過剰発現と関連する。短期細胞増殖アッセイにおいて、CDK8/19阻害剤セネキシンBおよび15uはアンドロゲンを含有する培地でのMYC-CAP-CR細胞増殖に対してほとんど効果を示さなかったが、エンザルタミドは逆説的にこれらの細胞の増殖を刺激した(図9A)。しかしながら、エンザルタミドをいずれかのCDK8/19阻害剤と組み合わせたとき、MYC-CAP-CR細胞増殖は強く阻害され(図9A)、CDK8/19阻害がエンザルタミド抵抗性を克服し得ることを示している。長期のクローン形成法において、エンザルタミドおよびCDK8/19阻害剤は両方共MYC-CaP-CRコロニー形成を低下させ、それらの組合せは明らかに相乗的な効果を生じた(図9B)。エンザルタミドと組み合わせた15uのインビボ効果を完全なままの(去勢されてない)FVB雄マウスの皮下で増殖するMYC-CaP-CR腫瘍で試験した。エンザルタミドおよび15u単独の両方が単独で使用されたとき腫瘍体積(図9C)および質量(図9D)に対して適度の効果を有していたが、それらの組合せはかなりの(p=0.02)腫瘍抑制を生じた。
チエノピリジン誘導体の抗白血病効果
15uの抗白血病特性を、インビトロおよびインビボでCDK8/19阻害に対して感受性であることが以前に示されている急性骨髄性白血病(AML)細胞株MV4-11で調べた(Pelish HE, et al., 2015. Nature 526(7572):273-276)。インビボ研究に使用したMV4-11細胞の集団を、生物発光画像法(BLI)による白血病増殖分析を可能にするために、レンチウイルス感染によりpHIV-Luc-ZsGreenでルシフェラーゼおよびZsGreenを発現するようにした。最初のルシフェラーゼ-ZsGreen形質導入細胞集団を蛍光活性化細胞分類でZsGreen陽性に関して選別した。このMV4-11細胞集団を15uに対する感受性に関して試験した。15uはMV4-11増殖を強く阻害し、25nMのIC50値で抗増殖性と思われた(図10A)。
結果。図10Dに示されているように、経口経管栄養により15uで処置されたマウスは優れた生存率を示した。
MDA-MB-468トリプルネガティブ乳がん(TNBC)異種移植片のインビボ増殖に対する15uの効果
ヒトMDA-MB-468トリプルネガティブ乳がん(TNBC)細胞はインビトロで長期の処置の際15uおよび他のCDK8/19阻害剤に対して応答性であることが判明した。MDA-MB-468異種移植片のインビボ増殖に対するCDK8/19阻害の効果を評価するために、百万個の細胞を40%Matrigel(100ml全体積)と共に免疫不全のNSG雌マウス(9週齢)の右の脇腹にs.c.注射した。接種の11日後、マウスを腫瘍サイズにより2つの群(n=9)にランダム化した。各々の群において平均腫瘍体積は115mm3であった。第1の群(対照)のマウスは規則的な食事を受け、第2の群(処置)のマウスは250ppmの15uを含有する薬を加えた食事を受けた。処置の開始から13日後、薬を加えた食事を、処置群においては5mg/kgの15u溶液を提供する毎日の経口経管栄養またはビヒクル単独(対照群)で補った。処置の開始から37日後、処置群において経管栄養用量を8mg/kgに増大し、処置を全部で66日間続けた。腫瘍体積を週に2回キャリパーで測定したところ(図11A)、15u処置群での腫瘍体積の有意な低下を示していた。研究の終了時、マウスを安楽死させ、腫瘍を解剖し、秤量した。腫瘍質量は15u処置群の方が有意に低かった(図11B)。マウス体重(図11C)は長期の15u処置の有害な効果を示さなかった。
CD-1マウスにおける15uの最大耐量(MTD)の決定
最大耐量(MTD)を決定するために、8週齢の雄または雌CD-1マウスを様々な用量群にランダムに割り当て、溶液の経口経管栄養または薬を加えた食物のいずれかにより増大する用量の15uで処置した。1つのMTDインビボ研究において、雌CD-1マウスを1日2回経管栄養(b.i.d.)で処置して5、10、15、30、60または120mg/kgの15uを提供し、雄CD-1マウスを経管栄養でb.i.d.処置して14日間60または120mg/kgを提供した。あらゆる処置群(60および120mg/kg b.i.d.)の雄マウスおよび60mg/kgまでの用量の15uでb.i.d.処置した群の雌マウス(図12A)で有害な効果は全く観察されなかった。最も高い用量(120mg/kg b.i.d.)は処置の7~10日後雌マウスで約10%の体重減少を生じたが、残りの処置期間を通じてさらなる悪化は観察されなかった(図12A)。
種々のマウス異種移植片モデルにおいて最大の治療効果が30mg/kgの1日用量で獲得することができることを考えると、これら2つのMTDアッセイは15uに対する高い治療指数を示唆していた。
