JP2018080194A - 両性イオン性試薬 - Google Patents
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Abstract
Description
試薬の水溶解度の改善、試薬の凝集の阻止、試薬の非特異的な結合の低減、及び血清又は全血におけるサンプル成分と試薬との非特異的な相互作用の低減は、臨床診断アッセイにおける継続的課題である。商用の診断イムノアッセイは、水溶解度が限定されている疎水性の化学発光標識及び蛍光標識を用いることが多く、そして、これら標識は、抗体等のタンパク質の非特異的な結合に悪影響を及ぼすことがある。診断において組換え型タンパク質及びペプチドが使用される機会が増加しており、そして、多くの場合、これらポリペプチドは、水溶解度が低いことに加えて、ミスフォールディング又は変性により不溶性の凝集体を形成する傾向がある。また、試薬は、非特異的にサンプル成分と相互作用する場合があり、これは、アッセイにおいて偽陽性を生じさせる。
前述の目的及び他の目的に従って、驚くべきことに、両性イオン性基を疎水性分子と共有結合させることにより疎水性化合物の特性が改善されて、その親水性、水溶液に対する溶解度が上昇し、その結果、固相との非特異的な結合が減少することが見出された。
(式中、
L1は、場合により20個以下のヘテロ原子で置換されている二価のC1−20アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール又はアラルキル基であり;
L2は、結合、又は場合により10個以下のヘテロ原子で置換されている二価のC1−4アルキル、アルケニル若しくはアルキニル基であり;
Zは、カルボキシレート(−COO−)、スルホネート(−SO3 −)、スルフェート(−OSO3 −)、ホスフェート(−OP(O)(OR)(O−))及びオキシド(−O−)(式中、Rは、場合により20個以下のヘテロ原子で置換されているC1−12アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール又はアラルキルである)からなる群より選択されるアニオン含有基であり;
Y1は、ペプチド、タンパク質又は巨大分子と共有結合を形成するための反応性官能基であって、求電子基、求核基又は光反応性基を含む官能基であり;そして、
R1及びR2は、独立して、各出現時において、それぞれ場合により20個以下のヘテロ原子で置換されているC1−20アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール又はアラルキル基から選択される)
で表される構造を有する。
(式中、
L1及びL3は、独立して、各出現時において、それぞれ場合により20個以下のヘテロ原子で置換されている二価のC1−20アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール又はアラルキル基から選択され;
L2は、結合、又は場合により10個以下のヘテロ原子で置換されている二価のC1−4アルキル、アルケニル若しくはアルキニル基であり;
Zは、カルボキシレート(−COO−)、スルホネート(−SO3 −)、スルフェート(−OSO3 −)、ホスフェート(−OP(O)(OR)(O−))及びオキシド(−O−)(式中、Rは、場合により20個以下のヘテロ原子で置換されているC1−12アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、又はアラルキルである)からなる群より選択されるアニオン含有基であり;
Y1は、被検体、被検体類似体、又は被検体の結合パートナーと共有結合を形成するための反応性官能基であって、求電子基、求核基又は光反応性基を含む官能基であり;
Gは、検出可能な標識であり;そして、
R1は、場合により20個以下のヘテロ原子で置換されているC1−20アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール又はアラルキル基である)
で表される構造を有する。
(式中、Ωは、以下の形態:
の両性イオン含有基であり、
L1及びL4は、独立して、各出現時において、それぞれ場合により20個以下のヘテロ原子で置換されている二価のC1−20アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール又はアラルキル基から選択され;
L2は、結合、又は場合により10個以下のヘテロ原子で置換されている二価のC1−4アルキル、アルケニル若しくはアルキニル基であり;
L5、L6及びL7は、独立して、各出現時において、結合、又はそれぞれ場合により20個以下のヘテロ原子で置換されている二価のC1−20アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール若しくはアラルキル基から選択され;
Qは、炭素原子又は窒素原子から選択されるが、但しQが窒素である場合、L5、L6及びL7は、それぞれ結合ではなく;
Zは、カルボキシレート(−COO−)、スルホネート(−SO3 −)、スルフェート(−OSO3 −)、ホスフェート(−OP(O)(OR)(O−))及びオキシド(−O−)(式中、Rは、場合により20個以下のヘテロ原子で置換されているC1−12アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール又はアラルキルである)からなる群より選択されるアニオン含有基であり;
Y1及びY2は、独立して、各出現時において、求電子基、求核基又は光反応性基を含むペプチド、タンパク質又は巨大分子と共有結合を形成するための反応性官能基から選択され;そして、
R1及びR2は、独立して、各出現時において、それぞれ場合により20個以下のヘテロ原子で置換されているC1−20アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール又はアラルキル基から選択される)
で表される構造を有する。
の両性イオン含有基であり、
そして、
L5、L6及びL7は、それぞれ基−Xa−Ra−(式中、XaはQに結合しており、そして、独立して、各出現時において、結合、酸素、硫黄、アミン、アミド(−C(O)NRN−若しくは−NRN−C(O)−)、エステル(−C(O)−O−若しくは−O−C(O)−)、カルバメート(−NRN−C(O)−O−若しくは−O−C(O)−NRN−)又は尿素(−NRN−C(O)−NRN−)から選択され、そして、RNは、独立して、各出現時において、水素、又は場合により20個以下のヘテロ原子で置換されているC1−20アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール若しくはアラルキル基であり;そして、Raは、独立して、各出現時において、結合、又はそれぞれ場合により20個以下のヘテロ原子で置換されている二価のC1−20アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール若しくはアラルキル基から選択されるが、但し、Qが窒素である場合、Raは結合ではない)である。
(式中、L2は、−(CH2)m−(式中、m=1〜4である)型で表される二価ラジカルであり;そして、Ra及びR*は、独立して、各出現時において、結合、又はそれぞれ場合により20個以下のヘテロ原子で置換されている二価のC1−15アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール若しくはアラルキル基から選択される)
を有し得る。
本発明の1つの目的は、溶解度を改善するため及び/又は非特異的な結合を低減するために疎水性分子を修飾するための両性イオン含有化合物の構造を提供することである。本発明の別の目的は、溶解度を改善するためにビオチン及びフルオレセイン等の検出可能な標識を修飾するための、そして、水溶解度の高い複合体を合成するための両性イオン性リンカーを提供することである。本発明の更に別の目的は、タンパク質、ペプチド及び他の巨大分子の複合体の調製に有用な両性イオン含有架橋試薬を提供することである。
