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EP3762427A1 - Anti-pd-1 vaccine composition - Google Patents

Anti-pd-1 vaccine composition

Info

Publication number
EP3762427A1
EP3762427A1 EP19714322.5A EP19714322A EP3762427A1 EP 3762427 A1 EP3762427 A1 EP 3762427A1 EP 19714322 A EP19714322 A EP 19714322A EP 3762427 A1 EP3762427 A1 EP 3762427A1
Authority
EP
European Patent Office
Prior art keywords
protein
sequence
polypeptide
acid residues
amino acid
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Withdrawn
Application number
EP19714322.5A
Other languages
German (de)
French (fr)
Inventor
Lucille DESALLAIS
Jean-Pierre Salles
Jean-François ZAGURY
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Peptinov Sas
CNAM Conservatoire National des Arts et Metiers
Original Assignee
Peptinov Sas
CNAM Conservatoire National des Arts et Metiers
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Peptinov Sas, CNAM Conservatoire National des Arts et Metiers filed Critical Peptinov Sas
Publication of EP3762427A1 publication Critical patent/EP3762427A1/en
Withdrawn legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/70503Immunoglobulin superfamily
    • C07K14/70521CD28, CD152
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/2803Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/2803Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily
    • C07K16/2827Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily against B7 molecules, e.g. CD80, CD86
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies

Definitions

  • the present invention provides polypeptides useful for eliciting an immune response directed against PD-1 protein.
  • the two most important are its targeting by monoclonal antibodies specific for cytotoxic T-cell-associated protein 4 (CTLA-4) and interaction between the programmed cell death protein 1 (PD-1) and the ligand of this programmed cell death protein 1 (PD-L1).
  • CTLA-4 cytotoxic T-cell-associated protein 4
  • PD-1 programmed cell death protein 1
  • PD-L1 programmed cell death protein 1
  • the inhibition of PD-L1 signaling has been proposed as a means of improving T cell immunity for the treatment of cancer (anfi-fumoral immunity) but also in the treatment of infections (acute persistent infection and chronic).
  • FDA US Federal Drug Administration
  • pembrolizumab an anti-PD-1 monoclonal antibody (mAb) approved for people with unresectable metastatic melanoma or advanced non-small-cell metastatic lung carcinoma (NSCLC) whose tumors express PD-1 L1;
  • nivolumab an anti-PD-1 monoclonal antibody (mAb) approved for unresectable or metastatic melanoma, advanced metastatic NSCLC progressing with or after platinum-based chemotherapy, and advanced renal cell carcinoma, including metastatic ;
  • Atezolizumab a recently approved anti-PD-Ll monoclonal antibody (mAb) for the treatment of locally advanced or metastatic urothelial carcinoma that does not respond to platinum derivative chemotherapy; e ⁇
  • Avelumab a recently approved anti-PD-Ll monoclonal antibody (mAb) for the treatment of metastatic Merkel cell carcinoma.
  • PD-L1 targeting ICBs have been shown to be highly effective in melanoma, NSCLC and renal cell carcinoma.
  • polypeptides derived from sequences extending residues of amino acids 22 to 33, 66 to 81, 95 to 110, e 123 to 137 of the human PD-1 protein allowed the production of antibodies neutralizing the PD-1 protein by mice to which they were administered.
  • the present invention therefore relates to a polypeptide comprising or consisting of:
  • a first sequence consisting of at least 8 contiguous amino acid residues selected within the sequence extending from amino acid residues 123 to 137 of the PD-1 protein and of at most 30 acid residues contiguous amines selected from the complete sequence of the PD-1 protein, or a variant sequence having at least 75% identity with the first sequence; and or
  • a second sequence consisting of at least 8 contiguous amino acid residues chosen from the sequence extending from amino acid residues 66 to 81 of the PD-1 protein and of at most 30 acid residues contiguous amines selected from the complete sequence of the PD-1 protein, or a variant sequence having at least 75% identity with the second sequence; and or
  • a third sequence consisting of at least 8 contiguous amino acid residues selected within the sequence extending from amino acid residues 95 to 110 of the PD-1 protein and at most 30 residues of contiguous amino acids selected from the complete sequence of the PD-1 protein, or a variant sequence having at least 75% identity with the third sequence; and or
  • a fourth sequence consisting of at least 8 contiguous amino acid residues selected from the sequence extending from amino acid residues 22 to 33 of the PD-1 protein and of at most 30 acid residues contiguous amines selected from the complete sequence of the PD-1 protein, or a variant sequence having at least 75% identity with the fourth sequence;
  • polypeptide is different from the PD-1 protein e ⁇ that it does not consist of a portion of more than 30 contiguous amino acid residues of the PD-1 protein, e ⁇ provided that polypeptides consisting respectively of variant sequences of the first, second, third, and fourth sequences elicit an immune response directed against the PD-1 protein.
  • the invention relates more particularly to a polypeptide comprising or consisting of:
  • a first sequence consisting of SEQ ID NO: 1, 50, 51, 52, 53, or 54, or a variant sequence having at least 75% identity with the first sequence; and or
  • a second sequence consisting of SEQ ID NO: 2, 55, 56, or 57, or a variant sequence having at least 75% identity with the second sequence; and or
  • a fourth sequence consisting of SEQ ID NO: 4, or a variant sequence exhibiting at least 75% identity with the fourth sequence; provided that polypeptides consisting respectively of variant sequences of the first, the second, the third and the fourth sequence elicit an immune response directed against the PD-1 protein.
  • the present invention also relates to a nucleic acid encoding a polypeptide as defined above, or the complement thereof.
  • the present invention also relates to:
  • the medicament, in particular the vaccine, as defined above also comprises at least one other compound intended for the prevention or treatment of a disease linked or due to the expression of PD-1 protein or PD-L1 protein, cancer or infectious disease.
  • the present invention also relates to a pharmaceutical composition, in particular a vaccine composition, comprising, with the filler of active substance:
  • the pharmaceutical composition, in particular vaccine, as defined above also comprises at least one other compound intended for the prevention or treatment of a disease linked or due to the expression of PD-1 protein or PD-L1 protein, cancer or infectious disease.
  • the present invention also relates to the use of a polypeptide as defined above, for the preparation of an antibody, an antibody fragment or an aptamer.
  • the present invention also relates to a method for preparing an antibody, an antibody fragment or an aptamer comprising a step of administering a polypeptide as defined above to an antibody producing organism or an affinity screening step of an antibody, an antibody fragment or an aptamer which binds to the polypeptide as defined above.
  • the present invention also relates to an antibody, an antibody fragment, or an anti-PD-1 aptamer specifically directed against the polypeptide as defined above, provided that the polypeptide does not comprise more than two amino acid residues. in addition to the first, second, third, or fourth sequences or their respective variant sequences.
  • the present invention also relates to an antibody, an antibody fragment, or an aptamer as defined above for use as a medicament.
  • the medicament as defined above also comprises at least one other compound intended for the prevention or treatment of a disease linked or due to the expression of the PD-1 protein. or PD-L1 protein, cancer or infectious disease.
  • the present invention also relates to a pharmaceutical composition
  • a pharmaceutical composition comprising, as active ingredient, an antibody, an antibody fragment, or an aptamer as defined above, optionally in combination with a pharmaceutically acceptable vehicle.
  • the pharmaceutical composition as defined above also comprises at least one other compound intended for the prevention or treatment of a disease linked or due to the expression of the PD-protein. 1 or PD-L1 protein, cancer or infectious disease.
  • the present invention also relates to a polypeptide as defined above, a nucleic acid as defined above, or a pharmaceutical composition as defined above, for use in a method for eliciting an immune response directed against the protein PD-1 in an individual.
  • the polypeptide, nucleic acid or pharmaceutical composition is used in combination with at least one other compound useful for eliciting an immune response directed against the PD-1 protein.
  • the present invention also relates to a method for eliciting an immune response directed against the PD-1 protein in an individual, comprising administering to the individual an effective amount of a polypeptide as defined above, a nucleic acid as defined above, or a pharmaceutical composition as defined above.
  • the polypeptide, nucleic acid or pharmaceutical composition is administered in combination with at least one other compound useful for eliciting an immune response directed against the PD-1 protein.
  • the present invention also relates to the use of a polypeptide as defined above or a nucleic acid as defined above for the preparation of a medicament for eliciting an immune response directed against the PD-1 protein in an individual.
  • the medicament also comprises at least one other compound useful for eliciting an immune response directed against the PD-1 protein.
  • the present invention also relates to a polypeptide as defined above, a nucleic acid as defined above, a pharmaceutical composition as defined above, or an antibody, an antibody fragment or an apfamer as defined herein. above, for use in a method of preventing or treating a PD-1 related or PD-related disease in an individual.
  • the polypeptide, the nucleic acid, the pharmaceutical composition, or the antibody, the antibody fragment or the apfamer is used in combination with at least one other therapy intended for the prevention or treatment of PD-1-related disease, cancer or infectious disease.
  • the present invention also relates to a method of preventing or treating a disease related to or due to expression of the PD-1 protein or the PD-L1 protein in an individual, comprising administering to the individual an effective amount of a polypeptide as defined above, a nucleic acid as defined above, a pharmaceutical composition such as as defined above, or an antibody, an antibody fragment or an apfamer as defined above.
  • the method comprises at least one other therapy for the prevention or treatment of a disease related to the expression of the PD-1 protein or of the PD-L1 protein, d 'a cancer or an infectious disease.
  • the present invention also relates to the use of a polypeptide as defined above, a nucleic acid as defined above, or an antibody, an antibody fragment or an apfamer such as as defined above, for the preparation of a medicament for the prevention or treatment of a disease related or due to the expression of the PD-1 protein or the PD-L1 protein in an individual.
  • the medicament comprises at least one other compound intended for the prevention of a disease linked or due to the expression of the PD-1 protein or of the PD-L1 protein, of cancer or an infectious disease.
  • the present invention also relates to products containing:
  • a combination product for simultaneous, separate or spread use over time for the prevention or treatment of a disease related to or due to expression of PD-1 protein or PD-L1 protein, cancer or an infectious disease in an individual.
  • the term “comprising” means “including”, “containing” or “encompassing”, that is, when an object “includes” one or more elements, other elements that those mentioned can also be included in the object.
  • the expression “consisting of” means “consisting of”, that is, when an object “consists of” In one or more elements, the object can not include other elements than those mentioned.
  • PD-1 protein is the programmed cell death protein (PDM1), also called PDC1 or differentiation cluster 279 (cluster of differentiation 279, CD279), and is well-known to humans. job.
  • PDM1 programmed cell death protein
  • differentiation cluster 279 cluster of differentiation 279, CD279
  • the PD-1 protein according to the invention is selected from the group consisting of human PD-1 protein, mouse PD-1 protein, monkey PD-1 protein, PD-1 protein, 1, bovine PD-1 protein, pig PD-1 protein, sheep PD-1 protein, goat PD-1 protein, camel PD-1 protein, and the like. wild or domestic, camel PD-1 protein, dog PD-1 protein, e. of PD-1 cat protein.
  • the PD-1 protein is the human PD-1 protein.
  • mouse PD-1 protein as described in the UniProt / Swisspro ⁇ database under the reference Q02242 e ⁇ es ⁇ consisting of SEQ ID NO: 6,
  • the dog PD-1 is as described in the SwissProf database under the reference A0A024FCJ9 e ⁇ es consisting of SEQ ID NO: 10, the chat PD-1 as described in the Genbank database under the reference NP_001 138982.1 ⁇ ⁇ consisting of SEQ ID NO: 1 1.
  • bovine PD-1 protein as described in the Genbank database as BAX73992.1; DAA30855.1 or NP_001076975.1 and es ⁇ consisting of SEQ ID NO: 12 or 13 or 14,
  • sheep protein PD-1 as described in the Genbank database under the reference XP_012031617.1 and es ⁇ consisting of SEQ ID NO: 17.
  • goat PD-1 protein ⁇ as described in the Genbank database under the reference XP_013818552.2 or XP_01 7899964.1 and es ⁇ consisting of SEQ ID NO: 18 or 19.
  • camel PD-1 protein ⁇ as described in the Genbank database under the reference XP_010986792.1 or XP_010986793.1 and es ⁇ consisting of SEQ ID NO: 24 or 25.
  • the amino acid residue numbering of the PD-1 protein begins on the first amino acid residue, typically a methionine (M), forming the N-terminus of complete PD-1. encoded by the open reading frame of the PD-1 gene, that is, including its signal peptide.
  • M methionine
  • the amino acid residue numbering of the PD-1 protein used herein is defined by reference to the human PD-1 protein.
  • the first sequence, the second sequence, the third, and the fourth sound sequence consist of at least 8, 9, 10, 11, 12 contiguous amino acid residues respectively selected within the sequence extending amino acid residues 123 to 137, 66 to 81, and 95 to 110, of the PD-1 protein or its ⁇ consisting respectively of at least the sequence extending from amino acid residues 123 to 137, 66 to 81, 95 to 110, and 22 to 33 of the PD-1 protein.
  • the first sequence, the second sequence, the third and the fourth sequence according to the invention are respectively constituted by at most 29, 28, 27, 26, 25, 24, 23, 22, 21, 20 residues. of contiguous amino acids selected from the complete sequence of the PD-1 protein, or its ⁇ consisting respectively of at most amino acid residues 123 to 137, 66 to 81, 95 to 110, and 22 to 33 of the PD-1 protein.
  • the first block according to the invention consists of SEQ ID NO: 1, 50, 51, 52, 53 or 54,
  • the second sequence according to the invention consists of SEQ ID NO: 2, 55, 56 or 57,
  • the third sequence according to the invention consists of SEQ ID NO: 3 or 58, and
  • the fourth sequence consists of SEQ ID NO: 4.
  • a variant sequence according to the invention which has at least 75% identity with one of the first, second, third, and fourth sequences above, preferably has at least 80%, 85%, 90%, 95% or 98% identity with one of the first, second, third, and fourth sequences above.
  • the percentage identity between two peptide sequences can be determined by performing optimal alignment over the entire length of the sequences, by determining the number of aligned positions for which the amino acids are identical in each sequence and by dividing this number by the total number of amino acids in the longest of the two sequences.
  • the optimal alignment is the one that gives the highest percentage of identity between the two sequences.
  • a variant sequence according to the invention has at least 75%, 80%, 85%, 90%, 95% or 98% identity with SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4 or SEQ ID NO: 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57 or 58.
  • the variant sequence according to the invention is such that a polypeptide consisting of the variant sequence must make it possible to elicit an immune response directed against the PD-1 protein; that is to say that the administration of such a peptide, optionally cyclized by formation of at least one inter-cysteine disulfide bridge, if necessary after adding one or two cysteines within the peptide, and / or at its N-terminal end and / or at its C-terminal end, the peptide optionally being linked to a carrier molecule, in particular a carrier protein, such as KLH (Keyhole Limpet Hemocyanin), to an animal, such as a mouse, a rat or a rabbit, causes the production of antibodies directed against a PD-1 protein, in particular a PD-1 protein of the same species.
  • a carrier molecule in particular a carrier protein, such as KLH (Keyhole Limpet Hemocyanin)
  • KLH Keyhole Limpet Hemocyanin
  • the antibodies elicited by administration of the peptide are blocking or neutralizing, that is to say they prevent the PD-1 protein from exercising all or part, especially at least 10%, 25%, 50 %, 75%, of its activity, for example measured in vitro.
  • the activity of PD-1 is preferably a binding to the PD-L1 protein, which can be measured as in Example 2 which follows.
  • the polypeptide according to the invention preferably comprises at most 200, 150, 100, 90, 80, 70, 60, 50, 40 or 30 amino acid residues. It is different from the PD-1 protein and does not consist of a portion of more than 30 contiguous amino acid residues of the PD-1 protein. As is well understood by those skilled in the art, this does not exclude that it may consist of two or more portions of the PD-1 protein of not more than 30 contiguous amino acid residues, since these portions are not arranged to reconstitute a portion of the PD-1 protein of more than 30 contiguous amino acids.
  • the polypeptide according to the invention can include several repetitions, for example 2, 3, 4, 5, 10 or 20 repetitions, respectively of the first, second, third, e ⁇ fourth sequences e ⁇ of the variant sequence according to the invention.
  • polypeptide according to the invention may also comprise additional sequences not originating from the PD-1 protein.
  • additional sequences may in particular provide physicochemical characteristics allowing improved structural presentation or improved solubility of the polypeptide according to the invention relative to a similar polypeptide but which will not include these additional sequences.
