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JP2002514893A - 生物学的事象のラパマイシンに基づく調節 - Google Patents

生物学的事象のラパマイシンに基づく調節

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JP2002514893A JP50324497A JP50324497A JP2002514893A JP 2002514893 A JP2002514893 A JP 2002514893A JP 50324497 A JP50324497 A JP 50324497A JP 50324497 A JP50324497 A JP 50324497A JP 2002514893 A JP2002514893 A JP 2002514893A
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Abstract

(57)【要約】 本発明は生物スイッチのための新規な配置形態に関し、動物細胞における生物学的事象を調節するのに有用な新規な方法および材料を提供する。本発明は、FKBP:ラパマイシンに結合しうるタンパク質、FRAP、Tor1、Tor2およびその他のタンパク質をコードする配列から誘導したDNA配列を含む組み換えDNA構築物、FKBPタンパク質の一部または全部をコードするDNA配列を含むその他の組み換えDNA構築物、これらの構築物によりコードされるタンパク質、1または2以上の構築物で形質転換された細胞(特に動物細胞)、キメラタンパク質に結合し、その多量体化を誘導しうる小分子(多価多量体化剤)並びにこれらを製造する方法および利用する方法を含む。

Description

【発明の詳細な説明】 生物学的事象のラパマイシンに基づく調節 発明の背景 ラパマイシン(I)は、FK506結合性タンパク質(FKBP)に高い親和性で結合して ラパマイシン:FKBP複合体を形成する天然タンパク質である。この相互作用に対 して報告されたKd値は200pM程度と低い。ラパマイシン:FKBP複合体は、高い親 和性で大きな細胞タンパク質のFRAPに結合して三成分体(tripartite)の[FKBP:ラ パマイシン]:[FRAP]複合体を形成する。この三成分複合体において、ラパマイシ ンはFKBPをFRAPに結合させるための二量体化剤またはアダプターとして作用する 。FRAPタンパク質の中のFKBP:ラパマイシン複合体と相互作用する部分はFRBド メインと呼ばれ、これについては後で詳しく述べる。FRAP、RAFT1もしくはRAPT1 と命名された大きな哺乳動物性タンパク質またはその酵母同族体であるDRRおよ びTORとのFKBP12のラパマイシン依存性の会合は、いくつかの研究グループによ り報告されてきた。例えば、Brown et al,1994,Nature 369:756-758;Sabatini et al,1994,Cell 78:35-43;Chiu et al,1994,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 91:12574-12578;Chen et al,1994,Biochem.Biophys.Res.Comm.203:1-7;K unz et al,1993,Cell 73:585-596;およびCafferkey et al,1993,Mol.Cell .Biol.13:6012-6023を参照。Chiu et alの同上論文およびStan et al,1994, J.Biol.Chem.269:32027-32030は、FRBドメインを含むFRAPのより小さいサブ ユニットへのFKBP12のラパマイシン依存性結合について述べている。FRAP、RAFT 、RAPTおよびその他のTORタンパク質はそれぞれ相同のFRBドメインを含み、本書 の目的にとってはこれらをFRAPタンパク質と考える。 数多くの天然のFK506結合性タンパク質(FKBP類)が知られている。例えば、K ay,1996,Biochem.J.314.361-385(レビュー)を参照。FKBPタンパク質類は 、Spencer et al,1993,Science 262:1019-1024およびPCT/US94/01617に開示さ れているように、それらのリガンド結合性のために、イムノフィリン系組換えタ ンパク質のリガンド媒介多量体化に基づく生物スイッチ(biological switch)に 使用されてきた。FK506の強力な免疫抑制活性のため、特に動物において二量体 化剤としてのその利用は制限されるかもしれないが、FK506(および関連化合物) の二量体はそのような免疫抑制活性を失っており、FKBPに由来するリガンド結合 性ドメインを含むキメラタンパク質の二量体化に有効であることが示された。 ラパマイシンは、FK506と同様に、タンパク質の天然の二量体化剤であって、 適当に設計されたキメラタンパク質を二量体化することができるが、強力な免疫 抑制活性を始めとするその顕著な生物学的活性により、遺伝子工学処理された生 物スイッチにおけるその使用は、特に動物での使用について、さらに厳重に制限 される。本発明は、ラパマイシン(および関連化合物)の二量体化剤としての可 能性を、その固有の根深い制限を避けながら引き出すものである。発明の要約 本発明は生物スイッチの新規な配置形態に関し、特に動物細胞内での生物学的 事象を調節するための新規な方法および材料を提供する。その種の生物学的事象 の例としては、遺伝子転写、例えば遺伝子発現またはアポトーシス(apoptosis) による細胞死に至る細胞内シグナル伝達経路の活性化、遺伝子ノックアウト、遺 伝子の発現の阻止、および遺伝子産物の機能の阻害が挙げられる。本発明は、2 種類のキメラタンパク質を利用したものであり、これらのキメラタンパク質は、 1つの共通のリガンドへの相互結合を経て複合体化させた時に、直接または間接 に所望の事象を作動させることができる。 本発明は、上述した2種類のキメラタンパク質をコードする組換えDNA構築物( constructs);それら構築物を1種もしくは2種以上含むDNAベクター;前記構築 物によりコードされる融合タンパク質(fusion proteins);本書に述べるDNA構築 物の1種もしくは2種以上で形質転換された(即ち、これら構築物を含み、発現 することができる)細胞、特に動物細胞;上記キメラタンパク質分子に結合し、 その多量体化を誘導することができる小分子(2価または多価多量体化剤);な らびにこれらの作製および使用方法を包含する。 より具体的には、本発明は、ラパマイシンの存在またはラパマイシンの構造類 似体(analog)、模擬体(mimic)もしくは誘導体(ラパログ<rapalog>と総称)の存 在に応答性の遺伝子工学処理された細胞の作製および使用方法および材料を提供 する。本発明はラパマイシンまたはラパログの存在下で互いに複合体化すること ができる一組の融合タンパク質をコードする組換えDNAの細胞への導入を利用す る。このような遺伝子工学処理された細胞がラパマイシンまたは適当なラパログ と接触すると、融合タンパク質の複合体化と生物学的応答の開始が起こる。融合 タンパク質の一方は、FKBP:ラパマイシン結合性(FKBP:rapamycin binding)(=FR B)ドメインの1または2以上のコピーと少なくとも1つの異種(heterologous)タ ンパク質ドメインとを含んでいる。もう1つの第2の融合タンパク質は、ラパマ イシンまたはラパログに結合することができ、かつFRB含有タンパク質と複合体 を形成することができるFKBPタンパク質に由来するドメインの1または2以上の コピーを含んでいる。第2の融合タンパク質はまた、最初の融合タンパク質の異 種ドメインと同一でも異なっていてもよい少なくとも1つの異種ドメインを含ん でいる。本発明の融合タンパク質に使用するためのFRBおよびFKBPドメインは、 天然タンパク質から選んでもよく、また後で詳しく説明するようにさまざまに修 飾してもよい。多様な種(species)に由来するFRB、FKBPおよび異種ドメインを使 用することができるが、ヒトの遺伝子治療の用途に対してはヒトのペプチド配列 またはその変異型が好ましい。操作的には、FRBまたはFKBPドメインはレセプタ ー(または「リガンド結合性」)ドメインとして作用し、ラパマイシンまたはラ パログ分子の媒介下で融合タンパク質の複合体化を指令する。ラパマイシンまた はラパログで媒介される複合体化により始動(trigger)される生物学的応答の性 質は、融合タンパク質の異種ドメインにより決まる。従って、この異種ドメイン は「作用(action)」ドメインとも呼ばれる。 これらの融合タンパク質には多様な異種タンパク質ドメインを使用することが できる。本発明の1側面では、2つの融合タンパク質(その一方は少なくとも1 つのFRBドメインを含み、もう一方は少なくとも1つのFKBPドメインを含む)は 、それぞれ少なくとも1つの異なる異種ドメイン、即ち、他方の融合タンパク質 に含まれていない異種ドメインを含んでいる。例えば、ある態様においては、融 合タンパク質の一方は少なくとも1つのDNA結合性ドメインを含み、他方の融合 タンパク質は少なくとも1つの転写活性化ドメインを含む。2つの融合タンパク 質のリガンドで媒介される会合は、転写因子複合体の形成を発現し、一方の融合 タンパク質上のDNA結合性ドメインで認識された(即ち、このドメインと結合する ことができる)DNA配列に結合した標的遺伝子の転写の開始を生ずる。別の態様で は、融合タンパク質の一方が、その融合タンパク質を細胞膜、核などの特定の細 胞内位置に向かわせることができる少なくとも1つのドメインを含んでいる。細 胞膜を標的とする局在化ドメインには、ミリストイル化部位またはレセプタータ ンパク質もしくは膜にわたる他のタンパク質の貫膜(transmembrane)領域といっ たドメインが含まれる。もう一方の融合タンパク質は、膜局在化および/または クラスター化(clustering)した後に、細胞シグナル伝達経路を活性化することが できるシグナル化ドメインを含んでいる。シグナル化ドメインの例には、成長因 子もしくはサイトカインレセプターの細胞内ドメイン、FASまたはTNF-R1の細胞 内ドメインのようなアポトーシスを引き起こすドメイン、ならびにSOS,Raf,lc k,ZAP-70等の他の細胞内シグナル化タンパク質に由来するドメインが含まれる 。多数のシグナル化タンパク質が、PCT/US94/01617(例、23〜26頁を参照)に 開示されている。さらに別の態様では、2つの融合タンパク質のそれぞれが、少 なくとも1つのFRBドメインおよび少なくとも1つのFKBPドメイン、ならびに1 または2以上の異種ドメインを含んでいる。このような融合タンパク質は、ラパ マイシンまたはラパログの存在下でホモ二量体化することができる。一般に、宿 主細胞に内生のペプチド配列を含むドメインが好ましい。例えば、ヒトの遺伝子 治療に対してはヒト起源のドメインが特に有利である。 融合タンパク質をコードする組換えDNA分子も、特に真核細胞(その中でも酵 母および動物細胞が特に有利である)内でそれらの発現を指令するベクターと同 様に提供される。融合タンパク質の構成成分を考慮すると、これらをコードする 組換えDNA分子は、(a)融合タンパク質の所定のリガンド結合性ドメイン(FRB ドメインまたはFKBPドメイン)もしくはこの種のドメインを含むタンパク質をコ ードするDNA分子、ならびに(b)上記の異種ドメインもしくはこの異種タンパク質 ドメインが誘導されるタンパク質をコードするDNA分子、に選択的にハイブリッ ド形成することができる。遺伝暗号の縮重がなければこのようなハイブリッド形 成が可能であるDNAも包含される。 本発明のキメラタンパク質をコードするDNA配列と、真核細胞内でのそれらの 発現を指令することができるベクターとを用いて、多数の重要な用途に対して細 胞を遺伝子工学処理することができる。それには、まず所望のキメラタンパク質 の真核細胞(好ましくは動物の)内での発現を指令するために発現ベクターまた はDNA構築物を用意し、次いで該細胞内に組換えDNAを、細胞の少なくとも一部で DNA取り込みおよび導入されたDNAの発現が可能となるように導入する。DNAを異 種遺伝子発現のために細胞内に導入するための各種の方法および材料のいずれも 使用でき、多様なこの種の方法および材料が周知であるか、および/または市販 されている。 かくして、本発明の目的の1つは、本書に説明するように2つの融合タンパク 質をコードする組換えDNAを含む動物細胞を提供することである。この融合タン パク質の一方はラパマイシンもしくはラパログに結合することができ、かつ少な くとも1つのFKBPドメインとこれとは異種の少なくとも1つのドメインとを含ん でいる。第2の融合タンパク質は、少なくとも1つのFRBドメインとこれとは異 種の少なくとも1つのドメインとを含んでいて、第1の融合タンパク質ならびに ラパマイシンもしくはラパログの1もしくは2以上の分子と一緒に三成分複合体 を形成することができる。一部の態様では、融合タンパク質の一方に存在する1 または2以上の異種ドメインが、他方の融合タンパク質にも存在する。即ち、2 つの融合タンパク質は1または2以上の共通異種ドメインを有している。別の態 様では、融合タンパク質がいずれも1または2以上の異なる異種ドメインを含ん でいる。 本発明の具体的目的は、細胞をラパマイシンまたはラパログと接触させると標 的遺伝子の転写を生ずるように遺伝子工学処理された動物細胞を提供することで ある。このような細胞は、2つの融合タンパク質をコードする組換えDNAに加え て、融合タンパク質とラパマイシンまたはラパログとの複合体の存在に応答性の DNA配列に標的遺伝子を操縦可能に連結させてなる標的遺伝子構築物を含んでい る。ある態様では、この細胞は、宿主細胞の内生のFKBPもしくはFRB含有タンパ ク質への結合に対して検出可能な優先度でFKBP融合タンパク質およびFRB融合タ ンパク質に結合するラパログとの接触に対して応答する。 本発明の別の具体的目的は、細胞をラパマイシンまたはラパログと接触させる と細胞死滅の開始を生ずるように遺伝子工学処理された動物細胞を提供すること である。このような細胞では、融合タンパク質の少なくとも一方に存在する異種 ドメインの少なくとも1つが、FASまたはTNF-R1の細胞内ドメインのような、ク ラスター化によりその細胞のアポトーシスを発動するドメインである。 本発明の別の具体的目的は、細胞をラパマイシンまたはラパログと接触させる と細胞の成長(growth)、分化または増殖(proliferation)を刺激するように遺伝 子工学処理された動物細胞を提供することである。このような細胞では、融合タ ンパク質の少なくとも一方に存在する異種ドメインの少なくとも1つが、ホルモ ンのレセプターの細胞内ドメインのような、細胞の成長、分化または増殖を媒介 するドメインである。細胞の成長、分化および/または増殖は、レセプターの細 胞内シグナル化ドメインのクラスター化に続いて生ずる。このようなクラスター 化は、本質的にホルモン結合の後に、本発明の遺伝子工学処理された細胞内では ラパマイシンまたはラパログとの接触の後に起こる。 ヒトの遺伝子治療の用途に対してはヒト起源の細胞が好ましいが、多様な起源 (ヒトまたは他の種)の細胞型を使用することもでき、所望によりこれをヒト被 験者用の生体適合性の材料の中に封入(カプセル化)してもよい。 本発明の別の目的は、前述した遺伝子工学処理された細胞の作製用の材料およ び方法を提供することである。この目的は、融合タンパク質をコードする組換え DNAを、標的遺伝子構築物のような任意の補助の組換えDNAと一緒に用意し、これ らの組換えDNAを宿主細胞内に、該細胞によるDNA取り込みが可能な条件下で導入 することにより達成される。このようなトランスフェクションは、培養状態に保 持された宿主細胞を用いてex vivo(生体外)で行ってもよい。培養液態で遺伝子 工学処理された細胞は、その後に例えばex vivo遺伝子治療用途において、宿主 生体内に導入することができる。即ち、そのようにすると、ラパマイシンまたは ラパログの存在に応答性(本書に説明した意味で)のある宿主生体、好ましくは ヒトまたはヒト以外の哺乳動物、を提供する方法を構成する。或いは、ヒトまた はヒト以外の宿主生体内に存在する宿主細胞を用いて、トランスフェクションを in vivo(生体内)で行ってもよい。この場合には、宿主生体の1種もしくは2種 以上の細胞によりDNAの取り込みが可能な条件下で、DNA分子は宿主生体内に直接 導入される。従って、この手法は、ラパマイシンまたはラパログの存在に応答性 (本書に説明した意味で)のある宿主生体、好ましくはヒトまたはヒト以外の哺 乳動物、を提供する別の方法を構成する。培養中の細胞内または完全な生体内に DNAを導入するための各種の材料および方法が当該技術分野で既知であり、これ らを本発明の実施において採用することができる。 本書に説明する遺伝子工学処理された細胞を用いて他の目的が達成される。例 えば、本書に説明する遺伝子工学処理された細胞を有効量のラパマイシンまたは 適当なラパログと接触させ、ラパマイシンまたはラパログを融合タンパク質との 複合体形成が可能になるようにすることにより、本発明の融合タンパク質を多量 体化する方法が提供される。融合タンパク質の多量体化が標的遺伝子の転写を発 動する態様では、これは標的遺伝子の発現を活性化する方法となるる。融合タン パク質が1または2以上のシグナル化ドメインを含む態様では、これは細胞シグ ナル伝達経路を活性化する方法となる。融合タンパク質が、クラスター化により アポトーシス性の細胞死を発動することができる1または2以上のドメインを含 む態様では、これは細胞死滅を作動させる方法となる。これらの方法は、細胞培 養物中でも、またはヒトの患者を包含する完全な生体内でも実施できる。前者の 場合には、ラパマイシンまたはラパログを培地に加える。後者の場合には、その 完全な生体にラパマイシンまたはラパログ(これは医薬または獣医薬組成物の形 態でもよい)を、例えば、経口、非経口等で投与する。好ましくは動物へのラパ マイシンまたはラパログの投与量は、受容体内での不当な免疫抑制を生ずる恐れ のある投与量水準より少なくする。 本発明の別の目的は、ヒトまたはヒト以外に動物の細胞を本書に説明するよう に遺伝子工学処理する際に用いるためのキットを提供することである。このよう なキットの1つは、本発明の一対の融合タンパク質をコードする組換えDNA構築 物を含んでいる。この組換えDNA構築物は一般に、動物細胞への導入に適した真 核性発現ベクターの形態をとり、その中で融合タンパク質の発現を指令すること ができる。このキットはまた、コードされた融合タンパク質と複合体を形成する ことができるラパマイシンまたはラパログのサンプルを含んでいてもよい。この キットはさらに、FK506または融合タンパク質の一方には結合することができる が、両方との複合体を形成することができない何らかの他の化合物のような多量 体化拮抗剤を含んでいてもよい。ある態様では、融合タンパク質をコードする組 換えDNA構築物は、1または2以上の異種ドメインをコードするDNAの代わりにク ローン化部位を含んでおり、それにより実施者が特定の異種ドメインをコードす るDNAを導入することが可能となる。別のある態様では、キットは、後でより詳 しく説明するように、複合体を形成した融合タンパク質の存在に応答性のDNA配 列に連結した標的遺伝子またはクローン化部位を含有する標的遺伝子構築物をさ らに含有していてもよい。図面の簡単な説明 図1(A)DNA結合性ドメインを含有するFKBPキメラの転写活性化ドメインを 含有するFRAPキメラとのラパマイシン依存性二量体化を示す。(B)実験例のい くつかに用いた代表的プラスミドの模式図。転写因子融合タンパク質は、ヒト部 位メガロウイルス(hCMV)即時型プロモーターおよびエンハンサーの制御下に作製 した。「E」はエピトープタグを意味し、「N」はSV40 T抗原核局在化配列を意 味し、どちらも転写因子のN末端に融合している。リポーター遺伝子は、ZFHD1 の12縦列反復結合部位に隣接する、エンハンサー配列が欠如した最小hCMVプロモ ーターからなるものであった。 図2は、本発明の融合タンパク質の多様なFRAP由来およびFKBP由来ドメインを ラパマイシンおよびラパマイシン類似体と一緒に模式的に示す。 図3は、各種の多量体とFRAPおよびFKBPドメインの配置形態を用いた転写検定 において得られた結果を比較する。 図4は、一時的にトランスフェクションされた細胞(A,B)および安定的にトラ ンスフェクションされた細胞(C,D)における各種ラパマイシン濃度での分泌アル カリ性ホスファターゼ活性の生成により測定したラパマイシン依存性遺伝子転写 の用量応答曲線を示す。(A)ZFHD1-3FKBPおよび1FRB-p65(361-450)をコードす るプラスミドは、pZHWTx12-CMV-SEAPリポーター遺伝子によりHT1080細胞中にト ランスフェクションした。増殖培地中に分泌されたSEAP活性は、表示濃度のラパ マイシンと一緒にインキュベーションした後で測定した。(B)表示のプラスミ ド(-)を省略し、空の発現ベクターだけと置き換えた。SEAP活性は、表示のよう に10nMラパマイシンの存在または不存在下でインキュベーションした後に測定し た。トランスフェクションは4回行い、平均値(相対単位)±標準偏差をプロッ トした。安定細胞系でのラパマイシン調節遺伝子発現。(C)pLH-ZHWTx12-IL2- SEAPリポーター遺伝子、ZFHD1-3FKBP DNA結合性ドメイン、およびIFRB-p65(361- 550)活性化ドメインを、3工程でHT1080細胞中に安定に組み込んでクローン性細 胞系HT20-6を作製した。増殖培地中に分泌されたSEAP活性を、表示濃度のラパマ イシンと一緒にHT20-6細胞をインキュベーションした後に測定した。検定は3回 行い、平均値(相対単位)±標準偏差をプロットした。(D)上図:単一転写物 からIFRB-p65(361-550)およびZFHD1-3FKBPの両方の発現に用いたIRES含有プラス ミドの模式図。下図:安定に組み込まれたpLH-ZHWTx12-IL2-SEAPリポーター遺伝 子を既に含んでいるHT1080細胞中に、ゼオシンに対する耐性を付与するプラスミ ドと一緒に、pCGNN-1FRB-p65(361-550)-IRES-ZFHD1-3FKBPをトランスフ ェクションした。ゼオシン耐性クローンであるHT23細胞のプールを表示濃度のラ パマイシンと一緒にインキュベーションし、増殖培地中に分泌されたSEAP活性を 測定した。 図5は、各種配置形態の転写因子融合タンパク質を用いたラパマイシン依存性 遺伝子転写実験の結果を示す。実験は、この系におけるラパマイシン結合性ドメ インの最適な配置形態を決定する目的で行った。HT1080細胞を表示のZFHD1-FKBP およびFRB-p65(450-550)融合タンパク質をコードするプラスミドによりトランス フェクションした。トランスフェクションされた細胞を10nMラパマイシンを含有 する培地でインキュベーションし、SEAP活性を測定した。トランスフェクション は3回行い、平均値(相対単位)±標準偏差をプロットした。イムノブロット分 析の結果は、より高水準で発現を生じたZFHD1-1FKBPを除いて、全ての融合物が 同程度の水準で発現したことを示している。トランスフェクションした各プラス ミドの量を広範囲に変更した場合にも同様の結果が得られた。結果は、4回の別 々の実験の表示である。 図6は、遺伝子工学処理された細胞を予め移植しておいた動物への二量体化剤 のin vivo投与が、調節された遺伝子発現ならびに遺伝子産物の産生および分泌 を生じたことを示す。トランスフェクションされたHT1080細胞(異なる4個所に 計2×106個/動物)を、雄性nu/nuラットに筋肉内注射した。約1時間後、動物 は表示濃度のラパマイシンの静脈内投与を受けた。ラパマイシン投与の17時間後 に血液試料を採取し、hGH濃度について検定した。ラパマイシン処置は、血清hGH 濃度(X±SEM;n=用量ごとに最低5)の用量依存性の増大を生じた。*はそれ ぞれより低いラパマイシン用量からの統計学的有意性を意味し、+は10倍または それ以上低いラパマイシン用量からの統計学的有意性を意味する(p<0.05、分 散およびターキー・クラマー多数回比較検定<Turkey-Kramerm ultiple comparis on testing>の1方向解析)。 図7は、実施例4に記載(図6も参照)のように遺伝子工学処理し、マウスに 移植したHT1080細胞が、ラパマイシンの静脈内投与後に長時間にわたってhGHを 産生することができる能力を示す。各マウスは、トランスフェクションされたHT 1080細胞の移植後に10.0mg/kgのラパマイシンで処置した。ラパマイシン投与の 4、8、17、24、および42時間後に血液試料を採取し、血清hGH濃度を測定した (X±SEM;n=地点ごとに最低4)。hGH応答の最終的な半減期は11.4時間であ ると算出された。 図8は、移植された遺伝子工学処理細胞が、最初の投与の作用が消失した後に 2回目のラパマイシン投与により再刺激される能力を示す。ラパマイシン(10.0 mg/kg)を多数の時点(矢印)で投与した。データは、X±SEM(n=地点ごとに 4〜9マウス)としてプロットした(実線)。実験の時間中を通して循環してい ると推定されるラパマイシンの濃度もプロットした(破線)。図中に「推定トラ フ(trough)ラパマイシン濃度」として示す平らな水平の線は、ラパマイシンの薬 物速度論およびこの試験で採用した16時間の投与間隔から算出したラパマイシン の定常状態トラフ濃度を表す。80時間から始まる下降線は、推定循環ラパマイシ ン濃度を表し、これは4.6時間の消失半減期を示している。 図9は、実施例6に記載した競合的FP検定を用いたFKBP結合親和性に対する各 種のラパマイシンC24オキシム(実施例5に記載のようにして調製)の分析結果 を示す。結果は、2つの別個の実験の平均値±SDで示す(C24メチルオキシムのプ ロットは1回の実験を示す)。 図10は、表示化合物の存在下にHis6標識FKBPと一緒にインキュベーションした 後、Ni-NTAアガロースでの捕捉および溶離した場合の、FRAP(アミノ酸2015-2114 )を表示(発現)するファージミド(phagemids)の特異的集積(enrichment)を示す 。結果は、非表示の対照ファージミドに対するFRAPファージミドの比として示し 、ソート前の比=1である。実験の詳細は実施例7。 図11:実施例7に記載のようにしてFKBP表示ファージを調製し、その結合性を ELISAにより分析した。一定量のFKBPファージ粒子を異なる濃度のFK506と一緒に インキュベーションした後、ストレプタビジン(streptavidin)に結合させたビオ チニル化FK506を塗布したウェルに適用した。ファージ結合は、HRPに複合した抗 ファージポリクローナル抗体により視覚化された。エラー棒線は、三回の測定の SDを示す。結果は、ファージ上に表示されたFKBPが、可溶性タンパク質(IC50=5 0nM)と本質的に同一の値でFK506と相互作用することを示している。 図12は、シグナル伝達プロセスのラパマイシン依存性制御に有用な配列形態の 代表例を示す。M/Eは、キメラ構築物を膜に位置させるミリストイル化モチーフ または細胞外レセプタードメインを意味し;EFFはオリゴマー化により細胞性応 答を誘起させるエフェクタードメイン(例えば、FASの死滅ドメインを含むポリ ペプチド)を意味する。どちらの配置形態を使用しても、エフェクタードメイン をホモ二量体化またはヘテロ二量体化(ヘテロ二量体化は(a)においてEFFおよび EFF'なる表示により示される)することができる。多くの他の配置形態も実現可 能であり、特に各ドメインの順序および数は適宜変更することができる。 図13は、実施例8に記載したように、ミリストイル化ドメイン、ヒトFRAPから のFRBドメイン、hFKBP12からのFKBPドメイン、およびFasの細胞内ドメインの一 部からなる混合キメラタンパク質を発現する細胞の生存の減少(a,b)を示す。(c )は、AP1428の存在下では二量体化するが、ラパマイシンの存在下ではしないよ うに設計した、ミリストイル化ドメイン、2つのFKBPドメインおよびFas細胞内 ドメインからなるキメラを用いた対照実験を示す。 図14は、Lex結合部位を含むDNAと一緒にインキュベーションしたほぼ同量のLe x-FKBPおよびLex-FRAPタンパク質を含有する結合反応のゲル移動度シフト検定を 示す。ラパマイシンの不存在下では、特異的結合は全く検出されない(図14、列 1)。結合反応中のラパマイシンの混入量が増えると、同時に移動度シフトゲル 中に特異的複合体の出現を生ずる(列2〜4)。この結果は、LexA標的配列を含 むDNAに結合することができるLex-FKBP/Lex-FRAPヘテロ二量体の生成をラパマ イシンが促進するという結論を支持する。それ以上の詳細については実施例9を 参照。発明の詳細な説明 次の定義および説明情報は本発明の開示の完全な理解に役立つであろう。 FRB ドメインは、典型的には少なくとも約89のアミノ酸残基からなるポリペプ チド領域(タンパク質「ドメイン」)であり、FKBPタンパク質およびラパマイシ ン(またはラパログ)との三成分複合体を形成することができる。FRBドメイン は、ヒトおよび他の種からのFRAPタンパク質(文献によっては"RAPT1"または"RA FT"とも呼ばれる);Tor1およびTor2を包含する酵母タンパク質;ならびにカン ジダFRAP同族体を始めとする多数の天然タンパク質中に存在している。これらの タンパク質のヌクレオチド配列、クローニング、および他の特徴に関する情報は 当該技術分野では既に公知であり、例えば周知の方法および公表された配列に基 くPCRプライマーを用いて、所望のFRBペプチド配列をコードするDNAの合成また はクローニングが可能である。 本発明に用いるFRBドメインは、一般に少なくとも約89〜100のアミノ酸残基を 含有する。Chiu et alの同上文献の図2は、保存されたFRB領域を包含するヒトF RAP、ネズミFRAP、S.cerevisiae(サッカロミセス・セレビシエ)Tor1およびS.c erevisiae Tor2の160アミノ酸範囲を表示している。典型的には、本発明の融合 タンパク質に使用するために選ばれたFRB配列は、上記の図の配列番号で、Glu-3 9からLys/Arg-127までの少なくとも89のアミノ酸配列に及んでいよう。因みに、 Chen et alまたはSabitini et alの配列番号を使用すると、この89のアミノ酸配 列の番号は、ヒトFRAPの場合でGlu-2025からLys-2113まで、Tor2の場合でGlu-19 65からLys-2053まで、Tor1の場合でGlu-1962からLys-2050までになる。本発明の 融合タンパク質に用いるFRBペプチド配列は、ラパマイシンまたはラパログに結 合されたFKBPタンパク質の複合体に結合することができ(このような結合を検出 するための任意の手段により直接的または間接的に決定して)、かつ上述 したタンパク質の指定された89のアミノ酸領域または相同タンパク質の対応領域 にまたがる天然のペプチド配列を含んでいてもよく;この天然配列に対してその 領域内に約10個まで(好ましくは1〜5個)のアミノ酸の置換、挿入または欠失 を含んでいてもよく;天然FRB領域をコードするDNA分子と選択的にハイブリッド 形成することができるDNA配列によりコードされるペプチド配列であってもよく ;或いは遺伝暗号の縮重がなければ天然のFRB領域をコードするDNA分子と選択的 にハイブリッド形成することができるDNA配列によりコードされるものであって もよい。 FKBP(FK506結合性タンパク質)は、FK506、FK520およびラパマイシンのよう なマクロライド(macrolide)の細胞質ゾル(サイトゾル)性レセプターであり、 種の主系統にわたり高度に保存されている。本発明の開示の目的にとって、FKBP は、本発明のラパマイシンまたはラパログに結合することができ、さらにFRB含 有タンパク質と三成分複合体を形成することができる、タンパク質またはタンパ ク質ドメインである。各種のFKBP種のヌクレオチド配列、クローニング、および 他の特徴に関する情報は当該技術分野では既に公知であり、例えば周知の方法お よび公表された配列に基づいたPCRプライマーを用いて、所望のFKBPペプチド配 列をコードするDNAの合成またはクローニングが可能である。例えば、Staendart et al,1990,Nature 346,671-674(ヒトFKBP12);Kay,1996,Biochem.J.31 4,361-385(レビュー)を参照。他の哺乳動物種、酵母、および他の生体内の相同 FKBPタンパク質も当該技術分野で公知であり、本書に開示する融合タンパク質に 使用することができる。例えば、Kay,1996,Biochem.J.314,361-385(レビュ ー)を参照。本発明に使用するFKBPドメインのサイズは、どのFKBPタンパク質を 使用するかに応じて変わってくる。本発明の融合タンパク質に用いるFKBPペプチ ド配列は、ラパマイシンまたはラパログに結合して、FRB含有タンパク質との三 成分複合体の形成に関与することができ(このような結合を検出するための任意 の手段により直接的または間接的に決定して)、かつヒトFKBP12タンパク質(後 で例示)に由来する天然のペプチド配列、または他のヒトFKBP、ネズミその他の 哺乳動物のFKBP、もしくは何らかの他の動物、酵母もしくは真菌のFKBPに由来す るペプチド配列を含んでいてもよく;この天然配列に対してその領域内に約 10個まで(好ましくは1〜5個)のアミノ酸の置換、挿入または欠失を含んでい てもよく;天然のFKBPをコードするDNA分子と選択的にハイブリッド形成するこ とができるDNA配列によりコードされるペプチド配列であるか或いは遺伝暗号の 縮重がなければ天然のFKBPをコードするDNA分子と選択的にハイブリッド形成す ることができるDNA配列によりコードされるものであってもよい。 本書で使用した「選択的にハイブリッド形成することができる」なる語句は、 2つのDNA分子が、ハイブリッド形成条件(これは当該技術分野の通常の知識を もつ実施者により経験的に選択ないし容易に決定することができる)下で、他の DNA分子の存在にもかかわらず、相互にハイブリッド形成し易いことを意味する 。このような処置としては、0.2〜6xSSCおよび/または0.1〜1% SDSを含有する 緩衝液により室温ないし65〜75℃の範囲の温度で強く洗浄するといった、高緊縮 度の条件を含む。例えば、F.M.Ausubel et al編,Short Protocols in Molecul ar Biology,Units 6.3および6.4(John Wiley and Sons,New York,第3版,1 995)を参照。 本書で用いた「組換え」、「キメラ」および「融合」なる用語は、各種の成分 ドメイン又は配列が、これらが本来は同じ配置内に一緒に存在しないという意味 で互いに異種であるということを意味する。より具体的には、これらの成分部分 は、本来は同じ連続ポリペプチドもしくはヌクレオチド配列または分子内で、少 なくとも本発明のキメラタンパク質または組換えDNA分子に存在するのと同じ順 序もしくは向きまたは同じ間隔では見出されない。 「二量体化」、「オリゴマー化」および「多量体化」は、本発明の実施におい て、2またはそれ以上のタンパク質が、1つの共通のリガンドへの各タンパク質 の結合を経て会合することを意味する。FRBドメインを含むタンパク質、FKBPド メインを含むタンパク質、およびラパマイシン分子からなる三成分複合体の形成 は、二量体化の例である。本発明のある態様では、融合タンパク質はFRAPおよび /またはFRBドメインの複数のコピーを含んでいる。このようなタンパク質の複 合体は、2分子以上のラパマイシンまたはラパログと、成分タンパク質の1また は2以上の2コピー以上を含有することがある。