JP2022504472A - Her2結合四量体ポリペプチド - Google Patents
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Abstract
Description
Drebinと同僚は、US6,733,752に開示されているラットneu遺伝子産物p185<neu>に対する抗体を提案した。
最近、代替の標的タンパク質が提案され、ヒト免疫グロブリン由来の抗体フラグメント及び抗体由来の構築物とフォーマットに比べて、分子構造がより多様であり、ヘテロ二量体及び多量体アセンブリを作製することによってより多くの分子フォーマットを可能にし、新しい生物学的機能をもたらす。このような標的タンパク質はたくさん記載されている((Binz et al.,2005,Nat.Biotech,23,1257-1268)で総説された)。このような標的タンパク質の非限定的な例として、ラクダ抗体、タンパク質Aドメインに由来するタンパク質足場(「アルファボディ」と呼ばれ、Affibody AB)、テンダミスタット(αアミラーゼ阻害剤、ストレプトマイセス・テンダエからの74個のアミノ酸のβシートタンパク質)、フィブロネクチン、リポカリン(「Anticalins」,Pieris)、T細胞受容体、アンキリン(「DARPins」と呼ばれる設計アンキリンリピートタンパク質,Univ.Zurich and Molecular Partners;US20120142611を参照)、いくつかの受容体のAドメイン(「Avimers」,Avidia)及びPDZドメイン、フィブロネクチンドメイン(FN3)(「Adnectins」,Adnexus)、コンセンサスフィブロネクチンドメイン(「Centyrins」,Centyrex/Johnson&Johnson)、ユビキチン(「Affilins」,SCILタンパク質)及びノッチン(Moore and Cochrane,2012, Methods in Enzymology 503,223-251及びその中に引用された参考文献)が挙げられる。
NからCの方向に第1のVL抗原結合ドメイン及び第1のCL定常ドメインを含む第1のポリペプチド鎖と、
NからCの方向に第1のVH抗原結合ドメイン、第1のCH1定常ドメイン、第1のCH2定常ドメイン及び第1のCH3定常ドメインを含む第2のポリペプチド鎖と、
HER2 D4エピトープに特異的に結合する第1のリガンドであって、第1のポリペプチド鎖に含まれ、かつ、第1のドメイン間アミノ酸リンカーにより第1のVL抗原結合ドメインのN末端に連結され、あるいは、第2のポリペプチド鎖に含まれ、かつ、第1のドメイン間アミノ酸リンカーにより第1のVH抗原結合ドメインのN末端に連結される、第1のリガンドと、
第1のポリペプチド鎖の第1のVL抗原結合ドメイン及び第2のポリペプチド鎖の第1のVH抗原結合ドメインが一緒になって構成する、HER2 D1エピトープに特異的に結合する第2のリガンド、特にFabドメインと、
NからCの方向に第2のVL抗原結合ドメイン及び第2のCL定常ドメインを含む第3のポリペプチド鎖と、
NからCの方向に第2のVH抗原結合ドメイン、第2のCH1定常ドメイン、第2のCH2定常ドメイン及び第2のCH3定常ドメインを含む第4のポリペプチド鎖と、
HER2 D4エピトープに特異的に結合する第3のリガンドであって、第3のポリペプチド鎖に含まれ、かつ、第2のドメイン間アミノ酸リンカーにより第2のVL抗原結合ドメインのN末端に連結され、あるいは、第4のポリペプチド鎖に含まれ、かつ、第2のドメイン間アミノ酸リンカーにより第2のVH抗原結合ドメインのN末端に連結される、第3のリガンドと、
第3のポリペプチド鎖の第2のVL抗原結合ドメイン及び第4のポリペプチド鎖の第2のVH抗原結合ドメインが一緒になって構成する、HER2 D1エピトープに特異的に結合する第4のリガンド、特にFabドメインと、を含むか、又はそれらからなる。
別途定義されていない限り、本明細書で使用される全ての技術的用語及び科学的用語は、本分野(例えば、細胞培養、分子遺伝学、核酸化学、ハイブリダイゼーション技術及び生化学)の当業者が普通に認識しているものと同じ意味を有する。標準的な技術は、分子的、遺伝的、生化学的方法(一般的に、Sambrook et al.,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,2d ed.(1989)Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,N.Y.and Ausubel et al.,Short Protocols in Molecular Biology(1999)4th Ed,John Wiley & Sons, Inc.を参照)及び化学的方法に適用される。
・タンパク質Aドメイン、
・フィブロネクチンドメインFN3、
・コンセンサスフィブロネクチンドメイン、
・リポカリン(Skerra,2000,Biochim.Biophys.Acta,1482(1-2),337-50を参照)、
・ジンクフィンガータンパク質に由来するポリペプチド(Kwan et al.,2003,Structure,11(7),803-813を参照)、
・Src相同ドメイン2(SH2)又はSrc相同ドメイン3(SH3)、
・PDZドメイン、
・ガンマクリスタリン、
・ユビキチン、
・システインノットポリペプチド又はノッチン、
・シスタチン、
・Sac7d、
・三重ヘリックスコイルドコイル(アルファボディとしても知られている)、
・クニッツドメイン又はクニッツ型プロテアーゼ阻害剤、及び
・炭水化物結合モジュール32-2。
・NからCの方向に第1のVL抗原結合ドメイン及び第1のCL定常ドメインを含む第1のポリペプチド鎖と、
・NからCの方向に第1のVH抗原結合ドメイン、第1のCH1定常ドメイン、第1のCH2定常ドメイン及び第1のCH3定常ドメインを含む第2のポリペプチド鎖と、
・HER2 D4エピトープに特異的に結合する第1のリガンドであって、第1のポリペプチド鎖に含まれ、かつ、第1のドメイン間アミノ酸リンカーにより第1のVL抗原結合ドメインのN末端に連結され、あるいは、第2のポリペプチド鎖に含まれ、かつ、第1のドメイン間アミノ酸リンカーにより第1のVH抗原結合ドメインのN末端に連結される、第1のリガンドと、
・第1のポリペプチド鎖の第1のVL抗原結合ドメイン及び第2のポリペプチド鎖の第1のVH抗原結合ドメインが一緒になって構成する、HER2 D1エピトープに特異的に結合する第2のリガンド、特にFabドメインと、
・NからCの方向に第2のVL抗原結合ドメイン及び第2のCL定常ドメインを含む第3のポリペプチド鎖と、
・NからCの方向に第2のVH抗原結合ドメイン、第2のCH1定常ドメイン、第2のCH2定常ドメイン及び第2のCH3定常ドメインを含む第4のポリペプチド鎖と、
・HER2 D4エピトープに特異的に結合する第3のリガンドであって、第3のポリペプチド鎖に含まれ、かつ、第2のドメイン間アミノ酸リンカーにより第2のVL抗原結合ドメインのN末端に連結され、あるいは、第4のポリペプチド鎖に含まれ、かつ、第2のドメイン間アミノ酸リンカーにより第2のVH抗原結合ドメインのN末端に連結される、第3のリガンドと、
・第3のポリペプチド鎖の第2のVL抗原結合ドメイン及び第4のポリペプチド鎖の第2のVH抗原結合ドメインが一緒になって構成する、HER2 D1エピトープに特異的に結合する第4のリガンド、特にFabドメインと、を含むか、又はそれらからなる。
・NからCの方向に第1のVL抗原結合ドメイン及び第1のCL定常ドメインを含む第1のポリペプチド鎖と、
