EA042576B1 - ANTI-IL-5 ANTIBODIES - Google Patents
ANTI-IL-5 ANTIBODIES Download PDFInfo
- Publication number
- EA042576B1 EA042576B1 EA201991552 EA042576B1 EA 042576 B1 EA042576 B1 EA 042576B1 EA 201991552 EA201991552 EA 201991552 EA 042576 B1 EA042576 B1 EA 042576B1
- Authority
- EA
- Eurasian Patent Office
- Prior art keywords
- amino acid
- acid sequence
- seq
- light chain
- antibody molecule
- Prior art date
Links
Description
Перекрестная ссылка на связанные заявкиCross-reference to related applications
Заявка на данный патент испрашивает приоритет по предварительной заявки США № 62/438502, поданной 23 декабря 2016 г., раскрытие которой включено в настоящее описание ссылкой во всей полноте.This patent application claims priority to U.S. Provisional Application No. 62/438,502, filed December 23, 2016, the disclosure of which is incorporated herein by reference in its entirety.
Перечень последовательностейSequence listing
Изобретение включает перечень последовательностей, который был представлен в электронном виде в формате ASCII и настоящим полностью включен ссылкой. Указанная копия ASCII, созданная 30 ноября 2017 года, называется 102085.000906_sl.txt и имеет размер 93529 байт.The invention includes a sequence listing which has been provided electronically in ASCII format and is hereby incorporated by reference in its entirety. The specified ASCII copy, created on November 30, 2017, is named 102085.000906_sl.txt and has a size of 93529 bytes.
Область техники, к которой относится изобретениеThe field of technology to which the invention belongs
В настоящем документе раскрыты новые молекулы антител, которые иммуноспецифично связывают IL-5, и применения раскрытых антител.The present document discloses novel antibody molecules that immunospecifically bind IL-5 and uses of the disclosed antibodies.
Предшествующий уровень техникиPrior Art
Интерлейкин-5 (IL-5) представляет собой цитокин Т-хелперов 2 (Th2), который вызывает пролиферацию и дифференцировку как В-клеток, так и эозинофилов. В В-клетках IL-5 также увеличивает секрецию иммуноглобулинов. IL-5 является ключевым модулятором эозинофилов, где он также регулирует созревание, миграцию в ткани, выживание и предотвращение апоптоза.Interleukin-5 (IL-5) is a T helper 2 (Th2) cytokine that induces the proliferation and differentiation of both B cells and eosinophils. In B cells, IL-5 also increases the secretion of immunoglobulins. IL-5 is a key modulator of eosinophils, where it also regulates maturation, tissue migration, survival, and apoptosis prevention.
Посредством двух отдельных мотивов IL5 связывается со своим специфическим рецептором (IL5Ra) и сигнальным рецептором, общей β-цепью (вс) для интерлейкина-3 (IL-3) и гранулоцитарномакрофагального колониестимулирующего фактора (GMCSF). Сообщалось, что аффинность IL-5 к IL5Ra находится в средне-низком диапазоне нМ (0,2-100 нМ); она смещается в диапазон средних пМ (~100 пМ) в присутствии вс. IL5-R специфически связывается с IL-5, который затем рекрутирует вс на IL-5R.Through two separate motifs, IL5 binds to its specific receptor (IL5Ra) and signaling receptor, the common β-chain (sun) for interleukin-3 (IL-3) and granulocyte-macrophage colony-stimulating factor (GMCSF). The affinity of IL-5 for IL5Ra has been reported to be in the mid-low nM range (0.2-100 nM); it shifts to the range of medium pM (~100 pM) in the presence of Sun. IL5-R binds specifically to IL-5, which then recruits everything to IL-5R.
Терапевтический потенциал направленного воздействия на интерлейкин-5 (IL-5) был продемонстрирован в результате обширной проверки в литературных данных и недавними положительными данными III фазы клинического исследования для реслизумаба и меполизумаба.The therapeutic potential for targeting interleukin-5 (IL-5) has been demonstrated through extensive validation of the literature and recent positive phase III clinical trial data for reslizumab and mepolizumab.
Сущность изобретенияThe essence of the invention
В настоящем документе раскрыты молекулы антител человека, которые иммуноспецифично связываются с IL-5 человека с равновесной константой аффинности (KD), равной по меньшей мере около 40 пМ, определенной поверхностным плазмонным резонансом.Disclosed herein are human antibody molecules that immunospecifically bind to human IL-5 with an equilibrium affinity constant (KD) of at least about 40 pM as determined by surface plasmon resonance.
Также предлагаются молекулы антитела, включающие CDR1 тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 4, CDR2 тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, CDR3 тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность, SEQ ID NO: 8, CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, 21, 24, 27, 30, 33, 36, 39 или 66, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, 42 или 45 и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15,48, 51, 54, 57, 60 или 63.Also provided are antibody molecules comprising a heavy chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 4, a heavy chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6, a heavy chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8, a light chain CDR1, comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, 21, 24, 27, 30, 33, 36, 39, or 66, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, 42, or 45, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15,48, 51, 54, 57, 60 or 63.
Раскрытые молекулы антитела могут включать вариабельную область тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 16 и вариабельную области легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 17, 22, 25, 28, 31, 34, 37, 40, 43, 46, 49, 52, 55, 58, 61, 64 или 67, где вариабельность (т.е. по меньшей мере 90, 95 , 96, 97, 98, 99 или 100% идентичности) имеет место за пределами последовательности CDR.The disclosed antibody molecules may include a heavy chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 16 and a light chain variable region comprising the amino acid sequence which is at least 90, 95, 96, 97, 98, 99 or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 17, 22, 25, 28, 31, 34, 37, 40, 43, 46, 49, 52 , 55, 58, 61, 64, or 67, where the variability (ie, at least 90, 95, 96, 97, 98, 99, or 100% identity) occurs outside of the CDR sequence.
Описанные молекулы антитела могут включать тяжелую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99, или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 18 или 20 и легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 19, 23, 26, 29, 32, 35, 38, 41, 44, 47, 50, 53, 56, 59, 62, 65 или 68, где вариабельность (т.е. по меньшей мере 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентичности) имеет место за пределами последовательности CDR.Described antibody molecules may include a heavy chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 18 or 20 and a light chain comprising an amino acid sequence which is at least 90, 95, 96, 97, 98, 99 or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 19, 23, 26, 29, 32, 35, 38, 41, 44, 47, 50, 53, 56, 59, 62, 65, or 68, where the variability (i.e., at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity) occurs outside of the CDR sequence.
Также представлены молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующие раскрытые молекулы антител, векторы, содержащие молекулы нуклеиновой кислоты, и клетки, трансформированные для экспрессии раскрытых молекул антител.Also provided are nucleic acid molecules encoding the disclosed antibody molecules, vectors containing nucleic acid molecules, and cells transformed to express the disclosed antibody molecules.
Также раскрыты фармацевтические композиции, содержащие любую из молекул антител, раскрытых в данном документе.Also disclosed are pharmaceutical compositions containing any of the antibody molecules disclosed herein.
Настоящее изобретение также относится к способам лечения объекта, имеющего эозинофильную астму, синдром гиперэозинофилии, полипы носа с эозинофильной вовлечением, эозинофильный гранулематоз с поливаскулитом, атопический дерматит или эозинофильный эзофагит, включающий введение объекту терапевтически эффективного количества любого из описанных в данном документе молекул антител или содержащих их фармацевтических композиций, для лечения эозинофильной астмы, гиперэозинофильного синдрома, полипоза носа с эозинофильным поражением, эозинофильного гранулематоза с полиангиитом, атопического дерматита или эозинофильного эзофагита.The present invention also relates to methods of treating a subject having eosinophilic asthma, hypereosinophilia syndrome, nasal polyps with eosinophilic involvement, eosinophilic granulomatosis with polyangiitis, atopic dermatitis, or eosinophilic esophagitis, comprising administering to the subject a therapeutically effective amount of any of the antibody molecules described herein or containing them pharmaceutical compositions for the treatment of eosinophilic asthma, hypereosinophilic syndrome, eosinophilic nasal polyposis, eosinophilic granulomatosis with polyangiitis, atopic dermatitis or eosinophilic esophagitis.
- 1 042576- 1 042576
Также предлагается применение эффективного количества любого из описанных в данном документе молекул антител, или содержащих их фармацевтических композиций, при лечении эозинофильной астмы, гиперэозинофильного синдрома, полипоза носа с эозинофильным вовлечением, эозинофильного гранулематоза с полиангиитом, атопического дерматита или эозинофильного эзофагита.Also provided is the use of an effective amount of any of the antibody molecules described herein, or pharmaceutical compositions containing them, in the treatment of eosinophilic asthma, hypereosinophilic syndrome, nasal polyposis with eosinophilic involvement, eosinophilic granulomatosis with polyangiitis, atopic dermatitis, or eosinophilic esophagitis.
Кроме того, предлагается применение любой из описанных в данном документе молекул антител, или содержащих их фармацевтических композиций, в производстве лекарственного средства, предназначенного для лечения эозинофильной астмы, гиперэозинофильного синдрома, полипоза носа с эозинофильной вовлечением, эозинофильного гранулематоза с полиангиитом атопического дерматита или эозинофильного эзофагита.Further provided is the use of any of the antibody molecules described herein, or pharmaceutical compositions containing them, in the manufacture of a medicament for the treatment of eosinophilic asthma, hypereosinophilic syndrome, nasal polyposis with eosinophilic involvement, eosinophilic granulomatosis with polyangiitis, atopic dermatitis, or eosinophilic esophagitis.
Краткое описание чертежейBrief description of the drawings
Краткое описание, а также последующее подробное описание далее понимаются при чтении в сочетании с прилагаемыми чертежами. С целью иллюстрации раскрытых молекул антител, способов и применений на чертежах показаны примерные воплощения молекул антител, способов и применений; однако молекулы, способы и применения антител не ограничиваются раскрытыми конкретными воплощениями.The brief description as well as the following detailed description are hereinafter understood when read in conjunction with the accompanying drawings. For the purpose of illustrating the disclosed antibody molecules, methods and uses, the drawings show exemplary embodiments of antibody molecules, methods and uses; however, the molecules, methods, and uses of the antibodies are not limited to the specific embodiments disclosed.
Фиг. 1 иллюстрирует анализ TF-1.6G4, показывающий, что вариант антитела 3А5.001 (в формате IgG4) сохраняет эффективность, эквивалентную исходному антителу 3А5 (в формате IgG1).Fig. 1 illustrates a TF-1.6G4 assay showing that the 3A5.001 variant (in IgG4 format) retains equivalent potency to the parent 3A5 antibody (in IgG1 format).
Фиг. 2 иллюстрирует анализ TF-1.6G4, показывающий, что вариант антитела 3А5.040 сохраняет эффективность, эквивалентную исходному антителу 3А5.001.Fig. 2 illustrates analysis of TF-1.6G4 showing that the 3A5.040 variant retains equivalent potency to the parent 3A5.001.
Фиг. 3 представляет собой графическую матрицу, показывающую положение и идентичность различных единичных аминокислотных замен, которые были сгенерированы в 3А5.040 VH CDR, при выравнивании с исходной последовательностью 3А5.040 VH (верхняя последовательность). Рамки содержат остатки, которые были обозначены как остатки CDR согласно номенклатуре AbM. В дополнение к остаткам CDR были сделаны варианты с номерами остатков по Kabat 93 и 94 (рядом с CDR3 НС), как описано в примере Функциональное тестирование и характеризация антител. Различные последовательности, приведенные на этой фигуре, представлены в SEQ ID NO: 73.Fig. 3 is a graphical matrix showing the position and identity of the various single amino acid substitutions that were generated in the 3A5.040 VH CDR when aligned with the original 3A5.040 VH sequence (upper sequence). The frames contain residues that have been designated as CDR residues according to AbM nomenclature. In addition to the CDR residues, variants were made with Kabat residue numbers 93 and 94 (next to HC CDR3) as described in Example Functional Testing and Antibody Characterization. The various sequences shown in this figure are shown in SEQ ID NO: 73.
Фиг. 4 представляет собой графическую матрицу, показывающую положение и идентичность различных единичных аминокислотных замен, которые были сгенерированы для CDR 3A5.040 VL, выровненные с исходной последовательностью 3А5.040 VL (верхняя последовательность). Рамки содержат остатки, которые были обозначены как остатки CDR согласно номенклатуре AbM. Различные последовательности, приведенные на этой фигуре, представлены в SEQ ID NO: 74.Fig. 4 is a graphical matrix showing the position and identity of the various single amino acid substitutions that were generated for the 3A5.040 VL CDRs aligned with the original 3A5.040 VL sequence (upper sequence). The frames contain residues that have been designated as CDR residues according to AbM nomenclature. The various sequences shown in this figure are shown in SEQ ID NO: 74.
Фиг. 5 иллюстрирует примерные консенсусные последовательности CDR легкой цепи, выровненные с последовательностью 3А5.040 VL (верхняя последовательность). Варианты 3А5.040 VL CDR с одной аминокислотной заменой, которые показали потенциальные улучшения в соответствии с критериями включения, описанными в примерах (отношение kd варианта к kd 3A5.040>1,5) и (отношение уровня экспрессии варианта к уровню экспрессии 3А5.040>0,5) были включены в консенсусные последовательности. Определения и нумерация CDR соответствуют номенклатуре AbM и Kabat соответственно. Рамками указаны положения CDR. Различные последовательности, приведенные на этой фигуре, представлены в SEQ ID NO: 75.Fig. 5 illustrates exemplary light chain CDR consensus sequences aligned with the 3A5.040 VL sequence (upper sequence). 3A5.040 VL CDR variants with a single amino acid substitution that showed potential improvements according to the inclusion criteria described in the examples (variant kd ratio to 3A5.040 >1.5 kd) and (variant expression level to 3A5.040 expression level ratio) >0.5) were included in the consensus sequences. The definitions and numbering of the CDRs correspond to the AbM and Kabat nomenclature, respectively. The frames indicate the provisions of the CDR. The various sequences shown in this figure are shown in SEQ ID NO: 75.
Фиг. 6 иллюстрирует мультиконцентрационный кинетический анализ Biacore связывания антитела 3А5.046 с рекомбинантным IL-5 человека при 2,5, 1,25, 0,625, 0,313 и 0,156 мкг/мл. Сенсограммы показывают снижение концентрации IL-5 с порядка 2,5 мкг/мл IL-5 на верхней кривой до 0,156 мкг/мл IL-5 на нижней кривой.Fig. 6 illustrates a multi-concentration Biacore kinetic assay of binding of antibody 3A5.046 to recombinant human IL-5 at 2.5, 1.25, 0.625, 0.313, and 0.156 μg/mL. The sensorgrams show a decrease in the concentration of IL-5 from about 2.5 μg/ml IL-5 in the upper curve to 0.156 μg/ml IL-5 in the lower curve.
Фиг. 7А и фиг. 7В иллюстрируют пролиферацию клеток TF-1.6G4 в ответ на IL-5 и эффективность ингибирования пролиферации, управляемой IL-5, с помощью 3А5.046. 3А5.046 был более сильным ингибитором IL-5 человека (фиг. 7А) и IL-5 яванского макака (фиг. 7В), чем меполизумаб.Fig. 7A and FIG. 7B illustrates the proliferation of TF-1.6G4 cells in response to IL-5 and the efficacy of inhibition of IL-5 driven proliferation by 3A5.046. 3A5.046 was a stronger inhibitor of human IL-5 (FIG. 7A) and cynomolgus monkey IL-5 (FIG. 7B) than mepolizumab.
Фиг. 8А и фиг. 8В показан пример ELISA, разработанного с использованием антитела 3А5 и контрольного захватывающего антитела (R & D Systems). ELISA был способен обнаружить рекомбинантный IL-5 (фиг. 8А) и IL-5, полученный из CD3/CD28/IL-33, активированных первичных Т-клеток человека от 3 доноров (фиг. 8В). Фиг. 8В верхняя панель: донор 1, фиг. 8В средняя панель: донор 3; фиг. 8В нижняя панель: донор 4.Fig. 8A and FIG. 8B shows an example of an ELISA designed using the 3A5 antibody and a control capture antibody (R&D Systems). ELISA was able to detect recombinant IL-5 (FIG. 8A) and IL-5 derived from CD3/CD28/IL-33 activated primary human T cells from 3 donors (FIG. 8B). Fig. 8B top panel: donor 1, FIG. 8B middle panel: donor 3; fig. 8B bottom panel: donor 4.
Фиг. 9 иллюстрирует результаты эксперимента, в котором CD34+ клетки пуповинной крови дифференцировались в фенотипически зрелые эозинофилы с использованием IL-5 и других цитокинов, как описано в примерах. Антитело 3А5.046 было более сильным, чем меполизумаб, при ингибировании индуцированной IL-5 дифференцировки эозинофилов.Fig. 9 illustrates the results of an experiment in which cord blood CD34+ cells were differentiated into phenotypically mature eosinophils using IL-5 and other cytokines as described in the examples. Antibody 3A5.046 was more potent than mepolizumab in inhibiting IL-5 induced eosinophil differentiation.
Фиг. 10А, фиг. 10В, фиг. 10С, фиг. 10D и фиг. 10Е иллюстрируют результаты анализа перекрестной реактивности Biacore антитела 3А5.046, связывающегося с IL-5 человека (фиг. 10A), IL-5 яванского макака (фиг. 10В), IL-5 мыши (фиг. 10С), IL-5 крысы (фиг. 10D) и IL-5 морской свинки (фиг. 10Е). Сенсограммы с двойными ссылками показаны для связывания с цитокинами в концентрации 1 мкг/мл или 10 мкг/мл.Fig. 10A, FIG. 10B, FIG. 10C, fig. 10D and FIG. 10E illustrates the results of a Biacore cross-reactivity assay of antibody 3A5.046 binding to human IL-5 (Fig. 10A), cynomolgus monkey IL-5 (Fig. 10B), mouse IL-5 (Fig. 10C), rat IL-5 ( Fig. 10D) and guinea pig IL-5 (Fig. 10E). Double referenced sensorgrams are shown for cytokine binding at 1 µg/mL or 10 µg/mL.
Фиг. 11А, фиг. 11В, фиг. 11С и фиг. 11D иллюстрируют результаты специфичности анализа BiacoreFig. 11A, FIG. 11B, FIG. 11C and FIG. 11D illustrate the specificity results of the Biacore assay.
- 2 042576 для антитела 3А5.046. Сенсограммы с двойными ссылками показаны для связывания с цитокинами при 10 мкг/мл (фиг. 11А и фиг. 11В) или 1 мкг/мл (фиг. 11С и фиг. 11D).- 2 042576 for antibody 3A5.046. Double referenced sensorgrams are shown for cytokine binding at 10 μg/mL (FIG. 11A and FIG. 11B) or 1 μg/mL (FIG. 11C and FIG. 11D).
Фиг. 12 иллюстрирует результаты провокационной пробы Ascaris suum (A. suum в модели эозинофилии дыхательных путей у яванского макака. На 2-й день наблюдалось существенное различие в количестве эозинофилов в легких (BALF) при сравнении животных, обработанных 3А5.046, и животных, получавших носитель (плацебо) (р<0,01; тест Манна-Уитни).Fig. 12 illustrates the results of the Ascaris suum challenge (A. suum in the cynomolgus monkey model of airway eosinophilia. On day 2, there was a significant difference in lung eosinophil count (BALF) when comparing animals treated with 3A5.046 and animals treated with vehicle (placebo) (p<0.01; Mann-Whitney test).
Фиг. 13А и фиг. 13В иллюстрируют ответ эозинофилов в крови в течение 10 дней после провокационной пробы A. suum у яванского макака, которых предварительно обрабатывали 3А5.046 или контрольным антителом с сопоставимым изотипом (плацебо) за неделю до провокационной пробы A. suum (фиг. 13А). Фиг. 13В иллюстрирует дополнительные детали подсчета эозинофилов в крови у животных, получавших антитело 3А5.046, до 45 дней после провокационной пробы (52 дня после введения дозы). Количество эозинофилов оставалось ниже исходного уровня в течение по меньшей мере 45 дней после провокационной пробы после однократного приема 3А5.046 за неделю до провокационной пробы.Fig. 13A and FIG. 13B illustrates the response of blood eosinophils 10 days after an A. suum challenge in cynomolgus monkeys that were pretreated with 3A5.046 or a comparable isotype control antibody (placebo) one week before the A. suum challenge (FIG. 13A). Fig. 13B illustrates additional details of blood eosinophil counts in animals treated with antibody 3A5.046 up to 45 days post-challenge (52 days post-dose). The eosinophil count remained below baseline for at least 45 days after the challenge following a single dose of 3A5.046 one week before the challenge.