このような多量体複合体も、1 または2以上の成分が複数コピーで有するとしても、3種類の成分分子の存在を 表すために本書ではなお三成分複合体と称することにする。 ラパログは、FKBP融合タンパク質と結合することができ、かつFKBP融合タンパ ク質およびFRB融合タンパク質との複合体を形成することができる、ラパマイシ ン以外の化合物であり、好ましくは分子量が5kD以下、より好ましくは2.5kD以 下である。特に興味あるラパログとしては、次式で示される、ラパマイシンそれ 自体以外の化合物が挙げられ、 上記式中、Uは-H,-OR1,-OC(O)R1,-OC(O)NHR1,-SR1,-NHR1,-NHC(O)R1,-N H-SO2-R1または-R2であり;Vは-OR3または(=O)であり;Wは=O,=NR4,=NOR4 ,=NNHR4,=NHOR4,-NHNHR4,-OR4,-OC(O)R4,-OC(O)NR4,または-Hであり;Y は-OR5,-OC(O)R5または-OC(O)NHR5であり;Zは=O,-OR6,-NR6,-H,-NC(O)R6 ,-OC(O)R6または-OC(O)NR6であり;R2は置換アリールもしくはアリルもしくは アルキルアリール(例、ベンジルまたは置換ベンジル)であり;R3はH,-R7,-C (O)R7,-C(O)NHR7,またはC-28/C-30環式カーボネートであり:R1,R4,R5,R6 およびR7は、H,アルキル,アルキルアリールおよびアリールから別個に選ばれ、 上記化合物は個々の分割された立体異性体ならびにそれらの混合物を包含する。 特に興味あるラパログは、天然のヒトFKBPおよびFRBドメインからなるタンパク 質と、レセプタードメインの一方または両方が少なくとも1つのアミノ酸置換、 欠失または付加を含んでいる対応するFKBPおよびFRBドメインを含むタンパク質 と比べた場合に、測定可能により低い親和性で複合体を形成する。 ・ ・ ・ ・ 上述したように、キメラタンパク質は、FRAPまたはFKBPタンパク質に由来する ペプチド配列を含んでいる少なくとも1つの「レセプター」または「リガンド結 合性」ドメインと、このレセプタードメインに対して異種であるが、キメラタン パク質分子のオリゴマー化により細胞性または生物学的な応答を発動することが できる少なくとも1つの「作用」ドメインとを含んでいる。このキメラタンパク 質の作用ドメインは、キメラタンパク質のオリゴマー化またはクラスター化によ り所望の生物学的結果を達成することができる広範囲の多様なタンパク質ドメイ ンから選択しうる。例えば、ある作用ドメインは、特定の細胞位置(膜、核、他 のオルガネラ等)にキメラタンパク質を向かわせることができる局在化ドメイン 、または例えば成長因子レセプターもしくはサイトカインレセプターの細胞内ド メインに由来し、クラスター化または多量体化により、細胞成長もしくは増殖、 所望遺伝子の転写、細胞死または他の何らかの所望の結果に至る細胞内シグナル 伝達経路を開始させることができるシグナル化ドメインから構成しうる。例えば 、T細胞レセプターCD3ゼータドメインの細胞内部分に由来する作用ドメインを 含んでいるキメラタンパク質のクラスター化は、IL-2プロモーターまたはその誘 導体の転写制御下で遺伝子の転写を発動する。別の態様では、作用ドメインはFA S抗原またはTNF-アルファレセプター(TNFアルファ-R1)のようなタンパク質に由 来するドメインからなり、これはオリゴマー化により細胞のアポトーシスを発動 することができる。さらに別の態様では、作用ドメインは、キメラタンパク質の オリゴマー化が、DNA結合性ドメインにより認識される(このドメインと特異的 結合相互作用をすることができる)DNA配列に連結された遺伝子の転写を生じる 転写因子複合体を組立てるように対を選択した、GAL4のようなDNA結合性ドメイ ンとVP16のような転写活性化ドメインとからなる。 これらのキメラタンパク質の発現をコードするDNA構築物質(および標的遺伝 子をコードするDNA構築物のような補助構築物)を、宿主細胞の遺伝子操作に使 用するために用意する。本発明の遺伝子工学処理された細胞を作製するには、前 述したDNA構築物を含み、かつ所望のキメラの発現を指令することができる組換 えDNA分子を宿主細胞内に導入する。任意の所望の補助構築物も導入する。これ は慣用の方法および材料(多様なその例が市販されている)を用いて行うことが できる。所望により、修飾された細胞をその後に選択し、他の細胞から分離し、 培養してもよく、これらも常法により実施できる。本発明の遺伝子工学処理され た細胞は、このようなキメラタンパク質をコードする少なくとも1つのDNA構築 物を含み、かつこれを発現させることができる。ある態様では、この細胞は、適 当なリガンドの存在下で多量体化することができる一対の本発明のキメラタンパ ク質をコードするDNA構築物を含み、かつこれを発現させることができる。別の 態様では、細胞は、多量体化されたキメラタンパク質に応答性のDNA要素の発現 制御下で標的遺伝子を含有する標的遺伝子構築物をさらに含んでいる。遺伝子工 学処理された細胞は、1または2以上の導入されたDNA分子により一時的にトラ ンスフェクションされたものでも、安定的に形質転換されたものでもよい。 有用な多量体化用のリガンドとしては、本発明のFRBおよびFKBPドメインを二 量体化することができるラパマイシンおよびラパログが挙げられる。このような 化合物は2価リガンドである、即ち、それぞれFRAPおよびFRBドメインを含有す る2またはそれ以上のキメラタンパク質分子に結合して多量体化することができ る。 本発明の多くの態様が、一対の異なるキメラタンパク質をコードする2つの組 換えDNA分子(または同じDNA分子内の少なくとも2つの組換えDNA配列)に関連 する。第1の組換えDNA分子は、(i)ラパマイシンまたはラパログに結合するこ とができる少なくとも1つのFKBPドメインと、(ii)このようなFKBPドメインの少 なくとも1つに対して異種の少なくとも1つのタンパク質("作用")ドメインとか らなるキメラタンパク質をコードする。この種のキメラタンパク質を単に「FKBP キメラ」と称するが、これはラパマイシンまたはラパログに結合して、FKBP12の ような天然のFKBPタンパク質のラパマイシンへの結合により形成される複合体に 類似した複合体を形成することができる。第2の組換えDNA分子は、(i)第1の キメラタンパク質とラパマイシンまたはラパログとにより形成された複合体に結 合することができる少なくとも1つのFRBドメインと、(ii)このようなFRBドメイ ンの少なくとも1つに対して異種の1つのタンパク質("作用")ドメインとを含ん でいるキメラタンパク質をコードする。この種のキメラタンパク質を、単に「FR APキメラ」と称する。FKBPキメラとFRAPキメラの対は、例えば共免疫沈降を 始めとする多用な手段により検出できる、ラパマイシンまたはラパログと一緒に 三成分複合体を形成することができる。1キメラ当たりに複数のFKBPおよび/ま たはFRBドメインを包含する態様は、ラパマイシンまたはラパログの存在下で、 より高次の多量体を形成することができる。一部の態様は、1もしくは2以上の FRBドメインおよび少なくとも1つのレセプタードメインに対して異種の1もし くは2以上のFKBPドメイン、1もしくは2以上作用ドメインを含有する「混合」 キメラタンパク質をコードする組換えDNA分子に関連する。混合キメラは、混合 キメラタンパク質分子のラパマイシンまたはラパログへの相互結合により、タン パク質ホモ二量体またはホモ多量体を形成することができる。 1または2以上のリガンド結合性(即ち、レセプター)ドメインと、例えば、 標的遺伝子の転写活性化、細胞死もしくは他のシグナル伝達経路の発動、細胞局 在化等のための、1または2以上の作用ドメインとを含むキメラタンパク質は、 PCT/US94/01617、PCT/US94/08008、およびSpencer et al同上論文に開示されて いる。リガンドが媒介する遺伝子ノックアウト、またはリガンドが媒介する遺伝 子発現の阻止もしくは遺伝子産物の機能阻害のためのこの種のキメラタンパク質 の設計および使用は、PCT/US95/10591に開示されている。標的遺伝子の調節され た転写を包含する態様に有用な新規なDNA結合性ドメインとこれが結合するDNA配 列は、例えば、Pomeranz et al,1995,Science 267:93-96に開示されている。 これらの文献は、本発明の実施者に有用かも知れない類似のキメラをコードする DNA構築物、標的遺伝子構築物、多価リガンド、および他の要素の設計、構築、 および使用に関する実質的な情報、指針および実例を提供する。PCT/US95/06722 (Mitotix,Inc.)も参照。以上の文献の全内容をここに参考文献として援用する 。 キメラタンパク質を適切に選択すると、本発明により、PCT/US94/01617および PCT/US94/08008ならびに上に引用した他の文献に記載の系と同様に、ラパマイシ ンまたはラパログに依存して、遺伝子工学処理された細胞内での所望遺伝子の転 写の活性化、アポトーシスの作動、または他の生物学的事象の発動が可能となる 。遺伝子工学処理された細胞、好ましくは動物細胞は、培養状態の増殖中または 保持されたものでもよく、或いはヒトの遺伝子治療、形質転換動物、および他の この種の用途の場合のように、完全な生体内に存在していてもよい。ラパマイシ ン またはラパログ多量体化剤は、対応するリガンド結合性ドメインを含有するキメ ラタンパク質を多量体化させるのに有効な量で(投与により発動された標的遺伝 子の転写、アポトーシスまたは他の生物学的プロセスを監視することにより間接 的に観察しうる)、細胞培養物または遺伝子工学処理された細胞を含んでいる生 体(場合に応じて)に投与される。完全な生体に投与する場合、ラパマイシンま たはラパログは、その多量体化剤と1種もしくは2種以上の許容される獣医学用 もしくは薬剤用希釈剤および/もしくは賦形剤とを含有する組成物の形態で投与 してもよい。 キメラタンパク質の一方には結合するが、両方のキメラタンパク質と三成分複 合体を形成することのない化合物を、多量体化拮抗剤として使用してもよい。そ の場合、この化合物は、多量体化剤の効果を阻止または逆転させる、即ち、キメ ラの多量体化を防止、阻害または止める、のに有効な量で、遺伝子工学処理され た細胞またはそれを含む生体に(好ましくは完全な動物に投与する場合には上述 した組成物の形態で)投与される。例えば、ラパマイシンが多量体化剤として作 用しうる場合には、FK506、FK520またはその他のFKBPおよびFRAPとの三成分複合 体を形成しない多くの合成FKBPリガンドのいずれかを拮抗剤として使用すること ができる。 本発明の1側面によれば、所望遺伝子の転写のリガンド依存性の直接活性化の ための材料および方法が提供される。かかる1態様において、2以上の異なるキ メラタンパク質と、それらの発現を指令することができる対応するDNA構築物と からなる1セットが提供される。このようなキメラタンパク質の1つはその作用 ドメインとして1または2以上の転写活性化ドメインを含んでいる。他方のキメ ラタンパク質はその作用ドメインとして1または2以上のDNA結合性ドメインを 含んでいる(図1)。本発明のラパマイシンまたはラパログは両方のキメラと結 合して二量体または多量体複合体を形成することができ、この複合体はかくして 少なくとも1つのDNA結合性ドメインと少なくとも1つの転写活性化ドメインと を含んでいる。このような複合体の形成は、標的遺伝子産物の存在または濃度を 直接的または間接的に監視することにより観察されうるように、前記DNA結合性 ドメインが結合することができるDNA配列にこのDNA配列の転写制御下で連結さ れた標的遺伝子の転写の活性化を生ずる。 好ましくは、DNA結合性ドメインと、これを含有するキメラは、他のDNA配列、 たいていは非常に多くの他のDNA配列が共存していても選択されたDNA配列への結 合が観察されうる(直接的または間接的に)ような十分な選択性で、その認識さ れたDNA配列に結合する。選択されたDNA配列へのDNA結合性ドメインを含むキメ ラの結合は、in vitro結合試験により測定するか、または選択されたDNA配列に 連結する遺伝子の転写の速度または水準を任意の別のDNA配列による場合と比べ て相対的に測定して、任意の別のDNA配列への結合より少なくとも2桁、より好 ましくは少なくとも3桁、さらにより好ましくは4桁以上も大きくなることが好 ましい。 1セットの構築物を任意の所望の補助構築物と一緒に含有するように遺伝子工 学処理された細胞は、所望の生物学的事象のリガンド媒介による調節された作動 、所望遺伝子の調節された転写、アポトーシスの発動のようなシグナル伝達経路 の調節された発動、または他の事象を包含する用途に使用しうる。例えば、標的 遺伝子の調節可能な発現のために遺伝子工学処理された細胞は、標的遺伝子によ りコードされる所望のタンパク質(または他の遺伝子産物)の調節された産生に 使用することができる。このような細胞は、慣用手段により培養により増殖させ てもよい。この細胞を含む培地にリガンドを添加すると、細胞による標的遺伝子 の発現とその遺伝子によりコードされるタンパク質の産生を生ずる。遺伝子の発 現とタンパク質の産生は、培地にそれ以上の多量体化剤を加えないか、培地から 残留多量体化剤を除去するか、または培地に多量体化拮抗剤を添加することによ り停止させることができる。 本発明の遺伝子工学処理された細胞は、完全な生体、好ましくは動物、特にヒ トを、例えば細胞がこれを含む動物内で所望のタンパク質または他の結果を生ず るように変えるために、in vivoで作製および/または使用することもできる。 このような用途は遺伝子治療への応用を包含する。 アポトーシスの調節可能な作動を包含する態様は、リガンドで誘導可能な細胞 死に感受性のある遺伝子工学処理された細胞を提供する。このような遺伝子工学 処理細胞は、これをその意図した用途(例、所望のタンパク質または他の産物の 産生)に供した後、これが望ましくない特性を持つか作り出す場合、またはこれ がもはや有用、安全または望ましいものではなくなった場合、細胞培養物または 宿主生体から消去することができる。消去は、ラパマイシンまたはラパログを培 地に添加するか、または宿主生体に投与することにより行われる。この場合、キ メラの作用ドメインは、オリゴマー化によりアポトーシスを発動するFAS抗原ま たはTNF-R1の細胞内ドメインのようなタンパク質ドメインである。 従って、本発明は多量体化リガンドの添加に応答して細胞内に生物学的効果を 達成するための材料および方法を提供する。この方法は、ここに説明したように 遺伝子工学処理された細胞を用意し、この細胞をリガンドに暴露することを包含 する。 例えば、本発明は、細胞内の標的遺伝子の転写を活性化する方法を提供する。 この方法は、(a)リガンド媒介多量体化により標的遺伝子の転写を開始させる ことができる本発明の1組のキメラタンパク質をコードするDNA構築物と、(b) 多量体化事象に応答性の関連の同族(cognate)のDNA配列に結合した標的遺伝子( 例、前記の1つのキメラタンパク質のDNA結合性ドメインで認識される、即ち、 これと結合することができる、DNA配列)を含有する細胞を用意することを含む 。この方法は、この細胞を、標的遺伝子の発現を生ずるのに有効な量のキメラタ ンパク質に結合することができる多量体化リガンドに暴露することを含む。細胞 が培養状態で増殖中の場合、細胞のリガンドへの暴露は、培地にリガンドを添加 することにより達成されうる。細胞が宿主生体内に存在する場合には、そのリガ ンドへの暴露は、宿主生体にリガンドを投与することにより達成される。例えば 、宿主生体がヒトまたはヒト以外である場合、宿主生体へのリガンドの投与は、 そのための適当なビヒクルを用いて、経口、バッカル、舌下、経皮、皮下、筋肉 内、静脈内、関節内または吸入投与により行うことができる。この場合も、キメ ラタンパク質に対する構築物および任意の補助構築物の設計に応じて、リガンド 媒介生物学的事象は、細胞成長、細胞増殖、遺伝子転写、もしくはアポトーシス を生ずるシグナル伝達のような細胞機能の活性化;対象遺伝子の欠失、対象遺伝 子の発現の阻止、もしくは対象遺伝子産物の機能の阻害;対象遺伝子の直接転写 などでよい。 本発明はさらに、本発明のラパマイシンまたはラパログを、薬剤に許容される 担体および場合により1種もしくは2種以上の薬剤に許容される賦形剤と混和し てなる薬剤組成物も包含する。このような薬剤組成物を使用して、例えば本書に 開示した目的のいずれかを達成するためのヒトの遺伝子治療用途において、完全 な動物内の遺伝子工学処理された細胞内で本発明のキメラの多量体化を促進させ ることができる。 換言すると、本発明は、前述した目的、例えば、標的遺伝子(典型的には治療 用タンパク質のための異種遺伝子)の転写の活性化、細胞の成長もしくは増殖、 細胞死または他の何らかの選択された生物学的事象、の何れかを、これを必要と し、本発明の遺伝子工学処理された細胞を含んでいる動物、好ましくはヒトの患 者において達成するための方法を提供する。その方法は、ラパマイシンまたはラ パログを含有する薬剤組成物を、遺伝子工学処理された細胞の少なくとも一部に おいてキメラタンパク質の多量体化を生じさせるのに有効な投与経路および量で 該動物に投与することを包含する。多量体化は、遺伝子発現の出現;細胞の成長 、増殖もしくは死;またはキメラを設計し、細胞を遺伝子工学処理した他の目的 を検出することにより間接的に検出しうる。 本発明はさらに、本発明の多量体化拮抗剤を、薬剤に許容される担体および場 合により1種もしくは2種以上の薬剤に許容される賦形剤と混和してなる、被験 者における本発明の遺伝子工学処理された細胞内のキメラタンパク質の多量体化 の程度を、全体的または部分的に、阻害ないし軽減し、こうして、例えば標的遺 伝子の転写を失活させ、または別の本発明の生物学的作用を停止させるための薬 剤組成物も包含する。即ち、本発明は、多量体化試薬を使用した薬剤組成物と、 多量体化拮抗剤の試薬を使用した薬剤組成物の両方を調製し、それらの薬理学的 作用を達成することを包含するものである。 本発明はまた、本発明の多量体化リガンドに応答性である宿主生体、好ましく は動物、典型的にはヒト以外の哺乳動物またはヒトを供与する方法も提供する。 この方法は、本発明に従って予め遺伝子工学処理された細胞、即ち、キメラタン パク質をコードする1または2以上のDNA構築物を含有する細胞等を生体に導入 することを包含する。遺伝子工学処理された細胞は、宿主生体に導入する前に、 多様な材料および方法のいずれかを用いてカプセル化してもよい。或いは、本発 明のDNA構築物を例えば哺乳動物といった宿主生体に、例えばウイルスベクター を用いた宿主哺乳動物の1または2以上の細胞中へのDNAの取り込み、注射もし くはカテーテルによるDNAの導入等が可能な条件下で導入することができる。 本発明のラパマイシンまたはラパログに応答性の細胞を作製するためのキット もまた提供される。このようなキットの1つは、リガンドが媒介するオリゴマー 化により所望の生物学的応答を発動するキメラをコードし、その発現を指令する ことができる1または2以上のDNA構築物を含んでいる。このキットはまた、キ ットのDNA構築物によりコードされるキメラタンパク質分子を多量体化すること ができる、ある量のオリゴマー化リガンド(ラパマイシンまたはラパログ)を含 んでいてもよく、さらにある量の多量体化拮抗剤を含んでいてもよい。このキッ トはさらに、二量体化されたキメラタンパク質により認識される同族のDNA配列 に連結した標的遺伝子(またはクローン化部位)をコードするDNA構築物を含ん でいてもよい。それにより、多量体化されたキメラタンパク質分子の存在下でそ の同族DNA配列に連結した遺伝子の転写が可能となる。DNA構築物には、トランス フェクタントの選択の便宜のための1または2以上の選択マーカー、ならびに原 核生物中での複製、真核生物中での発現などに有用な他の慣用のベクター要素が 付属していることが好ましい。選択マーカーは、異なるDNA構築物ごとに同じで も、または異なっていてもよく、このような各DNA構築物を含む細胞の選択が可 能になる。 細胞内に同族DNA配列と一緒に標的遺伝子を導入するための補助構築物は、標 的遺伝子の代わりにクローン化部位を含んでいてもよい。このような構築物を含 むキットは、遺伝子の調節可能な発現のための細胞の遺伝子工学処理を実施者が 提供することを可能にする。 本発明の別のキットは、キメラタンパク質のための1または2(またはそれ以 上)のDNA構築物を含んでいてもよく、その1または2以上が転写活性化剤また はDNA結合性タンパク質の代わりにクローン化部位を含んでいて、このようなド メインのうち使用者が望むどのドメインも挿入することが可能である。このよう なキッットは任意に、上述したような他の要素、例えば、予め選択したDNA結合 性ドメイン用の同族のDNA配列を伴うか、伴わない標的遺伝子用のDNA構築物、を 含んでいてもよい。 キットのどれも、リガンドへの細胞の暴露に応答してリポーター遺伝子(CAT では、β−ガラクトシダーゼまたは任意の検出の容易な遺伝子産物)を発現する ように本発明の構築物で安定に形質転換された陽性対照(positive control)細胞 をさらに含有していてもよい。リポーター遺伝子の発現の検出および/または定 量のための試薬もまた提供しうる。FKBP キメラ FKBPキメラタンパク質は、FKBPのペプチド配列の全部または一部を含む少なく とも1つのリガンド結合性ドメインと、少なくとも1つの異種の作用ドメインと からなる。このキメラタンパク質は、直接結合測定(例、蛍光消光)、競合結合 測定(例、対FK506)、FKBP酵素活性(ロタマーゼ)の阻害、または他の検定方法 により測定して、好ましくは約100nM以下、より好ましくは約10nM以下、さらに より好ましくは約1nM以下のKd値で、ラパマイシンまたはラパログに結合可能で なければならない。典型的には、このキメラタンパク質は、例えば、国際特許出 願PCT/US94/01617に記載されているような、FKBP12のそれに対応するペプチド配 列からなる1または2以上のタンパク質ドメインを含有していよう。そのペプチ ド配列は、通常は10個以下、好ましくは5個以下のアミノ酸残基の置換、挿入ま たは欠失により結合特異性を調整するように修飾されていてもよい。このような 修飾は、ある態様では、下記(a)または(b)の結合プロフィールの一方または両方 を生ずるように選択される:(a)FKBP12または遺伝子工学処理すべき宿主細胞に 内生するFKBPに比べて、修飾されたFKBPドメインまたはこれを含むキメラへのラ パログの結合が、好ましくは少なくとも1桁、より好ましくは少なくとも2桁、 さらにより好ましくは3〜4桁またはそれ以上の大きさで良好である(いずれか の測定法で);および(b)遺伝子工学処理すべき宿主細胞に内生するFRAPまたは 他のFRB含有タンパク質に比べて、第2のキメラ(これは、後述するように少な くとも1つのFRBドメインを含んでいる)へのラパマイシンまたはラパログとFKB Pキメラから形成された複合体の結合が、好ましくは少なくとも1桁、より好ま しくは少なくとも2桁、さらにより好ましくは少なくとも3桁の大きさで良 好である(いずれかの測定法で)。 FKBPキメラは、少なくとも1つの異種の作用ドメイン、即ち、非FKBPペプチド 配列を含むタンパク質ドメインも含んでいる。この作用ドメインは、本明細書の 別の個所、またはPCT/US94/01617もしくは他の引用文献に記載されているように 、DNA結合性ドメイン、転写活性化ドメイン、細胞局在化ドメイン、細胞内シグ ナル伝達ドメインなどでよい。一般的に言って、作用ドメインは、他の作用ドメ インとの会合または凝集により(例えば、同一もしくは異なる作用ドメインを含 むタンパク質の多量体化により)、キメラタンパク質を選択された特定の細胞位 置に向かわせるか、または生物学的作用を開始させることができる。 このようなタンパク質をコードする組換えDNAは、元のFKBPタンパク質、例え ば、ヒトFKBP12をコードするDNAと選択的にハイブリッド形成することができる か、または遺伝暗号の縮重がなければこのようなハイブリッド形成が可能となろ う。これらのキメラタンパク質は、別のタンパク質、例えば、Ga14,VP16,FAS ,CD3ゼータ鎖等、に由来する作用ドメインを含んでいるので、このキメラタン パク質をコードする組換えDNAも、そのような他のタンパク質をコードするDNAと 選択的にハイブリッド形成することができるか、または遺伝暗号の縮重がなけれ ばこのようなハイブリッド形成が可能となろう。 本発明のFKBPキメラタンパク質、ならびに後で詳述するFRAPキメラタンパク質 は、1もしくは2以上の異なるリガンド結合性ドメインの1もしくは2以上のコ ピーと、1もしくは2以上の作用ドメインの1もしくは2以上のコピーとを含ん でいてもよい。リガンド結合性ドメインは、作用ドメインに対してN末端、C末 端、または散在のいずれでもよい。複数コピーのレセプタードメインを含む態様 では、そのコピー数は通常は2、3または4である。例えば、FKBPキメラは、2 、3または4個のFKBPドメインを含有しうる。FKBPキメラ(および後述するFRAP キメラ)の各種ドメインは、場合により結合ペプチド領域(これは隣接するドメ インの1つに由来するものでもよく、または異種でもよい)により離されていて もよい。 本発明の実施に有用なFKBPキメラの例示としては、PCT/US94/01617(Stanford & Harvard),PCT/US94/08008(Stanford & Harvard),Spencer et al(同上), PCT/US95/10591(ARIAD)およびPCT/US95/06722(Miotix,Inc.)に開示されたF KBP融合タンパク質;後述する実施例に開示されたFKBP融合タンパク質;1もし くは2以上のFKBPドメインに10個まで(好ましくは1〜5個)のアミノ酸の挿入 、欠失もしくは置換を含むが、ラパマイシンまたはラパログになお結合すること ができる、前記のFKBP融合タンパク質のいずれかの変異体;天然のFKBPドメイン をコードするDNA配列と選択的にハイブリッド形成することができるDNA配列によ りコードされたFKBPドメインの1もしくは2以上のコピーを含み、かつラパマイ シンまたはラパログになお結合することができる、前記のFKBP融合タンパク質の いずれかの変異体;1もしくは2以上の異種作用ドメインが欠失しているか、ま たは別の異なる異種作用ドメインで置換もしくは追補されている前記のFKBP融合 タンパク質のいずれかの変異体;ヒト以外の供給源に由来するFKBPを含んでいて 、ラパマイシンまたはラパログに結合することができる、前記のFKBP融合タンパ ク質のいずれかの変異体;ならびにヒトFKBP12のTyr26,Phe36,Asp37,Arg42, Phe46,Phe48,Glu54,Va155,もしくはPhe99に対応する1もしくは2以上のア ミノ酸残基を含み、これらのアミノ酸残基の1もしくは2以上が別の異なるアミ ノ酸で置換されているが、ラパマイシンまたはラパログに結合することができる 、前記のFKBP融合タンパク質のいずれかの変異体、が挙げられる。 例えば、多くの場合、FKBP融合タンパク質は、ヒトFKBP12のアミノ酸1-107を 含むFKBPドメインの複数コピーからなり、各コピー間が、制限エンドヌクレアー ゼSpeIおよびXbaIでそれぞれ消化されたDNAの連結用産物であるACTAGAでコード される2-アミノ酸リンカーのThr-Argにより離された構造を持つ。次の表は前記F KBP12配列に基づく変異FKBPドメインのサブセットを示す。変異FKBPの例示 注:記入は、本来のアミノ酸を1文字記号と配列位置で表記し、その後に変 異体の置換アミノ酸を示す。例えば、F36Vは、36位置のフェニルアラニ ンがバリンで置換されたヒトFKBP12配列を表示する。 F36V/F99Aは、36および99位置のフェニルアラニンがそれぞれバリ ンおよびアラニンで置換された二重変異を意味する。FRAP キメラタンパク質 「FRAPキメラタンパク質」と称する第2の種類のキメラタンパク質は、少なく とも1つのFRBドメイン(これは、いずれかで説明するように、FRAPタンパク質 またはその変異体のペプチド配列の全部または一部からなるものでもよい)と、 少なくとも1つの異種タンパク質("作用")ドメインとからなる。 一般的に言って、FRBドメインまたはこれを含むキメラタンパク質は、天然のF RBドメインからなるタンパク質をコードするDNA分子、例えば、ヒトもしくは他 の哺乳動物のFRAPタンパク質または酵母タンパク質Tor1もしくはTor2の一方また は前述したカンジダFRB含有タンパク質をコードするDNA分子、と選択的にハイブ リッド形成することができるDNA分子によりコードされる。本発明のFRBドメイン には、FKBPタンパク質とラパマイシンまたはラパログとの複合体に結合すること ができるものが包含される。ここにより詳しく開示するように、ラパログは次式 で示される化合物を包含する。 上記式中、Uは-H,-OR1,-OC(O)R1,-OC(O)NHR1,-SR1,-NHR1,-NHC(O)R1,-N H-SO2-R1または-R2であり、ここでR2=置換アリールもしくはアリルもしくはア ルキルアリール(例、ベンジルまたは置換ベンジル);Vは-OR3または(=O)であ り;Wは=O,=NR4,=NOR4,=NNHR4,=NHOR4,-NHNHR4,-OR4,-OC(O)R4,-OC(O) NR4,または-Hであり;Yは-OR5,-OC(O)R5または-OC(O)NHR5であり;Zは=O,- OR6,-NR6,-H,-NC(O)R6,-OC(O)R6または-OC(O)NR6であり;ここでR3はH,-R7 ,-C(O)R7,-C(O)NHR7,またはC-28/C-30環式カーボネートであり、R4はHまた はアルキルであり、そしてR1,R4,R5,R6およびR7は、別個にH,アルキル,ア ルキルアリールおよびアリールから別個に選ばれる。 FRAPキメラタンパク質は、FKBPキメラとラパマイシンまたはラパログとにより 形成された複合体に結合することができなければならない。好ましくは、FRAPキ メラはその複合体に、慣用の方法で測定して200μM以下、より好ましくは10μM 以下のKd値で結合する。FRBドメインは、ラパマイシンまたはラパログとFKBPキ メラとの複合体に対して高い親和性を保持するのに十分な長さおよび組成のもの であろう。ある態様では、FRBドメインは約150アミノ酸より少ない長さであり、 別の態様では約100アミノ酸より少ない長さである。この種の領域の1例は、ヒ トFRAPのVal2012ないしTyr2144に及ぶ133アミノ酸領域からなる。Chiu et al,1 994,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 91:12574-12578を参照。特に興味あるFRB領 域は、ヒトFRAPのGlu2025ないしGln2114の間の領域であり、FKBP12−ラパマイシ ン複合体に対する親和性を保持している。一部の態様では、この90アミ ノ酸の配列からQ2214が取り除かれ、これが89アミノ酸のFRBドメインになってい る。FRBペプチド配列は、結合特異性を調整するため、通常は10個まで、好まし くは5個以下のアミノ酸の置換、挿入もしくは欠失により修飾されていてもよい 。このような修飾は、一部の態様において、内生のFKBPおよびFRAPタンパク質と ラパマイシンまたはラパログとの複合体の形成より、1または2分子以上のFKBP キメラ、FRAPキメラならびにラパマイシンもしくはラパログからなる複合体の形 成が優先的となるように選択される。好ましくは、この優先性は、少なくとも1 桁、より好ましくは少なくとも2桁、さらにより好ましくは少なくとも3桁の大 きさ(任意の測定法で)である。 このようなタンパク質をコードする組換えDNAは、FRAP種をコードするDNAと選 択的にハイブリッド形成することができるか、または遺伝暗号の縮重がなければ このようなハイブリッド形成が可能となろう。また、これらのキメラタンパク質 は、別のタンパク質、例えば、Ga14,VP16,FAS,CD3ゼータ鎖等、に由来する作 用ドメインを含んでいるので、このキメラタンパク質をコードする組換えDNAも 、そのような他のタンパク質をコードするDNAと選択的にハイブリッド形成する ことができるか、または遺伝暗号の縮重がなければこのようなハイブリッド形成 が可能となろう。 本発明の実施に有用なFRBキメラを例示すると、後述する実施例に開示したも の、1または2以上の異種ドメインを別の異種ドメインで置換したか、別の1ま たは2以上の異種ドメインを追補したその変異体、1または2以上のFRBドメイ ンがヒト以外のペプチド配列起源のドメイン(例えば、Tor2またはカンジダのよ うな)である変異体、ならびにFRBドメインがここに述べるようにアミノ酸の置 換もしくは挿入により修飾されている変異体(但し、変異キメラは、FKBPタンパ ク質とラパマイシンまたはラパログとにより形成された複合体に結合することが できる)が挙げられる。代表的なFRB融合タンパク質は、ヒトFRAPの2025-2113残 基を含む89アミノ酸FRBドメインを1または2以上含有し、これが前述したよう にSpeI-XbaI部位の連結により生成したThr-Argリンカーにより離された構造を持 つ。本発明のどの融合タンパク質においても、このような制限部位またはリンカ ーは、部位特異性突然変異誘発のような慣用技術を用いて欠失、置換または 延長させてもよいことは理解されるべきである。混合キメラタンパク質 第3の種類のキメラタンパク質は、1または2以上にFKBP由来リガンド結合性 (即ち、「レセプター」)ドメインと1または2以上の異種作用ドメインとから なるが、FRAPキメラについて説明したように、さらに1または2以上のFRBドメ インを含んでいる。 混合キメラタンパク質分子は、これが結合するラパマイシンまたはラパログの 存在下で、ホモ二量体またはホモ多量体タンパク質複合体を形成することができ る。混合キメラを利用した態様は、そうしないとFKBPキメラとFRAPキメラの両方 の発現を指令するのに必要となる2種類の組換えDNA構築物の代わりに、単一の 組換えDNA構築物の細胞内に導入するだけでよいという利点がある。 混合キメラタンパク質をコードする組換えDNAは、FKBPタンパク質をコードす るDNA、FRAPをコードするDNA、ならびに1もしくは2以上の作用ドメインの起源 であるタンパク質(例、Ga14,VP16,FAS,CD3ゼータ鎖等)をコードする異種DN A配列と選択的にハイブリッド形成することができるか、または遺伝暗号の縮重 がなければこのようなハイブリッド形成が可能となろう。異種ドメイン 上述したように、FKBPおよびFRAPキメラの異種の作用ドメインは、これらを保 有するキメラタンパク質の相互の会合により、DNA結合および/もしくは標的遺 伝子の転写の発動(もしくは阻害)、細胞の成長、分化、増殖もしくはアポトー シスの作動、タンパク質の特定の細胞位置への誘導、または他の生物学的事象の 作動を可能にするタンパク質ドメインである。 調節可能な遺伝子転写に関連する態様は、第1および第2のキメラタンパク質 の異種ドメインの会合または多量体化に応答性のDNA配列による転写制御下で、 標的遺伝子(これは対象となるポリペプチド、アンチセンスRNA、リボチーム等 をコードする)を含む標的遺伝子構築物を使用することを包含する。 転写の直接的な活性化を行う本発明の態様では、第1および第2のキメラタン パク質の異種ドメインは、それぞれ、Ga14のようなDNA結合性ドメインまたは後 述するZFHD1のようなキメラDNA結合性ドメイン、およびVP16またはp65に由来 するもののような転写活性化ドメインからなる。このような転写活性化ドメイン を含むキメラタンパク質が、DNA結合性ドメインを含むキメラタンパク質と多量 体化すると、転写活性化剤は、DNA結合性ドメインが結合しているプロモーター 要素を標的にするため、そのプロモーター要素に結合した標的遺伝子の転写を活 性化させる。