FR2800668A1

FR2800668A1 - MARKING OF ESPECIALLY ORGANIC SAMPLES

Info

Publication number: FR2800668A1
Application number: FR9913918A
Authority: FR
Inventors: Ligny Paul De
Original assignee: Thomson CSF SA
Current assignee: Thales SA
Priority date: 1999-11-05
Filing date: 1999-11-05
Publication date: 2001-05-11
Anticipated expiration: 2019-11-05
Also published as: FR2800668B1; WO2001032435A1; AU1285301A

Abstract

The invention concerns sample marking, in particular biological samples. The method consists in etching, on said zone and about an axis of symmetry, data concerning the sample in the form of a digital etching for optical scanning. The invention is useful for marking samples, in particular biological samples, for example veterinary and human.

Description

La presente invention concerne le marquage prélèvements d'échantillons notamment biologiques, par exemple vétérinaires et humains. The present invention relates to the marking of samples, in particular biological samples, for example veterinary and human samples.

Les prélèvements biologiques sont généralement placés dans des tubes fins appeles paillettes dont les extrémités sont obturées ou scellées et ils sont conservés par congélation. Le prélèvement et la conservation de longue durée d'echantillons biologiques sont devenus des gestes courants en milieu médical, par exemple pour le suivi d'un patient, pour une greffe de tissus ou pour constituer des bibliothèques biologiques, dites biothèques, qui permettent des études cliniques ultérieures de recherche médicale ou de mise au point d'un nouveau médicament. Biological samples are generally placed in fine tubes called flakes, the ends of which are closed or sealed and are stored by freezing. The taking and long-term preservation of biological samples have become common gestures in the medical environment, for example for the follow-up of a patient, for a tissue transplant or to build up biological libraries, called biobanks, which allow studies subsequent medical research or new drug development clinics.

De façon connue, une paillette peut être identifiee à l'aide d'une étiquette autocollante fixée sur la paillette elle-même ou d'un manchon enfilé sur la paillette, l'étiquette ou le manchon comportant un identificateur sous forme d'un code alphanumérique ou d'un code à barres. Par ailleurs une base de données des échantillons conservés est entretenue et l'ensemble des informations ou du dossier relatif à un prélèvement particulier est généralement accessible dans cette base à l'aide de l'identifïcateur du prélèvement. base de données d'échantillons est souvent matérialisée sous forme d'une base de données informatique. La gestion d'un prélèvement depend de celle de sa base de données et lorsque par exemple des prélèvements doivent être traités dans un laboratoire distinct du lieu de conservation, leurs paillettes doivent être transmises avec informations correspondantes de leur base de donnée. In a known manner, a straw can be identified using a self-adhesive label attached to the straw itself or a sleeve threaded over the straw, the label or the sleeve comprising an identifier in the form of a code. alphanumeric or barcode. In addition, a database of preserved samples is maintained and all of the information or the file relating to a particular sample is generally accessible in this database using the sample identifier. sample database is often materialized in the form of a computer database. The management of a sample depends on that of its database and when, for example, samples must be processed in a laboratory separate from the place of conservation, their glitter must be transmitted with corresponding information from their database.

La certitude de la bonne identification d'un échantillon biologique est ainsi liée à la fois à l'intégrité de l'identificateur et à celle la base de données associée. The certainty of the correct identification of a biological sample is thus linked both to the integrity of the identifier and to that of the associated database.

Une erreur peut se produire notamment lors du transfert physique d'une paillette d'un centre de conservation vers un centre utilisateur ou vers un autre centre de conservation car il est nécessaire de transférer parallèlement à l'échantillon le dossier associé. La destruction, même partielle, de la base de données, entraîne la perte de dossiers d'échantillons. D'autre part, l'identificateur est actuellement inscrit sur l'étiquette ou le manchon au moyen d'une imprimante à jet d'encre de type industriel. L'encre présente l'inconvénient de dégazer au cours du temps et elle entraîne une pollution de l'enceinte de stockage à froid des paillettes. An error can occur in particular during the physical transfer of a straw from a conservation center to a user center or to another conservation center because it is necessary to transfer parallel to the sample the associated file. The destruction, even partial, of the database leads to the loss of sample files. On the other hand, the identifier is currently written on the label or the sleeve by means of an industrial type inkjet printer. The ink has the disadvantage of degassing over time and it causes pollution of the cold storage enclosure of the flakes.