На фиг. 14 показаны уровни эозинофилов BALF в крысиной модели knock-in (KI) с IL-5 человека в ответ на провокационную пробу Alternaria alternata. Эта модель может быть использована для проверки эффективности антитела против IL-5 для модуляции количества эозинофилов BALF после провокационной пробы Alternaria.In FIG. 14 shows BALF eosinophil levels in a knock-in (KI) rat model with human IL-5 in response to an Alternaria alternata challenge. This model can be used to test the effectiveness of an anti-IL-5 antibody to modulate BALF eosinophil count following an Alternaria challenge.
Подробное описание иллюстративных воплощенийDetailed description of illustrative embodiments
Описанные молекулы антител, способы и применения могут быть поняты более легко при ссылке на следующее подробное описание в сочетании с сопровождающими фигурами, которые составляют часть данного описания. Следует понимать, что раскрытые молекулы антител, способы и применения не ограничиваются конкретными молекулами антител, способами и применениями, описанными и/или показанными в данном документе, и что терминология, используемая в данном документе, предназначена для описания конкретных воплощений только в качестве примера и не предназначена для ограничения заявленных молекул антител, способов и применений.The described antibody molecules, methods, and uses may be more readily understood by reference to the following detailed description in conjunction with the accompanying drawings, which form part of this description. It should be understood that the disclosed antibody molecules, methods and uses are not limited to the specific antibody molecules, methods and uses described and/or shown herein, and that the terminology used herein is intended to describe specific embodiments by way of example only and is not is intended to limit the claimed antibody molecules, methods and uses.
Если специально не указано иное, любое описание относительно возможного механизма или способа действия или причины улучшения предназначено только для иллюстрации, и раскрытые молекулы, способы и применения антител не должны быть ограничены правильностью или неправильностью любого такого предложенного механизма или способа действия или причины для улучшения.Unless specifically stated otherwise, any description regarding a possible mechanism or mode of action or reason for an improvement is for illustration only, and the disclosed antibody molecules, methods, and uses should not be limited by the correctness or incorrectness of any such proposed mechanism or mode of action or reason for improvement.
По всему тексту описания относятся к молекулам антител и способам применения указанных молекул антител. В тех случаях, когда раскрытие описывает или заявляет признак или воплощение, связанные с молекулой антитела, такой признак или воплощение в равной степени применимы к способам применения указанной молекулы антитела. Аналогичным образом, когда в описании описывается или заявляется признак или воплощение, связанные со способом применения молекулы антитела, такой признак или воплощение в равной степени применимы к молекуле антитела.Throughout the text, descriptions refer to antibody molecules and methods of using said antibody molecules. Where the disclosure describes or claims a feature or embodiment associated with an antibody molecule, such feature or embodiment is equally applicable to methods of using said antibody molecule. Similarly, where a feature or embodiment is described or claimed in connection with a method of using an antibody molecule, that feature or embodiment is equally applicable to the antibody molecule.
Если диапазон числовых значений приведен или установлен в данном документе, то этот диапазон включает его конечные точки и все отдельные целые числа и дроби в пределах диапазона, а также включает каждый из более узких диапазонов, образованных всеми возможными комбинациями этих конечных точек и внутренних целых чисел и дробей для формирования подгрупп большей группы значений в пределах указанного диапазона в той же степени, как если бы каждый из этих более узких диапазонов был явно указан. Когда диапазон числовых значений указан в данном документе как превышающий заявленное значение, диапазон, тем не менее, конечен и ограничен на своем верхнем конце значением, которое действует в контексте изобретения, как описано в данном документе. Если диапазон числовых значений указан в данном документе как меньший, чем указанное значение, диапазон, тем не менее, ограничен на своем нижнем конце ненулевым значением. Не предполагается, что объем изобретения ограничен конкретными значениями, указанными при определении диапазона. Все диапазоны включаются и комбинируются.If a range of numerical values is given or stated herein, then that range includes its endpoints and all individual integers and fractions within the range, and also includes each of the narrower ranges formed by all possible combinations of those endpoints and internal integers, and fractions to form subgroups of a larger group of values within a specified range to the same extent as if each of those narrower ranges were explicitly specified. When a range of numerical values is specified herein as being greater than the claimed value, the range is nonetheless finite and limited at its upper end to a value that is valid within the context of the invention as described herein. If a range of numeric values is specified herein as less than the specified value, the range is nevertheless limited at its lower end to a non-zero value. It is not intended that the scope of the invention be limited to the specific values specified in the definition of the range. All ranges are included and combined.
Ссылка на конкретное числовое значение включает, по меньшей мере, это конкретное значение, если контекст явно не предписывает иное.Reference to a specific numerical value includes at least that specific value, unless the context clearly dictates otherwise.
Когда значения выражены в виде аппроксимаций с использованием предшествующего около, будет понятно, что конкретное значение образует другой воплощение. Термин около при использовании в отношении числовых диапазонов, предельных значений или конкретных значений используется для обозначения того, что приведенные значения могут отличаться на величину до 10% от указанного значения. Таким образом, термин около используется для охвата отклонений ±10% или менее, отклонений ±5% или менее, отклонений ±1% или менее, отклонений ±0,5% или менее или отклонений ±0,1% или менее указанного значения.When values are expressed as approximations using the preceding about, it will be understood that a particular value forms a different embodiment. The term about, when used with respect to numerical ranges, limit values, or specific values, is used to indicate that the values given may differ by up to 10% from the stated value. Thus, the term about is used to cover deviations of ±10% or less, deviations of ±5% or less, deviations of ±1% or less, deviations of ±0.5% or less, or deviations of ±0.1% or less of a specified value.
Следует отметить, что некоторые признаки раскрытых молекул антител, способов и применений, которые, для ясности, описаны в настоящее описание в контексте отдельных воплощений, также могут быть представлены в комбинации в одном воплощении. И наоборот, различные признаки раскрытых молекул антител, способов и применений, которые для краткости описаны в контексте одного воплощения, также могут быть предоставлены отдельно или в любой субкомбинации.It should be noted that certain features of the disclosed antibody molecules, methods and uses, which, for clarity, are described herein in the context of separate embodiments, may also be presented in combination in one embodiment. Conversely, various features of the disclosed antibody molecules, methods, and uses, which are described for brevity in the context of a single embodiment, may also be provided separately or in any subcombination.
- 3 042576- 3 042576
При использовании в данном документе терминов в единственном числе они также включают в себя множественное число.When used in this document, the terms in the singular, they also include the plural.
Различные термины, относящиеся к аспектам описания, используются в описании и формуле изобретения. Такие термины должны иметь свое обычное значение в данной области, если не указано иное. Другие конкретно определенные термины должны толковаться в соответствии с определениями, представленными в настоящем документе.Various terms relating to aspects of the description are used in the description and claims. Such terms shall have their usual meaning in the art, unless otherwise indicated. Other specifically defined terms should be interpreted in accordance with the definitions provided in this document.
Термин включающий предназначен для включения, но без обязательного ограничения, примеров, охватывающих термины состоящий по существу из и состоящий из; аналогично, термин состоящий по существу из предназначен для включения, но без обязательного ограничения, примеров, охватываемых термином состоящий из.The term including is intended to include, but is not necessarily limited to, examples covering the terms consisting essentially of and consisting of; similarly, the term consisting essentially of is intended to include, but without necessarily being limited to, the examples covered by the term consisting of.
Термин молекула антитела имеет значение в широком смысле и включает полноразмерные молекулы иммуноглобулинов и антигенсвязывающие фрагменты.The term antibody molecule has a broad meaning and includes full-length immunoglobulin molecules and antigen-binding fragments.
Иммуноглобулины могут быть отнесены к пяти основным классам, а именно: IgA, IgD, IgE, IgG, IgM, в зависимости от аминокислотной последовательности константного домена тяжелой цепи. IgA и IgG дополнительно подразделяются на изотипы IgA1, IgA2, IgG1, IgG2, IgG3 и IgG4. Легкие цепи антител любого вида позвоночных могут быть отнесены к одному из двух четко различимых типов, а именно каппа (κ) и лямбда (λ), на основе аминокислотных последовательностей их постоянных доменов.Immunoglobulins can be classified into five main classes, namely: IgA, IgD, IgE, IgG, IgM, depending on the amino acid sequence of the heavy chain constant domain. IgA and IgG are further subdivided into IgA1, IgA2, IgG1, IgG2, IgG3 and IgG4 isotypes. The light chains of antibodies from any vertebrate species can be assigned to one of two distinct types, namely kappa (κ) and lambda (λ), based on the amino acid sequences of their constant domains.
Антигенсвязывающий фрагмент относится к части молекулы иммуноглобулина, которая сохраняет антигенсвязывающие свойства родительского полноразмерного антитела (т.е. его антигенсвязывающий фрагмент). Типичные антигенсвязывающие фрагменты могут иметь: области, определяющие комплементарность тяжелой цепи (HCDR) 1, 2 и/или 3; области, определяющие комплементарность легкой цепи (LCDR) 1, 2 и/или 3; вариабельную область тяжелой цепи (VH); вариабельную область легкой цепи (VL); и их комбинации. Антигенсвязывающие фрагменты включают: Fab-фрагмент, одновалентный фрагмент, состоящий из доменов VL, VH, константного домена легкой цепи (CL) и константного домена тяжелой цепи 1 (СН1); фрагмент F(ab)2, двухвалентный фрагмент, содержащий два фрагмента Fab, связанных дисульфидным мостиком в шарнирной области; фрагмент Fd, состоящий из доменов VH и СН1; фрагмент Fv, состоящий из доменов VL и VH одного плеча антитела; и фрагмент доменного антитела (dAb) (Ward et al., Nature 341: 544- 546, 1989), который состоит из домена VH или домена VL. Домены VH и VL могут быть сконструированы и связаны вместе через синтетический линкер для образования различных типов конструкций одноцепочечных антител, где домены VH/VL спариваются внутримолекулярно или межмолекулярно в тех случаях, когда домены VH и VL экспрессируются отдельным одноцепочечным антителом конструкции для образования моновалентного сайта связывания антигена, такого как одноцепочечный Fv (scFv) или диатело, описанное, например, в публикации международного патента № WO1998/44001, WO1988/01649, WO1994/13804 и WO1992/01047. Эти фрагменты антител получают с использованием методов, хорошо известных специалистам в данной области техники, и фрагменты проверяют на пригодность таким же образом, как и полноразмерные антитела.An antigen-binding fragment refers to a portion of an immunoglobulin molecule that retains the antigen-binding properties of the parent full-length antibody (i.e., its antigen-binding fragment). Typical antigen-binding fragments may have: heavy chain complementarity determining regions (HCDR) 1, 2 and/or 3; light chain complementarity determining regions (LCDR) 1, 2 and/or 3; heavy chain variable region (VH); light chain variable region (VL); and their combinations. Antigen binding fragments include: Fab fragment, a monovalent fragment consisting of VL, VH domains, light chain constant domain (CL) and heavy chain constant domain 1 (CH1); F(ab) 2 fragment, a bivalent fragment containing two Fab fragments linked by a disulfide bridge in the hinge region; Fd fragment consisting of VH and CH1 domains; an Fv fragment consisting of the VL and VH domains of one antibody arm; and a domain antibody fragment (dAb) (Ward et al., Nature 341: 544-546, 1989) which consists of a VH domain or a VL domain. The VH and VL domains can be engineered and linked together via a synthetic linker to form various types of single chain antibody constructs where the VH/VL domains are paired intramolecularly or intermolecularly in cases where the VH and VL domains are expressed by a single single chain antibody of the construct to form a monovalent antigen binding site such as a single chain Fv (scFv) or a diabody as described, for example, in International Patent Publication No. WO1998/44001, WO1988/01649, WO1994/13804 and WO1992/01047. These antibody fragments are prepared using methods well known to those skilled in the art and the fragments are screened for suitability in the same manner as full length antibodies.
Выражение иммуноспецифически связывается относится к способности раскрытых молекул антител преимущественно связываться с его мишенью (IL-5, в случае молекул анти-Ш-5 антител) без преимущественного связывания других молекул в образце, содержащем смешанную популяцию молекул. Молекулы антител, которые иммуноспецифически связывают IL-5, по существу не содержат других антител, обладающих различной антигенной специфичностью (например, антитело против IL-5 по существу не содержит антител, которые специфически связывают антигены, отличные от IL-5). Однако молекулы антител, которые иммуноспецифически связывают IL-5, могут иметь перекрестную реактивность с другими антигенами, такими как ортологи IL-5 человека, в том числе IL-5 Macaca flavicularis (яванского макака). Молекулы антител, раскрытые в данном документе, способны иммуноспецифически связывать как природно-продуцированный IL-5 человека, так и IL-5, который рекомбинантно продуцируется в клетках млекопитающих или прокариот.The expression immunospecifically binds refers to the ability of disclosed antibody molecules to preferentially bind to its target (IL-5, in the case of anti-III-5 antibody molecules) without preferentially binding other molecules in a sample containing a mixed population of molecules. Antibody molecules that immunospecifically bind IL-5 are substantially free of other antibodies having different antigenic specificities (eg, an anti-IL-5 antibody is substantially free of antibodies that specifically bind antigens other than IL-5). However, antibody molecules that immunospecifically bind IL-5 may be cross-reactive with other antigens, such as human IL-5 orthologues, including Macaca flavicularis (cynomolgus monkey) IL-5. The antibody molecules disclosed herein are capable of immunospecifically binding both naturally produced human IL-5 and IL-5 that is produced recombinantly in mammalian or prokaryotic cells.
Вариабельные области антитела состоят из четырех каркасных областей, прерываемых тремя антигенсвязывающими сайтами. Сайты связывания антигена задают с использованием различных определений: (i) Области определения комплементарности (CDR), три в VH (HCDR1, HCDR2, HCDR3) и три в VL (LCDR1, LCDR2, LCDR3), на основании вариабельности последовательности (Wu and Kabat J Exp Med 132: 211-50, 1970; Kabat et al. Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md., 1991); и (ii) Гипервариабельные области (HVR или HV), три в VH (H1, H2, Н3) и три в VL (L1, L2, L3), которым относят те области вариабельных доменов антител, которые являются гипервариабельными по структуре, как определено Chothia и Lesk (Chothia and Lesk Mol Biol 196: 901-17, 1987). Определение CDR AbM также широко используется; это компромисс между схемами нумерации Kabat и Chothia и назван так, потому что он использовался программным обеспечением Oxford Molecular для моделирования антител AbM (Rees, AR, Searle, SMJ, Henry, AHand Pedersen, JT (1996) In Sternberg M.J.E. (ed.), Protein Structure Prediction. Oxford University Press, Oxford, 141-172). Другие определения включают IMGT-CDR (Lefranc et al., Dev Comparat Immunol 27: 55-77, 2003) и использование остатков, определяющих специфичность (SDRU) (Almagro Mol Recognit 17: 132-43, 2004). Международная база данных ImMunoGeneTics (IMGT) (http://www_imgt_org) обеспеThe variable regions of an antibody consist of four framework regions interrupted by three antigen-binding sites. Antigen binding sites are defined using different definitions: (i) Complementarity Detection Regions (CDRs), three in VH (HCDR1, HCDR2, HCDR3) and three in VL (LCDR1, LCDR2, LCDR3), based on sequence variability (Wu and Kabat J Exp Med 132: 211-50, 1970 Kabat et al Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md., 1991); and (ii) Hypervariable regions (HVR or HV), three in VH (H1, H2, H3) and three in VL (L1, L2, L3), which refers to those antibody variable domain regions that are hypervariable in structure, as defined Chothia and Lesk (Chothia and Lesk Mol Biol 196: 901-17, 1987). The AbM CDR definition is also widely used; it is a compromise between the Kabat and Chothia numbering schemes and is so named because it was used by the Oxford Molecular software for modeling AbM antibodies (Rees, AR, Searle, SMJ, Henry, AHand Pedersen, JT (1996) In Sternberg M.J.E. (ed.), Protein Structure Prediction Oxford University Press, Oxford, 141-172). Other definitions include IMGT-CDR (Lefranc et al., Dev Comparat Immunol 27: 55-77, 2003) and the use of specificity determining residues (SDRUs) (Almagro Mol Recognit 17: 132-43, 2004). ImMunoGeneTics International Database (IMGT) (http://www_imgt_org) provides
- 4 042576 чивает стандартизированную нумерацию и определение антигенсвязывающих сайтов. Соответствие между CDR, HV и границами IMGT описано в Lefranc et al., Dev Comparat Immunol. 27: 55-77, 2003.- 4 042576 standardized numbering and definition of antigen-binding sites. The correspondence between CDR, HV and IMGT boundaries is described in Lefranc et al., Dev Comparat Immunol. 27:55-77, 2003.
Каркас или каркасные последовательности представляют собой остальные последовательности вариабельной области, отличные от тех, которые определены как антигенсвязывающие участки. Поскольку сайты связывания антигена могут быть определены различными терминами, как описано выше, точная аминокислотная последовательность каркаса зависит от того, как был определен сайт связывания антигена. Человеческое антитело, полностью человеческое антитело и подобные термины относятся к антителу, имеющему вариабельные области тяжелой и легкой цепи, в которых как каркас, так и сайты связывания антигена получены из последовательностей человеческого происхождения. Если антитело содержит константную область, константная область также происходит от последовательностей человеческого происхождения. Человеческое антитело содержит вариабельные области тяжелой и/или легкой цепи, которые получены из последовательностей человеческого происхождения, если вариабельные области антитела получены из системы, в которой используются гены человеческого иммуноглобулина зародышевой линии или перегруппированные иммуноглобулины. Такие системы включают библиотеки генов иммуноглобулинов человека, презентируемые на фаге, и трансгенных животных, отличных от человека, таких как мышь, несущие локусы иммуноглобулина человека, как описано в данном документе. Человеческое антитело может содержать аминокислотные различия по сравнению с последовательностями человеческой зародышевой линии или перестроенных иммуноглобулинов, например, вследствие естественных соматических мутаций или преднамеренного введения замен в вариабельный домен (каркас и сайты связывания антигена) или константный домен. Как правило, человеческое антитело идентично, по меньшей мере, на около 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% по аминокислотной последовательности с аминокислотной последовательностью, кодируемой геном иммуноглобулина зародышевой линией человека или перестроенным геном иммуноглобулина. В некоторых случаях человеческое антитело может содержать консенсусные каркасные последовательности, полученные из анализа каркасных последовательностей человека, например, как описано в Knappik et al., J Mol Biol 296: 57-86, 2000, или синтетический HCDR3, включенный в библиотеки генов человеческих иммуноглобулинов, презентируемых на фаге, как описано, например, в Shi et al., J Mol Biol 397: 385-96, 2010 и межд. пат. публ. № WO2009/085462. Антитела, в которых сайты связывания антигена происходят из вида, не являющегося человеком, не включены в определение человеческого антитела.The framework or framework sequences are other variable region sequences other than those defined as antigen binding sites. Since antigen binding sites can be defined in various terms as described above, the exact amino acid sequence of the framework depends on how the antigen binding site has been defined. Human antibody, fully human antibody, and like terms refer to an antibody having heavy and light chain variable regions in which both the backbone and antigen binding sites are derived from sequences of human origin. If the antibody contains a constant region, the constant region is also derived from sequences of human origin. A human antibody contains heavy and/or light chain variable regions that are derived from sequences of human origin if the antibody variable regions are derived from a system that uses human germline immunoglobulin genes or rearranged immunoglobulins. Such systems include human immunoglobulin gene libraries presented on phage and non-human transgenic animals such as mice carrying human immunoglobulin loci as described herein. A human antibody may contain amino acid differences compared to human germline or rearranged immunoglobulin sequences, for example, due to natural somatic mutations or deliberate substitutions in the variable domain (scaffold and antigen binding sites) or constant domain. Typically, a human antibody is at least about 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 identical , 99 or 100% amino acid sequence with the amino acid sequence encoded by the human germline immunoglobulin gene or rearranged immunoglobulin gene. In some cases, the human antibody may contain consensus framework sequences derived from analysis of human framework sequences, for example, as described in Knappik et al., J Mol Biol 296: 57-86, 2000, or synthetic HCDR3 included in human immunoglobulin gene libraries, presented on phage, as described, for example, in Shi et al., J Mol Biol 397: 385-96, 2010 and int. Pat. publ. No. WO2009/085462. Antibodies in which the antigen binding sites are from a non-human species are not included in the definition of a human antibody.