  • the additional sequences may also comprise one or more peptide linker sequences, that is to say peptide linker, which are useful for binding in particular to a carrier molecule.
  • Such peptide linker sequences typically comprise from 1 to 10, especially from 4 to 6, amino acid residues.
  • sequences not originating from the PD-1 protein may also comprise epitopes belonging to other proteins, making it possible to elicit or generate an immune response directed against these other proteins.
  • polypeptide according to the invention may comprise exogenous (s) T epitope sequences, preferably universal, which makes it possible to enhance the immunogenicity of the polypeptide according to the invention.
  • the polypeptide according to the invention may also comprise at least one sequence of a carrier protein, for example a virus-like particle (VLP), as is described in particular in the international application WO 05/117983 for TNF. .
  • VLP virus-like particle
  • the polypeptide according to the invention may be linear subform or cyclized subform.
  • the polypeptide according to the invention is in cyclized form. This cyclization may be of any type known to those skilled in the art.
  • the choice of the cyclization strategy according to the invention can in particular take into account the best antigenic presentation of the epitopes contained in the polypeptide according to the invention, and relate only to a part of the polypeptide (cyclization within the sequence). .
  • the polypeptide of the invention when the polypeptide of the invention is in a cyclized form, only a portion of the polypeptide may be included in one cycle while the remainder of the polypeptide is in linear form.
  • this cyclization can be carried out in several different ways, for example: from its C-terminus at its N-terminus, from its N-terminus to a side chain, a side chain at its C-terminal end or between two side chains.
  • lactamization lactonization or the formation of a disulfide bridge.
  • cysteines may already be present in the variant sequence according to the invention or in the first, second, third and fourth sequences according to the invention, or else be added within these sequences, as well as at their N-terminus and / or or C-terminal.
  • polypeptide according to the invention may comprise post-translational modifications, such as glycosylations, methylations, acylations, in particular by fatty acids, or phosphorylations.
  • post-translational modifications such as glycosylations, methylations, acylations, in particular by fatty acids, or phosphorylations.
  • the N-terminus of the polypeptide according to the invention may be acetylated and the C-terminus may be modified by amidation.
  • polypeptide according to the invention may also comprise one or more analogs or derivatives of amino acids, don ⁇ non-natural or non-standard amino acids, in particular norleucine (Nie).
  • polypeptide according to the invention is fixed or bound, in particular by covalent bonding, to a carrier molecule, in particular a carrier protein.
  • the carrier molecule may be Keyhole Limpet Hemocyanin (KLH) protein, hepatitis B surface antigen (HBsAg), bovine serum albumin (BSA), tetanus toxoid (TT) and toxoid of diphtheria (DT).
  • KLH Keyhole Limpet Hemocyanin
  • HBsAg hepatitis B surface antigen
  • BSA bovine serum albumin
  • TT tetanus toxoid
  • DT diphtheria
  • the toxoid of diphtheria (DT) is preferably selected from the group consisting of CRM 197, CRM 176, CRM 228, CRM 45, CRM 9, CRM 102, CRM 103, and CRM 107.
  • the carrier molecule is CRM 197.
  • the binding of the polypeptide according to the invention to a carrier molecule, in particular a carrier protein, can be carried out using a heterobifunctional coupling agent, such as the Ny-maleimidobutyryloxysuccinimide ester (GMBS) and the derivative.
  • GMBS Ny-maleimidobutyryloxysuccinimide ester
  • MBS m-maleimidobenzoyl-n-hydroxysuccinimide ester
  • SMCC sulfo-MBS derivative succinimidyl 4- (N-maleimidome ⁇ hyl) cyclohexane-1-carboxylate
  • BDB bisdiazonium-benzidine
  • glutaraldehyde araldehyde
  • GMBS, MBS or SMCC are used, they are preferably attached to a cysteine (C), which if not present in a first, a second, a third or a fourth sequence, or a sequence variant according to the invention may be added, in particular at its N-terminal or C-terminal end.
  • C cysteine
  • a cysteine is present in a first, a second, a third or a fourth sequence according to the invention at an undesired position, it is possible to implement, instead, a variant sequence in which cysteine is substituted with another amino acid, such as serine.
  • BDB When BDB is used, it is preferably attached to a tyrosine (Y), which if not present in a first, a second, a third or a fourth sequence, or a variant sequence according to the invention, may be added, especially at its N-terminus or C-terminus.
  • a tyrosine when a tyrosine is present in a first, a second, a third or a fourth sequence according to the invention at an undesired position, it is possible to implement, instead, a variant sequence in which the tyrosine is substituted by another amino acid, such as phenylalanine (F).
  • F phenylalanine
  • the binding of the polypeptide according to the invention to a carrier molecule can also be carried out using a peptide linker or peptide linker, which binds to the polypeptide according to the invention.
  • a carrier molecule in particular a carrier protein
  • peptide linker or peptide linker which binds to the polypeptide according to the invention.
  • one side and the carrier molecule on the other side optionally via a heterobifunctional coupling agent as defined above.
  • Such peptide bonds typically comprise from 1 to 10, especially from 4 to 6, amino acid residues.
  • polypeptide according to the invention is attached to the CRM 197 carrier protein according to a construction represented by a formula selected from the group consisting of the following formulas:
  • CRM 197 denotes the carrier protein
  • GMB denotes N-g-maleimidobutyryl
  • cyclo () indicates a lacfame-type cyclization between the side chains of amino acid residues at C-terminal and N-terminus
  • - cycloS-S () indicates a disulfide bridge cyclization between the sulfhydryl groups of the cysteines present in C-ferminal and in N-terminal,
  • brackets ([X] n) indicate that one or more polypeptides are attached to the carrier protein
  • the underlined part represents the polypeptide according to the invention, of which SEQ ID NO is indicated in the right-hand column.
  • the polypeptide according to the invention consists of a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1 and SEQ ID NO: 26 to 49.
  • the polypeptide according to the invention may be prepared by any method known in the state of the art and in particular by chemical synthesis. It is also possible to prepare it by expression of the nucleic acid according to the invention in eukaryotic or prokaryotic cells.
  • the polypeptide according to the invention if necessary linked to a carrier molecule, is immunogenic, that is to say it can elicit or cause an immune reaction, in particular of humoral type, that is to say the production of antibodies by an individual, in particular a mammalian type, to which it is administered.
  • the polypeptide according to the invention makes it possible to elicit an immune response directed against the PD-1 protein, in particular anti-PD-1 antibodies, preferably blocking or neutralizing anti-PD-1 antibodies, that is, that is to say that they prevent the PD-1 protein from exercising all or part, especially at least 10%, 25%, 50%, 75%, of its activity, for example measured in vitro.
  • the activity of PD-1 is preferably a binding to the PD-L1 protein, which can be measured as shown in Example 2 which follows.
  • the nucleic acid according to the invention is RNA or DNA, preferably DNA. It is preferred that the nucleic acid according to the invention is operably linked to a prokaryotic and / or eukaryotic promoter sequence, in particular that of a mammal or a virus. Moreover, the nucleic acid according to the invention can be included in a vector, such as a plasmid or a virus.
  • the antibodies, antibody fragments, and aptamers according to the invention are said to be specifically directed against a polypeptide as defined above when they show essentially no binding to another polypeptide, which does not does not include the polypeptide defined above, under conditions allowing the binding of antibodies, antibody fragment, and apfamers according to the invention to the polypeptides against which they are ⁇ specifically directed.
  • the antibody according to the invention may be polyclonal or monoclonal, preferably monoclonal.
  • the "antibody fragments" comprise at least one antigen-binding part of the antibody don ⁇ they are derived ⁇ , and its ⁇ in particular of Fab, Fab 'type, F (ab ') 2, disulfide stabilized Fv (dsFv), dimerized (diabody) V region, trimerized, tetramerized or pentamerized, single chain Fv (scFv), complementarity determining region (CDR).
  • the antibodies can be of any species, in particular human, mouse, ra ⁇ , rabbit or camelide. Moreover, when they are not human, they can also be humanized, that is to say that the constant parts of these antibodies are replaced partially or entirely by corresponding human constant parts.
  • the antibodies according to the invention can be obtained by immunization of an animal using a polypeptide according to the invention according to techniques well known to those skilled in the art.
  • aptamers are nucleic acids, particularly RNAs, capable of binding specifically to a molecular target, such as a protein. Aptamers can in particular be obtained by using the SELEX technique well known to those skilled in the art, from the polypeptides according to the invention.
  • the disease linked or due to the expression of the PD-1 protein or of the PD-L1 protein according to the invention is a cancer or an infectious disease.
  • the disease linked to or due to the PD-1 protein or the PD-L1 protein is selected from the group consisting of:
  • NSCLC non-small-cell metastatic lung carcinoma
  • advanced metastatic NSCLC progressing particularly with or after platinum-based chemotherapy
  • advanced renal cell carcinoma including metastatic, and locally advanced or metastatic urothelial carcinoma especially not responding to chemotherapy with platinum derivatives, prostate cancer, breast cancer, colorectal cancer, or any other cancer where PD-1 / PD-L1 is involved in the suppression of an anti-tumor immune response
  • bacterial infections such as pneumonia, meningitis, toxic shock syndrome, food poisoning, gastritis, ulcers, gonorrhea, boils, abscesses, impetigo, ear infections, tonsillitis, infections the urinary tract and genital infections broncho-pulmonary,
  • viral infections such as influenza, measles, hepatitis B, hepatitis C, infections with the human immunodeficiency virus (HIV), infections with herpes virus such as cytomegalovirus or Epsfein-Barr virus, herpes, e infections with human papillomavirus (HPV), e ⁇
  • HAV human immunodeficiency virus
  • herpes virus such as cytomegalovirus or Epsfein-Barr virus
  • HPV human papillomavirus
  • fungal infections such as blastomycosis, coccidioiodomycosis, rhisfoplamosis, paracoccidioiodomycosis, candidiasis, cryptococcosis, aspergillosis, mucomycosis and pneumocystosis.
  • the person or individuals according to the invention are animals, preferably mammals or marsupials, more preferably humans, horses, cattle, pigs, sheep, goats, camels, camels, dogs or dogs. cats, most preferably humans. It will be preferred according to the invention that the polypeptide according to the invention is derived from a PD-1 protein belonging to the same species as the individual in which the polypeptide is to be used or administered.
  • the polypeptide, the pharmaceutical composition, the drug or the product according to the invention is administered or in a form that can be administered orally, mucosally, in particular sublingually, parenterally, intraperitoneally, transcutaneously, intradermally, subcutaneously, intramuscularly. , intravenous or intra-arterial. doses
  • the polypeptide according to the invention may be administered in doses ranging for example from 1 ng to 1 g, preferably from 1 ⁇ g to 1 mg.
  • a "pharmaceutically acceptable carrier” includes all of the compounds, including excipients, that can be administered to an individual in conjunction with a pharmacological active ingredient.
  • the polypeptide according to the invention may be combined or combined with an adjuvant, or the pharmaceutical composition, the drug or the product according to the invention may comprise an adjuvant.
  • the adjuvant can be of any type suitable for increasing the immune response of an individual, animal or human, to the administration of a polypeptide. It can thus be complete or incomplete Freund's adjuvant, Monfanide ISA 51 VG, aluminum hydroxide or aluminum phosphate or calcium phosphate for example, the monfanide ISA 51 VG and the hydroxides of aluminum or aluminum phosphate being preferred.
  • the adjuvant may be combined with the polypeptide according to the invention by carrying out a 1/1 mixture by volume of an adjuvant solution and a solution comprising the polypeptide.
  • other therapy designates a pharmacological therapy with at least one other compound different from the polypeptide according to the invention or a non-pharmacological therapy such as, for example, radiotherapy, in particular anti-cancer therapy.
  • the other compound that is useful for eliciting an immune response directed against the PD-1 protein according to the invention may in particular be a polypeptide different from that of the invention derived from the PD-1 protein or a polypeptide derived from PD-L1.
  • the other compound intended for the prevention or treatment of a disease linked to or due to the PD-1 protein or the PD-L1 protein, a cancer or an infectious disease can be a compound anticancer chemotherapy, an anti-cancer immunotherapy compound, for example a monoclonal antibody, an antibiotic, an antiviral agent, especially of the interferon type, or an antimycotic agent.
  • the polypeptide according to the invention can be combined with other antigens intended to elicit an immune response. against a different target of the PD-1 protein, for example the PD-L1 protein. This type of combination is useful for the preparation of multivalent vaccines.
  • the expression "in combination” or “combination product” means that the polypeptide as defined above and the other compound as defined above can be combined within one and the same pharmaceutical composition or the same drug, e ⁇ therefore be administered together, or be administered separately, that is to say, according to separate routes of administration and / or separate administration regimes, subject to when they are administered separately the periods of prophylactic or therapeutic activity of the polypeptide as defined above e ⁇ of the other compound as defined above overlap in whole or in part.
  • the polypeptide as defined above when the polypeptide and the other compound are administered separately, the polypeptide as defined above will preferably be administered within 24 hours, more preferably within 2 hours, and still more preferably within 1 hour. Depending on the administration of the other compound as defined above, its administration may be continued in the following days. Conversely, the other compound as defined above will preferably be administered within 24 hours, more preferably within 2 hours, even more preferably within 1 hour, following administration of the polypeptide as defined above. His administration will eventually be continued on the following days. In another preferred embodiment of the invention, when the polypeptide as defined above and the other compound as defined above are administered separately, they are administered essentially simultaneously.
  • FIG. 1 represents the relative amount of anfi-huPD-1 antibody present in the serum diluted to 1 / 500th of SWISS mice immunized with peptides PPV-10-01, PPV-10-02, PPV-10-03, PPV. -10-04 and PPV-10-05 measured by ELISA (ordinate axis, optical density (OD) at 450nm).
  • the horizontal line at 0.2 OD unit represents the significance threshold.
  • Example 1 Recognition of the whole human PD-1 protein fhPD-1) by sera of mice immunized with peptides derived from hPD-1.
  • peptides derived from the human PD-1 protein were produced by solid phase chemical synthesis and then cyclized by adding cysteines to the ends of the epitope of interest and forming a disulfide bridge. They were then coupled via a peptide linkage containing a C-ferminal cysteine to a carrier protein, CRM 197 (C-Reactive Material 197), using the GMBS coupling agent.
  • CRM 197 C-Reactive Material 197
  • amino acid residues are annotated from the sequence of the human PD-1 protein (Swissprot Q 151 16)
  • the relative amount of anti-PD-1 antibody was evaluated in mouse sera on D54 by ELISA (1: 500 dilution). It is observed that all the conjugates tested generate the production of antibodies recognizing the human PD-1 protein (FIG.
  • Example 2 Neutralization of the biological activity of human PD-1 with antibodies purified from the serum of rabbits immunized with the peptides derived from
  • Neutralizing capacity of purified IgG from rabbit serum (n 4 / group) respectively immunized with peptides PPV-10-01, PPV-10-02, PPV-10-03, PPV-10-04 e ⁇ PPV 10-05, was evaluated in a PD-1 / PD-L1 interaction neutralization cell (Promega, J 1250). This is based on the interaction between 2 cell lines:
  • CHO-K1 cell line expressing the human PD-L1 gene and a surface protein making it possible to activate the TCRs in an antigen-dependent manner.
  • Plating J l: Inoculation of a 96-well flat-bottomed plate treated for cell culture with CHO-K1 cells. Incubate the plate for 20h at 37 ° C.

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Abstract

The present invention relates to a polypeptide which comprises or consists of: - a first sequence consisting of at least 8 contiguous amino acid residues selected from within the sequence extending from amino acid residues 123 to 137 of the PD-1 protein, and at most 30 contiguous amino acid residues selected from within the complete sequence of the PD-1 protein; and/or - a second sequence consisting of at least 8 contiguous amino acid residues selected from within the sequence extending from amino acid residues 66 to 81 of the PD-1 protein, and at most 30 contiguous amino acid residues selected from within the complete sequence of the PD-1 protein; and/or - a third sequence consisting of at least 8 contiguous amino acid residues selected from within the sequence extending from amino acid residues 95 to 110 of the PD-1 protein, and at most 30 contiguous amino acid residues selected from within the complete sequence of the PD-1 protein; and/or - a fourth sequence consisting of at least 8 contiguous amino acid residues selected from within the sequence extending from amino acid residues 22 to 33 of the PD-1 protein, and at most 30 contiguous amino acid residues selected from within the complete sequence of the PD-1 protein.

Description

COMPOSITION VACCINALE ANTI-PD-1  ANTI-PD-1 VACCINE COMPOSITION
Domaine de l’invention Field of the invention
La présente invention concerne des polypeptides utiles pour éliciter une réponse immunitaire dirigée contre la protéine PD-1.  The present invention provides polypeptides useful for eliciting an immune response directed against PD-1 protein.
