JP2019089772A - 改変抗体及びその作製方法 - Google Patents
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Abstract
Description
治療用抗体の免疫原性を低下させるさらに別の手法はヒト化と称される技術を利用する。ヒト化という用語は、免疫応答が生じる可能性を制限するために、改変された抗体があたかもヒトによって産生された抗体のように作製されているという事実を反映している。ヒト化技術は抗体をいっそうヒト-様にするために多数の異なる手法に及ぶ。
ヒト化に付随する重要なある欠点は、ヒト化はしばしば、非ヒト化ドナー抗体によって示される結合親和性よりも生成ヒト化抗体の結合親和性に大きな低下を生じるということである。治療用抗体に対して中和抗体が産生される事例のように、このことは、当該抗体の治療的使用を顕著に損なうことになり得る。特に、結合親和性の低下はより大用量の治療用抗体の投与を必要とし、それはさらにまた投薬頻度の増加も要求し得る。これらの要因はともに治療コストの増大及び患者の不便の増加をもたらす。さらにまた対象動物へのより大量の抗体の投与は、治療用抗体に対して中和抗体が生成されるリスクの増大をもたらす。
直接的な類推により、ヒト以外の種で使用するための抗体の種特化(speciesisation)は、同様に、生成抗体の選択標的種における免疫原性を低下させる一方で、改変抗体の結合親和性を維持するフレームワーク変更を行うという必要性によって妥協される。商業的観点から、ヒト以外の種での抗体の使用は特に重要な種(例えばコンパニオンアニマル(ネコ及びイヌ)及び耐久動物(ウマ及びラクダ))で治療が有効であり得る一連の共通疾患プロセス範囲のため、又は食糧生産動物(例えば乳牛、ヒツジ、ブタ及びニワトリ)の肉質改善のために希求される。したがって、これらの種で使用するために、抗体のより単純な変換を可能にする方法は大いに希求されよう。
したがって、ドナー抗体を改変する改善方法であって、生成抗体が標的抗原に対する結合親和性の低下を示すことなく該抗体を標的対象動物に投与することができ、一方、当該抗原に対する中和抗体生成の蓋然性を低下させるためにレシピエント抗体配列の変更を最小限にする方法が希求される。したがって、CDR構造に対する影響が最小限の標的種フレームワーク構造を達成するために、最小数の変更を有する標的種配列にドナー抗体配列を変換する方法が強く希求されよう。
甚だしい努力の後で、本発明者らは驚くべきことに、標的種に投与したとき完全に又は有意に非免疫原性であるように、ドナー抗体又は前記由来の抗原結合フラグメントを改変する方法を開発した。前記標的種はドナー抗体が由来した種とは異なる種である。典型的には、対象動物に投与した後で該生成抗体に対して中和抗体は生じない。さらにまた、抗体を非免疫原性にする抗体の改変は、目的の標的に対する結合特異性又は親和性の低下をもたらさないであろう。
−標的種以外の種からドナー免疫グロブリンを同定する工程(ここで該ドナー免疫グロブリンは標的種に存在する標的エピトープに対し結合特異性を有する)、
−該ドナー免疫グロブリンの重鎖及び/又は軽鎖可変ドメインのフレームワーク領域のアミノ酸配列を決定する工程、
−該ドナー免疫グロブリンの重鎖及び/又は軽鎖可変ドメインのフレームワーク領域のアミノ酸配列の各アミノ酸残基を、該標的種由来の1つ以上の免疫グロブリンのフレームワーク領域のアミノ酸配列の対応する位置に存在するアミノ酸残基と比較して、該標的種由来の1つ以上の免疫グロブリンの少なくとも1つのフレームワーク領域のアミノ酸配列の対応する位置に存在しない、ドナー免疫グロブリンの重鎖及び/又は軽鎖可変ドメインのフレームワーク領域のアミノ酸配列内の1つ以上のアミノ酸残基を同定する工程;及び
−該ドナー免疫グロブリンの重鎖及び/又は軽鎖可変ドメインのフレームワーク領域のアミノ酸配列に存在するが、該標的種由来の1つ以上の免疫グロブリンの少なくとも1つのフレームワーク領域のアミノ酸配列の対応する位置には存在しない該1つ以上の同定アミノ酸残基を、該標的種由来の1つ以上の免疫グロブリンの少なくとも1つのフレームワーク領域のアミノ酸配列の対応する位置に存在するアミノ酸残基で置換する工程。
異なる種に由来する免疫グロブリンのフレームワーク領域のアミノ酸配列は、公に入手できる多数のデータベースから得ることができる(前記データベースは当業者には周知であろう)。例えば、国立バイオテクノロジー情報センター(NCBI)によって維持されているデータベースは、非常に多様な種に由来する抗体の免疫グロブリン配列情報を含む。さらに別のデータベースは、公に入手できる生殖細胞系列及び発現cDNA配列を含む任意のデータベースを含むことができ、さらに定期刊行物又はデータベースも含むことができ、前記は例えば、免疫グロブリン配列のKabatデータベース(URL:www.kabatdatabase.com)及びV BASE、ヒト抗体データベース(http://vbase.mrc-cpe.cam.ac.uk/)であるが、ただしこれらに限定されない。あり得る標的アミノ酸の一覧表の作成手順は当業者には日常的作業である。
本明細書で規定するように、非免疫原性免疫グロブリンは、標的種に投与されたときにそれに対して免疫応答を惹起しない免疫グロブリンである。特に、該抗体に対する(特に該フレームワーク(FW)領域由来のアミノ酸残基を含むエピトープに対する)液性(抗体媒介)応答は媒介されない。
ドナーアミノ酸と標的アミノ酸がいずれかのKabat位置で異なる場合、アミノ酸は、標的の当該位置で天然に存在することが判明しているアミノ酸から選択されねばならない。前記は可能な多数の配列につながり、それらのいずれも本発明の好ましい配列又は少なくとも適切な配列に通じ得る。ドナー免疫グロブリンのフレームワーク領域に存在するアミノ酸残基の置換が必要とされる場合、典型的には、前記置換は保存的置換の原則を用いて実施される。典型的には、保存的置換は、該アミノ酸の相同アミノ酸残基(すなわち類似の特徴又は特性を共有する残基)による入れ替えを必要とする。そのような入れ替えは相同置換として知られよう。
対応する位置に存在する標的種免疫グロブリン残基のプールに存在しないドナー免疫グロブリン由来残基を保存的に置換できるか否かを考えるとき、アミノ酸側鎖の特性の類似性にしたがい一緒にグループ分けされたアミノ酸を基にして、当該固有の位置のために標的種由来の対応残基のプールで相同アミノ酸が入手可能であるか否かを判定することが好ましいであろう(A. L. Lehninger, in Biochemistry, 2nd Ed., 73-75, Worth Publishers, New York, 1975)。例えば以下のグループを定めることができる:(1)無極性(non-polar):Ala(A)、VaI(V)、Leu(L)、Ile(I)、Pro(P)、Phe(F)、Trp(W)、Met(M);(2)非荷電極性:GIy(G)、Ser(S)、Thr(T)、Cys(C)、Tyr(Y)、Asn(N)、Gln(Q);(3)酸性:Asp(D)、GIu(E);及び(4)塩基性:Lys(K)、Arg(R)、His(H)。したがって、あるアミノ酸残基を同じグループに存在する別のもので置換することが好ましい。
或いはまた、アミノ酸残基は、共通の側鎖特性を基準にしてグループに分けることができる:(1)疎水性:Met(M)、Ala(A)、VaI(V)、Leu(L)、Ile(I);(2)中性親水性:Cys(C)、Ser(S)、Thr(T)、Asn(N)、Gln(Q);(3)酸性:Asp(D)、Glu(E);(4)塩基性:His(H)、Lys(K)、Arg(R);(5)鎖の方向性に影響する残基:Gly(G)、Pro(P);及び(6)芳香族性:Trp(W)、Tyr(Y)、Phe(F)。繰り返せば、あるアミノ酸残基を同じグループに存在する別のもので置換することが好ましいであろう。
したがって、保存的置換は、これらのクラスの1つのあるメンバーの当該同じクラスの別のメンバーのための交換(置換)を伴うであろう。ある種の実施態様では、ドナー免疫グロブリンフレームワーク領域の配列に導入されるアミノ酸残基は、標的種由来免疫グロブリンプールの当該固有の位置で明示されたコンセンサスアミノ酸である。コンセンサスアミノ酸は、該プールを構成する標的種免疫グロブリン集合物を含む免疫グロブリンの当該位置でもっとも一般的に見出されるアミノ酸である。
