CZ20013081A3 - Epitopes and a extratopes obtained from C-epsilon-2 region or C-epsilon-4 IgE region, their antagonists a their therapeutic use - Google Patents
Epitopes and a extratopes obtained from C-epsilon-2 region or C-epsilon-4 IgE region, their antagonists a their therapeutic use Download PDFInfo
- Publication number
- CZ20013081A3 CZ20013081A3 CZ20013081A CZ20013081A CZ20013081A3 CZ 20013081 A3 CZ20013081 A3 CZ 20013081A3 CZ 20013081 A CZ20013081 A CZ 20013081A CZ 20013081 A CZ20013081 A CZ 20013081A CZ 20013081 A3 CZ20013081 A3 CZ 20013081A3
- Authority
- CZ
- Czechia
- Prior art keywords
- peptide
- seq
- ige
- mimotope
- protein
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
- A61P37/08—Antiallergic agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/505—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising antibodies
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/60—Medicinal preparations containing antigens or antibodies characteristics by the carrier linked to the antigen
- A61K2039/6031—Proteins
- A61K2039/6068—Other bacterial proteins, e.g. OMP
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
- C07K2317/52—Constant or Fc region; Isotype
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Pulmonology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
Abstract
Description
Epitopy a mimotopy získané z oblasti C-epsilon-2 nebo Cepsilon-4 IgE, jejich antagonisté a jejich terapeutické použitíEpitopes and mimotopes derived from the C-epsilon-2 or Cepsilon-4 IgE region, their antagonists and their therapeutic use
Oblast technikyTechnical field
Vynález se týká zajištění nového léku pro léčbu, prevenci nebo zlepšení alergického onemocnění. Nové léky jsou zvláště epitopy nebo mimotopy získané z oblastí Ce3 a Ce4 IgE. Tyto nové oblasti mohou být cílem pro pasivní a aktivní imunoprofylaxi nebo imunoterapii. Vynález dále popisuje způsoby produkce léků, farmaceutických prostředků, které je obsahují a jejich použití v medicíně. Vynález dále popisuje ligandy, zvláště monoklonální protilátky, které jsou schopny se vázat na oblasti IgE podle vynálezu, a jejich použití v medicíně jako pasivní imunoterapie nebo imunoprofylaxe.The invention relates to providing a novel medicament for the treatment, prevention or amelioration of an allergic disease. In particular, the novel drugs are epitopes or mimotopes derived from the Ce3 and Ce4 IgE regions. These new regions may be targets for passive and active immunoprophylaxis or immunotherapy. The invention further provides methods of producing medicaments, pharmaceutical compositions containing them and their use in medicine. The invention further provides ligands, particularly monoclonal antibodies, that are capable of binding to the IgE regions of the invention and their use in medicine as passive immunotherapy or immunoprophylaxis.
Dosavadní stav technikyBACKGROUND OF THE INVENTION
Při s alergií histamin, alergické odezvě jsou symptomy běžně spojované způsobeny uvolněním alergických mediátorů, jako je buněk do okolních tkání a vaskulárních z imunitních struktur.With allergy histamine, an allergic response, symptoms commonly associated with the release of allergic mediators such as cells into surrounding tissues and vascular from immune structures.
Histamin je buňkách a bazofilech, v normálním případě uchováván v žírných kdy dojde k uvolnění na až do doby, základě interakce s IgE specifickým pro alergen. Je dobře známa úloha IgE při zprostředkování alergických reakcí, jako je astma, alergie na j ídlo, atopická dermatitida, alergická rinitida.Histamine is in cells and basophils, normally stored in masts when released for up to a time, due to interaction with allergen specific IgE. The role of IgE in mediating allergic reactions such as asthma, food allergy, atopic dermatitis, allergic rhinitis is well known.
jakoas
B-buňky při je pyl nebo alergeny roztočů, reagují syntézou IgE specifickým pro alergen. IgE specifický pro alergen se pak váže na receptor FceRI (receptor s vysokou afinitou pro IgE) vyskytující se na bazofilech a žírných buňkách. Libovolné následné setkáni s alergenem vede k uvolnění histaminu z žírných buněk nebo bazofilů řetězenímB-cells, when pollen or mite allergens, react with allergen-specific IgE synthesis. The allergen specific IgE then binds to the FcεRI receptor (high affinity IgE receptor) found on basophils and mast cells. Any subsequent encounter with the allergen results in the release of histamine from mast cells or basophils by chaining
okolních komplexů IgE/FcsRI (popisuje se v publikaci Sutton andsurrounding IgE / FcεRI complexes (Sutton and
Gould, Nátuře, 1993, 366: 421-428, EP 0 477 231 Bl).Gould, Nature, 1993, 366: 421-428, EP 0 477 231 B1).
IgE podobně jako všechny imunoglobuliny obsahuje dva těžké a dva lehké řetězce. Těžký řetězec ε obsahuje pět oblastí: jednu variabilní oblast (VH) a čtyři konstantní oblasti (Cel až Cs4) . Molekulová hmotnost IgE je přibližně 190 000. Těžký řetězec tvoři přibližně 550 aminokyselin. Struktura IgE se popisuje v publikaci Padlan and Davis, Mol. Immunol., 23, 1063-75, 1986) a Heim et al., (model struktury 2IgE se uložil 2/10/90 do PDB (Protein Data Bank, Research Collaboratory for Structural Bioinformatics, http:/pdb-browsers.ebi.ac.uk)). Každá z domén IgE obsahuje promáčknutý barel sedmi antiparalelních řetězců prodloužených segmentů (β~) polypeptidu značených na f a rozdělených do dvou β-listů. Čtyři β-řetězce (á, b, d a e) tvoří jeden list, který leží proti druhému listu tří řetězců (c, f a g) (zobrazeno na obrázku č. 8) . Tvar každého β-listu je udržován laterálním pakováním postranního řetězce tvořeného aminokyselinovými zbytky z vedlejších antiparalelních řetězců v každém listu (a je dále stabilizován vodíkovou vazbou mezi těmito řetězci). Smyčka zbytků tvořící neprodloužené uspořádání spojuje antiparalelní β-listy, buď v listu nebo v prostoru mezi proti sobě ležícími listy. Spojení z řetězce a do řetězce b je označeno jako smyčka A-B atd. . Smyčky A-B a d-e patří topologicky ke čtyř řetězcovému listu a smyčka f-g patří ke tři řetězcovému listu. Interference mezi párem proti sobě ležících listů poskytuje hydrofóbní vnitřní část globulární oblasti. Toto hydrofóbní jádro bez přístupu vody vzniká z těsného pakování postranních řetězců, které leží proti sobě z opačných β-listů.Like all immunoglobulins, IgE contains two heavy and two light chains. The heavy chain ε contains five regions: one variable region (VH) and four constant regions (Cel to Cs4). The molecular weight of IgE is approximately 190,000. The heavy chain comprises approximately 550 amino acids. The structure of IgE is described in Padlan and Davis, Mol. Immunol., 23, 1063-75, 1986) and Heim et al., (The 2IgE structure model was deposited 2/10/90 in a PDB (Protein Data Bank, Research Laboratory for Structural Bioinformatics, http: / pdb-browsers.ebi). ac.uk)). Each of the IgE domains contains a dented barrel of seven antiparallel chains of extended segments (β ~) of the polypeptide labeled on f and divided into two β-sheets. The four β-chains (a, b, d and e) form one sheet opposite the other sheet of the three chains (c, f and g) (shown in Figure 8). The shape of each β-sheet is maintained by lateral packing of the side chain formed by amino acid residues from the side antiparallel chains in each sheet (and is further stabilized by the hydrogen bond between these chains). A loop of residues forming the non-elongated arrangement connects the antiparallel β-sheets, either in the sheet or in the space between the opposing sheets. The connection from string a to string b is designated as loop A-B, and so on. Loops A-B and d-e belong topologically to the four chain leaf and loop f-g belongs to the three chain leaf. Interference between a pair of opposing leaves provides a hydrophobic inner portion of the globular region. This water-free hydrophobic core results from the tight packing of the side chains, which lie opposite each other from opposite β-sheets.
V minulosti se zkoumala řada pasivních nebo aktivních imunoterapeutických přístupů, které se označily tak, že interferují s mechanizmem uvolnění histaminu zprostředkovanýmA number of passive or active immunotherapeutic approaches have been investigated in the past and have been identified as interfering with the histamine-mediated mechanism of mediated release
IgE. Tyto přístupy zahrnují interferenci s IgE nebo navázáni komplexů alergen/IgE na receptory FcsRI nebo FcsRII (receptor IgE s nízkou afinitou) buď s pasivní aplikací protilátek nebo s pasivní aplikací peptidů získaných z IgE, aby došlo ke kompetetivnímu navázání na receptory. Navíc někteří autoři popisují použití specifických peptidů získaných z IgE při aktivní imunizaci se stimulovaným uvolněním histaminu, který inhibuje imunitní odezvy.IgE. These approaches involve interfering with IgE or binding allergen / IgE complexes to FcεRI or FcεRII (a low affinity IgE receptor) with either passive administration of antibodies or passive administration of IgE-derived peptides to competitively bind to receptors. In addition, some authors describe the use of specific IgE-derived peptides in active immunization with stimulated release of histamine, which inhibits immune responses.
V průběhu jejich zkoumání se zvažovala řada problémů, se kterými je nutné počítat při navrhování nové anti-alergické terapie. Jeden z nejvážnějších problémů, které vznikly při vývoji síťování IgE při signálu uvolňujícím histamin. Nejčastějším případem je, že vytvoření protilátek proti IgE během aktivní vakcinace je schopné umožnit samo o sobě uvolnění histaminu sítěním okolních komplexůIn the course of their investigation, a number of problems have been considered to be considered when designing new anti-allergic therapies. One of the most serious problems that have arisen in the development of IgE crosslinking in the histamine releasing signal. The most common case is that the production of anti-IgE antibodies during active vaccination is capable of allowing histamine release by itself through the network of surrounding complexes
IgE-receptor v nepřítomnosti alergenu.IgE-receptor in the absence of allergen.
Tento j ev se nazývá anafylaktogennost.This phenomenon is called anaphylactogenicity.
Samozřejmě řada běžně dostupných monoklonálních protilátek protiOf course, a number of commonly available monoclonal antibodies against
IgE, které se normálně používají při testech detekceIgEs that are normally used in detection assays
IgE, jsou při aplikaci pacientovi anafylaktogenní a následně nepoužitelné potencionálně nebezpečné.IgE are anaphylactogenic and potentially unsafe for use when administered to a patient.
Zda jsou nebo nejsou protilátky anafylaktogenní závisí na umístění cílového epitopu na molekule IgE. Avšak na základě současných znalostí v této oblasti a navzdory velkému zájmu a úsilí výzkumníků je těžké předpovědět jaké charakteristiky má libovolná protilátka nebo epitop a zda má nebo může mít u pacienta pozitivní klinický účinek.Whether or not the antibodies are anaphylactogenic depends on the location of the target epitope on the IgE molecule. However, based on current knowledge in this field and despite the great interest and efforts of researchers, it is difficult to predict what characteristics any antibody or epitope has and whether or not it has a positive clinical effect in a patient.
Proto, aby se dosáhlo bezpečnosti nebo účinnosti pasivně aplikované nebo vakcinou indukované protilátky se musi vázat na oblast IgE, který je schopný interferovat s dráhou, která podněcuje uvolnění histaminu, aniž je sám o sobě anafylaktický. Vynález popisuje všechny tyto cíle a poskytuje léky, které jsou schopny dát vzniku neanafylaktickým protilátkám, které inhibují uvolnění histaminu. Tyto léky mohou tvořit základ aktivní vakcíny nebo mohou být použity ke vzniku správných protilátek v případě pasivní imunoterapie nebo mohou být samotné pasivně aplikovány za účelem terapeutického účinku.Therefore, in order to achieve the safety or efficacy of a passively administered or vaccine-induced antibody, it must bind to an IgE region that is able to interfere with a pathway that promotes histamine release without being anaphylactic in itself. The invention describes all of these objectives and provides drugs that are capable of generating non-anaphylactic antibodies that inhibit histamine release. These drugs may form the basis of an active vaccine, or may be used to produce the right antibodies in the case of passive immunotherapy, or may be passively administered alone for therapeutic effect.
Mnoho práce věnovaly výzkumníci identifikaci specifických protilátek proti IgE, které mají některé výhodné účinky proti alergické reakci zprostředkované IgE (WOMuch work has been done by researchers to identify specific anti-IgE antibodies that have some beneficial effects against an IgE-mediated allergic reaction (WO
90/15878,90/15878,
WOWO
89/04834, WO 93/05810). Hodně úsilí se také věnuje identifikaci epitopů rozeznávaným těmito použitelnými protilátkami, aby se vytvořily peptidové mimotopy takových epitopů a mohly se použít jako imunogeny k produkci protilátek proti IgE.89/04834, WO 93/05810). Much effort has also been devoted to identifying epitopes recognized by these useful antibodies in order to generate peptide mimotopes of such epitopes and to be used as immunogens to produce anti-IgE antibodies.
Dokument WO 97/31948 popisuje práce tohoto typu a dále popisuje peptidy IgE z oblastí Cs3 a Cs4 konjugovaných s molekulami nosičů pro účely aktivní vakcinace. Tyto imunogeny se mohou použít při vakcinačních studiích a uvádí se, že jsou schopny vytvořit protilátky, které následně inhibují uvolněni histaminu in vivo. V tomto dokumentu se popisuj i monoklonální protilátky (BSW17), o kterých se uvádí, že jsou schopny vázat se na peptidy IgE obsažené v oblasti Οε3, která je použitelná pro účely aktivní vakcinace.WO 97/31948 describes work of this type and further describes IgE peptides from Cs3 and Cs4 regions conjugated to carrier molecules for active vaccination purposes. These immunogens can be used in vaccine studies and are reported to be capable of generating antibodies that subsequently inhibit histamine release in vivo. Also described herein are monoclonal antibodies (BSW17) which are said to be capable of binding to IgE peptides contained in the Οε3 region, which are useful for active vaccination purposes.
Dokument EP 0 477 231 B1 popisuje imunogeny odvozené z oblasti Ce4 IgE (zbytky 497 až 506, které jsou také známy jako Stanworthův dekapeptid) konjugované s hemocyaninem přílipkovitých plžů (KLH) používaných při aktivní vakcinační imunoprofylaxi. Dokument WO 96/14333 je pokračování práce popsané v dokumentu EP 0 477 231 Bl.EP 0 477 231 B1 discloses immunogens derived from the Ce4 IgE region (residues 497 to 506, also known as Stanworth decapeptide) conjugated to hemocyanin of the gastric gastropod (KLH) used in active vaccine immunoprophylaxis. WO 96/14333 is a continuation of the work described in EP 0 477 231 B1.
Jiné přístupy jsou založeny na identifikaci peptidů odvozených od oblastí 0ε3 a 0ε4, které samy soutěží o navázání IgE na receptory na bazofilech nebo žirných buňkách s nízkou • * · · · · · • · · · • · · • · · · · · nebo vysokou afinitouOther approaches are based on the identification of peptides derived from the 0ε3 and 0ε4 regions, which themselves compete for the binding of IgE to receptors on basophils or mast cells with a low level of basophils or mast cells. high affinity
WO 98/24808, EP 0 303WO 98/24808, EP 0303
Podstata vynálezu (popisuje se v dokumentech WO 93/04173,SUMMARY OF THE INVENTION (described in WO 93/04173,
625 Bl, EP 0 341 290).625 B1, EP 0 341 290).
Vynález popisuje jsou používány při terapii. alergií.The invention discloses are used in therapy. allergies.
sekvencí IgE, které imunoprofylaxi nebo spojovány s léčbou které začleňují z pokračujících částí exponovány na povrchu a identifikovaných epitopů.IgE sequences that immunoprophylaxis or associated with treatment that incorporate from the continuing portions exposed to the surface and identified epitopes.
IgE, dáleIgE, infra
Tyto nebo identifikaci nových aktivní nebo pasivníThese or identify new active or passive
Tyto sekvence nebyly dříveThese sequences were not before
Vynález popisuje samotné peptidy, specifické izolované epitopy přičemž se zjistilo, že jsou poskytují mimotopy těchto nově peptidy nebo mimotopy se mohou používat při léčbě alergie se mohou použít jako vakcíny při indukci auto-protilátek proti IgE během aktivní imunoprofylaxe nebo alergie, redukci nebo eliminaci imunoterapie při omezeni alergických symptomů u vakcinovaných subjektů.The invention describes peptides themselves, specific isolated epitopes which have been found to provide mimotopes of these novel peptides or mimotopes can be used in the treatment of allergy can be used as a vaccine to induce IgE auto-antibodies during active immunoprophylaxis or allergy, reduce or eliminate immunotherapy in reducing allergic symptoms in vaccinated subjects.
Překvapivě, protilátky proti IgE indukované peptidy podle vynálezu jsou neanafylaktické a jsou schopné blokovat uvolnění histaminu zprostředkované IgE z žírných buněk a bazofilů.Surprisingly, the anti-IgE antibodies induced by the peptides of the invention are non-anaphylactic and are capable of blocking IgE-mediated histamine release from mast cells and basophils.
Oblasti lidského IgE, kterými jsou peptidy podle vynálezu a které mohou sloužit k poskytnutí základu pro modifikaci peptidů jsou:Regions of human IgE which are peptides of the invention and which may serve to provide a basis for peptide modification are:
Tabulka č. 1:Table 1:
............. ., .:,.............
Peptidy, které začleňuji tyto epitopy, tvoří preferovaný aspekt vynálezu. Také se popisují mimotopy, které máji stejné charakteristiky jako tyto epitopy, a imunogeny obsahující takové mimotopy, které generují imunitní odezvu, která zkříženě reaguje s epitopem IgE v souladu s molekulou IgE.Peptides that incorporate these epitopes form a preferred aspect of the invention. Also disclosed are mimotopes having the same characteristics as these epitopes, and immunogens comprising such mimotopes that generate an immune response that cross-reacts with an IgE epitope in accordance with an IgE molecule.
Vynález dále zahrnuje izolované peptidy obsahující tyto samotné epitopy IgE a jejich libovolné mimotopy. Význam termínu „mimotop se definuje jako entita, která je dostatečně podobná přirozenému epitopu IgE tak, že je schopna být rozeznávána protilátkami, které rozeznávají přirozený epitop IgE (popisuje se v publikaci Gheysen, Η. M. et al., 1986, Synthetic peptides as antigens. Wiley, Chichester, Ciba foundation symposium 119, pl30-149, Gheysen Η. M., 1986, Molecular Immunology, 23, 7, 709-715), nebo je schopna vytvořit protilátky, když se spojí s vhodným nosičem. Tyto protilátky zkříženě reagují s přirozeným epitopem IgE.The invention further encompasses isolated peptides comprising these IgE epitopes alone and any mimotopes thereof. The term "mimotope" is defined as an entity that is sufficiently similar to the natural IgE epitope to be recognized by antibodies that recognize the natural IgE epitope (Gheysen, M. et al., 1986, Synthetic peptides as Wiley, Chichester, Ciba Foundation Symposium 119, p130-149, Gheysen, M. M., 1986, Molecular Immunology, 23, 7, 709-715), or is capable of generating antibodies when coupled to a suitable carrier. These antibodies cross-react with the natural IgE epitope.
Mimotopy podle vynálezu mohou být peptidové nebo nemají peptidový charakter. Peptidový mimotop na povrchu exponovaných epitopů IgE identifikované shora v textu mohou také mít přesně stejnou sekvenci jako přirozený epitop. Taková molekula je popsána jako mimotop epitopu, protože ačkoliv tyto dvě molekuly sdílí stejnou sekvenci, mimotop nebude přítomen v souladu se strukturou celé oblasti IgE a jako takový, může mít slabě odlišné prostorové uspořádání ve srovnání s epitopem přirozeného IgE. Odborníkovi je zřejmé, že shora v textu identifikované lineární sekvence (PÍ až P7), když v terciální struktuře IgE leží vedle jiných sekvencí, jsou vzdálené od primární sekvence IgE. Jako takový například mimotop PÍ může být spojený nebo přerušený a může obsahovat nebo napodobovat segmenty PÍ a segmenty připravené z těchto vzdálených aminokyselinových zbytků.The mimotopes of the invention may be peptide or non-peptide in nature. The peptide mimotope on the surface of exposed IgE epitopes identified above may also have exactly the same sequence as the natural epitope. Such a molecule is described as an epitope mimotope because, although the two molecules share the same sequence, the mimotope will not be present in accordance with the structure of the entire IgE region and as such may have a slightly different spatial arrangement compared to the natural IgE epitope. The skilled artisan will appreciate that the linear sequences identified above (P1 to P7), when lying adjacent to other sequences in the tertiary structure of IgE, are remote from the primary IgE sequence. As such, for example, the P1 mimotope may be fused or interrupted and may contain or mimic P1 segments and segments prepared from these distant amino acid residues.
