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CN113227137A - IL-1β抗体在骨髓增生异常综合征的治疗或预防中的用途 - Google Patents

IL-1β抗体在骨髓增生异常综合征的治疗或预防中的用途 Download PDF

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CN113227137A
CN113227137A CN201980083892.7A CN201980083892A CN113227137A CN 113227137 A CN113227137 A CN 113227137A CN 201980083892 A CN201980083892 A CN 201980083892A CN 113227137 A CN113227137 A CN 113227137A
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C·王
K·G·K·瓦纳斯
M·里恩
J·雷德
A·马拉特
孙海莺
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Novartis AG
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Abstract

本公开涉及IL‑1β抗体，尤其是卡那吉努单抗和格沃吉珠单抗和生物标记物在治疗和/或预防具有骨髓增生异常综合征(MDS)的癌症中的用途。

Description

IL-1β抗体在骨髓增生异常综合征的治疗或预防中的用途
技术领域
本发明涉及IL-1β结合抗体或其功能片段用于治疗和/或预防癌症(例如具有至少部分炎症基础的癌症)的用途。
背景技术
大多数癌症仍然无法治愈。仍然需要开发针对癌症的新的治疗选择。
发明内容
本披露涉及IL-1β结合抗体或其功能片段(适当地是卡那吉努单抗，适当地是格沃吉珠单抗)用于治疗和/或预防癌症(例如具有至少部分炎症基础的癌症)的用途。具体而言，癌症是骨髓增生异常综合征(MDS)。
在另一方面，本发明涉及用于治疗MDS的IL-1β结合抗体或其功能片段(适当地是卡那吉努单抗，适当地是格沃吉珠单抗)的施用的特定临床剂量方案。在一个实施例中，卡那吉努单抗的优选剂量是每3周或每月优选皮下地施用约200mg。在一个实施例中，患者每3周或每月优选静脉内接受每次治疗约30mg至约120mg的格沃吉珠单抗。
在另一方面，患有MDS的受试者除了施用IL-1β结合抗体或其功能片段(适当地是卡那吉努单抗，适当地是格沃吉珠单抗)之外，还施用一种或多种抗癌治疗剂(例如，化疗剂)和/或已经接受/将要接受减积手术。
还提供了在人受试者中治疗MDS的方法，所述方法包括向所述受试者施用治疗有效量的IL-1β结合抗体或其功能片段。
本发明的另一方面是IL-1β结合抗体或其功能片段在制备用于治疗/预防MDS的药物中的用途。
本披露还提供了药物组合物，其包含治疗有效量的IL-1β结合抗体或其功能片段(适当地是卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)，用于治疗和/或预防MDS。在一个实施例中，包含治疗有效量的IL-1β结合抗体或其功能片段(例如卡那吉努单抗，例如格沃吉珠单抗)的药物组合物为自动注射器的形式。在一个实施例中，将约200mg的卡那吉努单抗装载在自动注射器中。在一个实施例中，将约250mg的卡那吉努单抗装载在自动注射器中。
附图说明
图1.自发性人乳腺癌向人骨转移的体内模型预测IL-1β信号转导在乳腺癌骨转移中的关键作用。将两块0.5cm3的人股骨皮下植入8周龄的雌性NOD SCID小鼠中(n＝10/组)。4周后将萤光素酶标记的MDA-MB-231-luc2-TdTomato或T47D细胞注射至后乳房脂肪垫中。每个实验在三个分开的时间进行，使用不同患者的骨骼进行每次重复。直方图显示与GAPDH相比IL-1B、IL-1R1、胱天蛋白酶1和IL-1Ra拷贝数(dCT)的倍数变化，在体内生长的肿瘤细胞与在组织培养瓶中生长的肿瘤细胞相比(a i)；转移的乳腺肿瘤与未转移的乳腺肿瘤相比(a ii)；循环肿瘤细胞与保留在脂肪垫中的肿瘤细胞相比(a iii)，以及骨转移与相匹配的原发肿瘤相比(a iv)。(b)中显示了IL-1β蛋白表达的倍数变化，(c)中显示了与GAPDH相比与EMT相关的基因(E-钙粘蛋白、N-钙粘蛋白和JUP)拷贝数的倍数变化。与原初骨相比，*＝P<0.01，**＝P<0.001，***＝P<0.0001，^^^＝P<0.001。
图2.用IL-1B稳定转染乳腺癌细胞。使用具有C端GFP标签的人cDNA ORF质粒或对照质粒，用IL-1B稳定转染MDA-MB-231、MCF7和T47D乳腺癌细胞。a)显示了与乱序序列对照相比，来自IL-1β阳性肿瘤细胞裂解物的pg/ng IL-1β蛋白。b)显示了通过ELISA测量的来自10,000个IL-1β+和对照细胞的分泌IL-1β的pg/ml。IL-1B过表达对MDA-MB-231和MCF7细胞增殖的影响分别在(c和d)中显示。与乱序序列对照相比，显示的数据为平均值+/-SEM，*＝P<0.01，**＝P<0.001，***＝P<0.0001。
图3.肿瘤来源的IL-1β在体外诱导上皮向间充质转化。稳定转染MDA-MB-231、MCF7和T47D细胞以表达高水平的IL-1B，或转染乱序序列(对照)以评估内源性IL-1B对与转移相关的参数的影响。升高的内源性IL-1B导致肿瘤细胞从上皮变为间充质表型(a)。b)显示分别与GAPDH和β-连环蛋白相比，IL-1B、IL-1R1、E-钙粘蛋白、N-钙粘蛋白和JUP的拷贝数和蛋白表达的倍数变化。(c)显示了肿瘤细胞通过基质胶和/或8μM孔侵袭成骨细胞的能力，以及使用伤口闭合测定显示了细胞在24和48小时内迁移的能力(d)。数据显示为平均值+/-SEM，*＝P<0.01，**＝P<0.001，***＝P<0.0001。