転写活性化ドメインを先にするか、または転写活性化ドメインの代 わりにリプレッサードメイン(PCT/US94/01617を参照)を使用すると、標的遺伝 子の転写を阻害するのに有用な類似のキメラが得られる。複合DNA結合性ドメイ ンおよびこれが結合するDNA配列は、Pomerantz et al,1995,同上,に開示され ており、その内容を参考のためにここに援用する。このような複合DNA結合性ド メインも、本発明を実施する際にDNA結合性ドメインとして、複合DBDが結合する 同族DNA配列を含む標的遺伝子構築物と一緒に使用しうる。 転写の間接的な活性化を行う態様では、キメラの異種ドメインは、凝集または 多量体化により、応答性プロモーターの制御下で転写の活性化を発動するシグナ ル化タンパク質のエフェクタードメインである。例えば、このシグナル化ドメイ ンはT細胞レセプターのゼータ・サブユニットの細胞内ドメインでよく、このド メインは凝集すると、IL-2プロモーターまたはその誘導体(例、反復NF-AT結合 部位)に結合した遺伝子の転写を発動する。 本発明の別の側面では、異種ドメインは、相互に会合すると細胞の死を引きお こすことができるタンパク質ドメインである。この種のドメインの例は、Fas抗 原またはTNF R1の細胞内ドメインである。Fasドメインを含むキメラタンパク質 はPCT/US94/01617の開示と同様にして設計および調製することができる。遺伝子工学処理されたレセプタードメイン 既述したように、FKBPおよびFRBドメインは、天然のFKBPおよびFRBドメインの ペプチド配列から選択されたペプチド配列を含有しうる。天然の配列は、ヒトFK BP12の配列およびヒトFRAPのFRBドメインの配列を含む。或いは、このペプチド 配列は、このような天然のペプチド配列から誘導されるが、これらのペプチド配 列の一方または両方に一般には10まで、好ましくは1〜5の変異を含んでいるも のでもよい。本書でより詳しく開示し、図2に示すように、かかる変異は多くの 重要な特徴を付与することができる。例えば、FKBPドメインは、これがあるラ パログを優先的に、即ち、修飾していないFKBPドメインと比べて少なくとも1桁 、好ましくは2桁,さらにより好ましくは3〜4桁もより効果的に、結合するこ とができるように修飾してもよい。FRBドメインは、これがある(修飾もしくは非 修飾)FKBP:ラパログ複合体を優先的に、即ち、修飾していないFRBドメインと比 べて少なくとも1桁、好ましくは2桁,さらにより好ましくは3桁もより効果的 に、結合することができるように修飾してもよい。FKBPおよびFRBドメインは、 これらがラパログとの、またはラパマイシンとの三成分複合体を優先的に、即ち 、修飾していないFKBPおよびFRBドメインと比べて少なくとも1桁、好ましくは 2桁,さらにより好ましくは3桁もより効果的に、形成することができるように 修飾してもよい。図2A〜Eは、例示だけの目的で提示するものであり、代償的 変異(compensatory mutation)を保有する多様に修飾されたラパログとレセプタ ードメインの他の関連する組合わせも本発明に包含され、各種の用途に適用する ことができる。 (a) FKBP 各種の置換基("バンプ")を含んでいるFK506の誘導体を結合させる高い能力を 付与するFKBP変異を同定する方法が、PCT/US94/01617に開示されている。同様の 手法は、バンプを持つラパマイシン誘導体、即ち、ラパログを優先的に結合させ る修飾したFKBPを得るのにも使用できる。ラパマイシンとFKBP12との複合体の構 造は既知である(例えば、Van Duyne et al,J.Am.Chem.Soc.(1991)113,74 33-7434を参照)。このようなデータを使用して、各種のラパログ置換基と衝突 する可能性のあるアミノ酸置換基を明らかにすることができる。この手法では、 分子モデルを用いてラパログ置換基に合うかもしれないFKBPドメイン中のアミノ 酸置換基の候補を同定し、次いで部位特異的突然変異を用いて、こうして同定さ れたタンパク質変異を遺伝子工学処理してもよい。変異体を標準的な方法によっ て発現させ、変異体が適当な活性/親和性を保持している場合には、そのラパロ グに対する結合親和性を、例えばロタマーゼ活性の阻害またはFK506のような分 子との結合に対する競合により測定する。 より具体的には、C-13またはC-14に修飾のあるラパマイシン誘導体(即ち、Y が-OH以外の置換基であり、および/またはZが=O以外であるラパログ)が、残 基Tyr26,Phe36,Asp37,Tyr82およびPhe99のうちの1または2以上が、より小 さな側鎖を持つアミノ酸(Gly,Ala,Val,MetおよびSerなど)で置換されたFKB Pに優先的に結合することを我々は考えている。26または36位に修飾のあるFKBP 変異体の例は、上掲の「変異FKBPの例」の表に示されている。同様に、C20に修 飾のあるラパログ(即ち、R4が-H以外であるラパログ)は、Tyr82および/また はIle56が他のアミノ酸、特により小さな側鎖を持つアミノ酸で置換されたFKBP に優先的に結合することも考えられる。さらに別の例では、C24に修飾を持つラ パログ(即ち、Wが=O以外であるラパログ)は、Phe46,Phe48およびVa155の1 または2以上が他のアミノ酸、やはり特により小さな側鎖を持つアミノ酸、で置 換されたFKBPに優先的に結合することも考えられる。さらに、C28および/また はC30に修飾のあるラパログ(即ち、R3がH以外、および/またはVが=O以外) は、Glu54が他のアミノ酸、特により小さな側鎖を持つもので置換されたFKBPに 優先的に結合することも考えられる。上記のすべての例で、単一または複数のア ミノ酸の置換をなしうる。やはり、具体例は前記の表に示されている。 単一または複数の変異の遺伝子工学処理と試験の反復という手法に代わる方法 は、1または2以上のラパログまたはラパマイシン置換基と接触した、またはそ の近くにあるか、またはその可能性がある、構造が同定された残基を共ランダム 化(co-randomination)する手法である。同定された位置(前節で述べたような) でランダム化されたFKBPドメインを含有するポリペプチドのコレクションを、例 えば慣用の合成方法または遺伝学的方法により準備する。このようなコレクショ ンは、かかる位置の1または2以上で置換アミノ酸を含有するFKBPドメインから なる1セットを意味する。このコレクションをスクリーニングして、所望のラパ ログ結合性を有するFKBP変異体を選び出す。一般に、数個の残基を同時にランダ ム化すると、これが側鎖間の有益な協同的相互作用の見込みを最大限にするため 、所定のバンプを持つラパログに対してより高い親和性および特異性を持つ補償 性変異体(compensating mutant)を生ずることが予想される。不連続な位置でラ ンダム化されたライブラリを調製する技法は公知であり、縮重オリゴヌクレオチ ドを用いたプライマー特異性(primer-directed)変異誘発、縮重オリゴヌクレオ チドを用いたPCR、および縮重オリゴヌクレオチドを用いたカセット変異誘発等 を 包含する(例えば、Lowman,H.B.,and Wells,J.A.,Methods:Comp.Methods E nzylmol.1991,3,205-216;Dennis,M.S.and Lazarus,R.A.,1994,J.Biol .Chem.268,22129-22136;ならびにこれらの中の参考文献を参照)。 多くの場合、ラパマイシンの所定位置に直接接触しているか、その付近の数個 の残基だけのランダム化では、ラパログ置換基(バンプ)に最適に適合する可能 性のあるFKBP配置形態の可能な変更例のすべてを探査することができないかも知 れないことを我々はさらに考えている。即ち、バンプのあるラパログへの優先的 結合性を付与する微妙な変異または組合わせを確定するには、構造上の考察に基 づかないランダム置換基を持つ偏りのないライブラリーからも構成を考慮する。 アラニン走査変異誘発(Cunningham and Wells(1989)Science 244,1081-1085) 、PCR誤取込み(misincorporation)変異誘発(Cadwell and Joyce,1992,PCR Me th.Applic.2,28-33を参照)、および「DNAシャフリング(DNA shuffling)」(S temmer,1994,Nature 370,389-391およびCrameri et al,1996,Nature Medic ine 2,100-103)を始めとするいくつかの適当な変異誘発スキームがこれまでに 説明されている。これらの方法は、ランダム変異体または単一変異体(single m utants)のセットのライブラリーを製造でき、これをその後でスクリーニングま たは選択手法によりサーチする。 多くの場合、所定バンプの優先的結合性に対する最良の変異体を確定するため の効果的な方策は、構造に基づく偏りのない手法の組合わせである。Clackson a nd Wells,1994,Trends Biotechnology 12,173-184(review)を参照。例えば 、重要な接触残基を、縮重オリゴヌクレオチドによるPCR法により、但しランダ ム位置にさらに変異を導入するためにエラー促進条件を用いて増幅を実施しなが らランダム化するライブラリーの構築を我々は考えている。別の例は、DNAシャ フリングを用いた構造に基づく偏りのないランダムライブラリーからの成分DNA 断片の組合わせである。 所望の変異に対するライブラリーのスクリーニングは、酵母2-ハイブリッド方 式(Fields and Song(1989)Nature 340,245-246)を用いて行うことができる 。例えば、1つのベクターにFRB-VP16融合物を導入し、ランダム化したFKBP配列 のライブラリーを別のGAL4融合ベクター中にクローン化する。酵母の共形質転換 体 をバンプのあるラパマイシン(即ち、ラパログ)で処理し、相補的FKBP変異体を 保有するものを、使用したベクターに応じて、例えばβ−ガラクトシダーゼまた はルシフェラーゼ産生(スクリーン)、または必須栄養素を欠いたプレート上で の生存(選択)により確定する。バンプ付きラパマイシンがFKBP−FRAP相互作用 の架橋に必要なことは、間違いの陽性(false positives)を消去する有用なスク リーンである。 FKBP(またはFRB)変異体のライブラリーから修飾されたリガンド結合性ドメイ ンを分離するための別の方策は、Huらにより報告された機能性(functional)二量 体形成に対する遺伝的選択(Hu,J.C.et al,1990,Science 250:1400-1403;レ ビューについてはHu J.C.1995 Structure 3:431-433を参照)を利用する。この 方策は、バクテリオファージλリプレッサーcIが二量体としてDNAに結合し、こ のようなホモ二量体のオペレーターDNAへの結合がファージの生活環の溶菌経路 に含まれるファージ遺伝子の転写を防止することに基づいている。即ち、機能性 λリプレッサーを発現する細菌細胞は、ファージλを重感染させることにより溶 菌に対して免疫性となる。リプレッサータンパク質は、アミノ末端DNA結合性ド メイン(アミノ酸1-92)が、カルボキシ末端二量体化ドメインに40アミノ酸可変 性リンカーにより結合したものからなる。分離されたN末端ドメインは、非効率 的な二量体形成のために低い親和性でしかDNAに結合しない。高親和性のDNA結合 性は、GCN4「ロイシンジッパー(leucine zipper)」のような異種二量体化ドメイ ンで回復させることができる。Huらは、大集団の配列からλリプレッサー二量体 形成を媒介することができるGCN4ロイシンジッパー変異体を分離ための遺伝的選 択としてファージ免疫を使用する方式について説明している(Hu et al,1990) 。 例えば、バンプ付きラパログに相補的なFRAP変異体を確定するためにλリプレ ッサー方式を使用するには、変異型FRAP配列を有するλリプレッサー−FRAPライ ブラリーを、野生型λリプレッサー−FKBPタンパク質を発現するE.Coli細胞中 に形質転換する。高力価のλファージと「バンプ付き」ラパマイシン化合物を含 有する細菌プレート上での溶菌に対して生存するコロニーからFRAP変異体を発現 するプラスミドを分離する。或いは、FKBP変異体を分離するには、野生型λリプ レッサー−FRAPタンパク質を発現するE.Coll細胞中に形質転換された変異FKBP 配列を有するλリプレッサー−FKBPライブラリーを用いて上記手法を反復する。 別の変更例は、ファージ表示(display)のためのベクター中にランダム化され たFKBP配列をクローン化して、ラパログに最もよく結合する変異型のin vitro選 択を可能にすることである。in vitro親和性選択は多くの方法で実施することが できる。例えば、ラパログを親和性ハンドル(例えば、ヘキサヒスチジン・タグ またはGST)で標識された組換えFRAPの存在下で溶液状態のライブラリーファージ プールと混合し、生成した複合体を、相補性変異を保有するFKBPを表わすファー ジを富化するように適当な親和性マトリックス上で捕捉する。ファージ表示の手 法は、既に文献に記載されており、他のin vitro選択方式(例えば、λファージ 上での表示、プラスミド上での表示、バクロウイルス(bacurovirus)上での表示 )も考慮することができる。さらに、in vivo安定性の向上といった本発明の用 途に有利な他の性質を改善するための選択およびスクリーニング手法を使用する こともできる。レビューについてはClackson,T.and Wells,J.A.1994,Trend s Biotechnol.12,173-184を参照。 (b) FRAP FRAP結合性エフェクタードメイン中でラパマイシンに対する修飾を含む(即ち 、バンプ付き)ラパログに優先的に結合する変異型FRBドメインの製造にも同様 の考えを用いる。例えば、C7位に-OMe以外の置換基を有するラパログを用いて、 ヒトFRAP FRBペプチド配列に基づくが、Tyr2038,Phe2039,Thr2098,Gln2099, Trp2101およびAsp2102残基の1種もしくは2種以上に対するアミノ酸置換を持つ FRBとの優先的結合を得ることができる。変異の例としては、Y2038H,Y2038L,Y 2038V,Y2038A,F2039H,F2039L,F2039A,F2039V,D2102A,T2098A,T2098N, およびT2098Sが挙げられる。C28に-OH以外の置換基を有するか、および/または C30に=O以外の置換基を有するラパログを用いて、Glu2032に対するアミノ酸置換 を持つFRAPタンパク質との優先的結合を得ることもできる。変異の例としては、 E2032AおよびE2032Sが挙げられる。前述した位置で1または2以上のアミノ酸置 換を含むFRBからなるタンパク質、それらの位置でランダム化された(即ち、 それらの残基に各種の置換アミノ酸を含む)タンパク質もしくはペプチドのライ ブラリー、タンパク質ドメイン全体をランダム化するライブラリー、またはこれ らの変異体のセットの組合わせは、バンプ付きラパログに優先的に結合する変異 FRAPを確定するための上述した方法を用いて作製される。 ラパログと複合体化したFKBPタンパク質の複合体に対する変異FRB候補の親和 性は、例えば、薬剤の存在下でGST-FKBPへのin vitro翻訳FRB変異体の結合(Che n et al.1995,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 92,4947-4951)または酵母の2 −ハイブリッド検定で適当なFKBP融合タンパク質とのラパログ依存性転写活性複 合体に関与する能力、といった多くの方法により検定することができる。 所望の結合性を持ったFRB変異体を、多様な分類手法を用いてファージ上に表 わされたライブラリーから分離することができる。例えば、ラパログを親和性ハ ンドル(例えば、ヘキサヒスチジン・タグまたはGST)で標識された組換えFKBPの 存在下で溶液状態のライブラリーファージプールと混合し、生成した複合体を、 相補性変異を保有するFRAPを表わすファージを富化するように適当な親和性マト リックス上で捕捉する。 本発明の各種態様において変化しうるFRB融合タンパク質の別の特徴は、使用 するFRBドメインの正確な配列である。ある用途では、最小(89アミノ酸)FRBド メインより大きなFRBの部分を使用することが好ましいかも知れない。これらは 、Glu2025残基までN末端の延長(好ましくは、少なくともArg2018またはIle202 1までの延長)、ならびに2113位を超えるC末端延長(例、2113,2141もしくは2 174またはそれ以上への延長)を包含し、これは場合により折り畳まれたFRBドメ インの安定性および/または発現の効率を改善することがある。異なるFRB配列 末端を使用するかも知れない別の用途には、例えば細胞膜での又はDNA上でのFRB が媒介するタンパク質−タンパク質会合に必要なポリペプチド鎖の歪み(ねじれ )に合うように、FRBドメインの片側または両側での立体的理由により長いリン カーが、望ましい用途もある。逆に、別の用途では、異種の作用ドメインを生物 学的機能に対して適切に与えるためにFRBドメインの片側または両側で短いリン カーが好ましいか、または必要となることがある。ヒトの遺伝子治療用途では、 このようなリンカーに対して天然のヒトFRAP配列を使用することが、異 種配列の導入にとって、または宿主生体内での免疫応答を刺激する危険性を低減 させるために、一般に好ましいであろう。 或る種のラパログ、特にFKBP結合性ドメインとFRAP結合性ドメインとの境界付 近にあると考えられる位置、例えば、C28,C30,C7およびC24といった位置に修 飾または置換基(ラパマイシンに対して)を有するラパログは、哺乳動物のFKBP ドメインとFRBドメインの両方、特に天然のヒトペプチド配列を含むこれらのド メインとの複合体形成能力が、ラパマイシンに比べて低い。この低い能力は、本 書で述べたいずれかの直接的または間接的検定法で測定した結合親和性の低さ、 またはT細胞増殖検定のような適当な検定で測定して免疫抑制活性の低さとして 現れることがある。このような場合、反復手法を用いて、天然のヒトペプチド配 列を含む対応するドメインより効果的にラパログとの複合体を形成することがで きる変異FKBPと変異FRBとの対を確定することができる。例えば、まずラパログ に結合することができる相補的修飾FKBPドメインを、先に説明したようにして確 定し、次いでこの変異FKBPドメインをラパログとの複合体における親和性マトリ ックスとして使用して、この複合体と会合することができる相補的修飾FRBドメ インを選択するとができる。かかる変異誘発およびスクリーニングを数サイクル 実施して、タンパク質の対を最適化することができる。 ある態様では、タンパク質−タンパク質相互作用(図2E参照)に影響しうる 変異を含むFRBおよび/またはFKBPドメインを使用することが望ましいであろう 。例えば、ラパマイシンまたは所定のラパログに結合させた時に、変異FRBに比 べて測定可能なより小さな有効性でしか内生FRBと複合体を形成できない変異FKB Pドメインが特に興味がある。やはり興味があるのが、ラパマイシンとの内生FKB Pの複合体に比べて、測定可能なより大きな有効性でラパマイシンまたは所定の ラパログと変異FKBPの複合体と会合することができる変異FRBドメインである。 既に説明したものに類似の選択およびスクリーニング法も、(i)ラパマイシン もしくはラパログならびに内生FRBとの三成分複合体を形成するFKBPドメインの 能力を測定可能に減少させるFKBPドメインへのアミノ酸置換、欠失または挿入を 確定するため、(ii)ラパマイシンもしくはラパログならびに内生FKBPとの三成分 複合体を形成するFRBドメインの能力を測定可能に減少させるFRBドメインへのア ミ ノ酸置換、欠失または挿入を確定するため、ならびに(iii)バートナータンパク 質中の補償用変異を選択および/または確定するため、に使用することができる 。三成分複合体形成の有効性が減少した適当な変異FKBPの例として、His87およ びIle90の一方または両方が、嵩高の側鎖基を持つArg,Trp,Phe,TyrまたはLys といったアミノ酸で置換された哺乳動物、好ましくはヒトのFKBPが挙げられる; その場合、FRBドメイン、好ましくは哺乳動物、より好ましくはヒトのペプチド 配列を含むFRBドメインは、上述のように変異させて、この変異FKBPならびにラ パマイシンもしくは所定のラパログとの三成分複合体を形成することができる相 補性変異型を発生させるようにしてもよい。H87WまたはH87R hFKBP12に対して有 用なFRB変異の例としては、Y2038がV,S,AまたはLで置換されたか、F2039 がAで置換されたか、および/またはR2042がL,AまたはSで置換されたヒトF RBが挙げられる。190W又は190R hFKBP12に対して有用なFRB変異の例としては、K 2095がL,S,A又はTで置換されたヒトFRBがあげられる。 また、本発明のレセプタードメインを最適化する場合、ポリペプチド配列の免 疫原性は、MHCタンパク質によるペプチドの結合と、内生T細胞レセプターによ り提示ペプチドを異物として認識することを必要とすると考えられていることを 理解すべきである。少なくともヒトの遺伝子治療用途では、連結ペプチド配列を 含む所定の外来のペプチド配列を、これがヒト中で免疫学的に提示される確率を 最小限にするように修飾することが好ましいかも知れない。例えば、ヒトMHCク ラスI分子に結合するペプチドは、結合ペプチド中の重要な「アンカー」位置に ある或る種の残基に対して厳格な要件を持つ。例えば、HLA-A2は2位にロイシン 、メチオニンまたはイソロイシンを、C末端にロイシンまたはバリンを必要とす る(レビューについてはStern and Wiley(1994)Structure 2,145-251を参照 )。従って、本発明の実施においてタンパク質を遺伝子工学処理する際に、これ らの残基のこの周期性を、特にヒトの遺伝子治療用途では避けることが好ましい 。以上のことは、レセプタードメイン中への点突然変異の遺伝子工学処理を制限 なしに包含する本発明の全ての遺伝子工学処理の側面、ならびに各種のタンパク 質ドメイン間の境界の選択もしくは設計にも当てはまる。他の成分、設計の特徴および用途 本発明のキメラタンパク質は膜保持ドメインのような細胞局在化ドメインを異 種ドメインとして含んでいてもよい。例えば、PCT/US94/01617、特に26〜27頁を 参照。簡単に述べると、膜保持ドメインは、宿主細胞に内生であるか否かにかか わらず、任意の好都合な膜結合タンパク質から分離することができる。膜保持ド メインは、多くのレセプターを始めとする貫膜保持ドメイン、即ち、細胞表面タ ンパク質の場合のように、膜を横断する長さのアミノ酸配列であってもよい。貫 膜ペプチド配列はまた、細胞外および/または細胞内ドメインの一部または全部 に達する長さであってもよい。或いは、膜保持ドメインは、細胞表面膜の脂質と の会合を可能にするミリストイル化またはパルミトイル化部位のような脂質膜保 持ドメインであってもよい。脂質膜保持ドメインは、膜とのN末端結合に対して はコーディング配列の5'末端に、およびC末端結合に対しては3'末端付近に通常 は付加されよう。脂質膜結合を準備するための翻訳後プロセシングに関与するペ プチドは、Carr et al,PNAS USA(1988)79,6128;Aitken et al,Febs Lett. (1982)150,314;Henderson et al,PNAS USA(1983)80,319;Schulz et al, Virology(1984)123,2131;Dellman et al,Nature(1985)314,374に記載さ れ、Ann.Rev.of Biochem.(1988)57,69に総括されている。興味あるアミノ 酸配列としては、配列M-G-S-S-K-S-K-P-K-D-P-S-Q-Rが挙げられる。各種のDNA配 列を用いて、本発明の各種キメラタンパク質内のこのような配列をコードするこ とができる。他の局在化ドメインとしては、-K-D-E-Lおよび-H-D-E-Lのようなオ ルガネラ標的ドメインおよび配列(これは、これを保有するタンパク質を小胞体 に標的化する)、ならびに(直接的)転写調節用に設計されたキメラタンパク質 に特に有用な核局在化配列が挙げられる。各種の細胞局在化配列およびシグナル が当該技術分野において周知である。 CD3ゼータ鎖のような細胞質シグナル開始ドメインを、とりわけVP16およびGAL 4を包含する核転写因子ドメイン、Fas細胞質ドメインを包含するアポトーシスを 発動させることができるドメインその他包含する各種の作用ドメインを含んでい るキメラタンパク質をコードする構築物の設計、組立ておよび使用に関して本発 明の実施に用いてもよいそれ以上の詳細は、PCT/US94/01617およびPCT/US95/105 91に開示されている。後者の国際出願はさらに、特に生物薬学の研究に疾病モ デルとして使用できる遺伝子工学処理された動物の作製に適用できる別の内容も 開示している。これらの内容は、キメラタンパク質の発現のための構築物に組織 特異的な調節要素を使用すること、および標的遺伝子としてのCreリコンビナー ゼの発現に調節された転写を適用して1oxP配列により挟まれた(flanked)対象遺 伝子の消去を生ずることを包含する。 さまざまな場合において、特に本発明に従って遺伝子工学処理された細胞を含 んでいる完全な動物を利用する態様において、キメラタンパク質の各種ドメイン を宿主細胞と同じ種のタンパク質から誘導することが往々にして好ましく、場合 によっては必要となろう。即ち、ヒト細胞の遺伝子工学処理に対しては、異種ド メイン(ならびにFKBPおよびFRBドメイン)が、細菌、酵母または他のヒト以外 の供給源に由来するものではなく、ヒト起源のものであることが好ましいことが 多い。 好都合な検出を可能にするために、エピトープ標識を本発明のキメラタンパク 質に取り込んでもよいことにも我々は注目している。組織特異的またはセルタイプ(細胞型)特異的な発現 ある種の態様では、本発明のキメラタンパク質を細胞特異的または組織特異的 に発現させることが好ましいであろう。このような発現の特異性は、このキメラ タンパク質をコードする1または2以上のDNA配列を、細胞型特異的な転写調節 配列(例、プロモーター/エンハンサー)に操作可能に結合することにより達成 しうる。数多くの細胞型特異的な転写調節配列が既知である。他のものも細胞型 特異的に発現される遺伝子から得ることができる。例えば、PCT/US94/01617、特 に36〜37頁を参照。 例えは、本発明のキメラタンパク質を発現する構築物は、選択された組織中で の特異的発現のために既知の遺伝子に由来する調節配列を含んでいてもよい。代 表例を次に表にまとめて示す。 標的遺伝子構築物 キメラタンパク質をその多量体化が標的遺伝子の転写を活性化するように設計 する本発明の態様では、遺伝子工学処理細胞に適当な標的遺伝子構築物もまた使 用する。適当な標的遺伝子構築物は、標的遺伝子と、プロモーター/エンハンサ ーのようなキメラタンパク質の多量体化に応答性の同族転写制御要素とを含んで いるものである。転写の直接活性化を利用する態様では、この応答性は本発明の キメラタンパク質のDNA結合性ドメインにより認識される1又は2以上のDNA配列 (即ち、キメラタンパク質が結合するDNA配列)が標的遺伝子構築物中に存在す ることにより達成されうる。転写の間接的な活性化を利用する態様では、応答性 は、キメラタンパク質の多量体化により発生する細胞内シグナルにより活性化さ れるプロモーターおよび/またはエンハンサー配列が標的遺伝子構築物中に存在 することにより達成されうる。例えば、キメラタンパク質がTCRゼータ鎖細胞内 ドメインを含んでいる場合、標的遺伝子はIL-2プロモーター領域にその発現制御 下で結合される。 本発明はまた、(a)例えば本発明のDNA結合性キメラタンパク質が結合するこ とができる(または上述のような間接的活性化に対して感受性の)同族DNA配列 と、(b)宿主細胞に対して内生の所望の標的遺伝子の遺伝子座からのフランキ ングDNA配列とを含んでいる標的DNA構築物も提供する。このような構築物は、内 生標的遺伝子に関して宿主細胞内への同族DNA配列の相同的組換えを可能にする 。別の態様では、この構築物は、所望の遺伝子と、所望の遺伝子座への標的遺伝 子の相同的組換えを可能にする標的遺伝子座からのフランキングDNAとを含んで いる。このような標的構築物はまた同族DNA配列を含んでいてもよく、或いは遺 伝子座により同族DNA配列を提供してもよい。 前述した任意の態様における標的遺伝子は、例えば、表面膜タンパク質(レセ プタータンパク質などの)、分泌タンパク質、細胞質タンパク質、核タンパク質 、Creのようなリコンビナーゼ、リボチーム、またはアンチセンスRNAをコードす るものでよい。一般的な設計および構築の詳細と遺伝子治療を含む各種応用につ いてはPCT/US94/01617を、また疾病の動物モデルへの応用についてははPCT/US95 /10591を参照。 本発明はキメラタンパク質の多様な配置形態を包含する。但し、標的遺伝子の 転写活性化を包含する場合は全て、キメラタンパク質は、そのキメラをコードす る構築物と標的遺伝子構築物とを含む細胞が、多量体化リガンドの存在下では、 これが不存在の場合に比べて、少なくとも1桁、好ましくは少なくとも2桁、よ り好ましくは少なくとも3〜4桁の大きさで標的遺伝子を発現するという重要な 特徴を共有している。最適には、細胞が多量体化リガンドに曝されるまでは選択 された遺伝子の発現が観察されない。 リキャップ(recap)のため、キメラタンパク質は、ラパマイシンまたはラパロ グリガンドの細胞に暴露される、即ち、キメラの多量体化の後、遺伝子工学処理 された細胞内で検出可能なレベルの標的遺伝子の転写を開始させることができる 。即ち、標的遺伝子の転写は、キメラタンパク質分子を多量体化させることがで きるラパマイシンまたはラパログリガンドへの細胞の暴露に続いて、本発明の遺 伝子工学処理された細胞内で活性化される。本発明のこの異なる遺伝子工学処理 がなされた細胞は、上述したキメラタンパク質を含んでおり、このキメラタンパ ク質分子を多量体化することができるラパマイシンまたはラパログリガンドの存 在および/または濃度に応答性である。この応答性は標的遺伝子の転写の活性化 として現れる。かかる転写活性化は、標的遺伝子の任意の慣用の転写検定法によ り容易に検出することができる。別の態様では、キメラのリガンド媒介多量体化 に対する生物学的応答は、標的遺伝子の転写の直接的活性化ではなく、細胞の死 または他の生物学的事象である。構築物の細胞内への導入 本発明は特に、動物細胞の遺伝子工学処理用とかかる遺伝子工学処理された動 物細胞を使用した用途に特に有用である。動物細胞は、昆虫、蠕虫(worm)、また は哺乳動物の細胞でよい。例えば、ウマ、ウシ、ヒツジ、イヌ、ネコ、ネズミお よびヒト以外の霊長類の細胞を包含する各種の哺乳動物の細胞を使用することが できるが、ヒトの細胞が特に有利である。多様な種(species)のうち、造血、神 経、神経膠、間葉、皮膚、粘膜、間質、筋肉(平滑筋細胞を含む)、脾臓、網状 内皮、上皮、内皮、肝臓、腎臓、胃腸、肺、繊維芽その他の細胞型(cell type) といった各種の細胞の型を使用することができる。特に興味あるのは造血細胞で あり、これは赤血球、リンパ球もしくは骨髄単球(myelomonocytic)系統、ならび に筋芽細胞および繊維芽細胞に関連しうる任意の核形成された細胞を包含しうる 。別の興味ある細胞は、造血、神経、間質、筋肉、肝臓、肺、胃腸および間葉の 幹細胞といった幹細胞および前駆細胞である。 細胞は、意図した宿主生体に対してオートロガス(自己)細胞、同系細胞、同 種(異系)細胞、そして場合によっては異種細胞でよい。細胞は、主要組織適合 性("MHC")プロファイルの変化、機能クラスIMHC分子の形成を防止するためのβ2 -ミクログロブリンの不活性化、クラスII分子の不活性化、1もしくは2以上の MHC分子の発現の準備、細胞毒性活性に関与する遺伝子の発現の増進もしくは阻 害による細胞毒性能力の増進もしくは不活性化などにより修飾してもよい。 場合によっては、特異的クローンまたはオリゴクローナル細胞が有利となるこ とがあり、その場合の細胞は特異的抗原特異性または帰還(homing)標的部位特異 性を持つT細胞またはB細胞のような特定の特異性を有する。 本発明のキメラタンパク質および標的遺伝子をコードする構築物は、1または 2以上のDNA分子または構築物として、多くの場合にはその構築物を含む宿主細 胞の選択を可能にする1または2以上のマーカーと組合わせて、細胞内に導入す ることができる。構築物の調製は、慣用の方法により実施でき、コード配列およ び調節領域は適宜に分離、連結、適当なクローニング用宿主内でクローン化、制 限酵素処理もしくは配列決定分析または他の好都合な手段による分析を行えばよ い。特に、PCRを用いて、機能ユニットの全部または一部を含む個々の断片を分 離してもよく、その場合には適宜に「プライマー修復」、連結、in vitro変異誘 発等を用いて1または2以上の突然変異を導入してもよい。構築物が完成し、適 切な配列を持つことが実証されたら、これを次いで任意の好都合な手段で宿主細 胞に導入する。構築物は、エピソーム複製の可能なベクター(例、BPVまたはEBV ベクター)中または宿主細胞の染色体中への組込み用に設計されたベクター中に 取り込んでもよい。構築物は、細胞内への感染または形質導入のために、レトロ ウイルスベクターを含む、アデノウイルス、アデノ関連ウイルス(AAV)または単 純性疱疹ウイルス(HSV)その他のような非複製型欠陥ウイルスゲノム中への組込 みおよび詰込みをしてもよい。或いは、構築物を原形質体(プロトプラスト) 融合、エレクトロポレーション、バイオリスティックス(biolistics)、リン酸カ ルシウムトランスフェクション、リポフェクション、DNAの微小注入(microinjec tion)などにより導入することもできる。宿主細胞は、場合により、構築物の導 入の前に培養により増殖および拡大させておき、その後で構築物の導入および構 築物の組込みのための適当な処理を行う。細胞を次いで拡大させ、構築物中に存 在するマーカーによりスクリーニングする。首尾よく使用できる各種のマーカー としては、hprt、ネオマイシン耐性、チミジンキナーゼ、ヒグロマイシン耐性等 、ならびにTac,CD8,CD3,Thy1およびNGFレセプターといった各種の細胞表面マ ーカーが挙げられる。 場合により、構築物を特定の遺伝子座に組込むことが望ましい場合、相同的組 換えに対する標的部位を有していてもよい。例えば、内在性遺伝子を削除および /または本発明の組換え標的構築物で(同じ遺伝子座またはどこでも)置換する ことができる。相同的組換えに対しては一般にΩまたはO−ベクターのいずれか を使用しうる。例えば、Thomas and Capecchi,Cell(1987)51,503-512;Manso ur,et al.,Nature(1988)336,348-352;およびJoyner,et al.,Nature(198 9)338,153-156を参照。 複数の構築物は、遺伝子の全部をコードする単一のDNA分子として、または1 または2以上の遺伝子を有する異なるDNA分子として導入することができる。複 数の構築物の導入は、それぞれ同じまたは異なるマーカーを用いて同時にまたは 順次行うことができる。 DNA構築物のストックの調製およびトランスフェクションの実施に使用できる 、細菌もしくは酵母の複製起点、選択および/もしくは増幅可能なマーカー、原 核生物もしくは真核生物中の発現のためのプロモーター/エンハンサー要素、お よび哺乳動物の発現制御要素等といった有用な要素を含むベクターは、当該技術 分野で周知であり、多くのものが市販されている。