JP2018536434A - 腫瘍形質導入のための組成物及び方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、2015年10月30日に提出された米国仮特許出願第62/249,183号明細書(その内容全体が参照により本明細書に組み込まれる)に対する優先権を主張する。
固形腫瘍に対するキメラ抗原受容体(CAR)T細胞の近年の事例は、臨床的(又は全臨床でも)失敗であった。本明細書に記載される本発明は、固形腫瘍及び他の癌適応症に対する解決法を提示する。
本発明は、少なくとも部分的に、癌細胞(例えば、固形腫瘍細胞などの腫瘍細胞)への細胞療法標的の導入に基づくものであり、それにより、癌細胞がエフェクター細胞に対してより感受性になり、エフェクター細胞が癌細胞を排除及び/又は低減することができるようにする。本明細書にさらに詳述するように、癌細胞(例えば、腫瘍)を融合タンパク質と一緒に形質導入することができる。こうした融合タンパク質は、標的成分に融合した結合成分から構成される。例えば、融合タンパク質は、細胞治療薬、例えば、CD19、サイトカイン標的融合物;二重特異性T細胞エンゲージャ(engager)(BiTE)の標的に融合した、1つ又は複数の腫瘍関連抗原(TAA)又は腫瘍特異的抗原(TSA)と結合する抗体若しくは抗体断片であってよい。これらの融合タンパク質又は変異体(若しくは突然変異体)は、腫瘍細胞により分泌され、及び/又は腫瘍微小環境を透過することができる。
本発明は、固形腫瘍細胞への細胞療法標的の導入に少なくとも部分的に基づく。腫瘍細胞を融合タンパク質と一緒に形質導入して、腫瘍細胞によって融合タンパク質が分泌され、腫瘍微小環境に放出されて腫瘍を殺傷することができる。
本明細書で使用されるとき、用語「抗体」は、特定の標的抗原に対する特異的な結合を付与する上で十分な規定免疫グロブリン配列要素を含むポリペプチドを指す。当技術分野で公知のように、天然に産生されるインタクトな抗体は、互いに結合して、一般に「Y字型」構造と呼ばれるものを形成する、2つの同じ重鎖ポリペプチド(各々約50kD)と2つの同じ軽鎖ポリペプチド(各々約25kD)からなるおよそ150kDの四量体物質である。各重鎖は、少なくとも4つのドメイン(各々約110アミノ酸長)−アミノ末端可変(VH)ドメイン(Y構造の先端に位置する)、続いて3つの定常ドメイン:CH1、CH2、及びカルボキシ末端CH3(Y字の幹の下端に位置する)からなる。「スイッチ」として知られる短い領域は、重鎖可変及び定常領域をつなげる。「ヒンジ」は、CH2及びCH3ドメインを抗体の残り部分とつなげる。このヒンジ領域中の2つのジスルフィド結合は、2つの重鎖ポリペプチドをインタクトな抗体中のもう1つのポリペプチドとつなげる。各軽鎖は、互いに他の「スイッチ」により隔てられた2つのドメイン、すなわち、アミノ末端可変(VL)ドメインと、それに続くカルボキシ末端定常(CL)ドメインからなる。インタクトな抗体四量体は、2つの重鎖−軽鎖二量体から構成され、重鎖及び軽鎖は、単一のジスルフィド結合によって互いに結合され;他の2つのジスルフィド結合が重鎖ヒンジ領域を互いに結合することにより、二量体が互いに結合して四量体が形成される。天然に産生される抗体も典型的にはCH2ドメインでグリコシル化される。天然抗体中の各ドメインは、圧縮された逆平行βバレル中に互いに接触して充填される2つのβシート(例えば、3、4、若しくは5本鎖シート)から形成される「免疫グロブリンフォールド」を特徴とする構造を有する。各可変ドメインは、「補体決定領域」(CDR1、CDR2、及びCDR3)として知られる3つの超可変ループと、4つの幾分不変の「フレームワーク」領域(FR1、FR2、FR3、及びFR4)とを含む。天然抗体が折り畳まれると、FR領域は、ドメインの構造フレームワークを付与するβシートを形成すると共に、重鎖及び軽鎖の両方からのCDRループ領域が3次元空間内で一緒になって、Y字構造の先端に位置する単一の超可変抗原結合部位を形成する。天然に存在する抗体のFc領域は、補体系の要素に、さらには例えば細胞傷害性を媒介するエフェクター細胞をはじめとするエフェクター細胞上の受容体にも結合する。当技術分野で公知のように、Fc受容体に対するFc領域の親和性及び/又は他の結合属性は、グリコシル化又は他の修飾を介して調節することができる。一部の実施形態では、本開示に従って生成及び/又は使用される抗体は、修飾又は操作されたそのようなグリコシル化を有するFcドメインなどのグリコシル化Fcドメインを含む。本開示の目的のために、いくつかの実施形態では、天然抗体に見出されるように十分な免疫グロブリンドメイン配列を含む任意のポリペプチド又はポリペプチドの複合体は、そのようなポリペプチドが天然に生成される(例えば、抗原に反応する生物によって産生される)か、又は組換え操作、化学的合成、又は他の人工系若しくは方法によって生成されるかにかかわらず、「抗体」と呼ぶことができ、且つ/又は「抗体」として使用することができる。一部の実施形態では、抗体は、ポリクローナルであり;一部の実施形態では、抗体は、モノクローナルである。一部の実施形態では、抗体は、マウス、ウサギ、霊長類、又はヒト抗体に特有の定常領域配列を有する。一部の実施形態では、抗体配列要素は、当技術分野で公知のように、完全にヒト由来であるか、又はヒト化、霊長類化、キメラなどである。