JP2020510430A - Aavベクターに基づくインフルエンザワクチン - Google Patents
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Abstract
Description
インフルエンザ感染は米国で7番目に多い死因であり、年間およそ49,000人の死亡に相当し、世界全体でのほぼ500,000人の死亡のうちの大きな割合を占めている。ワクチンは、ヒトをインフルエンザから防護するのに必ずしも有効であるとは限らない。さらに、新たなインフルエンザ大流行の発生は、大幅な人命損失及び世界的な経済崩壊を招き得る脅威であり続けている。ヒト集団において1997年にH5N1、2013年にH7N9の高病原性鳥インフルエンザが発生したことに例示されるように、水鳥が広範にインフルエンザAウイルスを保有していることは大流行の継続的脅威を意味している(J.Liu et al.,Highly pathogenic H5N1 influenza virus infection in migratory birds.Science 309,1206(2005)、H.Chen et al.,Avian flu:H5N1 virus outbreak in migratory
waterfowl.Nature 436,191−192(2005)、及びR.Gao et al.,Human infection with a novel avian−origin influenza A(H7N9) virus.N.Engl.J.Med.368,1888−1897(2013))。動物インフルエンザ流行の経済的負荷はおよそ870億ドルほどであると推定される。このコストの半分よりも多くを、ほぼ100万人に及ぶ患者に必要な病院看護が占めており、患者の70%は(65歳より高齢の)老人患者である。
u Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Thr Ala Gln Gly Gln Trp Arg Ala Ala Pro Val Ala Val Ala Ala Glu Tyr Glu Phe Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser)を有する。第3免疫グロブリン領域は、配列番号3のアミノ酸配列:(Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Leu Glu Asn Lys Ala Ile Gly Trp Phe Arg Gln Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Gly Val Leu Cys Ile Ser Lys Ser Gly Ser Trp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Val Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Thr Thr Thr Ala Gly Gly Gly Leu Cys Trp Asp Gly Thr Thr Phe Ser Arg Leu Ala Ser Ser Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser)を有する。第4免疫グロブリン領域は、配列番号4のアミノ酸配列:(Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Thr Ser Trp Met Tyr Trp Leu Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Ser Val Ile Asn Thr Asp Gly Gly Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys Asp Trp Gly Gly Pro Glu Pro Thr Arg Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser)を有する。
Animal Influenza Diagnosis and Surveillance,Geneva:World Health Organisation,2005,version 2002.5に記載されている。典型的には、本発明による結合分子は、試験管内でのウイルス中和アッセイ(VNA)で決定したときに1000nM以下、好ましくは100nM以下の中和活性、より好ましくは10nM以下、よりいっそう好ましくは1nM以下の中和活性を有する。
含み得、そのような融合タンパク質には、4つの免疫グロブリン領域のうちの2つ以上を繋ぎ合わせる連結配列が場合によって存在している。場合によって、連結配列は免疫グロブリンドメインとFc領域及び/またはヒンジ領域との間に存在し得る。連結配列は、ドメインまたは領域のうち2つ、3つまたは4つを離隔させるために使用されて第1ドメイン(領域)のC末端及び第2ドメイン(領域)のN末端のすぐ隣にあってもよい。長さ約1〜20アミノ酸の任意の好適な配列を選択してよいが、その長さは好ましくは3〜18アミノ酸、または約5〜約12アミノ酸である。コードされる単一のタンパク質配列の中に複数の連結配列が存在していてもよく、これらは独立して選択され得る。一実施形態では、少なくとも1つの連結配列はGGGGSGGGGS(配列番号7)である。
Fcである。一実施形態では、Fc領域は、操作されたFc断片である。例えば、Lobner,Elisabeth,et al.“Engineered IgG1−Fc−one fragment to bind them all.”Immunological reviews 270.1(2016):113−131、Saxena,Abhishek,and Donghui Wu.“Advances in therapeutic Fc engineering−modulation of IgG−Associated effector functions and serum half−life.”Frontiers in immunology 7(2016)、Irani,Vashti,et al.“Molecular properties of human IgG subclasses and their
implications for designing therapeutic monoclonal antibodies against infectious
diseases.”Molecular immunology 67.2(2015):171−182、Rath,Timo,et al.“Fc−fusion proteins and FcRn:structural insights for longer−lasting and more effective therapeutics.”Critical reviews in biotechnology 35.2(2015):235−254、及びInvivogen,IgG−Fc
Engineering For Therapeutic Use,www.invivogen.com/docs/Insight200605.pdf,April 2006を参照されたく、参照によりこれらの各々を本明細書に援用する。さらなる実施形態において、Fc領域は、配列番号11で再現されるアミノ酸配列を有する。特定の実施形態では、Fc領域は標的細胞における抗体依存性細胞傷害(ADCC)を誘導することができる。特定の実施形態では、Fc領域は、補体依存性細胞傷害(CDC)を誘導することができる。
繋げられた少なくとも2つのヒト化VHH抗体を含む結合分子を指す。
transduction independently of DNA synthesis”,Gene Therapy,(August 2001),Vol 8,Number 16,Pages 1248−1254を参照されたい。自己相補性AAVは、例えば、米国特許第6,596,535号、第7,125,717号及び第7,456,683号に記載されており、参照によりこれらの各々の全体を本明細書に援用する。
意のウイルスゲノム配列が増殖能欠損型である、つまりそれらが子孫ビリオンを生み出すことができないが標的細胞に感染する能力を保持している、合成または人工のウイルス粒子を指す。一実施形態では、ウイルスベクターのゲノムは、複製するのに必要とされる酵素をコードする遺伝子を含まない(ゲノムは、人工ゲノムの増幅及びパッケージングに必要とされるシグナルに挟まれた関心対象の導入遺伝子のみを含有して「ガットレス」になるように操作され得る)が、これらの遺伝子は生産中に供給され得るものである。したがってそれは、複製のために必要とされるウイルス酵素の存在下にある場合以外は子孫ビリオンによる複製及び感染が起こり得ないことから、遺伝子療法に使用するために安全であるとみなされる。
ムは、2つ以上の発現カセットを含有し得る。他の実施形態では、「導入遺伝子」という用語は、「発現カセット」と交換可能に使用され得る。
ウスモデルの例は本明細書中に記載されている。
本明細書に記載の組成物は、4つの抗免疫グロブリン領域を発現させるように設計されるが、これらは場合によって1つ以上の融合タンパク質として発現する。以下の「第1」、「第2」、「第3」及び「第4」への言及が、どの領域に言及しているのかを明確にするために使用されているということは理解されよう。しかしながらこれは、ベクターゲノム(複数可)からこれらが発現する順序、または融合タンパク質中にこれらが出現する順序に限定されない。したがって、融合タンパク質が、第1領域もしくは第2領域の上流もしくは下流に位置する「第3」領域を含有していてもよく、及び/または「第1」領域が、「第2」、「第3」もしくは「第4」領域の下流に位置していてもよい。
Gly Val Val Gln Pro Gly Gly Ser Leu Arg
Leu Ser Cys Ala Ala Ser Ile Ser Ile Phe
Asp Ile Tyr Ala Met Asp Trp Tyr Arg Gln
Ala Pro Gly Lys Gln Arg Glu Leu Val Ala
Val Ser Phe Arg Asp Gly Ser Thr Tyr Tyr
Ala Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile
Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp
Thr Ala Val Tyr Tyr Cys His Val Ser Leu
Tyr Arg Asp Pro Leu Gly Val Ala Gly Gly
Ile Gly Val Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu
Val Thr Val Ser Ser。特定の実施形態では、このアミノ酸配列におけるいくつかの変異が許容され、つまり、この配列と約95%〜約99%同一である配列は本発明に包含される。換言すれば、配列番号1の1つ、2つ、3つ、4つ、5つまたは6つのアミノ酸が修飾されていてもよい。一実施形態では、代替の第1免疫グロブリン領域は、配列番号30のaa24〜aa147として再現されI110M突然変異を伴って配列番号1のアミノ酸配列を有する免疫グロブリン領域を指す。特定の実施形態では、これらのアミノ酸配列は、保存された変化である。しかしながら、非保存残基を選択してもよい。本明細書中で使用する場合、「保存された変化」という用語は、アミノ酸を、類似する生物化学的特性(例えば、電荷、疎水性及び大きさ)を有する別のアミノ酸に変化させることを指す。
l Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Val Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Thr Thr Thr Ala Gly Gly Gly Leu Cys Trp Asp Gly Thr Thr Phe Ser Arg Leu Ala Ser Ser Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Serを有する。特定の実施形態では、このアミノ酸配列におけるいくつかの変異が許容され、つまり、この配列と約95%〜約99%同一である配列は本発明に包含される。換言すれば、配列番号3の1つ、2つ、3つ、4つ、5つまたは6つのアミノ酸が修飾されていてもよい。特定の実施形態では、これらのアミノ酸配列は、保存された変化である。
発現ベクターにライゲートすることができる。二量体構築物において第1免疫グロブリン領域のC末端は第2免疫グロブリン領域の末端に繋げられ得る。様々な長さ(10、15、35及び57アミノ酸)のリンカー配列はアミノ酸グリシン(G)及びセリン(S)からなる。連結配列は、ドメインまたは領域のうち2つ、3つまたは4つを離隔させるために使用されて第1ドメイン(領域)のC末端及び第2ドメイン(領域)のN末端のすぐ隣にあってもよい。長さ約1〜60アミノ酸のいかなる好適な配列を選択してよいが、その長さは好ましくは3〜35アミノ酸、または約5〜約15アミノ酸である。コードされる単一のタンパク質配列の中に複数の連結配列が存在していてもよく、これらは独立して選択され得る。
配列番号7:GGGGS GGGGS;
配列番号23:GGGGS GGGGS GGGGS;
配列番号24:GGGGS GGGGS GGGGS GGGGS GGGGS GGGGS GGGGS
配列番号25:GGGGS GGGGS GGGGS GGGGS GGGGGGS GGGGS GGGGS GGGGS GGGGS GGGGS GGGGS
が挙げられる。
融合タンパク質中に含まれ得る。一実施形態では、ベクターゲノムは配列番号31である。
上のウェブサービスを通じて入手可能である。そのようなプログラムの他の提供元は当業者に知られている。あるいは、ベクターNTIユーティリティーも使用される。また、上記プログラムの中に含まれているものを含めて、ヌクレオチド配列同一性を測定するために使用することができる当技術分野で知られている多くのアルゴリズムが存在する。別の例として、GCG バージョン6.1の中のプログラムであるFasta(商標)を使用してポリヌクレオチド配列を比較することができる。Fasta(商標)は、クエリー配列と検索配列との間で最もよく重複している領域のアラインメント及び配列同一性パーセントを提供する。例えば、参照により本明細書に援用するGCG バージョン6.1において提供されるようなデフォルトパラメータ(6のワードサイズ、スコア行列のためのNOPAM係数)でFasta(商標)を使用して核酸配列同士の配列同一性パーセントを決定することができる。また、複数の配列アラインメントプログラム、例えば、「Clustal Omega」、「Clustal X」、「MAP」、「PIMA」、「MSA」、「BLOCKMAKER」、「MEME」及び「Match−Box」プログラムがアミノ酸配列に対しても利用可能である。一般的にはこれらのプログラムのいずれかをデフォルト設定で使用するが、当業者であればこれらの設定を必要に応じて変更することができる。あるいは、当業者であれば、もたらされる同一性またはアラインメントのレベルが基準アルゴリズム及びプログラムによってもたらされるそのレベルと少なくとも同程度である別のアルゴリズムまたはコンピュータプログラムを利用することができる。例えば、J.D.Thomson et al,Nucl.Acids.Res.,“A comprehensive comparison of multiple sequence alignments”,27(13):2682−2690(1999)を参照されたい。