チエノピリジンおよびピロロピリジンのCDK8への結合のインシリコモデリング
Schrodinger Induced Fitドッキングを用いて、CDK8に結合する化合物15u、15w、15w_APP、15_PP、および15u_CNに対するドッキングモデルを生成した。Induced Fitプロトコルは活性なリガンドをGlideとドッキングさせ、次いで多様なアンサンブルのリガンドポーズを生成し、この手順は低下したvan der Waals半径および増大したCoulomb-vdWカットオフを使用して、ドッキング工程中極めて可撓性の側鎖を一時的に除去する。次いで、各々のポーズに対して、Prime構造予測を使用して、近隣の側鎖を再配向することによりリガンドを適応させる。次いでこれらの残基およびリガンドを最小化する。最後に、各々のリガンドをその対応する低エネルギータンパク質構造に再度ドッキングさせ、得られる複合体をGlideScoreに従ってランク付けする。このモデルを使用して、次の予測された新規な構造のデザインを導いた。
構造活性関係
表6は、本明細書に記載されている組成物に対する構造活性関係を要約する。阻害効力を決定するために、実施例1に記載されるNFκB活性アッセイ(HEK238-NFκB-Lucアッセイ)および実施例8に記載されるMV4-11アッセイ(MV4-11-Lucアッセイ)。PKを決定するために、8~12週齢の雌CD-1マウスを示されている用量(15~30mg/kg)の試験阻害剤で溶液製剤(10%N-メチル-2-ピロリドン(NMP)、27%プロピレングリコール(PG)、63%ポリエチレングリコール400(PEG-400))として経口の経管栄養により処置した。血液試料(70~100μL)を麻酔した動物の後眼窩静脈からヘパリン処理したミクロヘマトクリット毛細管により様々な時点(投与後1、2、6、8時間)で血清分離のためにBD Microtainer採血管に集めた。血清試料をLCMSMSのために処理して、化合物に特異的なMRM(15u:439~394;15u-D6:445~394;15w:453~436;15w-D2:455~438;15w-D6:459~442;6264:483~394;6300:480~380;6304:453~408)を用いて薬剤濃度を決定した。薬剤濃度を時点に対してプロットしてGraphPadソフトウエアでPK曲線を生成し、投薬後最初の8時間以内のAUC(曲線下面積)をExcelソフトウエアで計算して様々な化合物のPKプロファイルを比較した。
合成スキーム
スキーム1は本明細書に開示されている化合物を調製する一般合成手順を示す。特定の化合物の調製を以下に示す。
スキーム1.チエノピリジン(thyenopyridine)誘導体の小規模合成
スキーム2は15u_PPのようなピロロピリジンの調製のための合成スキームを示す。当業者はスキーム1および2を変更してフロピリジンを調製することができる。
スキーム2.15u_PPの合成
3-アミノ-4-(4-(4-(2-(ジメチルアミノ)-2-オキソエチル-1,1-d2)フェニル)-1,4-ジアゼパン-1-イル)チエノ[2,3-b]ピリジン-2-カルボキサミド(15w_D2)の合成
3-アミノ-4-(4-(4-(ジメチルカルバモイル)フェニル)-1,4-ジアゼパン-1-イル)チエノ[2,3-b]ピリジン-2-カルボキサミド(15u)の合成
3-アミノ-4-(4-(4-(ビス(メチル-d3)カルバモイル)フェニル)-1,4-ジアゼパン-1-イル)チエノ[2,3-b]ピリジン-2-カルボキサミド(15u_D6)の合成
1 H NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ: 8.39 (d, J=5.2 Hz, 1H), 7.08 (d, J=9.6 Hz, 3H), 7.07 (s, 2H), 6.97 (s, 2H), 6.71 (d, J=8.4 Hz, 2H), 3.75 (m, 2H), 3.52 (t, J=6.1 Hz, 2H), 3.32 (s, 2H), 3.29 (m, 2H), 2.33 (m, 8H), 2.16 (s, 3H), 2.13 (m, 2H); 13C NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ: 167.07, 160.35, 159.35, 150.53, 147.59, 146.38, 130.06, 130.06, 124.87, 119.21, 111.74, 111.34, 111.34, 94.99, 61.68, 55.83, 54.76, 54.66, 54.66, 52.30, 52.30, 47.99, 47.99, 45.63, 27.39; ESI-MS m/z: 480 ([M + H]+).
