JP2010529140A - サイクリン依存性キナーゼの選択的阻害剤 - Google Patents
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Abstract
Description
CDK1、CDK2、CDK4、およびCDK6が、主として細胞分裂制御に関与する一方で、CDK8およびCDK9などのその他のサイクリン依存性キナーゼは、主に転写を調節する。CDK7は、転写に重要であるが、CDK活性化キナーゼ(CAK)としても働くという点で他とは異なっている(Lolli and Johnson Cell Cycle 4: 572−577 (2005))。CDK7 CAK複合体は、サイクリンHおよびリングフィンガータンパク質MAT1を含み、Tループにおけるそのリン酸化がその活性に必要とされないという点で他とは異なっている(R. P. Fisher et al. Cell 83: 47−57 (1995); Devault et al. EMBO J. 14: 5027−5036 (1995))。転写調節において、CDK7/サイクリンH/MAT1は、RNAポリメラーゼII指向性の遺伝子の転写の開始に必要である、基本転写因子TFIIHの構成要素である。TFIIH複合体の一部として、CDK7は、RNAポリメラーゼIIの最大サブユニットのC末端ドメインをリン酸化する(R. P. Fisher J. Cell Sci. 118: 5171−5180 (2005))。さらに、TFIIHは、RNAポリメラーゼI媒介性の転写において役割を果たす(Iben et al. Cell 109: 297−306 (2002))。さらに、CAKまたはTFIIH関連CAKは、いくつかの転写因子をリン酸化し、それらの活性を調節する(例えば、Chen et al Mol Cell 6: 127−137 (2000); Bour et al PNAS 102: 16608−16613 (2005)参照)。細胞周期調節に関して、CDK7 CAK複合体は、細胞周期調節に関与するCDKの活性化に必要な活性化セグメント(Tループ)中で細胞周期CDKをリン酸化する(Lolli and Johnson Cell Cycle 4: 572−577 (2005))。
R1は、ヒドロキシル、アルコキシ、水素、またはハロゲンを表し;
R2は、水素、アルカニル、−NRaRb(RaとRbは独立して、最大6個の炭素原子を有する置換されていてもよいヒドロカルビルである。)、1から6個の炭素原子を有するアルコキシ鎖、−SRC(RCは、1から6個の炭素原子を含有するヒドロカルビルである。)、−SO2Rd(Rdは、1から6個の炭素原子を含有するヒドロカルビルである。)、またはハロゲンを表し;
R3は、水素、−SO2NH2、−SO2NReRf(ReとRfは独立して、最大6個の炭素原子を有する置換されていてもよいヒドロカルビルである。)、ハロゲン、または基−(A)a−Alk1[aは0もしくは1であり、aが1の場合、Aは−O−、−S−、もしくは−NR6(R6は水素もしくはC1−C5アルカニル鎖である。)であり、Alk1は、1から6個の炭素原子長さおよびAlk1が少なくとも2個の炭素原子を含有する場合、任意でAlk1の少なくとも2個の炭素原子間の不飽和結合を含有する置換されていてもよい二価のヒドロカルビル鎖である。]であり;
R4は、水素、ハロゲン、アルコキシ、ヒドロキシ、または最大6個の炭素原子を含有する置換されていてもよいヒドロカルビル基を表し;
R5は、水素、ヒドロキシル、アルコキシ、1から8個の炭素原子を有する直鎖、分岐鎖、もしくは環状鎖、またはハロゲンを表し;
Xは、水素、基−Alk2−Z、C1−C4ヒドロカルビル基、またはハロゲン[Alk2は、1から6個の炭素原子長さを含有する置換されていてもよい二価のアルカニル鎖、アルケニル鎖、もしくはアルキニル鎖であり;Zは、−OH基、−OR7基、−SH基、SR7基、−CN基、−NH2基、もしくはNHR7基(R7は、ハロゲンもしくはアルコキシで置換されていてもよいC1−C6ヒドロカルビル基もしくは複素環基である。)である。]を表し;
Yは、基−Alk3−(Q)a−Alk4−B[aは0または1であり、Alk3は、2から7個の炭素原子長さを含有するヒドロカルビル鎖(ここで、該ヒドロカルビル鎖は、該ヒドロカルビル鎖の炭素原子間に二重結合および/または三重結合を含んでもよく、かつ該ヒドロカルビル鎖は、ハロゲン、アルコキシ、または自身がハロゲン基、ヒドロキシル基、もしくはアルコキシ基で置換されていてもよいアルキル鎖で置換されていてもよい。)を表す。]を表し;
Qは、−CH2−、−O−、−S−、−NR−、−S(O2)−、−C(=O)−、および−S(O)−からなる群より選択され;
Alk4はアルカニル鎖であり;および
Bは、ヒドロキシル、アルコキシ、ハロゲン、アルキルチオ、ニトロ、シアノ、アミン、置換されていてもよい炭素環基、置換されていてもよい複素環基であり、かつ
XとYは、XとYとを連結する炭素原子と一緒に、置換されていないC1−C6アルキルを形成しない]
を有する化合物を含有する組成物を提供することである。
R1は、ヒドロキシル、アルコキシ、水素、またはハロゲンを表し;
R2は、水素、アルカニル、−NRaRb(RaとRbは独立して、最大6個の炭素原子を有する置換されていてもよいヒドロカルビルである。)、1から6個の炭素原子を有するアルコキシ鎖、−SRC(RCは、1から6個の炭素原子を含有するヒドロカルビルである。)、−SO2Rd(Rdは、1から6個の炭素原子を含有するヒドロカルビルである。)、またはハロゲンを表し;
R3は、水素、−SO2NH2、−SO2NReRf(ReとRfは独立して、最大6個の炭素原子を有する置換されていてもよいヒドロカルビルである。)、ハロゲン、または基−(A)a−Alk1[aは0もしくは1であり、aが1の場合、Aは−O−、−S−、もしくは−NR6(R6は水素もしくはC1−C5アルカニル鎖である。)であり、Alk1は1から6個の炭素原子長さおよびAlk1が少なくとも2個の炭素原子を含有する場合、任意でAlk1の少なくとも2個の炭素原子間の不飽和結合を含有する置換されていてもよい二価のヒドロカルビル鎖である。]であり;
R4は、水素、ハロゲン、アルコキシ、ヒドロキシ、または最大6個の炭素原子を含有する置換されていてもよいヒドロカルビル基を表し;
R5は、水素、ヒドロキシル、アルコキシ、1から8個の炭素原子を有する直鎖、分岐鎖、もしくは環状鎖、またはハロゲンを表し;
Xは、水素、基−Alk2−Z、C1−C4ヒドロカルビル基、またはハロゲン[Alk2は、1から6個の炭素原子長さを含有する置換されていてもよい二価のアルカニル鎖、アルケニル鎖、もしくはアルキニル鎖であり;Zは、−OH基、−OR7基、−SH基、SR7基、−CN基、−NH2基、もしくはNHR7基(R7は、ハロゲンもしくはアルコキシで置換されていてもよいC1−C6ヒドロカルビル基もしくは複素環基である。)を表す。]を表し;