さらに、本明細書で使用される用語「抗体」は、適切な実施形態(別の解釈が記載されているか、又は文脈から明らかでない限り)では、別の形態で抗体構造及び機能的特徴を使用することを目的とする、当技術分野で公知の又は開発された構築物若しくはフォーマットのいずれも指し得る。例えば、一部の実施形態では、本開示に従って使用される抗体は、限定されないが、以下:インタクトなIgG、IgE及びIgM、二重若しくは多重特異性抗体(例えば、Zybodies(登録商標)など)、単鎖Fv、ポリペプチド−Fc融合物、Fab、カメロイド(cameloid)抗体、マスクされた抗体(例えば、Probodies(登録商標))、小モジュラー免疫薬(Small Modular ImmunoPharmaceutical)(「SMIPsTM」)、単鎖若しくはタンデムダイアボディ(TandAb(登録商標))、VHH、Anticalins(登録商標)、Nanobodies(登録商標)、ミニボディ、BiTE(登録商標)、アンキリン反復タンパク質若しくはDARPIN(登録商標)、Avimers(登録商標)、DART、TCR様抗体、Adnectins(登録商標)、Affilins(登録商標)、Trans−bodies(登録商標)、Affibodies(登録商標)、TrimerX(登録商標)、MicroProteins、Fynomers(登録商標)、Centyrins(登録商標)、及びKALBITOR(登録商標)から選択されるフォーマットである。一部の実施形態では、抗体は、天然に生成されていれば有する共有結合修飾(例えば、グリカンの結合)が欠如していてもよい。一部の実施形態では、抗体は、共有結合修飾(例えば、グリカン、ペイロード(例えば、検出可能な部分、治療薬部分、触媒部分など)、又は別のペンダント基(例えば、ポリエチレングリコールなど))の結合)を含んでもよい。
本発明は、癌細胞(例えば、腫瘍細胞)中への融合タンパク質の導入のために使用することができ、個体の免疫系及び/又は別の治療薬のいずれかによる破壊に対して癌細胞をより感受性にする組成物を提供する。組成物は、限定されないが、本明細書に記載されるベクター及び様々な構築物、そうしたベクター及び/又は構築物を含有する宿主細胞(腫瘍細胞を含む)、これらのベクター及び/又は構築物を発現するか又は発現することができる宿主細胞、ベクター、構築物、指示書、及び/又は試薬などを含有するキットを含むことができる。
目的とする所望の遺伝子をコードする核酸配列をいくつかのタイプのベクターにクローン化することができる。例えば、核酸をプラスミド、ファージミド、ファージ誘導体、動物ウイルス、及びコスミドにクローン化することができる。他のベクターは、発現ベクター、複製ベクター、プローブ生成ベクター、シーケンシング用ベクター、及びウイルスベクターを含み得る。別の事例では、ベクターは、スプマウイルス(spumavirus)から作製されるレトロウイルスベクターの1タイプである、泡沫状ウイルス(FV)ベクターであってもよい。ウイルスベクター設計及び技術は、Sambrook et al,(Molecular Cloning:A Laboratory Manual,2001)、並びに他のウイルス学及び分子生物学マニュアルに記載されているように当技術分野で公知である。
細胞に目的の遺伝子を発現させることを目的とする、細胞の遺伝子修飾のための細胞への核酸の移入は、形質導入(例えば、ウイルス形質導入)によって広く実施されている。目的とする所望の遺伝子又はその部分(例えば、腫瘍関連抗原)をコードする核酸配列は、当技術分野で公知の組換え方法を用いて取得することができる。例示的な方法として、遺伝子を発現する細胞からライブラリをスクリーニングすること、ベクターから遺伝子を誘導すること、又は細胞及び組織から直接単離することなどがある。これらの方法は、標準的な技術を用いて実施される。別の実施形態では、目的の遺伝子は、クローン化されるのではなく、合成によって生成される。遺伝子送達方法は、例えば、米国特許第5,399,346号明細書など、当技術分野で公知である。
ウイルスは、特定の細胞型への核酸送達に非常に効率的であるが、往々にして感染した宿主免疫系による検出を回避する。これらの特徴により、特定のウイルスは、癌細胞、例えば、固形腫瘍細胞中への細胞療法標的の導入のためのビヒクルとして有力な候補となる。いくつかのウイルスベース系が哺乳動物細胞への遺伝子移入のために開発されている。ウイルスベクターの例として、限定されないが、レトロウイルス(retrovirus)、アデノウイルス(adenovirus)、アデノ関連ウイルス(adeno−associated virus)、ヘルペスウイルス(herpes virus)、レンチウイルス(lentivirus)、ポックスウイルス(poxvirus)、単純ヘルペス1ウイルス(herpes simplex 1 virus)、ヘルペスウイルス(herpes virus)、腫瘍ウイルス(oncovirus)(例えば、マウス白血病ウイルス(murine leukemia virus))などが挙げられる。一般に、好適なベクターは、少なくとも1つの生物において機能性の複製起点、プロモータ配列、好都合な制限エンドヌクレアーゼ部位、並びに1つ又は複数の選択マーカを含有する(例えば、国際公開第01/96584号パンフレット;同第01/29058号パンフレット;及び米国特許第6,326,193号明細書)。