ある種の実施態様では、本方法はさらに、ドナー免疫グロブリンの重鎖及び/又は軽鎖の定常ドメインの少なくとも1つ、好ましくは全部を、標的種由来の免疫グロブリンに由来する同等の重鎖及び/又は軽鎖で入れ替える工程を含む。ある種の実施態様では、標的種由来定常ドメインは、免疫グロブリンG(IgG)抗体サブタイプである。
ある種の実施態様では、フレームワーク領域のアミノ酸残基評価に用いられるドナー免疫グロブリンのアミノ酸配列プールは、標的種由来の(例えばカッパ又はラムダ軽鎖由来の)免疫グロブリンサブタイプに限定することができる。
ある種の実施態様では、標的種は哺乳動物の標的種である。ある実施態様では、標的哺乳動物種は、動物、特にコンパニオンアニマル(例えばイヌ、ネコ又はウマであるが、ただしこれらに限定されない)又は家畜動物である。さらに別の実施態様では、哺乳動物標的種はヒトである。
ある種の実施態様では、標的エピトープは神経成長因子(NGF)又は腫瘍壊死因子(TNF)である。
本発明のさらにまた別の特徴は、本明細書に規定の任意の方法にしたがって製造された免疫グロブリン又はその抗原結合フラグメントの疾患治療又は予防のための対象動物(特に哺乳動物対象)への投与に関する。
多様なさらに別の特徴では、本発明は、治療用免疫グロブリンを特定の種に投与したときに非免疫原性にするために前記を改変することに及ぶ。前記改変は、キメラ抗体、CDR移植技術によって製造された抗体、又はヒト化抗体に適用できる。
さらに別の特徴では、本発明はしたがって、治療用免疫グロブリンを改変して前記を非免疫原性にする方法を提供し、前記方法は以下の工程を含む:
−治療用ドナー免疫グロブリンを提供する工程、
−該ドナー免疫グロブリンの軽鎖及び/又は重鎖の可変ドメインの少なくとも1つのフレームワーク領域のアミノ酸配列を決定する工程、
−該免疫グロブリンが投与される標的種に由来する免疫グロブリンの軽鎖及び/又は重鎖の可変ドメインの少なくとも1つのフレームワーク領域に関係するアミノ酸配列プールを入手する工程、
−ドナー免疫グロブリンの軽鎖及び/又は重鎖の少なくとも1つのフレームワーク領域のアミノ酸配列のアミノ酸残基を、該アミノ酸配列プール中の同じKabat番号を有するアミノ酸残基と比較する工程、及び
−ドナー免疫グロブリンの軽鎖及び/又は重鎖の少なくとも1つのフレームワーク領域のアミノ酸配列の任意のアミノ酸残基を、該アミノ酸配列プール中の同じKabat番号を有するアミノ酸残基で置換する工程であって、ここでドナー免疫グロブリンの軽鎖及び/又は重鎖の少なくとも1つのフレームワーク領域のアミノ酸配列に存在するアミノ酸残基が該アミノ酸配列プール中の同じKabat番号を有するアミノ酸残基と相違する、前記工程。
ある種の実施態様では、生成PET化抗体又はその結合フラグメントは、1x10-8以下の結合親和性KDで所望の標的エピトープと結合する。
本発明のさらにまた別の特徴は、免疫グロブリン重鎖及び/又は軽鎖可変ドメインで使用するために少なくとも1つのフレームワーク領域を提供することに及ぶ。本発明のこの特徴の方法は、あるプロセス(例えば抗体のヒト化)で、又はヒト以外の種に投与する前にある抗体を改変して脱免疫するために用いられる同等なプロセスで特に有用であり得る。本発明のこの特徴によって提供されるフレームワーク領域は、ヒト化又は同様な種特化プロセスをまさに実施しようとしている抗体に導入するか、或いは以前に種特化を実施した抗体に後から導入することができる。具体的には、該改変フレームワーク領域は、あるプロセス(例えばCDR移植)のために改変を実施したか又はまさに実施しようとしている抗体に、或いはキメラ抗体(ここで抗体のFab領域は第一の種に由来し、該抗体のFc領域は第二の種に由来する)である抗体に導入することができる。
−ドナー免疫グロブリンの少なくとも1つのフレームワーク領域配列のアミノ酸配列を決定する工程、
−該ドナー免疫グロブリンの少なくとも1つのフレームワーク領域の各位置の固有のアミノ酸残基を、改変された供給源免疫グロブリンが投与される種に由来する抗体で見出されるフレームワーク領域配列の対応するアミノ酸の位置で見出されるアミノ酸残基のプールを含むデータベースと一残基ずつ比較する工程、
−ドナー免疫グロブリンの少なくとも1つのフレームワーク領域の固有の位置に存在するが、対応するアミノ酸の位置で見出されるアミノ酸残基のプールには存在しない任意のアミノ酸残基を、対応するアミノ酸の位置に見出されるアミノ酸残基のプールに存在するアミノ酸残基で置換する工程、及び
−ドナー免疫グロブリンの少なくとも1つのフレームワーク領域の固有の位置に存在し、さらにまた対応するアミノ酸の位置に見出されるアミノ酸残基のプールにも存在するアミノ酸残基はいずれも変更しないで放置する工程。
ある種の実施態様では、本方法は改変抗体を製造する方法に及び、前記方法は、改変フレームワーク領域配列を相補性決定領域(CDR)及び重鎖及び/又は軽鎖定常ドメインと一緒に発現させ、それによって前記改変フレームワーク領域配列を含むヘテロテトラマー抗体を製造する工程を含む。
本発明のある種のさらに別の特徴は、改変フレームワーク領域配列のアミノ酸配列を発現するオリゴヌクレオチドの提供及び宿主細胞での前記の発現に及ぶ。
本発明のさらにまた別の特徴は、非免疫原性フレームワーク領域配列を有する治療用抗体を製造する方法に関し、前記方法は以下の工程を含む:
−フレームワーク領域のアミノ酸配列を、治療用抗体が投与される種に由来する複数の免疫グロブリンの対応するアミノ酸の位置に存在する対応アミノ酸残基のプールと比較して固有の位置で相違する1つ以上のアミノ酸残基を同定することによって、置換されるべきフレームワーク領域のアミノ酸残基を同定する工程、及び
−1つ以上の該同定アミノ酸残基を、対応するアミノ酸残基のプールに存在するアミノ酸残基で置換する工程。
置換される(又は置換可能な)アミノ酸残基は、変種寛容位置として知られ得る位置に存在する。すなわち、別の残基のための当該残基の置換は、フレームワーク領域間に介在する相補性決定領域の結合特異性を変化させない。そのような置換は、1つの種のフレームワーク領域の特定の位置に存在するある残基は第二の種のフレームワーク領域配列の対応する位置には存在しないことがあるという事実のために必要であると考えられる。したがって、該アミノ酸は、当該アミノ酸残基がフレームワーク領域配列の当該位置に通常は存在しない種の免疫系によって異質とみなされるエピトープを形成するために、免疫誘導応答を前記に対して引き起こし得る。相同残基又は標的種に存在するコンセンサス残基で当該外部残基を置換する本方法論を用いることによって、潜在的に異質なエピトープを変化させ、異質と認識されないエピトープを形成することができる。したがって、抗体のフレームワーク領域からそのようなエピトープを全て除去することによって、該抗体が最初に得られた種とは異なる種である対象動物に投与したとき、該抗体の当該部分に対して液性応答が生じるのを防ぐことができる。
本発明者らはさらに、相補性決定領域(CDR)と結合して非免疫原性PET化重鎖及び軽鎖可変ドメインを形成することができる一連のフレームワーク領域(FR)を規定した。重鎖及び軽鎖ドメインの各々は4つのフレームワーク領域を有し、前記はFR1、FR2、FR3及びFR4と称される。この方法論を利用して、任意の抗体(免疫グロブリン)を脱免疫し所望の種に投与することができる。しかしながら単に実例を示すために、下記の例では、ヒト系、イヌ系、ネコ系及びウマ系抗体のそのようなフレームワーク領域の製造及び使用が例示されるであろう。
抗体分子は、CDR1、CDR2及びCDR3領域並びに付随する介在フレームワーク領域を含む重鎖可変ドメインを含むことができる。重鎖可変ドメイン(VH)のCDRはVHCDRとして知られ、これらのCDRはKabat番号付与系にしたがえば以下の位置に見出される:VHCDR1−Kabat残基31−35、VHCDR2−Kabat残基50−65、VHCDR3−Kabat残基95−102(Kabat EA et al. 1991 Sequences of proteins of immunological interest, 5th edition. Bethesda: US Department of Health and Human Services)。
