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JP2020523587A5 - - Google Patents

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JP2020523587A5
JP2020523587A5 JP2019568598A JP2019568598A JP2020523587A5 JP 2020523587 A5 JP2020523587 A5 JP 2020523587A5 JP 2019568598 A JP2019568598 A JP 2019568598A JP 2019568598 A JP2019568598 A JP 2019568598A JP 2020523587 A5 JP2020523587 A5 JP 2020523587A5
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上記ならびに他の態様、利点、および代替は、適宜添付の図面を参照しながら以下の詳細な説明を読めば、当業者には明らかになる。
本発明の実施形態において、例えば以下の項目が提供される。
（項目１）
発蛍光団、量子ドット、または色素のうちの少なくとも１つを含む２つまたはそれよりも多い入力共鳴体と、
発蛍光団または量子ドットのうちの少なくとも１つを含む出力共鳴体と、
有機骨格とを含み、前記２つまたはそれよりも多い入力共鳴体および前記出力共鳴体が、前記骨格に連結され、前記骨格が、前記入力共鳴体のそれぞれから前記出力共鳴体へエネルギーを伝送することができるように、前記入力共鳴体および前記出力共鳴体の相対位置を維持する、
標識。
（項目２）
前記２つまたはそれよりも多い入力共鳴体が、第１の入力共鳴体および第２の入力共鳴体を含み、前記骨格が、前記第２の入力共鳴体から前記出力共鳴体へ前記第１の入力共鳴体を介してエネルギーを伝送することができるように、前記入力共鳴体および前記出力共鳴体の相対位置を維持する、項目１に記載の標識。
（項目３）
前記第１の入力共鳴体から前記第２の入力共鳴体へエネルギーを移動させることができる、項目２に記載の標識。
（項目４）
前記入力共鳴体がすべて同じ発蛍光団を含む、項目２または３に記載の標識。
（項目５）
前記入力共鳴体がそれぞれ、それぞれのリンカーを介して前記骨格に連結され、前記リンカーが特有のリンカー長を有し、前記入力共鳴体がフェルスター半径によって特徴付けられ、前記リンカーが前記骨格にそれぞれの連結位置で連結され、前記連結位置が、前記フェルスター半径より小さく前記特有のリンカー長の２倍より大きい距離だけ互いから分離される、項目３に記載の標識。
（項目６）
前記２つまたはそれよりも多い入力共鳴体が、４つを超える入力共鳴体を含む、項目２〜５のいずれかに記載の標識。
（項目７）
前記２つまたはそれよりも多い入力共鳴体が、３０個を超える入力共鳴体を含む、項目２〜５のいずれかに記載の標識。
（項目８）
追加の出力共鳴体と、
２つまたはそれよりも多い追加の入力共鳴体とをさらに含み、前記２つまたはそれよりも多い追加の入力共鳴体および前記追加の出力共鳴体が、前記骨格に連結され、前記骨格が、前記追加の入力共鳴体のそれぞれから前記追加の出力共鳴体へエネルギーを伝送することができるように、前記追加の入力共鳴体および前記追加の出力共鳴体の相対位置を維持する、
項目１〜７のいずれかに記載の標識。
（項目９）
前記骨格が、前記追加の入力共鳴体のうちの少なくとも１つから前記出力共鳴体へエネルギーを伝送することができるように、前記追加の入力共鳴体および前記出力共鳴体の相対位置を維持する、項目８に記載の標識。
（項目１０）
１つまたは複数の仲介共鳴体をさらに含み、前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの少なくとも１つが、前記標識内で前記出力共鳴体の近傍に配置されて、前記出力共鳴体が前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの前記少なくとも１つからエネルギーを受け取ることができ、前記入力共鳴体のそれぞれから前記出力共鳴体へエネルギーを伝送することができるように、前記入力共鳴体および前記出力共鳴体の相対位置を維持する前記骨格が、前記入力共鳴体のそれぞれから前記出力共鳴体へ前記１つまたは複数の仲介共鳴体を介してエネルギーを伝送することができるように、前記入力共鳴体、前記出力共鳴体、および前記１つまたは複数の仲介共鳴体の相対位置を維持する前記骨格を含む、
項目１〜９のいずれかに記載の標識。
（項目１１）
前記入力共鳴体が励起波長の光を吸収し、前記出力共鳴体が放出波長の光を放出し、前記放出波長が前記励起波長とは異なり、前記１つまたは複数の仲介共鳴体が、それぞれの放出波長によって特徴付けられ、前記１つまたは複数の仲介共鳴体の前記放出波長が、前記入力共鳴体の前記励起波長と前記出力共鳴体の前記放出波長との間の中間にある、項目１０に記載の標識。
（項目１２）
前記１つまたは複数の仲介共鳴体が、前記標識内で前記入力共鳴体と前記出力共鳴体との間に共鳴体ワイヤとして配置される、項目１０または１１に記載の標識。
（項目１３）
前記仲介共鳴体がすべて同じ発蛍光団を含む、項目１０〜１２のいずれかに記載の標識。
（項目１４）
前記骨格に連結された促進共鳴体をさらに含み、前記骨格が、前記促進共鳴体が暗状態にあることで、前記入力共鳴体から前記出力共鳴体への前記１つまたは複数の仲介共鳴体を介したエネルギーの伝送を促進するように、前記入力共鳴体、前記出力共鳴体、前記１つまたは複数の仲介共鳴体、および前記促進共鳴体の相対位置を維持する、項目１０〜１３のいずれかに記載の標識。
（項目１５）
前記骨格に連結された抑制共鳴体をさらに含み、前記骨格が、前記抑制共鳴体が暗状態にあることで、前記入力共鳴体から前記出力共鳴体への前記１つまたは複数の仲介共鳴体を介したエネルギーの伝送を抑制するように、前記入力共鳴体、前記出力共鳴体、前記１つまたは複数の仲介共鳴体、および前記抑制共鳴体の相対位置を維持する、項目１０〜１４のいずれかに記載の標識。
（項目１６）
受容体をさらに含み、前記受容体が、目的の検体と選択的に相互作用し、前記受容体が、前記骨格に連結される、
項目１〜１５のいずれかに記載の標識。
（項目１７）
標識であって、
入力共鳴体と、
１つまたは複数の仲介共鳴体であって、前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの第１の仲介共鳴体が、前記入力共鳴体の近傍に配置されて、第１の仲介共鳴体が前記入力共鳴体からエネルギーを受け取ることができる、１つまたは複数の仲介共鳴体と、
出力共鳴体であって、前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの少なくとも１つが、前記標識内で前記出力共鳴体の近傍に配置されて、前記出力共鳴体が前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの前記少なくとも１つからエネルギーを受け取ることができる、出力共鳴体と、
骨格とを含み、前記入力共鳴体、前記出力共鳴体、および前記１つまたは複数の仲介共鳴体が、前記骨格に連結され、前記骨格が、前記入力共鳴体から前記出力共鳴体へ前記１つまたは複数の仲介共鳴体を介してエネルギーを伝送することができるように、前記入力共鳴体、前記出力共鳴体、および前記１つまたは複数の仲介共鳴体の相対位置を維持する、
標識。
（項目１８）
前記骨格が、少なくとも部分的に相補的な２つのＤＮＡ鎖である、項目１７に記載の標識。
（項目１９）
前記仲介共鳴体、前記入力共鳴体、または前記出力共鳴体のうちの少なくとも１つが発蛍光団を含む、項目１７または１８に記載の標識。
（項目２０）
前記１つまたは複数の仲介共鳴体が、前記標識内で前記入力共鳴体と前記出力共鳴体との間に共鳴体ワイヤとして配置される、項目１７〜１９のいずれかに記載の標識。
（項目２１）
前記仲介共鳴体がすべて同じ発蛍光団を含む、項目１７〜２０のいずれかに記載の標識。
（項目２２）