・NからCの方向に第1のVH抗原結合ドメイン及び第1のCH1定常ドメインを含み、特に第1のCH2定常ドメインを更に含み、より特に第1のCH2定常ドメインがそのC末端で欠損する第2のポリペプチド鎖と、
・HER2 D4エピトープに特異的に結合する第1のリガンドであって、第1のポリペプチド鎖に含まれ、かつ、第1のドメイン間アミノ酸リンカーにより第1のVL抗原結合ドメインのN末端に連結され、あるいは、第2のポリペプチド鎖に含まれ、かつ、第1のドメイン間アミノ酸リンカーにより第1のVH抗原結合ドメインのN末端に連結される、第1のリガンドと、
・第1のポリペプチド鎖の第1のVL抗原結合ドメイン及び第2のポリペプチド鎖の第1のVH抗原結合ドメインが一緒になって構成する、HER2 D1エピトープに特異的に結合する第2のリガンド、特にFabドメインと、
・NからCの方向に第2のVL抗原結合ドメイン及び第2のCL定常ドメインを含む第3のポリペプチド鎖と、
・NからCの方向に第2のVH抗原結合ドメイン及び第2のCH1定常ドメインを含み、特に第2のCH2定常ドメインを更に含み、より特に第2のCH2定常ドメインがそのC末端で欠損する第4のポリペプチド鎖と、
・HER2 D4エピトープに特異的に結合する第3のリガンドであって、第3のポリペプチド鎖に含まれ、かつ、第2のドメイン間アミノ酸リンカーにより第2のVL抗原結合ドメインのN末端に連結され、あるいは、第4のポリペプチド鎖に含まれ、かつ、第2のドメイン間アミノ酸リンカーにより第2のVH抗原結合ドメインのN末端に連結される、第3のリガンドと、
・第3のポリペプチド鎖の第2のVL抗原結合ドメイン及び第4のポリペプチド鎖の第2のVH抗原結合ドメインが一緒になって構成する、HER2 D1エピトープに特異的に結合する第4のリガンド、特にFabドメインと、を含むか、又はそれらからなる。
・第1のリガンドのscFv重鎖は、配列番号15、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号44、配列番号53、配列番号54及び配列番号80から選択されるペプチド配列と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有するペプチド配列を含むか、又はそれらからなり、最も特に、第1のリガンドのscFv重鎖は、配列番号15、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号44、配列番号53、配列番号54及び配列番号80から選択されるペプチド配列と同一のペプチド配列を含むか、又はそれらからなり、
・第1のリガンドのscFv軽鎖は、配列番号14、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号43及び配列番号81から選択されるペプチド配列と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有するペプチド配列を含むか、又はそれらからなり、最も特に、第1のリガンドのscFv軽鎖は、配列番号14、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号43及び配列番号81から選択されるペプチド配列と同一のペプチド配列を含むか、又はそれらからなる。
・第1のリガンドのscFv重鎖は、配列番号15、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号44、配列番号53、配列番号54及び配列番号80から選択されるペプチド配列と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するペプチド配列を含むか、又はそれらからなり、
・第1のリガンドのscFv軽鎖は、配列番号14、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号43及び配列番号81から選択されるペプチド配列と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するペプチド配列を含むか、又はそれらからなる。
・第3のリガンドのscFv重鎖は、配列番号15、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号44、配列番号53、配列番号54及び配列番号80から選択されるペプチド配列と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有するペプチド配列を含むか、又はそれらからなり、最も特に、第3のリガンドのscFv重鎖は、配列番号15、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号44、配列番号53、配列番号54及び配列番号80から選択されるペプチド配列と同一のペプチド配列を含むか、又はそれらからなり、
・第3のリガンドのscFv軽鎖は、配列番号14、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号43及び配列番号81から選択されるペプチド配列と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有するペプチド配列を含むか、又はそれらからなり、最も特に、第3のリガンドのscFv軽鎖は、配列番号14、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号43及び配列番号81から選択されるペプチド配列と同一のペプチド配列を含むか、又はそれらからなる。
・第3のリガンドのscFv軽鎖は、配列番号14、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号43及び配列番号81から選択されるペプチド配列と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するペプチド配列を含むか、又はそれらからなる。
・第1のリガンド及び第3のリガンドのscFv重鎖は、それぞれ配列番号15、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号44、配列番号53、配列番号54及び配列番号80から選択されるペプチド配列と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有するペプチド配列を含むか、又はそれらからなり、最も特に、第1のリガンド及び第3のリガンドのscFv重鎖は、それぞれ配列番号15、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号44、配列番号53、配列番号54及び配列番号80から選択されるペプチド配列と同一のペプチド配列を含むか、又はそれらからなり、
・第1のリガンド及び第3のリガンドのscFv軽鎖は、それぞれ配列番号14、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号43及び配列番号81から選択されるペプチド配列と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有するペプチド配列を含むか、又はそれらからなり、最も特に、第1のリガンド及び第3のリガンドのscFv軽鎖は、それぞれ配列番号14、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号43及び配列番号81から選択されるペプチド配列と同一のペプチド配列を含むか、又はそれらからなる。