さらにまた、抗体はさらにCDR1、CDR2及びCDR3領域並びに付随する介在フレームワーク領域を含む軽鎖可変ドメインを含む。軽鎖可変ドメイン(VL)のCDRはVLCDRとして知られ、これらのCDRはKabatの番号付与系にしたがえば以下のアミノ酸残基位置で見出される:VLCDR1−Kabat残基24−34、VLCDR2−Kabat残基50−56、VLCDR3−Kabat残基89−97。
軽鎖又は重鎖可変ドメインは、以下の構成でCDRが介在する4つのフレームワーク領域、FR1、FR2、FR3及びFR4を含む:FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4。
−ドナー免疫グロブリンに由来する相補性決定領域(CDR)(ここで該ドナー免疫グロブリンは標的種に存在するリガンドと特異的に結合する)、及び
−ドナー免疫グロブリンに由来するフレームワーク領域(ここで標的種の任意の免疫グロブリンの対応する位置にもまた存在しないいずれのアミノ酸も、標的種の対応する位置で見出されるアミノ酸で置換される)。
典型的には、アミノ酸置換は抗体のCDR領域に対しては実施されない。さらにまた、ある種の実施態様では、フレームワーク領域は、標的種由来の残基で置換された、7つを超えない連続アミノ酸残基を含む。さらにまた、ある種の実施態様では、フレームワーク領域は、標的種由来の残基で置換された、5つを超えない連続アミノ酸残基を含む。さらにまた、ある種の実施態様では、フレームワーク領域は、標的種由来の残基で置換された、3つを超えない連続アミノ酸残基を含む。
さらにまた、ある種の実施態様では、ドナー免疫グロブリンフレームワーク領域(重鎖FR1、FR2、FR3及びFR4並びに軽鎖FR1、FR2、FR3及びFR4)の10アミノ酸を超えない残基が、標的種由来の残基で置換される。さらにまた、ある種の実施態様では、ドナー免疫グロブリンフレームワーク領域(重鎖FR1、FR2、FR3及びFR4並びに軽鎖FR1、FR2、FR3及びFR4)の7アミノ酸を超えない残基が、標的種由来の残基で置換される。さらにまた、ある種の実施態様では、ドナー免疫グロブリンフレームワーク領域(重鎖FR1、FR2、FR3及びFR4並びに軽鎖FR1、FR2、FR3及びFR4)の5アミノ酸を超えない残基が、標的種由来の残基で置換される。
したがって、免疫グロブリンが標的種としてイヌに投与される実施態様では、該免疫グロブリンは、イヌの1つの抗体又は複数抗体に由来する定常ドメイン領域を含み、さらにドナー免疫グロブリンフレームワーク領域における置換残基は、対応するイヌフレームワーク領域のアミノ酸残基に由来する。
免疫グロブリンが標的種としてネコに投与される実施態様では、該免疫グロブリンは、ネコの1つの抗体又は複数抗体に由来する定常ドメイン領域を含み、さらにドナー免疫グロブリンフレームワーク領域における置換残基は、対応するネコフレームワーク領域のアミノ酸残基に由来する。
免疫グロブリンが標的種としてウマに投与される実施態様では、該免疫グロブリンは、ウマの1つの抗体又は複数抗体に由来する定常ドメイン領域を含み、さらにドナー免疫グロブリンフレームワーク領域における置換残基は、対応するウマフレームワーク領域のアミノ酸残基に由来する。
免疫グロブリンが標的種としてヒトに投与される実施態様では、該免疫グロブリンは、ヒトの1つの抗体又は複数抗体に由来する定常ドメイン領域を含み、さらにドナー免疫グロブリンフレームワーク領域における置換残基は、対応するヒトフレームワーク領域のアミノ酸残基に由来する。
本発明のさらにまた別の特徴は、疾患の治療又は予防のために、本発明の前述の特徴の免疫グロブリン又はその抗原結合フラグメントを対象動物(特に哺乳動物対象)へ投与することに関する。
本発明のさらにまた別の特徴は、以下の工程を含む免疫グロブリンの製造方法を提供する:
−重鎖及び軽鎖をコードするヌクレオチドを細胞に導入する工程(ここで該ヌクレオチドは、本明細書に規定の方法にしたがって製造されたフレームワーク領域を含む軽鎖及び重鎖可変ドメインをコードする)、及び
−該ヌクレオチドを細胞で発現させ、該免疫グロブリンを製造する工程。
(1)ドナー免疫グロブリンの重鎖及び/又は軽鎖フレームワーク領域の配列を、標的種の免疫グロブリン重鎖及び/又は軽鎖フレームワーク領域配列の集合物と比較する工程、(2)ドナー免疫グロブリンのフレームワーク領域配列の固有の位置に存在するが、標的種の免疫グロブリンフレームワーク領域配列集合物の対応する位置には存在しないいずれのアミノ酸残基も、標的種免疫グロブリンフレームワーク領域配列の集合物の対応する位置に存在するアミノ酸残基で置換する工程、
(3)ドナー免疫グロブリン可変領域由来CDR及び該置換フレームワーク領域を含む重鎖及び/又は軽鎖可変領域を、種に適切な重鎖及び/又は軽鎖定常ドメインと一緒にコードするDNAセグメントを合成する工程、
(4)該DNAセグメントを細胞に導入する工程、及び
(5)該細胞で該DNAセグメントを発現させて該免疫グロブリンを製造する工程。
ある種の実施態様では、本方法はさらに、ドナー免疫グロブリンの軽鎖及び重鎖可変領域の配列を決定する工程を含む。ある種の実施態様では、本発明はさらに該免疫グロブリンを精製する工程を含む。
ある種の実施態様では、本発明はさらに、医薬的に許容できる担体又は希釈剤中で該免疫グロブリンを処方する工程を含む。
該抗体は本発明の方法を用いて調製できる。
ある種の実施態様では、該軽鎖は、配列番号:25のアミノ酸配列又は前記配列に対して少なくとも85%、90%、95%又は99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、前記配列から成るか又は本質的に前記配列から成る。ある種の実施態様では、前記同一性は、少なくとも約15アミノ酸、好ましくは約20アミノ酸、より好ましくは約25アミノ酸の長さに及ぶ。
ある種の実施態様では、該重鎖は、配列番号:24のアミノ酸配列又は前記配列に対して少なくとも85%、90%、95%又は99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、前記配列から成るか又は本質的に前記配列から成る。ある種の実施態様では、前記同一性は、少なくとも約15アミノ酸、好ましくは約20アミノ酸、より好ましくは約25アミノ酸の長さに及ぶ。
したがって、ヒト神経成長因子(NGF)と特異的に結合することができる中和抗体又はその抗原結合フラグメントがまた提供され、ここで該抗体又はその抗原結合フラグメントは、
配列番号:60のアミノ酸配列から成るか又は前記配列を含むFR1フレームワーク領域、
配列番号:61のアミノ酸配列から成るか又は前記配列を含むFR2フレームワーク領域、
配列番号:62のアミノ酸配列から成るか又は前記配列を含むFR3フレームワーク領域及び配列番号:63のアミノ酸配列から成るか又は前記配列を含むFR4フレームワーク領域
の少なくとも1つを含む軽鎖可変領域、及び/又は
配列番号:64のアミノ酸配列から成るか又は前記配列を含むFR1フレームワーク領域、
配列番号:65のアミノ酸配列から成るか又は前記配列を含むFR2フレームワーク領域、
配列番号:66のアミノ酸配列から成るか又は前記配列を含むFR3フレームワーク領域及び配列番号:67のアミノ酸配列から成るか又は前記配列を含むFR4フレームワーク領域
の少なくとも1つを含む重鎖可変領域を含む。
ある種の実施態様では、該軽鎖は軽鎖FR1、FR2、FR3及びFR4の全てを含み、及び/又は該重鎖は重鎖FR1、FR2、FR3及びFR4の全てを含む。
ある種の実施態様では、本発明の上記の特徴の抗体又は結合フラグメントは、p75又はTrkAヒトNGFレセプターと結合するヒトNGFの能力を阻害する。
好ましくは、本発明の上記の特徴の抗体又は結合フラグメントはヒトで免疫原性ではない。
典型的には、本発明の上記の特徴の抗体は、ヒト由来の免疫グロブリンに由来する軽鎖及び/又は重鎖定常ドメインを含む。
ある種の実施態様では、本発明の上記の特徴の結合フラグメントは、単鎖Fv(scFv)抗体フラグメント、Fab抗体フラグメント、Fab'抗体フラグメント及びF(ab')2抗体フラグメントから成る群から選択される。
多様なさらに別の特徴では、本発明は、本発明の抗体又は抗原結合フラグメントをコードする単離核酸に及ぶ。
したがって、さらにまた別の特徴は、本発明の前述の特徴のいずれかに記載の抗体又は抗原結合フラグメントをコードする単離核酸を提供する。
ある種の実施態様では、該ポリヌクレオチドは、配列番号:13のアミノ酸配列又は前記配列に対して少なくとも85%、90%、95%又は99%の同一性を有するアミノ酸配列を有する、抗NGF抗体又は抗原結合フラグメントの軽鎖可変ドメインをコードする。
