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JP2000346847A - Method and device for detecting organism-derived material - Google Patents

Method and device for detecting organism-derived material

Info

Publication number
JP2000346847A
JP2000346847A JP2000091713A JP2000091713A JP2000346847A JP 2000346847 A JP2000346847 A JP 2000346847A JP 2000091713 A JP2000091713 A JP 2000091713A JP 2000091713 A JP2000091713 A JP 2000091713A JP 2000346847 A JP2000346847 A JP 2000346847A
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
template
substance
test piece
signal
roi
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
JP2000091713A
Other languages
Japanese (ja)
Inventor
Yasuhiro Tsutamori
康浩 蔦森
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Fujifilm Holdings Corp
Original Assignee
Fuji Photo Film Co Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Fuji Photo Film Co Ltd filed Critical Fuji Photo Film Co Ltd
Priority to JP2000091713A priority Critical patent/JP2000346847A/en
Publication of JP2000346847A publication Critical patent/JP2000346847A/en
Pending legal-status Critical Current

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  • Automatic Analysis And Handling Materials Therefor (AREA)
  • Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Investigating, Analyzing Materials By Fluorescence Or Luminescence (AREA)
  • Investigating Or Analysing Materials By The Use Of Chemical Reactions (AREA)

Abstract

PROBLEM TO BE SOLVED: To make detectable a signal value without preparing a new template when detecting the signal value generated from a spot position of a test piece using a template, even if a test piece with a different spot position is used. SOLUTION: Plural kinds of templates T are stored on a template storing means 12 corresponding to a plurality of kinds of test pieces with different spot position arrangements. For performing analysis with an analyzing means 11, the template T where ROI is placed at a position corresponding to the spot position of a used test piece is read out from the template storing means 12, this template T is set to an image shown by marking data S1, S2, and a signal value at a position corresponding to the ROI of the template T is detected for evaluation.

Description

【発明の詳細な説明】DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION

【0001】[0001]

【発明の属する技術分野】本発明は、DNAの解析や免
疫学的解析に用いられる試験片によって生体由来物質を
検出する方法および装置に関するものである。
BACKGROUND OF THE INVENTION 1. Field of the Invention The present invention relates to a method and an apparatus for detecting a substance derived from a living body using a test piece used for DNA analysis or immunological analysis.

【0002】[0002]

【従来の技術】近年、遺伝子工学分野における技術が急
速に発展し、10万個にも及ぶと考えられているヒトゲ
ノムの塩基配列を解読することを1つの目的とするヒト
ゲノムプロジェクトが展開されている。
2. Description of the Related Art In recent years, the technology in the field of genetic engineering has rapidly developed, and the human genome project has been developed with one object of decoding the base sequence of the human genome, which is thought to reach 100,000. .

【0003】一方、抗原抗体反応を利用する酵素免疫測
定法や蛍光抗体法等が診断や研究のために利用され、ま
た各種遺伝子疾患に影響を与えているDNAを探索する
研究も進んでおり、その1つの方法としてアレイ技術が
注目されている。
On the other hand, enzyme immunoassays and fluorescent antibody methods utilizing antigen-antibody reactions have been used for diagnosis and research, and research has been advanced to search for DNAs affecting various genetic diseases. Array technology has attracted attention as one of the methods.

【0004】このアレイ技術は、図1に示すような、既
に解読されている互いに異なる既知の多数のcDNA
(特異的結合物質の一例)がメンブレンフィルタやスラ
イドガラス等の坦体2上にマトリクス状に高密度に予め
配置されたアレイチップ(DNAチップと称するものも
あるが、ここでは総称してアレイチップとする)を試験
片1として用いる技術であり、例えば、蛍光色素や放射
性同位体からなる標識物質で標識された健常者Aの細胞
由来のDNA(生体由来物質の一例)および上記標識物
質で標識された、遺伝子疾患を有する検体Bの細胞由来
のDNAをそれぞれ別個のアレイチップに滴下して、各
検体A,BのcDNAとアレイチップ上のcDNAとを
ハイブリダイズさせ、後に各アレイチップ上の各cDN
Aに、各標識物質を励起するレーザ光を走査して各cD
NA毎に放出される蛍光や放射線を光検出器で検出し、
アレイチップ上における発光位置(スポット位置)に対
応付けられたこの検出結果を表す標識信号を得、各検体
のcDNAがいずれのcDNAとハイブリダイズされて
いるかを求め、両検体間において得られる標識信号の比
あるいは差を求めることにより、両検体間においてハイ
ブリダイズされたcDNAを比較して、上記疾病により
発現した遺伝子または欠損した遺伝子(以下発現の変化
とする)を特定する技術である。この際、標識信号によ
り表される2つの画像をプリント出力あるいはモニタに
出力して、目視により確認することにより発現の変化を
特定することができる。一方、両検体から得られる標識
信号の比は、発現の変化がある位置において得られるも
のほど大きく(あるいは小さく)なることから、各検体
間における標識信号の比が大きい方から(あるいは小さ
い方から)順に例えば50箇所分のスポット位置におけ
る信号値の比を、その信号が得られた位置と対応付けて
測定結果を表す測定結果表として出力し、この測定結果
表とモニタに表示された画像とに基づいてその信号値が
得られた位置を求め、発現の変化を特定することができ
る。
This array technique uses a large number of different known cDNAs that have already been decoded, as shown in FIG.
An array chip (an example of a specific binding substance) is arranged in a matrix at a high density on a carrier 2 such as a membrane filter or a slide glass in advance. Is used as the test piece 1. For example, a DNA (an example of a biological substance) derived from cells of a healthy individual A, which is labeled with a labeling substance composed of a fluorescent dye or a radioisotope, and labeled with the above labeling substance The DNA derived from the cells of the specimen B having the genetic disease is dropped on separate array chips, and the cDNAs of the specimens A and B are hybridized with the cDNA on the array chip. Each cDN
A is scanned with laser light to excite each labeling substance,
Fluorescence and radiation emitted for each NA are detected with a photodetector,
A label signal representing this detection result associated with the light emission position (spot position) on the array chip is obtained, and to which cDNA the cDNA of each sample is hybridized, a label signal obtained between both samples is obtained. This is a technique of comparing the cDNAs hybridized between the two specimens by determining the ratio or difference between the two, and specifying the gene expressed or deleted due to the above-mentioned disease (hereinafter referred to as a change in expression). At this time, a change in expression can be specified by outputting two images represented by the marker signal to a printout or a monitor and visually confirming them. On the other hand, since the ratio of the label signals obtained from both samples becomes larger (or smaller) at the position where the expression change occurs, the ratio of the label signals between the samples becomes larger (or smaller). ) Sequentially output, for example, a ratio of signal values at 50 spot positions as a measurement result table showing the measurement result in association with the position where the signal was obtained, and output the measurement result table and the image displayed on the monitor. , The position where the signal value is obtained is obtained, and the change in expression can be specified.

【0005】この際、各スポット位置に対応する信号値
は、標識信号により表される画像に対して、スポット位
置に対応する円形のROIが配置されたテンプレートを
設定し、このテンプレートのROIの位置に対応する箇
所における信号値を検出することにより得られるもので
ある。
At this time, the signal value corresponding to each spot position is set to a template in which a circular ROI corresponding to the spot position is arranged for an image represented by the beacon signal, and the position of the ROI of this template is set. Is obtained by detecting a signal value at a location corresponding to.