图4.IL-1β的药理阻断抑制体内自发的转移至人骨。携带两块0.5cm3的人股骨的雌性NOD-SCID小鼠在乳房内注射了MDA-MB-231Luc2-TdTomato细胞。注射肿瘤细胞后一周，小鼠用1mg/kg/天的IL-1Ra、20mg/kg/14天的卡那吉努单抗或安慰剂(对照)进行治疗(n＝10/组)。注射肿瘤细胞后35天选取所有动物。通过萤光素酶成像在体内以及在尸体解剖后立即评估对骨转移的影响(a)并在组织切片上进行离体确认。数据显示为皮下注射D-萤光素2分钟后每秒发出的光子数。(b)中显示了对在循环中检测到的肿瘤细胞数量的影响。*＝P<0.01，**＝P<0.001，***＝P<0.0001。
图5.肿瘤来源的IL-1β在体内促进乳腺癌的骨归巢。向8周大的雌性BALB/c裸鼠经侧尾静脉注射对照(乱序序列)或过表达IL-1β的MDA-MB-231-IL-1β+细胞。通过GFP成像在体内测量骨和肺中的肿瘤生长，并且在组织切片上离体确认发现。a)显示了骨骼中的肿瘤生长；b)显示了带有胫骨的肿瘤的代表性μCT图像，并且该图显示了骨体积(BV)/组织体积(TV)之比，表明对肿瘤引起的骨破坏有影响；c)显示了肺中检测到的来自每种细胞系的肿瘤的数量和大小。*＝P<0.01，**＝P<0.001，***＝P<0.0001。(B＝骨骼，T＝肿瘤，L＝肺)
图6.肿瘤细胞-骨细胞相互作用刺激IL-1β产生细胞增殖。单独培养MDA-MB-231或T47D人乳腺癌细胞系，或与活人骨、HS5骨髓细胞或OB1原代成骨细胞组合培养。a)显示了在活人骨盘中培养MDA-MB-231或T47D细胞对分泌到培养基中的IL-1β浓度的影响。b)和c)中显示了MDA-MB-231或T47D细胞与HS5骨细胞共培养对源自细胞分选后的单个细胞类型的IL-1β的影响以及对这些细胞的增殖的影响。d)中显示了MDA-MB-231或T47D细胞与OB1(成骨细胞)共培养对增殖的影响。数据显示为平均值+/-SEM，*＝P<0.01，**＝P<0.001，***＝P<0.0001。
图7.骨微环境中的IL-1β刺激骨转移微环境的扩展。(a)中显示了向MDA-MB-231或T47D乳腺癌细胞中添加40pg/ml或5ng/ml重组IL-1β的影响，以及b)和c)分别显示了添加20pg/ml、40pg/ml或5ng/ml IL-1B对HS5、骨髓或OB1成骨细胞增殖的影响。(d)在来自10-12周龄雌性IL-1R1基因敲除小鼠的胫骨小梁区域中进行CD34染色后，测量了IL-1驱动的骨血管改变。(e)用1mg/ml/天的IL-1Ra治疗31天的BALB/c裸鼠，以及(f)用10μM卡那吉努单抗治疗4-96小时的C57BL/6小鼠。数据显示为平均值+/-SEM，*＝P<0.01，**＝P<0.001，***＝P<0.0001。
图8.IL-1信号传导的抑制影响骨完整性和血管。对来自不表达IL-1R1(IL-1R1KO)的小鼠、每天以1mg/kg的IL-1R拮抗剂治疗21天和31天的BALB/c裸鼠和以10mg/kg的卡那吉努单抗(Ilaris)治疗0-96小时的C57BL/6小鼠的胫骨和血清针对以下进行分析：通过μCT分析骨完整性并且通过针对内皮素1和泛VEGF的ELISA分析血管。a)显示了IL-1R1 KO的影响；b)阿那白滞素的影响，以及c)与组织体积(i)、内皮素1的浓度(ii)和分泌到血清中的VEGF的浓度相比卡那吉努单抗对骨体积的影响。与对照相比，显示的数据为平均值+/-SEM，*＝P<0.01，**＝P<0.001，***＝P<0.0001。
图9.肿瘤来源的IL-1β预测II期和III期乳腺癌患者的未来复发和骨复发。对约1300例无转移迹象的II期和III期乳腺癌患者的原发性乳腺癌样品进行17kD活性IL-1β染色。在肿瘤细胞群体中对肿瘤进行IL-1β评分。显示的数据为Kaplan Meyer曲线，表示肿瘤来源的IL-1β与随后的在10年时间段内a)在任何部位或b)在骨中复发之间的相关性。
图10.卡那吉努单抗PK谱和hsCRP谱的模拟。a)显示了卡那吉努单抗浓度时间谱。实线和带：预测间隔为2.5％-97.5％的各个模拟浓度的中值(300mg Q12W(底线)、200mgQ3W(中线)，和300mg Q4W(顶线))。b)显示了三个不同群体第3个月hsCRP低于1.8mg/L的临界点的比例：所有CANTOS患者(情境1)，确诊的肺癌患者(情境2)和晚期肺癌患者(情境3)以及三种不同的剂量方案。c)与b)相似，临界点为2mg/L。d)显示了三种不同剂量随时间的hsCRP浓度中值。e)显示了单剂量后与基线hsCRP相比的降低百分比。
图11.对接受PDR001与卡那吉努单抗组合、PDR001与依维莫司组合和PDR001与其它组合的结肠直肠癌患者，通过RNA测序进行基因表达分析。在热图的附图中，每一行代表标记基因的RNA水平。用垂直线描绘患者样品，在左列中显示筛选(预处理)样品，在右列中显示周期3(治疗中)样品。每个基因的RNA水平均按行标准化，黑色表示RNA水平较高的样品，白色表示RNA水平较低的样品。中性粒细胞特异性基因FCGR3B、CXCR2、FFAR2、OSM和G0S2加框表示。
图12.格沃吉珠单抗治疗后的临床数据(a组)及其外推至更高剂量(b，c和d组)。a)患者中hsCRP相对于基线的调整百分比变化。b)中显示了六种不同的hsCRP基线浓度的hsCRP暴露应答关系。b)和c)中显示了两种不同剂量的格沃吉珠单抗的模拟。
图13.在两种癌症小鼠模型中抗IL-1β治疗的影响。a)、b)和c)显示来自MC38小鼠模型的数据，d)和e)显示来自LL2小鼠模型的数据。