Yは、基−Alk3−(Q)a−(Alk4)b−B[aとbは独立して0または1であり、Alk3は、2から7個の炭素原子長さを含有するヒドロカルビル鎖(ここで、該ヒドロカルビル鎖は、該ヒドロカルビル鎖の炭素原子間に二重結合および/または三重結合を含んでもよく、かつ該ヒドロカルビル鎖は、ハロゲン、ヒドロキシル、アルコキシ、または自身がハロゲン基、ヒドロキシル基、もしくはアルコキシ基で置換されていてもよいアルキル鎖で置換されていてもよい。)を表す。]を表し;
Qは、−CH2−、−O−、−S−、−NR−、−S(O2)−、−C(=O)−、および−S(O)−からなる群より選択され;
Alk4はアルカニル鎖であり;および
Bは、ヒドロキシル、アルコキシ、ハロゲン、アルキルチオ、ニトロ、シアノ、アミン、置換されていてもよい炭素環基、置換されていてもよい複素環基であり、かつ
XとYは、XとYとを連結する炭素原子と一緒に、置換されていないC1−C6アルキルを形成しない]
を有する化合物を含有する組成物を提供することである。
Xは、水素または基−Alk2−Z(Alk2は、1個もしくは2個の炭素原子を含有するアルカニルであり;Zは−OH基を表す。)を表し;
Yは、基−Alk5(Alk5は、1個または2個の炭素を含み、但し、Alk5は、2個の炭素を含有する場合、脂肪族またはオレフィンであってもよく、かつAlk5は、オレフィンでない場合、各々の炭素原子上で1個のヒドロキシルで置換されていてもよい。)を表し;
XとYは、XとYとを連結する炭素原子と一緒に、置換されていないC1−C6アルキルを形成しない]
を有する化合物を含有する組成物を提供することである。
スキーム1に従って、式(I)(R2、R3、R4、およびR5は水素である。)の化合物を調製することができる。
N−ベンジル−5−クロロ−3−イソプロピルピラゾロ[1,5−a]ピリミジン−7−アミン
3−イソプロピル−5,7−ジクロロピラゾロ[1,5−a]ピリミジン(500mg、2.17mmol)およびベンジルアミン(0.52mL、4.78mmol)のエタノール溶液(20mL)を還流下で3時間加熱した。反応混合物を室温まで冷却し、真空中で濃縮した。残留残留物をシリカカラムクロマトグラフィー(メタノール/酢酸エチル)で精製し、所望の生成物を白色固体(630mg、97%)として得た。
tert−ブチルベンジル−5−クロロ−3−イソプロピルピラゾロ[1,5−a]ピリミジン−7−イルカルバメート
アミン(300mg、1mmol)、Boc2O(284mg、1.3mmol)、DMAP(24mg、0.2mmol)、およびTHF(6mL)をフラスコに投入した。この混合物を室温で1.5時間撹拌した。酢酸エチル(10mL)を加え、有機相を水(3×20mL)、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液(20mL)で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させた。濃縮後、粗生成物をシリカカラムクロマトグラフィー(酢酸エチル:ヘキサン=1:20)で精製し、生成物を淡黄色固体(385mg、96%)として得た。
塩化ヘテロアリール(50mg、0.12mmol)、Pd2dba3(6mg、5mol%)、rac−BINAP(11mg、15mol%)、およびナトリウムtert−ブトキシド(17mg、0.18mmol)をトルエン(0.5mL)に懸濁した。5分間撹拌した後、イソプロピルアミン(13μL、0.15mmol)を加え、赤色混合物を密封管中、100℃で12時間加熱した。反応混合物を室温まで冷却し、水(10mL)中に注入した。水相を酢酸エチル(3×10mL)で抽出し、有機相を合わせて無水硫酸ナトリウムで乾燥させた。回転式蒸発による濃縮後、粗生成物をシリカカラムクロマトグラフィー(酢酸エチル:ヘキサン=10:1)で精製し、生成物を黄色シロップ状物質(39mg、77%)として得た。
N7−ベンジル−N5,3−ジイソプロピルピラゾロ[1,5−a]ピリミジン−5,7−ジアミン
カルバメート(39mg、0.09mmol)を、メタノール中の塩化水素(5mL、1.25M)に溶解し、室温で2時間撹拌した。溶媒を蒸発させ、残留物をジクロロメタン(10mL)に溶解し、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液(10mL)で洗浄した。有機相を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を真空中で除去し、明黄色固体(29mg、97%)を得た。
tert−ブチルベンジル−(5−{2−[2−(tert−ブチルジメチルシリルオキシ)−エトキシ]エチルアミノ}−3−イソプロピルピラゾロ[1,5−a]ピリミジン−7−イル)−カルバメート
塩化ヘテロアリール(100mg、0.25mmol)、Pd2dba3(11mg、5mol%)、rac−BINAP(23mg、15mol%)、およびナトリウムtert−ブトキシド(36mg、0.36mmol)をトルエン(0.5mL)に懸濁した。5分間撹拌した後、アミン(66mg、0.30mmol)を加え、赤色混合物を100℃で12時間加熱した。反応混合物を室温まで冷却し、水(10mL)中に注入した。水相を酢酸エチル(3×10mL)で抽出し、有機相を合わせて無水硫酸ナトリウムで乾燥させた。回転式蒸発による濃縮後、粗生成物をシリカカラムクロマトグラフィー(ヘキサン:酢酸エチル=4:1)で精製し、生成物を黄色シロップ状物質(84mg、58%)として得た。
2−(2−(7−(ベンジルアミノ)−3−イソプロピルピラゾロ[1,5−a]ピリミジン−5−イルアミノ)エトキシ)エタノール
カルバメート(20mg、0.034mmol)を、メタノール中の塩化水素(5mL、1.25M)に溶解し、室温で2時間撹拌した。溶媒を蒸発させ、残留物をジクロロメタン(10mL)に溶解し、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液(10mL)で洗浄した。有機相を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を真空中で除去し、明黄色固体(12mg、96%)を得た。
3−イソプロピル−5,7−ジクロロピラゾロ[1,5−a]ピリミジン(500mg、2.17mmol)およびオルトフルオロベンジルアミン(0.5mL、4.34mmol)のエタノール溶液(20mL)を還流下で3時間加熱した。反応混合物を室温まで冷却し、真空中で濃縮した。残留残留物をシリカカラムクロマトグラフィー(メタノール/酢酸エチル)で精製し、所望の生成物を明黄色固体(681mg、98%)として得た。
tert−ブチル−2−フルオロベンジル−5−クロロ−3−イソプロピルピラゾロ[1,5−a]ピリミジン−7−イルカルバメート