【0006】[0006]

【発明が解決しようとする課題】しかしながら、上述し
た試験片におけるスポット位置の配置の仕方は、試験片
の製造メーカーや試験の目的などに応じて種々異なるた
め、特定の製造メーカーや特定の試験に用いられる試験
片にのみ対応するテンプレートしか有していない場合
は、他の試験片を用いると、スポット位置とROIの位
置とが対応しないことから、信号値の検出を行うことが
できなくなる。この場合、使用する試験片のスポット位
置に対応する位置にROIが配置された新たなテンプレ
ートを作成すれば信号値の検出を行うことができる。し
かしながら、試験片におけるスポット位置は少ないもの
で500箇所、多いものでは数万箇所もあり、スポット
位置の配置の仕方も試験片毎に種々異なるため、テンプ
レートを作成する作業が非常に煩わしいものとなる。
However, the arrangement of the spot positions in the test piece described above varies depending on the manufacturer of the test piece, the purpose of the test, and the like. When only the template corresponding to the test piece to be used is used, if another test piece is used, the spot value and the ROI position do not correspond to each other, so that the signal value cannot be detected. In this case, the signal value can be detected by creating a new template in which the ROI is arranged at a position corresponding to the spot position of the test piece to be used. However, the number of spot positions on the test piece is as small as 500 and as many as tens of thousands, and the arrangement of the spot positions is variously different for each test piece, so that the operation of creating a template becomes very troublesome. .

【0007】本発明は上記事情に鑑みなされたものであ
り、スポット位置の配置が異なる試験片を用いても、ス
ポット位置における信号値の検出を行うことができる生
体由来物質の検出方法および装置を提供することを目的
とするものである。
The present invention has been made in view of the above circumstances, and provides a method and an apparatus for detecting a substance derived from a living body which can detect a signal value at a spot position even when test pieces having different spot position arrangements are used. It is intended to provide.

【0008】[0008]

【課題を解決するための手段】本発明による生体由来物
質の検出方法は、坦体上の所定の複数位置に互いに異な
る複数の既知の特異的結合物質が配置された試験片にお
ける前記特異的結合物質に、検体の標識物質で標識され
た生体由来物質を結合せしめ、該結合した前記生体由来
物質の標識物質から放出される標識信号により表される
画像を得、前記試験片における前記特的結合物質の配置
位置に対応するROIが配置されたテンプレートを前記
画像上に設定し、該画像の前記ROIに対応する位置に
おける前記標識信号の信号値を検出する生体由来物質の
検出方法において、複数種類のテンプレートを記憶した
テンプレート記憶手段から、前記試験片に対応する種類
のテンプレートを読出し、該読出されたテンプレートに
基づいて、前記信号値を検出することを特徴とするもの
である。
According to the present invention, there is provided a method for detecting a substance derived from a living body, the method comprising the steps of: A substance is bound to a biological substance labeled with a labeled substance of a specimen, and an image represented by a label signal released from the bound labeled substance of the biological substance is obtained, and the specific binding in the test piece is obtained. In a method for detecting a substance derived from a living body, in which a template on which an ROI corresponding to an arrangement position of a substance is arranged is set on the image, and a signal value of the label signal is detected at a position corresponding to the ROI of the image, A template of a type corresponding to the test piece is read out from the template storage means storing the template, and the signal is read based on the read template. It is characterized in that for detecting a value.

【0009】ここで、「ROI」は使用する試験片にお
ける特異的結合物質の配置位置に応じて配置されてお
り、「試験片に対応する種類のテンプレートを読出す」
とは、使用する試験片の特異的結合物質の配置位置に対
応してROIが配置されたテンプレートを読出すことを
いう。
[0009] Here, the "ROI" is arranged according to the arrangement position of the specific binding substance in the test piece to be used, and "reads out the type of template corresponding to the test piece".
"Reading out a template in which the ROI is arranged corresponding to the arrangement position of the specific binding substance of the test piece to be used."

【0010】また、「テンプレートに基づいて信号値を
検出する」とは、テンプレートを標識信号により表され
る画像上に設定し、この画像のROIに対応する位置に
おける標識信号の信号値を検出することをいう。
"Detecting a signal value based on a template" means that a template is set on an image represented by a beacon signal, and a signal value of the beacon signal at a position corresponding to the ROI of the image is detected. That means.

【0011】「担体」とは、特異的結合物質を安定に結
合、点着できるものであればよく、例えばメンブレンフ
ィルタやスライドガラス板等である。これらの担体は特
異的結合物質を安定に結合するために、前処理がなされ
ているものであってもよい。
The "carrier" is not particularly limited as long as it is capable of stably binding and spotting a specific binding substance, and examples thereof include a membrane filter and a slide glass plate. These carriers may be pretreated in order to stably bind the specific binding substance.

【0012】「特異的結合物質」とは、ホルモン類、腫
瘍マーカー、酵素、抗体、抗原、アブザイム、その他の
タンパク、核酸、cDNA、DNA、RNA等であっ
て、生体由来物質と特異的に結合可能な物質を意味す
る。「既知の」とは、特異的結合物質によって異なる
が、例えば核酸であればその塩基配列や塩基の長さ等
が、タンパクであればアミノ酸の組成等が分かっている
ことを意味する。ここで、担体の所定の複数位置に配置
される特異的結合物質は、各位置毎に1種類の特異的結
合物質が配置されていることを意味する。
"Specific binding substance" refers to hormones, tumor markers, enzymes, antibodies, antigens, abzymes, other proteins, nucleic acids, cDNAs, DNAs, RNAs, etc., which specifically bind to biological substances. Mean possible substance. The term "known" means that the nucleotide sequence and length of a nucleic acid are known for a nucleic acid, and the composition of amino acids and the like are known for a protein. Here, the specific binding substance disposed at a plurality of predetermined positions on the carrier means that one type of specific binding substance is disposed at each position.

【0013】「生体由来物質」とは、担体上の所定の位
置に配置された既知の特異的結合物質と特異的に結合す
る物質であって、生体から抽出、単離等された物質を意
味するが、生体から直接抽出されたものだけでなく、こ
れらを化学処理、化学修飾等したものも含まれる。例え
ばホルモン類、腫瘍マーカー、酵素、抗体、抗原、アブ
ザイム、その他のタンパク、核酸、cDNA、DNA、
mRNA等の物質である。
The term "substance derived from a living body" refers to a substance that specifically binds to a known specific binding substance placed at a predetermined position on a carrier, and is extracted and isolated from a living body. However, not only those directly extracted from a living body but also those obtained by chemically treating or chemically modifying these are included. For example, hormones, tumor markers, enzymes, antibodies, antigens, abzymes, other proteins, nucleic acids, cDNA, DNA,
It is a substance such as mRNA.

【0014】「標識物質」とは、生体由来物質から情報
を得るためにこれらの一部を改変し、あるいはこれらに
直接付加される、目印となる物質を意味する。標識物質
は、標識物質から放出される標識信号が検出でき、かつ
生体由来物質に取り込まれる規則性が予め分かっている
ものであれば特に限定されるものではない。例えばサイ
バーグリーンII、Cy5、フルオレセインイソチオシア
ネート等の蛍光色素や 32P、33P等の放射性同位体
を用いることが好ましい。
"Labeled substance" means information derived from a biological substance.
Modify some of them to obtain
It refers to a substance that is directly added and serves as a mark. Labeling substance
Can detect the label signal emitted from the labeling substance, and
Predetermined regularity incorporated into biological substances
It is not particularly limited as long as it is one. For example, rhino
Bargreen II, Cy5, fluorescein isothiocyan
Fluorescent dyes such as 32P,33Radioactive isotopes such as P
It is preferable to use

【0015】「標識信号」とは、例えば標識物質が蛍光
色素である場合には蛍光、標識物質が放射性同位体であ
る場合には放射線のように、標識物質から放出、あるい
は出力されるものを光検出器あるいは放射線検出器にお
いて検出することにより得られる信号のことをいう。
The term "label signal" refers to a signal emitted from or output from a labeling substance, such as fluorescence when the labeling substance is a fluorescent dye and radiation when the labeling substance is a radioisotope. A signal obtained by detecting with a light detector or a radiation detector.