本発明の一部の態様では、細胞療法標的又は腫瘍関連抗原をコードする核酸配列が腫瘍細胞の遺伝子構造の一部として組み込まれる。特定の理論に拘束されるわけではないが、腫瘍細胞が複製すると、子孫腫瘍細胞が細胞療法標的を発現し、従ってエフェクター細胞及び他の治療薬(併用療法薬を含む)に感受性となることから、細胞療法標的をコードする核酸配列の組込みは有用となり得る。その結果、転移性疾患などのいくつかの適応症では、急速な腫瘍細胞増殖の状態が本発明の治療薬を増殖させる上で有用となる。
腫瘍細胞に生産的に導入される遺伝子は、有効性に対する重大な障壁に取り組むか又はこれを回避することにより、改善された細胞療法活性を提供する。これらの遺伝子は、抗腫瘍応答を「伝播する」ことによって治療有効性を改善し、局所環境内のサイトカイン支持を最適化し、局所免疫抑制を逆転させ、細胞エフェクター機能を改善し、腫瘍への細胞アクセスを促進する。任意の遺伝子を本明細書に記載の発現構築物に含有させることができ、本開示は、いずれの具体的な遺伝子にも限定されない。細胞療法標的として含有させることができる例示的で非限定的な遺伝子型として、例えば、別の細胞療法薬の標的、ポリペプチド抗原、抗体、サイトカイン、腫瘍微小環境をターゲティングする因子、及び細胞成長/増殖を支持する因子が挙げられる。
多様な発現パターンを駆動するプロモータの組を作製する。例として、数日で測定される高速且つ持続的な発現、又は高速であるが、可逆的な発現、又は遅延させた発現が挙げられる。また、発現のレベルは、調節及びプロモータエレメントの選択的使用によって修飾することができる。こうした方法は、例えば、E.D.Papadakis,et al.,Current Gene Therapy,4:89−113(参照により本明細書に組み込まれる)において十分に理解されている。
本発明は、癌細胞(例えば、腫瘍細胞又は固形腫瘍細胞)が、TAA又はTSA及び治療薬を含む融合タンパク質を分泌する系を操作することにより、癌を治療する組成物又は方法を提供する。癌を有するか又は癌を有することが疑われる個体に、その癌細胞のインビボ形質導入を可能にする組成物を投与することができる。投与は、限定されないが、静脈内、全身、筋肉内、腹腔内、又は腫瘍内注射をはじめとする任意の手段で行うことができる。
一部の実施形態では、融合タンパク質の形質導入及び分泌の後に局所腫瘍細胞に発現された細胞治療薬抗原は、エフェクター細胞により認識され、これは、腫瘍関連抗原(TAA)を含むことができる。一実施形態では、TAA発現は、腫瘍細胞集団のみに限定し、全ての腫瘍細胞に発現させ、腫瘍細胞表面上に発現させることができる。他の抗原は、腫瘍細胞に過剰発現されるが、正常細胞には低レベルで存在し、従って腫瘍選択的抗原(TSA)である。さらに、一部の腫瘍抗原は、「パッセンジャー突然変異」として発生し、すなわち、DNA修復に対する制御欠陥を有するために、多様なタンパク質中に突然変異を蓄積する腫瘍細胞によって発現される非必須抗原である。いくつかの腫瘍抗原は、免疫応答;特にT細胞媒介性免疫応答を誘発する腫瘍細胞により産生されるタンパク質である。細胞療法標的によりターゲティングされ得る腫瘍特異的分子は、当技術分野で公知の腫瘍関連抗原を含み、例えば、以下:神経膠腫関連抗原、癌胎児性抗原(CEA)、β−ヒト絨毛性ゴナドトロピン、αフェトプロテイン(AFP)、レクチン反応性AFP、サイログロブリン、RAGE−1、MN−CA IX、ヒトテロメラーゼ逆転写酵素、RU1、RU2(AS)、腸カルボキシエステラーゼ、mut hsp70−2、M−CSF、プロスターゼ、前立腺特異的抗原(PSA)、PAP、NY−ESO−1、LAGE−la、p53、プロステイン、PSMA、Her2/neu、サバイビン及びテロメラーゼ、前立腺癌腫瘍抗原−1(PCTA−1)、MAGE、ELF2M、好中球エラスターゼ、エフリンB2、CD22、インスリン増殖因子(IGF)−I、IGF−II、IGF−I受容体及びメソテリンを挙げることができる。腫瘍ゲノム及びエキソームの次世代シーケンシング(NGS)、及び腫瘍プロテオームの高感度質量分析(タンパク質シーケンシング)分析をはじめとする技術の適用は、本発明で使用される新たなTAA及びTSA抗原を同定し続けている。
別の実施形態では、形質導入された細胞は、公知の抗体−薬物複合体によりターゲティングされる融合タンパク質を分泌し、例えば、こうしたものとして、例えば、ブレンツキシマブベドチン(アドセトリス(ADCETRIS)、Seattle Genetics);トラスツズマブ・エムタンシン(Roche);ゲムツズマブ・オゾガマイシン(Pfizer);CMC−544;SAR3419;CDX−011;PSMA−ADC;BT−062;CD30、HER2、及びIMGN901が挙げられる(例えば、Sassoon et al.,Methods Mol.Biol.1045:1−27(2013);Bouchard et al.,Bioorganic Med.Chem.Lett.24:5357−5363(2014)を参照)。別の実施形態では、形質導入された細胞は、抗体依存的細胞傷害性機能を有する抗体によってターゲティングすることができる融合タンパク質、例えば、リツキシマブ、オクレリズマブ、イピリムマブ、シツキシマブ、アービタックス及びその他多数によって認識されるものを分泌する。従って、一部の実施形態では、こうした既知の抗体薬物複合体の1つ又は複数に結合する融合タンパク質の一部としてポリペプチド抗原をコードする核酸を、本明細書に記載の細胞療法標的として含有させることができる。