本明細書中で使用する場合、AAVの群に関する「クレード」という用語は、AAV vp1アミノ酸配列のアラインメントに基づいて(少なくとも1000個の複製物の)少なくとも75%のブートストラップ値及び0.05以下のポアソン補正距離測定値による近接結合アルゴリズムを用いて判定した場合に系統学的に互いに関連し合っているAAVの群を指す。近接結合アルゴリズムは文献に記載されている。例えば、M.Nei and S.Kumar,Molecular Evolution and Phylogenetics(Oxford University Press,New York(2000)を参照されたい。このアルゴリズムを実行するために使用することができるコンピュータプログラムは入手可能である。例えば、MEGA v2.1プログラムは改変Nei−Gojobori法を実装している。これらの技術及びコンピュータプログラムならびにAAV vp1カプシドタンパク質の配列を用いて当業者は、選択されたAAVが本明細書で特定されるクレードの1つに含まれているか、別のクレードに含まれているか、またはこれらのクレードから外れるかについて容易に判定することができる。例えば、クレードA、B、C、D、E及びFを同定し新規AAV、GenBank受託番号AY530553〜AY530629の核酸配列を提供しているG Gao,et al,
J Virol,2004 Jun;78(12):6381−6388を参照されたい。また、WO2005/033321も参照されたい。
のアスパラギン酸:イソアスパラギン酸、または約1:3のアスパラギン酸:イソアスパラギン酸、または別の選択された比であり得る。
736の予測アミノ酸配列をコードする核酸配列からの発現によって産生されるAAVhu68 vp2タンパク質、配列番号18の少なくともヌクレオチド412〜2211を含む配列から産生されるvp2タンパク質、もしくは配列番号16の少なくとも約アミノ酸138〜736の予測アミノ酸配列をコードし配列番号18の少なくともヌクレオチド412〜2211と少なくとも70%同一である核酸配列から産生されるvp2タンパク質、及び/または、配列番号16の少なくとも約アミノ酸203〜736の予測アミノ酸配列をコードする核酸配列からの発現によって産生されるAAVhu68 vp3タンパク質、配列番号18の少なくともヌクレオチド607〜2211を含む配列から産生されるvp3タンパク質、もしくは配列番号16の少なくとも約アミノ酸203〜736の予測アミノ酸配列をコードし配列番号18の少なくともヌクレオチド607〜2211と少なくとも70%同一である核酸配列から産生されるvp3タンパク質を含む。
hu68カプシドは、配列番号16の予測アミノ酸残基からの修飾を有するvp1タンパク質内、vp2タンパク質内及びvp3タンパク質内の亜集団を含有する。これらの亜集団は最低でも脱アミド化アスパラギン(NまたはAsn)残基を含む。例えば、アスパラギン−グリシン対のアスパラギンが高度に脱アミド化されている。
RF)の完全長を改変することが好適である。しかしながら、いくつかの実施形態ではORFの一部のみが変更されていてもよい。これらの方法のうちの1つを用いることによって、頻度を任意の所与のポリペプチド配列に適用することができ、ポリペプチドをコードするコドン最適化コード領域の核酸断片を産生させることができる。コドンに対する実際の変更を実施するためまたは本明細書に記載されているとおりに設計されたコドン最適化コード領域を合成するために、多くの選択肢が利用可能である。そのような改変または合成は、当業者によく知られている標準的及び慣例的な分子生物学的操作を用いて実施され得る。1つの手法では、長さが各々80〜90ヌクレオチドであり所望の配列の長さにまたがる一連の相補的オリゴヌクレオチド対は、標準的な方法によって合成される。これらのオリゴヌクレオチド対は、それらがアニーリング時に付着末端を含有する80〜90塩基対の二本鎖断片を形成するように合成され、例えば、対の各オリゴヌクレオチドは、対のもう一方のオリゴヌクレオチドに相補的な領域を越えて3、4、5、6、7、8、9、10個またはそれより多い塩基を延出させるように合成される。各対のオリゴヌクレオチドの一本鎖端部は、別の対のオリゴヌクレオチドの一本鎖端部とアニーリングするように設計される。オリゴヌクレオチド対をアニーリングさせ、その後、これらの二本鎖断片のおよそ5〜6個を付着一本鎖端部を介してアニーリングさせ、その後、それらをライゲートし合わせ、標準的な細菌クローニングベクター、例えば、Invitrogen Corporation,Carlsbad,Califから入手することができるTOPO(登録商標)ベクターにクローニングする。その後、構築物の配列決定を標準的な方法で行う。ライゲートされ合った5〜6断片の80〜90塩基対断片、すなわち約500塩基対の断片からなるこれらの構築物のいくつかは、所望の配列の全体が一連のプラスミド構築物として表されるように作製される。その後、これらのプラスミドのインサートを適切な制限酵素で切断し、ライゲートし合わせて最終構築物を形成する。その後、最終構築物を標準的な細菌クローニングベクターにクローニングし、配列決定する。さらなる方法は当業者であればすぐに分かるであろう。加えて、遺伝子合成は商業的に容易に利用することができる。
びvp3タンパク質を有しているAAVhu68カプシドを有する。rAAVにおける脱アミド化は、2Dゲル電気泳動及び/または質量分析及び/またはタンパク質モデリング技術を用いて決定され得る。Acclaim PepMapカラム、及びNanoFlexソースを備えたQ Exactive HF(Thermo Fisher Scientific)と連結したThermo UltiMate3000RSLCシステム(Thermo Fisher Scientific)を用いてオンラインクロマトグラフィーを実施してもよい。MSデータは、検査スキャン(200〜2000m/z)から最も豊富な配列未決定の前駆体イオンを動的に選択する、Q Exactive HFのためのデータ依存的上位20位法を用いて取得される。配列決定は、予測自動ゲイン制御を用いて決定される目標値を1e5イオンとする高エネルギー衝突解離フラグメンテーションによって実施し、前駆体の単離は余裕枠を4m/zとして実施した。検査スキャンは、m/z200で120,000の分解能で取得した。HCDスペクトルの分解能は、最大イオン注入時間を50msとし正規化衝突エネルギーを30としてm/z200で30,000に設定され得る。S−レンズRFレベルは、消化物からのペプチドが占有するm/z領域の透過を最適化するために50に設定され得る。前駆体イオンは、単一の未帰属の、または6つ以上の荷電状態によってフラグメンテーション選択から除外され得る。取得したデータの解析のためにBioPharma Finder 1.0ソフトウェア(Thermo Fischer Scientific)が使用され得る。ペプチドマッピングのためには単一入力タンパク質FASTAデータベースを使用し、カルバミドメチル化を固定の修飾に設定し、酸化、脱アミド化及びリン酸化を可変の修飾に設定し、質量精度を10−ppmとし、高いプロテアーゼ特異性とし、信頼度レベルをMS/MSスペクトルのために0.8として、検索を実施する。好適なプロテアーゼの例には、例えばトリプシンまたはキモトリプシンが含まれ得る。脱アミド化は未処理の分子の質量に+0.984Da(−OH基と−NH2基との質量差)だけ足すので、質量分析による脱アミド化ペプチドの同定は比較的平易である。特定のペプチドの脱アミド化パーセントは、脱アミド化ペプチドの決定された質量面積を脱アミド化ペプチドと元のペプチドとの合計面積で割ったものである。脱アミド化可能な部位の数を考える場合、異なる部位で脱アミド化されている同重体種同士は、寄り合って1本のピークとなり得る。結果として、複数の潜在的脱アミド化部位を有するペプチドから発生するフラグメントイオンを用いて脱アミド化の複数の部位を突き止める、または区別することができる。これらの場合には、観察された同位体パターンの相対強度を用いて種々の脱アミド化ペプチド異性体の相対存在量を具体的に決定することができる。この方法は、全ての異性体種についてフラグメンテーション効率が同じであり脱アミド化の部位に無関係であることを仮定している。当業者であれば、これらの例示的方法に対する多くの変更を用いることができることを理解するであろう。例えば、好適な質量分析装置としては、Waters XevoもしくはAgilent 6530などの四重極型飛行時間質量分析装置(QTOF)または、Orbitrap FusionもしくはOrbitrap Velos(Thermo Fisher)などのオービトラップ型装置が挙げられ得る。好適な液体クロマトグラフィーシステムとしては、例えば、WatersからのAcquity UPLCシステム、またはAgilentシステム(シリーズ1100または1200)が挙げられる。好適なデータ解析ソフトウェアは、例えば、MassLynx(Waters)、Pinpoint
and Pepfinder(Thermo Fischer Scientific)、Mascot(Matrix Science)、Peaks DB(Bioinformatics Solutions)を含み得る。さらに他の技術は、例えば、2017年6月16日にオンライン公開されたX.Jin et al,Hu Gene Therapy Methods,Vol.28,No.5,pp.255−267に記載されている可能性がある。
ン)がリン酸化されている。場合によってはカプシドのvp1、vp2及び/またはvp3の少なくとも1つのT(Thr、スレオニン)がリン酸化されている。場合によってはカプシドのvp1、vp2及び/またはvp3の少なくとも1つのW(trp、トリプトファン)が酸化されている。場合によってはカプシドのvp1、vp2及び/またはvp3の少なくとも1つのM(Met、メチオニン)が酸化されている。特定の実施形態では、カプシドタンパク質は1つ以上のリン酸化を有する。例えば、特定のvp1カプシドタンパク質が位置149においてリン酸化されている場合がある。
脱アミド化されているvp1、vp2及び/またはvp3タンパク質の亜集団を含む;(e)rAAVhu68カプシドは、配列番号16の付番に基づく位置N66、N94、N113、N252、N253、Q259、N270、N303、N304、N305、N319、N328、N336、N409、N410、N477、N515、N598、Q599、N628、N651、N663、N709のうちの1つ以上またはその組み合わせにおいて1〜20%の脱アミド化を含むvp1、vp2及び/またはvp3タンパク質の亜集団を含む;(f)rAAVhu68カプシドは、配列番号16の付番に基づいてvp1タンパク質の位置57にあるNの65〜100%が脱アミド化されているvp1の亜集団を含む;(g)rAAVhu68カプシドは、vp1タンパク質の位置57にあるNの75〜100%が脱アミド化されているvp1タンパク質の亜集団を含む;(h)rAAVhu68カプシドは、配列番号16の付番に基づく位置329にあるNの80〜100%が脱アミド化されているvp1タンパク質、vp2タンパク質及び/またはvp3タンパク質の亜集団を含む;(i)rAAVhu68カプシドは、配列番号16の付番に基づく位置452にあるNの80〜100%が脱アミド化されているvp1タンパク質、vp2タンパク質及び/またはvp3タンパク質の亜集団を含む;(j)rAAVhu68カプシドは、配列番号16の付番に基づく位置512にあるNの80〜100%が脱アミド化されているvp1タンパク質、vp2タンパク質及び/またはvp3タンパク質の亜集団を含む;(k)rAAVは、合計約60個のカプシドタンパク質をvp1対vp2対vp3タンパク質の約1対約1〜1.5対3〜10の比で含む;(l)rAAVは、合計約60個のカプシドタンパク質をvp1対vp2対vp3タンパク質の約1対約1対3〜9の比で含む。
、及び/または貯蔵時、特に懸濁液形態での貯蔵時の安定性を向上させ得る。
6のアミノ酸配列の残基付番に基づいてvp1、v2及びvp3タンパク質の位置452にあるアスパラギン−グリシン対のNの少なくとも50%が脱アミド化されていること;及び/または(d)配列番号16のアミノ酸配列の残基付番に基づいてvp1、v2及びvp3タンパク質の位置512にあるアスパラギン−グリシン対のNの少なくとも75%が脱アミド化されていることのうちの1つ以上を有する亜集団を含む。特定の実施形態では、hu68カプシドは、質量分析を用いて決定した場合にvp1タンパク質の位置57にあるNの75〜100%が脱アミド化されているvp1の亜集団を含む。特定の実施形態では、hu68カプシドは、質量分析を用いて決定した場合に配列番号16の付番に基づく位置329にあるNの75〜100%が脱アミド化されているvp1タンパク質、vp2タンパク質及び/またはvp3タンパク質の亜集団を含む。特定の実施形態では、hu68カプシドは、質量分析を用いて決定した場合に配列番号16の付番に基づく位置452にあるNの75〜100%が脱アミド化されているvp1タンパク質、vp2タンパク質及び/またはvp3タンパク質の亜集団を含む。特定の実施形態では、hu68カプシドは、配列番号16の付番に基づく位置512にあるNの75〜100%が脱アミド化されているvp1タンパク質、vp2タンパク質及び/またはvp3タンパク質の亜集団を含む。特定の実施形態では、タンパク質をコードする核酸配列は、配列番号18、または配列番号16のアミノ酸配列をコードし配列番号18と少なくとも80%〜少なくとも99%同一である配列である。特定の実施形態では、配列は配列番号18と少なくとも80%〜97%同一である。特定の実施形態では、rAAVhu68カプシドは少なくとも、N57、329、452、512またはそれらの組み合わせのうちの1つ以上から選択される少なくとも4つの位置における少なくとも約50〜100%の脱アミド化を含む配列番号16からのアミノ酸修飾を有しているvp1、vp2及び/またはvp3タンパク質の亜集団をさらに含む。特定の実施形態では、hu68カプシドは、位置N94、N113、N252、N253、Q259、N270、N303、N304、N305、N319、N328、N336、N409、N410、N477、N515、N598、Q599、N628、N651、N663、N709またはそれらの組み合わせのうちの少なくとも1つ以上における1%〜約40%の脱アミド化をさらに含むvp1、vp2及び/またはvp3タンパク質の亜集団を含む。特定の実施形態では、hu68カプシドは、以下のうちの1つ以上における1つ以上の修飾から選択される1つ以上の修飾をさらに含むvp1、vp2及び/またはvp3タンパク質の亜集団を含む:アセチル化リジン、リン酸化セリン及び/またはスレオニン、異性化アスパラギン酸、酸化トリプトファン及び/またはメチオニン、またはアミド化アミノ酸。特定の実施形態では、rAAVhu68は、合計約60個のカプシドタンパク質をvp1対vp2対vp3タンパク質の約1対約1〜1.5対3〜10の比で含む。特定の実施形態では、AAVhu68カプシドの合計約60個のカプシドタンパク質はvp1対vp2対vp3タンパク質の比が約1対約1対3〜9である。特定の実施形態では、ベクターゲノムは、AAVhu68以外のAAV源からのAAV ITR配列を含む。