Arrière-plan technique Technical background
Il est aujourd’hui établi que l’intensité de la réponse immunitaire naturelle contre les antigènes du cancer est corrélée à de meilleurs pronostics pour les patients et ce pour de nombreux types de néoplasie. Des observations cliniques, appuyées par de nombreuses preuves expérimentales, ont permis de définir le concept d'immuno-surveillance du cancer, selon lequel les tumeurs émergentes son† généralement éradiquées par le système immunitaire, sauf dans des circonstances où les cellules cancéreuses on† évolué pour échapper à la détection immunitaire.  It is now established that the intensity of the natural immune response against cancer antigens is correlated with better prognosis for patients for many types of neoplasia. Clinical observations, supported by extensive experimental evidence, have helped define the concept of cancer immunoassay, in which emerging tumors are usually eradicated by the immune system, except in circumstances where cancer cells have evolved. to escape immune detection.
L'immunothérapie anticancéreuse - application directe du concept d'immuno-surveillance - qui a connu un essor et un succès spectaculaire au cours de la dernière décennie, a révolutionné la prise en charge clinique d'un large éventail de tumeurs malignes auparavant associées à un mauvais pronostic.  Cancer Immunotherapy - a direct application of the concept of immuno-surveillance - which has experienced spectacular growth and success over the past decade, has revolutionized the clinical management of a wide range of malignancies previously associated with poor prognosis
Au premier plan du développement de l'immunothérapie se trouvent les anticorps monoclonaux, bloqueurs des points de contrôles de la réponse immunitaires ( immune-checkpoint blockers (ICB)), qui connaissent un grand succès en cancérologie grâce à leur large activité sur de nombreux types de tumeurs, la durabilité de leurs réponses et leurs capacités de traitement dans les cas de tumeurs métastasiques chimio-résistantes.  At the forefront of the development of immunotherapy are monoclonal antibodies, blockers of immune-checkpoint blockers (ICBs), which are very successful in oncology because of their wide activity on many types tumors, the durability of their responses and their treatment capabilities in metastatic chemo-resistant tumors.
Parmi les stratégies de blocage des points de contrôle, les deux plus importantes (en termes de succès clinique à ce jour) son† le ciblage par des anticorps monoclonaux spécifiques de la protéine 4 associée aux lymphocytes T cytotoxiques (CTLA-4) et de l'interaction entre la protéine de mort cellulaire programmée 1 (PD-1 ) et le ligand de cette protéine de mort cellulaire programmé 1 (PD-L1 ). En particulier, l'inhibition de la signalisation PD-L1 a été proposée comme un moyen d'améliorer l'immunité des cellules T pour le traitement du cancer (immunité anfi-fumorale) mais également dans le traitement des infections (infection persistante aiguë et chronique). À ce jour, quatre ICB ciblant l’axe PD-1 /PD-L1 ont ainsi été notamment approuvés par l’agence fédérale du médicament (FDA) américaine (pour revue voir par exemple Abdin et al. (2018) Cancers 10 32,) : Among the control point blocking strategies, the two most important (in terms of clinical success to date) are its targeting by monoclonal antibodies specific for cytotoxic T-cell-associated protein 4 (CTLA-4) and interaction between the programmed cell death protein 1 (PD-1) and the ligand of this programmed cell death protein 1 (PD-L1). In particular, the inhibition of PD-L1 signaling has been proposed as a means of improving T cell immunity for the treatment of cancer (anfi-fumoral immunity) but also in the treatment of infections (acute persistent infection and chronic). To date, four CBIs targeting the PD-1 / PD-L1 axis have been approved by the US Federal Drug Administration (FDA) for review (see for example, see Abdin et al (2018) Cancers 10 32, ):
(1 ) le pembrolizumab, un anticorps monoclonal (mAb) anti-PD-1 approuvé pour les personnes atteintes d'un mélanome métastatique non résécable ou d'un carcinome pulmonaire métastatique non à petites cellules avancé (NSCLC) dont les tumeurs expriment PD-L1 ;  (1) pembrolizumab, an anti-PD-1 monoclonal antibody (mAb) approved for people with unresectable metastatic melanoma or advanced non-small-cell metastatic lung carcinoma (NSCLC) whose tumors express PD-1 L1;
(2) le nivolumab, un anticorps monoclonal (mAb) anti-PD-1 approuvé pour le mélanome non résécable ou métastatique, le NSCLC métastatique avancé progressant avec ou après une chimiothérapie à base de platine, e† le carcinome rénal avancé, notamment métastatique ;  (2) nivolumab, an anti-PD-1 monoclonal antibody (mAb) approved for unresectable or metastatic melanoma, advanced metastatic NSCLC progressing with or after platinum-based chemotherapy, and advanced renal cell carcinoma, including metastatic ;
(3) l'atezolizumab, un anticorps monoclonal (mAb) anti-PD-Ll récemment approuvé pour le traitement du carcinome urothélial localement avancé ou métastatique ne répondant pas à la chimiothérapie à base de dérivés du platine ; e†  (3) atezolizumab, a recently approved anti-PD-Ll monoclonal antibody (mAb) for the treatment of locally advanced or metastatic urothelial carcinoma that does not respond to platinum derivative chemotherapy; e †
(4) l’avelumab, un anticorps monoclonal (mAb) anti-PD-Ll récemment approuvé pour le traitement du carcinome métastatique à cellules de Merkel.  (4) Avelumab, a recently approved anti-PD-Ll monoclonal antibody (mAb) for the treatment of metastatic Merkel cell carcinoma.
De plus ces ICB déjà approuvés dans un certain nombre d’indications pourraient être également reconnus à l’avenir comme étant utiles dans le cadre du traitement d’autres formes de cancer.  In addition, these already approved BCIs in a number of indications could also be recognized in the future as being useful in the treatment of other forms of cancer.
Par ailleurs, des ICB ciblant PD-L1 se sont révélés très efficaces dans le mélanome, le NSCLC e† le carcinome rénal.  In addition, PD-L1 targeting ICBs have been shown to be highly effective in melanoma, NSCLC and renal cell carcinoma.
Toutefois, l’ensemble des produits commercialisés ou développés en tant qu’ICB ciblant l’axe PD-1 /PD-L1 sont des anticorps monoclonaux e† sont donc affectés des mêmes limitations que d’autres traitements par anticorps monoclonaux : un coût élevé, la nécessité de ré-adminisfrafion fréquente e† le développement d’une réaction immunitaire dirigée contre les anticorps monoclonaux administrés.  However, all the products marketed or developed as IBB targeting the PD-1 / PD-L1 axis are monoclonal antibodies e † are therefore affected by the same limitations as other monoclonal antibody treatments: a high cost The need for frequent re-administration is the development of an immune response against the administered monoclonal antibodies.
C’est donc un objet de la présente invention que de surmonter ces inconvénients.  It is therefore an object of the present invention to overcome these disadvantages.
Résumé de l’invention Summary of the invention
La présente invention découle de la mise en évidence inattendue, par les inventeurs, que des polypeptides dérivés de séquences s’étendant des résidus d’acides aminés 22 à 33, 66 à 81 , 95 à 1 10, e† 123 à 137 de la protéine PD-1 humaine permettaient la production d’anticorps neutralisant la protéine PD-1 par des souris auxquelles ils ont été administrés. The present invention results from the unexpected finding by the inventors that polypeptides derived from sequences extending residues of amino acids 22 to 33, 66 to 81, 95 to 110, e 123 to 137 of the human PD-1 protein allowed the production of antibodies neutralizing the PD-1 protein by mice to which they were administered.
La présente invention concerne donc un polypeptide comprenant, ou constitué de :  The present invention therefore relates to a polypeptide comprising or consisting of:
- une première séquence constituée d’au moins 8 résidus d’acides aminés contigus choisis au sein de la séquence s’étendant des résidus d’acides aminés 123 à 137 de la protéine PD-1 et d’au plus 30 résidus d’acides aminés contigus choisis au sein de la séquence complète de la protéine PD-1 , ou une séquence variante présentant au moins 75% d’identité avec la première séquence ; et/ou  a first sequence consisting of at least 8 contiguous amino acid residues selected within the sequence extending from amino acid residues 123 to 137 of the PD-1 protein and of at most 30 acid residues contiguous amines selected from the complete sequence of the PD-1 protein, or a variant sequence having at least 75% identity with the first sequence; and or
- une deuxième séquence constituée d’au moins 8 résidus d’acides aminés contigus choisis au sein de la séquence s’étendant des résidus d’acides aminés 66 à 81 de la protéine PD-1 et d’au plus 30 résidus d’acides aminés contigus choisis au sein de la séquence complète de la protéine PD-1 , ou une séquence variante présentant au moins 75% d’identité avec la deuxième séquence ; et/ou  a second sequence consisting of at least 8 contiguous amino acid residues chosen from the sequence extending from amino acid residues 66 to 81 of the PD-1 protein and of at most 30 acid residues contiguous amines selected from the complete sequence of the PD-1 protein, or a variant sequence having at least 75% identity with the second sequence; and or
- une troisième séquence constituée d’au moins 8 résidus d’acides aminés contigus choisis au sein de la séquence s’étendant des résidus d’acides aminés 95 à 1 10 de la protéine PD-1 et d’au plus 30 résidus d’acides aminés contigus choisis au sein de la séquence complète de la protéine PD-1 , ou une séquence variante présentant au moins 75% d’identité avec la troisième séquence ; et/ou  a third sequence consisting of at least 8 contiguous amino acid residues selected within the sequence extending from amino acid residues 95 to 110 of the PD-1 protein and at most 30 residues of contiguous amino acids selected from the complete sequence of the PD-1 protein, or a variant sequence having at least 75% identity with the third sequence; and or
- une quatrième séquence constituée d’au moins 8 résidus d’acides aminés contigus choisis au sein de la séquence s’étendant des résidus d’acides aminés 22 à 33 de la protéine PD-1 et d’au plus 30 résidus d’acides aminés contigus choisis au sein de la séquence complète de la protéine PD-1 , ou une séquence variante présentant au moins 75% d’identité avec la quatrième séquence ;  a fourth sequence consisting of at least 8 contiguous amino acid residues selected from the sequence extending from amino acid residues 22 to 33 of the PD-1 protein and of at most 30 acid residues contiguous amines selected from the complete sequence of the PD-1 protein, or a variant sequence having at least 75% identity with the fourth sequence;
sous réserve que le polypeptide soit différent de la protéine PD-1 e† qu’il ne soi† pas constitué d’une portion de plus de 30 résidus d’acides aminés contigus de la protéine PD-1 , e† sous réserve que des polypeptides respectivement constitués des séquences variantes de la première, la deuxième, la troisième, et la quatrième séquence permettent d’éliciter une réponse immunitaire dirigée contre la protéine PD-1. provided that the polypeptide is different from the PD-1 protein e † that it does not consist of a portion of more than 30 contiguous amino acid residues of the PD-1 protein, e † provided that polypeptides consisting respectively of variant sequences of the first, second, third, and fourth sequences elicit an immune response directed against the PD-1 protein.
Dans un mode de réalisation préféré, l’invention concerne plus particulièrement un polypeptide comprenant, ou constitué de :  In a preferred embodiment, the invention relates more particularly to a polypeptide comprising or consisting of:
- une première séquence constituée de SEQ ID NO : 1 , 50, 51 , 52, 53, ou 54, ou une séquence variante présentant au moins 75% d’identité avec la première séquence ; et/ou  a first sequence consisting of SEQ ID NO: 1, 50, 51, 52, 53, or 54, or a variant sequence having at least 75% identity with the first sequence; and or
- une deuxième séquence constituée de SEQ ID NO : 2, 55, 56, ou 57, ou une séquence variante présentant au moins 75% d’identité avec la deuxième séquence ; et/ou  a second sequence consisting of SEQ ID NO: 2, 55, 56, or 57, or a variant sequence having at least 75% identity with the second sequence; and or
- une troisième séquence constituée de SEQ ID NO : 3 ou 58, ou une séquence variante présentant au moins 75% d’identité avec la troisième séquence ; et/ou  a third sequence consisting of SEQ ID NO: 3 or 58, or a variant sequence exhibiting at least 75% identity with the third sequence; and or
- une quatrième séquence constituée de SEQ ID NO : 4, ou une séquence variante présentant au moins 75% d’identité avec la quatrième séquence ; sous réserve que des polypeptides respectivement constitués des séquences variantes de la première, la deuxième, la troisième, e† la quatrième séquence permettent d’éliciter une réponse immunitaire dirigée contre la protéine PD-1.  a fourth sequence consisting of SEQ ID NO: 4, or a variant sequence exhibiting at least 75% identity with the fourth sequence; provided that polypeptides consisting respectively of variant sequences of the first, the second, the third and the fourth sequence elicit an immune response directed against the PD-1 protein.
La présente invention concerne également un acide nucléique codant pour un polypeptide tel que défini ci-dessus, ou le complémentaire de celui-ci.  The present invention also relates to a nucleic acid encoding a polypeptide as defined above, or the complement thereof.
La présente invention concerne également :  The present invention also relates to:
- au moins un polypeptide tel que défini ci-dessus, ou  at least one polypeptide as defined above, or
- au moins un acide nucléique tel que défini ci-dessus,  at least one nucleic acid as defined above,
pour une utilisation à fifre de médicament, notamment de vaccin. Dans un mode de réalisation particulier de l’invention, le médicament, notamment le vaccin, tel que défini ci-dessus comprend également au moins un autre composé destiné à la prévention ou au traitement d’une maladie liée ou due à l’expression de la protéine PD-1 ou de la protéine PD-L1 , d’un cancer ou d’une maladie infectieuse. for use in fife medicine, especially vaccine. In a particular embodiment of the invention, the medicament, in particular the vaccine, as defined above also comprises at least one other compound intended for the prevention or treatment of a disease linked or due to the expression of PD-1 protein or PD-L1 protein, cancer or infectious disease.
La présente invention concerne également une composition pharmaceutique, notamment vaccinale, comprenant, à fifre de substance active : The present invention also relates to a pharmaceutical composition, in particular a vaccine composition, comprising, with the filler of active substance:
- au moins un polypeptide tel que défini ci-dessus, ou at least one polypeptide as defined above, or
- au moins un acide nucléique tel que défini ci-dessus, éventuellement en association avec au moins un véhicule pharmaceutiquement acceptable. Dans un mode de réalisation particulier de l’invention, la composition pharmaceutique, notamment vaccinale, telle que définie ci-dessus comprend également au moins un autre composé destiné à la prévention ou au traitement d’une maladie liée ou due à l’expression de la protéine PD-1 ou de la protéine PD-L1 , d’un cancer ou d’une maladie infectieuse. at least one nucleic acid as defined above, optionally in combination with at least one pharmaceutically acceptable vehicle. In a particular embodiment of the invention, the pharmaceutical composition, in particular vaccine, as defined above also comprises at least one other compound intended for the prevention or treatment of a disease linked or due to the expression of PD-1 protein or PD-L1 protein, cancer or infectious disease.
La présente invention concerne également l’utilisation d’un polypeptide tel que défini ci-dessus, pour la préparation d’un anticorps, d’un fragment d’anticorps ou d’un aptamère.  The present invention also relates to the use of a polypeptide as defined above, for the preparation of an antibody, an antibody fragment or an aptamer.
La présente invention concerne également une méthode de préparation d’un anticorps, d’un fragment d’anticorps ou d’un aptamère comprenant une étape d’administration d’un polypeptide tel que défini ci-dessus à un organisme producteur d’anticorps ou une étape de sélection par affinité d’un anticorps, d’un fragment d’anticorps ou d’un aptamère qui se lie au polypeptide tel que défini ci- dessus.  The present invention also relates to a method for preparing an antibody, an antibody fragment or an aptamer comprising a step of administering a polypeptide as defined above to an antibody producing organism or an affinity screening step of an antibody, an antibody fragment or an aptamer which binds to the polypeptide as defined above.
La présente invention concerne également un anticorps, un fragment d’anticorps, ou un aptamère anfi-PD-1 spécifiquement dirigé contre le polypeptide tel que défini ci-dessus, sous réserve que le polypeptide ne comprenne pas plus de deux résidus d’acides aminés en plus de la première, de la deuxième, de la troisième, ou quatrième séquence ou de leurs séquences variantes respectives.  The present invention also relates to an antibody, an antibody fragment, or an anti-PD-1 aptamer specifically directed against the polypeptide as defined above, provided that the polypeptide does not comprise more than two amino acid residues. in addition to the first, second, third, or fourth sequences or their respective variant sequences.