一部の実施形態では、腫瘍又は腫瘍微小環境をサイトカイン融合タンパク質、例えば、サイトカイン(例えば、抗腫瘍サイトカイン)と、本明細書に記載の1つ又は複数の別の細胞治療薬(例えば、CAR−T細胞)の標的との融合タンパク質で形質導入する。例示的なサイトカインは、腫瘍に結合し、サイトカインを含む腫瘍を提示する。例えば、いくつかの考慮される標的として、CD19、CD20、CD21、CD22、CD24、及びBCMAが挙げられる。こうした細胞療法は、腫瘍表面に1つ又は複数の別の細胞治療薬(例えば、CAR−T細胞)の標的と刺激性サイトカインとの両方を供給することができる。例えば、発現及び/又は分泌された構築物は、サイトカイン−CD19融合タンパク質、又はサイトカインとCD19断片、例えば、CD19−CAR−T細胞が結合するCD19断片との融合物をコードすることができる。一部の実施形態では、CD19断片は、CD19IgCドメインである。特定の理論に拘束されることは望まないが、こうした融合タンパク質をコードする単一発現構築物は、有利には、最小(例えば、単一)トランスジーンを用いて細胞治療薬を遺伝子改変することができる。サイトカイン融合タンパク質を使用するもう1つの利点は、サイトカイン機能効果以外に、受容体に対するそれらの堅固な結合を使用することである。
一部の実施形態では、本明細書に記載の組換え腫瘍は、本明細書に記載の融合タンパク質と同様に、1つ又は複数の免疫応答促進剤、例えば、癌療法に使用される1つ又は複数のサイトカインをコードする。含有させることができる非限定的、例示的なサイトカインとして、例えば、IFNα、IFNβ、IFNγ、IL−1、IL−2、IL−7、IL−12、IL−15、IL−21、IL−36、TNF、LTα、GM−CSF、G−CSF、TLRアゴニスト、及び免疫チェックポイント抗体断片が挙げられる。
いくつかの例では、組換え腫瘍細胞は、融合タンパク質の一部として、scFv又はTCRを発現することができ、これらを細胞動員部分(例えば、抗CD3又は抗CD16)に融合させることができる。別の実施形態では、二重特異性T細胞エンゲージャ(BiTE(登録商標))技術を利用して、身体の内在性T細胞にエンゲージすることを促進すると共に、1つ又は複数のTAAを発現するように操作された標的癌細胞をターゲティングする。BiTE(登録商標)技術の抗体構築物は、TAA又は腫瘍結合表面抗原に対する、及びT細胞受容体結合分子に対するモノクローナル抗体の最小結合ドメインを一本鎖ポリペプチド鎖と遺伝子的に連結することによって構築される。一方の抗体は、標的腫瘍細胞上の選択された表面抗原に特異的であり、他方の抗体は、T細胞の表面上のT細胞受容体複合体と結合した部分(例えば、CD3)に特異的である。BiTE(登録商標)技術は、ポリクローナル細胞傷害性T細胞と標的悪性腫瘍細胞とに結合する。
一部の実施形態では、1つ又は複数の別の細胞治療薬の標的は、ポリペプチド抗原であるか、又はこれを含む。別の細胞治療薬(例えば、CAR−T細胞)が、こうしたポリペプチド抗原を認識して結合するようにこれを操作することができれば、発現構築物によって発現されるポリペプチド抗原は、特定のポリペプチド又はその部分に限定されない。一部の実施形態では、ポリペプチド標的は、腫瘍関連抗原ではないポリペプチドである。一部の実施形態では、標的は、腫瘍抗原、例えば、BCMA、CD19、CD20、CD22、ROR1、メソテリン、CD33/IL3Ra、c−Met、PSMA、グリコリピド(Glycolipid)F77、EGFRvIII、GD−2、NY−ESO−1 TCR、又はMAGE A3 TCRである。
一部の実施形態では、腫瘍又は腫瘍微小環境を、抗体(又はその抗体結合断片、例えば、分泌されたscFv又は他の抗体フォーマット)と、1つ又は複数の別の細胞治療薬(例えば、CAR−T細胞)の標的とを含む融合タンパク質で形質導入する。抗体(又は断片)は、例えば、腫瘍抗原(例えば、本明細書に記載の腫瘍抗原)に結合するように選択することができ、その融合パートナーは、1つ又は複数の別の細胞治療薬の標的を含んでもよい。こうした抗体(又はその抗体結合断片)は、例えば、モノクローナル抗体(mAb)を含み、例えば、scFv及び完全長mAb、VHHドメイン、ディアボディ、ナノボディなどが挙げられる。一例では、構築物は、mAb(例えば、抗腫瘍関連抗原mAb又は抗原結合断片)及びCD19又はその断片(例えば、CD19Igドメイン)からなる分泌された融合タンパク質をコードする。
一部の実施形態では、局所因子を阻害するペプチド(例えば、ポリペプチド及びその断片)を腫瘍細胞により融合タンパク質として発現させることができる。これらのペプチドをコードする核酸を本明細書に記載のように、及び/又は当業者には周知の任意の方法で操作することにより、ペプチドを発現させることができる。非限定的な例として、TGFβ、アデノシン受容体2、血管内皮増殖因子(VEGF)、血小板由来増殖因子(PDGF)、インドールアミン2,3−ジオキシゲナーゼ(IDO1)、及びマトリックスメタロプロテイナーゼ(MMP))が挙げられる。