图14.卡那吉努单抗与兰洛利珠单抗组合抑制肿瘤生长的功效。
图15.卡那吉努单抗与多西他赛组合治疗癌症的临床前数据。
图16.在肿瘤植入后第8天和第15天，将4T1细胞sc植入小鼠，并用指定的治疗进行治疗。每组有10只小鼠。
图17.单剂量的多西他赛、01BSUR或多西他赛与01BSUR的组合后5天，4T1肿瘤中的中性粒细胞(上)和单核细胞(下)。
图18.单剂量的多西他赛、01BSUR或多西他赛与01BSUR的组合后5天，4T1肿瘤中的粒细胞(上)和单核细胞(下)MDSC。
图19.第二剂量的多西他赛、01BSUR或多西他赛与01BSUR的组合后4天，在4T1肿瘤中的TIM-3+CD4+(上)和CD8+(下)T细胞。
图20.第二剂量的多西他赛、01BSUR或多西他赛与01BSUR的组合后4天，4T1肿瘤中的表达TIM-3的Treg。
图21.根据基线临床特征，根据亚组，卡那吉努单抗与安慰剂相比对易发性贫血的临床功效。数据显示为与安慰剂相比，卡那吉努单抗组合剂量(50mg、150mg和300mg)的危险比。
图22.≥65岁或<65岁的安慰剂和卡那吉努单抗组中的贫血发生率。
具体实施方式
在慢性炎症区域出现许多恶性肿瘤，并且认为炎症消退的不足在肿瘤的侵袭、进展和转移中起主要作用(Voronov E等人,PNAS 2003)。
有许多观察结果表明IL-1β在MDS中起作用。炎症在MDS中有广泛描述(Barreyro等人,Blood[血液].2018)，特别是NLRP3炎性小体已被证明是骨髓增生异常综合征表型的驱动因素，这导致IL-1β的产生以及MDS造血干细胞和祖细胞的细胞焦亡(Basiorka等人,Blood[血液].2016；128(25):2960-2975)。已经发现IL-1β基因的改变(单核苷酸多态性，SNP)与骨髓增生异常综合征的易感性有关，并且具有IL-1β多态性的患者比不具有IL-1β多态性的患者的血红蛋白更低(Yin等人,Life Sci.[生命科学]2016；165:109-112)。此外，IL-1β与红细胞生成素的转录抑制和细胞加工有关(Cluzeau等人,Haematologica[血液学].2017；102(12):2015-2020)。高水平的IL-1β能够在体外阻断红细胞生成素对红系祖细胞的增殖作用(Schooley等人，1987年)，并且造血干细胞长期暴露于升高的IL-1β在体内促进髓系分化，抑制红系分化并导致造血干细胞衰竭(Pietras等人2016)。同样，IL-1β(连同TNFα)已被确认为骨髓抑制细胞因子(其由骨髓细胞以p38 MAPK依赖性方式分泌)，导致CD34+干细胞凋亡(Navas等人,Leuk Lymphoma[白血病和淋巴瘤].2008；49(10):1963-75)。
如Ridker等人(Lancet，2017)报道，卡那吉努单抗在10061个动脉粥样硬化患者(其患有心肌梗塞，无先前诊断出的癌症且高敏感性C反应蛋白(hsCRP)浓度为2mg/L或更高)中的一项随机、双盲、安慰剂对照试验在2017年六月完成(CANTOS试验)。为了评估剂量应答的效果，通过计算机生成的代码将患者随机分配到三个卡那吉努单抗剂量(每3个月皮下50mg、150mg和300mg)或安慰剂。
hsCRP(中值6·0mg/L相比于4·2mg/L；p<0·0001)和白介素6(3·2相比于2·6ng/L；p<0·0001)的基线浓度在随后被诊断患有肺癌的参与者中比在未诊断出癌症的参与者中显著更高。在3 7年的中值随访期间，与安慰剂相比，卡那吉努单抗与剂量依赖性的hsCRP浓度降低26％-41％和白介素6浓度降低25％-43％有关(对于所有比较，p<0·0001)。合并卡那吉努单抗组的总癌症死亡率(n＝196)显著低于安慰剂组(各组间趋势p＝0·0007)，但仅单独在300mg组中显著低于安慰剂(危险比[HR]0·49[95％CI 0·31-0·75]；p＝0·0009)。在150mg(HR 0·61[95％CI0·39-0·97]；p＝0·034)和300mg组(HR 0·33[95％CI 0·18-0·59]；p<0·0001；各组间趋势p<0·0001)中，易发性肺癌(n＝129)的频率显著降低。肺癌死亡率在卡那吉努单抗300mg组中显著低于安慰剂组(HR0·23[95％CI0·10-0·54]；p＝0·0002)并且在合并的卡那吉努单抗群体中显著低于安慰剂组(各组间趋势p＝0·0002)。
来自CANTOS试验的非肺癌患者(尤其是GI/GU癌症)的生物标志物分析显示，他们的基线hsCRP水平和IL-6水平升高。此外，与基线水平较低的患者相比，hsCRP和IL-6基线水平较高的GI/GU癌症患者的癌症诊断时间似乎更短(实例11)，表明IL-1β介导的炎症参与除肺癌外还有更广泛的癌症适应症的可能性，这保证了在这些癌症的治疗中靶向IL-1β。此外，GI/GU患者的hsCRP水平和IL-6水平在CANTOS试验治疗组的其他患者可比的范围内降低，表明这些患者的IL-1β信号传导受到抑制。如实例中提供的数据进一步支持的，单独抑制IL-1β或优选与其他抗癌剂组合可导致在治疗癌症例如具有至少部分炎症基础的癌症方面的临床益处。
癌症，例如具有至少部分炎症基础的癌症
因此，一方面，本发明提供了IL-1β结合抗体或其功能片段(为了简洁起见，术语“IL-1β结合抗体或其功能片段”在本申请中有时称为“本发明的药物”，应将其理解为相同的术语)、适当地是卡那吉努单抗或其功能片段(包括在本发明的药物中)、适当地是格沃吉珠单抗或其功能片段(包括在本发明的药物中)用于治疗和/或预防MDS的用途。