テムを使用してもよい。例えば、そのような産生システムは、(a)配列番号16のアミノ酸配列をコードするAAVhu68カプシド核酸配列;(b)AAVhu68カプシド内へのパッケージングに適した核酸分子であって、少なくとも1つのAAV末端逆位反復配列(ITR)と、遺伝子産物をコードしており宿主細胞における当該産物の発現を促す配列に機能可能に繋げられている非AAV核酸配列とを含む当該核酸分子;ならびに(c)組換えAAVhu68カプシド内への核酸分子のパッケージングを可能にするに足るAAV rep機能及びヘルパー機能を含み得る。特定の実施形態では、(a)の核酸配列は少なくとも、配列番号18、または配列番号16のアミノ酸配列をコードし配列番号18と少なくとも70%〜少なくとも99%同一である配列を含む。特定の実施形態では、システムは場合によってさらに、配列番号16の約aa203〜約アミノ酸736のAAVhu68 vp3をコードする配列番号18の約nt607〜約nt2211の核酸配列を含む。特定の実施形態では、システムは、ヒト胚性腎臓293細胞またはバキュロウイルスシステムを含む。
AAVカプシド内にパッケージングされ宿主細胞に送達されるゲノム配列は、典型的には、最低でも、導入遺伝子及びその調節配列、ならびにAAV末端逆位反復配列(ITR
)からなる。一本鎖AAV及び自己相補性(sc)AAVはどちらもrAAVに包含される。導入遺伝子は、ベクター配列にとって異種である核酸コード配列であるが、これは、関心対象のポリペプチド、タンパク質、機能性RNA分子(例えば、miRNA、miRNA阻害物質)またはその他の遺伝子産物をコードするものである。核酸コード配列は、標的組織の細胞における導入遺伝子の転写、翻訳及び/または発現を可能にするように調節性構成要素に機能的に繋げられる。
ad.Sci.USA 88:4626−4630(1991)、アデノシンデアミナーゼプロモーター、ホスホグリセロールキナーゼ(PGK)プロモーター、ピルビン酸キナーゼプロモーター ホスホグリセロールムターゼプロモーター、β−アクチンプロモーター(Lai et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86:10006−10010(1989))、モロニー白血病ウイルス及びその他のレトロウイルスの長鎖末端反復配列(LTR)、単純ヘルペスウイルスのチミジンキナーゼプロモーター、ならびに当業者に知られている他の恒常的プロモーターが挙げられる。本発明における使用に適する組織または細胞特異的プロモーターの例としては、限定されないが、内皮細胞に特有のエンドセリン−I(ET−I)及びFlt−I、(線毛細胞を指向する)FoxJ1が挙げられる。
29:99−108)、Brinster et al.(1982,Nature 296:39−42)及びSearle et al.(1985,Mol.Cell.Biol.5:1480−1489)によって教示されているもの、または熱ショック応答エレメント、例えばNouer et al.によって(Heat Shock Response,ed.Nouer,L.,CRC,Boca Raton,Fla.,ppI67−220,1991の中で)教示されているものが挙げられる。
.(1981,Nature 294:228−232)、Hynes et al.(1981,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 78:2038−2042)、Klock et al.(1987,Nature 329:734−736)、及びIsrael &Kaufman(1989,Nucl.Acids Res.17:2589−2604)によって教示されるもの、ならびに当技術分野で知られている他の誘導性プロモーターが挙げられ得る。そのようなプロモーターを使用して、例えばTet−on/offシステム(Gossen et al.,1995,Science 268:1766−9、Gossen et al.,1992,Proc.Natl.Acad.Sci.USA.,89(12):5547−51)、TetR−KRABシステム(Urrutia R.,2003,Genome Biol.,4(10):231、Deuschle U et al.,1995,Mol Cell Biol.(4):1907−14)、mifepristone(RU486)調節性システム(Geneswitch;Wang Y et al.,1994,Proc.Natl.Acad.Sci.USA.,91(17):8180−4、Schillinger et al.,2005,Proc.Natl.Acad.Sci.USA.102(39):13789−94)、及びヒト化タモキシフェン−dep調節性システム(Roscilli et al.,2002,Mol.Ther.6(5):653−63)によって、中和抗体構築物の発現を制御することができる。
Technology(ARIAD Pharmaceuticals,Cambridge,Mass.)、ならびに米国特許第6,015,709号、第6,117,680号、第6,479,653号、第6,187,757号及び第6,649,595号、米国公開第2002/0173474号、米国公開第200910100535号、米国特許第5,834,266号、米国特許第7,109,317号、米国特許第7,485,441号、米国特許第5,830,462号、米国特許第5,869,337号、米国特許第5,871,753号、米国特許第6,011,018号、米国特許第6,043,082号、米国特許第6,046,047号、米国特許第6,063,625号、米国特許第6,140,120号、米国特許第6,165,787号、米国特許第6,972,193号、米国特許第6,326,166号、米国特許第7,008,780号、米国特許第6,133,456号、米国特許第6,150,527号、米国特許第6,506,379号、米国特許第6,258,823号、米国特許第6,693,189号、米国特許第6,127,521号、米国特許第6,150,137号、米国特許第6,464,974号、米国特許第6,509,152号、米国特許第6,015,709号、米国特許第6,117,680号、米国特許第6,479,653号、米国特許第6,187,757号、米国特許第6,649,595号、米国特許第6,984,635号、米国特許第7,067,526号、米国特許第7,196,192号、米国特許第6,476,200号、米国特許第6,492,106号、WO94/18347、WO96/20951、WO96/06097、WO97/31898、WO96/41865、WO98/02441、WO95/33052、WO99110508、WO99110510、WO99/36553、WO99/41258、WO01114387に記載されているシステム、ARGENT(商標)Regulated Transcription Retrovirusキット、バージョン2.0(9109102)、及びARGENT(商標)Regulated Transcription Plasmidキット、バージョン2.0(9109/02)が挙げられ、参照によりこれらの各々の全体を本明細書に援用する。Ariadシステムは、ラパマイシン及び「ラパログ」と呼ばれるその類縁体によって誘導されるように設計されている。好適なラパマイシンの例は、ARGEN
T(商標)システムの説明に関連して上に列挙した文献の中に示されている。一実施形態では、分子はラパマイシン[例えば、PfizerによってRapamune(商標)として販売されているもの]である。別の実施形態では、AP21967[ARIAD]として知られるラパログを使用する。本発明において使用することができるこれらの二量体化剤分子の例としては、限定されないが、ラパマイシン、FK506、FK1012(FK506の同種二量体)、内因性FKBP及び/またはFRAPへの親和性を低減または消去する「こぶ」を付け加える化学修飾を天然産物に対して行うことによって容易に調製されるラパマイシン類縁体(「ラパログ」)が挙げられる。ラパログの例としては、限定されないが、例えば、内因性FKBPとの相互作用を最小限に抑える意図された「こぶ」を有する、AP26113(Ariad)、AP1510(Amara,J.F.,et
al.,1997,Proc Natl Acad Sci USA,94(20):10618−23) AP22660、AP22594、AP21370、AP22594、AP23054、AP1855、AP1856、AP1701、AP1861、AP1692及びAP1889が挙げられる。さらに他のラパログ、例えばAP23573[Merck]を選択してもよい。
限因子である場合の使用によく適する。より頻繁にあるのは、導入遺伝子が大きいか、複数のサブユニットからなるか、または2つの導入遺伝子が共送達される場合に、所望の導入遺伝子(複数可)またはサブユニットを保有するrAAVを共投与して、それらを生体内で鎖状体化させ、単一のベクターゲノムを形成させることである。そのような実施形態では、第1AAVは、単一の導入遺伝子を発現する発現カセットを保有し得、第2AAVは、宿主細胞における共発現のための異なる導入遺伝子を発現する発現カセットを保有し得る。しかしながら、選択される導入遺伝子は任意の生物学的活性産物または他の産物、例えば試験のために望ましい産物をコードしてよい。
Schenborn,E.T.A Comparison of pCI−neo Vector and pcDNA4/HisMax Vector)、及びhFIXイントロンが挙げられる。本明細書において適する様々なイントロンが当技術分野で知られており、これには、限定されないが、参照により本明細書に援用されるbpg.utoledo.edu/〜afedorov/lab/eid.htmlにおいて見出されるものが含まれる。Shepelev V.,Fedorov A.Advances in the Exon−Intron Database.Briefings in Bioinformatics 2006,7:178−185も参照されたく、参照によりこれを本明細書に援用する。
ーを置き換えてもよいこと、及び他のコード配列を選択してもよいことを理解するであろう。本明細書に記載の免疫グロブリンドメイン及び/または融合タンパク質をコードするベクターゲノム及び発現カセットの例は、例えば、配列番号5、配列番号14、配列番号15、配列番号19、配列番号20、配列番号21及び配列番号31で示される。これらの例示的ベクターゲノムは、プロモーター(例えば、ニワトリベータアクチン、UBCまたはTBG)、イントロン(例えばSV40イントロンまたはキメライントロン)、5’UTR配列(例えば、c−myc)、コザック配列、ポリA(例えば、SV40、ウシ成長ホルモンまたはウサギグロビン)を含めたベクターエレメントを含むことが好適である。特定の実施形態では、IRESまたはフューリン、フューリン/F2A、または両方ともが発現カセットに含められる。他のベクターエレメントを選択してもよいことは理解されよう。
AAVウイルスベクター(例えば組換え(r)AAV)の生産に使用するためには、発現カセットは、パッケージング宿主細胞へ送達される任意の好適なベクター、例えばプラスミドに保有され得る。本発明に有用なプラスミドは、数ある中でも原核細胞、昆虫細胞、哺乳動物細胞における試験管内での複製及びパッケージングに適するように操作され得る。好適なトランスフェクション技術及びパッケージング宿主細胞は知られている、及び/または当業者によって容易に設計され得る。
れている。さらに別の代替として、選択される安定な宿主細胞は、恒常的プロモーターの制御下にある選択された構成要素(複数可)と、1つ以上の誘導性プロモーターの制御下にある他の選択された構成要素(複数可)とを含有してもよい。例えば、(恒常的プロモーター制御下のE1ヘルパー機能を含有する)293細胞に由来しながらも誘導性プロモーター制御下のrep及び/またはcapタンパク質を含有する安定な宿主細胞を生成してもよい。さらに他の安定な宿主細胞は当業者によって生み出され得る。
S7588772B2を参照されたい。そのような方法は、AAVカプシドをコードする核酸配列;機能性rep遺伝子;最低でもAAV末端逆位反復配列(ITR)と導入遺伝子とからなる発現カセット;及びAAVカプシドタンパク質内への発現カセットのパッケージングを可能にするに足るヘルパー機能を含有する宿主細胞を培養することを含む。カプシドを生成する方法、そのためのコード配列、及びrAAVウイルスベクターを生産するための方法については教示がなされている。例えば、Gao,et al,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.100(10),6081−6086(2003)及びUS2013/0045186A1を参照されたい。
virus hybrid for large−scale recombinant adeno−associated virus production,”Human Gene Therapy 20:922−929を全体的に参照されたく、参照によりこの全体を本明細書に援用する。これら及びその他のAAV産生システムを作り使用する方法は以下の米国特許に記載されており、参照によりこれらの各々の内容全体を本明細書に援用する:第5,139,941号、第5,741,683号、第6,057,152号、第6,204,059号、第6,268,213号、第6,491,907号、第6,660,514号、第6,951,753号、第7,094,604号、第7,172,893号、第7,201,898号、第7,229,823号及び第7,439,065号。
al.,Molec.Ther.(2003)7:122−128を参照されたい。変性カプシドを試験するために、方法は、処理したAAV材料を、3つのカプシドタンパク質を分離することができる任意のゲル、例えば緩衝液中3〜8%のトリス−酢酸を含有する勾配ゲルからなるSDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動に供し、その後、試料材料が分離するまでゲルを流し、ゲルをナイロン製またはニトロセルロース製、好ましくはナイロン製の膜にブロッティングすることを含む。その後、抗AAVカプシド抗体、好ましくは抗AAVカプシドモノクローナル抗体、最も好ましくはB1抗AAV−2モノクローナル抗体を、変性カプシドタンパク質に結合する一次抗体として使用する(Wobus et al.,J.Virol.(2000)74:9281−9293)。その後、一次抗体との結合を検出するための手段を含有し一次抗体に結合する二次抗体、より好まし
