FR2552776A1 - Vectors for expressing a antigenic rabies protein in eucaryotic cells and their application in the preparation of a vaccine - Google Patents
Vectors for expressing a antigenic rabies protein in eucaryotic cells and their application in the preparation of a vaccine Download PDFInfo
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Abstract
Description
La présente invention concerne plus particulièrement l'élaboration d'un vaccin contre la rage. The present invention relates more particularly to the development of a rabies vaccine.
La rage est une maladie1 provoquée par le virus rabique, qui se présente sous forme d'une encéphalomyélite gravissime qui est presque toujours fatale en l'absence de traitement avant l'apparition des symptôme"
La rage est une zoonose. Tous les animaux a sang chaud, qu'ils soient mammifères ou oiseaux, sont receptifs. Le principal vecteur est en général constitué par des mammifères mordeurs, qu'ils soient domestiques ou sauvages.Rabies is a disease1 caused by the rabies virus, which presents in the form of a very serious encephalomyelitis which is almost always fatal in the absence of treatment before the onset of symptoms "
Rabies is a zoonosis. All warm-blooded animals, whether mammals or birds, are receptive. The main vector is generally constituted by biting mammals, whether domestic or wild.
Les mesures de prévention efficaces ont permis de limiter les cas de rage humaine, qui se réduisent a quelques cas accidentels dans les pays fortement indus trialisés. Effective preventive measures have made it possible to limit cases of human rabies, which are reduced to a few accidental cases in highly industrialized countries.
Neanmoins, la rage reste encore une maladie très importante dans certains pays d'Amerique du Sud, en Afrique et en Asie. However, rabies is still a very important disease in some countries of South America, Africa and Asia.
L'arme essentielle de la lutte contre la rage pourratt être la prévention par la vaccination. The essential weapon in the fight against rabies could be prevention through vaccination.
Les vaccins actuellement utilisés sont constitués par des virus inactivés. The vaccines currently used consist of inactivated viruses.
Toutefois, pour être reproduits industriellement, ces virus doivent être cultivés sur des milieux tels que des cerveaux de souriceaux nouveau-nés, sur des embryons d'oiseaux, sur des cellules rénales animales ou sur des cellules diploïdes humaines, après quoi ils sont complètement inactivés par action deâ-propio lactone par exemple. However, to be reproduced industrially, these viruses must be cultured on media such as the brains of newborn mice, on bird embryos, on animal renal cells or on human diploid cells, after which they are completely inactivated. by deâ-propio lactone action for example.
L'utilisation de vaccins inactivés pose toujours le problème du risque d'une inactivation insuffisante. Enfin la nature particulière des milieux de culture conduit à de nombreuses difficultés au stade industriel qui font que le vaccin antirabique reste actuellement un vaccin très cher. The use of inactivated vaccines always poses the problem of the risk of insufficient inactivation. Finally, the particular nature of the culture media leads to numerous difficulties at the industrial stage which mean that the rabies vaccine currently remains a very expensive vaccine.
La Société TRANSGENE a déjà apporté une première solution à ce problème grâce à des vecteurs qui assurent l'expression de la protéine antigénique de la rage dans les bactéries tel que E. coli (voir en particulier le FR-A 82 08401). The TRANSGENE Company has already provided a first solution to this problem using vectors which ensure the expression of the antigenic protein of rabies in bacteria such as E. coli (see in particular FR-A 82 08401).
Le but de la présente invention est la préparation d'une protéine antigénique vaccinante exempte de risque d'infection accidentelle qui, en outre, peut être préparée dans des conditions industrielles telles qu'elle assure un coût très faible du vaccin en n'utilisant plus des bactéries comme agents de production, mais des Cellules eucaryotes. The object of the present invention is the preparation of a vaccinating antigenic protein free of risk of accidental infection which, moreover, can be prepared under industrial conditions such that it ensures a very low cost of the vaccine by no longer using bacteria as production agents, but eukaryotic cells.
L'un des avantages potentiels des cellules eucaryotes en tant qu'élément d'expression est qu'elles sont susceptibles de fabriquer des antigènes de structure plus proche de celle de la rage et plus complètes que les bactéries.One of the potential advantages of eukaryotic cells as an element of expression is that they are capable of producing antigens with a structure closer to that of rabies and more complete than bacteria.
Le virus de la rage est un rhabdovirus. The rabies virus is a rhabdovirus.
Ce rhabdovirus est constitué d'une nucléocapdite hélicotdale contenant un ARN inclus dans une enveloppe lipoprotéinique ayant la forme d'un obus. This rhabdovirus consists of a helicotdale nucleocapdite containing an RNA included in a lipoprotein envelope having the shape of a shell.
Ce virus comprend cinq protéines qui sont codées par le génome : G (glycoprotéine), N (nucléocapdite), M1 et M2 (matrice)et L (large, transcriptase). This virus comprises five proteins which are coded by the genome: G (glycoprotein), N (nucleocapdite), M1 and M2 (matrix) and L (large, transcriptase).
Comme la couverture membranaire provenant de l'hôte, le seul antigène efficace présent sur la surface est une glycoprotéine qui est une protéine transmembranaire de poids moléculaire d'environ 65 000 daltons qui possède une activité hémagglutinante.Like the membrane covering originating from the host, the only effective antigen present on the surface is a glycoprotein which is a transmembrane protein of molecular weight of approximately 65,000 daltons which has hemagglutinating activity.
La glycoprotéine purifiée est environ six fois plus active dans les essais d'hemagglutination que le virus intact. The purified glycoprotein is approximately six times more active in hemagglutination tests than the intact virus.
Comme son nom l'indique, la glycoprotéine du virus de la rage est glycosylée, bien que le rôle de cette glycosylation soit inconnu. As its name suggests, the glycoprotein of the rabies virus is glycosylated, although the role of this glycosylation is unknown.
La séquence d'ADN complémentaire du mARN de la glycoproteine du virus de la rage a été décrite dans l'article de A. Anilionis et al., Nature 294; 275-278
(1981).The DNA sequence complementary to the mRNA of the rabies virus glycoprotein was described in the article by A. Anilionis et al., Nature 294; 275-278
(nineteen eighty one).
Ce gène a été utilisé dans le cadre des expérimentations qui seront decrites ci-après et est représenté schématiquement sur la figure 1 ci-annexée. This gene was used in the context of the experiments which will be described below and is shown diagrammatically in FIG. 1 appended.
Le présente invention concerne un vecteur d'expression d'une protéine antigénique de la rage, dans les cellules eucaryotes, caractérisé en ce qu'il comporte au moins
une séquence d'ADN (1) codant pour ladite protéine antigénique de la rage,
les éléments d'expression de cette séquence dans une cellule eucaryote.The present invention relates to a vector for the expression of an antigenic protein of rabies, in eukaryotic cells, characterized in that it comprises at least
a DNA sequence (1) coding for said rabies antigenic protein,
the expression elements of this sequence in a eukaryotic cell.
Par séquence d'ADN (1) codant pour une protéine antigénique de la rage on entend désigner une séquence qui lorsqu'elle est exprimée dans les cellules eucaryotes conduit à une protéine antigénique de la rage. By DNA sequence (1) coding for an antigenic protein of rabies is meant a sequence which when expressed in eukaryotic cells leads to an antigenic protein of rabies.
I1 peut s'agir de tout ou partie de la séquence d'ADN efficace codant pour la protéine antigénique de la rage ou bien d'une séquence d'ADN qui conduit, lorsqu'elle est exprimée, à une protéine ayant des propriétés imunologiques identiques ou très similaires à celle de la protéine antigénique de la rage. It may be all or part of the effective DNA sequence coding for the rabies antigenic protein or else a DNA sequence which, when expressed, results in a protein having identical immunological properties or very similar to that of the rabies antigenic protein.
I1 est également intéressant d'utiliser 1'ADN complet codant pour la protéine antigénique de la rage sous forme d'un fragment -PstI - PstI. Dans un tel fragment on peut par exemple supprimer tout ou partie des
G/C d'extrémité sans nuire à la qualité de la glycopro téine exprimée.It is also advantageous to use the complete DNA coding for the antigenic protein of rabies in the form of a fragment -PstI - PstI. In such a fragment, it is possible, for example, to delete all or part of the
G / C end without harming the quality of the expressed glycopro tein.