を含んでよい。
(式中、
n=1〜6、好ましくは1〜4、そしてより好ましくは2〜4であり;そして、
m=1〜6、好ましくは1〜4、そしてより好ましくは2〜4である)
を有する。
(式中、
n=1〜6、好ましくは1〜4、そしてより好ましくは2〜4であり;
m=1〜6、好ましくは1〜4、そしてより好ましくは2〜4であり;そして、
r=1〜6、好ましくは1〜4、そしてより好ましくは2〜4である)
を有する。
(式中、
n=1〜6、好ましくは1〜4、そしてより好ましくは2〜4であり;そして、
m=1〜6、好ましくは1〜4、そしてより好ましくは2〜4である)
を有する。
(式中、
n=1〜6、好ましくは1〜4、そしてより好ましくは2〜4であり;そして、
m=1〜6、好ましくは1〜4、そしてより好ましくは2〜4である)
を有する。
(式中、
n=1〜6、好ましくは1〜4、そしてより好ましくは2〜4であり;
m=1〜6、好ましくは1〜4、そしてより好ましくは2〜4であり;そして、
y=1〜6、好ましくは2〜5、そしてより好ましくは3〜5である)
を有する。
(式中、
Ωは、以下の形態:
の両性イオン含有基であり、
Y1及びY2は、例えば、ペプチド、タンパク質、又は巨大分子等の疎水性分子と共有結合を形成するための任意の適切な反応性官能基を含み得る)で表される構造を有する。より具体的には、Y1及び/又はY2は、疎水性分子と複合体を形成するのに適切な任意の求電子基、求核基又は光反応性基を含んでもよい。例えば、Y1及び/又はY2は、被検体を測定又は定量するための生物学的結合アッセイにおける被検体、被検体類似体又は被検体の結合パートナーと共有結合を形成するための反応性官能基を含み得る。特定の態様では、Y1及び/又はY2は、独立して、各出現時において、アミン反応性基、チオール反応性基、カルボキシ反応性基、マレイミジル反応性基、炭水化物反応性基、又は光反応性基から選択される。より具体的には、Y1及びY2に適切な官能基は、例えば、以下:
を含んでよい。
(式中、
n=1〜6、好ましくは1〜4、そしてより好ましくは2〜4であり;
m=1〜6、好ましくは1〜4、そしてより好ましくは2〜4であり;そして、
q=1〜6、好ましくは1〜4、そしてより好ましくは2〜4である)
を有する。
(式中、L2は、−(CH2)m−(式中、m=1〜4である)型で表される二価ラジカルであり;
Ra及びR*は、場合により少なくとも1個のヘテロ原子又はヘテロ原子含有部分で置換されている任意の二価の炭化水素部分であってよい)を有する。例えば、Ra及び/又はR*は、独立して、各出現時において、例えば、場合により窒素、酸素、カルボキシル、アミン、及び/又はカルボニル基等の1〜20個のヘテロ原子又はヘテロ原子含有部分を含むアルキル、アルケニル、アルキニル、アリール又はアルキル−アリール基等のC1−C30炭化水素ラジカルから選択してよい。幾つかの実施形態では、Ra及びR*は、独立して、各出現時において、場合により1〜20、1〜10、1〜5又は1〜3個のヘテロ原子又はヘテロ原子含有部分を含む水素又はC1−C20、C1−C12、C1−C6、C1−C4若しくはC1−C3の炭化水素ラジカルから選択してよい。好ましくは、Ra及びR*は、独立して、各出現時において、結合、又はそれぞれ場合により20個以下のヘテロ原子で置換されている二価のC1−15アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、若しくはアラルキル基から選択される。他の実施形態では、Ra及びR*は、独立して、各出現時において、それぞれ場合により20個以下のヘテロ原子又はヘテロ原子含有部分で置換されている、置換又は非置換の、分枝状又は直鎖の、C1−C20アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール又はアルキル−アリール基からなる群から選択してよく、例えば、制限するものではないが、−(CH2)a−(式中、「a」は1〜20の整数である)型の直鎖アルキル部分、例えば−CH2−、−CH2CH2−、−CH2CH2CH2−又は−CH2CH2CH2CH2−;−O(CH2)aO−又は−O(CH2)aO−(式中、「a」は1〜19の整数である)型の直鎖アルコキシ部分、例えば−CH2O−、又は−OCH2−、−CH2CH2O−又は−OCH2CH2−、−CH2CH2CH2O−又は−OCH2CH2CH2−;−O(CH2)aO−(式中、「a」は上に定義した通りである);あるいは−(CH2)bO(CH2)c−、−(CH2)bS(CH2)c−、又は−(CH2)bNRL(CH2)c−(式中、「b」及び「c」は、独立して、1〜18の整数であり、そして、RLは、それぞれ場合により20個以下のヘテロ原子で置換されているアルキル、アルケニル、アルキニル、アリール又はアルキル−アリール基である)型の部分を含む。
Z2−PFP(化合物1d)の合成
a) 化合物1a
無水トルエン(50mL)中4−ジメチルアミノ酪酸塩酸塩(2g、0.012モル、Aldrich)、p−トルエンスルホン酸(1.53g、1.05当量)及びベンジルアルコール(2.2g、0.0204モル)の混合物を、水を共沸除去しながら窒素雰囲気下で還流させた。2時間後、反応物を室温に冷却し、そして、水(75mL)及び酢酸エチル(50mL)で希釈した。生成物を含有する水溶液を酢酸エチルで3回抽出した(3×50mL)。次いで、水溶液のpHを5%のKOHでpH9に調節し、そして、得られた懸濁液を酢酸エチルで抽出した(2×50mL)。合わせた酢酸エチル抽出物を無水硫酸マグネシウムで乾燥させて、濾過し、そして、減圧下で濃縮して、粘着性の油状物を得た。収量=0.9g(34%)。
[BMIM]BF4](1mL、Aldrich)中化合物1a(0.1g、0.45mmol)、ナトリウム2−ブロモエタンスルホネート(0.19g、2当量)及び2,6−ジ−tert−ブチルピリジン(99μL、0.45mmol)の混合物を、16時間激しく撹拌しながら150℃の油浴中で加熱した。次いで、反応物を室温に冷却し、そして、反応混合物のごく一部を回収し、メタノール/水で希釈し、そして、Phenomenex、C18、4.6×250mmカラム、ならびに流速1.0mL/分の10→70%のMeCN/水(0.05%のTFAを含む)の30分間勾配、ならびに260nm及び220nmのUV検出を使用して、分析的HPLCによって分析した。生成物は、Rt=13.3分で溶離することが観察された(約40%変換)。それを水(15mL)で希釈し、そして、この溶液を酢酸エチル(2×25mL)で洗浄することにより、反応混合物を調製した。次いで、水溶液をアンモニア3〜4滴で処理し、そして、酢酸エチル(2×25mL)で更に抽出した。次いで、回転蒸発により水溶液を約7mLに濃縮した。次いで、YMC、C18、30×250mmカラム、及び流速20mL/分の上記と同じ勾配を使用して、分取HPLCにより生成物を精製した。生成物を含有するHPLC画分を合わせ、減圧下で濃縮した。収量=30mg(20%、白色固体);MALDI-TOF MS 330.6(実測値)。
10%水メタノール(20mL)中化合物1bの溶液を、48時間室温にて5%パラジウム炭素30mg超で水素化させた。次いで、懸濁液を濾過し、触媒を1:1水メタノール(5mL)ですすいだ。合わせた濾液を減圧下で濃縮した。収量=26mg(定量);MALDI-TOF MS 240.5(実測値)。
1:1の0.1N HCl/MeCN(4mL)中化合物1c(25mg、0.104mmol)及びペンタフルオロフェノール(45mg、0.25mmol)の溶液を、EDC.HCl(50mg、2.5当量)で処理した。反応物を室温で撹拌した。1.5時間後に、セクション(b)に記載したHPLC解析により、生成物がRt=17分で溶離することが示された。YMC、C18、30×250mmカラム及び流速20mL/分の上記10→100%のMeOH/水(0.05%のTFAを含む)の30分間勾配を使用して、分取HPLCにより生成物を精製した。27分で溶離する生成物画分を回収し、等体積の水で希釈し、−80℃で凍結させ、凍結乾固させた。収量=13.2mg(31%);MALDI-TOF MS 406.6(実測値)。
