JP2002311027A - ビーズ、ビーズ製造方法、フローサイトメータ及びプログラム - Google Patents
ビーズ、ビーズ製造方法、フローサイトメータ及びプログラムInfo
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Abstract
崩壊することなく安定しており、なおかつ単一波長の光
を照射することで励起され複数蛍光を発光可能であって
フローサイトメータにより識別することができるビー
ズ、ビーズ製造方法、そのためのフローサイトメータ及
びプログラムを提供すること。 【解決手段】 ポリスチレンビーズ11に半導体ナノ微
粒子12を蛍光試薬として染色することにより、ビーズ
の識別を行うのと同時にレポーター用の検出用にも蛍光
波長の異なる半導体ナノ微粒子16を使用し、遺伝子の
SNP特定、モニタリング、またはタンパク質などの生
体高分子の濃度を求めることを可能ならしめる。半導体
ナノ微粒子は、粒径を制御することにより、その蛍光波
長が変動し、また、半導体であるために通常の蛍光試薬
と比較した場合の耐久度が高い特徴をもつ。
Description
ucleotide Polymorphism:一塩基変異多型)の検出のた
めのプローブなどの標識として用いて好適なビーズ、そ
のビーズ製造方法、そのビーズを検出するフローサイト
メータ及びそのフローサイトメータに用いるプログラム
に関する。
内に存在する粒子状の物質、たとえば赤血球や白血球と
いった形状をしらべるためのツールとして知られてい
る。図6は、従来のフローサイトメトリーの概略構成を
示す図である。粒子状のサンプルを含む溶液は筒状の管
31に注ぎ込まれ(サンプルインジェクション)、その
管からサンプルが流れ出ると、その周りを流れるシース
液による流体力学的絞りによりサンプル流は細く絞ら
れ、これら粒子状の物質の粒子一つ一つが測定を行う際
に重複しないように流量を調整し、細い管の中の粒子状
のサンプルにレーザー32からレーザー光を照射する。
が放射され、フィルター33、34で蛍光波長を分離
し、それぞれの蛍光波長に関してPMT(光電子増倍管)
35、36等でその蛍光強度を求める。さらに、前方散
乱光及び側方散乱光をフォトダイオード37、38によ
って検出する。
した測定結果を示す図である。FL1には蛍光物質としてF
ITC(イソチオシアン酸フルオレセイン)、FL2には蛍光
物質としてPE(フィコエリスリン)を用いて測定した。
それぞれの蛍光物質は通常は抗体などのタンパク質と結
合させておき、細胞表面に存在する抗原部位との抗原抗
体反応により、抗原部位に反応した抗体-蛍光物質から
放射される蛍光を定量的に測定することにより、細胞表
面に存在する抗原の割合を間接的に測定することが可能
である。
の代わりに担体としてポリスチレンのビーズを使用し、
ビーズの識別をフローサイトメトリーの技術を使用して
行うという試みがされており、実際に製品化した商品も
販売されている。これらのビーズは、あらかじめ濃度を
変化させた蛍光物質で染色することで、フローサイトメ
ータのFL1やFL2で測定を行い、FL1,FL2の濃度差によ
り、ビーズの識別を行うという技術である。
メトリーで使用してきた蛍光物質としてPEやFITCが存在
し、最近では市販品としてUVレーザーを搭載したフロ
ーサイトメータも登場し、DAPI(4‘−6−ジイミド−
2−フェニルインドール)やヘキストダイ(ビスベンズ
イミドH33258)といったものも励起、測定できる
ようになった。
レーザー光はもちろん、通常の太陽光にも弱く、光に暴
露することによって物質が崩壊し、蛍光強度が弱くなる
といった欠点を持ち合わせている。それゆえに、前述で
ビーズを蛍光試薬で染色した場合においても同様の欠点
を有し、その保存には遮光や冷凍を要し、注意を払わね
ばならない。
学的に安定であり、光を浴びても崩壊することなく安定
しており、なおかつ単一波長の光を照射することで励起
され複数蛍光を発光可能であってフローサイトメータに
より識別することができるビーズ、ビーズ製造方法、そ
のためのフローサイトメータ及びプログラムを提供する
ことを目的とする。
が1〜10nmである半導体ナノ微粒子を表面に有する。
また、前記半導体ナノ微粒子は、電磁波による励起によ
り複数の波長でピークを有する光を発光するように複数
の粒径のものから成ることで、多くのビーズを識別する
ことができる。
表面にDNAを共有結合するステップと、所望のmRN
Aを鋳型とし、前記DNAをプライマーとし、少なくと