Les éléments d'expression de 1'ADN(1) varient selon la nature des cellules eucaryotes hôtes. On peut distinguer deux cas qui présentent actuellement un intérêt industriel : les cellules animales en particulier les cellules de mammifères, et leslevures, bien que les autres types de cellules eucaryotes ne soient pas à écarter à priori. The expression elements of DNA (1) vary according to the nature of the eukaryotic host cells. We can distinguish two cases which are currently of industrial interest: animal cells in particular mammalian cells, and yeasts, although the other types of eukaryotic cells should not be ruled out a priori.
Expression dans les cellules animales
Dans le cas où les cellules hôtes sont des cellules animales les éléments d'expression seront en général prélevés sur un virus par exemple des virus de la famille des Papovaviridiae tel que SV40 (virus simien 40, polyomavirus) ou le BPV- (virus du papillome bovin, papillomavirus). Mais on peut utiliser d'autres virus
tels que des adenovirus. L'un des avantages du virus SV40
est que sa réplication dans les cellules hôtes conduit
à une amplification considérable, plusieurs milliers de copies.Expression in animal cells
In the case where the host cells are animal cells, the expression elements will generally be taken from a virus, for example viruses of the Papovaviridiae family such as SV40 (simian virus 40, polyomavirus) or BPV- (papilloma virus bovine, papillomavirus). But we can use other viruses
such as adenoviruses. One of the advantages of the SV40 virus
is that its replication in host cells leads
to a considerable amplification, several thousand copies.
Les éléments d'expression des vecteurs selon
l'invention comprendront au moins le promoteur d'un virus qui peut être l'un des promoteurs du virus vecteur, ainsi dans SV40 on peut utiliser le promoteur des gènes tardifs, mais ce promoteur peut provenir d'un virus diffurent ainsi dans le BPV on utilisera ci-après le promoteur du gène de la thymidine kinase du virus Herpes Simplex.The elements of expression of the vectors according to
the invention will comprise at least the promoter of a virus which can be one of the promoters of the vector virus, thus in SV40 one can use the promoter of late genes, but this promoter can come from a virus thus diffuse in BPV the herpes simplex virus thymidine kinase gene promoter will be used below.
Afin d'améliorer l'expressioles vecteurs
selon l'invention peuvent comprendre également des introns et des sites de polyadémylation situés dans cet ordre a
l'extrémité de la séquence d'ADN(1),Ces éléments peuvent
îà aussi provenir du virus vecteur ou bien être exogènes.In order to improve the expressive vectors
according to the invention can also include introns and polyademylation sites located in this order a
the end of the DNA sequence (1), These elements can
also come from the vector virus or be exogenous.
Ainsi dans le vecteur BPV les sites de polyadénylation
seront les sites précoces ou tardifs de SV40. Parmi les introns utilisables il faut citer l'intron I du gène de la globine de lapin, bien que cela ne soit nullement limitatif.Thus in the BPV vector the polyadenylation sites
will be the early or late SV40 sites. Among the introns that can be used, mention should be made of intron I of the rabbit globin gene, although this is in no way limiting.
Enfin un vecteur d'expression autonome doit être capable de se répliquer dans les cellules hôtes, le vecteur devra donc comporter une origine de réplica
tion, par exemple origine de réplication de SV40 ou de
BPV. En outre, le vecteur devra éventuellement être capa
ble d'exprimer les protéines nécessaires a son maintient
et à sa réplication dans lesdites cellules comme l'anti
gène T pour SV40.Finally, an autonomous expression vector must be capable of replicating in host cells, the vector must therefore contain an origin of replica
tion, for example origin of replication of SV40 or
BPV. In addition, the vector will eventually have to be capa
ble to express the proteins necessary for its maintenance
and its replication in said cells as anti
T gene for SV40.
Dans certains cas les vecteurs comportant
l'ensemble de ces éléments peuvent devenir trop importants
pour être utilisables, dans ce cas certains des éléments
nécessaires au maintient et à la réplication du vecteur
peuvent être apportés par l'intermédiaire d'un autre vecteur ou bien être produits par les cellules ellesmêmes, en permettant de supprimer les parties correspondantes dans le vecteur.In some cases the vectors comprising
all of these may become too important
to be usable, in this case some of the elements
necessary for the maintenance and replication of the vector
can be provided via another vector or else be produced by the cells themselves, making it possible to delete the corresponding parts in the vector.
Ainsi les cellules COS qui portent un genome de SV40 intégré et qui produisent l'antigène T nécessaire a la réplication de SV40, sont capables d'assurer la réplication d'un vecteur SV40 qui comporte une origine de réplication mais qui ne comporte pas les fonctions précoces de SV40. Thus, COS cells which carry an integrated SV40 genome and which produce the T antigen necessary for the replication of SV40, are capable of ensuring the replication of an SV40 vector which has an origin of replication but which does not include the functions SV40 early.
Dans l'exemple gui sera décrit ci-après, la complémentation du vecteur d'expression proprement-dit (c'est-a-dire le vecteur portant la séquence d'ADN(1) sera assurée par un autre vecteur dit vecteur de complément" assurant l'expression des éléments manquants au vecteur d'expression. In the example which will be described below, the complementation of the expression vector proper (that is to say the vector carrying the DNA sequence (1) will be ensured by another vector called the complement vector "ensuring expression of missing elements in the expression vector.
Dans certains cas il peut être intéressantd'intro- duire dans le vecteur d'expression un marqueur, gène de sélection positive ou négative dans les cellules hôtes ainsi par exemple un gène de resistance a un composé chimique particulier. Dans le cas de la construction
BPV ce gène est le gène codant pour la dhfr (dihydrofolateréductase) qui confère aux cellules la résistance au méthotrexate
Ce gène de sélection permet la manipulation des vecteurs dans les cellules hôtes et peut, dans certains cas, assurer leur maintien.In certain cases it may be advantageous to introduce into the expression vector a marker, a positive or negative selection gene in host cells, for example a gene for resistance to a particular chemical compound. In the case of construction
BPV this gene is the gene coding for dhfr (dihydrofolatereductase) which gives cells resistance to methotrexate
This selection gene allows the manipulation of vectors in host cells and can, in some cases, ensure their maintenance.
Expression dans les levures. Expression in yeasts.
Dans le cas où les cellules hôtes sont des levures, les éléments d'expression sont essentiellement constitués d'un promoteur et éventuellement d'un terminateur. Ces élément sont de préférence, bien que non nécessairement, des promoteurs et des terminateurs de gènes de la levure hôte. Ainsi lorsque la cellule hôte est Saccharomyces cereviseae, on pourra utiliser le promoteur et le terminateur du gène URA3 ou du gène
PGK (phosphoglycerate kinase).In the case where the host cells are yeasts, the expression elements essentially consist of a promoter and optionally a terminator. These elements are preferably, although not necessarily, promoters and terminators of host yeast genes. So when the host cell is Saccharomyces cereviseae, we can use the promoter and the terminator of the URA3 gene or the gene
PGK (phosphoglycerate kinase).
Comme dans le cas précédent le vecteur d'expression autonome doit être capable de se répliquer dans les levures, pour se faire il comportera une origine de réplication de levure telle que l'origine de réplication du plasmide 2 , mais il est possible d'utiliser d'autres origines de réplication par exemple des origines de réplication d 'origines chromosomiques. As in the previous case, the autonomous expression vector must be capable of replicating in yeasts, to do this it will include an origin of yeast replication such as the origin of replication of plasmid 2, but it is possible to use other origins of replication, for example origins of replication of chromosomal origins.
Les vecteurs selon l'invention comporteront également de préférence un gène de sélection par exemple le gène LEU2 ou URA3 qui complémente une souche leu ou ura
Les vecteurs selon l'invention peuvent se présenter sous forme de vecteur autonome, c'est-a-dire sous forme de plasmide ou bien être intégrés dans les chromosomes des cellules eucaryotes, tant levures que cellules de mammifères dans ce cas il est possible d'intégrer le fragment codant pour 1'ADN(1), par exemple le fragment promoteurXgène/terminateur en un ou plusieurs exemplaires dans les chromosomes (Weawer & coll. 1981).The vectors according to the invention will also preferably comprise a selection gene, for example the LEU2 or URA3 gene which complements a leu or ura strain.