アミン(644mg、2.02mmol)、Boc2O(573g、2.63mmol)、4−(ジメチルアミノ)ピリジン(49mg、0.40mmol)、およびTHF(12mL)をフラスコに投入した。この混合物を室温で1.5時間撹拌した。酢酸エチル(20mL)を加え、有機相を水(3×20mL)、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液(40mL)で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させた。回転式蒸発による濃縮後、粗生成物をシリカカラムクロマトグラフィー(酢酸エチル:ヘキサン=1:20)で精製し、生成物を淡黄色固体(837mg、99%)として得た。
tert−ブチル{5−[(R)−6−tert−ブトキシカルボニルアミノ−(tert−ブチルジメチルシリルオキシメチル)−ヘキシルアミノ]−3−イソプロピルピラゾロ[1,5−a]ピリミジン−7−イル}−(2−フルオロベンジル)カルバメート
塩化ヘテロアリール(50mg、0.12mmol)、Pd2dba3(6mg、10mol%)、rac−BINAP(12mg、30mol%)、およびナトリウムtert−ブトキシド(19mg、0.20mmol)をトルエン(0.5mL)に懸濁した。5分間撹拌した後、アミン(50mg、0.14mmol)を加え、赤色混合物を100℃で12時間加熱した。反応混合物を室温まで冷却し、水(10mL)中に注入した。水相を酢酸エチル(3×10mL)で抽出し、有機相を合わせて無水硫酸ナトリウムで乾燥させた。回転式蒸発による濃縮後、粗生成物をシリカカラムクロマトグラフィー(酢酸エチル:ヘキサン=10:1)で精製し、生成物を黄色シロップ状物質(41mg、46%)として得た。
tert−ブチル[5−(R)−6−tert−ブトキシカルボニルアミノ−ヒドロキシメチル−ヘプチルアミノ]−3−イソプロピルピラゾロ[1,5−a]ピリミジン−7−イル)−(2−フルオロベンジル)カルバメート
シリルエーテル(40mg、0.054mmol)をTHF(5mL)に溶解し、THF中のフッ化テトラブチルアンモニウム(1M、0.07mL、0.065mmol)を室温で加えた。得られた溶液を、TLCで完全転化が示されるまで撹拌した。飽和塩化アンモニウム水溶液(5mL)を加えることにより、この反応を停止させた。水相を酢酸エチル(3×10mL)で抽出し、有機相を合わせて無水硫酸ナトリウムで乾燥させた。回転式蒸発による濃縮後、粗生成物をシリカカラムクロマトグラフィー(ヘキサン:酢酸エチル=4:1)で精製し、生成物を明黄色油状物(24mg、71%)として得た。
(R)−2−(7−(2−フルオロベンジルアミノ)−3−イソプロピルピラゾロ[1,5−a]ピリミジン−5−イルアミノ)−7−アミノヘプタノール
カルバメート(23mg、0.037mmol)をMeOH/HCl(5mL、1.25M)に溶解し、室温で2時間撹拌した。溶媒を蒸発させ、残留物をジクロロメタン(10mL)に溶解し、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液(10mL)で洗浄した。有機相を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を真空中で除去し、無色固体(14mg、88%)を得た。
実施例5〜12の化合物を上記の方法に従って調製した。それらの全てをCDK7の阻害剤として試験し、かつCDK2およびCDK9を含むその他のキナーゼに対するそれらの活性について試験した。表2は得られた結果を示しており、これには実施例2、3、および4の化合物が含まれる。
トリメチルシリル−1−ヘキセニル−6−(トリフェニル)ヨウ化ホスホニウム
トリメチルシリルアセチレン(7.2mL、51mmol)のTHF溶液(50mL)を−20℃に冷却し、n−ブチルリチウム(ヘキサン中20.4mL、51mmol、2.5M)を滴下して加えた。この混合物を30分間撹拌し、1−クロロ−4−ヨードブタン(5mL、41mmol)を加えた。混合物を室温まで加温し、72時間撹拌した。反応混合物を飽和炭酸水素ナトリウム水溶液(50mL)中に注入し、水相をジエチルエーテル(5×40mL)で抽出した。有機相を合わせて食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、回転式蒸発によって濃縮した。
(R)−tert−ブチル−2,2−ジメチル−4−((Z)−7−(トリメチルシリル)ヘプテン−6−イニル)オキサゾリジン−3−カルボキシレート
ホスホニウム塩(4.5g、8.3mmol)を室温でTHF(40mL)に懸濁し、0.5Mのヘキサメチルシラザンカリウムのトルエン溶液(16.4mL、8.2mmol)を加えた。得られた懸濁液を室温で1時間撹拌し、その後−78℃に冷却し、(S)−tert−ブチル−2,2−ジメチル−4−ホルミルオキサゾリジン−3−カルボキシレート(6.9mmol)のTHF溶液(10mL)を滴下して加えた。冷却槽から取り出し、混合物をさらに2時間撹拌した。この反応をMeOH(3mL)で停止させ、得られた混合物を飽和酒石酸カリウムナトリウム水溶液と水との混合物(1:1、50mL)中に注入した。ジエチルエーテル(2×25mL)で抽出し、乾燥(無水硫酸マグネシウム)させ、真空中で溶媒を蒸発させることにより、無色油状物が得られた。これをシリカカラムクロマトグラフィー(ヘキサン:酢酸エチル=9:1)で精製することによって、アルケン(762mg、30%)が無色油状物として得られ、それに付随して脱シリル化されたアルケン(455mg、22%)も得られた。
(R,Z)−2−アミノノン−3−エン−8−イン−1−オール塩酸塩
カルバメート(760mg、2.08mmol)を塩酸(6M、3mL)に溶解し、室温で2時間撹拌した。溶媒を蒸発させ、無色固体(394mg、100%)を得た。
N−[(Z)−(R)−1−(tert−ブチルジメチルシリルオキシ)−ノン−3−エン−8−イン−2−イル]−2,2,2−トリフルオロアセトアミド
アミノアルコール塩酸塩(511mg、2.69mmol)のジクロロメタン溶液(20mL)に、無水硫酸マグネシウム(0.83mL、5.93mmol)、4−(ジメチルアミノ)ピリジン(2mg)、および塩化tert−ブチルジメチルシリル(446mg、2.96mmol)を加えた。この混合物を室温で一晩撹拌した。水(20mL)を加え、混合物を激しく10分間撹拌した。有機層を分離し、水(20mL)、食塩水(20mL)で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させた。真空中で蒸発させることにより、分析的に純粋なアミン(607mg、84%)が得られた。
(N)−[(Z)−(R)−1−(tert−ブチルジメチルシリルオキシ)−9−(6−フルオロピリジン−3−イル)−ノン−3−エン−8−イン−2−イル]−2,2,2−トリフルオロアセトアミド