前記入力共鳴体が第１の入力共鳴体であり、前記標識が、第２の入力共鳴体をさらに含み、前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの少なくとも１つが、前記第２の入力共鳴体の近傍に配置されて、前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの前記少なくとも１つが、前記第２の入力共鳴体からエネルギーを受け取ることができる、項目１７〜２１のいずれかに記載の標識。
（項目２３）
前記第１の入力共鳴体が、第１の励起波長によって特徴付けられ、前記第２の入力共鳴体が、前記第１の励起波長とは異なる第２の励起波長によって特徴付けられる、項目２２に記載の標識。
（項目２４）
前記出力共鳴体が第１の出力共鳴体であり、前記標識が、第２の出力共鳴体をさらに含み、前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの少なくとも１つが、前記標識内で前記第２の出力共鳴体の近傍に配置されて、前記第２の出力共鳴体が、前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの前記少なくとも１つからエネルギーを受け取ることができる、項目１７〜２３のいずれかに記載の標識。
（項目２５）
前記第２の出力共鳴体が、前記第１の出力共鳴体の前記放出波長とは異なる第２の放出波長によって特徴付けられる、項目２４に記載の標識。
（項目２６）
前記入力共鳴体が励起波長の光を吸収し、前記出力共鳴体が放出波長の光を放出し、前記放出波長が前記励起波長とは異なる、項目１７〜２５のいずれかに記載の標識。
（項目２７）
前記１つまたは複数の仲介共鳴体が、それぞれの放出波長によって特徴付けられ、前記１つまたは複数の仲介共鳴体の前記放出波長が、前記入力共鳴体の前記励起波長と前記出力共鳴体の前記放出波長との間の中間にある、項目２６に記載の標識。
（項目２８）
前記骨格に連結された促進共鳴体をさらに含み、前記骨格が、前記促進共鳴体が暗状態にあることで、前記入力共鳴体から前記出力共鳴体への前記１つまたは複数の仲介共鳴体を介したエネルギーの伝送を促進するように、前記入力共鳴体、前記出力共鳴体、前記１つまたは複数の仲介共鳴体、および前記促進共鳴体の相対位置を維持する、項目１７〜２７のいずれかに記載の標識。
（項目２９）
前記骨格に連結された抑制共鳴体をさらに含み、前記骨格が、前記抑制共鳴体が暗状態にあることで、前記入力共鳴体から前記出力共鳴体への前記１つまたは複数の仲介共鳴体を介したエネルギーの伝送を抑制するように、前記入力共鳴体、前記出力共鳴体、前記１つまたは複数の仲介共鳴体、および前記抑制共鳴体の相対位置を維持する、項目１７〜２８のいずれかに記載の標識。
（項目３０）
受容体をさらに含み、前記受容体が、目的の検体と選択的に相互作用し、前記受容体が、前記骨格に連結される、
項目１７〜２９のいずれかに記載の標識。
（項目３１）
試料容器と、
光源と、
光検出器と、
コントローラとを備え、前記コントローラが、
前記光源を使用して、前記試料容器を照射することと、
前記光検出器を使用して、検出波長範囲内の前記試料容器からの複数の光子の放出の前記試料容器の前記照射に対するタイミングを検出することと、
前記複数の光子の放出の前記検出されたタイミングに基づいて、標識の識別情報を判定することとを含む動作を実行するようにプログラムされ、前記標識の前記識別情報を判定することが、１組の既知の標識から前記標識の前記識別情報を選択することを含み、前記標識が、
入力共鳴体と、
放出波長によって特徴付けられる出力共鳴体であって、前記検出波長範囲が前記出力共鳴体の前記放出波長を含む、出力共鳴体と、
１つまたは複数の仲介共鳴体のネットワークとを含み、前記標識内の前記入力共鳴体、前記出力共鳴体、および前記１つまたは複数の仲介共鳴体の相対位置が、前記入力共鳴体が前記照射によって励起されたことに応答して、前記入力共鳴体から前記出力共鳴体へ前記１つまたは複数の仲介共鳴体を介してエネルギーを伝送することができるようになっている、
システム。
（項目３２）
前記動作が、
前記標識の前記判定された識別情報に基づいて、前記試料容器の内容物を１つまたは複数の位置に分類することをさらに含む、項目３１に記載のシステム。
（項目３３）
前記標識の前記識別情報を判定することが、
前記複数の光子の放出の前記検出されたタイミングに基づいて、前記試料容器の照射に応答した前記試料容器からの光子の放出の前記タイミングに対する確率密度関数を判定することと、
前記判定された確率密度関数を１組の既知の時間的減衰プロファイルと比較することとを含み、前記１組の既知の標識のうちの各標識が、前記１組の既知の時間的減衰プロファイルのうちの前記時間的減衰プロファイルのそれぞれに対応する、項目３１または３２に記載のシステム。
（項目３４）
前記判定された確率密度関数を１組の既知の時間的減衰プロファイルと比較することが、前記判定された確率密度関数と前記１組の既知の時間的減衰プロファイルのうちの前記時間的減衰プロファイルのそれぞれとの間の統計的ダイバージェンスの測度を判定することを含む、項目３３に記載のシステム。
（項目３５）
前記標識が第１の標識であり、前記動作が、
前記複数の光子の放出の前記検出されたタイミングに基づいて、第２の標識の識別情報を判定することをさらに含み、前記第２の標識の前記識別情報を判定することが、前記１組の既知の標識から前記第２の標識の前記識別情報を選択することを含み、前記第２の標識が、
第２の入力共鳴体と、
第２の出力共鳴体であって、前記検出波長範囲が前記第２の出力共鳴体の放出波長を含む、第２の出力共鳴体と、
１つまたは複数の仲介共鳴体の第２のネットワークとを含み、前記第２の標識内の前記第２の入力共鳴体、前記第２の出力共鳴体、および前記１つまたは複数の仲介共鳴体の第２のネットワークのうちの仲介共鳴体の相対位置が、前記第２の入力共鳴体が前記照射によって励起されたことに応答して、前記第２の入力共鳴体から前記第２の出力共鳴体へ前記１つまたは複数の仲介共鳴体の第２のネットワークを介してエネルギーを伝送することができるようになっており、
前記第１の標識の前記１つまたは複数の仲介共鳴体のネットワークが、前記１つまたは複数の仲介共鳴体の第２のネットワークとは異なる、項目３１〜３４のいずれかに記載のシステム。
（項目３６）
前記動作が、
前記第１の標識の前記判定された識別情報および前記第２の標識の前記判定された識別情報に基づいて、前記試料容器の内容物を識別することをさらに含む、項目３５に記載のシステム。
（項目３７）
前記第１の標識の前記入力共鳴体が、前記第２の入力共鳴体と同じであり、前記第１の標識の前記出力共鳴体が、前記第２の出力共鳴体と同じである、項目３５または３６に記載のシステム。
（項目３８）
前記動作が、
前記複数の光子の放出の前記検出されたタイミングに基づいて、前記試料容器内の前記第２の標識の量に対して、前記試料容器内の前記第１の標識の量を判定することをさらに含む、項目３５〜３７のいずれかに記載のシステム。
（項目３９）
前記試料容器内の前記第２の標識の量に対して、前記試料容器内の前記第１の標識の量を判定することが、
前記複数の光子の放出の前記検出されたタイミングに基づいて、前記試料容器の照射に応答した前記試料容器からの光子の放出の前記タイミングに対する確率密度関数を判定することと、
前記判定された確率密度関数、前記第１の標識に対応する第１の既知の時間的減衰プロファイル、および前記第２の標識に対応する第２の既知の時間的減衰プロファイルに基づいて、前記試料容器内の前記第２の標識の量に対して、前記試料容器内の前記第１の標識の量の量を判定することとを含む、項目３８に記載のシステム。
（項目４０）
前記仲介共鳴体のネットワークのうちの第１の仲介共鳴体が、さらなる放出波長によって特徴付けられ、前記システムが、
第２の光検出器をさらに備え、前記動作が、前記第２の光検出器を使用して、さらなる検出波長範囲内の前記試料容器からのさらなる複数の光子の放出の前記試料容器の前記照射に対するタイミングを検出することをさらに含み、前記さらなる検出波長範囲が、前記第１の仲介共鳴体の前記さらなる放出波長を含み、前記標識の前記識別情報を判定することが、前記さらなる複数の光子の放出の前記検出されたタイミングに基づいて、前記標識の前記識別情報を判定することを含む、項目３１〜３９のいずれかに記載のシステム。
（項目４１）
前記光検出器が単一光子アバランシェダイオードを備える、項目３１〜４０のいずれかに記載のシステム。
（項目４２）