Человеческие антитела, полученные из последовательностей иммуноглобулина человека, могут быть получены с использованием систем, таких как фаговый дисплей, включающий синтетические CDR, и/или синтетические каркасы, или могут быть подвергнуты мутагенезу in vitro для улучшения свойств антител в вариабельных областях или константных областях или в обоих, что приводит к антителам, которые в природе не существуют в репертуаре человеческих антител зародышевой линии in vivo.Human antibodies derived from human immunoglobulin sequences may be generated using systems such as phage display including synthetic CDRs and/or synthetic scaffolds, or may be subjected to in vitro mutagenesis to improve antibody properties in variable regions or constant regions or in both, resulting in antibodies that do not naturally exist in the in vivo human germline antibody repertoire.
Рекомбинантное антитело включает все антитела, которые получены, экспрессированы, созданы или выделены рекомбинантными способами, такими как: антитела, выделенные из животного (например, мыши), которое является трансгенным или трансхромосомные гены иммуноглобулинов человека или гибридомы приготовленные из них (описанные ниже); антитела, выделенные из клетки-хозяина, трансформированной для экспрессии антитела; антитела, выделенные из библиотеки рекомбинантных комбинаторных антител; и антитела, полученные, экспрессированные, созданные или выделенные любыми другими способами, которые включают сплайсинг последовательностей генов иммуноглобулина человека с другими последовательностями ДНК, или антитела, которые генерируются in vitro с использованием обмена Fab-плечей.A recombinant antibody includes all antibodies that are made, expressed, generated, or isolated by recombinant methods, such as: antibodies isolated from an animal (eg, mouse) that is transgenic or transchromosomal human immunoglobulin genes or hybridomas prepared from them (described below); antibodies isolated from a host cell transformed to express the antibody; antibodies isolated from a library of recombinant combinatorial antibodies; and antibodies made, expressed, made or isolated by any other means that involve splicing human immunoglobulin gene sequences with other DNA sequences, or antibodies that are generated in vitro using Fab arm exchange.
Моноклональное антитело относится к популяции молекул антител одного молекулярного состава. Композиция моноклонального антитела проявляет одну специфичность связывания и аффинность к конкретному эпитопу или, в случае биспецифического моноклонального антитела, специфичность двойного связывания к двум отдельным эпитопам. Таким образом, моноклональное антитело относится к популяции антител с одним аминокислотным составом в каждой тяжелой и каждой легкой цепях, за исключением возможных хорошо известных изменений, таких как удаление С-концевого лизина из тяжелой цепи антитела. Моноклональные антитела могут иметь гетерогенное гликозилирование в популяции антител. Моноклональное антитело может быть моноспецифичным или полиспецифичным, или моновалентным, бивалентным или поливалентным. Биспецифическое антитело включено в термин моноклональное антитело.A monoclonal antibody refers to a population of antibody molecules of the same molecular composition. A monoclonal antibody composition exhibits a single binding specificity and affinity for a particular epitope or, in the case of a bispecific monoclonal antibody, a double binding specificity for two separate epitopes. Thus, a monoclonal antibody refers to a population of antibodies with a single amino acid composition in each heavy and each light chain, except for possible well-known changes such as removal of the C-terminal lysine from the heavy chain of the antibody. Monoclonal antibodies may have heterogeneous glycosylation within an antibody population. The monoclonal antibody may be monospecific or polyspecific, or monovalent, bivalent or multivalent. A bispecific antibody is included in the term monoclonal antibody.
Эпитоп относится к части антигена, с которой антитело специфически связывается. Эпитопы обычно состоят из химически активных (таких как полярные, неполярные или гидрофобные) поверхностных группировок групп, таких как боковые цепи аминокислот или полисахаридов, и могут иметь специфические трехмерные структурные характеристики, а также специфические характеристики заряда. Эпитоп может состоять из смежных и/или смежных аминокислот, которые образуют конформационную пространственную единицу. Для непрерывного эпитопа аминокислоты из разных частей линейной последовательности антигена находятся в непосредственной близости в 3-мерном пространстве посредством сворачивания молекулы белка.An epitope refers to the portion of an antigen to which an antibody specifically binds. Epitopes typically consist of reactive (such as polar, nonpolar, or hydrophobic) surface groupings of groups, such as amino acid or polysaccharide side chains, and may have specific three-dimensional structural characteristics as well as specific charge characteristics. An epitope may be composed of contiguous and/or contiguous amino acids that form a conformational spatial unit. For a continuous epitope, amino acids from different parts of the linear antigen sequence are in close proximity in 3-dimensional space through the folding of the protein molecule.
Вариант относится к полипептиду или полинуклеотиду, который отличается от эталонного полиVariant refers to a polypeptide or polynucleotide that differs from the reference poly
- 5 042576 пептида или эталонного полинуклеотида одной или несколькими модификациями, например, заменой, вставкой или делецией. Используемый в данном документе термин мутация предназначен для обозначения одной или нескольких преднамеренных замен, которые сделаны в полипептиде или полинуклеотиде.- 5 042576 peptide or reference polynucleotide with one or more modifications, such as substitution, insertion or deletion. As used herein, the term mutation is intended to refer to one or more deliberate substitutions that are made in a polypeptide or polynucleotide.
В данном описании на 90% идентичен включает по меньшей мере на 90% идентичен, 91% идентичен, 92% идентичны, 93% идентичен, 94% идентичен, на 95% идентичен, 96% идентичен, 97% идентичен, 98% идентичен, 99% идентичен или 100% идентичен эталонному элементу (например, биологической последовательности). В текущем описании термин % идентичен используется для описания ряда последовательностей. Следует понимать, что термин % идентичен означает, что при сравнении двух последовательностей в указанной области две последовательности имеют указанное количество идентичных остатков в одном и том же положении. Уровень идентичности может быть определен с использованием CLUSTAL W с параметрами по умолчанию.As used herein, 90% identical includes at least 90% identical, 91% identical, 92% identical, 93% identical, 94% identical, 95% identical, 96% identical, 97% identical, 98% identical, 99 % identical or 100% identical to a reference element (eg, biological sequence). In the current description, the term % identical is used to describe a number of sequences. It should be understood that the term % identical means that when comparing two sequences in a specified region, two sequences have a specified number of identical residues at the same position. The identity level can be determined using CLUSTAL W with default options.
Термины лечить, лечение и тому подобные термины относятся как к терапевтическому лечению, так и к профилактическим или превентивным мерам, и включают уменьшение тяжести и/или частоты симптомов, устранение симптомов и/или основной причины симптомов, уменьшение частоты или вероятность появления симптомов и/или их первопричины, улучшение или устранение повреждений, вызванных, прямо или косвенно, эозинофильной астмой, гиперэозинофильным синдромом, полипозом носа с эозинофильным поражением, эозинофильным гранулематозом с полиангиитом, атопическим дерматитом или эозинофильным эзофагитом. Лечение также включает продление выживаемости по сравнению с ожидаемой выживаемостью объекта, не получающего лечение. Объекты, подлежащие лечению, включают тех, у кого есть состояние или расстройство, а также тех, кто склонен иметь это состояние или расстройство, или тех, у кого необходимо предотвратить состояние или расстройство.The terms treat, treatment, and the like refer to both therapeutic treatment and prophylactic or preventive measures, and include reducing the severity and/or frequency of symptoms, eliminating symptoms and/or the underlying cause of symptoms, reducing the frequency or likelihood of symptoms, and/or their underlying causes, improvement or elimination of damage caused, directly or indirectly, by eosinophilic asthma, hypereosinophilic syndrome, nasal polyposis with eosinophilic involvement, eosinophilic granulomatosis with polyangiitis, atopic dermatitis or eosinophilic esophagitis. The treatment also includes prolonging survival compared to the expected survival of an untreated subject. Subjects to be treated include those who have the condition or disorder, as well as those who are prone to have the condition or disorder, or those in whom the condition or disorder needs to be prevented.
При использовании в данном описании термин введение объекту и подобные термины указывают на процедуру, с помощью которой раскрытые молекулы антитела или композиции, содержащие их, инъецируют в тело пациента таким образом, что целевые клетки, ткани или сегменты организма объекта связываются с раскрытыми молекулами антител.As used herein, the term administration to a subject and similar terms refer to the procedure by which the disclosed antibody molecules, or compositions containing them, are injected into the body of a patient such that target cells, tissues, or body segments of the subject bind to the disclosed antibody molecules.
Выражение терапевтически эффективное количество относится к количеству молекул антител, как описано в данном документе, эффективным для достижения конкретного биологического или терапевтического результата, таких как, без ограничения указанным, биологические или терапевтические результаты, раскрытые, описанные, или приведенные в качестве примеров в данном описании. Терапевтически эффективное количество может варьировать в зависимости от таких факторов, как болезненное состояние, возраст, пол и масса индивидуума и способность композиции вызывать желаемый ответ у объекта. Типичные показатели количества терапевтического эффекта включают, например, улучшение самочувствия пациента, уменьшение симптомов заболевания, остановку или замедление прогрессирования симптомов заболевания и/или отсутствие симптомов заболевания.The expression "therapeutically effective amount" refers to the amount of antibody molecules, as described herein, effective to achieve a particular biological or therapeutic result, such as, without limitation, the biological or therapeutic results disclosed, described, or exemplified in this description. A therapeutically effective amount may vary depending on such factors as disease state, age, sex and weight of the individual and the ability of the composition to elicit the desired response in the subject. Typical indicators of the amount of a therapeutic effect include, for example, improvement in the well-being of the patient, reduction in the symptoms of the disease, stopping or slowing the progression of the symptoms of the disease, and/or the absence of symptoms of the disease.
Следующие сокращения используются в данном документе: Alternaria alternata (Alternaria), Ascaris suum (A. suum); область, определяющая комплементарность (CDR); тяжелая цепь (НС); легкая цепь (LC); вариабельная область тяжелой цепи (VH); вариабельная область легкой цепи (VL); поверхностный плазмонный резонанс (SPR).The following abbreviations are used in this document: Alternaria alternata (Alternaria), Ascaris suum (A. suum); complementarity determining region (CDR); heavy chain (HC); light chain (LC); heavy chain variable region (VH); light chain variable region (VL); surface plasmon resonance (SPR).
Молекулы антител.Antibody molecules.
Раскрытое в данном документе, являются молекулами антител человека, которые иммуноспецифично связываются с IL-5 человека. Молекулы человеческого антитела могут иммуноспецифически связываться с IL-5 человека с равновесной константой аффинности (KD), по меньшей мере, около 40 пМ, что определено поверхностным плазмонным резонансом (SPR). Используемый в данном документе термин по меньшей мере около 40 пМ означает, что раскрытые антитела иммуноспецифически связывают IL-5 человека с KD, меньшим или равным около 40 пМ. Например, раскрытые антитела могут иммуноспецифично связывать IL-5 человека с KD, равным около 40, около 30, около 20, около 10 или менее чем 10 пМ.Disclosed herein are human antibody molecules that immunospecifically bind to human IL-5. Human antibody molecules can immunospecifically bind to human IL-5 with an equilibrium affinity constant (KD) of at least about 40 pM as determined by surface plasmon resonance (SPR). As used herein, the term at least about 40 pM means that the disclosed antibodies immunospecifically bind human IL-5 with a KD less than or equal to about 40 pM. For example, the disclosed antibodies can immunospecifically bind human IL-5 with a KD of about 40, about 30, about 20, about 10, or less than 10 pM.
Описанные молекулы человеческого антитела могут включать CDR1 тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 4, CDR2 тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, CDR3 тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8, консенсусную CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, консенсусную CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 2, и консенсусную CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 3.Described human antibody molecules may include a heavy chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 4, a heavy chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6, a heavy chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8, a light chain consensus CDR1, comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, a light chain consensus CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2, and a light chain consensus CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3.
Консенсусная CDR1, легкой цепи включает аминокислотную последовательность GX1X2X3X4X5X6KX7X8Y (SEQ ID NO: 1), в которой:The light chain consensus CDR1 comprises the amino acid sequence GX1X2X3X4X5X6KX7X8Y (SEQ ID NO: 1) wherein:
X1 представляет собой G или K;X 1 is G or K;
Х2 представляет собой N или D;X 2 represents N or D;
Х3 представляет собой N или Н;X 3 represents N or H;
Х4 представляет собой I или А;X 4 is I or A;
Х5 представляет собой G или D;X 5 is G or D;
- 6 042576- 6 042576
Х6 представляет собой S или K;X 6 is S or K;
Х7 представляет собой N или Н; иX 7 is N or H; And
Х8 представляет собой V или А.X 8 is V or A.
В некоторых воплощениях аминокислотная последовательность CDR1 легкой цепи может включать GGNNIGSKNVY (SEQ ID NO: 5). В некоторых воплощениях аминокислотная последовательность CDR1 легкой цепи может включать GKNNIGSKNVY (SEQ ID NO: 21). В некоторых воплощениях аминокислотная последовательность CDR1 легкой цепи может включать GGDNIGSKNVY (SEQ ID NO: 24). В некоторых воплощениях аминокислотная последовательность CDR1 легкой цепи может включать GGNHIGSKNVY (SEQ ID NO: 27). В некоторых воплощениях аминокислотная последовательность CDR1 легкой цепи может включать GGNNAGSKNVY (SEQ ID NO: 30). В некоторых воплощениях аминокислотная последовательность CDR1 легкой цепи может включать GGNNIDSKNVY (SEQ ID NO: 66). В некоторых воплощениях аминокислотная последовательность CDR1 легкой цепи может включать GGNNIGKKNVY (SEQ ID NO: 33). В некоторых воплощениях аминокислотная последовательность CDR1 легкой цепи может включать GGNNIGSKHVY (SEQ ID NO: 36). В некоторых воплощениях аминокислотная последовательность CDR1 легкой цепи может включать GGNNIGSKNAY (SEQ ID NO: 39).In some embodiments, the light chain CDR1 amino acid sequence may include GGNNIGSKNVY (SEQ ID NO: 5). In some embodiments, the light chain CDR1 amino acid sequence may include GKNNIGSKNVY (SEQ ID NO: 21). In some embodiments, the light chain CDR1 amino acid sequence may include GGDNIGSKNVY (SEQ ID NO: 24). In some embodiments, the light chain CDR1 amino acid sequence may include GGNHIGSKNVY (SEQ ID NO: 27). In some embodiments, the light chain CDR1 amino acid sequence may include GGNNAGSKNVY (SEQ ID NO: 30). In some embodiments, the light chain CDR1 amino acid sequence may include GGNNIDSKNVY (SEQ ID NO: 66). In some embodiments, the light chain CDR1 amino acid sequence may include GGNNIGKKNVY (SEQ ID NO: 33). In some embodiments, the light chain CDR1 amino acid sequence may include GGNNIGSKHVY (SEQ ID NO: 36). In some embodiments, the light chain CDR1 amino acid sequence may include GGNNIGSKNAY (SEQ ID NO: 39).
Аминокислотная последовательность CDR2 легкой цепи включает DDX8X9RPS (SEQ ID NO: 2), в которой:The light chain CDR2 amino acid sequence includes DDX8X9RPS (SEQ ID NO: 2) wherein:
X8 представляет собой S или L; иX 8 is S or L; And
Х9 представляет собой D или S.X 9 is D or S.
В некоторых воплощениях, аминокислотная последовательность CDR2 легкой цепи может включать DDSDRPS (SEQ ID NO: 7). В некоторых воплощениях аминокислотная последовательность CDR2 легкой цепи может включать DDLDRPS (SEQ ID NO: 42). В некоторых воплощениях аминокислотная последовательность CDR2 легкой цепи может включать DDSSRPS (SEQ ID NO: 45).In some embodiments, the light chain CDR2 amino acid sequence may include DDSDRPS (SEQ ID NO: 7). In some embodiments, the light chain CDR2 amino acid sequence may include DDLDRPS (SEQ ID NO: 42). In some embodiments, the light chain CDR2 amino acid sequence may include DDSSRPS (SEQ ID NO: 45).
Аминокислотная последовательность CDR3 легкой цепи содержит QVWX10SSSDX11VX12 (SEQ ID NO: 3), в которой:The light chain CDR3 amino acid sequence contains QVWX 10 SSSDX11VX 12 (SEQ ID NO: 3) wherein:
Х10 представляет собой D или L;X 10 is D or L;
Хп представляет собой Н, S, Y или D; иX p represents H, S, Y or D; And
X12 представляет собой V, А или W.X 12 is V, A or W.
В некоторых воплощениях аминокислотная последовательность CDR3 легкой цепи может включать QVWDSSSDHVV (SEQ ID NO: 15). В некоторых воплощениях аминокислотная последовательность CDR3 легкой цепи может включать QVWLSSSDHVV (SEQ ID NO: 48). В некоторых воплощениях аминокислотная последовательность CDR3 легкой цепи может включать QVWDSSSDSVV (SEQ ID NO: 51). В некоторых воплощениях аминокислотная последовательность CDR3 легкой цепи может включать QVWDSSSDYVV (SEQ ID NO: 54). В некоторых воплощениях аминокислотная последовательность CDR3 легкой цепи может включать QVWDSSSDDVV (SEQ ID NO: 57). В некоторых воплощениях аминокислотная последовательность CDR3 легкой цепи может включать QVWDSSSDHVA (SEQ ID NO: 60). В некоторых воплощениях аминокислотная последовательность CDR3 легкой цепи может включать QVWDSSSDHVW (SEQ ID NO: 63).In some embodiments, the light chain CDR3 amino acid sequence may include QVWDSSSDHVV (SEQ ID NO: 15). In some embodiments, the light chain CDR3 amino acid sequence may include QVWLSSSDHVV (SEQ ID NO: 48). In some embodiments, the light chain CDR3 amino acid sequence may include QVWDSSSDSVV (SEQ ID NO: 51). In some embodiments, the light chain CDR3 amino acid sequence may include QVWDSSSDYVV (SEQ ID NO: 54). In some embodiments, the light chain CDR3 amino acid sequence may include QVWDSSSDDVV (SEQ ID NO: 57). In some embodiments, the light chain CDR3 amino acid sequence may include QVWDSSSSDHVA (SEQ ID NO: 60). In some embodiments, the light chain CDR3 amino acid sequence may include QVWDSSSDHVW (SEQ ID NO: 63).
Описанные молекулы человеческого антитела могут включать CDR1 тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 4, CDR2 тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, CDR3 тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8, CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, 21, 24, 27, 30, 33, 36, 39 или 66, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, 42 или 45 и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15, 48, 51, 54, 57, 60 или 63. Типичные молекулы антител содержат CDR1 тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 4, CDR2 тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, CDR3 тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8 иThe described human antibody molecules may include a heavy chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 4, a heavy chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6, a heavy chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8, a light chain CDR1 comprising amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, 21, 24, 27, 30, 33, 36, 39 or 66, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, 42 or 45 and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15, 48, 51, 54, 57, 60, or 63. Exemplary antibody molecules comprise a heavy chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 4, a heavy chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6, a heavy chain CDR3, comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8 and
a) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15;a) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15;
b) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15;b) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 21, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15;
c) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15;c) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 24, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15;
d) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15;d) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15;
e) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 30, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи,e) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 30, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3,
- 7 042576 включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15;- 7 042576 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15;
f) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 33, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15;f) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 33, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15;
g) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 36, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15;g) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 36, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15;
h) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 39, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15;h) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 39, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15;
i) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 66, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15;i) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 66, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15;
j) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 42, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15;j) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 42, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15;
k) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 45, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15;k) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 45, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15;
l) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 48;l) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 48;
m) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51;m) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51;
n) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54;n) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54;
o) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57;o) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 57;
p) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60; илиp) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 60; or
q) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;q) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
где положение аминокислотных остатков CDR определяется в соответствии с AbM.where the position of the amino acid residues of the CDR is determined in accordance with AbM.