Mimotopy podle vynálezu napodobují na povrchu exponované oblasti struktury IgE, avšak v těchto oblastech se jako dominantní uvažují ty oblasti exponované na povrchu, které korelují se strukturou smyčky. Struktura oblastí IgE je popsána v publikaci „Introduction to protein Structure (page 304, 2nd Edition, Branden and Tooze, Garland Publishing, New York, ISBN 0 8153 2305-0) a má formu beta-barelu, která vznikla ze dvou protilehlých paralelních beta-listů (zobrazeno na obrázku č. 8). Mimotopy mohou proto obsahovat smyčku s prodloužením N- a C-konců, kterými mohou být přirozené aminokyselinové zbytky z okolních listů. Jako příklad slouží oblast P100, která obsahuje smyčku A-B Cs3, P8 obsahuje smyčku A-B Cs4, P5 obsahuje smyčku C-D Cs3 a P110 obsahuje smyčku C-D Ce4 . Podobně, mimotopy těchto smyček tvoři aspekt vynálezu. Zvláště preferovanými smyčkami jsou smyčky C-D Cs3 nebo Cs4 a smyčka A-B Cs4.The mimotopes of the invention mimic the surface exposed area of the IgE structure, but in these areas the surface exposed areas that correlate with the loop structure are considered to be dominant. IgE domain structure is described in "Introduction to Protein Structure (page 304, 2nd Edition, Branden and Tooze, Garland Publishing, New York, ISBN 0 8153 2305-0) and has the form of beta-barrel, which originated from two opposed parallel beta-sheets (shown in Figure 8). The mimotopes may therefore comprise a loop with an extension of the N- and C-termini, which may be natural amino acid residues from surrounding leaves. As an example, the P100 region that contains the AB Cs3 loop, P8 contains the AB Cs4 loop, P5 includes the CD Cs3 loop, and P110 contains the CD Ce4 loop. Similarly, mimotopes of these loops form an aspect of the invention. Particularly preferred loops are CD Cs3 or Cs4 loops and AB Cs4 loop.
Peptidové mimotopy shora identifikovaných epitopů IgE mohou být navrženy pro určité účely přidáním, delecí nebo substitucí volených aminokyselin. Tak peptidy podle vynálezu mohou být modifikovány pro účely zjednodušení konjugace s proteinovým nosičem. Například může být nutné v případě některých metod chemické konjugace zahrnout do epitopu IgE terminální cystein. Navíc v případě peptidů konjugovaných s proteinovým nosičem může být nutné, aby zahrnovaly hydrofóbní konec vzdálený od konjugovaného konce peptidů tak, že volný konjugovaný konec peptidů zůstává spojený s povrchem nosičového proteinu. To redukuje konformačni stupně volnosti peptidů a tak zvýšení pravděpodobnosti, že peptid je přítomen v konformaci, která se nejblíže podobá konformaci peptidů IgE, tak jak se zjistila v souladu s celou molekulou IgE. Peptidy se mohou například změnit tak, aby měly N-terminální cystein a C-terminální hydrofóbní amidovaný konec. V jiném případě se může uskutečnit adice nebo substituce D-stereoizomérové formy jednoho nebo více aminokyselin za vzniku výhodného derivátu například pro zvýšení stability peptidu. Odborníkům je zřejmé, že takové modifikované peptidy nebo mimotopy by mohly být zcela nebo částečně mimotopy, které nejsou peptidy, kde podstatné zbytky nejsou nezbytně omezeny na 20 přirozeně se vyskytujících aminokyselin. Navíc tyto části se mohou cyklizovat metodami známými v oboru, aby vznikl peptid v konformaci, která blízce podobá tvaru, kdy peptidová sekvence je v souladu s celou molekulou IgE. Preferovaná metoda cyklizace peptidu obsahuje přidáni páru cysteinových zbytků, přičemž se umožní vznik disulfidového můstku.Peptide mimotopes of the above identified IgE epitopes may be designed for certain purposes by the addition, deletion, or substitution of the selected amino acids. Thus, the peptides of the invention may be modified to facilitate conjugation to a protein carrier. For example, for some chemical conjugation methods, it may be necessary to include terminal cysteine in the IgE epitope. In addition, for peptide-conjugated peptides, they may need to include a hydrophobic tail remote from the conjugated tail of the peptides such that the free conjugated tail of the peptides remains attached to the surface of the carrier protein. This reduces the conformational degrees of freedom of the peptides and thus increases the likelihood that the peptide is present in the conformation closest to that of the IgE peptides as found consistent with the entire IgE molecule. For example, the peptides may be altered to have an N-terminal cysteine and a C-terminal hydrophobic amidated end. Alternatively, addition or substitution of the D-stereoisomeric form of one or more amino acids may be made to provide a preferred derivative, for example, to enhance the stability of the peptide. It will be appreciated by those skilled in the art that such modified peptides or mimotopes could be wholly or partially mimotopes that are not peptides wherein the essential residues are not necessarily limited to 20 naturally occurring amino acids. In addition, these moieties can be cyclized by methods known in the art to produce a peptide in a conformation that closely resembles a shape where the peptide sequence is consistent with the entire IgE molecule. A preferred method of cyclizing the peptide comprises adding a pair of cysteine residues to allow the formation of a disulfide bridge.
Odborníkovi je zřejmé, že mimotopy nebo imunogeny podle vynálezu mohou být větší než shora identifikované epitopy a jako takové mohou obsahovat zde popsané sekvence. Podobně mimotopy podle vynálezu mohou obsahovat další N- a/nebo Cterminálni prodloužení řady jiných přirozených zbytků na jednom nebo obou koncích. Peptidové mimotopy mohou také být retro-sekvence přirozených sekvencí IgE, ve kterých je orientace sekvence obrácená nebo v jiném případě mohou celé nebo jejich části obsahovat D-stereoizomérové aminokyseliny (inverzní sekvence). Peptidové sekvence mohou být svým charakterem retro-inverzni, to znamená, že orientace aminokyselin je obrácená a aminokyseliny jsou v Dstereoizomérové formě. Takové retro- nebo retroinverzní peptidy mají výhodu, že se vyskytují samostatně a jako takové obcházejí problémy samotolerance imunitního systému (například P14c) .The skilled artisan will appreciate that the mimotopes or immunogens of the invention may be larger than the epitopes identified above and as such may contain the sequences described herein. Similarly, mimotopes of the invention may comprise additional N- and / or terminalminal extension of a number of other natural residues at one or both ends. The peptide mimotopes may also be retro-sequences of natural IgE sequences in which the sequence orientation is reversed, or alternatively may contain all or part of the D-stereoisomeric amino acids (inverse sequences). The peptide sequences may be retro-inverse in nature, that is, the orientation of the amino acids is reversed and the amino acids are in the stereoisomeric form. Such retro- or retro-inverse peptides have the advantage that they occur alone and as such circumvent the problems of self-tolerance of the immune system (for example P14c).
V jiném případě peptidové mimotopy mohou být identifikovány použitím protilátek, které jsou samy schopné vázat se na epitopy IgE podle vynálezu za použití metod, jako je technologie vyjadřující fága (EP 0 522 267 Bl). Tento postup generuje velké množství peptidových sekvencí, které napodobují strukturu přirozených peptidů a jsou proto schopnyAlternatively, peptide mimotopes can be identified using antibodies that are themselves capable of binding to IgE epitopes of the invention using methods such as phage-expressing technology (EP 0 522 267 B1). This procedure generates a large number of peptide sequences that mimic the structure of natural peptides and are therefore capable
vázat se na protilátky proti přirozenému peptidu, ale nemohou nezbytně sdílet podstatnou sekvenční homologii s přirozeným peptidem IgE. Tento přístup může být výhodný tím, že umožňuje identifikaci peptidu se zvýšenými imunogenními vlastnostmi (tak jako jsou vazebné charakteristiky s vyšší afinitou k receptorům IgE nebo protilátky proti IgE nebo jsou schopny indukovat polyklonální imunitní odezvu, přičemž uvedené protilátky se vážou na IgE s vyšší afinitou) nebo mohou obejít libovolné potencionální problémy tolerance na samotný antigen, které jsou spojovány s použitím přirozené peptidové sekvence. Navíc tato metoda umožňuje identifikaci rozeznávaného paternu pro každý přirozený peptid na základě jeho sdílených chemických vlastností mezi rozeznávanými sekvencemi mimotopů.bind to antibodies against the native peptide, but cannot necessarily share substantial sequence homology with the native IgE peptide. This approach may be advantageous by allowing the identification of peptides with enhanced immunogenic properties (such as binding characteristics with higher affinity for IgE receptors or anti-IgE antibodies or capable of inducing a polyclonal immune response, wherein said antibodies bind to higher affinity IgE) or they can bypass any potential tolerance problems to the antigen itself that are associated using the native peptide sequence. In addition, this method allows the recognition of a recognition pattern for each natural peptide based on its shared chemical properties among the recognized mimotope sequences.
Příklady takových mimotopů jsou:Examples of such mimotopes are:
« ·«·
V jiném případě peptidové mimotopy mohou být vytvořeny s ohledem na zvýšení imunogenicity peptidu zvýšením jeho afinity k polyklonální protilátce proti peptidu IgE, jehož účinek může být měřen metodami známými v oboru, jako jsou experimenty Biocore. Za účelem dosažení této peptidové sekvence mohou být selektivně změněny následující obecná pravidla:Alternatively, peptide mimotopes can be generated to enhance the immunogenicity of a peptide by increasing its affinity for a polyclonal antibody against an IgE peptide, the effect of which can be measured by methods known in the art, such as Biocore experiments. To achieve this peptide sequence, the following general rules can be selectively changed:
• udržovat strukturální omezení, to znamená, že proliny a glyciny by se neměly nahradit • jiné polohy mohou být substituovány aminokyselinou, která má podobné fyzikálně chemické vlastnosti.• maintain structural constraints, that is, proline and glycine should not be replaced • other positions may be substituted with an amino acid that has similar physicochemical properties.
Což znamená, že aminokyselinový zbytek může být nahrazen aminokyselinou, která je nejvíce podobná aminokyselině. Například A se může nahradit V, L nebo I, jak se popisuje v následující tabulce.That is, the amino acid residue may be replaced by an amino acid that is most similar to the amino acid. For example, A can be replaced by V, L or I as described in the following table.
Zvláště -preferované peptidy IgE jsou P8 a jejich varianty (takové jako P14 nebo P14a) . Tyto peptidy, když jsou spojeny s nosičem jsou potentni při indukci imunitní odezvy proti IgE. Tato imunitní odezva je schopná inhibovat uvolnění histaminu z lidských bazofilů. Varianty nebo mimotopy P8 jsou popsány primárně jako libovolný imunogen založený na peptidu, který je schopný indukovat imunitní odezvu, která je schopná rozeznat P8. Bez omezení rozsahem vynálezu některé varianty P8 mohou být popsány obecným vzorcem, ve kterém jisté aminokyseliny mohou být nahrazeny jejich nejbližšími doplňky. Použitím tohoto postupu peptidové mimotopy P8 mohou být popsány obecným vzorcem:Particularly preferred IgE peptides are P8 and variants thereof (such as P14 or P14a). These peptides, when coupled to a carrier, are potent in inducing an immune response against IgE. This immune response is capable of inhibiting histamine release from human basophils. P8 variants or mimotopes are described primarily as any peptide-based immunogen that is capable of inducing an immune response that is able to recognize P8. Without being limited by the scope of the invention, some P8 variants may be described by the general formula in which certain amino acids may be replaced by their closest complement. Using this procedure, peptide mimotopes of P8 can be described by the general formula:
P, Xlř X2, Ρ, Χβζ X4z ΧδΛ %6r ΧδΛ neboP, Xlø X 2 , Ρ, Χβζ X 4 of ΧδΛ% 6r ΧδΛ or
Mimotopy P8 mohou být také identifikovány použitím protilátek, které jsou samy schopny se vázat na P8, dále použitím postupů, jako je technologie vyjadřující fága (popisuje se v dokumentu EP 0 552 267 Bl). V tomto ohledu jsou zvláště vhodné monoklonální protilátky, jako- je P14/23, P14/31 P14/33.P8 mimotopes can also be identified using antibodies that are capable of binding to P8 themselves, further using techniques such as phage-expressing technology (described in EP 0 552 267 B1). Monoclonal antibodies such as P14 / 23, P14 / 31, P14 / 33 are particularly suitable in this regard.
Vynález proto popisuje nové epitopy a jejich mimotopy a jejich použiti při výrobě farmaceutických kompozic pro profylaxi nebo terapii alergii. Dále se popisuji imunogeny obsahující alespoň jeden z epitopů nebo mimotopů podle vynálezu a molekuly nosičů, které jsou vhodné pro použiti ve vakcínách pro imunoprofylaxi nebo terapii alergií. Podobně epitopy, mimotopy nebo imunogeny podle vynálezu jsou vhodné pro použití v medicíně a při léčbě nebo profylaxi alergického onemocnění. Preferované imunogeny a vakcíny podle vynálezu obsahují epitop P8 IgE nebo jeho mimotopy, které zahrnují P14.The invention therefore describes novel epitopes and mimotopes thereof and their use in the manufacture of pharmaceutical compositions for the prophylaxis or therapy of allergy. Further disclosed are immunogens comprising at least one of the epitopes or mimotopes of the invention and carrier molecules that are suitable for use in vaccines for immunoprophylaxis or allergy therapy. Similarly, the epitopes, mimotopes or immunogens of the invention are suitable for use in medicine and in the treatment or prophylaxis of an allergic disease. Preferred immunogens and vaccines of the invention comprise a P8 IgE epitope or mimotopes thereof that include P14.
Ukazuje se, že různé metody, kterými se prezentuje epitop nebo mimotop, mají podstatné účinky na navázáni na monoklonální protilátky a imunitní odezvu po vakcinaci. Například, když se použijí cyklické peptidy, změní se délka a fáze smyčky, může to mít podstatné účinky na vazebnou aktivitu cyklických mimotopů na monoklonální protilátky P14 (P14/23, P14/31 nebo P14/33). Vyvinul se nový systém, který vybírá místa cyklizace, čímž zvyšuje pravděpodobnost, že cyklické peptidy udržují správnou strukturu smyčky, která obsahuje správné aminokyselinové zbytky. Tímto způsobem je protein pravděpodobně uzavřen v konformaci, která nejvíce připomíná tu konformaci, které se peptidy v normálním případě přizpůsobí, jestliže byly v souladu s celou oblastí IgE. Proto cyklické mimotopy bez omezení vynálezem, které splňují tato nová pravidla, tvoří preferovaný aspekt vynálezu.Various methods by which an epitope or mimotope are presented have been shown to have substantial effects on binding to monoclonal antibodies and immune response following vaccination. For example, when cyclic peptides are used, the length and phase of the loop are altered, this may have significant effects on the binding activity of cyclic mimotopes to monoclonal antibodies P14 (P14 / 23, P14 / 31 or P14 / 33). A new system has been developed which selects cyclization sites, thereby increasing the likelihood that the cyclic peptides maintain the correct loop structure containing the correct amino acid residues. In this way, the protein is likely to be encapsulated in a conformation that most resembles that conformation that peptides would normally conform to when they were consistent with the entire IgE region. Therefore, cyclic mimotopes without limitation by the invention that meet these new rules constitute a preferred aspect of the invention.
Putativní mimotopové sekvence, které nesplňují tyto pravidla mohou stále vytvořit použitelné antisérum (například P14 a Pil), takové následující příklady jsou pouze podsady typů mimotopů podle vynálezu.Putative mimotope sequences that do not meet these rules can still produce a useful antiserum (e.g., P14 and Pil), such the following examples being only subset of mimotope types of the invention.
Příklady preferovaných peptidu, která splňuji tato nově definovaná strukturální pravidla jsou:Examples of preferred peptides that meet these newly defined structural rules are:
Tabulka č. 3Table 3
Předpokládá se, že mimotopy podle vynálezu jsou malé, tak že napodobují oblast vybranou z celé oblasti IgE, ve které je zjištěn přirozený epitop.The mimotopes of the invention are believed to be small, mimicking a region selected from the entire IgE region in which a natural epitope is detected.
méně obsahovat než 100 obsahovat méně než 75less than 100 contain less than 75
Peptidové mimotopy by měly aminokyselin, aminokyselin, než 50 aminokyselin a až 25 aminokyselin.The peptide mimotopes would have amino acids, amino acids other than 50 amino acids, and up to 25 amino acids.
obsahovat méně obsahovat s výhodou výhodněj i nej výhodněji Specifické by by proto měly měly měly by příklady preferovaných peptidových mimotopů jsou P14 a PH, které obsahují 13 a 23 aminokyselin. Předpokládá se, že nepeptidové mimotopy mají ve srovnání s jejich peptidovými doplňky stejnou velikost na základě objemu molekuly.contain less contain preferably more preferably and most preferably Specific should therefore be examples of preferred peptide mimotopes are P14 and PH, which contain 13 and 23 amino acids. The non-peptide mimotopes are believed to be the same size based on the volume of the molecule as compared to their peptide supplements.
V oboru je známo, které metody je možné použít k potvrzení statutu specifické konstrukce, jako mimotopů, který spadá do rozsahu vynálezu. Takové metody zahrnují, ale nejsou omezeny na následující. U putativniho mimotopu je možné testovat imunogennost konstrukce, kterou vzniká antisérum, kdy putativní mimotop zkříženě reaguje s přirozenou molekulou IgE, a jsou také funkční při blokování uvolnění alergických mediátorů z alergických efektorových buněk. Speicifita této odezvy může být potvrzena experimenty kompetice blokováním aktivity antiséra se samotným mimotopem nebo přirozeným IgE a/nebo specifickými monoklonálními protilátkami, které jsou známy, že se váží na epitop v IgE. Specifické příklady takových monoklonálních protilátek vhodných pro použití v testech kompetice zahrnují P14/23, P14/31 nebo P14/33, které potvrdí status putativniho mimotopu jako mimotop P8. · 'It is known in the art which methods can be used to confirm the status of a specific construct as mimotope, which is within the scope of the invention. Such methods include, but are not limited to, the following. In a putative mimotope, it is possible to test the immunogenicity of an antisera-forming construct where the putative mimotope cross-reacts with the natural IgE molecule, and are also useful in blocking the release of allergic mediators from allergic effector cells. The specificity of this response can be confirmed by competition experiments by blocking the activity of the antisera with mimotope alone or natural IgE and / or specific monoclonal antibodies known to bind to an epitope in IgE. Specific examples of such monoclonal antibodies suitable for use in competition assays include P14 / 23, P14 / 31 or P14 / 33, which confirm the status of a putative mimotope as P8 mimotope. · '
V jednom provedení vynálezu je alespoň jeden epitop IgE nebo mimotop spojen s molekulami nosiče za vzniku imunogenů vhodných pro vakcinační protokoly. Je výhodné, aby molekuly nosiče nebyly příbuzné přirozené molekule IgE. Mimotopy mohou být spojeny prostřednictvím chemické kovalentní konjugace nebo expresí geneticky manipulovaných fúzních partnerů pomocí linkerové sekvence. V jednom provedeni vynálezu peptidy podle vynálezu jsou exprimovány ve fúzní molekule s fúzním partnerem, kde peptidová sekvence je zjištěna v primární sekvenci fúzního partnera.In one embodiment of the invention, at least one IgE epitope or mimotope is linked to carrier molecules to produce immunogens suitable for vaccination protocols. It is preferred that the carrier molecules are not related to the native IgE molecule. The mimotopes may be linked by chemical covalent conjugation or by expression of genetically manipulated fusion partners using a linker sequence. In one embodiment, the peptides of the invention are expressed in a fusion partner fusion molecule, wherein the peptide sequence is detected in the primary fusion partner sequence.
Kovalentní spojení peptidu s imunogenním nosičem může být provedeno způsobem dobře známým v oboru. Tak například v případě přímého kovalentního spojení je možné využít karbodiimid, glutaraldehyd nebo (Ν-[γmaleimidobutyryloxy]sukcinimidester, využívající běžné komerčně dostupné heterobifunkční linkery, jako je CDAP a SPDP (použití instrukcí výrobce). Po interakci je možné imunogen jednoduše izolovat a čistit dialyzační metodou, gelovou filtrací a frakcinační metodou atd..Covalent coupling of the peptide to an immunogenic carrier can be accomplished in a manner well known in the art. For example, in the case of direct covalent coupling, carbodiimide, glutaraldehyde or (Ν- [γmaleimidobutyryloxy] succinimide ester using conventional commercially available heterobifunctional linkers such as CDAP and SPDP (using manufacturer's instructions) may be utilized. method, gel filtration and fractionation method etc ..
·· • ♦ · ··· • ♦ · ·
V preferovaném provedení podle vynálezu se zjistilo, že peptidy, zvláště cyklické peptidy mohou být konjugovány na nosič přípravou derivátů acylhydrazinového peptidu.In a preferred embodiment of the invention, it has been found that peptides, in particular cyclic peptides, can be conjugated to a carrier by preparing derivatives of an acylhydrazine peptide.