The vectors according to the invention may be in the form of an autonomous vector, that is to say in the form of a plasmid or else be integrated into the chromosomes of eukaryotic cells, both yeast and mammalian cells in this case it is possible to integrate the fragment coding for DNA (1), for example the promoterXgene / terminator fragment in one or more copies into the chromosomes (Weawer & coll. 1981).
De façon générale, les vecteurs selon l'invention comporteront en outre des éléments permettant leur maintien dans des bactéries et notamment comporteront une origine de réplication fonctionnelle dàns E. coli (ori-eco) et un gène de sélection par exemple un gène de résistance a un antibiotique par exemple l'Ampicilline (Ampr). In general, the vectors according to the invention will also comprise elements allowing their maintenance in bacteria and in particular will comprise an origin of functional replication in E. coli (ori-eco) and a selection gene for example a resistance gene a an antibiotic, for example Ampicillin (Ampr).
Ces éléments sont intéressants lors de la construction des vecteurs, lorsqu'on utilise comme cellules hôtes des bactéries ; lors de l'expression de l'ADN(l) dans les cellules eucaryotes ces éléments pourront faire défaut. These elements are useful during the construction of vectors, when bacteria are used as host cells; during the expression of DNA (1) in eukaryotic cells these elements may be lacking.
Les vecteurs ainsi obtenus sont utilisés pour transformer ou transfecter les cellules eucaryotes correspondantes selon des processus connus. The vectors thus obtained are used to transform or transfect the corresponding eukaryotic cells according to known processes.
Ainsi pour les levures on peut utiliser la technique de transfection decrite par H. Ito & coll 1983. Thus for yeasts, the transfection technique described by H. Ito & coll 1983 can be used.
Dans les exemples la souche utilisée est un ségregant par ticulier de Saccharomyces cereviseae (TG Y 1 spl), mais d'autres souches de la même espece ou d'autres espèces
(Schizosaccharamyces pombes, S. uvanum) peuvent être egalement des hôtes convenables.In the examples, the strain used is a particular segregant of Saccharomyces cereviseae (TG Y 1 spl), but other strains of the same species or of other species
(Schizosaccharamyces pombes, S. uvanum) can also be suitable hosts.
Dans le cas des cellules de mammifères la trans fection peut être effectuée par exemple par la méthode décrite par Wigler et al 1978 pour les ADN cellulaires, par des techniques de fusion de protoplastes ou de microinjections, dautrestechniques snt onnues brsque vecteur st sous forme vira- le. Les cellules hôtes de mammifères peuvent être variées mais adaptées au vecteur mis en oeuvre. In the case of mammalian cells, the transfection can be carried out for example by the method described by Wigler et al 1978 for cellular DNA, by techniques of fusion of protoplasts or microinjections, other techniques which are quite simple, as vector and in viral form. the. The mammalian host cells can be varied but adapted to the vector used.
Les cellules transformées ou transfectées sont cultivées sur un milieu approprié assurant leur croissance. The transformed or transfected cells are cultured on an appropriate medium ensuring their growth.
Après culture, les cellules sont récoltées et la protéine antigénique de la rage peut être isolée par des techniques connues dans le domaine de purification des protéines et des antigènes. After culture, the cells are harvested and the rabies antigenic protein can be isolated by techniques known in the field of purification of proteins and antigens.
Les antigènes ainsi préparés sont utiles tant pour le traitement et la prévention de la rage comme les antigènes préparés par les procédés "classiques", mais peuvent également être utilisés dans les diagnostiques in vitro de cette maladie. The antigens thus prepared are useful both for the treatment and prevention of rabies like the antigens prepared by the "conventional" methods, but can also be used in the in vitro diagnostics of this disease.
Les exemples ci-après sont destinés a mettre en évidence d'autres caractéristiques et avantages de la présente invention sans pour autant la limiter. The examples below are intended to demonstrate other characteristics and advantages of the present invention without, however, limiting it.
Sur les dessins ci-annexés la figure 1 représente la structure du gène codant
pour la glycoprotéine de la rage.In the attached drawings, FIG. 1 represents the structure of the gene encoding
for the rabies glycoprotein.
la figure 2 représente la structure du virus SV40 la figure 3 schématise la synthèse de pal 47 la figure 4 schématisela synthèse de pTG150 la figure 5 schématise la synthèse de pSVTGl5l la figure 6 schématise la synthèse du vecteur de
complémentation pTGl 52 la figure 7 schématise la synthèse de pTG155 la figure 8 explicite la technique permettant de
supprimer les extrémités G/C en 5'
d'un cDNA de la glycoprotéine dans pTGl55 la figure 9 schématise la synthèse de SVTG171 la figure 10 schématise la synthèse de M13TG140 la figure 11 représente la structure simplifiée du BPV la figure 12 représente la structure simplifiée
du plasmide pMOP la figure 13 représente le détail de la structure de
pMOP au niveau du bloc d'expression du
gêné dhfr la figure 14 représente la synthèse de pTG158 - SAL la figure 15 représente la synthèse de pTG172 la figure 16 représente la synthèse de pTG856 la figure 17 représente la modification de l'extrémité
du promoteur PGK la figure 18 représente les éléments et la structure
finale de la jonction entre le promoteur
de levure et le gène de la rage la figure 19 représente les immunoprécipités spécifi
ques du polypeptique de la glycoprotéine
du virus de la rage dans les extraits de
levure le figure 20 représente un cliché d'immunofluorescence
obtenu à partir des extraits de cellule 3T3
Les matériels et méthodes suivants sont mis en oeuvre dans les exemples, sauf indications contraires
Souches et plasmides
La souche de bactérie utilisée est une souche
E. coli 1106 (SupE hSdS met supF). TGY1spl est un segregeant obtenu par croisement de la souche GFR18 (MatO( His3-11-15
Leu2-3-12) (FINK et coll.) avec la souche TGY10-1 (Mata
Ura3-251-373-328). La souche TGY10-1 est un dérive isogénique de la souche FL100 (ATCC 2283). FIG. 2 represents the structure of the SV40 virus FIG. 3 diagrams the synthesis of pal 47 FIG. 4 diagrams the synthesis of pTG150 FIG. 5 diagrams the synthesis of pSVTGl5l FIG. 6 diagrams the synthesis of the vector of
Complementation pTGl 52 Figure 7 shows schematically the synthesis of pTG155 Figure 8 explains the technique for
remove the G / C ends in 5 '
of a cDNA of the glycoprotein in pTGl55 FIG. 9 diagrams the synthesis of SVTG171 FIG. 10 diagrams the synthesis of M13TG140 FIG. 11 represents the simplified structure of BPV FIG. 12 represents the simplified structure
of the plasmid pMOP FIG. 13 represents the detail of the structure of
pMOP at the level of the expression block of the
embarrassed dhfr Figure 14 represents the synthesis of pTG158 - SAL Figure 15 represents the synthesis of pTG172 Figure 16 represents the synthesis of pTG856 Figure 17 represents the modification of the end
of the PGK promoter Figure 18 represents the elements and the structure
final of the junction between the promoter
yeast and the rabies gene Figure 19 shows the specific immunoprecipitates
of the glycoprotein polypeptide
rabies virus in extracts of
yeast figure 20 represents an immunofluorescence picture
obtained from 3T3 cell extracts
The following materials and methods are used in the examples, unless otherwise indicated
Strains and plasmids
The strain of bacteria used is a strain
E. coli 1106 (SupE hSdS met supF). TGY1spl is a segregeant obtained by crossing the GFR18 strain (MatO (His3-11-15
Leu2-3-12) (FINK et al.) With the strain TGY10-1 (Mata
Ura3-251-373-328). The TGY10-1 strain is an isogenic derivative of the FL100 strain (ATCC 2283).
Enzymes et produits chimiques
Tous les enzymes utilisés proviennent de Bethesda
Research Laboratories, New England Biolab ou Borhienger
Manhein.Enzymes and chemicals
All enzymes used come from Bethesda
Research Laboratories, New England Biolab or Borhienger
Manhein.