Описанные молекулы антитела могут включать вариабельную область тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99, или 100% идентична аминокислотной последовательности, SEQ ID NO: 16 и вариабельную области легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 17, 22, 25, 28, 31, 34, 37, 40, 43, 46, 49, 52, 55, 58, 61, 64 или 67, где вариабельность (т.е. по меньшей мере 90, 95 , 96, 97, 98, 99 или 100% идентичности) имеет место за пределами последовательности CDR. Типичные молекулы антител представлены в табл. 1 и табл. 15.Described antibody molecules may include a heavy chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90, 95, 96, 97, 98, 99, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 16 and a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90, 95, 96, 97, 98, 99, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NOs: 17, 22, 25, 28, 31, 34, 37, 40, 43, 46, 49 , 52, 55, 58, 61, 64, or 67, where the variability (ie, at least 90, 95, 96, 97, 98, 99, or 100% identity) occurs outside of the CDR sequence. Typical antibody molecules are presented in table. 1 and table. 15.
- 8 042576- 8 042576
Таблица 1Table 1
Сводная информация о цепи/доменном составе антителSummary of antibody chain/domain composition
- 9 042576- 9 042576
* Строчная буква b в каждой из этих последовательностей относится к нумерации Kabat для положения CDR. Нумерация по Kabat допускает CDR переменного размера, используя буквенно-цифровую нумерацию для обозначения вставок аминокислот в определенных положениях. В этих последовательностях CDR присутствовали дополнительные аминокислоты, которые были пронумерованы как положения 95а и 95b (соответствующие положениям Kabat 95A и 95В соответственно). Так, например, для антитела 3А5.276 H95bS указывает на мутацию гистидина (Н) в серии (S) в положении 95В в соответствии с числом Kabat относительно цепи VL 3A5.040. Поэтому в данном документе используется строчная запись, чтобы отличить число Kabat, отдельно от мутации в указанном положении Kabat.* The lowercase b in each of these sequences refers to the Kabat numbering for the CDR position. Kabat numbering allows variable size CDRs, using alphanumeric numbering to indicate amino acid insertions at certain positions. Additional amino acids were present in these CDR sequences, which were numbered positions 95a and 95b (corresponding to Kabat positions 95A and 95B, respectively). For example, for the 3A5.276 antibody, H95bS indicates a histidine (H) mutation in the (S) series at position 95B in accordance with the Kabat number relative to the VL 3A5.040 chain. Therefore, lower case notation is used herein to distinguish the Kabat number, separate from the mutation at the specified Kabat position.
В некоторых воплощениях, раскрытые молекулы антитела могут включать вариабельную область тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99, или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 16 иIn some embodiments, disclosed antibody molecules may include a heavy chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 16 and
a) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 17;a) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 17;
b) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 22;b) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 22;
c) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 25;c) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 25;
d) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 28;d) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 28;
e) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 31;e) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 31;
f) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQf) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ
- 10 042576- 10 042576
ID NO: 34;ID NO: 34;
g) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 37;g) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 37;
h) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 40;h) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 40;
i) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 43;i) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 43;
j) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 46;j) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 46;
k) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 49;k) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 49;
l) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 52;l) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 52;
m) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 55;m) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 55;
n) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 58;n) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58;
o) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 61;o) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 61;
p) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 64; илиp) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 64; or
q) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 67, где вариабельность (т.е. идентичность, по меньшей мере, на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100%) имеет место вне последовательности CDR.q) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90, 95, 96, 97, 98, 99, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 67, where the variability (i.e., identity is at least at least 90, 95, 96, 97, 98, 99, or 100%) occurs out of the CDR sequence.
Описанные молекулы антитела могут включать одну или несколько мутаций, делеций или вставок, в каркасных и/или константных областях. В некоторых воплощениях молекула антитела IgG4 может содержать мутацию S228P. S228 расположена в шарнирной области молекулы антитела IgG4. Мутация серина (S) на пролин (Р) служит для стабилизации шарнира IgG4 и предотвращения обмена Fabплечами in vitro и in vivo. В некоторых воплощениях молекулы антитела могут включать одну или несколько модификаций, которые увеличивают время полувыведения молекул антител in vivo. Например, в некоторых воплощениях антитело может содержать мутацию M252Y, мутацию S254T и мутацию Т256Е (в совокупности называемые мутацией YTE). М252, S254 и Т256 расположены в домене СН2 тяжелой цепи. Мутация этих остатков на тирозин (Y), треонин (Т) и глутамат (Е), соответственно, защищает молекулы антител от лизосомальной деградации, тем самым увеличивая период полувыведения в сыворотке молекул антител. На основании примера других антител предполагается, что введение мутации YTE в антитело против IL-5 может обеспечить достаточное продление периода полувыведения в сыворотке, чтобы обеспечить режимы введения с интервалами между дозами 3 месяца или более. В некоторых воплощениях молекулы антитела могут включать делецию С-концевого остатка лизина тяжелой цепи. Удаление С-концевого остатка лизина тяжелой цепи снижает гетерогенность молекул антител при продуцировании клетками млекопитающих. В некоторых воплощениях молекулы антител могут включать комбинацию мутаций, делеций или вставок. Например, в некоторых аспектах раскрытые молекулы антитела могут включать мутацию S228P и делецию С-концевого остатка лизина тяжелой цепи. Раскрытые антитела, содержащие последовательность тяжелой цепи SEQ ID NO: 18, например, содержат мутацию S228P и делецию С-концевого остатка лизина тяжелой цепи. В некоторых аспектах раскрытая молекула антитела может содержать мутацию S228P, мутацию M252Y, мутацию S254T, мутацию Т256Е и делецию С-концевого остатка лизина тяжелой цепи. Например, антитело 3А5.046, которое содержит тяжелую цепь SEQ ID NO: 20, содержит мутацию S228P, мутацию M252Y, мутацию S254T, мутацию Т256Е и делецию С-концевого остатка лизина тяжелой цепи.Described antibody molecules may include one or more mutations, deletions or insertions in the framework and/or constant regions. In some embodiments, the IgG4 antibody molecule may contain the S228P mutation. S228 is located in the hinge region of the IgG4 antibody molecule. The serine (S) to proline (P) mutation serves to stabilize the IgG4 hinge and prevent Fab-arm exchange in vitro and in vivo. In some embodiments, the antibody molecules may include one or more modifications that increase the in vivo half-life of the antibody molecules. For example, in some embodiments, an antibody may contain an M252Y mutation, an S254T mutation, and a T256E mutation (collectively referred to as a YTE mutation). M252, S254 and T256 are located in the CH2 domain of the heavy chain. Mutation of these residues to tyrosine (Y), threonine (T), and glutamate (E), respectively, protects antibody molecules from lysosomal degradation, thereby increasing the serum half-life of antibody molecules. Based on the example of other antibodies, it is contemplated that the introduction of a YTE mutation in an anti-IL-5 antibody can provide sufficient prolongation of the serum half-life to allow for dosing schedules of 3 months or more between doses. In some embodiments, the antibody molecules may include a deletion of the C-terminal heavy chain lysine residue. Removal of the C-terminal heavy chain lysine residue reduces the heterogeneity of antibody molecules when produced by mammalian cells. In some embodiments, the antibody molecules may include a combination of mutations, deletions, or insertions. For example, in some aspects, disclosed antibody molecules may include an S228P mutation and a deletion of a C-terminal heavy chain lysine residue. The disclosed antibodies containing the heavy chain sequence of SEQ ID NO: 18, for example, contain the S228P mutation and a deletion of the C-terminal heavy chain lysine residue. In some aspects, a disclosed antibody molecule may contain an S228P mutation, an M252Y mutation, an S254T mutation, a T256E mutation, and a deletion of a C-terminal heavy chain lysine residue. For example, antibody 3A5.046, which contains the heavy chain of SEQ ID NO: 20, contains an S228P mutation, an M252Y mutation, an S254T mutation, a T256E mutation, and a deletion of the C-terminal heavy chain lysine residue.
Молекула антитела может содержать константную область тяжелой цепи IgG1 или IgG4 и константную область легкой цепи лямбда. В некоторых воплощениях молекула антитела включает константную область тяжелой цепи IgG1 и константную область легкой цепи лямбда (например, антителоAn antibody molecule may comprise an IgG1 or IgG4 heavy chain constant region and a lambda light chain constant region. In some embodiments, the antibody molecule comprises an IgG1 heavy chain constant region and a lambda light chain constant region (e.g., an antibody
- 11 042576- 11 042576
3А5). В некоторых воплощениях молекула антитела включает константную область тяжелой цепи IgG4 и константную область легкой цепи лямбда.3A5). In some embodiments, the antibody molecule includes an IgG4 heavy chain constant region and a lambda light chain constant region.
Описанные молекулы антитела могут включать тяжелую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99, или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 18 или 20 и легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 19, 23, 26, 29, 32, 35, 38, 41, 44, 47, 50, 53, 56, 59, 62, 65 или 68, где вариабельность (т.е. идентичность по меньшей мере 90%) имеет место за пределами последовательности CDR. Типичные молекулы антител представлены в табл. 1 и табл. 15. В некоторых воплощениях молекулы антитела могут включать тяжелую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 18 иDescribed antibody molecules may include a heavy chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 18 or 20 and a light chain comprising an amino acid sequence which is at least 90, 95, 96, 97, 98, 99 or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 19, 23, 26, 29, 32, 35, 38, 41, 44, 47, 50, 53, 56, 59, 62, 65, or 68, where the variability (ie, at least 90% identity) occurs outside of the CDR sequence. Typical antibody molecules are presented in table. 1 and table. 15. In some embodiments, antibody molecules may include a heavy chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 18 and
a) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 19;a) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 19;
b) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 23;b) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 23;
c) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 26;c) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26;
d) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 29;d) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 29;
e) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 32;e) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 32;
f) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 35;f) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 35;
g) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 38;g) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 38;
h) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 41;h) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 41;
i) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 44;i) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 44;
j) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 47;j) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 47;
k) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 50;k) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 50;
l) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 53;l) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 53;
m) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 56;m) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 56;
n) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 59;n) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 59;
о) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 62;o) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 62;
р) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 65; илиp) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 65; or
q) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 68, где вариабельность (т.е. идентичность, по меньшей мере, на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100%) имеет место вне последовательности CDR.q) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 68, where the variability (i.e., identity is at least at 90, 95, 96, 97, 98, 99, or 100%) occurs out of the CDR sequence.
Описанные молекулы антитела могут включать тяжелую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99, или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 20 и легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 19 где вариабельность (т.е. идентичность, по меньшей мере, на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100%) имеет место вне последовательности CDR.Described antibody molecules may include a heavy chain comprising an amino acid sequence that is at least 90, 95, 96, 97, 98, 99, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 20 and a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 19 or 100%) occurs outside of the CDR sequence.
В некоторых воплощениях молекулы антитела являются полными молекулами антител длиной (с или без удаления С-концевого остатка лизина тяжелой цепи). В других воплощениях молекулы антитела представляют собой антигенсвязывающие фрагменты. Подходящие фрагменты, связывающие антитела, включают, без ограничения указанным, фрагмент Fab, фрагмент Fab2 или одноцепочечное антитело.In some embodiments, the antibody molecules are full length antibodies (with or without removal of the C-terminal heavy chain lysine residue). In other embodiments, the antibody molecules are antigen-binding fragments. Suitable antibody binding fragments include, but are not limited to, a Fab fragment, a Fab2 fragment, or a single chain antibody.
Молекулы антител могут иметь одно или несколько из следующих свойств:Antibody molecules may have one or more of the following properties:
а) связываться с IL-5 человека с равновесной константой аффинности (KD), равной по меньшей мере около 40 пМ, определенной по поверхностным плазмонным резонансом;a) bind to human IL-5 with an equilibrium affinity constant (KD) of at least about 40 pM as determined by surface plasmon resonance;
b) уменьшать связывание IL-5 с рецептором IL-5;b) reduce the binding of IL-5 to the IL-5 receptor;
- 12 042576- 12 042576
c) иметь период полувыведения в сыворотке по меньшей мере около 20 дней; илиc) have a serum half-life of at least about 20 days; or
d) связывать IL-5 человека и яванского макака, но не IL-5 мыши, крысы или морской свинки.d) bind human and cynomolgus monkey IL-5 but not mouse, rat or guinea pig IL-5.
Также предлагаются фармацевтические композиции, содержащие любую из раскрытых молекул антител.Also provided are pharmaceutical compositions containing any of the disclosed antibody molecules.
Также предлагаются молекулы нуклеиновых кислот, кодирующие любые из раскрытых молекул антител и векторы, содержащие раскрытые молекулы нуклеиновых кислот.Also provided are nucleic acid molecules encoding any of the disclosed antibody molecules and vectors containing the disclosed nucleic acid molecules.
Также предлагаются клетки, трансформированные для экспрессии любой из раскрытых молекул антител.Also provided are cells transformed to express any of the disclosed antibody molecules.
Способы и примененияMethods and uses
Описанные молекулы антител или фармацевтические композиции, содержащие их, могут быть использованы для лечения эозинофильной астмы, гиперэозинофильного синдрома, полипоза носа с эозинофильным поражением, эозинофильного гранулематоза с полиангиитом, атопического дерматита и эозинофильного эзофагита. Любые характеристики молекулы антитела, раскрытые в данном документе, в равной степени применимы к антителам, используемым в раскрытых способах и применениях.The described antibody molecules or pharmaceutical compositions containing them can be used to treat eosinophilic asthma, hypereosinophilic syndrome, nasal polyposis with eosinophilic lesions, eosinophilic granulomatosis with polyangiitis, atopic dermatitis and eosinophilic esophagitis. Any characteristics of an antibody molecule disclosed herein apply equally to the antibodies used in the disclosed methods and uses.
Раскрытое в данном документе представляет собой способы лечения объекта, имеющего эозинофильную астму, синдром гиперэозинофилии, полипоз носа с эозинофильной вовлечением, эозинофильный гранулематоз с поливаскулитом, атопический дерматит или эозинофильный эзофагит, включающие введение объекту терапевтически эффективного количества любой из молекул антител, описанные или фармацевтические композиции, содержащие его, для лечения эозинофильной астмы, гиперэозинофильного синдрома, полипоза носа с эозинофильным поражением, эозинофильного гранулематоза с полиангиитом, атопического дерматита или эозинофильного эзофагита.Disclosed herein are methods of treating a subject having eosinophilic asthma, hypereosinophilia syndrome, nasal polyposis with eosinophilic involvement, eosinophilic granulomatosis with polyangiitis, atopic dermatitis, or eosinophilic esophagitis, comprising administering to the subject a therapeutically effective amount of any of the antibody molecules described or pharmaceutical compositions, containing it, for the treatment of eosinophilic asthma, hypereosinophilic syndrome, nasal polyposis with eosinophilic lesions, eosinophilic granulomatosis with polyangiitis, atopic dermatitis or eosinophilic esophagitis.
Также предлагается применение эффективного количества любой из описанных молекул антител, или содержащих их фармацевтических композиций, при лечении эозинофильной астмы, гиперэозинофильного синдрома, полипоза носа с эозинофильным вовлечением, эозинофильного гранулематоза с поливаскулитом, атопического дерматита или эозинофильного эзофагита.Also provided is the use of an effective amount of any of the described antibody molecules, or pharmaceutical compositions containing them, in the treatment of eosinophilic asthma, hypereosinophilic syndrome, nasal polyposis with eosinophilic involvement, eosinophilic granulomatosis with polyangiitis, atopic dermatitis, or eosinophilic esophagitis.
Кроме того, предлагается применение любой из описанных молекул антител, или фармацевтических композиций, содержащих их, в производстве лекарственного средства, предназначенного для лечения эозинофильной астмы, гиперэозинофильного синдрома, полипоза носа с эозинофильным вовлечением, эозинофильного гранулематоза с с полиангиитом, атопического дерматита или эозинофильного эзофагита.In addition, the use of any of the described antibody molecules, or pharmaceutical compositions containing them, is proposed in the manufacture of a medicament intended for the treatment of eosinophilic asthma, hypereosinophilic syndrome, nasal polyposis with eosinophilic involvement, eosinophilic granulomatosis with polyangiitis, atopic dermatitis or eosinophilic esophagitis.
ПримерыExamples
Следующие примеры приведены для дальнейшего описания некоторых из воплощений, раскрытых в данном документе. Примеры предназначены для иллюстрации, а не для ограничения раскрытых воплощений.The following examples are provided to further describe some of the embodiments disclosed herein. The examples are intended to be illustrative and not limiting of the disclosed embodiments.
Получение антител против IL-5 человека.Obtaining antibodies against human IL-5.
Антитела против IL-5 человека были получены из трансгенных крыс (ОМТ) с клонированными в их геномы человеческими V-генами, которые продуцируют антитела с человеческими V-доменами и крысиными Fc-доменами. Вкратце, трансгенных крыс генетически иммунизировали ДНК, кодирующей IL-5, четыре раза в течение 21 дня (в дни 0, 7, 14, 21) и стимулировали рекомбинантным IL-5 человека на 28 день протокола иммунизации. Титры сывороточных антител определяли в дни 0 и 38 протокола иммунизации с помощью анализа ELISA с использованием рекомбинантного IL-5 человека. Вкратце, сыворотки от каждого животного разводили в PBS 1% BSA и тестировали с использованием планшетов ELISA, покрытых 1 мкг/мл IL-5 человека или BSA в качестве контроля. Конъюгат козьего антитела против крысиных IgG с R-фикоэритрином (SouthernBiotech, № 3030-09) использовали в качестве вторичного антитела в концентрации 10 мкг/мл. Конкретные животные были выбраны для слияния гибридом на основе этих сывороточных титров.Antibodies against human IL-5 were obtained from transgenic rats (HMTs) with human V genes cloned into their genomes, which produce antibodies with human V domains and rat Fc domains. Briefly, transgenic rats were genetically immunized with DNA encoding IL-5 four times over 21 days (days 0, 7, 14, 21) and challenged with recombinant human IL-5 on day 28 of the immunization protocol. Serum antibody titers were determined on days 0 and 38 of the immunization protocol by an ELISA assay using recombinant human IL-5. Briefly, sera from each animal were diluted in PBS 1% BSA and tested using ELISA plates coated with 1 μg/ml human IL-5 or BSA as controls. Goat anti-rat IgG R-phycoerythrin conjugate (SouthernBiotech, no. 3030-09) was used as secondary antibody at a concentration of 10 μg/ml. Specific animals were selected for hybridoma fusion based on these serum titers.
Для получения гибридом, которые продуцируют моноклональные антитела к IL-5 человека, спленоциты и/или клетки лимфатических узлов от иммунизированных животных выделяли и объединяли с клетками P3X63Ag8.653 несекретирующей мышиной миеломы (АТСС, CRL-1580). Клетки высевали при около 1x105 клеток/мл в планшеты для микротитрования с плоским дном с последующей двухнедельной инкубацией в селективной среде, которая включала 10% фетальной клональной сыворотки и 1 х HAT (Sigma). Гибридомы размножали путем последовательных пассажей через четыре смены среды в 96луночных планшетах (96-луночные стадии 1-4), затем во флаконах Т25 и, наконец, Т75.To obtain hybridomas that produce anti-human IL-5 monoclonal antibodies, splenocytes and/or lymph node cells from immunized animals were isolated and combined with P3X63Ag8.653 non-secreting murine myeloma (ATCC, CRL-1580) cells. Cells were seeded at about 1 x 105 cells/ml in flat bottom microtiter plates followed by a two week incubation in selective media that included 10% fetal clonal serum and 1 x HAT (Sigma). The hybridomas were propagated by passage through four medium changes in 96-well plates (96-well steps 1-4), then in T25 flasks, and finally in T75 flasks.
Надосадочные жидкости гибридомных клонов анализировали во время процесса размножения гибридом, первоначально в ELISA на цельных клетках с использованием клеток, трансфицированных GPIзаякоренным IL-5 человека, а затем ELISA с использованием теста ELISA на рекомбинантный IL-5 человека (последний как описано выше). Гибридомы, которые пережили процесс масштабирования до стадии Т75 и которые давали сигналы связывания выше заданного порога в обоих из этих анализов, были заморожены в виде клеточных гранул для клонирования и секвенирования Ig v-доменов. После этих стадий скрининга приблизительно 20 гибридом, продуцирующих химерные IgG, отобрали для клонирования.Supernatants from the hybridoma clones were analyzed during the hybridoma propagation process, initially in whole cell ELISA using cells transfected with GPI-anchored human IL-5, and then ELISA using the recombinant human IL-5 ELISA assay (the latter as described above). Hybridomas that survived the scaling process to the T75 stage and that gave binding signals above a given threshold in both of these assays were frozen as cell pellets for cloning and sequencing of Ig v domains. After these screening steps, approximately 20 chimeric IgG producing hybridomas were selected for cloning.