Konstrukce peptidy/proteinový nosič může být produkována následujícím způsobem. Deriváty acylhydrazinového peptidu mohou být připraveny na pevné fázi, jak je zobrazeno v následujícím schématu 1:Peptide / protein carrier constructs can be produced as follows. Acylhydrazine peptide derivatives can be prepared on the solid phase as shown in Scheme 1 below:
Schéma 1:Scheme 1:
Syntéza peptidu na pevné fázi:Solid phase peptide synthesis:
Rink-pryskyřice syntéza peptidu na pevné fáziRink-resin solid phase peptide synthesis
Χ-AAj...C (Trt)......C (Trt)......AAn-Lys (Dde) -Rink-pryskyřice hydrazinhyarátN-AAj ... C (Trt) ...... C (Trt) ...... AA n -Lys (Dde) -Rink-Resin Hydrazine Hydrate
ÝÝ
Χ-AAi...C (Trt)......C (Trt)......AAn-Lys (NH2) -Rink-pryskyřice (i) sukcinanhydrid (ii) HBTU/HOBt/NMM/N2H4 N-AAi ... C (Trt) ...... C (Trt) ...... AA n -Lys (NH 2 ) -Rink-resin (i) succinic anhydride (ii) HBTU / HOBt / NMM / N 2 H 4
VIN
Χ-ΑΑχ.-.C (Trt)......C (Trt)......AA^-Lys-Rink-pryskyřice^-ΑΑχ .-. C (Trt) ...... C (Trt) ...... AA-Lys-Rink-Resin
N HZ-N HZ-
íi oíi o
NHN 4NHN 4
TFA íTFA i
Χ-AAi...C (-SH)......C (-SH)AA-AAi ... C (-SH) ...... C (-SH)
oxidace H2O2 toxidation of H 2 O 2 t
X-AAi...C...C...AAn-Lys-CONH2 IX-AAi ... C ... C ... AA n -Lys-CONH 2 I
N HZTyto peptidové deriváty mohou použitím dobře známého postupu „Fmoc nebo polyethylenglykolpolystyrenového automatizovaném zařízení pomocí postupu, který být snadno připraveny , použitím polyamidového (PEG-PS) podkladu v plně je dobře znám v oboru (metody a postupy pro syntézu na pevné popisuje v publikaci Solid Phase fázi, jak seN HZThese peptide derivatives can be well known in the art using the well known Fmoc or polyethylene glycol polystyrene automated equipment process by a process that is easy to prepare using a polyamide (PEG-PS) support (methods and procedures for solid synthesis are described in Solid. Phase stage how to
PeptidePeptide
Synthesis: ASynthesis: A
Practical ApprouchPractical Approuch
Oxford University kyselinou poskytujeOxford University Acid Provides
Sheppard, IRL, zprostředkované lineární, nechráněný a upravený peptid.Sheppard, IRL, mediated linear, unprotected and modified peptide.
by E. Atherton and R.C.by E. Atherton and R.C.
ŠtěpeníFission
Tento peptid se snadno oxiduje a čistí, přičemž vzniká epitop upravený disulfidovým můstkem za použití metodologie popsané v publikaci „Methods in Molecular Biology, Vol. 35: Peptide Synthesis Protocols (ed. M.W. Pennington and Β. M. Dunn), chapter 7, pp. 91 - 171, D. Andreu et al.,.This peptide is readily oxidized and purified to form a disulfide-bridged epitope using the methodology described in "Methods in Molecular Biology, Vol. 35: Peptide Synthesis Protocols (edited by M. W. Pennington and M. Dunn), chapter 7, pp. 91-171, D. Andreu et al.,.
Takto syntetizované peptidy mohou pak být konjugované s proteinovými nosiči za použití následujících metod:The peptides thus synthesized can then be conjugated to proteinaceous carriers using the following methods:
Zavedení funkce arylaldehydu využilo aktivní sukcinimidester (BAL-Osu) připravený způsobem zobrazeným ve schématu 2 (další detaily se popisují v dokumentu WO 98/17621). Substituce amino funkcí například nosiče BSA (bovinni sérový albumin až 50 %) dává vzniku rozpustnému upravenému proteinu. Větší substituce BSA vede k nerozpustným konstrukcím. BSA a BAL-Osu se smíchaly v ekvimolární koncentraci v DMSO/pufr (znázorněno ve schématu) po dobu 2 hodiny. Tento experimentálně získaný protokol dává vzniku přibližně 50 % substituci, jak se odhaduje fluorescenčním aminovým testem pro volné aminoskupiny, v následujícím schématu 2/3- příprava upraveného nosiče:The introduction of the arylaldehyde function utilized the active succinimide ester (BAL-Osu) prepared as shown in Scheme 2 (further details are described in WO 98/17621). Substitution of amino functions with, for example, BSA (bovine serum albumin up to 50%) supports soluble soluble protein. Greater BSA substitution results in insoluble constructs. BSA and BAL-Osu were mixed at equimolar concentration in DMSO / buffer (shown in the diagram) for 2 hours. This experimentally obtained protocol gives rise to approximately 50% substitution, as estimated by the fluorescent amine assay for free amino groups, in the following scheme 2 / 3- preparation of the modified carrier:
Schéma 2:Scheme 2:
Schéma 3:Scheme 3:
BSA-BAL ♦Φ· 444· « 4BSA-BAL · 444 · 4
Jednoduchá kombinace upraveného peptidů a derivatizovaný nosič poskytuji konstrukce peptidového nosiče, který je možné snadno izolovat dialýzou - schéma 4 - konjugát peptid/nosič.A simple combination of engineered peptides and derivatized carrier provides peptide carrier constructions that can be easily isolated by dialysis - Scheme 4 - peptide / carrier conjugate.
Schéma 4:Scheme 4:
I—II — I
X-AAj ...C....C....AAn-Lys-CONH2 X-AAj ... C .... C .... AA n -Lys-CONH 2
NH-ZNH-Z
50%DMSO/ Pufr (pH 3.5, 0.1 MNaHCO2)50% DMSO / Buffer (pH 3.5, 0.1 MNaHCO 2 )
-8-16 h.-8-16 h.
’r ' r
NHNH
Lys...AAn...C...,.....Lys AA ... n ... C ..., .....
C...AArXC ... AA r X
TYPY nosičů používaných u imunogenů podle vynálezu jsou dobře známy v oboru. Funkce nosiče je poskytnout pomoc cytokinu za účelem pomoci indukovat imunitní odezvu proti peptidůThe types of carriers used in the immunogens of the invention are well known in the art. The function of the carrier is to provide cytokine assistance to help induce an immune response against the peptides
IgE.IgE.
Seznam nosičů, které se mohou použit podle vynálezu zahrnuj e:The list of carriers that can be used according to the invention includes:
hemocyanin přílipkovitých plžů (KLH), sérové albuminy, jako je bovinní sérový albumin deaktivované bakteriální toxiny, jako je toxin tetanu nebo diftérie (TT a DT) nebo jejich rekombinantni fragmenty (například oblast 1 fragmentu C toxinu TT nebo translokačni oblast DT) nebo čištěný proteinový derivát tuberkulinu (PPD). V alternativním případě mimotopy nebo epitopy mohou být přímo konjugovány s lipozomovými nosiči, které mohou navíc obsahovat imunogeny schopné poskytnout pomocné T-buňky. Je výhodné, aby poměr mimotopů ku nosiči byl 1:1 až 20:1 a je výhodné, když každý nosič nese mezi 3 až 15 peptidy.gastric gastric hemocyanin (KLH), serum albumins such as bovine serum albumin inactivated bacterial toxins such as tetanus toxin or diphtheria (TT and DT) or recombinant fragments thereof (for example, TT fragment C fragment TT or translocation region DT) or purified protein a tuberculin derivative (PPD). Alternatively, the mimotopes or epitopes may be directly conjugated to liposome carriers, which may additionally contain immunogens capable of providing helper T-cells. It is preferred that the mimotope to carrier ratio be 1: 1 to 20: 1 and it is preferred that each carrier carries between 3 to 15 peptides.
V jednom provedení podle vynálezu preferovaným nosičem je protein D z organizmu Haemophilus influenzae (popisuje se v dokumentu EP 0 594 610 Bl) . Protein D je protein vázajícíIn one embodiment of the invention, the preferred carrier is protein D from Haemophilus influenzae (EP 0 594 610 B1). Protein D is a protein binding
IgD z organizmu Haemophilus influenzae a je chráněn patentem WO 91/18926, EP 0 594 610 Bl) . Při některých okolnostech, například v rekombinantních imunogenních expresivních systémech může být nutné použít fragmenty proteinu D, například protein D l/3Ed (obsahuje N-terminální 100 až 110 aminokyselin proteinu D (popisuje se v dokumentu GB 9717953.5)) .IgD from Haemophilus influenzae and is protected by patent WO 91/18926, EP 0 594 610 B1). In some circumstances, for example in recombinant immunogenic expression systems, it may be necessary to use fragments of protein D, for example protein D 1/3 Ed (comprising the N-terminal 100 to 110 amino acids of protein D (described in GB 9717953.5)).
Jiná preferovaná metoda prezentující rekombinantní je v souladu s v dokumentu EP 0 vynálezuAnother preferred recombinant presentation method is in accordance with EP 0 of the invention
Například částic jaderného antigenu v částicích podobným virovým peptidy IgE podle fúzní molekulou.For example, nuclear antigen particles in particles similar to the viral IgE peptides of the fusion molecule.
421 635 B se chimérického částicím jsou popisuje použití hepadnaviru, kdy přítomny cizorodé peptidové sekvence. Jako takové imunogeny podle vynálezu mohou obsahovat peptidy IgE přítomné v chimérických částicích obsahujících jaderný antigen hepatítidy B. Navíc rekombinantní fúzní proteiny mohou obsahovat mimotopy podle vynálezu a nosičový protein, jako je NS1 viru chřipky. V případě libovolného rekombinantně exprimovaného proteinu, který tvoří část vynálezu, nukleová kyselina, která kóduje uvedený imunogen je také předmětem vynálezu.421,635 B to chimeric particles are described using a hepadnavir wherein foreign peptide sequences are present. As such, the immunogens of the invention may comprise IgE peptides present in chimeric particles containing the hepatitis B nuclear antigen. In addition, the recombinant fusion proteins may comprise mimotopes of the invention and a carrier protein such as NS1 influenza virus. In the case of any recombinantly expressed protein forming part of the invention, the nucleic acid that encodes said immunogen is also an object of the invention.
Peptidy podle vynálezu mohou být snadno syntetizovány postupem na pevné fázi, který je dobře znám v oboru. Vhodné syntézy je možné uskutečnit využitím postupů „T-boc nebo „Fmoc . Cyklické peptidy je možné syntetizovat postupem na pevné fázi, kde se používá ve zcela automatizovaném přístroji velmi dobře známý postup „F-moc a polyamidová pryskyřice. V jiném případě odborníci budou znát nezbytné laboratorní postupy, aby mohly uskutečnit postup manuálně. Techniky a postupy syntézy na pevné fázi jsou popsány v publikaci „Solid Phase Peptide Synthesis: A Practical Approach, E. Atherton and R.C. Sheppard, IRL, Oxford University Press (1989). V jiném případě se mohou peptidy produkovat metodami rekombinace, které zahrnují expresi molekul nukleové kyseliny v bakteriální a savčí buněčné linii. Pak exprimovaného mimotopu. proteinů Maniatis,The peptides of the invention can be readily synthesized by a solid phase method well known in the art. Suitable syntheses can be accomplished using "T-boc" or "Fmoc" procedures. The cyclic peptides can be synthesized by a solid-phase process using a well-known F-moc and polyamide resin process in a fully automated apparatus. Alternatively, those skilled in the art will know the necessary laboratory procedures to carry out the procedure manually. Solid phase synthesis techniques and procedures are described in "Solid Phase Peptide Synthesis: A Practical Approach" by E. Atherton and R.C. Sheppard, IRL, Oxford University Press (1989). Alternatively, the peptides can be produced by recombination methods that involve expression of nucleic acid molecules in a bacterial and mammalian cell line. Then the expressed mimotope. protein Maniatis,
Metody rekombinantní kódující mimotopy následuje čištění peptidů a exprese clonning,Methods of recombinant coding for mimotopes are followed by peptide purification and clonning expression,
Laboratory jsou známyLaboratories are known
T., Fritsch, v oboru a popisují se vT., Fritsch, in the art and are described in U.S. Pat
E. F. and Sambrook et al., a laboratoryE. F. and Sambrook et al., A laboratory
Press, Cold Spring Harbor, publikaciPress, Cold Spring Harbor, publication
Molecular manual 2nd Molecular manual 3 nd
Ed., Cold SpringEd., Cold Spring
New York (1989).New York (1989).
obsahovat peptidy,contain peptides,
HarborHarbor
Imunogeny podle vynálezu mohou textu, zahrnující mimotopy nebo popisuje shora v jak se j ej ich analogy nebo mohou fragmenty. Vynález být zkříženě reaktivní deriváty nebo jej ich dále popisuje části nukleové kyseliny, které kódují imunogeny podle vynálezu nebo peptidy, mimotopy nebo jejich deriváty.The immunogens of the invention may include, including mimotopes or described above, as analogs or fragments thereof. The invention is to be cross-reactive derivatives or further described by nucleic acid portions that encode the immunogens of the invention or peptides, mimotopes or derivatives thereof.
Vynález dále popisuje použití nových epitopů nebo mimotopů (jak se definuje shora v textu) při výrobě farmaceutických prostředků pro profylaxi nebo terapii alergií. Imunogeny obsahující mimotopy nebo peptidy podle vynálezu a nosičové molekuly jsou také vhodné pro použití ve vakcínách pro imunoprofylaxi nebo terapii alergií. Podobně mimotopy, peptidy nebo imunogeny podle vynálezu jsou vhodné pro použití v medicíně a v medicínské léčbě nebo profylaxi alergického onemocnění.The invention further provides the use of novel epitopes or mimotopes (as defined above) in the manufacture of pharmaceutical compositions for the prophylaxis or therapy of allergies. Immunogens comprising the mimotopes or peptides of the invention and carrier molecules are also suitable for use in vaccines for immunoprophylaxis or allergy therapy. Similarly, the mimotopes, peptides or immunogens of the invention are suitable for use in medicine and in the medical treatment or prophylaxis of an allergic disease.
Vakcíny podle vynálezu mohou výhodně také zahrnovat adjuvans. Vhodné adjuvans pro vakcíny podle vynálezu obsahují ty adjuvans, která jsou schopna zvyšovat protilátkové odezvy • 9The vaccines of the invention may advantageously also include an adjuvant. Suitable adjuvants for the vaccines of the invention include those adjuvants that are capable of enhancing antibody responses
* ·· · ··44 proti peptidovému imunogenu IgE. Adjuvans jsou dobře známy v oboru (Vaccine Design - The Subunit and Adjuvans Approuch, 1995, Pharmaceutical Biotechnology, Volume 6, Eds. Powell, M. F. , and Newman, M. J. , Plenům Press, New York and London, ISBN 0-306-44867-X). Preferovaná adjuvans vhodná pro použiti s imunogeny podle vynálezu zahrnuji sole hliníku nebo vápníku (hydroxid nebo fosforečnan).* 44 against IgE peptide immunogen. Adjuvants are well known in the art (Vaccine Design - The Subunit and Adjuvans Approuch, 1995, Pharmaceutical Biotechnology, Volume 6, Eds. Powell, MF, and Newman, MJ, Plenum Press, New York and London, ISBN 0-306-44867- X). Preferred adjuvants suitable for use with the immunogens of the invention include aluminum or calcium salts (hydroxide or phosphate).
Vakcíny podle vynálezu je možné v obecném případě aplikovat jako primární nebo jako zesilující dávku. Očekává se, že zesilující dávky jsou adekvátně odděleny nebo se aplikují časně, v takové době, kdy množství cirkulující protilátky je nižší než požadovaná hodnota. Posilující dávky mohou obsahovat peptid v nepřítomnosti původní molekuly nosiče. Takové konstrukce vhodné jako zesilovací dávka mohou obsahovat alternativní nosič nebe mohou existovat i když není přítomen nosič.The vaccines of the invention may generally be administered as a primary or as an booster dose. Booster doses are expected to be adequately separated or administered early, at a time when the amount of circulating antibody is less than the desired value. Booster doses may contain the peptide in the absence of the parent carrier molecule. Such constructions suitable as a booster dose may include an alternative carrier or may exist even if no carrier is present.
Vynález dále popisuje zde popsaný imunogen nebo vakcínu pro použití v medicíně.The invention further provides an immunogen or vaccine described herein for use in medicine.
Vakcinační prostředky podle vynálezu se mohou použít k ochraně nebo k léčbě savce náchylného k alergiím nebo trpícího alergií způsobem aplikace uvedené vakcíny systémovou nebo mukozální cestou. Tyto aplikace mohou zahrnovat intramuskulární, intraperitoneální, intradermální nebo subkutánní injekci nebo mukozální aplikaci do orálního/zažívacího, respiračního, močopohlavního traktu. Preferovaný způsob aplikace je transdermálním způsobem například kožními náplastmi. Podobně se popisuje způsob léčby alergie zahrnující aplikaci peptidů, imunogenu nebo ligandu podle vynálezu pacientovi, který trpí alergií nebo je k alergiím náchylný.The vaccine compositions of the invention may be used to protect or treat a mammal susceptible to or suffering from an allergy by administering said vaccine by the systemic or mucosal route. These applications may include intramuscular, intraperitoneal, intradermal or subcutaneous injection or mucosal administration into the oral / digestive, respiratory, genitourinary tract. The preferred route of administration is the transdermal route, for example, through skin patches. Similarly, there is provided a method of treating allergy comprising administering to a patient suffering from or susceptible to allergy the peptides, immunogen or ligand of the invention.
Množství proteinu v každé vakcinační dávce je vybráno jako množství, které indukuje imunoprotektivní ochranu bez ·· · ” ·: ·: · ·· .:The amount of protein in each vaccine dose is selected as an amount that induces immunoprotective protection without ·· · ”·: · · ··.
• .· · ; : * i ; · ······· ... ...•. · ·; : * i; · ······· ... ...
podstatných nežádoucích účinků, které se objevuji u typických vakcín. Takové množství bude kolísat v závislosti na použitém specifickém imunogenu a na způsobu prezentace. V obecném případě se očekává, že každá dávka bude obsahovat 1 až 1 000 pg proteinu, přednostně 1 až 500 pg, výhodnější je 1 až 1 000 pg, přičemž rozmezí 1 až 50 pg je nejvýhodnější rozmezí. Optimální množství v případě určité vakcíny je možné zjistit standardními studiemi, které zahrnuji pozorování vhodné imunitní odezvy u subjektu. Po počáteční vakcinaci se subjektům může aplikovat jedna nebo více adekvátně rozdělených posilujících dávek.significant adverse reactions that occur with typical vaccines. Such amount will vary depending upon the specific immunogen used and the presentation method. Generally, it is expected that each dose will contain 1 to 1000 pg of protein, preferably 1 to 500 pg, more preferably 1 to 1000 pg, with a range of 1 to 50 pg being the most preferred range. The optimum amount for a particular vaccine can be ascertained by standard studies involving observation of a suitable immune response in the subject. Following initial vaccination, subjects may be administered one or more adequately divided booster doses.
Vynález dále popisuje ligandy schopné vázat se na peptidy podle vynálezu. Příklad takových ligandů jsou protilátky (nebo fragmenty Fab). Také se popisuje použití ligandů v medicíně a při výrobě léků pro léčbu alergií. Termín „protilátka znamená molekulu, která vykazuje použitelnou vazebnou specifitu na antigen. Pro odborníky je výhodné, že tento termín také zahrnuje polypeptidy, které jsou fragmenty nebo deriváty protilátek a které mohou vykazovat stejnou nebo podobnou funkci. Takové fragmenty nebo deriváty protilátek také spadají do termínu protilátka.The invention further provides ligands capable of binding to the peptides of the invention. Examples of such ligands are antibodies (or Fab fragments). The use of ligands in medicine and in the manufacture of medicaments for the treatment of allergies is also described. The term "antibody" refers to a molecule that exhibits useful antigen binding specificity. It will be appreciated by those skilled in the art that the term also encompasses polypeptides that are fragments or derivatives of antibodies and which may have the same or similar function. Such antibody fragments or derivatives also fall within the term antibody.