La présente invention concerne également un anticorps, un fragment d’anticorps, ou un aptamère tel que défini ci-dessus, pour une utilisation à titre de médicament. Dans un mode de réalisation particulier de l’invention, le médicament tel que défini ci-dessus comprend également au moins un autre composé destiné à la prévention ou au traitement d’une maladie liée ou due à l’expression de la protéine PD-1 ou de la protéine PD-L1 , d’un cancer ou d’une maladie infectieuse.  The present invention also relates to an antibody, an antibody fragment, or an aptamer as defined above for use as a medicament. In a particular embodiment of the invention, the medicament as defined above also comprises at least one other compound intended for the prevention or treatment of a disease linked or due to the expression of the PD-1 protein. or PD-L1 protein, cancer or infectious disease.
La présente invention concerne également une composition pharmaceutique comprenant, à titre de principe actif, un anticorps, un fragment d’anticorps, ou un aptamère tel que défini ci-dessus, éventuellement en association avec un véhicule pharmaceutiquement acceptable. Dans un mode de réalisation particulier de l’invention, la composition pharmaceutique telle que définie ci-dessus comprend également au moins un autre composé destiné à la prévention ou au traitement d’une maladie liée ou due à l’expression de la protéine PD-1 ou de la protéine PD-L1 , d’un cancer ou d’une maladie infectieuse. La présente invention concerne également un polypeptide tel que défini ci- dessus, un acide nucléique tel que défini ci-dessus, ou une composition pharmaceutique telle que définie ci-dessus, pour une utilisation dans une méthode pour éliciter une réponse immunitaire dirigée contre la protéine PD-1 chez un individu. Dans un mode de réalisation particulier de l’invention, le polypeptide, l’acide nucléique ou la composition pharmaceutique est utilisé en combinaison avec au moins un autre composé utile pour éliciter une réponse immunitaire dirigée contre la protéine PD-1. The present invention also relates to a pharmaceutical composition comprising, as active ingredient, an antibody, an antibody fragment, or an aptamer as defined above, optionally in combination with a pharmaceutically acceptable vehicle. In a particular embodiment of the invention, the pharmaceutical composition as defined above also comprises at least one other compound intended for the prevention or treatment of a disease linked or due to the expression of the PD-protein. 1 or PD-L1 protein, cancer or infectious disease. The present invention also relates to a polypeptide as defined above, a nucleic acid as defined above, or a pharmaceutical composition as defined above, for use in a method for eliciting an immune response directed against the protein PD-1 in an individual. In a particular embodiment of the invention, the polypeptide, nucleic acid or pharmaceutical composition is used in combination with at least one other compound useful for eliciting an immune response directed against the PD-1 protein.
La présente invention concerne également une méthode pour éliciter une réponse immunitaire dirigée contre la protéine PD-1 chez un individu, comprenant l’administration à l’individu d’une quantité efficace d’un polypeptide tel que défini ci-dessus, d’un acide nucléique tel que défini ci-dessus, ou d’une composition pharmaceutique telle que définie ci-dessus. Dans un mode de réalisation particulier de l’invention, le polypeptide, l’acide nucléique ou la composition pharmaceutique est administrée en combinaison avec au moins un autre composé utile pour éliciter une réponse immunitaire dirigée contre la protéine PD-1.  The present invention also relates to a method for eliciting an immune response directed against the PD-1 protein in an individual, comprising administering to the individual an effective amount of a polypeptide as defined above, a nucleic acid as defined above, or a pharmaceutical composition as defined above. In a particular embodiment of the invention, the polypeptide, nucleic acid or pharmaceutical composition is administered in combination with at least one other compound useful for eliciting an immune response directed against the PD-1 protein.
La présente invention concerne également l’utilisation d’un polypeptide tel que défini ci-dessus ou d’un acide nucléique tel que défini ci-dessus pour la préparation d’un médicament destiné à éliciter une réponse immunitaire dirigée contre la protéine PD-1 chez un individu. Dans un mode de réalisation particulier de l’invention, le médicament comprend également au moins un autre composé utile pour éliciter une réponse immunitaire dirigée contre la protéine PD-1.  The present invention also relates to the use of a polypeptide as defined above or a nucleic acid as defined above for the preparation of a medicament for eliciting an immune response directed against the PD-1 protein in an individual. In a particular embodiment of the invention, the medicament also comprises at least one other compound useful for eliciting an immune response directed against the PD-1 protein.
La présente invention concerne également un polypeptide tel que défini ci- dessus, un acide nucléique tel que défini ci-dessus, une composition pharmaceutique telle que définie ci-dessus, ou un anticorps, un fragment d’anticorps ou un apfamère tel que défini ci-dessus, pour une utilisation dans une méthode de prévention ou de traitement d’une maladie liée ou due à la protéine PD-1 chez un individu. Dans un mode de réalisation particulier de l’invention, le polypeptide, l’acide nucléique, la composition pharmaceutique, ou l’anticorps, le fragment d’anticorps ou l 'apfamère est utilisé en combinaison avec au moins une autre thérapie destinée à la prévention ou au traitement d’une maladie liée à la protéine PD-1 , d’un cancer ou d’une maladie infectieuse.  The present invention also relates to a polypeptide as defined above, a nucleic acid as defined above, a pharmaceutical composition as defined above, or an antibody, an antibody fragment or an apfamer as defined herein. above, for use in a method of preventing or treating a PD-1 related or PD-related disease in an individual. In a particular embodiment of the invention, the polypeptide, the nucleic acid, the pharmaceutical composition, or the antibody, the antibody fragment or the apfamer is used in combination with at least one other therapy intended for the prevention or treatment of PD-1-related disease, cancer or infectious disease.
La présente invention concerne également une méthode de prévention ou de traitement d’une maladie liée ou due à l’expression de la protéine PD-1 ou de la protéine PD-L1 chez un individu, comprenant l’administration à l’individu d’une quantité efficace d’un polypeptide tel que défini ci-dessus, d’un acide nucléique tel que défini ci-dessus, d’une composition pharmaceutique telle que définie ci-dessus, ou d’un anticorps, d’un fragment d’anticorps ou d’un apfamère tel que défini ci- dessus. Dans un mode de réalisation particulier de l’invention, la méthode comprend au moins une autre thérapie destinée à la prévention ou au traitement d’une maladie liée à l’expression de la protéine PD-1 ou de la protéine PD-L1 , d’un cancer ou d’une maladie infectieuse. The present invention also relates to a method of preventing or treating a disease related to or due to expression of the PD-1 protein or the PD-L1 protein in an individual, comprising administering to the individual an effective amount of a polypeptide as defined above, a nucleic acid as defined above, a pharmaceutical composition such as as defined above, or an antibody, an antibody fragment or an apfamer as defined above. In a particular embodiment of the invention, the method comprises at least one other therapy for the prevention or treatment of a disease related to the expression of the PD-1 protein or of the PD-L1 protein, d 'a cancer or an infectious disease.
La présente invention concerne également l’utilisation d’un polypeptide tel que défini ci-dessus, d’un acide nucléique tel que défini ci-dessus, ou d’un anticorps, d’un fragment d’anticorps ou d’un apfamère tel que défini ci-dessus, pour la préparation d’un médicament destiné à la prévention ou au traitement d’une maladie liée ou due à l’expression de la protéine PD-1 ou de la protéine PD-L1 chez un individu. Dans un mode de réalisation particulier de l’invention, le médicament comprend au moins un autre composé destiné à la prévention d’une maladie liée ou due à l’expression de la protéine PD-1 ou de la protéine PD-L1 , d’un cancer ou d’une maladie infectieuse.  The present invention also relates to the use of a polypeptide as defined above, a nucleic acid as defined above, or an antibody, an antibody fragment or an apfamer such as as defined above, for the preparation of a medicament for the prevention or treatment of a disease related or due to the expression of the PD-1 protein or the PD-L1 protein in an individual. In a particular embodiment of the invention, the medicament comprises at least one other compound intended for the prevention of a disease linked or due to the expression of the PD-1 protein or of the PD-L1 protein, of cancer or an infectious disease.
La présente invention concerne également des produits contenant :  The present invention also relates to products containing:
- un polypeptide ou un acide nucléique tel que défini ci-dessus, et  a polypeptide or a nucleic acid as defined above, and
- au moins un autre composé destiné à la prévention ou au traitement d’une maladie liée ou due à l’expression de la protéine PD-1 ou de la protéine PD-L1 , d’un cancer ou d’une maladie infectieuse,  at least one other compound intended for the prevention or treatment of a disease linked or due to the expression of the PD-1 protein or the PD-L1 protein, of a cancer or of an infectious disease,
comme produit de combinaison pour une utilisation simultanée, séparée ou étalée dans le temps pour la prévention ou le traitement d’une maladie liée ou due à l’expression de la protéine PD-1 ou de la protéine PD-L1 , d’un cancer ou d’une maladie infectieuse chez un individu. as a combination product for simultaneous, separate or spread use over time for the prevention or treatment of a disease related to or due to expression of PD-1 protein or PD-L1 protein, cancer or an infectious disease in an individual.
Description de l’invention Description of the invention
A titre préliminaire, on rappellera que le terme « comprenant » signifie « incluant », « contenant » ou « englobant », c’esf-à-dire que lorsqu’un objet « comprend » un élément ou plusieurs éléments, d’autres éléments que ceux mentionnés peuvent également être compris dans l’objet. A contrario, l’expression « consistant en » signifie « constitué de », c’esf-à-dire que lorsqu’un objet « consiste en » un élément ou plusieurs éléments, l’objet ne peu† pas comprendre d’autres éléments que ceux mentionnés. As a preliminary, it will be recalled that the term "comprising" means "including", "containing" or "encompassing", that is, when an object "includes" one or more elements, other elements that those mentioned can also be included in the object. On the other hand, the expression "consisting of" means "consisting of", that is, when an object "consists of" In one or more elements, the object can not include other elements than those mentioned.
Polypeptide polypeptide
Définition de la protéine PD- J  Definition of PD-J protein
La protéine PD-1 est la protéine de la mort cellulaire programmée 1 (programmed cell death protein / ), également nommée PDC1 ou encore cluster de différentiation 279 ( cluster of différentiation 279, CD279), elle es† bien connue de l’homme du métier.  PD-1 protein is the programmed cell death protein (PDM1), also called PDC1 or differentiation cluster 279 (cluster of differentiation 279, CD279), and is well-known to humans. job.
Espèces et séquences préférées de la protéine PD- J Preferred species and sequences of the PD-J protein
De préférence, la protéine PD-1 selon l’invention es† sélectionnée dans le groupe constitué de la protéine PD-1 humaine, de la protéine PD-1 de souris, de la protéine PD-1 de singe, de la protéine PD-1 de cheval, de la protéine PD-1 de bovin, de la protéine PD-1 de cochon, de la protéine PD-1 de mouton, de la protéine PD-1 de chèvre, de la protéine PD-1 de chameau, notamment sauvage ou domestique, de la protéine PD-1 de dromadaire, de la protéine PD-1 de chien, e† de la protéine PD-1 de chat. De manière particulièrement préférée, la protéine PD-1 es† la protéine PD-1 humaine.  Preferably, the PD-1 protein according to the invention is selected from the group consisting of human PD-1 protein, mouse PD-1 protein, monkey PD-1 protein, PD-1 protein, 1, bovine PD-1 protein, pig PD-1 protein, sheep PD-1 protein, goat PD-1 protein, camel PD-1 protein, and the like. wild or domestic, camel PD-1 protein, dog PD-1 protein, e. of PD-1 cat protein. Particularly preferably, the PD-1 protein is the human PD-1 protein.
De préférence :  Preferably:
la protéine PD-1 humaine (hPD-1 ) es† telle que décrite dans la base de données UniProt/Swisspro† sous la référence Q151 16 e† es† constituée de SEQ ID NO : 5,  the human PD-1 protein (hPD-1) es † as described in the UniProt / Swisspro † database under the reference Q151 16 e † es consisting of SEQ ID NO: 5,
la protéine PD-1 de souris (mPD-1 ) es† telle que décrite dans la base de données UniProt/Swisspro† sous la référence Q02242 e† es† constituée de SEQ ID NO : 6,  mouse PD-1 protein (mPD-1) as described in the UniProt / Swisspro † database under the reference Q02242 e † es † consisting of SEQ ID NO: 6,
la protéine PD-1 de singe es† telle que décrite dans la base de données Genbank sous la référence NP_001 107830 e† es† constituée de SEQ ID NO : 7, la protéine PD-1 de cheval es† telle que décrite dans la base de données Genbank sous la référence XP_023498583.1 ou XP_023498582.1 e† es† constituée de SEQ ID NO : 8 ou 9,  the monkey PD-1 protein as described in the Genbank database as NP_001 107830 e † es † consisting of SEQ ID NO: 7, the horse PD-1 protein as described in the database. Genbank data under the reference XP_023498583.1 or XP_023498582.1 e † es † consisting of SEQ ID NO: 8 or 9,
la PD-1 de chien es† telle que décrite dans la base de données SwissProf sous la référence A0A024FCJ9 e† es† constituée de SEQ ID NO : 10, la PD-1 de chat es† telle que décrite dans la base de données Genbank sous la référence NP_001 138982.1 e† es† constituée de SEQ ID NO : 1 1 . the dog PD-1 is as described in the SwissProf database under the reference A0A024FCJ9 e † es consisting of SEQ ID NO: 10, the chat PD-1 as described in the Genbank database under the reference NP_001 138982.1 † † consisting of SEQ ID NO: 1 1.
la protéine PD-1 de bovin es† telle que décrite dans la base de données Genbank sous la référence BAX73992.1 ; DAA30855.1 ou NP_001076975.1 et es† constituée de SEQ ID NO : 12 ou 13 ou 14,  bovine PD-1 protein as described in the Genbank database as BAX73992.1; DAA30855.1 or NP_001076975.1 and es † consisting of SEQ ID NO: 12 or 13 or 14,
la PD-1 de cochon es† telle que décrite dans la base de données Genbank sous la référence NP_001 191308.1 ou XP_020930289.1 et es† constituée de SEQ ID NO : 15 ou 16,  the pig PD-1 es as described in the Genbank database under the reference NP_001 191308.1 or XP_020930289.1 and es † consisting of SEQ ID NO: 15 or 16,
la protéine PD-1 de mouton es† telle que décrite dans la base de données Genbank sous la référence XP_012031617.1 et es† constituée de SEQ ID NO : 17.  sheep protein PD-1 as described in the Genbank database under the reference XP_012031617.1 and es † consisting of SEQ ID NO: 17.
la protéine PD-1 de chèvre es† telle que décrite dans la base de données Genbank sous la référence XP_013818552.2 ou XP_01 7899964.1 et es† constituée de SEQ ID NO : 18 ou 19.  goat PD-1 protein † as described in the Genbank database under the reference XP_013818552.2 or XP_01 7899964.1 and es † consisting of SEQ ID NO: 18 or 19.
la protéine PD-1 de chameau domestique es† telle que décrite dans la base de données Genbank sous la référence XP_010946391 .1 ou XP_010946392.1 et es† constituée de SEQ ID NO : 20 ou 21 .  the domestic camel PD-1 protein as described in the Genbank database under the reference XP_010946391 .1 or XP_010946392.1 and es † consisting of SEQ ID NO: 20 or 21.
la protéine PD-1 de chameau sauvage es† telle que décrite dans la base de données Genbank sous la référence XP_014412330.1 ou XP_014412331 .1 et es† constituée de SEQ ID NO : 22 ou 23.  the wild camel PD-1 protein as described in the Genbank database under the reference XP_014412330.1 or XP_014412331 .1 and es † consisting of SEQ ID NO: 22 or 23.
la protéine PD-1 de dromadaire es† telle que décrite dans la base de données Genbank sous la référence XP_010986792.1 ou XP_010986793.1 et es† constituée de SEQ ID NO : 24 ou 25.  the camel PD-1 protein † as described in the Genbank database under the reference XP_010986792.1 or XP_010986793.1 and es † consisting of SEQ ID NO: 24 or 25.