アルケン(291mg、0.8mmol)を入れたフラスコに、新たに蒸留したジクロロメタン(1mL)、5−ブロモ−2−フルオロピリミジン(0.25mL、2.4mmol、3当量)、(Ph3P)2PdCl2(11mg、0.016mmol、0.02当量)、CuI(1mg、0.008mmol、0.01当量)、およびEt3N(0.7mL、4.8mmol、6当量)を加えた。得られた溶液を還流下で13時間撹拌し、室温まで冷却し、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液で反応を停止させた。この混合物をジクロロメタンで抽出し、有機層を合わせて乾燥(無水硫酸マグネシウム)させ、真空中で蒸発させた。カラムクロマトグラフィー(シリカゲル、ヘキサン/酢酸エチル 20/1)による精製から、アミドが黄色油状物(249mg、68%)として得られた。
(R)−(1−(tert−ブチルジメチルシリルオキシ))−9−(6−フルオロピリジン−3−イル)−2−オクチルアミン
ピリジン(235mg、0.51mmol)、パラジウム炭素(65mg、10mol%)、および酢酸エチル(10mL)をフラスコに投入し、パール装置中、水素雰囲気下で13時間激しく撹拌した。この混合物をセライトに通して濾過し、濃縮し、真空中で乾燥させることにより、分析的に純粋な生成物(165mg、70%)が得られた。[α]D +12.7 (c 1.45, CH2Cl2)。IR(ニート)νmax=3306, 3091, 2930, 2858, 1706, 1593, 1558, 1472, 1393, 1253, 1184, 1162, 837, 778。1H NMR (400MHz, CDCl3):δH 0.05 (s, 6H), 0.88 (s, 9H), 1.30 (m, 9H), 1.57 (m, 3H), 2.57 (m, 2H), 3.64 (m, 2H), 3.96 (m, 1H), 6.66 (m, 1H), 6.83 (m, 1H), 7.58 (m, 1H), 7.98 (s, 1H)。13C (100MHz, CDCl3):δC −5.67, 18.15, 25.70, 28.88, 29.18, 30.95, 31.13, 31.93, 51.30, 63.55, 108.95, 115.94, 135.44, 141.03, 146.78, 156.65, 162.23。MS (CI): m/z 465 (M+H)。HRMS (CI) 計算値: 465.2547、実測値: 465.2547。
tert−ブチルベンジル−{5−[(R)−(1−(tert−ブチルジメチルシリルオキシ))−9−(6−フルオロピリジン−3−イル)ノニル−2−アミノ]−3−イソプロピルピラゾロ[1,5−a]ピリミジン−7−イル}カルバメート
塩化物(49mg、0.12mmol)、Pd2dba3(5.5mg、5mol%)、rac−BINAP(11mg、15mol%)、およびナトリウムtert−ブトキシド(17mg、0.18mmol、1.5当量)をトルエン(0.5mL)に懸濁した。5分間撹拌した後に、アミン(50mg、0.14mmol、1.1当量)を加え、赤色混合物を100℃で13時間加熱した。反応混合物を室温まで冷却し、蒸発させた。濃縮後、粗生成物をシリカカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/酢酸エチル 10/1)で精製し、生成物を黄色油状物(30.6mg、35%)として得た。
(R)−tert−ブチルベンジル−(5−(9−(6−フルオロピリジン−3−イル)−1−ヒドロキシノナン−2−イルアミノ)−3−イソプロピルピラゾロ[1,5−a]ピリミジン−7−イル)カルバメート
カルバメート(30mg、0.04mmol)の乾燥THF溶液(1mL)にフッ化テトラブチルアンモニウム(1M溶液、0.16mL)を加えた。この反応混合物を室温で2時間撹拌した。塩化アンモニウムの飽和溶液を加え、混合物を酢酸エチルで洗浄した。有機画分を合わせて硫酸マグネシウムで乾燥させ、真空中で濃縮した。この生成物を、50%の酢酸エチルを含有するヘキサンを用いてシリカゲルで精製することにより、生成物を黄色油状物(17mg、69%)として得た。
CDK7/CycH/MAT1三量体複合体:キナーゼアッセイIC50
CDK7活性のインビトロ阻害を、150ngの精製した組換えCDK7複合体(CDK7、サイクリンH、MAT1;Proqinase GmbH, Germanyから購入)を化合物と下記の手順に従って温置することによって達成した。
1. 10μlのCDK7アッセイ緩衝液(150mM Hepes−NaOH (pH7.5)に、3mM DTT、7.5mM MgCl2、7.5 MnCl2、7.5μMオルトバナジウム酸ナトリウム、125μg/ml PEG20,000を加えたもの)に、1反応(500μM)当たり2.5μlの500μM CDK7/9tideペプチド(配列:YSPTSPSYSPTSPS)、および150ng CDK7複合体を添加した。
2. 1000μM、100μM、10μM、1μM、および0.1μMの濃度で調製された試験化合物を調製した。ddH2Oに40分の1に希釈し、1μlの試験化合物またはDMSO(対照)を添加した。
3. 30℃で30分間、水槽中で温置した。
4. 最終濃度2μM ATPになるように、1反応当たり10μlのATP(0.5μM)を添加した。
5. ddH2Oで全容量25μlとした。
6. 30℃で20分間、水槽中で温置した。
7. PKLightキナーゼアッセイ(Cambrex, UK)を用いて、各反応に10μlの停止反応物を添加し、完全に混合した。室温で10分間温置した。
8. 1反応当たり20μlルシフェラーゼ反応混合物(Cambrex, UK)を添加し、室温で10分間さらに温置し、製造元の方法に従ってルシフェラーゼ活性を決定した。キナーゼ反応物を96ウェルマイクロプレートに添加し、Packard TopCount NXT(商標)発光カウンター(TopCount 9904)を用いてルシフェラーゼ活性を決定した。読込測定が0.1読込時間となるようにルミノメーターをプログラムし、光の放出は560nmで検出できた。
9. キナーゼ阻害アッセイは全て、3通りで行なった。生物発光シグナルはキナーゼ活性と反比例するので、値を全て、酵素を含まない対照から差し引いた。その後、これらの値を、100%の活性に対する参照として酵素対照を用いてプロットし、全てのその他の値と比較した。キナーゼ活性が、溶媒(DMSO)の存在下で得られる活性の50%である阻害剤濃度として、IC50を決定した。
タンパク質キナーゼ活性の阻害のためのインビトロアッセイ
本発明に係る様々な化合物をアッセイ研究用に調製した。表4は、このアッセイ研究に用いられた化合物の構造を提供する。
BS−181によるRNAポリメラーゼIIのリン酸化の阻害