Z3−PFP(化合物2c)の合成
a) 化合物2a
無水ジメチルホルムアミド(DMF)(5mL)中化合物1a(0.2g、0.905mmol)の溶液を1,3−プロパンスルトン(0.165g、1.5当量)及び2,6−ジ−tert−ブチルピリジン(0.24mL、1.2当量)で処理した。窒素雰囲気下で150℃にて反応物を加熱した。1時間後、Phenomenex、C18、4.6×250mmカラム、ならびに流速1.0mL/分の10→40%のMeCN/水(0.05%のTFAを含む)の40分間勾配、ならびに260nm及び220nmのUV検出を使用して、HPLC分析を実施した。生成物は、Rt=14分で、出発物質はRt=13分で溶離することが観察された。反応を室温に冷却し、減圧下で溶媒を除去した。残渣を酢酸エチル(50mL)と水(50mL)の間で分配した。水溶液を分離し、酢酸エチル(2×50mL)で洗浄した。水溶液をアンモニア5滴で処理し、そして、酢酸エチル(2×25mL)で更に抽出した。次いで、減圧下で水溶液を濃縮して、粘着質のゴム状物を得た。収量=0.35g;MALDI-TOF MS 344.3(実測値)。
メタノール(40mL)中化合物2a(0.42g、1.22mmol)の溶液を、10%のパラジウム炭素0.25gで処理した。懸濁液を室温にて2時間40psiでParrシェーカー内にて水素化した。次いで、反応物を濾過し、メタノール溶液を減圧下で濃縮して、白色の固体を得た。
収量=0.234g(定量);MALDI-TOF MS 254.3(実測値)。
0.1N HCl/MeCNの1:1混合物(6mL)中化合物2b(0.114g、0.45mmol)の溶液を、ペンタフルオロフェノール(0.125g、1.5当量)及びEDC/HCl(0.230g、2.5当量)で処理した。反応物を室温で撹拌した。1時間後、Phenomenex、C18、4.6×250mmカラム、ならびに流速1.0mL/分の10→60%のMeCN/水(0.05%のTFAを含む)の40分間勾配、ならびに260nm及び220nmのUV検出を使用して、HPLC分析を実施した。生成物は、Rt=18分で溶離することが観察された。YMC、C18、30×250mmカラム及び流速20mL/分の上記10→60%のMeCN/水(0.05%のTFAを含む)の40分間勾配を使用して、HPLCにより粗反応混合物を精製した。生成物を含有するHPLC画分を−80℃で凍結させ、そして、凍結乾固させた。収量=78mg(41%);MALDI-TOF MS 420(実測値)。
Z4−PFP(化合物3c)の合成
a) 化合物3a
無水DMF(5mL)中化合物1a(0.15g、0.68mmol)及び1,4−ブタンスルトン(0.185g、2当量)の混合物を、16時間窒素雰囲気下で140〜145℃にて加熱した。次いで、反応物を室温に冷却し、減圧下で溶媒を除去した。残渣を水(30mL)と酢酸エチル(30mL)との間で分配した。水層を酢酸エチル(30mL)で1回洗浄した。次いで、水溶液をアンモニア2滴で処理し、そして、酢酸エチル(30mL)で更に抽出した。Phenomenex、C18、10×250mm「PRODIGY」カラム、及び流速4.0mL/分の10→40%のMeCN/水(0.05%のTFAを含む)の40分間勾配、及び260nmのUV検出を使用して、HPLC分析を実施した。生成物は、Rt=20分で非常にシャープなピークとして溶離し、Rt=25分でごく微量の出発物質が溶離することが観察された。減圧下で水溶液を濃縮して、茶色の粘着質の固体を得た。収量=0.3g;MALDI-TOF MS 358.2(実測値)。
粗化合物3a(0.3g、0.84mmol)をメタノール(25mL)に溶解させ、5%プラチナ炭素(0.3g)で処理した。バルーンを使用して、室温で3日間室温にて反応物を水素化した。次いで、反応物を濾過し、触媒をメタノール(10mL)ですすいだ。減圧下でメタノール溶液を濃縮して、粘着質の固体を得た。収量=0.245g(定量);MALDI-TOF MS 268.3(実測値)。
1:1の0.1N HCl/MeCN(6mL)中化合物3b(0.16g、0.6mmol)及びペンタフルオロフェノール(0.165g、1.5当量)の溶液を、EDC.HCl(0.286g、2.5当量)で処理した。反応物を室温で撹拌した。1時間後、Phenomenex、C18、4.6×250mmカラム、及び流速1.0mL/分の10→70%のMeCN/水(0.05%のTFAを含む)の30分間勾配、及び260nmのUV検出を使用して、HPLC分析を実施した。生成物は、Rt=19分で溶離することが観察された。YMC、C18、30×250mmカラム及び流速20mL/分の上記10→100%のMeOH/水(0.05%のTFAを含む)の30分間勾配を使用して、HPLCにより粗反応混合物を精製した。生成物を含有するHPLC画分を2体積の水で希釈し、−80℃で凍結させ、そして、凍結乾固させた。収量=120mg(46%);MALDI-TOF MS 434.5(実測値)。
ZPB−PFP(化合物4c)の合成
a) 化合物4a
[BMIM][BF4](1mL)の中化合物1a(0.1g、0.45mmol)、及びn−プロピルシクロホスフェートエステル(0.112g、1.5当量、Peresypkin and MengerによるOrg. Lett. 1999, 9, 1347-1350に記載の通り1,3,2−ジオキサホスホラン−2−オキシド及びn−プロパノールから合成)の混合物を150℃で3時間加熱した。次いで、反応物を室温に冷却し、そして、その一部(5μL)を回収し、メタノール(0.1mL)で希釈し、そして、Phenomenex、C18、4.6×250mmカラム、及び流速1.0mL/分の10→70%のMeCN/水(0.05%のTFAを含む)の30分間勾配、及び260nmのUV検出を使用して、HPLCによって分析した。生成物(>50%変換)はRt=21分で溶離することが観察された。次いで、実施例1のセクション(b)に記載の通り反応混合物を処理した。YMC、C18、30×250mmカラム及び流速20mL/分の上記10→100%のMeOH/水(0.05%のTFAを含む)の30分間勾配を使用して、HPLCにより粗反応混合物を精製した。生成物を含有するHPLC画分を減圧下で濃縮した。収量=100mg(57%);MALDI-TOF MS 388.9(実測値)。
メタノール(20mL)中化合物4a(0.1g、0.26mmol)の溶液を5%プラチナ炭素0.1gで処理し、バルーンを用いて室温で水素化した。16時間後、反応物を濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。収量=78mg(定量);MALDI-TOF MS 298.3(実測値)。
1:1の0.1N HCl/MeCN(4mL)中化合物4b(40mg、0.134mmol)及びペンタフルオロフェノール(37mg、1.5当量)の溶液を、EDC.HCl(64mg、2.5当量)で処理した。反応物を室温で撹拌した。1時間後、Phenomenex、C18、4.6×250mmカラム、及び流速1.0mL/分の10→70%のMeCN/水(0.05%のTFAを含む)の30分間勾配、及び260nmのUV検出を使用して、HPLC分析を実施した。生成物は、Rt=26分で溶離することが観察された。YMC、C18、30×250mmカラム及び流速20mL/分の上記10→70%のMeCN/水(0.05%のTFAを含む)の30分間勾配を使用して、HPLCにより粗反応混合物を精製した。生成物を含有するHPLC画分を−80℃で凍結させ、そして、凍結乾固させた。収量=5.5mg(9%);MALDI-TOF MS 464.4(実測値)。
Z−NH2(化合物5c)の合成
a) 化合物5a