【0016】「生体由来物質を特異的結合物質に結合」
とは、例えばDNAやRNA等で見られる相補的なヌク
レオチド配列の間に安定な二重鎖が形成されるような場
合(ハイブリダイゼーション)や、抗原と抗体、ビオチ
ンとアビジン等のように、特定の物質とのみ選択的に反
応する極めて特異性の高い結合を意味する。
"Binding a biological substance to a specific binding substance"
For example, when a stable double strand is formed between complementary nucleotide sequences found in DNA or RNA (hybridization), or when a specific nucleotide such as an antigen and an antibody or biotin and avidin is used. Means a highly specific binding that selectively reacts only with the substance.

【0017】なお、本発明による生体由来物質の検出方
法においては、新たなテンプレートを作成し、該新たな
テンプレートを前記テンプレート記憶手段に記憶するこ
とが好ましい。
In the method for detecting a substance derived from a living body according to the present invention, it is preferable that a new template is created and the new template is stored in the template storage means.

【0018】本発明による生体由来物質の検出装置は、
坦体上の所定の複数位置に互いに異なる複数の既知の特
異的結合物質が配置された試験片における前記特異的結
合物質に、検体の標識物質で標識された生体由来物質を
結合せしめ、該結合した前記生体由来物質の標識物質か
ら放出される標識信号により表される画像を得、前記試
験片における前記特的結合物質の配置位置に対応するR
OIが配置されたテンプレートを前記画像上に設定し、
該画像の前記ROIに対応する位置における前記標識信
号の信号値を検出する解析手段を備えた生体由来物質の
検出装置において、複数種類のテンプレートを記憶した
テンプレート記憶手段と、該テンプレート記憶手段から
前記試験片に対応する種類のテンプレートを読出す読出
手段とを備え、前記解析手段は、前記読出されたテンプ
レートに基づいて、前記信号値を検出する手段であるこ
とを特徴とするものである。
An apparatus for detecting a biological substance according to the present invention comprises:
A plurality of known specific binding substances, which are different from each other, are arranged at predetermined plural positions on a carrier, and the specific binding substance is bound to a biological substance labeled with a labeling substance of a specimen. An image represented by a labeling signal emitted from the labeled substance of the biological substance is obtained, and R corresponding to the position of the specific binding substance on the test piece is obtained.
Setting a template on which the OI is arranged on the image,
In a biological substance detection apparatus including an analysis unit that detects a signal value of the label signal at a position corresponding to the ROI of the image, a template storage unit that stores a plurality of types of templates; and Reading means for reading a template of a type corresponding to the test piece, wherein the analyzing means is means for detecting the signal value based on the read template.

【0019】なお、本発明による生体由来物質の検出装
置においては、新たなテンプレートを作成し、該新たな
テンプレートを前記テンプレート記憶手段に記憶するテ
ンプレート作成手段をさらに備えることが好ましい。
It is preferable that the apparatus for detecting a substance derived from a living body according to the present invention further includes a template creating means for creating a new template and storing the new template in the template storage means.

【0020】[0020]

【発明の効果】本発明によれば、複数種類のテンプレー
トを記憶したテンプレート記憶手段から、試験片に対応
する種類のテンプレートを読出して信号値の検出を行う
ようにしたため、使用する可能性のある試験片に対応す
るテンプレートをテンプレート記憶手段に記憶しておけ
ば、どのような試験片を用いても、新たなテンプレート
を作成することなく、標識信号から特的結合物質が配置
された位置における信号値を検出することができる。
According to the present invention, a template of a type corresponding to a test piece is read out from the template storage means storing a plurality of types of templates to detect a signal value, so that there is a possibility of use. If the template corresponding to the test piece is stored in the template storage means, no matter what kind of test piece is used, the signal at the position where the specific binding substance is located can be obtained from the label signal without creating a new template. The value can be detected.

【0021】また、試験片における特的結合物質の配置
がテンプレート記憶手段に記憶されたテンプレートにな
いものであっても、新たなテンプレートを作成可能とす
ることにより、この試験片からも特異的結合物質が配置
された位置における信号値を検出することができる。こ
の場合、テンプレートを作成する手間がかかるが、新た
に作成したテンプレートをテンプレート記憶手段に記憶
しておけば、これと同一の試験片を使用した場合に直ち
にこの試験片から信号値を検出することができる。
Further, even if the arrangement of the specific binding substance in the test piece is not in the template stored in the template storage means, the new template can be created so that the specific binding can be performed from this test piece. The signal value at the position where the substance is located can be detected. In this case, it takes time to create a template, but if the newly created template is stored in the template storage means, the signal value can be immediately detected from this test piece when the same test piece is used. Can be.

【0022】[0022]

【発明の実施の形態】以下図面を参照して本発明の実施
形態について説明する。
Embodiments of the present invention will be described below with reference to the drawings.

【0023】図1は本発明の実施形態に用いられる試験
片を示す図である。図1に示すように、本実施形態に用
いられる試験片1は、メンブレンフィルタやスライドガ
ラス等の坦体2の所定の複数位置に互いに異なる複数の
既知のcDNA(特異的結合物質として)が配置されて
なるものである。なお、坦体2に配置されるcDNAは
既にその塩基配列が解読されている互いに異なるDNA
にそれぞれ対応したものであり、坦体2上におけるその
配置位置は予め定められている。また、坦体2に配置さ
れるcDNAの位置(以下スポット位置とする)は、試
験片1のメーカー毎に異なるものとされている。
FIG. 1 is a view showing a test piece used in the embodiment of the present invention. As shown in FIG. 1, a test piece 1 used in the present embodiment has a plurality of known cDNAs (as specific binding substances) different from each other at predetermined positions on a carrier 2 such as a membrane filter or a slide glass. It has been done. The cDNAs arranged on the carrier 2 are different DNAs whose base sequences have already been decoded.
And the arrangement position on the carrier 2 is predetermined. Further, the position of the cDNA (hereinafter referred to as a spot position) arranged on the carrier 2 is different for each manufacturer of the test piece 1.