また提供されるものは、配列番号:25のアミノ酸配列又は前記配列に対して少なくとも85%、90%、95%又は99%の同一性を有するアミノ酸配列を有する、抗NGF抗体又は抗原結合フラグメントの軽鎖をコードする単離核酸である。
また提供されるものは、配列番号:24のアミノ酸配列又は前記配列に対して少なくとも85%、90%、95%又は99%の同一性を有するアミノ酸配列を有する、抗NGF抗体又は抗原結合フラグメントの重鎖をコードする単離核酸である。
ある種の実施態様では、該単離核酸はさらに、作動できるように該単離核酸と連結された1つ以上の調節配列をコードする核酸を含む。
さらに別の特徴では、本発明の重鎖及び/又は軽鎖可変ドメイン又は重鎖及び/又は軽鎖をコードするポリヌクレオチドを含む発現ベクターが提供される。ある種の実施態様では、該発現ベクターはさらに1つ以上の調節配列を含む。ある種の実施態様では、該ベクターはプラスミド又はレトロウイルスベクターである。
本発明のさらにまた別の特徴はヒト化NGF中和抗体を製造する方法を提供し、該方法は、本発明の前述の特徴の宿主細胞を培養し該細胞にヒト化NGF中和抗体を発現させる工程を含む。
本発明のさらにまた別の特徴は本発明のNGF中和抗体を製造する方法を提供し、該方法は、本発明の抗体の軽鎖及び/又は重鎖を発現する、本発明の前述の特徴のポリヌクレオチド/核酸又はベクターの1つ以上を適切な宿主細胞で発現させる工程、該発現ポリペプチド(1つの宿主細胞で一緒に発現されてもよく、異なる宿主細胞で別々に発現されてもよい)を回収する工程、及び抗体を単離する工程を含む。
ある種の実施態様では、本発明の抗体又は結合フラグメント及び少なくとも1つの医薬的に許容できる希釈剤又は担体が提供される。
本発明のさらにまた別の特徴は、疾患(例えば関節炎)の治療若しくは予防用医薬、又は痛み(例えば疾患に付随する痛み(例えば神経障害痛、術後痛、慢性痛、腫瘍学的痛など))の治療、予防若しくは緩和用医薬の調製における、本発明の上記特徴の抗体若しくは結合フラグメント、核酸、医薬組成物又は発現ベクターの使用を提供する。多様なさらに別の特徴では、本発明は、治療及び診断方法における、本発明の上記特徴の抗体又は結合フラグメントの使用に及ぶ。
ある種の実施態様では、該疾患は、神経成長因子(NGF)に対する感受性の増加によって引き起こされるか、前記感受性の増加に付随するか、又は前記感受性の増加をもたらす症状である。ある種の実施態様では、該疾患はNGFによって増殖が誘発される腫瘍(例えば骨肉腫)に関する。
ある種の実施態様では、本発明の前述の方法はさらに、本発明の抗NGF抗体の有効性を強化又は補完することができる少なくとも1つのさらに別の薬剤を共投与する工程を含む。例えば、該抗体又はその抗原結合フラグメントは、少なくとも1つの鎮痛剤、NASAID、オピオイド、コルチコステロイド、ステロイド、ヒアルロナン又はヒアルロン酸と一緒に共投与できる。
さらにまた別の特徴では、本発明の抗ヒトNGF中和モノクローナル抗体又はそのフラグメントを産生する細胞株又はその派生若しくは子孫細胞が提供される。
本発明のさらにまた別の特徴は、ヒトの痛みの治療用、又は痛みに付随する症状の治療用、又は変形性関節症、慢性関節リウマチ及び炎症に付随する痛みの治療、緩和若しくは阻止用キットを提供し、該キットは、本発明の前述の特徴のいずれかに記載の抗NGF抗体及び前記の使用のための指示を含む。
本発明のさらにまた別の特徴は、液体中の抗ヒトNGFモノクローナル抗体のin vitro、ex vivo及びin vivoでの検出用キットであって、前記抗体の濃度の決定で使用されるものを提供する。該キットは、本発明の抗体のいずれか又はその結合フラグメントを含むことができる。該キットは前記を使用するための指示を含むことができる。
該抗体は本発明の方法を用いて調製できる。典型的には、本発明の上記特徴の抗体は、イヌ由来免疫グロブリンに由来する軽鎖及び/又は重鎖定常ドメインを含む。ある種の実施態様では、該重鎖は、配列番号:18、19、20若しくは21のアミノ酸配列又は前記配列に対して少なくとも85%、90%、95%又は99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、前記配列から成るか又は本質的に前記配列から成る。ある種の実施態様では、前記同一性は、少なくとも約15アミノ酸、好ましくは約20アミノ酸、より好ましくは約25アミノ酸の長さに及ぶ。
ある種の実施態様では、本発明の上記の特徴の結合フラグメントは、単鎖Fv(scFv)抗体フラグメント、Fab抗体フラグメント、Fab'抗体フラグメント及びF(ab')2抗体フラグメントから成る群から選択される。
多様なさらに別の特徴では、本発明は、本発明の抗体又は抗原結合フラグメントをコードする単離核酸に及ぶ。
したがって、さらにまた別の特徴は、本発明の前述の特徴のいずれかに記載の抗体又は抗原結合フラグメントをコードする単離核酸を提供する。
ある種の実施態様では、該ポリヌクレオチドは、配列番号:71のアミノ酸配列又は前記に対して少なくとも85%、90%、95%又は99%の同一性を有するアミノ酸配列を有する、抗TNF抗体又は抗原結合フラグメントの軽鎖可変ドメインをコードする。
ある種の実施態様では、該単離核酸はさらに、作動できるように該単離核酸と連結された1つ以上の調節配列をコードする核酸を含む。さらに別の特徴では、本発明の重鎖及び/又は軽鎖可変ドメイン又は重鎖及び/又は軽鎖をコードするポリヌクレオチドを含む発現ベクターが提供される。ある種の実施態様では、該発現ベクターはさらに1つ以上の調節配列を含む。ある種の実施態様では、該ベクターはプラスミド又はレトロウイルスベクターである。さらにまた別の特徴は、本発明の前述の特徴の発現ベクターを含む宿主細胞を提供する。本発明のさらに別の特徴は、本発明の前述の特徴のいずれかの抗体を製造する宿主細胞を提供する。
本発明のさらにまた別の特徴は本発明のTNF中和抗体を製造する方法を提供し、該方法は、本発明の抗体の軽鎖及び/又は重鎖を発現する、本発明の前述の特徴のポリヌクレオチド/核酸又はベクターの1つ以上を適切な宿主細胞で発現させる工程、該発現ポリペプチド(1つの宿主細胞で一緒に発現されるか、又は異なる宿主細胞で別々に発現され得る)を回収する工程、及び抗体を単離する工程を含む。
ある種の実施態様では、本発明の抗体又は結合フラグメント及び少なくとも1つの医薬的に許容できる希釈剤又は担体が提供される。
本発明のさらにまた別の特徴は、疾患、特にイヌTNFの発現増加又はイヌのTNF感受性増加によって引き起こされるか、前記に付随するか、又は前記をもたらす任意の症状の治療又は予防用医薬の調製における、本発明の上記特徴の抗体若しくは結合フラグメント、核酸、医薬組成物又は発現ベクターの使用を提供する。多様なさらに別の特徴では、本発明は、治療及び診断方法における、本発明の上記特徴の抗体又は結合フラグメントの使用に及ぶ。
本発明のさらにまた別の特徴は、疾患の治療若しくは予防のために、本発明の上記特徴の抗体若しくは結合フラグメント、核酸、医薬組成物又は発現ベクターをイヌに投与することに関する。
さらにまた別の特徴では、本発明の抗イヌTNF中和モノクローナル抗体又はそのフラグメントを産生する細胞株又はその派生若しくは子孫細胞が提供される。
該抗体は本発明の方法を用いて調製できる。
ある種の実施態様では、該軽鎖は、配列番号:7のアミノ酸配列又は前記配列に対して少なくとも85%、90%、95%又は99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、前記配列から成るか又は本質的に前記配列から成る。ある種の実施態様では、前記同一性は、少なくとも約15アミノ酸、好ましくは約20アミノ酸、より好ましくは約25アミノ酸の長さに及ぶ。
ある種の実施態様では、該重鎖は、配列番号:70のアミノ酸配列又は前記配列に対して少なくとも85%、90%、95%又は99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、前記配列から成るか又は本質的に前記配列から成る。ある種の実施態様では、前記同一性は、少なくとも約15アミノ酸、好ましくは約20アミノ酸、より好ましくは約25アミノ酸の長さに及ぶ。
好ましくは、本発明の上記特徴の抗体又は結合フラグメントはイヌにおいて免疫原性ではない。