・第1のリガンド及び第3のリガンドのscFv重鎖は、それぞれ配列番号15、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号44、配列番号53、配列番号54及び配列番号80から選択されるペプチド配列と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するペプチド配列を含むか、又はそれらからなり、
・第1のリガンド及び第3のリガンドのscFv軽鎖は、それぞれ配列番号14、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号43及び配列番号81から選択されるペプチド配列と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するペプチド配列を含むか、又はそれらからなる。
・第1のポリペプチド鎖は、配列番号18、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号39、配列番号41、配列番号50及び配列番号76から選択されるペプチド配列と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有するペプチド配列を含み、最も特に、第1のポリペプチド鎖は、配列番号18、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号39、配列番号41、配列番号50及び配列番号76から選択されるペプチド配列と同一のペプチド配列を含み、
・第2のポリペプチド鎖は、配列番号19、配列番号20、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号40、配列番号42、配列番号51、配列番号52及び配列番号77から選択されるペプチド配列と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有するペプチド配列を含み、最も特に、第2のポリペプチド鎖は、配列番号19、配列番号20、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号40、配列番号42、配列番号51、配列番号52及び配列番号77から選択されるペプチド配列と同一のペプチド配列を含む。
・第1のポリペプチド鎖は、配列番号18、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号39、配列番号41、配列番号50及び配列番号76から選択されるペプチド配列と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するペプチド配列を含み、
・第2のポリペプチド鎖は、配列番号19、配列番号20、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号40、配列番号42、配列番号51、配列番号52及び配列番号77から選択されるペプチド配列と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するペプチド配列を含む。
・第3のポリペプチド鎖は、配列番号18、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号39、配列番号41、配列番号50及び配列番号76から選択されるペプチド配列と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有するペプチド配列を含み、最も特に、第3のポリペプチド鎖は、配列番号18、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号39、配列番号41、配列番号50及び配列番号76から選択されるペプチド配列と同一のペプチド配列を含み、
・第4のポリペプチド鎖は、配列番号19、配列番号20、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号40、配列番号42、配列番号51、配列番号52及び配列番号77から選択されるペプチド配列と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有するペプチド配列を含み、最も特に、第4のポリペプチド鎖は、配列番号19、配列番号20、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号40、配列番号42、配列番号51、配列番号52及び配列番号77から選択されるペプチド配列と同一のペプチド配列を含む。
・第3のポリペプチド鎖は、配列番号18、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号39、配列番号41、配列番号50及び配列番号76から選択されるペプチド配列と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するペプチド配列を含み、
・第4のポリペプチド鎖は、配列番号19、配列番号20、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号40、配列番号42、配列番号51、配列番号52及び配列番号77から選択されるペプチド配列と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するペプチド配列を含む。
・第1のポリペプチド鎖及び第3のポリペプチド鎖は、それぞれ配列番号18、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号39、配列番号41、配列番号50及び配列番号76から選択されるペプチド配列と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有するペプチド配列を含み、最も特に、第1のポリペプチド鎖及び第3のポリペプチド鎖は、それぞれ配列番号18、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号39、配列番号41、配列番号50及び配列番号76から選択されるペプチド配列と同一のペプチド配列を含み、
・第2のポリペプチド鎖及び第4のポリペプチド鎖は、それぞれ配列番号19、配列番号20、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号40、配列番号42、配列番号51、配列番号52及び配列番号77から選択されるペプチド配列と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有するペプチド配列を含み、最も特に、第2のポリペプチド鎖及び第4のポリペプチド鎖は、それぞれ配列番号19、配列番号20、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号40、配列番号42、配列番号51、配列番号52及び配列番号77から選択されるペプチド配列と同一のペプチド配列を含む。
・第1のポリペプチド鎖及び第3のポリペプチド鎖は、それぞれ配列番号18、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号39、配列番号41、配列番号50及び配列番号76から選択されるペプチド配列と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するペプチド配列を含み、