Un but de l'invention est notamment de simplifier et de sécuriser la gestion des prélèvements stockés. En particulier pour une biothèque, il s'agit de permettre la conservation pérenne de chaque prélèvement et de ses informations sur une durée pouvant atteindre quelques dizaines d'années. An object of the invention is in particular to simplify and secure the management of stored samples. In particular for a biotheque, it is a question of allowing the perennial conservation of each sample and its information for a duration which can reach a few tens of years.

Pour cela, l'invention propose un procédé de marquage de prélèvement d'échantillon conservé dans un tube, ou paillette, comportant une zone cylindrique présentant une symétrie de révolution autour d'un axe de symétrie, caractérisé en ce qu'il consiste à graver, sur ladite zone et autour de l'axe de symétrie, des informations relatives au prélevement sous forme d'une gravure de type digitale à lecture optique. For this, the invention provides a method of marking the sample taken from a tube, or flake, comprising a cylindrical zone having a symmetry of revolution around an axis of symmetry, characterized in that it consists in etching , on said zone and around the axis of symmetry, information relating to the sampling in the form of a digital type engraving with optical reading.

Les informations sont gravées autour de l'axe symétrie au moyen d'un mouvement de rotation, de la paillette ou du dispositif de gravure, présentant un axe de rotation confondu avec ledit axe de symétrie. The information is engraved around the axis of symmetry by means of a rotational movement, of the glitter or of the engraving device, having an axis of rotation coinciding with said axis of symmetry.

De préférence, le procédé réalise une gravure en hélice autour de l'axe de symétrie. Ce procédé présente l'avantage d'être mis en oeuvre à l'aide de mouvements géométriques simples, le moyen de gravure étant de préférence affecté d'un mouvement de translation le long de l'axe de symetrie, pendant que la paillette est affectée d'un mouvement de rotation à vitesse constante autour dudit axe. Preferably, the method performs helical etching around the axis of symmetry. This method has the advantage of being implemented using simple geometric movements, the etching means being preferably affected by a translational movement along the axis of symmetry, while the flake is affected. a rotational movement at constant speed around said axis.

La zone cylindrique gravée est une partie de la surface de la paillette, elle est de préférence un fourreau de forme cylindrique qui entoure une partie cylindrique de la paillette. Le fourreau est par exemple enfilé sur la paillette. The engraved cylindrical zone is a part of the surface of the glitter, it is preferably a cylindrical sheath which surrounds a cylindrical part of the glitter. The sheath is for example threaded on the sequin.

Le procédé réalise la gravure en taille douce, par stylet thermique ou écriture laser de préférence au moyen d'un laser semi-conducteur. Le procédé présente l'avantage de permettre de graver l'ensemble d'un dossier relatif au prélèvement, représentant un volume d'information d'une dizaine de koctets à faible coût. The process carries out the engraving in intaglio, by thermal stylus or laser writing preferably by means of a semiconductor laser. The method has the advantage of making it possible to burn the whole of a file relating to the withdrawal, representing a volume of information of ten kbytes at low cost.

D'autres caractéristiques et avantages de l'invention apparaîtront à la lecture de la description détaillée suivante de réalisations particulières qui sont faites en référence aux dessins annexés suivants # la figure 1 représente une gravure en hélice du fourreau entourant la paillette ; # la figure 2 représente une gravure en anneau sur la paillette. Dans l'exemple de réalisation du procédé illustré à l'aide de la figure , une paillette ou tube présente une surface 1 sur laquelle est rapportée un manchon ou fourreau 2 présentant au moins une zone cylindrique avec une symétrie de révolution autour d'un axe de symétrie de révolution 3. De préférence, le manchon 2 se présente sous la forme d'une bague enfilée sur la paillette. Other characteristics and advantages of the invention will appear on reading the following detailed description of particular embodiments which are made with reference to the following appended drawings: FIG. 1 represents a helical engraving of the sheath surrounding the straw; # Figure 2 shows a ring engraving on the glitter. In the exemplary embodiment of the method illustrated with the help of the figure, a straw or tube has a surface 1 on which is attached a sleeve or sheath 2 having at least one cylindrical zone with a symmetry of revolution about an axis of symmetry of revolution 3. Preferably, the sleeve 2 is in the form of a ring threaded on the straw.