クロロホルム(25mL)中N−(ベンジルオキシカルボニルオキシ)スクシンイミド(6.30g、24.79mmol、Aldrich)の撹拌溶液を、0℃で窒素雰囲気下にて、クロロホルム(15mL)に溶解しているN,N−ジメチルエチレンジアミン(2.00g、21.55mmol)の溶液に滴下した。反応混合物を0℃で1時間攪拌し、次いで、室温で1時間攪拌した。得られた反応混合物をクロロホルム(40mL)で希釈し、飽和水性重炭酸ナトリウム(3×20mL)で洗浄した。有機層を分離し、無水硫酸ナトリウム上で乾燥させた。濾液を濃縮して、わずかにピンク色の油状物として望ましい生成物5.16gを得た。MALDI-TOF MS 223.5(実測値)。
化合物5a(1.00g、4.5mmol)を封管内の無水酢酸エチル(5mL)に溶解させ、窒素雰囲気下で3−プロパンスルトン(1.10g、9.0mmol)を添加した。封管を16時間かけて90℃に加熱し、次いで室温に冷却した。白色の沈殿物を濾過し、無水酢酸エチル(20mL×3)で洗浄した。得られた白色の固体を高真空下で乾燥させて、望ましい生成物1.31g(85%)を得た。MALDI-TOF MS 344.9(実測値)。
化合物5b(580mg、1.7mmol)をメタノール/水(95/5、40mL)に溶解させ、そして、10%パラジウム活性炭(58mg)を添加した。反応物を室温で4時間バルーンを使用して水素化した。次いで、反応混合物を濾過し、そして、濾液を濃縮乾固させて、白色の固体として望ましい生成物を得た。MALDI-TOF MS 211(実測値)。
Z−マレイミド−1(化合物6b)の合成
無水THF(5mL)中メトキシカルボニルマレイミド(0.183g、0.0012モル、Keller and Rudinger Hel. Chim. Acta. 1975, 58, 531-541)の溶液を、N,N−ジメチルエチレンジアミン(64μL、0.5当量)で処理した。反応物を室温で撹拌し、そして、1時間後、溶離剤としてMeOHを用いるシリカでのTLCによって、極性生成物6a(Rf約0.2、すじ状)の形成が示された。粗反応混合物のMALDI-TOF質量分光分析は、169.5において強い生成物イオンを示した。ガラスウールによって反応混合物を濾過し、濾液を蒸留プロパンスルトン(0.288g、2当量)で処理した。4〜5時間窒素雰囲気下で反応物を還流させた。反応において白色の固体が形成されたことが観察された。反応物を酢酸エチル(10〜15mL)で希釈し、36時間冷蔵庫で冷却して、沈殿を完了させた。次いで、濾過により生成物を回収し、そして、酢酸エチル(5mL)ですすいだ。次いで、粘着質の固体を水(10mL、0.05%のTFAを含有)に溶解させた。MALDI-TOF質量分光分析は、291.5において生成物を表す強いイオンを示し、そして、出発物質は示されなかった。水溶液を−80℃で凍結させ、凍結乾燥させて、白色のふわふわした粉末を得た。収量=53mg(20%);
Z−マレイミド−2(化合物7a)の合成
無水ジメチルスルホキシド(1mL)中化合物5c(21.0mg、0.1mmol)及び4−マレイミド酪酸(18.3mg、0.1mmol)の溶液に、ジイソプロピルエチルアミン(35μL、0.2mmol)及びBOP試薬(66.2mg、0.15mmol)を添加した。反応物を1時間室温で撹拌した。YMC、C18、30×250mmカラム及び流速20mL/分の上記0→40%のMeCN/水(0.05%のTFAを含む)の40分間勾配を使用して、HPLCにより粗反応混合物を精製した。生成物を含有するHPLC画分を−80℃で凍結させ、そして、凍結乾固させた。収量=43mg(定量);MALDI-TOF MS 376.7(実測値)。
Z−ジアミン(化合物8c)及びZ−ジ−NHS(化合物8d)の合成
a) 化合物8a
クロロホルム(40mL)中N,N−ビス(3−アミノプロピル)メチルアミン(1g、6.9mmol、TCI)の溶液をベンジルオキシカルボニルスクシンイミド(3.78g、2.2当量)で処理した。反応物を16時間室温で撹拌した。酢酸エチル中15%メタノールを使用して反応混合物をシリカでのTLCで分析することにより、透明な反応物中に極性生成物が形成されたことが示された。反応混合物をクロロホルム(40mL)で希釈し、飽和重炭酸ナトリウム水溶液で洗浄した。次いで、無水硫酸マグネシウム上でそれを乾燥して、濾過し、そして、減圧下で濃縮して、保存中に固化してろう状の固体になる粘着性の油状物を得た。収量=3.2g;MALDI-TOF MS 414.4(実測値)。
無水DMF(15mL)中化合物8a(1.2g、2.9mmol)の溶液を1,3−プロパンスルトン(0.71g、2当量)で処理した。反応物を1時間窒素下で145℃にて加熱した。Phenomenex、C18、4.6mm×25cmカラム、及び流速1.0mL/分の10→70%B(A=0.05%TFAを含む水、B=0.05%TFAを含むMeCN)の30分間勾配、及び260nmのUV検出を使用して、反応混合物のごく一部をHPLC分析した。生成物は、Rt=19.6分(約80%変換)で、出発物質はRt=21.6分で溶離することが観察された。反応混合物を減圧下で濃縮し、回収した油状物をメタノール(20mL)に溶解させた。40%のメタノール、60%の酢酸エチルを使用するシリカでのTLC分析により、出発物質(Rf約0.3)から純粋な生成物(Rf約0.2)が分離されたことが示された。同じ規模で上記反応を繰り返し、そして、合わせた反応混合物を40%のメタノール、60%の酢酸エチルを溶離剤として使用するシリカでのフラッシュクロマトグラフィーにより精製した。収量=1.55g(60%);白色の発泡体;MALDI-TOF MS 536.4(実測値)。
24時間室温で33%HBr/AcOH15mL中にて、化合物8b(0.8g、1.49mmol)を撹拌した。次いで、エーテル(100mL)を添加したところ、白色の粒状固体が分離した。生成物を沈降させ、エーテルをデカンタした。エーテルで2回(2×50mL)この工程を繰り返した。最後に、真空下で生成物を乾燥させた。回収した粘着性の油状物を5〜6mLの水に溶解させ、−80℃で凍結させ、そして、凍結乾固させてガラス質の固体を得た。収量=0.766g(定量);MALDI-TOF MS 268.2(実測値)。25%のアンモニア、75%のメタノール及び可視化用のニンヒドリンを使用するシリカでのTLC分析により、Rf約0.2のシングルスポットが示された。
DMSO(1mL)中化合物8c(25mg、56μmol)の溶液をジイソプロピルエチルアミン(39μL、4当量)で処理し、この溶液をDMSO(2mL)中ジスクシンイミジルカーボネート(96mg、0.37mmol)の溶液に滴下した。反応物を室温で撹拌した。30分間後、Phenomenex、C18、4.6mm×25cmカラム、及び流速1.0mL/分の10→40%B(A=0.05%TFAを含む水、B=0.05%TFAを含むMeCN)の30分間勾配、及び220nmのUV検出を使用して、反応混合物の一部をHPLCによって分析した。生成物は、Rt=10分で溶離することが観察された。YMC、C18、30×250mmカラム及び流速20mL/分の上記0→40%のMeCN/水(0.05%のTFAを含む)の40分間勾配を使用して、HPLCにより粗反応混合物を精製した。生成物を含有するHPLC画分を−80℃で凍結させ、そして、凍結乾固させた。収量=15mg(50%);MALDI-TOF MS 549.8(実測値)。
Z−マレイミド−NHS(化合物9e)の合成
a) 化合物9a
無水DMSO(2mL)中化合物5c(105mg、0.5mmol)の溶液をトリエチルアミン(70μL、0.5mmol)及びN−α−t−BOC−N−ε−CBZ−リシン−N−ヒドロキシスクシンイミドエステル(239mg、0.5mmol、Aldrich)で処理した。懸濁液を24時間室温で撹拌し、次いで、YMC、C18、50×4.0mm、3ミクロンカラム、及び流速1.0mL/分の10→90%のMeCN/水(0.05%のTFAを含む)の10分間勾配、及び260nmのUV検出を使用して、HPLCにより分析した。生成物は、Rt=6.2分で溶離することが観察された。YMC、C18、30×250mmカラム及び流速20mL/分の10→70%のMeCN/水(0.05%のTFAを含む)の30分間勾配を使用して、分取HPLCにより生成物を精製した。生成物画分を回収し、そして、−80℃で凍結させ、凍結乾燥させた。白色の粉末として生成物を得た。収量=225mg(79%);MALDI-TOF MS 572.6(実測値)。