Zvláště preferovanými ligandy jsou monoklonální protilátky. P14/23, P14/31 nebo P14/33 a jsou to monoklonální protilátky, které rozeznávají P8 (které vznikají vakcinaci imunogenem P14). Hybridomy těchto protilátek byly uloženy podle Budapešťské úmluvy v instituci ECACC (European Collection of Cell Cultures, Vaccine Research and Production Laboratory, Public Health Laboratory Service, Centre for Applied Microbiology Research, Porton Down, Salisbury, Wiltshire, SP4 OJG, UK) 26. ledna 2000 s přístupovým číslem 00012610, 00012611, 00012612. Důležitým aspektem vynálezu je použití monoklonálních protilátek při identifikaci novýchParticularly preferred ligands are monoclonal antibodies. P14 / 23, P14 / 31 or P14 / 33, and are monoclonal antibodies that recognize P8 (which are vaccinated with P14 immunogen). Hybridomas of these antibodies were deposited under the Budapest Convention at ECACC (European Collection of Cell Cultures, Vaccine Research and Production Laboratory, Public Health Laboratory Service, Porton Down, Salisbury, Wiltshire, SP4 OJG, UK) on January 26 2000 with accession number 00012610, 00012611, 00012612. An important aspect of the invention is the use of monoclonal antibodies in the identification of new
mimotopů IgE při následném použiti při léčbě alergie a použití protilátek při výrobě léčiva pro léčbu nebo profylaxi alergie. Všechny funkce monoklonálnich protilátek in vivo inhibují uvolnění histaminu z lidských bazofilů a také P14/23 a P14/31 a jak se ukázalo také inhibují pasivní kožní anafylaxi in vivo.IgE mimotopes for subsequent use in the treatment of allergy and use of antibodies in the manufacture of a medicament for the treatment or prophylaxis of allergy. All monoclonal antibody functions in vivo inhibit histamine release from human basophils as well as P14 / 23 and P14 / 31, and have also been shown to inhibit passive cutaneous anaphylaxis in vivo.
Proto mimotopy IgE Cs4, které jsou schopny vázat se na P14/23, P14/31 nebo P14/33 a imunogeny obsahující tyto mimotopy tvoří důležitý aspekt vynálezu. Vakcíny obsahující mimotopy, které jsou schopny vázat se na pl4/23, P14/31 nebo P14/33 jsou použitelné při léčbě alergie.Therefore, IgE Cs4 mimotopes that are capable of binding to P14 / 23, P14 / 31 or P14 / 33 and immunogens comprising these mimotopes form an important aspect of the invention. Vaccines containing mimotopes that are capable of binding to p14 / 23, P14 / 31 or P14 / 33 are useful in the treatment of allergy.
Navíc protilátky vyvolané v jednom zvířeti vakcinací peptidy nebo imunogeny podle vynálezu se mohou čistit a pasivně aplikovat jinému zvířeti za účelem profylaxe nebo terapie alergie. Peptidy podle vynálezu se mohou použít pro vytvoření hybridomů monoklonálnich protilátek (použitím nových metod popsaných například v publikaci Kohler and Milstein, Nátuře, 1975, 256, p495), humanizovaných monoklonálnich protilátek nebo monoklonálů se začleněným CDR, postupy známými v oboru. Takové protilátky se mohou použít při pasivní imunoprofylaxi nebo imunoterapii nebo se používají při identifikaci mimotopů peptidu IgE.In addition, antibodies elicited in one animal by vaccination with the peptides or immunogens of the invention can be purified and passively administered to another animal for the prophylaxis or therapy of allergy. The peptides of the invention can be used to generate hybridomas of monoclonal antibodies (using the novel methods described, for example, in Kohler and Milstein, Nature, 1975, 256, p495), humanized monoclonal antibodies or monoclonals incorporating CDRs, by methods known in the art. Such antibodies can be used in passive immunoprophylaxis or immunotherapy or are used to identify mimotopes of an IgE peptide.
Jako ligandy podle vynálezu se mohou použít při profylaxi nebo léčbě alergie, přičemž se poskytují farmaceutické prostředky obsahující ligandy podle vynálezu. Preferované farmaceutické prostředky vhodné pro léčbu nebo profylaxi 'alergie obsahují monoklonální protilátky P14/23, P14/31 nebo P14/33.They can be used as ligands of the invention in the prophylaxis or treatment of allergy, providing pharmaceutical compositions comprising the ligands of the invention. Preferred pharmaceutical compositions suitable for the treatment or prophylaxis of allergy include the monoclonal antibodies P14 / 23, P14 / 31 or P14 / 33.
Vynález dále může popisovat použití diagnostických testů. Například soubor ligandů, které rozeznávají různé peptidy podle vynálezu, mohou být použity při testování titrůThe invention may further describe the use of diagnostic tests. For example, a set of ligands that recognize the various peptides of the invention can be used in titer testing
protilátky proti IgE v séru odebraném pacientovi. Peptidy se však mohou samotné použít k typování obíhajícího anti-IgE. Za některých okolností je vhodné testovat množství cirkulujícího anti-IgE, například u atopických pacientů a jako takové peptidy a poly/monoklonální protilátky podle vynálezu se mohou použít pro diagnózu atopie. Peptidy se navíc mohou použít pro afinitní odstraněni cirkulujícího anti-IgE z krve pacientů před opětném zavedení krve pacientovi infúzí.anti-IgE antibodies in the serum collected from the patient. However, the peptides can themselves be used to type circulating anti-IgE. In some circumstances, it is appropriate to test the amount of circulating anti-IgE, for example in atopic patients, and as such, the peptides and poly / monoclonal antibodies of the invention may be used to diagnose atopy. In addition, the peptides can be used to affinity remove circulating anti-IgE from patient blood prior to re-introduction of blood to the patient by infusion.
Vynález dále popisuje způsob identifikace peptidových imunogenů pro imunoprofylaxi nebo terapii alergie, které obsahuje použití počítačového modelu struktury IgE a identifikace těchto peptidů IgE, které jsou exponovány na povrchu. Tyto oblasti se pak mohou zavést do imunogenů a použít v medicíně. Podobně použití P14/23, P14/31 nebo P14/33 při identifikaci peptidů pro použití při imunoprofylaxi nebo terapii alergie tvoří část vynálezu.The invention further provides a method of identifying peptide immunogens for immunoprophylaxis or allergy therapy, which comprises using a computer model of the IgE structure and identifying those IgE peptides that are exposed on the surface. These regions can then be introduced into immunogens and used in medicine. Similarly, the use of P14 / 23, P14 / 31 or P14 / 33 in identifying peptides for use in immunoprophylaxis or allergy therapy forms part of the invention.
Příprava vakcíny se v obecném případě popisuje v publikaci New Trends and Developments in Vaccines, ed. Voliér et al., University Park Press, Baltimore, Maryland, U.S.A. 1978. Konjugace proteinů s makromolekulami se popisuje v publikaci Likhite, patent USA č. 4,372,945 a Armor et al., patent USA č. 4,474,757.Vaccine preparation is generally described in New Trends and Developments in Vaccines, ed. Volier et al., University Park Press, Baltimore, Maryland, U.S.A. The conjugation of proteins to macromolecules is described in Likhite, U.S. Patent No. 4,372,945 and Armor et al., U.S. Patent No. 4,474,757.
Přehled obrázků na výkreseOverview of the drawings
Na obrázku č. 1 je zobrazena povrchová expozice Cs3 a Cs4 lidského IgE, jak se vypočítalo z modelu podle Padlana a Davise 1986.Figure 1 shows the surface exposure of Cs3 and Cs4 of human IgE as calculated from the model of Padel and Davis 1986.
Na obrázku č. 2 je zobrazena inhibice uvolněni histaminu a anafylaktogennost antiséra P14. Monoklonální protilátky PTmAb0005 a PTmAbOOll, které se používají jako pozitivní kontroly byly přidány v koncentraci 1 μς/ιπΐ k séru proti BSAFigure 2 shows inhibition of histamine release and anaphylactogenicity of P14 antiserum. Monoclonal antibodies PTmAb0005 and PTmAbOO11, which are used as positive controls, were added at a concentration of 1 μς / ιπΐ to serum against BSA
ředěném 1/100 a 1/500 (konečné ředění). Antisérum proti P14 se přidalo ke konečnému ředění 1/100 a 1/500. Buňky se získaly z alergických pacientů, kteří jsou citliví na travní pyly. Uvolnění histaminu se provedlo inkubací s alergenem pylu trávy.diluted 1/100 and 1/500 (final dilution). Antisera against P14 were added to a final dilution of 1/100 and 1/500. Cells were obtained from allergic patients who are sensitive to grass pollen. Histamine release was performed by incubation with grass pollen allergen.
Na obrázku č. 3 je znázorněna inhibice uvolnění histaminu a anafylagennost antiséra proti P14. Antisérum P14 z různých myší se přidalo v různých ředěních (80x nebo 40x),. aby obsahovalo přibližně 1 μg/ml protilátek proti IgE, jak se stanovilo testem ELISA pro navázání na receptor IgE. Použily se tři negativní kontroly: antisérum proti BSA, nespecifické IgGl a směs nespecifického IgGl ředěného v antiséru proti BSA. Monoklonální protilátka mAbll je monoklonální protilátkou, která je známa tím, že inhibuje uvolnění histaminu a používá se jako pozitivní kontrola (přidá se v koncentraci 2 μς/ml).Figure 3 shows inhibition of histamine release and anaphylagenicity of antiserum against P14. P14 antiserum from different mice was added in different dilutions (80x or 40x). to contain approximately 1 µg / ml anti-IgE antibodies as determined by the IgE receptor binding ELISA. Three negative controls were used: anti-BSA antisera, non-specific IgG1 and a mixture of non-specific IgG1 diluted in anti-BSA antisera. The mAb11 mAb is a monoclonal antibody known to inhibit histamine release and is used as a positive control (added at 2 μς / ml).
Na obrázku č. 4 je zobrazena inhibice uvolnění histaminu a anafylaktogennost antiséra proti P14. Antisérum proti P14 z různých myší se přidalo ke konečnému ředění 1/50. Monoklonální protilátky se přidaly v koncentraci 2 μg/ml buď v testovacím pufru nebo v séru proti BSA v ředění 1/50. Použily se následující tři negativní kontroly antisérum proti BSA, nespecifické IgGl a směs nespecifického IgGl ředěného v antiséru proti BSA. Monoklonální protilátka mAbll je monoklonální protilátka známá tím, že inhibuje uvolnění histaminu a použila se jako pozitivní kontrola (přidala se v koncentraci 2 μg/ml).Figure 4 shows inhibition of histamine release and anaphylactogenicity of anti-P14 antiserum. Anti-P14 antisera from various mice were added to a final dilution of 1/50. Monoclonal antibodies were added at a concentration of 2 µg / ml either in assay buffer or in anti-BSA serum at a 1/50 dilution. The following three negative controls were used as anti-BSA antisera, non-specific IgG1 and a mixture of non-specific IgG1 diluted in anti-BSA antisera. MAb11 is a monoclonal antibody known to inhibit histamine release and was used as a positive control (added at a concentration of 2 μg / ml).
Na obrázku č. 4 je zobrazena protilátková odezva proti peptidů Pil. Peptid Pil se nanesl v koncentraci 1 μς/πιΐ v uhličitanovém pufru při teplotě 4 °C přes noc. Po saturaci ploten se přidalo sériově dvakrát ředěné sérum a inkubovalo se po dobu jedné hodiny při teplotě 37 °C. Vázané IgG se detekovalo anti-myší ' protilátkou značenou biotinem, pak streptavidinem POD a substrátem TMB. Časové body udávají A. 14 dni po vakcinaci 1 a 14 dni po vakcinaci 2, B. 14 dni po vakcinaci 3.Figure 4 shows antibody response against P1 peptides. P1 peptide was loaded at 1 μς / πιΐ in carbonate buffer at 4 ° C overnight. After saturation of the plates, serially twice diluted serum was added and incubated for one hour at 37 ° C. Bound IgG was detected with anti-mouse biotin-labeled antibody, then streptavidin POD and TMB substrate. The time points are A. 14 days after vaccination 1 and 14 days after vaccination 2, B. 14 days after vaccination 3.
Na obrázku č. 6 jsou znázorněny titry anti-Pll IgG antilidského IgE. Lidské IgE se naneslo, v koncentraci 1 μς/ιηΐ. Dvakrát sériově ředěné sérum („sebraný BSA je sebráno z kontrolní skupiny) nebo PTmAb0005 (pozitivní kontrolní monoklonální protilátky) se inkubovaly po dobu jedné hodiny při teplotě 37 °C. Vázaný IgG se detekoval anti-myší protilátkou značenou biotinem.Figure 6 shows anti-P11 IgG titers of anti-human IgE. Human IgE was loaded at a concentration of 1 μς / ιηΐ. Twice serially diluted serum ("collected BSA is collected from control group") or PTmAb0005 (positive control monoclonal antibody) was incubated for one hour at 37 ° C. Bound IgG was detected with an anti-mouse antibody labeled with biotin.
Na obrázku č. 7 jsou znázorněny studie uvolnění histaminu s monoklonálními protilátkami proti P14 s alergickými bazofily, které se získaly od pacientů alergických na roztoče (A10 a All) a travní pyly (G8 a G4) . PT11 (PtmAbOOll) se použily jako pozitivní kontrola a nespecifické IgG2 se použilo jako izotypová kontrola pro P14/23, P14/31 a P14/33.Figure 7 shows histamine release studies with monoclonal anti-P14 antibodies with allergic basophils obtained from mite allergic patients (A10 and All) and grass pollen (G8 and G4). PT11 (PtmAbOO11) was used as a positive control and non-specific IgG2 was used as an isotype control for P14 / 23, P14 / 31 and P14 / 33.
Na obrázku č. 8 je znázorněna struktura oblasti IgE. (A) Každá oblast se skládá ze dvou proti sobě ležících beta-listů, jeden ze 4 anti-paralelnich beta-řetězců (značený 4) a další ze tří anti-paralelnich beta-řetězců (značeno 3) . (B) Sedm řetězců je znázorněno topograficky jako blok označený šipkou až do f rozdělený mezi dva listy, jak je zobrazeno. Konektivita řetězců smyček je topologicky zobrazena v křivce šipkami: prázdné šipky označuji smyčky uvnitř listu a čárkované šipky označují smyčky mezi listy. Ve strukturách oblasti Fc IgGl krátký řetězec c'tvoří část smyčky C-D, jak se předpovědělo v případě oblasti Fc IgE.Figure 8 shows the structure of the IgE region. (A) Each region consists of two opposing beta-sheets, one of 4 anti-parallel beta-chains (labeled 4) and the other of three anti-parallel beta-chains (labeled 3). (B) The seven strings are represented topographically as a block indicated by an arrow up to f divided between two sheets as shown. Loop string connectivity is topologically represented in the curve by arrows: blank arrows indicate loops inside a sheet, and dashed arrows indicate loops between sheets. In the structures of the IgG1 Fc region, the short chain c forms part of the C-D loop as predicted for the Fc IgE region.
Na obrázku č. 9 je A) znázorněno předpokládané strukturální uspořádání sekvencí smyčky A-B oblastí Cs2, 3a 4 lidského IgE s ekvivalentními segmenty z krystalograficky stanovenou strukturu Fc lidského IgGl (oblasti Cy2 a Cy3) .Figure 9 shows A) the predicted structural alignment of the A-B loop sequences of the human IgE Cs2, 3 and 4 regions with equivalent segments from the crystallographically determined Fc structure of human IgG1 (Cy2 and Cy3 regions).
Řetězce beta ve struktuře IgGl jsou podtrženy a označeny jako a a b. Aminokyselinové zbytky každého řetězce jsou číslovány. Vertikální šipky pod blokem sekvencí označují předpokládané optimální krystalizační polohy, značené a spojené čárkovanou a nepřerušovanou čárou, jak je zobrazeno na obrázku č. 10b. (B) je znázorněno předpokládané strukturální uspořádání smyčky c-d Cs2,3 a 4 lidského IgE ve srovnání s Fc lidského IgGl. Řetězce beta ve struktuře IgGl jsou podtrženy a jsou označeny jako c, c'a d. Aminokyselinové zbytky na koncích každého segmentu sekvence jsou číslovány. Zbytky v čárkovaných rámečkách tvoří (Cy2 a Cy3) a nebo se předpokládá, že tvoří (Cs2, zlepšením homologického modelu a experimentem, Cs3, Cs4 modelováním homologie) chráněné jádro ve smyčce. Předpokládá se, že zbytky v prázdných rámečcích jsou zahrnuty do rozeznávání receptorů a/nebo protilátek. Vertikální šipky pod bloky sekvencí označují předpokládané optimální polohy cyklizace, značené a spojené čárkovanou a nepřerušovanou čárou, jak je zobrazeno na obrázku č. 11b.The beta chains in the IgG1 structure are underlined and designated as a and b. The amino acid residues of each chain are numbered. The vertical arrows below the sequence block indicate the expected optimum crystallization positions, indicated and connected by a dashed and continuous line, as shown in Figure 10b. (B) the predicted structural alignment of the c-d loop of Cs2.3 and 4 of human IgE as compared to the Fc of human IgG1. The beta chains in the IgG1 structure are underlined and are designated c, c'and d. The amino acid residues at the ends of each segment of the sequence are numbered. The residues in the dashed boxes form (Cy2 and Cy3) or are believed to form (Cs2, by improving the homology model and experiment, Cs3, Cs4 by modeling the homology) a protected core in the loop. It is believed that residues in the empty boxes are involved in the recognition of receptors and / or antibodies. The vertical arrows below the sequence blocks indicate the expected optimal cyclization positions, indicated and connected by a dashed and continuous line, as shown in Figure 11b.
Na obrázku č. 10 (A) je zobrazena schématická struktura vlásenky A-B v meziprostoru list-list konstantních oblastí Ig. Sousedící antiparalelní beta-řetězce jsou zobrazeny prázdnými šipkami a jsou označeny jako a a b. Zbytky v řetězci a jsou značeny i, zbytky v řetězci b jsou značeny j. Zbytky i + n a j + m, kde oba symboly a a m jsou 0 nebo se rovnají, tvoří část meziprostoru list-list v oblasti. Zbytky i+a a j+m, kde symboly n a m jsou lichá čísla, tvoří část povrchu oblasti vystavené rozpouštědlu. Smyčka A-B je zobrazena jako černá šipka. Obrázek č. 10 (B) zobrazuje schematickou strukturu vlásenky A-B, jako na obrázku č. 3a s polohami zbytků optimálními pro cyklizaci spojenou čárkovanými nebo nepřerušovanými čarami.Figure 10 (A) shows a schematic structure of the hairpin A-B in the leaf-list constant region of the Ig constant regions. Adjacent antiparallel beta-chains are represented by empty arrows and are denoted as a and b. Residues in chain a are labeled i, residues in chain b are labeled j. Residues i + n and n + m, where both a and n are 0 or equal, part of the interspace leaf-list in the area. The residues i + a and j + m, where n and m are odd numbers, form part of the surface of the solvent exposed area. Loop A-B is shown as a black arrow. Figure 10 (B) shows a schematic structure of the hairpin A-B, as in Figure 3a, with residue positions optimal for cyclization coupled with dashed or continuous lines.
Na obrázku č. 11 (A) je znázorněna schématická struktura vlásenky C-D (smyčka plus podporující beta-řetězce) na hraně vnitřního prostoru list-list konstantních oblastí Ig. Protilehlé antiparalelní beta-řetězce jsou zobrazeny jako pevné šipky značené jako c ad. Zbytky podél řetězce c jsou značeny i, zbytky podél řetězce d jsou značeny j. Zbytky i+n a j+m, kde symbol A je liché číslo, ale symbol m je sudé číslo, tvoři v oblasti část meziprostoru list-list. Zbytky i+n a j+m, kde symbol n je 0 nebo sudé číslo, ale symbol m je liché číslo, tvoří část povrchu oblasti exponované v rozpouštědle. Smyčka c-d obsahující krátký řetězec c'je zobrazena černou šipkou. Obrázek č. 11 (B) zobrazuje schématickou strukturu vlásenky c-d s polohami zbytků, které jsou optimální pro cyklizaci spojené přerušovanou a nepřerušovanou čarou.Figure 11 (A) shows a schematic structure of the hairpin C-D (loop plus beta-chain support) at the edge of the inner space of the leaf-list of constant Ig regions. Opposite anti-parallel beta-chains are shown as solid arrows denoted by c and d. The residues along the c chain are denoted i, the residues along the d chain are denoted j. The residues i + n and j + m, where A is an odd number but m is an even number, form part of the leaf-list interspace in the region. The residues i + n and j + m, where n is 0 or an even number, but m is an odd number, form part of the surface area of the solvent exposed area. Loop c-d containing the short chain c'is represented by a black arrow. Figure 11 (B) shows a schematic structure of the hairpin c-d with residue positions that are optimal for cyclization linked by a dashed and continuous line.
Příklady provedení vynálezuDETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION
Část 1: Studie aktivní vakcinacePart 1: Active vaccination studies
Příklad 1:Example 1:
1.1: Identifikace peptidu1.1: Identification of peptide
Peptidy se identifikovaly následujícím postupem.The peptides were identified as follows.
Modelové struktury lidského IgE se popisují v publikaci Padlan and Davies Mol. Immunol., 23, 1063-75, 1986.Model structures of human IgE are described in Padlan and Davies Mol. Immunol., 23, 1063-75 (1986).