前記試料容器が流れチャネルを備え、前記試料容器を照射することが、前記流れチャネルの一部分を照射することを含み、前記試料容器からの複数の光子の放出のタイミングを検出することが、前記流れチャネルからの複数の光子の放出のタイミングを検出することを含む、項目３１〜４１のいずれかに記載のシステム。
（項目４３）
前記入力共鳴体が第１の入力共鳴体であり、前記標識が、第２の入力共鳴体をさらに含み、前記標識内の前記第２の入力共鳴体、前記出力共鳴体、および前記１つまたは複数の仲介共鳴体の相対位置が、前記第２の入力共鳴体が前記照射によって励起されたことに応答して、前記第２の入力共鳴体から前記出力共鳴体へ前記１つまたは複数の仲介共鳴体を介してエネルギーを伝送することができるようになっている、項目３１〜４２のいずれかに記載のシステム。
（項目４４）
前記第１の入力共鳴体が、第１の励起波長によって特徴付けられ、前記第２の入力共鳴体が、前記第１の励起波長とは異なる第２の励起波長によって特徴付けられ、前記光源を使用して前記試料容器を照射することが、
前記第１の励起波長の光を含む第１の照射を、第１の時間期間中に前記試料容器へ提供することと、
前記第２の励起波長の光を含む第２の照射を、第２の時間期間中に前記試料容器へ提供することとを含む、項目４３に記載のシステム。
（項目４５）
前記出力共鳴体が第１の出力共鳴体であり、前記標識が、第２の出力共鳴体をさらに含み、前記標識内の前記入力共鳴体、前記第２の出力共鳴体、および前記１つまたは複数の仲介共鳴体の相対位置が、前記入力共鳴体が前記照射によって励起されたことに応答して、前記入力共鳴体から前記第２の出力共鳴体へ前記１つまたは複数の仲介共鳴体を介してエネルギーを伝送することができるようになっている、項目３１〜４４のいずれかに記載のシステム。
（項目４６）
前記第２の出力共鳴体が、前記第１の出力共鳴体の前記放出波長とは異なる第２の放出波長によって特徴付けられ、前記動作が、
前記光検出器を使用して、第２の検出波長範囲内の前記試料容器からの第２の複数の光子の放出の前記試料容器の前記照射に対するタイミングを検出することをさらに含み、前記第２の検出波長範囲が前記第２の放出波長を含み、前記標識の前記識別情報を判定することが、前記第２の複数の光子の放出の前記検出されたタイミングに基づいて、前記標識の前記識別情報を判定することを含む、項目４５に記載のシステム。
（項目４７）
さらなる光源をさらに備え、
前記標識が、骨格に連結された促進共鳴体をさらに含み、前記骨格が、前記促進共鳴体が暗状態にあることで、前記入力共鳴体から前記出力共鳴体への前記１つまたは複数の仲介共鳴体を介したエネルギーの伝送を促進するように、前記入力共鳴体、前記出力共鳴体、前記１つまたは複数の仲介共鳴体、および前記促進共鳴体の相対位置を維持し、
前記動作が、
前記さらなる光源を使用して、前記促進共鳴体が前記暗状態に入るような照射で前記試料容器を照射することをさらに含む、
項目３１〜４６のいずれかに記載のシステム。
（項目４８）
さらなる光源をさらに備え、
前記標識が、骨格に連結された抑制共鳴体をさらに含み、前記骨格が、前記抑制共鳴体が暗状態にあることで、前記入力共鳴体から前記出力共鳴体への前記１つまたは複数の仲介共鳴体を介したエネルギーの伝送を抑制するように、前記入力共鳴体、前記出力共鳴体、前記１つまたは複数の仲介共鳴体、および前記抑制共鳴体の相対位置を維持し、
前記動作が、
前記さらなる光源を使用して、前記抑制共鳴体が前記暗状態に入るような照射で前記試料容器を照射することをさらに含む、
項目３１〜４６のいずれかに記載のシステム。
（項目４９）
機能を実行するように少なくとも１つのプロセッサによって実行可能な命令が記憶されている非一時的コンピュータ可読媒体であって、前記機能が、
試料を照射することであって、前記試料が標識を含み、前記標識が、
入力共鳴体、
放出波長によって特徴付けられる出力共鳴体、
１つまたは複数の仲介共鳴体のネットワークを含み、前記標識内の前記入力共鳴体、前記出力共鳴体、および前記１つまたは複数の仲介共鳴体の相対位置が、前記入力共鳴体が前記照射によって励起されたことに応答して、前記入力共鳴体から前記出力共鳴体へ前記１つまたは複数の仲介共鳴体のネットワークを介してエネルギーを伝送することができるようになっている、照射することと、
検出波長範囲内の前記試料からの複数の光子の放出の前記試料の前記照射に対するタイミングを検出することであって、前記検出波長範囲が前記出力共鳴体の前記放出波長を含む、検出することと、
前記複数の光子の放出の前記検出されたタイミングに基づいて、前記標識の識別情報を判定することとを含み、前記標識の前記識別情報を判定することが、１組の既知の標識から前記標識の前記識別情報を選択することとを含む、非一時的コンピュータ可読媒体。
（項目５０）
第１の標識であって、
第１の目的の検体と選択的に相互作用する第１の受容体、
少なくとも２つの第１の入力共鳴体、
少なくとも１つの第１の出力共鳴体であって、前記第１の標識内の複数の第１の入力共鳴体の前記第１の標識内の複数の第１の出力共鳴体に対する比が第１の値を有する、少なくとも１つの第１の出力共鳴体、および
第１の骨格を含み、前記第１の受容体、前記少なくとも２つの第１の入力共鳴体、および前記少なくとも１つの第１の出力共鳴体が、前記第１の骨格に連結され、前記第１の骨格が、前記第１の入力共鳴体のそれぞれから少なくとも１つの第１の出力共鳴体へエネルギーを伝送することができるように、前記少なくとも２つの第１の入力共鳴体および前記少なくとも１つの第１の出力共鳴体の相対位置を維持する、第１の標識と、
第２の標識であって、
第２の目的の検体と選択的に相互作用する第２の受容体、
少なくとも２つの第２の入力共鳴体、
少なくとも１つの第２の出力共鳴体であって、前記第２の標識内の複数の第２の入力共鳴体の前記第２の標識内の複数の第２の出力共鳴体に対する比が第２の値を有する、少なくとも１つの第２の出力共鳴体、および
第２の骨格を含み、前記第２の受容体、前記少なくとも２つの第２の入力共鳴体、および前記少なくとも１つの第２の出力共鳴体が、前記第２の骨格に連結され、前記第２の骨格が、前記第２の入力共鳴体のそれぞれから少なくとも１つの第２の出力共鳴体へエネルギーを伝送することができるように、前記少なくとも２つの第２の入力共鳴体および前記少なくとも１つの第２の出力共鳴体の相対位置を維持する、第２の標識とを含み、
前記第１の値および前記第２の値が異なる、
造影剤。
（項目５１）
前記第１の入力共鳴体および前記第２の入力共鳴体が、吸収波長に関して異なる、項目５０に記載の造影剤。
（項目５２）
前記第１の出力共鳴体および前記第２の出力共鳴体が、放出波長に関して異なる、項目５０または５１に記載の造影剤。
（項目５３）
前記第１の標識が、
１つまたは複数の仲介共鳴体をさらに含み、前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの第１の仲介共鳴体が、前記第１の標識内で前記少なくとも２つの第１の入力共鳴体の近傍に配置されて、前記第１の仲介共鳴体が、前記少なくとも２つの第１の入力共鳴体のそれぞれからエネルギーを受け取ることができ、前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの少なくとも１つが、前記第１の標識内で少なくとも１つの第１の出力共鳴体の近傍に配置されて、前記少なくとも１つの第１の出力共鳴体が前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの前記少なくとも１つからエネルギーを受け取ることができ、前記第１の入力共鳴体のそれぞれから少なくとも１つの第１の出力共鳴体へエネルギーを伝送することができるように、前記少なくとも２つの第１の入力共鳴体および前記少なくとも１つの出力共鳴体の相対位置を維持する前記第１の骨格が、前記第１の入力共鳴体のそれぞれから前記少なくとも１つの第１の出力共鳴体へ前記１つまたは複数の仲介共鳴体を介してエネルギーを伝送することができるように、前記第１の入力共鳴体、前記少なくとも１つの第１の出力共鳴体、および前記１つまたは複数の仲介共鳴体の相対位置を維持する骨格を含む、項目５０〜５２のいずれかに記載の造影剤。
（項目５４）
標識を含む試料を照射することであって、前記標識が、
入力共鳴体、
放出波長によって特徴付けられる出力共鳴体、