Dans l'exemple de la figure 1, le manchon a un diamètre sensiblement égal à celui de la partie de surface extérieure cylindrique de la paillette. Par exemple, le manchon est enfilé sur une paillette cylindrique vide, échantillon biologique est ensuite déposé dans la paillette et les extrémités de celle-ci sont scellées par exemple par pincement. La paillette présente alors une déformation de chacune de ses deux extrémités 4 et 5, comme par exemple une surface écrasée moins épaisse et plus large que le diamètre d'origine de la paillette. Le manchon peut glisser éventuellement le long la paillette entre les extrémités 4 et 5 mais il reste solidaire de la paillette. De façon connue, le manchon est inamovible de paillette sans détérioration de la paillette ou du manchon lui-même. In the example of Figure 1, the sleeve has a diameter substantially equal to that of the cylindrical outer surface portion of the straw. For example, the sleeve is threaded on an empty cylindrical straw, a biological sample is then deposited in the straw and the ends of the latter are sealed, for example by pinching. The straw then has a deformation of each of its two ends 4 and 5, such as for example a crushed surface that is thinner and wider than the original diameter of the straw. The sleeve can optionally slide along the glitter between the ends 4 and 5 but it remains integral with the glitter. In known manner, the sleeve is irremovable with glitter without deterioration of the glitter or of the sleeve itself.

Dans la réalisation illustrée par la figure 1, procédé de l'invention consiste à graver les informations du dossier relatif à l'échantillon dépose dans la paillette sur la surface cylindrique du manchon. Les informations du dossier comportent par exemple l'identite du donneur d'échantillon, la date du prélèvement, le centre de prélèvement, la nature du produit préleve, la date de congélation, le centre de stockage. gravure est de type digitale à lecture optique, elle présente l'avantage de ne pas comporter de composant polluant l'enceinte de conservation a très basse température dans laquelle les paillettes sont stockées. In the embodiment illustrated in FIG. 1, the method of the invention consists in engraving the information in the file relating to the sample deposited in the straw on the cylindrical surface of the sleeve. The information in the file includes, for example, the identity of the sample donor, the date of the sample, the collection center, the nature of the product taken, the date of freezing, the storage center. Etching is of digital type with optical reading, it has the advantage of not comprising any component polluting the conservation enclosure at very low temperature in which the glitter is stored.

Dans cette première réalisation, le procédé effectue une gravure en hélice 6 autour de l'axe de symétrie du manchon. De 'férence, le procédé réalise le sillon de la gravure en animant le manchon d'un mouvement rotation à vitesse constante dont l'axe rotation est confondu avec l'axe de symétrie de révolution 3, le mouvement de rotation étant combine avec un mouvement de translation rectiligne uniforme le long du même axe de symétrie de révolution 3 du manchon. Ces mouvements géométriques simples à contrôler permettent au procédé d'être coûteux. In this first embodiment, the method performs helical etching 6 around the axis of symmetry of the sleeve. In preference, the process creates the groove of the engraving by animating the sleeve with a rotation movement at constant speed whose axis of rotation coincides with the axis of symmetry of revolution 3, the rotation movement being combined with a movement of uniform rectilinear translation along the same axis of symmetry of revolution 3 of the sleeve. These simple geometric movements to control allow the process to be expensive.