Человеческие v-домены из кандидатных химерных IgG выделяли путем получения кДНК из клеточных осадков гибридом, ПЦР-амплификации v-областей, субклонирования и секвенирования ДНК. ВHuman v-domains from candidate chimeric IgGs were isolated by obtaining cDNA from hybridoma cell pellets, PCR amplification of the v-regions, subcloning and DNA sequencing. IN
- 13 042576 результате секвенирования этих гибридом было получено около 35 комбинаций тяжелых и легких цепей. Все антитела клонировали в экспрессирующий вектор для млекопитающих и транзиторно трансфицировали в клетки HEK-293. Антитела очищали с использованием стандартных протоколов очистки с протеином А.- 13 042576 sequencing of these hybridomas resulted in about 35 combinations of heavy and light chains. All antibodies were cloned into a mammalian expression vector and transiently transfected into HEK-293 cells. Antibodies were purified using standard protein A purification protocols.
Функциональное тестирование и характеризация антител.Functional testing and characterization of antibodies.
Отдельные антитела в формате человеческого IgG1 сначала анализировали на специфичность в ELISA с IL-5 человека. Вкратце, антитела разводили в PBS 0,1% BSA и тестировали с использованием планшетов для ELISA, покрытых 1 мкг/мл IL-5 человека или нерелевантного контрольного белка. Антитело против IgG, конъюгированное с пероксидазой хрена, использовали в качестве вторичного антитела.Individual antibodies in human IgG1 format were first analyzed for specificity in an ELISA with human IL-5. Briefly, antibodies were diluted in PBS 0.1% BSA and tested using ELISA plates coated with 1 μg/ml human IL-5 or an irrelevant control protein. An anti-IgG antibody conjugated to horseradish peroxidase was used as a secondary antibody.
Антитела, которые показали иммуноспецифическое связывание с IL-5 человека были ранжированы по активности в анализе IL-5-зависимой пролиферации Т-клеток человека с помощью человеческих клеток TF-1.6G4 (производные от линии эритролейкозных клеток человека TF-1). Клеточную линию TF1.6G4 субклонировали и отбирали для усиления поверхностной экспрессии IL-5R и последовательного пролиферативного ответа на IL-5 человека. Клеточную линию TF-1.6G4 поддерживали в культуре в соответствии со стандартными условиями, используемыми для линии эритролейкозных клеток человека TF-1 (ATCC: CRL-2003). Вкратце, разведения каждого антитела инкубировали в присутствии 45 пМ IL-5 человека и 5х104 клеток TF-1.6G4 на лунку в течение 48 ч и определяли пролиферацию клеток с использованием CellTiter-Glo® Luminescent Cell Viability. Assay (Promega, Висконсин). Все кривые пролиферации и ингибирования были построены с использованием трех- или четырехпараметрической модели доза-ответ в программном обеспечении GraphPad Prism 6 (версия 6.04). Табл. 2 суммирует эти результаты.Antibodies that showed immunospecific binding to human IL-5 were ranked for activity in a human IL-5-dependent T cell proliferation assay using human TF-1.6G4 cells (derived from the human erythroleukemia cell line TF-1). The TF1.6G4 cell line was subcloned and selected for enhanced surface expression of IL-5R and consistent proliferative response to human IL-5. The TF-1.6G4 cell line was maintained in culture according to the standard conditions used for the human erythroleukemic cell line TF-1 (ATCC: CRL-2003). Briefly, dilutions of each antibody were incubated in the presence of 45 pM human IL-5 and 5×10 4 TF-1.6G4 cells per well for 48 hours and cell proliferation was determined using CellTiter-Glo® Luminescent Cell Viability. Assay (Promega, Wisconsin). All proliferation and inhibition curves were built using a three- or four-parameter dose-response model in GraphPad Prism 6 software (version 6.04). Tab. 2 summarizes these results.
Таблица 2table 2
Сводка данных скрининга и характеризации первоначальной тестовой панели в формате IgG1Summary of screening and characterization data from the initial test panel in IgG1 format
В табл. 2 результаты тестов ранжированы в порядке эффективности анализа на TF1.6G4. Первоначальная тестовая панель была выбрана на основе активности, аффинности, ингибирования IL-5R и последовательностей (иммуногенность и проявляющая способность).In table. 2, the test results are ranked in order of the effectiveness of the analysis for TF1.6G4. The initial test panel was selected based on activity, affinity, IL-5R inhibition, and sequences (immunogenicity and expressiveness).
Для определения аффинности тестируемых антител к рекомбинантному IL-5 человека и их активности при ингибировании связывания IL-5Ra с IL-5 человека были использованы анализы Biacore. Табл. 2 суммирует эти результаты. Аффинность связывания тестируемых антител с IL-5 человека (KD; фиг. 6) определяли с помощью системы Biacore T200 (GE Healthcare), покрывая сенсорный чип Biacore Series S Sensor Chip Protein A (GE Healthcare) выбранным очищенным антителом IgG с уровнем захвата 75 RU, затем вводили рекомбинантный IL-5 человека со скоростью 60 мкл/мин в 7-стадийном диапазоне двукратного серийного разведения, начиная с 1 мкг/мл. Все эксперименты проводили с использованием буфера HBS-EP+ (GE Healthcare). Полученные сенсограммы имели двойной контроль (значения тестируемой проточной ячейки вычитали из значений проточной ячейки контроля (поверхность с протеином А без антитела), а также пустого буфера). Константы связывания определяли путем подгонки модели связывания Ленгмюра 1:1 к сенсограммам с двойным контролем.Biacore assays were used to determine the affinity of test antibodies for recombinant human IL-5 and their activity in inhibiting IL-5Ra binding to human IL-5. Tab. 2 summarizes these results. The binding affinity of test antibodies to human IL-5 (KD; Fig. 6) was determined using a Biacore T200 system (GE Healthcare) by coating a Biacore Series S Sensor Chip Protein A (GE Healthcare) sensor chip with a selected purified IgG antibody with a capture level of 75 RU , then recombinant human IL-5 was injected at 60 μl/min over a 7-step 2-fold serial dilution range starting at 1 μg/ml. All experiments were performed using HBS-EP+ buffer (GE Healthcare). The obtained sensograms had a double control (the values of the tested flow cell were subtracted from the values of the flow cell of the control (surface with protein A without antibody), as well as empty buffer). Binding constants were determined by fitting a 1:1 Langmuir binding model to dual control sensorograms.
Для того, чтобы определить, ингибирует ли каждое тестируемое антитело связывание IL-5 с IL5Ra, использовали либо систему Biacore T200, либо систему Biacore 3000 (GE Healthcare). Чип датчика Biacore CM5 сначала дериватизировали с помощью набора для захвата Fab (GE Healthcare) в соответствии с инструкциями производителя на двух соседних (тестируемая и контрольная) проточных ячейках. Эту поверхность использовали для захвата каждого очищенного тестируемого антитела IgG на однойTo determine if each antibody tested inhibits IL-5 binding to IL5Ra, either the Biacore T200 system or the Biacore 3000 system (GE Healthcare) was used. The Biacore CM5 sensor chip was first derivatized with a Fab capture kit (GE Healthcare) according to the manufacturer's instructions on two adjacent (test and control) flow cells. This surface was used to capture each purified IgG test antibody on one
- 14 042576 тестируемой проточной ячейке. Затем через тестовую и контрольную проточные ячейки вводили рекомбинантный IL-5 человека в концентрации 5 мкг/мл или пустой буфер для насыщения поверхности тестируемой проточной ячейки и контроля неспецифической ассоциации IL-5, соответственно. Вторую инъекцию очищенного тестируемого антитела IgG в концентрации 10 мкг/мл или пустого буфера выполняли на тестируемой проточной ячейке для блокирования свободных сайтов связывания IL-5 и контроля диссоциации тестируемого антитела IgG от антитела, захватывающего Fab, соответственно.- 14 042576 flow cell to be tested. Then, recombinant human IL-5 at a concentration of 5 μg/ml or empty buffer was injected through the test and control flow cells to saturate the surface of the test flow cell and control for non-specific association of IL-5, respectively. A second injection of purified IgG test antibody at 10 μg/mL or blank buffer was performed on the test flow cell to block free IL-5 binding sites and control dissociation of IgG test antibody from the Fab capture antibody, respectively.
Последующие инъекции IL-5Ra-Fc (R & D Systems) в концентрации 5 или 20 мкг/мл или пустого буфера через обе проточные ячейки использовали для определения блокирует ли тестируемое антитело IgG, взаимодействие между IL-5 и IL-5Ra или для контроля диссоциации антитела IgG от антитела захвата Fab во время этой стадии. Антитела, которые ингибировали связывание IL-5 с IL-5R, демонстрировали заметно сниженный сигнал при инъекции IL-5R (табл. 2). Способ тройного вычитания контроля использовали для анализа данных, как описано выше. Все данные были экспортированы из оценочного программного обеспечения Biacore и вычтены в программном обеспечении Excel (Microsoft). Все эксперименты проводили с использованием буфера HBS-EP+ (GE Healthcare).Subsequent injections of IL-5Ra-Fc (R&D Systems) at 5 or 20 µg/mL or empty buffer through both flow cells were used to determine if the test antibody blocked IgG, the interaction between IL-5 and IL-5Ra, or to control dissociation. IgG antibodies from the Fab capture antibody during this step. Antibodies that inhibited IL-5 binding to IL-5R showed a markedly reduced signal upon injection of IL-5R (Table 2). The triple subtraction control method was used for data analysis as described above. All data were exported from Biacore evaluation software and subtracted in Excel software (Microsoft). All experiments were performed using HBS-EP+ buffer (GE Healthcare).
На основании этих результатов была выбрана меньшая панель тестируемых антител (3А5, 2В4 и 5Н11 в табл. 2). Антитела были переформатированы в человеческий IgG4 и протестированы в тех же анализах. IgG4-Bepcra антитела 3А5 (первоначально IgG1) была обозначена как 3А5.001. Было продемонстрировано, что это полностью человеческое антитело обладает эффективностью, эквивалентной исходному тесту 3А5 в формате IgGl (фиг. 1).Based on these results, a smaller panel of test antibodies was selected (3A5, 2B4 and 5H11 in Table 2). The antibodies were reformatted to human IgG4 and tested in the same assays. The IgG4-Bepcra antibody 3A5 (originally IgG1) was designated 3A5.001. This fully human antibody was shown to have equivalent potency to the original 3A5 IgGl assay (FIG. 1).
Вариант антитела 3А5.001 (обозначенный 3А5.040) получали с конкретными аминокислотными заменами (VH: S[68]T, N[82A]S; VL: S[2]Y, I[3]V, Y[92]D, где остатки в квадратных скобках представляют положения Kabat), введенные в области V-домена для удаления спрогнозированных Т-клеточных эпитопов. Было продемонстрировано, что в анализе с TF-1.6G4 антитело 3А5.040 обладает активностью, эквивалентной его родительскому антителу 3А5.001 (фиг. 2).The 3A5.001 antibody variant (designated 3A5.040) was generated with specific amino acid substitutions (VH: S[68]T, N[82A]S; VL: S[2]Y, I[3]V, Y[92]D where residues in square brackets represent Kabat positions) introduced in the V domain region to remove predicted T-cell epitopes. In the TF-1.6G4 assay, antibody 3A5.040 was shown to have equivalent activity to its parent antibody 3A5.001 (FIG. 2).
Сканирование CDR антитела 3А5.040.CDR scan of antibody 3A5.040.
Получение вариантов антитела 3А5.040 - варианты антитела 3А5.040 с одной мутацией были сделаны путем замены одной из группы из девяти репрезентативных аминокислот -A, S, L, Y, D, Q, K, Н, W- в каждом аминокислотном положении в CDR1 легкой цепи (CDR-L1), CDR2 легкой цепи (CDR-L2), CDR1 тяжелой цепи (CDR-H1) и CDR2 тяжелой цепи (CDR-H2) (определенных по номенклатуре AbM). Варианты антител также были созданы путем замены одной из группы из десяти репрезентативных аминокислот-А, S, L, Y, D, Q, K, Н, W, Р- в каждом аминокислотном положении CDR в CDR3 легкой цепи (CDR-L3), CDR3 тяжелой цепи (CDR-H3) и в положениях Kabat 93 и 94 в вариабельной области тяжелой цепи. Полный список всех созданных вариантов одного мутантного антитела показан на фиг. 3 (вариабельная тяжелая цепь) и фиг. 4 (вариабельная легкая цепь), соответственно.Generation of 3A5.040 Variants - Single mutation variants of the 3A5.040 antibody were made by substituting one of a group of nine representative amino acids -A, S, L, Y, D, Q, K, H, W- at each amino acid position in Light chain CDR1 (CDR-L1), light chain CDR2 (CDR-L2), heavy chain CDR1 (CDR-H1), and heavy chain CDR2 (CDR-H2) (defined by AbM nomenclature). Antibody variants have also been generated by substituting one of a group of ten representative amino acids - A, S, L, Y, D, Q, K, H, W, P - at each amino acid position of the CDR in the light chain CDR3 (CDR-L3), heavy chain CDR3 (CDR-H3) and at Kabat positions 93 and 94 in the heavy chain variable region. A complete listing of all generated variants of a single mutant antibody is shown in FIG. 3 (variable heavy chain) and FIG. 4 (variable light chain), respectively.
Конструирование векторов экспрессии антител - варианты вариабельной. области были получены с помощью обратной трансляции аминокислотных последовательностей в ДНК-последовательности, которые впоследствии были синтезированы de novo путем сборки синтетических олигонуклеотидов. Варианты вариабельной тяжелой цепи (VH) субклонировали в экспрессирующий вектор для млекопитающих, содержащий константную область человека, для получения полноразмерных тяжелых цепей антител человека (домены СН1, шарнирные, СН2 и СН3 тяжелой цепи человеческого IgG4). Сходным образом варианты вариабельной легкой цепи (VL) субклонировали в экспрессирующий вектор для млекопитающих, содержащий константную область легкой цепи лямбда человека, для получения полноразмерных лямбдацепей антител.Construction of antibody expression vectors - Variable variants. the regions were generated by reverse translation of amino acid sequences into DNA sequences, which were subsequently synthesized de novo by assembling synthetic oligonucleotides. Variable heavy chain (VH) variants were subcloned into a mammalian expression vector containing a human constant region to generate full-length human heavy chains (human IgG4 heavy chain CH1, hinge, CH2 and CH3 domains). Similarly, variable light chain (VL) variants were subcloned into a mammalian expression vector containing a human lambda light chain constant region to generate full-length antibody lambda chains.
Экспрессия вариантов антител - антитела были получены путем совместной трансфекции отдельных экспрессирующих векторов, кодирующих тяжелые цепи и легкие цепи антитела в клетках EXPI293® (Life Technologies, Карлсбад, Калифорния). Каждая цепь с одной мутацией была спарена с родительской цепью для экспрессии белка в системе EXPI293®. Для каждых 20 мл трансфекции требовалось 3,6x107 клеток в 20 мл среды для экспрессии EXPI293®. За день до трансфекции клетки высевали с плотностью 0,9x106 жизнеспособных клеток/мл и инкубировали в течение ночи при 37°С в увлажненной атмосфере с 8% CO2 в воздухе на орбитальном шейкере, вращающемся со скоростью 200 об/мин. В день трансфекции количество клеток и их жизнеспособность определяли с использованием автоматического счетчика клеток. Использовали только культуры с>98% жизнеспособных клеток. Для каждых 20 мл трансфекции липид-ДНК-комплексы готовили путем разбавления 10 мкг ДНК тяжелой цепи и 10 мкг ДНК легкой цепи в среде со сниженным количеством сыворотки OPTI-MEM® I (Life Technologies, Карлсбад, Калифорния) (кат. № 31985-062) до общего объема 1,0 мл. 54 мкл реагента EXPIFECTAMINE® 293 (Life Technologies, Карлсбад, Калифорния) разводили в среде OPTI-MEM® I до общего объема 1,0 мл. Оба флакона осторожно перемешивали и инкубировали в течение 5 мин при комнатной температуре. После инкубации разбавленную ДНК смешивали с разведенным реагентом EXPIFECTAMINE® 293 и смесью ДНК-реагент EXPIFECTAMINE® 293 и инкубировали еще 20 мин при комнатной температуре для образования комплексов ДНК-реагент EXPIFECTAMINE® 293. После инкубации 2 мл комплекса ДНК-реагент EXPIFECTAMINE® 293 добавляли в каждую биореакторную пробирку емкостью 50 мл (ТРР Techno PlasticExpression of Antibody Variants - Antibodies were generated by co-transfection of separate expression vectors encoding antibody heavy chains and light chains into EXPI293® cells (Life Technologies, Carlsbad, CA). Each strand with one mutation was paired with the parent strand for protein expression in the EXPI293® system. For every 20 ml of transfection, 3.6x107 cells were required in 20 ml of EXPI293® expression medium. The day before transfection, cells were seeded at a density of 0.9x106 viable cells/ml and incubated overnight at 37° C. in a humidified atmosphere with 8% CO 2 in air on an orbital shaker rotating at 200 rpm. On the day of transfection, the number of cells and their viability was determined using an automatic cell counter. Only cultures with >98% viable cells were used. For each 20 ml of transfection, lipid-DNA complexes were prepared by diluting 10 µg of heavy chain DNA and 10 µg of light chain DNA in OPTI-MEM® I Serum Reduced Medium (Life Technologies, Carlsbad, CA) (cat. no. 31985-062 ) to a total volume of 1.0 ml. 54 µl of EXPIFECTAMINE® 293 reagent (Life Technologies, Carlsbad, CA) was diluted in OPTI-MEM® I medium to a total volume of 1.0 ml. Both vials were gently mixed and incubated for 5 min at room temperature. After incubation, diluted DNA was mixed with diluted EXPIFECTAMINE® 293 Reagent and EXPIFECTAMINE® 293 DNA Reagent and incubated for an additional 20 min at room temperature to form EXPIFECTAMINE® 293 DNA Reagent complexes. After incubation, 2 ml of EXPIFECTAMINE® 293 DNA Reagent complex was added each 50 ml bioreactor tube (TPP Techno Plastic
- 15 042576- 15 042576
Products AG). 2 мл среды OPTI-MEM® I (Life Technologies, Карлсбад, Калифорния) добавляли в пробирку с отрицательным контролем вместо комплекса ДНК-реагент EXPIFECTAMINE® 293. Клетки инкубировали в инкубаторе при 37°С с увлажненной атмосферой с 8% СО2 в воздухе на орбитальном шейкере, вращающемся со скоростью 200 об/мин. Приблизительно через 16-18 ч после трансфекции в каждый биореактор добавляли 100 мкл усилителя трансфекции EXPIFECTAMINE® 293 Transfection Enhancer 1 и 1,0 мл усилителя трансфекции EXPIFECTAMINE® 293 Transfection Enhancer 2. Надосадочные жидкости собирали через около 48 ч после трансфекции.Products AG). 2 ml of OPTI-MEM® I medium (Life Technologies, Carlsbad, CA) was added to the negative control tube in place of EXPIFECTAMINE® 293 DNA-reagent complex. Cells were incubated in a 37°C humidified incubator with 8% CO 2 in air for orbital shaker rotating at 200 rpm. Approximately 16-18 hours after transfection, 100 μl of EXPIFECTAMINE® 293 Transfection Enhancer 1 and 1.0 ml of EXPIFECTAMINE® 293 Transfection Enhancer 2 were added to each bioreactor. Supernatants were collected about 48 hours after transfection.