１つまたは複数の仲介共鳴体のネットワークを含み、前記標識内の前記入力共鳴体、前記出力共鳴体、および前記１つまたは複数の仲介共鳴体の相対位置が、前記入力共鳴体が前記照射によって励起されたことに応答して、前記入力共鳴体から前記出力共鳴体へ前記１つまたは複数の仲介共鳴体のネットワークを介してエネルギーを伝送することができるようになっている、照射することと、
検出波長範囲内の前記試料からの複数の光子の放出の前記試料の前記照射に対するタイミングを検出することであって、前記検出波長範囲が前記出力共鳴体の前記放出波長を含む、検出することと、
前記複数の光子の放出の前記検出されたタイミングに基づいて、前記標識の識別情報を判定することとを含み、前記標識の前記識別情報を判定することが、１組の既知の標識から前記標識の前記識別情報を選択することを含む、
方法。
（項目５５）
前記試料が、１つまたは複数の粒子を含み、前記方法が、
前記標識の前記判定された識別情報に基づいて、前記１つまたは複数の粒子を１つまたは複数の位置へ分類することをさらに含む、項目５４に記載の方法。
（項目５６）
前記標識の前記識別情報を判定することが、
前記複数の光子の放出の前記検出されたタイミングに基づいて、前記試料の照射に応答した前記試料からの光子の放出の前記タイミングに対する確率密度関数を判定することと、
前記判定された確率密度関数を１組の既知の時間的減衰プロファイルと比較することとを含み、前記１組の既知の標識のうちの各標識が、前記１組の既知の時間的減衰プロファイルのうちの前記時間的減衰プロファイルのそれぞれに対応する、項目５４または５５に記載の方法。
（項目５７）
前記判定された確率密度関数を１組の既知の時間的減衰プロファイルと比較することが、前記判定された確率密度関数と前記１組の既知の時間的減衰プロファイルのうちの前記時間的減衰プロファイルのそれぞれとの間の統計的ダイバージェンスの測度を判定することを含む、項目５６に記載の方法。
（項目５８）
前記標識が第１の標識であり、前記試料が第２の標識を含み、前記第２の標識が、
第２の入力共鳴体と、
第２の出力共鳴体であって、前記検出波長範囲が前記第２の出力共鳴体の放出波長を含む、第２の出力共鳴体と、
１つまたは複数の仲介共鳴体の第２のネットワークとを含み、前記第２の標識内の前記第２の入力共鳴体、前記第２の出力共鳴体、および前記１つまたは複数の仲介共鳴体の第２のネットワークのうちの仲介共鳴体の相対位置が、前記第２の入力共鳴体が前記照射によって励起されたことに応答して、前記第２の入力共鳴体から前記第２の出力共鳴体へ前記１つまたは複数の仲介共鳴体の第２のネットワークを介してエネルギーを伝送することができるようになっており、
前記第１の標識の前記１つまたは複数の仲介共鳴体のネットワークが、前記１つまたは複数の仲介共鳴体の第２のネットワークとは異なり、前記方法が、
前記複数の光子の放出の前記検出されたタイミングに基づいて、前記第２の標識の識別情報を判定することをさらに含み、前記第２の標識の前記識別情報を判定することが、前記１組の既知の標識から前記第２の標識の前記識別情報を選択することを含む、項目５４〜５７のいずれかに記載の方法。
（項目５９）
前記第１の標識の前記判定された識別情報および前記第２の標識の前記判定された識別情報に基づいて、前記試料中の粒子を識別することをさらに含む、
項目５８に記載の方法。
（項目６０）
前記第１の標識の前記入力共鳴体が、前記第２の入力共鳴体と同じであり、前記第１の標識の出力共鳴体が、前記第２の出力共鳴体と同じである、項目５８または５９に記載の方法。
（項目６１）
前記複数の光子の放出の前記検出されたタイミングに基づいて、前記試料中の前記第２の標識の量に対して、前記試料中の前記第１の標識の量を判定することをさらに含む、
項目５８〜６０のいずれかに記載の方法。
（項目６２）
前記試料中の前記第２の標識の量に対して、前記試料中の前記第１の標識の量を判定することが、
前記複数の光子の放出の前記検出されたタイミングに基づいて、前記試料の照射に応答した前記試料からの光子の放出の前記タイミングに対する確率密度関数を判定することと、
前記判定された確率密度関数、前記第１の標識に対応する第１の既知の時間的減衰プロファイル、および前記第２の標識に対応する第２の既知の時間的減衰プロファイルに基づいて、前記試料中の前記第２の標識の量に対して、前記試料中の前記第１の標識の量を判定することとを含む、項目６１に記載の方法。
（項目６３）
前記仲介共鳴体のネットワークのうちの第１の仲介共鳴体が、さらなる放出波長によって特徴付けられ、前記方法が、
さらなる検出波長範囲内の前記試料からのさらなる複数の光子の放出の前記試料の前記照射に対するタイミングを検出することをさらに含み、前記さらなる検出波長範囲が、前記第１の仲介共鳴体の前記さらなる放出波長を含み、前記標識の前記識別情報を判定することが、前記さらなる複数の光子の放出の前記検出されたタイミングに基づいて、前記標識の前記識別情報を判定することを含む、項目５４〜６２のいずれかに記載の方法。
（項目６４）
前記入力共鳴体が第１の入力共鳴体であり、前記標識が、第２の入力共鳴体をさらに含み、前記標識内の前記第２の入力共鳴体、前記出力共鳴体、および前記１つまたは複数の仲介共鳴体の相対位置が、前記第２の入力共鳴体が前記照射によって励起されたことに応答して、前記第２の入力共鳴体から前記出力共鳴体へ前記１つまたは複数の仲介共鳴体を介してエネルギーを伝送することができるようになっている、項目５４〜６３のいずれかに記載の方法。
（項目６５）
前記第１の入力共鳴体が、第１の励起波長によって特徴付けられ、前記第２の入力共鳴体が、前記第１の励起波長とは異なる第２の励起波長によって特徴付けられ、前記試料を照射することが、
前記第１の励起波長の光を含む第１の照射を、第１の時間期間中に前記試料へ提供することと、
前記第２の励起波長の光を含む第２の照射を、第２の時間期間中に前記試料へ提供することとを含む、項目６４に記載の方法。
（項目６６）
前記出力共鳴体が第１の出力共鳴体であり、前記標識が、第２の出力共鳴体をさらに含み、前記標識内の前記入力共鳴体、前記第２の出力共鳴体、および前記１つまたは複数の仲介共鳴体の相対位置が、前記入力共鳴体が前記照射によって励起されたことに応答して、前記入力共鳴体から前記第２の出力共鳴体へ前記１つまたは複数の仲介共鳴体を介してエネルギーを伝送することができるようになっている、項目５４〜６５のいずれかに記載の方法。
（項目６７）
前記第２の出力共鳴体が、前記第１の出力共鳴体の前記放出波長とは異なる第２の放出波長によって特徴付けられ、前記方法が、
第２の検出波長範囲内の前記試料からの第２の複数の光子の放出の前記試料の前記照射に対するタイミングを検出することをさらに含み、前記第２の検出波長範囲が前記第２の放出波長を含み、前記標識の前記識別情報を判定することが、前記第２の複数の光子の放出の前記検出されたタイミングに基づいて、前記標識の前記識別情報を判定することを含む、項目６６に記載の方法。
（項目６８）
前記標識が、骨格に連結された促進共鳴体をさらに含み、前記骨格が、前記促進共鳴体が暗状態にあることで、前記入力共鳴体から前記出力共鳴体への前記１つまたは複数の仲介共鳴体を介したエネルギーの伝送を促進するように、前記入力共鳴体、前記出力共鳴体、前記１つまたは複数の仲介共鳴体、および前記促進共鳴体の相対位置を維持し、前記方法が、
前記促進共鳴体が前記暗状態に入るような照射で前記試料を照射することをさらに含む、項目５４〜６７のいずれかに記載の方法。
（項目６９）
前記標識が、骨格に連結された抑制共鳴体をさらに含み、前記骨格が、前記抑制共鳴体が暗状態にあることで、前記入力共鳴体から前記出力共鳴体への前記１つまたは複数の仲介共鳴体を介したエネルギーの伝送を抑制するように、前記入力共鳴体、前記出力共鳴体、前記１つまたは複数の仲介共鳴体、および前記抑制共鳴体の相対位置を維持し、前記方法が、
前記抑制共鳴体が前記暗状態に入るような照射で前記試料を照射することをさらに含む、項目５４〜６８のいずれかに記載の方法。
（項目７０）
試料容器と、
光源と、
光検出器と、
コントローラとを備え、前記コントローラが、
前記光源を使用して、前記試料容器を照射することと、
前記光検出器を使用して、検出波長範囲内の前記試料容器からの複数の光子の放出の前記試料容器の前記照射に対するタイミングを検出することと、