Dans des variantes de réalisation les mouvements décrits de rotation et de translation peuvent par exemple s'appliquer premier au manchon et le second à la tête du dispositif assurant la gravure ou bien même les deux à la tête de gravure, le manchon restant alors fixe. In alternative embodiments the described movements of rotation and translation can for example be applied first to the sleeve and the second to the head of the device ensuring the engraving or even both to the engraving head, the sleeve then remaining fixed.

Dans cette première réalisation, le procédé de l'invention effectue la gravure des informations du dossier au moyen d'un laser. manchon comporte par exemple un thermoplastique et un colorant et l'énergie envoyée sur le manchon par le laser lors de l'écriture de gravure et absorbée le colorant permet de façon connue de déformer le thermoplastique et d'y inscrire des informations gravées. De préférence au colorant, manchon comporte un pigment qui présente l'avantage d'une meilleure stabilité de ses caractéristiques au cours du temps. pigment est par exemple noir de fumée ou un métal. L'utilisation du pigment permet notamment d'effectuer une ou plusieurs nouvelles écritures sur des zones non utilisées manchon à des âges différents de la paillette écartés de quelques années, voire de quelques dizaines d'années. Les gravures complémentaires sur des zones par exemple en inscrivant, lors d'un changement d'emplacement de conservation, la date et les coordonnées du nouveau lieu de stockage. In this first embodiment, the method of the invention performs the burning of the information in the file by means of a laser. sleeve includes for example a thermoplastic and a dye and the energy sent to the sleeve by the laser during the etching writing and absorbed the dye allows in known manner to deform the thermoplastic and to write engraved information thereon. In preference to the dye, the sleeve comprises a pigment which has the advantage of better stability of its characteristics over time. pigment is for example smoke black or a metal. The use of the pigment makes it possible in particular to carry out one or more new writings on unused sleeve areas at different ages of the glitter separated by a few years, or even a few decades. Additional engravings on areas, for example by entering, when changing the storage location, the date and contact details of the new storage location.

Le laser utilisé par le procédé selon la première réalisation est de préférence un laser semi-conducteur. II présente un coût réduit. La quantité d'informations à inscrire sur la paillette, par exemple de quelques dizaines de Kilo-octets, a une densité surfacique d'un rapport 10 à vis-à-vis de celle des disques d'enregistrement optique, la surface d'un pixel d'information gravé selon le procédé étant comprise entre quelques microns au carré et plusieurs centaines de microns au carré. Le procédé présente une fiabilité importante et une grande résistance aux contraintes d'environnement car les vitesses d'écriture et de lecture des informations sont moins sévères que celles d'un compact disque. La lecture des informations du dossier s'effectue en utilisant les mouvements simples de rotation et de translation utilisés lors de l'écriture. La gravure selon le procédé est lue par lecture optique. La lecture est par exemple réalisée pour confirmer le contenu d'une paillette lors d'une expédition de l'échantillon à un utilisateur. La lecture s'effectue de préférence à froid, dans l'enceinte de stockage de la paillette. La densité d'écriture relativement faible selon le procédé permet une lecture dans des conditions thermiques sévères et en s'affranchissant des phénomènes de condensation. La lecture peut s'effectuer à une température supérieure à celle de conservation longue durée par exemple si la paillette est à température ambiante. La lecture s'effectue de préférence à une température inférieure ou égale à la température maximale admissible pour une bonne conservation de la paillette. The laser used by the method according to the first embodiment is preferably a semiconductor laser. It has a reduced cost. The quantity of information to be written on the straw, for example a few tens of kilobytes, has a surface density of a ratio 10 compared to that of optical recording discs, the surface of a information pixel etched according to the process being between a few microns squared and several hundred microns squared. The method has significant reliability and great resistance to environmental constraints because the speeds of writing and reading information are less severe than those of a compact disc. The information in the file is read using the simple movements of rotation and translation used during writing. The engraving according to the method is read by optical reading. The reading is for example carried out to confirm the content of a straw when the sample is sent to a user. The reading is preferably carried out cold, in the straw storage enclosure. The relatively low writing density according to the method allows reading under severe thermal conditions and by avoiding condensation phenomena. Reading can be done at a temperature higher than that of long-term storage, for example if the straw is at room temperature. The reading is preferably carried out at a temperature less than or equal to the maximum admissible temperature for good preservation of the straw.