・第2のポリペプチド及び第4のポリペプチド鎖は、それぞれ配列番号19、配列番号20、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号40、配列番号42、配列番号51、配列番号52及び配列番号77から選択されるペプチド配列と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するペプチド配列を含む。
・第1のポリペプチド鎖は、配列番号36、配列番号37、配列番号38及び配列番号78と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有するペプチド配列を含み、最も特に、第1のポリペプチド鎖は、配列番号36、配列番号37、配列番号38及び配列番号78と同一のペプチド配列を含み、
・第2のポリペプチド鎖は、配列番号33、配列番号34、配列番号35及び配列番号79と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有するペプチド配列を含み、最も特に、第2のポリペプチド鎖は、配列番号33、配列番号34、配列番号35及び配列番号79と同一のペプチド配列を含む。
・第1のポリペプチド鎖は、配列番号36、配列番号37、配列番号38及び配列番号78と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するペプチド配列を含み、
・第2のポリペプチド鎖は、配列番号33、配列番号34、配列番号35及び配列番号79と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するペプチド配列を含む。
・第3のポリペプチド鎖は、配列番号36、配列番号37、配列番号38及び配列番号78と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有するペプチド配列を含み、最も特に、第3のポリペプチド鎖は、配列番号36、配列番号37、配列番号38及び配列番号78と同一のペプチド配列を含み、
・第4のポリペプチド鎖は、配列番号33、配列番号34、配列番号35及び配列番号79と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有するペプチド配列を含み、最も特に、第4のポリペプチド鎖は、配列番号33、配列番号34、配列番号35及び配列番号79と同一のペプチド配列を含む。
・第3のポリペプチド鎖は、配列番号36、配列番号37、配列番号38及び配列番号78と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するペプチド配列を含み、
・第4のポリペプチド鎖は、配列番号33、配列番号34、配列番号35及び配列番号79と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するペプチド配列を含む。
・第1のポリペプチド鎖及び第3のポリペプチド鎖は、それぞれ配列番号36、配列番号37、配列番号38及び配列番号78と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有するペプチド配列を含み、最も特に、第1のポリペプチド鎖及び第3のポリペプチド鎖は、それぞれ配列番号36、配列番号37、配列番号38及び配列番号78と同一のペプチド配列を含み、
・第2のポリペプチド鎖及び第4のポリペプチド鎖は、それぞれ配列番号33、配列番号34、配列番号35及び配列番号79と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有するペプチド配列を含み、最も特に、第2のポリペプチド鎖及び第4のポリペプチド鎖は、それぞれ配列番号33、配列番号34、配列番号35及び配列番号79と同一のペプチド配列を含む。
・第1のポリペプチド鎖及び第3のポリペプチド鎖は、それぞれ配列番号36、配列番号37、配列番号38及び配列番号78と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するペプチド配列を含み、
・第2のポリペプチド鎖及び第4のポリペプチド鎖は、それぞれ配列番号33、配列番号34、配列番号35及び配列番号79と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するペプチド配列を含む。
・第1のポリペプチド鎖は、配列番号1と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有し、最も特に、第1のポリペプチド鎖は、配列番号1と同一であり、
・第2のポリペプチド鎖は、配列番号2と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有し、最も特に、第2のポリペプチド鎖は、配列番号2と同一である。
・第1のポリペプチド鎖は、配列番号1と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有し、
・第2のポリペプチド鎖は、配列番号2と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有する。
・第3のポリペプチド鎖は、配列番号1と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有し、最も特に、第3のポリペプチド鎖は、配列番号1と同一であり、
・第4のポリペプチド鎖は、配列番号2と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有し、最も特に、第4のポリペプチド鎖は、配列番号2と同一である。
・第3のポリペプチド鎖は、配列番号1と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有し、
・第4のポリペプチド鎖は、配列番号2と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有する。
・第1のポリペプチド鎖及び第3のポリペプチド鎖は、それぞれ配列番号1と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有し、最も特に、第1のポリペプチド鎖及び第3のポリペプチド鎖は、配列番号1と同一であり、
・第2のポリペプチド鎖及び第4のポリペプチド鎖は、それぞれ配列番号2と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有し、最も特に、第2のポリペプチド鎖及び第4のポリペプチド鎖は、配列番号2と同一である。
・第1のポリペプチド鎖及び第3のポリペプチド鎖は、それぞれ配列番号1と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有し、
・第2のポリペプチド鎖及び第4のポリペプチド鎖は、それぞれ配列番号2と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有する。
・第1のポリペプチド鎖は、配列番号3と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有し、最も特に、第1のポリペプチド鎖は、配列番号3と同一であり、
・第2のポリペプチド鎖は、配列番号4と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有し、最も特に、第2のポリペプチド鎖は、配列番号4と同一である。
・第1のポリペプチド鎖は、配列番号3と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有し、