Les oligonucléases utilisées proviennent soit de
New England Biolab, Hana Biologics et Worthington Biochemical, ou sont synthétisés par les techniques Kohli et coll.The oligonucleases used come from either
New England Biolab, Hana Biologics and Worthington Biochemical, or are synthesized by techniques Kohli et al.
Tous les produits radioactifs ont été obtenus chez Radio Chemical Center Amerscham. All radioactive products were obtained from Radio Chemical Center Amerscham.
Transformation
La transformation de E. coli 1106 par les phsmides est effectuée comme décrit par Dagert et Ehrlich 1979.Transformation
The transformation of E. coli 1106 by phsmids is carried out as described by Dagert and Ehrlich 1979.
Utilisation des enzymes de restriction
Les enzymes de restriction sont utilisées selon les conditions spécifiées par le fabricant. Les autres traitements enzymatiques sont effectués selon les techniques décrites par Maniatis et coll. (1982).Use of restriction enzymes
Restriction enzymes are used under the conditions specified by the manufacturer. The other enzymatic treatments are carried out according to the techniques described by Maniatis et al. (1982).
Après chaque traitement enzymatique, 1'ADN est extrait avec le phénol, deux fois avec octanol - chloroforme (1 : 8) puis précipitation avec l'éthanol. Dans le cas de petits fragments ( < 100 bp) une triple extraction avec le diéthylether remplace la précipitation à l'éthanol. After each enzymatic treatment, the DNA is extracted with phenol, twice with octanol-chloroform (1: 8) then precipitation with ethanol. In the case of small fragments (<100 bp), triple extraction with diethyl ether replaces precipitation with ethanol.
L'analyse des produits de digestion est effectue par électrophorèse sur gel d'agarose selon les techniques connues. The analysis of the digestion products is carried out by electrophoresis on agarose gel according to known techniques.
L'insértion des "linkers" non phosphorylés a été effectuée de la façon suivante
Les linkers sont repris dans du tampon TE (lOmM Tris.HCl pH 7,5, 1 mM Na2EDTA) à la concentration de 1 mg/ml et prehybridés par refroidissement de 650C à 40C. La ligaison est effectuée dans un tampon de concentration 30 mM NaCl, 30 mM Tris.HCl pH 7,5, 1mM spermidine, 0,25 mM ATP, 2 mM DTT, 0,2 mM Na2EDTA et 0,1 mg/ml serum albumine bovine. En général, la ligaison (10 à 50 ssl est effectuée avec un excès molaire du linker sur les extrémités d'ADN de 80 fois, et une concentration d'ADN cible de 0,1 FM. La ligase est utilisée à la concentration de 100 à 200 unités/ml et la ligaison est effectuée à 40C pendant 16 heures.Les linkers excédentaires sont éliminés par précipitation à la spermine (Hoopes et Mc Clure, 1981). L'ADN est ensuite repris dans 10 mM Tris.HCl pH 7,5, 1 mM Na2EDTA, puis dilué dans du tampon d'hybridation (100 mM Tris.HCl pH 7,5, 5 mM Na2EDTA, 100 mM NaCl). La réhybridation est effectué comme la préhybidation des linkers, et des aliquots sont transformés directement dans E. coli. Le principe de la méthode est décrit par
LATHE et Coll., 1983. The insertion of non-phosphorylated "linkers" was carried out as follows
The linkers are taken up in TE buffer (10 mM Tris.HCl pH 7.5, 1 mM Na2EDTA) at a concentration of 1 mg / ml and prehybridized by cooling from 650C to 40C. The binding is carried out in a concentration buffer 30 mM NaCl, 30 mM Tris.HCl pH 7.5, 1 mM spermidine, 0.25 mM ATP, 2 mM DTT, 0.2 mM Na2EDTA and 0.1 mg / ml serum albumin bovine. In general, the binding (10 to 50 ssl is carried out with a molar excess of the linker on the DNA ends of 80 times, and a target DNA concentration of 0.1 FM. The ligase is used at the concentration of 100 at 200 units / ml and the binding is carried out at 40C for 16 hours. The excess linkers are eliminated by precipitation with spermine (Hoopes and Mc Clure, 1981). The DNA is then taken up in 10 mM Tris.HCl pH 7, 5.1 mM Na2EDTA, then diluted in hybridization buffer (100 mM Tris.HCl pH 7.5, 5 mM Na2EDTA, 100 mM NaCl). Rehybridization is carried out as prehybidation of linkers, and aliquots are transformed directly in E. coli. The principle of the method is described by
LATHE et al., 1983.
Exemple 1 : Expression à l'aide du virus SV40
1 - L'expression du gène codant pour une protéine antigène de la rage (ci-après gène de la rage) dans les cellules de singe par l'intermédiaire de SV40 repose sur la complémentation entre deux vecteurs dont l'un porte le gène de la rage et une partie du génome de SV40 et l'autre porte la partie complémentaire du génome de SV40 ceci afin d'obtenir deux vecteur de dimensions réduites de l'ordre de 5200 bp (la taille de SV40 sans insertion) susceptibles de se complémenter et de s'encapsider.Example 1: Expression using the SV40 virus
1 - The expression of the gene coding for a rabies antigen protein (hereinafter the rabies gene) in monkey cells via SV40 is based on the complementation between two vectors, one of which carries the gene for rabies and part of the SV40 genome and the other carries the complementary part of the SV40 genome this in order to obtain two vectors of reduced dimensions of the order of 5200 bp (the size of SV40 without insertion) capable of complementing each other and get wrapped up.
Le génome du virus simien schématise sur la figure 2 d'après Griffin (1981) est constitué d'une molécule ADN circulaire à double brin comportant 5243 bp. The genome of the simian virus shown diagrammatically in FIG. 2 according to Griffin (1981) consists of a circular double-stranded DNA molecule comprising 5243 bp.
Ce génome comporte pour ce qui nous intéresse une origine de réplication OR, une région précoce codant pour deux antigènes, les antigènes T et t et une région tardive comportant VP1, VP2 et VP3.This genome includes, for our purposes, an origin of OR replication, an early region coding for two antigens, the T and t antigens and a late region comprising VP1, VP2 and VP3.
Construction de pTG149 - figure 4
Le plasmide pBR327 (Soberon et coll 1980) est mis en digestion avec HindIII, les extrémités cohésives sont complémentées par traitement avec l'ADN polymérase
Klenow, et le plasmide est lié avec un "linker1, BglII octamère 5' dCAGATCTG-3'. Après réhybridation des extrémités de "linker" et transformation dans E. coli, on met en évidence les plasmides corrects par restriction avec
BglII.Construction of pTG149 - Figure 4
The plasmid pBR327 (Soberon et al 1980) is digested with HindIII, the cohesive ends are complemented by treatment with DNA polymerase
Klenow, and the plasmid is linked with a "linker1, BglII octamer 5 'dCAGATCTG-3'. After rehybridization of the" linker "ends and transformation in E. coli, the correct plasmids are demonstrated by restriction with
BglII.
Construction de pTG147
La construction de ce vecteur est schématisée sur la figure 3 ci- annexée.Construction of pTG147
The construction of this vector is shown diagrammatically in FIG. 3 appended.
Le plasmide pK 14 de ddpart comporte un fragment EcoR1-BamH1 provenant de SU40, inséré entre les sites EcoRI-BamH1 de pBR322. The plasmid pK 14 of ddpart comprises an EcoR1-BamH1 fragment originating from SU40, inserted between the EcoRI-BamH1 sites of pBR322.
Le fragment SV40 comprend un fragment EcoR1 Hpaî lié par l'intermédiaire d'un oligonucléotide "linker" Kpnî à un fragment Hpal-BamH1. Ainsi les sites de polyadénylation (A) pour la transcription immédiate et tardive de SV40 sont flanqués par un site Kpnî et un site BamH1. The SV40 fragment comprises an EcoR1 HpaI fragment linked via a "linker" KpnI oligonucleotide to a Hpal-BamH1 fragment. Thus the polyadenylation sites (A) for the immediate and late transcription of SV40 are flanked by a KpnI site and a BamH1 site.