前記複数の光子の放出の前記検出されたタイミングに基づいて、標識の識別情報を判定することとを含む動作を実行するようにプログラムされ、前記標識の前記識別情報を判定することが、１組の既知の標識から前記標識の前記識別情報を選択することを含み、前記標識が、
放出波長によって特徴付けられる入力共鳴体であって、前記検出波長範囲が前記入力共鳴体の前記放出波長を含む、入力共鳴体と、
変調共鳴体とを含み、前記標識内の前記入力共鳴体および前記変調共鳴体の相対位置が、前記入力共鳴体が前記照射によって励起されたことに応答して、前記入力共鳴体と前記変調共鳴体との間でエネルギーを伝送することができるようになっている、
システム。
（項目７１）
暗状態を有する第１の入力共鳴体であって、第１の入力励起波長の照射を受け取ったことに応答して前記暗状態に入ることができる第１の入力共鳴体と、
読出し波長の照射からエネルギーを受け取ることができる読出し共鳴体と、
出力共鳴体と、
骨格とを含み、前記第１の入力共鳴体、前記読出し共鳴体、および前記出力共鳴体が、前記骨格に連結され、前記骨格が、前記読出し共鳴体から前記出力共鳴体へエネルギーを伝送することができるように、さらに前記読出し共鳴体から前記出力共鳴体へエネルギーが伝送される確率が、前記第１の入力共鳴体が前記暗状態にあるかどうかに関係するように、前記第１の入力共鳴体、前記読出し共鳴体、および前記出力共鳴体の相対位置を維持する、
共鳴体ネットワーク。
（項目７２）
前記第１の入力共鳴体が前記暗状態にあることで、前記読出し共鳴体から前記出力共鳴体へのエネルギーの伝送を抑制する、項目７１に記載の共鳴体ネットワーク。
（項目７３）
前記骨格が、前記読出し共鳴体から前記出力共鳴体へ前記第１の入力共鳴体を介してエネルギーを伝送することができるように、前記第１の入力共鳴体が前記暗状態にあることで、前記読出し共鳴体から前記出力共鳴体への前記第１の入力共鳴体を介したエネルギーの伝送を防止するように、前記第１の入力共鳴体、前記読出し共鳴体、および前記出力共鳴体の相対位置を維持する、項目７２に記載の共鳴体ネットワーク。
（項目７４）
前記骨格に連結された第２の入力共鳴体をさらに含み、前記第２の入力共鳴体が暗状態を有し、前記第２の入力共鳴体が、第２の入力励起波長の照射を受け取ったことに応答して、前記暗状態に入ることができ、前記骨格が、前記第２の入力共鳴体が前記暗状態にあることによって、前記読出し共鳴体から前記出力共鳴体へのエネルギーの伝送が促進されるように、前記第１の入力共鳴体、前記第２の入力共鳴体、前記読出し共鳴体、および前記出力共鳴体の相対位置を維持する、
項目７２または７３に記載の共鳴体ネットワーク。
（項目７５）
第１の入力波長および第２の入力波長が、１０ナノメートル未満だけ異なる、項目７４に記載の共鳴体ネットワーク。
（項目７６）
第１の入力波長および第２の入力波長が、５０ナノメートルを超えて異なる、項目７４に記載の共鳴体ネットワーク。
（項目７７）
前記骨格に連結された第２の入力共鳴体をさらに含み、前記第２の入力共鳴体が暗状態を有し、前記第２の入力共鳴体が、第２の入力励起波長の照射を受け取ったことに応答して、前記暗状態に入ることができ、前記骨格が、前記第２の入力共鳴体が前記暗状態にあることによって、前記読出し共鳴体から前記出力共鳴体へのエネルギーの伝送が抑制されるように、前記第１の入力共鳴体、前記第２の入力共鳴体、前記読出し共鳴体、および前記出力共鳴体の相対位置を維持する、
項目７２または７３に記載の共鳴体ネットワーク。
（項目７８）
前記第１の入力波長および前記第２の入力波長が、１０ナノメートル未満だけ異なる、項目７７に記載の共鳴体ネットワーク。
（項目７９）
前記第１の入力波長および前記第２の入力波長が、５０ナノメートルを超えて異なる、項目７７に記載の共鳴体ネットワーク。
（項目８０）
前記第１の入力共鳴体が前記暗状態にあることで、前記読出し共鳴体から前記出力共鳴体へのエネルギーの伝送を促進する、項目７１に記載の共鳴体ネットワーク。
（項目８１）
前記骨格が、前記第１の入力共鳴体が前記暗状態にないとき、エネルギーが前記出力共鳴体へ伝送されるより、前記読出し共鳴体から前記第１の入力共鳴体へ伝送され、次いで前記第１の入力共鳴体によって放散される可能性の方が高くなるように、前記第１の入力共鳴体、前記読出し共鳴体、および前記出力共鳴体の相対位置を維持する、項目８０に記載の共鳴体ネットワーク。
（項目８２）
前記骨格に連結された第２の入力共鳴体をさらに含み、前記第２の入力共鳴体が暗状態を有し、前記第２の入力共鳴体が、第２の入力励起波長の照射を受け取ったことに応答して、前記暗状態に入ることができ、前記骨格が、前記第２の入力共鳴体が前記暗状態にあることによって、前記読出し共鳴体から前記出力共鳴体へのエネルギーの伝送が促進されるように、前記第１の入力共鳴体、前記第２の入力共鳴体、前記読出し共鳴体、および前記出力共鳴体の相対位置を維持する、
項目８０または８１に記載の共鳴体ネットワーク。
（項目８３）
前記第１の入力波長および前記第２の入力波長が、１０ナノメートル未満だけ異なる、項目８２に記載の共鳴体ネットワーク。
（項目８４）
前記第１の入力波長および前記第２の入力波長が、５０ナノメートルを超えて異なる、項目８２に記載の共鳴体ネットワーク。
（項目８５）
１つまたは複数の仲介共鳴体をさらに含み、前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの第１の仲介共鳴体が、前記共鳴体ネットワーク内で前記読出し共鳴体の近傍に配置され、したがって前記読出し共鳴体が前記読出し波長の照射による前記読出し共鳴体の前記励起に応答することによって、前記第１の仲介共鳴体を励起することができ、前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの少なくとも１つが、前記共鳴体ネットワーク内で前記出力共鳴体の近傍に配置されて、前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの前記少なくとも１つによって前記出力共鳴体を励起することができる、
項目７１〜８４のいずれかに記載の共鳴体ネットワーク。
（項目８６）
前記骨格に連結された感知体をさらに含み、前記感知体が、前記共鳴体ネットワークの環境の特性に関係する状態を有し、前記読出し共鳴体から前記出力共鳴体へエネルギーが伝送される確率が、前記感知体の前記状態に関係する、
項目８５に記載の共鳴体ネットワーク。
（項目８７）
前記共鳴体ネットワークの前記環境の前記特性が、前記共鳴体ネットワークの前記環境内の流体のｐＨである、項目８６に記載の共鳴体ネットワーク。
（項目８８）
前記骨格に連結された感知体をさらに含み、前記感知体が、検体に優先的に結合する受容体を含み、前記検体のインスタンスが前記受容体に結合されることで、前記感知体が前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの少なくとも１つを消光させる、
項目８５に記載の共鳴体ネットワーク。
（項目８９）
前記骨格に連結された感知体をさらに含み、前記感知体が、検体に優先的に結合する受容体を含み、前記受容体が前記検体のいずれのインスタンスにも結合されていないことで、前記感知体が前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの少なくとも１つを消光させる、
項目８５に記載の共鳴体ネットワーク。
（項目９０）
前記骨格に連結された感知体をさらに含み、前記感知体が、検体に優先的に結合する受容体を含み、前記受容体が前記検体のインスタンスに結合することで、前記感知体が前記骨格に対する前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの少なくとも１つの位置を修正する、
項目８５に記載の共鳴体ネットワーク。
（項目９１）
前記共鳴体ネットワークが、時間依存確率密度関数に応じて、前記読出し共鳴体が前記読出し波長の照射を受け取ったことに応答して、前記出力共鳴体から光子を放出し、前記時間依存確率密度関数の検出可能な特性が、前記第１の入力共鳴体が前記暗状態にあるかどうかに関係する、項目７１〜８５のいずれかに記載の共鳴体ネットワーク。
（項目９２）
検体を検出する方法であって、
第１の時間期間中に共鳴体ネットワークを第１の入力波長の光で照射することであって、前記共鳴体ネットワークが、