構築物の動物への導入 本発明のDNA構築物でex vivo修飾された細胞を選択的条件下で培養により増殖 させ、所望の構築物を持つとして選ばれた細胞を次いで拡大させ、さらに例えば 宿主細胞内の構築物の存在を決定するためのポリメラーゼ連鎖反応および/ま たは所望の遺伝子産物の産生に対する検定を用いてさらに分析する。修飾された 宿主細胞を同定したら、次いでこれを計画通りに用いて、例えば培養により増殖 させるか、または宿主生体中に導入する。 細胞の性質に応じて、細胞の宿主生体(例、哺乳動物)への導入は多様な方法 により実施しうる。造血細胞を注射により血管系内に投与してもよく、細胞数は 通常は少なくとも約104個で、一般に約1010個以下である。使用する細胞数は、 多くの状況、導入の目的、細胞の寿命、使用すべきプロトコル、例えば、投与回 数、細胞の増殖能力、治療剤の安定性、治療剤の生理学的必要性等に依存しよう 。一般に、例えば筋芽細胞または繊維芽細胞については、細胞数は約104個以上 、約109個以下であり、分散液として、一般に対象位置またはその付近に注射さ れて投与しうる。細胞は通常は生理学的に許容される媒体中で用いる。 本発明に従って遺伝子工学処理した細胞はまた、治療用タンパク質の産生のた め宿主生体または患者に移植する前に、例えば慣用の生体適合性の材料と方法を 用いてカプセル化してもよい。例えば、Hguyen et al,宿主内で高生菌密度を維 持するための組織移植システム及び方法,米国特許第5,314,471(Baxter Interna tional,Inc.);Uludag and Sefton,1993,J.Biomed.Mater.Res.27(10):121 3-24(HepG2細胞/ヒドロキシエチルメタクリレート−メチルメタクリレート膜); Chang et al,1993,Hum.Gene Ther.4(4):433-40(hGHを発現するマウスLtk細 胞/免疫保護・選択<perm-selective>アルギネートマイクロカプセル);Reddy et al,1993,J.Infect.Dis.168(4):1082-3(アルギネート);Tai and Sun,1993 ,FASEB J.7(11):1061-9(hGHを発現するマウス繊維芽/アルギネート−ポリ− L−リシン−アルギネート膜);Ao et al,1995,Transplantation Proc.27(6): 3349-3350(アルギネート);Rajotte et al,1995,Transplantation Proc.27 (6):3389(アルギネート);Lakey et al,1995,Transplantation Proc.27(6):32 66(アルギネート);Korbutt et al,1995,Transplantation Proc.27(6):3212( アルギネート);Dorian et al,米国特許第5,429,821(アルギネート);Emerich et al,1993,Exp.Neurol.122(1):37-47(ポリマーカプセル化PC12細胞);Sagen et al.,1993,J.Neurosci.13(6):2415-23(ポリマー半透膜内にカプセ ル化され、ラット脊髄クモ膜下腔内に移植されたウシ・クロマフィン親和性細胞 );Aebischer et al,1994,Exp.Neurol.126(2):151-8(サルに移植されたポリ マーカプセル化ラットPC12細胞、Aebischer WO92/19595も参照);Savelkoul et a l,1994,J.Immunol.Methods,170(2):185-96(抗体を産生するカプセル化ハイ ブリドーマ;各種サイトカインを発現するカプセル化トランスフェクティド);Win n et al,1994,PNAS USA 91(6):2324-8(免疫分離<immunoisolation>ポリマー製 デバイスにカプセル化され、ラットに移植されたヒト神経成長因子を発現する遺 伝子工学処理されたBHK細胞);Emerich et al,1994,Prog.Neuropsychopharmac ol.Biol.Psychiatry 18(5):935-46(ラットに移植されたポリマーカプセル化PC 12細胞);Kordower et al,1994,PNAS USA 91(23):10898-902(サルに移植された 、hNGFを発現するポリマーカプセル化遺伝子工学処理BHK細胞);およびButler et al WO 95/04521(カプセル化デバイス)を参照。細胞を次いでカプセル化形態 でそれを必要とする動物宿主、好ましくは哺乳動物、より好ましくはヒトの患者 に導入しうる。好ましくは、カプセル化材料は、カプセル化された細胞により産 生された分泌タンパク質の宿主中への放出が可能になるように半透過性である。 多くの態様では、半透過性カプセル化により、カプセル化された細胞は、これを 導入する宿主生体から免疫学的に分離されるようになる。そのような態様では、 カプセル化される細胞は、宿主種のタンパク質に由来するか、および/またはウ イルス性タンパク質もしくは宿主種以外の種からのタンパク質に由来する成分ド メインを含む1または2以上のキメラタンパク質を発現しうる。例えば、このよ うな場合に、キメラはGAL4およびVP16に由来する要素を含有しうる。この細胞は 受容体(者)以外の1または2以上の個体に由来するものでもよく、また受容生 体または患者とは異なる種に由来するものでもよい。 細胞のex vivo修飾の代わりに、多くの場合、細胞をin vivo修飾したいことが ある。このために、標的組織および細胞のin vivo修飾用に各種手法が開発され ている。アデノウイルス、アデノ関連ウイルス、およびレトロウイルスといった 多くのウイルスベクターが開発されており、これらは宿主へのウイルスのトラン スフェクションと場合により組込みを可能にする。例えば、Debenksky et al(1 984)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 81,7529-7533;Kaneda et al,(1989)Sc ienece 243,375-378;Hiebert et al(1989)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86, 3594-3598;Hatzoglu et al(1990)J.Biol.Chem.265,17285-17293;およびFe rry et al(1991)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 88,8377-8381を参照。ベクタ ーは注射(例、脈管内または筋肉内)、吸入または他の非経口経路で投与しうる 。リポソームとの複合体または注射、カテーテルもしくはビオリスティックスに よるによるDNAの投与といった非ウイルス型の供給も使用できる。 in vivo遺伝的修飾によれば、修飾方法は、組織の性質、要求される細胞修飾 の効率、その細胞を修飾する機会の数、導入すべきDNA組成物への組織の接近の し易さ等に依存しよう。所望により、標的転写開始領域を保有する弱毒化または 修飾されたレトロウイルスを採用することにより、ウイルスが産生され、隣接細 胞を移入するように、本発明の転写因子構築物の一つを用いてウイルスを活性化 することができる。 DNA導入はすべての場合に組込みを生じなくてもよい。状況によっては、導入 されたDNAの一時的な維持で十分である。このようにして短期間作用を得ること ができ、その場合、細胞を宿主に導入してから、所定時間後、例えば細胞を特定 の部位に戻ることができるようになった後、ターンオン(turn on)することがで きる。多量体化剤 本発明に使用するのに適したリガンドとしては、FKBPキメラおよびFRAPキメラ に結合して三成分複合体を形成することができるラパマイシンおよびラパマイシ ン類似体、誘導体および疑似体(ラパログ)が挙げられる。遺伝子工学処理され た細胞に対して内生のFKBPおよび/またはFRAPへのその結合を減少させ、好まし くは実質的に阻止する1または2以上の置換基("バンプ")を有する本発明のラパ ログが好ましい。本発明の変異FKBPは、PCT/US94/01617およびPCT/US94/08008に 記載のようにして、所定のラパログへの結合のために取得およびスクリーニング しうる。ある種のラパログは、FKBP複合体としてのFRAPへのその結合を減少させ 、好ましくは実質的に阻止するが、(変異)FKBPキメラタンパク質、(変異)FR APキメラへの結合と複合体化(図2)は行う任意の置換基を有している。かかる バンプを含んでいるラパログは、FKBP12またはFRAPの内生プールによる妨害を受 け ずに、変異FKBPキメラおよび/または変異FRAPキメラへのより選択的な結合を可 能にする。これは多くの用途、特に完全な生体内での使用にとって望ましい。内 生FRAPへの結合の減少の別の利点は、このような多量体化剤が単独で又は内生FK BP12もしくはFKBPドメインを含んでいるキメラと一緒に、ラパマイシンに比べて 相対的に減少した免疫抑制活性または機構に基づく毒性を有することである。表 面残基変異のために内生FRAPへのリガンド依存性結合は実質的に阻止されるが、 代償性変異を持つ1または2以上のFRBドメインを含んでいるキメラタンパク質 にはリガンド依存性で結合することができる(図2E)変異FKBPドメインからな るキメラタンパク質も本発明で意図している。 PCT/US94/01617に開示されているような単量体型の1価リガンド、ならびに本 書に記載した誘導体化合物は、キメラタンパク質の一方に結合することができる が、(リガンドの1価の性質のために)その二量体化またはより高次の多量体化 を行うことができず、多量体化拮抗剤となる。 特に興味あるラパログは、ヒトFKBP12に結合し、および/またはFK506,FK520 またはラパマイシンのいずれに比べても、そのロタマーゼ活性の阻害の効力が少 なくとも1桁は小さい。このような検定法は当該技術分野で周知である。例えば 、Holt et al,J.Amer.Chem.Soc.,1993,115,9925-9938を参照。阻害活性 の減少は、約2桁以上の大きさとなることもあり、場合によっては約3桁を超え よう。有用なラパログ置換基としては、とりわけ、アルキル、アリール、−O− アルキル、−O−アリール、置換もしくは非置換アミン、アミド、カルバミドお よびウレアが挙げられ、ここでアルキルおよびアリールは本書のいずれかで定義 する通りである。例えば、PCT/US94/01617およびPCT/US94/08008を参照。 本発明の多量体化リガンドは具体的には、次式で示されるラパマイシンおよび ラパログを包含する。上記式中、 Uは-H,-OR1,-SR1, -OC(O)R1もしくは-OC(O)NHR1, -NHR1,-NHC(O)R1,-NH-SO2-R1または -R2であり、ここでR2=置換アリールもしくはアリルもしくはアルキルアリ ール(例、ベンジルまたは置換ベンジル) Vは-OR3または(=O)であり Wは=O,=NR4,=NOR4もしくは=NNHR4, -NHOR4もしくは-NHNHR4, -OR4, -OC(O)R4もしくは-OC(O)NR4,または-Hであり Yは-OR5,-OC(O)R5または-OC(O)NHR5であり Zは=O,-OR6,-NR6,-H,-NC(O)R6,-OC(O)R6または-OC(O)NR6であり R3はH,-R7,-C(O)R7もしくは-C(O)NHR7,またはC-28/C-30環式カーボネートで あり R4はHまたはアルキルであり、 ここでR1,R4,R5,R6およびR7は、H、アルキル、アルキルアリールおよびアリ ールから別個に選ばれる。 ラパマイシンでは、Uが-OMe、Vが=O、W=O、Yが-OH、Zが=O、そしてR3お よびR4がHであり、立体異性は第1頁の式Iに示す通りである。本発明のラパロ グは可能な立体異性配向のいずれかにおいて置換基を含有しうる。 アルキルなる用語を本書で用いた場合、これは一般に1〜8個の連続した脂肪 族炭素原子を含有する飽和および不飽和の、線状(直鎖)、分岐鎖、環式および 多環式の脂肪族炭化水素基(例、メチル、エチル、n-プロピル、イソプロピル、 シクロプロピル、n-ブチル、イソブチル、sec-ブチル、t-ブチル、シクロブチル 、n-ペンチル、イソペンチル、sec-ペンチル、シクロペンチルなど)を包含する 意味であり、これは任意にヒドロキシ、C1〜C8アルコキシ、アシルオキシ、カル バモイル、アミノ、N-アシルアミノ、ケト、ハロ(クロロ、ブロモ、フルオロも しくはヨード)、トリハロメチル、シアノ、カルボキシル、アルキル、シクロア ル キル、アリールおよびヘテロアリールよりなる群から選ばれた1または2以上の 官能基(これらの官能基それ自体も、ヒドロキシ、ハロおよびシアノ基を除いて 、1または2以上の上記官能基を有していてもよい)で場合により置換されてい てもよい。好ましくは、アルキル、アルコキシおよびアシル基は1〜6個の連続 した脂肪族炭素原子を含有し、置換基を有していてもよい。 アリールなる用語を本書で用いた場合、これは安定な環式、複素環式、多環式 、および複素多環式の不飽和C3〜C14部分(フェニル、ビフェニル、ナフチル、 ピリジル、フリル、チオフェニル、イミダゾイル、ピリミジニル、およびオキサ ゾイルで例示されるが、これに限られない)を包含する意味であり、これはヒド ロキシ、C1〜C8アルコキシ、C1〜C8分岐鎖もしくは直鎖アルキル、アシルオキシ 、カルバモイル、アミノ、N-アシルアミノ、ニトロ、ハロ、トリフルオロメチル 、シアノ、およびカルボキシルよりなる群から選ばれた1〜5個の官能基(これ らの官能基それ自体も、ヒドロキシ、ハロ、トリフルオロメチルおよびシアノ基 を除いて、1または2以上の上記官能基を有していてもよい)で置換されていて もよい。 ヘテロアルキルおよびヘテロアリールなる用語を本書で用いた場合、これらは 1または2以上の炭素原子の代わりに1または2以上の酸素、イオウ、または窒 素を含有するそれぞれアルキルおよびアリール部分を意味する。 ある種の態様では、特に有利なリガンドが、ラパマイシンそれ自体以外の化合 物、14位にヒドロキシル基を有する還元形態のラパマイシン、またはUがC2〜C8 直鎖、分岐鎖もしくは環式脂肪族もしくはアルコキシル部分;アリールもしくは ヘテロアリール;置換アルキルもしくはアルコキシル部分;またはアリールおよ びヘテロアリール部分が置換でも非置換でもよいアリール、アリールオキシ、ヘ テロアリルもしくはヘテロアリールオキシ部分であるラパマイシン誘導体を包含 する。 多様なかかる化合物または上記置換基を持つ関連化合物の例が、それらの合成 と同様に当該技術分野で既知である。例示の目的で、所望のラパログを製造する のに採用できる変換の例を下記の合成反応式で示す。C-7 バンプの調製 C-13 バンプの調製 C-14 バンプの調製 C-20 バンプの調製 C-24 バンプの調製 C-28 バンプの調製 C-30 バンプの調製 別の変換は下記を包含する。C-14 での変性 C-13 での変性 C-24 での変性 処方、投与量および投与 本発明のラパマイシンまたはラパログは、そのタンパク質−タンパク質相互作 用の促進能力により、本発明の遺伝子工学処理された細胞を含んでいる哺乳動物 内で本発明のキメラタンパク質の三成分複合体の形成を促進させるための薬剤組 成物および方法に使用することができる。 かかる処置または予防の好ましい方法は、遺伝子工学処理された細胞内でのこ の複合体形成の測定可能な促進、または好ましくはこの複合体形成により発動さ れる所望の生物学的事象(例、標的遺伝子の転写、遺伝子工学処理された細胞の アポトーシス等)の作動の測定可能な促進、に有効な量で該化合物を哺乳動物に 投与することによる。治療用/予防用投与と薬剤組成物 ラパマイシンおよび各種のラパログは、遊離形態で、または適当であれば塩の 形態で存在しうる。薬剤に許容される塩およびその調製は当業者には周知である 。この種の化合物の薬剤に許容される塩には、例えば、無機または有機の酸また は 塩基により形成されるこの化合物の慣用の無毒な塩または第四級アンモニウム塩 が含まれる。 本発明の化合物は、水和物または溶媒和物を形成しうる。電荷を持つ化合物は 水を用いて凍結乾燥すると水和種を形成し、また適当な有機溶媒との溶液状態で 濃縮すると溶媒和物を形成することは当業者には知られている。 本発明は、治療(または予防)に有効な量の前記化合物と、薬剤に許容される 担体または賦形剤とからなる薬剤組成物にも関する。担体の例としては、食塩水 、緩衝剤含有食塩水、デキストロース、水、グリセロール、エタノール、および これらの混合物が挙げられ、後でより詳しく説明する。この組成物はまた、所望 により、少量の湿潤もしくは乳化剤、またはpH緩衝剤も含有することができる 。組成物は、液体溶液、懸濁液、エマルジョン、錠剤、丸薬、カプセル、持効性 処方剤、または散剤の形態をとりうる。組成物は、トリグリセライド等の従来の 結合剤兼担体を用いて座剤として処方することもできる。経口用の処方は、薬剤 用のマンニトール、乳糖、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、サッカリンナ トリウム、セルロース、炭酸マグネシウム等の標準的な担体を含有しうる。処方 は、所望の製剤に応じて、成分の混合、造粒および圧縮、または溶解といった操 作を適宜含んでいる。 使用する薬剤用担体は、例えは、固体と液体のいずれでもよい。 固体の担体の例としては、乳糖、白土、ショ糖、タルク、ゼラチン、寒天、ペ クチン、アカシア、ステアリン酸マグネシウム、ステアリン酸等が挙げられる。 固体担体は、香料、滑剤、可溶化剤、懸濁剤、充填剤、グリダント(glidant)、 圧縮助剤、結合剤、または錠剤崩壊剤としても作用しうる1種または2種以上の 物質を含有することができ、またカプセル化材料であってもよい。散剤の場合、 担体は微細な固体であり、これを微細な有効成分と混合する。錠剤では、有効成 分を必要な圧縮特性を持つ担体と適当な割合で混合し、所望の形状および寸法に 圧縮する。散剤および錠剤の有効成分の含有量はは好ましくは99%までである。 適当な固体担体としては、例えば、リン酸カルシウム、ステアリン酸マグネシウ ム、タルク、糖類、乳糖、デキストリン、デンプン、ゼラチン、セルロース、メ チルセルロース、ナトリウムカルボキシメチルセルロース、ポリビニルピロリド ン、低融点ワックスおよびイオン交換樹脂が挙げられる。 液体担体の例としては、シロップ、ピーナツ油、オリーブ油、水などが挙げら れる。液体担体は溶液、懸濁液、エマルジョン、シロップ、エリキシールおよび 加圧組成物の調製に使用される。有効成分を、水、有機溶媒、両者の混合物など の薬剤に許容される液体担体、または薬剤に許容される油脂に溶解または懸濁さ せることができる。液体担体は、可溶化剤、乳化剤、緩衝剤、保存料、甘味料、 香料、懸濁剤、増粘剤、着色料、粘度調整剤、安定剤、または浸透圧調整剤など の他の適当な製薬用添加剤を含有しうる。経口および非経口投与用の液体担体の 適当な例としては、水(上記の添加剤、例えば、セルロース誘導体、好ましくは ナトリウムカルボキシメチルセルロース溶液を部分的に含有する)、アルコール (1価アルコールおよび多価アルコール、例、グリコール)およびその誘導体、 ならびに油(例、分留ヤシ油およびアラキス<arachis>油)がある。非経口投与 に対しては、担体はオレイン酸エチルおよびミリスチン酸イソプロピルのような 油状エステルであってもよい。滅菌液体カーダー(carder)は非経口投与用の滅菌 液体形態組成物に有用である。加圧組成物用の液体担体は、ハロゲン化炭化水素 その他の薬剤に許容される噴射剤でよい。滅菌溶液または懸濁液である液体薬剤 組成物は、例えば、筋肉内、腹腔内、または皮下注射により利用することができ る。滅菌溶液はさらに静脈内投与も可能である。化合物はまた、液体または固体 のいずれかの組成物形態で経口投与することもできる。 担体または賦形剤は、モノステアリン酸グリセリルもしくはジステアリン酸グ リセリル単独、またはこれとワックス、エチルセルロース、ヒドロキシプロピル メチルセルロース、メチルメタクリレート等との組合わせといった、当該技術分 野で周知の遅効材料を含有していてもよい。経口投与用に処方する場合、PHOSAL PG-50(1,2-プロピレングリコールとのリン脂質濃厚液,A.Nattermann & Cie. GmbH)中の0.01%Tween 80溶液が、ラパマイシンに対して許容される経口処方を 与えることが認められた。この溶液は、各種のラパログに対する処方にも適用し うる。 多様な剤形を採用できる。固体担体を使用した場合、調剤物を打錠するか、粉 末もしくはペレット状で硬質ゼラチンカプセル内に充填するか、またはトローチ もしくはロジンジの形態にすることができる。固体担体の量は広範囲に変動しう るが、好ましくは約25mgないし約1gであろう。液体担体を使用する場合には、 調剤物はシロップ、エマルジョン、軟質ゼラチンカプセル、アンプルもしくはバ イアル内の滅菌注射用溶液もしくは懸濁液、または非水液体懸濁液の形態となろ う。 安定な水溶性の投与形態を得るには、ラパマイシンまたはラパログの薬剤に許 容される塩を、0.3Mコハク酸またはクエン酸溶液といった有機酸または無機酸の 水溶液中に溶解させてもよい。或いは、酸性誘導体を適当な塩基性溶液中に溶解 させることができる。可溶性の塩の形態が利用できない場合には、化合物を適当 な共溶媒または2種以上の共溶媒の混合物中に溶解させる。このような適当な共 溶媒の例としては、これらに限られないが、アルコール、プロピレングリコール 、ポリエチレングリコール300、ポリソルベート80、グリセリン、ポリオキシエ チル化脂肪酸、脂肪アルコールまたはグリセリンヒドロキシ脂肪酸エステルなど が挙げられ、全容積の0〜60%の範囲内の濃度で使用される。 各種の供給システムが公知であり、ラパマイシンもしくはラパログ、またはそ の各種の処方物(錠剤、カプセル剤、注射液、リポソーム内封入剤、微粒子剤、 マイクロカプセル剤等を含む)を投与するのに使用することができる。導入方法 としては、これに限られないが、皮膚、皮内、筋肉内、腹腔内、静脈内、皮下、 鼻孔内、肺、硬膜外、眼、および経口経路(これが通常は好ましい)が挙げられ る。化合物は任意の好都合なまたはその他の点で有利な経路、例えば、輸注もし くはボーラス注射により、上皮または粘膜皮膚内層(例、口腔粘膜、直腸および 腸管粘膜等)を通る吸収により投与してもよく、また他の生物学的に活性な薬剤 と一緒に投与してもよい。投与は全身または局所でよい。鼻孔、気管支または肺 の症状の治療または予防の場合、好ましい投与経路は経口、経鼻、または気管支 用エアゾールまたはネブライザーである。 ある種の態様では、化合物を治療を必要とする部位に局所的に投与することが 望ましいことがある。これは、例えば(限定としてではないが)手術中の局所輸 注、局部の塗布、注射、カテーテルの使用、座薬として、または皮膚パッチもし くは移植片(この移植片は、シアラスティック<sialastic>膜のような膜を含む 、 多孔質、非多孔質、またはゼラチン質材料のものでよい)により達成することが できる。 ある具体的態様においては、薬剤組成物をヒトへの静脈内投与に使われる薬剤 組成物として常套的な手法に従って処方する。典型的には、静脈内投与用の組成 物は滅菌等張水性緩衝液中の溶液である。必要であれば、組成物はさらに安定化 剤および注射の側の苦痛を緩和するための局所麻酔薬を含有していてもよい。一 般に、各成分は別々に供給されるか、一緒に混合されて単位投与形態にされ、例 えば、有効成分の量を表示したアンプルまたは小袋のような密封容器内に凍結乾 燥粉末または水を含まない濃厚液として収容される。組成物を輸注により投与す べき場合には、滅菌した薬剤用の水または食塩水を入れた輸液ビンで投薬するこ とができる。組成物を注射により投与する場合には、成分を投与前に混合するこ とができるように、注射用滅菌水または食塩水のアンプルを用意することができ る。 有効量の化合物の個体への投与は、化合物をその個体の皮膚の患部に直接投与 することにより局所的に行うこともできる。このためには、ゲル、軟膏、ローシ ョン、またはクリームといった薬剤に許容される局所用担体を含む組成物中で化 合物が投与または塗布される。この担体は、水、グリセロール、アルコール、プ ロピレングリコール、脂肪アルコール、トリグリセライド、脂肪酸エステル、ま たは鉱油といった担体(これらに制限されないが)を含んでいる。 他の局所用担体は、流動石油、パルミチン酸イソプロピル、ポリエチレングリ コール、エタノール(95%)、水中のポリオキシエチレンモノラウレート(5%)、 または水中のラウリル硫酸ナトリウム(5%)を含有する。酸化防止剤、保湿剤、 粘度安定剤、および類似の添加剤といった他の材料も、必要に応じて添加しうる 。アゾン(Azone)のような経皮浸透向上剤も含有させることができる。 さらに、ある種の態様では、皮膚の上、中、または下に置いた器材の内部に化 合物を配置する場合があることも予想される。かかる器材としては、受動的また は能動的放出機構により化合物を皮膚に放出するパッチ、移植片、および注射が 挙げられる。 多様な処方を作るための材料および方法は当該技術分野において周知であり、 本発明の実施に適合させることができる。例えば、米国特許第5,182,293号およ び第4,837,311号(錠剤、カプセル剤およびその他の経口用処方ならびに静脈内 処方)ならびに欧州特許出願公開第0 649 659号(1995年4月26日公開;静脈内 投与用のラパマイシン処方)および第0 648 494号(1995年4月19日公開;経口投 与用のラパマイシン処方)を参照。 化合物の有効用量は、哺乳動物の体重1kg当たりで、典型的には約0.01〜約50 mg/kg、好ましくは約0.1〜約10mg/kgの範囲内であり、1回または複数回投与さ れよう。一般に、本発明の化合物は、かかる治療を必要とする患者に、一人当た り約1〜約2000mgの日用量範囲内で投与しうる。化合物がラパマイシンであるか 、またはある程度の残留免疫抑制作用のあるラパログである態様では、投与量は 過度の免疫抑制作用を伴う量より少なくすることが好ましい。 具体的な疾患または症状の治療または予防に有効な化合物の量は、その疾患ま たは症状の性質にも部分的には依存し、標準的な臨床技法により決定することが できる。また、最適の投与量範囲の確定を助けるためin vitroもしくはin vivo 検定を任意に採用してもよい。有効量は、in vitroまたは動物モデル試験方式か ら得られた用量応答曲線から外挿してもよい。正確な投与量水準は担当医または 他の健康管理提供者により決定されるべきであり、投与経路やその個体の年齢、 体重、性別、および全般的健康状態を含む周知の因子;その疾病の性質、重篤度 および臨床段階;同時に行う治療の有無;ならびに患者内の細胞の遺伝子工学処 理の性質と程度に依存しよう。 本発明はまた、本発明の薬剤組成物の1または2以上の成分を入れた1または 2以上の容器からなる薬剤パックまたはキットも提供する。このような容器に任 意に付随しうるのは、医薬または生物学的製品の製造、使用または販売の規制に 関する政府機関により指示された形態の注意書である。この注意書はヒトの投与 用の製造、使用または販売の監督官庁による認可を反映した内容となる。応用 本発明は、大きなゲノムの内部に埋め込まれた外性導入遺伝子の発現を必要と する任意の状況に適用可能である。所望の発現の水準を、非常に高水準または非 常に低水準に予め設定できよう。或いは、調節された又は効力決定が可能な発現 を達成するようにこのシステムをさらに遺伝子工学処理することもできる。例え ば、PCT/US93/01617を参照。多くの場合、関連のない細胞の遺伝子の偶発的な活 性化は望ましくない。次に本発明の応用の非制限的な例を説明する。 1.調節された遺伝子治療:多くの場合、治療用遺伝子のオン、オフの切替え が随意に可能であること、または発現の強さを正確に定量できること、が治療効 力に重要である。本発明は特にヒトの遺伝子治療の分野で治療用標的遺伝子の調 節された発現を得るのによく適している。その1例は、一対のキメラタンパク質 (一方はFRAP由来レセプタードメインを含み、他方はFKBP由来レセプタードメイ ンを含む)と、これらのキメラを二量体化することができる二量体化剤と、発現 させる標的遺伝子構築物とを使用する。キメラタンパク質の一方は、Pomerantz et al,同上,に説明した複合DNA結合性領域を異種の作用ドメインとして含有す る。第2のキメラタンパク質は、転写活性化ドメインを異種の作用ドメインとし て含有する。ラパマイシンまたはラパログの二量体化剤は、両方のキメラに結合 することができ、こうしてこれらのキメラを二量体化またはオリゴマー化するこ とができる。これらのキメラタンパク質をコードし、その発現を指令することが できるDNA分子を、遺伝子工学処理する細胞内に導入する。やはりこの細胞内に 導入されるのは、複合DNA結合性ドメインが結合することができるDNA配列に結合 した標的遺伝子である。遺伝子工学処理した細胞またはそのプロゲニー(子孫) を二量体化剤と接触(この剤の動物または患者への投与により)させると、転写 因子複合体の組立て、従って標的遺伝子の発現を生ずる。同様な成分の設計およ び使用は、PCT/US93/01617に開示されている。この参照用特許文献に開示されて いるような代替DNA結合性ドメインの代わりに複合DNA結合性ドメインとこれをコ ードするDNA配列とを用い、FKBP由来レセプタードメインの代わりにキメラの一 方のFRAP由来レセプタードメインを使用し、開示のような二量体化剤の代わりに 単量体のラパマイシン型二量体化剤を使用して、上記特許を本発明に応用しても よい。実施において、標的遺伝子発現のレベルは、キメラ転写因子複合体の数ま たは濃度により変化し、この数または能動は二量体化リガンドの濃度により変化 することになる。後述する実験データは、このような(二量体化リガンドの)用 量−応答性遺伝子発現を実証している。 二量体化リガンドは、標的遺伝子の転写を活性化するため所望に応じて患者に 投与しうる。リガンドの結合親和性に応じて、望まれる応答、投与方法、半減期 、細胞の存在数、各種プロトコルを採用しうる。リガンドは非経口または経口投 与しうる。投与回数は上述した因子に応じて変動しよう。リガンドの投与は、錠 剤、粉剤、もしくは分散液として経口;バッカル;舌下;静脈内、腹腔内、筋肉 内、皮下注射;吸入等の経路でよい。リガンド(および拮抗物質である単量体化 合物)は、各種の投与経路に対して当該技術分野で周知の慣用方法および材料を 用いて処方することができる。正確な投与量および具体的な投与方法は上記の因 子に依存し、担当医やヒトもしくは動物の健康管理提供者により決定されよう。 ほとんどの場合、投与方法は経験的に決定されよう。 リガンドによる転写活性化を逆転または停止させたい場合には、二量体化リガ ンドと競合することができる単量体化合物を投与してもよい。即ち、副作用が現 れたか、または治療効果を終了させたい場合、二量体化剤に対する拮抗物質を任 意の好都合な方法で、特に素早く逆転させたい場合には脈管内経路で投与するこ とができる。或いは、リガンド結合性ドメインと一緒に不活性化ドメイン(また は転写サイレンサー)を存在させるようにしてもよい。別の手法として、各所に 記載されているように、FasまたはTNFレセプターを介したシグナリングを経てア ポトーシスにより細胞を排除してもよい。国際特許出願PCT/US94/01617およびPC T/US94/08008を参照。 特定レベルの発現の維持が長期間(例、約2週間またはそれ以上)にわたって 望まれる場合、または短期間にわたるリガンドの個々のもしくは反復投与を長期 の間隔(例、2週間またはそれ以上)で繰り返す反復治療を行う場合、各用途に 対するリガンドの具体的な投与量は、治療投与量の監視に対して使用される手法 に従って決定しうる。所定範囲内のリガンドの用量を与え、応答を監視して、時 間−発現レベルの関係を得ると同時に、治療応答を観察する。その時間内に観察 されたレベルおよび治療応答に応じて、その応答に続く次回には用量を増減する ことができる。この方法を治療範囲内である投与量を得るまで反復して繰り返す 。リガンドを長期投与する場合には、リガンドの維持用量を決定したら、細胞系 が発現生成物の適当な応答およびレベルを与え続けることが確保されるように長 期 の間隔で検定を行うことができる。 このシステムは、リガンドに対する細胞応答、発現の効率、ならびに適宜、分 泌のレベル、発現生成物の活性、患者の具体的な必要性(これは時間と状況によ り変動しうる)、細胞自体もしくは個々の細胞の発現活性の消失に起因する細胞 活性の低下の速度等の多くの変動因子による影響を受けることは理解されよう。 2.組換えタンパク質およびウイルスの生産:商業的および研究の目的で組換 え治療用タンパク質の生産が、高レベルにタンパク質を発現するように遺伝子工 学処理された哺乳動物の細胞系を用いてしばしば行われている。細菌または酵母 ではなく、哺乳動物細胞の使用は、タンパク質の適正な機能が、異種細胞では一 般に達成されない翻訳後修飾を必要とする場合に指示される。この方法で商業生 産されているタンパク質の例には、エリトロポイエチン、組織プラスミノーゲン 活性化剤、第VIII因子:cのような血液凝固因子、抗体等が挙げられる。このよ うな手段でのタンパク質の生産コストは遺伝子工学処理した細胞において達成さ れた発現のレベルに直接関連する。かかるタンパク質の生産に及ぼす別の制限は 、宿主細胞に対する毒性であり、タンパク質発現が細胞の高密度増殖を妨げて生 産レベルが急減することがある。従って、調節された遺伝子治療について説明し たように、タンパク質発現の緊密な制御が可能であることから、タンパク質を生 産せずに細胞を高密度に増殖させることが可能となる。最適の細胞密度に達した 後で始めて、遺伝子の発現を活性化させ、その後で生産されたタンパク質を採集 する。 同様の問題が、商業用(例、遺伝子治療)および実験用の組換えウイルスの生 産についても「パッケージング(ゲノム詰め込み)系」の構築および使用におい て経験されている。これらの細胞系は、欠陥組換えゲノムをもつ感染性ウイルス 粒子のアセンブリに必要なウイルス性タンパク質を生産するために遺伝子工学処 理される。かかるパッケージング系に依存するウイルスベクターとしては、レト ロウイルス、アデノウイルス、およびアデノ関連ウイルスが挙げられる。後者の 場合、或るパッケージング系から得られたウイルスストックの力価は、そのウイ ルスのrepおよびコアタンパク質の生産レベルに直接関係する。しかし、これら のタンパク質は宿主細胞に対する毒性が高い。従って、高力価の組換えAAVウイ ルスの発生は困難であることが証明されてきた。本発明は、repおよびコア遺伝 子をここに説明したように設計された調節可能な転写因子の制御下に置いたパッ ケージング系の構築を可能にすることで、この問題に対する解答を与える。この パッケージング細胞系を高密度に増殖させ、ヘルパーウイルスで感染させ、組換 えウイルスゲノムでトランスフェクションすることができる。その後、二量体化 材料を添加して、パッケージング細胞でコードされるウイルス性タンパク質の発 現を誘導させると、高力価のウイルスの生産が可能になる。 3.生物学的研究:本発明は、標的遺伝子の正確な制御が求められる広範囲の 生物学実験に適用可能である。このような実験には、(1)生化学的精製のため の対象タンパク質もしくはRNAの発現、(2)組織培養細胞中(または遺伝子工学 処理された細胞によりin vivo)の対象タンパク質もしくはRNAの生物学的機能を 評価する目的での調節された発現、(3)形質転換動物中の対象タンパク質もし くはRNAの生物学的機能を評価する目的での調節された発現、(4)内在性遺伝子 に作用する別の調節タンパク質、リボチームまたはアンチセンス分子をコードす る遺伝子の発現を、その遺伝子の生物学的機能を評価する目的で調節、といった 実験が含まれる。本発明の成分を適用できる形質導入動物モデルおよび他の応用 としては、PCT/US95/10591に開示されているものがある。 本発明はさらに、以上の用途に有用なキットも提供する。