・第2のポリペプチド鎖は、配列番号4と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有する。
・第3のポリペプチド鎖は、配列番号3と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有し、最も特に、第3のポリペプチド鎖は、配列番号3と同一であり、
・第4のポリペプチド鎖は、配列番号4と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有し、最も特に、第4のポリペプチド鎖は、配列番号4と同一である。
・第3のポリペプチド鎖は、配列番号3と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有し、
・第4のポリペプチド鎖は、配列番号4と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有する。
・第1のポリペプチド鎖及び第3のポリペプチド鎖は、それぞれ配列番号3と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有し、最も特に、第1のポリペプチド鎖及び第3のポリペプチド鎖は、配列番号3と同一であり、
・第2のポリペプチド鎖及び第4のポリペプチド鎖は、それぞれ配列番号4と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有し、最も特に、第2のポリペプチド鎖及び第4のポリペプチド鎖は、配列番号4と同一である。
・第1のポリペプチド鎖及び第3のポリペプチド鎖は、それぞれ配列番号3と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有し、
・第2のポリペプチド鎖及び第4のポリペプチド鎖は、それぞれ配列番号4と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有する。
・第1のポリペプチド鎖は、配列番号11と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有し、最も特に、第1のポリペプチド鎖は、配列番号11と同一であり、
・第2のポリペプチド鎖は、配列番号12と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有し、最も特に、第2のポリペプチド鎖は、配列番号12と同一である。
・第1のポリペプチド鎖は、配列番号11と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有し、
・第2のポリペプチド鎖は、配列番号12と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有する。
・第3のポリペプチド鎖は、配列番号11と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有し、最も特に、第3のポリペプチド鎖は、配列番号11と同一であり、
・第4のポリペプチド鎖は、配列番号12と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有し、最も特に、第4のポリペプチド鎖は、配列番号12と同一である。
・第3のポリペプチド鎖は、配列番号11と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有し、
・第4のポリペプチド鎖は、配列番号12と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有する。
・第1のポリペプチド鎖及び第3のポリペプチド鎖は、それぞれ配列番号11と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有し、最も特に、第1のポリペプチド鎖及び第3のポリペプチド鎖は、配列番号11と同一であり、
・第2のポリペプチド鎖及び第4のポリペプチド鎖は、それぞれ配列番号12と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性を有し、最も特に、第2のポリペプチド鎖及び第4のポリペプチド鎖は、配列番号12と同一である。
・第1のポリペプチド鎖及び第3のポリペプチド鎖は、それぞれ配列番号11と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有し、
・第2のポリペプチド鎖及び第4のポリペプチド鎖は、それぞれ配列番号12と70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の配列同一性を有する。
本発明の別の側面は、本発明の四量体ポリペプチド、又はその医薬的に許容される塩、及び医薬的に許容される担体を含む医薬組成物に関する。更なる実施形態において、当該組成物は、本明細書に記載された少なくとも2つの医薬的に許容される担体を含む。
項目1:HER2 D4エピトープに結合する第1のリガンド、ドメイン間アミノ酸リンカー及び第1の免疫グロブリンドメインを含む第1のポリペプチド鎖と、
第2の免疫グロブリンドメインを含む第2のポリペプチド鎖であって、第1の免疫グロブリンドメイン及び第2の免疫グロブリンドメインが共にHER2 D1エピトープに結合する第2のリガンド、特にFabドメインを構成する第2のポリペプチド鎖と、
HER2 D4エピトープに結合する第3のリガンド、ドメイン間アミノ酸リンカー及び第3の免疫グロブリンドメインを含む第3のポリペプチド鎖と、
第4の免疫グロブリンドメインを含む第4のポリペプチド鎖であって、第3の免疫グロブリンドメイン及び第4の免疫グロブリンドメインが共にHER2 D1エピトープに結合する第4のリガンド、特にFabドメインを構成する第4のポリペプチド鎖と、を含むか、又はそれらからなる四量体ポリペプチド。
項目2:項目1に記載のポリペプチドにおいて、前記第1の免疫グロブリンドメインは、前記第3の免疫グロブリンドメインと実質的に同じであり、及び/又は前記第2の免疫グロブリンドメインは、前記第4の免疫グロブリンドメインと実質的に同じである。
項目3:項目1又は2に記載のポリペプチドにおいて、前記第1のリガンドは、前記第3のリガンドと実質的に同じである。
項目4:前記項目のいずれか一項に記載のポリペプチドにおいて、前記第1のリガンド及び/又は前記第3のリガンドは、scFv重鎖、scFvリンカー鎖及びscFv軽鎖を含む一本鎖可変フラグメントポリペプチド鎖を含むか、又はそれからなる。
項目5:項目4に記載のポリペプチドにおいて、前記scFv重鎖は、4D5のVHドメインであり、前記scFv軽鎖は、4D5のVLドメインである。
項目6:項目1~5のいずれか一項に記載のポリペプチドにおいて、
-前記第1の免疫グロブリンドメインはVLドメインであり、前記第2の免疫グロブリンドメインはVHドメインであり、及び/又は前記第3の免疫グロブリンドメインはVLドメインであり、前記第4の免疫グロブリンドメインはVHドメインであり、又は
-前記第1の免疫グロブリンドメインはVHドメインであり、前記第2の免疫グロブリンドメインはVLドメインであり、及び/又は前記第3の免疫グロブリンドメインはVHドメインであり、前記第4の免疫グロブリンドメインはVLドメインである。
項目7:項目6に記載のポリペプチドにおいて、前記VHドメインは、C末端でCH1ドメインに連結される。
項目8:項目7に記載のポリペプチドにおいて、前記CH1ドメインは、C末端でCH2ドメイン又はCH2ドメイン及びCH3ドメインに連結される。