も1種類の塩基に標識を施した塩基を材料として逆転写
反応を行ってビーズ表面に前記標識をレポーターとして
導入するステップとを備える。これにより、目的とする
mRNAの定量を行うことが可能となる。
表面にDNAを共有結合するステップと、所望のmRN
A又はcDNAを鋳型とし、前記DNAをプライマーと
し、少なくとも1種類の塩基に標識を施した塩基を材料
としてPCRを行ってビーズ表面に前記標識をレポータ
ーとして導入するステップとを備える。これにより、少
量しか発現していないmRNAの定量を行うことが可能
となる。
に置換基が存在する塩基をビーズ表面に固定し、ビーズ
を生物反応器内に充填した後に、前記置換基に対してさ
らに塩基を連結結合することによりDNA合成を固相ビ
ーズ上で行うことで、通常はDNA合成とビーズへの共
有結合を1つの反応器の中で行うことが可能となり、ビ
ーズチップの生産能を増す。
ンプルを励起するUVレーザー光を発光するUVレーザ
ーと、サンプルから発光される複数の蛍光をそれぞれ検
出する複数の蛍光検出手段と、該蛍光検出手段からの出
力信号を、ビーズ識別用とレポーター検出用とに切換え
る切換え手段と、を備える。
ルを励起するUVレーザー光を発光するUVレーザー
と、サンプルから発光される複数の蛍光をそれぞれ検出
する複数の蛍光検出手段と、該蛍光検出手段からの出力
信号を、ビーズ識別用とレポーター検出用とに切換える
切換え手段と、を備えるフローサイトメータとして機能
させるためのプログラムである。
が生産可能となり生体高分子への結合も応用可能なこと
が証明された(Sience,vol.281,p2013(1998年))。半導
体ナノ微粒子は、その性質として粒径により蛍光波長が
可変するという特徴を有する無機化合物である。また、
励起するためのエネルギーはバンドギャップを超えるエ
ネルギーを与えれば励起可能なために、通常の半導体ナ
ノ微粒子はUV側の高エネルギーを出力するレーザーで
多種の粒径の半導体ナノ微粒子を励起することが可能で
ある。
法が報告されており、蒸着法、有機化学的合成法、マイ
クロ波を利用した作成方法(特許第3005683号公
報参照)などがある。半導体のナノ微粒子を蛍光物質と
して利用するためには、蛍光波長がシャープに発光する
必要性があり、そのためには粒径の均一な半導体ナノ微
粒子を作成する必要がある。
蛍光波長とナノ微粒子の粒径との関係を示す図である。
本発明では上述のような方法などにより、半導体ナノ微
粒子を作成し、ポリスチレン製などのビーズの表面に存
在するようにしてビーズの識別をフローサイトメータに
より可能とするためのビーズ、ビーズ製造方法、フロー
サイトメータ及びプログラムを提供する。以下に本発明
の実施の形態を詳細に述べる。
ノ微粒子(4.2nmの粒径と5.5nmの粒径)を用意し、ポリ
スチレンビーズ(0.1μ〜100μmの範囲内で特に1
μm〜10μmの粒径が望ましい)に結合する。この際
のビーズの材料及び結合方法は特に問わない。ここで
は、2種類の蛍光試薬として半導体ナノ微粒子の混合比
を変えて溶媒に溶解した状態で、ポリスチレンビーズに
染色する。
発光される蛍光強度との関係を示す図である。粒径が4.
2nmの半導体ナノ微粒子と粒径が5.5nmの半導体ナノ微粒
子とを混合する。その混合割合を(10:1)から(1
0:7)までに変えて、それぞれポリスチレンビーズA
〜Gを染色する。ビーズA(4.2nm半導体ナノ微粒子:
5.5nm半導体ナノ微粒子=10:1)とビーズB(1
0:2)についてフローサイトメータで測定した結果を
示す。4.2nm半導体ナノ微粒子に相当する570nmの波長に
おける光強度ピークはA、Bの両者ほとんど同じである
が、5.5nm半導体ナノ微粒子に相当する625nmの波長の光
強度ピークは、ビーズAに対してビーズBは570nmの光
強度ピークに対する相対強度がほぼ2倍となっている。
このように570nmの光強度ピークに対する625nmの光強度
ピークの相対強度をシグナルとして、どのビーズである
かの識別を行うことができる。作成したビーズA〜Gに
A,T,C,Gの4塩基のいずれかを固定する。固定し
た後にビーズを反応器に充填し、DNA合成を行う。
合成する方法の概略を示す図である。パラレルアレイ法
では、β-シアノエチル化学反応の連続によってDNA
を合成する。各サイクルは、固定担体2に固定されたフ
ァーストヌクレオチドからトリチル基1をはずして5'-
水素基をフリーにする「脱保護」、DNAを流し込んで
次のヌクレオチドを結合させる「カップリング」、ヌク