CD19は、Igスーパーファミリーに属する95kd膜貫通タンパク質であり、2つの細胞外C2型Igドメインを含む(例えば、Tedder Nature Rev.Rheum.5:572−577(2009);Wang et al.,Exp.Hematol.Oncol.2012 Nov 29;1(1):36.doi:10.1186/2162−3619−1−36.)を参照)。一部の実施形態では、C2型Igドメインの一方若しくは両方を突然変異誘発のスカフォールドとして使用し、CD19変異体(例えば、一方若しくは両方のC2型Igドメイン内に1つ若しくは複数の突然変異を含むCD19若しくはその一部分)を、本明細書に記載の標的抗原への結合についてスクリーニング及び選択することができる。
以下の表1に、既知の入手可能な抗体剤によってターゲティングされるいくつかのヒトポリペプチド抗原の非包括的リストを示し、抗体剤が有用であると想定されているいくつかの癌適応症を記載する。
癌治療薬のためのサイトカイン支持には長い歴史がある(例えば、TNF、LTa、IFNa及びIL−2の全身使用など)。全身性サイトカイン療法に固有の問題として、高用量要件、わずかな有効性、及び毒性(TNF及びLTaの場合には致死的)が挙げられる。こうした毒性により、IL−12及びIL−15の使用が限定されている。
CAR T細胞、CAR NK細胞、TCR T細胞、TIL、同種異系NK細胞、及びオートロガスNK細胞を、TAAを含むサイトカイン融合タンパク質としてIL−21の徐放を達成するように操作する。CD8+T細胞において拡大及びエフェクター分化を誘導してNK細胞活性化及び細胞傷害活性を支持する。
標的は、毒素に結合した抗体であるADCによって認識されるポリペプチド配列、1つ又は複数のタンパク質ドメインである。ADC標的は、中でも、HER2受容体、CD30細胞表面タンパク質、葉酸受容体α、及びCD19である。
「免疫応答促進剤」は、免疫応答細胞集団を含む刺激細胞によって免疫応答を刺激することができるあらゆる物質である。免疫応答を直接刺激する物質として、サイトカイン、「危険シグナル」(DAMP、PAMP、TLRアゴニストなど)、アゴニスト抗体又はリガンド(例えば、抗4−1BB、CD40L、B7−1、及びその他多数)、免疫抑制シグナルの阻害剤(PD−1、PD−L1、CTLA4、Lag−3、TIM−3、IDO1、アデノシン受容体、TGFβのアンタゴニスト、及びその他多数)が挙げられる。
免疫エフェクター細胞の動員のための別の方法は、リンカーにより連結された2つのscFvから構成される二重特異性T細胞エンゲージャ(例えば、BiTE)の作製である。一方のアームは、抗TAAscFvであり、2つ目のscFvは、TCR複合体のCD3εサブユニットに結合するため、T細胞活性化をトリガーする。重要なことに、BiTE及び関連分子(DART、ダイアボディ、fCabなど)は、非常に低いエフェクター/標的(E/T)細胞比のT細胞により、腫瘍細胞溶解のラウンドを繰り返し誘発する。細胞傷害性は、膜穿孔及びそれに続くグランザイム及びアポトーシスの誘導によって媒介され、これは、まさに抗腫瘍環境に誘発することが意図された殺傷のタイプである。通常、抗TAAscFv腫瘍関連抗原の親和性は、CD3に対するものよりもはるかに高く、これは標的腫瘍に対する特異性を強化する。多くのBiTEが作製されており、そのようなものとして、CD19、EpCAM、HER2、癌胎児性抗原(CEA)、エフリンA2(EphA2)、CD33、及び黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)をターゲティングするBiTEが挙げられる。臨床試験中の他のBiTEは、EpCAM、前立腺特異的膜抗原(PSMA)、又はCD3結合モジュールと組み合わせたCEA結合分子から構成される。
Her2を発現する乳癌の異種移植マウスモデルの腫瘍細胞を形質導入するために、ScFv−CD19融合タンパク質を含むHPV偽ウイルスをIV注射する。形質導入された腫瘍は、ScFv−CD19融合タンパク質を分泌し、その結果、ScFvとHer2との結合を介してScFv−Cd19融合タンパク質による腫瘍細胞の被覆が起こる。CD19指向性CAR T細胞の添加により、CD19で被覆された腫瘍細胞を殺傷する。CD19指向性CAR T細胞は、標準的な方法によって作製される。
Her2を発現する乳癌の異種移植マウスモデルの腫瘍細胞を形質導入するために、キメラAAV/ファージウイルスをIV注射する。形質導入された腫瘍は、ScFv−CD19融合タンパク質を分泌し、その結果、ScFvとHer2との結合を介してScFv−CD19融合タンパク質による腫瘍細胞の被覆が起こる。CD19指向性CAR T細胞の添加により、CD19で被覆された腫瘍細胞を殺傷する。CD19指向性CAR T細胞の作製は十分に確立されている。
Her2を発現する乳癌の異種移植マウスモデルの腫瘍細胞を形質導入するために、ScFv−CD30融合タンパク質を含むHPV偽ウイルスをIV注射する。形質導入された腫瘍は、ScFv−CD30融合タンパク質を分泌し、その結果、ScFvとHer2との結合を介してScFv−CD30融合タンパク質による腫瘍細胞の被覆が起こる。CD30指向性抗体薬物複合体(ADC)の添加により、CD30で被覆された腫瘍細胞を殺傷する。アドセトリスは、Seattle Geneticsから市販されているADCである。