描绘肿瘤与肿瘤微环境之间相互作用的高级研究表明，慢性炎症可以促进肿瘤的发展，而肿瘤可以促进炎症，从而促进肿瘤的进展和转移。具有细胞和非细胞分泌因子的炎症微环境通过诱导血管生成、招募促肿瘤细胞、免疫抑制细胞和抑制免疫效应细胞介导的抗肿瘤免疫应答为肿瘤进展提供了庇护所。支持肿瘤发展和进展的主要炎性途径之一是IL-1β，它是由肿瘤和肿瘤相关的免疫抑制细胞(包括肿瘤微环境中的中性粒细胞和巨噬细胞)产生的促炎细胞因子。
因此，本公开提供了使用IL-1β结合抗体或其功能片段治疗癌症的方法，其中这样的IL-1β结合抗体或其功能片段可以减轻炎症和/或改善肿瘤微环境，例如，它们可以在肿瘤微环境中抑制IL-1β介导的炎症和IL-1β介导的免疫抑制。在本文的实例6中显示了使用IL-1β结合抗体来调节肿瘤微环境的例子。在一些实施例中，IL-1β结合抗体或其功能片段单独用作单一疗法。在一些实施例中，IL-1β结合抗体或其功能片段与另一种疗法(例如检查点抑制剂和/或一种或多种化疗剂)组合使用。如本文所论述，炎症可以促进肿瘤发展，IL-1β结合抗体或其功能片段单独或与另一种疗法组合，可以用于治疗可受益于减轻IL-1β介导的炎症和/或改善肿瘤环境的任何癌症。尽管程度不同，但炎症组分普遍存在于癌症的发展过程中。
“具有至少部分炎症基础的癌症”或“具有至少部分炎症基础的癌症”的含义是本领域所熟知的，并且如本文所用，是指其中IL-1β介导的炎症应答促成肿瘤发展和/或传播(包括但不限于转移)的任何癌症。此类癌症通常具有伴随的炎症激活的炎症或部分通过Nod样受体蛋白3(NLRP3)炎性小体激活并由此引起局部白介素-1β的产生而介导的炎症。在患有这种癌症的患者中，与正常组织相比，通常可以在肿瘤的部位(尤其是在肿瘤的周围组织中)检测到IL-1β的表达或甚至过表达。可以通过本领域已知的常规方法来检测IL-1β的表达，例如在肿瘤以及血清/血浆中的免疫染色、基于ELISA的测定、ISH、RNA测序或RT-PCR。IL-1β的表达或更高表达可以被推断出，例如针对阴性对照(通常是在相同部位的正常组织)或如果高于健康人的血清/血浆中存在的正常水平的IL-1β(参考值)则可以被推断出。同时地或可替代地，患有这种癌症的患者通常患有慢性炎症，其表现为通常高于正常水平的hsCRP(或CRP)、IL-6或TNFα，优选hsCRP或IL-6，优选IL-6。这是因为IL-6紧接IL-1β的下游。HsCRP在更下游，并可能受其他因素影响。癌症，特别是具有至少部分炎症基础的癌症，包括MDS。癌症还包括最初可能不表达IL-1β，仅在此类癌症治疗(例如，包括用如本文所述的化疗剂治疗，其有助于在肿瘤和/或肿瘤微环境中表达IL-1β)之后才开始表达IL-1β的癌症。在一些实施例中，所述方法和用途包括治疗其癌症用所述试剂治疗后复发或再发生的患者。在其它实施例中，所述试剂与IL-1β表达相关，并且IL-1β抗体或其功能片段与该药剂组合给药。
IL-1β的抑制导致炎症状态降低，包括但不限于降低的hsCRP或IL-6水平。因此，本发明对癌症患者的影响可以通过减少的炎症状态来测量，包括但不限于降低的hsCRP或IL-6水平。
术语“具有至少部分炎症基础的癌症(cancers that have at least a partialinflammatory basis或cancer having at least a partial inflammatory basis)”还包括受益于IL-1β结合抗体或其功能片段的治疗的癌症。由于炎症通常已在早期阶段促进肿瘤生长，因此施用IL-1β结合抗体或其功能片段(卡那奴单抗或格沃吉珠单抗)可能会在早期阶段有效阻止肿瘤生长或在早期阶段有效延迟肿瘤进展，即使炎症状态(例如表达或过表达IL-1β，或CRP或hsCRP、IL-6或TNFα的水平升高)仍然不明显或无法测量。但是，患有早期癌症的患者仍然可以从IL-1β结合抗体或其功能片段的治疗中受益，这可以在临床试验中表现出来。临床受益可以通过以下方法测量，包括但不限于无病生存期(DFS)、无进展生存期(PFS)、总体应答率(ORR)、疾病控制率(DCR)、应答持续时间(DOR)和总体生存期(OS)，优选在临床试验情境中针对适当的对照组，例如针对通过在SoC之上添加或不使用SoC的护理标准(SoC)药物实现的效果。如果与对照相比，用本发明的药物治疗的患者在上述一个或多个参数方面显示出任何改善，则认为所述患者受益于根据本发明的治疗。
本领域技术人员已知的可用技术允许检测和定量组织以及血清/血浆中的IL-1β，特别是当IL-1β在高于正常水平处表达时。例如，使用R&D系统公司的高敏感性IL-1β ELISA试剂盒，无法在大多数健康供体血清样品中检测到IL-1β，如下表
样品值
血清/血浆-在本测定中评估明显健康的志愿者的样品中人IL-1β的存在。
对于在本研究中使用的供体没有可用的医疗史。
样品类型 可检测的平均值(pg/mL) ％可检测的 范围(pg/mL)
血清(n＝50) 0.357 10 ND-0.606
EDTA血浆(n＝50) 0.292 12 ND-0.580
肝素血浆(n＝50) 0.448 14 ND-1.08
ND＝不可检测的
所示。
因此，根据本测试，使用高敏感性
Figure BDA0003119995180000101
Il-1β ELISA试剂盒，在健康人中IL-1β水平几乎检测不到或略高于检测极限。预期具有至少部分炎症基础的癌症患者具有高于正常水平的IL-1β，并且IL-1β的水平可以通过相同的试剂盒进行检测。以健康人的IL-1β表达水平为正常水平(参考水平)，术语“高于正常水平的IL-1β”是指高于参考水平的IL-1β水平。通常，参考水平的至少约2倍、至少约5倍、至少约10倍、至少约15倍、或至少约20倍被认为高于正常水平。可替代地，以健康人的IL-1β表达水平为正常水平(参考水平)，术语“高于正常水平的IL-1β”是指高于参考水平的IL-1β水平，通常高于0.8pg/ml、高于1pg/ml、高于1.3pg/ml、高于1.5pg/ml、高于2pg/ml、高于3pg/ml，如优选通过上述R&D试剂盒所测定的。阻断IL-1β途径通常会触发补偿机制，导致更多的IL-1β产生。因此，术语“高于正常水平的IL-1β”也表示并包括IL-1β结合抗体或其片段施用后或更优选地在施用之前的IL-1β水平。用IL-1β抑制剂以外的药剂(例如某些化疗剂)治疗癌症可导致肿瘤微环境中IL-1β的产生。因此，术语“高于正常水平的IL-1β”也指在施用这种药剂之前或之后的IL-1β水平。