Identifikovaly se peptidy, které byly oba kontinuální a exponované v rozpouštědlu. Toho se dosáhlo použitím softwaru molekulární simulace (MSI), aby se vypočítala přístupnost každé aminokyseliny IgE. Přístupný povrch se zprůměrizoval přes průhledné okénko pěti zbytků a čímž se stanovily oblasti peptidu IgE, které měly průměr uvedeného pětiméru větší než 80 A2.Peptides were identified which were both continuous and exposed in solvent. This was achieved using molecular simulation software (MSI) to calculate the accessibility of each amino acid of IgE. Zprůměrizoval accessible surface via the transparent window of five residues, and thereby determine the IgE peptide region having a diameter greater than said pětiméru 80 A second
Výsledky testu jsou zobrazeny na obrázku č. 1.The test results are shown in Figure 1.
• ·• ·
VýsledkyResults
Na obrázku č. 1 existují čísla přirozených peptidů, které se mohou použít jako imunogeny pro vznik protilátek proti IgE.In Figure 1, there are natural peptide numbers that can be used as immunogens for the production of anti-IgE antibodies.
Vedle těchto peptidů identifikovaných shora v textu za použití stejného selekčního kritéria s modelem IgE popsaného v publikaci Helm et al. se identifikovaly následující peptidy (strukturní model 2IgE uložený 2/10/90 v PDB (Protein Data Bank, Research Collaboratory for Structural Bioinformatics, http:/pdb-browsers.ebi.ac.uk) ) .In addition to these peptides identified above using the same selection criteria with the IgE model described by Helm et al. the following peptides were identified (the 2IgE structural model deposited 2/10/90 in PDB (Protein Data Bank, Research Collaboratory for Structural Bioinformatics, http: / pdb-browsers.ebi.ac.uk)).
Tabulka č. 5: Peptidy identifikované použitím modelu podleTable 5: Peptides identified using the
Helma at al 1990Helma at al 1990
• · ·• · ·
Tyto peptidy nebo jejich mimotopy se syntetizovaly a spojovaly s nosičovými proteiny za účelem použití ve studiích imunogenností.These peptides or mimotopes thereof were synthesized and coupled to carrier proteins for use in immunogenicity studies.
Příklad 1.2: Syntéza konjugátů peptidů IgE/proteinu D použitím sukcinimidmaleimidového síťovacího činidlaExample 1.2: Synthesis of IgE / Protein D peptide conjugates using succinimide maleimide crosslinking agent
Protein D se může spojovat přímo s peptidy IgE za vzniku antigenů podle vynálezu použitím sukcinimidmaleimidového síťovacího činidla. Tento chemický postup umožňuje kontrolovanou aktivaci NH2 nosičových zbytků fixováním sukcinimidové skupiny. Maleímidové skupiny jsou místa vázající cystein. Proto pro účely následujících příkladů peptidy IgE, aby se konjugovaly, vyžadují přidání N-terminálního cysteinu.Protein D can be coupled directly to IgE peptides to produce antigens of the invention using a succinimide maleimide crosslinking agent. This chemical procedure allows the controlled activation of the NH 2 carrier residues by fixing the succinimide group. Maleimide groups are cysteine binding sites. Therefore, for the purposes of the following examples, IgE peptides require the addition of an N-terminal cysteine to conjugate.
Spojovací činidlo je selektivní heterobifunkční síťovací činidlo, kdy jeden konec sloučeniny aktivuje aminoskupinu proteinového nosiče sukcinimidylesterem a druhý konec připojuje sulhydrylovou skupinu peptidů maleimidoskupinou. Reakční schéma je následující:The coupling agent is a selective heterobifunctional crosslinking agent wherein one end of the compound activates the amino group of the protein carrier with the succinimidyl ester and the other end attaches the sulhydryl group of the peptides to the maleimido group. The reaction scheme is as follows:
a. Aktivace proteinu reakcí mezi lyzinem a sukcinimidylesterema. Activation of protein by reaction between lysine and succinimidyl ester
b. Interakce mezi aktivovaným proteinem a peptidovým cysteinemb. Interaction between activated protein and peptide cysteine
Příklad 1.3: Příprava konjugátu peptid IgE - protein DExample 1.3: Preparation of IgE-D protein conjugate
Protein D se rozpustil ve fyziologickém roztoku pufrovaném fosforečnanem s hodnotou pH 7,2 a koncentrace je 2,5 mg/ml. Interakční činidlo (Ν-ίγ-maleimidobutyryloxyJsukcinimidester, GMBS) se rozpustilo v DMSO při koncentraci 102,5 mg/ml a přidal se roztok proteinu. 1, 025 mg GMBS se použilo pro 1 mg proteinu D. Reakční roztok se inkuboval po dobu jedné hodiny při teplotě místnosti. Vedlejší produkty se odstranily v kroku odstranění solí na permeačním gelu sephacryl 200HR. Eluační činidlo je fyziologický roztok pufrovaný fosforečnanem s 0,1 % Tween 80 při pH 6,8. Sebraly se aktivované proteiny a slily se dohromady. Peptidy (jak se uvádí v tabulce 4 nebo 5 nebo jejich deriváty nebo mimotopy ) se rozpustily v koncentraci 4 mg/ml v 0,1 M kyselině octové, aby se zabránilo tvorbě vazby S-S. Pro interakci se použil molární poměr 2 až 20 peptidů na 1 aktivovaný protein D. K proteinu se pomalu přidává roztok peptidu a směs se inkubovala po dobu 1 hodiny při teplotě 25 °C. Hodnota pH během fáze interakce se udržovala na hodnotě 6,6. Krok ukončení se provedl přidáním cysteinu (0,1 mg cysteinu na jeden miligram aktivovaného -PD rozpuštěného v koncentraci 4 mg/ml kyseliny octové v koncentraci 0,1 M) po dobu 30 minut při teplotě 25 °C a hodnota pH je 6,5. Aby se odstranil nadbytek cysteinu nebo peptidu uskutečnily se dvě dialýzy proti NaCl v koncentraci 150 mM 0,1 % Tween 80.Protein D was dissolved in phosphate buffered saline, pH 7.2, and the concentration was 2.5 mg / ml. The interaction reagent (β-γ-maleimidobutyryloxy) succinimide ester (GMBS) was dissolved in DMSO at a concentration of 102.5 mg / ml and a protein solution was added. 1.025 mg of GMBS was used for 1 mg of protein D. The reaction solution was incubated for one hour at room temperature. The by-products were removed in the salt removal step on a sephacryl 200HR permeation gel. The eluent is phosphate buffered saline with 0.1% Tween 80 at pH 6.8. Activated proteins were collected and pooled. Peptides (as shown in Table 4 or 5 or derivatives or mimotopes thereof) were dissolved at a concentration of 4 mg / ml in 0.1 M acetic acid to prevent S-S binding. A molar ratio of 2 to 20 peptides per 1 activated protein D was used for the interaction. The peptide solution was slowly added to the protein and the mixture was incubated for 1 hour at 25 ° C. The pH was maintained at 6.6 during the interaction phase. The completion step was performed by adding cysteine (0.1 mg cysteine per milligram of activated -PD dissolved at 4 mg / ml acetic acid at 0.1 M) for 30 minutes at 25 ° C and a pH of 6.5 . To remove excess cysteine or peptide, two dialysis against NaCl was performed at a concentration of 150 mM 0.1% Tween 80.
Poslední krok je sterilní filtrace přes membrány s póry o velikosti 0,22 mikrometrů. Konečný produkt je filtrovatelný roztok konzervovaný při teplotě 4 °C. Konečný poměr peptid/PD se může stanovit analýzou aminokyselin.The final step is sterile filtration through 0.22 micron pore membranes. The final product is a filterable solution preserved at 4 ° C. The final peptide / PD ratio can be determined by amino acid analysis.
Analogickým způsobem se mohou konjugovat peptidy podle vynálezu s jinými nosiči, které zahrnují BSA. Předem aktivované BSA je možné běžně získat od firmy Pierce lne..In an analogous manner, peptides of the invention may be conjugated to other carriers that include BSA. Pre-activated BSA can be conveniently obtained from Pierce Inc.
Syntetizovaly se mimotopy P8 (P14, SEQ ID NO: 20, CLEDGQVMDVDLL) a P5 (PH, SEQ ID NO: 8, CRASGKPVNHSTRKEEKQRNGLL) , které se spojily s proteinem D a BSA použitím shora popsaných postupů.P8 (P14, SEQ ID NO: 20, CLEDGQVMDVDLL) and P5 (PH, SEQ ID NO: 8, CRASGKPVNHSTRKEEKQRNGLL) mimotopes were synthesized, which were coupled to protein D and BSA using the procedures described above.
Příklad 1.4: Způsoby ELISAExample 1.4: ELISA Methods
Test ELISA proti peptidu nebo proti peptidovému nosičiELISA against peptide or peptide carrier
Imunitní odezvy proti peptidu a proti nosiči se zkoumaly za použití dále uvedeného postupu ELISA. Mikrotitrační destičky (Nunc) se potáhly specifickým antigenem v PBS (při teplotě 4 °C přes noc) buď streptavidinem v koncentraci 2 gg/ml (pak následuje inkubace s peptidem značeným biotinem (1 μΜ) po dobu jedné hodiny při teplotě 37 °C, promyly se třikrát 0,1 % PBS-Tween 20. Destičky se saturovaly pufrem PBS-BSA 1%-Tween 20 1% (pufr Sat) po dobu jedné hodiny při teplotě 37 °C. Přidá se 1° protilátky, což znamená sérum ve dvoustupňovém ředění (v pufru Sat) , vše se inkubovalo po dobu 1 hod 30 min při teplotě 37 °C. Promytí proběhlo třikrát. Přidalo se 2° anti-myšího Ig (nebo anti-myšího izotypu specifických monoklonálních protilátek) spojených s HRP. Vše se inkubovalo po dobu jedné hodiny při teplotě 37 °C. Promytí se provedlo 5x. Vyvíjení se uskutečnilo s TMB (BioRad) po dobu 10 minut při teplotě místnosti ve tmě. Blokační reakce proběhla s 0,4 N H2SO4.Immune responses against the peptide and the vehicle were examined using the ELISA procedure below. Microtiter plates (Nunc) were coated with specific antigen in PBS (at 4 ° C overnight) with either 2 gg / ml streptavidin (followed by incubation with biotin-labeled peptide (1 μΜ) for one hour at 37 ° C, Wash three times with 0.1% PBS-Tween 20. Plates were saturated with PBS-BSA 1% -Tween 20 1% buffer (Sat buffer) for 1 hour at 37 ° C. 2-step dilution (in Sat buffer), incubated for 1 hour 30 min at 37 ° C. Washing three times, adding 2 ° anti-mouse Ig (or anti-mouse isotype specific monoclonal antibodies) associated with HRP. Incubation was performed with TMB (BioRad) for 10 minutes at room temperature in the dark with a blocking reaction of 0.4 N H2SO4.
Způsob detekce reaktivity proti lidskému IgE v myším séru (test ELISA, kdy na plotny se váže IgE)Method for Detection of Reactivity Against Human IgE in Mouse Serum (ELISA Assaying IgE Binding to Plates)
Destičky vhodné pro test ELISA se potáhly lidskými chimérovými IgE v koncentraci 1 pg/ml při pH 9,6 potahovacím t pufrem uhličitan/hydrogenuhličitan po dobu jedné hodiny při teplotě 37 °C nebo přes noc při teplotě 4 °C. Nespecifická vazebná místa jsou blokována pufrem PBS/0,05 % Tween 20, který obsahuje 5 % (hmot./objem) mléčného prášku Marvel po dobu 1 hod. při teplotě 37 °C. Pak se přidalo sériové ředění myšího séra v pufru PBS/0,05 % Tween 20/ 1 % (hmot./obj em) BSA/ 4 % séra čerstvě narozených telat a směs se nechala inkubovat po dobu 1 hod při teplotě 37 °C. Navázáni na polyklonální sérum se detekovalo kozím anti-myším IgG-biotin (1/200) následovaným streptavidinem-HRP (1/1 000). Konjugované protilátky se detekovaly substrátem TMB při vlnové délce 450 nm. Standardní křivka PTmAbOOll je zahrnuta na každé destičce tak, že je možné ve vzorcích séra vypočítat reaktivitu proti IgE v pg/ml.ELISA plates were coated with 1 µg / ml human chimeric IgE at pH 9.6 with carbonate / bicarbonate coating t buffer for one hour at 37 ° C or overnight at 4 ° C. Non-specific binding sites are blocked with PBS / 0.05% Tween 20 containing 5% (w / v) Marvel milk powder for 1 hour at 37 ° C. Serial dilutions of mouse serum in PBS / 0.05% Tween 20/1% (w / v) BSA / 4% serum of newly born calves were then added and incubated for 1 hour at 37 ° C. Binding to polyclonal serum was detected in goat anti-mouse IgG-biotin (1/200) followed by streptavidin-HRP (1/1000). Conjugated antibodies were detected with TMB substrate at 450 nm. A standard PTmAbOO11 curve is included on each plate so that it is possible to calculate IgE reactivity in pg / ml in serum samples.
Soutěžení navázání IgE s peptidy mimotopu, rozpustným IgE nebo PTmAbOOllCompetition for IgE binding with mimotope peptides, soluble IgE or PTmAbOO11
Jednoduché ředění polyklonálního myšího séra se smíchalo s jedinou koncentrací buď peptidu mimotopu nebo lidského IgE v předem blokované polypropylenové destičce s 96 prohlubněmi. Směsi se inkubovaly po dobu jedné hodiny při teplotě 37 °C a pak se přidaly na destičky pro test ELISA potažené IgE po dobu 1 hodiny při teplotě 37 °C. Navázání polyklonálního séra se detekovalo kozími anti-myšími IgG značeným biotinem (1/2 000) a pak streptavidinem-HRP (1/1 000) . Konjugovaná protilátka se detekovala se subtrátem TMB při vlnové délce 450 nm. V případě soutěže mezi sérem a PTmAbOOll o navázání na IgE se směsi séra •·· ·♦ * 9· • » • ·· • · • · ·· ··· a PTmAbOOll značené biotinem přidaly na destičky vhodné pro test ELISA potažené IgE. Navázání PTmAbOOll se detekovalo pomocí Streptavidinu-HRP (1/1 000).Single dilution of polyclonal mouse serum was mixed with a single concentration of either mimotope peptide or human IgE in a pre-blocked 96-well polypropylene plate. The mixtures were incubated for 1 hour at 37 ° C and then added to IgE coated ELISA plates for 1 hour at 37 ° C. Binding of polyclonal serum was detected with biotin labeled goat anti-mouse IgG (1/2000) and then streptavidin-HRP (1/1000). The conjugated antibody was detected with TMB substrate at 450 nm. In the case of competition between serum and PTmAbOO11 for IgE binding, serum mixtures of biotin-labeled serum and PTmAbOO11 were added to IgE-coated ELISA plates. PTmAbOO11 binding was detected with Streptavidin-HRP (1/1000).
Přiklad 1.5: Testy lidských bazofilůExample 1.5: Human basophil assay
S lidskými bazofily se stanovilaIt was determined with human basophils
Jedním se protilátek, a druhý se způsobené s monoklonálními protilátkami.One is with antibodies, and the other is caused with monoclonal antibodies.
uskutečnily dva typy testů (HBA). anafylaktogennost monoklonálních přičemž se k izolovanému používá k měření inhibice uvolněním histaminuconducted two types of tests (HBA). monoclonal anaphylactogenicity wherein the isolated is used to measure histamine release inhibition
PBMC přidají protilátkyPBMCs add antibodies
Lol PI (silný alergen) pre-inkubacíLol PI (strong allergen) by pre-incubation
HBAHBA
Krev se získala z cév alergických ve zkumavkách obsahujících heparin a donorů a shromáždila se čistily nejsou erytrocyty. Buňky se promyly jednou v se a resuspendovaly se v HBH/HSA při hustotě buněk v jednom mililitru. Do prohlubní se buňky, které HBH/HSA, potáhly buněk 2.0 x 106 destiček s 96 prohlubněmi s dnem ve tvaru V, které obsahujíBlood was obtained from allergic blood vessels in tubes containing heparin and donors and collected to clean non-erythrocytes. Cells were washed once per second and resuspended in HBH / HSA at a cell density of one milliliter. In the wells, HBH / HSA cells were coated with 2.0 x 10 6 cells of 96-well V-bottom plates containing
100 μΐ ředěného testovaného vzorku, se přidalo 100 μΐ buněčné suspenze nebo monoklonálních protilátek. Každý testovaný vzorek se testoval každé ředění. Obsahy v rozmezí ředění s buněk se smíchaly za teplotě 37 °C po dobu prohlubněmi pro použití míchačky a minut.100 μΐ of diluted test sample, 100 μΐ of cell suspension or monoclonal antibodies was added. Each test sample was tested at each dilution. The contents in the dilution range with the cells were mixed at 37 ° C for wells for minutes and using a mixer.
V případě každého ředěni séra se do pak tří prohlubní se přidalo 10 μΐ HBH/HSA, anafylaktogennost.For each serum dilution, 10 µΐ HBH / HSA, anaphylactogenicity, was added to the three wells.
míchačky a použití dalších minut.mixer and use additional minutes.
po dobu minut.for minutes.
se inkubovaly při prohlubni přidalowere incubated with the wells added
1/1 aby se1/1 make up
Obsahy prohlubní se opět pak se inkubovaly při teplotě Inkubace je ukončena centrifugaci histaminový test za pro stanovení EIA histaminu používají kontrolní prohlubně provedl a do 3 odhadla zamíchaly za °C po dobu při 500 g se v nichThe contents of the wells were then incubated again at the temperature. Incubation was terminated by centrifugation. The histamine assay was used to determine the EIA of histamine using control wells performed and shaken up to 3 ° C for 500 g with them.
Supernatanty se separovaly, aby použití komerčně dostupného kitu (Immunotech) . Rutině se v testu obsahující buňky bez testovaného · · * · · · • · ♦ ♦ · · · · · • · · · · · · ♦· «9·· ··· ··· ·· ··· vzorku, aby se stanovilo spontánní a spuštěné uvolnění. Vzorky buněk se lyžovaly dvojnásobným zmrazením/rozmrazením a testovalo se celkové množství histaminu obsažené v buňkách.Supernatants were separated to use a commercially available kit (Immunotech). Routine in a test containing cells without a test sample to make a sample to spontaneous and triggered release was determined. Cell samples were lysed by double freezing / thawing and assayed for the total amount of histamine contained in the cells.
Výsledky se vyjádřily následujícím způsobem:The results were expressed as follows:
Test anafylaktogennosti:Anaphylactogenicity test:
uvolnění histaminu způsobené testovanými vzorky = % uvolnění histaminu z buněk ošetřených testovacím vzorkem - % histaminu uvolněného spontánněhistamine release caused by test samples =% histamine release from test sample treated cells -% histamine released spontaneously
Blokační test:Block test:
Stupeň inhibice uvolnění histaminu se může vypočítat za použití vzorce:The degree of inhibition of histamine release can be calculated using the formula:
% inhibice =% inhibition =
1-(histamin uvolněný z buněk ošetřených testovaným vzorkem*) (uvolnění histaminu z buněk stimulovaných antigenem*) x 1001- (histamine released from cells treated with test sample *) (histamine release from antigen-stimulated cells *) x 100
Hodnoty jsou v případě spontánního uvolnění upraveny.The values are adjusted in case of spontaneous relaxation.
Příklad 2: Imunizace myší s konjugáty P14 (P14-BSA, P14-BSA) indukují produkci protilátek proti lidskému IgEExample 2: Immunization of mice with P14 conjugates (P14-BSA, P14-BSA) induce the production of antibodies against human IgE
Konjugáty obsahující mimotop P14 (25 pg proteinu/v dávce) popsané v příkladu 1 se aplikovaly do skupin 10-ti myší BalbC, kde se jako adjuvans použila emulze oleje a vody obsahující QS21 a 3D-MPL popsaný v dokumentu WO 95/17210. Posilující dávka se uskutečnila v dny 14, 24 a 72, séra se sklidila 14 dní po každé imunizaci.The conjugates containing the P14 mimotope (25 µg protein / dose) described in Example 1 were administered to groups of 10 BalbC mice using an oil-water emulsion containing QS21 and 3D-MPL described in WO 95/17210 as adjuvant. Booster dose was performed on days 14, 24 and 72, sera harvested 14 days after each immunization.
Imunitní odezvy proti peptidu a proti IgE vázanému na IgE se sledovaly použitím metod ELISA popsaných v příkladu 1. V antiséru se pak testovala anafylaktogennost a funkční • · ··φ • φ· ·φ ♦ *φ« • · · · ·φ ♦ φ · · φ φ* φ · · ·· • φφφ ··· φφ φφφ aktivita při inhibici uvolnění histaminu z lidských alergických bazofilů (metody, jak se popisuje v přikladu 1) .Immune responses against the peptide and against IgE bound to IgE were monitored using the ELISA methods described in Example 1. Anaphylactogenicity and functional were then tested in the antiserum and functional. The activity to inhibit the release of histamine from human allergic basophils (methods as described in Example 1).