くは、検出分子を含有しそれと共有結合的に結合している抗IgG抗体、最も好ましくは西洋ワサビペルオキシダーゼに共有結合的に繋げられたヒツジ抗マウスIgG抗体を使用する。結合を検出する方法を用いて半定量的に一次抗体と二次抗体との結合を決定するが、検出方法は、放射性同位体放射、電磁波または比色変化を検出できることが好ましく、最も好ましくは化学発光検出キットである。例えば、SDS−PAGEのために試料はカラム画分から採取され得、還元剤(例えばDTT)を含有するSDS−PAGE装填用緩衝液中で加熱され得るが、カプシドタンパク質はプレキャスト勾配ポリアクリルアミドゲル(例えばNovex)で分離された。SilverXpress(Invitrogen,CA)を製造者の使用説明書に従って使用して銀染色を実施してもよいし、他の好適な染色方法、すなわちSYPROルビーまたはクーマシー染色剤を使用してもよい。一実施形態では、カラム画分中のAAVベクターゲノム(vg)の濃度は定量的リアルタイムPCR(Q−PCR)によって測定することができる。試料を希釈し、DNアーゼI(または別の好適なヌクレアーゼ)で消化して外来DNAを除去する。ヌクレアーゼを不活性化させた後、試料をさらに希釈し、プライマーと、プライマー間のDNA配列に特異的なTaqMan(商標)発蛍光プローブとを使用して増幅する。定義されたレベルの蛍光に達するのに必要とされるサイクル数(閾値サイクル、Ct)を各試料についてApplied Biosystems Prism 7700配列検出システムで測定する。AAVベクターが含有しているのと同一である配列を含有するプラスミドDNAを採用してQ−PCR反応の標準曲線を生成する。試料から得られたサイクル閾(Ct)値を使用して、それをプラスミド標準曲線のCt値に対して正規化することによってベクターゲノム力価を決定する。デジタルPCRに基づく終点分析法を用いることもできる。
低い温度(例えば約37℃〜約50℃)でより長い期間(例えば約20分〜約30分)にわたって、またはより高い温度(例えば約60℃以下)でより短い期間(例えば約5〜10分)にわたって実施してもよい。同様に、熱不活性化は大抵約95℃で約15分間であるが、温度を下げ(例えば約70〜約90℃)、時間を延長してもよい(例えば約20分〜約30分)。その後、試料を(例えば1000倍)希釈し、標準的アッセイにおいて記載したようなTaqMan分析に供する。定量はViroCytまたはフローサイトメトリーを用いて行うこともできる。
本明細書において提供するのは、少なくとも1つのrAAV材料(例えば、rAAVhu68材料)ならびに任意選択の担体、賦形剤及び/または保存剤を含有する組成物である。rAAV材料とは、例えば濃度及び投薬量単位についての記述において以下に記載する量などが同じである、複数のrAAVベクターを指す。
有することによって第1のベクター材料とは異なり得る。特定の実施形態では、本明細書に記載の組成物は、本明細書に記載の発現カセット、または別の抗インフルエンザ成分(例えば、抗体構築物、別の生物製剤、及び/または低分子薬)を発現する異なるベクターを含有し得る。
ーの治療的に有効なヒト投薬量は大抵、約109〜4×1014GCのAAVベクターの用量を含有する約25〜約1000マイクロリットル〜約5mLの範囲の水性懸濁液である。投薬量は、治療的利益と任意の副作用との釣り合いをとるように調節されることになり、そのような投薬量は、組換えベクターを採用する治療的用途に応じて様々であり得る。導入遺伝子の発現レベルは、ミニ遺伝子を含有するウイルスベクター、好ましくはAAVベクターをもたらす投薬頻度を決定すべく追跡され得る。場合によっては、治療目的のために記載されているものに類似する投薬計画を、本発明の組成物を使用する免疫化のために利用してもよい。
である。一実施形態では、体積は約50μLである。別の実施形態では、体積は約75μLである。別の実施形態では、体積は約100μLである。別の実施形態では、体積は約125μLである。別の実施形態では、体積は約150μLである。別の実施形態では、体積は約175μLである。さらに別の実施形態では、体積は約200μLである。別の実施形態では、体積は約225μLである。さらに別の実施形態では、体積は約250μLである。さらに別の実施形態では、体積は約275μLである。さらに別の実施形態では、体積は約300μLである。さらに別の実施形態では、体積は約325μLである。別の実施形態では、体積は約350μLである。別の実施形態では、体積は約375μLである。別の実施形態では、体積は約400μLである。別の実施形態では、体積は約450μLである。別の実施形態では、体積は約500μLである。別の実施形態では、体積は約550μLである。別の実施形態では、体積は約600μLである。別の実施形態では、体積は約650μLである。別の実施形態では、体積は約700μLである。別の実施形態では、体積は約700〜1000μLである。
H5N1;H7N7;H1N2;H9N2;H7N2;H7N3及びH10N7が挙げられる。インフルエンザAに対する広域中和抗体について教示されている。本明細書中で使用する場合、「広域中和抗体」は、複数の亜型からの複数の株を中和することができる中和抗体を指す。例えば、CR6261[The Scripps Institute/Crucell]は、1918「スペイン風邪」(SC1918/H1)を含む広範なインフルエンザウイルス、及び2004年にベトナムでニワトリからヒトへと飛躍した鳥インフルエンザのH5N1クラスのウイルス(Viet04/H5)に結合するモノクローナル抗体として記載されている。CR6261は、インフルエンザウイルス表面上の主たるタンパク質であるヘマグルチニンの膜近傍ステムの高度に保存されたヘリックス領域を認識する。この抗体は、参照により本明細書に援用するWO2010/130636に記載されている。別の中和抗体F10[XOMA Ltd]は、H1N1及びH5N1に対して有用であると教示されている(Sui,Jianhua,et al.“Structural and functional bases for broad−spectrum neutralization of avian and human influenza A viruses.”Nature structural &molecular biology 16.3(2009):265−273)。インフルエンザに対する他の抗体、例えばFab28及びFab49を選択してもよい。例えばWO2010/140114及びWO2009/115972を参照されたく、参照によりこれらを援用する。さらに他の抗体、例えば、WO2010/010466、米国公開特許公報第US/2011/076265号、及びWO2008/156763に記載されているものは容易に選択され得る。
ファイルを有する新規AAVベクターを発見した。様々なヒト及び非ヒト霊長類組織から内因性AAVを検出及び単離することを意図した高度に専門的な分子技術を用いて、新規AAVであるAAVhu68がヒト組織から単離された。このベクターは、向上した製造可能性及び多くの異なる組織種にわたって強化された形質導入を含めた好ましい表現型を発揮する。AAVhu68を候補AAVベクター血清型の好例として使用してインフルエンザ抗体発現カセットを最適化した。多重ドメインAb(MDAb)の発現のための単一のオープンリーディングフレームをコードするAAVベクターを1つだけ試験した。
以下の改変を伴ってQIAampカラム(Qiagen)を製造者の推奨に従って使用してヒト組織試料からPCR鋳型としての組織DNAを抽出した。Gao,et al[Proc Natl Acad Sci USA,2002 Sep 3,99(18):11854−11859(電子公開2002年8月21日)]によって記載されているようにQ5DNAポリメラーゼ(Q5(登録商標)Hot Start High−Fidelity 2X Master Mix,NEB)を、試料中の潜在的AAVの完全長VP1遺伝子を回収するその極めて高い忠実度及び堅牢な効率ゆえに選択し、以下のとおりに改変されたプライマー組を使用した:AV1NSの代わりにプライマーprm504[GCTGCGTCAACTGGACCAATGAGAAC、配列番号28]を使用し、逆方向プライマーAV2CASの代わりにprm505[CGCAGAGACCAAAGTTCAACTGAAACGA、配列番号29]を使用した。
GFP及びLacZなどの様々な導入遺伝子カセットを保有しているAAVhu68及びAAV9ベクターを生成及び評価した。Gao et al[Gao,Guang−Ping,et al.“Novel adeno−associated viruses from rhesus monkeys as vectors for human gene therapy.”Proceedings of the National Academy of Sciences 99.18(2002):11854−11859]によって記載されているように293細胞において三重トランスフェクション技術を用いてベクターの各々を生成した。
vp1カプシドタンパク質をコードする核酸配列を配列番号18に示す。
パッケージング効率、収率及び形質導入特性を評価するために、pAAV2/9主鎖のAAV9 VP1遺伝子の場所にAAVhu68のVP1遺伝子を搭載することによって
pAAV2/hu68トランスプラスミドを作った。pAAV2/9プラスミドは、カプシド遺伝子を挟んでAAV2の5’及び3’ITRを含有し、Penn Vector Core[University of Pennsylvania,Phila,PA
US,pennvectorcore.med.upenn.edu]から入手することができる。
10%のウシ胎仔血清を含むイーグル最小必須培地中で293細胞を5%のCO2の雰囲気下、37℃で培養及び維持した。トランスフェクションは、ベクタープラスミドをpAAV2/hu68またはpAAV2/9で置き換えてGao et al[Gao,Guang−Ping,et al.“Novel adeno−associated viruses from rhesus monkeys as vectors for human gene therapy.”Proceedings of the National Academy of Sciences 99.18(2002):11854−11859]によって記載されているように実施された。トランスフェクトした細胞をさらに6ウェルプレートで培養した。Gao et al[Gao,Guangping,et al.“Purification of recombinant adeno−associated virus vectors by column chromatography and its performance in vivo.”Human gene therapy 11.15(2000):2079−2091.]に記載されているようにポリA領域を標的とするプローブ及びプライマーを使用することによるTaqMan(Applied Biosystems)分析によってウイルス定量を行うために、細胞の全溶解物及び上清を回収した。上清の力価と全溶解物の力価との両方に関して6つのpAAV2/9プラスミド及び6つのpAAV2/hu68プラスミドの収率を6ウェルプレートで直接比較した。各プラスミドは個々の細菌コロニーから得たものであった。
1つの試験において、AAVhu68ベクターでは収率が向上した(表1)。
この試験の目的はAAV1.CB7.hJAb、AAV9.CB7.hJAb及びAAVhu68.CB7.hJAbベクターの防御有効性を評価及び比較することであったが、これらは全て、マウスに鼻腔内(IN)投与された場合にインフルエンザA(A/Puerto Rico/8/34)の予防を付与するように設計されたものであった。全ての試験において、雌のBALB/cマウス(6週齢)をJackson Laboratory(Bar Harbor,Maine)から購入し、ペンシルバニア大学のトランスレーショナル研究所の動物施設で飼育した。本明細書に記載されている動物に対する全ての手順は、ペンシルバニア大学の動物実験委員会によって承認された。
この試験の目的は、AAV1.CB7.hJAb、AAV9.CB7.hJAb及びAAVhu68.CB7.hJAbベクターの防御有効性を評価及び比較することであったが、これらは全て、マウスにIN投与する場合にインフルエンザB(B/Lee/40)の予防を付与するために設計されたものである。
この試験の目的は、様々な用量のAAVhu68.CB7.hJAbをBALB/cマウスのINに送達したときのBALFにおけるhJAb発現のレベルを評価することであった。
この試験の目的は、インフルエンザAまたはBの予防に必要とされるAAVhu68.CB7.JAb210aベクターのMEDを決定することであった。
この試験の目的は、気道に沿って並ぶ細胞からのhJAbの発現を改善すると予測されるコドン最適化体系を用いて気道上皮の細胞からのhJAbの優先的発現を実現することにより、証明されたAAV媒介によるhJAb発現の有効性をさらに改善することであった。生体内での気道におけるhJAbの発現を改善するために種々様々なコドン最適化体系を用いた。インフルエンザ攻撃試験におけるその有効性の評価に加えてベクター産物の収率も評価した。コドン最適化の結果としてAAVhu68.CB7.CI.JAb210aの収率は親AAVhu68.CB7.hJAbよりも約20%高くなった。加えて、(a)インフルエンザAまたはBのどちらかによるIN攻撃に対する防御のMEDを確立すること、(b)AAVhu68.CB7.CI.JAb210aベクターによって付与される防御の開始を評価すること、及び(c)血清中循環AAVhu68特異的NAbの存在下で効果的に再投与されるAAVhu68.CB7.CI.JAb210aベクターの能力を評価することを意図した一連の攻撃試験において、インフルエンザA及びBに対する防御についてAAVhu68.CB7.CI.JAb210aを評価した。
この試験の目的は、マウスにおけるIN送達後のAAVhu68.CB7.CI.JAb210aベクターによる、インフルエンザA(PR8)またはB(B/Lee/40)に対する有効な防御の開始を判定することであった。
この試験の目的は、AAVhu68に対する血清中循環NAbの存在にもかかわらず気道上皮の細胞に効果的に形質導入するAAVhu68.CB7.JAb210aベクターの能力を決定することであった。先に記載したように51μl中の109GC〜3×10
10GCの範囲の用量でAAVhu68.CB7.nLacZベクター(インフルエンザに無関係な導入遺伝子を発現する)をマウスのINに与えた。28日後(抗体応答のピーク時)または90日目(Nabが安定化するはずの時間)に血清をベクター処置(及び非ベクター処置)マウスの各々から単離し、血清中AAVhu68特異的NAbの力価を評価した。28日目及び90日目の群のマウスをそれらのNAb状態によって層別し、AAVhu68.CB7.CI.JAb210aベクターの投与のための3つの群の各々に分配した(図9A〜F及び図10A〜C)。群1には、109GCのAAVhu68.CB7.CI.JAb210aを投与した(図9A、28日目及び図10A、90日目)。群2には、3×109GCのAAVhu68.CB7.CI.JAb210aを投与した(図9B、28日目及び図10B、90日目)。群3には、1010GCのAAVhu68.CB7.CI.JAb210aを投与した(図9C、28日目及び図10C、90日目)。
1011GC(高)〜109GC(低)の範囲の用量のAAVhu68.hJAbベクターをBALB/cマウスのINに与え、7日後に剖検した。組織(肺、肝臓、脾臓、心臓及び脳)を生体内分布分析のために採取した。点線はアッセイのバックグラウンドのレベルを表す。
を30日後に剖検し、いくつかの組織をAAVhu68生体内分布の分析のために採取した。
AAVhu68.hJAb及びAAVhu68.JAb210aベクターは、インフルエンザA及びBの様々な株による致死的攻撃に対して生体内で見事な予防プロファイルを発揮した。マウスの鼻に塗布した場合、それは、低用量で投与したときでさえインフルエンザAまたはBの株に対する十分な防御を付与した。
nasal)装置を使用してサルの鼻に送達されたAAV9.CB7.hJAbの発現及びベクター分布プロファイルの評価