Pour cloner ce plasmide sous forme d'un fragment EcoR1
Sal1, il est nécessaire d'écarter la partie entre les sites BamH1 et Saîl (ce fragment étant déjà présent dans le virus vecteur), en outre, une répétition directe de ce fragment produirait une délétion par recombinaison homologue in vivo.To clone this plasmid in the form of an EcoR1 fragment
Sal1, it is necessary to discard the part between the BamH1 and SalI sites (this fragment already being present in the vector virus), in addition, a direct repetition of this fragment would produce a deletion by homologous recombination in vivo.
C'est pourquoi, pK14 est traité avec BamH1 et la nucléase S1 suivi par une digestion avec Sall et d'un traitement à l'ADN polymérase, afin de remplir les extensions 5' produites par le clivage avec Saîl. La fusion des deux extrémités par l'ADN ligase conduit à une reconstitution du site Saîl dans pTG142. This is why, pK14 is treated with BamH1 and the nuclease S1 followed by digestion with SalI and a treatment with DNA polymerase, in order to fill the 5 ′ extensions produced by the cleavage with SalI. The fusion of the two ends by DNA ligase leads to a reconstruction of the SaiI site in pTG142.
Comme l'on désire insérer le cADN de la glycoprotéine, soit dans les sites EcoR1, soit dans le site Kpnl, il a été envisagé d'utiliser le site EcoR1 de pBR328, ce site est un site interne du gène plasmidique-qui se trouve situé dans le gène de résistance au chloramphenicol. Ayant rencontré des problèmes de léthalité associée avec l'expression du gène de la glycoprotéine dans les bactéries on a transféré le fragment EcoR1-Sal1 dans les sites correspondants de pBR322 pour obtenir pTG143. On insère ensuite un linker Bg1II entre les deux sites EcoR1 et Kpn1 et on utilise la technologie des adaptateurs pour insérer le gène de la glycoprotéine. As it is desired to insert the cDNA of the glycoprotein, either into the EcoR1 sites or into the KpnI site, it has been envisaged to use the EcoR1 site of pBR328, this site is an internal site of the plasmid gene which is found located in the chloramphenicol resistance gene. Having encountered problems of lethality associated with the expression of the glycoprotein gene in bacteria, the EcoR1-Sal1 fragment was transferred to the corresponding sites of pBR322 to obtain pTG143. A Bg1II linker is then inserted between the two EcoR1 and Kpn1 sites and adapter technology is used to insert the glycoprotein gene.
L'insertion du gène de la glycoprotéine de la rage sous forme d'un.fragment Pstl - Pstl provenant du plasmide pRG décrit par Anilianis 1981, dans le site BglII a été rendue possible en utilisant un adaptateur octamère 5'
GATCTGCA 3' comme intermédiaire (Lathé et coll 1983). The insertion of the rabies glycoprotein gene in the form of a Pstl - Pstl fragment from the plasmid pRG described by Anilianis 1981, into the BglII site was made possible using a 5 'octamer adapter
GATCTGCA 3 'as intermediary (Lathé et al 1983).
Construction de pTG150 - figure 4
Les plasmides pTG147 et pTG149 sont digérés complètement avec bu NI, mélangés en quantité équimolaire, lids, et le mélange de ligation est utilisé pour transformer
E. coli. Le plasmide pTG150 est identifié comme le plasmide comportant le cDNA complet de la glycoprotéine de la rage inséré dans le site BglII de pTGî49. Construction of pTG150 - Figure 4
Plasmids pTG147 and pTG149 are digested completely with NI bu, mixed in equimolar amount, lids, and the ligation mixture is used to transform
E. coli. The plasmid pTG150 is identified as the plasmid comprising the complete cDNA of the rabies glycoprotein inserted into the BglII site of pTGl49.
Construction de pTG15î et de SVTG151 - figure 5
Le plasmide pTG150 est introduit entièrement sous forme d'un fragment de digestion Clai dans le site de restriction HpaII du virus SV40 (dénomé ci-après SV401) en soumettant respectivement pTG150 à Clal, SV40 à HpaII et en mettant les morceaux de restriction en présence de ligase.Construction of pTG15î and SVTG151 - Figure 5
The plasmid pTG150 is introduced entirely in the form of a Clai digestion fragment into the HpaII restriction site of the SV40 virus (hereinafter referred to as SV401) by subjecting pTG150 to Cla, SV40 to HpaII respectively and putting the restriction pieces in the presence ligase.
On obtient ainsi le plasmide pTG151 de 10,1 kb. This gives the plasmid pTG151 of 10.1 kb.
Ce plasmide est trop grand pour pouvoir être introduit dans des cellules de mammifères. C'est pourquoi on l'utilise sous forme d'un fragment linéarisé par BamHî. This plasmid is too large to be able to be introduced into mammalian cells. This is why it is used in the form of a fragment linearized with BamHI.
En effet, le fragment BamH1 comporte, outre le gène de la glycoprotéine de la rage, la partie du génome de SV40 qui peut être complémentée par le plasmide pTG152 dont la construction va être explicitée ci-après.Indeed, the BamH1 fragment comprises, in addition to the gene for the rabies glycoprotein, the part of the SV40 genome which can be complemented by the plasmid pTG152, the construction of which will be explained below.
Construction de pTG152 - figure 6
Le plasmide pTG152 est obtenu à partir de pBR327 D par digestion avev BamH1 et Clal afin d'isoler un fragment comportant une origine de réplication fonctionnelle dans
E. coli (ori-eco) et le gène de résistance à l'ampicilline.Construction of pTG152 - Figure 6
The plasmid pTG152 is obtained from pBR327 D by digestion with BamH1 and ClaI in order to isolate a fragment comprising an origin of functional replication in
E. coli (ori-eco) and the ampicillin resistance gene.
Ce fragment est lié à un fragment obtenu par digestion de
SV40 par Bcl1 et Tagal. On obtient ainsi le plasmide pTG152 de 5,3 kb qui comporte la partie complémentaire pour SV40 du plasmide SVTG151. This fragment is linked to a fragment obtained by digestion of
SV40 by Bcl1 and Tagal. This gives the plasmid pTG152 of 5.3 kb which comprises the complementary part for SV40 of the plasmid SVTG151.
Exemple 2 : Synthèse du vecteur SVTG160 - fig. 7
Synthèse du plasmide pTG155
A partir du plasmide pTG150 on effectue une digestion partielle avec Bglil puis ensuite une digestion complète avec MstII. Le plasmide est recircularisé par ligation en présence d'un adaptateur double brin synthétique dont la formule est donnée en B figes 8, afin de fusionner les sites BglII et MstII pour déléter le polymère G/C à l'extrémité 5' de l'élément cDNA.Ce plasmide pTG155 contient un site d'initiation de la traduction reconstituée dans lequel le nucléotide adenine est situé en position -3 pour être conforme à la séquence généralement admise pour l'initiation de la traduction dans les cellules eucaryotes.Example 2: Synthesis of the SVTG160 vector - fig. 7
Synthesis of the plasmid pTG155
From the plasmid pTG150, a partial digestion is carried out with Bglil and then a complete digestion with MstII. The plasmid is recircularized by ligation in the presence of a synthetic double-strand adapter whose formula is given in B figs 8, in order to merge the BglII and MstII sites to delete the G / C polymer at the 5 'end of the element cDNA.This plasmid pTG155 contains a site of initiation of the reconstituted translation in which the nucleotide adenine is located in position -3 to be in conformity with the generally accepted sequence for the initiation of translation in eukaryotic cells.
Ce plasmide peut être traité comme pTG150 pour donner le vecteur SvTG160. This plasmid can be treated as pTG150 to give the vector SvTG160.
Exemple 3 : Synthèse du vecteur SVTG171 - Fig. 9
Ce vecteur se différence des précédents en ce qu'il comporte un intron à la suite du gène de la rage.Example 3: Synthesis of the SVTG171 vector - FIG. 9
This vector differs from the previous ones in that it comprises an intron following the rabies gene.