かかるキットは、本 発明のキメラタンパク質をコードしその発現を指令することができるDNA構築物 を含み(さらに上述した追加のドメインを含んでいてもよい)、調節された遺伝 子転写を行う態様では、キメラタンパク質の多量体化により活性化される1また は2以上の転写制御要素に連結した標的遺伝子を含んでいる標的遺伝子構築物も 含む。或いは、標的遺伝子構築物は、実施者による所望の標的遺伝子の挿入のた めのクローン化サイトを含んでいてもよい。かかるキットは、2種類の組換えタ ンパク質を二量体化して、標的遺伝子の転写を活性化することができる二量体化 剤のサンプルをさらに含んでいてもよい。 実施例実施例1:キメラ転写因子をコードする構築物 A. 特に説明がなければ、この及び他の実施例に記載した全てのDNA操作は標準 的な手法(例、F.M.Ausubel et al編,Current Protocols in Molecular Biolo gy<John Wiley & Sons,New York,1994>を参照)を用いて実施した。B.プラスミド ヒトFKBP12(以下、"FKBP")の酵母GAL4DNA結合性ドメイン、HSV VP16活性化 ドメイン、ヒトT細胞CD3ゼータ鎖細胞内ドメイン、またはヒトFASの細胞内ドメ インとの融合体をコードする構築物は、PCT/US94/01617に開示されている。 本発明に関連する融合タンパク質の発現を指令する別のDNAベクターは、哺乳 動物発現ベクターpCGNN(Attar,R.M.and Gilman,M.Z.1992,MCB 12:2432-24 43)から誘導された。pCGNNにXbaI-BamHI断片としてクローン化された挿入断片 を、ヒトCMVプロモーターおよびエンハンサー配列(キャップ部位に対してヌク レオチド-522ないし+72)の制御下で転写し、任意のエピトープ標識(モノクロ ーナル抗体12CA5により認識されるH.influenzaeヘマグルチニン(赤血球凝集素 )遺伝子の16アミノ酸部分)および、転写因子ドメインの場合にはN末端核局在 化配列(NLSと略記,SV40 T抗原から)と共に発現させる。 説明した場合を除いて、pCGNNにクローン化された全ての断片は、BamHI部位の すぐ上流のSpeI部位を包含するXbaI-BamHI断片として挿入された。XbaIとSpeIは 適合性のある末端を生ずるので、最初の挿入断片の下流にさらにXbaI-BamHI断片 を挿入することが可能となり、多成分からなるタンパク質の段階的組立てが容易 となった。停止コドンをSpeI部位とBamHI部位の間に入れた。初期構築物に対し ては、ベクターpCGNN-GAL4をさらに使用した。このベクターでは、XbaI部位が断 片の3'末端だけで再び生じるように、GAL4 DNA結合性ドメイン遺伝子のコドン1- 94が、pCGNNのXbaI部位中にクローン化されていた。従って、このベクター中にX baI-BamHI断片をクローン化してGAL4融合体を生成させ、その後に回収すること ができる。 (a) GAL4 DNA 結合性ドメイン−FRAP融合体をコードする構築物 ヒトFRAP遺伝子の一部を得るために、MMLV逆転写酵素およびランダムヘキサマ ー・プライマー(Clontech第1ストランド合成キット)を用いて、ヒト胸腺全RN A(Clontech #64028-1)を逆転写した。このcDNAを、プライマー1および2とPf uポリメラーゼ(Stratagene)とを含有するPCR反応に直接使用した。プライマー は、Chenら(Proc.Natl.Acad.Sci.USA(1995)92,4947-4951)によりFKBP− ラパマイシン結合に必要かつ十分であると同定された最小'FRB’ドメイン(以下 、FRBと命名)に本質的に対応する89アミノ酸領域であるヒトFRAPを内包するア ミノ酸2025-2113に対するコード配列を増幅するように設計された。適当な大き さのバンドを精製し、XbaIおよびSpeIで消化し、XbaI-SpeI消化pCGNN-GAL4中に 連結させた。この構築物を制限酵素分析(正確な方向を確かめるため)とDNA(塩 基)配列決定とにより確認し、pCGNN-GAL4-1FRBと命名した。 FRB XbaI-BamHI断片を分離し、次いでこれをSpeIとBamHIで消化されたpCGNN-G AL4-1FRB中に戻して連結させてpCGNN-GAL4-2FRB(これは制限酵素分析により確認 した)を生成させることにより、FRB多量体をコードする構築物を得た。この新た な構築物について上記の手法を同様に繰り返して、pCGNN-GAL4-3FRBおよびpCGNN -GAL4-4FRBを得た。 最小FRBドメイン(アミノ酸2025-2113)を包含するが、これを超えた長さを持つ FRAPのより大きな断片をコードするベクターも構築した。下に示すように、両隣 りが5'XbaIおよび3'SpeI部位となる各種FRAP領域を増幅するPCRプライマーを設 計した。 まず、断片FRAPiを上記のようにRT-PCRにより増幅し、XbaIおよびSpeIで消化 し、XbaI-SpeI消化pCGNN-GAL4中に連結させた。この構築物pCGNN-GAL4-FRAPiをP CRにより分析して挿入方向を確認し、DNA配列決定により照合した。次いで、こ れをPCR基質として使用し、上に列挙したプライマーを用いて他の断片を増幅さ せた。これらの新たな断片を上記のようにGAL4融合体としてクローン化し、構築 物pCGNN-GAL4-FRAPa,pCGNN-GAL4-FRAPb等を生成させ、これらをDNA配列決定に より確認した。 2つのより大きなFRAP断片、FRAPdとFRAPeのコンカテマー(鎖状体)をコード するベクターを、先に使用したのと類似の方法により形成した。FRAPdおよびFRA PeをコードするXbaI-BamHI断片をpCGNN-GAL4-FRAPdおよびpCGNN-GAL4-FRAPeから 分離し、SpeIとBamHIで消化された同じベクター中に戻して連結させて、pCGNN-G AL4-2FRAPdおよびpCGNN-GAL4-2FRAPeを形成した。この新たな構築物について上 記の手法を同様に繰り返して、pCGNN-GAL4-3FRAPd,pCGNN-GAL4-3FRAPe,pCGNN- GAL4-4FRAPdおよびpCGNN-GAL4-4FRAPeを得た。全ての構築物を制限酵素分析によ り確認した。 (b) FRAP-VP16 活性化ドメイン融合体をコードする構築物 単純疱疹ウイルスタンパク質VP16の活性化ドメインとのFRBドメインのN末端 融合体を生成させるため、1、2、3及び4コピーのFRBをコードするXbaI-BamH I断片をGAL4融合ベクターから回収し、XbaI-BamHI消化pCGNN中に連結して、pCGN N-1FRB、pCGNN-2FRB等を得た。次いでこれらのベクターをSpeIとBamHIで消化し た。VP16のアミノ酸414-490をコードするXbaI-BamHI断片を、プラスミドpCG-Ga1 4-VP16(Das,G.,Hinkley,C.S.and Herr,W.(1995)Nature 374,657-660)か ら分離し、SpeI-BamHI消化ベクター中に連結して、pCGNN-1FRB-VP16,pCGNN-2FR B-VP16等を形成した。これらの構築物は制限酵素分析および/またはDNA配列決 定により確認した。 (c) ZFHD1 DNA 結合性ドメイン−FRAP融合体をコードする構築物 哺乳動物細胞中のZFHD1コード配列の発現を指令する発現ベクターを次によう にして調製した。プライマー5'Xba/Zifおよび3'Zif+Gを用いたPCRによりcDNAク ローンからZif268配列を増幅した。プライマー5'Not Oct HDおよびSpe/Bam 3' Octを用いたPCRによりcDNAクローンからOct-1ホメオドメイン配列を増幅した。Z if268 PCR断片は、XbaIとNotIとて切断した。Oct-1 PCR断片は、NotIとBamHIと て切断した。両断片をpCGNN(Attar and Gilman,1992)のXbaI部位とBamHI部位と の間に3-方向連結反応で連結して、cDNA挿入断片がヒトCMVプロモーターおよび エンハンサー配列の転写制御下にあり、SV40 T抗原からの核局在化配列に連結し ているpCGNNZFHD1を作成した。プラスミドpCGNNはまた、選択可能なマーカーと して作用しうるアンピシリン耐性の遺伝子も含有している。 (pCGNNZFHD1のSpeI部位とBamHI部位との間にXbaI-BamHI断片として連結させた ヒトFKBP12の1または3縦列反復を含んだ誘導体てあるpCGNNZFHD1-FKBPx1およ びpCGNNZFHD1-FKBPx3も調製した。pCGNNZFHD1-FKBPx3のサンプルは、American T ype Culture CollectionにATCC受託番号97399とし寄託された。)プライマー FRBドメインのキメラDNA結合性タンパク質ZFHD1とのC末端融合体を生成させ るため、1、2、3及び4コピーのFRBをコードするXbaI-BamHI断片をGAL4融合 ベクターから回収し、SpeI-BamHI消化pCGNN-ZFHD1中に連結して、pCGNN-ZFHD1-1 FRB、pCGNN-ZFHD1-2FRB等を得た。これらの構築物を制限酵素分析および/また はDNA配列決定により確認した。 ZFHD1とC末端FRBドメインとの間に追加の「リンカー」ポリペプチドを導入す ることによる効果を検証するため、FRBのN末端の外配列(extra sequence)をコ ードするFRAP断片をZFHD1融合体としてクローン化した。FRAPa,FRAPb,FRAPc, FRAPdおよびFRAPeをコードするXbaI-BamHI断片を、ベクターpCGNN-GAL4-FRAPa, pCGNN-GAL4-FRAPb等から切り出し、SpeI-BamHI消化pCGNN-ZFHD1中に連結させて 、ベクターpCGNN-ZFHD1-FRAPa,pCGNN-ZFHD1-FRAPb等を得た。FRAPeの2、3、 および4個のC末端コピーへのZFHD1の融合体をコードするベクターの構築 も、pCGNN-GAL4-2FRAPe,pCGNN-GAL4-3FRAPeおよびpCGNN-GAL4-4FRAPeから、2FR APe、3FRAPeおよび4FRAPeをコードするXbaI-BamHI断片を分離し、これらをSpeI- BamHI消化pCGNN-ZFHD1中に連結させて、ベクターpCGNN-ZFHD1-2FRAPe,pCGNN-ZF HD1-3FRAPeおよびpCGNN-ZFHD1-4FRAPeを得ることにより行った。全ての構築物を 制限酵素分析により確認した。 ZFHD1とのFRBドメインのN末端融合体をコードするベクターも構築した。1、 2、3及び4コピーのFRAPeをコードするXbaI-BamHI断片をpCGNN-GAL4-1FRAPe、 pCGNN-GAL4-2FRAPe等から分離し、XbaI-BamHI消化pCGNN中に連結させて、pCGNN- 1FRAPe、pCGNN-2FRAPe等を得た。次いでこれらのベクターをSpeIとBamHIとで消 化し、ZFHD1をコードするXbaI-BamHI断片(pCGNN-GZFHD1から分離)をこのベク ター中に連結させて、構築物のpCGNN-1FRAPe-ZFHD1、pCGNN-2FRAPe-ZFHD1等を得 た。これらの構築物は制限酵素分析により確認した。 (d) FRAP-p65 活性化ドメイン融合体をコードする構築物 ヒトNF-kBp65サブユニット(以下、p65という)の活性化ドメインとのFRBドメ インの融合体を形成するため、プラスミドpCG-p65からPCRにより2つの断片を増 幅させた。プライマー9(p65/5'Xba)および11(p65 3'Spe/Bam)はアミノ酸450-55 0のコード配列を増幅させ、プライマー10(p65/361 Xba)および11はアミノ酸361- 550のコード配列を増幅させ、どちらも5'Xbaおよび3'SpeI/BamHI部位に隣接して いた。PCR産物をXbaIとBamHIで消化し、XbaI-BamHI消化pCGNN中にクローン化し て、pCGNN-p65(450-550)およびpCGNN-p65(361-550)を得た。これらの構築物は制 限酵素分析とDNA配列決定により確認した。 100アミノ酸の方のp65転写活性化配列は、次の線状配列によりコードされる。 より長い方のp65転写活性化ドメイン(351-550)は、次の線状配列によりコード される。 p65活性化ドメインの部分とのFRBドメインのN末端融合体を生成させるため、 プラスミドpCGNN-1FRB、pCGNN-2FRB等をSpeIおよびBamHIで消化した。p65(450-5 50)をコードするXbaI-BamHI断片をpCGNN-p65(450-550)から分離し、SpeI-BamHI 消化ベクター中に連結させて、プラスミドpCGNN-1FRB-p65(450-550),pCGNN-2FR B-p65(450-550)等を得た。構築物pCGNN-1FRB-p65(361-550)も、pCGNN-p65(361-5 50)から分離したXbaI-BamHI断片を用いて同様に作成した。これらの構築物は制 限酵素分析により確認した。 p65活性化ドメインとN末端FRBドメインとの間に追加の「リンカー」ポリペプ チドを導入することによる効果を検証するため、FRBに対してC末端の外配列を コードするFRAP断片をp65融合体としてクローン化した。FRAPa,FRAPb,FRAPf, FRAPgおよびFRAPbをコードするXbaI-BamHI断片を、ベクターpCGNN-GAL4-FRAPa, pCGNN-GAL4-FRAPb等から切り出し、XbaI-BamHI消化pCGNN中に連結させて、ベク ターpCGNN-FRAPa,pCGNN-FRAPb等を得た。次いで、これらのプラスミドをSpeIと BamHIとて消化し、p65(アミノ酸450-550)をコードするXbaI-BamHI断片をこれに 連結させて、5種類のベクターpCGNN-FRAPa-p65,pCGNN-FRAPb-p65等を得た。こ れらは制限酵素分析により確認した。 FRAPeの1および3個のN末端コピーへのp65の融合体をコードするベクターも 、pCGNN-1FRAPeおよびpCGNN-3FRAPeをSpeIおよびBamHIで消化することにより調 製した。次に、p65(450-550)およびp65(361-550)をコードするXbaI-BamHI断片( pCGNN-p65(450-550)およびpCGNN-p65(361-550)から分離)をこれに連結させて、 ベクターpCGNN-1FRAPe-p65(450-550),pCGNN-3FRAPe-p65(450-550),pCGNN-1FRA Pe-p65(361-550)およびpCGNN-3FRAPe-p65(361-550)を得た。全ての構築物を制限 酵素分析により確認した。 p65活性化ドメインの部分とのFRBドメインのC末端融合体をコードするベクタ ーも構築した。プラスミドpCGNN-p65(450-550)及びpCGNN-p65(361-550)をSpeIお よびBamHIで消化し、FRAPeの1および3コピーをコードするXbaI-BamHI断片(pC GNN-GAL4-1FRAPeおよびpCGNN-GAL4-3FRAPeから分離)及びFRBの1コピー(pCGNN -GAL4-1FRBから分離)をこれに連結させて、プラスミドpCGNN-p65(450-550)-1FR APe,pCGNN-p65(450-550)-3FRAPe,pCGNN-p65(361-550)-1FRAPe,pCGNN-p65(361 -550)-3FRAPe,pCGNN-p65(450-550)-1FRBおよびpCGNN-p65(361-550)-1FRBを得た 。全ての構築物を制限酵素分析により確認した。 (e) その他の構築物 他の構築物も上記手順と同様に、但しFRAP配列の別の部分を用いて作成するこ とができる。例えば、プライマー12および13はFRAPの全コード領域の増幅に使用 される。プライマー1と13、6と13、および5と13は、FRBドメインを包含し、 そのタンパク質のC末端へ伸びている(脂質キナーゼ相同ドメインを含む)三つ の断片の増幅に使用される。これらの断片は、FRBドメインに対してN末端のタ ンパク質の異なる部分をコードすることにより相違する。どの場合も、RT-PCRを 上記のように用いてヒト胸腺RNAからの領域を増幅し、PCR産物を精製し、XbaIお よびSpeIで消化し、XbaI-SpeI消化pCGNN中に連結させ、制限酵素分析およびDNA 配列決定で確認する。 (f) プライマー配列 下線部は制限酵素部位である(XbaI=TCTAGA、SpeI=ACGAGT、BamHI=GGATCC ) (g) 代表的最終構築物:pCGNN-ZFHD1-1FRBのDNA配列 ・非コード(コーディングしない)ヌクレオチドは小文字で表示 ・(S/X)および(X/S)は、どの酵素でも開裂しえない配列を生じさせるための、 XbaIおよびSpeIによる消化の適合性産物の間の連結反応の結果を示す ・*は停止コドンを示す (h) 二シストロン性(bicistronic)構築物 脳心筋炎ウイルスからの内部リボソーム・エントリー配列(IRES)をpWZL-Bleo からのPCRにより増幅した。得られた断片をpBS-SK+(Stratagene)中にクローン化 したものは、IRES配列の上流側にXbaI部位と停止コドンを含み、その下流側には ATGを包含するNcoI部位とその後ろのSpeIおよびBamHI部位とを含んでいる。クロ ーン化を容易にするため、それぞれ下記のオリゴヌクレオチドを使用して、pCGN N-ZFHD1-3FKBPの開始ATGの付近の配列をNcoI部位に変異させ、そしてXbaI部位は NheI部位に変異させた。 および 次いで、ZFHD1-3FKBPを含むNcoI-BamHI断片を、pBS-IRESの下流側でクローン化 してpBS-IRES-ZFHD1-3FKBPを作成した。次にこのプラスミドから得たXbaI-BamHI 断片をSpeI/BamHI切断pCGNN-1FRB-p65(361-550)中にクローン化して、pCGNN-1FR B-p65(361-550)-IRES-ZFHD1-3FKBPを作成した。C.キメラタンパク質発現のためのレトロウイルスベクター 安定に組込まれた低コピー遺伝子から転写因子融合タンパク質を発現させるの に用いるレトロウイルスベクターをpSRαMSVtkNeo(Muller et al,MCB 11:1785 -92,1991)およびpSRαMSV(XbaI)(Sawyers et al,J.Exp.Med.181:307-313 ,1991)から得た。どちらのベクターにもあるユニークBamHI部位をBamHIによる 消化により除去し、クレノウ(Klenow)断片で充填し、再連結反応させて、それぞ れpSMTN2およびpSMTX2を作成した。pSMTN2は、内部チミジンキナーゼプロモータ ーからのNeo遺伝子を発現する。pSMTX2中の内部チミジンキナーゼプロモーター の下流側のユニークXbaI部位の中にNheI断片としてゼオシン(Zeocin)遺伝子(I nvitrogen)をクローン化すると、pSNTZが得られよう。このゼオシン断片は、pZe o/SV(Invitrogen)を下記プライマーを用いて変異誘発させて、ゼオシンコード配 列の両側に隣接NheI部位を導入することにより形成された。 pSMTN2は、LTRの下流にユニークEcoRIおよびHindIII部位を含んでいる。XbaI- BamHI断片として合成された転写因子融合タンパク質のクローン化を容易にする ため、下記の配列をEcoRI部位とHindIII部位との間に挿入してpSMTN3を作成した 。 pSNTZのユニークEcoRI部位に同等の断片を挿入すると、3'HindIII部位がEcoRI 部位で置換された点が唯一の相違点であるpSMTZ3が作成される。 pSMTN3とpSMTZ3は、キメラ転写因子をXbaI-BamHI断片として5'ウイルスLTRの 下流にクローン化させることを可能にし、それぞれ抗生物質のG418またはゼオシ ンに対する耐性を付与するそれらの能力のため安定な組込み体(integrant)に対 する選択を可能にする。 レトロウイルスベクターSMTN-ZFHD1-3FKBPを形成するため、まずpCGNN-ZFHD1- 3FKBPを変異させてこの融合タンパク質の最初のアミノ酸の上流にEcoRI部位を付 加した。次いで、ZFHD1-3FKBPをレトロウイルスLTRから発現させるように、EcoR I-HindIII(blunted)pSRαMSVtkNeo(ref.51)中にEcoRI-BamHI(blunted)をクロー ン化した。実施例2:ラパマイシン依存性の転写活性化 我々の以前の実験は、3コピーのFKBPをGa14 DNA結合性ドメインまたは転写活 性化ドメインのいずれかに融合させた融合タンパク質は、安定的に取込まれたか 、または一時的にトランスフェクションされたどちらのリポーター遺伝子も、1 個または2個だけしかFKBPドメインを含んでいない対応する融合タンパク質より 強力に活性化させることを示した。FRB融合タンパク質とのこのパラメーターを 評価するため、1またはそれ以上のコピーのFRBドメインに融合させたGa14 DNA 結合性ドメインを含むエフェクタープラスミドを、一時的トランスフェクション により3個のFKBPドメインおよびp65活性化ドメイン(3xFKBP-p65)をコードする プ ラスミドと一緒に共トランスフェクションした。図3Aに示したデータは、この 系では、4コピーのFRBドメインをGa14 DNA結合性ドメインに融合した融合タン パク質が、安定に組込まれたリポーター遺伝子を、FRBドメインの数がより少な い残りの対応する融合タンパク質より強力に活性化させたことを示している。方法 :HT1080 B細胞を10%ウシ(仔牛)血清添加MEM中で増殖させた。6ウェル ・プレート(Falcon)中の約4×105個/ウェルの細胞を、供給業者(GIBCO,BLR) が推奨するようにリポフェクション(Lipofection)手法により一時的にトランス フェクションした。この実験に用いたDNA:リポフェクタミン比は1:6に相当した 。各ウェルの細胞は、500ngのpCGNN F3-p65、担体として1.9ugのPUC 118プラス ミド、および100ngの下記プラスミドのいずれか1つ(pCGNN Ga14-1FRB,pCGNN G a14-2FRB,pCGNN Ga14-3FRBまたはpCGNN Ga14-4FRB)を受容した。トランスフェ クション後、2mlの新鮮培地を加え、指定濃度までラパマイシンを添加した。24 時間後、100ulの培地を文献記載(Spencer et al,1993)のようにSEAP活性につい て検定した。 p65活性化ドメインに融合した複数のFRBドメインがリポーター遺伝子の転写活 性化の増大を生ずるかどうかを試験するため、本発明者らは、HT1080 B細胞をGa 14-3xFKBPを発現するプラスミドならびにp65活性化ドメインに融合させた1、2 、3もしくは4コピーのFRBと一緒に共トランスフェクションした。予想外なこ とに、DNA結合性ドメイン−FRB融合体とは異なり、1コピーのFRBをp65活性化ド メインに融合させた融合タンパク質が、2以上のコピーのFRBを含んでいる対応 する融合タンパク質より著しく強力にリポーター遺伝子を活性化させた。図3B 。方法 :HT1080 B細胞を10%ウシ(仔牛)血清添加MEM中で増殖させた。6ウェル ・プレート(Falcon)中の約4×105個/ウェルの細胞を、GIBCO,BLRが推奨する ようにリポフェクション手法によって一時的にトランスフェクションした。使用 したDNA:リポフェクタミン比は1.6に相当した。各ウェルの細胞は、担体として1 .9ugのPUC 118プラスミド、100ngのpCGNN Ga14-F3、および500ngの下記プラスミ ドのいずれか1つ(pCGNN 1,2,3または4 FRB-p65)を受容した。トランスフェク ション後、2mlの新鮮培地を加え、指定濃度までラパマイシンを添加し た。24時間後、100ulの培地を文献記載(Spencer et al,1993)のようにSEAP活性 について検定した。 同様の実験をさらに、5xGa14-IL2-SEAPリポーター遺伝子と、安定に組み込ま れたGa14 DNA結合性ドメインおよび3コピーのFKBPを含む融合タンパク質をコー ドするDNA配列とを含んでいる、別の安定な細胞系(HT1080 B14)を用いて行っ た。この細胞は、1またはそれ以上のコピーのFRBドメインに融合させたp65活性 化ドメインを発現するエフェクタープラスミドで一時的にトランスフェクション した。HT1080 B細胞での我々の考察と同様に、1コピーのFRB-p65活性化ドメイ ン融合タンパク質を発現するエフェクタープラスミドは、2コピー以上のFRBを 含む他のものより強力にリポーター遺伝子を活性化させた。実施例3 A.一時的トランスフェクション細胞:ZFHD1およびp65融合体中でのラパマイシ ン依存性転写活性化 SEAP標的遺伝子と代表的なZFHD-FKBP-およびFRB-p65含有融合タンパク質をコ ードするプラスミドとで一時的にトランスフェクションされたヒト繊維肉腫細胞 は、細胞培地中へのラパマイシン依存性で用量応答性のSEAP分泌を示した。図4 Aを参照。SEAP産生は、転写因子融合プラスミドの一方または両方が除かれた細 胞では検出されず、ラパマイシンを添加しない場合も検出されなかった(図4B )。しかし、全成分が存在していると、0.5nMという低いラパマイシン濃度でもS EAP分泌が検出可能であった(図4A)。ピークSEAP分泌は5nMで認められた。 同じ転写因子を用いてhGHリポーター遺伝子またはレトロウイルスベクターの感 染により作成したSEAPリポーター遺伝子の安定組み込みバージョンのラパマイシ ン依存性活性化を引き起こした場合にも同様の結果が得られた。薬剤が存在しな い場合のSEAP分泌のレベルが検出不能であるため、ラパマイシンへの応答におけ る活性化の倍数を決定することは困難であったが、この方式では、ラパマイシン が存在しないバックグラウンド水準に比べて少なくとも1000倍の増大になること は明らかである。即ち、このシステムは、検出不可能なバックグラウンド活性と 高い動的範囲(dynamic range)を示す。 転写因子融合タンパク質に対するいくつかの異なる形態が探査された(図5) 。FKBPドメインをZFHD1に、FRBドメインをp65にそれぞれ融合させた場合、複数 のFKBPがZFHD1に融合し、それより少ない数のFRBがp65に融合すると、最適レベ ルのラパマイシン誘発活性化が起こった。DNA結合性タンパク質に対して複数の 薬剤結合性ドメインの方が優先することは、これらのタンパク質が複数の活性化 ドメインを引き入れるため、より高度のプロモーター活性を引き出すことができ ることを反映しているかもしれない。活性化ドメイン上に薬剤結合性ドメインが 1個だけしか存在していないと、ZFHD上の各FKBPは1個のp65を引き入れること ができる。p65上のFRBの数が増大すると、1つづつが複数のFRB-FKBP相互作用に 結合されて、より少ない数の活性化ドメインがZFHDに引き入れられる場合が多く なろう。方法 : ヒト繊維肉腫細胞に由来するHT1080細胞(ATCC CCL-121)を、非必須アミノ酸お よび10%ウシ胎児血清添加MEM中で増殖させた。24ウェルの皿で平板培養した細 胞(Falcon,6×104個/ウェル)を、製造業者(GIBCO/BLR)が推奨する条件下で リポフェクションを用いてトランスフェクションした。各ウェルに、合計300ng の下記DNAをトランスフェクションした:100ngのZFHDx12-CMV-SEAPリポーター遺 伝子、2.5ngのpCGNN-ZFHD1-3FKBPもしくは他のDNA結合性ドメイン融合体、5ngの pCGNN-1FRB-p65(361-550)もしくは他の活性化ドメイン融合体、ならびに192.5ng のpUC118。DNA結合性ドメインまたは活性化ドメインを省略した場合は、等量の 空のpCGNN発現ベクターで置き換えた。リポフェクション後(約5時間)、表示 量のラパマイシンを含む500μの培地を各ウエルに加えた。24時間後培地を取り 出し、励起350nmおよび発光450nmのルミネセンス分光計(Perkin Elmer)を用いて 、文献記載(Spencer et al,Science 262:1019-24,1993)のようにSEAP活性に ついて検定した。 マウスへの注射(後述)用の一時的にトランスフェクションされたHT1080細胞 の調製は、100mmの皿に入れた細胞(2×106個/皿)をリン酸カルシウム沈降に より16時間トランスフェクションすることにより行った(Gatz,C.,Kaiser,A. & Wendenburg,R.,1991,Mol.Gen.Genet.227,229-237)。使用したDNA は、10μgのZHWTx12-CMV-hGH,1μgのpCGNN-ZFHD1-3FKBP,2μgのpCGNN-1FRB-p6 5(361-550)および7μgのpUC118であった。トランスフェクションした細胞をリ ン酸塩緩衝食塩水(PBS)で2回洗浄し、新鮮培地で5時間培養した。注射用に採 集するため、10mM EDTAを含有する・EPES緩衝食塩水中で皿から細胞を取り出し 、PBS/0.1% BSA/0.1%グルコースで洗浄し、同じ液に2×107個/mlの濃度で再懸 濁させた。プラスミド 転写因子融合プラスミドの構築は上に説明した。pZHWTx12-CMV-SEAP ZFHD1結合性部位(Pomerantz et al,1995)の12縦列コピーと、分泌アルカリ性 フォスファターゼ(SEAP)をコードする遺伝子の発現を推進するヒトサイトメガロ ウイルス(CMV,Boshart et al,1985)の即時型遺伝子からの基礎プロモーターと を含んでいるこのリポーター遺伝子は、pSEAPプロモーター(Clontech)のNheI-Hi ndIII断片を、12のZFHD結合性部位を含む下記のNheI-XbaI断片: (下線部がZFHD1結合性部位である) および最小CMVプロモーター(-54〜+45)を含む下記のXbaI-HindIII断片: (下線部がCMV最小プロモーターである) で置換することにより調製した。pZHWTx12-CMV-hGH このリポーター遺伝子の活性化はhGHの生産を生ずる。これは、pZHWTx12-CMV- SEAP(SEAPコード配列を含む)のHindIII-BamHI(blunted)断片を、pOGH(hGHゲノ ムクローンを含む;Selden et al,MCB 6:3171-3179,1986;BamIIIおよびEcoR I部位は一緒にブラント<blunt>されていた)からのHindIII(blunted)-EcoRI断片 で置換することにより構築された。pZHWTx12-IL2-SEAP このリポーター遺伝子は、最小CMVプロモーターを含むXbaI-HindIII断片を、 最小IL2遺伝子プロモーター(出発部位に対して-72ないし+45,Siebenlist et a l,MCB 6:3042-3049,1986)を含む下記のXbaI-HindIII断片で置換した点を除い て、pZHWTx12-CMV-SEAPと同一である。 (下線部がIL2最小プロモーターである)pLH 1または少数コピーのリポーター遺伝子の安定な組込みを容易にするため、下 記のレトロウイルスベクターを構築した。Moloneyマウス白血病ウイルスLTRによ り運ばれたヒグロマイシンB耐性遺伝子とユニーク内部ClaI部位とを含んでいる pLH(LTR-hph)を次のようにして構築した。hph遺伝子を、pBabe HygroからのHi ndIII-ClaI断片(Morganstern and Land,NAR 18:3587-96,1990)としてBamHI- Clat切断pBabe Bleo(bleo遺伝子の損失を生ずる;BamHIおよびHindIII部位は一 緒にブラントされていた)中にクローン化した。pLH-ZHWTx12-IL2-SEAP ZFHD1結合性部位の12縦列コピーと、pLHレトロウイルスベクター中へのSEAP遺 伝子の発現を推進するIL2遺伝子からの基礎プロモーターとを含んでいる1コピ ーのリポーター遺伝子をクローン化するため、pZHWTx12-IL2-SEAP(ClaIリンカー を添加)からのMluI-ClaI断片をpLHのClaI部位中にクローン化した。これは、ウ イルスLTRからの転写方向と内部ZFHD-IL2プロモーターからの転写方向が同じに なるような向きであった。pLH-G5-IL2-SEAP SEAP遺伝子の発現を推進する最小IL2プロモーター中に埋め込まれた5個のGa1 4部位を含むレトロウイルスベクターを構築するため、下記からなるClaI-BstBI 断片を、ウイルスLTRからの転写方向と内部Ga14-IL2プロモーターからの転写方 向が同じになるように、pLHのClaI部位中に挿入し[ClaI-HindIII断片は、5個の Ga14部位(下線部)と、IL2遺伝子の-324ないし-294(太字部)および-72ないし +45(イタリック体)とを含んでいる]: SEAP遺伝子コード配列を含んでいるHindIII-BstBI断片(Berger et al,Gene 66: 1-10,1988)を、停止コドンのすぐ後に下記配列(BstBI部位を含む)を追加する ように変異誘発させた。 B.安定的にトランスフェクションした細胞内のラパマイシン依存性転写活性化 このシステムが安定的にトランスフェクションされた細胞内でも同様の性質を 示すことを確認するために下記の実験を行った。SEAP標的遺伝子とそれぞれZFHD 1-3FKBPおよび1FRB-p65に対する発現ベクターの逐次トランスフェクションにに より安定な細胞系を発生させた。最終トランスフェクションから得られた数十の 安定なクローンを集めた集団は、ラパマイシン依存性SEAP産生を示した。この集 団からいくつかの個々のクローンの特性を調べたが、その多くはラパマイシンに 感応して高水準のSEAPを産生した。かかるクローンの1つから得られた結果を図 4Cに示す。このクローンのSEAP産生水準は、集団より約40倍も高く、一時的に トランスフェクションした細胞よりも著しく高かった。このクローンのバックグ ラウンドSEAP産生および誘導比を厳密に定量化するつもりで、未処理細胞のSEAP 活性もすべて検出するためにSEAP検定の長さを約50倍も増大させた2回目の検定 を行った。かかる条件下では、任意蛍光単位で、偽のトランスフェクションした 細胞は47単位を生じたのに対し、トランスフェクションしたクローンは、ラパマ イシンが存在しないと54単位を生じ、100nMのラパマイシン濃度で90,000単位以 上を生じた。即ち、この安定な細胞系では、バックグラウンドの遺伝子発現は無 視でき、誘導比(7単位:90,000単位)は4桁以上の大きさであった。 安定なトランスフェクションの作業を単純化するため、内部リボソームエント リー配列(IRES)の使用により、ZFHD1-3FKBPと1FRB-p65の両方の産生を指令する 二シストロン性の発現ベクターを使用した。この発現プラスミドを、ゼオシン耐 性マーカープラスミドと一緒に、レトロウイルスにより形質導入されたSEAPリポ ーター遺伝子を有する細胞系に中に共トランスフェクションし、約50の薬剤耐性 クローンの集団を選択し、拡張した。図4Dは、このクローン集団も、検出可能 なバックグラウンドを持たずにラパマイシン依存性のSEAP産生を生じ、一時的に トランスフェクションした細胞に見られるのと非常に似た用量−応答曲線を与え ることを示している。この集団も、図4Cで検討したクローンに似た性能を持つ 個々のクローンを含んでいることが予測されよう。即ち、ラパマイシン応答性の 遺伝子発現は、一時的と安定的のいずれのトランスフェクション細胞でも容易に 得ることができる。いずれの場合も、調節は、バックグラウンドが非常に低く、 誘導比が高いことが特徴である。安定細胞系 リポーター遺伝子またはDNA結合性ドメイン融合体を含む、ヘルパーのないレ トロウイルスを、Psi(-)両種性パッケージングベクターと、それぞれレトロウイ ルスベクターpLH-ZHWTx12-IL2-SEAPもしくはSMTN-ZFHD1-3FKBPとを用いて、293T 細胞の一時的共トランスフェクションによって発生させた(Pear,W.S.,Nolan, G.P.,Scott,M.L.