レオチドが結合しそこなったところにフタをする「キャ
ッピング」、セカンドヌクレオチドが結合したところを
安定化させる「酸化」(図示せず)、セカンドヌクレオチ
ドの「脱保護」、というような過程を繰り返す。ここで
の固定担体2はビーズである。
よいし、あらかじめ末端の修飾を施した状態でDNAを
合成した後に、ビーズに結合してもかまわない。このよ
うな過程を経て、DNAが表面に共有結合した状態のビ
ーズは、そのDNAとの相補鎖に対してハイブリダイゼ
ーションを行うことができる。
例を示す図である。たとえば、ビーズA上に配列(5'-C
AG GCC AAG TAA CTT CTT CG-3')の合成を、ビーズB上
に配列(5'-TCC TTC TGC ATC CTG TCG GCA-3')の合成
を行う。ビーズA上の配列はルシフェラーゼ(lucifera
se)由来の遺伝子であり、通常の人が発現しているmR
NA中に相補鎖は存在しない。また、ビーズB上の配列
は人のβアクチン遺伝子のmRNAと相補鎖になってお
り、通常の人トータルRNA中のmRNAとハイブリダ
イゼーションを行えることが判明している。βアクチン
は通常どこの細胞ででも発現しているハウスキーピング
遺伝子として広く知られている。
12で染色され、それぞれ異なるDNA13を固定した
ビーズ11を2種を用意し、人由来のトータルRNAと
逆転写酵素を使用し、逆転写反応を行う。この際に使用
する4種類のdNTP(デオキシヌクレオチド)の内、
1種類にビオチンで修飾したdUTP(Biotin-11-dUTP
アマシャムファルマシア RPZ2001)を用い、逆転写反
応を行う。トータルRNAの中にビーズに結合している
DNAの相補鎖が存在すれば、逆転写反応が行われ、ビ
オチン(三角形で図示)で修飾したdUTPが取り込まれ、
ビオチン修飾DNA14が結合されることになる。ここ
までの処理により、ビーズBはビオチンで修飾され、ビ
ーズAはビオチンで修飾されていないことになる。
溶液の中に、2.3nmの半導体ナノ微粒子16をストレプ
トアビジン15に結合したコンジュゲイトを添加する
と、ビオチン-ストレプトアビジンの結合により、ビー
ズBには間接的に2.3nmの半導体ナノ微粒子16が修飾
され、ビーズAには修飾されない。
ルソーサー)で測定した結果を示す図である。図でわか
るとおり、ビーズBの方には結合したレポーターに標識
されている蛍光物質による460nmの蛍光波長が強くでて
いる。これは実験に使用したトータルRNAの中にβア
クチン遺伝子のmRNAが存在することを示している。
また逆にビーズAの方には460nmの蛍光波長がまったく
でていないことより、人由来のトータルRNAにはルシ
フェラーゼ遺伝子のmRNAは発現していないことを示
している。
いような遺伝子に関しては、通常RT−PCR法により
その存在量を測定することができる。RT−PCR法と
は、mRNAの逆転写により作成したcDNAを元にし
て、PCR反応を行う方法である。この方法はPCR反
応を行うことにより、少量しか発現していないmRNA
をDNAの形で増幅を行うことによりその可否を確かめ
る方法である。
るDNAをプライマーとして使用することにより行うこ
とも可能である。PCR反応の際に逆転写反応の際と同
じようにビオチン修飾したdUTPを使用することにより標
識する。その後ストレプトアビジン-半導体ナノ微粒子
(粒径2.3nm)で2次標識を行うことによりUVレーザ
ー搭載のFACSで検出を行うことが可能である。
とに蛍光種を変更できる検出器の概略を示す図である。
ここまでで使用してきた半導体ナノ微粒子は3種類であ
るが、さらに種類を増やすことによりビーズ識別用又は
レポーター検出用に用いる蛍光の数を増やすことが可能
である。また、通常の蛍光試薬は蛍光波長が異なると蛍
光物質を励起するための励起波長も異なるために、ビー
ズ識別用とレポーター検出用の蛍光物質をあらかじめ決
めておく必要があった。しかし、半導体ナノ微粒子の場
合はUVレーザー21による励起によりそれぞれの蛍光
すべてを発光させることが可能であるために、ビーズ識
別用の蛍光とレポーター検出用の蛍光を自在に入れ替え
ることが可能である。
10段階の濃度を識別可能であるとすると、ビーズ識別
用に2色使用した場合は100種類のビーズを識別可能
である。そして、UVレーザーの励起により各半導体ナ
ノ微粒子から発光される蛍光の波長が5段階に切り分け
可能とすると、図5に示すようにビーズを使用したアッ
セイ方法は4種類存在することになる。すなわち、設定
1においては、ビーズ識別用に4種類の蛍光を用いて1