暗状態を有し、第１の入力励起波長の照射を受け取ったことに応答して前記暗状態に入ることができる第１の入力共鳴体、
読出し波長の照射からエネルギーを受け取ることができる読出し共鳴体、
仲介共鳴体、
出力共鳴体、
検体に優先的に結合する受容体を含む感知体、および
骨格を含み、前記第１の入力共鳴体、前記読出し共鳴体、前記感知体、および前記出力共鳴体が、前記骨格に連結され、前記骨格が、前記読出し共鳴体から前記出力共鳴体へ前記仲介共鳴体を介してエネルギーを伝送することができるように、さらに前記第１の入力共鳴体が前記暗状態にあるときに前記読出し共鳴体から前記出力共鳴体へエネルギーが伝送される確率が、前記受容体が前記検体のインスタンスに結合されているかどうかに関係するように、前記第１の入力共鳴体、前記読出し共鳴体、前記仲介共鳴体、前記感知体、および前記出力共鳴体の相対位置を維持する、照射することと、
前記第１の時間期間中に前記共鳴体ネットワークを前記読出し波長の光で照射することと、
前記第１の時間期間中に前記出力共鳴体から放出される光の強度を検出することとを含む方法。
（項目９３）
前記検体のインスタンスが前記受容体に結合されることで、前記感知体が前記仲介共鳴体を消光させる、項目９２に記載の方法。
（項目９４）
前記受容体が前記検体のいずれのインスタンスにも結合されていないことで、前記感知体が前記仲介共鳴体を消光させる、項目９２に記載の方法。
（項目９５）
前記受容体が前記検体のインスタンスに結合されることで、前記感知体が前記骨格に対する前記仲介共鳴体の位置を修正する、項目９２に記載の方法。
（項目９６）
前記共鳴体ネットワークが、
前記骨格に連結された第２の入力共鳴体であって、暗状態を有し、第２の入力励起波長の照射を受け取ったことに応答して前記暗状態に入ることができる第２の入力共鳴体と、
前記骨格に連結された第２の感知体であって、第２の検体に優先的に結合する第２の受容体を含む第２の感知体と、
第２の仲介共鳴体とをさらに含み、
前記骨格が、前記読出し共鳴体から前記出力共鳴体へ前記第２の仲介共鳴体を介してエネルギーを伝送することができるように、さらに前記第２の入力共鳴体が前記暗状態にあり、かつ前記第１の入力共鳴体が前記暗状態にないときに前記読出し共鳴体から前記出力共鳴体へエネルギーが伝送される確率が、前記第２の受容体が前記第２の検体のインスタンスに結合されているかどうかに関係するように、前記第２の入力共鳴体、前記読出し共鳴体、前記第２の仲介共鳴体、前記第２の感知体、および前記出力共鳴体の相対位置を維持し、
前記方法が、
前記第１の時間期間後の第２の時間期間中に前記共鳴体ネットワークを前記第２の入力波長の光で照射することと、
前記第２の時間期間中に前記共鳴体ネットワークを前記読出し波長の光で照射することと、
前記第２の時間期間中に前記出力共鳴体から放出される光の強度を検出することとをさらに含む、項目９２〜９５のいずれかに記載の方法。
（項目９７）
前記第１の時間期間中に前記出力共鳴体から放出される光の前記強度に基づいて、前記共鳴体ネットワークの環境内の前記第１の検体の存在または量を判定することをさらに含む、
項目９２〜９６のいずれかに記載の方法。
（項目９８）
第１の時間期間中に複数の共鳴体ネットワークを第１の入力波長の光で照射することであって、前記複数の共鳴体ネットワークの各共鳴体ネットワークが、
暗状態を有し、第１の入力励起波長の照射を受け取ったことに応答して前記暗状態に入ることができる第１の入力共鳴体、
読出し波長の照射からエネルギーを受け取ることができる読出し共鳴体、
２つまたはそれよりも多い仲介共鳴体、
出力共鳴体、および
骨格を含み、前記第１の入力共鳴体、前記読出し共鳴体、前記２つまたはそれよりも多い仲介共鳴体、および前記出力共鳴体が、前記骨格に連結され、前記骨格が、前記読出し共鳴体から前記出力共鳴体へ前記仲介共鳴体を介してエネルギーを伝送することができるように、さらに時間依存確率密度関数に応じて、前記読出し共鳴体が前記読出し波長の照射を受け取ったことに応答して、前記共鳴体ネットワークが前記出力共鳴体から光子を放出するように、前記第１の入力共鳴体、前記読出し共鳴体、前記２つまたはそれよりも多い仲介共鳴体、および前記出力共鳴体の相対位置を維持し、前記時間依存確率密度関数の検出可能な特性が、前記第１の入力共鳴体が前記暗状態にあるかどうかに関係する、照射することと、
前記第１の時間期間中に前記複数の共鳴体ネットワークを前記読出し波長の光で照射することと、
前記複数の共鳴体ネットワークの前記出力共鳴体からの複数の光子の放出の前記共鳴体ネットワークの前記照射に対するタイミングを検出することとを含む、
方法。
（項目９９）
前記複数の共鳴体ネットワークの各共鳴体ネットワークが、第２の入力共鳴体をさらに含み、前記第２の入力共鳴体が暗状態を有し、第２の入力励起波長の照射を受け取ったことに応答して前記暗状態に入ることができ、前記時間依存確率密度関数の検出可能な特性が、前記第２の入力共鳴体が前記暗状態にあるかどうかに関係し、前記方法が、
前記第１の時間期間後の第２の時間期間中に前記複数の共鳴体ネットワークを前記第２の入力波長の光で照射することと、
前記第２の時間期間中に前記複数の共鳴体ネットワークを前記読出し波長の光で照射することと、
前記複数の共鳴体ネットワークの前記出力共鳴体からの複数の光子の放出の前記第２の時間期間中の前記共鳴体ネットワークの前記照射に対するタイミングを検出することとをさらに含む、項目９８に記載の方法。
（項目１００）
前記複数の共鳴体ネットワークの各共鳴体ネットワークが、第２の入力共鳴体をさらに含み、前記第２の入力共鳴体が暗状態を有し、第２の入力励起波長の照射を受け取ったことに応答して前記暗状態に入ることができ、前記時間依存確率密度関数の検出可能な特性が、前記第２の入力共鳴体が前記暗状態にあるかどうかに関係し、前記方法が、
前記第１の時間期間後の第２の時間期間中に前記複数の共鳴体ネットワークを前記第１の入力波長の光および前記第２の入力波長の光で照射することと、
前記第２の時間期間中に前記複数の共鳴体ネットワークを前記読出し波長の光で照射することと、
前記複数の共鳴体ネットワークの前記出力共鳴体からの複数の光子の放出の前記第２の時間期間中の前記共鳴体ネットワークの前記照射に対するタイミングを検出することとをさらに含む、項目９８に記載の方法。
（項目１０１）
前記第１の時間期間中の前記複数の光子の放出の前記検出されたタイミングに基づいて、ランダム変数のサンプルを生成すること
をさらに含む、項目９８〜１００のいずれかに記載の方法。
（項目１０２）
前記第１の時間期間後の第２の時間期間中に前記複数の共鳴体ネットワークを前記読出し波長の光で照射することと、
前記複数の共鳴体ネットワークの前記出力共鳴体からの複数の光子の放出の前記第２の時間期間中の前記共鳴体ネットワークの前記照射に対するタイミングを検出することと、
前記第２の時間期間中の前記複数の光子の放出の前記検出されたタイミングに基づいて、第２のランダム変数のサンプルを生成することと
をさらに含む、項目１０１に記載の方法。
（項目１０３）
第１の入力波長および読出し波長の照射を提供するように構成された光源と、
光感知体と、
共鳴体ネットワークと、
項目９２〜１０２に記載の方法のいずれかを実施するように前記光源および前記光感知体を動作させるように構成されたコントローラと
を備えるシステム。

Claims (47)

  1. 発蛍光団、量子ドット、または色素のうちの少なくとも１つを含む２つまたはそれよりも多い入力共鳴体と、
    発蛍光団、量子ドットまたは色素のうちの少なくとも１つを含む出力共鳴体と、
    有機骨格とを含み、前記２つまたはそれよりも多い入力共鳴体および前記出力共鳴体が、前記骨格に連結され、前記骨格が、前記入力共鳴体のそれぞれから前記出力共鳴体へエネルギーを伝送することができるように、前記入力共鳴体および前記出力共鳴体の相対位置を維持する、
    標識。
  2. 前記２つまたはそれよりも多い入力共鳴体が、第１の入力共鳴体および第２の入力共鳴体を含み、前記骨格が、前記第２の入力共鳴体から前記出力共鳴体へ前記第１の入力共鳴体を介してエネルギーを伝送することができるように、前記入力共鳴体および前記出力共鳴体の相対位置を維持する、請求項１に記載の標識。
  3. 前記第１の入力共鳴体から前記第２の入力共鳴体へエネルギーを移動させることができる、請求項２に記載の標識。