この試験は、アカゲザルの鼻への代用ベクター(AAV9)発現アカゲザルαフェトタンパク質(rhAFP;JAb210aの代用)の送達について、臨床的送達装置LMA(登録商標)MAD Nasal(商標)鼻腔内粘膜噴霧(MAD nasal)を評価することを意図したものであった。鼻腔洗浄液において導入遺伝子産物rhAFPの開始及びピーク発現レベルを評価し、剖検時にベクター生体内分布を評価した。
浄液(NLF)採取のために、小児用フォーリーカテーテルを片方の鼻孔の中に配置し、定位置に配置された時点でバルーンを空気で拡張させ、抵抗が得られるまでカテーテルを引き戻した。隔離された鼻腔の中に5ml以下のリン酸緩衝生理食塩水を輸注し、頭部を横に傾けて、鼻孔直下に配置された50mlFalconチューブ内に洗浄液を流れ込ませた。過程の最後に、遠位に配置されたカテーテルを解除して取り出し、外側を無菌PBSで浄化し、隣の鼻孔内に配置して手順を繰り返した。サルに気管内チューブを挿管して開存気道を維持し、仰臥位に保った。AAVベクターの液体送達(動物RA0065)のために、小児用フォーリーカテーテルを片方の鼻孔の中に配置し、バルーンを空気で拡張させ、抵抗が得られるまでカテーテルを引き戻した。1013GCの用量のAAVベクター(体積1mL中)を各鼻孔に添加し、そこで約5分間保持させた(合計用量2×1013GC)。
この試験は、MAD Nasal(商標)を使用してアカゲザルの鼻に送達した場合のAAVhu68.CB7.CI.JAb210a.rBGの発現プロファイルを評価することを意図したものであった。体積0.34mL中2×1013GCのAAVhu68.CB7.CI.JAb210aを鼻孔のために2等分してMAD Nasal(商標)装
置によって雄のアカゲザルに投与した。MAD nasalは、承認薬をINに投与され得る微細な霧にして噴霧する。全ての動物に対して生存能確認をSOP7404に従って毎日実施する。SOPに従って体重、体温、呼吸速度及び心拍数を追跡評価し、全時点で記録する。7、14、21、28及び35日目に鼻腔擦過検体をJAb210a発現のRT−PCRによる分析のために採取する。35日目のデータの評価の後、動物を長期にわたって追跡するかまたはベクター生体内分布について剖検するかの判断を下す。7、14、21、28、35、56及び77日目にNLF及び血液試料をJAb210a発現の分析のために採取した。77日目に採取した試料(微細ブラシを使用して鼻から採取した解離鼻腔細胞)において、JAb210aを検出することを特に意図したRT−PCRに基づくアッセイによってJAb210aの発現が確認された。
治療剤としてのモノクローナルAbの用途には、Abの正常ヒト及びアカゲザル組織に対する交差反応性の評価が必要とされる。組織交差反応性試験は、1997年2月にFDAによって公表された「Points to Consider in the Manufacture and Testing of Monoclonal Ab Products for Human Use」及び2008年12月にEMAによって公表された「Guideline on Development,Production,Characterisation and Specifications for
Monoclonal Antibodies and Related Products」(EMEA/CHMP/BWP/157653/2007)に準じた、モノクローナルAbの様々な正常ヒト及びアカゲザル組織に対する免疫組織化学的または細胞化学的検査を含む。この試験の目的は、ヒト及びアカゲザル組織の選択されたパネルによって免疫組織化学を用いてAAVhu68.CB7.CI.JAb210aの導入遺伝子産物の潜在的な交差反応性を評価することである。
この試験の目的は、老齢マウスの効果的な予防の可能性を評価すること、及び老齢(9〜18月齢)BALB/c雌マウスにIN投与された場合のAAVhu68.CB7.JAb210aベクターのインフルエンザA(A/Puerto Rico/8/34)に対する防御有効性を評価することであった。麻酔を掛けたマウスを上顎前歯で懸垂し、17μlのアリコート3つとして送達される51μlの総体積にPBSで希釈した109GCまたは3×109GCのAAVベクターをINに与えた。攻撃試験はベクター投与から7日後に起こった。麻酔を掛けたマウスを上顎前歯で懸垂し、17μlのアリコート3つとして送達される51μlのPR8(5LD50)をINに投与した。図13Aに示すように、攻撃後、マウスの体重を毎日測定した。体重減少百分率はインフルエンザ攻撃の日の体重を基準として算出した。苦痛の兆候または30%以上の体重減少を示しているマウスはどれも安楽死させた。生き残ったマウスは攻撃から21日後に屠殺した。図13Bは、PR8攻撃後の生存率をグラフ化したものである。
本明細書では、インフルエンザヘマグルチニンに対する様々なラマ単一ドメイン抗体のパネルから生み出され、インフルエンザA及びBウイルスに対するかつてない幅広さ及び力価を有して繋げられた、多重ドメイン抗体を報告した。多重ドメイン抗体は、静脈内に
投与されるかまたは組換えアデノ随伴ウイルスベクターから局所的に発現する場合、マウスにおけるインフルエンザA及びBへの感染を防御する。結果は、複数のエピトープを標的とする多重ドメイン抗体が、強化されたウイルス交差反応性及び力価を発揮し、アデノ随伴ウイルス送達と組み合わせて使用される場合にインフルエンザ及びその他の高可変性抗原への感染の防止を提供することを示す。
between Human and Ferret Antisera derived Antigenic Maps.Sci.Rep.5,15279(2015))。しかも、いくつかの研究は、インフルエンザ関連の合併症を発症するリスクが高い高齢者においてインフルエンザワクチンの有効性が著しく低下することを示している。例えば、H.Chen et al.,Avian flu:H5N1 virus outbreak in migratory waterfowl.Nature 436,191−192(2005)、M.T.Osterholm,N.S.Kelley,A.Sommer,E.A.Belongia,Efficacy and effectiveness of influenza vaccines:a systematic review and meta−analysis.Lancet Infect
Dis.12,36−44(2012)、及びW.E.Beyer et al.,Cochrane re−arranged:support for policies
to vaccinate elderly people against influenza.Vaccine 31,6030−6033(2013)を参照されたい。インフルエンザA及びBウイルスからの広範なHAに対する広域中和抗体(bnAb)は広く特性評価されてきた。例えば、A.K.Kashyap et al.,Combinatorial antibody libraries from survivors of the Turkish H5N1 avian influenza outbreak reveal virus neutralization strategies.Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.105,5986−5991(2008)、M.Throsby et al.,Heterosubtypic neutralizing monoclonal antibodies cross−protective against H5N1 and H1N1 recovered from human IgM+ memory B cells.PLoS One 3,e3942(2008)、D.Corti et al.,A neutralizing antibody selected from plasma cells that binds to group 1 and group
2 influenza A hemagglutinins.Science 333,850−856(2011)、C.Dreyfus et al.,Highly conserved protective epitopes on influenza B viruses.Science 337,1343−1348(2012)、D.C.Ekiert et al.,Antibody recognition of a highly conserved influenza virus epitope.Science 324,246−251(2009)、J.Sui et
al.,Structural and functional bases for
broad−spectrum neutralization of avian
and human influenza A viruses.Nat.Struct.Mol.Biol.16,265−273(2009)、D.C.Ekiert et
al.,A highly conserved neutralizing epitope on group 2 influenza A viruses.Science 333,843−850(2011)、R.H.Friesen et al.,A common solution to group 2 influenza virus neutralization.Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.111,445−450(2014)、P.S.Lee et al.,Heterosubtypic antibody recognition of the influenza virus hemagglutinin receptor
binding site enhanced by avidity.Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.109,17040−17045(2012)、及びA.Forsman et al.,Llama antibody fragments with cross−subtype human immunodeficiency virus type 1(HIV−1)−neutralizing properties and high affinity for HIV−1 gp120.J.Virol.82,12069−12081(2008)を参照されたい。以前にこれらのbnAbは高齢者及びその他の高リスク群における予防剤として提案されたが、そのような用途は、(i)十分な交差反応性ならびにインフルエンザA及びBの両方のウイルスに対する防御が欠如しており、これによって少なくとも2つのbnAbの投与が必要になること、ならびに(ii)インフルエンザの季節全体を通して防御のための複数回の高用量注射が必要であることによって甚だしく妨げられる。
AAVによって発現するMD3606(AAV9.MD3606)による生体内での防御を評価するために、本発明者らは、マウス適合性インフルエンザH1N1、H3N2及びBウイルスで攻撃したBALB/cマウスにおいて、抗インフルエンザ抗体(Ab)ドメインをコードするヒト化配列をコードする組換えAAV9ベクターの予防有効性を評価した(図14A〜B)。インフルエンザ攻撃の7日前にAAV9.MD3606hを4×107〜5×109ゲノムコピー(GC)の範囲のベクター用量で鼻腔内に投与した。5×109GCの投与はマウスをH1N1ウイルス(A/Puerto Rico/8/34−MA)による致死的攻撃から完璧に防護した一方、8匹中7匹のマウスは5分の1低くした用量で生存した。H3N2ウイルス(A/Hong Kong/1/68−MA)で攻撃したマウスは、5×108GC(試験した最低用量)のAAV9.MD3606h
の鼻腔内投与によって十分に防護された。最後に、インフルエンザBウイルス(B/Lee/40−MA)で攻撃したマウスは1×109GCのAAV9.MD3606hの鼻腔内投与によって完璧に防護された。
ヒト化JAbであるhJAbをハイブリッド型サイトメガロウイルス(CMV)エンハンサーニワトリβ−アクチンプロモーター(CB7)の制御下で発現するAAV9ベクターを構築し、以前に教示されているように生産した(M.P.Limberis et al.,Intranasal antibody gene transfer in
mice and ferrets elicits broad protection against pandemic influenza.Sci.Transl.Med.5,187ra72(2013))。Jackson Laboratory,Bar Harbor,Maine,USAから購入した6週齢の雌のBALB/cマウスをペンシルバニア大学のトランスレーショナル研究所の動物施設で飼育した。マウスにPBS中の100mg/kgのケタミン/10mg/kgのキシラジン混合物を腹腔内注射することによって麻酔を掛け、後肢を台の上で支えながら上顎前歯で懸垂し、17μlのアリコート3つとして送達される総体積51μlのPBS中のAAV9.hJAbベクターを鼻腔内に投与した。ベクター投与から1週間後に処置マウス及びナイーブマウスの体重を測定し、上記のとおりに麻酔を掛け、上記のとおりPBSの51μlの総体積中の攻撃ウイルス(5LD50のA/Puerto Rico/8/34−MA H1N1、5LD50のA/Hong Kong/1/68−MA H3N2、または5LD50のB/Lee/40−MA)を鼻腔内に投与した。マウスの体重を毎日測定し、疾患または苦痛の兆候がないかを監視した。苦痛の行動兆候を呈したかまたは初期体重の25%をなくした動物は安楽死させた。実験はペンシルバニア大学の動物実験委員会の指針に従って承認及び実施された。
AAVhu68.CB7.CI.JAb210a.rBGは、外部のベクター構成要素と内部のDNAゲノムとからなる。外部ベクター構成要素は、1:1:18の比でVP1とVP2とVP3との3つのAAVウイルスタンパク質の60コピーからなる血清型hu68、T=1の二十面体カプシドである。カプシドは、2つのAAV末端逆位反復配列(ITR)に挟まれたJAb210a導入遺伝子からなる一本鎖DNAゲノムを含有する。エンハンサー、プロモーター、イントロン、JAb210aコード配列及びポリアデニル化(ポリA)シグナルがJAb210a導入遺伝子を構成している。ITRは、ベクター生産中にゲノムの複製及びパッケージングを担う遺伝要素であり、rAAVを生成するのに必要とされる唯一のウイルスシスエレメントである。JAb210aコード配列の発現は、サイトメガロウイルス(CMV)即時早期エンハンサー(C4)とニワトリベータアクチンプロモーターとのハイブリッドであるCB7プロモーターによって促される。この
プロモーターからの転写はニワトリベータアクチンイントロン(CI)の存在によって増進される。ヒトJAb210a mRNA転写産物の終結を媒介するためにウサギベータグロビンポリAシグナルが含められる。AAVhu68.CB7.CI.JAb210a.rBGベクターゲノムの模式図を図15に示す。