1 H NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ: 7.30 (d, J=8.9 Hz, 2H), 7.02 (s, 2H), 6.96 (s, 3H), 6.77 (d, J=8.9 Hz, 2H), 3.81 (m, 2H) 3.58 (m, 2H), 3.27 (m, 2H), 3.16 (m, 2H), 2.97 (s, 6H), 2.45 (s, 3H), 2.14 (m, 2H); 13C NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ: 170.50, 167.18, 160.03, 159.94, 159.39, 149.42, 146.46, 129.35, 129.35, 122.56, 117.13, 111.78, 110.45, 110.45, 94.25, 55.52, 54.93, 47.88, 47.75, 39.52, 39.52, 27.23, 24.22; ESI-MS m/z: 453 ([M + H]+).
1 H NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ: 8.40 (d, J=5.6 Hz, 1H), 7.27 (d, J=8.7 Hz, 2H), 7.10 (s, 2H), 7.08 (d, J=5.6 Hz, 1H), 7.00 (s, 2H), 6.78 (d, J=8.7 Hz, 2H), 4.47 (t, J=5.4 Hz, 1H), 3.81 (m, 2H), 3.59 (t, J=6.5 Hz, 2H), 3.41 (m, 4H), 3.30 (m, 2H), 3.20 (m, 2H), 2.95 (s, 3H), 2.16 (m, 2H), 1.70 (m, 2H); 13C NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ: 170.69, 167.08, 160.35, 159.23, 150.55, 149.36, 146.38, 129.03, 129.03, 123.02, 119.19, 111.70, 110.50, 110.50, 95.13, 58.36, 58.36, 55.72, 54.82, 47.82, 47.82, 39.53, 39.53, 27.21; ESI-MS m/z: 483 ([M + H]+).
Claims (62)
- 式1の化合物。
[式中、
Qは硫黄、-NH-、または酸素から選択され;
Xは-(CH2)n-から選択され、nは0、1、または2から選択され;
R4は水素、または飽和もしくは不飽和、分岐もしくは非分岐、置換もしくは非置換のC1-C6アルキルであり;
R3は水素、シアノ、ハロ、置換もしくは非置換アミノ、置換もしくは非置換アミド、または置換もしくは非置換スルホンアミドから選択され;
R2は水素、シアノ、ハロ、置換もしくは非置換アミノ、置換もしくは非置換アミドまたは置換もしくは非置換スルホンアミドから選択され;
(ii)Qが硫黄であるとき、nは0であり、R4は水素であり、R3は-C(O)NH2であり、R2は-NH2であり、R1は重水素化ヒドロキシル、重水素化カルボキシ、置換もしくは非置換の重水素化アミノ;置換もしくは非置換の重水素化アミド;置換もしくは非置換の重水素化もしくは非重水素化スルホンアミド、飽和もしくは不飽和、分岐もしくは非分岐、置換もしくは非置換の重水素化C1-C6アルキル;飽和もしくは不飽和、分岐もしくは非分岐、置換もしくは非置換の重水素化C1-C6アルコキシルから選択され;または
(ii)Qの少なくとも1つが硫黄でないとき、nは0でなく、R4は水素でなく、R3は-C(O)NH2でなく、R2は-NH2でなく、R1はシアノ;重水素化もしくは非重水素化ヒドロキシル、重水素化もしくは非重水素化カルボキシ、ハロ、置換もしくは非置換の重水素化もしくは非重水素化アミノ;置換もしくは非置換の重水素化もしくは非重水素化アミド;置換もしくは非置換の重水素化もしくは非重水素化スルホンアミド、飽和もしくは不飽和、分岐もしくは非分岐、置換もしくは非置換、重水素化もしくは非重水素化C1-C6アルキル;飽和もしくは不飽和、分岐もしくは非分岐、置換もしくは非置換、重水素化もしくは非重水素化C1-C6アルコキシルから選択される] - R1がN,N-ビス(メチル(metyl)-d3)ホルムアミド、N,N-ビス(メチル(metyl)-d3)アセトアミド、またはN,N-ジメチルアセトアミド-2,2-d2である、請求項2に記載の化合物。