本実施例は、融合タンパク質をコードするAAVウイルス粒子で形質導入された細胞からの融合タンパク質の発現を示す。さらに、本実施例は、発現された融合タンパク質が、抗CD19抗体FMC63に結合されて、抗His抗体とC末端Hisタグとの結合により検出することができることを立証する。発現されると、融合タンパク質は、CD19陰性である細胞の存在下でCAR19T細胞を活性化することができる。
以下の表に、本実施例で試験した様々な構築物を列記する。
12ウェルプレートにDMEM+10%FBS培地中約4×10e5細胞/ウェルでA431又は293T細胞のいずれかを接種した。翌日、1ウェルをカウントして、ウイルス感染について正確なカウントを得た。細胞は、1×106又は5×106の感染多重度で感染した。AAV2ウイルス粒子をVigene(Rockville,MD)により作製した。ウイルス粒子は、CD19D1+D2−scFv−His配列を含有する挿入片をpAV−FHにクローン化したプラスミドから作製した。ウイルス粒子AAV−1(CD19D1+D2−トラスツズマブscFv(VH/VL)、配列番号1)、AAV−3(CD19D1+D2−MOC31scFv(VH/VL)、配列番号3)、AAV−5(CD19D1+D2−LY2875358scFv(VH/VL)、配列番号5)及びAAV−7(CD19D1+D2−パニツムマブscFv(VH/VL)、配列番号7)は、それぞれ8.39×1013、1.51×1014、3.03×1014及び2.13×1014GC/mlの力価を有した。0.6ml/ウェルDMEM+2% FBS中で感染を実施し、その際、培地中にウイルスを直接添加した。104(「104」又は「10e4」としても知られる)〜5×106(「5x106」又は「5×10e6」としても知られる)の様々な濃度のウイルスを使用した。翌日、培地をDMEM+10%FBSに交換し、インキュベーションを3又は6日間続けた。
ELISAを用いて上清中の発現分析を調べたが、その際、捕捉のために抗CD19FMC63を、検出のために抗Hisを用いた。手短には、96ウェルプレート(Pierce,Cat#15041)を0.1M炭酸塩、pH9.5中の1.0μg/mlの試薬で一晩4℃において被覆した。次に、プレートをTBS(200μl/ウェル)中の0.3%脱脂粉乳(NFD)で1時間RTにおいて遮断した。続いて、プレートを洗浄バッファー(1×TBST:0.1M Tris、0.5M NaCl、0.05%Tween20)で3回洗浄した。1ウェル当たり100μlの非希釈細胞培養物上清又は段階的3×希釈物を含む1.0μg/mlの精製済タンパク質から滴定を実施し、RTで1時間インキュベートした。希釈バッファーは、1×TBS(0.1M Tris、0.5M NaCl)中の1%BSAであり、続いて洗浄バッファーで3回洗浄する。1μg/ml濃度のビオチン化試薬などの二次試薬をRTで1時間(必要に応じて)添加した。HRP−共役試薬を1:2000で添加し、1ウェル当たり100μl塗布して、RTの暗所において1時間インキュベートした。1ウェル当たり100μlの1−Step Ultra TMB−ELISA(Thermo Fisher,Prod♯34028)を添加した。発色が起こったとき、プレートを405nmで読み取った。
XTT試薬のアリコート及び活性化試薬を使用前に37℃で急速解凍した。次に、0.1mlの活性化試薬を5.0mlのXTT試薬に添加した。続いて、50μlの活性化−XTT溶液を各ウェルに添加した。プレートを細胞培養インキュベータ内に2〜4時間配置し、発色についてモニターした。プレートの吸光度を波長450nmで読み取った。細胞死%(別名:細胞傷害性)を以下のように計算した。
殺傷%=[1−OD(実験ウェル−対応するT細胞数)/OD(T細胞−培地を含まない腫瘍細胞)]×100
96ウェルプレート(Pierce、製品#15041)を0.1M炭酸塩バッファー、pH9.5中の1.0μg/mlのマウス抗ヒトIFNγ(BD Pharmingen, Cat♯551221)で一晩4℃において被覆した。次に、トリス緩衝食塩水(TBS)中の0.3%脱脂粉乳溶液200μl/ウェルを用いて、プレートを1時間室温で遮断した。プレートを洗浄バッファー(1×TBS/Tween:0.1M Tris、0.5M NaCl、0.05%Tween20)で3回洗浄した。24時間又は48時間培養プレート(前述参照)からの100μlの培養物上清をELISAプレートに添加した。組換えヒトIFNγ(Thermo Fisher,Cat♯RIFNG100)の滴定も、300ng/mlから段階的3×希釈により2pg/mlまで同じプレート中で実施して標準曲線を作成した。次に、プレートを室温で1時間インキュベートした。希釈バッファーは、1%BSAを含む1×TBS(0.1M Tris、0.5M NaCl)であった。プレートを洗浄バッファーで3回洗浄した。ビオチン化マウス抗ヒトIFNγ(BD Pharmingen, Cat♯554550)を1μg/ml濃度で添加してから、プレートを室温で1時間インキュベートした。プレートをさらに洗浄バッファーで3回洗浄した。HRP共役ストレプトアビジン(Thermo Fisher,Cat♯21130)を原液から1:2000希釈で、1ウェル当たり100μl添加した。次に、プレートを室温の暗所において1時間インキュベートした。プレートをさらに洗浄バッファーで3回洗浄した。1ウェル当たり100μlの1−Step Ultra TMB−ELISA発色溶液(Thermo Fisher,Cat♯34028)を各ウェルに添加した。発色が十分に起こったとき、プレートを波長405nmで読み取った。