Очистка вариантов антител - каждый вариант антитела экспрессировали в клетках EXPI293® либо в 20, либо в 100 мл клеточной культуры. Культуры центрифугировали в 50 мл пробирках типа Falcon при 3000 g в течение 20 мин и надосадочные жидкости фильтровали с использованием фильтра 0,22 мкм. Надосадочные жидкости очищали с использованием робота Gilson ASPEC GX274. Вкратце, картриджи SPE (Agilent, 12131014), заполненные 1,2 мл смолой с протеином A MABSELECT SURE® (GE Healthcare), предварительно уравновешивали 3 объемами колонки 1X PBS. Надосадочную жидкость пропускали через колонки с последующей промывкой 4 мл 1X PBS. Каждую колонку промывали 9 мл 1 М лимонной кислоты, рН 2,9. Антитела элюировали 2 мл 0,1 М лимонной кислоты, рН 2,9. Антитела обессоливали в S0rensens PBS (5 мМ KH2PO4, 3 мМ Na2HPO42Н2О, 145,4 мМ NaCl (рН ~5,8)) с использованием колонок PD-10 (GE Healthcare).Purification of Antibody Variants - Each antibody variant was expressed in EXPI293® cells in either 20 or 100 ml of cell culture. The cultures were centrifuged in 50 ml Falcon type tubes at 3000 g for 20 min and the supernatants were filtered using a 0.22 µm filter. Supernatants were purified using a Gilson ASPEC GX274 robot. Briefly, SPE cartridges (Agilent, 12131014) filled with 1.2 ml MABSELECT SURE® Protein A Resin (GE Healthcare) were pre-equilibrated with 3 column volumes of 1X PBS. The supernatant was passed through the columns followed by washing with 4 ml 1X PBS. Each column was washed with 9 ml of 1 M citric acid, pH 2.9. Antibodies were eluted with 2 ml of 0.1 M citric acid, pH 2.9. Antibodies were desalted in SOrensens PBS (5 mM KH 2 PO 4 , 3 mM Na 2 HPO42H 2 O, 145.4 mM NaCl (pH ~5.8)) using PD-10 columns (GE Healthcare).
Определение титра вариантного антитела 3А5.040 в надосадочной жидкости с помощью Biacore надосадочную жидкость, содержащую антитела из экспрессии в клетках EXPI293® анализировали с использованием чипа Protein A series S на Biacore Т200 для того, чтобы определить их титр и ранжировать их по отношению к родительскому антителу 3А5.040. Каждый образец надосадочной жидкости разбавляли рабочим буфером (1xHBS-EP+, 350 мМ NaCl) и переносили инъекцией со скоростью 60 мкл/мин в проточную ячейку (FC) 2. Результирующий уровень захвата в единицах ответа (RU) измеряли на FC 2-1 путем вычитания точки отчета через 5 с после начала цикла из точки отчета через 5 с после введения. Поверхность регенерировали путем впрыскивания 50 мМ NaOH в течение 12 с при скорости потока 60 мкл/мин на FC 1 и 2 каждые 4 цикла. После каждой регенерации поверхность и сенсограмму стабилизировали в течение 120 с путем введения рабочего буфера. Из-за большого количества антител, которые были подвергнуты скринингу таким образом, было проведено множество прогонов партий.Determination of the 3A5.040 variant antibody titer in the supernatant using Biacore Supernatant containing antibodies from expression in EXPI293® cells were analyzed using the Protein A series S chip on the Biacore T200 in order to determine their titer and rank them relative to the parent antibody 3A5.040. Each supernatant sample was diluted with running buffer (1xHBS-EP+, 350 mM NaCl) and injected at 60 µl/min into flow cell (FC) 2. The resulting uptake in response units (RU) was measured on FC 2-1 by subtracting reporting points 5 s after the start of the cycle from the reporting point 5 s after injection. The surface was regenerated by injecting 50 mM NaOH for 12 s at a flow rate of 60 μl/min on FC 1 and 2 every 4 cycles. After each regeneration, the surface and the sensorgram were stabilized for 120 s by introducing the working buffer. Due to the large number of antibodies that have been screened in this manner, many batch runs have been carried out.
Уровни захвата (в единицах ответа Biacore RU), полученные для каждого образца надосадочной жидкости были скорректированы путем умножения значения, полученного для каждой инъекции 30 сек на коэффициент разбавления надосадочной жидкости, что позволяет сравнить уровни захвата между надосадочными жидкостями разбавленными в разной степени среди разных экспериментальных прогонов. Относительный уровень экспрессии антител (титр) каждого мутанта сравнивали с надосадочной жидкостью, специфичной для партии 3А5.040 (табл. 3) с использованием следующей формулы:The capture levels (in Biacore RU response units) obtained for each supernatant sample were adjusted by multiplying the value obtained for each 30 sec injection by the supernatant dilution factor, which allows comparison of the capture levels between supernatants diluted to varying degrees among different experimental runs. . The relative level of antibody expression (titer) of each mutant was compared with the supernatant fluid specific for batch 3A5.040 (Table 3) using the following formula:
(скорректированный RU эталонного 3А5.040 для 30-секундной инъекции/скорректированный RU вариантного антитела для 30-секундной инъекции) х100 = пропорциональный титр родительского антитела (% титра 3А5.040)(corrected RU of reference 3A5.040 for 30 sec injection/corrected RU of variant antibody for 30 sec injection) x100 = Proportional titer of parent antibody (% titer of 3A5.040)
Формула 1Formula 1
Вариантные антитела с более высоким титром, чем родительское антитело 3А5.040 имели значение % титра 3А5.040>100%, а антитела с более низким титром, имеют значение <100%. Это позволило идентифицировать вариантные антитела, которые могли бы иметь улучшенную экспрессию по сравнению с родительским антителом 3А5.040. Титры некоторых вариантов не определяли анализом Biacore образцов надосадочных жидкостей, но экспрессировали и очищали, как указано выше, и их очищенные выходы определяли спектрофотометрическим анализом (А280), а затем сравнивали с родительским антителом 3А5.040 (табл. 5).Variant antibodies with a higher titer than the parent antibody 3A5.040 had a % titer 3A5.040 value of >100%, and antibodies with a lower titer had a value of <100%. This allowed the identification of variant antibodies that could have improved expression compared to the parent antibody 3A5.040. Some variants were not titered by Biacore analysis of supernatant samples but were expressed and purified as above and their purified yields were determined by spectrophotometric analysis (A 280 ) and then compared to the parent antibody 3A5.040 (Table 5).
Определение IL-5-связывающей кинетики вариантного антитела 3А5.040 с помощью Biacore - надосадочную жидкость, содержащую антитела из экспрессии в клетках EXPI293® или очищенные антитела анализировали с использованием чипа Protein A series S в системе Biacore T200 (GE Healthcare), определяли их аффинность связывания с рекомбинантным IL-5 человека и ранжировали их по отношению к родительскому антителу 3А5.040.Determination of IL-5 binding kinetics of variant antibody 3A5.040 using Biacore - supernatant containing antibodies from expression in EXPI293® cells or purified antibodies were analyzed using the Protein A series S chip in the Biacore T200 system (GE Healthcare), their affinity was determined binding to recombinant human IL-5 and ranked them in relation to the parental antibody 3A5.040.
Каждое антитело разводили в рабочем буфере (1xHBS-EP+, 350 мМ NaCl), и захватывали при 60 мкл/мин до около 50 RU на FC 2. Затем поверхность и сенсограмму стабилизировали в течение 120 с путем введения рабочего буфера. Рекомбинантный IL-5 человека в концентрации 5 мкг/мл или рабочий буфер вводили в FC 1 и 2 со скоростью потока 60 мкл/мин в течение 70 с. IL-5 давали возможность диссоциировать в рабочем буфере в течение 300 с. Поверхность регенерировали путем впрыскивания 50 мМ NaOH в течение 12 с при скорости потока 60 мкл/мин в FC 1 и 2. Буфер вводили для дальнейшего дрейфа при очистке в течение 60 с при скорости потока 60 мкл/мин на FC 1 и 2. Поверхность стабилизировали в течение 300 с с помощью проточного буфера над FC 1 и 2. Надосадочную жидкость, содержащую родительское антитело 3А5.040 и которое было трансфецировано каждой партией, прогоняли примерно каждые 25 циклов в течение каждого прогона. Очищенный образец 3А5.040 и изотипического контрольного IgG4 лямбда прогоняли с каждой партией для измерения вариативности результатов между анализами.Each antibody was diluted in running buffer (1xHBS-EP+, 350 mM NaCl) and captured at 60 µl/min to about 50 RU per FC 2. The surface and sensorogram were then stabilized for 120 s by injecting running buffer. Recombinant human IL-5 at a concentration of 5 μg/ml or running buffer was injected into FC 1 and 2 at a flow rate of 60 μl/min for 70 seconds. IL-5 was allowed to dissociate in running buffer for 300 s. The surface was regenerated by injecting 50 mM NaOH for 12 s at a flow rate of 60 μl/min in FC 1 and 2. Buffer was injected to further drift in purification for 60 s at a flow rate of 60 μl/min in FC 1 and 2. The surface was stabilized for 300 seconds with running buffer over FC 1 and 2. The supernatant containing the parental 3A5.040 antibody that was transfected with each batch was run approximately every 25 cycles during each run. Purified sample 3A5.040 and lambda isotype control IgG4 were run with each batch to measure inter-assay variability in results.
- 16 042576- 16 042576
Из-за большого количества антител, которые были подвергнуты скринингу таким образом, было проведено множество прогонов партий.Due to the large number of antibodies that have been screened in this manner, many batch runs have been carried out.
Данные имели двойной контроль (проточная ячейка 2 вычиталась из проточной ячейки 1 и пустого буфера) и сенсограммы подгонялись к модели связывания Ленгмюра 1:1 с помощью программного обеспечения Biacore Evaluation. Значение kd (скорость диссоциации) рассчитывали для каждого образца надосадочной жидкости 3А5.040 на протяжении всего цикла, и они были усреднены для получения эталонного kd, за исключением прогона 2.1, в котором был только один образец надосадочной жидкости 3А5.040 (табл. 3 и 6-11). Рассчитанное значение kd для каждого антитела надосадочной жидкости сравнивали со средним эталонным kd 3A5.040 по следующей формуле:Data were double controlled (flow cell 2 subtracted from flow cell 1 and empty buffer) and sensorgrams were fitted to a 1:1 Langmuir binding model using Biacore Evaluation software. The kd value (rate of dissociation) was calculated for each sample of 3A5.040 supernatant throughout the run, and they were averaged to give the reference kd, except for run 2.1, which had only one sample of 3A5.040 supernatant (Table 3 and 6-11). The calculated kd value for each supernatant antibody was compared to the average reference kd 3A5.040 using the following formula:
(эталонное kd 3A5.040/kd вариантного антитела) х100 = пропорциональное kd родительского антитела (% 3А5.040 kd)(reference kd 3A5.040/kd variant antibody) x100 = proportional kd of parent antibody (% 3A5.040 kd)
Формула 2Formula 2
Вариантные антитела с более низким kd (более медленная скорость диссоциации), чем родительское антитело 3А5.040, имели значение % 3А5.040 kd>100%, а антитела с более высоким kd (более быстрой скоростью диссоциации) имели значение <100%. Это позволило идентифицировать вариантные антитела, которые могли бы улучшить кинетику связывания с IL-5 и, следовательно, улучшить функцию по сравнению с родительским антителом, 3А5.040. Для вариантов, в которых был получен только очищенный белок (Табл. 6), кинетический анализ Biacore проводили в трех повторах, как указано выше, с использованием этих очищенных антител, а средние значения из каждого анализа в трех повторах использовали для выполнения расчета пропорционального kd, как указано выше (табл. 4 и 8-11).Variant antibodies with a lower kd (slower dissociation rate) than the parent antibody 3A5.040 had a % 3A5.040 kd value >100%, and antibodies with a higher kd (faster dissociation rate) had a value <100%. This allowed the identification of variant antibodies that could improve IL-5 binding kinetics and therefore improve function compared to the parent antibody, 3A5.040. For variants in which only purified protein was obtained (Table 6), the Biacore kinetic assay was performed in triplicate as above using these purified antibodies, and the averages from each triplicate assay were used to perform the proportional kd calculation. as above (Tables 4 and 8-11).
Таблица 3Table 3
Определение титра антитела-варианта 3А5.040 в надосадочной жидкости и кинетики связывания с IL-5 с помощью BiacoreDetermination of the titer of the antibody variant 3A5.040 in the supernatant and the kinetics of binding to IL-5 using Biacore
- 17 042576- 17 042576
- 18 042576- 18 042576
- 19 042576- 19 042576
- 20 042576- 20 042576
- 21 042576- 21 042576
- 22 042576- 22 042576
- 23 042576- 23 042576
- 24 042576- 24 042576
- 25 042576- 25 042576
- 26 042576- 26 042576
- 27 042576- 27 042576
Эта таблица содержит сводку рассчитанных кинетических данных и данных титров для каждого тестируемого антитела надосадочной жидкости. Вариантные антитела с более низким значением kd (более медленная скорость диссоциации), чем у исходного антитела 3А5.040, имеют значение % 3А5.040 kd>100%, а антитела с более высоким значением kd (более быстрой скоростью диссоциации) - значение <100%. Вариантные антитела с более высоким титром, чем родительское антитело 3А5.040, имеют значение %3А5.040>100%, а антитела с более низким титром-значение <100%. N/A, Не применимо. NB, нет связывания. NE, нет экспрессии.This table contains a summary of the calculated kinetic data and titer data for each supernatant antibody tested. Variant antibodies with a lower kd value (slower dissociation rate) than the parent antibody 3A5.040 have a % 3A5.040 kd value >100%, while antibodies with a higher kd value (faster dissociation rate) have a value <100 %. Variant antibodies with a higher titer than the parent antibody 3A5.040 have a %3A5.040>100% value, and lower titer antibodies have a value of <100%. N/A, Not applicable. NB, no binding. NE, no expression.
- 28 042576- 28 042576
Таблица 4Table 4
Определение кинетики связывания IL-5 очищенным антителом- вариантом 3А5.040 с помощью BiacoreDetermination of IL-5 Binding Kinetics with Purified Antibody Variant 3A5.040 Using Biacore
- 29 042576- 29 042576
- 30 042576- 30 042576
Таблица 5Table 5
Выход экспрессии очищенного белка для выбранных антител-вариантов 3А5.040Expression yield of purified protein for selected antibody variants 3A5.040
Таблица 6Table 6
Матрица сканирования VH CDR1Scanning matrix VH CDR1
и kdand kd
VH CDR1 для вариантовVH CDR1 for options
SC А SSC A S
D Q К н W РD Q K n W P
Сводка различий в титре антитела-варианта 3А5.040 (определениеSummary of differences in titer of antibody variant 3A5.040 (determination
AbM). Нумерация аминокислот по Kabat и аминокислоты родительского 3А5.040 приведены в верхнем ряду. Мутированные остатки указаны в левом столбце. Крайнее левое значение в каждой ячейке является пропорциональным титром каждого варианта по сравнению с родительским 3А5.040 (>1=более высокий титр, <1=более низкий титр), в то время как правое значение является пропорциональным kd (>1=более низкое kd, <1=более высокое kd) каждого варианта по сравнению с родительским 3А5.040. Несделанные варианты отмечены серым цветом. NB, отсутствие связывания. NE, отсутствие экспрессии (Последова- 31 042576 тельность VH CDR1 раскрыта как остатки 26-37 из SEQ ID NO: 73).AbM). Amino acid numbering according to Kabat and amino acids of the parent 3A5.040 are shown in the top row. Mutated residues are listed in the left column. The leftmost value in each cell is the proportional titer of each variant compared to the parent 3A5.040 (>1=higher titer, <1=lower titer), while the rightmost value is proportional to kd (>1=lower kd , <1=higher kd) of each variant compared to parent 3A5.040. Unmade options are marked in grey. NB, no binding. NE, no expression (The VH CDR1 sequence is disclosed as residues 26-37 of SEQ ID NO: 73).
Таблица 7Table 7
Матрица сканирования VH CDR2Scanning matrix VH CDR2
Сводка различий в титре антитела-варианта 3А5.040 и kd для вариантов CDR2 VH (определение AbM). Нумерация аминокислот по Kabat и исходные аминокислоты 3А5.040 приведены в верхнем ряду. Мутированные остатки указаны в левом столбце. Крайнее левое значение в каждой ячейке является пропорциональным титром каждого варианта по сравнению с родительским 3А5.040 (>1=более высокий титр, <1=более низкий титр), в то время как правое значение является пропорциональным kd (>1=более низкое kd, <1=более высокое kd) каждого варианта по сравнению с родительским 3А5.040. Несделанные варианты отмечены серым цветом. NB, отсутствие связывания. NE, отсутствие экспрессии (Последовательность VH CDR2 раскрыта как остатки 52-60 из SEQ ID NO: 73).Summary of differences in 3A5.040 variant antibody titer and kd for CDR2 VH variants (AbM detection). Amino acid numbering according to Kabat and the original amino acids 3A5.040 are shown in the top row. Mutated residues are listed in the left column. The leftmost value in each cell is the proportional titer of each variant compared to the parent 3A5.040 (>1=higher titer, <1=lower titer), while the rightmost value is proportional to kd (>1=lower kd , <1=higher kd) of each variant compared to parent 3A5.040. Unmade options are marked in grey. NB, no binding. NE, no expression (VH CDR2 sequence disclosed as residues 52-60 of SEQ ID NO: 73).
Таблица 8Table 8
Матрица сканирования VH CDR3Scanning matrix VH CDR3
Сводка различий в титре антитела-варианта 3А5.040 и kd для вариантов CDR3 VH (определение AbM) и аминокислотных положений по Kabat 93 и 94. Нумерация аминокислот по Kabat и исходные аминокислоты 3А5.040 приведены в верхнем ряду. Мутированные остатки указаны в левом столбце. Крайнее левое значение в каждой ячейке является пропорциональным титром каждого варианта по сравнению с родительским 3А5.040 (>1=более высокий титр, <1=более низкий титр), в то время как правое значение является пропорциональным kd (>1=более низкое kd, <1=более высокое kd) каждого варианта по сравнению с родительским 3А5.040. Несделанные варианты отмечены серым цветом. NB, отсутствие связывания. NE, отсутствие экспрессии. (Последовательность VH CDR3 раскрыта как остатки 98-106 из SEQ ID NO: 73).Summary of differences in 3A5.040 variant antibody titer and kd for CDR3 VH variants (AbM detection) and Kabat amino acid positions 93 and 94. Kabat amino acid numbering and the original 3A5.040 amino acids are shown in the top row. Mutated residues are indicated in the left column. The leftmost value in each cell is the proportional titer of each variant compared to the parent 3A5.040 (>1=higher titer, <1=lower titer), while the rightmost value is proportional to kd (>1=lower kd , <1=higher kd) of each variant compared to parent 3A5.040. Unmade options are marked in grey. NB, no binding. NE, no expression. (The VH CDR3 sequence is disclosed as residues 98-106 of SEQ ID NO: 73).
Таблица 9Table 9
Матрица сканирования VL CDR1Scanning matrix VL CDR1
Сводка различий в титре антитела-варианта 3А5.040 и kd для вариантов CDR1 VL (определение AbM). Нумерация аминокислот по Kabat и исходные аминокислоты 3А5.040 приведены в верхнем ряду. Мутированные остатки указаны в левом столбце. Крайнее левое значение в каждой ячейке является проSummary of differences in variant 3A5.040 antibody titer and kd for CDR1 VL variants (AbM detection). Amino acid numbering according to Kabat and the original amino acids 3A5.040 are shown in the top row. Mutated residues are listed in the left column. The leftmost value in each cell is the
- 32 042576 порциональным титром каждого варианта по сравнению с родительским 3А5.040 (>1=более высокий титр, <1=более низкий титр), в то время как правое значение является пропорциональным kd (>1=более низкое kd, <1=более высокое kd) каждого варианта по сравнению с родительским 3А5.040. Несделанные варианты отмечены серым цветом. NB, отсутствие связывания. NE, отсутствие экспрессии. (Последовательность VL CDR1 раскрыта как остатки 23-33 из SEQ ID NO: 74).- 32 042576 portional titer of each variant compared to the parent 3A5.040 (>1=higher titer, <1=lower titer), while the right value is proportional to kd (>1=lower kd, <1= higher kd) of each variant compared to parent 3A5.040. Unmade options are marked in grey. NB, no binding. NE, no expression. (The VL CDR1 sequence is disclosed as residues 23-33 of SEQ ID NO: 74).