Výsledky imunogennostiResults of immunogenicity
Oba konjugáty PD-P14 a BSA-P14 byly schopny indukovat imunitní odezvu proti P14 a proti IgE. Výsledky v případě anti-peptidu a odezev proti IgE indukovaných konjugáty BSAP14, jak se měřilo v den 14 po třetí a čtvrté vakcinaci, jsou zobrazeny v tabulce č. 6. PTmAbOOll je monoklonální protilátka, o které je známo, že váže oblast Cs2 IgE a použila se ke kvantifikaci odezev proti IgE a vyjádřila se v μς/πτί.Both PD-P14 and BSA-P14 conjugates were able to induce an immune response against P14 and against IgE. Results for anti-peptide and anti-IgE responses induced by BSAP14 conjugates, as measured on day 14 after the third and fourth vaccination, are shown in Table 6. PTmAbOO11 is a monoclonal antibody known to bind the Cs2 region of IgE and it was used to quantify IgE responses and expressed in μς / πτί.
Tabulka č. 6: Výsledky imunogennosti v případě konjugátů BSAP14Table 6: Immunogenicity results for BSAP14 conjugates
poznámky: AV(průměr), SD(střední odchylka), GM(geometrický průměr)notes: AV (mean), SD (mean deviation), GM (geometric mean)
Myši vakcinované samotným BSA, které slouží jako kontroly netvoří žádné detekovatelné odezvy na peptid nebo IgE.Mice vaccinated with BSA alone as controls do not produce any detectable responses to the peptide or IgE.
Výsledky funkční aktivityResults of functional activity
Zjistilo se, že antisérum vzniklé vakcinaci P14 je funkční tím, že je účinné při inhibici uvolnění histaminu z alergických lidských bazofilů po vyvolání alergenem (popisuje se na obrázcích č. 2,3 a 4). Nezjistilo se však, že sérum je anafylaktogenní (zobrazeno na obrázku č. 2, 3 a 4).It has been found that the antiserum resulting from P14 vaccination is functional in that it is effective in inhibiting histamine release from allergic human basophils upon allergen induction (see Figures 2,3 and 4). However, the serum was not found to be anaphylactogenic (shown in Figures 2, 3 and 4).
ShrnutíSummary
Ukázalo se, že P14 (mimotop P8) je schopen vytvořit u myši vysoké titry protilátek proti pl4 a proti IgE. Následně se ukázalo, že tyto protilátky jsou funkční tím, že inhibují uvolnění histaminu z alergických lidských bazofilů a nejsou anafylaktogenní. P14 a P8 se proto mohou použít při léčbě nebo profylaxi alergie.P14 (mimotope P8) has been shown to be able to generate high titers of anti-p14 and anti-IgE antibodies in mice. Subsequently, these antibodies have been shown to be functional by inhibiting histamine release from allergic human basophils and are not anaphylactogenic. Therefore, P14 and P8 can be used in the treatment or prophylaxis of allergy.
Příklad 3: Imunizace myší s konjugáty Pil (Pll-BSA, Pll-BSA) vyvolá produkci protilátek proti lidskému IgEExample 3: Immunization of mice with Pil conjugates (P11-BSA, P11-BSA) induces production of antibodies against human IgE
Epitop peptidů Pil lidského IgE se spojil s BSA (Pierce) aktivovaným maleimidem (BSA-CRASGKPVNHSTRKEEKQRNGLL). 25 μg konjugátu vytvořeného v SBAS2 se zavedlo injekcí IM osmi samicím myší BALB/c v den 0, 14 a 28. Jedné kontrolní skupině myší se injekcí zavedlo BSA/SBAS2. Krevní vzorky se odebraly 14 dní po každé injekci (uskutečnily se čtyři odběry v den 24 po 3, aby se zvýšila dostupnost séra). Protilátky proti peptidů a IgE vzniklé vakcinaci se měřily testem ELISA, jak se popisuje v příkladu 1.The epitope of P1 peptides of human IgE was linked to maleimide-activated BSA (Pierce) (BSA-CRASGKPVNHSTRKEEKQRNGLL). 25 µg of conjugate formed in SBAS2 was injected IM with eight BALB / c female mice on days 0, 14 and 28. One control group of mice was injected with BSA / SBAS2. Blood samples were taken 14 days after each injection (four samples were taken on day 24 after 3 to increase serum availability). Peptide and IgE vaccine-derived antibodies were measured by ELISA as described in Example 1.
VýsledkyResults
Homogenní odezva IgG proti Pil by se mohla detekovat už po první injekci, ale po druhé a třetí injekci se dále zvyšovala (obrázek č. 5a a 5b). Všechny myši vykazovaly odezvu proti IgE (která je v rozmezí 28 až 244 μg/ml, jak se exprimovalo v ekvivalentech mAb005) po třetí injekci (obrázek č. 6).A homogeneous anti-Pil IgG response could be detected after the first injection, but increased further after the second and third injections (Figures 5a and 5b). All mice showed an anti-IgE response (which is in the range of 28 to 244 µg / ml as expressed in mAb005 equivalents) after the third injection (Figure 6).
Část 2: Funkční aktivita monoklonálnich protilátek specifických pro epitopPart 2: Functional activity of epitope-specific monoclonal antibodies
Příklad 4:Example 4:
Funkční aktivita monoklonálních protilátek vytvořených proti P14Functional activity of monoclonal antibodies raised against P14
Vytvořily se monoklonální protilátky, které specificky rozeznávají P8 a jejich mimotopy za použití postupů známých v oboru. Konjugát P14-BSA popsaný v části 1 těchto příkladů se zavedl injekcí do skupin myší Balb/C s adjuvans (o/hmot.), které obsahuje QS21 a 3D-MPL. Odebraly se buňky sleziny a fúzovaly se s buněčnou linií nádorových buněk B SP2/O a u supernatantů se testovala reaktivita proti peptidů P14 a IgE. Vytvořilo se několik buněčných linií, kterými jsou P14/23, P14/31 a P14/33, které jsou uloženy podle Budapešťské úmluvy v instituci ECACC 26/1/00 s přístupovým číslem 00012610, 00012611, 00012612. Potvrdilo se, že všechny tři monoklonální protilátky se váží na IgE. Zvláště za použití vazebných testů ELISA se ukázalo, že P14 se specificky váží na IgE a dále se použily P14 kompetitivní testy proti monoklonální protilátce vázající se na IgE.Monoclonal antibodies have been generated that specifically recognize P8 and its mimotopes using techniques known in the art. The P14-BSA conjugate described in Part 1 of these examples was injected into groups of adjuvanted Balb / C mice (w / w) containing QS21 and 3D-MPL. Spleen cells were harvested and fused to the B cell line SP2 / O and the supernatants tested for reactivity against P14 and IgE peptides. Several cell lines, P14 / 23, P14 / 31 and P14 / 33, were deposited under the Budapest Convention at ECACC 26/1/00 with accession numbers 00012610, 00012611, 00012612. It was confirmed that all three monoclonal antibodies bind to IgE. Especially using ELISA binding assays, it was shown that P14 specifically binds to IgE and further used P14 competitive assays against an IgE binding monoclonal antibody.
Funkční aktivita těchto monoklonálních protilátek se testovala testy inhibice uvolnění histaminu z lidských bazofilů, jak se popisuje v příkladu 1.The functional activity of these monoclonal antibodies was tested by inhibiting histamine release from human basophils as described in Example 1.
VýsledkyResults
Všechny monoklonální protilátky P14 se testovaly na bazofilech odebraných ze čtyř různých alergických pacientů (A pacienti byli alergičtí na antigen roztoče, G pacienti byli alergičtí na travní pyly)· PT11 (PTmAbOOll) zahrnují jako pozitivní kontrolu protilátky, o kterých se ví, že inhibují uvolnění histaminu in vitro. Všechny tři monoklonální protilátky P14 (23, 31 a 33) jsou účinné při inhibici uvolnění histaminu z alergických bazofilů (zobrazeno na obrázku č. 7).All P14 monoclonal antibodies were tested on basophils taken from four different allergic patients (A patients were allergic to mite antigen, G patients were allergic to grass pollen) · PT11 (PTmAbOO11) includes antibodies known to inhibit release as positive control histamine in vitro. All three P14 monoclonal antibodies (23, 31 and 33) are effective in inhibiting histamine release from allergic basophils (shown in Figure 7).
Příklad 5:Example 5:
Protilátky protiAntibodies against
IgE vyvolané po imunizaci s konjugátem jsou schopné blokovat lokální alergickou odezvu v modelu opičí kožní anafylaxeIgE induced after immunization with conjugate are able to block local allergic response in monkey skin anaphylaxis model
U P14/23 a P14/31 se také testovala aktivita in vivo. Seškrábaly se lokální kožní žírné buňky Afrických zelených opic a intradermální aplikací 100 ng IgE proti NP (lidské IgE proti nitrofenylacetylu (NP), získaly se od firmy Serotech) do obou paží se zvýšila jejich citlivost. Po 24 hodinách se dávkové rozmezí monoklonálních protilátek zavedlo injekcí do stejného místa aplikace jako lidské IgE do jedné paže. Do kontrolních míst na opačné paži stejných zvířat se aplikoval fyziologický roztok pufrovaný fosforečnanem (PBS) nebo nespecifický lidský IgE (specifický pro lidský cytomegalovirus (CMV.) nebo lidský virus lidské imunitní nedostatečnosti (HIV)). Po 5 hodinách 10 mg konjugátu BSA-NP (získaného od firmy Biosearch Laboratories) se aplikoval intravenózní injekcí. Po 15 až 30 minutách se u kontrolních zvířat z anafylaxe vyvinul snadno pozorovatelný skoro cirkulární edém, který je možné měřit v milimetrech. Výsledky jsou exprimovány buď jako hodnoty středního průměru otoku ve skupině tří opic nebo jako procento inhibice v porovnání s kontrolami PBS. PTmAbOOll je monoklonální protilátka používaná jako pozitivní kontrola. SbmAb0006 se použily jako negativní kontrola.P14 / 23 and P14 / 31 were also tested for in vivo activity. The local skin mast cells of African Green Monkeys were scraped and their sensitivity was increased by intradermal administration of 100 ng of anti-NP IgE (human anti-nitrophenylacetyl (NP) IgE, obtained from Serotech). After 24 hours, the dose range of the monoclonal antibodies was injected into the same injection site as human IgE into one arm. Phosphate buffered saline (PBS) or non-specific human IgE (specific for human cytomegalovirus (CMV.) Or human human immunodeficiency virus (HIV)) was applied to control sites on the opposite arm of the same animals. After 5 hours, 10 mg of BSA-NP conjugate (obtained from Biosearch Laboratories) was injected intravenously. After 15 to 30 minutes, control animals from anaphylaxis developed an easily observable near-circular edema, which can be measured in millimeters. The results are expressed either as mean mean swelling values in a group of three monkeys or as a percentage of inhibition compared to PBS controls. PTmAbOO11 is a monoclonal antibody used as a positive control. SbmAb0006 were used as a negative control.
Tabulka č. 7: výsledky P14/23Table 7: Results P14 / 23
• ·· · · 9« ·· · · ·· ·· « « « • · · · · · ♦ · · · · · · · t · · · · ·9 9 «9 9 9« «« «t t t t t t t t t 9
Tabulka č. 8: výsledky P14/31Table 8: Results P14 / 31
I když se pozorovala inhibice anafylaxe vyššími dávkami monoklonální protilátky, tyto protilátky nejsou samy o sobě anafylaktogenní, když se aplikuji in vivo.Although inhibition of anaphylaxis by higher doses of monoclonal antibody has been observed, these antibodies are not themselves anaphylactogenic when administered in vivo.
Příklad 6: Strukturální aspekty mimotopů IgEExample 6: Structural aspects of IgE mimotopes
Vynález popisuje, že konformace, ve kterých epitopy nebo mimotopy podle vynálezu jsou důležité při rozeznávání protilátek proti mimotopům a také při schopnosti peptidů vytvořit silné imunitní odezvy proti IgE. Vynález popisuje vyvinutá strukturální pravidla, které předpokládají optimální místa cyklizace peptidu. Peptidy, který používají tato místa cyklizace tvoří preferovaný aspekt vynálezu.The invention discloses that conformations in which the epitopes or mimotopes of the invention are important in recognizing antibodies against mimotopes as well as in the ability of peptides to produce strong immune responses against IgE. The invention describes developed structural rules that assume optimal peptide cyclization sites. Peptides that use these cyclization sites form a preferred aspect of the invention.
Protože celá struktura IgE Fc nebyla stanovena, zdokonalili se dostupné modely (popisuje se v publikaci Helm et al., Padlan and Davis, Mol. Immunol., 23, 1063-75, 1986) použitím známé struktury Cy2 a Cy3 IgGl (popisuje se v publikaci Deisenhofer J., 1981, Biochemistry, 20, 23612370). Navíc se porovnáním se známými strukturami balící jednotky Ig vytvořily modely oblasti Cs2. Vynálezci navrhly tyto modely homologie IgE Fc a tím předpověděli konečnou a makroskopickou strukturu smyček prostoru mezi listy (smyčka AB, obrázek č. 9A) a smyček vně listů oblastí IgE Fc (smyčka CD, zobrazeno na obrázku č. 9B) . Předpokládané smyčky mají definované předpokládané smyčky A-B a C-D IgE Fc s jejich • · · · · φ · φ · • · · φ · · φ Φ·· ΦΦΦΦ φ·φ ··· ·Φ 4·φ podporujícími beta-řetězci, mimotopy smyček mohou být získány z primární sekvence divokého typu (WT) každé smyčky kovalentní cyklizace mezi vybranými specifickými zbytky podél sousedících beta-řetězců. Cyklizace se s výhodou uvolní vytvořením disulfidové vazby mezi terminálními cysteiny, které se proto kombinují, aby se staly cystinem.Since the entire IgE Fc structure has not been determined, the available models have been improved (Helm et al., Padlan and Davis, Mol. Immunol., 23, 1063-75, 1986) using the known structure of Cy2 and Cy3 IgG1 (described in Deisenhofer J., 1981, Biochemistry, 20, 23612370). In addition, models of the Cs2 region were generated by comparison with known structures of the Ig packaging unit. The inventors designed these models of IgE Fc homology thereby predicting the final and macroscopic structure of the leaf-space loops (loop AB, Figure 9A) and the loops outside the leaves of the IgE Fc regions (CD loop, shown in Figure 9B). Assumed loops have defined anticipated AB and CD IgE Fc loops with their beta-chain, mimotope-enhancing loops, Φ · ΦΦΦΦ · ΦΦΦΦ · · · · · · · · · · · · · The loops can be obtained from the primary wild-type sequence (WT) of each loop of covalent cyclization between selected specific residues along adjacent beta-chains. The cyclization is preferably released by forming a disulfide bond between the terminal cysteines, which are therefore combined to become cystine.
Na základě strukturálních uspořádání (zobrazeno na obrázku č. 9A a 9B) se odvodily snadno předpokládaná pravidla za účelem zvýšit pravděpodobnost, že konformace adoptované mimotopem po konjugaci s vhodnou molekulou nosiče jsou podobné konformacím rodičovského epitopu.Based on the structural arrangements (shown in Figures 9A and 9B), easily predicted rules were derived to increase the likelihood that conformations adopted by the mimotope upon conjugation with a suitable carrier molecule are similar to those of the parental epitope.
Pravidlo 1Rule 1
Hydrofobní cysteinová skupina by měla nahradit zbytky WT beta-řetězce, které patří k jádru konstantní oblasti Ig bez přístupu vody, tvořené prostorem mezi dvěma beta-listy.The hydrophobic cysteine group should replace the WT beta-chain residues that belong to the core of the water-free Ig constant region formed by the space between the two beta-sheets.
Pravidlo 2iRule 2i
V případě smyček uvnitř listu (například smyčka A-B) cysteinová skupina by měla nahradit zbytky WT, které jsouIn the case of loops inside the leaf (for example, loop A-B), the cysteine group should replace the WT residues that are
straně listu.hand sheet.
Podle pravidla 1 k tomu dochází uvnitř oblasti listu. Strukturální odchylka tohoto pravidla v případě smyčekAccording to rule 1, this occurs within the leaf area. Structural deviation of this rule for loops
A-B je znázorněna schématicky na obrázku č. 10 A a 10 B.A-B is shown schematically in Figures 10A and 10B.
Pravidlo 2iiRule 2ii
V případě smyček vně listů (například smyčka C-D) by měla cysteinová skupina nahradit zbytky WT na anti-paralelních beta-řetězcích, jeden řetězec z každého listu. Podle pravidla 1 zbytky tvořící optimální balíček párů spolu s proti ležícími povrchy beta-listu tak tvoří část prostoru mezi listy. Strukturální odchylka tohoto pravidla v případě smyček C-D je schématicky zobrazena na obrázku č. 11A a 11B. V tabulkách putativních mimotopových sekvenci, v textu, jsou návrhy, které se zdají sekvenci která •In the case of loops outside the leaves (for example, C-D loop), the cysteine moiety should replace the WT residues on the anti-parallel beta-chains, one chain from each leaf. According to Rule 1, the residues forming the optimal package of pairs together with the opposing beta-sheet surfaces thus form part of the space between the leaves. The structural variation of this rule for C-D loops is shown schematically in Figures 11A and 11B. In the tables of putative mimotope sequences, in the text, there are suggestions that seem to •
• a• a
následuje • 4 •followed by • 4 •
*· · dále optimální, podtrženy, každým blokem sekvencí přerušované a nepřerušované spojuji polohy zbytků vybraných pro optimální cyklizaci, které jsou také zobrazeny stejným způsobem na obrázku č. 10 /smyčky A-B) a na obrázku č. 11B (smyčky C-D).Further optimally underlined, by each intermittent and uninterrupted sequence block, the splice positions selected for optimal cyclization, which are also shown in the same way in Figure 10 / Loops A-B) and Figure 11B (Loops C-D), are joined.
Pod čáryUnder the lines
Použitím uspořádání sekvencí zobrazené na obrázku č. 9A a 9B spolu se shora uvedenými pravidly se navrhl následující seznam peptidů uvedený v tabulce č. 9 a 12. Peptidy, které jsou podtrženy (nepřerušovanou nebo přerušovanou čarou jsou optimální peptidy podle shora identifikovaných pravidel. Stejné čáry jsou zobrazeny na obrázku č. 1ΌΒ a 11B. Nepodtržené sekvence jsou mimotopy.Using the sequence alignment shown in Figures 9A and 9B together with the above rules, the following list of peptides is shown in Tables 9 and 12. are shown in Figures 1ΌΒ and 11B The underlined sequences are mimotopes.