Numérotation des résidus d’acides aminés Numbering of amino acid residues
Comme on l’entend ici, la numérotation des résidus d’acides aminés de la protéine PD-1 commence sur le premier résidu d’acide aminé, généralement une méthionine (M), formant l’extrémité N-terminale de PD-1 complète codée par le cadre ouvert de lecture du gène de PD-1 , c'esf-à-dire incluant son peptide signal. Par ailleurs, la numérotation des résidus d’acides aminés de la protéine PD-1 utilisée ici es† définie par référence à la protéine PD-1 humaine. Il es† ainsi aisé pour l’homme du méfier de déterminer le résidu d’acide aminé d’une protéine PD-1 correspondant à un numéro de position auquel il es† fai† référence selon l’invention : il suffi† d’aligner la séquence de la protéine PD-1 pour laquelle on souhaite déterminer le résidu d’acide aminé correspondant à un numéro de position avec une séquence de la protéine PD-1 humaine, notamment SEQ ID NO : 5, de manière à optimiser le pourcentage d’identité entre les deux séquences alignées, puis d’identifier le résidu d’acide aminé correspondant au numéro de position recherché comme étant celui qui est aligné avec le résidu d’acide aminé de la séquence de la protéine PD-1 humaine qui porte ce numéro de position. As used herein, the amino acid residue numbering of the PD-1 protein begins on the first amino acid residue, typically a methionine (M), forming the N-terminus of complete PD-1. encoded by the open reading frame of the PD-1 gene, that is, including its signal peptide. In addition, the amino acid residue numbering of the PD-1 protein used herein is defined by reference to the human PD-1 protein. It is thus easy for the mistrusting man to determine the amino acid residue of a PD-1 protein corresponding to a position number to which it is referred to according to the invention: it is sufficient to align the sequence of the PD-1 protein for which the residue is to be determined amino acid corresponding to a position number with a sequence of the human PD-1 protein, in particular SEQ ID NO: 5, so as to optimize the percentage identity between the two aligned sequences, and then to identify the residue of the amino acid corresponding to the position number sought as being that which is aligned with the amino acid residue of the sequence of the human PD-1 protein which bears that position number.
Première, deuxième, troisième, et quatrième séquences First, second, third, and fourth sequences
De préférence, la première séquence, la deuxième séquence, la troisième, et la quatrième séquence son† constituées d’au moins 8, 9, 10, 1 1 , 12 résidus d’acides aminés contigus respectivement choisis au sein de la séquence s’étendant des résidus d’acides aminés 123 à 137, 66 à 81 , et 95 à 1 10, de la protéine PD-1 ou son† constituées respectivement au moins de la séquence s’étendant des résidus d’acides aminés 123 à 137, 66 à 81 , 95 à 1 10, et 22 à 33 de la protéine PD-1 .  Preferably, the first sequence, the second sequence, the third, and the fourth sound sequence consist of at least 8, 9, 10, 11, 12 contiguous amino acid residues respectively selected within the sequence extending amino acid residues 123 to 137, 66 to 81, and 95 to 110, of the PD-1 protein or its † consisting respectively of at least the sequence extending from amino acid residues 123 to 137, 66 to 81, 95 to 110, and 22 to 33 of the PD-1 protein.
De préférence également, la première séquence, la deuxième séquence, la troisième, et la quatrième séquence selon l’invention son† constituées respectivement au plus de 29, 28, 27, 26, 25, 24, 23, 22, 21 , 20 résidus d’acides aminés contigus choisis au sein de la séquence complète de la protéine PD-1 , ou son† constituées respectivement au plus des résidus d’acides aminés 123 à 137, 66 à 81 , 95 à 1 10, et 22 à 33 de la protéine PD-1 .  Also preferably, the first sequence, the second sequence, the third and the fourth sequence according to the invention are respectively constituted by at most 29, 28, 27, 26, 25, 24, 23, 22, 21, 20 residues. of contiguous amino acids selected from the complete sequence of the PD-1 protein, or its † consisting respectively of at most amino acid residues 123 to 137, 66 to 81, 95 to 110, and 22 to 33 of the PD-1 protein.
De manière préférée :  In a preferred manner:
la première séquence selon l’invention est constituée de SEQ ID NO : 1 , 50, 51 , 52, 53 ou 54,  the first block according to the invention consists of SEQ ID NO: 1, 50, 51, 52, 53 or 54,
la deuxième séquence selon l’invention est constituée de SEQ ID NO : 2, 55, 56 ou 57,  the second sequence according to the invention consists of SEQ ID NO: 2, 55, 56 or 57,
la troisième séquence selon l’invention est constituée de SEQ ID NO : 3 ou 58, et  the third sequence according to the invention consists of SEQ ID NO: 3 or 58, and
la quatrième séquence est constituée de SEQ ID NO : 4.  the fourth sequence consists of SEQ ID NO: 4.
Les résidus d’acides aminés de la protéine PD-1 humaine correspondant à ces séquences son† présentés dans le tableau qui suit :  The amino acid residues of the human PD-1 protein corresponding to these sequences are shown in the following table:
Séquences variantes Variant sequences
Une séquence variante selon l’invention, qui présente au moins 75% d’identité avec l’une des première, deuxième, troisième, et quatrième séquences ci-dessus, présente de manière préférée au moins 80%, 85%, 90%, 95% ou 98% d’identité avec l’une des première, deuxième, troisième, et quatrième séquences ci-dessus.  A variant sequence according to the invention, which has at least 75% identity with one of the first, second, third, and fourth sequences above, preferably has at least 80%, 85%, 90%, 95% or 98% identity with one of the first, second, third, and fourth sequences above.
Comme on l’entend ici, le pourcentage d’identité entre deux séquences peptidiques peut être déterminé en réalisant un alignement optimal sur toute la longueur des séquences, en déterminant le nombre de positions alignées pour lesquelles les acides aminés son† identiques dans chaque séquence et en divisant ce nombre par le nombre total d’acides aminés dans la plus longue des deux séquences. L’alignement optimal est celui qui donne le pourcentage d’identité le plus élevé entre les deux séquences.  As used herein, the percentage identity between two peptide sequences can be determined by performing optimal alignment over the entire length of the sequences, by determining the number of aligned positions for which the amino acids are identical in each sequence and by dividing this number by the total number of amino acids in the longest of the two sequences. The optimal alignment is the one that gives the highest percentage of identity between the two sequences.
De manière préférée également, une séquence variante selon l’invention présente au moins 75%, 80%, 85%, 90%, 95% ou 98% d’identité avec SEQ ID NO : 1 , SEQ ID NO : 2, SEQ ID NO : 3, SEQ ID NO : 4 ou SEQ ID NO : 50, 51 , 52, 53, 54, 55, 56, 57 ou 58.  Also preferably, a variant sequence according to the invention has at least 75%, 80%, 85%, 90%, 95% or 98% identity with SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4 or SEQ ID NO: 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57 or 58.
La séquence variante selon l’invention est telle qu’un polypeptide constitué de la séquence variante doit permettre d’éliciter une réponse immunitaire dirigée contre la protéine PD-1 ; c'est-à-dire que l’administration d’un tel peptide, éventuellement cyclisé par formation d’au moins un pont disulfure inter-cystéines, si nécessaire après adjonction d’une ou deux cystéines au sein du peptide, et/ou à son extrémité N-terminale et/ou à son extrémité C-terminale, le peptide étant éventuellement lié à une molécule porteuse, notamment une protéine porteuse, telle que la KLH ( Keyhole Limpet Hemocyanin), à un animal, tel qu’une souris, un rat ou un lapin, provoque la production d’anticorps dirigés contre une protéine PD-1 , notamment une protéine PD-1 de la même espèce que celle à laquelle appartient la séquence avec laquelle la séquence variante présente le pourcentage d’identité le plus élevé. L’homme du métier sait bien comment déterminer si un anticorps est dirigé contre la PD-1 , notamment en mettant en œuvre un test ELISA. De manière préférée, les anticorps élicités par administration du peptide sont bloquants ou neutralisants, c'est-à-dire qu’ils empêchent la protéine PD-1 d’exercer tou† ou partie, notamment au moins 10%, 25%, 50%, 75%, de son activité, par exemple mesurée in vitro. Comme on l’entend ici l’activité de PD-1 es† de préférence une liaison à la protéine PD-L1 , qui peu† être mesurée comme dans l’Exemple 2 qui suif. The variant sequence according to the invention is such that a polypeptide consisting of the variant sequence must make it possible to elicit an immune response directed against the PD-1 protein; that is to say that the administration of such a peptide, optionally cyclized by formation of at least one inter-cysteine disulfide bridge, if necessary after adding one or two cysteines within the peptide, and / or at its N-terminal end and / or at its C-terminal end, the peptide optionally being linked to a carrier molecule, in particular a carrier protein, such as KLH (Keyhole Limpet Hemocyanin), to an animal, such as a mouse, a rat or a rabbit, causes the production of antibodies directed against a PD-1 protein, in particular a PD-1 protein of the same species. than the one to which the sequence with which the variant sequence belongs has the highest percentage of identity. Those skilled in the art are well aware of how to determine whether an antibody is directed against PD-1, in particular by implementing an ELISA test. Preferably, the antibodies elicited by administration of the peptide are blocking or neutralizing, that is to say they prevent the PD-1 protein from exercising all or part, especially at least 10%, 25%, 50 %, 75%, of its activity, for example measured in vitro. As used herein, the activity of PD-1 is preferably a binding to the PD-L1 protein, which can be measured as in Example 2 which follows.
Longueur du polypeptide Polypeptide length
Le polypeptide selon l’invention comprend de préférence au plus 200, 150, 100, 90, 80, 70, 60, 50, 40 ou 30 résidus d’acides aminés. Il es† différent de la protéine PD-1 e† n’es† pas constitué d’une portion de plus de 30 résidus d’acides aminés contigus de la protéine PD-1 . Comme l’homme du métier le comprend bien cela n’exclu† pas qu’il puisse être constitué de deux ou plus portions de la protéine PD-1 d’au plus 30 résidus d’acides aminés contigus, dans la mesure où ces portions ne sont pas agencées de manière à reconstituer une portion de la protéine PD-1 de plus de 30 acides aminés contigus.  The polypeptide according to the invention preferably comprises at most 200, 150, 100, 90, 80, 70, 60, 50, 40 or 30 amino acid residues. It is different from the PD-1 protein and does not consist of a portion of more than 30 contiguous amino acid residues of the PD-1 protein. As is well understood by those skilled in the art, this does not exclude that it may consist of two or more portions of the PD-1 protein of not more than 30 contiguous amino acid residues, since these portions are not arranged to reconstitute a portion of the PD-1 protein of more than 30 contiguous amino acids.
Comme cela apparaîtra clairement à l’homme du méfier, le polypeptide selon l’invention peu† comprendre plusieurs répétitions, par exemple 2, 3, 4, 5, 10 ou 20 répétitions, respectivement des première, deuxième, troisième, e† quatrième séquences e† de la séquence variante selon l’invention.  As will be clear to the skilled man, the polypeptide according to the invention can include several repetitions, for example 2, 3, 4, 5, 10 or 20 repetitions, respectively of the first, second, third, e † fourth sequences e † of the variant sequence according to the invention.
Séquences en plus des séquences des première , deuxième, troisième, et quatrième séquences et des séquences variantes Sequences in addition to the sequences of the first, second, third, and fourth sequences and variant sequences
Par ailleurs, le polypeptide selon l’invention peu† également comprendre des séquences additionnelles ne provenant pas de la protéine PD-1 .  Moreover, the polypeptide according to the invention may also comprise additional sequences not originating from the PD-1 protein.
Ces séquences additionnelles pourront notamment apporter des caractéristiques physico-chimiques permettant une présentation structurale améliorée ou une solubilité améliorée du polypeptide selon l’invention par rapport à un polypeptide similaire mais qui ne comprendrai† pas ces séquences additionnelles. Les séquences additionnelles peuvent également comprendre une ou plusieurs séquences de lien peptidique, c’est-à-dire de peptide linker, utiles pour une liaison notamment à une molécule porteuse. De telles séquences de lien peptidique comprennent typiquement de 1 à 10, notamment de 4 à 6, résidus d’acides aminés. These additional sequences may in particular provide physicochemical characteristics allowing improved structural presentation or improved solubility of the polypeptide according to the invention relative to a similar polypeptide but which will not include these additional sequences. The additional sequences may also comprise one or more peptide linker sequences, that is to say peptide linker, which are useful for binding in particular to a carrier molecule. Such peptide linker sequences typically comprise from 1 to 10, especially from 4 to 6, amino acid residues.
Par ailleurs, ces séquences ne provenant pas de la protéine PD-1 , pourront aussi comprendre des épitopes appartenant à d’autres protéines, permettant d’éliciter ou de générer une réponse immunitaire dirigée contre ces autres protéines.  Moreover, these sequences not originating from the PD-1 protein may also comprise epitopes belonging to other proteins, making it possible to elicit or generate an immune response directed against these other proteins.
En outre, le polypeptide selon l’invention peut comprendre des séquences d’épitope(s) T exogène(s), préférablement universel(s), ce qui permet de renforcer l’immunogénicité du polypeptide selon l’invention.  In addition, the polypeptide according to the invention may comprise exogenous (s) T epitope sequences, preferably universal, which makes it possible to enhance the immunogenicity of the polypeptide according to the invention.
Le polypeptide selon l’invention peu† également comprendre au moins une séquence d’une protéine porteuse, par exemple une particule de type virale (VLP), comme cela es† notamment décrit dans la demande internationale WO 05/1 1 7983 pour le TNF.  The polypeptide according to the invention may also comprise at least one sequence of a carrier protein, for example a virus-like particle (VLP), as is described in particular in the international application WO 05/117983 for TNF. .
Cyclisation du polypeptide Cyclization of the polypeptide
Le polypeptide selon l’invention peu† être sous-forme linéaire ou sous-forme cyclisée. De préférence, le polypeptide selon l’invention es† sous forme cyclisée. Cette cyclisation peu† être de tou† type connu de l’homme du métier.  The polypeptide according to the invention may be linear subform or cyclized subform. Preferably, the polypeptide according to the invention is in cyclized form. This cyclization may be of any type known to those skilled in the art.
Le choix de la stratégie de cyclisation selon l’invention peu† notamment tenir compte de la meilleure présentation antigénique des épitopes contenus dans le polypeptide selon l’invention, e† ne porter que sur une partie du polypeptide (cyclisation au sein de la séquence). Ainsi, comme on l’entend ici, lorsque le polypeptide selon l’invention es† sous forme cyclisée, seule une partie du polypeptide peu† être incluse dans un cycle tandis que le reste du polypeptide es† sous forme linéaire.  The choice of the cyclization strategy according to the invention can in particular take into account the best antigenic presentation of the epitopes contained in the polypeptide according to the invention, and relate only to a part of the polypeptide (cyclization within the sequence). . Thus, as used herein, when the polypeptide of the invention is in a cyclized form, only a portion of the polypeptide may be included in one cycle while the remainder of the polypeptide is in linear form.
En fonction des groupes fonctionnels présents dans le polypeptide, ceffe cyclisation peu† s’effectuer de plusieurs manières différentes, comme par exemple : de son extrémité C-terminale à son extrémité N-terminale, de son extrémité N- terminale à une chaîne latérale, d’une chaîne latérale à son extrémité C-†erminale ou encore entre deux chaînes latérales. Parmi les diverses modalités de cyclisation de polypeptides, il es† possible de citer la lactamisation, la lactonisation ou la formation d'un pont disulfure. En particulier, lors de la formation d’un pont disulfure inter-cystéine, c'est-à-dire entre les radicaux -SH de deux cystéines, les cystéines peuvent être déjà présentes dans la séquence variante selon l’invention ou dans les première, deuxième, troisième, et quatrième séquences selon l’invention, ou bien être ajoutées au sein de ces séquences, ainsi qu’à leur extrémité N-terminale et/ou C-terminale. Depending on the functional groups present in the polypeptide, this cyclization can be carried out in several different ways, for example: from its C-terminus at its N-terminus, from its N-terminus to a side chain, a side chain at its C-terminal end or between two side chains. Among the various methods of cyclizing polypeptides, it is possible to mention lactamization, lactonization or the formation of a disulfide bridge. In particular, during the formation of an inter-cysteine disulfide bridge, that is to say between the radicals -SH of two cysteines, the cysteines may already be present in the variant sequence according to the invention or in the first, second, third and fourth sequences according to the invention, or else be added within these sequences, as well as at their N-terminus and / or or C-terminal.
Modifications post-traductionnelles, analogues d’acides aminés Post-translational modifications, amino acid analogues
En outre, le polypeptide selon l’invention peut comprendre des modifications post-traductionnelles, telles que des glycosylations, des méthylations, des acylations, notamment par des acides gras, ou des phosphorylations. En particulier, l’extrémité N-terminale du polypeptide selon l’invention peut être acétylée et l’extrémité C- terminale peut être modifiée par amidation.  In addition, the polypeptide according to the invention may comprise post-translational modifications, such as glycosylations, methylations, acylations, in particular by fatty acids, or phosphorylations. In particular, the N-terminus of the polypeptide according to the invention may be acetylated and the C-terminus may be modified by amidation.