- R1がN,N-ビス(メチル(metyl)-d3)ホルムアミドである、請求項3に記載の化合物。
- Qが硫黄であり、nが0であり、R4が水素またはメチルであり、R3が-C(O)NH2であり、R2が-NH2である、請求項3または4に記載の化合物。
- R4が水素である、請求項5に記載の化合物。
- R1がN,N-ビス(メチル(metyl)-d3)アセトアミドである、請求項3に記載の化合物。
- Qが硫黄であり、nが0であり、R4が水素またはメチルであり、R3が-C(O)NH2であり、R2が-NH2であり、R1がN,N-ビス(メチル(metyl)-d3)アセトアミドである、請求項7に記載の化合物。
- R4が水素である、請求項8に記載の化合物。
- R1がN,N-ジメチルホルムアミド、N,N-ジメチルアセトアミド、またはN-メチルホルムアミドであり、Qの少なくとも1つが硫黄でなく、nが0でなく、R4が水素でなく、R3が-C(O)NH2でなく、R2が-NH2でない、請求項2に記載の化合物。
- Qが硫黄であり、nが0であり、R4がメチルであり、R3が-C(O)NH2であり、R2が-NH2である、請求項10に記載の化合物。
- R1がN,N-ジメチルホルムアミドである、請求項11に記載の化合物。
- R1がN-(3-ヒドロキシプロピル)ホルムアミド、N-(3-アミノプロピル)-N-メチルホルムアミド、またはtert-ブチル(3-(N-メチルホルムアミド)プロピル)カルバメートである、請求項2に記載の化合物。
- R1がN-(3-ヒドロキシプロピル)ホルムアミドである、請求項13に記載の化合物。
- Qが硫黄であり、nが0であり、R4が水素またはメチルであり、R3が-C(O)NH2であり、R2が-NH2である、請求項13または14に記載の化合物。
- R4が水素である、請求項15に記載の化合物。
- R1が(4-メチルピペラジン-1-イル)メチレン、4-メチルピペラジン-1-カルバルデヒド、ピペラジン-1-カルバルデヒド、またはtert-ブチル4-ホルミルピペラジン-1-カルボキシレートである、請求項17に記載の化合物。
- R1が(4-メチルピペラジン-1-イル)メチレンである、請求項18に記載の化合物。
- Qが硫黄であり、nが0であり、R4が水素またはメチルであり、R3が-C(O)NH2であり、R2が-NH2である、請求項17~19のいずれか1項に記載の化合物。
- R4が水素である、請求項20に記載の化合物。
- 治療有効量の請求項1~21のいずれか1項に記載の化合物および薬学的に許容される担体、賦形剤、または希釈剤を含む医薬組成物。
- 式1の化合物の治療有効量を投与することを含む、がんを有する対象の処置方法。
[式中、
Qは硫黄、-NH-、または酸素から選択され;
Xは-(CH2)n-から選択され、nは0、1、または2から選択され;
R4は水素、または飽和もしくは不飽和、分岐もしくは非分岐、置換もしくは非置換のC1-C6アルキルであり;
R3は水素、シアノ、ハロ、置換もしくは非置換アミノ、置換もしくは非置換アミド、または置換もしくは非置換スルホンアミドから選択され;
R2は水素、シアノ、ハロ、置換もしくは非置換アミノ、置換もしくは非置換アミドまたは置換もしくは非置換スルホンアミドから選択され;
R1は水素、シアノ、重水素化もしくは非重水素化ヒドロキシル、重水素化もしくは非重水素化カルボキシ、ハロ、置換もしくは非置換の重水素化もしくは非重水素化アミノ;置換もしくは非置換の重水素化もしくは非重水素化アミド;置換もしくは非置換の重水素化もしくは非重水素化スルホンアミド、飽和もしくは不飽和、分岐もしくは非分岐、置換もしくは非置換、重水素化もしくは非重水素化C1-C6アルキル;飽和もしくは不飽和、分岐もしくは非分岐、置換もしくは非置換、重水素化もしくは非重水素化C1-C6アルコキシルから選択される] - がんが前立腺がん、白血病、乳がん、結腸がん、卵巣がん、膵がん、または黒色腫である、請求項23に記載の方法。
- がんが前立腺がんである、請求項24に記載の方法。
- 前立腺がんが去勢抵抗性前立腺がんであるか、またはアンドロゲン遮断療法に抵抗性である、請求項25に記載の方法。