【0024】次に図2を用いて、図1に示した試験片1
の読取装置について説明する。図示の読取装置100
は、後述する2種類の試験片1,1′の読取装置の一実
施形態であり、上述した多数の既知の互いに異なるcD
NAが配置されている2つの試験片1,1′のそれぞれ
に、互いに異なる2つの検体A,Bの蛍光色素で標識さ
れたcDNA(生体由来物質として)をハイブリダイズ
させたものを載置して所定の位置に設置する透明な試料
台20と、蛍光色素を励起するのに適した発光波長のレ
ーザ光L1を発光するレーザ光源21と、試験片1,
1′の蛍光色素が励起されて発光した蛍光を光電的に検
出するフォトマルチプライヤ(以下PMTという)90
と、レーザ光源21から出射されたレーザ光L1を、試
料台20に載置された試験片1,1′に照射させるとと
もに、この照射により試験片1,1′から出射する蛍光
K1,K2をPMT90に導光させる光学ヘッド50
と、光学ヘッド50を矢印X方向に等速移動させる主走
査手段60と、レーザ光源21、光学ヘッド50および
PMT90を一体的に矢印Y方向(矢印X方向に直行す
る方向)に移動させる副走査手段70と、PMT90に
より検出された検出信号を対数増幅する増幅器91と、
この増幅された検出信号をA/D変換して標識データS
1,S2を得るA/D変換器92と、試験片1,1′間
において、互いに対応するスポット位置における標識デ
ータS1,S2を比較して比較結果を算出する解析装置
93と、レーザ光L1を出射させる制御を行うコントロ
ールユニット95とを備えた構成である。なお、標識デ
ータS1,S2は試験片1,1′における検体A,Bが
ハイブリダイズされた各スポット位置において得られる
信号値の全体を総称するものである。
Next, referring to FIG. 2, the test piece 1 shown in FIG.
Will be described. The illustrated reading device 100
Is an embodiment of an apparatus for reading two types of test strips 1 and 1 ', which will be described later.
On each of the two test strips 1 and 1 'on which NA is arranged, a sample obtained by hybridizing cDNA (as a biological substance) labeled with a fluorescent dye of two different specimens A and B is placed. A transparent sample stage 20 installed at a predetermined position, a laser light source 21 emitting a laser beam L1 having an emission wavelength suitable for exciting a fluorescent dye,
A photomultiplier (hereinafter referred to as PMT) 90 for photoelectrically detecting fluorescence emitted by excitation of the 1 'fluorescent dye.
And the laser beam L1 emitted from the laser light source 21 is applied to the test pieces 1, 1 'mounted on the sample table 20, and the fluorescent light K1, K2 emitted from the test pieces 1, 1' by this irradiation is emitted. Optical head 50 for guiding light to PMT 90
Main scanning means 60 for moving the optical head 50 at a constant speed in the direction of the arrow X, and sub-scanning for integrally moving the laser light source 21, the optical head 50 and the PMT 90 in the direction of the arrow Y (the direction perpendicular to the direction of the arrow X). Means 70; an amplifier 91 for logarithmically amplifying the detection signal detected by the PMT 90;
The amplified detection signal is A / D-converted and labeled data S
A / D converter 92 that obtains S1 and S2, analysis device 93 that compares label data S1 and S2 at spot positions corresponding to each other between test pieces 1 and 1 ′ and calculates a comparison result, and laser beam L1 And a control unit 95 for controlling emission of light. Note that the label data S1 and S2 collectively refer to the entire signal value obtained at each spot position where the specimens A and B in the test pieces 1 and 1 'are hybridized.

【0025】検体Aは健常者であり、検体Bは所定の遺
伝子疾病を有する者である。各試験片1,1′には上述
したように、多数の既知の互いに異なるcDNAが所定
スポット位置に配置されており、さらにこの試験片1,
1′に上記各検体A,Bの細胞由来の各cDNAがピペ
ット等でスポットされ、試験片1,1′上の多数のcD
NAのうち、各検体A,Bの各cDNAに対応する(相
補的な)cDNAはこれらのcDNAとハイブリダイズ
されている。そして所定の溶液で、いずれかの検体のc
DNAとハイブリダイズされたcDNAを残して、いず
れの検体のcDNAともハイブリダイズされていないc
DNAは洗浄されている。
Sample A is a healthy person, and sample B is a person having a predetermined genetic disease. As described above, a number of known and different cDNAs are arranged at predetermined spot positions on each test piece 1, 1 '.
1 ′, each cDNA derived from the cells of the above-mentioned specimens A and B is spotted with a pipette or the like, and a large number of cD
Among the NAs, cDNAs (complementary) corresponding to the cDNAs of the specimens A and B are hybridized with these cDNAs. Then, with a predetermined solution, c
The cDNA not hybridized with the cDNA of any sample, except for the cDNA hybridized with the DNA
DNA has been washed.

【0026】ここで、レーザ光源21は例えば波長633n
mのレーザ光L1を出射するHe−Neレーザ、波長532nmの
レーザ光L1を出射するSHGレーザ、波長473nmのレ
ーザ光L1を出射するSHGレーザを用いることができ
る。波長633nmのレーザ光L1は、例えばCy5という
蛍光色素を励起するのに適し、波長532nmのレーザ光L
1は、例えばCy3という蛍光色素を励起するのに適
し、波長473nmのレーザ光L1は、例えばFloresceinと
いう蛍光色素を励起するのに適している。
The laser light source 21 has a wavelength of, for example, 633n.
A He-Ne laser that emits a laser beam L1 of m, an SHG laser that emits a laser beam L1 of a wavelength of 532 nm, and an SHG laser that emits a laser beam L1 of a wavelength of 473 nm can be used. The laser beam L1 having a wavelength of 633 nm is suitable for exciting a fluorescent dye such as Cy5, and the laser beam L1 having a wavelength of 532 nm.
1 is suitable for exciting, for example, a fluorescent dye called Cy3, and the laser beam L1 having a wavelength of 473 nm is suitable for, for example, exciting a fluorescent dye called Florescein.

【0027】次に本実施形態の読取装置100の動作に
ついて説明する。
Next, the operation of the reading apparatus 100 according to this embodiment will be described.

【0028】試料台20上に、検体Aの蛍光色素で標識
されたcDNAがハイブリダイズされた試験片1が載置
され、コントロールユニット95はレーザ光L1を出射
させるようにレーザ光源21を制御し、これにより、レ
ーザ光源21からレーザ光L1が出射される。レーザ光
源21から出射されたレーザ光L1は矢印X方向に進
む。光学ヘッド50の平面ミラー51に入射したレーザ
光L1は図示上方に反射され、孔開きミラー52の小孔
52aを通過してレンズ53に入射し、レンズ53を通
って試料台20上に載置された試験片1の微小領域を照
射する。このとき光学ヘッド50は、主走査手段60に
より高速にかつ等速度で矢印X方向に移動させられてお
り、レーザ光L1は試験片1を矢印X方向に主走査する
ため、この主走査中に、レーザ光L1が照射された微小
領域に存在するcDNAに対しては、照射されたレーザ
光L1により蛍光色素が励起されて蛍光K1を発光す
る。
The test piece 1 on which the cDNA labeled with the fluorescent dye of the sample A is hybridized is placed on the sample table 20, and the control unit 95 controls the laser light source 21 so as to emit the laser light L1. Thus, the laser light L1 is emitted from the laser light source 21. The laser light L1 emitted from the laser light source 21 travels in the direction of the arrow X. The laser beam L1 incident on the plane mirror 51 of the optical head 50 is reflected upward in the drawing, passes through the small hole 52a of the perforated mirror 52, enters the lens 53, passes through the lens 53, and is placed on the sample stage 20. A small area of the test piece 1 is irradiated. At this time, the optical head 50 is moved at high speed and at a constant speed in the arrow X direction by the main scanning means 60, and the laser beam L1 main-scans the test piece 1 in the arrow X direction. The fluorescent dye is excited by the irradiated laser light L1 for the cDNA existing in the minute region irradiated with the laser light L1, and emits the fluorescent light K1.