Tabulka č. 9: sekvence smyčky A-B Cs3 IgETable 9: Sequence of A-B Cs3 IgE loop
·♦ · • 44· • 4 4 44·· 4 · 4 ·
4 44 • 4 4 4· • 4 444 44 • 4 4 4 • 4 44
44» 4444444 »44444
Tabulka č. 10: Sekvence smyčky Ά-Β Cs4 IgETable 10: Sequence of Ά-Β Cs4 IgE loop
Tabulka č. 11: sekvence smyčky Cs3 IgETable 11: Cs3 IgE loop sequence
• 4 44 44 44 4
4· 44 4 4 4 44 44 44 4 4 4 4
4 · « 44 · «4
4 4 4 4 ·4 4 4 4 ·
4 4 4 44 4 4 4
444 444 44 444 •·* »4 ·· • ·444 444 44 444
4· • · • 4 · 44 4 44 · 4 · 44 4 4
Tabulka č. 12: Sekvence mimotopu smyčky C-D Cs4 IgETable 12: C-D Cs4 IgE loop mimotope sequence
Seznam sekvenci (2) Informace o SEQ ID NO: 1:Sequence Listing (2) SEQ ID NO: 1 Information:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 22 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 1:(A) LENGTH: 22 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 1:
Aru Ai a Se^ Gly Lvs Pro Val Asn His Ser Thr Arg Lys Glu Glu Lys T 5 '10 15Aru Ai and Se ^ Gly Ls Glu Lys Glu Glu Lys T 5 '10 15
Gin Arg Asn Gly Thr Leu ’ 20 (2) Informace o SEQ ID NO: 2:Gin Arg Asn Gly Thr Leu '20 (2) Information about SEQ ID NO: 2:
Gly Thr Arg Asp Trn Ile Glu Gly Glu 1 5 (2) Informace o SEQ ID NO: 3:Gly Thr Arg Asp Thorn Ile Glu Gly Glu 1 5 (2) Information about SEQ ID NO: 3:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 19 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi)(A) LENGTH: 19 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi)
Popis sekvence: SEQ ID NO: 3:Sequence Description: SEQ ID NO: 3:
Pro His Leu Pro Arg Ala Leu 5 His Pro Leu Pro Arg Ala Leu 5
Pro Arg AlaFor Arg Ala
Met Arg Ser Thr Thr Lys ThrMet Arg Ser Thr Thr Lys Thr
Ser Gly (2) Informace o SEQ ID NO: 4:Ser Gly (2) Information about SEQ ID NO: 4:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 11 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence(A) LENGTH: 11 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence
(xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 4:(xi) Sequence description: SEQ ID NO: 4:
Pro Glu Trp Pro Gly Ser Arg Asp Lvs Arg Thr 'I 5 ' ' 10'Pro Glu Trp Pro Gly Ser
(xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 6:(xi) Sequence description: SEQ ID NO: 6:
Leu Se1 Arg Pro Ser Pro Phe Asp Leu Phe Ile Arg Lvs Ser Pro Thr I 5 10 15Leu Se 1 Arg Pro Ser Pro Phe Asp Leu Phe Ile Arg Lvs Ser Pro Thr I 5 10 15
Ile Thr Cys (2) Informace o SEQ ID NO: 7:Ile Thr Cys (2) Information about SEQ ID NO: 7:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 22 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 7:(A) LENGTH: 22 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 7:
Tro Leu His Asn Glu Val Gin Leu Pro Asp Ala Arg His Ser Thr Thr 1‘ 5 10 .15Tro Leu His Asn Glu Val Gin Le Ser Pro Ser Arg Thr Thr Thr 1 ‘5 10 .15
Gin Pro Arg Lvs Thr 'Gin Pro Arg Lvs Thr '
(2) Informace o SEQ ID NO: 8:(2) SEQ ID NO: 8 information:
• ·• ·
(2) Informace o SEQ ID NO: 9:(2) SEQ ID NO: 9 information:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 11 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 9:(A) LENGTH: 11 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 9:
Gly Lys Pro Val Asn His Ser Thr Gly Gly Cys '1 5 10 (2) Informace o SEQ ID NO: 10:Gly Lys Pro Val Asn His Ser Thr Gly Cly '1 5 10 (2) Information about SEQ ID NO: 10:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 18 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 10:(A) LENGTH: 18 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 10:
Gly Lvs Pro Val Asn His Ser Thr Arg Lys Glu Glu Lys Gin Arg Asn 1'5 10 15Gly Lvs Gin Glu Lys Gin Arg Asn 1'5 10 15
Gly Cys (2) Informace o SEQ ID NO: 11:Gly Cys (2) Information about SEQ ID NO: 11:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 20 aminokyselin (B) TYP: protein(A) LENGTH: 20 amino acids (B) TYPE: protein
(2) Informace o SEQ ID NO: 12:(2) SEQ ID NO: 12 information:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 14 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 12:(A) LENGTH: 14 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Description of sequence: SEQ ID NO: 12:
Arg Ala Ser Gly Lys Pro Val Asn His Ser Thr Gly Gly Cys (2) Informace o SEQ ID NO: 13:Arg Ala Ser Gly Lys For Val Asn His Ser Thr Gly Gly Cys (2) Information about SEQ ID NO: 13:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 11 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 13:(A) LENGTH: 11 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 13:
Cys Gly Thr Arg Asp Trp Ile Glu Gly Leu Leu (2) Informace o SEQ ID NO: 14:Cys Gly Thr Arg Asp Trp Ile Glu Leu Leu (2) Information about SEQ ID NO: 14:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 22 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 14:(A) LENGTH: 22 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 14:
Cys Gly Thr Arg Asp Trp Ile Glu Gly Glu Thr Leu 1 5 10 (2) Informace o SEQ ID NO: 15:Cys Gly Thr Arg Asp Trp Ile Glu Gly Glu Thr Leu 1 5 10 (2) Information about SEQ ID NO: 15:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 12 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 15:(A) LENGTH: 12 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 15:
Gly Thr Arg Asp Trp Ile Glu Gly Glu Thr Glv Cys 1 5 10 * (2) Informace o SEQ ID NO: 16:Gly Glu Thr Arg Asp Trp Ile Glu Glu Glu Thr Glv Cys 1 5 10 * (2) Information of SEQ ID NO: 16:
• · · ··· : .·. ::• · · ···:. ·. ::
• · ·· ··· ···· ... ...• · ·· ··· ···· ...
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 12 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 16:(A) LENGTH: 12 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Description of sequence: SEQ ID NO: 16:
Cys His Pro His Leu Pro Arg Ala Leu Met Leu Leu !Cys His For His Leu For Arg Ala Leu Met Leu Leu!
. 1 5 10· (2) Informace o SEQ ID NO: 17:. 1 5 10 · (2) Information about SEQ ID NO: 17:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 13 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 17:(A) LENGTH: 13 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Description of sequence: SEQ ID NO: 17:
Cys Gly Thr His Pro His Leu Pro Arg Ala Leu MetCys Gly Thr His For His Leu For Arg Ala Leu Met
5 10 (3) Informace o SEQ ID NO: 18:(10) Information about SEQ ID NO: 18:
(iii) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(iii) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(C) DÉLKA: 13 aminokyselin (D) TYP: protein (iv) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xii) Popis sekvence: SEQ ID NO: 18:(C) LENGTH: 13 amino acids (D) TYPE: protein (iv) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xii) Sequence description: SEQ ID NO: 18:
Thr His Pro His Leu Pro Arg Ala Leu Met Arg Ser CysThr His For His Leu For Arg Ala Leu Met Arg Ser Cys
5 10 (2) Informace o SEQ ID NO: 19:(10) Information about SEQ ID NO: 19:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 22 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 19:(A) LENGTH: 22 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 19:
Glv Pro His Leu Pro Arg Ala Leu Met Arg Ser Ser Ser Cys / 5 10 (2) Informace o SEQ ID NO: 20:Glv Pro His Leu For Arg Ala Leu Met Arg Ser Ser Ser Cys / 5 10 (2) Information about SEQ ID NO: 20:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 13 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 20:(A) LENGTH: 13 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Description of sequence: SEQ ID NO: 20:
Ala Pro Glu Tro Pro Gly Ser Arg' Asp Lys Arg Thr Cys ! 5 10 (2) Informace o SEQ ID NO: 21:Ala Pro Glu Tro Gly Ser Arg 'Asp Lys Arg Thr Cys! (10) Information about SEQ ID NO: 21:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(2) Informace o SEQ ID NO: 22:(2) Information about SEQ ID NO: 22:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 17 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 22:(A) LENGTH: 17 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 22:
Cys Gly Gly Ala Thr Pro Glu Trp Pro Gly Ser Arg Asp Lys Arg Tnr ! 5 -10 15Cly Gly Gly Ala Thr Pro Glu Trp Pro Gly Ser Arg Lys Arg Tnr! 5 -10 15
Leu (2). Informace o SEQ ID NO: 23:Leu (1). Information about SEQ ID NO: 23:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 13 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 23(A) LENGTH: 13 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 23
Cvs Thr Arg Lys Asd Arg Ser Glv Pro Tro Glu Pro AlaCvs Thr Arg Lys Asd
5' '10 (2) Informace o SEQ ID NO: 24:5 ''10 (2) Information about SEQ ID NO: 24:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 15 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 24:(A) LENGTH: 15 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 24:
Ala Pro Cys Trp Pro Gly Ser Arg Asp Cys Arg Thr Leu Ala Gly 1 5 10 15 (2) Informace o SEQ ID NO: 25:Ala Pro Cys Trp Pro Gly Ser Asp Cys Arg Thr Leu Ala Gly 1 5 10 15 (2) Information about SEQ ID NO: 25:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 17 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 25:(A) LENGTH: 17 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 25:
Ala Cys Pro Glu Trp Pro Gly Ser Arg Asp Arg Cys Thr Leu Ala GlyAla Cys Thr Leu Ala Gly
10 (2) Informace o SEQ ID NO: 27:10 (2) Information about SEQ ID NO: 27:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 16 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 27:(A) LENGTH: 16 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 27:
Cys Ala Thr Pro Glu Trp Pro Gly Ser Arg Asp Lys Arg Thr Leu Cys 1 5 10 15Cys Ala Thr Pro Glu Trp Pro Gly Ser Lys Arg Thr Leu Cys 1 5 10 15
Gly (2) Informace o SEQ ID NO: 28:Gly (2) Information about SEQ ID NO: 28:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 13 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 28:(A) LENGTH: 13 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 28:
Thr Ρ’-ο Cys Tru Pro Gly Ser Arg Asp Lys Arg Cys Gly i ‘ * 5 10Thr--C ys Pro ys 5 5 5 * 5 10
(2) Informace o SEQ ID NO: 30:(2) Information about SEQ ID NO: 30:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 11 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 30:(A) LENGTH: 11 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 30:
Ala Glu TrD Glu Gin Lys Asp Glu Phe Ile Cys 1 ‘ 5 10 (2) Informace o SEQ ID NO: 31: - (i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:Ala Glu TrD Glu Gin Lys Asp Glu Phe Ile Cys 1 ‘5 10 (2) SEQ ID NO: 31 information: - (i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 9 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 31:(A) LENGTH: 9 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 31:
Gly Glu Gin Lvs Asd Glu Phe Ile Cys 1 ' 5 (2) Informace o SEQ ID NO: 32:Gly Glu Gs Lvs Asd Glu Phe Ile Cys 1 '5 (2) Information about SEQ ID NO: 32:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 10 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 32:(A) LENGTH: 10 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 32:
Cys Ala Glu GlyCys Ala Glu Gly
Cu Gin Lys Asp Glu Leu ; 10 (2) Informace o SEQ ID NO: 33:Cu Gln Lys Asp Glu Leu; 10 (2) Information about SEQ ID NO: 33:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 19 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 33:(A) LENGTH: 19 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Description of sequence: SEQ ID NO: 33:
Cys Ser Arg Pro Ser Pro Phe Asp Leu Phe Ile Arg Lys Ser Pro Thr ; 5 10 15Cys Ser Arg Pro Ser Phe Asp Leu Phe Ile Arg Lys Ser Pro Thr; 5 10 15
Ile Thr CysIle Thr Cys
Informace o SEQSEQ
ID NO:ID NO:
34:34:
(i)(and)
CHARAKTERISTIKACHARACTERISTICS
SEKVENCE:SEQUENCE:
CysCys
SeSe
Pro ThrPro Thr
Ser Pro Thr (2) Informace o SEQ ID NO: 36:Ser Pro Thr (2) Information about SEQ ID NO: 36:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 16 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 36:(A) LENGTH: 16 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 36:
Cvs Ser Arg Pro Ser Pro Phe Asp Leu Phe Ile Arg Lys Ser Pro Cys í ' 5 10 15 (2) Informace o SEQ ID NO: 37:Cvs Ser Arg Pro Ser Pro Phe Asp Leu Phe Ile Arg Lys Ser Pro Cys' 5 10 15 (2) SEQ ID NO: 37 information:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 15 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 37:(A) LENGTH: 15 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 37:
Cvs Arg Pro Ser Pro Phe Asd Leu Phe Ile Arg Lys Se1 Dto Cvs í 5 10 ' * “ 15 (2) Informace o SEQ ID NO: 38:Cvs Arg Pro Ser Pro Phe Asd Leu Phe Ile Arg Lys Se 1 Dt Cvs 5 10 '*' 15 (2) SEQ ID NO: 38:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 16 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 38:(A) LENGTH: 16 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 38:
Cvs Arg Pro Ser Pro Phe Asp Leu Phe Ile Arg Lvs Ser Pro Thr Cys í 5 10 15 (2) Informace o SEQ ID NO: 39:Arg Pro Ser Pro Phe Asp Leu Phe Ile Arg Lvs Ser Pro Thr Cys 5 10 15 (2) SEQ ID NO: 39 Information:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 17 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 39:(A) LENGTH: 17 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 39:
Cys Arg Pro Ser Pro Phe Asp Leu Phe Ile Arg Lys.Ser Pro Thr Ile 1 5 10 15Cys Arg Pro Ser Pro Phe Asp Leu Phe Ile Arg Lys.Ser Pro Thr Ile 1 5 10 15
Cys (2) Informace o SEQ ID NO: 40:Cys (2) Information about SEQ ID NO: 40:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
Pro Thr Ile ·· ♦ · « • · • · · • · ······ · (2) (2) (A) (B)Pro Thr Ile (2) (2) (A) (B)
DRUHSPECIES
DÉLKA: 18 aminokyselinLENGTH: 18 amino acids
TYP: proteinTYPE: protein
MOLEKULY: lidská a umělá sekvenceMOLECULES: human and artificial sequences
Popis sekvence: SEQ ID NO: 40:Sequence Description: SEQ ID NO: 40:
CysCys
ThrThr
Arg Pro Ser Pro Phe Asp Leu Phe Ile Arg Lys SerArg Pro Ser Pro Phe Asp
CysCys
Informace oInformation about
SEQ ID NO: 41:SEQ ID NO: 41:
CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) (B)(A) (B)
DRUHSPECIES
DÉLKA: 17 aminokyselinLENGTH: 17 amino acids
TYP: proteinTYPE: protein
MOLEKULY: lidská a umělá sekvenceMOLECULES: human and artificial sequences
Informace o SEQ ID NO: 42:Information about SEQ ID NO: 42:
(i)(and)
CysCys
CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A)(AND)
DRUHSPECIES
DÉLKA: 16 aminokyselinLENGTH: 16 amino acids
TYP: proteinTYPE: protein
MOLEKULY: lidská aMOLECULES: human a
Popis sekvence: SEQ IDSequence description: SEQ ID
P-O Ser Pro Phe Asp Leu PheP-O Ser Pro Phe Asp Leu Phe
Informace o SEQ ID NO: 43:Information about SEQ ID NO: 43:
umělá sekvenceartificial sequence
NO: 42:NO: 42:
Ile Arg Lys Ser ProIle Arg Lys Ser Pro
CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A)(AND)
DÉLKA: 15 aminokyselinLENGTH: 15 amino acids
TYP: proteinTYPE: protein
DRUHSPECIES
MOLEKULY: lidská a umělá sekvenceMOLECULES: human and artificial sequences
Popis sekvence: SEQ ID NO: 43:Sequence Description: SEQ ID NO: 43:
CysCys
Informace o SEQ ID NO: 44:Information about SEQ ID NO: 44:
CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 14 aminokyselin • 4 *« · (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 44:(A) LENGTH: 14 amino acids • 4 * · · (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 44:
Cys Pro Ser Pro Phe Asp Leu Phe Ile Arg Lvs Ser Pro Cys 1 5 10 (2) Informace o SEQ ID NO: 45:Cys Pro Ser Pro Phe Asp Leu Phe Ile Arg Lvs Ser Pro Cys 1 5 10 (2) SEQ ID NO: 45 info:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 20 aminokyselin * (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 45:(A) LENGTH: 20 amino acids * (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 45:
Cys Tyr Ala Phe Ala Thr Pro Glu Trp Pro Gly Ser Arg Aso Lys Ar 1 5 10 · ‘ -i ~Cys Tyr Ala Phe Ala Thr Pro Glu Trp Pro Gly Ser Aso Lys Ar 1 5 10 · '-i ~
Thr Leu Ala Cys 3 Thr Leu Ala Cys 4
(xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 46:(xi) Sequence description: SEQ ID NO: 46:
Cys Tyr Ala Phe Ala Thr Pro Glu Trp Pro Gly Ser Arg Asp Lys ArgLys Arg
(2) Informace o SEQ ID NO: 47:(2) SEQ ID NO: 47 information:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 18 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 47:(A) LENGTH: 18 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Description of sequence: SEQ ID NO: 47:
Cys Tyr Ala Phe Ala Thr Pro Glu Trp Pro Gly Ser Arg Asp Lys ArgLys Arg
Thr CysThr Cys
(xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 48:(xi) Sequence description: SEQ ID NO: 48:
Cys Tyr Ala Phe Ala Thr Pro Glu Trp Pro Glv Ser Arg Asp Lys Arg 1 5 10 15Cys Tyr Ala Phe Ala Thr Pro Glu Trp Pro Gv Ser Arg Lys Arg 1 5 10 15
CysCys
(xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 49:(xi) Sequence description: SEQ ID NO: 49:
Cys Ma'řhe Ma Thr Pro Glu Trp Prc Gly Ser Arg Asp Lys Arg Cys '1 5 10 (2) Informace o SEQ ID NO: 50:Cys Ma'rhe Ma Thr Pro Glu Trp Prc Gly Ser Arg Lys Arg Cys' 1 5 10 (2) SEQ ID NO: 50 info:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 18 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 50:(A) LENGTH: 18 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Description of sequence: SEQ ID NO: 50:
Cys Ala Phe Ala Thr Pro Glu Trp Pro Gly Ser Arg Aso Lys Arg Th Cys 10 15 (2) Informace o SEQ ID NO: 51:Cys Ala Phe Ala Thr Pro Glu Trp Pro Gly Ser Aso Lys Arg Th Cys 10 15 (2) SEQ ID NO: 51 info:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 18 aminokyselin (B) TYP: protein (ii)) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 51:(A) LENGTH: 18 amino acids (B) TYPE: protein (ii)) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 51:
Cys Ala Phe Ala Thr Pro Glu Trp Pro Gly Ser Arg Asp Lys Arg Thr 15 10 15Cys Ala Phe Ala Thr Pro Glu Trp Pro Gly Ser
Leu CysLeu Cys
(2) Informace o SEQ ID NO: 52:(2) Information about SEQ ID NO: 52:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 19 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 52:(A) LENGTH: 19 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Description of sequence: SEQ ID NO: 52:
Cys Ala Phe Ala Thr Pro Glu Trp Pro Gly Ser Arg Asp Lys Arg ThrCys Ala Phe Ala Thr For Glu Trp For Gly Ser Asp Asp Lys Arg Thr
1.5 10 ,151.5 10, 15
Leu Ala Cys (2) Informace o SEQ ID NO: 53:Leu Ala Cys (2) Information about SEQ ID NO: 53:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 18 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 53:(A) LENGTH: 18 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 53:
Cys Phe Ala Thr Pro Glu -Trp Pro Gly Ser Arg Asd Lys Arg Thr Leu 1 5 · 10 ‘ 15Cys Phe Ala Thr Pro Glu -Trp Pro Gly Ser Asd Lys Arg Thr Leu 1 5 · 10 '15
Ala Cys (2) Informace o SEQ ID NO: 54:Ala Cys (2) Information about SEQ ID NO: 54:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
Cys Phe Ala Thr Pro Glu Trp Pro Gly Ser Arg Asp Lys Arg Thr Leu 1 ·5 Cys Phe Ala Thr For Glu Trp For Gly Ser L Asp Arg Thr Leu 1 · 5
Cys (2) Informace o SEQ ID NO: 55:Cys (2) Information about SEQ ID NO: 55:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 16 aminokyselin(A) LENGTH: 16 amino acids
(B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 55:(B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 55:
Cvs Phe Ala Thr Pro Glu Trp Pro Gly Ser Arg Asn Lys Arg Thr Cys 1'5 10 15 (2) Informace o SEQ ID NO: 56:Cvs Phe Ala Thr Pro Glu Trp Pro Gly Ser Arg Asn Lys Arg Thr Cys 1'5 10 15 (2) SEQ ID NO: 56:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 15 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 56:(A) LENGTH: 15 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Description of sequence: SEQ ID NO: 56:
Cys Phe Ala Thr Pro Glu Trp Pro Gly Ser Arg Asd Lys Arg Cys 1 ,5 10 ’ 15 (2) Informace o SEQ ID NO: 57:Cys Phe Ala Thr Pro Glu Trp Pro Gly Ser Arg Asd Lys Arg Cys 1 , 5 10 '15 (2) Information about SEQ ID NO: 57:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 17 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 57:(A) LENGTH: 17 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Description of sequence: SEQ ID NO: 57:
Cys Thr Trp Ser Arg Ala Ser Gly Lys Pro Val Asn His Ser Th- Arg 1 5 10 15Cys Thr Trp Ser Ser Ala Ser Gly Lys Pro Val Asn His Ser Th- Arg 1 5 10 15
Cys (2) Informace o SEQ ID NO: 58:Cys (2) Information of SEQ ID NO: 58:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 16 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 58:(A) LENGTH: 16 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 58:
Cys Thr Trp Ser Arg Ala Ser Glv Lys Pro Val Asn His Ser Thr Cys 1 5 -10 15.Cys Thr Trp Ser Arg Lys Pro Val Asn His Ser Thr Cys 1 5 -10 15.