Le polypeptide selon l’invention peut également comprendre un ou plusieurs analogues ou dérivés d’acides aminés, don† les acides aminés non naturels ou non standards, en particulier la norleucine (Nie).  The polypeptide according to the invention may also comprise one or more analogs or derivatives of amino acids, don † non-natural or non-standard amino acids, in particular norleucine (Nie).
Molécule porteuse Carrier molecule
De manière préférée également, le polypeptide selon l’invention est fixé ou lié, notamment par liaison covalente, à une molécule porteuse, notamment une protéine porteuse.  Also preferably, the polypeptide according to the invention is fixed or bound, in particular by covalent bonding, to a carrier molecule, in particular a carrier protein.
En particulier, la molécule porteuse peut être la protéine Keyhole Limpet Hemocyanin (KLH), l’antigène de surface de l’hépatite B (HBsAg), l’albumine sérique bovine (BSA), le toxoïde du tétanos (TT) et le toxoïde de la diphtérie (DT).  In particular, the carrier molecule may be Keyhole Limpet Hemocyanin (KLH) protein, hepatitis B surface antigen (HBsAg), bovine serum albumin (BSA), tetanus toxoid (TT) and toxoid of diphtheria (DT).
Le toxoïde de la diphtérie (DT) selon l’invention est de préférence choisi dans le groupe constitué de CRM 197, de CRM 176, de CRM 228, de CRM 45, de CRM 9, de CRM 102, de CRM 103, et de CRM 107.  The toxoid of diphtheria (DT) according to the invention is preferably selected from the group consisting of CRM 197, CRM 176, CRM 228, CRM 45, CRM 9, CRM 102, CRM 103, and CRM 107.
De manière particulièrement préférée, la molécule porteuse est CRM 197. Particularly preferably, the carrier molecule is CRM 197.
La liaison du polypeptide selon l’invention à une molécule porteuse, notamment une protéine porteuse, peut être réalisée à l’aide d’un agent de couplage hétérobifonctionnel, tel que l’ester de N-y-maleimidobutyryl- oxysuccinimide (GMBS) et le dérivé sulfo-GMBS, l’ester du m-maléimidobenzoyl-n- hydroxysuccinimide (MBS) et le dérivé sulfo-MBS, le succinimidyl 4-(N- maleimidome†hyl)cyclohexane-l -carboxyla†e (SMCC), un carbodiimide, le bisdiazonium-benzidine (BDB) ou le glutaraldéhyde. Lorsque le GMBS, le MBS ou le SMCC son† utilisés, ils sont de préférence fixés sur une cystéine (C), qui si elle n’esf pas présente dans une première, une deuxième, une troisième ou une quatrième séquence, ou une séquence variante selon l’invention, peut être ajoutée, notamment à son extrémité N-terminale ou C- terminale. Par ailleurs, lorsqu’une cystéine est présente dans une première, une deuxième, une troisième ou une quatrième séquence, selon l’invention à une position non souhaitée, il est possible de mettre en oeuvre, à la place, une séquence variante dans laquelle la cystéine est substituée par un autre acide aminé, tel qu’une serine. The binding of the polypeptide according to the invention to a carrier molecule, in particular a carrier protein, can be carried out using a heterobifunctional coupling agent, such as the Ny-maleimidobutyryloxysuccinimide ester (GMBS) and the derivative. sulfo-GMBS, m-maleimidobenzoyl-n-hydroxysuccinimide ester (MBS) and the sulfo-MBS derivative succinimidyl 4- (N-maleimidome † hyl) cyclohexane-1-carboxylate (SMCC), a carbodiimide, bisdiazonium-benzidine (BDB) or glutaraldehyde. When the GMBS, MBS or SMCC are used, they are preferably attached to a cysteine (C), which if not present in a first, a second, a third or a fourth sequence, or a sequence variant according to the invention may be added, in particular at its N-terminal or C-terminal end. Furthermore, when a cysteine is present in a first, a second, a third or a fourth sequence according to the invention at an undesired position, it is possible to implement, instead, a variant sequence in which cysteine is substituted with another amino acid, such as serine.
Lorsque le_BDB est utilisé, il est de préférence fixé sur une tyrosine (Y), qui si elle n’est pas présente dans une première, une deuxième, une troisième ou une quatrième séquence, ou une séquence variante selon l’invention, peut être ajoutée, notamment à son extrémité N-terminale ou C-terminale. Par ailleurs, lorsqu’une tyrosine est présente dans une première, une deuxième, une troisième ou une quatrième séquence selon l’invention à une position non souhaitée, il est possible de mettre en oeuvre, à la place, une séquence variante dans laquelle la tyrosine est substituée par un autre acide aminé, tel qu’une phénylalanine (F).  When BDB is used, it is preferably attached to a tyrosine (Y), which if not present in a first, a second, a third or a fourth sequence, or a variant sequence according to the invention, may be added, especially at its N-terminus or C-terminus. Moreover, when a tyrosine is present in a first, a second, a third or a fourth sequence according to the invention at an undesired position, it is possible to implement, instead, a variant sequence in which the tyrosine is substituted by another amino acid, such as phenylalanine (F).
Par ailleurs, la liaison du polypeptide selon l’invention à une molécule porteuse, notamment une protéine porteuse, peut également être réalisée à l’aide d’un lien peptidique ou peptide linker, qui se lien† au polypeptide selon l’invention d’un côté et à la molécule porteuse de l’autre côté, éventuellement via un agent de couplage hétérobifonctionnel tel que défini ci-dessus. De tels liens peptidiques comprennent typiquement de 1 à 10, notamment de 4 à 6, résidus d’acides aminés.  Moreover, the binding of the polypeptide according to the invention to a carrier molecule, in particular a carrier protein, can also be carried out using a peptide linker or peptide linker, which binds to the polypeptide according to the invention. one side and the carrier molecule on the other side, optionally via a heterobifunctional coupling agent as defined above. Such peptide bonds typically comprise from 1 to 10, especially from 4 to 6, amino acid residues.
De manière tout particulièrement préférée le polypeptide selon l’invention est fixé sur la protéine porteuse CRM 197 selon une construction représentée par une formule sélectionnée dans le groupe constitué des formules suivantes :  Most preferably, the polypeptide according to the invention is attached to the CRM 197 carrier protein according to a construction represented by a formula selected from the group consisting of the following formulas:
ou : or :
- CRM 197 désigne la protéine porteuse,  CRM 197 denotes the carrier protein,
- GMB désigne le N-g-maleimidobutyryl,  GMB denotes N-g-maleimidobutyryl,
- Acétyl+ indique que l’extrémité N-terminale est acétylée,  - Acetyl + indicates that the N-terminus is acetylated,
- Amide+ indique que l’extrémité C-terminale est modifiée par amidation,  - Amide + indicates that the C-terminus is modified by amidation,
- cyclo() indique une cyclisation de type lacfame entre les chaînes latérales des résidus d’acides aminés en C-†erminal e† en N-terminal,  cyclo () indicates a lacfame-type cyclization between the side chains of amino acid residues at C-terminal and N-terminus,
- cycloS-S() indique une cyclisation par pont disulfure entre les groupements sulfhydriles des cystéines présentes en C-ferminal et en N-terminal,  - cycloS-S () indicates a disulfide bridge cyclization between the sulfhydryl groups of the cysteines present in C-ferminal and in N-terminal,
- les crochets ( [X] n) indiquent qu’un ou plusieurs polypeptides sont fixés sur la protéine porteuse, et  the brackets ([X] n) indicate that one or more polypeptides are attached to the carrier protein, and
- la partie soulignée représente le polypeptide selon l’invention dont le SEQ ID NO es† indiqué dans la colonne de droite. Ainsi, de manière tout particulièrement préférée le polypeptide selon l’invention est constitué d’une séquence sélectionnée dans le groupe constitué de SEQ ID NO : 1 et SEQ ID NO : 26 à 49. the underlined part represents the polypeptide according to the invention, of which SEQ ID NO is indicated in the right-hand column. Thus, very particularly preferably the polypeptide according to the invention consists of a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1 and SEQ ID NO: 26 to 49.
Préparation du polypeptide Preparation of the polypeptide
Le polypeptide selon l’invention peut être préparé par toute méthode connue dans l’état de la technique et notamment par synthèse chimique. Il est également possible de le préparer par expression de l’acide nucléique selon l’invention dans des cellules eucaryotes ou procaryotes.  The polypeptide according to the invention may be prepared by any method known in the state of the art and in particular by chemical synthesis. It is also possible to prepare it by expression of the nucleic acid according to the invention in eukaryotic or prokaryotic cells.
Activité du polypeptide Polypeptide activity
Le polypeptide selon l’invention, si nécessaire lié à une molécule porteuse, est immunogène, c’est-à-dire qu’il peut éliciter, ou provoquer, une réaction immunitaire, notamment de type humorale, c’est-à-dire la production d’anticorps, par un individu, notamment de type mammifère, auquel il est administré. En particulier, le polypeptide selon l’invention permet d 'éliciter une réponse immunitaire dirigée contre la protéine PD-1 , notamment des anticorps anti-PD-1 , de préférence des anticorps anti-PD-1 bloquants ou neutralisants, c'est-à-dire qu’ils empêchent la protéine PD-1 d’exercer tout ou partie, notamment au moins 10%, 25%, 50%, 75%, de son activité, par exemple mesurée in vitro. Comme on l’entend ici l’activité de PD-1 est de préférence une liaison à la protéine PD-L1 , qui peut être mesurée comme indiqué dans l’Exemple 2 qui suit.  The polypeptide according to the invention, if necessary linked to a carrier molecule, is immunogenic, that is to say it can elicit or cause an immune reaction, in particular of humoral type, that is to say the production of antibodies by an individual, in particular a mammalian type, to which it is administered. In particular, the polypeptide according to the invention makes it possible to elicit an immune response directed against the PD-1 protein, in particular anti-PD-1 antibodies, preferably blocking or neutralizing anti-PD-1 antibodies, that is, that is to say that they prevent the PD-1 protein from exercising all or part, especially at least 10%, 25%, 50%, 75%, of its activity, for example measured in vitro. As used herein, the activity of PD-1 is preferably a binding to the PD-L1 protein, which can be measured as shown in Example 2 which follows.
Acide nucléique Nucleic acid
L’acide nucléique selon l’invention est de l’ARN ou de l’ADN, de préférence de l’ADN. On préfère que l’acide nucléique selon l’invention soif lié de manière opératoire à une séquence promotrice procaryote et/ou eucaryote, notamment de mammifère ou de virus. Par ailleurs, l’acide nucléique selon l’invention peut être inclus dans un vecteur, tel qu’un plasmide ou un virus.  The nucleic acid according to the invention is RNA or DNA, preferably DNA. It is preferred that the nucleic acid according to the invention is operably linked to a prokaryotic and / or eukaryotic promoter sequence, in particular that of a mammal or a virus. Moreover, the nucleic acid according to the invention can be included in a vector, such as a plasmid or a virus.
Anticorps, fragments d’anticorps et aptamères Antibodies, antibody fragments and aptamers
Les anticorps, fragments d’anticorps, et aptamères selon l’invention son† dits être spécifiquement dirigés contre un polypeptide tel que défini ci-dessus lorsqu’ils ne présentent essentiellement pas de liaison à un autre polypeptide, qui ne comprend pas le polypeptide défini ci-dessus, dans des conditions permettant la liaison des anticorps, fragment d’anticorps, et apfamères selon l’invention aux polypeptides contre lesquels ils son† spécifiquement dirigés. The antibodies, antibody fragments, and aptamers according to the invention are said to be specifically directed against a polypeptide as defined above when they show essentially no binding to another polypeptide, which does not does not include the polypeptide defined above, under conditions allowing the binding of antibodies, antibody fragment, and apfamers according to the invention to the polypeptides against which they are † specifically directed.
L’anticorps selon l’invention peut être polyclonal ou monoclonal, de préférence monoclonal. Par ailleurs, comme on l’entend ici, les « fragments d’anticorps » comprennent au moins une partie de liaison à l’antigène de l’anticorps don† ils son† issus, et son† notamment de type Fab, Fab’, F(ab’)2, Fv stabilisé par disulfure (dsFv), région V dimérisée (diacorps), trimérisée, tétramérisée ou pentamérisée, Fv à chaîne unique (scFv), région déterminant la complémentarité (CDR).  The antibody according to the invention may be polyclonal or monoclonal, preferably monoclonal. Moreover, as used herein, the "antibody fragments" comprise at least one antigen-binding part of the antibody don † they are derived †, and its † in particular of Fab, Fab 'type, F (ab ') 2, disulfide stabilized Fv (dsFv), dimerized (diabody) V region, trimerized, tetramerized or pentamerized, single chain Fv (scFv), complementarity determining region (CDR).
Les anticorps peuvent être de toute espèce, notamment humains, de souris, de ra†, de lapin ou de camélidé. Par ailleurs, lorsqu’ils ne son† pas humains, ils peuvent également être humanisés, c’est-à-dire que les parties constantes de ces anticorps son† remplacées partiellement ou en totalité par des parties constantes correspondantes humaines.  The antibodies can be of any species, in particular human, mouse, ra †, rabbit or camelide. Moreover, when they are not human, they can also be humanized, that is to say that the constant parts of these antibodies are replaced partially or entirely by corresponding human constant parts.
Les anticorps selon l’invention peuvent être obtenus par immunisation d’un animal à l’aide d’un polypeptide selon l’invention selon des techniques bien connues de l’homme du métier.  The antibodies according to the invention can be obtained by immunization of an animal using a polypeptide according to the invention according to techniques well known to those skilled in the art.
Comme on l’entend ici, les aptamères son† des acides nucléiques, en particulier des ARN, capables de se lier spécifiquement à une cible moléculaire, telle qu’une protéine. Les aptamères peuvent notamment être obtenus par mise en œuvre de la technique SELEX bien connue de l’homme du métier, à partir des polypeptides selon l’invention.  As used herein, aptamers are nucleic acids, particularly RNAs, capable of binding specifically to a molecular target, such as a protein. Aptamers can in particular be obtained by using the SELEX technique well known to those skilled in the art, from the polypeptides according to the invention.
Utilisation thérapeutique Therapeutic use
Maladies  diseases
De préférence, la maladie liée ou due à l’expression de la protéine PD-1 ou de la protéine PD-L1 selon l’invention est un cancer ou une maladie infectieuse.  Preferably, the disease linked or due to the expression of the PD-1 protein or of the PD-L1 protein according to the invention is a cancer or an infectious disease.
Plus préférablement, la maladie liée ou due à la protéine PD-1 ou à la protéine PD-L1 est sélectionnée dans le groupe constitué :  More preferably, the disease linked to or due to the PD-1 protein or the PD-L1 protein is selected from the group consisting of:
- du mélanome métastatique non résécable, du carcinome pulmonaire métastatique non à petites cellules avancé (NSCLC), du NSCLC métastatique avancé progressant en particulier avec ou après une chimiothérapie à base de platine, du carcinome rénal avancé, notamment métastatique, et du carcinome urothélial localement avancé ou métastatique en particulier ne répondant pas à la chimiothérapie à base de dérivés du platine, du cancer de la prostate, du cancer du sein, du cancer colo-rectal, ou tout autre cancer où l’axe PD-1 /PD-L1 est mis en jeu dans la suppression d’une réponse immunitaire anti-tumorale, - unresectable metastatic melanoma, advanced non-small-cell metastatic lung carcinoma (NSCLC), advanced metastatic NSCLC progressing particularly with or after platinum-based chemotherapy, advanced renal cell carcinoma, including metastatic, and locally advanced or metastatic urothelial carcinoma especially not responding to chemotherapy with platinum derivatives, prostate cancer, breast cancer, colorectal cancer, or any other cancer where PD-1 / PD-L1 is involved in the suppression of an anti-tumor immune response,
- des infections bactériennes, telles que la pneumonie, la méningite, le syndrome de choc toxique, les intoxications alimentaires, la gastrite, les ulcères, la gonorrhée, les furoncles, les abcès, l’impétigo, les otites, les angines, les infections des voies urinaires e† génitales e† les infections broncho pulmonaires,  - bacterial infections, such as pneumonia, meningitis, toxic shock syndrome, food poisoning, gastritis, ulcers, gonorrhea, boils, abscesses, impetigo, ear infections, tonsillitis, infections the urinary tract and genital infections broncho-pulmonary,
- des infections virales, telles que la grippe, la rougeole, l’hépatite B, l’hépatite C, les infections par le virus de l’immunodéficience humaine (VIH), les infections par les virus de type Herpès comme par exemple le cytomégalovirus ou le virus d'Epsfein-Barr, l’herpès, e† les infections par le virus du papillome humain (VPH), e†  - viral infections, such as influenza, measles, hepatitis B, hepatitis C, infections with the human immunodeficiency virus (HIV), infections with herpes virus such as cytomegalovirus or Epsfein-Barr virus, herpes, e infections with human papillomavirus (HPV), e †
- des infections fongiques, telles que la blasfomycose, la coccidioiodomycose, rhisfoplamose, la paracoccidioiodomycose, la candidose, la cryptococcose, l’aspergillose, la mucomycose e† la pneumocystose.  fungal infections, such as blastomycosis, coccidioiodomycosis, rhisfoplamosis, paracoccidioiodomycosis, candidiasis, cryptococcosis, aspergillosis, mucomycosis and pneumocystosis.