図2A〜2Cは、形質導入細胞からの融合タンパク質の発現を示す。図2Aは、融合タンパク質をコードするAAVウイルス粒子によるA431又は293T細胞の形質導入後、融合タンパク質CD19D1+2−トラスツズマブscFv(VH/VL)(AAV#1)の検出が発現されることを示す。発現された融合タンパク質は、抗CD19抗体FMC63に結合されて、抗His抗体とC末端Hisタグとの結合により検出することができる。図2Bは、表示の融合タンパク質コードするAAVウイルス粒子による293T細胞の形質導入から得られた融合タンパク質AAV−3(CD19D1+D2−MOC31scFv(VH/VL)、配列番号3)、AAV−5(CD19D1+D2−LY2875358scFv(VH/VL)、配列番号5)、及びAAV−7(CD19D1+D2−パニツムマブscFv(VH/VL)、配列番号7)の発現の検出を示す。図2Cは、融合タンパク質コードするAAVウイルス粒子によるA431細胞の形質導入から得られた融合タンパク質AAV−3(CD19D1+D2−MOC31scFv(VH/VL)の発現の検出を示す。
Claims (32)
- 融合タンパク質として、腫瘍関連抗原(TAA)又は腫瘍特異的抗原(TSA)及び治療薬に対する抗体又は抗体断片をコードする組換えベクター。
- 前記治療薬が、サイトカイン、ペプチド、タンパク質、抗体、抗体断片、T細胞エンゲージャ及びNK細胞エンゲージャからなる群から選択される、請求項1に記載のベクター。
- 前記治療薬が、神経膠腫関連抗原、癌胎児性抗原(CEA)、β−ヒト絨毛性ゴナドトロピン、αフェトプロテイン(AFP)、レクチン反応性AFP、サイログロブリン、RAGE−1、MN−CA IX、ヒトテロメラーゼ逆転写酵素、RU1、RU2(AS)、腸カルボキシエステラーゼ、mut hsp70−2、M−CSF、プロスターゼ、前立腺特異的抗原(PSA)、PAP、NY−ESO−1、LAGE−la、p53、プロステイン、PSMA、Her2/neu、サバイビン及びテロメラーゼ、前立腺癌腫瘍抗原−1(PCTA−1)、MAGE、ELF2M、好中球エラスターゼ、エフリンB2、CD22、インスリン増殖因子(IGF)−I、IGF−II、IGF−I受容体及びメソテリン、EphA2、HER2、GD2、グリピカン−3、5T4、8H9、ανβ6インテグリン、BCMA、B7−H3、B7−H6、CAIX、CA9、CD19、CD20、CD22、κ軽鎖、CD30、CD33、CD38、CD44、CD44v6、CD44v7/8、CD70、CD123、CD138、CD171、CEA、CSPG4、EGFR、EGFRvIII、EGP2、EGP40、EPCAM、ERBB3、ERBB4、ErbB3/4、FAP、FAR、FBP、胎児性AchR、葉酸受容体a、GD2、GD3、HLA−AI MAGE Al、HLA−A2、ILl lRa、IL13Ra2、KDR、ラムダ、ルイス−Y、MCSP、メソテリン、Mucl、Mucl6、NCAM、NKG2Dリガンド、NY−ESO−1、PRAME、PSCA、PSC1、PSMA、ROR1、サバイビン、TAG72、TEM1、TEM8、VEGRR2、癌胎児性抗原、HMW−MAA、並びにVEGF受容体からなる群から選択される、請求項1に記載のベクター。
- 前記サイトカインが、前記ベクターを含む腫瘍細胞によって分泌され得る、請求項2に記載のベクター。
- ウイルスベクターである、請求項1〜3のいずれか一項に記載のベクター。
- 癌細胞のゲノムに組み込まれる、請求項1〜4のいずれか一項に記載のベクター。
- 前記治療薬が、キメラ抗原受容体(CAR)の抗原である、請求項1〜6のいずれか一項に記載のベクター。
- 前記治療薬がT細胞受容体(TCR)の抗原である、請求項1〜6のいずれか一項に記載のベクター。
- 前記治療薬がADC抗体、ADCC抗体、及び/又は放射線治療用抗体の抗原である、請求項1〜6のいずれか一項に記載のベクター。
- 前記治療薬が、TLRアゴニスト、PAMP、DAMP及び他の刺激因子からなる群から選択される免疫刺激性サイトカイン又は分子である、請求項1〜6のいずれか一項に記載のベクター。
- 前記治療薬が、免疫調節性又は抗腫瘍性を有するペプチドである、請求項1〜6のいずれか一項に記載のベクター。
- 前記TAA又はTSA及び治療薬が融合タンパク質として発現される、請求項1〜11のいずれか一項に記載のベクター。
- 前記TAA又はTSAが、神経膠腫関連抗原、癌胎児性抗原(CEA)、β−ヒト絨毛性ゴナドトロピン、αフェトプロテイン(AFP)、レクチン反応性AFP、サイログロブリン、RAGE−1、MN−CA IX、ヒトテロメラーゼ逆転写酵素、RU1、RU2(AS)、腸カルボキシエステラーゼ、mut hsp70−2、M−CSF、プロスターゼ、前立腺特異的抗原(PSA)、PAP、NY−ESO−1、LAGE−la、p53、プロステイン、PSMA、Her2/neu、サバイビン及びテロメラーゼ、前立腺癌腫瘍抗原−1(PCTA−1)、MAGE、ELF2M、好中球エラスターゼ、エフリンB2、CD22、インスリン増殖因子(IGF)−I、IGF−II、IGF−I受容体及びメソテリン、EphA2、HER2、GD2、グリピカン−3、5T4、8H9、ανβ6インテグリン、BCMA、B7−H3、B7−H6、CAIX、CA9、CD19、CD20、CD22、κ軽鎖、CD30、CD33、CD38、CD44、CD44v6、CD44v7/8、CD70、CD123、CD138、CD171、CEA、CSPG4、EGFR、EGFRvIII、EGP2、EGP40、EPCAM、ERBB3、ERBB4、ErbB3/4、FAP、FAR、FBP、胎児性AchR、葉酸受容体a、GD2、GD3、HLA−AI