【0029】レーザ光L1で発光した蛍光K1は試験片
1の下面から広がって出射し、出射した蛍光K1は、光
学ヘッド50のレンズ53により図示下方のビームとさ
れ、同じく光学ヘッド50の孔開きミラー52に入射す
る。蛍光K1は孔開きミラー52の反射面で反射され、
矢印X方向に沿った方向に進行する。矢印X方向に進行
した蛍光K1はPMT90に入射する。PMT90に入
射した蛍光K1は、それぞれPMT90により増幅され
て光電検出され、対応する電気信号として読み取られ、
対数増幅器91により増幅され、A/D変換器92によ
りデジタル信号化される。
The fluorescent light K1 emitted by the laser light L1 spreads out from the lower surface of the test piece 1 and is emitted. The emitted fluorescent light K1 is converted into a lower beam in the figure by the lens 53 of the optical head 50. The light enters the mirror 52. The fluorescence K1 is reflected by the reflection surface of the perforated mirror 52,
It proceeds in the direction along the arrow X direction. The fluorescence K1 that has progressed in the direction of the arrow X enters the PMT 90. The fluorescence K1 incident on the PMT 90 is amplified by the PMT 90, photoelectrically detected, and read as a corresponding electric signal,
The signal is amplified by a logarithmic amplifier 91 and converted into a digital signal by an A / D converter 92.

【0030】このようにして1主走査による読取りが終
了すると、光学ヘッド50は主走査手段60により元の
位置まで戻され、一方その間に、副走査手段70がレー
ザ光源21、光学ヘッド50およびPMT90を一体的
に矢印Y方向に副走査させる。そして、以上の主走査と
副走査とを繰り返すことにより、試験片1の全面に亘っ
てレーザ光L1が照射され、試験片1の各スポット位置
に対応した蛍光K1がデジタル信号化され標識データS
1として取得され、解析装置93に入力される。
When reading by one main scanning is completed in this way, the optical head 50 is returned to the original position by the main scanning means 60, while the sub-scanning means 70 is operated by the laser light source 21, the optical head 50 and the PMT 90. Are integrally sub-scanned in the arrow Y direction. By repeating the main scanning and the sub-scanning described above, the entire surface of the test piece 1 is irradiated with the laser light L1, the fluorescence K1 corresponding to each spot position on the test piece 1 is converted into a digital signal, and the label data S
1 and input to the analyzer 93.

【0031】主走査、副走査を終え試験片1から標識デ
ータS1が取得されると、光学ヘッド50は最初の位置
まで戻され、次に検体Bの蛍光色素で標識されたcDN
Aがハイブリダイズされた試験片1′が試料台20上に
載置され、試験片1と同様に読取りが行われて標識デー
タS2が取得され、解析装置93に入力される。
After the main scan and the sub-scan are completed and the label data S1 is obtained from the test piece 1, the optical head 50 is returned to the initial position, and then the cDN labeled with the fluorescent dye of the specimen B
The test piece 1 ′ hybridized with A is placed on the sample table 20, read in the same manner as the test piece 1, and the label data S 2 is obtained and input to the analyzer 93.

【0032】図3は解析装置93の構成を示す概略ブロ
ック図である。図3に示すように解析装置93は、標識
データS1,S2を読み込む読込手段10と、標識デー
タS1,S2を解析して測定結果表Hを出力する解析手
段11と、解析手段11において解析を行う際に必要と
なるテンプレートTを、使用する試験片1,1′の種類
に応じて複数記憶したテンプレート記憶手段12と、後
述するようにテンプレートTによりアドレスが対応付け
られた標識データS1,S2を格納する画像格納手段1
3と、測定結果表Hを格納する測定結果格納手段14
と、測定結果表Hおよび画像を表示するモニタ15と、
種々の入力を行うキーボードおよびマウスからなる入力
手段16と、後述するように選択された測定結果に対応
するスポット位置の画像を画像データS4,S5として
画像格納手段13から読出す読出手段17とを備える。
FIG. 3 is a schematic block diagram showing the configuration of the analyzer 93. As shown in FIG. 3, the analyzing device 93 reads the sign data S1 and S2, the analyzing means 11 which analyzes the sign data S1 and S2 and outputs the measurement result table H, and the analyzing means 11 A template storage means 12 storing a plurality of templates T required for the execution according to the types of the test pieces 1 and 1 'to be used, and marker data S1 and S2 associated with addresses by the templates T as described later. Image storing means 1 for storing
3 and a measurement result storage means 14 for storing a measurement result table H
A monitor 15 for displaying the measurement result table H and an image,
Input means 16 comprising a keyboard and a mouse for performing various inputs, and reading means 17 for reading an image of a spot position corresponding to the selected measurement result from the image storage means 13 as image data S4 and S5 as described later. Prepare.

【0033】テンプレート記憶手段12には、試験片
1,1′のスポット位置に対応する複数の円形のROI
を有するテンプレートTが複数記憶されている。すなわ
ち、試験片1,1′におけるスポット位置の配置は試験
片1,1′の製造メーカーや試験の目的などに応じて種
々異なるものであり、使用される試験片1,1′の種類
に応じて例えば図4から図6に示すように複数のテンプ
レートTがテンプレート記憶手段12に記憶されてい
る。なお、図4から図6に示すテンプレートTにおいて
円形部分がスポット位置に対応するROIとなってい
る。
The template storage means 12 stores a plurality of circular ROIs corresponding to the spot positions of the test pieces 1 and 1 '.
Are stored. That is, the arrangement of the spot positions on the test pieces 1 and 1 'varies depending on the manufacturer of the test pieces 1 and 1', the purpose of the test, and the like, and depends on the type of the test pieces 1 and 1 'used. For example, as shown in FIGS. 4 to 6, a plurality of templates T are stored in the template storage unit 12. In the template T shown in FIGS. 4 to 6, a circular portion is an ROI corresponding to a spot position.

【0034】また、テンプレートTの各ROIにはアド
レス番号が付与されている。例えば図4に示すテンプレ
ートにおいては、テンプレートTがField1〜6の6つ
のフィールドに分割されており、各フィールドにおいて
4×4のROIブロックが16×24個存在する。この
ROIブロックにはXY両方向においてそれぞれa〜
p、1〜24のアドレス番号が付与されており、このR
OIブロックの位置は各フィールドにおいて例えばa−
1として表すことができる。さらに、ROIブロックに
は8種類のcDNAが1組ずつ配置されており、同一の
cDNAが配置されたスポット位置には同一のパターン
番号が付与されている。したがって、例えばROIブロ
ックにおけるパターン番号が「2」であった場合、図4
に示すテンプレートにおいては、ROIは例えば「Fiel
d1,a−1,2」をアドレス番号としてその位置を特
定することができる。
An address number is assigned to each ROI of the template T. For example, in the template shown in FIG. 4, the template T is divided into six fields of Fields 1 to 6, and each field has 16 × 24 4 × 4 ROI blocks. This ROI block has a to a in both XY directions.
p, 1 to 24 are assigned.
The position of the OI block is, for example, a-
It can be represented as 1. Further, one set of eight types of cDNAs is arranged in the ROI block, and the same pattern number is assigned to the spot position where the same cDNA is arranged. Therefore, for example, when the pattern number in the ROI block is “2”, FIG.
In the template shown in FIG.
The position can be specified using “d1, a-1, 2” as the address number.