当使用染色(例如免疫染色)检测组织制品中的IL-1β表达时，术语“高于正常水平的IL-1β”是指通过特异性IL-1β蛋白或IL-1β RNA检测分子产生的染色信号明显强于不表达IL-1β的周围组织的染色信号。
本领域技术人员已知的可用技术允许检测和定量组织以及血清/血浆中的IL-6，特别是当IL-6表达至高于正常水平时。例如，使用R&D系统公司(www.RnDsystems.com)“高定量人HS ELISA，人IL-6免疫测定”，可以在大多数健康供体血清样品中检测到IL-6，如下表所示。
样品值
在本测定中评估明显健康的志愿者的样品中人IL-6的存在。
对于在本研究中使用的供体没有可用的医疗史。
Figure BDA0003119995180000111
ND＝不可检测的
预期在具有至少部分炎症基础的癌症患者中，其IL-6水平通常高于正常水平，并且可以通过相同的试剂盒进行检测。以健康人的IL-6表达水平为正常水平(参考水平)，术语“高于正常水平的IL-6”是指高于参考水平的IL-6水平，通常高于1.9pg/ml、高于2pg/ml、高于2.2pg/ml、高于2.5pg/ml、高于2.7pg/ml、高于3pg/ml、高于3.5pg/ml或高于4pg/ml，如优选通过上述R&D试剂盒所测定的。阻断IL-1β途径通常会触发补偿机制，导致更多的IL-1β产生。因此，术语“高于正常水平的IL-6”也表示并包括IL-1β结合抗体或其片段施用后或更优选地在施用之前的IL-6水平。用IL-1β抑制剂以外的药剂(例如某些化疗剂)治疗癌症可导致肿瘤微环境中IL-1β的产生。因此，术语“高于正常水平的IL-6”也指在施用这种药剂之前或之后的IL-6水平。
当使用染色(例如免疫染色)检测组织制品中的IL-6表达时，术语“高于正常水平的IL-6”是指通过特异性IL-6蛋白或IL-6RNA检测分子产生的染色信号明显强于不表达IL-6的周围组织的染色信号。
如本文使用的，术语“治疗(treat、treatment和treating)”是指由施用一种或多种疗法导致的障碍(例如增殖性障碍)的进展、严重性和/或持续时间的减少或缓解，或者障碍的一种或多种症状(适当地，一种或多种可辨别的症状)的缓解。在具体的实施例中，术语“治疗(treat、treatment和treating)”是指改善增殖性障碍的至少一种可测量的物理参数，如肿瘤的生长，这不一定是患者可辨别的。在其他实施例中，术语“治疗(treat、treatment和treating)”是指通过例如稳定可辨别的症状来物理地，或通过例如稳定物理参数来生理地，或通过两者，抑制增殖性障碍的进展。在其他实施例中，术语“治疗(treat、treatment和treating)”是指患者中MDS因子的减少或稳定(使用国际预后评分系统(IPSS和修订的IPSS-R)和/或WHO预后评分系统(WPSS)进行定量)或癌细胞计数的减少或稳定。就本文讨论的癌症而言，以MDS为例，术语治疗是指以下至少一种：缓解MDS的一种或多种症状，延迟MDS的进展，改善患者的MDS因子，稳定患者的MDS因子，延长总体生存期，延长无进展生存期，预防或延迟MDS肿瘤转移，预防或延迟MDS进展为继发性急性髓性白血病，减少(例如消除)先前存在的MDS转移，减少先前存在的MDS转移的发生率或负担或预防MDS复发。
IL-1β抑制剂，尤其是IL-1β结合抗体或其片段
如本文所用，IL-1β抑制剂包括但不限于卡那吉努单抗或其功能片段、格沃吉珠单抗或其功能片段、阿那白滞素、双醋瑞因、利纳西普、IL-1亲合体(SOBI 006，Z-FC(瑞典Orphan Biovitrum/亲合体)和鲁吉珠单抗(ABT-981)(雅培公司)，CDP-484(细胞技术公司(Celltech))，LY-2189102(礼来公司(Lilly))。
在本发明的任何用途或方法的一个实施例中，所述IL-1β结合抗体是卡那吉努单抗。卡那吉努单抗(ACZ885)是针对白介素-1β的高亲和力、完全人源的IgG1/k单克隆抗体，已开发用于治疗IL-1β驱动的炎症性疾病。它被设计为与人IL-1β结合，从而阻断该细胞因子与其受体的相互作用。
在本发明的任何用途或方法的其它实施例中，所述IL-1β结合抗体是格沃吉珠单抗。格沃吉珠单抗(XOMA-052)是针对白介素-1β的高亲和力、人源化的IgG2同种型的单克隆抗体，已开发用于治疗IL-1β驱动的炎症性疾病。格沃吉珠单抗调节IL-1β与其信号受体的结合。
在一个实施例中，所述IL-1β结合抗体是LY-2189102，其是人源化的白介素-1β(IL-1β)单克隆抗体。
在一个实施例中，所述IL-1β结合抗体或其功能片段是CDP-484(细胞技术公司)，其是阻断IL-1β的抗体片段。
在一个实施例中，所述IL-1β结合抗体或其功能片段是IL-1亲合体(SOBI 006，Z-FC(瑞典Orphan Biovitrum/亲合体))。
如本文所用，抗体是指具有抗体的天然生物学形式的抗体。这种抗体是一种糖蛋白，由四个多肽(两条相同的重链和两条相同的轻链)组成，连接形成“Y”形分子。每条重链由重链可变区(VH)和重链恒定区组成。重链恒定区由三个或四个恒定结构域(CH1、CH2、CH3和CH4，取决于抗体种类或同种型)构成。每条轻链由轻链可变区(VL)和具有一个结构域的轻链恒定区CL构成。木瓜蛋白酶，一种蛋白水解酶，将“Y”形分裂为三个独立的分子，两个称为“Fab”片段(Fab＝片段抗原结合)，另一个称为“Fc”片段(Fc＝可结晶片段)。Fab片段由整个轻链和部分重链组成。VL和VH区位于“Y”形抗体分子的末端。VL和VH分别具有三个互补决定区(CDR)。