  4. 前記入力共鳴体がすべて同じ発蛍光団を含む、請求項２に記載の標識。
  5. 前記入力共鳴体がそれぞれ、それぞれのリンカーを介して前記骨格に連結され、
    前記リンカーが特有のリンカー長を有し、
    前記入力共鳴体がフェルスター半径によって特徴付けられ、前記リンカーが前記骨格にそれぞれの連結位置で連結され、
    前記連結位置が、前記フェルスター半径より小さく前記入力共鳴体の消光のための特有の距離の２倍より大きい距離だけ互いから分離される、請求項３に記載の標識。
  6. 前記２つまたはそれよりも多い入力共鳴体が、４つを超える入力共鳴体を含む、請求項１に記載の標識。
  7. 前記２つまたはそれよりも多い入力共鳴体が、３０個を超える入力共鳴体を含む、請求項１に記載の標識。
  8. 前記出力共鳴体は、第１の出力共鳴体であり、
    前記標識は、
    第２の出力共鳴体と、
    ２つまたはそれよりも多い追加の入力共鳴体と
    をさらに含み、
    前記２つまたはそれよりも多い追加の入力共鳴体および前記第２の出力共鳴体が、前記骨格に連結され、
    前記骨格が、前記追加の入力共鳴体のそれぞれから前記第２の出力共鳴体へエネルギーを伝送することができるように、前記追加の入力共鳴体および前記第２の出力共鳴体の相対位置を維持する、
    請求項１に記載の標識。
  9. 前記骨格が、前記追加の入力共鳴体のうちの少なくとも１つから前記第１の出力共鳴体へエネルギーを伝送することができるように、前記追加の入力共鳴体および前記第１の出力共鳴体の相対位置を維持する、請求項８に記載の標識。
  10. １つまたは複数の仲介共鳴体をさらに含み、前記１つまたは複数の仲介共鳴体が前記骨格に結合されており、前記骨格が、前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの少なくとも１つの相対位置を維持し、前記出力共鳴体が前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの前記少なくとも１つからエネルギーを受け取ることができ、前記入力共鳴体のそれぞれから前記出力共鳴体へエネルギーを伝送することができるように、前記入力共鳴体および前記出力共鳴体の相対位置を維持する前記骨格が、前記入力共鳴体のそれぞれから前記出力共鳴体へ前記１つまたは複数の仲介共鳴体を介してエネルギーを伝送することができるように、前記入力共鳴体、前記出力共鳴体、および前記１つまたは複数の仲介共鳴体の相対位置を維持する前記骨格を含む、
    請求項１に記載の標識。
  11. 前記入力共鳴体が励起波長の光を吸収し、前記出力共鳴体が放出波長の光を放出し、前記放出波長が前記励起波長とは異なり、前記１つまたは複数の仲介共鳴体が、それぞれの放出波長によって特徴付けられ、前記１つまたは複数の仲介共鳴体の前記放出波長が、前記入力共鳴体の前記励起波長と前記出力共鳴体の前記放出波長との間の中間にある、請求項１０に記載の標識。
  12. 前記１つまたは複数の仲介共鳴体が、前記標識内で前記入力共鳴体と前記出力共鳴体との間に共鳴体ワイヤとして配置される、請求項１０に記載の標識。
  13. 前記仲介共鳴体がすべて同じ発蛍光団を含む、請求項１０に記載の標識。
  14. 前記骨格に連結された促進共鳴体をさらに含み、前記骨格が、前記促進共鳴体が暗状態にあることで、前記入力共鳴体から前記出力共鳴体への前記１つまたは複数の仲介共鳴体を介したエネルギーの伝送を促進するように、前記入力共鳴体、前記出力共鳴体、前記１つまたは複数の仲介共鳴体、および前記促進共鳴体の相対位置を維持する、請求項１０に記載の標識。
  15. 前記骨格に連結された抑制共鳴体をさらに含み、前記骨格が、前記抑制共鳴体が暗状態にあることで、前記入力共鳴体から前記出力共鳴体への前記１つまたは複数の仲介共鳴体を介したエネルギーの伝送を抑制するように、前記入力共鳴体、前記出力共鳴体、前記１つまたは複数の仲介共鳴体、および前記抑制共鳴体の相対位置を維持する、請求項１０に記載の標識。
  16. 受容体をさらに含み、前記受容体が、目的の検体と選択的に相互作用し、前記受容体が、前記骨格に連結される、
    請求項１に記載の標識。
  17. 前記骨格が、少なくとも部分的に相補的な２つのＤＮＡ鎖を含む、請求項１に記載の標識。
  18. 標識であって、
    入力共鳴体と、
    １つまたは複数の仲介共鳴体であって、前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの第１の仲介共鳴体が、前記入力共鳴体の近傍に配置されて、第１の仲介共鳴体が前記入力共鳴体からエネルギーを受け取ることができる、１つまたは複数の仲介共鳴体と、
    出力共鳴体であって、前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの少なくとも１つが、前記標識内で前記出力共鳴体の近傍に配置されて、前記出力共鳴体が前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの前記少なくとも１つからエネルギーを受け取ることができる、出力共鳴体と、
    骨格とを含み、前記入力共鳴体、前記出力共鳴体、および前記１つまたは複数の仲介共鳴体が、前記骨格に連結され、前記骨格が、前記入力共鳴体から前記出力共鳴体へ前記１つまたは複数の仲介共鳴体を介してエネルギーを伝送することができるように、前記入力共鳴体、前記出力共鳴体、および前記１つまたは複数の仲介共鳴体の相対位置を維持する、
    標識。
  19. 前記骨格が、少なくとも部分的に相補的な２つのＤＮＡ鎖を含む、請求項１８に記載の標識。
  20. 前記仲介共鳴体、前記入力共鳴体、または前記出力共鳴体のうちの少なくとも１つが発蛍光団を含む、請求項１８に記載の標識。
  21. 前記１つまたは複数の仲介共鳴体が、前記標識内で前記入力共鳴体と前記出力共鳴体との間に共鳴体ワイヤとして配置される、請求項１８に記載の標識。
  22. 前記仲介共鳴体がすべて同じ発蛍光団を含む、請求項１８に記載の標識。
  23. 前記入力共鳴体が第１の入力共鳴体であり、前記標識が、第２の入力共鳴体をさらに含み、前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの少なくとも１つが、前記第２の入力共鳴体の近傍に配置されて、前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの前記少なくとも１つが、前記第２の入力共鳴体からエネルギーを受け取ることができる、請求項１８に記載の標識。
  24. 前記第１の入力共鳴体が、第１の励起波長によって特徴付けられ、前記第２の入力共鳴体が、前記第１の励起波長とは異なる第２の励起波長によって特徴付けられる、請求項２３に記載の標識。
  25. 前記出力共鳴体が第１の出力共鳴体であり、前記標識が、第２の出力共鳴体をさらに含み、前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの少なくとも１つが、前記標識内で前記第２の出力共鳴体の近傍に配置されて、前記第２の出力共鳴体が、前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの前記少なくとも１つからエネルギーを受け取ることができる、請求項１８に記載の標識。
  26. 前記第２の出力共鳴体が、前記第１の出力共鳴体の前記放出波長とは異なる第２の放出波長によって特徴付けられる、請求項２５に記載の標識。
  27. 前記入力共鳴体が励起波長の光を吸収し、前記出力共鳴体が放出波長の光を放出し、前記放出波長が前記励起波長とは異なる、請求項１８に記載の標識。
  28. 前記１つまたは複数の仲介共鳴体が、それぞれの放出波長によって特徴付けられ、前記１つまたは複数の仲介共鳴体の前記放出波長が、前記入力共鳴体の前記励起波長と前記出力共鳴体の前記放出波長との間の中間にある、請求項２７に記載の標識。
  29. 前記骨格に連結された促進共鳴体をさらに含み、前記骨格が、前記促進共鳴体が暗状態にあることで、前記入力共鳴体から前記出力共鳴体への前記１つまたは複数の仲介共鳴体を介したエネルギーの伝送を促進するように、前記入力共鳴体、前記出力共鳴体、前記１つまたは複数の仲介共鳴体、および前記促進共鳴体の相対位置を維持する、請求項１８に記載の標識。