Таблица 10Table 10
Матрица сканирования VL CDR2Scanning matrix VL CDR2
Сводка различий в титре антитела-варианта 3А5.040 и kd для вариантов VL CDR2 (определение AbM). Нумерация аминокислот по Kabat и исходные аминокислоты 3А5.040 приведены в верхнем ряду. Мутированные остатки указаны в левом столбце. Крайнее левое значение в каждой ячейке является пропорциональным титром каждого варианта по сравнению с родительским 3А5.040 (>1=более высокий титр, <1=более низкий титр), в то время как правое значение является пропорциональным kd (>1=более низкое kd, <1=более высокое kd) каждого варианта по сравнению с родительским 3А5.040. Несделанные варианты отмечены серым цветом. NB, отсутствие связывания. NE, отсутствие экспрессии (Последовательность VL CDR2 раскрыта как остатки 49-55 из SEQ ID NO: 74).Summary of differences in 3A5.040 variant antibody titer and kd for VL CDR2 variants (AbM determination). Amino acid numbering according to Kabat and the original amino acids 3A5.040 are shown in the top row. Mutated residues are indicated in the left column. The leftmost value in each cell is the proportional titer of each variant compared to the parent 3A5.040 (>1=higher titer, <1=lower titer), while the rightmost value is proportional to kd (>1=lower kd , <1=higher kd) of each variant compared to parent 3A5.040. Unmade options are marked in grey. NB, no binding. NE, no expression (VL CDR2 sequence disclosed as residues 49-55 of SEQ ID NO: 74).
Таблица 11Table 11
Матрица сканирования VL CDR3Scanning matrix VL CDR3
VL CDR3VL CDR3
Сводка различий в титре антитела-варианта 3А5.040 и kd для вариантов CDR3 VL (определение AbM). Нумерация аминокислот по Kabat и исходные аминокислоты 3А5.040 приведены в верхнем ряду. Мутированные остатки указаны в левом столбце. Крайнее левое значение в каждой ячейке является пропорциональным титром каждого варианта по сравнению с родительским 3А5.040 (>1=более высокий титр, <1=более низкий титр), в то время как правое значение является пропорциональным kd (>1=более низкое kd, <1=более высокое kd) каждого варианта по сравнению с родительским 3А5.040. Несделанные варианты отмечены серым цветом. NB, отсутствие связывания. NE, отсутствие экспрессии. (Последовательность VL CDR3 раскрыта как остатки 88-98 из SEQ ID NO: 74).Summary of differences in variant 3A5.040 antibody titer and kd for CDR3 VL variants (AbM determination). Amino acid numbering according to Kabat and the original amino acids 3A5.040 are shown in the top row. Mutated residues are listed in the left column. The leftmost value in each cell is the proportional titer of each variant compared to the parent 3A5.040 (>1=higher titer, <1=lower titer), while the rightmost value is proportional to kd (>1=lower kd , <1=higher kd) of each variant compared to parent 3A5.040. Unmade options are marked in grey. NB, no binding. NE, no expression. (The VL CDR3 sequence is disclosed as residues 88-98 of SEQ ID NO: 74).
Создание экспрессирующего вектора.Creation of an expression vector.
Нуклеотидная последовательность может влиять на экспрессию гена и последующий уровень экспрессии белка. Исследовали несколько различных нуклеотидных последовательностей на предмет оптимальной экспрессии 3А5.046. Эти последовательности приведены в следующей таблице:The nucleotide sequence can influence gene expression and the subsequent level of protein expression. Several different nucleotide sequences were examined for optimal expression of 3A5.046. These sequences are shown in the following table:
Таблица 12Table 12
Нуклеотидная последовательностьNucleotide sequence
- 33 042576- 33 042576
Измерение аффинности антитела 3А5.046 к рекомбинантному IL-5 человека с помощью SPR.Measurement of the affinity of the antibody 3A5.046 to recombinant human IL-5 using SPR.
Аффинность антител 3А5.046 к рекомбинантному IL-5 человека была определена с использованием системы Biacore T200 (GE Healthcare). Вкратце, коммерческое мышиное антитело против IgG человека (Thermo Scientific) было присоединено к двум смежным (контрольной и тестовой) проточным ячейкам на чипе Biacore CM5 (GE Healthcare) в соответствии с рекомендациями производителя. Антитело 3А5.046 было захвачено при низкой плотности (около 125 RU) на поверхности тестируемой проточной ячейки, и разведения рекомбинантного IL-5 человека или пустого буфера были инъецированы через тестовую и контрольную проточную ячейку со скоростью 30 мкл/мин (фиг. 6, табл. 13).The affinity of antibodies 3A5.046 to recombinant human IL-5 was determined using the Biacore T200 system (GE Healthcare). Briefly, a commercial mouse anti-human IgG antibody (Thermo Scientific) was attached to two adjacent (control and test) flow cells on a Biacore CM5 chip (GE Healthcare) according to the manufacturer's recommendations. Antibody 3A5.046 was captured at low density (about 125 RU) on the surface of the test flow cell, and dilutions of recombinant human IL-5 or blank buffer were injected through the test and control flow cell at a rate of 30 μl/min (Fig. 6, Table . 13).
Полученные сенсограммы имели двойной контроль (значения тестовой проточной ячейки вычитались из значений проточной ячейки контроля (поверхность, связанная с анти-IgG человека без покрытого антитела), а также пустого буфера). Вычтенные сенсограммы из инъекций IL-5 человека при 2,5, 1,25, 0,625, 0,313 и 0,156 мкг/мл были подогнаны к модели связывания Ленгмюра 1:1 с использованием программного обеспечения Biacore Evaluation для определения констант связывания из анализов в двух повторах (табл. 13).The obtained sensograms were double controls (test flow cell values subtracted from control flow cell values (surface bound to human anti-IgG without coated antibody) and empty buffer). Subtracted sensograms from human IL-5 injections at 2.5, 1.25, 0.625, 0.313, and 0.156 µg/mL were fitted to a 1:1 Langmuir binding model using Biacore Evaluation software to determine binding constants from duplicate assays ( Table 13).
Таблица 13Table 13
Кинетические константы из мультиконцентрационного кинетического анализа Biacore связывания антитела 3А5.046 с рекомбинантным IL-5 человека при 2,5, 1,25, 0,625, 0,313 и 0,156 мкг/млKinetic constants from a multi-concentration Biacore kinetic assay of binding of antibody 3A5.046 to recombinant human IL-5 at 2.5, 1.25, 0.625, 0.313, and 0.156 µg/mL
Эти результаты показывают, что антитело 3А5.046 имеет высокую аффинность к рекомбинантному IL-5 человека.These results indicate that the 3A5.046 antibody has a high affinity for recombinant human IL-5.
Активность 3А5.046 по сравнению с меполизумабом в анализе пролиферации клеточной линии TF1.6G4 3А5.046 и меполизумаб использовали в анализе пролиферации клеточной линии TF-1.6G4. 3А5.046 и меполизумаб ингибировали пролиферацию, вызванную IL-5 человека, со средним IC50-13,8 пМ и 534 пМ, соответственно (см. табл. 14 и фиг. 7А). Оба антитела продемонстрировали ингибирование IL-5 яванского макака на клеточной линии TF1.6G4 (фиг. 7В), со средним IC50 для 3А5.046, равным 43,8 пМ, и для меполизумаба, равным 584 пМ.Activity of 3A5.046 compared to mepolizumab in the TF1.6G4 cell line proliferation assay 3A5.046 and mepolizumab were used in the TF-1.6G4 cell line proliferation assay. 3A5.046 and mepolizumab inhibited human IL-5 induced proliferation with mean IC 50s of −13.8 pM and 534 pM, respectively (see Table 14 and Figure 7A). Both antibodies showed inhibition of cynomolgus IL-5 on the TF1.6G4 cell line (FIG. 7B), with a mean IC 50 for 3A5.046 of 43.8 pM and for mepolizumab of 584 pM.
Таблица 14Table 14
Обнаружение нативного IL5 из первичных клеток с помощью ELISA с использованием анти-IL-5 антител по изобретению.Detection of native IL5 from primary cells by ELISA using anti-IL-5 antibodies of the invention.
Антитело 3А5 было использовано в качестве захватывающего реагента в сэндвич-ELISA. В сочетании с коммерчески доступным детектирующим антителом (TRFk5R; R & D systems, # МАВ405) может быть проведена количественная оценка уровней рекомбинантного IL-5 в образцах буфера с добавкой определяемого вещества (фиг. 8). Затем этот способ был применен для обнаружения нативного IL-5, секретируемого первичными клетками. Стимулировали CD4+ Т-клетки от четырех доноров для секреции IL-5. Уровни IL-5 затем определяли с использованием сэндвич-ELISA с антителом 3А5 в качестве реагента для захвата. Три из четырех донорских Т-клеток ответили на стимуляцию Т-клеток и имели определяемые уровни IL-5 в надосадочной жидкости клеточной культуры (фиг. 8). Аналогичные исследования были выполнены с IL-5 человека, секретируемом первичными человеческими донорскими CD4+ Тклетками, с использованием антитела 3А5.046 в качестве агента захвата, и полученные результаты соответствовали результатам, полученным с антителом 3А5 (данные не показаны).The 3A5 antibody was used as the capture reagent in the sandwich ELISA. In combination with a commercially available detection antibody (TRFk5R; R&D systems, #MAB405), levels of recombinant IL-5 in analyte buffer samples can be quantified (FIG. 8). This method was then applied to detect native IL-5 secreted by primary cells. CD4+ T cells from four donors were stimulated to secrete IL-5. IL-5 levels were then determined using a sandwich ELISA with 3A5 antibody as the capture reagent. Three of the four donor T cells responded to T cell stimulation and had detectable levels of IL-5 in the cell culture supernatant (FIG. 8). Similar studies were performed with human IL-5 secreted from primary human donor CD4+ T cells using the 3A5.046 antibody as the capture agent and the results were consistent with those obtained with the 3A5 antibody (data not shown).
Ингибирование анти-IL-5 антителом дифференцировки эозинофилов.Anti-IL-5 inhibition of eosinophil differentiation by antibody.
Анализ на выживание с использованием CD34+ клеток пуповинной крови был использован для оценки способности анти-IL-5 антител ингибировать IL-5 зависимую дифференцировку клетокпредшественников костного мозга в эозинофилы и оценки способности анти-IL-5 антител ингибировать фенотипически зрелую выживаемость эозинофилов. В контрольных клетках, обработанных IL-5, фенотипически зрелые эозинофилы были преобладающей популяцией на 28 день (фиг. 9, заштрихованная область на графике). Антитело 3А5.046 способно ингибировать дифференцировку CD34+ клеток пупоA survival assay using cord blood CD34+ cells was used to assess the ability of anti-IL-5 antibodies to inhibit IL-5 dependent differentiation of bone marrow progenitor cells into eosinophils and to assess the ability of anti-IL-5 antibodies to inhibit phenotypically mature eosinophil survival. In IL-5 treated control cells, phenotypically mature eosinophils were the predominant population at day 28 (FIG. 9, shaded area in the graph). Antibody 3A5.046 is able to inhibit the differentiation of CD34+ umbilical cells
- 34 042576 винной крови, инкубированных с IL-5 в течение 28 дней, в эозинофилы. Антитело 3А5.046 было более сильным ингибитором IL-5-опосредованной дифференцировки эозинофилов, чем меполизумаб (фиг. 9).- 34 042576 wine blood, incubated with IL-5 for 28 days, in eosinophils. Antibody 3A5.046 was a stronger inhibitor of IL-5-mediated eosinophil differentiation than mepolizumab (FIG. 9).
Рентгеноструктурный анализ.X-ray diffraction analysis.
Молекулярную структуру комплекса между Fab антитела 3А5.046 и рекомбинантным IL-5 человека исследовали с помощью рентгеновской кристаллографии. Чтобы подготовиться к экспериментам с рентгеновской кристаллографией, 3А5.046 гидролизовали папаином, который расщепляет интактное антитело в шарнирной области, разделяя домены Fc и Fab. Fab 3А5.046 очищали стандартной аффинной хроматографией с протеином А и включали в комплекс с рекомбинантным негликозилированным IL-5 человека. Комплекс 3А5.046 Fab: IL-5 человека очищали для экспериментов по кристаллизации с использованием стандартной эксклюзионной хроматографии. Комплекс использовали в варьирующих концентрациях в коммерчески доступных скринингах кристаллизации белков типа sparse matrix (разреженная матрица) для широкого отбора условий кристаллизации. Оптимизации любых условий попадания, которые обеспечивают кристаллы комплекса из скринингов кристаллизации белков типа sparse matrix (разреженная матрица), проводили для улучшения морфологии кристалла и дифракции кристалла по мере необходимости.The molecular structure of the complex between Fab antibody 3A5.046 and recombinant human IL-5 was examined using X-ray crystallography. To prepare for X-ray crystallography experiments, 3A5.046 was digested with papain, which cleaves intact antibody at the hinge region, separating the Fc and Fab domains. Fab 3A5.046 was purified by standard protein A affinity chromatography and complexed with recombinant non-glycosylated human IL-5. The 3A5.046 Fab:human IL-5 complex was purified for crystallization experiments using standard size exclusion chromatography. The complex was used at varying concentrations in commercially available sparse matrix protein crystallization screens for a wide selection of crystallization conditions. Optimization of any hitting conditions provided by the crystals of the complex from sparse matrix protein crystallization screens was performed to improve crystal morphology and crystal diffraction as needed.
Кристаллы комплекса 3А5.046 Fab: IL-5 человека, собирали, быстро замораживали в жидком азоте и транспортировали к синхротронному комплексу для дифракционных тестов и сбора данных. Кристаллическое дифракционное тестирование выполняли на синхротроне, который создает высокоэнергетические рентгеновские микропучки для получения дифракции высокого разрешения. Таким образом получали данные дифракции рентгеновских лучей на кристаллах комплекса 3А5.046 Fab: IL-5 человека. Исходная структурная модель комплекса может быть получена с использованием стандартных методов молекулярного замещения с опубликованными молекулярными структурами IL-5 и Fab в качестве матриц. Окончательная структура комплекса Fab и IL-5 человека 3 А5.046 может быть получена путем итеративного уточнения модели структуры до тех пор, пока ошибки подгонки не станут лучше, чем 30% (конечный Rfree равен 0,3), а параметры химической связи (например, распределение длин и углов связей, стереохимия и водородные связи) не будут находиться в допустимых пределах.Crystals of the 3A5.046 Fab:human IL-5 complex were harvested, flash frozen in liquid nitrogen, and transported to the synchrotron complex for diffraction tests and data collection. Crystalline diffraction testing was performed on a synchrotron that generates high energy x-ray microbeams to obtain high resolution diffraction. Thus, crystal X-ray diffraction data of the 3A5.046 Fab: human IL-5 complex were obtained. The initial structural model of the complex can be generated using standard molecular displacement techniques with published IL-5 and Fab molecular structures as templates. The final structure of the complex of Fab and human IL-5 3 A5.046 can be obtained by iterative refinement of the structure model until the fitting errors are better than 30% (final R free is 0.3) and the chemical bond parameters ( for example, bond length and angle distributions, stereochemistry, and hydrogen bonds) will not be within acceptable limits.
Характеризация связывания антитела 3А5.046 с IL-5 из модельных видов, отличных от человека.Characterization of binding of antibody 3A5.046 to IL-5 from non-human model species.
Антитело 3А5.046 было проверено с помощью анализа Biacore с использованием системы Т200 (GE Healthcare) на предмет связывания с рекомбинантными цитокинами IL-5 человека, IL-5 крысы, IL-5 мыши и IL-5 морской свинки. Эта панель нечеловеческих IL-5 была выбрана для представления основных видов животных моделей, используемых при доклинической разработке. Изотипное контрольное антитело (IgG4) и антитело 3А5.046 иммобилизовали на проточных ячейках 1 и 2 чипа СМ5 серии S (GE Healthcare), соответственно, с использованием стандартных способов аминного сочетания. Цитокины разбавляли до 1 и 10 μг/мл в рабочем буфере HBS-EP+ (GE Healthcare) и впрыскивали через проточные ячейки 1 и 2. Инъекции только буфера через проточные ячейки 1 и 2 были включены для двойного контроля. Анализ данных проводился с использованием оценочного программного обеспечения Biacore T200. Полученные сенсограммы имели двойной контроль (значения тестируемой проточной ячейки вычитались из значений контрольной проточной ячейки, а также пустого буфера).Antibody 3A5.046 was tested by Biacore assay using the T200 system (GE Healthcare) for binding to recombinant human IL-5, rat IL-5, mouse IL-5 and guinea pig IL-5 cytokines. This panel of non-human IL-5s was chosen to represent the main types of animal models used in preclinical development. Isotype control antibody (IgG4) and antibody 3A5.046 were immobilized on flow cells 1 and 2 of the S series CM5 chip (GE Healthcare), respectively, using standard amine coupling methods. Cytokines were diluted to 1 and 10 μg/ml in HBS-EP+ running buffer (GE Healthcare) and injected through flow cells 1 and 2. Injections of buffer only through flow cells 1 and 2 were included for dual control. Data analysis was performed using Biacore T200 evaluation software. The obtained sensograms had a double control (the values of the tested flow cell were subtracted from the values of the control flow cell, as well as the empty buffer).
Было обнаружено, что антитело 3А5.046 связывается с IL-5 человека и IL-5 яванского макака, но не с IL-5 мыши, IL-5 крысы или IL-5 морской свинки (фиг. 10А и 10Е). Это указывало на то, что 3А5.046 можно использовать в доклинических моделях с яванским макаком.Antibody 3A5.046 was found to bind to human IL-5 and cynomolgus monkey IL-5, but not to mouse IL-5, rat IL-5, or guinea pig IL-5 (FIGS. 10A and 10E). This indicated that 3A5.046 could be used in preclinical cynomolgus monkey models.
Антитело 3А5.046 не связывается с другими человеческими цитокинами, близко родственными с IL-5.Antibody 3A5.046 does not bind to other human cytokines closely related to IL-5.
Антитело 3А5.046 было проверено с помощью анализа Biacore с использованием системы Т200 (GE Healthcare) на предмет связывания с рекомбинантными человеческими цитокинами IL-2, IL-3, IL-4, IL-5, гранулоцитарно-макрофагальным колониестимулирующим фактором (GM-CSF), макрофагальным колониестимулирующим фактором (M-CSF) и гормоном роста (GH). Эта репрезентативная группа близкородственных человеческих цитокинов была выбрана на основании их структурного и функционального сходства с IL-5 человека. Контрольное изотипическое антитело (IgG4) и антитело 3А5.046 были иммобилизованы на проточных ячейках 1 и 2 чипа СМ5 серии S (GE Healthcare), соответственно, с использованием стандартных способов аминного сочетания. Цитокины разбавляли до 1 и 10 μг/мл в рабочем буфере HBS-EP+ (GE Healthcare) и инъецировали через проточные ячейки 1 и 2. Инъекции только буфера через проточные ячейки 1 и 2 были включены для двойного контроля. Анализ данных проводился с использованием оценочного программного обеспечения Biacore T200. Полученные сенсограммы имели двойной контроль (значения тестируемой проточной ячейки вычитались из значений контрольной проточной ячейки, а также пустого буфера).Antibody 3A5.046 was tested by Biacore assay using the T200 system (GE Healthcare) for binding to recombinant human cytokines IL-2, IL-3, IL-4, IL-5, granulocyte-macrophage colony stimulating factor (GM-CSF ), macrophage colony stimulating factor (M-CSF) and growth hormone (GH). This representative group of closely related human cytokines was selected based on their structural and functional similarity to human IL-5. Isotype control antibody (IgG4) and antibody 3A5.046 were immobilized on flow cells 1 and 2 of the S series CM5 chip (GE Healthcare), respectively, using standard amine coupling methods. Cytokines were diluted to 1 and 10 μg/ml in HBS-EP+ running buffer (GE Healthcare) and injected through flow cells 1 and 2. Buffer alone injections through flow cells 1 and 2 were included for dual control. Data analysis was performed using Biacore T200 evaluation software. The received sensograms had a double control (the values of the tested flow cell were subtracted from the values of the control flow cell, as well as the empty buffer).