“IL-1β结合抗体”是指能够特异性结合IL-1β并因此抑制或调节IL-1β与其受体的结合并进而抑制IL-1β功能的任何抗体。优选地，IL-1β结合抗体不结合IL-1α。
优选地，IL-1β结合抗体包括：
(1)抗体，其包含三个VL CDR(具有氨基酸序列RASQSIGSSLH(SEQ ID NO:1)、ASQSFS(SEQ ID NO:2)和HQSSSLP(SEQ ID NO:3))和三个VH CDR(具有氨基酸序列VYGMN(SEQ ID NO:5)、IIWYDGDNQYYADSVKG(SEQ ID NO:6)和DLRTGP(SEQ ID NO:7))；
(2)抗体，其包含三个VL CDR(具有氨基酸序列RASQDISNYLS(SEQ ID NO:9)、YTSKLHS(SEQ ID NO:10)和LQGKMLPWT(SEQ ID NO:11))和三个VH CDR(具有氨基酸序列TSGMGVG(SEQ ID NO:13)、HIWWDGDESYNPSLK(SEQ ID NO:14)和NRYDPPWFVD(SEQ ID NO:15))；以及
(3)抗体，其包含(1)或(2)中所述的六个CDR，其中一个或多个CDR序列，优选至多两个CDR，优选仅一个CDR与(1)或(2)中所述的相应序列分别差异一个氨基酸。
优选地，IL-1β结合抗体包括：
(1)抗体，其包含三个VL CDR(具有氨基酸序列RASQSIGSSLH(SEQ ID NO:1)、ASQSFS(SEQ ID NO:2)和HQSSSLP(SEQ ID NO:3))并包含具有SEQ ID NO：8所示氨基酸序列的VH；
(2)抗体，其包含具有SEQ ID NO：4所示氨基酸序列的VL并且包含三个VH CDR(具有氨基酸序列VYGMN(SEQ ID NO:5)、IIWYDGDNQYYADSVKG(SEQ ID NO:6)和DLRTGP(SEQ IDNO:7))；
(3)抗体，其包含三个VL CDR(具有氨基酸序列RASQDISNYLS(SEQ ID NO:9)、YTSKLHS(SEQ ID NO:10)和LQGKMLPWT(SEQ ID NO:11))并且包含具有SEQ ID NO：16所示氨基酸的VH；
(4)抗体，其包含具有SEQ ID NO：12所示氨基酸的VL并且包含三个VH CDR(具有氨基酸序列TSGMGVG(SEQ ID NO:13)、HIWWDGDESYNPSLK(SEQ ID NO:14)和NRYDPPWFVD(SEQID NO:15))；
(5)抗体，其包含(1)或(3)中所述的三个VL CDR和VH序列，其中一个或多个VL CDR序列，优选至多两个CDR，优选仅一个CDR与(1)或(3)中所述的相应序列分别差异一个氨基酸，并且其中VH序列分别与(1)或(3)中所述的相应序列至少90％相同；以及
(6)抗体，其包含(2)或(4)中所述的VL序列和三个VH CDR，其中VL序列分别与(2)或(4)中所述的相应序列至少90％相同，并且其中一个或多个VH CDR序列，优选至多两个CDR，优选仅一个CDR与(2)或(4)中所述的相应序列分别差异一个氨基酸。
优选地，IL-1β结合抗体包括：
(1)抗体，其包含具有SEQ ID NO：4所示氨基酸序列的VL并且包含具有SEQ ID NO：8所示氨基酸序列的VH；
(2)一种抗体，其包含具有SEQ ID NO：12所示氨基酸的VL并且包含具有SEQ IDNO：16所示氨基酸的VH；以及
(3)(1)或(2)中所述的抗体，其中与卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗相比，重链的恒定区、轻链的恒定区或两者已改变为不同的同种型。
优选地，IL-1β结合抗体包括：
(1)卡那吉努单抗(SEQ ID NO：17和18)；以及
(2)格沃吉珠单抗(SEQ ID NO：19和20)。
如上定义的IL-1β结合抗体具有与卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗的CDR序列基本相同或相同的CDR序列。因此，它与IL-1β上的相同表位结合，并具有与卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗相似的结合亲和力。已经针对卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗建立的在治疗癌症(尤其是具有至少部分炎症基础的癌症)方面具有治疗效果的临床相关剂量和给药方案将适用于其他IL-1β结合抗体。
另外或可替代地，IL-1β抗体是指能够以与卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗相似的亲和力特异性结合IL-1β的抗体。WO 2007/050607中卡那吉努单抗的Kd参考为30.5pM，而格沃吉珠单抗的Kd为0.3pM。因此，在相似范围内的亲和力是指约0.05pM至300pM，优选0.1pM至100pM。尽管两者均与IL-1β结合，但卡那吉努单抗直接抑制与IL-1受体的结合，而格沃吉珠单抗是一种变构抑制剂。它不会阻止IL-1β与受体结合，但会阻止受体激活。优选地，IL-1β抗体具有与卡那吉努单抗相似范围的结合亲和力，优选地在1pM至300pM的范围内，优选地在10pM至100pM的范围内，其中优选地，所述抗体直接抑制结合。优选地，IL-1β抗体具有与格沃吉珠单抗相似范围的结合亲和力，优选地在0.05pM至3pM的范围内，优选地在0.1pM至1pM的范围内，其中优选地，所述抗体是变构抑制剂。