Dans une variante de cette première réalisation, le procédé réalise la gravure en taille douce. L'ablation de matière permet d'inscrire les informations du dossier. La taille douce est une technologie utilisée actuellement de façon industrielle par exemple pour la confection de billets banque ou de badges sécurisés, elle permet de réaliser dispositif de gravure peu coûteux. Selon une autre variante, le procédé réalise la gravure au moyen d'un stylet thermique vibrant par exemple avec un piézo-électrique sur un matériau thermoformable comme par exemple de la nitrocellullose. La gravure par pointe vibrante chauffante, utilisée notamment pour la fabrication des disques vinyles, est une technologie bien maîtrisée et présente un faible coût. In a variant of this first embodiment, the method carries out the intaglio engraving. The ablation of material makes it possible to record the information in the file. Intaglio printing is a technology currently used industrially, for example for making banknotes or secure badges, it makes it possible to produce inexpensive engraving devices. According to another variant, the method performs the etching by means of a vibrating thermal stylus, for example with a piezoelectric, on a thermoformable material such as, for example, nitrocellullose. Burning with a heated vibrating tip, used in particular for the manufacture of vinyl records, is a well-mastered technology and has a low cost.

Le procédé de réalisation du procédé illustré par la figure 1 et ses variantes sont notamment applicables à des paillettes commerce réalisées dans un matériau biocompatible tel que par exemple du polychlorure de vinyle, du polypropylène, polyéthylène, du polyacrylonitrile ou encore du polyester. Le procédé de l'invention présente l'avantage d'être compatible avec une procédure actuelle fabrication et de livraison aux utilisateurs de paillettes selon laquelle des paillettes en matériau biocompatible sont réalisées puis préidentifiées par un marquage par jet d'encre sur un manchon individuel à chaque paillette, puis stérilisées par lots à l'aide d'un rayonnement gamma ou beta, et distribuées stériles et préidentifiées aux utilisateurs. Une paillette marquée selon le procédé de l'invention présente l'avantage de supporter une stérilisation notamment par rayons gamma ou bêta. Mais le procède permet en plus de réaliser un marquage sur une paillette préalablement stérilisée sans détérioration de l'échantillon biologique qui peut y être dejà déposé. La gravure selon le procédé s'effectue de préférence initialement à température ambiante, ce qui permet d'utiliser un dispositif de gravure coûteux adapté à des conditions standard d'environnement. Mais la gravure selon le procédé s'effectue aussi à basse température notamment lorsque l'utilisateur veut graver des informations complémentaires au cours de la conservation longue durée à très basse température de l'échantillon. dispositif de gravure à très basse température est cependant généralement plus coûteux compte tenu des conditions d'utilisation thermiques plus sevères. La figure 2 présente un autre exemple de réalisation du procédé de l'invention selon lequel une gravure 7 est directement effectuée à la surface cylindrique d'une paillette 8. La gravure 7 comporte un ou plusieurs sillons, chaque sillon a la forme d'un anneau circulaire autour de la paillette. Le procédé réalise la gravure d'un anneau en taille douce, par stylet thermique ou par écriture laser comme décrit ci-dessus avec un mouvement de translation rectiligne uniforme de vitesse nulle. Cette réalisation du procédé permet de graver des informations sous forme de code à barres dont la lecture est par exemple faite avec un lecteur de code à barres classique de type douchette 9 positionné sensiblement perpendiculairement au plan des anneaux gravés lequel est perpendiculaire à l'axe 10 de symétrie de la paillette 8 cylindrique. La gravure d'anneaux circulaires complets autour de la paillette permet un positionnement souple du lecteur 9 rapport à la paillette. II n'est notamment pas necessaire d'effectuer rotation de la paillette autour de son axe 10 pour placer le code à barres devant le lecteur 9 comme cela est généralement nécessaire avec un marquage sous forme d'une étiquette avec code à barres collée sur une partie de la surface de la paillette. The process for carrying out the process illustrated in FIG. 1 and its variants are notably applicable to commercial flakes produced in a biocompatible material such as for example polyvinyl chloride, polypropylene, polyethylene, polyacrylonitrile or polyester. The process of the invention has the advantage of being compatible with a current procedure for manufacturing and delivering to users of glitter, according to which glitters made of biocompatible material are produced and then identified by an ink jet marking on an individual sleeve to each straw, then sterilized in batches using gamma or beta radiation, and distributed sterile and pre-identified to users. A straw labeled according to the method of the invention has the advantage of supporting sterilization in particular by gamma or beta rays. However, the process also makes it possible to carry out labeling on a previously sterilized straw without deterioration of the biological sample which can already be deposited there. The etching according to the method is preferably carried out initially at room temperature, which makes it possible to use an expensive etching device adapted to standard environmental conditions. However, the etching according to the method is also carried out at low temperature, especially when the user wants to engrave additional information during long-term preservation at very low temperature of the sample. etching device at very low temperature is however generally more expensive taking into account the more severe thermal conditions of use. FIG. 2 shows another embodiment of the method of the invention according to which an etching 7 is carried out directly on the cylindrical surface of a straw 8. The etching 7 comprises one or more grooves, each groove has the shape of a circular ring around the glitter. The method etches an intaglio ring, by thermal stylus or by laser writing as described above with a uniform rectilinear translational movement of zero speed. This embodiment of the method makes it possible to burn information in the form of bar code, the reading of which is for example done with a conventional bar code reader of the hand shower type 9 positioned substantially perpendicular to the plane of the engraved rings which is perpendicular to the axis 10 of symmetry of the cylindrical straw 8. The engraving of complete circular rings around the glitter allows flexible positioning of the reader 9 relative to the glitter. In particular, it is not necessary to rotate the glitter around its axis 10 to place the bar code in front of the reader 9 as is generally necessary with marking in the form of a bar code label stuck on a part of the surface of the glitter.