0000種類のビーズを識別し、レポーター検出用に1
種類の蛍光を用いて1種類のレポーターを検出する。設
定2においては、ビーズ識別用に3種類の蛍光を用いて
1000種類のビーズを識別し、レポーター検出用に2
種類の蛍光を用いて2種類のレポーターを検出する。設
定3においては、ビーズ識別用に2種類の蛍光を用いて
100種類のビーズを識別し、レポーター検出用に3種
類の蛍光を用いて3種類のレポーターを検出する。設定
4においては、ビーズ識別用に1種類の蛍光を用いて1
0種類のビーズを識別し、レポーター検出用に4種類の
蛍光を用いて4種類のレポーターを検出する。このよう
に、1つのハードウェア構成に対してソフトウェア的な
制御を施すだけで、それぞれの設定に可変可能である。
用として、判定はオンオフだけでもよいが、ビーズの種
類が多量に必要な場合は設定1を使用し、判定を行いた
い部分は少量であるが、4つの検体に対して同時にアッ
セイを行いたい場合は設定4を使用すればよいことにな
る。なお、本発明は上記実施の形態に限定されるもので
はない。ビーズ表面にDNAを結合するという場合のビ
ーズは半導体ナノ微粒子でもよい。また、本発明のフロ
ーサイトメータは、コンピュータを本フローサイトメー
タとして機能させるためのプログラムでも実現される。
このプログラムは、コンピュータで読み取り可能な記録
媒体に格納されていてもよい。
ローサイトメータに装填されているROMそのものであ
ってもよいし、また、外部記憶装置としてCD−ROM
ドライブ等のプログラム読取装置が設けられ、そこに記
録媒体を挿入することで読み取り可能なCD−ROM等
であってもよい。また、上記記録媒体は、磁気テープ、
カセットテープ、フロッピー(登録商標)ディスク、ハ
ードディスク、MO/MD/DVD等、又は半導体メモ
リであってもよい。
も化学的に安定であり、光を浴びても崩壊することなく
安定しており、なおかつ単一波長の光を照射することで
励起され複数蛍光を発光可能であってフローサイトメー
タにより識別することができるビーズ、ビーズ製造方
法、そのためのフローサイトメータ及びプログラムを提
供することができる。
光強度との関係を示す図である。
の概略を示す図である。
ある。
示す図である。
変更できる検出器の概略を示す図である。
図である。
を示す図である。
ノ微粒子の粒径との関係を示す図である。
Claims (7)
- 【請求項1】 粒径が1〜10nmである半導体ナノ微粒
子を表面に有することを特徴とするビーズ。 - 【請求項2】 前記半導体ナノ微粒子は、電磁波による
励起により複数の波長でピークを有する光を発光するよ
うに複数の粒径のものから成ることを特徴とする請求項
1記載のビーズ。 - 【請求項3】 ビーズ表面にDNAを共有結合するステ
ップと、 所望のmRNAを鋳型とし、前記DNAをプライマーと
し、少なくとも1種類の塩基に標識を施した塩基を材料
として逆転写反応を行ってビーズ表面に前記標識をレポ
ーターとして導入するステップとを備えることを特徴と
するビーズ製造方法。 - 【請求項4】 ビーズ表面にDNAを共有結合するステ
ップと、 所望のmRNA又はcDNAを鋳型とし、前記DNAを
プライマーとし、少なくとも1種類の塩基に標識を施し
た塩基を材料としてPCRを行ってビーズ表面に前記標
識をレポーターとして導入するステップとを備えること
を特徴とするビーズ製造方法。 - 【請求項5】 前記共有結合するステップは、末端に置
換基が存在する塩基をビーズ表面に固定し、ビーズを生
物反応器内に充填した後に、前記置換基に対してさらに
塩基を連結結合することによりDNA合成を固相ビーズ
上で行うことを特徴とする請求項3又は4記載のビーズ
製造方法。 - 【請求項6】 サンプルを励起するUVレーザー光を発
光するUVレーザーと、 サンプルから発光される複数の蛍光をそれぞれ検出する
複数の蛍光検出手段と、 該蛍光検出手段からの出力信号を、ビーズ識別用とレポ
ーター検出用とに切換える切換え手段と、を備えること
を特徴とするフローサイトメータ。 - 【請求項7】 コンピュータを、 サンプルを励起するUVレーザー光を発光するUVレー
ザーと、サンプルから発光される複数の蛍光をそれぞれ
検出する複数の蛍光検出手段と、該蛍光検出手段からの
出力信号を、ビーズ識別用とレポーター検出用とに切換
える切換え手段と、を備えるフローサイトメータとして
機能させるためのプログラム。
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