本実施例は、BS−181と表される化合物(表3参照)が、RNAポリメラーゼIIのリン酸化を阻害することができるということを示す。細胞を採取する前に4時間、図2に示した濃度のBS−181またはロスコビチンでMCF−7乳癌細胞を処置した。図2は、RNAポリメラーゼII(Pol II)、C末端ドメイン中の2番目のセリンでリン酸化されたPolII(P−Ser−2)、または5番目のセリンでリン酸化されたPolII(P−Ser−5)についてのイムノブロットを示す。β−アクチンについてのイムノブロットを、タンパク質含有量についてのローディング対照として用いた。2番目および5番目のセリンのリン酸化が50%阻害されたロスコビチンおよびBS−181の濃度(IC50)も図2に示す。
BS−181によるヌードマウスにおけるMCF−7腫瘍成長の阻害
本実施例は、BS−181がヌードマウスにおけるMCF−7腫瘍成長を阻害することができることを例証する。以下のプロトコルをこれらのマウス異種移植実験で用いた。メスの、7週齢の、nu/nu−BALB/c無胸腺ヌードマウスをHarlan Olac社から購入した。隔離されたベンチレーター式ケージ(IVC)の中で12時間の明暗周期で動物を飼育した。動物は、随時、滅菌水および滅菌された齧歯動物用の餌を与えられた。全ての手順は、CBS、Imperial College London Ethics Committeeによって承認され、これらの特定の研究に対するGovernment Home Officeのプロジェクトライセンスに含まれた。動物に細胞を接種する前に、0.72mgの17βエストラジオール60日放出ペレットを皮下に埋め込んだ(Innovative Research of America, USA)。挿入のために、動物に麻酔をかけ、無菌条件下で動物の脇腹に切開を施し、ペレットを埋め込んだ。創傷部をステンレス製の非常に硬い縫合糸で閉じた。MCF−7細胞(5×106細胞)を、0.1ml以下の容量で動物の脇腹に皮下注射した。腫瘍測定を1週間に2回行ない、公式1/2 [長さ(mm)]×[幅(mm)]2を用いて体積を計算した。動物を無作為抽出し、腫瘍が100〜200mm3の体積に達した時に、動物を13匹ずつの様々な処置群に入れ、試験薬物またはビヒクル対照による処置を開始した。動物を、1日2回、腹腔内注射で、合計14日間、化合物で処置した。10%DMSO、50mM HCl、5%Tween 20、および85%生理食塩水のビヒクル中に化合物を調製した。注射容量が0.2mlを超えないように、正確な体重を目安にして化合物を投与した。処置期間(14日)の最後に、マウスを屠殺した。14日間の処置期間を通じて、動物重量は毎日、腫瘍体積は48時間毎に決定した。
BS−181の特異性についてのキナーゼスクリーニング
本実施例では、酵素活性について組換えキナーゼを2通りで検査した。表5は、10μMのBS−181を添加した後の平均残存活性を(最初の活性のパーセンテージとして)示す。右側の欄の値は標準偏差を表す。これらの実験から、最大限の阻害を示す3つのキナーゼが、CDK2、CK1、およびDYRK1Aであることが明らかにされた。BS−181に関するこれら3つのキナーゼのIC50値は、それぞれ750nM、7.4μM、および2.3μMであることが明らかにされた。
MKK1アッセイ:これは、不活性MAPK(0.06mg/ml)を、25mM Tris、0.1mM EGTA、0.01% Brij35、10mM酢酸マグネシウム、および0.005mM ATP を含有する25.5μl中で、(25mM Tris、0.1mM EGTA、0.1% b−メルカプトエタノール、0.01% Brij35、1mg/ml BSAに希釈した)MKK1によって活性化する2工程アッセイであった。室温で30分間温置した後、第1の反応物からの5μlをピペットで取って、25mM Tris(pH7.5)、0.1mM EGTA、0.1mM Na3VO4、0.66mg/mlミエリン塩基性タンパク質(MBP)、10mM酢酸マグネシウム、および0.05mM [33P−g−ATP](500〜1000cpm/pmole)(最終濃度)を含有する20μlの第2の反応混合物に入れ、室温で30分間温置した。5μlの0.5M(3%)オルトリン酸の添加によってアッセイを停止させ、その後50mMオルトリン酸の洗浄緩衝液でP81 Unifilterプレート上に採取した。
本実施例は、CDK2、CDK4、CDK5、CDK7、およびCDK9と対比した、本発明の範囲内の様々な化合物についてのインビトロキナーゼ阻害データを提供する。プロトコルは、実施例14に示したものと同様であった。100nMの各化合物を用いてタンパク質キナーゼの阻害を3通りで行なった。表6は、100nMの濃度の化合物との温置の後に、残存するキナーゼ活性のパーセンテージを示す。
本実施例は、CDK2、CDK4、CDK5、CDK7、およびCDK 9と対比した、本発明の範囲内の様々な化合物についてのインビトロキナーゼ阻害データを提供する。表7に示すように、データをIC50値に換算して報告する。このデータを得るのに用いたプロトコルは、実施例14に報告されたものと同様である。
下記に示す表8は、SRBアッセイを用いて得られたMCF−7細胞株についての成長阻害データを提供する。SRBアッセイでは、3×103個のMCF−7細胞を、10%FCSを含有するDMEM中に入れて96ウェルプレートに播種した16時間後、培地を、0.1〜100μMの範囲の濃度の関心のある化合物または等容量のビヒクル対照(DMSO)を補充した新鮮培地と交換した。複製を作製するために、化合物を3つのウェルに添加した。24時間後、4℃で1時間、細胞を40%(w/v)TCAを用いて固定し、蒸留脱イオンH2Oで5回洗浄し、その後室温で1時間、1%酢酸中で0.4%(w/v)スルホローダミンB(SRB)と温置した。1%酢酸を用いた5回の洗浄で余分な色素を除去し、室温で乾燥させた。各ウェルに100μlの10mM Tris塩基を添加することによって色素を可溶化した後、480nmにおける吸光度を決定した。
BS−194および類似体の合成
上記のデータによって示されるように、BS−194は、2つ以上のサイクリン依存性キナーゼ(特にCDK5およびCDK9)を特異的に阻害するための化合物としての見込みを示している。以下の実験プロトコルおよび装置を、BS−194、BS−195、および表9に示した対応する類似体の調製に用いた。
芳香族コアICEC0012(BS−96)およびICEC0013(BS−107)の合成を、スキーム1.1のBS−181合成と同様に行なった。
融点242〜243℃(エタノール)。
3−イソプロピル−5,7−ジクロロピラゾロ[1,5−a]ピリミジンICEC0005(2.17mmol)およびアミン(4.56mmol)のEtOH溶液(20mL)を還流下で3時間加熱した。反応混合物を室温まで冷却し、真空中で濃縮した。残留物をシリカフラッシュクロマトグラフィー(メタノール/酢酸エチル)で精製し、分析的に純粋な形で所望の生成物を得た。