AAVベクターゲノムプラスミドpAAV.CB7.CI.JAb210a.rBG(p3618、図16)を構築し、この大きさは7976bpである。このプラスミドから導かれるベクターゲノムは、JAb210a発現カセットを挟んでAAV2由来のITRを有する一本鎖DNAゲノムである。導入遺伝子カセットからの発現は、サイトメガロウイルス(CMV)即時早期エンハンサー(C4)とニワトリベータアクチンプロモーターとのハイブリッドであるCB7プロモーターによって促される一方、このプロモーターからの転写はニワトリベータアクチンイントロン(CI)の存在によって増進される。発現カセットのためのポリAシグナルはウサギベータグロビン(rBG)ポリAである。プラスミドは、コドン最適化、及び複数のインフルエンザ抗原を認識するMDAb様ポリペプチドに融合させたヒトIgG1 FC領域をコードする配列(GeneArt)の合成によって構築し、結果として得られた構築物を、CB7、CI及びrBG発現エレメントを含有しAAV2ITRに挟まれた発現カセットであるプラスミドpN469にクローニングして、pAAV.CB7.CI.JAb210a.rBG(p3618)を得た。プラスミドの全ての構成部分はQiagen Genomic Servicesによる直接配列決定によって検証され、Purexynでの製造プロセスの一部として確認される。
末端逆位反復配列(ITR):AAV ITR(GenBank#NC001401)は、両端が同一であるが反対向きになっている配列である。AAV及びアデノウイルスヘルパー機能がトランスで提供されるのに対し、AAV2 ITR配列はベクターDNA複製起点としてもベクターゲノムのパッケージングシグナルとしても機能する。このように、ITR配列はベクターゲノムの複製及びパッケージングに必要とされる唯一のシス配列に相当する。
AAV2/hu68ヘルパープラスミドpAAV2/hu68(ロット#:p0065;7329bp)を構築した。それは、AAV血清型hu68からの4つの野生型AAV2 repタンパク質及び3つの野生型AAV VPカプシドタンパク質をコードするAAVヘルパープラスミドである。ヒト心臓組織DNAから新規AAV配列が得られ、AAV血清型hu68と名付けた。キメラパッケージング構築物を作出するために、野生型AAV2rep及びAAV9 cap遺伝子を含有する、プラスミドpAAV2/9(p0061−2)由来のAAV2 cap遺伝子を除去し、AAVhu68 cap遺伝子プラスミドpAAV2/hu68(p0065)の断片で置き換えた(図17A)。通常はrep発現を促すものであるAAV p5プロモーターをこの構築物内でrepの5’端
部からcapの3’端部へと移動させる。この配置は、プロモーターとrep遺伝子(すなわちプラスミド主鎖)との間にスペーサーを導入すること、repの発現を下方制御すること、及びベクター産生を支援する能力を高めることのために役立つ。pAAV2/9のプラスミド主鎖はpBluescript KSからのものである。プラスミドの全ての構成部分は直接配列決定によって検証した。その後、アンピシリン耐性遺伝子をカナマイシン耐性遺伝子で置き換えてpAAV2/hu68n.KanR(p0068)を得た(図17B)。AAVhu68カプシド遺伝子の同一性は、Qiagen Genomic Servicesによって実施されるDNAプラスミド配列決定によって確認された。
プラスミドpAdDeltaF6(Kan)を構築したが、その大きさは15,774bpである。当該プラスミドは、AAV複製にとって重要なアデノウイルスゲノムの領域、すなわちE2A、E4及びVA RNA(アデノウイルスE1の機能は293細胞によって提供される)を含有するが、その他のアデノウイルス複製または構造遺伝子を含有しない。プラスミドは、複製に必須なシスエレメント、例えばアデノウイルス末端逆位反復配列を含有せず、したがって、感染性アデノウイルスは生成しないと推測される。それはAd5のE1、E3を欠失させた分子クローン(pBR322系プラスミドであるpBHG10)から得られた。欠失は、不必要なアデノウイルス遺伝子の発現を除去するため及びアデノウイルスDNAの量を32Kbから12kbに減らすためにAd5 DNA中に導入された(図18A)。最後に、アンピシリン耐性遺伝子をカナマイシン耐性遺伝子で置き換えてpAdeltaF6(Kan)を得た(図18B)。このプラスミドの中に残っているE2、E4及びVAIアデノウイルス遺伝子は、HEK293細胞内に存在するE1と共に、AAVベクター産生のために必要なものである。
細菌マスターセルバンク(BMCB)グリセロール原液は、プラスミドDNA増幅のために使用する終夜細菌培養物1Lのうちの1mLを等体積の無菌50%グリセロールと混合することによって作られる。混合物から構築物1つにつきBMCBグリセロール原液の2つの0.5mLアリコートを調製し、Nalgene冷凍用バイアルの中で−80℃で保存する。BMCBグリセロール原液の検証を行うために、増幅したプラスミドDNAを、制限酵素消化に続くゲル電気泳動を含む構造解析、及びQiagenでのサンガー配列決定による完全プラスミド配列解析に供する。プラスミドDNA製造者(Puresyn)へ出荷するための細菌ワーキングセルバンク(BWCB)グリセロール原液アリコートを調製するために、BMCBグリセロール原液からの3mLの培養物を接種し、一晩生育させる。終夜培養物1mLを使用して上記のようなBWCBグリセロール原液アリコートを調製する。新しいBWCBグリセロール原液アリコートを、終夜細菌培養物の残りの2mlから抽出したDNAに対する上記構造解析によって検証する。BWCBグリセロール原液は、プラスミドDNA製造者に受け取られた時点でプロジェクト固有の場所に−80℃で保存される。生産培養物は、凍結BWCBグリセロール原液から削り取ることによって播種される。
毒性学/生体内分布試験及び第1/2相治験のためのAAVベクターの生産に使用する全てのプラスミドは、Puresynによって彼らの特別な臨床及びIND準備プログラムを通して作られた。Puresynは、最終生成物の生産においてスーパーコイルプラスミドが中間体となる場合に組換えウイルスベクター及びその他の生成物のcGMP製造に使用されるスーパーコイルプラスミドを生産している。プロセスに使用される全ての培地は(成分製品についての各販売会社からの分析証明書に基づいて)「動物質不含」である。発酵フラスコ、容器、膜、樹脂、カラム、管類からの、プロセスに使用するあらゆる
構成要素、及びプラスミドと接触するいかなる成分も、単一のプラスミド専用のものであり、BSF不含の認証を受けている。共用される構成要素はなく、使い捨て製品を適宜使用する。PolyFlo(登録商標)樹脂、カラム及び利用する構成要素はPuresynによって専らプラスミドの製造のために使用される。特定プラスミド専用の構成要素を使用することに加えて、プラスミドを活動ベースで処理する。プラスミドの発酵、溶解及び精製は、特定プラスミドの生産専用の部屋で起こる。全ての部屋には指定のプラスミド名で印が付けられ、他のプラスミドはそれらの部屋で同時には処理されない。部屋及び装備はプラスミド生産活動ごとの合間に清掃する。各プラスミドの規格を表2に示す。さらに、生産された各プラスミドを、組換えAAVhu68.CB7.CI.JAb210a.rBGベクターの生産に使用される前に完全に配列決定する。
ヒト胚性腎臓(HEK)293細胞は元来、切断されたアデノウイルス5型DNAでHEK細胞を形質転換することによって、Frank Graham及び同僚によって生み出された(Graham FL,et al.Characteristics of a human cell line transformed by DNA from human adenovirus type 5.J Gen Virol 1977;36:59−74)。細胞は、高力価rAAV産生に必要とされるE1A及びE1B遺伝子産物を発現させる。HEK293細胞は、接着性であり、トランスフェクト能が高く、DNAプラスミドトランスフェクションによって高力価のrAAVを生む。
製造プロセスフロー図は図19A〜Bに示されており、AAVhu68.CB7.CI.JAb210a.rBGベクター生産プロセスを表す。製品調製に組み込まれる主な試薬を図の左側に示し、工程内品質評価を図の右側に描写する。各生産及び精製ステップの説明も提供されている。製品製造は直線的単位操作フローに従って行い、特に指定しない限り使い捨てのバイオ処理閉鎖系を利用する。AAVhu68.CB7.CI.JAb2
10a.rBGは、特定の生産室内で製造される唯一の製品である。細胞播種から上清採集までの細胞培養を伴う生産プロセスの全ステップは、滅菌された単回使用管類及びバッグ組立体を使用して無菌的に実施される。Corning 10層型CellSTACKs(登録商標)(CS−10)及びHYPERstack(登録商標)36層(S−36)において細胞を培養し、全ての開放型操作はクラスIIのバイオセーフティーキャビネット内でISOクラス5環境で実施する。精製プロセスは可能な場合には閉鎖系で実施するが、カラムクロマトグラフィー操作は、完全に閉鎖系であるとはみなされない。このリスクを最小限に抑えるために、単回使用流路をカラムクロマトグラフィー生産流れ基盤の一部として利用する。カラムクロマトグラフィー精製後、生成物をFFBで透析濾過する。その後、BDSを−60℃以下で冷凍する。認証済み規格に対してBDSバッチを個別に試験及び検証し、それらを解凍し、必要に応じてプールし、最終製剤用緩衝液で目標濃度に調節し、無菌濾過し、それらの充填室内で無菌Daikyo Crystal Zenith(登録商標)2mlバイアル(West Pharmaceutical Services,Inc.(登録商標))容器に充填する。無菌濾過に使用されたフィルターは、使用後にフィルターの完全性試験が行われる。充填後、AAVhu68.CB7.CI.JAb210a.rBGは発売前検査及び品質保証(QA)再調査を受ける。細胞増殖から最終充填までの生産プロセス全体は、臨床現場への公表の前に職員及びQA技術的再調査を受ける作成済みのバッチレコード書類(BRD)に載録される。
適格なHEK293細胞株を生産プロセスに使用する。ワーキングセルバンク(WCB)は、十分に特性評価されたMCBから生産された。ベクター生産に使用する細胞培養物は、1回解凍したWCBバイアルから開始し、マスターバッチレコード書類(MBR)に従って増殖させる。Corning T−フラスコ及びCS−10を使用して、細胞を5×109〜5×1010細胞にまで増殖させるが、これは、BDSロット1つあたりベクター生産のために45個までのHyperstack−36(HS−36)に播種するのに十分な細胞量を生成することを可能にする。ガンマ線照射され米国から提供される10%のウシ胎仔血清(FBS)を補充したダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)からなる培地中で細胞を培養する。細胞は固定化依存性であり、細胞解離は、動物産物を含まない細胞解離用試薬であるTrypLE(商標)Selectを使用して成し遂げられる。細胞播種は、無菌の単回使用バイオ処理バッグ及び管類のセットを使用して成し遂げられる。細胞は5%(±0.5%)CO2雰囲気下で37℃(±2℃)で維持される。
およそ3日間の増殖(DMEM培地+10%FBS)の後、HS−36細胞培養培地を新鮮な無血清DMEM培地で交換し、最適化ポリエチレンイミン(PEI)に基づくトランスフェクション方法を用いて3つの生産プラスミドをトランスフェクトする。生産プロセスに使用する全てのプラスミドは、CMO品質システムならびに、トレーサビリティ、書類管理及び材料分離を可能にする管理を利用する基本的施設との関連において生産される。BSCにおいて十分なプラスミドDNAトランスフェクション複合体を作製して(BDSバッチ1回あたり)50HS−36にトランスフェクトする。まず、シス(ベクターゲノム)プラスミド、トランス(カプシド遺伝子)プラスミド及びヘルパー(Ad)プラスミドを0.1:1:2の比で含有しGMPグレードのPEI(PEIPro、PolyPlus Transfection SA)を含有するDNA/PEI混合物を調製する。このプラスミド比は、小規模最適化試験においてAAV産生にとって最適となるように決定されたものである。十分に混合した後、溶液を室温で25分間静置し、その後、反応を停止させるために無血清培地に加え、最後にHS−36に加える。トランスフェクション混合物をHS−36の36層全てにおいて等しくし、細胞を5%(±0.5%)CO2雰囲気下で5日間37℃(±2℃)でインキュベートする。
使い捨てバイオ処理バッグを使用して培地をユニットから無菌的に排出させることによって、各HS−36からトランスフェクトした細胞及び培地を採集する。培地採集後、およそ200リットルの体積にMgCl2(ベンゾナーゼの補助因子)を2mMの終濃度になるまで補充し、ベンゾナーゼヌクレアーゼ(カタログ#:1.016797.0001、Merck Group)を25ユニット/mLの終濃度になるまで添加する。インキュベータ内で(使い捨てバイオ処理バッグに入った)産物を37℃で2時間インキュベートして、トランスフェクション手順の結果としての採集物の中に残存する細胞DNA及びプラスミドDNAの酵素的消化のために十分な時間を提供する。このステップは、最終ベクター中に残存するDNAの量を最小限に抑えるために実施される。インキュベート後、濾過及び下流でのタンジェンシャルフロー濾過の間の産物回収に役立てるためにNaClを500mMの終濃度になるまで添加する。
細胞及び細胞残屑は、蠕動ポンプによって駆動される無菌閉鎖型管類及びバッグのセットとして直列で連結されたデプスフィルターカプセル(1.2/0.22μm)を使用して産物から除去される。清澄化は、下流のフィルター及びクロマトグラフィーカラムが汚染から保護されることを保証し、生物汚染軽減濾過は、上流での生産プロセスの間に潜在的に取り込まれたいかなる生物汚染も下流での精製よりも前の一連の濾過の最後に除去されていることを保証する。採集材料はSartorius Sartoguard PESカプセルフィルター(1.2/0.22μm)(Sartorius Stedim Biotech Inc.)に通される。
清澄化した生成物の体積の低減(10分の1)は、あつらえの無菌閉鎖型バイオ処理管類、バッグ及び膜のセットを使用してタンジェンシャルフロー濾過(TFF)によって実現される。TFFの原理は、圧力下で溶液を好適な多孔度の膜(100kDa)に平行に流すことである。圧力差分は、膜孔よりも大きい分子を保持しつつ、より小さい径の分子を膜中へ、そして効果的に排液流中へと送り込む。溶液を再循環させることによって、平行流は膜表面をかっさらい、膜孔の詰まりを防止する。適切な膜孔径及び表面積を選択することによって、液体試料の体積が急速に低減され得る一方で所望の分子が保持及び濃縮され得る。TFF用途における透析濾過には、液体が膜を通り抜けて排液流へと流れるのと同じ速度で再循環している試料に新鮮な緩衝液を添加することを伴う。透析濾過の体積が増加するにつれて、ますます多くの量の小分子が再循環試料から除去される。これによって清澄化生成物は適度に精製されるだけでなく、次の親和性カラムクロマトグラフィーステップに適合する緩衝液交換も成し遂げられる。したがって、濃縮のために100kDaのPES膜を利用し、そうしてpH7.5の20mMのトリスと400mMのNaClとからなる最低4ダイア容積の緩衝液で透析濾過する。透析濾過生成物は、4℃で一晩保存され、その後、いかなる析出物質も除去すべく1.2/0.22μmデプスフィルターカプセルでさらに清澄化される。
AAVhu68血清型を効率的に捕捉するPoros TM Capture SelectTM AAV9親和性樹脂(Life Technologies)に対して透析濾過生成物を使用する。これらのイオン性条件下では、残存する細胞DNA及びタンパク質はかなりの割合でカラムを通り抜けて流れる一方、AAV粒子は効率的に捕捉される。使用後、カラムを5体積の低塩ベンゾナーゼ溶液(2500ユニット/mLのベンゾナーゼ、pH7.5の20mMのトリス、及び40mMのNaCl、1.5mMのMgCl2)で処理して、残存するいかなる宿主細胞及びプラスミド核酸も除去する。カラムを洗浄して追加給液不純物を除去し、続いて、1/10の体積の中和用緩衝液(pH10.2の