Было обнаружено, что антитело 3А5.046 связывается только с IL-5 человека, но не с человеческими цитокинами IL-2, IL-3, IL-4, GM-CSF, M-CSF, или GH (фиг. 11А и 11D), демонстрируя, таким образом, высокую специфичность 3А5.046 к IL-5 человека.The 3A5.046 antibody was found to bind only to human IL-5, but not to the human cytokines IL-2, IL-3, IL-4, GM-CSF, M-CSF, or GH (FIGS. 11A and 11D) , thus demonstrating the high specificity of 3A5.046 for human IL-5.
Оценка антител 3А5.046 на модели эозинофилии дыхательных путей яванского макака, индуцированной Ascaris suum.Evaluation of 3A5.046 antibodies in a cynomolgus macaque airway eosinophilia model induced by Ascaris suum.
- 35 042576- 35 042576
Антитело 3А5.046 тестировали с использованием модели острой эозинофилии дыхательных путей у яванского макака с Ascaris suum, как описано в Hart, Т.к., et al., Preclinical efficacy and safety of mepolizumab (SB-240563), a humanized monoclonal antibody to IL-5, in cynomolgus monkeys. J Allergy Clin Immunol, 2001. 108(2): p. 250-7.Antibody 3A5.046 was tested using the Ascaris suum cynomolgus monkey model of acute airway eosinophilia as described in Hart, T., et al., Preclinical efficacy and safety of mepolizumab (SB-240563), a humanized monoclonal antibody to IL-5, in cynomolgus monkeys. J Allergy Clin Immunol, 2001. 108(2): p. 250-7.
Шестнадцать самок яванского макака, которые были ранее сенсибилизированы к Ascaris suum, оценивали по уровню остаточной чувствительности с помощью интрадермальной контрольной провокационной пробы A. suum. Четырнадцать из этих животных были отобраны для участия в исследовании на основании ответа на провокационную пробу, кожных волдырей, и рандомизированы на две группы по n=7 на группу. Через две недели после внутрикожного тестирования кожной сыворотки были взяты исходные образцы крови и жидкости бронхоальвеолярного лаважа (BALF) (день 8). Приблизительно через 24 ч после сбора исходной пробы животных обрабатывали либо плацебо (содержащим водный буфер рН 6,3 с 200 мМ аргинином и 25 мМ гистидином), либо антителом 3А5,046 (10 мг/кг внутривенно, в водном буфере рН 6,3 с 200 мМ аргинином и 25 мМ гистидина) в виде слепого исследования (день 7). Через одну неделю после лечения плацебо или антителом выполняли вторую внутрикожную инъекцию А. suum и всем животным давали инъекцию A. suum путем доставки равного количества экстракта A. suum (Greer Laboratories Inc .; 5 мг/мл в стерильной воде) через небулайзер PARI LC (день 0). Диаметр кожных волдырей измеряли через 15 мин после провокационной пробы. Через два дня после ингаляционной провокационной пробы А. suum были взяты образцы крови и BALF. Дополнительные образцы крови для гематологических конечных точек и PK-анализа собирали еженедельно, начиная с 10-го дня и до 45-го дня.Sixteen female cynomolgus monkeys that had previously been sensitized to Ascaris suum were assessed for residual susceptibility using an A. suum intradermal challenge challenge. Fourteen of these animals were selected to participate in the study based on the response to the challenge test, skin blisters, and randomized into two groups of n=7 per group. Two weeks after intradermal skin serum testing, baseline blood and bronchoalveolar lavage fluid (BALF) samples were taken (Day 8). Approximately 24 hours after initial sample collection, animals were treated with either placebo (containing aqueous buffer pH 6.3 with 200 mM arginine and 25 mM histidine) or antibody 3A5.046 (10 mg/kg IV, in aqueous buffer pH 6.3 with 200 mM arginine and 25 mM histidine) as a blind study (day 7). One week after placebo or antibody treatment, a second intradermal injection of A. suum was performed and all animals were injected with A. suum by delivering an equal amount of A. suum extract (Greer Laboratories Inc.; 5 mg/mL in sterile water) via a PARI LC nebulizer ( day 0). The diameter of the skin blisters was measured 15 min after the provocative test. Two days after the A. suum inhalation challenge, blood and BALF samples were taken. Additional blood samples for hematological endpoints and PK analysis were collected weekly from day 10 to day 45.
Существенных различий в реакции кожных волдырей между первой и второй интрадермальными провокационными пробами A. suum обнаружено не было. У всех животных было выявлено увеличение эозинофилов в BALF в результате провокационной пробы A. suum, но у животных, получавших антитело 3А5.046, это увеличение было незначительным. В BALF у животных, получавших антитело 3А5.046, эозинофилов было значительно меньше чем через 48 ч после провокационной пробы A. suum у животных, получавших плацебо (р<0,01; тест Манна-Уитни; фиг. 12).There were no significant differences in skin blister response between the first and second A. suum intradermal challenge tests. All animals showed an increase in eosinophils in BALF as a result of the A. suum challenge, but in animals treated with antibody 3A5.046, this increase was negligible. In BALF, 3A5.046-treated animals had significantly fewer eosinophils than 48 hours after the A. suum challenge in placebo-treated animals (p<0.01; Mann-Whitney test; Fig. 12).
Провокационная проба A. suum также приводила к значительному увеличению эозинофилов в крови по сравнению с исходным уровнем у животных, получавших плацебо, до 10-го дня после провокационной пробы (фиг. 13А). Обработка антителом 3А5.046 приводила к значительному снижению уровня эозинофилов в крови до уровней ниже исходного уровня (фиг. 13А), и это снижение количества эозинофилов в крови сохранялось в течение, по меньшей мере, 52 дней после начальной дозы (фиг. 13В).The A. suum challenge also resulted in a significant increase in blood eosinophils from baseline in placebo-treated animals up to day 10 post challenge (FIG. 13A). Treatment with antibody 3A5.046 resulted in a significant decrease in blood eosinophil levels to levels below baseline (FIG. 13A), and this decrease in blood eosinophils was maintained for at least 52 days after the initial dose (FIG. 13B).
Таким образом, обработка с помощью 3А5.046 значительно снизила индуцированную A. suum эозинофилию дыхательных путей через 48 ч после провокационной пробы, и значительно уменьшила количество эозинофилов в крови, ниже базовых уровней, в течение по меньшей мере 52 дней после однократного внутривенного (IV) дозы 10 мг/кг.Thus, treatment with 3A5.046 significantly reduced A. suum-induced airway eosinophilia 48 hours after challenge, and significantly reduced blood eosinophils, below baseline levels, for at least 52 days after a single intravenous (IV) doses of 10 mg/kg.
Исследование функции антител в модели эозинофилии дыхательных путей на крысах с гуманизированным IL-5.Investigation of antibody function in a rat model of airway eosinophilia with humanized IL-5.
Alternaria alternata (Alternaria) является грибным аллергеном, который, как известно, вызывает астму у людей и может привести к эозинофилии и астма-подобным симптомам у грызунов. При провокационной пробе Alternaria, у knock-in крыс с гуманизированным IL-5 (животные, у которых крысиный IL-5 был заменен IL-5 человека), наблюдается повышенный уровень эозинофилов в жидкости бронхоальвеолярного лаважа (BALF) из легких (фиг. 14).Alternaria alternata (Alternaria) is a fungal allergen known to cause asthma in humans and can lead to eosinophilia and asthma-like symptoms in rodents. In the Alternaria challenge, knock-in rats with humanized IL-5 (animals in which rat IL-5 has been replaced with human IL-5) show increased levels of eosinophils in bronchoalveolar lavage fluid (BALF) from the lungs (Fig. 14) .
Одиночную интратрахеальную инстилляцию суспензии Alternaria вводили гуманизированным крысам IL-5, и образцы крови и BALF отбирали через 2, 3 или 4 дня после введения Alternaria. Обычно в этой модели эозинофилы значительно повышены в образцах BALF и могут быть либо увеличены, либо неизмены в образцах крови.A single intratracheal instillation of Alternaria suspension was administered to humanized IL-5 rats and blood and BALF samples were taken 2, 3 or 4 days after Alternaria administration. Typically in this model, eosinophils are significantly elevated in BALF samples and may be either increased or unchanged in blood samples.
Тестовые антитела вводили до индукции эозинофилии с помощью Alternaria и оценивали по их способности снижать количество эозинофилов в BALF и крови.Test antibodies were administered prior to induction of eosinophilia with Alternaria and evaluated for their ability to reduce eosinophil counts in BALF and blood.
Специалисты в данной области техники будет очевидно, что многочисленные изменения и модификации могут быть сделаны к предпочтительным воплощениям настоящего изобретения, и что такие изменения и модификации могут быть сделаны без отхода от сущности настоящего изобретения. Поэтому предполагается, что прилагаемая формула изобретения охватывает все такие эквивалентные варианты, которые соответствуют истинному духу и объему изобретения.Those skilled in the art will appreciate that numerous changes and modifications can be made to the preferred embodiments of the present invention, and that such changes and modifications can be made without departing from the spirit of the present invention. Therefore, the appended claims are intended to cover all such equivalent variations as fall within the true spirit and scope of the invention.
Раскрытия каждого патента, патентной заявки и публикации, цитируемые или описанные в этом документе, настоящим включены в данное описание посредством ссылки в полном объеме.The disclosures of each patent, patent application, and publication cited or described in this document are hereby incorporated herein by reference in their entirety.
- 36 042576- 36 042576
Таблица 15Table 15
ПоследовательностиSequences
- 37 042576- 37 042576
- 38 042576- 38 042576
- 39 042576- 39 042576
- 40 042576- 40 042576
- 41 042576- 41 042576
- 42 042576- 42 042576
- 43 042576- 43 042576
-44042576-44042576
-45042576-45042576
- 46 042576- 46 042576
- 47 042576- 47 042576
- 48 042576- 48 042576
- 49 042576- 49 042576
- 50 042576- 50 042576
Воплощения.Incarnations.
Следующий список воплощений предназначен для дополнения, а не для искажения или замены предыдущих описаний.The following list of embodiments is intended to supplement, and not to distort or replace, previous descriptions.
Воплощение 1. Молекула человеческого антитела, которая иммуноспецифически связывается с IL-5 человека с равновесной константой аффинности (KD), равной по меньшей мере около 40 пМ, которая определена поверхностным плазмонным резонансом.Embodiment 1 A human antibody molecule that immunospecifically binds to human IL-5 with an equilibrium affinity constant (KD) of at least about 40 pM as determined by surface plasmon resonance.
Воплощение 2. Молекула антитела человека, которая иммуноспецифически связывается с IL-5 человека, причем молекула антитела включает: CDR1 тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 4, CDR2 тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, CDR3 тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8, CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, 21, 24, 27, 30, 33, 36, 39 или 66, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, 42 или 45, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15, 48, 51, 54, 57, 60 или 63.Embodiment 2. A human antibody molecule that immunospecifically binds to human IL-5, wherein the antibody molecule comprises: a heavy chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 4, a heavy chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6, a heavy chain CDR3 , comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8, a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, 21, 24, 27, 30, 33, 36, 39 or 66, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, 42, or 45, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15, 48, 51, 54, 57, 60, or 63.
Воплощение 3. Молекула антитела по воплощению 1 или 2, где молекула антитела включает CDR1 тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 4, CDR2 тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, CDR3 тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8, иEmbodiment 3. An antibody molecule according to embodiment 1 or 2, wherein the antibody molecule comprises a heavy chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 4, a heavy chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6, a heavy chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8, and
a) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15;a) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15;
- 51 042576- 51 042576
b) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15;b) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 21, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15;
c) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15;c) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 24, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15;
d) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15;d) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15;
e) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 30, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15;e) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 30, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15;
f) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 33, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15;f) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 33, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15;
g) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 36, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15;g) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 36, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15;
h) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 39, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15;h) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 39, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15;
i) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 66, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15;i) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 66, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15;
j) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 42, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15;j) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 42, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15;
k) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 45, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15;k) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 45, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15;
l) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 48;l) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 48;
m) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51;m) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51;
n) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54;n) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54;
о) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57;o) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 57;
p) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60; илиp) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 60; or
q) CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;q) a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
где положение аминокислотных остатков CDR определяется в соответствии с AbM.where the position of the amino acid residues of the CDR is determined in accordance with AbM.
Воплощение 4. Молекула антитела по воплощению 3, где молекула антитела включает CDR1 тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 4, CDR2 тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, CDR3 тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8, CDR1 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, CDR2 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и CDR3 легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15.Embodiment 4. An antibody molecule according to embodiment 3, wherein the antibody molecule comprises a heavy chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 4, a heavy chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6, a heavy chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8, a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, and a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15.
Воплощение 5. Молекула антитела по любому из предыдущих воплощений, где молекула антитела включает вариабельную область тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 16 иEmbodiment 5 An antibody molecule according to any of the previous embodiments, wherein the antibody molecule comprises a heavy chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 16 and
a) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 17;a) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 17;
- 52 042576- 52 042576
b) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 22;b) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 22;
c) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 25;c) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 25;
d) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 28;d) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 28;
e) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 31;e) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 31;
f) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 34;f) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 34;
g) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 37;g) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 37;
h) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 40;h) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 40;
i) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 43;i) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 43;
j) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 46;j) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 46;
k) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 49;k) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 49;
l) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 52;l) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 52;
m) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 55;m) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 55;
n) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 58;n) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58;
о) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 61;o) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 61;
р) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 64; илиp) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 64; or
q) вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 67.q) a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 67.
Воплощение 6. Молекула антитела по любому из предыдущих воплощений, где молекула антитела включает вариабельную область тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 16 и вариабельную области легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична к аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 17.Embodiment 6 An antibody molecule according to any of the previous embodiments, wherein the antibody molecule comprises a heavy chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 16 and a light chain variable region comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 17.
Воплощение 7. Молекула антитела по любому из предыдущих воплощений, где молекула антитела включает:Embodiment 7 An antibody molecule according to any of the previous embodiments, wherein the antibody molecule comprises:
a) мутацию S228P;a) S228P mutation;
b) мутацию M252Y, мутацию S254T и мутацию Т256Е;b) M252Y mutation, S254T mutation and T256E mutation;
c) делецию С-концевого остатка лизина тяжелой цепи; илиc) deletion of the C-terminal heavy chain lysine residue; or
d) любую комбинацию а-с.d) any combination of a-c.
Воплощение 8. Молекула антитела по воплощению 7, где молекула антитела включает мутацию S228P и делецию С-концевого остатка лизина тяжелой цепи.Embodiment 8 An antibody molecule according to embodiment 7 wherein the antibody molecule comprises an S228P mutation and a deletion of a C-terminal heavy chain lysine residue.
- 53 042576- 53 042576
Воплощение 9. Молекула антитела по воплощению 7, где молекула антитела включает мутацию S228P, мутацию M252Y, мутацию S254T, мутацию Т256Е и делецию С-концевого остатка лизина тяжелой цепи.Embodiment 9 An antibody molecule according to embodiment 7, wherein the antibody molecule comprises an S228P mutation, an M252Y mutation, an S254T mutation, a T256E mutation, and a deletion of a C-terminal heavy chain lysine residue.
Воплощение 10. Молекула антитела по любому из предыдущих воплощений, где молекула антитела включает константную область тяжелой цепи IgG4 и константную область легкой цепи лямбда.Embodiment 10 An antibody molecule according to any of the previous embodiments, wherein the antibody molecule comprises an IgG4 heavy chain constant region and a lambda light chain constant region.
Воплощение 11. Молекула антитела по любому из предыдущих воплощений, где молекула антитела включает тяжелую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая идентична, по меньшей мере, на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 18 иEmbodiment 11 An antibody molecule according to any of the previous embodiments, wherein the antibody molecule comprises a heavy chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95, 96, 97, 98, 99, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 18 and
a) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 19;a) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 19;
b) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 23;b) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 23;
c) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 26;c) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26;
d) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 29;d) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 29;
e) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 32;e) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 32;
f) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 35;f) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 35;
g) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 38;g) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 38;
h) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 41;h) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 41;
i) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 44;i) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 44;
j) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 47;j) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 47;
k) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 50;k) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 50;
l) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 53;l) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 53;
m) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 56;m) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 56;
n) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 59;n) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 59;
о) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 62;o) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 62;
р) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 65; илиp) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 65; or
q) легкую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 68.q) a light chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 68.
Воплощение 12. Молекула антитела по любому из воплощений 1-10, где молекула антитела включает тяжелую цепь, включающую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100%. идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 20 и легкой цепи, содержащей аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентична аминокислотной кислотная последовательность SEQ ID NO: 19.Embodiment 12 An antibody molecule according to any one of embodiments 1-10, wherein the antibody molecule comprises a heavy chain comprising an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100%. identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 20 and a light chain containing an amino acid sequence that is at least 90, 95, 96, 97, 98, 99 or 100% identical to the amino acid acid sequence of SEQ ID NO: 19.
Воплощение 13. Молекула антитела по воплощению 2 или воплощению 3, где молекула антитела представляет собой Fab-фрагмент, Pab2-фрагмент или одноцепочечное антитело.Embodiment 13 An antibody molecule according to embodiment 2 or embodiment 3, wherein the antibody molecule is a Fab fragment, a Pab2 fragment, or a single chain antibody.
Воплощение 14. Молекула антитела по любому из предыдущих воплощений, где молекула антитела обладает одним или несколькими из следующих свойств:Embodiment 14 An antibody molecule according to any of the previous embodiments, wherein the antibody molecule has one or more of the following properties:
a) уменьшает связывание IL-5 с рецептором IL-5;a) reduces the binding of IL-5 to the IL-5 receptor;
b) имеет период полувыведения в сыворотке по меньшей мере около 20 дней; илиb) has a serum half-life of at least about 20 days; or
c) связывает IL-5 человека и яванского макака, но не IL-5 мыши, крысы или морской свинки.c) binds human and cynomolgus monkey IL-5, but not mouse, rat or guinea pig IL-5.
Воплощение 15. Молекула антитела по воплощению 2, где молекула антитела связывается с IL-5 человека с равновесной константой аффинности (KD), по меньшей мере, около 40 пМ, определенной поверхностным плазмонным резонансом.Embodiment 15 An antibody molecule according to embodiment 2, wherein the antibody molecule binds to human IL-5 with an equilibrium affinity constant (KD) of at least about 40 pM as determined by surface plasmon resonance.
Воплощение 16. Фармацевтическая композиция, содержащая молекулу антитела по любому из воплощений 1-15.Embodiment 16 A pharmaceutical composition comprising an antibody molecule according to any one of embodiments 1-15.
Воплощение 17. Молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая молекулу антитела по любому из воплощений 1-15.Embodiment 17 A nucleic acid molecule encoding an antibody molecule according to any one of embodiments 1-15.
Воплощение 18. Вектор, содержащий молекулу нуклеиновой кислоты по воплощению 17.Embodiment 18. A vector containing a nucleic acid molecule according to embodiment 17.
--
Claims (21)
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US62/438,502 | 2016-12-23 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
EA042576B1 true EA042576B1 (en) | 2023-03-01 |
Family
ID=
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US20220267440A1 (en) | Anti-cd47 antibodies | |
US20220204615A1 (en) | Caninized Antibodies | |
US20220127352A1 (en) | Antibodies that specifically bind to human il-15 and uses thereof | |
US20210355205A1 (en) | Anti-IL-5 Antibodies | |
AU2019201141B2 (en) | Novel antibody binding to TFPI and composition comprising the same | |
KR20200014414A (en) | Antibodies that specifically bind to PD-1 and methods of use | |
EP3693393A1 (en) | Antibodies that specifically bind to tl1a | |
CN105218674A (en) | The antibody combined in pH dependence antigen | |
KR20140084253A (en) | Immunobinders directed against tnf | |
US11028164B2 (en) | Anti-CXCL13 antibodies | |
US12134645B2 (en) | Monoclonal antibodies against human tim-3 | |
PT2403528E (en) | Antibodies against a proliferating inducing ligand (april) | |
JP2023528235A (en) | SARS-CoV-2 Antibodies and Methods of Selecting and Using The Same | |
CA3129317A1 (en) | Antibodies comprising a common light chain and uses thereof | |
CA3231553A1 (en) | Pharmaceutical composition comprising anti-pvrig/tigit bispecific antibody | |
JP2023551981A (en) | Multispecific antibodies and antibody combinations | |
CA3091307A1 (en) | Csf1r binding agents | |
EA042576B1 (en) | ANTI-IL-5 ANTIBODIES |