MeOH及びH2O(20mL、95/5)の混合物に化合物9a(200mg、0.35mmol)を添加した。次いで、10%Pd/C(20mg)を添加した。得られた懸濁液を、バルーンを用いて室温で4時間水素化した。次いで、反応混合物を濾過した。室温で減圧下にて濾液を濃縮した。透明な油状物として望ましい生成物を得た。収量=176mg(定量);MALDI-TOF MS 440.3(実測値)。
無水DMSO(4mL)中化合物9b(176mg、0.4mmol)の溶液を、4−マレイミド酪酸N−ヒドロキシスクシンイミドエステル(50mg、0.178mmol、Thermo)及びトリエチルアミン(54μL、0.4mmol)で処理した。反応物を室温で撹拌した。1〜2時間後、Phenomenex、C18、4.6×250mmカラム、ならびに流速1.0mL/分の0→40%のMeCN/水(0.05%のTFAを含む)の40分間勾配、ならびに260nm及び220nmのUV検出を使用して、HPLC分析を実施した。生成物は、Rt=27.5分で溶離することが観察された。YMC、C18、30×250mmカラム及び流速20mL/分の0→40%のMeCN/水(0.05%のTFAを含む)の40分間勾配を使用して、HPLCにより粗反応混合物を精製した。生成物を含有するHPLC画分を−80℃で凍結させ、そして、凍結乾固させた。収量=45mg(40%);MALDI-TOF MS 604.9(実測値)。
トリフルオロ酢酸(2mL)中化合物9c(25mg、41μmol)の溶液を3時間氷浴中で撹拌した。次いで、無水エーテル(75mL)を反応混合物に添加して、生成物を沈殿させ、これを濾過により回収し、そして、エーテルですすいだ。次いで、生成物をメタノール(15〜20mL)に溶解させ、実施例9のセクション(c)に記載の通りHPLCによって分析した。生成物は、Rt=13.7分で溶離することが観察された(完全に変換)。メタノール溶液を無水トルエン(10mL)で希釈し、次いで、減圧下で濃縮して、白色の粘着質の固体を得た。収量=45mg(定量);MALDI-TOF MS 504.4(実測値)。
無水DMSO(2mL)中の粗化合物9d(24mg、38.6μmol)及びジスクシンイミジルグルタレート(50mg、4当量、Thermo)の溶液を、トリエチルアミン(6μL、1.1当量)で処理した。反応物を室温で撹拌した。15分後に、実施例9のセクション(c)に記載の通りHPLC分析を行った。生成物は、Rt=24分で溶離することが観察された。実施例9のセクション(c)に記載の通り、分取HPLCにより生成物を精製した。生成物を含有するHPLC画分を−80℃で凍結させ、そして、凍結乾固させた。収量=8mg(30%);MALDI-TOF MS 717.1(実測値)。
ビオチン−Z−NH2(化合物10a)及びビオチン−Z−NHS(化合物10b)の合成
a) 化合物10a
無水DMF(1.5mL)中ビオチン−p−ニトロフェニルエステル(11mg、30μmol)の溶液を、水(0.8mL)及び0.1M炭酸ナトリウム pH9(1.0mL)の混合物に溶解している化合物8c(40mg、89.4μmol、HBr塩)の撹拌溶液に滴下した。反応物を室温で撹拌した。30分間後、Phenomenex、C18、4.6mm×25cmカラム、及び流速1.0mL/分の0→40%B(A=0.05%TFAを含む水、B=0.05%TFAを含むMeCN)の40分間勾配、及び220nmのUV検出を使用して、反応混合物のごく一部をHPLC分析した。生成物は、Rt=13分で溶離することが観察された。上記勾配を用いて実施例4のセクション(c)に記載の通り、分取HPLCにより生成物を精製した。生成物を含有するHPLC画分を減圧下で濃縮した。収量=18.2mg(定量);MALDI-TOF MS 494(実測値)。
メタノール(2mL)中化合物10a(18.2mg、37μmol)の溶液を、ジイソプロピルエチルアミン(32.2μL、5当量)及び無水グルタル酸(21mg、5当量)で処理した。反応物を室温で撹拌した。30分間後、セクション(d)に記載したHPLC分析により、生成物がRt=17.5分で溶離することが示された。0→40%MeCN/水(0.05%TFAを含む)の40分間勾配を用いて実施例4のセクション(c)に記載の通り、分取HPLCにより生成物を精製した。生成物を含有するHPLC画分を減圧下で濃縮した。収量=19.7mg(88%);MALDI-TOF MS 608.5(実測値)。
無水DMF(1mL)中化合物10b(19.7mg、32.4μmol)の溶液を、ジイソプロピルエチルアミン(11.3μL、2当量)及びTSTU(15mg、1.5当量)で処理した。反応物を室温で撹拌した。15分間後、実施例10のセクション(a)に記載したHPLC分析により、生成物がRt=22分で溶離することが示された。0→40%MeCN/水(0.05%TFAを含む)の40分間勾配を用いて実施例4のセクション(c)に記載の通り、分取HPLCにより生成物を精製した。生成物を含有するHPLC画分を−80℃で凍結させ、そして、凍結乾固させて、白色のふわふわした粉末を得た。収量=6.3mg(28%);MALDI-TOF MS 705(実測値)。
フルオレセイン−Z−NH2(化合物11a)、フルオレセイン−Z−NHS(化合物11c)、フルオレセイン−Z−3−CMO−プロゲステロン(化合物11d)、及びフルオレセイン−Z−22−CMO−FK506(化合物11e)の合成
a) 化合物11a
DMF(1mL)中カルボキシフルオレスセイン−NHSエステル(5及び6つの異性体、10mg、21.1μmol)の溶液を、25%のDMF、75%の0.1M炭酸ナトリウム(pH9)1.5mLに溶解している化合物8a(28mg、62.6μmol、HBr塩)の撹拌溶液に滴下した。反応物を室温で撹拌した。30分間後、Phenomenex、C18、4.6mm×25cmカラム、及び流速1.0mL/分の0→70%B(A=0.05%TFAを含む水、B=0.05%TFAを含むMeCN)の30分間勾配、及び260nmのUV検出を使用して、反応混合物のごく一部をHPLC分析した。生成物は、Rt=12.5分で溶離することが観察された。YMC、C18、30×250mmカラム及び流速20mL/分の上記10→70%のMeCN/水(0.05%のTFAを含む)の30分間勾配を使用して、HPLCにより粗反応混合物を精製した。生成物を含有するHPLC画分を減圧下で濃縮した。収量=12.3mg(93%);MALDI-TOF MS 626.4(実測値)。
メタノール(2mL)中化合物9a(12.3mg、19.6μmol)の溶液を、ジイソプロピルエチルアミン(17μL、5当量)及び無水グルタル酸(11mg、5当量)で処理した。反応物を室温で撹拌した。30分間後、Phenomenex、C18、4.6mm×25cmカラム、及び流速1.0mL/分の10→70%B(A=0.05%TFAを含む水、B=0.05%TFAを含むMeCN)の30分間勾配、及び260nmのUV検出を使用して、反応混合物のごく一部をHPLC分析した。Rt=17.5分(フェノールで反応)で溶離する副生成物とともに、生成物がRt=14.5分で溶離されることが観察された。0.5M水性ピペリジン0.2mLで反応混合物を処理し、30分間撹拌した。後続のHPLC分析により、フェノールエステルが完全に加水分解されており、Rt=14.5分で溶離する純粋な生成物が形成されたことが示された。YMC、C18、30×250mmカラム及び流速20mL/分の上記10→70%のMeCN/水(0.05%のTFAを含む)の30分間勾配を使用して、HPLCにより粗反応混合物を精製した。生成物を含有するHPLC画分を減圧下で濃縮した。収量=8.1mg(56%);MALDI-TOF MS 739.8(実測値)。