所定位置に所望の立体化学を保持させるために、側鎖の合成をL−セリンから始めた。全体的な流れをスキーム2.1に概説する。
(S)−3−(tert−ブトキシカルボニル)−N−メトキシ−2,2,N−トリメチルオキサゾリジン−4−カルボキサミド(ICEC0001)
BS−194の生成は、BS−181の合成と類似の方法で行なった。これをスキーム2.2に示す。
ベンジル−{5−[(R)−(tert−ブチルジメチルシラニルオキシメチル)−アリルアミノ]−3−イソプロピルピラゾロ[1,5−a]ピリミジン−7−イル}カルバミン酸tert−ブチルエステル(ICEC0064)
方法1:
ベンジル−{5−[(S)−(tert−ブチルジメチルシラニルオキシメチル)−2,3−ジヒドロキシプロピルアミノ]−3−イソプロピルピラゾロ[1,5−a]ピリミジン−7−イル}カルバミン酸tert−ブチルエステル(ICEC0068)
[α]D (c 0.50, CH2Cl2): −3.2。1H NMR (CDCl3, 300MHz)δ7.78 (s, 1H), 7.26 (m, 5H), 5.71 (s, 1H), 5.22 (m, 1H), 4.96 (m, 3H), 4.15 (m, 1H), 3.89 (m, 1H), 3.75 (m, 1H), 3.58 (m, 3H), 3.08 (m, 1H), 2.83 (m, 1H), 1.42〜1.28 (m, 15H), 0.92 (s, 9H), 0.11 (s, 6H)。13C NMR (CDCl3, 75MHz)δ154.8, 153.4, 141.7, 137.6, 128.5, 127.9, 127.6, 113.8, 97.4, 83.8, 82.5, 70.4, 62.5, 61.8, 53.5, 51.7, 28.0, 25.9, 23.6, 23.5, 23.2, −5.4。IR(ニート)νmax=3363, 2955, 2929, 2857, 1721, 1644, 1518, 1368, 1157, 836, 778。MS m/z (CI) 600 (M+H)。HRMS (CI) 計算値: 600.3581、実測値: 600.3578。
[α]D (c 0.50, CH2Cl2): −28.4。1H NMR (CDCl3, 300MHz)δ7.77 (s, 1H), 7.28 (m, 5H), 5.73 (s, 1H), 5.10 (m, 1H), 4.95 (m, 2H), 4.31 (m, 2H), 4.13 (m, 1H), 4.00 (m, 2H), 3.58 (m, 2H), 3.36 (m, 1H), 3.07 (m, 1H), 1.41〜1.26 (m, 15H), 0.90 (s, 9H), 0.08 (s, 6H)。13C NMR (CDCl3, 75MHz)δ141.7, 137.6, 128.5, 127.9, 113.8, 97.4, 83.8, 74.1, 65.8, 62.6, 51.6, 28.0, 25.8, 23.6, −5.5。IR(ニート)νmax=3361, 2955, 2931, 2860, 1719, 1644, 1518, 1254, 1158, 836, 777。MS m/z (CI) 600 (M+H)。HRMS (CI) 計算値: 600.3581、実測値: 600.3574。
[α]D (c 0.20, CH3OH): +38.0。1H NMR (CD3OD, 300MHz)δ7.66 (s, 1H), 7.34 (m, 5H), 5.29 (s, 1H), 4.54 (s, 2H), 4.03 (m, 1H), 3.83 (m, 2H), 3.57 (m, 3H), 3.04 (m, 1H), 1.28 (m, 7H)。13C NMR (CD3OD, 75MHz)δ129.8, 128.5, 128.1, 85.1, 74.5, 74.3, 73.6, 64.5, 63.2, 55.9, 24.7, 24.0, 23.7。IR(ニート)νmax=3291, 1638, 1579, 1445, 1077。
[α]D (c 0.20, CH3OH): −53.0。1H NMR (CD3OD, 300MHz)δ7.66 (s, 1H), 7.34 (m, 5H), 5.32 (s, 1H), 4.54 (s, 2H), 4.17 (m, 1H), 3.89 (m, 1H), 3.75 (m, 2H), 3.50 (m, 1H), 3.36 (m, 1H), 3.01 (m, 1H), 1.28 (m, 8H)。13C NMR (CD3OD, 75MHz)δ129.8, 128.5, 128.1, 63.5, 24.7, 24.0, 23.7。IR(ニート)νmax=3305, 1638, 1579, 1443, 1069。
ベンジル−{5−[(S)−(tert−ブチルジメチルシラニルオキシメチル)−2,3−ジヒドロキシプロピルアミノ]−3−イソプロピルピラゾロ[1,5−a]ピリミジン−7−イル}カルバミン酸tert−ブチルエステル(ICEC0068)
[α]D (c 0.50, CH2Cl2): −3.2。1H NMR (CDCl3, 300MHz)δ7.78 (s, 1H), 7.26 (m, 5H), 5.71 (s, 1H), 5.22 (m, 1H), 4.96 (m, 3H), 4.15 (m, 1H), 3.89 (m, 1H), 3.75 (m, 1H), 3.58 (m, 3H), 3.08 (m, 1H), 2.83 (m, 1H), 1.42〜1.28 (m, 15H), 0.92 (s, 9H), 0.11 (s, 6H)。13C NMR (CDCl3, 75MHz)δ154.8, 153.4, 141.7, 137.6, 128.5, 127.9, 127.6, 113.8, 97.4, 83.8, 82.5, 70.4, 62.5, 61.8, 53.5, 51.7, 28.0, 25.9, 23.6, 23.5, 23.2, −5.4。IR(ニート)νmax=3363, 2955, 2929, 2857, 1721, 1644, 1518, 1368, 1157, 836, 778。MS m/z (CI) 600 (M+H)。HRMS (CI) 計算値: 600.3581、実測値: 600.3578。
[α]D (c 0.50, CH2Cl2): −28.4。1H NMR (CDCl3, 400MHz)δ7.77 (s, 1H), 7.28 (m, 5H), 5.73 (s, 1H), 5.10 (m, 1H), 4.95 (m, 2H), 4.31 (m, 2H), 4.13 (m, 1H), 4.00 (m, 2H), 3.58 (m, 2H), 3.36 (m, 1H), 3.07 (m, 1H), 1.41〜1.26 (m, 15H), 0.90 (s, 9H), 0.08 (s, 6H)。13C NMR (CDCl3, 75MHz)δ141.7, 137.6, 128.5, 127.9, 113.8, 97.4, 83.8, 74.1, 65.8, 62.6, 51.6, 28.0, 25.8, 23.6, −5.5。IR(ニート)νmax=3361, 2955, 2931, 2860, 1719, 1644, 1518, 1254, 1158, 836, 777。MS m/z (CI) 600 (M+H)。HRMS (CI) 計算値: 600.3581、実測値: 600.3574。