典型的には、本発明の上記特徴の抗体は、イヌ由来の免疫グロブリンに由来する軽鎖及び/又は重鎖定常ドメインを含む。
ある種の実施態様では、本発明の上記特徴の結合フラグメントは、単鎖Fv(scFv)抗体フラグメント、Fab抗体フラグメント、Fab'抗体フラグメント及びF(ab')2抗体フラグメントから成る群から選択される。
多様なさらに別の特徴では、本発明は、本発明の抗体又は抗原結合フラグメントをコードする単離核酸に及ぶ。
したがって、さらにまた別の特徴は、本発明の前述の特徴のいずれかに記載の抗体又は抗原結合フラグメントをコードする単離核酸を提供する。
ある種の実施態様では、該ポリヌクレオチドは、配列番号:1のアミノ酸配列又は前記配列に対して少なくとも85%、90%、95%又は99%の同一性を有するアミノ酸配列を有する、抗NGF抗体又は抗原結合フラグメントの軽鎖可変ドメインをコードする。
また提供されるものは、配列番号:7のアミノ酸配列又は前記配列に対して少なくとも85%、90%、95%又は99%の同一性を有するアミノ酸配列を有する、抗NGF抗体又は抗原結合フラグメントの軽鎖をコードする単離核酸である。
また提供されるものは、配列番号:70のアミノ酸配列又は前記配列に対して少なくとも85%、90%、95%又は99%の同一性を有するアミノ酸配列を有する、抗NGF抗体又は抗原結合フラグメントの重鎖をコードする単離核酸である。
ある種の実施態様では、該単離核酸はさらに、作動できるように該単離核酸と連結された1つ以上の調節配列をコードする核酸を含む。
さらに別の特徴では、本発明の重鎖及び/又は軽鎖可変ドメイン又は重鎖及び/又は軽鎖をコードするポリヌクレオチドを含む発現ベクターが提供される。ある種の実施態様では、該発現ベクターはさらに1つ以上の調節配列を含む。ある種の実施態様では、該ベクターはプラスミド又はレトロウイルスベクターである。
本発明のさらにまた別の特徴はイヌ化NGF中和抗体を製造する方法を提供し、該方法は、本発明の前述の特徴の宿主細胞を培養し該細胞にイヌ化NGF中和抗体を発現させる工程を含む。
本発明のさらにまた別の特徴は本発明のNGF中和抗体を製造する方法を提供し、該方法は、本発明の抗体の軽鎖及び/又は重鎖を発現する、本発明の前述の特徴のポリヌクレオチド/核酸又はベクターの1つ以上を適切な宿主細胞で発現させる工程、該発現ポリペプチド(1つの宿主細胞で一緒に発現されてもよく、又は異なる宿主細胞で別々に発現されてもよい)を回収する工程、及び抗体を単離する工程を含む。
ある種の実施態様では、本発明の抗体又は結合フラグメント及び少なくとも1つの医薬的に許容できる希釈剤又は担体が提供される。
本発明のさらにまた別の特徴は、疾患(例えば関節炎)又は痛みの治療若しくは予防のために、本発明の上記特徴の抗体若しくは結合フラグメント、核酸、医薬組成物又は発現ベクターをイヌに投与することに関する。
ある種の実施態様では、該疾患は、神経成長因子(NGF)に対する感受性の増加によって引き起こされるか、前記に付随するか、又は前記をもたらす症状である。ある種の実施態様では、該疾患はNGFによって増殖が誘発される腫瘍(例えば骨肉腫)に関する。
ある種の実施態様では、本発明の前述の方法はさらに、本発明の抗NGF抗体の有効性を強化又は補完することができる少なくとも1つのさらに別の薬剤を共投与する工程を含む。例えば、該抗体又はその抗原結合フラグメントは、少なくとも1つの鎮痛剤、NASAID、オピオイド、コルチコステロイド、ステロイド、ヒアルロナン又はヒアルロン酸と一緒に共投与できる。
本発明のさらにまた別の特徴は、イヌの痛みの治療用、又は痛みに付随する症状の治療用、又は変形性関節症、慢性関節リウマチ及び炎症に付随する痛みの治療、緩和若しくは阻止用キットを提供し、該キットは、本発明の前述の特徴のいずれかに記載の抗NGF抗体及び前記の使用のための指示を含む。
本発明のさらにまた別の特徴は、液体中の抗イヌNGFモノクローナル抗体のin vitro、ex vivo及びin vivoでの検出用キットであって、前記抗体の濃度の決定で使用されるものを提供する。該キットは、本発明の抗体のいずれか又はその結合フラグメントを含むことができる。該キットは前記を使用するための指示を含むことができる。
本発明は、抗体が由来した種と異なる種に投与したときに低い免疫原性を示し、一方、標的リガンドに対する該抗体の結合親和性、アビジチー又は特異性は維持されている(すなわち低下していない)ドナー抗体の変種を設計又は作製する新規な方法に及ぶ。特に、該抗体又は抗体の結合フラグメントのフレームワーク領域の配列を判定し、さらに改変して該抗体が投与されるべき種に由来する抗体のプールの対応する位置で見出されない残基を除去する。
特に、本発明の方法は、ドナー(親)抗体のフレームワークが目的のレシピエントに最適に適合するように、前記フレームワークを改変する(ここで目的のレシピエントは該ドナー以外の種である)。
−軽鎖配列:配列番号:1、3、5、7、9、11、13、15、17、25、27及び71;
−重鎖配列:配列番号:2、4、6、8、10、12、14、16、18、19、20、21、24、26、68、69及び70。
本発明の抗体及び結合メンバーは化学的合成によって全体として又は部分として製造できる。例えば、本発明の抗体及び結合メンバーは、当業者に周知の技術(例えば標準的な液体ペプチド合成又は固相ペプチド合成の方法)によって調製できる。或いはまた、該抗体及び結合メンバーは、液相ペプチド合成技術を用いて、又はさらに固相、液相及び溶液化学の組合せによって調製できる。
本発明はさらに、本発明の抗体を含む少なくとも1つのアミノ酸をコードする核酸を、所望のペプチド又はポリペプチドをコードし得る適切な発現系で発現させることによって本発明の抗体又は結合メンバーを製造することに及ぶ。例えば、軽鎖アミノ酸をコードする第一の核酸及び重鎖アミノ酸をコードする第二の核酸を発現させ、本発明の抗体を提供することができる。
したがって、本発明のある種のさらに別の特徴では、本発明の抗体又は結合メンバーを形成するアミノ酸配列をコードする核酸が提供される。
典型的には、本発明の抗体又は結合メンバーを形成するアミノ酸配列をコードする核酸は、単離形若しくは精製形で提供されるか、又は天然では当該核酸に付随し得る物質を実質的に含まない(ただし例外として1つ以上の調節配列を有する)形態で提供され得る。本発明の抗体又は結合メンバーを発現する核酸は全体として又は部分として合成でき、前記にはDNA、cDNA及びRNAが含まれ得るが、ただしこれらに限定されない。
多様な種々の宿主細胞でポリペプチドをクローニング及び発現させる系は良く知られている。適切な宿主細胞には、細菌、哺乳動物細胞、酵母、昆虫及びバキュロウイルス系が含まれる。異種ポリペプチドの発現に当業界で利用可能な哺乳動物細胞株には、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞、HeLa細胞、ベビーハムスター腎細胞及びNS0マウスミエローマ細胞が含まれる。一般的で好ましい細菌宿主は大腸菌(E. coli)である。抗体及び抗体フラグメントの原核細胞(例えばE. coli)での発現は当業界ではしっかりと確立されている。培養真核細胞での発現もまた、結合メンバーの製造のための選択肢として当業者は利用できる。
抗体を製造する一般的な技術を当業者は周知であり、そのような方法は、例えば以下で考察されている:Kohler and Milstein (1975) Nature 256: 495-497;米国特許4,376,110号;Harlow and Lane, Antibodies: a Laboratory Manual, (1988) Cold Spring Harbor。組換え抗体分子の調製技術は、上記の参考文献に及び例えば欧州特許0,368,684号にも記載されている。
さらにまた、抗体の重鎖可変ドメイン及び/又は軽鎖可変ドメインをコードする核酸は、天然に存在する重鎖可変ドメイン及び/又は軽鎖可変ドメイン又はその変異体をコードする真性の配列を有する、酵素的に又は化学的に合成した核酸であり得る。