項目9:項目6~8のいずれか一項に記載のポリペプチドにおいて、前記VLドメインは、C末端でCLドメインに連結される。
項目10:項目6~9のいずれか一項に記載のポリペプチドにおいて、前記VHドメインは、A21のVHドメイン及び7C2のVHドメインから選択され、前記VLドメインは、A21のVLドメイン及び7C2のVLドメインから選択される。
項目11:前記項目のいずれか一項に記載のポリペプチドにおいて、前記ドメイン間アミノ酸リンカーは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19又は20個のアミノ酸からなる。
項目12:前記項目のいずれか一項に記載のポリペプチドにおいて、前記ドメイン間アミノ酸リンカーは、アミノ酸G、A、J、S、T、P、C、V、M及びEを含むか、又はそれらからなり、特に、前記ドメイン間アミノ酸リンカーは、アミノ酸G、S、A及びTを含むか、又はそれらからなる。
項目13:前記項目のいずれか一項に記載のポリペプチドにおいて、前記ドメイン間アミノ酸リンカーは、アミノ酸配列(GGGGS)nにより特徴付けられ、nは、1、2、3、4又は5である。
項目14:前記項目のいずれか一項に記載の二重特異性HER2ポリペプチドにおいて、前記ドメイン間アミノ酸リンカーは、配列番号17、配列番号55~配列番号69及び配列番号82~配列番号91のいずれか1つにより特徴付けられる配列を含むか、又はそのような配列である。
項目15:前記項目のいずれか一項に記載のポリペプチドにおいて、前記ドメイン間アミノ酸リンカーは、配列番号17、配列番号55~配列番号69及び配列番号82~配列番号91のうちの1つから選択されるペプチド配列、又は少なくとも70%の配列同一性を有する機能的に同等のペプチド配列を含むか、又はそれらからなる。
項目16:前記項目のいずれか一項に記載のポリペプチドのHer2の発現に関連する悪性腫瘍性疾患の予防又は治療方法における応用。
本発明者らは、バイパラトピックIgG誘導体を生成した。Medimmune MEDI4276からの抗体薬物複合体(ADC)(Li et al.,2016)のような他の利用可能なバイパラトピックHER2標的抗体と比較すれば、これらのIgGは、薬物が付着していない(Kast et al.,調製中)「裸の」結合タンパク質として、非常に強い抗腫瘍活性を示す。従って、これらの新規のバイパラトピック抗HER2 IgGは、単一の分子でトラスツズマブとペルツズマブの作用メカニズム、及びHER2に対する小分子キナーゼ阻害剤の作用メカニズムを組み合わせたと認められている。更に、ADCがその毒素によって多くの健康な組織で作用できることに対し、バイパラトピック抗HER2 IgGは、HER2中毒細胞のみに作用できるため、その潜在的なオフターゲット効果が、T-DM1やMEDI4276などのADC融合体の効果より遥かに低いと予想される。よって、新しい併用療法の治療濃度域が開拓される。更に、HER2受容体の重合によるpan-ErbB阻害は、他の受容体型チロシンキナーゼ(RTK)の代償性活性化を受動的に遮断する可能性がある。バイパラトピック抗HER2結合剤は、他のRTKの活性化を遮断する可能性のあるシグナル伝達能力を有する複合体を誘導することなく、HER2増幅癌の細胞表面でのHER2受容体の自由な横移動を干渉する。その結果、バイパラトピック抗HER2結合剤は、小分子阻害剤との強い相乗効果を示すことができ、当該小分子阻害剤は、最終的に治療から逃げるように働く代償性RTKの発現を誘導する傾向がある。従って、幅広いHER2増幅癌では、バイパラトピック抗HER2 IgGは、小分子阻害剤と組み合わせることで強い抗腫瘍相乗効果を引き出す潜在能力が非常に高い。小分子阻害剤との相乗効果の潜在能力は、現在の単一特異性抗体又は抗体の組み合わせより優れている。
ベクターの設計
同時トランスフェクションのために、2つの発現カセット又は2つのベクターシステムを含むバイシストロニックプラスミドを構築する。プラスミドpYMex10(Morphosys)の誘導体をバイシストロニック戦略に用いる。得られたプラスミド構築物において、多量体構築物のポリペプチド鎖のコード配列は、それぞれ各々のCMVプロモーターにより制御され、例えばウシ成長ホルモン又はシミアンウイルス40から得られたポリAテールシグナルによって終わる(図3及び図4を参照)。pcDNA3.1(Thermo)に由来するベクターを同時トランスフェクションに用いる。ここで、各々のポリペプチド鎖は、別々のプラスミドにあり、相同要素の組換えのリスクが低減され、更に収量を改善するようにトランスフェクション用プラスミドのモル比が調整可能になる。標準クローニング技術によって対象遺伝子の交換を行うことができる。得られた構築物の例は図5に示される。
TPP600バイオリアクタにおいて、指数関数的に成長するCHO-S細胞(Thermo)を、1mlあたりに400万の密度でCHOgro(Mirrus)に接種する。1mlの培養物あたりに、3μgの線状ポリエチレンイミン(MW25,000,PolySciences Inc)と1.25μgの高純度プラスミドDNAを混合しながら添加する。最後に、最終濃度が1mMになるように培養物にバルプロ酸を追加する。Kuhner ISF1-Xシェーカーにおいて、31℃又は37℃、8%のCO2、180rpm、及び50mmの振幅で12日間もタンパク質を発現する。
1400rpm及び4℃で30分間遠心分離することによって発現培養物が得られる。上澄み液を0.22μmの濾過によって更に清澄し、pHを7に調整する。全ての後続の精製ステップは4℃で実施される。上澄み液を、AEKTA Pureシステムで操作されてPBSで平衡化したrProteinAカラム(GE)に注ぐ。PBSで洗浄した後、結合したタンパク質を0.1Mのグリシン(pH2.75)で溶出する(図6のクロマトグラム)。対象画分を合わせ、バッファーを20mMのBis/Trisメタン、20mMのNaCl(pH6.75)に交換する。濾過後のタンパク質溶液をResource S(GE)カラムにロードし、100%の20mMのBis/Trisメタン、1000mMのNaCl(pH6.75)になるように勾配で溶出する(図7を参照)。所望の画分を合わせ、必要に応じて、高純度を得るようにSEC(適切なサイズのSuperdex200カラム,GE)で仕上げる(図8)。単量体画分を合わせ、濾過し、SDSPAGEで純度を分析する(図9)。最後に、純粋なタンパク質は、生化学及び細胞アッセイ、ならびに生体内研究に用いられる。
当業者に公知の様々なアッセイで、四量体(四価及びバイパラトピック)ポリペプチド構築物441及び47C2をテストし、且つ、四価IgG融合体MEDI4276(毒素無し)、二量体二価バイパラトピックポリペプチド構築物841、87C2及びそれらのFc融合体、二価バイパラトピックDARPin構築物6L1G(特許出願WO2014/060365A1を参照)、単一のIgG(TZB、PZB、A21及び7C2)及びそれらの組み合わせと比較する。
BT-474及びHCC1419乳癌細胞を用いた顕微鏡検査