無水DMF(2mL)中化合物9b(12.3mg、16.6μmol)の溶液を、N−ヒドロキシスクシンイミド(9.6mg、5当量)及びEDC.HCl(10mg、3当量)で処理した。反応物を室温で撹拌し、そして、30分間後、Phenomenex、C18、4.6mm×25cmカラム、及び流速1.0mL/分の0→70%B(A=0.05%TFAを含む水、B=0.05%TFAを含むMeCN)の30分間勾配、及び260nmのUV検出を使用して、反応混合物のごく一部をHPLC分析した。生成物(約30%変換)はRt=16分で溶離することが観察された。更なるEDC.HCl(10mg、3当量)を添加し、そして、反応を継続した。2時間後のHPLC分析により、約70%の変換が示された。YMC、C18、30×250mmカラム及び流速20mL/分の上記10→70%のMeCN/水(0.05%のTFAを含む)の30分間勾配を使用して、HPLCにより粗反応混合物を精製した。生成物を含有するHPLC画分を−80℃で凍結させ、そして、凍結乾固させた。収量=10mg(71%);MALDI-TOF MS 836.6(実測値)。
プロゲステロン−3−CMO(8.1mg、21μmol)の無水DMF(1mL)溶液に、化合物11a(13mg、21μmol)、ジイソプロピルエチルアミン(7.3μL、42μmol)及びBOP試薬(13.8mg、31μmol)を添加した。反応物を24時間室温で撹拌し、次いで、YMC、C18、50×4.0mm、3ミクロンカラム及び流速1.0mL/分の10→90%のMeCN/水(0.05%のTFAを含む)の10分間勾配、及び260nmのUV検出を使用して、HPLCにより分析した。生成物は、Rt=7.8分で溶離することが観察された。YMC、C18、30×250mmカラム及び流速20mL/分の上記10→90%のMeCN/水(0.05%のTFAを含む)の30分間勾配を使用して、分取HPLCにより生成物を精製した。生成物画分を回収し、そして、−80℃で凍結させ、凍結乾燥させた。黄色の粉末を得た。収量=14.4mg(70%);MALDI-TOF MS 995.1(実測値)。
無水ジメチルホルムアミド(0.5mL)に、FK506−C22−CMO(8.8mg、10μmol、国際公開第93/25533号)、11a(7.5mg、12μmol)、ジイソプロピルエチルアミン(4.4μL、25μmol)及びBOP試薬(8.9mg、20μmol)を添加した。混合物を24時間室温で撹拌した。次いで、Phenomenex Luna PFP(2)、150×4.6mm、3ミクロンカラム、ならびに流速1.0mL/分の10→90%MeCN/水(0.05%のTFAを含む)の20分間勾配、ならびに260nm及び220nmのUV検出を使用して、反応混合物をHPLCにより分析した。生成物は14.8〜5.1分で溶離し、そして、出発物質は17.8分で溶離した。YMC、C18、30×250mmカラム及び流速20mL/分の上記10→90%のMeCN/水(0.05%のTFAを含む)の30分間勾配を使用して、反応混合物を精製した。生成物を含有するHPLC画分を−80℃で凍結させ、そして、凍結乾固させた。望ましい生成物として黄色の粉末(8.2mg)を得た(MALDI-TOF MS: MH+ 1484.30、収率55%)。
両性イオンを用いる疎水性ペプチドの標識
以下は、図3bに示す通り、Z3−PFP(化合物2c)を用いてペンタ(フェニルアラニン)を標識するための例示的な手順である。
Z−ジ−NHS(化合物8d)を用いるペンタ(フェニルアラニン)とPhe-Gly-Gly-Pheとの複合体形成
a) 化合物13a
無水ジメチルスルホキシド(2mL)中化合物8d、Z−ジ−NHS(4.5mg、8.3μmol)の溶液を、ジイソプロピルエチルアミン(2μL、11.4μmol)とともにペンタ(フェニルアラニン)(2mg、2.7μmol)に添加した。反応物を室温で撹拌した。16時間後、Phenomenex、C18、4.6mm×25cmカラム、ならびに流速1.0mL/分の10→100%MeCN/水(0.05%TFAを含む)の30分間勾配、ならびに220nm及び260nmのUV検出を使用して、反応混合物をHPLC分析した。生成物13a(約65%変換)はRt=17分で溶離することが観察された。YMC、C18、30×250mmカラム及び流速20mL/分の上記10→100%のMeCN/水(0.05%のTFAを含む)の30分間勾配を使用して、HPLCにより粗反応混合物を精製した。生成物を含有するHPLC画分を−80℃で凍結させ、そして、凍結乾固させた。収量=2.0mg(64%);MALDI-TOF MS 1187.8(実測値)。
ジメチルスルホキシド(2.5mL)中化合物13a(2mg、1.68μmol)、Phe-Gly-Gly-Phe(3.6mg、5当量)及びジイソプロピルエチルアミン(1.5μL、5当量)の混合物を室温で撹拌した。1時間後に、実施例13のセクション(a)に記載の通りHPLC分析を行った。生成物13bは、Rt=19分で溶離することが観察された。セクション(a)に記載の通り生成物を精製した。収量=1.6mg(63%);MALDI-TOF MS 1500.2(実測値)。
Z−マレイミド−NHS(化合物9e)を用いるペンタ(フェニルアラニン)とCys-Glyとの複合体形成
無水DMF(3mL)中ペンタ(フェニルアラニン)(8mg、11.2μmol)及び化合物9e(4mg、5.6μmol)の溶液をトリエチルアミン(4μL、4当量)で処理した。反応物を16時間室温で撹拌し、次いで、Phenomenex、C18、4.6mm×25cmカラム及び流速1.0mL/分の10→100%のMeCN/水(0.05%のTFAを含む)の30分間勾配、ならびに220及び260nmのUV検出を使用して、HPLCにより分析した。生成物14aはRt=18.4分で溶離することが観察された(MALDI-TOF MS 1355.8(実測値))。Rt=10分で溶離する出発物質9eは完全に消費されていた。反応混合物に、ジペプチドCys-Gly(2mg、11.1μmol)を添加した。反応物を室温で撹拌した。20分後、HPLC解析は、Rt=16.5分で溶離する純粋なヘプタペプチド14bが形成されたことを示したが、Rt=18.4分で14aは溶離しなかった。YMC、C18、30×250mmカラム及び流速20mL/分の上記10→100%のMeCN/水(0.05%のTFAを含む)の30分間勾配を使用して、HPLCによりヘプタペプチドを精製した。生成物を含有するHPLC画分を−80℃で凍結させ、そして、凍結乾固させた。収量=8.8mg(定量)、MALDI-TOF MS 1535.3(実測値)。
アクリジニウムエステル及び両性イオン標識1d、2c、3c、及び4cを用いたBSAの標識の一般手順(表1)
0.1M重炭酸ナトリウム1mL中BSA(4mg、60nmol)の溶液を、DMF溶液(DMF中2mg/mL溶液72μL)として添加される5当量の2’,6’−ジメチル−4’−N−スクシンイミジルオキシカルボニル)フェニル10−(3’−スルホプロピル)−アクリジニウム−9−カルボキシレート(NSP-DMAE-NHS)で処理した。反応物を4時間室温で撹拌した。次いで、4mLのamiconフィルタ(カットオフMW 30,000)に反応物を移し、脱イオン水3mLで希釈した。8分間4000Gでフィルタを遠心分離して、体積を約0.25mLに減らした。最終複合体を脱イオン水で0.8mLに希釈して、5mg/mLの溶液を得た。マトリクスとしてシナピン酸を用いるMALDI-TOF質量分光法によって測定されたアクリジニウムエステル標識取込みでは、1.4標識の取込みが示された。
アクリジニウムエステル及び両性イオン標識Z3−PFP(化合物2c)を用いるタンパク質の標識の一般手順(表2)