本発明の抗体は、組換え手段によって、直接的に製造されるだけでなく異種ポリペプチドとの融合ポリペプチドとしても製造することができる(前記異種ポリペプチドは、好ましくはシグナル配列又は成熟タンパク質若しくはポリペプチドのN-末端に特異的な切断部位を有する他のポリペプチドである)。優先的に選択される異種シグナル配列は、宿主細胞によって認識されプロセッシングされる(すなわちシグナルペプチダーゼによって切断される)ものである。本来の抗体のシグナル配列を認識及びプロセッシングしない原核宿主細胞については、シグナル配列は、例えばアルカリホスファターゼ、ペニシリナーゼ、Ipp又は熱安定性エンテロトキシンIIリーダーの群から選択される原核細胞シグナル配列によって代用される。
抗体、結合メンバー及び核酸は希釈剤又はアジュバントとともに処方することができ、さらに実用的な目的のために単離された形態で提供されると考えられる。例えば、抗体及び結合メンバーは、イムノアッセイで使用するためにマイクロタイタープレートの被覆に用いられる場合にはゼラチン又は他の担体と混合され得る。また前記は、診断又は治療で用いられるときには医薬的に許容できる担体又は希釈剤と混合されるであろう。抗体又は結合メンバーは、天然の態様によって又は異種真核細胞(例えばCHO又はNSO細胞)系によってグリコシル化されていてもよく、またそれらは(例えば原核細胞での発現によって製造される場合には)グリコシル化されてなくてもよい。
本発明の抗体を含む不均質調製物もまた本発明の部分を形成する。例えば、そのような調製物は、完全長の重鎖及びC-末端リジンを欠く重鎖を有する抗体、種々の程度のグリコシル化を示す抗体、及び/又は誘導アミノ酸(例えばピログルタミン酸残基の形成のために環化されたN-末端グルタミン酸)を有する抗体の混合物であり得る。
特段の規定がなければ、本明細書で用いられる全ての技術用語及び学術用語は、本発明の分野の業者が一般的に理解する意味と同じ意味を有する。用語の意味及び範囲は明瞭であるべきであるが、何らかのあいまいさが存在する場合には、本明細書で提供する定義が一切の辞書又は非本質的な定義を超える先例となる。
本明細書を通して、文脈が特段に要求しないかぎり、“comprise”若しくは“include”又は変型、例えば“comprises”若しくは“comprising”、“includes”若しくは“including”は、記述された整数又は整数群を含むが、任意の他の整数又は整数群も排除しないことを暗示すると理解されよう。
本明細書で用いられるように、例えば“a”、“an”及び“the”という用語は、文脈がそうでないことを明瞭に要求しないかぎり単数及び複数の該当語を含む。したがって、例えば、“an active agent”又は“a pharmacologically active agent”と言えば、ただ1つの活性薬剤だけでなく2つ以上の組み合わされた異なる活性薬剤を含み、一方、“a carrier”と言えば、ただ1つの担体と同様に2つ以上の担体の混合物も含まれる。さらにまた、文脈がそうでないことを要求しないかぎり、単数用語は複数形を含み、複数用語は単数形を含むであろう。
本明細書で用いられるように、“相補性決定領域(CDR)”という用語は、本来の免疫グロブリン結合部位の天然のFv領域の結合親和性及び特異性を共同して規定するアミノ酸配列を指し、前記はKabatら(Kabat,E.A., Wu,T.T., Perry,H., Gottesman,K. and Foeller,C. (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition. NIH Publication No. 91-3242)によって正確に示された。本明細書で用いられるように、“フレームワーク領域(FR)”という用語は、CDRの間に介在するアミノ酸配列を指す。抗体のこれらの部分は、CDRを適切な向きで保持する(CDRが抗原と結合することを可能にする)ために機能する。
本明細書で用いられる“キメラ抗体”という用語は、2つの異なる抗体(典型的には異なる種である)に由来する配列を含む抗体を指す。もっとも典型的には、キメラ抗体は、ドナー種に由来する可変ドメイン(標的エピトープに特異的に結合する)及び該抗体が投与される標的種から得られた抗体に由来する定常ドメインを含む。
本明細書で用いられる“免疫原性”という用語は、レシピエントに投与されたときに、免疫応答(液性又は細胞性)を誘引するターゲティングタンパク質又は治療部分の能力の強さを指す。本発明は対象動物種特化抗体の免疫原性に関する。好ましくは、本発明の抗体は免疫原性をもたず、すなわち、標的種に投与されたときそれらに対して中和抗体が生じないということである。
(1)以下の工程を含む、標的種に投与するためにドナー免疫グロブリンを改変する方法であって、前記改変された免疫グロブリンが、重鎖および/または軽鎖可変ドメインのフレームワーク領域内のいずれの位置においても、その位置において前記標的種由来の1以上の免疫グロブリンにとって外来性であるいずれのアミノ酸も含まない、前記方法:
−標的種以外の種からドナー免疫グロブリンを同定する工程であって、該ドナー免疫グロブリンは標的種に存在する標的エピトープに対し結合特異性を有する、前記工程
−該ドナー免疫グロブリンの重鎖及び/又は軽鎖可変ドメインのフレームワーク領域のアミノ酸配列を決定する工程、
−該ドナー免疫グロブリンの重鎖及び/又は軽鎖可変ドメインのフレームワーク領域のアミノ酸配列の各アミノ酸残基を、該標的種由来の1つ以上の免疫グロブリンのフレームワーク領域のアミノ酸配列の対応する位置に存在するアミノ酸残基と比較して、該標的種由来の1つ以上の免疫グロブリンの少なくとも1つのフレームワーク領域のアミノ酸配列の対応する位置に存在しない、該ドナー免疫グロブリンの重鎖及び/又は軽鎖可変ドメインのフレームワーク領域のアミノ酸配列内の1つ以上のアミノ酸残基を同定する工程;及び−該ドナー免疫グロブリンの重鎖及び/又は軽鎖可変ドメインフレームワーク領域のアミノ酸配列に存在するが、該標的種由来の前記1つ以上の免疫グロブリンの少なくとも1つのフレームワーク領域のアミノ酸配列の対応する位置には存在しない該1つ以上の同定アミノ酸残基を、該標的種由来の1つ以上の免疫グロブリンの少なくとも1つのフレームワーク領域のアミノ酸配列の対応する位置に存在するアミノ酸残基で置換する工程。
(2)ドナー免疫グロブリンの重鎖及び/又は軽鎖可変ドメインのフレームワーク領域のアミノ酸配列に存在するアミノ酸残基の置換が、保存的置換の原則を用いて行われる、(1)に記載の方法。
(3)ドナー免疫グロブリンの重鎖及び/又は軽鎖の少なくとも1つの定常ドメインを、標的種由来の免疫グロブリンに由来する重鎖及び/又は軽鎖の定常ドメインで入れ替える工程をさらに含む、(1)または(2)に記載の方法。
(4)標的種が哺乳動物標的種である、(1)から(3)のいずれかに記載の方法。
(5)哺乳動物種が、イヌ、ネコ及びウマから成る群から選択されるコンパニオンアニマルである、(4)に記載の方法。
(6)哺乳動物種がヒトである、(4)に記載の方法。
(7)ヒト神経成長因子(NGF)と特異的に結合することができる中和抗体又はその抗原結合フラグメントであって、該抗体又は抗原結合フラグメントが、配列番号:13のアミノ酸配列又は前記と少なくとも85%の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、及び/又は配列番号:14のアミノ酸配列又は前記と少なくとも85%の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含み、重鎖および軽鎖可変ドメインのいずれの位置においても、その位置においてヒト由来の1以上の免疫グロブリンにとって外来性であるいずれのアミノ酸も含まない、前記中和抗体又はその抗原結合フラグメント。
(8)軽鎖が配列番号:25のアミノ酸配列又は前記配列と少なくとも85%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、(7)に記載の抗体又はその抗原結合フラグメント。
(9)重鎖が配列番号:24のアミノ酸配列又は前記配列と少なくとも85%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、(7)又は(8)に記載の抗体又はその抗原結合フラグメント。
(10)(7)から(9)いずれかに記載の抗体又はその抗原結合フラグメントを含む医薬組成物。
(11)ヒトの痛みの治療又は予防用の、(10)記載の医薬組成物。
(12)ヒトの関節炎に付随する痛みの治療用の、(10)記載の医薬組成物。