如本文所用，术语抗体的“功能片段”是指保留特异结合抗原(例如，IL-1β)的能力的抗体的部分或片段。涵盖在术语抗体的“功能片段”内的结合片段的实例包括单链Fv(scFv)、Fab片段，其是由VL、VH、CL和CH1结构域组成的单价片段；F(ab)2片段，包含在铰链区通过二硫桥连接的两个Fab片段的二价片段；Fd片段，其由VH和CH1结构域组成；Fv片段，其由抗体的单臂的VL和VH结构域组成；dAb片段(Ward等人,1989)，其由VH结构域组成；以及分离的互补决定区(CDR)；以及排列在肽支架上的一个或多个CDR，所述肽支架可以与典型抗体相比更小、更大或折叠不同。
术语“功能片段”也可指以下之一：
·双特异性单链Fv二聚体(PCT/US 92/09965)
·通过基因融合构建的“双抗体”或“三抗体”，多价或多特异性片段(TomlinsonI&Hollinger P(2000)Methods Enzymol[酶学方法].326:461-79；W094113804；Holliger P等人,(1993)Proc.Natl.Acad.Sci[美国国家科学院院刊].USA,90:6444-48)
·将scFv遗传融合到相同或不同的抗体上(Coloma MJ和Morrison SL(1997)Nature Biotechnology[自然生物技术],15(2):159-163)
·与Fc区融合的scFv、双抗体或结构域抗体
·与相同或不同抗体融合的scFv
·Fv，scFv或双抗体分子可以通过掺入连接VH和VL结构域的二硫桥来稳定(Reiter,Y.等人,(1996)Nature Biotech[自然生物技术],14,1239-1245)。
·也可以制备包含与CH3结构域连接的scFv的小抗体(Hu,S.等人,(1996)CancerRes.[癌症研究],56,3055-3061)。
·结合片段的其他思路是Fab'(其与Fab片段的区别在于在重链CH1结果域的羧基末端添加了一些残基，包括来自抗体铰链区的一个或多个半胱氨酸)，以及Fab'-SH(其是Fab'片段，其中恒定域的一个或多个半胱氨酸残基带有游离硫醇基团)。
通常并且优选地，IL-1β结合抗体的功能片段是如上定义的“IL-1β结合抗体”的一部分或片段。
本发明的给药方案
如果以能够有效降低患者(患有具有至少部分炎症基础的癌症)的hsCRP水平的剂量范围施用IL-1β抑制剂(例如IL-1β抗体或其功能片段)，所述癌症的治疗效果可能会实现。特定IL-1β抑制剂(优选地IL-1β抗体或其功能片段)的可以有效降低hsCRP水平的剂量范围是已知的或可以在临床情境中进行测试。
因此，在一个实施例中，本发明包括将IL-1β结合抗体或其功能片段施用给患有具有至少部分炎症基础的癌症的患者，每次治疗在约20mg至约400mg的范围，优选每次治疗在约30mg至约400mg的范围，优选每次治疗在约30mg至约200mg的范围，优选在约60mg至约200mg的范围。在一个实施例中，患者约每两周、约每三周、约每四周(每月)、约每6周、约每双个月(约每2个月)、约每九周或约每季度(约每3个月)接受一次治疗。在一个实施例中，患者约每3周接受一次治疗。在一个实施例中，患者约每4周接受一次治疗。在本申请中，尤其是在本上下文中使用的术语“每次治疗”应理解为每次医院就诊或每次自我施用或每次由健康护理者协助施用的药物总量。通常并且优选地，在约2小时内，优选在约一小时内或在约半小时内向患者施用每次治疗所接受的药物总量。在一个优选的实施例中，术语“每次治疗”应理解为药物以一次注射施用，优选以一个剂量施用。
在实践中，由于医生、患者或药物/设施的可用性的限制，有时不能严格保持时间间隔。因此，时间间隔可以略有变化，通常在约5天、约4天、约3天、约2天或优选地约1天之间。
有时需要快速减轻炎症。IL-1β自诱导已在体外在人单核血液、人血管内皮和血管平滑肌细胞中以及在兔中体内显示出来，其中已证明IL-1会诱导其自身的基因表达和循环中的IL-1β水平(Dinarello等人.1987,Warner等人.1987a,和Warner等人.1987b)。
该通过施用第一剂，然后在第一剂施用约两周后施用第二剂的超过约2周的诱导期是为了确保在治疗开始时充分抑制IL-1β途径的自诱导。这种早期高剂量施用对IL-1β相关基因表达的完全抑制，加上持续的卡那吉努单抗治疗效果(已被证明能持续整个CANTOS的季度给药周期)是为了最小化IL-1β反弹的可能性。此外，急性炎症情境中的数据表明，通过诱导可获得的更高初始剂量的卡那吉努单抗是安全的，并提供了改善对潜在的IL-1β自诱导的关注以及实现对IL-1β相关基因表达的更大的早期抑制的机会。
因此，在一个实施例中，本发明在保持上述给药时间表的同时，特别设想本发明的药物的第二次施用距首次施用约一周或至多约两周，优选地约两周。然后，第三次及以后的施用将按照约每2周、约每3周、约每4周(每月)、约每6周、每双个月(约每2个月)、约每9周、或约每季度(约每3个月)的时间表。
在一个实施例中，IL-1β结合抗体是卡那吉努单抗，其中卡那吉努单抗施用给患有癌症的患者，例如具有至少部分炎症基础的癌症，每次治疗在约100mg至约400mg的范围，优选约200mg。在一个实施例中，患者约每2周、约每3周、约每4周(约每月)、约每6周、约每双个月(约每2个月)、约每9周或约每季度(约每3个月)接受一次治疗。在一个实施例中，患者约每月或约每三周接受卡那吉努单抗。在一个实施例中，卡那吉努单抗对患者的优选剂量是每3周约200mg。在一个实施例中，卡那吉努单抗的优选剂量是每月约200mg。当引起安全关注时，剂量可以滴定降低，优选地通过增加给药间隔，优选地通过使给药间隔增至两倍或三倍。例如，约每月或约每3周约200mg的方案可分别改变为约每2个月或约每6周或约每3个月或约每9周。在一个可替代的实施例中，患者在滴定阶段或没有任何安全性问题的维持阶段或在整个治疗阶段约每两个月或约每6周接受约200mg剂量的卡那吉努单抗。在一个可替代的实施例中，患者在滴定阶段或没有任何安全性问题的维持阶段或在整个治疗阶段约每3个月或约每9周接受约200mg剂量的卡那吉努单抗。在一个可替代的实施例中，患者接受约150mg，约250mg或约300mg剂量的卡那吉努单抗。在一个可替代的实施例中，患者约每4周接受约150mg剂量的卡那吉努单抗。在一个可替代的实施例中，患者约每4周接受约250mg剂量的卡那吉努单抗。在一个可替代的实施例中，患者约每4周接受约300mg剂量的卡那吉努单抗。