固定サンプルに顕微鏡検査を行うために、細胞を4・104cm-2の密度で完全培地のμスライド(Ibidi,cat.no.80824)に接種する。翌日、対応する分子で細胞を処理する。2時間後、ダルベッコリン酸緩衝生理食塩水(DPBS)で細胞を一回洗浄し、DPBSに溶解した4%(w/v)のパラホルムアルデヒドを添加し、室温で10分間インキュベートすることで固定する。次に、PBSBA+T(1%(w/v)のウシ血清アルブミン(BSA)、0.1%(w/v)のアジ化ナトリウム、及び0.5%(w/v)のTween-20を追加したDPBS)で細胞を2回洗浄する。その後、1:150(v/v)でPBSBA+Tに溶解し、更に100ng ml-1の2-(4-アミジノフェニル)-1H-インドール-6-カルボキシミドアミド(DAPI)を追加した抗LAMP抗体(Cell Signaling Technology,cat.no.D401S)において、室温で細胞を30分間インキュベートする。次に、PBSBA+Tで細胞を2回洗浄し、続いてAlexa Fluor 488(Thermo Fisher Scientific,cat.no.A11001)に接合する抗マウス抗体、及びAlexa Fluor 647(Thermo Fisher Scientific,cat.no.A-21445)に接合してPBSBA+Tに溶解したヤギ由来の抗ヒト抗体を添加し、室温で30分間インキュベートする。次に、PBSBA+Tで細胞を2回洗浄し、DPBSに溶解した4%(w/v)のパラホルムアルデヒドを添加して再度固定し、室温で10分間インキュベートし、最後にPBSAで1回洗浄し、測定するまでに4℃でPBSA(0.1%(w/v)のアジ化ナトリウムを追加したDPBS)で保存する。SP5共焦点レーザー走査型顕微鏡(Leica)に画像を形成する。画像から、2つの細胞株に対して、441のみがその急速な内在化を誘導することができ、リソソーム(LAMP1陽性)コンパートメントとの強い共局在性を示していることが分かる。
治療時のHER2の内在化と分解を定量化するために、定量的な表面タンパク質の内在化と分解アッセイを実施した。簡潔に言えば、メーカーの説明書に基づいて、安定したFlp-In TREx HEK293細胞株(Thermo Fisher Scientific,cat.no.K650001)を生成し、誘導時にHaloTag-HER2受容体融合体を過剰発現することができる。アッセイについて、初回の処理時点の2日前に細胞を接種し、処理時点の1日前にドキシサイクリンを添加して安定した過剰発現を24時間誘導する。細胞標識の時間を参照して、示された時点で処理物(100nM)を添加する。
フローサイトメトリー機器のAF660及びTMRチャネルでの異なる検出効率を補正するために、データをスケーリングして、相対的存在量を算出する。そのために、第1の(HTL-AF660標識)段階が省略された対照サンプル(utr.,s.)が必要となる。このサンプルでは、全てのHaloTag分子は、その局在性を問わず、この「単一」(s.)の標識手順でHTL-TMRと反応する。一重項非透過性細胞集団の平均蛍光強度(MFI)を使用して、単一標識の未処理対照サンプル(utr.,s.)の正規化及びバックグラウンド除去によって、サンプルのTMRチャネルの正規化(特徴スケーリング)シグナルSTMRを取得する。
Claims (15)
- (a)第1のVL抗原結合ドメイン及び第1のCL定常ドメインを含む第1のポリペプチド鎖と、
(b)第1のVH抗原結合ドメイン、第1のCH1定常ドメイン、第1のCH2定常ドメイン及び第1のCH3定常ドメインを含む第2のポリペプチド鎖と、
(c)HER2 D4エピトープに特異的に結合する第1のリガンドであって、前記第1のポリペプチド鎖に含まれ、かつ、第1のドメイン間アミノ酸リンカーにより前記第1のVL抗原結合ドメインのN末端に連結され、あるいは、前記第2のポリペプチド鎖に含まれ、かつ、第1のドメイン間アミノ酸リンカーにより前記第1のVH抗原結合ドメインのN末端に連結される、第1のリガンドと、
(d)第1のポリペプチド鎖の第1のVL抗原結合ドメイン及び第2のポリペプチド鎖の第1のVH抗原結合ドメインが一緒になって構成する、HER2 D1エピトープに特異的に結合する第2のリガンド、特にFabドメインと、
(e)第2のVL抗原結合ドメイン及び第2のCL定常ドメインを含む第3のポリペプチド鎖と、
(f)第2のVH抗原結合ドメイン、第2のCH1定常ドメイン、第2のCH2定常ドメイン及び第2のCH3定常ドメインを含む第4のポリペプチド鎖と、
(g)HER2 D4エピトープに特異的に結合する第3のリガンドであって、前記第3のポリペプチド鎖に含まれ、かつ、第2のドメイン間アミノ酸リンカーにより前記第2のVL抗原結合ドメインのN末端に連結され、あるいは、前記第4のポリペプチド鎖に含まれ、かつ、第2のドメイン間アミノ酸リンカーにより前記第2のVH抗原結合ドメインのN末端に連結される、第3のリガンドと、
(h)第3のポリペプチド鎖の第2のVL抗原結合ドメイン及び第4のポリペプチド鎖の第2のVH抗原結合ドメインが一緒になって構成する、HER2 D1エピトープに特異的に結合する第4のリガンド、特にFabドメインと、
を含むか、又はそれらからなる、四量体ポリペプチド。 - 前記第1のポリペプチド鎖と前記第3のポリペプチド鎖、及び/又は前記第2のポリペプチド鎖と前記第4のポリペプチド鎖は、互いに70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性により特徴付けられ、最も特に前記第1のポリペプチド鎖と前記第3のポリペプチド鎖、及び/又は前記第2のポリペプチド鎖と前記第4のポリペプチド鎖は同一であり、及び/又は、前記第1のリガンドと前記第3のリガンドは、互いに70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性により特徴付けられ、最も特に前記第1のリガンドと前記第3のリガンドは同一である、請求項1に記載のポリペプチド。
- 前記第2のポリペプチド鎖の前記第1のCH2定常ドメイン及び前記第1のCH3定常ドメインが、前記第4のポリペプチド鎖の前記第2のCH2定常ドメイン及び前記第2のCH3定常ドメインと相互作用し、特に共有結合することで、四量体ポリペプチドが形成される、請求項1又は2に記載の四量体ポリペプチド。
- 前記第2のポリペプチド鎖が、前記第1のCH1定常ドメインと前記第1のCH2定常ドメインの間に第1のヒンジ領域を含み、前記第4のポリペプチド鎖が、前記第2のCH1定常ドメインと前記第2のCH2定常ドメインの間に第2のヒンジ領域を含み、前記第1のヒンジ領域及び前記第2のヒンジ領域が、特に少なくとも1つのジスルフィド結合により、前記第2のポリペプチド鎖と前記第4のポリペプチド鎖の間の複合体形成を媒介することで、四量体ポリペプチドが形成される、請求項1~3のいずれか一項に記載の四量体ポリペプチド。
- 前記第1のリガンド及び/又は前記第3のリガンドが、scFv重鎖、scFvリンカー鎖及びscFv軽鎖を含む一本鎖可変フラグメントポリペプチド鎖を含むか、又はそれらからなり、特に、
(a)前記第1のリガンド及び/又は前記第3のリガンドの前記scFv重鎖が、配列番号15、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号44、配列番号53、配列番号54及び配列番号80から選択されるペプチド配列と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性により特徴付けられるペプチド配列を含み、最も特に、前記第1のリガンド及び/又は前記第3のリガンドの前記scFv重鎖が、配列番号15、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号44、配列番号53、配列番号54及び配列番号80から選択されるペプチド配列と同一のペプチド配列を含み、