  30. 前記骨格に連結された抑制共鳴体をさらに含み、前記骨格が、前記抑制共鳴体が暗状態にあることで、前記入力共鳴体から前記出力共鳴体への前記１つまたは複数の仲介共鳴体を介したエネルギーの伝送を抑制するように、前記入力共鳴体、前記出力共鳴体、前記１つまたは複数の仲介共鳴体、および前記抑制共鳴体の相対位置を維持する、請求項１８に記載の標識。
  31. 受容体をさらに含み、前記受容体が、目的の検体と選択的に相互作用し、前記受容体が、前記骨格に連結される、
    請求項１８に記載の標識。
  32. 標識であって、
    複数の入力共鳴体であって、前記複数の入力共鳴体の入力共鳴体が前記標識内で互いの近傍に配置されて、前記入力共鳴体が互いの間でエネルギーを伝送することができる、複数の入力共鳴体と、
    骨格であって、前記入力共鳴体が前記骨格に連結され、前記入力共鳴体の間でエネルギーを伝送することができるように、前記骨格が、前記入力共鳴体の相対位置を維持する、骨格と
    を含む、標識。
  33. 前記骨格が、少なくとも部分的に相補的な２つのＤＮＡ鎖を含む、請求項３２に記載の標識。
  34. 前記複数の入力共鳴体の全ての入力共鳴体が、同じ発蛍光団を含む、請求項３２に記載の標識。
  35. 複数の出力共鳴体をさらに含み、前記複数の出力共鳴体の出力共鳴体は前記骨格に連結され、前記複数の入力共鳴体のそれぞれの入力共鳴体から前記出力共鳴体のそれぞれへエネルギーを伝送することができるように、前記骨格が、前記入力共鳴体および前記出力共鳴体の相対位置を維持する、請求項３２に記載の標識。
  36. 前記入力共鳴体が励起波長の光を吸収し、前記出力共鳴体が放出波長の光を放出し、前記放出波長が前記励起波長とは異なる、請求項３５に記載の標識。
  37. 受容体をさらに含み、前記受容体が、目的の検体と選択的に相互作用し、前記受容体が、前記骨格に連結される、請求項３２に記載の標識。
  38. 前記複数の入力共鳴体が、４つを超える入力共鳴体を含む、請求項３２に記載の標識。
  39. 前記複数の入力共鳴体が、３０個を超える入力共鳴体を含む、請求項３２に記載の標識。
  40. 試料容器と、
    光源と、
    光検出器と、
    コントローラとを備え、前記コントローラが、
    前記光源を使用して、前記試料容器を照射することと、
    前記光検出器を使用して、前記試料容器からの複数の光子の放出の波長または強度のうちの少なくとも１つを検出することと、
    前記複数の光子の放出の前記検出された波長または強度に基づいて、標識の識別情報を判定することとを含む動作を実行するようにプログラムされ、前記標識の前記識別情報を判定することが、１組の既知の標識から前記標識の前記識別情報を選択することを含み、前記１組の既知の標識は第１の標識および第２の標識を含み、前記第１の標識が、
    第１の目的の検体と選択的に相互作用する第１の受容体、
    少なくとも２つの第１の入力共鳴体、
    少なくとも１つの第１の出力共鳴体であって、前記第１の標識内の第１の入力共鳴体の数と前記第１の標識内の第１の出力共鳴体の数との間の比が第１の値を有する、少なくとも１つの第１の出力共鳴体、および
    第１の骨格を含み、前記第１の受容体、前記少なくとも２つの第１の入力共鳴体、および前記少なくとも１つの第１の出力共鳴体が、前記第１の骨格に連結され、前記第１の骨格が、前記第１の入力共鳴体のそれぞれから少なくとも１つの第１の出力共鳴体へエネルギーを伝送することができるように、前記少なくとも２つの第１の入力共鳴体および前記少なくとも１つの第１の出力共鳴体の相対位置を維持し、
    前記第２の標識が、
    第２の目的の検体と選択的に相互作用する第２の受容体、
    少なくとも２つの第２の入力共鳴体、
    少なくとも１つの第２の出力共鳴体であって、前記第２の標識内の第２の入力共鳴体の数と前記第２の標識内の第２の出力共鳴体の数との間の比が第２の値を有する、少なくとも１つの第２の出力共鳴体、および
    第２の骨格を含み、前記第２の受容体、前記少なくとも２つの第２の入力共鳴体、および前記少なくとも１つの第２の出力共鳴体が、前記第２の骨格に連結され、前記第２の骨格が、前記第２の入力共鳴体のそれぞれから少なくとも１つの第２の出力共鳴体へエネルギーを伝送することができるように、前記少なくとも２つの第２の入力共鳴体および前記少なくとも１つの第２の出力共鳴体の相対位置を維持する、
    システム。
  41. 前記第１の値および前記第２の値が異なる、請求項４０に記載のシステム。
  42. 前記動作が、前記標識の前記判定された識別情報に基づいて、前記試料容器の内容物を１つまたは複数の位置に分類することをさらに含む、請求項４０に記載のシステム。
  43. 第１の標識であって、
    第１の目的の検体と選択的に相互作用する第１の受容体、
    少なくとも２つの第１の入力共鳴体、
    少なくとも１つの第１の出力共鳴体であって、前記第１の標識内の第１の入力共鳴体の数と前記第１の標識内の第１の出力共鳴体の数との間の比が第１の値を有する、少なくとも１つの第１の出力共鳴体、および
    第１の骨格を含み、前記第１の受容体、前記少なくとも２つの第１の入力共鳴体、および前記少なくとも１つの第１の出力共鳴体が、前記第１の骨格に連結され、前記第１の骨格が、前記第１の入力共鳴体のそれぞれから少なくとも１つの第１の出力共鳴体へエネルギーを伝送することができるように、前記少なくとも２つの第１の入力共鳴体および前記少なくとも１つの第１の出力共鳴体の相対位置を維持する、第１の標識と、
    第２の標識であって、
    第２の目的の検体と選択的に相互作用する第２の受容体、
    少なくとも２つの第２の入力共鳴体、
    少なくとも１つの第２の出力共鳴体であって、前記第２の標識内の第２の入力共鳴体の数と前記第２の標識内の第２の出力共鳴体の数との間の比が第２の値を有する、少なくとも１つの第２の出力共鳴体、および
    第２の骨格を含み、前記第２の受容体、前記少なくとも２つの第２の入力共鳴体、および前記少なくとも１つの第２の出力共鳴体が、前記第２の骨格に連結され、前記第２の骨格が、前記第２の入力共鳴体のそれぞれから少なくとも１つの第２の出力共鳴体へエネルギーを伝送することができるように、前記少なくとも２つの第２の入力共鳴体および前記少なくとも１つの第２の出力共鳴体の相対位置を維持する、第２の標識と
    を含む、造影剤。
  44. 前記第１の値および前記第２の値が異なる、請求項４３に記載の造影剤。
  45. 前記第１の入力共鳴体および前記第２の入力共鳴体が、吸収波長に関して異なる、請求項４３に記載の造影剤。
  46. 前記第１の出力共鳴体および前記第２の出力共鳴体が、放出波長に関して異なる、請求項４３に記載の造影剤。
  47. 前記第１の標識が、
    １つまたは複数の仲介共鳴体をさらに含み、前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの第１の仲介共鳴体が、前記第１の標識内で前記少なくとも２つの第１の入力共鳴体の近傍に配置されて、前記第１の仲介共鳴体が、前記少なくとも２つの第１の入力共鳴体のそれぞれからエネルギーを受け取ることができ、前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの少なくとも１つが、前記第１の標識内で少なくとも１つの第１の出力共鳴体の近傍に配置されて、前記少なくとも１つの第１の出力共鳴体が前記１つまたは複数の仲介共鳴体のうちの前記少なくとも１つからエネルギーを受け取ることができ、前記第１の入力共鳴体のそれぞれから少なくとも１つの第１の出力共鳴体へエネルギーを伝送することができるように、前記少なくとも２つの第１の入力共鳴体および前記少なくとも１つの出力共鳴体の相対位置を維持する前記第１の骨格が、前記第１の入力共鳴体のそれぞれから前記少なくとも１つの第１の出力共鳴体へ前記１つまたは複数の仲介共鳴体を介してエネルギーを伝送することができるように、前記第１の入力共鳴体、前記少なくとも１つの第１の出力共鳴体、および前記１つまたは複数の仲介共鳴体の相対位置を維持する骨格を含む、請求項４３に記載の造影剤。

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