& Baltimore D.,1993,一時的トランスフェクションによる ヘルパー・フリーの高力価レトロウイルスの作成,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90,8392-8396)。安定に組み込まれたリポーター遺伝子を含むクローン性細胞 系を形成するため、レトロウイルスの原液で感染させたHT1080細胞を希釈し、ヒ グロマイシンB 300μg/mlの存在下で選択した。この細胞系および後述する他の 細胞系から得られた個々のクローンを、上記のように欠落成分の一時的トランス フェクション後にラパマイシンを添加する試験でスクリーニングした。分析した 12の全部のクローンが誘導可能で、基礎活性はほとんど或いは全く持っていなか った。最も応答性の高いクローンHT1080Lをその後の検討のために選択した。 HT1080L細胞をまずSMTN-ZFHD1-3FKBPでパッケージングしたレトロウイルスで 感染させ、500μg/mlのG418を含有する培地中で選択することにより、安定に組 み込まれたpLH-ZHWTx12-IL2-SEAPリポーター遺伝子、ZFHD1-3FKBP DNA結合性ド メインおよび1FRB-p65(361-550)活性化ドメインを含んでいるHT20-6細胞を発生 させた。次いで、強力に応答するクローンのHT1080L3を、直線化pCGNN-1FRB-p65 (361-550)およびpZeoSV(Invitrogen)でトランスフェクションし、250μg/ml のゼオシンを含有する培地中で選択した。個々のクローンを、まずウェスタンに より1FRB-p65(361-550)の存在について試験した。8個の陽性クローンをラパマ イシンの添加により分析した。8個全部が基礎活性が低く、そのうち6個では遺 伝子発現が少なくとも2桁の大きさで誘導された。最強の応答を示したクローン HT20-6をその後の分析のために選択した。 直線化pCGNN-1FRB-p65(361-550)-IRES-ZFHD1-3FKBPとpZeoSVとでHT1080L細胞 を共トランスフェクションし、250μg/mlのゼオシンを含有する培地中で選択す ることにより、HT23細胞を発生させた。約50クローンを分析のために集めた。 分析のため、細胞を96ウェルの皿(1.5×104個/ウェル)で平板培養し、指定量 のラパマイシン(またはビヒクル)を含有する培地200μlを各ウェルに添加した 。18時間後、培地を取り出し、SEAP活性について分析した。場合により、培地を 分析前に希釈し、得られた相対SEAP単位に希釈倍数を乗じた。トランスフェクシ ョンしていないHT1080細胞で測定されたバックグラウンドSEAP活性を、それぞれ の値から差し引いた。実施例4:マウスにおけるhGHのラパマイシン依存性の産生 in vivo 試験:動物、飼育および一般操作 :雄性nu/nuマウスをCharles River La boratories(Wilmington,MA)から入手し、実験前に5日間馴化させた。各マウ スは無菌条件下で飼育し、実験の全期間を通して滅菌食物および滅菌水を自由に 摂取させ、無菌技法により取り扱った。免疫無防備状態の動物はどれも、外来感 染(outward infection)を示さず、また飼育技法もしくは実験技法の結果として 病気の状態になることもなかった。 一時的にトランスフェクションされた細胞をマウスに移植するため、2×106 個のトランスフェクションHT1080細胞を、100μlのPBS/0.1% BSA/0.1%グルコー ス緩衝液中に懸濁させ、動物の脾腹と後四半部の4カ所の筋肉内部位に投与した (1部位当たり約25μl)。対照用のマウスには同量の緩衝液のみを注射した。 ラパマイシンは、N,N-ジメチルアセトアミドとポリエチレングリコール(平均 分子量400)およびポリオキシエチレンソルビタンモノオレエートの9:1(v:v)混合 物とを等量で混合した中に溶解させることにより、in vivo投与用に処方した。 完成した処方中のラパマイシン濃度は、2.0ml/kg注射量で適当な量のin vivo投 与が可能となるのに十分な濃度であった。尾静脈への静脈内投与の前に、投与用 溶液の精度をHPLC分析により確認した。トランスフェクションHT1080細胞を持っ ていない一部の対照用マウスには、10.0mg/kgのラパマイシンを投与した。また 、トランスフェクション細胞を持っている別の対照用マウスには、ラパマイシン のビヒクルだけを投与した。 マウスを麻酔するか、CO2吸入により致死させて血液を採取した。麻酔したマ ウスは、心臓穿刺により100μlの血液を採取するのに使用した。マウスが意識を 取り戻した後、次回の血液採取のために回復させた。致死させたマウスは直ちに しゃ血した。血液検体を4℃で24時間放置して凝固させ、1000Xgで15分間の遠心 分離後に血清を集めた。血清hGHをBoehringer Mannheim非等張サンドイッチELIS A(Cat No.1 585 878)により測定した。この検定法は、0.0125ng/mlと検出限 界がより低く、動的範囲は0.4ng/mlに達していた。推奨された検定の指示に従っ た。Molecular Devicesマイクロタイター・プレート・リーダーを用いて、参照 波長を490nmにして405nmで吸光度を測定した。ELISAでの抗体試薬は、希釈剤の 血清中または自然の検体中では内生マウスhGHとの交差反応性を全く示さなかっ た。in vivo hGH 発現 hGH発現の用量依存性ラパマイシン誘導刺激の評価のために、HT1080細胞の注 射から約1時間後にラパマイシンをマウスに投与した。ラパマイシンの投与量は 、0.01,0.03,0.1,0.3,1.0,3.0,または10.0mg/kgのいずれかであった。ラ パマイシン投与から17時間後に、血液採取のためにマウスを致死させた。 in vivo hGH発現の時間経過を追うために、マウスに細胞の注射から1時間後 に10.0mg/kgのラパマイシンを投与した。ラパマイシン投与から4、8、17、24お よび42時間後にマウスを致死させた。 ラパマイシンが移植したHT1080細胞から持続したhGH発現を誘導する能力を、 ラパマイシンの反復投与により試験した。マウスに上記のようにしてトランスフ ェクションしたHT1080細胞を投与した。細胞の注射から約1時間後に、10.0mg/k g量の5回のラパマイシン静脈内投与の第1回目を行った。残りの4回の投与は 、16、32、48および64時間での血液採取のすぐ後に麻酔下で行った。最初のラパ マイシン投与から72、80、88および96時間後にも追加の血液採取を行った。対照 用のマウスには細胞は投与したが、ラパマイシン投与の各時間にはビヒクルだけ を投与した。実験動物およびそれらに対応する対照用の動物は、それぞれ2つの 群の1つに帰属させた。2つの実験動物群および2つの対照動物群はどれも、そ れぞれ同じ薬剤またはビヒクル処置を受けた。これら2つの群の相違点は、各動 物の血液採取の頻度を減らすために、血液採取時間を2つの群の間で交替させた ことであった。結果 ラパマイシンは実験動物におけるhGHの用量応答性産生を誘発させた(図6) 。ラパマイシンで処置した動物のhGH濃度は、ヒトの正常な循環系濃度(0.2〜0.3 ng/ml)にほぼ匹敵する。この実験ではhGH産生のプラトーは認められなかった。 これは、トランスフェクション細胞の最大hGH産生能力に達していないことを示 唆している。トランスフェクション細胞を投与したがラパマイシンを投与しなか ったものと、ラパマイシンを投与したが細胞を投与しなかったものを含む対照動 物では、検出可能な血清hGHを示さなかった。即ち、試験動物におけるhGHの産生 は遺伝子工学処理細胞とラパマイシンの両者の存在に完全に依存性であった。 ラパマイシンの投与から17時間後の血清に著しい濃度でhGHが存在することは 、この試験動物ではhGHが4分未満の半減期で循環系から消失するので、注目に 値する。この観察結果は、遺伝子工学処理した細胞がラパマイシン処置の後も何 時間もhGHを分泌し続けるということを示唆していた。hGH産生のラパマイシン制 御の動力学(速度)を検証するため、動物をラパマイシンの1回の投与で処置し 、その後の異なる時間でhGH濃度を測定した。血清hGHは、ラパマイシン処置から 4時間以内に認められ、8時間でピーク(hGH ELISAの感度限界の100倍以上)に達 し、処置から42時間は検出可能であり続けた(図7)。hGH濃度は、そのピーク から約11時間の半減期で減少した。この半減期は、この試験動物におけるhGH自 体の半減期の数百倍も長く、ラパマイシンの半減期(4.6時間)の約2倍の長さで ある。ラパマイシンに比べて血清hGHの減少速度が遅いことは、移植した細胞の 付近により高いラパマイシン組織濃度が存在することを反映しているかもしれな い。或いは、遺伝子工学処理細胞からのhGH産生の持続性が、hGH mRNAの安定性 により向上したことも考えられる。 興味深いことに、これらの動物に42時間で2回目のラパマイシンの投与を行う と、血清hGHの2番目のピークが生じ、このピークが最初と同様の速度で減少し ていった。このことは、遺伝子工学処理細胞が少なくとも2日間はラパマイシン に対する応答能力を保持することを示した。そのため、このシステムが持つ循環 系hGH濃度の向上・維持能力を確める目的で、16時間の間隔で動物にラパマイシ ンを何回も投与する実験を行った。この間隔は、hGH濃度がピークに達し、次い で約半分まで減少するのに要する時間に対応している。この投与方法によれば、 ラパマイシン濃度は2回目の投与後は1.7μg/mlの定常状態の一定濃度に達する (図8に破線で示すように)ことが予測される。hGH濃度も2回目の投与後は定 常状態の一定濃度に達する筈である。図8は、処置した動物が実際にラパマイシ ンの反復した投与に応答して比較的安定な循環系hGH濃度を保持することを示し ている。最後の投与後、hGH濃度は16時間も一定を保持し、その後はラパマイシ ンに似た半減期(ラパマイシンの4.6時間に対してhGHは6.8時間)で減少した。 これらのデータは、多数回の投与により循環系ラパマイシンがin vivoのトラン スフェクション細胞からのhGH分泌に対する緊密な制御を付与することを示唆し ている。特に、薬剤の撤収によりタンパク質誘導がすばやく終了することが明ら かである。考察 上記の実験は、小分子薬剤を用いて、遺伝子工学処理した細胞からの分泌治療 用タンパク質の産生を制御することが可能であることを実証している。このシス テムは、ヒトの遺伝子および細胞治療への使用に必要な多くの特徴を備えている 。 まずバックグラウンド活性が非常に低く、誘導比が高いという特徴を持つ。また 、宿主の生理作用または任意の細胞型特異的因子から独立して機能する。さらに 、完全にヒトタンパク質から構成される。制御用薬剤はin vivoで十分に挙動し 、経口で生体利用性がある。 この一般的な設計のシステムで、in vivoで遺伝子工学処理細胞から安定かつ 正確な力価の量の分泌治療用タンパク質を提供することが恐らく可能となろう。 間欠的またはパルス様の投与も可能となるであろう。小分子による制御下で遺伝 子工学処理細胞からタンパク質を供給する顕著な利点は、任意の所定時点でのタ ンパク質産生速度が、その小分子薬剤の循環系濃度に相関することである。従っ て、hGHのような治療用タンパク質の見掛けの薬物供給速度を劇的に変化させる ことができる。我々の実験では、例えば、ラパマイシンを1回投与した後の遺伝 子工学処理細胞ら供給された循環系hGH濃度の変化は、組換えタンパク質を1回 投与した後に見られるものとは著しく相違する。マウスに静脈内投与したhGHは 数分の半減期で消失するのに対し、ラパマイシンで誘導した遺伝子工学処理細胞 からのhGH濃度は、約11時間の半減期で減少した。ヒトの場合も、hGH消失の半減 期は約20分であり、一日おきに注射する必要があり、血清hGH濃度は非常に大き く変動する。厳密な薬理的制御下で遺伝子工学処理細胞からタンパク質を供給す ると、特に薬剤供給速度が低いか治療指数が低いタンパク質にとって、より効果 的な治療を生ずることも考えられる。 小分子の薬剤を用いてDNA結合性ドメインと活性化ドメインを結合するのは、i n vivo遺伝子発現の調節に対する有効な方策となる。特に魅力的な1つの特徴は 、システムが完全にモジュール化されていて、各成分を別々に最適化および遺伝 子工学処理することができることである。DNA結合活性の制御を比較的微妙なア ロステリックな分子間相互作用に頼っている細菌リプレッサーとは異なり、本発 明の二量体化の方策は実質的にあらゆるDNA結合性および活性化ドメインに適用 することがことができる。ここでは、DNA結合親和性および新規な認識特異性の 合理的な遺伝子工学処理を容易に支持する構造の確定したDNA結合性ドメインを 使用した。同様に、活性化ドメインも効力および他の特性が最高になるように遺 伝子工学処理することができる。実際、上記の実験で用いた遺伝子工学処理し た転写因子は、従来のプロモーター/エンハンサーシステムに対して非常に高水 準の遺伝子発現を誘起させ、いずれのドメインもさらなる向上を容易に取り入れ ることができる。単一の標的遺伝子の転写に供された遺伝子工学処理した転写因 子の誘導が可能であるため、従来の発現ベクターに比べてより低いバックグラウ ンドと実質的により高水準のin vivo遺伝子発現を得る機会が与えられる。 我々はまた、免疫系による認識可能性を最小限にするためにヒトタンパク質か らの調節された転写因子を構築するように選択した。細菌性ヒグロマイシンホス ホトランスフェラーゼおよび疱疹ウイルスのチミジンキナーゼからなる融合タン パク質を発現するオートロガスT細胞が、免疫系の衰弱したエイズ患者でも、宿 主細胞毒性T細胞により効果的に認識され、排除されたことが報告された(Ridde 11,S.R.et al,HIV感染患者における遺伝子修飾HIV特異性細胞毒性Tリンパ球 のT細胞媒介拒絶,Nature Med.2,216-223(1996))。この考察は、遺伝子工学処 理された細胞中の異種タンパク質の免疫認識の危険性が現実のものであり、従っ て、ヒト細胞中の調節機能を実行するヒトタンパク質の使用が賢明であることを 示唆している。本発明の転写因子融合タンパク質の各成分はそれぞれ配列がヒト のものであるが、各タンパク質は異物として認識される可能性のある結合ペプチ ドを含んでいる。ただし、これらの結合は、既述したように、免疫系に対するそ の提示が最小限となるように設計ないし選択することができる。 ラパマイシンに基づくシステムの原理的な制限は、FRAP活性の阻害により、in vivo免疫抑制を生ずる細胞周期進行を阻止するラパマイシンの本来の生物学的 活性である。しかし、我々の実験は、ラパマイシンの免疫抑制用量未満(1mg/kg 未満)でhGHのような治療用タンパク質の生理学的に意味ある濃度を得ることがで きることを実証している。さらに、FKBPまたはFRAPのいずれかへの結合を破壊す る置換基をラパマイシン分子上に導入することできるため、免疫抑制活性が完全 に欠落したラパマイシン類似物に容易に接近させることができる。本来の生物学 的活性は持たないが、ラパマイシンの魅力的な薬理特性を保持しているラパログ は、実験動物およびヒトの遺伝子治療において遺伝子工学処理されたタンパク質 産生の調節に広範囲に有用であることが恐らく証明されよう。実施例5代表的C-24修飾ラパログの合成 ラパマイシンの精製 :ラパマイシンは醗酵により得た。ラパマイシンを産生する 微生物のストレプトマイセス・ヒグロスコピカス(Streptomyces hygroscopicus) (ATCC # 29253)を15Lまたは30Lのフェッドバッチ(流加)培養器内で複合培地(c omplex medium)により培養した。9〜14日後に遠心分離によりバイオマスを集菌 した。上清を非イオン性の高分子吸着剤樹脂XAD-16(Rohm and Haas)と1〜2時 間接触させた。吸着剤を遠心分離により回収し、バイオマスと混合し、塩化メチ レンで繰り返し抽出した。溶媒を減圧除去し、得られた残渣をアセトニトリルで 抽出し、次いで抽出液を同様に濃縮した。粗製ラパマイシンのクロマトグラフィ ー精製を、シリカゲルでのフラッシュクロマトグラフィー(40%アセトン/ヘキ サン)とその後のC-18逆相HPLC(70%CH3CN/H2O)により行った。得られたラパマ イシンは、ラパマイシンの真正試料と同一のHPLC、分光学的および生物学的特性 を示した。ラパマイシン(EおよびZ)-24-(O-メチルオキシム)(AP1731および1732)一般操作 MeOH(2mL)中のラパマイシン(60mg,65.6mmol)の溶液を、NaOAc(22mg,26 2mmol,4.0等量)で、続いてメトキシルアミン塩酸塩(22mg,262mmol,4.0等量 )で処理し、室温で48時間攪拌した。この攪拌時間の後、反応混合物をH2O(10m L)で静め、EtOAc(3×10mL)で抽出した。有機抽出液を合わせて、飽和NaCl溶液( 2×10mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥し、濾過し、濾液を減圧濃縮した。得られた残 渣をシリカゲルでのフラッシュクロマトグラフィー(10%MeOH/ジクロロメタン )で処理して、異性体混合物を得た。この異性体混合物をHPLC(Kromosil C-18 2 50x20mmカラムで35%〜25%H2O/MeCNにより溶離、12mL/min)で分離して、13mg( 21%)のより速く溶離するZ異性体と7.6mg(12%)のE異性体とを得た。Z異性 体:高解像質量スペクトル(FAB)m/z 965.5749[(M+Na)+,C52H82N2O13Naの計算 値965.5710]。E異性体:高解像質量スペクトル(FAB)m/z 965.5701[(M+Na)+, C52H82N2O13Naの計算値965.5710]。ラパマイシン(EおよびZ)-24-(O-エチルオキシム)(AP1688および1689) ラパマイシン(EおよびZ)-24−(O−メチルオキシム)と類似の方法で調製した。 異性体混合物の分離をHPLC(Kromosil C-18250x20mmカラムで30%H2O/MeCNにより 溶離、12mL/min)で行って、7.7mg(25%)のより速く溶離するZ異性体 と0.5mg(2%)のE異性体とを得た。Z異性体:高解像質量スペクトル(FAB)m/z 979.5902[(M+Na)+,C53H84N2O13Naの計算値979.5871]。ラパマイシン(EおよびZ)-24-(O-イソブチルオキシム)(AP1684および1685) ラパマイシン(EおよびZ)-24-(O-メチルオキシム)と類似の方法で調製した。異 性体混合物の分離をHPLC(Kromosil C-18250x20mmカラムで15%H2O/MeCNにより溶 離、12mL/min)で行って、28mg(65%)のより速く溶離するZ異性体と3.0mg(7%) のE異性体とを得た。Z異性体:高解像質量スペクトル(FAB)m/z1007.6146[( M+Na)+,C55H88N2O13Naの計算値1007.6184]。E異性体:高解像質量スペクトル (FAB)m/z 1007.6157[(M+Na)+,C55H88N2O13Naの計算値1007.6184]。ラパマイシン(EおよびZ)-24-(O-ベンジルオキシム)(AP1682および1683) ラパマイシン(EおよびZ)-24-(O-メチルオキシム)と類似の方法で調製した。異 性体混合物の分離をHPLC(Kromosil C-18 250x20mmカラムで15%H2O/MeCNにより 溶離、12mL/min)で行って、19.6mg(44%)のより速く溶離するZ異性体と6.1mg( 14%)のE異性体とを得た。Z異性体:高解像質量スペクトル(FAB)m/z 1041. 6033[(M+Na)+,C58H86N2O13Naの計算値1041.6028]。E異性体:高解像質量ス ペクトル(FAB)m/z 1041.5988[(M+Na)+,C58H86N2O13Naの計算値1041.6028] 。ラパマイシン(EおよびZ)-24-(O-カルボキシメチルオキシム)(AP1686および1687) ラパマイシン(EおよびZ)-24-(O-メチルオキシム)と類似の方法で調製した。異 性体混合物の分離をHPLC(Kromosil C-18250x20mmカラムで45%H2O/MeCNにより溶 離、12mL/min)で行って、4.6mg(11%)のより速く溶離するZ異性体と1.0mg(2 %)のE異性体とを得た。Z異性体:高解像質量スペクトル(FAB)m/z1009.5644 [(M+Na)+,C53H82N2O15Naの計算値1009.5613]。E異性体:高解像質量スペク トル(FAB)m/z 1009.5604[(M+Na)+,C53H82N2O15Naの計算値1009.5613]ラパマイシン(EおよびZ)-24-(O-カルボキサミドメチルオキシム)(AP1729および1 730) ラパマイシン(EおよびZ)-24-(O-メチルオキシム)と類似の方法で調製した。異 性体混合物の分離をHPLC(Kromosil C-18250x20mmカラムで35%H2O/MeCNにより溶 離、12mL/min)で行って、6.2mg(10%)のより速く溶離するZ異性体と1.4mg(2 %)のE異性体とを得た。Z異性体:高解像質量スペクトル(FAB)m/z 1008.579 0[(M+Na)+,C53H83N2O14Naの計算値1008.5768]。E異性体:高解像質量スペク トル(FAB)m/z 1008.5753[(M+Na)+,C53H83N2O14Naの計算値1008.5768]。実施例6 A.ラパマイシンC24「バンプ」類似体のFKBPへの結合試験 ラパマイシンC24類似体のFKBPに対する親和性を、蛍光偏り(FP)に基づく競合 分析を用いて測定した。フルオレセイン標識FK506プローブ(AP1491)を合成し、 その蛍光の偏りの増加を、亜飽和FKBPと種々の量のラパマイシン類似体を競合物 として含む平衡結合実験において結合したプローブ割合(%)の直接の読みとし て用いた。(i)フルオレセイン化FK506プローブ(AP1491)の合成 FK506 の24,32−ビス(tert−ブチルジメチルシリル)エーテル tert−ブチルジメチルシリル・トリフルオロメタンスルホネート(108μL、470 μmol)をFK506(103mg、128μmol)と2,6−ルチジン(89.5μL、768μmol)のジク ロロメタン(3mL)中の0℃の溶液に攪拌しながら滴加した。得られた溶液を0 ℃で2時間攪拌し、次いでMeOH(0.5mL)およびエーテル(15mL)で処理した。 この混合物を10%NaHCO3水溶液(3mL)およびブライン(3mL)で洗浄した。有 機層をデカンテーションし、無水Na2SO4で乾燥し、ろ過し、濃縮して黄色油状物 とした。カラムクロマトグラフィー(シリカゲル、ヘキサン−EtOAc 3:1)に より表題化合物を無色油状物(104mg)として得た。中間体1 FK506の24,32−ビス(tert−ブチルジメチルシリル)エーテル(100mg、97μmo l)のTHF(2.5mL)中の溶液へ、モルホリンN−オキシド(68mg、580μmol)、次い で水(60μL)及び四酸化オスミウムの4%水溶液(123μL、20μmol)を加えた。得 られた混合物を室温で4.5時間攪拌した。次いで、これをMeOH 50%水溶液(1.5mL )及び過ヨウ素酸ナトリウム(207mg、97μmol)で処理し、懸濁液をさらに1時間 攪拌した。この混合物をエーテル(10mL)で希釈し、NaHCO3飽和水溶液(2×4mL )で洗浄した。有機層をデカンテーションし、亜硫酸ナトリウムを少量含む無水 硫酸ナトリウムで乾燥し、ろ過し、濃縮した。残渣を無水THF(2.8mL)に溶解し、 チッ素下で−78℃に冷却し、リチウムトリス[(3−エチル−3−ペンチル)オキ シ]アルミニウム水素化物のTHF(282μl)中の0.5M溶液で処理した。得られた溶液 を−78℃で1.75時間攪拌し、次いでエーテル(6mL)及び塩化アンモニウム飽和 溶液(250μL)の添加により反応停止させた。この混合物を室温にまで温め、無水 硫酸ナトリウムで処理した。ろ過及び減圧下での濃縮により淡黄色油状物(97mg) が得られ、これをカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、ヘキサン−EtOAc 3 :1)により精製すると、無色油状物として1が得られた。中間体2 上記アルコール(300mg、290μmol)のアセトニトリル(10mL)中の溶液を2,6-ル チジン(338μL、2.9mmol)及びN,N'−ジスクシニミジルカーボネート(371mg、1.4 5mmol)で処理した。得られた懸濁液を室温で14.5時間攪拌し、次いで減圧下で濃 縮した。残渣をクロマトグラフィー(シリカゲル、ヘキサン-EtOAc2:1〜 100% EtOAcの勾配)にかけると淡黄色油状物(127mg)として混合カーボネート2 が得られた。中間体3 上記カーボネート(30mg、26μmol)とトリエチルアミン(36μL、260μmol)のア セトニトリル(1mL)中の溶液を、4'-(アミノメチル)フルオレセイン(13.5mg、 34μmol)で処理した。得られた明橙色の懸濁液を室温で1時間攪拌し、次いで減 圧下で濃縮した。残渣をクロマトグラフィー(シリカゲル、ヘキサン-EtOAc1: 1〜100% EtOAc〜EtOAc-MeOH 1:1の勾配)にかけると明黄色固体として3(20. 5mg)が得られた。化合物4 ビス−シリルエーテル3(35mg、25μmol)のアセトニトリル(2mL)中の溶液 をHFの48%(w/w)水溶液(250μL)で処理した。得られた混合物を室温で5.5時間攪 拌した。次いでこれをジクロロメタン(10mL)で希釈し、水(2×2mL)で洗浄し た。有機層をデカンテーションし、無水硫酸ナトリウムで乾燥し、減圧下で濃縮 した。残渣をクロマトグラフィー(シリカゲル、100%EtOAc)にかけると、明黄色 固体として4(13mg)が得られた。(ii)FPを用いたラパマイシン類似体の結合親和性(IC50)の測定 各類似体の連続10倍希釈物をガラスビン中で100%エタノールで調製し、氷中 に貯蔵した。その他の操作はすべて室温で行った。精製した組換えFKBP(標準的 方法で精製、Wiederrecht,G.et al.1992,J.Biol.Chem.267,21753−2176 0参照)のストックを50mMリン酸カリウムpH7.8/150mM NaCl/100μg/mlウシガン マグロブリン(「FP緩衝液」:Panvera製、低蛍光試薬のみを用いて調製)で11. 25mMまで希釈し、98μL部分をDynatech micro-fluor black 96ウエル蛍光プレー トのウェルに移した。次いで、2.0μLのラパマイシン類似体サンプルをこのウエ ルに混合しながら移した(二重)。最後に、0.1%エタノール/FP緩衝液中に10 μM AP1491を含むプローブ溶液を調製し、100μLを各ウエルに混合しなから加え た。二重の対照ウエルはラパマイシン類似体の代わりにエタノール(100%プロ ーブ結合に対して)を、あるいはラパマイシン類似体の代わりにエタノール、そ してFKBPの代わりにFP緩衝液(0%結合)を含んでいた。 このプレートを暗中で被覆された状態で約30分貯蔵し、平衡化させ、次いで各 ウエル中のサンプルの蛍光の偏りを製造業者の説明に従ってJolley FPM-2FPプレ ートリーダー(Jolleyコンサルティング&リサーチ社、グレイスレイク、IL)で読 んだ。各競合物濃度に対する平均偏り(mP単位)は通常、対照値に対して全結合% に変換され、競合物(x)の最終モル濃度の対数に対してプロット(y)された。非線 形最小二乗法分析を用い、曲線に合わせて以下の式を用いIC50を導いた。 y=M1+(M4−M1)/(1+exp[M2*(M3−X))) ここでM3は1C50である。不完全な曲線ではIC50は内挿によって決定した。各場 合においてラパマイシンとC14−デソキソ−ラパマイシンが対照として含まれた (C14−デソキソ−ラパマイシンはLuengo,J.I.et al.1994,Tetrahedron Lett .35,6469−6472に記載の方法で製造した)。(c) ラパマイシンC24オキシムの結合試験の結果 親和性はIC50及び親和性減少の倍数(=IC50/ラパマイシンのIC50)で示した 。 B.C7ラパログ−FKBP複合体のFRAPへの結合試験 C7に嵩高の置換基を有する一連のラパログを、文献に一般に記載されている化 学反応(Luengo et al.1995,Chemistry and Biology 2,471-481)を用いて合 成した。本明細書のデータは以下に示す3つのラパログに関する: (a) 合成 AP1700 、7S−イソプロポキシラパマイシン: ラパマイシン(60mg、0.066mmol)のイソプロパノール3.0mL中の溶液を固体p− トルエンスルホン酸(75mg、0.39mmol)で処理した。反応混合物を室温で4時間攪 拌し、次いで30mLの酢酸エチルで希釈し、重炭酸ナトリウム飽和水溶液(3×20mL )及びブライン(2×20mL)で洗浄した。次いで、有機相を無水硫酸マグネシウムで 乾燥し、ろ過し、濃縮した。逆相HPLC(Rainin C-18 ODS 1”カラム、35%アセト ニトリル/水、55℃)により所望の精製物25mg(40%)を得た。AP1701 、7R−(3−インドリル)ラパマイシン及び−AP1702、7S−(3−インドリル) ラパマイシン トリフルオロ酢酸(0.084mL、1.1mmol)をラパマイシン(50mg、0.055mmol)及び インドール(64mg、0.55mmol)のジクロロメタン2ml中の溶液(−40℃)に攪拌し ながら添加した。温度は3時間の間−40℃から−45℃の間に維持し、次いで反応 混合物を酢酸エチル(10mL)とブライン(20mL)との間で分配した。次いで、有機相 をさらにブライン(4×20ml)で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥した。逆相HPL C(Rainin C-18 ODS 1”カラム、65%アセトニトリル/水、55℃)にかけて11.8mg の7S−インドールと7.6mgの7R−インドール(35%)を得た。 正確な質量分析とNMRにより化合物を確認した。 (b) C7 ラパログのFKBP結合親和性のFP試験 競合FPを用いて、上記AでC24ラパログについて記載したようにして、FKBPに 対するラパログの親和性を調べた。ラパマイシン及びC14−デソキソ−ラパマイ シン(Luengo et al.1994,Tetrahedron Lett.35,6469−6472に記載のようにし て調製)を対照として含んだ。 親和性は以下において1C50及び親和性の減少倍数(=IC50/ラパマイシンのIC 50)で示した。 これらのデータは、ラパマイシン−FRAP界面におけるC7位の位置に応じ、これ らの大きいC7置換基がラパマイシンのFKBPに対する親和性をあまり減少させない ことを示している。(c) C7 ラパログのFKBP結合親和性のFP試験 培養細胞におけるラパログ−FKBP複合体の結合を分析するために、HT20-6細胞 (ZFHD1−応答性SEAPリポーターを有し、ZFHD1−(3×FKBP)及びFRB-p65を安定 的に発現する、実施例3(B)参照)を用いた。HT20-6細胞を96−ウエルの皿で培 養し(1×104細胞/ウエル)、ラパログの連続希釈物を含む200μ培地を各ウエル に加えた(三重)。22時間後培地を除去し、実施例2に記載したようにしてSEAP 活性を調べた。 結果は図15に示され、これはAP1700のイソプロポキシC7置換基がFRAP親和性を 適度に減少させる(SEAP産生の減少により示される)ことを示している。しかし 、AP1701及びAP1702のより大きいインドリル置換基はほぼ完全にSEAP発現を止め 、これはこの修飾がラパログ−FKBP複合体のFRAPへの結合をさまたげるバンプと して作用することを示している。 活性化ヒトT細胞又はネズミ脾臓細胞(splenocyte)増殖を減少させるC7ラパ ログの能力についても、FRAPに結合するその能力の減少を指標として調べた。当 分野において、適当な試験法、例えば3H−チミジン取り込みの阻害(Luengo et a l.1995,Chemistry and Biology 2,471-481)がよく知られている。実施例7:種々のラパログに相補性の修飾リガンド結合性ドメインを作成するた めの変異誘発及びファージ発現(display) A.遺伝子工学処理したFKBP及びFRBドメイン 例示の修飾リガンド結合性ドメインを有する以下の表に挙げた融合タンパク質 をコードする組み換えDNA構築物を設計し作成した。特に説明がなければ、変異 体は標準的方法(Kunkel,T.A.,Bebenek,K.およびMcC1ary,J.1991,Meth Enz ymol.204,235-139)によるオリゴムクレオチド媒介部位特異的変異誘発を用い て作成し、ジデオキシ配列決定法により確認した。 以下のFRB融合タンパク質をコードする構築物も作成した。 本書で述べた修飾hFRAP FRBドメインと同様にして修飾した酵母およびカンジ ダFRBは、そのそれぞれのFRBドメイン内の2個の保存Phe残基と保存AspおよびAs n残基のうちの1または2以上の代わりに異なるアミノ酸のコドンを置き換えて 製造してもよい。TOR1およびT0R2由来の例示した修飾FRBドメインには以下のも のがある。 B.合理的に設計されたFKBP変異体のラパログへの結合性試験 ヘキサヒスチジン標識及びモノクローナル抗体12CA5のエピトープであるH.イ ンフルエンザ(H.influenza)ヘマグルチニンタンパク質の一部を前に有するFKBP を発現する、pET20b(Novagen)に基づく発現ベクターを標準的操作を用いて構築 した。 ラパマイシン接触残基において変異したFKBP用発現ベクターを作成するために 、文献記載の方法(Kunkel,T.A.,Bebenek,K.及びMcClary,J.1991,Meth.En gy mol.204,235-139)でE.coli CJ236から作成した単鎖形態のベクターにおいて、 オリゴヌクアレオチド媒介部位特異的変異誘発を行った。変異体はジデオキシ配 列決定法により確認した。変異体タンパク質は文献記載の方法(Wiederrecht,G .et al.1992,J.Biol.Chem.267,21753-21760)でE.coli BL21(DE3)(Novag en)中で発現させ、文献記載の方法(Cardenas,M.E.et al.1994,EMBO J.13, 5944-5957)で均一になるよう精製した。 このプロトコルを用いて以下の変異ヒトFKBP12タンパク質を、表示のオリゴヌ クレオチドプライマー(変異した塩基を大文字で示す;5'→3')を用いて生成さ せた: C24ラパログへの結合のために設計した変異体: C13/C14ラパログへの結合のために設計した変異体: C28/C30ラパログへの結合のために設計した変異体: ラパマイシン及びラパログのFKBP変異体への相対的結合親和性を調べるために 、変異体によるFK506(及びプローブ)結合親和性の保持に依存する競合的蛍光偏 り(FP)分析を用いる。この操作は、亜飽和を得るために競合反応において用いる 変異FKBPの希釈(濃縮)を決定するために、最初に直接結合分析を行うことを除 いて実施例6に記載されたものと同じである。変異FKBPの連続希釈をDynatech m icro-fluorプレートにおいて100μl容積でFP緩衝液(実施例6)中で行い、次い で各ウエルに[FP緩衝液+2%エタノール]中の10nM AP1491(プローブ)100μl を加える。平衡化及びプレートの読みは実施例6の通りである。