ヒト、ネコ、イヌ及びウマ起源の免疫グロブリンガンマ(IgG)可変ドメイン重鎖(VH)及び軽鎖(VL)タンパク質配列(公的に利用可能な発現cDNAデータベース及び刊行物に由来する)を、ClustaIWプログラムを用いて種にしたがってグループとしてアラインメントした。BLOSUMコストマトリックス並びにギャップ空白コスト10及びギャップ伸長コスト0.1を用いた。低い相同性を示す低品質配列はアラインメントから除去し、フレームワーク領域の偽似ギャップを回避した。Kabatの命名法にしたがってフレームワーク及びCDR領域を同定し、それぞれのKabatフレームワーク領域の位置のアミノ酸残基を同定し、軽鎖及び重鎖の一覧表を作成した(表1−8)。軽鎖の表はカッパ軽鎖の集合物から構築されるが、ある種から別の種へとラムダ軽鎖の変換に使用される同様な表は、本特許に記載した方法にしたがってラムダ軽鎖から構築できる。
軽鎖フレームワークのQ6、C23、W35、P44、Y83、C85及びG98位、並びの重鎖フレームワークのG8、C22、W36、R38、D86、Y90及びG106位における4種のIgG配列間の配列変換によって、出発データセットに単純なヌクレオチド配列エラーにより生じたプールアミノ酸の小さな混交が存在することが示唆される。表1−8のフレームワーク領域の各々に存在する残基のプールの組成は、それぞれの種で利用可能なデータによって決定される。分析される種のいずれかに由来する免疫グロブリンについて追加されるアミノ酸配列の決定は、これらの表に存在する任意の位置で選択される組成をさらに多様化させよう。これは、これまでのところただ1つの例のみが文献で利用可能であるネコ由来可変軽鎖に関して特に言えることである(前記については、本発明者らは、表1−8に示すように、ネコ脾臓組織のmRNA IgG軽鎖配列の縮退オリゴヌクレオチドプライムによるポリメラーゼ連鎖反応増幅によって新規なセットを創出した)。それにもかかわらず、下記に示すように、従来の表を本明細書に開示した方法論と一緒に用いて、多数の異なる種への投与に適した抗体を製造することができる。
置換されるアミノ酸を保存アミノ酸で入れ替えることができるか否かを決定するとき、典型的には、判定は複数の要件、例えば(a)置換エリアのペプチド骨格の構造(例えばシート又はヘリックス構造)、(b)標的部位における分子の荷電又は疎水性、及び(c)側鎖の体積(ただしこれらに限定されない)により実施できる。
標的プールに存在しないドナーアミノ酸を保存的に置換できるか否かを考えるとき、好ましくは、アミノ酸側鎖の特性の類似性にしたがい一緒にグループ分けされたアミノ酸を基にして、相同なアミノ酸が存在するか否かを判定できる(A. L. Lehninger, in Biochemistry, 2nd Ed., 73-75, Worth Publishers, New York, 1975)。例えば以下のグループを定めることができる:(1)無極性:Ala(A)、VaI(V)、Leu(L)、Ile(I)、Pro(P)、Phe(F)、Trp(W)、Met(M);(2)非荷電極性:GIy(G)、Ser(S)、Thr(T)、Cys(C)、Tyr(Y)、Asn(N)、Gln(Q);(3)酸性:Asp(D)、GIu(E);及び(4)塩基性:Lys(K)、Arg(R)、His(H)。
或いは、アミノ酸残基は共通の側鎖の特性を基にしたグループに分けることができる:(1)疎水性:Met、Ala、VaI、Leu、Ile;(2)中性親水性:Cys、Ser、Thr、Asn、Gln;(3)酸性:Asp、Glu;(4)塩基性:His、Lys、Arg;(5)鎖の方向性に影響する残基:Gly、Pro;及び(6)芳香族性:Trp、Tyr、Phe。
保存的置換は、これらのクラスの1つのメンバーを同じクラスの別のメンバーに交換(置換)することを必要とするであろう。
例示すれば、ラット抗マウスNGFモノクローナル抗体(αD11)から決定したドナー免疫グロブリン軽鎖及び重鎖可変ドメイン配列をこれらの表を用いてアラインメントし、発現のためにPET化イヌ、ウマ及びネコ変種を設計及び構築した。それぞれの種のために選択したフレームワーク領域残基を図1に示し、ドナーラット配列との相違は図2に示す。図1及び2から分かるように、αD11のイヌ、ネコ又はウマ型の作製に必要な変更はそれぞれの種について数及びタイプが異なる。
図3、4及び5に示すそれぞれの種の定常ドメインへのC-末端の融合及びCHO細胞にトランスフェクトした適切な重鎖及び軽鎖対の共発現によって、αD11のイヌ、ネコ及びウマ型の可変ドメインを完全な抗体として発現させた(可変ドメインは配列番号:1−6、完全抗体は配列番号:7−12)。全IgGとして発現させた重鎖及び軽鎖対を含む上清をSDS-PAGEによって分析し、さらに神経増殖因子による培養TF-1細胞の増殖を阻害するそれらの能力を試験した。重鎖及び軽鎖はクーマシーブルー染色SDS-PAGEゲルで観察され(図6)、上清はNGFによって誘発されるTF-1細胞の増殖を阻害することができた(図7)。比較によれば、αD11のイヌ化変種の精製サンプルは、NGF活性阻害においてαD11のヒト化型と同じように有効で(図5a)(Pavone et al. WO2006/131951)、本明細書に記載したPET化技術は、抗体のヒト化に用いたCDR移植の標準的方法(Pavone et al.)と比較することによって抗体構造それ自体の性能の低下をもたらさないことを示した。αD11のイヌ、ネコ及びウマ型の同様な生物活性をさらに図7Dに示す。
PET化技術はまた、ヒトでの使用のためにPavoneらのものとはまた別のヒトアミノ酸重鎖及び軽鎖配列を有する抗体を変換するために用いることができ(上記では“再ヒト化”と称した)、上記に記載した方法及び表1−8に示したヒト由来フレームワーク領域位置固有アミノ酸残基が用いられた。
この軽鎖(図8A)及び重鎖(図8B)の再ヒト化フレームワーク配列の比較は、得られたVH及びVL配列(図9A)に加えて示されている。本明細書に開示した方法を用いたときヒト化αD11 MAbに対して実施する必要がある変更(フレームワーク領域に対して3アミノ酸)は、Pavoneと共同研究者らによる標準的なCDR移植方法で用いられる変更(43アミノ酸の変更)よりもはるかに少ないことは明白である。
再ヒト化αD11抗体の可変重鎖(VH)及び軽鎖(VL)変種のタンパク質配列(New-HuαD11、図9A)は、ラットαD11由来のN-末端シグナル配列並びにそれぞれC-末端のヒトIgG4重鎖由来IgG定常ドメイン及びヒトカッパ軽鎖を用いて設計された(図9B)。これらをコードする合成遺伝子はオリゴヌクレオチドを土台にした遺伝子合成によって調製し、各々を哺乳動物の発現ベクターpcDNA3.1+でサブクローニングした。CHO細胞への共トランスフェクション及びプロテインAクロマトグラフィーによる細胞上清の精製によって精製抗体を得た。前記抗体をELISAによってNGFとの結合について試験し、Pavoneらの記載したαD11のヒト化変種(WO06/131951;CDR移植によって設計)による結合と比較した。図9Cに示したELISAの結果から分かるように、本特許のNew HuαD11変種は、Pavoneらが記載したものと区別がつかないNGFとの結合性を有する。図9Cに記載した抗体を図7Cに記載の方法によりNGF阻害について試験した。両ヒト化抗体が同等な生物活性を示した。
更なる例示として、ヒト抗体D2E7(腫瘍壊死因子と結合する)をそのイヌ変種作製の出発点として用い、本特許のPET化方法を実施した。
下記に示す表9−16は、ヒトモノクローナル抗体D2E7の軽鎖及び重鎖可変ドメインのフレームワーク領域とイヌ免疫グロブリンフレームワーク配列の各位置について明らかにしたアミノ酸残基のプール(表1−8に示されている)とのアラインメントを例示する。以前にKabatの配列位置で異質と考えられたある種の残基(表9で*印)は今ではイヌにとって自然であると考えられ、したがって*印の位置で示された変更はもはや実施されないか、又は別のより保存的な残基が選択され得る(表10の**印)。この追加情報を基に、Ser9、Ala13及びGly16(表9で*印)を含む、3つの軽鎖の位置が変更されないであろう.軽鎖のHis42は当該位置の残基のまた別の選択であろう(表10の**印)。これらの位置におけるイヌ化D2E7フレームワーク残基の改変及びそのような改変を含む抗体は本発明の範囲内と考える。そのような抗体は、配列番号:15に示す配列を有する軽鎖可変ドメインを含むであろうが、ただし除外例として、セリン残基は9位に提供され、アラニン残基は13位に提供され、グリシン残基は16位に提供され、配列番号:15の上記の位置に示される残基の位置を占める。場合によって、配列番号:15のグルタミンの位置の42位にヒスチジン残基を提供することができる。これらの変更を示す改変配列は配列番号:71として提供される。本発明は、配列番号:71を含む軽鎖可変ドメインを含む抗体及び前記抗体に由来する抗原結合フラグメントに及ぶ。