Individu Individual
Le ou les individus selon l’invention sont des animaux, de préférence des mammifères ou des marsupiaux, plus préférablement des humains, des chevaux, des bovins, des cochons, des moutons, des chèvres, des chameaux, des dromadaires, des chiens ou des chats, le plus préférablement des humains. On préférera, selon l’invention que le polypeptide selon l’invention soif dérivé d’une protéine PD-1 appartenant à la même espèce que l’individu chez lesquels le polypeptide doit être utilisé ou administré.  The person or individuals according to the invention are animals, preferably mammals or marsupials, more preferably humans, horses, cattle, pigs, sheep, goats, camels, camels, dogs or dogs. cats, most preferably humans. It will be preferred according to the invention that the polypeptide according to the invention is derived from a PD-1 protein belonging to the same species as the individual in which the polypeptide is to be used or administered.
Administration Administration
De préférence, le polypeptide, la composition pharmaceutique, le médicament ou le produit selon l’invention es† administré ou sous une forme administrable par la voie orale, mucosale, notamment sublinguale, parentérale, intrapéritonéale, transcutanée, intradermique, sous-cutanée, intramusculaire, intraveineuse ou intra-artérielle. Doses Preferably, the polypeptide, the pharmaceutical composition, the drug or the product according to the invention is administered or in a form that can be administered orally, mucosally, in particular sublingually, parenterally, intraperitoneally, transcutaneously, intradermally, subcutaneously, intramuscularly. , intravenous or intra-arterial. doses
Dans le cadre de l'invention, le polypeptide selon l'invention peut être administré à des doses allant par exemple de 1 ng à 1 g, de préférence de l pg à 1 mg.  In the context of the invention, the polypeptide according to the invention may be administered in doses ranging for example from 1 ng to 1 g, preferably from 1 μg to 1 mg.
Véhicule pharmaceutiquement acceptable Pharmaceutically acceptable vehicle
Comme on l’entend ici, un « véhicule pharmaceutiquement acceptable » regroupe l’ensemble des composés, notamment les excipients, pouvant être administrés à un individu en conjonction avec un principe actif pharmacologique.  As used herein, a "pharmaceutically acceptable carrier" includes all of the compounds, including excipients, that can be administered to an individual in conjunction with a pharmacological active ingredient.
Adjuvant adjuvant
Par ailleurs, notamment lorsqu'il est utilisé dans un cadre vaccinal ou prophylactique le polypeptide selon l'invention peut être associé ou combiné à un adjuvant, ou la composition pharmaceutique, le médicament ou le produit selon l’invention peut comprendre un adjuvant. L'adjuvant peut être de tout type adapté à augmenter la réponse immunitaire d'un individu, animal ou humain, à l'administration d'un polypeptide. Il peut ainsi s'agir d'adjuvant complet ou incomplet de Freund, de Monfanide ISA 51 VG, d'hydroxyde d’aluminium ou de phosphate d’aluminium ou de phosphate de calcium par exemple, le Monfanide ISA 51 VG et les hydroxydes d’aluminium ou de phosphate d’aluminium étant préférés. L'adjuvant peut être associé au polypeptide selon l'invention en réalisant un mélange 1 /1 en volume d'une solution d'adjuvant et d'une solution comprenant le polypeptide.  Moreover, especially when it is used in a vaccine or prophylactic context, the polypeptide according to the invention may be combined or combined with an adjuvant, or the pharmaceutical composition, the drug or the product according to the invention may comprise an adjuvant. The adjuvant can be of any type suitable for increasing the immune response of an individual, animal or human, to the administration of a polypeptide. It can thus be complete or incomplete Freund's adjuvant, Monfanide ISA 51 VG, aluminum hydroxide or aluminum phosphate or calcium phosphate for example, the monfanide ISA 51 VG and the hydroxides of aluminum or aluminum phosphate being preferred. The adjuvant may be combined with the polypeptide according to the invention by carrying out a 1/1 mixture by volume of an adjuvant solution and a solution comprising the polypeptide.
Autre thérapie Other therapy
Comme on l’entend ici l’expression « autre thérapie » désigne une thérapie pharmacologique avec au moins un autre composé différent du polypeptide selon l’invention ou une thérapie non-pharmacologique comme par exemple une radiothérapie, notamment anti-cancéreuse.  As used herein, the term "other therapy" designates a pharmacological therapy with at least one other compound different from the polypeptide according to the invention or a non-pharmacological therapy such as, for example, radiotherapy, in particular anti-cancer therapy.
Autre composé Other compound
L’autre composé utile pour éliciter une réponse immunitaire dirigée contre la protéine PD-1 selon l’invention peut notamment être un polypeptide différent de celui de l’invention dérivé de la protéine PD-1 ou un polypeptide dérivé de PD-L1. Par ailleurs, l’autre composé destiné à la prévention ou au traitement d’une maladie liée ou due à la protéine PD-1 ou à la protéine PD-L1 , d’un cancer ou d’une maladie infectieuse peu† être un composé de chimiothérapie anticancéreuse, un composé d’immunothérapie anticancéreuse, par exemple un anticorps monoclonal, un antibiotique, un antiviral, notamment de type interféron, ou un antimycotique. The other compound that is useful for eliciting an immune response directed against the PD-1 protein according to the invention may in particular be a polypeptide different from that of the invention derived from the PD-1 protein or a polypeptide derived from PD-L1. Moreover, the other compound intended for the prevention or treatment of a disease linked to or due to the PD-1 protein or the PD-L1 protein, a cancer or an infectious disease can be a compound anticancer chemotherapy, an anti-cancer immunotherapy compound, for example a monoclonal antibody, an antibiotic, an antiviral agent, especially of the interferon type, or an antimycotic agent.
En outre, notamment lorsqu’il es† utilisé dans un cadre vaccinal ou qu’il es† compris dans un vaccin ou une composition vaccinale, le polypeptide selon l’invention peu† être combiné à d’autres antigènes destinés à élicifer une réponse immunitaire contre une cible différente de la protéine PD-1 , par exemple la protéine PD-L1 . Ce type de combinaison es† utile pour la préparation de vaccins multivalents.  In addition, especially when it is used in a vaccine frame or included in a vaccine or a vaccine composition, the polypeptide according to the invention can be combined with other antigens intended to elicit an immune response. against a different target of the PD-1 protein, for example the PD-L1 protein. This type of combination is useful for the preparation of multivalent vaccines.
Comme on l’entend ici l’expression « en combinaison » ou « produit de combinaison » signifie que le polypeptide tel que défini ci-dessus e† l’autre composé tel que défini ci-dessus peuvent être associés au sein d’une même composition pharmaceutique ou d’un même médicament, e† donc être administrés ensemble, ou bien être administrés de manière séparée, c'est-à-dire selon des voies d’administration distinctes et/ou des régimes d’administration distincts, sous réserve que lorsqu’ils sont administrés de manière séparée les périodes d’activité prophylactique ou thérapeutique du polypeptide tel que défini ci-dessus e† de l’autre composé tel que défini ci-dessus se recouvrent en totalité ou en partie.  As used herein, the expression "in combination" or "combination product" means that the polypeptide as defined above and the other compound as defined above can be combined within one and the same pharmaceutical composition or the same drug, e † therefore be administered together, or be administered separately, that is to say, according to separate routes of administration and / or separate administration regimes, subject to when they are administered separately the periods of prophylactic or therapeutic activity of the polypeptide as defined above e † of the other compound as defined above overlap in whole or in part.
Ainsi, lorsque le polypeptide e† l’autre composé sont administrés de manière séparée, le polypeptide tel que défini ci-dessus sera de préférence administré dans les 24 heures, plus préférablement dans les 2 heures, e† encore plus préférablement dans l’heure, suivant l’administration de l’autre composé tel que défini ci-dessus, e† son administration sera éventuellement poursuivie les jours suivants. Réciproquement, l’autre composé tel que défini ci-dessus sera de préférence administré dans les 24 heures, plus préférablement dans les 2 heures, e† encore plus préférablement dans l’heure, suivant l’administration du polypeptide tel que défini ci-dessus, e† son administration sera éventuellement poursuivie les jours suivants. Dans un autre mode de réalisation préférée de l’invention, lorsque le polypeptide tel que défini ci-dessus e† l’autre composé tel que défini ci-dessus sont administrés de manière séparée, ils sont administrés essentiellement simultanément.  Thus, when the polypeptide and the other compound are administered separately, the polypeptide as defined above will preferably be administered within 24 hours, more preferably within 2 hours, and still more preferably within 1 hour. Depending on the administration of the other compound as defined above, its administration may be continued in the following days. Conversely, the other compound as defined above will preferably be administered within 24 hours, more preferably within 2 hours, even more preferably within 1 hour, following administration of the polypeptide as defined above. His administration will eventually be continued on the following days. In another preferred embodiment of the invention, when the polypeptide as defined above and the other compound as defined above are administered separately, they are administered essentially simultaneously.
L'invention es† davantage illustrée à l'aide des figures e† des Exemples, non limitatifs, qui suivent. Description des figures The invention is further illustrated with the aid of Figures e † of the nonlimiting Examples which follow. Description of figures
Figure 1 Figure 1
La figure 1 représente la quantité relative d’anticorps anfi-huPD-1 présent dans le sérum dilué au l /500ème de souris SWISS immunisées avec les peptides PPV-10-01 , PPV-10-02, PPV-10-03, PPV-10-04 et PPV-10-05 mesurée par ELISA (axe des ordonnées, densité optique (OD) à 450nm). Le trait horizontal à 0,2 unité de DO représente le seuil de significativité.  FIG. 1 represents the relative amount of anfi-huPD-1 antibody present in the serum diluted to 1 / 500th of SWISS mice immunized with peptides PPV-10-01, PPV-10-02, PPV-10-03, PPV. -10-04 and PPV-10-05 measured by ELISA (ordinate axis, optical density (OD) at 450nm). The horizontal line at 0.2 OD unit represents the significance threshold.
Figure 2 Figure 2
La figure 2 représente le pourcentage de neutralisation de l’interaction PD1 /PD-L1 obtenu avec des anticorps purifiés de lapins (n=4/groupe) immunisés avec les peptides PPV-10-01 , PPV-10-02, PPV-10-03, PPV-10-04 et PPV-10-05. FIG. 2 represents the percentage of neutralization of the PD1 / PD-L1 interaction obtained with purified rabbit antibodies (n = 4 / group) immunized with peptides PPV-10-01, PPV-10-02, PPV-10 -03, PPV-10-04 and PPV-10-05.
EXEMPLES EXAMPLES
Exemple 1 : Reconnaissance de la protéine entière PD-1 humaine fhPD-1 ) par des sérums de souris immunisées avec des peptides dérivés de hPD-1 . Example 1: Recognition of the whole human PD-1 protein fhPD-1) by sera of mice immunized with peptides derived from hPD-1.
Quatre peptides dérivés de la protéine PD-1 humaine ont été produits par synthèse chimique en phase solide, puis cyclisés par ajout de cystéines aux extrémités de l’épitope d’intérêt et formation d’un pont disulfure. Ils ont ensuite été couplés via un lien peptidique comportant une cystéine en C-ferminal à une protéine porteuse, la CRM 197 ( C-Reactive Material 197), à l’aide de l’agent de couplage GMBS.  Four peptides derived from the human PD-1 protein were produced by solid phase chemical synthesis and then cyclized by adding cysteines to the ends of the epitope of interest and forming a disulfide bridge. They were then coupled via a peptide linkage containing a C-ferminal cysteine to a carrier protein, CRM 197 (C-Reactive Material 197), using the GMBS coupling agent.
Pour chaque conjugué, des souris SWISS (Janvier Labs, Le Genesf-Saint-lsie, France) exemptes d’organismes pathogènes spécifiques ont été immunisées par voie sous-cufanée avec 100 pg d’équivalent peptide dérivés de PD-1 humaine (PPV- 10-01 , PPV-10-02, PPV-10-03, PPV-10-04 ou PPPV-10-05 ; voir Tableau 1 ) émulsionnés en adjuvant Montanide ISA 51 VG (n=8 par conjugué). Les souris ont reçu quatre injections sous-cufanées espacées de 15 jours (J0, J 15, J30 e†J45).  For each conjugate, SWISS mice (Janvier Labs, Genesf-Saint-Denis, France) free of specific pathogens were immunized subcutaneously with 100 μg peptide equivalent derived from human PD-1 (PPV-1). 10-01, PPV-10-02, PPV-10-03, PPV-10-04 or PPPV-10-05, see Table 1) emulsified with Montanide ISA 51 VG adjuvant (n = 8 per conjugate). The mice received four subcutaneous injections spaced 15 days apart (D0, D15, D30 and D45).
Tableau 1 : Peptides dérivés de PD-1 humaine utilisés pour l’immunisation Table 1: Peptides derived from human PD-1 used for immunization
Les résidus d’acides aminés sont annotés à partir de la séquence de la protéine PD- 1 humaine (Swissprot Q 151 16)  The amino acid residues are annotated from the sequence of the human PD-1 protein (Swissprot Q 151 16)
La quantité relative d’anticorps anti-PD-1 es† évaluée dans les sérums de souris à J54 par ELISA (dilution au l /500ème). On observe que l’ensemble des conjugué testés engendrent la production d’anticorps reconnaissant la protéine PD-1 humaine (Figure 1 1. The relative amount of anti-PD-1 antibody was evaluated in mouse sera on D54 by ELISA (1: 500 dilution). It is observed that all the conjugates tested generate the production of antibodies recognizing the human PD-1 protein (FIG.
Exemple 2 : Neutralisation de l’activité biologique de PD-1 humaine par des anticorps purifiés à partir du sérum de lapins immunisés par les peptides dérivés deExample 2 Neutralization of the biological activity of human PD-1 with antibodies purified from the serum of rabbits immunized with the peptides derived from
PD-1 humaine PD-1 human
La capacité neutralisante des IgG purifiées à partir du sérum de lapins (n=4/groupe) respectivement immunisés avec les peptides PPV-10-01 , PPV-10-02, PPV-10-03, PPV-10-04 e† PPV-10-05, a été évaluée dans un tes† cellulaire de neutralisation de l’interaction PD-1 /PD-L1 (Promega, J 1250). Ce tes† repose sur l’interaction entre 2 lignées cellulaires :  Neutralizing capacity of purified IgG from rabbit serum (n = 4 / group) respectively immunized with peptides PPV-10-01, PPV-10-02, PPV-10-03, PPV-10-04 e † PPV 10-05, was evaluated in a PD-1 / PD-L1 interaction neutralization cell (Promega, J 1250). This is based on the interaction between 2 cell lines:
- une lignée de cellules effectrices Jurkat exprimant le gène PD-1 humain e† le gène de la luciférase placé sous le contrôle de l’élément de réponse NFAT-RE,  a Jurkat effector cell line expressing the human PD-1 gene and the luciferase gene placed under the control of the NFAT-RE response element,
- une lignée de cellules CHO-K1 exprimant le gène PD-L1 humain e† une protéine de surface permettant d’activer les TCR d’une manière antigène-dépendante.  a CHO-K1 cell line expressing the human PD-L1 gene and a surface protein making it possible to activate the TCRs in an antigen-dependent manner.