0.1M炭酸ナトリウム(pH9)1mL中において、卵白アビジン(AVD)、ウシガンマグロブリン(BGG)及びウシフィブリノゲン(FBN)の2mg/mL溶液を調製した。次いで、米国特許第5,656,246号にNatrajanらによって記載されている10当量のNSP-DMAE-NHS(DMSO溶液の形態で添加された)でタンパク質溶液を処理した。具体的には、DMSO中アクリジニウムエステルの2mg/mL溶液を調製し、そして、89μL、40μL及び18μLのこの溶液を、それぞれAVD、BGG及びFBNに添加した。反応物を3時間4℃で撹拌した。各反応物の一部(0.5mL)を25当量のZ3−PFP(化合物2c)(DMSO溶液の形態で添加した)で更に処理した。具体的には、DMSO中Z3−PFPの5mg/mL溶液を調製し、そして、32μL、14μL及び6μLのこの溶液を、それぞれアクリジニウムエステルで標識されたAVD、BGG及びFBNに添加した。反応物を16時間4℃で撹拌した。次いで、6つの複合体全てをそれぞれ0.1Mのホスフェート(pH7.4)0.5mLで希釈し、4mLのcentriconフィルタに移した。更に3mLのバッファで複合体を希釈し、7分間4000Gで遠心分離して、体積を約0.2mLに減らした。この工程を更に2回繰り返した。最終複合体をリン酸バッファで総体積0.5〜1.0mLに希釈し、そして、4℃で保存した。
非特異的な結合の測定
それぞれNSP-DMAE及び両性イオン標識Z3−PFPで標識された3つのタンパク質アビジン、ウシガンマグロブリン及びフィブリノゲンの非特異的結合率(fNSB)を測定し、そして、NSP-DMAEのみで標識された3つの同じタンパク質の非特異的結合と比較した。0.1モル濃度のナトリウムN−(2−ヒドロキシエチル)ピペラジン−N’−2−エタンスルホネート(HEPES)、0.15モル濃度の塩化ナトリウム、7.7ミリモル濃度のアジ化ナトリウム、1.0ミリモル濃度のエチレンジアミン四酢酸四ナトリウム(EDTA)、12ミリモル濃度のt−オクチルフェノキシポリエトキシエタノール(TritonX-100)、76マイクロモル濃度のウシ血清アルブミン、7ミリモル濃度のマウス免疫グロブリン(pH7.7)からなる溶液中10ナノモル濃度の当量濃度になるように複合体を希釈した。これら10ナノモル濃度のタンパク質−アクリジニウムエステル溶液100マイクロリットルを、それぞれ、ウマ血清200マイクロリットル及び3つの固相のうちのいずれか200マイクロリットルと混合した。第1の固相は、ヒツジ抗体で共有結合的に被覆されているSiemens Healthcare Diagnostics常磁性微粒子(PMP)0.35グラム/リットルであった。第2の固相は、ストレプトアビジンで共有結合的に被覆されているポリスチレントシル活性化ビーズ(Invitrogen Corporation M-280磁気ラテックスマイクロ粒子(MLP)Dynalbeads)0.35グラム/リットルであった。第3の固相は、ストレプトアビジンで共有結合的に被覆されているグリシジルエーテル(エポキシ)カルボン酸ビーズ(Invitrogen Corporation M-270磁気ラテックスマイクロ粒子(MLP)Dynalbeads)0.35グラム/リットルであった。以下の規格を有する、第2及び第3の固相用の特別なビーズを使用した:
Claims (60)
- ペプチド、タンパク質又は巨大分子と複合体を形成するための両性イオン含有化合物であって、式(I):
(式中、
L1は、場合により20個以下のヘテロ原子で置換されている二価のC1−20アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール又はアラルキル基であり;
L2は、結合、又は場合により10個以下のヘテロ原子で置換されている二価のC1−4アルキル、アルケニル若しくはアルキニル基であり;
Zは、カルボキシレート(−COO−)、スルホネート(−SO3 −)、スルフェート(−OSO3 −)、ホスフェート(−OP(O)(OR)(O−))及びオキシド(−O−)(式中、Rは、場合により20個以下のヘテロ原子で置換されているC1−12アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール又はアラルキルである)からなる群より選択されるアニオン含有基であり;
Y1は、ペプチド、タンパク質又は巨大分子と共有結合を形成するための反応性官能基であって、求電子基、求核基又は光反応性基を含む官能基であり;そして、
R1及びR2は、独立して、各出現時において、それぞれ場合により20個以下のヘテロ原子で置換されているC1−20アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール又はアラルキル基から選択される)
で表される構造を有する両性イオン含有化合物。 - Y1が、アミン反応性基、チオール反応性基、カルボキシ反応性基、マレイミジル反応性基、炭水化物反応性基又は光反応性基から選択される、請求項1に記載の両性イオン含有化合物。
- Y1が、ペンタフルオロフェニル(PFP)エステル、マレイミド、アミン又はN−スクシンイミジルオキシカルボニルから選択される、請求項3に記載の両性イオン含有化合物。
- L1が、場合により20個以下のヘテロ原子で置換されている二価のC1−10アルキルである、請求項1に記載の両性イオン含有化合物。
- L1が、−(CH2)n−(式中、n=1〜6である)型の二価ラジカルである、請求項5に記載の両性イオン含有化合物。
- L2が、場合により10個以下のヘテロ原子で置換されている二価のC1−4アルキルである、請求項5に記載の両性イオン含有化合物。
- L2が、−(CH2)m−(式中、m=1〜4である)型の二価ラジカルである、請求項7に記載の両性イオン含有化合物。
- Zが、スルホネート(−SO3 −)である、請求項8に記載の両性イオン含有化合物。
- Zが、ホスフェート(−OP(O)(OR)(O−))である、請求項8に記載の両性イオン含有化合物。
- Zが、カルボキシレート(−COO−)である、請求項8に記載の両性イオン含有化合物。
- 被検体、被検体類似体又は被検体の結合パートナーを標識するための両性イオン含有化合物であって、式(II):
(式中、
L1及びL3は、独立して、各出現時において、それぞれ場合により20個以下のヘテロ原子で置換されている二価のC1−20アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール又はアラルキル基から選択され;
L2は、結合、又は場合により10個以下のヘテロ原子で置換されている二価のC1−4アルキル、アルケニル若しくはアルキニル基であり;
Zは、カルボキシレート(−COO−)、スルホネート(−SO3 −)、スルフェート(−OSO3 −)、ホスフェート(−OP(O)(OR)(O−))及びオキシド(−O−)(式中、Rは、場合により20個以下のヘテロ原子で置換されているC1−12アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール又はアラルキルである)からなる群より選択されるアニオン含有基であり;
Y1は、被検体、被検体類似体、又は被検体の結合パートナーと共有結合を形成するための反応性官能基であって、求電子基、求核基又は光反応性基を含む官能基であり;
Gは、検出可能な標識であり;そして、
R1は、場合により20個以下のヘテロ原子で置換されているC1−20アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール又はアラルキル基である)
で表される構造を有する両性イオン含有化合物。 - Gが、蛍光標識、化学発光標識又はビオチンから選択される、請求項17に記載の両性イオン含有化合物。
- Gが、フルオレセイン又はビオチンである、請求項18に記載の両性イオン含有化合物。
- Y1が、アミン反応性基、チオール反応性基、カルボキシ反応性基、マレイミジル反応性基、炭水化物反応性基又は光反応性基である、請求項17に記載の両性イオン含有化合物。
- Y1が、ペンタフルオロフェニル(PFP)エステル、マレイミド、アミン又はN−スクシンイミジルオキシカルボニルである、請求項21に記載の両性イオン含有化合物。