- 対象が化合物の対象への投与前にアンドロゲン遮断療法を受けている、請求項24または25に記載の方法。
- 対象が化合物の対象への投与と同時にアンドロゲン遮断療法を受けている、請求項24~27のいずれか1項に記載の方法。
- がんが白血病である、請求項24に記載の方法。
- 白血病が急性骨髄性(meyloid)白血病である、請求項29に記載の方法。
- がんが乳がんである、請求項24に記載の方法。
- 乳がんが転移性乳がんまたはトリプルネガティブ乳がんである、請求項31に記載の方法。
- R1がN,N-ビス(メチル(metyl)-d3)ホルムアミド、N,N-ビス(メチル(metyl)-d3)アセトアミド、またはN,N-ジメチルアセトアミド-2,2-d2である、請求項33に記載の方法。
- R1がN,N-ビス(メチル(metyl)-d3)ホルムアミドである、請求項34に記載の方法。
- Qが硫黄であり、nが0であり、R4が水素またはメチルであり、R3が-C(O)NH2であり、R2が-NH2である、請求項33~35のいずれか1項に記載の方法。
- R4が水素である、請求項36に記載の方法。
- R1がN,N-ビス(メチル(metyl)-d3)プロピオンアミドである、請求項33または34に記載の方法。
- Qが硫黄であり、nが0であり、R4が水素またはメチルであり、R3が-C(O)NH2であり、R2が-NH2であり、R1がN,N-ビス(メチル(metyl)-d3)プロピオンアミドである、請求項38に記載の方法。
- R4が水素である、請求項39に記載の方法。
- R1がN,N-ジメチルホルムアミド、N,N-ジメチルアセトアミド、またはN-メチルホルムアミドである、請求項33に記載の方法。
- R1がN,N-ジメチルホルムアミドである、請求項41に記載の方法。
- Qが硫黄であり、nが0であり、R4が水素またはメチルであり、R3が-C(O)NH2であり、R2が-NH2である、請求項41または42に記載の方法。
- R4がメチルである、請求項43に記載の方法。
- R4が水素である、請求項43に記載の方法。
- R1がN,N-ジメチルアセトアミドである、請求項41に記載の方法。
- Qが硫黄であり、nが0であり、R4が水素またはメチルであり、R3が-C(O)NH2であり、R2が-NH2である、請求項41または46に記載の方法。
- R4がメチルである、請求項47に記載の方法。
- R4が水素である、請求項47に記載の方法。
- R1がN-(3-ヒドロキシプロピル)ホルムアミド、N-(3-アミノプロピル)-N-メチルホルムアミド、またはtert-ブチル(3-(N-メチルホルムアミド)プロピル)カルバメートである、請求項33に記載の方法。
- R1がN-(3-ヒドロキシプロピル)ホルムアミドである、請求項50に記載の方法。
- Qが硫黄であり、nが0であり、R4が水素またはメチルであり、R3が-C(O)NH2であり、R2が-NH2である、請求項50または51に記載の方法。
- R4が水素である、請求項52に記載の方法。
- R1が(4-メチルピペラジン-1-イル)メチレン、4-メチルピペラジン-1-カルバルデヒド、ピペラジン-1-カルバルデヒド、またはtert-ブチル4-ホルミルピペラジン-1-カルボキシレートである、請求項54に記載の方法。
- R1が(4-メチルピペラジン-1-イル)メチレンである、請求項55に記載の方法。
- Qが硫黄であり、nが0であり、R4が水素またはメチルであり、R3が-C(O)NH2であり、R2が-NH2である、請求項54~56のいずれか1項に記載の方法。
- R4が水素である、請求項57に記載の方法。
- 化合物が、治療有効量の化合物および薬学的に許容される担体、賦形剤、または希釈剤を含む医薬組成物として投与される、請求項23~58のいずれか1項に記載の方法。
- 請求項1~21のいずれか1項に記載の化合物をCDK8またはCDK19と接触させることを含む、CDK8またはCDK19を阻害する方法。
- 化合物がCDK8と接触し、化合物がCDK8を特異的に阻害するか、または化合物がCDK19と接触し、化合物がCDK19を特異的に阻害する、請求項60に記載の方法。
- 化合物がCDK8およびCDK19の両方を特異的に阻害する、請求項61に記載の方法。
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