Lorsque les 2 lignées sont co-cultivées, l’interaction de la protéine PD-1 avec la protéine PDL-1 inhibe la signalisation via le TCR e† l’expression de la luciférase (aucune luminescence ne sera émise). En revanche, l’addition d’anticorps anti-PD-1 neutralisant l’interaction de PD-1 avec PD-L1 va lever le signal inhibiteur, entraîner l’activation du TCR e† l’émission de luminescence.  When both lines are co-cultured, the interaction of PD-1 protein with PDL-1 protein inhibits TCR signaling and luciferase expression (no luminescence will be emitted). On the other hand, the addition of anti-PD-1 antibodies neutralizing the interaction of PD-1 with PD-L1 will raise the inhibitory signal, lead to the activation of the TCR and the emission of luminescence.
Descriptif de l’expérience réalisée : Description of the experiment carried out:
Mise en plaque (J l ) : ensemencement d’une plaque 96 puits à fond plat, traitée pour la culture cellulaire avec les cellules CHO-K1 . Incuber la plaque 20h à 37°C.  Plating (J l): Inoculation of a 96-well flat-bottomed plate treated for cell culture with CHO-K1 cells. Incubate the plate for 20h at 37 ° C.
Incubation des échantillons e† révélation (J2) : Distribution sur la plaque contenant les cellules CHO-K1 , des échantillons d’anticorps à tester ainsi que des cellules effectrices Jurkat. La plaque es† alors incubée 6h à 37°C.  Incubation of samples (J2): Distribution on the plate containing CHO-K1 cells, antibody samples to be tested as well as Jurkat effector cells. The plate is then incubated for 6 hours at 37 ° C.
Ajout dans chaque puits du réactif de révélation Bio-GIo™. Incubation de 30 minutes à température ambiante. Mesure de la luminescence à l’aide d’un luminomètre. On observe que les IgG des lapins immunisés avec les peptides PPV-10-01 , PPV-10-02, PPV-10-03, PPV-10-04 et PPV-10-05 neutralisent l’interaction de la protéine PD-1 avec la protéine PD-L1 à des degrés variés, d’environ 30% à environ 60% (Figure 2) . Addition of Bio-GIo ™ Revelation Reagent to each well. Incubation for 30 minutes at room temperature. Measurement of luminescence using a luminometer. IgG from rabbits immunized with peptides PPV-10-01, PPV-10-02, PPV-10-03, PPV-10-04 and PPV-10-05 were found to neutralize the interaction of PD-1 protein. with the PD-L1 protein to varying degrees, from about 30% to about 60% (Figure 2).

Claims

REVENDICATIONS
1. Polypeptide comprenant, ou constitué de : A polypeptide comprising or consisting of:
- une première séquence constituée d’au moins 8 résidus d’acides aminés contigus choisis au sein de la séquence s’étendant des résidus d’acides aminés 123 à 137 de la protéine PD-1 et d’au plus 30 résidus d’acides aminés contigus choisis au sein de la séquence complète de la protéine PD-1 , ou une séquence variante présentant au moins 75% d’identité avec la première séquence ; et/ou a first sequence consisting of at least 8 contiguous amino acid residues selected within the sequence extending from amino acid residues 123 to 137 of the PD-1 protein and of at most 30 acid residues contiguous amines selected from the complete sequence of the PD-1 protein, or a variant sequence having at least 75% identity with the first sequence; and or
- une deuxième séquence constituée d’au moins 8 résidus d’acides aminés contigus choisis au sein de la séquence s’étendant des résidus d’acides aminés 66 à 81 de la protéine PD-1 et d’au plus 30 résidus d’acides aminés contigus choisis au sein de la séquence complète de la protéine PD-1 , ou une séquence variante présentant au moins 75% d’identité avec la deuxième séquence ; et/ou a second sequence consisting of at least 8 contiguous amino acid residues chosen from the sequence extending from amino acid residues 66 to 81 of the PD-1 protein and of at most 30 acid residues contiguous amines selected from the complete sequence of the PD-1 protein, or a variant sequence having at least 75% identity with the second sequence; and or
- une troisième séquence constituée d’au moins 8 résidus d’acides aminés contigus choisis au sein de la séquence s’étendant des résidus d’acides aminés 95 à 1 10 de la protéine PD-1 et d’au plus 30 résidus d’acides aminés contigus choisis au sein de la séquence complète de la protéine PD-1 , ou une séquence variante présentant au moins 75% d’identité avec la troisième séquence ; et/ou a third sequence consisting of at least 8 contiguous amino acid residues selected within the sequence extending from amino acid residues 95 to 110 of the PD-1 protein and at most 30 residues of contiguous amino acids selected from the complete sequence of the PD-1 protein, or a variant sequence having at least 75% identity with the third sequence; and or
- une quatrième séquence constituée d’au moins 8 résidus d’acides aminés contigus choisis au sein de la séquence s’étendant des résidus d’acides aminés 22 à 33 de la protéine PD- 1 et d’au plus 30 résidus d’acides aminés contigus choisis au sein de la séquence complète de la protéine PD-1 , ou une séquence variante présentant au moins 75% d’identité avec la quatrième séquence ; sous réserve que le polypeptide soit différent de la protéine PD-1 e† qu’il ne soi† pas constitué d’une portion de plus de 30 résidus d’acides aminés contigus de la protéine PD-1 , et a fourth sequence consisting of at least 8 contiguous amino acid residues selected from the sequence extending from amino acid residues 22 to 33 of the PD-1 protein and of at most 30 acid residues contiguous amines selected from the complete sequence of the PD-1 protein, or a variant sequence having at least 75% identity with the fourth sequence; provided that the polypeptide is different from the PD-1 protein e † that it does not consist of a portion of more than 30 contiguous amino acid residues of the PD-1 protein, and
sous réserve que des polypeptides respectivement constitués des séquences variantes de la première, la deuxième, la troisième et la quatrième séquence permettent d’éliciter une réponse immunitaire dirigée contre la protéine PD-1 . provided that polypeptides consisting respectively of variant sequences of the first, second, third and fourth sequences elicit an immune response directed against the PD-1 protein.
2. Polypeptide selon la revendication 1 , dans lequel la première séquence, la deuxième séquence, la troisième e† la quatrième séquence sont constituées d’au moins 1 2 résidus d’acides aminés contigus respectivement choisis au sein de la The polypeptide according to claim 1, wherein the first sequence, the second sequence, the third, and the fourth sequence consist of at least 12 contiguous amino acid residues respectively selected within the
FEUILLE RECTIFIÉE (RÈGLE 91) ISA/EP séquence s’étendant des résidus d’acides aminés 66 à 81 , 95 à 1 10, 123 à 137, et 22 à 33 de la protéine PD-1 . RECTIFIED SHEET (RULE 91) ISA / EP sequence extending from amino acid residues 66 to 81, 95 to 110, 123 to 137, and 22 to 33 of the PD-1 protein.
3. Polypeptide selon la revendication 1 ou 2, dans lequel la première séquence, la deuxième séquence, la troisième et la quatrième séquence sont respectivement constituées au plus des résidus d’acides aminés 66 à 81 , 95 à 1 10, 123 à 137, et 22 à 33de la protéine PD-1 . The polypeptide according to claim 1 or 2, wherein the first sequence, the second sequence, the third and the fourth sequence are respectively at most amino acid residues 66 to 81, 95 to 110, 123 to 137, and 22 to 33 of the PD-1 protein.
4. Polypeptide selon l’une des revendications 1 à 3, dans lequel la protéine PD-1 est sélectionnée dans le groupe constitué de la protéine PD-1 humaine, de la protéine PD-1 de souris, de la protéine PD-1 de singe, de la protéine PD-1 de cheval, de la protéine PD-1 de bovin, de la protéine PD-1 de cochon, de la protéine PD-1 de mouton, de la protéine PD-1 de chèvre, de la protéine PD-1 de chameau et de la protéine PD-1 de dromadaire, de la protéine PD-1 de chien, et de la protéine PD-1 de chat. The polypeptide according to one of claims 1 to 3, wherein the PD-1 protein is selected from the group consisting of human PD-1 protein, mouse PD-1 protein, PD-1 protein monkey, horse PD-1 protein, bovine PD-1 protein, pig PD-1 protein, sheep PD-1 protein, goat PD-1 protein, protein PD-1 camel and camel PD-1 protein, dog PD-1 protein, and cat PD-1 protein.
5. Polypeptide selon l’une des revendications 1 à 4, dans lequel la protéine PD-1 est la protéine PD-1 humaine. The polypeptide according to one of claims 1 to 4, wherein the PD-1 protein is human PD-1 protein.
6. Polypeptide selon l’une des revendications 1 à 5, dans lequel : Polypeptide according to one of Claims 1 to 5, in which:
- la première séquence est constituée de SEQ ID NO : 1 , 50, 51 , 52 ou 54,  the first sequence consists of SEQ ID NO: 1, 50, 51, 52 or 54,
- la deuxième séquence est constituée de SEQ ID NO : 2, 55, 56 ou 57, et  the second sequence consists of SEQ ID NO: 2, 55, 56 or 57, and
- la troisième séquence est constituée de SEQ ID NO : 3 ou 58,  the third sequence consists of SEQ ID NO: 3 or 58,
- la quatrième séquence est constituée de SEQ ID NO : 4.  the fourth sequence consists of SEQ ID NO: 4.
7. Polypeptide selon l’une des revendications 1 à 6, dans lequel le polypeptide est sous forme cyclisée. The polypeptide according to one of claims 1 to 6, wherein the polypeptide is in cyclized form.
8. Polypeptide selon l’une des revendications 1 à 7, dans lequel le polypeptide est lié à une molécule porteuse. 8. The polypeptide according to one of claims 1 to 7, wherein the polypeptide is linked to a carrier molecule.
9. Acide nucléique codant pour un polypeptide tel que défini dans l’une des revendications 1 à 8, ou le complémentaire de celui-ci. 9. Nucleic acid encoding a polypeptide as defined in one of claims 1 to 8, or the complement thereof.
FEUILLE RECTIFIÉE (RÈGLE 91) ISA/EP RECTIFIED SHEET (RULE 91) ISA / EP
10. Composition pharmaceutique comprenant, à titre de substance active : 10. Pharmaceutical composition comprising, as active substance:
- au moins un polypeptide tel que défini dans l’une des revendications 1 à 8, ou at least one polypeptide as defined in one of claims 1 to 8, or
- au moins un acide nucléique tel que défini dans la revendication 9, at least one nucleic acid as defined in claim 9,
éventuellement en association avec au moins un véhicule pharmaceufiquement acceptable. optionally in combination with at least one pharmaceutically acceptable carrier.
11. Utilisation d’un polypeptide tel que défini dans l’une des revendications 1 à 8, pour la préparation d’un anticorps, d’un fragment d’anticorps ou d’un aptamère. 11. Use of a polypeptide as defined in one of claims 1 to 8, for the preparation of an antibody, an antibody fragment or an aptamer.
12. Anticorps, fragment d’anticorps, ou aptamère anti-PD-1 spécifiquement dirigé contre le polypeptide tel que défini dans l’une des revendications 1 à 7, sous réserve que le polypeptide ne comprenne pas plus de deux résidus d’acides aminés en plus de la première, de la deuxième, de la troisième ou de la quatrième séquence ou de leurs séquences variantes respectives. An antibody, antibody fragment, or anti-PD-1 aptamer specifically directed against the polypeptide as defined in one of claims 1 to 7, provided that the polypeptide does not comprise more than two amino acid residues. in addition to the first, second, third or fourth sequences or their respective variant sequences.
13. Anticorps, fragment d’anticorps, ou aptamère selon la revendication 12, pour une utilisation à fifre de médicament. An antibody, antibody fragment, or aptamer according to claim 12 for use with a fife of medicine.
14. Polypeptide tel que défini dans l’une des revendications 1 à 8, acide nucléique tel que défini dans la revendication 9, ou composition pharmaceutique telle que définie dans la revendication 1 0, pour une utilisation dans une méthode pour éliciter une réponse immunitaire dirigée contre la protéine PD-1 chez un individu. A polypeptide as defined in one of claims 1 to 8, a nucleic acid as defined in claim 9, or a pharmaceutical composition as defined in claim 10, for use in a method for eliciting a directed immune response against the PD-1 protein in an individual.
15. Polypeptide tel que défini dans l’une des revendications 1 à 8, acide nucléique tel que défini dans la revendication 9, composition pharmaceutique telle que définie dans la revendication 10, ou anticorps, fragment d’anticorps ou aptamère tel que défini dans la revendication 1 3, pour une utilisation dans une méthode de prévention ou de traitement d’une maladie liée ou due à l’expression de la protéine PD-1 ou de la protéine PD-L1 chez un individu. Polypeptide as defined in one of claims 1 to 8, nucleic acid as defined in claim 9, pharmaceutical composition as defined in claim 10, or antibody, antibody fragment or aptamer as defined in the present invention. claim 1 3 for use in a method of preventing or treating a disease related to or due to expression of the PD-1 protein or PD-L1 protein in an individual.
16. Polypeptide, acide nucléique, composition pharmaceutique, ou anticorps, fragment d’anticorps ou aptamère pour une utilisation selon la revendication 15, dans laquelle la maladie liée ou due à l’expression de la protéine PD-1 ou de la protéine PD-L1 est un cancer ou une maladie infectieuse. Polypeptide, nucleic acid, pharmaceutical composition, or antibody, antibody fragment or aptamer for use according to claim 15, wherein the disease related to or due to the expression of the PD-1 protein or the PD-1 protein. L1 is a cancer or an infectious disease.
FEUILLE RECTIFIÉE (RÈGLE 91) ISA/EP RECTIFIED SHEET (RULE 91) ISA / EP
17. Polypeptide, acide nucléique, composition pharmaceutique, ou anticorps, fragment d’anticorps ou apfamère pour une utilisation selon la revendication 15 ou 16, dans laquelle la maladie liée ou due à l’expression de la protéine PD-1 ou de la protéine PD-L1 , est sélectionnée dans le groupe constitué : 17. A polypeptide, nucleic acid, pharmaceutical composition, or antibody, antibody fragment or apfamer for use according to claim 15 or 16, wherein the disease linked or due to the expression of the PD-1 protein or the protein PD-L1, is selected from the group consisting of:
- du mélanome métastatique non résécable, du carcinome pulmonaire métastatique non à petites cellules avancé (NSCLC), du NSCLC métastatique avancé progressant en particulier avec ou après une chimiothérapie à base de platine, du carcinome rénal avancé, notamment métastatique, et du carcinome urothélial localement avancé ou métastatique en particulier ne répondant pas à la chimiothérapie à base de dérives du platine, du cancer de la prostate, du cancer du sein, du cancer colo rectal, ou tout autre cancer où l’axe PD-1 -PD-L1 est mis en jeu dans la suppression d'une réponse immunitaire anti-tumorale  - unresectable metastatic melanoma, advanced non-small-cell metastatic lung carcinoma (NSCLC), advanced metastatic NSCLC progressing particularly with or after platinum-based chemotherapy, advanced renal cell carcinoma, including metastatic carcinoma, and urothelial carcinoma locally advanced or metastatic in particular not responding to chemotherapy based on platinum drifts, prostate cancer, breast cancer, colorectal cancer, or any other cancer where the PD-1-PD-L1 axis is involved in suppressing an anti-tumor immune response
- des infections bactériennes, telles que la pneumonie, la méningite, le syndrome de choc toxique, les intoxications alimentaires, la gastrite, les ulcères, la gonorrhée, les furoncles, les abcès, l’impétigo, les otites, les angines, les infections des voies urinaires et génitales et les infections broncho-pulmonaires,  - bacterial infections, such as pneumonia, meningitis, toxic shock syndrome, food poisoning, gastritis, ulcers, gonorrhea, boils, abscesses, impetigo, ear infections, tonsillitis, infections urinary and genital tract and bronchopulmonary infections,
- des infections virales, telles que la grippe, la rougeole, l’hépatite B, l’hépatite C, les infections par le virus de l’immunodéficience humaine (VIH), les infections par les virus de type Herpès comme par exemple le cytomégalovirus ou le virus d'Epsfein-Barr, l’herpès, et les infections par le virus du papillome humain (VPH), et  - viral infections, such as influenza, measles, hepatitis B, hepatitis C, infections with the human immunodeficiency virus (HIV), infections with herpes virus such as cytomegalovirus or the Epsfein-Barr virus, herpes, and human papillomavirus (HPV) infections, and
- des infections fongiques, telles que la blastomycose, la coccidioiodomycose, l'histoplamose, la paracoccidioiodomycose, la candidose, la cryptococcose, l’aspergillose, la mucomycose et la pneumocystose.  fungal infections, such as blastomycosis, coccidioiodomycosis, histoplamosis, paracoccidioiodomycosis, candidiasis, cryptococcosis, aspergillosis, mucomycosis and pneumocystosis.
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