ベンジル−{5−[(S)−(tert−ブチルジメチルシラニルオキシメチル)−2,3−ジヒドロキシプロピルアミノ]−3−イソプロピルピラゾロ[1,5−a]ピリミジン−7−イル}カルバミン酸tert−ブチルエステル (ICEC0068)
1H NMR (CDCl3, 400MHz)δ7.80 (s, 1H), 7.36〜7.27 (m, 5H), 5.72 (s, 1H), 5.24〜5.22 (m, 1H), 4.98〜4.94 (m, 3H), 4.18〜4.11 (m, 1H), 3.95〜3.90 (m, 1H), 3.79〜3.76 (m, 1H), 3.64〜3.57 (m, 3H), 3.10 (hept, J=6.9Hz, 1H), 2.84〜2.81 (m, 1H), 1.43 (s, 9H), 1.33 (d, J=6.9Hz, 6H), 0.93 (s, 9H), 0.13〜0.12 (m, 6H)。13C NMR (CDCl3, 100MHz)δ154.8, 153.4, 141.7, 137.6, 128.5, 127.9, 127.6, 113.8, 97.4, 83.8, 82.5, 70.4, 62.5, 61.8, 53.5, 51.7, 28.0, 25.9, 23.6, 23.5, 23.2, −5.4。MS m/z (CI) 600 (M+H)。
1H NMR (CDCl3, 400MHz)δ7.77 (s, 1H), 7.32〜7.23 (m, 5H), 5.78 (s, 1H), 5.27〜5.25 (m, 1H), 4.98〜4.89 (m, 2H), 4.41〜4.31 (m, 2H), 4.14〜4.09 (m, 1H), 4.00〜3.90 (m, 2H), 3.79〜3.75 (m, 1H), 3.61〜3.57 (m, 1H), 3.40〜3.36 (m, 1H), 3.11〜3.04 (m, 1H), 1.40 (s, 9H), 1.32〜1.28 (m, 6H), 0.89 (s, 9H), 0.08〜0.06 (m, 6H)。13C NMR (CDCl3, 100MHz)δ154.8, 153.5, 141.7, 137.6, 128.5, 127.9, 127.6, 113.8, 97.4, 82.5, 70.4, 62.4, 61.8, 60.4, 53.5, 51.6, 28.0, 25.9, 23.6, −5.4。MS m/z (CI) 600 (M+H)。
構造的に関連のあるICEC0318(BS−194)の類似体の活性を調べた。ICEC0318(BS−194)の類似体の構造を下記に示す。
この小さく焦点を絞ったライブラリーに必要なアミノアルコールの大部分は市販されていた。Pdクロスカップリング反応の前に、遊離アルコールを適切に保護した。アミノエタノール、アミノプロパノール、および2−アミノプロパンジオールのTBS保護は、NEt3および触媒DMAPの存在下で、アミノアルコールをDCM中でTBSClによって処理することにより行なった。1−アミノプロパンジオールについては、このジオールがアセトニドとして保護されている市販の形態のものをラセミ化合物として用いた。
合成は、先のカップリング反応に用いられた方法に従って行なった。
BS−194によるヌードマウスにおけるMCF−7腫瘍成長の阻害
本実施例は、BS−194がヌードマウスでMCF−7腫瘍の成長を阻害する能力を示す。全てにおいて、32匹のメスの8〜10週齢のBalb/cヌードマウス(Harlan UK)を無作為に3つの群に分けた。マウスに0.72mgの60日放出E2ペレット(Innovative Research of America, USA)を与え、これを一方の脇腹に皮下移植した。MCF7細胞をトリプシン消化し、0.1mlのPBS中の5×106細胞を各マウスのもう一方の脇腹に皮下注射し、公式(腫瘍の幅の2乗×腫瘍の長さ)/2に従って、2〜3日毎に腫瘍体積を測定した。動物重量も研究の経過を通じて記録された。1日に2回、14日間、10%DMSO、50mM HCl、5% Tween 20、および85%生理食塩水に調製したBS−194を動物に皮下注射し、14日の時点で動物を屠殺した。適切な倫理的承認およびライセンス供与が得られた後に、UK‘Guidance on the operation of animals (Scientific Procedure) Act 1986(HMSO, London, UK, 1990)に従って、異種移植実験を行なった。
BS−194についてのインビトロでのヒト腫瘍細胞株スクリーニング
本実施例は、米国立癌研究所(NCI)/米国立保健研究所(NIH)(例えば、http://dtp.nci.nih.gov/branches/btb/ivclsp.html参照)で示されたプロトコルに従って行なわれた、BS−194についてのインビトロでのヒト腫瘍細胞株スクリーニングの結果を提供する。
濃度がTi>/=Tzの場合、[(Ti−Tz)/(C−Tz)] x 100
濃度がTi<Tzの場合、[(Ti−Tz)/Tz] x 100
BS−193、BS−194、BS−189、およびICEC−0232についてのキナーゼスクリーニング
本実施例では、組換えキナーゼを酵素活性について2通りで試験した。実施例18で示したプロトコルを用いてアッセイを行なった。表13は、10μMのBS−193、BS−194、BS−189、またはICEC−0232を添加した後の(最初の活性のパーセンテージとしての)平均残存活性を示す。平均活性を報告する各々の表示欄について、すぐ右の未表示欄は、平均活性測定のそれぞれの標準偏差に相当する。これらの実験から、最大限の阻害を示す2つのキナーゼが、CDK2およびCK1であることが明らかにされた。
Claims (72)
- 下記の一般式の化合物を含む組成物であって:
Rは、1から6個の炭素原子を含有するヒドロカルビルを表し;
R1は、ヒドロキシル、アルコキシ、水素、またはハロゲンを表し;
R2は、水素、アルカニル、−NRaRb(RaとRbは独立して、最大6個の炭素原子を有する置換されていてもよいヒドロカルビルである。)、1から6個の炭素原子を有するアルコキシ鎖、−SRC(RCは、1から6個の炭素原子を含有するヒドロカルビルである。)、−SO2Rd(Rdは、1から6個の炭素原子を含有するヒドロカルビルである。)、またはハロゲンを表し;