Cet intron est l'intron I provenant de pSXBETA+ (ssglobine de lapin). Cet intron est prélevé sous forme d'un fragment PvuII/BamH1 et inséré dans un phase M13 en l'occurence M13 TG120 entre les sites HindII et BamH1. On obtient ainsi le phage M13 TG140 (fig.10) qui comporte l'intron I, lequel est prélevé sous forme d'un fragment BglII/BamH1 pour être inséré entre les sites correspondants de pTG149 (voir ci-dessus)
On obtient ainsi le plasmide pTG170.This intron is intron I from pSXBETA + (rabbit ssglobin). This intron is taken in the form of a PvuII / BamH1 fragment and inserted into an M13 phase, in this case M13 TG120, between the HindII and BamH1 sites. The phage M13 TG140 (FIG. 10) is thus obtained which comprises the intron I, which is taken in the form of a BglII / BamH1 fragment to be inserted between the corresponding sites of pTG149 (see above)
The plasmid pTG170 is thus obtained.
Par digestion de pTG170 et de pTG151 (voir ci-dessus) par BglII et SalI et mise en présence des fragments de digestion on obtient le plasmide pTG171 qui, comme précédemment, est linéarité par BamHI afin de fournir le vecteur SVTG171. By digestion of pTG170 and pTG151 (see above) with BglII and SalI and placing in the presence of the digestion fragments, the plasmid pTG171 is obtained which, as before, is linear with BamHI in order to provide the vector SVTG171.
On peut dans des conditions analogues et en utilisant pTG160 obtenir un plasmide comportant un intron. It is possible, under analogous conditions and using pTG160, to obtain a plasmid comprising an intron.
Les différents plasmides SVTG171, SVTG151 et SVTG160 complémentés par pTG152 dans les cellules de mammifores, permettent de produire une protéine antigénique de la rage. The different plasmids SVTG171, SVTG151 and SVTG160 complemented by pTG152 in mammalian cells, make it possible to produce an antigenic protein of rabies.
Exemple 4 : Préparation d'un vecteur à partir du PVB. Example 4: Preparation of a vector from PVB.
1) Le plasmide pMOP - figures 11 - 12
Le virus BPV se divise en deux parties limitées par deux sites uniques de restriction HindIII et BamH1 qui délimite deux fragments dit respectivement de "69 %" et de "31 %". (figure 11 d'après Chen et coll. 1982).1) The plasmid pMOP - Figures 11 - 12
The BPV virus is divided into two parts limited by two unique restriction sites HindIII and BamH1 which delimits two fragments said to be "69%" and "31%" respectively. (Figure 11 after Chen et al. 1982).
Le vecteur dérivé du BPV mis en oeuvre dans cet exemple est dénommé pMOP. il est obtenu par introduction dans le site BamH1 du BPV du marqueur dhfr codant pour la dihydrofolate réductase sous le contrôle du promoteur précoce de SV40 (voir figure 13). The vector derived from BPV used in this example is called pMOP. it is obtained by introduction into the BamH1 site of BPV of the dhfr marker coding for dihydrofolate reductase under the control of the SV40 early promoter (see FIG. 13).
Ce vecteur pMOP comporte en outre un fragment de pBR322 portant le gène de résistance à l'ampicilline qui provient du plasmide pML2 décrit par Lusky et Botchan (1981). La figure 13 représente le détail de la structure de pMOP entre les sites BamH1, ces éléments ne constituent pas des éléments essentiels dans le cadre de la présente invention puisqu'ils sont destinés à assurer l'expression du gène dhfr. This pMOP vector further comprises a fragment of pBR322 carrying the ampicillin resistance gene which comes from the plasmid pML2 described by Lusky and Botchan (1981). FIG. 13 represents the detail of the structure of pMOP between the BamH1 sites, these elements do not constitute essential elements in the context of the present invention since they are intended to ensure the expression of the dhfr gene.
2) Le plasmide pTG158SAL - figure 14
Le gène codant pour la protéine antigénique de la rage provient du plasmide pTG147 dont la construction a été explicitée précédemment.2) The plasmid pTG158SAL - Figure 14
The gene coding for the rabies antigenic protein comes from the plasmid pTG147, the construction of which has been explained previously.
Ce gène est prélevé sous forme d'un fragment
BglII/SalI par digestion partielle de pTG147 pour être introduit entre les sites correspondants du plasmide pTG301 traité par BglII/SalI. Ce plasmide pTG301 comporte le gène de la thymidine kinase (tk) et son promoteur (ptk), il est obtenu par insertion dans le site BamH1 de pBR322 d'un fragment BamH1-BamH1 de l'Herpes virus simplex, le traitement de restriction élimine le gène tk.This gene is taken in the form of a fragment
BglII / SalI by partial digestion of pTG147 to be introduced between the corresponding sites of the plasmid pTG301 treated with BglII / SalI. This plasmid pTG301 comprises the thymidine kinase gene (tk) and its promoter (ptk), it is obtained by insertion into the BamH1 site of pBR322 of a BamH1-BamH1 fragment of the Herpes virus simplex, the restriction treatment eliminates the tk gene.
Le produit de ligation pTG156 comporte dans sa partie intéressante le gène de la rage sous le contrôle du promoteur de la thymidine kinase, le gène étant suivi du site de polyadénylation de SV40 (A). The ligation product pTG156 contains, in its interesting part, the rabies gene under the control of the thymidine kinase promoter, the gene being followed by the polyadenylation site of SV40 (A).
L'introduction de l'intron de la globine est effectuée à partir du phage M13TG140 (voir ci-dessus) sous forme d'un fragment BglII/BamH1 qui est inséré dans le site BglII de pTG156 après délétion du fragment
BhlII/BglII correspondant.The introduction of the globin intron is carried out from the phage M13TG140 (see above) in the form of a BglII / BamH1 fragment which is inserted into the BglII site of pTG156 after deletion of the fragment
BhlII / BglII corresponding.
Cette délétion ayant supprimé le gène de la rage, celui-ci est réintroduit dans le site unique BglII de pTG156 sous forme d'un fragment BglII/BglII de pTG147. This deletion having deleted the rabies gene, it is reintroduced into the unique BglII site of pTG156 in the form of a BglII / BglII fragment of pTG147.
On obtient ainsi le plasmide pTG158.The plasmid pTG158 is thus obtained.
La partie essentielle de ce plasmide devant être prélevée sous forme d'un fragment SalI/SalI (l'un des rares sites unique de pMOP) on introduit en amont du promoteur au niveau du site BamHI, un petit fragment provenant de
M13TG120 et comportant un site SalI. M13TG120 est mis en digestion avec BglII et BamHI et pTG158 avec BamHi l'ensemble est lié pour donner pTG158 SAL.The essential part of this plasmid having to be taken in the form of a SalI / SalI fragment (one of the rare unique sites of pMOP) is introduced upstream of the promoter at the BamHI site, a small fragment originating from
M13TG120 and comprising a SalI site. M13TG120 is digested with BglII and BamHI and pTG158 with BamHi the whole is linked to give pTG158 SAL.
3) Synthèse du vecteur - figure 15
Par digestion de pTG158 et de pMOP avec Sall et ligation on obtient le plasmide pTG172 qui comporte, outre l'ensemble des éléments rappelés pour pMOP, le gène de la rage sous le contrôle du promoteur Ptk et terminé par l'intron de la globine et un site de polyadénylation.3) Synthesis of the vector - figure 15
By digestion of pTG158 and pMOP with SalI and ligation, the plasmid pTG172 is obtained which comprises, in addition to all the elements mentioned for pMOP, the rabies gene under the control of the Ptk promoter and terminated by the globin intron and a polyadenylation site.
Par transfection de cellules de mammifères ce vecteur produit une protéine antigénique de la rage, comme cela sera démontré ci-après. By transfection of mammalian cells this vector produces an antigenic protein of rabies, as will be demonstrated below.
Exemple 5 : Transformation des cellules 3 T 3 NIHA (fibrolastes de souris)
On utilise pour ces transformations le plasmide pMOP d'origine et le plasmide pTG172. Example 5 Transformation of NIHA 3 T 3 Cells (Mouse Fibrolasts)
The original pMOP plasmid and the pTG172 plasmid are used for these transformations.
Les cellules sont niisesen culture à raison de 8.105 cellules / boite de Petri de 10 cm de diamètre en milieu Dulbecco + 10 % SVNN + antibiotique. (SVNN sérum de veau nouveau-né). The cells are cultured in a proportion of 8.105 cells / Petri dish 10 cm in diameter in Dulbecco medium + 10% SVNN + antibiotic. (SVNN newborn calf serum).