配列番号:17(軽鎖)及び配列番号:19(重鎖、アイソタイプB)のアミノ酸配列を有するイヌ化抗TNFモノクローナル抗体、並びに配列番号:22のアミノ酸の軽鎖及び配列番号:23の重鎖(図13)を有するキメラ抗TNFモノクローナル抗体をコードするcDNAは、pcDNA3.1+(Invitrogen/Life technologies)でアミノ末端分泌シグナル(提示されていない)とともにサブクローニングした。イヌ化重鎖及び軽鎖配列(ca-HCB+ca-kLC)又はキメラ重鎖及び軽鎖(ch-HCB+ch-kLC)のどちらかの組合せをCHO細胞に共トランスフェクトした。得られた上清をプロテインAで精製し、SDS-PAGEで分析し、表示の抗体濃度(μg/mL)でイヌTNFアルファ(5μg/mLで被覆;R&D systems)との結合につてELISAによって試験し、抗イヌポリクローナル抗体-セイヨウワサビペルオキシダーゼ結合物(Sigma A9042)を用いて検出した(図14B)。陰性コントロールは、検出用ポリクローナル抗体を単独被覆抗原に用いた。
イヌTNF活性を阻害する精製抗体の能力についてそれら抗体を試験した。蛍光によってヒトTNFに応答するTNF感受性NF-kB-EGFPレポーター細胞株(Vincr et al., Cell 131, 682, 2007)を作製するために293-HEK細胞にpTRH1をトランスフェクトして用いた。これらの細胞でイヌTNFがGFP発現を活性化することをまず初めに示し(約1ng/mL で50%最大刺激)、続いて1ng/mLのイヌTNFを阻害するそれらの能力について図14に示すイヌ抗体を試験した。
図15(A−C)に示すように、イヌ化抗体及びキメラ抗体の両方がこのアッセイでイヌTNFの強力な阻害物質であった。
これらの結果を総合すれば、本発明のイヌ化抗体及びヒト-イヌキメラ抗体はイヌTNFと結合すること、及びそれらはELISA及び阻害アッセイの両方で同等に強力であることを示し、本イヌ化プロセスは最初のD2E7抗体の完全に活性なイヌ化型を生じる事を明示した。
図16は、イヌ化及びキメラD2E7モノクローナル抗体(MAb)と抗ヒトTNF MAbクローン148を土台にしたさらに別のイヌ化抗体との比較を示す。このイヌ化抗huTNF MAb148(配列番号:26及び配列番号:27、図17)はCHO細胞で発現させ、プロテインAクロマトグラフィーを用いて精製した(パネルA、左レーン)。前記イヌ化148MAbをヒトTNF(パネルB)及びイヌTNF(パネルC)との結合について試験し、図14及び15のイヌ化(Ca)及びキメラ(Ch)D2E7系MAbと比較した(バックグラウンド陰性コントロールは矢印で示されている)。パネルB及びCから、イヌ化MAb148はヒトTNFと結合するがイヌTNFとは結合しないことが分かる。したがって、D2E7を土台にしたイヌ化及びキメラM7Ab並びに本発明の対象物は、予期に反してイヌTNFに対してヒトTNFとの結合と同等の強い結合を示すが、一方、イヌ化MAb148はヒトTNFとの結合のみを示す。したがって、イヌ化D2E7系MAbは驚くべきことに、イヌTNFによって媒介されるイヌの疾患の治療に有用である。
総合すれば、PET化ラット抗NGF MAbαD11のイヌ、ウマ、ネコ及び新規なヒト型並びにヒト抗TNF MAbのイヌPET化型は、本特許に開示する方法による可変ドメインフレームワークのPET化変換は、卓抜し再現性を有し、多数のMAbの多数種変換に応用できる。
抗体療法:
配列番号:7及び配列番号:70(イヌHCA型重鎖)を発現する発現ベクターに由来する抗イヌNGFモノクローナル抗体をCHO細胞で発現させ、イオン交換クロマトグラフィー、疎水性相互作用クロマトグラフィー及びサイズ排除クロマトグラフィーの組合せによって精製し、リン酸緩衝食塩水に緩衝液を交換した。
炎症のイヌモデル:
全ての実験は院内倫理委員会(CRL, Ireland)の事前承認を得て実施した。ビーグル犬の一方の後肢のフットパッドにカオリンを注射し(=-1日目)、およそ24時間後に開始する自己緩解性炎症(前記はイヌを一次的に跛行に至らしめる)を発生させた。このモデルでは、カオリンに対する初期炎症応答が減弱すると、イヌの跛行は約1−2週間の期間に着実に軽減され、続いて完全に回復する。
3匹のイヌの複数のグループに、200μg/kg体重で抗イヌNGFモノクローナル抗体又はビヒクルコントロールとしてのリン酸緩衝食塩水を静脈内注射した(0日目)。これらのイヌを以下の目視スコア方法によって7日間にわたって跛行について判定した:スコア0、跛行無し(完全な体重保持);スコア1、わずかな跛行(体重保持は完全ではないが歩行は良好);スコア2、中等度の跛行(わずかに体重を保持し歩行も良好でない);スコア3、重篤な跛行(体重を保持できない)。観察者はどのイヌが注射を受けているかを知らされていない。
結果は図18に示される。跛行スコアは、賦形剤コントロールと比較して抗NGFモノクローナル抗体を投与されたイヌで注射後3日目に緩和され、抗NGFモノクローナル抗体は、賦形剤単独で観察されたものよりもイヌの痛みの緩和に効果を有することを示した。この遅延活性は、抗イヌNGFモノクローナル抗体の血中薬理動態(約30時間の緩徐な組織分布(アルファ)相を示した)及びフットパッド領域の比較的貧弱な血管形成と一致する。図18に示した結果は、本発明の方法によって製造した抗イヌNGF抗体は、イヌの炎症痛を緩和し、その結果跛行を軽減することを示している。
本明細書に引用した全ての文書類は参照により本明細書に含まれる。本発明に記載した実施態様の多様な改変及び変型は、本発明の範囲を逸脱することなく当業者には明白であろう。本発明を特定の好ましい実施態様との関連でこれまで説明してきたが、特許請求の範囲に記載した本発明はそのような個々の実施態様に限定されるべきではないことは理解されよう。実際のところ、本発明の実施に関して記載した態様の当業者に明白な多様な改変は本発明に包含される。
Claims (6)
- ヒト神経成長因子(NGF)と特異的に結合することができる、ヒト化抗体又はその抗原結合フラグメントであって、該抗体又は抗原結合フラグメントはヒトにおいて完全に又は有意に非免疫原性であり、配列番号:13のアミノ酸配列又は前記配列と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、及び配列番号:14のアミノ酸配列又は前記配列と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含み、前記重鎖可変領域および前記軽鎖可変領域のフレームワーク領域内のいずれの位置においても、その位置においてヒト由来の免疫グロブリンでは外来性であるいずれのアミノ酸も含まず、前記軽鎖可変領域が、RASEDIYNALAからなるCDR1配列、NTDTLHTからなるCDR2配列、および、HYFHYPRTからなるCDR3配列を含み、前記重鎖可変領域が、TVSGFSLTNNNVNからなるCDR1配列、GVWAGGATDYNSALKからなるCDR2配列、および、DGGYSSSTLYAMDAからなるCDR3配列を含む、前記ヒト化抗体又はその抗原結合フラグメント。
- 軽鎖が配列番号:25のアミノ酸配列又は前記配列と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項1に記載の抗体又はその抗原結合フラグメント。
- 重鎖が配列番号:24のアミノ酸配列又は前記配列と少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項1又は2に記載の抗体又はその抗原結合フラグメント。
- 請求項1から3のいずれか1項に記載の抗体又はその抗原結合フラグメントを含む医薬組成物。
- ヒトの痛みの治療又は予防用の請求項4記載の医薬組成物。
- ヒトの関節炎に付随する痛みの治療用である、請求項4記載の医薬組成物。
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