【0035】また、図5に示すテンプレートは、Field
1,2の2つのフィールドに分割されており、各フィー
ルドがさらにA〜Hの8つの領域に分割されている。各
領域においては12×30個のROIが存在する。この
ROIにはXY両方向においてそれぞれa〜l、1〜3
0のアドレス番号が付与されており、図5に示すテンプ
レートにおいて、ROIは例えば「Field1,B,a−
1」をアドレス番号としてその位置を特定することがで
きる。
The template shown in FIG.
The field is divided into two fields of 1 and 2, and each field is further divided into eight areas A to H. In each region, there are 12 × 30 ROIs. The ROI has al to l, 1 to 3 in both XY directions.
0 is assigned, and in the template shown in FIG. 5, the ROI is, for example, “Field1, B, a-
The position can be specified by using "1" as the address number.

【0036】さらに、図6に示すテンプレートは、A〜
Fの6つの領域に分割されており、各領域においては2
×14個のROIブロックがX方向に7組存在する。R
OIブロックにおいてはY方向にa〜mのアドレス番号
が付与されており、ROIブロックはX方向に1〜7の
アドレス番号が付与されている。なお、図6に示すテン
プレートにおいては、ROIブロックの番号が同一の場
合はそこは同一のcDNAが配置されてなるものであ
る。したがって、図6に示すテンプレートにおいて、R
OIは例えば「A,1−a」をアドレス番号としてその
位置を特定することができる。
Further, the template shown in FIG.
F is divided into six areas, and in each area, 2
There are seven sets of × 14 ROI blocks in the X direction. R
In the OI block, address numbers a to m are assigned in the Y direction, and in the ROI block, address numbers 1 to 7 are assigned in the X direction. In the template shown in FIG. 6, when the numbers of the ROI blocks are the same, the same cDNA is arranged there. Therefore, in the template shown in FIG.
The OI can specify its position using, for example, “A, 1-a” as an address number.

【0037】次いで、解析装置93の動作について説明
する。まず、使用した試験片1,1′の種類を入力手段
16から解析手段11に入力すると、解析手段11にお
いて、試験片1,1′のスポット位置に対応するROI
が配置されたテンプレートTをテンプレート記憶手段1
2から読出し、標識データS1,S2により表される画
像上にテンプレートTをそれぞれ配置する。なお、本実
施形態においては図4に示すテンプレートに対応する試
験片1,1′を使用したものとして説明するが、図5あ
るいは図6に示すテンプレートに対応する試験片を用い
た場合は、この試験片に対応するテンプレートTがテン
プレート記憶手段12から読出される。そして、テンプ
レートTにおける円形のROIが画像上のスポット位置
に適合するようにテンプレートTの位置を調節するフィ
ッティングを行う。すなわち、試験片1,1′において
はスポット位置に対応するようにスポットが行われる
が、スポット毎に若干の位置ずれが生じることがある。
したがって、各スポット位置における測定を正確に行う
ためにROIをスポット位置に合わせる操作を行う。具
体的にはテンプレートTを回転、左右上下方向へ移動、
拡大縮小することにより、ROIの位置とスポット位置
とを合わせる。このフィッティングは自動で行ってもよ
いが、標識データS1,S2およびテンプレートTをモ
ニタ15に表示し、入力手段16のマウスを操作して手
動で行ってもよい。なお、このフィッティングの前に、
標識データS1,S2をモニタ15に表示し、検体A,
Bを試験片1,1′にスポットした際のスポットのぼ
け、にじみ、蛍光の発光量が大きいこと、上述したよう
に所定の溶液で洗浄した際に残存する検体のむら等に起
因する、各スポット位置の信号値に異常を有する異常箇
所を除去することが好ましい。そしてこのフィッティン
グにより、各スポット位置にはテンプレートのアドレス
番号に対応するアドレス番号が付与されることとなる。
また、標識データS1,S2により表される画像におい
ては、各画素の位置を座標値として表すことができるた
め、アドレス番号とアドレス番号の中心位置を表す画像
上の座標値との対応付けがなされ、この対応付け結果を
表す対応付け情報が標識データS1,S2に付与され
る。
Next, the operation of the analyzer 93 will be described. First, when the type of the used test piece 1, 1 'is input from the input means 16 to the analysis means 11, the analysis means 11 outputs a ROI corresponding to the spot position of the test piece 1, 1'.
Is stored in the template storage means 1
2 and the template T is arranged on the image represented by the sign data S1 and S2. In this embodiment, the test pieces 1 and 1 'corresponding to the template shown in FIG. 4 will be described. However, when the test pieces corresponding to the template The template T corresponding to the test piece is read from the template storage unit 12. Then, fitting is performed to adjust the position of the template T so that the circular ROI of the template T matches the spot position on the image. That is, spots are formed on the test pieces 1 and 1 'so as to correspond to the spot positions, but a slight displacement may occur for each spot.
Therefore, an operation for adjusting the ROI to the spot position is performed in order to accurately measure at each spot position. Specifically, the template T is rotated, moved left, right, up and down,
By scaling, the position of the ROI and the spot position are matched. This fitting may be performed automatically, or may be performed manually by displaying the sign data S1 and S2 and the template T on the monitor 15 and operating the mouse of the input means 16. Before this fitting,
The label data S1 and S2 are displayed on the monitor 15, and the samples A and
B spots when spots B were spotted on the test pieces 1 and 1 ', each spot caused by a large amount of fluorescence emission, and unevenness of the specimen remaining when washed with a predetermined solution as described above. It is preferable to remove an abnormal part having an abnormality in the signal value of the position. By this fitting, an address number corresponding to the address number of the template is assigned to each spot position.
Further, in the image represented by the sign data S1 and S2, since the position of each pixel can be represented as a coordinate value, the address number is associated with the coordinate value on the image representing the center position of the address number. The association information indicating the association result is added to the sign data S1 and S2.

【0038】そしてこのようにフィッティングが行われ
ると、入力手段16からの指示により各スポット位置に
おける濃度の測定が行われる。具体的には、ROIによ
り囲まれる領域の信号値を積算し、この積算した信号値
をそのスポット位置における濃度値として検出する。こ
の際、背景の濃度値すなわち試験片1,1′の坦体2の
濃度値を検出された濃度値から除去することが好まし
い。そして、標識データS1,S2に設定された全ての
ROIにおいて濃度値が検出されると、標識データS
1,S2間において互いに対応するスポット位置におい
て得られた濃度値の比を求める。ここで、標識データS
1の特定スポット位置において得られる濃度値をN1、
標識データS2においてこの特定スポット位置に対応す
るスポット位置において得られる濃度値をN2とする
と、この比はN2/N1として求められる。そして、こ
の比が大きい順に例えば50箇所分のスポット位置のア
ドレス番号と比の値とを対応付けた測定結果表Hを作成
し、これを測定結果格納手段14に格納する。また、標
識データS1,S2は上記対応付け情報が付与されて画
像格納手段13に格納される。
When the fitting is performed as described above, the density at each spot position is measured according to an instruction from the input means 16. Specifically, the signal values in an area surrounded by the ROI are integrated, and the integrated signal value is detected as a density value at the spot position. At this time, it is preferable to remove the density value of the background, that is, the density value of the carrier 2 of the test pieces 1 and 1 'from the detected density values. When the density values are detected in all the ROIs set in the label data S1 and S2, the label data S
The ratio of density values obtained at spot positions corresponding to each other between S1 and S2 is determined. Here, the sign data S
The density value obtained at one specific spot position is N1,
Assuming that the density value obtained at the spot position corresponding to the specific spot position in the marker data S2 is N2, this ratio is obtained as N2 / N1. Then, a measurement result table H is created in which the address numbers of the 50 spot positions and the values of the ratios are associated with each other, for example, in descending order of the ratio, and stored in the measurement result storage means 14. The sign data S1 and S2 are stored in the image storage unit 13 with the above-mentioned association information added thereto.