200mMのビストリスプロパン)中への回収によって速やかに中和される低pHステップ溶離(400mMのNaCl、pH2.5の20mMのクエン酸ナトリウム)を行う。
空のAAV粒子を含めた工程内不純物のさらなる低減を実現するために、Poros−AAVhu68溶離プールを50倍に希釈(20mMのビストリスプロパン、pH10.2の0.001%のプルロニックF68)してイオン強度を下げ、CIMultusTM
QAモノリスマトリックス(BIA Separations)への結合を可能にする。低塩洗浄に続いて、60カラム容積(CV)のNaCl線形塩勾配(10〜180mMのNaCl)を用いてベクター産物を溶離させる。この緩やかな塩勾配は、ベクターゲノムを含有する粒子(充満粒子)から、ベクターゲノムを有さないカプシド粒子(空の粒子)を効果的に分離し、充満カプシドが濃縮された配合物をもたらす。画分は、1/100の体積の0.1%プルロニックF68及び1/27の体積のビストリスpH6.3がそれぞれチューブとの非特異的結合及び高pHへの長い曝露を最小限に抑えるために入っている無菌ポリプロピレンチューブの中へと回収される。プールした充満粒子ピーク画分を20mMのビストリスプロパン、pH10.2の0.001%のプルロニックF68で20倍に希釈し、洗浄して準備しておいた同じカラムに対して再び使用する。10〜180mMのNaCl塩勾配を再び用い、適切な充満粒子ピーク画分を回収する。ピーク面積を評価し、おおよそのベクター収率の決定のために以前のデータと比較する。
200mMの合計塩濃度、0.001%(w/v)プルロニックF68及び5%のグリセロールを含むPBS、そして濃縮して所望の目標(すなわち4.5〜5.5×1013GC/ml)のBDS中間物質が得られる。BDS中間物質検査のために試料を抜き取る。BDS中間物質を無菌濾過(0.22μm)し、無菌ポリプロピレンチューブの中に保存し、最終充填のための取出し時まで隔離された場所に−60℃以下で冷凍する。
200mMの合計塩濃度、0.001%(w/v)プルロニックF68及び5%のグリセロールを含むPBS。その後、最終的に生成物を0.22μmフィルターに通し、無菌のDaikyo Crystal Zenithバイアル(West Pharmaceutical Services,Inc.(登録商標))に充填し、バイアル1個あたり0.5mL以上1.0mL以下の充填容積のところにかしめシール付き栓をする。個々のバイアルにラベルを付ける。ラベルを付けたバイアルは−60℃以下で保管する。投与前にFFBで希釈することを必要とする用量もあるであろう。投薬時に希釈は臨床現場の薬局によって行われる。
投薬レベルの変動性を生む可能性がある問題は、ベクター保存中及び患者への投与の間のプラスチック及びその他の固体表面への結合によるAAVベクターの逸失である。この点に関して、臨床上適する界面活性剤であるプルロニックF68は、AAVベクターの最終製剤用緩衝液に添加され、この種の逸失を最小限に抑えることが期待される。
機能的免疫系を欠くマウスの効果的な予防の可能性を評価した。成熟T細胞またはB細胞を欠くRag KOマウス(Rag1tm1Mom、Jax002216)を使用した。Rag KO雌マウス(6〜8週齢)のINに、17μlのアリコート3つとして送達される51μlの総体積にPBSで希釈した1010GCのAAVhu68.CB7.CI.JAb210a.rBGを与えた。7日後にマウスを5LD50のPR8で攻撃した
。図20は、ベクター投与から7日後に攻撃したRag KOマウスの体重の変化率(%)を示す線グラフである。x軸で表されるように、マウスの体重を毎日測定した。感染インフルエンザ攻撃の日の体重を基準として体重減少百分率を算出した。苦痛の兆候または30%以上の体重減少を示しているマウスはどれも安楽死させた。AAVhu68.CB7.CI.JAb210a.rBGを受けている全てのRag KOマウスはPR8攻撃を生き抜いた。
A.概要
この非臨床薬理学/毒性試験のために、1または2回用量のAAVhu68.CB7.CI.JAb210a.rBGまたは対照としてのビヒクル(FFB)単独の鼻腔内送達をアカゲザルに与える。ベクターは無菌の1×DPBS+0.001%プルロニックF−68で希釈する。第I相治験のための臨床用ベクター製剤は、終塩濃度200mM、0.001%(w/v)のプルロニックF68、及び5%のグリセロールを有するPBSである。ベクター投与後、非ヒト霊長類(NHP)の全体的所見を毎日監視する。週に2回、NHPの包括的臨床病態(鑑別を伴う細胞数算定、臨床化学及び凝血パネル)を追跡評価し、遺伝子移入ベクターに対する免疫反応を毎月追跡評価する[AAVhu68カプシドに対する中和抗体(NAb)、及びカプシドと導入遺伝子との両方に対する細胞傷害性Tリンパ球(CTL)応答をIFN−γ ELISPOTアッセイによって評価する]。
試験品AAVhu68.CB7.CI.JAb210a.rBGを実施例16に記載のとおりに製造する。最終生成物をFFBで希釈する。生産後、投薬の日までベクターを−60℃未満で保存する。ベクター調製は投薬の日に実施する。調製及び希釈は検証される。希釈したベクターは6時間以内の投薬まで濡れた氷の上または2〜8℃に保つ。対照動物にはベクターを含有しないビヒクル緩衝液(対照品)を投与する。これは、この試験のためのビヒクル対照としての役割を果たす。対照品は受け入れてから投薬日まで室温で保存する。投薬後、残ったベクター製剤及び対照品は−60℃未満で保持及び冷凍する。
7頭の雄及び7頭の雌のアカゲザル(3〜6歳、3〜10kg)をこの試験で使用し、AAVhu68.CB7.CI.JAb210a.rBGの2つの異なる用量を検査する。NHPのある群(群1)は、ヒトの鼻の表面積(表3)に基づいて外挿した場合に治験の最高ベクター用量に相当する0.28mL(70μLのアリコート4つとして与えられる)の総体積で1.7×1013GCのAAVhu68.CB7.CI.JAb210a.rBGを受ける。NHPの他の群(群2)は、総体積0.56mLとして与えられる(0.07mLのアリコート8つとして与えられる)4.25×1013GCのAAVhu
68.CB7.CI.JAb210a.rBGを受ける。この用量は、NHPの鼻の表面積に基づいて外挿したとき、治験の最高ベクター用量よりも2.5倍高い。
などの遊具を毎日提供する。また、動物は日常的に人間との相互作用と共に視覚エンリッチメントを受ける。SOP7408に準拠してサルに麻酔を掛ける。
Nasal(商標)を使用して0.20mLのアリコートにして与えられる。群1(1.7×1013GC)及び群2(4.25×1013GC)のために選択される用量はそれぞれ、治験のために計画される最高用量である5×1013GC、及び治験のために計画される最高用量よりも2.5倍高い用量を反映している。
施した。アカゲザルAFP(rhAFP)を含めたいくつかの導入遺伝子を利用して、AAVを鼻に直接塗布した場合のNHPの鼻腔洗浄液における発現の動態の時間表を打ち立てた。導入遺伝子発現は、早くもベクター送達後14日目に検出され、14日目から28日目までの間にそのピークに達した。その後、導入遺伝子発現は安定し、56日目から84日目までの間に減衰し始めた。本明細書に記載の目下の試験のために選択した時点は、遺伝子発現のピーク(28日目)、さらにはベクター発現のピークより後(90日目)を捉えるために選択した。これらの時点は、早い時間(28日目)及び遺伝子発現が減衰する長い期間(90日目)でのベクターの安全性及び毒性に関する重要な情報を収集することを可能にする。
パ節(腸間膜)、リンパ節(腋窩、左及び右)、骨髄(肋骨)、パイエル板(腸の切片と共に採取される);筋骨格系の骨格筋(大腿四頭筋);呼吸器系の副鼻腔、篩板、鼻中隔、咽頭、喉頭、気管、肺(4つの肺葉);神経系の脳(大脳葉[前頭葉及び後頭葉]を含む)、中脳、視神経(左及び右)、視交叉、小脳、髄質/橋、眼(左及び右、改変ダビッドソン固定液中に採取される);脊髄(頚部、胸中部、腰部)、坐骨神経(左及び右);生殖器系(雄)の精巣(左及び右、改変ダビッドソン固定液中に採取される)、精巣上体(左及び右)、前立腺;生殖器系(雌)の卵巣(左及び右)、子宮、乳腺(左及び右);泌尿器系の腎臓(左及び右)、膀胱;ならびに種々雑多な胸部入れ墨、皮膚、巨視的所見(剖検時になされ、組織病理学がふさわしくないもの(例えば、流体、排泄空気、欠けている解剖学的部分)は採取しない)を含む。
及び忍容性
A.概要
第1相治験は、次の第2相有効性評価のためにAAV2/hu68によって発現する導入遺伝子の適切な用量を決定すべく研究中である。臨床展開は、JAB210a MDAbを送達するAAV2/hu68ベクターの単回投与を評価する第1相用量漸増試験から開始され、最適用量での安全性評価のための拡張を伴う。最初の第1相試験においてベクターが、許容される安全性及びPKプロファイルを有している場合、次の第2相展開は、制御されたインフルエンザ攻撃モデルにおける安全性、PK及び予備的有効性についてのベクターの評価を含み得る。高齢者集団(65歳以上)がこの臨床製品開発計画の標的集団である。ベクターは、2つの潜在的役割を有することが予測される:流行病に対する対抗策、及び従来の季節ごとのワクチンに対する代替策。流行病対抗策としてのその用途は、インフルエンザ流行病が出現する間の備蓄または製造活動に関連するものであり得る。第1相試験は、適格なCROにて第2相有効性試験(すなわち攻撃試験)への拡張の可能性を有して米国内で開始される。健常ボランティアにおいて安全性及び予備的有効性が実証される場合、さらなる展開のために次の拡張された集団群での試験が検討される。
Nasal(商標))によって投与する。目標は、ベクターの投与から2週間後の鼻腔洗浄溶液において測定されるJAb210a MDAbの5〜20ng/mlの濃度を実現することであろう。ベクターの単回用量を4つの用量コホート(6.25×1012GC、1.25×1013GC、2.5×1013GC、または5×1013GC)のうちの1つで0日目に投与する。各投薬計画において対象を安全性及び免疫原性パラメータに関して試験180(±2)日目まで追跡評価する。
主目的は、高齢対象におけるベクターの安全性及び忍容性を、CBC、化学、検尿、鼻に限局される局所免疫応答、及び臨床所見に基づく有害事象の発生によって評価することであった。有害事象を2007年9月にFDAによって公表されたToxicity Grading Scale for Healthy Adult and Adolescent Volunteers Enrolled in Preventative Vaccine Clinical Trialsの修正版に準じて評定する。
ELISAに基づくアッセイにおいて、インフルエンザ中和活性のレベル及び持続期間
を評価すること;鼻腔洗浄液及び血清においてJAb210a MDAb発現のレベル及び持続期間を評価すること;導入遺伝子及びカプシドに対する中和抗体のレベルを評価すること;IFNγ ELISPOTアッセイによって測定したときの導入遺伝子、JAb210a MDAb及びカプシドに対する細胞性応答のレベル、ならびに鼻腔、咽頭、尿、直腸及び血液の試料におけるベクターの排出を評価することである。
予備的安全性及び忍容性を評価し、健常ボランティアにおけるベクターの薬理動態を理解し、さらなる展開のために用量レベルを選択するために、前臨床データに基づく用量レベルでの非盲検用量漸増試験を実施する。試験はコホート1つあたり対象を4名として5つ以下のコホートを参加させる。対象を処置の4〜12週間前に選考し、6ヶ月までにわたって追跡する。
各ボランティアに1回の0.8ml用量のベクターを、認可済みMAD Nasal(商標)を使用して鼻孔1つあたり0.2mlを各鼻孔内に2回連続塗布することによってINに与える。5つのコホートとして24名以下のボランティアを参加させる。コホート1〜4には漸増用量レベルのベクターを与え、最終コホート(コホート5)は最適用量レベル(コホート1〜4における安全性及び薬理動態パラメータによって定義される)で8名のボランティアに拡張する。
コホート1:用量6.25×1012GC;
コホート2:用量1.25×1013GC;
コホート3:用量2.50×1013GC;
コホート4:用量5.00×1013GC;
コホート5:最適用量レベルでの拡張コホート。
の処置関連グレード4または任意の2つのグレード3処置関連有害事象の発生として定義される。全ての有害事象は、用量漸増、コホート拡張または中止に関する判断に先立って慎重に再検討される。
診断及び主要組入れ基準は、肥満指数が19kg/m2以上30kg/m2以下であり体重が50kg以上100kg以下である65歳以上の健常な男性または女性の対象である。出産の可能性を有する女性は、試験登録前に血清妊娠試験で陰性であり避妊の効果的な方法(ホルモン剤、IUD)を用いているならば参加者として適格である。
性薬、または顕著な主要臓器毒性に関連している場合が多いと知られている他の薬物、または全身コルチコステロイド(経口または注射)(局所コルチコステロイドは許容されよう)など、免疫系に悪影響を与える可能性がある何らかの医療またはその他の治療を現在受けていること(または受けていることの履歴);試験前の年における薬物または化学物質の乱用歴;ベクター投与前30日以内に研究製品または非登録薬を受けること、または何らかの研究薬試験に現在参加している、もしくはそのような試験に後の試験期間内に参加する意図があること;ベクター投与または試験期間中に計画される投与の6ヶ月前に血液または血液製品を受けること;発熱の有無にかかわらず軽度もしくは重度の病気の存在(医療歴及び身体検査によって研究者によって判定される)、または口内で38℃より高い熱の存在として定義される、ベクター投与前72時間以内の急性疾患;妊娠及び/または授乳している女性;1:80より高い、AAV2/hu68に対する血清循環中和抗体;ならびに研究者の意見において試験の主な目的及び評価を妨害する可能性があるとされる何らかの症状である。
初期用量レベルは前臨床有効性データに基づいて選択し、非臨床安全性評価に基づいて調整し、最高用量はAAVの凝集特性によって制限する。用量は、MAD Nasal(商標)によって鼻孔1つあたり2×0.2mlとして投与される6.25×1012〜5×1013GC/用量の範囲である。目標は、ベクター投与から2週間後の鼻腔洗浄液において目標の5〜20ng/mlのJAb210a MDAbが得られることであろう。これらの用量は、全体重で調節したときサル、マウス及びフェレットに与えた用量よりもかなり低い。治験のベクターに構造が類似しているベクターまたはAAVベクターの変異型の任意の用量でこれらの種に行ったどの前臨床試験においても実質的な毒性は認められなかった。
各用量群に、鼻孔1つあたり0.4ml中のベクターをMAD Nasal(商標)によって与える。対象は一人ずつ投薬される。同じ用量群内での処置間隔は非臨床試験によって決定されよう(例えば1週間)。1つのコホート内の全ての対象が試験14日目を経過した時点で予備的安全性データを再検討する。識別される安全上の問題がない場合に次の用量への用量漸増を開始する。コホート4が終了し最高用量の予備的安全性が実証された後、5番目の最終コホートを、最大耐量または投与され得る最高用量である最適用量で合計8名の対象(追加の4名の対象)への拡張のために参加させる。最大の対象人数は24名である。