R3は、水素、−SO2NH2、−SO2NReRf(ReとRfは独立して、最大6個の炭素原子を有する置換されていてもよいヒドロカルビルである。)、ハロゲン、または基−(A)a−Alk1[aは0もしくは1であり、およびaが1の場合、Aは−O−、−S−、もしくは−NR6(R6は水素もしくはC1−C5アルカニル鎖である。)であり、ならびにAlk1は、1から6個の炭素原子長さおよびAlk1が少なくとも2個の炭素原子を含有する場合、任意でAlk1の少なくとも2個の炭素原子間の不飽和結合を含有する置換されていてもよい二価のヒドロカルビル鎖である。]であり;
R4は、水素、ハロゲン、アルコキシ、ヒドロキシ、または最大6個の炭素原子を含有する置換されていてもよいヒドロカルビル基を表し;
R5は、水素、ヒドロキシル、アルコキシ、1から8個の炭素原子を有する直鎖、分岐鎖、もしくは環状鎖、またはハロゲンを表し;
Xは、水素、基−Alk2−Z、C1−C4ヒドロカルビル基、またはハロゲン[Alk2は、1から6個の炭素原子長さを含有する置換されていてもよい二価のアルカニル鎖、アルケニル鎖、もしくはアルキニル鎖であり;ならびにZは、−OH基、−OR7基、−SH基、SR7基、−CN基、−NH2基、もしくはNHR7基(R7は、ハロゲンもしくはアルコキシによって置換されていてもよいC1−C6ヒドロカルビル基もしくは複素環基である。)を表す。]を表し;
Yは、基−Alk3−(Q)a−Alk4−B[aは0または1であり、およびAlk3は、2から7個の炭素原子長さを含有するヒドロカルビル鎖(前記ヒドロカルビル鎖は、前記ヒドロカルビル鎖の炭素原子間に二重結合および/または三重結合を含んでもよく、かつ前記ヒドロカルビル鎖は、ハロゲン、アルコキシ、または自身がハロゲン基、ヒドロキシル基、もしくはアルコキシ基で置換されていてもよいアルキル鎖で置換されていてもよい。)を表す。]を表し;
Qは、−CH2−、−O−、−S−、−NR−、−S(O2)−、−C(=O)−、および−S(O)−からなる群より選択され;
Alk4はアルカニル鎖であり;および
Bは、ヒドロキシル、アルコキシ、ハロゲン、アルキルチオ、ニトロ、シアノ、アミン、置換されていてもよい炭素環基、置換されていてもよい複素環基であり、および
XとYは、XとYとを連結する炭素原子と一緒に、置換されていないC1−C6アルキルを形成しない、組成物。 - 化合物が下記の構造を有する塩である、請求項1記載の組成物。
- 下記の構造を有する化合物を含む組成物であって:
R1は、フッ素または水素のいずれかであり;
Xは、水素または基−Alk2−Z(Alk2は、1個もしくは2個の炭素原子を含有するアルカニルであり;ならびにZは−OH基を表す。)を表し;
Yは、基−Alk5(Alk5は、1個または2個の炭素を含み、但し、Alk5は、2個の炭素を含有する場合、脂肪族またはオレフィンであってもよく、かつAlk5は、オレフィンでない場合、各々の炭素原子上で1個のヒドロキシル基で置換されていてもよい。)を表し;および
XとYは、XとYとを連結する炭素原子と一緒に、置換されていないC1−C6アルキルを形成しない、組成物。 - 下記の構造を有する化合物を含む組成物であって:
Rは、1から6個の炭素原子を含有するヒドロカルビルを表し;
R1は、ヒドロキシル、アルコキシ、水素、またはハロゲンを表し;
R2は、水素、アルカニル、−NRaRb(RaとRbは独立して、最大6個の炭素原子を有する置換されていてもよいヒドロカルビルである。)、1から6個の炭素原子を有するアルコキシ鎖、−SRC(RCは、1から6個の炭素原子を含有するヒドロカルビルである。)、−SO2Rd(Rdは、1から6個の炭素原子を含有するヒドロカルビルである。)、またはハロゲンを表し;
R3は、水素、−SO2NH2、−SO2NReRf(ReとRfは独立して、最大6個の炭素原子を有する置換されていてもよいヒドロカルビルである。)、ハロゲン、または基−(A)a−Alk1[aは0もしくは1であり、aが1の場合、Aは−O−、−S−、もしくは−NR6(R6は水素もしくはC1−C5アルカニル鎖である。)であり、Alk1は1から6個の炭素原子長さおよびAlk1が少なくとも2つの炭素原子を含有する場合、任意でAlk1の少なくとも2個の炭素原子間の不飽和結合を含有する置換されていてもよい二価のヒドロカルビル鎖である。]であり;
R4は、水素、ハロゲン、アルコキシ、ヒドロキシ、または最大6個の炭素原子を含有する置換されていてもよいヒドロカルビル基を表し;
R5は、水素、ヒドロキシル、アルコキシ、1から8個の炭素原子を有する直鎖、分岐鎖、もしくは環状鎖、またはハロゲンを表し;
Xは、水素、基−Alk2−Z、C1−C4ヒドロカルビル基、またはハロゲン[Alk2は、1から6個の炭素原子長さを含有する置換されていてもよい二価のアルカニル鎖、アルケニル鎖、もしくはアルキニル鎖であり;Zは、−OH基、−OR7基、−SH基、SR7基、−CN基、−NH2基、もしくはNHR7基(R7は、ハロゲンもしくはアルコキシによって置換されていてもよいC1−C6ヒドロカルビル基もしくは複素環基である。)である。]を表し;
Yは、基−Alk3−(Q)a−(Alk4)b−B[aとbは独立して0または1であり、Alk3は、2から7個の炭素原子長さを含有するヒドロカルビル鎖(ここで、前記ヒドロカルビル鎖は、前記ヒドロカルビル鎖の炭素原子間に二重結合および/または三重結合を含んでもよく、かつ前記ヒドロカルビル鎖は、ハロゲン、ヒドロキシル、アルコキシ、または自身がハロゲン基、ヒドロキシル基、もしくはアルコキシ基で置換されていてもよいアルキル鎖で置換されていてもよい。)を表す。]を表し;
Qは、−CH2−、−O−、−S−、−NR−、−S(O2)−、−C(=O)−、および−S(O)−からなる群より選択され;
Alk4はアルカニル鎖であり;および
Bは、ヒドロキシル、アルコキシ、ハロゲン、アルキルチオ、ニトロ、シアノ、アミン、置換されていてもよい炭素環基、置換されていてもよい複素環基であり、および
XとYは、XとYとを連結する炭素原子と一緒に、置換されていないC1−C6アルキルを形成しない、組成物。 - 少なくともサイクリン依存性キナーゼの活性を阻害する方法であって、前記方法が、少なくとも1つのサイクリン依存性キナーゼを、請求項1、52、または67に記載の組成物に曝露させる工程を含む、方法。
- 少なくとも1つのサイクリン依存性キナーゼが、CDK2、CDK4、CDK5、CDK7、およびCDK9からなる群より選択される、請求項55記載の方法。
- 組成物がBS−181またはBS−194を含む、請求項55記載の方法。
- 癌患者を治療する方法であって、前記方法が、癌細胞を治療有効量の請求項1、52、または67に記載の組成物に曝露させる工程を含む、方法。
- 前記癌が、乳癌、白血病、黒色腫、前立腺癌、肺癌、中枢神経系癌、結腸直腸癌、腎癌、および卵巣癌からなる群より選択される、請求項58記載の方法。
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