【0039】次いで、入力手段16から測定結果表Hお
よび標識データS1,S2を表示する指示がなされる
と、測定結果格納手段14から測定結果表Hが、画像格
納手段13から標識データS1,S2が読出されてモニ
タ15に表示される。図7は測定結果表Hおよび標識デ
ータS1,S2の表示状態を示す図である。図7に示す
ようにモニタ15のウィンドウ40には測定結果表Hの
うち上位7つまでのリストが表示され、スクロールバー
40Aを操作することにより全てのリストをウィンドウ
40に表示することができる。なお、測定結果表Hに
は、そのリストの番号(No.)、フィールド番号(Fi
eld)、XY両方向のアドレス番号(X,Y)、パター
ン番号(Pattern)、求められた比(Ratio)および判断
(Judge)の各項目が設けられている。なお、Judgeの項
目は空欄となっており、ここにオペレータの評価を入力
するものである。また、ウィンドウ41,42には、測
定結果表Hにおいて選択されたリストに対応するスポッ
ト位置の画像G1,G2が表示される。なお、図7にお
いてはNo.3のリストが選択され、このリストにおけ
るスポット位置であるField2、n−13の位置におけ
るROIブロックに対応するスポットブロックの画像が
ウィンドウ41,42に表示された状態を示している。
Next, when an instruction to display the measurement result table H and the sign data S1 and S2 is given from the input means 16, the measurement result table H is sent from the measurement result storage means 14 and the sign data S1 and S2 are sent from the image storage means 13. Is read out and displayed on the monitor 15. FIG. 7 is a diagram showing a display state of the measurement result table H and the label data S1 and S2. As shown in FIG. 7, the top seven lists of the measurement result table H are displayed in the window 40 of the monitor 15, and all the lists can be displayed in the window 40 by operating the scroll bar 40 </ b> A. In the measurement result table H, the number (No.) of the list and the field number (Fi
eld), an address number in both XY directions (X, Y), a pattern number (Pattern), an obtained ratio (Ratio), and a judgment (Judge) are provided. The item of Judge is blank, and the operator's evaluation is input here. In the windows 41 and 42, images G1 and G2 of spot positions corresponding to the list selected in the measurement result table H are displayed. Note that in FIG. The list of No. 3 is selected, and the image of the spot block corresponding to the ROI block at the position of Field 2, n-13, which is the spot position in this list, is displayed in the windows 41, 42.

【0040】オペレータはこのように表示された測定結
果表Hおよび画像G1,G2を観察し、その評価を測定
結果表HのJudgeの欄に入力する。なお、この評価とし
ては測定結果と画像の状態とから目的の遺伝子が発現し
ていることを表す「Good」、目的の遺伝子が発現し
ていないことを表す「NG」および判断が付かないこと
を表す「?」の文字を入力手段16から入力することに
より行う。ここで、評価の入力は例えばキーボードの
「G」を押下すると「Good」と入力され、「N」を
押下すると「NG」と入力されるようにすることが好ま
しい。そして、順次リストを選択することにより、画像
G1,G2と測定結果表Hとを参照して評価を行う。
The operator observes the measurement result table H and the images G1 and G2 displayed as described above, and inputs the evaluation into the Judge column of the measurement result table H. In this evaluation, “Good” indicating that the target gene is expressed, “NG” indicating that the target gene is not expressed, and “No judgment” are given based on the measurement result and the state of the image. This is performed by inputting the character "?" Here, it is preferable that the input of the evaluation is such that, for example, when "G" on the keyboard is pressed, "Good" is input, and when "N" is pressed, "NG" is input. Then, by sequentially selecting the list, the evaluation is performed with reference to the images G1 and G2 and the measurement result table H.

【0041】このように、本実施形態によれば、複数種
類のテンプレートを記憶したテンプレート記憶手段12
から、使用した試験片1,1′のスポット位置に対応す
るROIが配置されたテンプレートTを読出すようにし
たため、使用する可能性のある試験片に対応する複数種
類のテンプレートをテンプレート記憶手段12に記憶し
ておけば、どのような試験片を用いても、テンプレート
Tを新たに作成することなく、標識データS1,S2か
らスポット位置における濃度値を検出することができ
る。
As described above, according to the present embodiment, the template storage means 12 storing a plurality of types of templates.
, The template T in which the ROIs corresponding to the spot positions of the used test pieces 1 and 1 ′ are read out, so that a plurality of types of templates corresponding to the test pieces that may be used are stored in the template storage unit 12. , It is possible to detect the density value at the spot position from the label data S1 and S2 without newly creating a template T, no matter what test piece is used.

【0042】なお、上記実施形態においては、使用した
試験片1,1′のスポット位置に対応するROIが配置
されたテンプレートがテンプレート記憶手段12に記憶
されていない場合がある。このため、テンプレート記憶
手段12に新たなテンプレートを作成するためのテンプ
レート作成手段を設け、試験片1,1′のスポット位置
に応じてROIを配置した新たなテンプレートを作成す
るようにしてもよい。この場合、スポット位置の属性と
して、マトリクス状にスポットを配置した1レイヤーあ
るいは図4に示すように4×4のスポットブロックを複
数配置した2レイヤー等のレイヤー数、スポット数、ス
ポットブロック数、アドレスの表現方法、Field数、Fie
ld内のスポット数、図6に示すようにペアとなるスポッ
トの有無、ペアスポットの番号、スポットが信号値検出
用であるか、位置決め用であるか、スポットがなされな
いものであるかなどのスポット毎の測定属性など、種々
のものがあり、この属性が試験片の製造メーカーによっ
て異なるものである。したがって、テンプレート作成手
段は、これらの属性を考慮してテンプレートを作成可能
なものとすることが好ましい。
In the above embodiment, the template in which the ROIs corresponding to the spot positions of the test pieces 1 and 1 'used are not stored in the template storage means 12 in some cases. Therefore, a template creating means for creating a new template may be provided in the template storage means 12 to create a new template in which the ROIs are arranged according to the spot positions of the test pieces 1 and 1 '. In this case, as the attributes of the spot position, the number of layers such as one layer in which spots are arranged in a matrix or two layers in which a plurality of 4 × 4 spot blocks are arranged as shown in FIG. 4, the number of spots, the number of spot blocks, and the address Expression method, number of fields, Fie
The number of spots in ld, the presence or absence of spots to be paired as shown in FIG. 6, the number of paired spots, whether the spots are for signal value detection, positioning, spots are not formed, etc. There are various types such as a measurement attribute for each spot, and this attribute differs depending on the manufacturer of the test piece. Therefore, it is preferable that the template creating means can create a template in consideration of these attributes.

【0043】また、上記実施形態においては、特異的結
合物質としてcDNAを、生体由来物質として細胞から
抽出したcDNAを用いて説明したが、本発明はこれに
限定されるものではない。
In the above embodiment, cDNA was used as a specific binding substance, and cDNA extracted from cells was used as a biological substance. However, the present invention is not limited to this.