MAGE Al、HLA−A2、ILl lRa、IL13Ra2、KDR、ラムダ、ルイス−Y、MCSP、メソテリン、Mucl、Mucl6、NCAM、NKG2Dリガンド、NY−ESO−1、PRAME、PSCA、PSC1、PSMA、ROR1、サバイビン、TAG72、TEM1、TEM8、VEGRR2、癌胎児性抗原、HMW−MAA、並びにVEGF受容体からなる群から選択される、請求項1〜12のいずれか一項に記載のベクター。
- 融合タンパク質として、腫瘍発現サイトカイン受容体に対するサイトカイン及び治療薬をコードする組換えベクター。
- 前記サイトカイン受容体がI型受容体又はII型受容体である、請求項14に記載のベクター。
- 請求項1〜15のいずれか一項に記載のベクターを含む組換え腫瘍細胞。
- 1つ又は複数の融合タンパク質を発現する、請求項16に記載の腫瘍細胞。
- 腫瘍関連抗原(TAA)又は腫瘍特異的抗原(TSA)及び治療薬に対する抗体又は抗体断片を含む融合タンパク質を発現することができる組換え腫瘍細胞を生成する方法であって、(a)請求項1〜15のいずれか一項に記載のベクターを腫瘍細胞に導入するステップ;及び(b)前記ベクターが前記腫瘍細胞中に形質導入されるように前記腫瘍細胞を培養するステップを含む方法。
- 前記ベクター及び/又はその成分が前記腫瘍細胞のゲノムに組み込まれる、請求項18に記載の方法。
- 前記TAA又はTSAが、神経膠腫関連抗原、癌胎児性抗原(CEA)、β−ヒト絨毛性ゴナドトロピン、αフェトプロテイン(AFP)、レクチン反応性AFP、サイログロブリン、RAGE−1、MN−CA IX、ヒトテロメラーゼ逆転写酵素、RU1、RU2(AS)、腸カルボキシエステラーゼ、mut hsp70−2、M−CSF、プロスターゼ、前立腺特異的抗原(PSA)、PAP、NY−ESO−1、LAGE−la、p53、プロステイン、PSMA、Her2/neu、サバイビン及びテロメラーゼ、前立腺癌腫瘍抗原−1(PCTA−1)、MAGE、ELF2M、好中球エラスターゼ、エフリンB2、CD22、インスリン増殖因子(IGF)−I、IGF−II、IGF−I受容体及びメソテリン、EphA2、HER2、GD2、グリピカン−3、5T4、8H9、ανβ6インテグリン、BCMA、B7−H3、B7−H6、CAIX、CA9、CD19、CD20、CD22、κ軽鎖、CD30、CD33、CD38、CD44、CD44v6、CD44v7/8、CD70、CD123、CD138、CD171、CEA、CSPG4、EGFR、EGFRvIII、EGP2、EGP40、EPCAM、ERBB3、ERBB4、ErbB3/4、FAP、FAR、FBP、胎児性AchR、葉酸受容体a、GD2、GD3、HLA−AI MAGE Al、HLA−A2、ILl lRa、IL13Ra2、KDR、ラムダ、ルイス−Y、MCSP、メソテリン、Mucl、Mucl6、NCAM、NKG2Dリガンド、NY−ESO−1、PRAME、PSCA、PSC1、PSMA、ROR1、サバイビン、TAG72、TEM1、TEM8、VEGRR2、癌胎児性抗原、HMW−MAA、並びにVEGF受容体からなる群から選択される、請求項18又は19に記載の方法。
- 前記TAA又はTSAがキメラ抗原受容体(CAR)の抗原である、請求項18〜20のいずれか一項に記載の方法。
- 前記TAA又はTSAがT細胞受容体(TCR)の抗原である、請求項18〜20のいずれか一項に記載の方法。
- 前記治療薬がADC抗体、ADCC抗体、及び/又は放射線治療用抗体の抗原である、請求項18〜20のいずれか一項に記載の方法。
- 前記治療薬が、TLRアゴニスト、PAMP、DAMP及び他の刺激因子からなる群から選択される免疫刺激性サイトカイン又は分子である、請求項18〜20のいずれか一項に記載の方法。
- 前記治療薬が、免疫調節性又は抗腫瘍性を有するペプチドである、請求項18〜20のいずれか一項に記載の方法。
- 癌の治療を、それを必要とする個体において行う方法であって、請求項1〜15のいずれか一項に記載のベクターを含む組成物を投与するステップを含む方法。
- 融合タンパク質が発現される、請求項26に記載の方法。
- 前記癌細胞が、前記癌細胞に対する免疫応答を高める治療薬を発現する、請求項26又は27に記載の方法。
- 前記癌細胞が、CARによって認識され得る1つ又は複数のタンパク質又はペプチド抗原を発現する、請求項17又は18に記載の方法。
- 前記癌細胞が、TCRによって認識され得る1つ又は複数のタンパク質又はペプチド抗原を発現する、請求項17又は18に記載の方法。
- 前記癌細胞が、個体の免疫細胞によって認識され得る治療薬を含む1つ又は複数の融合タンパク質を発現する、請求項17又は18に記載の方法。
- 個体へのCAR T細胞の投与をさらに含む、請求項17又は18のいずれか一項に記載の方法。
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