(b)前記第1のリガンド及び/又は前記第3のリガンドの前記scFv軽鎖が、配列番号14、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号43及び配列番号81から選択されるペプチド配列と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性により特徴付けられるペプチド配列を含み、最も特に、前記第1のリガンド及び/又は前記第3のリガンドの前記scFv軽鎖が、配列番号14、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号43及び配列番号81から選択されるペプチド配列と同一のペプチド配列を含む、
請求項1~4のいずれか一項に記載のポリペプチド。 - 前記scFvリンカー鎖が、配列番号16と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性により特徴付けられるペプチド配列を含み、最も特に、前記scFvリンカー鎖が、配列番号16と同一のペプチド配列を含む、請求項5に記載のポリペプチド。
- (a)前記第1のポリペプチド鎖及び/又は前記第3のポリペプチド鎖が、配列番号18、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号39、配列番号41、配列番号50及び配列番号76から選択されるペプチド配列と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性により特徴付けられるペプチド配列を含み、最も特に、前記第1のポリペプチド鎖及び/又は前記第3のポリペプチド鎖が、配列番号18、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号39、配列番号41、配列番号50及び配列番号76から選択されるペプチド配列と同一のペプチド配列を含み、
(b)前記第2のポリペプチド鎖及び/又は前記第4のポリペプチド鎖が、配列番号19、配列番号20、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号40、配列番号42、配列番号51、配列番号52及び配列番号77から選択されるペプチド配列と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性により特徴付けられるペプチド配列を含み、最も特に、前記第2のポリペプチド鎖及び/又は前記第4のポリペプチド鎖が、配列番号19、配列番号20、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号40、配列番号42、配列番号51、配列番号52及び配列番号77から選択されるペプチド配列と同一のペプチド配列を含む、
請求項1~6のいずれか一項に記載のポリペプチド。 - (a)前記第1のポリペプチド鎖及び/又は前記第3のポリペプチド鎖が、配列番号36、配列番号37、配列番号38及び配列番号78と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性により特徴付けられるペプチド配列を含み、最も特に、前記第1のポリペプチド鎖及び/又は前記第3のポリペプチド鎖が、配列番号36、配列番号37、配列番号38及び配列番号78と同一のペプチド配列を含み、
(b)前記第2のポリペプチド鎖及び/又は前記第4のポリペプチド鎖が、配列番号33、配列番号34、配列番号35及び配列番号79と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性により特徴付けられるペプチド配列を含み、最も特に、前記第2のポリペプチド鎖及び/又は前記第4のポリペプチド鎖が、配列番号33、配列番号34、配列番号35及び配列番号79と同一のペプチド配列を含む、
請求項1~7のいずれか一項に記載のポリペプチド。 - (a)前記第1のポリペプチド鎖及び/又は前記第3のポリペプチド鎖が、配列番号1と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性により特徴付けられ、最も特に、前記第1のポリペプチド鎖及び/又は前記第3のポリペプチド鎖が、配列番号1と同一であり、
(b)前記第2のポリペプチド鎖及び/又は前記第4のポリペプチド鎖が、配列番号2と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性により特徴付けられ、最も特に、前記第2のポリペプチド鎖及び/又は前記第4のポリペプチド鎖が、配列番号2と同一である、
請求項1~8のいずれか一項に記載のポリペプチド。 - (a)前記第1のポリペプチド鎖及び/又は前記第3のポリペプチド鎖が、配列番号3と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性により特徴付けられ、最も特に、前記第1のポリペプチド鎖及び/又は前記第3のポリペプチド鎖が、配列番号3と同一であり、
(b)前記第2のポリペプチド鎖及び/又は前記第4のポリペプチド鎖が、配列番号4と70%以上、特に80%以上、より特に90%以上、更に特に95%以上の配列同一性により特徴付けられ、最も特に、前記第2のポリペプチド鎖及び/又は前記第4のポリペプチド鎖が、配列番号4と同一である、
請求項1~9のいずれか一項に記載のポリペプチド。 - 前記第1のドメイン間アミノ酸リンカー及び/又は前記第2のドメイン間アミノ酸リンカーが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19又は20個のアミノ酸からなり、前記第1のドメイン間アミノ酸リンカー及び/又は前記第2のドメイン間アミノ酸リンカーが、アミノ酸G、A、J、S、T、P、C、V、M及びEを含むか、又はそれらからなり、特に、前記第1のドメイン間アミノ酸リンカー及び/又は前記第2のドメイン間アミノ酸リンカーが、アミノ酸G、S、A及びTを含むか、又はそれらからなり、特に、前記第1のドメイン間アミノ酸リンカー及び/又は前記第2のドメイン間アミノ酸リンカーが、アミノ酸配列(GGGGS)nにより特徴付けられ、nは、1、2、3、4又は5であり、あるいは、前記第1のドメイン間アミノ酸リンカー及び/又は前記第2のドメイン間アミノ酸リンカーが、配列番号17、配列番号55~配列番号69及び配列番号82~配列番号91のいずれか1つから選択されるペプチド配列、又は少なくとも70%の配列同一性により特徴付けられる機能的同等ペプチド配列を含むか、又はそれらからなる、請求項1~10のいずれか一項に記載のポリペプチド。
- HER2の発現に関連する悪性腫瘍性疾患の予防又は治療方法に用いるための、請求項1~11のいずれか一項に記載のポリペプチド。
- 請求項1~11のいずれか一項に記載のポリペプチドの第1のポリペプチド鎖、第2のポリペプチド鎖、第3のポリペプチド鎖及び第4のポリペプチド鎖の少なくとも1つをコードする、単離された核酸。
- 請求項1~11のいずれか一項に記載のポリペプチドの第1のポリペプチド鎖、第2のポリペプチド鎖、第3のポリペプチド鎖及び第4のポリペプチド鎖の少なくとも1つの生成に適合する宿主細胞であって、特に、請求項1~11のいずれか一項に記載のポリペプチドの第1のポリペプチド鎖、第2のポリペプチド鎖、第3のポリペプチド鎖及び第4のポリペプチド鎖の少なくとも1つを生成できるように、請求項13に記載の単離された核酸を含む、宿主細胞。
- 請求項1~11のいずれか一項に記載のポリペプチドを取得する方法であって、請求項1~11のいずれか一項に記載のポリペプチドの第1のポリペプチド鎖、第2のポリペプチド鎖、第3のポリペプチド鎖及び第4のポリペプチド鎖の少なくとも1つを生成するように、請求項14に記載の宿主細胞を培養することを含む、方法。
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