·· © ·· « · (2) Informace o SEQ ID NO: 59:(2) Information about SEQ ID NO: 59:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 15 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 59:(A) LENGTH: 15 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 59:
Cvs Th” Trp Ser Arg Ala Ser Gly Lys Pro Val Asn His Ser Cys 1*5 10 15 (2) Informace o SEQ ID NO: 60:Cvs Th ”Trp Ser Arg Ala Ser Gly Lys For Val Asn His Ser Cys 1 * 5 10 15 (2) Information about SEQ ID NO: 60:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 14 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 60:(A) LENGTH: 14 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 60:
Cys Thr Trp Ser Arg Ala Ser Glv Lys Pro Val Asn His Cys 1 -5 ‘10 (2) Informace o SEQ ID NO: 61:Cys 1r p10 (2) Information about SEQ ID NO: 61:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 14 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 61:(A) LENGTH: 14 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 61:
Cvs Tro Ser Arg Ala Ser Gly Lys Prč Val Asn His Cys '1 5 10 (2) Informace o SEQ ID NO: 62:Cvs T ro Ser Arg Ala Ser Gly Lys Off Val Asn His Cys' 1 5 10 (2) Information about SEQ ID NO: 62:
(xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 62:(xi) Sequence description: SEQ ID NO: 62:
Cys Trp Ser Arg Ala Ser Glv Lys Pro Val Asn His Ser Cvs 1 5 10 (2) Informace o SEQ ID NO: 63:Cys Trp Ser Arg Ala Ser Glv Lys For Val Asn His Ser Cvs 1 5 10 (2) Information of SEQ ID NO: 63:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 15 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 63:(A) LENGTH: 15 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 63:
Cys Tro Ser Arg Ala Ser Gly Lys Pro Val Asň His Ser Thr Cys 1*5 10 15 (2) Informace o SEQ ID NO: 64:His Ser Thr Cys 1 * 5 10 15 (2) Information about SEQ ID NO: 64:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 16 aminokyselin (B) TYP: protein(A) LENGTH: 16 amino acids (B) TYPE: protein
(2) Informace o SEQ ID NO: 65:(2) Information about SEQ ID NO: 65:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 15 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 65:(A) LENGTH: 15 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 65:
Cys Ser Arg Ala Ser Gly Lvs Pro Val Asn His Ser Thr Arg Cys (2) Informace o SEQ ID NO: 66:Cys Ser Arg Ala Ser Gly Lvs For Val Asn His Ser Thr Arg Cys (2) SEQ ID NO: 66 info:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 14 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 66:(A) LENGTH: 14 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 66:
• ·· ♦ · · ······· Φ• ·· ♦ · · ······· Φ
Lys Pro Vál Asn His Ser Thr CysLys For War Asn His Ser Thr Cys
-Cys Ser Arg Ala Ser Gly-Cys Ser Arg Ala Ser Gly
5 :5:
Informace o SEQ ID NO:SEQ ID NO Information:
CysCys
Ser Arg Ala Ser Gly ’Lys ProSer Arg Ala Ser Gly's Lys Pro
Val Asn His Ser Cys (2) Informace o SEQ ID NO: 68:Val Asn His Ser Cys (2) Information about SEQ ID NO: 68:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 12 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 68:(A) LENGTH: 12 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Description of sequence: SEQ ID NO: 68:
Cys Ser Arg Ala Ser Gly Lys Pro Val Asn His Cys 5 (2) Informace o SEQ ID NO: 69:Cys Ser Arg Ala Ser Gly Lys For Val Asn His Cys 5 (2) Information about SEQ ID NO: 69:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 17 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 69:(A) LENGTH: 17 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 69:
Cys Gin TrD Leu His .Asn Glu Val Gin Leu Pro Asp Ala Arg His Ser 1'5 10 ' 15Cys Gin TrD Leu His. As Glu Val Gin Leu Asp Asp Arg His Ser 1'5 10 '15
Cys (2) Informace o SEQ ID NO: 70:Cys (2) Information about SEQ ID NO: 70:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 16 aminokyselin (B) TYP: protein • · (ii)(A) LENGTH: 16 amino acids (B) TYPE: protein • (ii)
DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvenceMOLECULES TYPE: human and artificial sequence
Leu Pro Asp Ala Arg His CvsLeu Pro Asp Arg Arg His Cvs
- - -- - -
Popis sekvence:Sequence description:
SEQ ID NO: 70:SEQ ID NO: 70:
Cys Gin Trp Leu HisCys Gin Trp Leu His
55
Asn Glu Vál GinAsn Glu Val Gin
71:71:
Informace o SEQ ID NO:SEQ ID NO Information:
(2)(2)
sekvencesequence
Cys Gin Trp Leu His Asn Glu Val Gin Leu Pro Asp Ala Arg Cys 1 5 10 15 (2) Informace o SEQ ID NO: 72:Cys Gin Trp Leu His Asn Glu Val Gin Leu For Asp Ala Arg Cys 1 5 10 15 (2) SEQ ID NO: 72 info:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 14 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 72:(A) LENGTH: 14 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 72:
Cys Gin Trn Leu His Asn Glu Val Gin Leu Pro Asd Ala Cys í ’ 5 10 ' (2) Informace o SEQ ID NO: 73:Cys Gin Thorn Leu His Asn Glu Val Gin Leu For Asd Ala Cys '5 10' (2) SEQ ID NO: 73:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 13 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 73:(A) LENGTH: 13 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 73:
Cys Trp Leu His Asn Glu Val Gin Leu Pro Asp Ala Cys 1 5 1° (2) Informace o SEQ ID NO: 74:Cys Trp Leu His Asn Glu Val Gin Leu For Asp Ala Cys 1 5 1 ° (2) Information about SEQ ID NO: 74:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
·« · · (A) DÉLKA: 14 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 74:(A) LENGTH: 14 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 74:
Cys Trp Leu His Asn Glu Val Glr. Leu Pro Asd Ala Aro Cvs 1 5 10 (•2) Informace o SEQ ID NO: 75:Cys Trp Leu His Gn Val Glr. Leu Pro Asd Ala Aro Cvs 1 5 10 (• 2) Information about SEQ ID NO: 75:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 15 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 75:(A) LENGTH: 15 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 75:
Cys Trp Leu His Asn Glu Val Gin Leu Pro Asd Ala Arg H’S Cv=· 1 5 10 15 (2) Informace o SEQ ID NO: 76:Cys Trp Leu His Asn Glu Val Gin Leu For Asd Ala Arg H'S Cv = · 1 5 10 15 (2) Information about SEQ ID NO: 76:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 16 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 76:(A) LENGTH: 16 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Description of sequence: SEQ ID NO: 76:
Cys iCys i
Trp Leu His Asn Glu Val Gin LeuTrp Leu His Asn Glu
Pro Asd AlaFor Asd Ala
ArgArg
HisHis
Ser Cvs (2) Informace o SEQ ID NO: 77:Ser Cvs (2) Information about SEQ ID NO: 77:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 15 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 77:(A) LENGTH: 15 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 77:
Cys Leu His Asn Glu Val Glr. Leu Pro Asp Ala .Arg His Ser CysCys Leu His Gn Val Glr. Leu Pro Asp Ala .Arg His Ser Cys
·· · (2) Informace o SEQ ID NO: 78:(2) Information about SEQ ID NO: 78:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 14 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 78:(A) LENGTH: 14 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 78:
Cys Leu His Asn Glu Val Gin Leu Pro Asp Ala Arg His Cys 1 5 10’ (2) Informace o SEQ ID NO: 79:Cys Leu His Asn Glu Val Gin Leu For Asp Ala Arg His Cys 1 5 10 ´ (2) SEQ ID NO: 79 info:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 13 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 79:(A) LENGTH: 13 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 79:
Cvs Leu His Asn Glu Val Gin Leu Pro Asp Ala Arg Cys 1 . 5 10 (2) Informace o SEQ ID NO: 80:Cvs Leu His Asn Glu Val Gin Leu For Asp Ala Arg Cys 1. (10) Information about SEQ ID NO: 80:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 12 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 80:(A) LENGTH: 12 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 80:
Cys Leu His Asn Glu Val Gin Leu Pro Asp Ala Cys 1 5 10 (2) Informace o SEQ ID NO: 81:Cys Leu His Asn Glu Val Gin Leu For Asp Ala Cys 1 5 10 (2) SEQ ID NO: 81 info:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 6 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 81:(A) LENGTH: 6 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 81:
Leu Phe Ile Arg Lys SerLeu Phe Ile Arg
5 (2) Informace o SEQ ID NO: 82:5 (2) Information about SEQ ID NO: 82:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 7 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 82:(A) LENGTH: 7 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Description of sequence: SEQ ID NO: 82:
Ρ’-ο Ser Lys Gly Thr Val Asn ' 5 (2) Informace o SEQ ID NO: 83:L'-ο Ser Lys Gly Thr Val Asn ' 5 (2) Information about SEQ ID NO: 83:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 23 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID.NO: 83:(A) LENGTH: 23 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 83:
Leu His Asn Glu Val Gin Leu Pro Asp Ala Arg His Ser Thr Thr Gin i_ 5 1θ l·1 Leu His Asn Glu Val Gin Leu For Asp Ala Arg His Ser Thr Thr Gin i_ 5 1θ l · 1
Ρ’-ο A^g Lys Thr Lvs Gly Ser (2) Informace o SEQ ID NO: 84:Lys Thr Lvs Gly Ser (2) Information about SEQ ID NO: 84:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 6 aminokyselin (B) TYP: protein (ii) DRUH MOLEKULY: lidská a umělá sekvence (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 84:(A) LENGTH: 6 amino acids (B) TYPE: protein (ii) MOLECULAR TYPE: human and artificial sequence (xi) Description of sequence: SEQ ID NO: 84:
Ser Val Asn Pro Gly LvsSer Val Asn For Gly Lvs
5 (2) Informace o SEQ ID NO: 85:5 (2) Information about SEQ ID NO: 85:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 13 aminokyselin ·· • · · • · • ♦··· ·(A) LENGTH: 13 amino acids ·· · · · · · ♦ ··· ·
φ.φ.
·· · • ··« ♦ ·· • ♦ 4« • ·· ♦ · ·· · (B) TYP: protein(4) (B) TYPE: protein
ThrThr
Thr Pro Glu TrcThr Pro Glu Trc
Pro Glv Cys Ατσ ksp Lys Arg Cvs GlyPro Glv Cys Ατα ksp Lys Arg Cvs Gly
Claims (3)
Applications Claiming Priority (8)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
GBGB9904408.3A GB9904408D0 (en) | 1999-02-25 | 1999-02-25 | Vaccine |
GBGB9917144.9A GB9917144D0 (en) | 1999-07-21 | 1999-07-21 | Vaccine |
GBGB9918598.5A GB9918598D0 (en) | 1999-08-07 | 1999-08-07 | Novel peptides |
GBGB9918604.1A GB9918604D0 (en) | 1999-08-07 | 1999-08-07 | Novel peptides |
GBGB9918599.3A GB9918599D0 (en) | 1999-08-07 | 1999-08-07 | Novel peptides |
GBGB9918601.7A GB9918601D0 (en) | 1999-08-07 | 1999-08-07 | Novel peptides |
GBGB9918606.6A GB9918606D0 (en) | 1999-08-07 | 1999-08-07 | Novel peptides |
GBGB9925618.2A GB9925618D0 (en) | 1999-10-29 | 1999-10-29 | Vaccine |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CZ20013081A3 true CZ20013081A3 (en) | 2002-02-13 |
Family
ID=27571340
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CZ20013081A CZ20013081A3 (en) | 1999-02-25 | 2000-02-22 | Epitopes and a extratopes obtained from C-epsilon-2 region or C-epsilon-4 IgE region, their antagonists a their therapeutic use |
Country Status (18)
Country | Link |
---|---|
EP (1) | EP1155038A1 (en) |
JP (1) | JP2002537403A (en) |
KR (1) | KR20020007314A (en) |
CN (1) | CN1520423A (en) |
AR (1) | AR029619A1 (en) |
AU (1) | AU3281100A (en) |
CA (1) | CA2363641A1 (en) |
CO (1) | CO5231139A1 (en) |
CZ (1) | CZ20013081A3 (en) |
HK (1) | HK1043134A1 (en) |
HU (1) | HUP0105490A3 (en) |
IL (1) | IL145025A0 (en) |
MX (1) | MXPA01008612A (en) |
NO (1) | NO20014131L (en) |
NZ (1) | NZ513680A (en) |
PL (1) | PL350992A1 (en) |
TR (1) | TR200102493T2 (en) |
WO (1) | WO2000050461A1 (en) |
Families Citing this family (25)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
AU2206701A (en) * | 1999-12-21 | 2001-07-03 | Acambis Research Limited | A reversible linkage technology for controlled conjugation |
EP1278542A2 (en) | 2000-05-05 | 2003-01-29 | Cytos Biotechnology AG | Molecular antigen arrays and vaccines |
GB0026334D0 (en) * | 2000-10-27 | 2000-12-13 | Smithkline Beecham Biolog | Vaccine |
US7320793B2 (en) | 2001-01-19 | 2008-01-22 | Cytos Biotechnology Ag | Molecular antigen array |
US7094409B2 (en) | 2001-01-19 | 2006-08-22 | Cytos Biotechnology Ag | Antigen arrays for treatment of allergic eosinophilic diseases |
US7128911B2 (en) | 2001-01-19 | 2006-10-31 | Cytos Biotechnology Ag | Antigen arrays for treatment of bone disease |
JP2003047482A (en) * | 2001-05-22 | 2003-02-18 | Pfizer Prod Inc | IgE VACCINE FREE FROM ANAPHYLAXIS-INDUCING PROPERTY |
ES2335979T3 (en) | 2001-09-14 | 2010-04-07 | Cytos Biotechnology Ag | IMMUNOSTIMULATOR CPG PACKAGING IN VIRUS SIMILAR PARTICLES: PREPARATION METHOD AND ITS USE. |
US7115266B2 (en) | 2001-10-05 | 2006-10-03 | Cytos Biotechnology Ag | Angiotensin peptide-carrier conjugates and uses thereof |
GB0209878D0 (en) * | 2002-04-30 | 2002-06-05 | Glaxosmithkline Biolog Sa | Vaccine |
CN1668637B (en) | 2002-07-17 | 2010-05-26 | 希托斯生物技术股份公司 | Molecular antigen arrays using a virus like particle derived from the AP205 coat protein |
WO2004009116A2 (en) | 2002-07-18 | 2004-01-29 | Cytos Biotechnology Ag | Hapten-carrier conjugates comprising virus like particles and uses thereof |
ATE506964T1 (en) | 2002-07-19 | 2011-05-15 | Cytos Biotechnology Ag | VACCINE COMPOSITIONS CONTAINING AMYLOID BETA 1-6 ANTIGEN ARRAYS |
AU2004224761A1 (en) | 2003-03-26 | 2004-10-07 | Cytos Biotechnology Ag | HIV-peptide-carrier-conjugates |
US7537767B2 (en) | 2003-03-26 | 2009-05-26 | Cytis Biotechnology Ag | Melan-A- carrier conjugates |
KR20070008578A (en) * | 2004-02-02 | 2007-01-17 | 타녹스 인코퍼레이티드 | Identification of novel ige epitopes |
GB0424563D0 (en) | 2004-11-05 | 2004-12-08 | Novartis Ag | Organic compounds |
AU2006297304B2 (en) | 2005-09-29 | 2012-05-17 | Medimmune, Llc | Method of identifying membrane LG specific antibodies and use thereof for targeting immunoglobulin-producing precursor cells |
CA2636139A1 (en) | 2005-12-14 | 2007-06-21 | Cytos Biotechnology Ag | Immunostimulatory nucleic acid packaged particles for the treatment of hypersensitivity |
KR101552227B1 (en) | 2006-06-12 | 2015-09-10 | 사이토스 바이오테크놀로지 아게 | - processes for packaging oligonucleotides into virus-like particles of rna bacteriophages |
NZ592977A (en) | 2008-12-09 | 2013-01-25 | Pfizer Vaccines Llc | IgE CH3 PEPTIDE VACCINE |
EP2575868A1 (en) | 2010-06-07 | 2013-04-10 | Pfizer Vaccines LLC | Ige ch3 peptide vaccine |
EP2862873B1 (en) * | 2012-06-18 | 2020-04-29 | Nippon Zenyaku Kogyo Co., Ltd. | IgE PEPTIDE VACCINE |
AU2019247321A1 (en) * | 2018-04-06 | 2020-10-22 | Slsbio Co., Ltd. | Novel epitope of immunoglobulin E, antibody binding thereto, and kit for analyzing immunoglobulin E in sample containing same |
US20240245190A1 (en) | 2023-01-19 | 2024-07-25 | Sharkninja Operating Llc | Identification of hair care appliance attachments |
Family Cites Families (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPH02229200A (en) * | 1989-02-28 | 1990-09-11 | Dainippon Pharmaceut Co Ltd | Peptide having anti-allergic activity |
ATE233813T1 (en) * | 1991-08-14 | 2003-03-15 | Genentech Inc | MODIFIED IMMUNOLOBULINS FOR SPECIFIC FC-EPSILON RECEPTORS |
US6610297B1 (en) * | 1996-03-01 | 2003-08-26 | Novartis Ag | Peptide immunogens for vaccination against and treatment of allergy |
WO1998024808A2 (en) * | 1996-12-06 | 1998-06-11 | THE UNITED STATES OF AMERICA represented by THE SECRETARY DEPARTMENT OF HEALTH & HUMAN SERVICES, THE NATIONAL INSTITUTES OF HEALTH | INHIBITION OF IgE-MEDIATED ALLERGIES BY A HUMAN IgE-DERIVED OLIGOPEPTIDE |
TWI227241B (en) * | 1998-06-20 | 2005-02-01 | United Biomedical Inc | IgE-CH3 domain antigen peptide, peptide conjugate containing the same, and pharmaceutical composition for treating allergies containing the peptide conjugate |
-
2000
- 2000-02-22 MX MXPA01008612A patent/MXPA01008612A/en unknown
- 2000-02-22 CN CNA008067562A patent/CN1520423A/en active Pending
- 2000-02-22 TR TR2001/02493T patent/TR200102493T2/en unknown
- 2000-02-22 AU AU32811/00A patent/AU3281100A/en not_active Abandoned
- 2000-02-22 CZ CZ20013081A patent/CZ20013081A3/en unknown
- 2000-02-22 JP JP2000601039A patent/JP2002537403A/en active Pending
- 2000-02-22 HU HU0105490A patent/HUP0105490A3/en unknown
- 2000-02-22 PL PL00350992A patent/PL350992A1/en not_active Application Discontinuation
- 2000-02-22 NZ NZ513680A patent/NZ513680A/en not_active Application Discontinuation
- 2000-02-22 IL IL14502500A patent/IL145025A0/en unknown
- 2000-02-22 WO PCT/EP2000/001456 patent/WO2000050461A1/en not_active Application Discontinuation
- 2000-02-22 EP EP00910690A patent/EP1155038A1/en not_active Withdrawn
- 2000-02-22 KR KR1020017010940A patent/KR20020007314A/en not_active Application Discontinuation
- 2000-02-22 CA CA002363641A patent/CA2363641A1/en not_active Abandoned
- 2000-02-25 AR ARP000100821A patent/AR029619A1/en not_active Application Discontinuation
- 2000-02-25 CO CO00013386A patent/CO5231139A1/en not_active Application Discontinuation
-
2001
- 2001-08-24 NO NO20014131A patent/NO20014131L/en not_active Application Discontinuation
-
2002
- 2002-04-29 HK HK02103181.1A patent/HK1043134A1/en unknown
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
EP1155038A1 (en) | 2001-11-21 |
WO2000050461A1 (en) | 2000-08-31 |
NZ513680A (en) | 2001-09-28 |
AU3281100A (en) | 2000-09-14 |
HUP0105490A3 (en) | 2002-05-28 |
HK1043134A1 (en) | 2002-09-06 |
NO20014131D0 (en) | 2001-08-24 |
AR029619A1 (en) | 2003-07-10 |
JP2002537403A (en) | 2002-11-05 |
IL145025A0 (en) | 2002-06-30 |
CA2363641A1 (en) | 2000-08-31 |
TR200102493T2 (en) | 2002-02-21 |
MXPA01008612A (en) | 2003-06-24 |
CO5231139A1 (en) | 2002-12-27 |
NO20014131L (en) | 2001-10-02 |
PL350992A1 (en) | 2003-02-24 |
KR20020007314A (en) | 2002-01-26 |
HUP0105490A2 (en) | 2002-04-29 |
CN1520423A (en) | 2004-08-11 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CZ20013081A3 (en) | Epitopes and a extratopes obtained from C-epsilon-2 region or C-epsilon-4 IgE region, their antagonists a their therapeutic use | |
JP3421970B2 (en) | Peptide immunogen | |
JP4031201B2 (en) | Peptide composition as immunogen for allergy treatment | |
WO2000050460A1 (en) | Epitopes or mimotopes derived from the c-epsilon-2 domain of ige, antagonists thereof, and their therapeutic uses | |
US20040030106A1 (en) | Novel compounds and process | |
WO2003092714A2 (en) | Peptide variants of ige constrained by beta-lactam bond | |
US20040115220A1 (en) | Vaccine | |
US20050152892A1 (en) | Epitopes or mimotopes derived from the C-epsilon-3 or C-epsilon-4 domains of IgE, antagonists thereof, and their therapeutics uses | |
US20030170229A1 (en) | Vaccine | |
US20050214285A1 (en) | Epitopes or mimotopes derived from the C-epsilon-3 or C-epsilon-4 domains of IgE, antagonists thereof, and their therapeutic uses | |
CN107849119A (en) | For the vaccine for the disease for treating and preventing IgE mediations | |
ZA200107016B (en) | Epitopes or mimotopes derived from the C-epsilon-2 domain of ige, antagonists thereof, and their therapeutic uses. | |
MXPA00011938A (en) | Peptide composition as immunogen for the treatment of allergy |