mP単位対FKBP変 異体濃度のプロットは次式に適合し: y=M3+(((x+M1+M2)-SQRT(((x+M1+M2)^2)-(4*×*M1)))/(2*(M1)))* (M4-M3) 90%のプローブが特異的に結合している最終変異体濃度/希釈倍数は内挿により 決定する。次いでこの最終濃度を実施例6で行った競合FP試験に用い、このプロ トコルでは2×(変異体の最終濃度)が11.25nMのFKBPに置きかわる。競合試験 により高い感度を与えるために、90%飽和の代わりに75%を選択することもでき る。ラパマイシン類似体の連続希釈物を競合体として用い、結果は各変異体へ結 合する各ラパログについてIC50として表わす。C.FKBP−ラパログ複合体への結合のために合理的に設計されたFBR変異体の試 ヒトFRAPの残基2021−2113(これも含む)をコードするNcoI−BamHI断片をプ ライマー28及び29(下記)を用いたPCRにより作成し、NdeI部位がNcoIに変異し ているpET20b(+)(Novagen)誘導体中にクローン化し、pET-FRAP(2021-2113)を創 出した。このベクターの単鎖DNAを上記した部位特異的変異誘発操作で鋳型とし て用いて、ラパマイシン接触残基において変異しているFRAPをコードするベクタ ーを作成した。変異体はジデオキシ配列決定で確認した。次いで変異体を、XbaI 及びSpeI部位を付加したプライマー(30及び31)を用いたPCRによって増幅し、Xba I−SpeI消化pCGNN-FRB-p65(361-550)(実施例1)にクローン化し、E-N-変異FRAP( 2021-2113)-p65(361-550)型(ここでEはHAエピトープ標識を、Nは核局在化配 列を示す)のキメラタンパク質の哺乳動物での発現を指示する一連の構築物を作 成した。構築物は制限酵素切断及びジデオキシ配列決定により確認された。 この操作を用いて、C7ラパログに結合する可能があり、それぞれp65(361-550) 活性化ドメインに融合している変異FRAPをコードする以下の構築物を、記載のオ リゴヌクレオチドプライマー(大文字は変異した塩基;5'→3')を用いて作成し た。 これらの変異体のFKBPとラパマイシン及び各種ラパログとの複合体に対する相 対的結合親和性を調べるために、各構築物を実施例2に記載したようにしてヒト HT1080B14細胞中に一時的に共トランスフェクションを行う。トランスフェクシ ョン後、連続希釈ラパマイシン又はラパログを培地に添加する。24時間後、実施 例2に記載のようにしてSEAP活性を測定する;種々のラパログ濃度でのSEAP活性 化の効力はFKBPとラパログとの複合体に対するFRAP変異体の親和性に比例する。 PCRプライマー(大文字は制限酵素部位を示す;5'→3'): D.繊維状バクテリオファージにおけるFRAPのFRBドメインの機能表示(発現) :修飾ドメインの合理的設計の代替としての選択の1方法 (a) ベクター構築 カルベニシリン耐性ファージミド表示ベクター(Pharmacia)であるpCANTAB-5E の誘導体を、fd遺伝子IIIのCys202をTyrで置換したプライマー1を用いて部位特 異的変異誘発により作成した。Cys202は混合ジスルフィドの形成によりAsp198で 融合したタンパク質の発現を妨害することがあり、この問題はTyr置換により解 消する(Cunningham,B.C.et al.1994,EMBO J.13,2508)。構築物はDNA配 列決定により確認し、次いでNcoI及びBamHIで切断した。1対のオリゴヌクレオ チド(2及び3)を連結し、プラスミドpCANTAB-AP-polyを生成させ、これはgen eIIIシグナル配列のNcoI部位とgeneIIIのコドン198のBamHIの間にNcoI-SpeI-Bam HIポリリンカーを含む。このベクターは枠内(in frame)NcoI-BamHI断片を受け 入れ、pIII残基198-406上にコードされるタンパク質(Cunningham et al.(199 4,EMBO J.13,2508)により記載された融合形態)のN末端発現を指示する構築 物を得た。 残基2015-2114までをコードするFRAP断片をPfuポリメラーゼ(Stratagene)とプ ライマー4及び5を用いてpCGNN-FRAPPiから増幅した。この断片を精製し、NcoI 及びBamHIで切断し、NcoI-BamHI切断pCANTAB-AP-poly中に連結し、ベクターp-CA NTAB-FRAP(2015-2114)を作成し、これはDNA配列決定により確認された。(b) His6-flag-FKBP の調製 FRAP表示ファージミドの親和性富化(精製)用の標識FKBPタンパク質を得るた めに、pET20b(Novagen)に基づく発現ベクターを標準的操作を用いて作成し、こ れはヘキサヒスチジン標識(親和性精製のため)及び「flag」配列(Kodak IBI) (免疫学的検出のため)を前に有するFKBPを発現した。このタンパク質は既知の 方法(Wiederrecht,G.et al.1992,J.Biol.Chem.267,21753-21760)によりE.coli BL21(DE3(Novagen))中で発現され、既知の方法(Cardenas,M.E.et al.1994,E MBO.J.13,5944-5957)によりNi-NTAアガロース(Qiagen)を用いて均一になるまで 精製した。 発現したタンパク質の配列は次の通り: (c) 結合富化 p-CANTAB-AP-FRAP(2015-2114)をE.coliXL-1(Stratagene)に形質転換し、以下 の点を除いて本質的には既知の方法(Lowman,H.B.及びWells,J.A.Methods:Comp. Methods Enzymol.1991,3,205-126)によりヘルパーファージK07の助けにより表示 (発現)ファージを作成した。既知の方法との違いは、ファージミド増殖物を接 種するのに用いる一晩培養物は2%グルコース含有培地で増殖させ、ファージ増 殖はK07感染を可能とするために37℃で最初に1時間培養した後25℃で行われた 点であった。参照試薬を提供するために、ファージミド粒子も、クロランフェニ コール耐性ベクターpBC(Stratagene)で形質転換した細胞から調製した。各場合 のファージミド力価(コロニー形成単位、cfu)を既知のようにして(Lowman,H.B. 及びWells,J.A.Methods:Comp.Methods Engymol.1991,3,205-216)測定した。 FKBP−ラパマイシンへのFRAP含有ファージの特異的結合富化を立証するために 、約103cfuをPBS/3%BSA/0.05%トウィーン-20(「PBSBT」)250μl中のpBCファ ージミド約1010cfuと混合した。1μM(最終)のHis6-flag-FKBPタンパク質を加え 、次いで100%エタノール中の100μMラパマイシン又はFK506、あるいはエタノー ル単独を2.5μl加えた。この混合物を室温で1時間インキュベーションし、次い でPBSBT中で平衡化されたNi-NTAPアガロースビーズの1:1スラリーを100μl(H is6-標識FKBP及び関連ファージミドを捕捉するために)加えた。こ の混合物をエンドーオバー−エンドミキサー(end-over-end mixer)で15分間穏 やかに回転させ、その後、ビーズをマイクロヒュージ(microfuge)中で30秒間800 0rpmで回転させることによりペレット化した。次いでこのビーズを1mlのPBS/0. 05%トウィーン-20中で5回、1mlのPBS/0.05%トウィーン-20/1M NaCl中で5回 洗浄した。結合したファージミドは200μlの0.2MグリシンpH2.0を加え10分間イ ンキュベーションすることによりビーズから溶離した。このビーズをペレット化 し、上清(溶離ファージミドを含有)を集め、26μlの1Mトリス塩基で中和した 。カルベニシリン(carb)とクロランフェニコール(chlor)耐性cfu力価を上記のよ うにして測定し、carb/chlor比を(カルベニシリン耐性)FRAPファージミドの特異 的富化(精製)の指標として用いた。 結果は、ラパマイシン-FKBPマトリックス上での親和性富化の後は出発混合物 に比べてFRAPファージの富化(271倍)が劇的であるが、FK506-FKBPマトリックス (2.4倍)またはFKBP単独(1.5倍)ではそうではないことを示した。この実験は、 分子のFRAP結合側(例えばC7位)にバンプを有するラパマイシン類似体に結合す る変異FRAPをライブラリーから精製するのに用いる操作を示す。(d) プライマー 制限酵素部位に下線(NcoI=CCATGG;BamHI=GGATCC) (e) pCANTAB-AP-FRAP(2015-2114) の配列 上記配列における注: *はXL-1(Lowman,H.B.及びWells,J.A.1993,J.Mol.Biol.234,564-578)などのSup E E.coli株にGlnとして抑制されているアンバー停止コドンを示す。 +は遺伝子工学処理されたCys202→Tyr変異の位置を示す。 +はシグナルペプチド開裂後の成熟ポリペプチドの1番目のアミノ酸(Ala)を示 す。 E.繊維状バクテリオファージでのFKBPの機能表示(発現)(a) ベクター構築 FKBP(アミノ酸1-107)のコード配列を5ngのプラスミドpCGNN-F1(米国特許出願 No.08/581,713(1995年12月29日出願))を鋳型としプライマー1及び2を用いてPC Rにより増幅した。PCR産物を精製し、NcoIとBamHIで消化し、NcoI-BamHI消化pCA NTAB-AP-polyに連結してベクターpCANTAB-AP-FKBPを作成し、これは制限酵素分 析及びDNA配列決定で確認した。この構築物はCKys202がTyrに変異したpIII残基1 98-406においてFKBPのN末端発現を指令する:配置はCunningham et al.(1994,E MBO J.13,2508)により報告。(b) 親和性富化の研究のためのビオチニル化FK506の合成 ファージ上でのFKBPの機能発現の立証を可能にする固定化リガンドを提供する ために、ビオチン部分がリンカーを介してエフェクタードメインのアルキル基に 結合した(以下の図式参照)FK506の変形を合成した。2mLのCH2Cl2中のN-(6-ア ミノヘキシル)FK506(35mg、36.8mmol)の溶液へ、ビオチン-Su(25.1mg、73.5mmol )、次いでNEt3(51.4mL、368mmol)を加えた。この懸濁液へDMFを反応混合物が透 明になるまで加えた。10分後反応が完了した。得られた混合物をCH2Cl2(25mL) で希釈し、H2O(15mL)、ブライン(15mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させた。溶離剤 として10%MeOH/CH2Cl2を有するフラッシュクロマトグラフィーにより、所望の 生成物13ng(30%)を白色固体として得た。この構造はNMRとMSで確認した。 N-(6-アミノヘキシル)FK506 カルバメイト (この化合物の調製は、アリアド317PCT参照) (c) FKBP 表示ファージの増殖 pCANTAB-AP-FKBPをE.coli XL-1(Stratagene)に形質転換し、表示ファージを以 下の点を除いては既知の方法(Lowman,H.B.and Wells,J.A.Methods:Comp.Meth ods Enzymol.1991,3,205-216)と本質的に同じ方法でヘルパーファージK07の助け により作成した。既知方法とは、ファージミド増殖物を接種するのに用いる一晩 培養物を2%グルコース含有培地で増殖させた点で異なった。ファージミド力価 (コロニー形成単位、cfu)は既知のようにして(Lowman,H.B.and Wells,J.A.Met hods:Comp.Methods Enzymol.1991,3,205-216)測定した。(d) ビオチニル化FK506を用いた競合ELISAによるFKBP機能表示の立証 96−ウエルのマキシソープ(maxisorp)プレート(Nunc)のウエルを1ウエルに つきPBS中の1μg/mlストレプタビジン(Pierce)100μlで被覆し、覆いをして4 ℃で一晩インキュベーションした。室温で1時間、1%トウィ−20/PBSでブロッ クした後、ブロック用溶液を除去し、PBS/1%エタノール中の10nMビオチニル化F K506を加え、インキュベーションをさらに10分間続けた。その間、インキュベー ション液100μlを、FKBPファージ(約5×105cfu)及びPBS/0.02% BSA/1%エタ ノール中の連続希釈FK506を含有する別々のチューブに入れた。これらの インキュベーション液を室温で1時間放置し平衡化させ、その後被覆したウエル をPBS/0.05%トウィーン−20で5回洗浄し、ファージ−FK506混合物をウエルに 加えた。プレートを室温で1時間インキュベーションし、次いでPBS/0.05%トウ ィーン−20で15回洗浄した。結合ファージの検出のために、抗M13抗体−HRPコン ジュゲート(Pharmacia)の1/5000希釈液を100μl各ウエルに加え、室温で1時間 インキュベーションを行い、その後プレートを前と同様10回洗浄し、次いで製造 業者の指示に従いTMB基質(Boehringer)を用いてHRP活性を定量した。値はビオチ ニル化FK506を被覆していない(結合0%)か、FK506競合物を入れていない(結 合100%)対照ウエルに対して全ファージ結合%として算出した。 図に示すように、この実験は表示されたFKBPのFK506に対する特異的高親和性 結合を実証した。この分析における相互作用に対するIC50は0.65nMであり、報告 されたFKBPのFK506に対する0.4-1nMのKd値とよく一致した。この実験はファージ でのFKBPの表示がバンプを有するリガンドに親和性をもつFKBPを変異体ライブラ リーから親和性選択する手段として用いられることを確立した。(e) ラパマイシンのC13及びC14位を標的とするファージ上の変異FKBPのライブリーの作成 C13及びC14位にバンプを有するラパマイシン類似体に結合する変異体を得るた めの変異FKBPのライブラリーを作成するために、縮重プライマー3及び4を用い てFKBP遺伝子の一部を再増幅し、Tyr26、Phe36、Asp37、Arg42及びPhe99のコド ンの代わりに縮重コドンNNS(ここでNは任意の塩基でsはGまたはC)を導入し た。これらの残基の側鎖は、コンピューターグラフィックスを用いるとC14カル ボニル及び/又はC13ヒドロキシルに接触しているか、あるいは接触している残 基に隣接していることが観察され、従ってこれらの位置に導入されたバンプを有 する類似体に対して良好な親和性を有するかもしれない変異体を作成するための 変異の候補であった。ランダム化領域に隣接し、pCANTAB-AP-FKBPにおいて特異 なApaLIとBamHI部位が好都合に用いられた。 FKBPの一部をプライマー3及び4とPfuポリメラーゼを用いてpCGNN-F1から増 幅した。PCR産物をQIAEX IIキット(Qiagen)を用いて精製し、ApaLIとBamHIで広 く消化し、ApaLI-BamHI消化pCANTAB-AP-FKBP中に連結した。連結生成物はフ ェノール抽出で精製し、エタノール沈殿で濃縮し、標準的手法(Dower,W.J.et a l.1988,Nucleic Acids Res.16,6127)によりE.coli XL-1細胞にエレクトロポレー ションを行った。ファージを取り出し、上記のようにして(Lowman,H.G.and Wel ls,J.A.Methods:Comp.Methods Enzymol.1991,3,205-216)、力価を測定した。(f) ライブラリー選別 約1010〜1011cfuのファージミド粒子を250μlのPBS/3%BSA/0.05%トウィー ン−20(PBSBT)中に調製した。組み換えGST-FRAP融合タンパク質(E.coli中で発現 させ、Chen et al.1995,Proc.Natl.Acad.Sci.USA.92,4947-4951に記載の ようにして、精製)を最終濃度1μMとなるよう加え、次いでバンプを有するラパ マイシンの100%エタノール中10μMのストックを5μlを加えた。この混合物を 室温で1時間インキュベーションし、次いで(GST標識FRAP及び関連ファージミド を捕捉するため)PBSBT中で平衡化したグルタチオン−アガロースビーズ(Pharmac ia)の1:1スラリー100μlを加えた。この混合物をエンド−オバー−エンドミ キサーで15分間穏やかに回転させ、その後ビーズをマイクロビュージで30秒間80 00rpmで回転させることによりペレット化した。次いでこのビーズを1mlのPBS/0 .05%トウィーン-20中で5回、1mlのPBS/0.05%トウィーン-20/1M NaClで5回 洗浄した。200μlの0.2MグリシンpH2.0を加え10分間インキュベーションするこ とにより結合ファージミドをビーズから溶離させた。ビーズをペレット化し、上 清(溶離ファージミド含有)を集め、26μlの1Mトリス塩基で中和した。カルベ ニシリン(carb)とクロランフェニコール(chlor)耐性のcfu力価を上記のようにし て測定し、carb/chlor比を(カルベニシリン耐性)FRAPファージミドの特異的富 化の指標として用いた。溶離ファージストック100μlを対数期のE.coli XL-1細 胞に感染させるのに用い、次回の選択のためのファージミドを作成した。これは 既知の方法(Lowman,H.B.and Wells,J.A.Methods:Comp.Methods Enzymol.1991 ,3,205-216)によった。 ファージの力価は数回の選択の間に監視され、バックグラウンドを超える特異 的富化が検出された場合は個々のRKBPファージクローンを分離し、標準的方法で 配列決定した。クローンのバンプ含有ラパマイシンに対する結合は競合ELISAま たは蛍光偏り分析により測定する。(g) プライマー配列 下線は制限酵素部位(NcoI=CCATGG;BamHI=GGATCC;ApaLI=GTGCAC)(h) pCANTAB-AP-FKBP の配列 *はXL-1(Lowman,H.B.and Wells,J.A.1993,J.Mol.Biol.234,564-578)などのs up E E.coliにおいてGlnとして抑制されているアンバー停止コドンを示す。 +は遺伝子工学処理されたCys202−Tyr変異の位置を示す。 +はシグナルペプチド開裂後の成熟ポリペプチドの第1のアミノ酸(Ala)を示す 。実施例8:シグナル伝達のラパマイシン依存性活性化 多数の細胞レセプターがその生理学的リガンドあるいは抗レセプター抗体のい ずれかによる凝集により活性化されうる。さらに、2つの異なるタンパク質の凝 集は細胞内シグナルを開始しうることが多い。ラパマイシン及びその類似体を、 キメラタンパク質をオリゴマー化することによりレセプターのエフェクタードメ インの活性化を開始させのに用いることができ、キメラタンパク質のうちの一方 は1または2以上のFKBPとエフェクタードメインを含有し、他方は1または2以 上のFRAPドメインとエフェクタードメインを含有している。この機構は図T1(a) に説明されている。両タンパク質が膜に固定されて示されているが、唯一つが膜 固定されていればよく、ラパマイシンまたは類似体の添加により第2のタンパク 質が二量体化を介して膜に引き入れられるであろう。膜固定は貫膜タンパク質ア ンカーを介して、あるいはミリストイル化などのタンパク質の脂質修飾により行 われてもよい。両タンパク質に同じエフェクタードメインが存在してもよく、ま たは機能的に相互に作用する異なるタンパク質ドメイン、例えばプロテインキナ ーゼとプロテインキナーゼ基質などを用いてもよい。あるいは、第2のエフェク ターが第1のエフェクターの活性を阻害するように作用してもよい。 ある態様では、キメラタンパク質が前述の混合キメラであり、異種エフェクタ ードメインと共にFKBP及びFRAPドメインを含有している。図T1(b)に示すように 単一の混合キメラのオリゴマー化をシグナル伝達の活性化に用いてもよい。ここ では、ラパマイシンはタンパク質の2つの同じコピーを二量体化するように示さ れている。 FKBPとFRAPドメインのくり返しにより、高次の複合体が生じ、幾何学的拘束を 受ける。 シグナル伝達においてラパマイシンを用いる2つの例は、レセプターチロシン キナーゼ活性化を開始させること、及びFas活性化を介したアポトーシスを開始 させることであり、この2つは以下に説明される。特に説明がなければDNA操作 は全て標準的方法により行われ(F.M.Ausubed et al.編、Current Protocols in Molucular Biology,John Wiley & Sons,New York,1994)、タンパク質プロトコ ルはすべて標準的操作(Harlow,E.and Lane,D.1988,Antibodies,a Laboratory Manual.Cold Spring Harbor Laboratory,Cold Spring Harbor)に従って行われ た。構築物を作成するのに用いたPCR産物はすべて配列決定により確認された。A.ラパマイシン−誘導性レセプタ−チロシンキナーゼ活性化 1.ミリチル化シグナルを含む発現ベクターpCMの構築 オリゴヌクレオチド1及び2をアニーリングして得られるXbaI-Myr-BamHIカセ ットをXbaI/BamHIで消化し、pCG発現ベクター(Tanaka,M.and Herr,W.1990,Cel l 60:375-386)のXbaI/BamHI部位にクローン化してpCGMを作成した(オリゴヌク レオチド配列については、以下の(7)参照)。このオリゴヌクレオチドカセット は枠内XbaI部位、その後のミリスチル化を可能にしタンパク質を原形質膜に標的 化することが報告されてきた(Cross et al.,1984,MCB.4:1834-1842)c-Srcチロ シンキナーゼの最初の15アミノ酸残基をコードする配列からなる。ミリストイル 化ドメインの後は枠内SpeI部位と停止コドンが続く。pCGベクターのXbaI部位は 、開始Met及びクローン化配列の間に2個のアミノ酸を付け加えるような位置に 置かれる。開始Metとミリスチル化Gly間の距離はc-Srの膜局在化に重要である(P ellman et al.1985,PNAS.82:1623-1627)ので、pCGM中でATGに続くXbaI部位は 製造業者のプロトコル(Muta-Gene,BoilRad)により部位特異的変異誘発により除 かれた。後のクローニング工程を容易にするためミリスチル化カセット中のSpeI 部位をXbaI部位に変異させた。pCGMの一本鎖ウラシルDNAを調製し、オリゴヌク レオチド3(ATGの後のXbaIを除き、ATGの5'にEcoRI部位を加えるため)及びオリゴ ヌクレオチド4(ミリスチル化ドメインの後のSpeI部位をXbaI部位に変えるため )を用いて変異誘発を行った。pCMベクターのATGを囲む生成した配列 はオリゴヌクレオチド5(下記(8)の配列1参照)を用いる配列により確認した 。2.FKBP及びエピトープ・タグのpCMへの付加によりpCMF1/2/3.HAを作成 相補性オリゴヌクレオチド(オリゴヌクレオチド6及び7)をアニーリングし てSpeI-HA-BamHIカセットを調製した。このカセットは枠内SpeI部位、続いて、 モノクロール抗体12CA5により認識されるH.インフルエンザエのヘマグルチニン 遺伝子の9アミノ酸、停止コドン及びBamHI部位を有する。SpeI-HA-BamHIカセッ トをpCGNNFI、pCGNNF2及びpCGNNF3のSpeI/BamHI部位にサブクローン化した。次 いで、HAエピトープと融合した1/2/3コピーのFKBPをpCM中にXbaI/BamHI断片とし てサブクローン化した。得られたプラスミド(pCMF1/2/3.HA)は次の特徴を有する :ミリスチル化ドメイン、枠内XbaI部位;1/2/3コピーのFKBP;枠内SpeI部位;HAエ ピトープ・タグ,停止コドン。3.FRB 及びエピトープ・タグのpCMへの付加によりpCMFR 1/2/3.Flagを作成 SpeI-Flag-BamHIカセットは相補性オリゴヌクレオチド(オリゴヌクレオチド 8及び9)のアニーニングにより調製できる。このカセットは、枠内SpeI部位の 次がモノクローナル抗体の抗−FLAG.M2(Kodak Scientific Imaging Systems)に より認識される8アミノ酸(DYKDDDDY)(Hopp et al.,1988,Biotech.6:1205-121 0)をコードする配列であることを除いて、上記SpeI-HA-BamHIカセットと同じ特 徴を有する。このSpeI-Flag-BamHIカセットをpCGNN-1FRB、pCGNN-2FRB及びpCGNN -3FRB中のSpeI/BamHI部位にサブクローン化する。次いで1/2/3コピーのFRBドメ イン−Flagエピトープ融合物をXbaI/BamHI断片としてpCM中にサブクローン化す る。得られプラスミド(pCMFR1/2/3.Flag)は次の特徴を有する;ミリストイル化ド メイン;枠内XbaI部位;1/2/3コピーのFRB;枠内SpeI部位;Flagエピトープ・タグ; 及び停止コドン。4.FKBP及びFRB構築物のレセプターチロシンキナーゼ細胞質ドメインへの融合 選択したレセプターチロシンキナーゼの細胞質ドメイン(例えばEGFR、erbB-2 、PDGFR、KDR/F1k-1、Flt-1)を枠内5'XbaI及び3'SpeI部位でPCR増幅する。このP CR産物は、PCMFR群又はpCMF群のベクター(上記参照)において、XbaI部位を復 帰させるように枠内XbaI部位へ、あるいはSpeI部位を復帰させるように枠内SpeI 部位へサブクローン化してもよい。その結果、FKBP/FRBドメインをレセプター チロシンキナーゼの細胞質ドメインのC末端又はNH2末端に置くことができる。 このベクターは、(i)あるレセプターがFKBPとFRBの両方に融合する(例えばF KBP又はFRBに融合したEGFR細胞質ドメイン)か、(ii)2つの異なるレセプター の細胞質ドメインがFKBP及びFRBに融合する(例えばFKBPに融合したEGFR細胞質 ドメイン及びFRBに融合したerbB-2細胞質ドメイン)ように構築される。前者で は(i)薬剤、ラパマイシンの添加がホモ二量体(例えばEGFR/EGFR)の形成を誘 導し、一方後者では(ii)薬剤の添加がヘテロ二量体(例えばEGFR/erbB-2)を誘 導し、これはシグナル伝達カスケードを活性化する。5.構築物の試験 ラパマイシン又は類似体のFKBP-及びFRB-レセプター細胞質ドメイン融合物を 二量体化する能力を試験するために、選択した構築物(例えばpCMEGFR-FR1及びp CMEGFR-F1)をリポフェクション(Gibco BRL)によりCos-1細胞中に共トランスフ ェクションする。トランスフェクションの3日後、細胞をラパマイシンで誘導し 、溶菌緩衝液(1%TritonX-100;50mM Tris.cl pH8.0;150mM Nacl;5mM NaF;1mM オルトバナジウム酸ナトリウム;10ug/mlアプロチニン;10ug/mlロイペプチン)中 で溶菌させる。ラパマイシン処理及び未処理細胞ライゼートからの融合タンパク 質を抗Flag及び12CA5抗体で免疫沈降させ、抗ホスホチロシン抗体でイムノブロ ットする。細胞型の選択、移入されたDNA量;ラパマイシンの使用濃度及び薬剤処 理の期間は最適の結果が得られるよう変化させる。6.ラパマイシン誘導性細胞増殖 選ばれた哺乳動物細胞系(例えばNIH3T3)をFRB及びFKBP融合タンパク質をコ ードする構築物(例、pCMEGFR-FR1及びpCMEGFR-F1)で共トランスフェクション し、融合タンパク質を発現する安定細胞系を確立する。レセプター細胞質ドメイ ンのラパマイシン誘導性活性化が細胞増殖を誘導するかどうかを測定するために は、融合タンパク質を発現する安定細胞系をラパマイシンの存在下又は不在下で 増殖させ、細胞増殖の変化を通常の操作(例えば細胞数の監視、3Hチミジン取り 込み速度の測定、その他により)により測定する。レセプターチロシンキナーゼ の選択;レセプター活性化の型(ホモ二量体対ヘテロ二量体)は最適の結果が得 られるように選べばよい。7.オリゴヌクレオチド配列 8.配列1: 修飾された配列は小文字の太字で示され、下線は開始ATGを示す。大文字で示 す配列はもとのpCG骨格に由来する。B.Fasのドメインを含むキメラタンパク質をコードする構築物 Fas活性化を制御し、小分子を介してアポトーシスを開始させる能力は、遺伝 子治療(遺伝子工学処理された細胞を選択的に除去するのに用いることができる )及び実験系の両方に応用される。本書に記載するタンパク質は低親和性NGFレ セプター(p75とも称される)を介して膜に固定される。しかし、別のタンパク質 固定を用いることができることも理解すべきである。p75はその細胞外ドメイン に対する抗体を利用でき、任意の同定されたリガンド(Bothwell,M.1995,Annu .Rev.Neurosci,18:223-253)との高親和性相互作用が欠けているため実験的に 有用である。1.2−タンパク質ラパマイシン制御Fas活性化 (a) p75 ベクターの構築 低親和性NGFレセプター(p75とも称する)の細胞外の貫膜ドメインを含むFRAP-F as融合タンパク質の発現を指令するベクターを、哺乳動物発現ベクターpJ7W(Mor genstern,J.P.and Land,H.1990,Nucleic Acids Res.18:1068)から誘導し、標 準的方法を用いてもとのpBR骨格をpUC骨格で置き換えて修飾した。このベクター をpA7Wと呼ぶ。このプラスミドのポリリンカー部位にクローン化された挿入物を サルCMVプロモーター及びエンハンサー配列の制御下で転写する。ポリリンカー は、HindIII-SalI-XbaI-BamHI-SmaI-SstI-EcoRI-ClaI-KpnI-BglIIを有するCMV配 列の後である。適宜クローニング部位及びプロモーターを有する任意の哺乳動物 発現ベクターを代わりに用いてもよい。 HindIIIおよびXbaI部位に隣接するp75の断片をコードする制御酵素断片を、p7 5の配列(Johnson,D.,Lanahan,A.,Buck,C.R.,Shegal,A.,Morgen,C.,Mercer ,E.,Bothwell,M.,Chao,M.1986,Cell 47:545-554)に基づく、プライマーJ1(5 ')およびJ2(3')を用いたPCRにより作成した。PCR鋳型の供給源はJ1及びJ2に似て いるが異なる制限酵素部位を有するプライマーを用いてヒト脳ライブラリーから 誘導したクローンであった。 得られた断片の5'末端はHindIII部位、次いでEcoRI部位、Kozak配列及びp75コ ード配列の開始(アミノ酸1)を含む。得られた3'末端はアミノ酸274まで(こ れも含む)のレセプター配列、予想された膜にわたる配列の2アミノ酸過ぎ、次 いでXbaI部位をコードする。他の貫膜レセプターの類似部分をこの断片の代わり に用いてもよい。PCR産物をHindIII-XbaI切断pA7W中にHindIII-XbaI断片とし てサブクローン化して、pA7Wp75を作成した。構築物は制限酵素分析及びDNA配列 決定により確認した。(b) pA7Wp75 へのFasの付加 Fasアミノ酸206-304(FasS)およびFasアミノ酸206-319(Fas1)をコードするXbaI -SpeI断片をPCRにより作成し、同じ酵素で切断したpA7Wp75へサブクローン化し た。用いたプライマーはJ3(5')とJ4又はJ5(3')であった。J5はその停止コドンを 超えて終わるFasの断片を生じ、SpeLで切断されるとFasの末端15アミノ酸をコー ドするヌクレオチドが除去されて細胞内Fasの切りつめた形(我々はFasSと呼ぶ )が生じる。これらの15アミノ酸の除去によりある細胞型ではFasの活性が増加 する(Itoh,N.,and Nagata,S.1993,J.Biol.Chem.268:10932)。プライマーJ4は Fasの天然の停止コドンをSpeI部位に代え、またFasに含まれるもとのSpeI部位を 変異させてFasLを生じる。これらの断片をサブクローン化して得られるプラスミ ドはそれぞれpA7Wp75-FasSおよびpA7Wp75-FasLである。これらの構築物は制限酵 素分析およびDNA配列決定により確認された。これらの挿入物へエピトープ・タ グを加えるために、XbaI-SpeI Fas断片を分離し、pCMF 1/2/3.HA(SpeI部位、次 いでBamHI部位の3'の、H.インフルエンザのヘマグルチニンタンパク質(E)からの 9アミノ酸のエピトープ・タグをコードする上記プラスミド)のXbaI-SpeI切断 骨格中に連結した。得られたプラスミドをXbaIおよびBamHIで切断するとFas、次 いでエピトープ・タグ(これらの構築物ではEと呼ぶ)をコードする断片を生じ た。(c) p75-FRAP-Fas- エピトープ融合タンパク質:pA7Wp75-FasSE及びpA7Wp75-FasL EへのFRAP含有断片付加によるp75-FRAPx-FasS or LE及びp75-FasS or L-FRAPxE の作成 FRAPの一部を含むXbaI-SpeI断片は本書で既に説明している。これらのXbaI-Sp eI断片をp75コード配列のすぐ後のXbaI部位へ挿入してp75-FRAPx-Fas S or LEを 作成するか、Fas断片のすぐ後のSpeI部位に挿入してp75-FasS or L-FRAPxEを作 成した。あるいは、2以上のFRAP断片を、FRAPn断片としてあるは第1のFRAPをX baI又はSpeIにサブクローン化した後に利用できるSpeI部位にXbaI-SpeI断片を連 続サブクローン化することによりサブクローン化する。このように最終 群のベクターは(NからC末端までの)p75の細胞外貫膜配列、1又は2以上のF RAP由来ドメインが1又は2以上のFas細胞内ドメインにN又はC末端で融合して いるもの、およびエピトープ・タグをコードする。(d) p75-FKBP-Fas 融合タンパク質:pA7Wp75-FasSE及びpA7Wp75-FasLEへのFKBP含 有断片の付加によるp75-FKBPn-Fas S or L又はp75-FasS or L-FKBPnの作成 1又は2以上のFKBPを含有するXbaI-SpeI断片は本書の他の箇所で説明した。 これらの断片をp75コード配列のすぐ後のXbaI部位に挿入してp75-FKBPn-FasS or Lを得るか、Fas断片のすぐ後のSpeI部位に挿入してp75-FasS or L-FKBPnを得る 。このように最終群のベクターは、(NからC末端までの)p75の細胞外貫膜配 列、1又は2以上のFKBPが1又は2以上のFas細胞内ドメインへN又はC末端で 融合したもの、及びエピトープ・タグをコードする。(e) ラパマイシン媒介Fas活性化の測定 Fas及びFRAPドメインを含むタンパク質並びにFas及びFKBPドメインを含むタン パク質のFasを活性化し、ラパマイシン添加により細胞死を引き起こす発現能力 は一時的又は安定的にトランスフェクションされた細胞のいずれでも試験するこ とができる。 一時的トランスフェクションには、試験する2つのプラスミドをHT1080等の細 胞系へ、リポフェクション、リン酸カルシウム沈降又はエレクトロポレーション 等の標準的方法で共トランスフェクションする。トランスフェノールの1日また は2日以上後に細胞を、ラパマイシン無添加、1又は2以上の濃度のラパマイシ ン、又は1又は2以上の濃度のFK1012等の二量体化剤で処理する。FK1012はFKBP -Fas構築物が機能していることの正の対照として作用する。数時間から1日後細 胞をいくつかの方法のうちの1つで応答を監視する。細胞ライゼートを慣用の方 法で調製し、HA又はp75の細胞外ドメインに対する抗体でつり上げられるウエス タンブロットを作成するのに用いた。あるいは細胞を等張溶液+10mMEDTA中に集 めて分析し、抗p75モノクローナル抗体および標識二次抗体で染色し、陽性の細 胞をFACSにより測定することもできる。