La transfection avec les vecteurs est effectude après 24 heures de culture par la technique de Wigler et al. 1978. The transfection with the vectors is carried out after 24 hours of culture by the technique of Wigler et al. 1978.
Le milieu est changé 24 heures après la transfection. Puis on effectue un repiquage sur milieu sélectif contenant du méthotrexate. The medium is changed 24 hours after transfection. Then transplanting is carried out on selective medium containing methotrexate.
Après 2 à 3 semaines on peut fixer les cellules en colonie et mettre en évidence les antigènes produits en utilisant l'immunofluorescence. After 2 to 3 weeks, the cells can be fixed in a colony and the antigens produced can be demonstrated using immunofluorescence.
Des cellules de la lignée 3T3 ont été transfectées par l'ADN purifié de
a) : plasmide pTG172-O (pMOP; vecteur BPV dhfr sans insert additionnel).Cells of the 3T3 line were transfected with DNA purified from
a): plasmid pTG172-O (pMOP; vector BPV dhfr without additional insert).
b) : plasmide pTG172-rage (BPVTG172 t vecteur
BPV dhfr avec un insert additionnel qui comprend les différents éléments permettant l'expression de la glycoprotéine de la rage).b): plasmid pTG172-rage (BPVTG172 t vector
BPV dhfr with an additional insert which includes the different elements allowing the expression of the rabies glycoprotein).
Les colonies dérivant de cellules ayant incorporé un plasmide et donc une résistance au méthotrexate (dhfr +) ont été fixées par traitement à l'acétone. L'expression de la glycoprotéine rabique a été visualisée par traitements succesifs avec un anticorps monoclonal (nO 509-6) dirigé contre la glycoprotéine et un deuxième anticoprs fluorescent dirigé contre ce premier anticorps. Colonies derived from cells which have incorporated a plasmid and therefore a resistance to methotrexate (dhfr +) were fixed by treatment with acetone. The expression of rabies glycoprotein was visualized by successive treatments with a monoclonal antibody (nO 509-6) directed against the glycoprotein and a second fluorescent anticoprs directed against this first antibody.
Agrandissement : environ 1.000 fois. Magnification: approximately 1,000 times.
Exemple 6 : Construction du plasmide pTG 856 comprenant le gène de la glycoprotéine de la rage.(Figure 16). Example 6: Construction of the plasmid pTG 856 comprising the gene for the rabies glycoprotein (FIG. 16).
On a isolé le gène PGK de levure à partir d'une banque de DNA chromosomique réalisée par intégration de fragments coupés au hasard (digestion partielle par SaU3A) au site
BamHl d'un plasmide (pFL 1) capable de répliquer à la fois dans la levure et dans E. coli (Chevallier et al, 1980). La détection d'un fragment contenant le gène PGK a été réalisée par hybridation in situ de colonies bactériennes, transformées par cette banque, avec une sonde spécifique (5'-TGTTTAGTTTAGTAGAACCTCGTGAAACTT-3') (Maniatis et al, 1982). La région 5' du gène PGK a été reclonée sous forme d'un fragment HindIII - SalI (2.3. kb) dans pBR 322.The yeast PGK gene was isolated from a chromosomal DNA library produced by integration of fragments cut at random (partial digestion with SaU3A) at the site.
BamHI of a plasmid (pFL 1) capable of replicating both in yeast and in E. coli (Chevallier et al, 1980). The detection of a fragment containing the PGK gene was carried out by in situ hybridization of bacterial colonies, transformed by this library, with a specific probe (5'-TGTTTAGTTTAGTAGAACCTCGTGAAACTT-3 ') (Maniatis et al, 1982). The 5 'region of the PGK gene was recloned as a HindIII-SalI fragment (2.3. Kb) in pBR 322.
Ce fragment comporte l'intégralité des séquences impli quées dans le contrôle de l'initiation de la transcription (promoteur) du gène PGK, plus le début de la séquence codante (Hitzeman et al, 1982 > . This fragment includes all of the sequences involved in controlling the initiation of transcription (promoter) of the PGK gene, plus the start of the coding sequence (Hitzeman et al, 1982>.
On a créé un site BglII détruisant l'ATG ouvrant la séquence codante du PGK, par mutagénèse in vitro (Smith et
Gillam,1979) (figure 17). An ATG-destroying BglII site opening the PGK coding sequence was created by in vitro mutagenesis (Smith and
Gillam, 1979) (Figure 17).
D'autre part, un fragment EcoRI - HindIII (0,5. kb) comprenant la fin (3') de la séquence codante et les signaux de terminaison transcriptionnelle du PGK a été traité à la polymé- rase Klenow et ligé au site PvuII unique du plasmide décrit au paragraphe précédent, de façon que le site EcoRI ainsi reconstitué soit en amont du site Hindili détruit. Ce nouveau fragment intégré comprend un site BglII localisé dans la partie codante du gène PGK. La délétion du fragment compris entre les deux sites BglII, celui nouvellement créé en aval du promoteur
PGK et celui en amont du terminateur, laisse un site BglII unique où l'on peut cloner les gènes que l'on veut exprimer.On the other hand, an EcoRI-HindIII fragment (0.5. Kb) comprising the end (3 ') of the coding sequence and the transcriptional termination signals of the PGK was treated with Klenow polymerase and ligated to the PvuII site. unique of the plasmid described in the previous paragraph, so that the EcoRI site thus reconstituted is upstream of the destroyed Hindili site. This new integrated fragment comprises a BglII site located in the coding part of the PGK gene. The deletion of the fragment between the two BglII sites, that newly created downstream of the promoter
PGK and that upstream of the terminator, leaves a unique BglII site where one can clone the genes that one wants to express.
Le fragment HindIII - Pst 1 comprenant dans l'ordre la partie promotrice du gène PGK, le site BglII, la partie terminatrice du gène PGK,l'origine de réplication de pBR 322 et une partie de la séquence du gène Ampr conférant la résistance à l'ampicilline a été ligaturé avec le plus grand fragment résultant de la double digestion HindIII - Pst 1 du plasmide pJDB 207 de façon à reconstituer le gène Ampr(deggs, 1981) (cf. figure 16).Le plasmide résultant (pTG 841) possède donc : le gène LEU2 de levure, le gène Ampr de E. coli, le gène REP3 du plasmide 2 X de levure, l'origine de réplica- tion du plasmide 2 p de levure, l'origine de réplication de bR 322, le promoteur et le terminateur du gène PGK de levure. The HindIII - Pst 1 fragment comprising, in order, the promoter part of the PGK gene, the BglII site, the terminator part of the PGK gene, the origin of replication of pBR 322 and part of the sequence of the Ampr gene conferring resistance to the ampicillin was ligated with the largest fragment resulting from the double digestion HindIII - Pst 1 of the plasmid pJDB 207 so as to reconstitute the Ampr gene (deggs, 1981) (cf. FIG. 16). The resulting plasmid (pTG 841) therefore has: the yeast LEU2 gene, the E. coli Ampr gene, the yeast plasmid 2 X REP3 gene, the origin of replication of the yeast plasmid 2 p, the origin of replication of bR 322, the promoter and the terminator of the yeast PGK gene.
Un fragment Hindili de 1.1 kb comprenant le gène
URA3 de levure (Brevet européen n 78 3210) a été cloné au site HindIII de pTG 902, un dérivé de pBR 322 dépourvu des sites Pstl et NdeI, pour former le plasmide pTG 802. Le DNA de ce plasmide a été linéarisé par coupure au site Pstl unique - localisé dans la région 5' non codante du gène URA3 - , traité à la polymérase Klenow pour rendre franches les extrémités libéréesparla digestionpstl, et recircularisé par l'action de la DNA ligase du phage T4.Le fragment HindIII de 1.1 kb ainsi modifié (dépourvu de site Pstl) a été intégré au site Hindlil unique du plasmide pTG 841 de façon que le sens de transcription du gène URA3 soit divergent par rapport a celui du PGK (plasmide pTG 849). Le plasmide PTG 849 possède donc les mêmes caractéristiques que pTG 841, avec en plus la présence du gène URA3 modifié.A 1.1 kb Hindili fragment comprising the gene
Yeast URA3 (European Patent No. 78 3210) was cloned at the HindIII site of pTG 902, a pBR 322 derivative lacking the Pstl and NdeI sites, to form the plasmid pTG 802. The DNA of this plasmid was linearized by unique Pstl site - located in the 5 'non-coding region of the URA3 gene -, treated with Klenow polymerase to make blunt the ends freed by digestion pstl, and recircularized by the action of DNA ligase from phage T4. The 1.1 kb HindIII fragment thus modified (devoid of PstI site) was integrated into the unique HindIII site of the plasmid pTG 841 so that the direction of transcription of the URA3 gene is divergent compared to that of the PGK (plasmid pTG 849). The plasmid PTG 849 therefore has the same characteristics as pTG 841, with the addition of the modified URA3 gene.