インフォームドコンセント/HIPAA、人口学的評価/医療歴、及び組入れ/除外選考を−12〜−4週目における訪問0(選考)中に行う。
主目的は、ベースラインから処置の6ヶ月後までの、有害事象の発生ならびに研究所パラメータ及びバイタルサインの変化によって定義されるベクター溶液の単回漸増用量の安全性及び忍容性である。安全性評価には、ベクター溶液投与後14日間の急性期にわたる鼻腔粘膜及び肺における反応原性評価も含まれる。
ベクター溶液の投与は、各鼻孔内への2つの連続する0.2ml用量(つまり、合計0.8mlのベクター溶液)で起こる。ベクター溶液は、Teleflex Medical(Teleflex.com)によって製造された商業化認可済みの装置を使用して投与される。装置はLMA MAD Nasal(商標)(鼻腔内粘膜噴霧装置)と呼ばれる。鼻腔粘膜にIPを送達するための最良の装置使用方法についての詳細は当該会社の手順ガイドに提供されている。基本的には対象を側臥位に配置し、装置の先端を各鼻道の開口部に(一つずつ)配置し、その後、噴霧器によってシリンジを介して流体を押し出すことによってベクター溶液を送達する。
用量漸増体系が基づく主な評価項目は安全性である。安全性の追跡評価は、臨床所見と研究所検査の結果との両方を含み、2007年9月にFDAによって公表されたToxicity Grading Scale for Healthy Adult and
Adolescent Volunteers Enrolled in Preventative Vaccine Clinical Trialsの修正に準じて評定される。唯一の改訂は臨床異常の評価に関するものであり、指針文書中では注射部位に関係する所見に焦点が当てられている。近位及び遠位呼吸器系における臨床所見に関連する基準は確立されている。
毒性を被る場合には、追加で4名の対象を同じ用量で処置する。当該追加の対象が誰も処置関連グレード3または4の毒性を被らない場合には(全体で1/8)、用量を漸増し、次のより高い用量で次の4名の対象を処置する。当該追加の対象の誰かがグレード3または4の毒性を被る場合には(全体で1/8より多い)、4名の対象を追加でより低いコホートに参加させ、問題がなければそれをMTDとみなし;処置関連グレード4毒性を被る対象がいる場合には、この用量でさらに多くの対象を参加させることをせず、グレード4毒性が起こった用量よりも低い用量を受けているコホートに追加で4名の対象を参加させてMTDを確立する。
対象またはその他の者へのリスクを伴う不測の問題は、以下の基準を全て満たす任意の出来事、経験または結末として定義される:性質、重症度または頻度が予想外であること(つまり、試験関連書面、例えば、IRB承認済みのプロトコールまたは同意書、研究者が作った冊子などに記載がない);研究への参画に関係するまたは関係する可能性があること(つまり、関係する可能性があるとは、出来事の経験または結末が、研究に含まれる手順によって引き起こされた合理的な可能性があるということを意味する);ならびに、研究が対象またはその他の者にさらに大きな危害(物理的、心理的、経済的または社会的な危害を含む)のリスクを負わせることを示唆していること。
ばならない。研究者は、試験参画を対象が中断または終了した後の何らかの時に起こっている合理的にこの試験に関係付けられ得るいかなる死亡または有害事象も、試験提供者に知らせなければならない。研究者が万一、この試験に参画した対象のがんの発症または後に身ごもった子孫の先天性異常に気付いた場合にも、スポンサーに知らせなければならない。
ホート内の8名以下の対象のために追加で4名の対象にその用量で投薬することが引き起こされる。その用量で処置関連グレード3毒性を伴う2人目の対象がいることで用量低減が引き起こされ、これに伴い、合計8名の対象を処置することを確保する必要がある場合には追加で4名の対象がいっそう低い用量で処置され、このいっそう低い用量においてグレード3毒性が2名以下でありグレード4毒性ない場合にはそれをMTDとみなす。処置関連グレード4毒性がいるとその用量での累加は中止され、もっと低い用量で追加の4名の対象の累加が引き起こされて、MTDを確立するために役立てられる。いかなる重篤な有害事象も速やかに報告され、試験処置とのその関係性が評価される。SAEが処置関連のものであると考えられる場合、それは試験の中止基準として役立つ。
図式的方法を含めた様々な記述統計学を用いて有効性評価項目を要約する。測定された連続変数について平均、標準偏差、中央値及び範囲を計算する。適宜、要約統計値のために信頼区間を生成する。仮説検定はα=0.05の両側有意性レベル(第一種過誤)を用いて行うが、実際のp値を報告する。測定された連続変数について、(例えば用量コホート間の)2群比較は概してウィルコクソンの順位和検定を採用し、ウィルコクソンの符号順位検定を肺機能パラメータのベースラインからの変化などの対データのために用いる。群間ではフィッシャーの正確検定を用い、患者の中ではマクネマー検定を用いて、カテゴリカル変数を比較する。
以下の情報は数字識別子<223>の下でフリーテキストを含んでいる配列のために提供される。
Claims (29)
- AAV末端逆位反復配列と、
免疫グロブリン領域(a)、(b)、(c)及び(d)をコードする少なくとも1つの核酸配列と
を含むベクターゲノムを中にパッケージングして有しているAAVカプシドを有する非複製性組換えアデノ随伴ウイルス(rAAV)であって、免疫グロブリン領域(a)、(b)、(c)及び(d)の各々が前記rAAVから発現するものであり、
(a)が、配列番号1のアミノ酸配列:(Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Ile Ser Ile Phe Asp Ile Tyr Ala Met Asp Trp Tyr Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gln Arg Glu Leu Val Ala Val Ser Phe Arg Asp Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys His Val Ser Leu Tyr Arg Asp Pro Leu Gly Val Ala Gly Gly Ile Gly Val Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser)を有する第1免疫グロブリン領域であり、
(b)が、配列番号2のアミノ酸配列:(Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Arg Thr Tyr Ala Met Gly Trp Phe Arg Gln Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Phe Val Ala Ala Ile Asn Ala Leu Gly Thr Arg Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Thr Ala Gln Gly Gln Trp Arg Ala Ala Pro Val Ala Val Ala Ala Glu Tyr Glu Phe Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser)を有する第2免疫グロブリン領域であり、
(c)が、配列番号3のアミノ酸配列:(Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Leu Glu Asn Lys Ala Ile Gly Trp Phe Arg Gln Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Gly Val Leu Cys Ile Ser Lys Ser Gly Ser Trp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Val Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Thr Thr Thr Ala Gly Gly Gly Leu Cys Trp Asp Gly Thr Thr Phe Ser Arg Leu Ala Ser Ser Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser)を有する第3免疫グロブリン領域であり、
(d)が、配列番号4のアミノ酸配列:(Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Thr Ser Trp Met Tyr Trp Leu Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Ser Val Ile Asn Thr Asp Gly Gly Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys Asp Trp Gly Gly Pro Glu Pro Thr Arg Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser)を有する第4免疫グロブリン領域である、前記rAAV。 - 前記第1、第2、第3及び/または第4免疫グロブリン領域が融合構築物中にあり、前記融合構築物がさらにFc領域を含み、前記融合構築物には前記4つの免疫グロブリン領域と前記Fc領域とを繋ぎ合わせる連結配列が場合によって存在している、請求項1に記載のrAAV。
- 前記融合構築物がさらに、前記免疫グロブリン領域のうちの2つ以上の間に位置する前記連結配列を含む、請求項2に記載のrAAV。
- 各連結配列が独立して選択される、請求項2または請求項3に記載のrAAV。
- 少なくとも1つの連結配列がGGGGSGGGGS(配列番号7)である、請求項2〜4のいずれかに記載のrAAV。
- 前記ベクターゲノムが、前記第1免疫グロブリンのアミノ末端にある免疫グロブリンにとって外来性である供給源からのシグナルペプチドを含む、請求項1〜5のいずれか1項に記載のrAAV。
- 前記シグナルペプチドがヒトインターロイキン−2シグナルペプチドである、請求項6に記載のrAAV。
- 前記ベクターゲノムがモノシストロン性の発現カセットを含む、請求項1〜7のいずれか1項に記載のrAAV。
- 前記ベクターゲノムがバイシストロン性の発現カセットを含む、請求項1〜7のいずれか1項に記載のrAAV。
- 前記免疫グロブリン領域のうち2つが第1Fcに連結されて第1鎖を形成しており、もう2つの免疫グロブリン領域が第2Fcに連結されて第2鎖を形成している、請求項9に記載のrAAV。
- 前記ベクターゲノムがIRESまたはF2A配列を含む、請求項9または請求項10に記載のrAAV。
- 前記ベクターゲノムが5’UTRを含む、請求項1〜11のいずれか1項に記載のrAAV。
- 前記5’UTRがヒトc−myc 5’UTRの断片である、請求項12に記載のrAAV。
- 前記ベクターゲノムが一本鎖AAV 5’末端逆位反復配列と、AAV 3’末端逆位反復配列とを含む、請求項1〜13のいずれか1項に記載のrAAV。
- 前記ベクターゲノムが、配列番号27、配列番号12または配列番号30のアミノ酸配列を有する抗インフルエンザ融合構築物をコードする、請求項1〜14のいずれか1項に記載のrAAV。
- 前記ベクターゲノムが、配列番号21、配列番号19、配列番号15、配列番号14、配列番号5、配列番号26、配列番号20、配列番号13、配列番号31及び配列番号32からなる群から選択される核酸配列を含む、請求項1〜15のいずれか1項に記載のrAAV。
- 前記rAAVがAAVhu68カプシドを有し、前記AAVhu68カプシドが、
配列番号16の1〜736の予測アミノ酸配列をコードする核酸配列からの発現によって産生されるvp1タンパク質、配列番号18から産生されるvp1タンパク質、または配列番号16の1〜736の予測アミノ酸配列をコードし配列番号18と少なくとも70%同一である核酸配列から産生されるvp1タンパク質
から選択されるAAVhu68 vp1タンパク質の異種集団、
配列番号16の少なくとも約アミノ酸138〜736の予測アミノ酸配列をコードする核酸配列からの発現によって産生されるvp2タンパク質、配列番号18の少なくともヌクレオチド412〜2211を含む配列から産生されるvp2タンパク質、または配列番号16の少なくとも約アミノ酸138〜736の予測アミノ酸配列をコードし配列番号18の少なくともヌクレオチド412〜2211と少なくとも70%同一である核酸配列から産生されるvp2タンパク質
から選択されるAAVhu68 vp2タンパク質の異種集団、
配列番号16の少なくとも約アミノ酸203〜736の予測アミノ酸配列コードする核酸配列からの発現によって産生されるvp3、配列番号18の少なくともヌクレオチド607〜2211を含む配列から産生されるvp3タンパク質、または配列番号16の少なくとも約アミノ酸203〜736の予測アミノ酸配列をコードし配列番号18の少なくともヌクレオチド607〜2211と少なくとも70%同一である核酸配列から産生されるvp3タンパク質
から選択されるAAVhu68 vp3タンパク質の異種集団
を含む、請求項1〜16のいずれか1項に記載のrAAV。 - 前記タンパク質をコードする前記核酸配列が、
配列番号18、または
配列番号16のアミノ酸配列をコードし配列番号18と少なくとも80%〜少なくとも99%同一である配列
である、請求項1〜17のいずれか1項に記載のrAAV。 - 前記配列が配列番号18と少なくとも80%〜97%同一である、請求項17または請求項18のいずれか1項に記載のrAAV。
- 前記AAVがAAV9カプシドを有し、前記AAV9カプシドが、
配列番号17のアミノ酸配列または
配列番号36によってコードされるアミノ酸配列
を有するvp1カプシドタンパク質を含む、請求項1〜16のいずれか1項に記載のrA
AV。 - 担体、希釈剤または賦形剤と、少なくとも、請求項1〜20のいずれか1項に記載の非複製性rAAVの材料とを含む、組成物。
- 前記組成物が鼻腔内投与のために製剤化される、請求項21に記載の組成物。
- 前記組成物が筋肉内または静脈内投与のために製剤化される、請求項22に記載の組成物。
- ヒト患者にインフルエンザに対するワクチン接種または免疫化を施すのに有用である、請求項1〜20のいずれか1項に記載のrAAVまたは請求項21〜23のいずれか1項に記載の組成物。
- 約109〜約7×1013GCのrAAVを患者の鼻腔内に投薬するのに適合している請求項24に記載のrAAVまたは組成物。
- インフルエンザからヒト患者を防護するための、請求項1〜20のいずれか1項に記載のrAAVまたは請求項21〜25のいずれか1項に記載の組成物の用途。
- インフルエンザに対してヒト患者を免疫化する方法であって、請求項1〜20のいずれか1項に記載のrAAVまたは請求項21〜25のいずれか1項に記載の組成物を有効量投与することを含む、前記方法。
- 前記患者が用量を鼻腔内にrAAVの約109〜約7×1013GCの量で投与される、請求項27に記載の方法。
- 請求項1〜20のいずれか1項に記載のrAAVを含む容器、任意選択の希釈剤、及び投与のための説明書を含む、製品。
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