- L3が、基−XG−RG−(式中、XGはGに結合しており、XGは、結合、酸素、硫黄、アミン、アミド(−C(O)NRN−若しくは−NRN−C(O)−)、エステル(−C(O)−O−若しくは−O−C(O)−)、カルバメート(−NRN−C(O)−O−若しくは−O−C(O)−NRN−)又は尿素(−NRN−C(O)−NRN−)から選択され、そして、RNは、水素、又は場合により20個以下のヘテロ原子で置換されているC1−20アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール若しくはアラルキルであり;そして、RGは、場合により20個以下のヘテロ原子で置換されている二価のC1−20アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール又はアラルキルである)である、請求項17に記載の両性イオン含有化合物。
- L1が、場合により20個以下のヘテロ原子で置換されている二価のC1−10アルキルから選択され、そして、
RGが、場合により20個以下のヘテロ原子で置換されている二価のC1−10アルキルである、請求項23に記載の両性イオン含有化合物。 - L1が、−(CH2)n−(式中、n=1〜6である)型の二価ラジカルである、請求項24に記載の両性イオン含有化合物。
- RGが、−(CH2)g−(式中、g=1〜6である)型の二価ラジカルである、請求項24に記載の両性イオン含有化合物。
- L2が、場合により10個以下のヘテロ原子で置換されている二価のC1−4アルキルである、請求項24に記載の両性イオン含有化合物。
- L2が、−(CH2)m−(式中、m=1〜4である)型の二価ラジカルである、請求項27に記載の両性イオン含有化合物。
- Zが、スルホネート(−SO3 −)である、請求項17に記載の両性イオン含有化合物。
- Zが、ホスフェート(−OP(O)(OR)(O−))である、請求項17に記載の両性イオン含有化合物。
- Zが、カルボキシレート(−COO−)である、請求項17に記載の両性イオン含有化合物。
- ペプチド、タンパク質、及び/又は巨大分子を架橋するための両性イオン含有化合物であって、式(III):
(式中、
Ωは、以下の形態:
の両性イオン含有基であり、
L1及びL4は、独立して、各出現時において、それぞれ場合により20個以下のヘテロ原子で置換されている二価のC1−20アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール又はアラルキル基から選択され;
L2は、結合、又は場合により10個以下のヘテロ原子で置換されている二価のC1−4アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール若しくはアラルキル基であり;
L5、L6及びL7は、独立して、各出現時において、結合、又はそれぞれ場合により20個以下のヘテロ原子で置換されている二価のC1−20アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール若しくはアラルキル基から選択され;
Qは、炭素原子又は窒素原子から選択されるが、但しQが窒素である場合、L5、L6及びL7は、それぞれ結合ではなく;
Zは、カルボキシレート(−COO−)、スルホネート(−SO3 −)、スルフェート(−OSO3 −)、ホスフェート(−OP(O)(OR)(O−))及びオキシド(−O−)(式中、Rは、場合により20個以下のヘテロ原子で置換されているC1−12アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール又はアラルキルである)からなる群より選択されるアニオン含有基であり;
Y1及びY2は、独立して、各出現時において、求電子基、求核基又は光反応性基を含むペプチド、タンパク質又は巨大分子と共有結合を形成するための反応性官能基から選択され;そして、
R1及びR2は、独立して、各出現時において、それぞれ場合により20個以下のヘテロ原子で置換されているC1−20アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール又はアラルキル基から選択される)
で表される構造を有する両性イオン含有化合物。 - Y1及びY2が、独立して、各出現時において、アミン反応性基、チオール反応性基、カルボキシ反応性基、マレイミジル反応性基、炭水化物反応性基又は光反応性基から選択される、請求項36に記載の両性イオン含有化合物。
- Y1又はY2が、一方の出現時において、ペンタフルオロフェニル(PFP)エステル、マレイミド、アミン又はN−スクシンイミジルオキシカルボニルである、請求項38に記載の両性イオン含有化合物。
- L2が、場合により10個以下のヘテロ原子で置換されている二価のC1−4アルキルである、請求項36に記載の両性イオン含有化合物。
- L2が、−(CH2)m−(式中、m=1〜4である)型の二価ラジカルである、請求項40に記載の両性イオン含有化合物。
- L2が、−(CH2)m−(式中、m=1〜4である)型の二価ラジカルである、請求項42に記載の両性イオン含有化合物。
- L1が、−(CH2)n−(式中、n=1〜6である)型の二価ラジカルである、請求項42に記載の両性イオン含有化合物。
- L4が、−(CH2)p−(式中、p=1〜6である)型の二価ラジカルである、請求項42に記載の両性イオン含有化合物。
- Zが、スルホネート(−SO3 −)である、請求項42に記載の両性イオン含有化合物。
- Ωが、以下の形態:
の両性イオン含有基であり、
L5、L6及びL7が、それぞれ基−Xa−Ra−
(式中、XaはQに結合しており、そして、独立して、各出現時において、結合、酸素、硫黄、アミン、アミド(−C(O)NRN−若しくは−NRN−C(O)−)、エステル(−C(O)−O−若しくは−O−C(O)−)、カルバメート(−NRN−C(O)−O−若しくは−O−C(O)−NRN−)又は尿素(−NRN−C(O)−NRN−)から選択され、そして、RNは、独立して、各出現時において、水素、又は場合により20個以下のヘテロ原子で置換されているC1−20アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール若しくはアラルキル基であり;そして、
Raは、独立して、各出現時において、結合、又はそれぞれ場合により20個以下のヘテロ原子で置換されている二価のC1−20アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール若しくはアラルキル基から選択されるが、但し、Qが窒素である場合、Raは結合ではない)
である、請求項36に記載の両性イオン含有化合物。 - L2が、−(CH2)m−(式中、m=1〜4である)型の二価ラジカルである、請求項50に記載の両性イオン含有化合物。
- Raが、独立して、各出現時において、−(CH2)q−(式中、q=1〜6である)型の二価ラジカルから選択される、請求項50に記載の両性イオン含有化合物。
- Xaが、ある出現時において、アミン又はアミド(−C(O)NRN−又は−NRN−C(O)−)であり、そして、Qが炭素である、請求項50に記載の両性イオン含有化合物。
- Zが、スルホネート(−SO3 −)である、請求項50に記載の両性イオン含有化合物。
- ペプチド、タンパク質、又は巨大分子の水溶解度を改善する方法であって、請求項1に記載の両性イオン含有化合物を前記ペプチド、タンパク質又は巨大分子に共有結合させることを含む方法。
- 生物学的結合アッセイにおける被検体、被検体類似体又は被検体の結合パートナーの非特異的結合を低減する方法であって、請求項1に記載の両性イオン含有化合物を前記被検体、被検体類似体又は被検体の結合パートナーに共有結合させることを含む方法。
- 生物学的結合アッセイにおける被検体、被検体類似体又は被検体の結合パートナーを標識する方法であって、請求項17に記載の両性イオン含有化合物を前記被検体、被検体類似体又は被検体の結合パートナーに共有結合させることを含む方法。
- 2つの分子及び/又は巨大分子の複合体を調製する方法であって、請求項36に記載の両性イオン含有化合物を第1の分子又は巨大分子と第2の分子又は巨大分子とに共有結合させることを含む方法。
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