【0044】さらに、上記実施形態においては、解析装
置93において標識データS1,S2の比を求めている
が、標識データS1,S2の差を求め、この差が大きい
順に50箇所分のスポット位置と差の値とを対応付けた
測定結果表Hを作成してもよい。
Further, in the above-described embodiment, the ratio between the marker data S1 and S2 is determined by the analyzer 93. The difference between the marker data S1 and S2 is determined, and the spot positions of 50 spots are determined in the descending order of the difference. The measurement result table H in which the difference values are associated with each other may be created.

【0045】さらにまた、上記実施形態においては、2
つの試験片1,1′を用いて解析を行っているが、多数
の既知の互いに異なるcDNAが2組配置された1つの
試験片を用いて2種類の検体A,Bについて解析を行う
ようにしてもよい。
Further, in the above embodiment, 2
Although analysis is performed using one test piece 1 and 1 ′, analysis is performed on two types of specimens A and B using one test piece in which a large number of two sets of known and different cDNAs are arranged. You may.

【0046】また、上記実施形態においては、2種類の
検体A,Bについて解析を行っているが、3種類以上の
検体についても上記と同様に試験片1,1′の読取り、
解析および測定結果表Hと画像との表示を行うことが可
能である。
In the above embodiment, two types of specimens A and B are analyzed. However, for three or more types of specimens, the reading of test pieces 1 and 1 'is performed in the same manner as described above.
It is possible to display the analysis and measurement result table H and the image.

【0047】また、上記実施形態においては、標識物質
として蛍光色素を用いたが、放射性同位体を用いること
も可能である。
In the above embodiment, a fluorescent dye is used as a labeling substance, but a radioactive isotope can be used.

【図面の簡単な説明】[Brief description of the drawings]

【図1】本実施形態に用いられる試験片を示す図FIG. 1 shows a test piece used in the present embodiment.

【図2】本実施形態に用いられる読取装置の構成を示す
FIG. 2 is a diagram showing a configuration of a reading device used in the embodiment.

【図3】解析装置の構成を示す概略ブロック図FIG. 3 is a schematic block diagram showing a configuration of an analyzer.

【図4】テンプレートを示す図(その1)FIG. 4 shows a template (part 1).

【図5】テンプレートを示す図(その2)FIG. 5 shows a template (part 2).

【図6】テンプレートを示す図(その3)FIG. 6 shows a template (part 3).

【図7】測定結果表および画像の表示状態を示す図FIG. 7 is a view showing a display state of a measurement result table and an image.

【符号の説明】[Explanation of symbols]

1,1′ 試験片 2 坦体 10 読込手段 11 解析手段 12 テンプレート記憶手段 13 画像格納手段 14 測定結果格納手段 15 モニタ 16 入力手段 17 読出手段 93 解析装置 100 読取装置 Reference Signs List 1, 1 'test piece 2 carrier 10 reading means 11 analysis means 12 template storage means 13 image storage means 14 measurement result storage means 15 monitor 16 input means 17 reading means 93 analysis device 100 reading device

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) G01N 33/53 G01N 33/53 M D 33/543 501 33/543 501D 521 521 35/00 35/00 A 35/02 35/02 F // C12N 15/09 C12N 15/00 A ──────────────────────────────────────────────────続 き Continued on the front page (51) Int.Cl. 7 Identification symbol FI Theme coat ゛ (Reference) G01N 33/53 G01N 33/53 MD 33/543 501 33/543 501D 521 521 35/00 35/00 A 35/02 35/02 F // C12N 15/09 C12N 15/00 A

Claims (4)

【特許請求の範囲】[Claims] 【請求項1】 坦体上の所定の複数位置に互いに異な
る複数の既知の特異的結合物質が配置された試験片にお
ける前記特異的結合物質に、検体の標識物質で標識され
た生体由来物質を結合せしめ、該結合した前記生体由来
物質の標識物質から放出される標識信号により表される
画像を得、前記試験片における前記特的結合物質の配置
位置に対応するROIが配置されたテンプレートを前記
画像上に設定し、該画像の前記ROIに対応する位置に
おける前記標識信号の信号値を検出する生体由来物質の
検出方法において、 複数種類のテンプレートを記憶したテンプレート記憶手
段から、前記試験片に対応する種類のテンプレートを読
出し、 該読出されたテンプレートに基づいて、前記信号値を検
出することを特徴とする生体由来物質の検出方法。
1. A test specimen in which a plurality of known specific binding substances different from each other are arranged at a plurality of predetermined positions on a carrier, a biological substance labeled with a labeling substance of a specimen is added to the specific binding substance. After binding, an image represented by a labeling signal released from the bound labeling substance of the biological substance is obtained, and the template on which the ROI corresponding to the location of the specific binding substance in the test strip is placed is described. In a method for detecting a biological substance, which is set on an image and detects a signal value of the label signal at a position corresponding to the ROI of the image, a template storage unit storing a plurality of types of templates corresponds to the test piece. Detecting a signal value based on the read template, and detecting the signal value based on the read template.
【請求項2】 新たなテンプレートを作成し、該新た
なテンプレートを前記テンプレート記憶手段に記憶する
ことを特徴とする請求項1記載の生体由来物質の検出方
法。
2. The method according to claim 1, wherein a new template is created and the new template is stored in the template storage unit.
【請求項3】 坦体上の所定の複数位置に互いに異な
る複数の既知の特異的結合物質が配置された試験片にお
ける前記特異的結合物質に、検体の標識物質で標識され
た生体由来物質を結合せしめ、該結合した前記生体由来
物質の標識物質から放出される標識信号により表される
画像を得、前記試験片における前記特的結合物質の配置
位置に対応するROIが配置されたテンプレートを前記
画像上に設定し、該画像の前記ROIに対応する位置に
おける前記標識信号の信号値を検出する解析手段を備え
た生体由来物質の検出装置において、 複数種類のテンプレートを記憶したテンプレート記憶手
段と、 該テンプレート記憶手段から前記試験片に対応する種類
のテンプレートを読出す読出手段とを備え、 前記解析手段は、前記読出されたテンプレートに基づい
て、前記信号値を検出する手段であることを特徴とする
生体由来物質の検出装置。
3. A test strip having a plurality of known specific binding substances different from each other arranged at a plurality of predetermined positions on a carrier, wherein a bio-derived substance labeled with a labeling substance of a sample is added to the specific binding substance. After binding, an image represented by a labeling signal released from the bound labeling substance of the biological substance is obtained, and the template on which the ROI corresponding to the location of the specific binding substance in the test strip is placed is described. In a biological substance detection apparatus, which is provided on an image and includes an analysis unit configured to detect a signal value of the label signal at a position corresponding to the ROI of the image, a template storage unit storing a plurality of types of templates, Reading means for reading a template of a type corresponding to the test piece from the template storage means, wherein the analyzing means comprises: An apparatus for detecting a substance derived from a living body, which is means for detecting the signal value based on a signal.
【請求項4】 新たなテンプレートを作成し、該新た
なテンプレートを前記テンプレート記憶手段に記憶する
テンプレート作成手段をさらに備えたことを特徴とする
請求項3記載の生体由来物質の検出装置。
4. The apparatus according to claim 3, further comprising a template creating unit that creates a new template and stores the new template in the template storage unit.
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Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2005527829A (en) * 2002-05-24 2005-09-15 ニンブルゲン システムズ インコーポレイテッド Microarray for performing hybridization reaction of multiple samples on single microarray and method therefor
JP2007064927A (en) * 2005-09-02 2007-03-15 Nipro Corp Test specimen for qualitative reaction

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