Le cDNA de la glycoprotéine de la rage a été isolé sous forme d'un fragment BglI comprenant l'intégralité de la séquence codante plus les extrémités polydGdC. Un site MstII est situé au début (5') de la séquence codante, l'enzyme coupant entre le septième et le huitième nucléotide suivant le
A du ATG initiateur. Une séquence synthétique a été conçue pour substituer le fragment BglII - MstII dans la région 5' du gène, de façon à remplacer l'extrémité 5' polydGdc par une séquence plus proche des séquences non traduites des ARNs messager de levure (figure 17). Le fragment BqlII ainsi modifié a été intégré au site BglII unique de pTG 849, de façon que le sens de transcription du gène de la glycoprotéine rabique soit le même que celui du PGK. The rabies glycoprotein cDNA was isolated in the form of a BglI fragment comprising the entire coding sequence plus the polydGdC ends. An MstII site is located at the beginning (5 ′) of the coding sequence, the enzyme cutting between the seventh and the eighth nucleotide following the
From the initiating ATG. A synthetic sequence was designed to substitute the BglII - MstII fragment in the 5 'region of the gene, so as to replace the 5' polydGdc end with a sequence closer to the untranslated sequences of the yeast messenger RNAs (FIG. 17). The BqlII fragment thus modified was integrated into the unique BglII site of pTG 849, so that the direction of transcription of the rabies glycoprotein gene is the same as that of the PGK.
Exemple 7 : Expression de polypeptide de la glycoprotéine du virus de la rage dans la levure. Example 7: Expression of rabies virus glycoprotein polypeptide in yeast.
Le plasmide PTG856 est introduit dans la souche
S.Cerevisiae TGYlspl suivant la technique aux sels de lithium (Ito & coll 1983).Plasmid PTG856 is introduced into the strain
S.Cerevisiae TGYlspl using the lithium salt technique (Ito & coll 1983).
La même souche a été transformée par PTG849 qui est le même plasmide que PTG856 mais qui ne comporte pas le gène de la glycoprotéine. Ces souches ont été cultivées dans 25 ml de milieu sans uracile permettant de stabiliser le plasmide. The same strain was transformed with PTG849 which is the same plasmid as PTG856 but which does not contain the glycoprotein gene. These strains were cultivated in 25 ml of medium without uracil allowing the plasmid to be stabilized.
On ajoute de la cystéine radioactive S35 pour marquer les protéines de la levure. Radioactive cysteine S35 is added to label the yeast proteins.
Les cellules sont broyées dans le tampon suivant
250 pl : 25 mM Tris HCl pH 7,5
10 mM Na2 EDTA pH 8.The cells are crushed in the following buffer
250 µl: 25 mM Tris HCl pH 7.5
10 mM Na2 EDTA pH 8.
250 pl : 1M.KCl
0,1 M Tris/SCl pH 8,8
2 % Triton X 100
5 r1 : P.M.S.F. Phényl-méthyl-sulfunyl-fluoride
5 pl : "Soybean Trypsin inhibitor" 10 mg/m
Iodoacetamide 100 mM
N-éthylmaléimide 10 mM
1,10 - phenanthroline 10 mM 5 5 pl : DNAse I (0,5 mg/ml)
Les surnageants de ces broyats contenant les protéines radioactives sont incubés une nuit à 40 avec 5 Fl de sérum de lapin. Deux sérums étaient dirigés contre la glycoprotéine (lots 2726 et 2527) et un contre le virus total (lot 2725). On ajoute 50 iil de protéine A- sépharose (Pharmacia CL-4 B).Après incubation, le culot est lavé 4 fois avec un tampon (0,5 M Kcl ; 10 mM Tris.Hcl pH 8,8 ; 0,5 % Triton X100) et trois fois avec un second tampon (10 mM Tris/Cl pH 8,8). Le culot est incubé 10 minutes à 1000C dans un tampon de dénaturation (62 mM Tris.HCl pH 6,8 ; 2 % SDS ; 5 % 6-mercaptoéthanol ; 0,01 % bleu de bromophénol). L'extrait est alors analysé sur gel de polyacrylamide suivant la technique de Laemmli (1970).250 pl: 1M.KCl
0.1 M Tris / SCl pH 8.8
2% Triton X 100
5 r1: PMSF Phenyl-methyl-sulfunyl-fluoride
5 pl: "Soybean Trypsin inhibitor" 10 mg / m
Iodoacetamide 100 mM
10mM N-ethylmaleimide
1,10 - phenanthroline 10 mM 5 5 pl: DNAse I (0.5 mg / ml)
The supernatants of these ground materials containing the radioactive proteins are incubated overnight at 40 with 5 μl of rabbit serum. Two sera were directed against the glycoprotein (lots 2726 and 2527) and one against the total virus (lot 2725). 50 μl of protein A-sepharose (Pharmacia CL-4 B) are added. After incubation, the pellet is washed 4 times with a buffer (0.5 M Kcl; 10 mM Tris.Hcl pH 8.8; 0.5% Triton X100) and three times with a second buffer (10 mM Tris / Cl pH 8.8). The pellet is incubated for 10 minutes at 1000C in denaturation buffer (62 mM Tris.HCl pH 6.8; 2% SDS; 5% 6-mercaptoethanol; 0.01% bromophenol blue). The extract is then analyzed on polyacrylamide gel according to the technique of Laemmli (1970).
Après exposition du gel b un film photographique et développement, les différentes bandes correspondant aux protéines sont visibles (figure 19).After exposure of the gel to a photographic film and development, the different bands corresponding to the proteins are visible (FIG. 19).
On peut en particulier voir dans les extraits de souches portant PTG 856 (a) et (b) une bande fortement marquée de poids moléculaire environ 65000 indiquée par une flèche qui est absente des extraits de souche portant
PTG 849 (c) et (d). Ce poids moléculaire est celui attendu pour la glycoprotéine du virus de la rage.One can see in particular in the extracts of strains carrying PTG 856 (a) and (b) a strongly marked band of molecular weight approximately 65000 indicated by an arrow which is absent from the extracts of strain carrying
PTG 849 (c) and (d). This molecular weight is that expected for the rabies virus glycoprotein.
Les souches suivantes ont été déposées le 30 septembre 1983 dans la Collection Nationale de cultures de microorganismes (CNCM) de l'institut Pasteur
E.Coli 1106 / pTG 152 nO I 247
E.Coli 1106 / pTG 171 nO I 248
E.Coli 1106 / pTG 172 nO I 249
S.Cereviseae TGYlspl / pTG 856 nO I 250
Les plasmides pK14, pMOP et pSXBETA ont été aimablement communiqués par R. Breathnach. The following strains were deposited on September 30, 1983 in the National Collection of microorganism cultures (CNCM) of the Institut Pasteur
E.Coli 1106 / pTG 152 nO I 247
E.Coli 1106 / pTG 171 nO I 248
E.Coli 1106 / pTG 172 nO I 249
S.Cereviseae TGYlspl / pTG 856 nO I 250
The plasmids pK14, pMOP and pSXBETA were kindly provided by R. Breathnach.
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Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5830477A (en) * | 1984-04-25 | 1998-11-03 | Transgene S.A. | Vaccine against rabies and process for preparation thereof |
US6024953A (en) * | 1984-04-25 | 2000-02-15 | Transgene S.A. | Vaccine against rabies and process for preparation thereof |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
FR2552776B1 (en) | 1986-05-09 |
JPS61500946A (en) | 1986-05-15 |
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