ウエスタンブロットシグナル又は処理後 のFACSシグナルの減少は細胞死をうまく誘導できたこと(あるいはタンパク質発 現の減少)を示す。さらに、市販のキットを用いてアポトーシスを監視すること もできる。 細胞を安定にトランスフェクションするには、ネオマイシン耐性のような選択 可能なマーカーをコードするベクターを上記プラスミドと共に共トランスフェク ションする。トランスフェクションの2〜3日後、細胞をG418に入れ、耐性の集 団即ちクローンを標準的方法で分離する。次いで、これらの集団を二量体化剤で の処理、次いで細胞数の計測又は細胞生存能の他の測定法によりアポトーシスの 誘導を直接監視することができる。 対象の構築物を発現する安定な細胞系を作成する別の手段は、レトロウイルス ベクター中に挿入物をサブクローン化することである。この挿入物はEcoRIで切 り出し可能であり、このサブクローニングが容易になる。次いでこのベクターを 用いて慣用の方法を用いてパッケージング細胞による形質導入用上清を製造する 。2.単純タンパク質ラパマイシン制御Fas活性化 (a) Fas細胞内ドメインのラパマイシン依存性ホモ二量体化のためのFKBP-FRAPキ メラ断片FKBP-FRAP融合構築物の構築 i.構造による設計 ラパマイシン依存性ホモ二量体化が可能なFRAP及びFKBPドメインを含む分子を 設計するためには、ヒトFKBP12、ラパマイシン及び最少FRBドメインを含むヒトF RAPの一部の間の三成分複合体の三次元構造を考えればよい。FRAP、FKBP及びFas 部分を含む融合タンパク質の2つの分子のホモ二量体化の要件には(i)凝集し たFasがシグナルを伝達する能力を維持しながら、FRAP-FKBP相互作用が膜に固定 された分子間に生じるのに必要な歪に適合するのに十分なポリペプチドの長さ及 び可変性、及び(ii)ラパマイシンによる分子内二量体化の防止又は最小化、キ レート効果によりエントロピー的に非常に好ましく、従って望ましい分子間の分 子二量体化を妨害すると予想される事象。 構造を考慮することにより融合構築物に対する以下の設計が好ましいと考えら れる。 (i)FRBとFKBPは、分子内二量体化が立体的に妨害されるのに十分短いポリペ プチドリンカーで結合されるのがよい。一般に好ましい配置形態は、FRAPのC末 端とFKBPのN末端が離れており、分子内二量体化を妨害するが可変性は有する長 いリンカー(10以上のアミノ酸)を可能にする、FRAP-FKBPである。 (ii)このFRAP-FKBP「カセット」が膜近くに(即ちC末端にFasドメインが付加 されている)、あるいは膜から離れて(Fasドメインが膜近くであり、FRAP-FKBP カセットがC末端に付加されている)存在しうる。 (iii)長いリンカーがFRAP-FKBPドメインのN末端に存在して、膜での二量体化 に関与する構造の歪みを可能にするか、あるいはこのドメインがC末端に付加さ れる場合。 またFRAPがN-末端に存在するのは、この長いリンカーがFRBドメインに対して N末端の領域からの天然FRAP配列からなり、キメラタンパク質の免疫原性を最小 にするので好ましい。 (iv)あるタンパク質に対する最適のリンカー長さと融合位置は経験的に確認さ れるべきである。 一連のFKBPとFRAPの12の融合物(T1〜T12称する)を設計した。9つはArg2018 (N末端リンカー)に対してN末端の13、23又は33アミノ酸、2つのタンパク質を 分けている4、7又は10残基を含むN-FRAP-FKBP-C融合物であった。残りの3つ はFKBP Glu107とFRAP Arg1028間のFRAP配列の3、0又は−4残基に介在するN-F RAP-FKBP-C融合物であった。(ii)構築 12個の融合物をXbaI-BamHIカセットとして作成し、これは3-プライマーPCRス プライシング法(You,J.and Fried,M.1989,Nucleic Acids Res.17,4895)を用 いて単一断片として直接クローン化できた。この方法でクローン化すると、外来 の配列をコードしリンカーの長さを変えるであろう遺伝子間への制限酵素部位の 導入が避けられた。pCGNN-1FRAPiとpCANTAB-AP-FKBP各1ngの混合物を、所望の 融合を行わせる両遺伝子に相補性の単一の「スプライス」オリゴ(B)0.01μMの存 在下で、2っの外側のプライマー(A及びC)各1μMを用いPfuポリメラーゼにより 増幅させた。 用いたプライマーは以下に示す。 * は5'XbaI部位によりコードされるArgとFRAP Arg2018(融合物T1-T9に対して )との間のアミノ酸の数を示す。 +はFRAP Ser2112とFKBP Gly1との間(融合物T1-T9に対して)、あるいはFKBP Glu107とFRAP Arg2018との間(融合物T10〜T12)のアミノ酸数を示す。 PCR産物を精製し、XbaIとBamHIで消化し、XbaI-BamHI消化pCMに連結した。構 築物は制限酵素分析とDNA配列決定により確認した。プライマー配列 下線は制限酵素部位(XbaI=TCTAGA、SpeI=ACGAGT、BamHI=GGATCC) 代表的構築物の配列:融合物T6 (b) FRAP-FKBPキメラ挿入物のpA7Wp75-Fas S EおよびpA7Wp75-Fas L Eへの付加 T1からT12をXbaIで線状化したpA7Wp75-Fas S EおよびpA7Wp75-Fas L E中へXba I-SpeI断片としてサブクローン化すると、p75TFas S Eまたはp75TFas L Eが得ら れる。SpeIで線状化したpA7Wp75-Fas L Eにサブクローン化するとp75Fas S T-E またはpFas L T-Eが得られる。これらの構築物を表1に示す(下記の(d))。 (c) 別のFRAP-Fas-FKBP構築物 キメラ断片T1-T12配列の代わりに、一本鎖の方法では最適の活性にはドメイン の異なる方向付けが必要となろう。この方法では、FRAPおよびFRBがFas断片で分 離されている別の一連の構築物が得られた。これらの構築物の出発点はpCMF1HA 、pCMF2HAおよびpCMF3HAである。キメラ転写因子の構築のための上記方法と同様 に、FRAPおよびFRB断片(本書の他の部分で説明)をBamHI部位の直ぐ上流にSpeI を含有するXbaI-BamHI断片としてpCM骨格中にクローン化した。XbaIおよびSpeI は適合末端を生ずるので、これによりさらにXbaI-BamHI断片を最初の挿入物の下 流に挿入することが可能となった。さらに、XbaI-SpeI断片のクローン化により 構築物の5'末端にこの断片が付加される。表1(下記の(d))に示すXbaI-SpeI断片 をpA7Wp75-Fas S E中にサブクローン化することによりp75固定最終構築物を作 成した。pA7Wp75-Fas L Eにサブクローン化することにより同様の構築物が作成 される。XbaIで切断されたベクター中に挿入すると、p75断片の3'に挿入物が付 加される。SpeIで切断されたこのベクター中に挿入すると、Fas断片の3'に挿入 物が付加される。XbaIおよびSpeIで切断されたこのベクター中に挿入すると、p7 5断片の3'に挿入物が付加され、ベクター中にもともとあったFas断片が削除され ることになる。これらの3つのサブクローン化方法を用いることにより、以下の 一連の構築物を作成した。下付数字はドメインの反復数を示す。 (d) 表1 コード:N=p75NGFレセプターaa 1-274 Fas S=Fas aa 206-304 Fas L=Fas aa 206-319 K=FKBP aa 2-108 R=FRAP 2012-2113、但し他の境界に置換可 E=pCMF1/2/3.HAにおいて記載した、HAエピトープ、次いで停止コドン(e) 使用断片の末端(FKBPおよびFRB断片は本書の他の箇所で説明) i.p75細胞外貫膜断片 5'末端3'末端 ii.Fasの細胞内ドメイン: 5'末端 Fas L構築物の3'末端 Fas S構築物の3'末端 (f) 使用オリゴ類 タンパク質を膜に固定するのにミリストイル化配列を用いる構築物には、pCM (本書の他の箇所で説明)を使用し、挿入物をミリストイル化シグナル配列の3' にXbaI-BamHIまたはXbaI-SpeI断片としてクローン化した。(g) 安定的にトランスフェクションされた培養状態のヒトHT1080細胞のラパマイ シン調節アポトーシス 構築物A30およびA31(d、表1)からのXbaI-BamHI断片をpCMにクローン化し てM30およびM31を得た。これはMT5Fas SEおよびMT6Fas SEの発現を指令し、ここ でMはミリストイル化ドメイン(この実施例のA.1.およびA.8.参照)を意味し、 他の略語はd、表1に記載の通りである。これらの発現カセットを含むEcoRI-Bam HI断片を次いでレトロウイルスベクターpSMTN3(実施例1)中に挿入した。この DNAを含有するヘルパー−フリーのレトロウイルスを、この構築物およびPsi(-) 両種性パッケージングベクターを用いて293T細胞(Pear,W.S.et al.,1993,Proc. Natl.Acad.Sci.USA,90,8392-8396)の一時的共トランスフェクションにより作 成した。HT1080細胞をウイルスのストックで感染させ、G418で選択した。 安定的にトランスフェクションされた細胞集団のラパマイシンに応答したアポ トーシスを分析するために、細胞を96-ウェル培養プレートに10000細胞/ウェル で培養した。一晩培養した後、50ng/ml(最終)のアクチノマイシンDと共に連続 希釈ラパマイシンを添加し、培養を37℃、5%CO2で約20時間続けた。培地を除去 し、10%アラマーブルー(alamar blue)染料含有培地100μlで置き換えた。プレ ートを前と同様にして培養し、細胞の生存度をマイクロタイター・プレート・リ ーダーにおける570nmおよび600nmのODの分光光度定量により周期的に分析した。 典型的には対照(未処理)ウェルがブランクを引いた後にOD0.2-0.4となるまで 読み取りを続けた。 図13は、(a)M30および(b)M31発現構築物で安定的にトランスフェクションされ た細胞の生存がラパマイシンの存在下では用量応答的に効果的に低下することを 示す。図13(c)から明らかなように、細胞死の程度は、合成FKBPホモ二量体化剤 のAP1428で処理されたミリストイル化(FKBP×2)-Fas構築物(PCT/US94/08008に 開示)を発現する細胞の場合と同等である。 AP1428はPCT/US94/10559に開示の化合物49である。ただしラパマイシンは混合 キメラタンパク質を発現しない細胞の生存には最小の影響を示す(図13(c))。実施例9:ラパマイシン依存性DNA結合 DNA結合のレベルで転写因子機能を調節する能力は、治療用遺伝子発現の小分 子制御への別の方法である。DNA結合についてラパマイシン依存性である転写因 子の作成への一つの方法は、多くの転写因子が二量体としてその同族配列に結合 するという事実を利用することである。かかる転写因子のDNA結合性ドメインは 、DNAとの直接接触に関与する領域と二量体形成の媒介に関与する領域に副次分 割されうることが多い。従って、天然の転写因子二量体化ドメインに代えFKBPま たはFRAPを用いることにより、キメラ転写因子はラパマイシン依存性DNA結合を 示すはずである。 任意のヒト二量体転写因子がこの方法によることができる。HNF-1、SRFまたは その他のMADS box含有タンパク質、MyoD、myogeninなどのヘリックス-ループ-ヘ リックス転写因子群の任意の因子、FOS,JUN,ATF,CREBなどのbZIP転写因子群の任 意の因子が例示される。 内生転写因子による治療用遺伝子の望ましくない活性化を避けるために、キメ ラ転写因子のDNA結合特異性を「もとの」タンパク質のものとは異なるように操 作することができる。これは、ラパマイシン媒介キメラタンパク質二量体は結合 しうるが天然のもとの二量体は結合できないようにパリンドローム標的DNA配列 の半分の部位の位置を変えることにより行うことができる。in vitro ラパマイシン依存性DNA結合が細菌のレセプタータンパク質LexAの誘導 体を用いて立証された LexAはその標的オペレーターに二量体として結合し、直接DNAと相互作用する アミノ末端ドメインと二量体化を媒介するカルボキシ末端ドメインとからなる。 LexA二量体化ドメインをFKBPまたはFRAPに代えたキメラタンパク質を作成した。 図14は、Lex結合性部位含有DNAと共にインキュベーションしたおよそ等量のLex- FKBPとLex-FRAPタンパク質を含有する結合反応液のゲル移動度シフト分析を示す 。ラパマイシンの不在下では特異的結合は検出されない(図14、レーン1)。結 合反応にラパマイシンの増加量を含むと移動度シフトゲルに特異的複合体が同時 に出現する(図14、レーン2〜4)。これらの結果は、ラパマイシンが、LexA標 的配列を含むDNAに結合しうるLex-FKBP/Lex-FRAPヘテロ二量体の形成を促進する という結論を支持する。図14 Lex-FKBP/Lex-FRAPヘテロ二量体によるラパマイシン依存性DNA結合 Lex-FKBPおよびLex-FRAPタンパク質をin vitroで翻訳し、放射標識LexConオリ ゴヌクレオチドとの結合反応液に一緒に混合した。ラパマイシンは示された濃度 (レーン1〜4)で結合反応液に含まれていた。 矢印はラパマイシン依存性タンパク質-DNA複合体の位置を示す。 LexConプローブの配列を以下に示し、下線はLexA結合部位を示す: プラスミド構築物 プラスミドp19BL87、p19BL87G6FKBPおよびp19BL87FRBを、すべての発現タンパ ク質がアミノ末端His・タグ、次いでヘマグルチニンエピトープ・タグを含むよ うに修飾されたpET-19BHA、pET-19Bに基づくベクター中に作成した。 p19BL87はLexA DNA結合性ドメイン(aa 1-87)をコードする。LexAコード配列を プライマーLexAXbaおよびLexA87 Spe/Bamを用いてpCGNNLex202からPCRにより増 幅した。PCR産物をXbaIおよびBamHIで消化し、p19BHAのXbaIおよびBamHI 部位の間に連結した。 p19BL87G6FKBPは6個のグリシンの可変性リンカーを介して枠内でFKBP(aa2-10 8)に融合しているLexA(aa 1-87)をコードする。FKBPコード配列をプライマー5'X G6FKBPおよびFKBP3'Spe/Bamを用いてpCGNNF1からPCRにより増幅した。pCGNNZFHD 1-FKBP3×3(ATCC受託番号97399)をFKBPコードDNAの供給源として用いてもよいUS SN 08/581,713(1995年12月29日出願)参照。PCR産物をXbaIおよびBamHIで消化 し、p19BL87のSpeIおよびBamHI部位の間に連結した。 p19BL87FRBは枠内でFRAP(aa 2025-2113)に融合しているLexA(aa 1-87)をコー ドする。FRAPコード配列をpCGNN-GAL4-1FRBからXbaI-BamHI断片として分離して 、p19BL87のSpeIおよびBamHI部位の間に連結した。PCR プライマー 結合反応液 p19BL87G6FKBPおよびp19BL87FRBプラスミドを製造業者の指示に従ってTNT結合 網状赤血球ライゼート系(Promega)を用いin vitroで翻訳した。 結合反応液は全量20ml中に15mlの結合緩衝液(10mMトリスpH7.5、1mMDDT、0.1m M EDTA、10%v/vグリセロール、5mM MgCl2、60mM NaCl)、50mg/ml子ウシ血清ア ルブミン(NEB)、200ng Poly(dIdC)-Poly(dIdC)(Pharmacia)、L87G6FKBPおよび L87FRBがプログラムされた網状赤血球ライゼート各1ml、およびg-32P-dATP標識 LexConプローブ0.2ngを含んでいた。ラパマイシンを適宜濃度で添加し、反応液 を室温で30分間インキュベーションした。ゲル移動度シフト分析 複合体を0.5×TBE緩衝液中の4%の40:1架橋ポリアクリルアミドゲル上で10- 15V/cmで2時間分解した。ゲルを乾燥し、はずし、3MMペーパーに乗せ8時間オ ートラジオグラフィーにかけた。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE, DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,IT,L U,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ,CF ,CG,CI,CM,GA,GN,ML,MR,NE, SN,TD,TG),AP(KE,LS,MW,SD,S Z,UG),EA(AM,AZ,BY,KG,KZ,MD ,RU,TJ,TM),AL,AM,AT,AU,AZ ,BB,BG,BR,BY,CA,CH,CN,CZ, DE,DK,EE,ES,FI,GB,GE,HU,I S,JP,KE,KG,KP,KR,KZ,LK,LR ,LS,LT,LU,LV,MD,MG,MK,MN, MW,MX,NO,NZ,PL,PT,RO,RU,S D,SE,SG,SI,SK,TJ,TM,TR,TT ,UA,UG,US,UZ,VN (72)発明者 ギルマン,マイケル・ゼット アメリカ合衆国、マサチューセッツ州 02168、ニュートン、チェストナット・ス トリート555

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1 少なくとも2つの組み換えDNAを含有する動物細胞であり、 第1の組み換えDNAは、ラパマイシンもしくはその類似体に結合することができ 、少なくとも1つのラパマイシン結合性ドメインおよびそれに対して異種の少な くとも1つのタンパク質ドメインを含有する第1のキメラタンパク質をコードし 、ここでラパマイシン結合性ドメインは下記から選ばれたペプチド配列を含み: (i)天然FKBPまたはその一部、 (ii)天然FKBPの、10個までのアミノ酸残基が欠失、挿入もしくは代替アミノ酸で 置換された変異体、 (iii)(i)または(ii)のFKBPをコードするDNA配列と選択的にハイブリッド形 成しうるDNA配列によりコードされるFKBP; 第2の組み換えDNAは、ラパマイシンもしくはラパマイシン類似体および第1の キメラタンパク質と複合体を形成することができ、少なくとも1つのFRBドメイ ンおよびそれに対して異種の少なくとも1つのドメインを含有する第2のキメラ タンパク質をコードし、ここでFRBドメインは下記から選ばれたペプチド配列を 含み: (iv)天然のFRBドメイン、 (v)天然FRBの、10個までのアミノ酸残基が欠失、挿入もしくは代替アミノ酸で置 換された変異体、 (vi)(iv)または(v)のFRBをコードするDNA配列と選択的にハイブリッド形成し うるDNA配列によりコードされるFRB ドメイン。 2.第1のキメラタンパク質が、ヒトFKBP12のペプチド配列、該配列の5個まで のアミノ酸の置換、欠失もしくは挿入を含む変異体、またはヒトFKBP12をコード するDNA配列と選択的にハイブリッド形成しうるDNA配列によりコードされるペプ チド配列から選ばれたペプチド配列を含む請求の範囲第1項記載の動物細胞。 3.第1のキメラタンパク質が、ヒトFKBP12のTyr26、Phe36、Asp37、Arg42、Ph e46、Phe48、Glu54、Val55およびPhe99に相当する1または2以上のアミノ酸残 基が削除あるいは代替アミノ酸で置換されているFKBPドメインを含む請 求の範囲第2項記載の動物細胞。 4.第2のキメラタンパク質が、次のペプチド配列:ヒトもしくはネズミFRAPの Glu-2025からLys2113、Tor1(S.セレビシアエ)のGlu-1962からArg-2050、Tor1 (S.セレビシアエ)のGlu-1962からArg-2050のペプチド配列、Tor2(S.セレビシ アエ)のGlu-1965からLys-2053、これらの配列のいずれかの、10個までのアミノ 酸の置換、欠失もしくは挿入を含む変異体、およびこれらのペプチド配列のいず れかをコードするDNA配列と選択的にハイブリッド形成しうるDNA配列によりコー ドされるペプチド配列より選ばれたペプチド配列を含む請求の範囲第1項記載の 動物細胞。 5.第2のキメラタンパク質が、ヒトFRAPのTyr2038、Phe2039、Thr2098、Gln20 99、Trp2101およびAsp2102に相当する1または2以上のアミノ酸残基が削除ある いは代替アミノ酸で置換されているFRBドメインを含む請求の範囲第4項記載の 動物細胞。 6.少なくとも1つのキメラタンパク質が膜局在化ドメインを含む請求の範囲第 1項記載の動物細胞。 7.少なくとも1つのキメラタンパク質がヒト起源のペプチド配列を含む異種ド メインを含有する請求の範囲第1項記載の動物細胞。 8.第1のキメラタンパク質が2またはそれ以上のFKBPドメインを含む請求の範 囲第1項記載の動物細胞。 9.第2のキメラタンパク質が2またはそれ以上のFRBドメインを含む請求の範 囲第1項記載の動物細胞。 10.一方のキメラタンパク質が少なくとも1つのDNA結合性ドメインを含み、他 方のキメラタンパク質が少なくとも1つの転写活性化ドメインを含み、前記細胞 が、DNA結合性ドメインが結合しうるDNA配列に操作可能に連結されている標的遺 伝子をさらに含む請求の範囲第1項記載の動物細胞。 11.少なくとも1つのキメラタンパク質が、多量体化により細胞の成長、分化、 増殖、アポトーシスもしくは遺伝子発現を生じる細胞内シグナルを開始すること ができる異種ドメインからなる異種ドメインを含む請求の範囲第1項記載の動物 細胞。 12.異種ドメインがFASもしくはTNF-R1の細胞内ドメインまたはその断片から誘 導されたペプチド配列を含む請求の範囲第11項記載の動物細胞。 13.2つのキメラタンパク質がそれぞれ1または2以上の共通異種ドメインを含 有する請求の範囲第1項記載の動物細胞。 14.2つのキメラタンパク質がそれぞれ、多量体化により細胞の成長、分化、増 殖、アポトーシスもしくは遺伝子発現を生じる細胞内シグナルを開始することが できるドメインを含む請求の範囲第13項記載の動物細胞。 15.2つのキメラタンパク質が同じであり、多量体化により細胞内シグナルを開 始する請求の範囲第11項ないし14項のいずれかに記載の動物細胞。 16.ヒト起源のものである請求の範囲第1項ないし15項のいずれかに記載の動物 細胞。 17.生体適合性材料内にカプセル化した請求の範囲第1項ないし16項のいずれか に記載の動物細胞。 18.請求の範囲第1項ないし17項のいずれかに記載の動物細胞を含有するヒト以 外の動物。 19.細胞によるDNA取り込みが可能な条件下で、キメラタンパク質をコードする 1または2以上のDNA分子を宿主動物細胞に導入することを含む、請求の範囲第 1項ないし18項のいずれかに記載の動物細胞を製造する方法。 20.キメラタンパク質の会合に応答して標的遺伝子転写を可能にするDNA配列に 連結した標的遺伝子をコードするDNA分子を、細胞内に導入することをさらに含 む請求の範囲第19項記載の方法。 21.動物に、該動物の1または2以上の細胞によるDNA取り込みが可能な条件下 で、キメラタンパク質をコードする1または2以上のDNA分子を導入することを 含む、請求の範囲第1項ないし16項のいずれかに記載の動物細胞を製造する方法 。 22.動物に、請求の範囲第1項ないし17項のいずれかに記載の細胞を導入するこ とを含む、請求の範囲第1項ないし17項のいずれかに記載の細胞を含む動物を製 造する方法。 23.細胞を、キメラタンパク質との複合体の形成を可能にする条件下でラパマイ シンもしくは適当なラパマイシン類似体の有効量と接触させることを含む、請求 の範囲第1項ないし17項のいずれかに記載の細胞中でキメラタンパク質を多量体 化する方法。 24.細胞を、ラパマイシン以外の下記式を有する化合物と接触させる請求の範囲 第23項記載の方法: 上記式中、 Uは-H,-OR1,-SR1, -OC(O)R1もしくは-OC(O)NHR1, -NHR1,-NHC(O)R1,-NH-SO2-R1または -R2であり、ここでR2=置換アリールもしくはアリルもしくはアルキルアリ ール Vは-OR3または(=O)であり Wは=O,=NR4,=NOR4もしくは=NNHR4, -NHOR4もしくは-NHNHR4, -OR4, -OC(O)R4もしくは-OC(O)NR4,または-Hであり Yは-OR5,-OC(O)R5または-OC(O)NHR5であり Zは=O,-OR6,-NR6,-H,-NC(O)R6,-OC(O)R6または-OC(O)NR6であり R3はH,-R7,-C(O)R7もしくは-C(O)NHR7,またはC-28/C-30環式カーボネートで あり R4はHまたはアルキルであり、 ここでR1,R4,R5,R6およびR7は、H、アルキル、アルキルアリールおよびアリ ールから別個に選ばれる。 25.細胞を、遺伝子発現させるのに有効な量でキメラタンパク質との複合体形成 が可能なラパマイシンもしくはラパマイシン類似体と接触させることを含む、キ メラタンパク質の二量体化に応答性の標的遺伝子構築物を含む請求の範囲第10、 11または14項記載の細胞中で標的遺伝子の転写を活性化する方法。 26.細胞を、ラパマイシン以外の下記式を有する化合物と接触させる請求の範囲 第25項記載の方法: 上記式中、 Uは-H,-OR1,-SR1, -OC(O)R1もしくは-OC(O)NHR1, -NHR1,-NHC(O)R1,-NH-SO2-R1または -R2であり、ここでR2=置換アリールもしくはアリルもしくはアルキルアリ ール Vは-OR3または(=O)であり Wは=O,=NR4,=NOR4もしくは=NNHR4, -NHOR4もしくは-NHNHR4, -OR4, -OC(O)R4もしくは-OC(O)NR4,または-Hであり Yは-OR5,-OC(O)R5または-OC(O)NHR5であり Zは=O,-OR6,-NR6,-H,-NC(O)R6,-OC(O)R6または-OC(O)NR6であり R3はH,-R7,-C(O)R7もしくは-C(O)NHR7,またはC-28/C-30環式カーボネートで あり R4はHまたはアルキルであり、 ここでR1,R4,R5,R6およびR7は、H、アルキル、アルキルアリールおよびアリ ールから別個に選ばれる。 27.細胞を、キメラタンパク質との複合体形成が可能なラパマイシンもしくはラ パマイシン類似体と、該複合体を形成させるのに有効な量で接触させることを含 む、請求の範囲第11ないし14項のいずれかに記載の細胞中でシグナル伝達経路を 発動させる方法。 28.細胞を、ラパマイシン以外の下記式を有する化合物と接触させる請求の範囲 第27項記載の方法: 上記式中、 Uは-H,-OR1,-SR1, -OC(O)R1もしくは-OC(O)NHR1, -NHR1,-NHC(O)R1,-NH-SO2-R1または -R2であり、ここでR2=置換アリールもしくはアリルもしくはアルキルアリ ール Vは-OR3または(=O)であり Wは=O,=NR4,=NOR4もしくは=NNHR4, -NHOR4もしくは-NHNHR4, -OR4, -OC(O)R4もしくは-OC(O)NR4,または-Hであり Yは-OR5,-OC(O)R5または-OC(O)NHR5であり Zは=O,-OR6,-NR6,-H,-NC(O)R6,-OC(O)R6または-OC(O)NR6であり R3はH,-R7,-C(O)R7もしくは-C(O)NHR7,またはC-28/C-30環式カーボネート であり R4はHまたはアルキルであり、 ここでR1,R4,R5,R6およびR7は、H、アルキル、アルキルアリールおよびアリ ールから別個に選ばれる。 29.細胞を、キメラタンパク質との複合体形成が可能なラパマイシンもしくはラ パマイシン類似体と該複合体を形成させるのに有効な量で接触させることを含む 、多量体化によりアポトーシスを始動させうる異種ドメインを含む少なくとも1 つのキメラタンパク質を含有する請求の範囲第11、12、14、または15項のいずれ かに記載の細胞中で細胞死を発動させる方法。 30.細胞を倍地中で増殖させ、接触を倍地にラパマイシンまたはラパマイシン類 似体を添加することにより行う請求の範囲第23項ないし29項のいずれかに記載の 方法。 31.細胞が宿主生体内に存在し、接触を宿主生体内にラパマイシンまたはラパマ イシン類似体を投与することにより行う請求の範囲第23項ないし29項のいずれか に記載の方法。 32.宿主生体が哺乳動物であり、ラパマイシン型化合物が経口、バッカル、舌下 、経皮、皮下、筋肉内、静脈内、関節内または吸入投与によりその適宜医薬用ま たは獣医薬用ビヒクル中で投与される請求の範囲第31項記載の方法。 33.少なくとも2つの組み換えDNAを動物細胞中に導入することを含む、ラパマ イシンまたはラパマイシン類似体に応答性の動物細胞を提供する方法であり、第 1の組み換えDNAは、ラパマイシンもしくはその類似体に結合することができ、 少なくとも1つのラパマイシン結合性ドメインおよびそれに対して異種の少なく とも1つのタンパク質ドメインを含有する第1のキメラタンパク質をコードし、 ここでラパマイシン結合性ドメインは下記から選ばれたペプチド配列を含み: (i)天然FKBPまたはその一部、 (ii)天然FKBPの、10個までのアミノ酸残基が欠失、挿入もしくは代替アミノ酸で 置換された変異体、 (iii)(i)または(ii)のFKBPをコードするDNA配列と選択的にハイブリッド形 成しうるDNA配列によりコードされるFKBP; 第2の組み換えDNAは、ラパマイシンもしくはラパマイシン類似体および第1の キメラタンパク質と複合体を形成することができ、少なくとも1つのFRBドメイ ンおよびそれに対して異種の少なくとも1つのドメインを含有する第2のキメラ タンパク質をコードし、ここでFRBドメインは下記から選ばれたペプチド配列を 含み: (iv)天然のFRB ドメイン、 (v)天然FRBの、10個までのアミノ酸残基が欠失、挿入もしくは代替アミノ酸で置 換された変異体、 (vi)(iv)または(v)のFRBをコードするDNA配列と選択的にハイブリッド形成し うるDNA配列によりコードされるFRB ドメイン。 34.少なくとも2つの組み換えDNAを、宿主動物の1または2以上の細胞のトラ ンスフェクションを可能にする条件下で宿主哺乳動物に導入することを含む、ラ パマイシンまたはラパマイシン類似体に応答性の哺乳動物を提供する方法であり 、第1の組み換えDNAは、ラパマイシンもしくはその類似体に結合することがで き、少なくとも1つのラパマイシン結合性ドメインおよびそれに対して異種の少 なくとも1つのタンパク質ドメインを含有する第1のキメラタンパク質をコード し、ここでラパマイシン結合性ドメインは下記から選ばれたペプチド配列を含み : (i)天然FKBPまたはその一部、 (ii)天然FKBPの、10個までのアミノ酸残基が欠失、挿入もしくは代替アミノ酸で 置換された変異体、 (iii)(i)または(ii)のFKBPをコードするDNA配列と選択的にハイブリッド形 成しうるDNA配列によりコードされるFKBP; 第2の組み換えDNAは、ラパマイシンもしくはラパマイシン類似体および第1の キメラタンパク質と複合体を形成することができ、少なくとも1つのFRBドメイ ンおよびそれに対して異種の少なくとも1つのドメインを含有する第2のキメラ タンパク質をコードし、ここでFRBドメインは下記から選ばれたペプチド配列を 含み: (iv)天然のFRBドメイン、 (v)天然FRBの、10個までのアミノ酸残基が欠失、挿入もしくは代替アミノ酸で 置換された変異体、 (vi)(iv)または(v)のFRBをコードするDNA配列と選択的にハイブリッド形成し うるDNA配列によりコードされるFRBドメイン。 35.少なくとも2つの組み換えDNA含有する細胞を、宿主哺乳動物に導入するこ とを含む、ラパマイシンまたはラパマイシン類似体に応答性の哺乳動物を提供す る方法であり、第1の組み換えDNAは、ラパマイシンもしくはその類似体に結合 することかでき、少なくとも1つのラパマイシン結合性ドメインおよびそれに対 して異種の少なくとも1つのタンパク質ドメインを含有する第1のキメラタンパ ク質をコードし、ここでラパマイシン結合性ドメインは下記から選ばれたペプチ ド配列を含み: (i)天然FKBPまたはその一部、 (ii)天然FKBPの、10個までのアミノ酸残基が欠失、挿入もしくは代替アミノ酸で 置換された変異体、 (iii)(i)または(ii)のFKBPをコードするDNA配列と選択的にハイブリッド形 成しうるDNA配列によりコードされるFKBP; 第2の組み換えDNAは、ラパマイシンもしくはラパマイシン類似体および第1の キメラタンパク質と複合体を形成することができ、少なくとも1つのFRBドメイ ンおよびそれに対して異種の少なくとも1つのドメインを含有する第2のキメラ タンパク質をコードし、ここでFRBドメインは下記から選ばれたペプチド配列を 含み: (iv)天然のFRBドメイン、 (v)天然FRBの、10個までのアミノ酸残基が欠失、挿入もしくは代替アミノ酸で置 換された変異体、 (vi)(iv)または(v)のFRBをコードするDNA配列と選択的にハイブリッド形成し うるDNA配列によりコードされるFRBドメイン。 36.少なくとも2つの組み換えDNAを含有するキットであり、第1の組み換え DNAは、ラパマイシンまたはラパマイシン類似体に結合可能であり、少なくと も1つのラパマイシン結合性ドメインおよびそれに対して異種の少なくとも1つ のタンパク質ドメインを含有する第1のタンパク質をコードし、ここでラパマイ シン結合性ドメインは下記から選ばれたペプチド配列を含み: (i)天然FKBPまたはその一部、 (ii)天然FKBPの、10個までのアミノ酸残基が欠失、挿入もしくは代替アミノ酸で 置換された変異体、 (iii)(i)または(ii)のFKBPをコードするDNA配列と選択的にハイブリッド形 成しうるDNA配列によりコードされるFKBP; 第2の組み換えDNAは、ラパマイシンもしくはラパマイシン類似体および第1の キメラタンパク質と複合体を形成することができ、少なくとも1つのFRBドメイ ンおよびそれに対して異種の少なくとも1つのドメインを含有する第2のキメラ タンパク質をコードし、ここでFRBドメインは下記から選ばれたペプチド配列を 含み: (iv)天然のFRBドメイン、 (v)天然FRBの、10個までのアミノ酸残基が欠失、挿入もしくは代替アミノ酸で置 換された変異体、 (vi)(iv)または(v)のFRBをコードするDNA配列に選択的とハイブリッド形成し うるDNA配列によりコードされるFRBドメイン。 37.キメラタンパク質と複合体を形成しうるラパマイシンまたはラパマイシン類 似体をさらに含む請求の範囲第36項記載のキット。 38.多量体化拮抗剤をさらに含有する請求の範囲第36項記載のキット。 39.キメラタンパク質およびラパマイシンもしくはラパマイシン類似体により形 成される複合体に応答性の転写制御要素に連結した標的遺伝子を含む、少なくと も1つの標的遺伝子構築物をさらに含有する請求の範囲第36項記載のキット。 40.1または2以上のDNA構築物が異種ドメインの代わりにクローン化部位を含 む請求の範囲第36項記載のキット。 41.標的遺伝子構築物が標的遺伝子の代わりにクローン化部位を含む請求の範囲 第39項記載のキット。 42.1または2以上のFRBドメインおよびFasのペプチド配列から選ばれたペプチ ド配列を含む1または2以上のドメインを含有する融合タンパク質をコードする 組み換えDNA構築物。 43.2または3以上のFRBドメインとそれに対して異種の少なくとも1つのドメ インを含む融合タンパク質をコードする組み換えDNA構築物。 44.1または2以上のFRBドメインおよび細胞局在化ドメインを含む融合タンパ ク質をコードする組み換えDNA構築物。 45.FKBPドメイン含有タンパク質と共に、ラパマイシンよりも優位にラパマイシ ン類似体と三成分複合体を形成する1または2以上のFRBドメイン含有する融合 タンパク質をコードする組み換えDNA構築物。
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