Le procédé selon l'invention n'est pas strictement limité aux réalisations décrites à l'aide de la figure 1 ou de la figure 2, s'étend également aux variantes combinant les réalisations décrites. La gravure hélicoïdale peut notamment s'effectuer directement sur la paillette.The method according to the invention is not strictly limited to the embodiments described with the aid of FIG. 1 or of FIG. 2, also extends to the variants combining the embodiments described. Helical engraving can in particular be carried out directly on the glitter.

Claims

1. A method of marking a sample taken from a tube comprising a cylindrical zone having a symmetry of revolution about an axis of symmetry, characterized in that it consists in etching, on said zone and around the axis of symmetry, information relating to the sample in the form of an optical type digital engraving.

2. Method according to claim 1, characterized in that it consists in engraving the information around the axis of symmetry by means of a rotational movement having an axis of rotation coincident with said axis of symmetry.

3. Method according to one of claims 1 or 2, characterized in that it performs helical etching around the axis of symmetry.

4. Method according to one of claims 1 or 2, characterized in that it performs the etching in at least one ring around the axis of symmetry

5. Method according to one of the preceding claims, characterized in that it consists in etching part of the external surface of the tube.

6. Method according to one of the preceding claims, characterized in that it consists in etching a sheath surrounding a part of the external surface of the tube.

7. Method according to one of the preceding claims, characterized in that it consists in engraving said intaglio zone.

8. Method according to one of claims to 6, characterized in that it consists in etching said area by means of a thermal stylus.

9. Method according to one of claims 1 to 6, characterized in that it consists in etching said area by semiconductor laser.

10.Tube for conservation of biological sample collection comprising a cylindrical zone having a symmetry of revolution about an axis of symmetry, characterized in that it includes an engraving, on said zone and around the axis of symmetry, of digital type with optical reading, said engraving comprising information relating to the sample.

11. A method of reading the information engraved on a tube for the conservation of biological sample collection and according to one of the preceding claims, characterized in that it consists in carrying out the cold reading in the storage enclosure of said tube .