适当地，上述剂量和给药适用于根据本发明的卡那吉努单抗功能片段的使用。
卡那吉努单抗或其功能片段可以静脉内或皮下施用，优选皮下施用。
本文披露的给药方案适用于本申请中披露的每个和各个卡那吉努单抗相关实施例，包括但不限于单一疗法或与一种或多种抗癌治疗剂组合，用于辅助情境或一线、二线或三线治疗。
在一个实施例中，本发明包括向患有癌症(例如具有至少部分炎症基础的癌症)的患者施用格沃吉珠单抗，每次治疗在约20mg至约240mg的范围内，每次治疗优选在约20mg至约180mg的范围内，优选在约30mg至约120mg的范围内，优选在约30mg至约60mg的范围内，优选在约60mg至约120mg的范围内。在一个实施例中，患者每次治疗接受约30mg至约120mg。在一个实施例中，患者每次治疗接受约30mg至约60mg。在一个实施例中，患者每次治疗接受约30mg、约60mg、约90mg、约120mg或约180mg。在一个实施例中，患者约每2周、约每3周、约每月(约每4周)、约每6周、约每双个月(约每2个月)、约每9周或约每季度(约每3个月)接受一次治疗。在一个实施例中，患者约每3周接受一次治疗。在一个实施例中，患者约每4周接受一次治疗。
当引起安全关注时，剂量可以滴定降低，优选地通过增加给药间隔，优选地通过使给药间隔增至两倍或三倍。例如，约每月或约每3周约60mg的方案可分别增至两倍为约每2个月或约每6周或增至三倍为约每3个月或约每9周。在一个可替代的实施例中，患者在滴定阶段或没有任何安全性问题的维持阶段或在整个治疗阶段约每2个月或约每6周接受约30mg至约120mg剂量的格沃吉珠单抗。在一个可替代的实施例中，患者在滴定阶段或没有任何安全性问题的维持阶段或在整个治疗阶段约每3个月或约每9周接受约30mg至约120mg剂量的格沃吉珠单抗。
适当地，上述剂量和给药适用于根据本发明的格沃吉珠单抗功能片段的使用。
格沃吉珠单抗或其功能片段可以静脉内或皮下施用，优选静脉内施用。
本文披露的给药方案适用于本申请中披露的每个和各个格沃吉珠单抗相关实施例，包括但不限于单一疗法或与一种或多种抗癌治疗剂组合，用于辅助情境或一线、二线或三线治疗。
当卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗与一种或多种抗癌治疗剂(例如化疗剂或检查点抑制剂)组合使用时，尤其是当一种或多种治疗剂是癌症适应症的SoC时，为了患者的方便起见，卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗的给药间隔可以调整为与组合伴侣对齐。通常，无需每次治疗更改卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗剂量。例如，约每3周与兰洛利珠单抗组合施用约200mg卡那吉努单抗。例如，约每4周与FOLFOX组合施用约200mg卡那吉努单抗。例如，约每4周与MBG453组合施用约250mg卡那吉努单抗。
生物标志物
一方面，本发明提供了IL-1β结合抗体或其功能片段(适当地是卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)在C反应蛋白(hsCRP)水平高于正常水平的患者中治疗MDS的用途。
如本文所用，“C反应蛋白”和“CRP”是指血清或血浆C反应蛋白，其典型地用作炎症急性期应答的指标。但是，在例如癌症的慢性疾病中，CRP水平可能会升高。血清或血浆中的CRP水平可用任何浓度给出，例如mg/dl、mg/L、nmol/L。可通过多种众所周知的方法来测量CRP的水平，例如放射免疫扩散、电免疫测定、免疫比浊法(例如颗粒(例如乳胶)-增强的比浊免疫测定)、ELISA、比浊法、荧光偏振免疫测定和激光比浊法。CRP测试可采用标准CRP测试或高敏感性CRP(hsCRP)测试(即通过使用免疫测定或激光比浊法能够测量样品中较低水平的CRP的高敏感性测试)。可从多家公司购买用于检测CRP水平的试剂盒，例如卡尔生物技术公司(Calbiotech Inc)、凯门化学公司(Cayman Chemical)、罗氏诊断公司(RocheDiagnostics Corporation)、Abazyme、DADE Behring、Abnova公司、Aniara公司、Bio-QuantInc.、西门子医疗诊断(Siemens Healthcare Diagnostics)、雅培实验室公司(AbbottLaboratories)等。
如本文所用，术语“hsCRP”是指通过高敏感性CRP测试测量的血液(血清或血浆)中的CRP水平。例如，可使用Tina定量C反应蛋白(乳胶)高敏感性测定法(罗氏诊断公司)来定量受试者的hsCRP水平。可在
Figure BDA0003119995180000221
平台(罗氏诊断公司)或罗氏/日立(例如Modular P)分析仪上分析这种乳胶增强的比浊免疫测定。在CANTOS试验中，所述hsCRP水平通过在罗氏/日立Modular P分析仪上的Tina定量C反应蛋白(乳胶)高敏感性测定法(罗氏诊断公司)进行测量，所述方法可典型地和优选地用作测定hsCRP水平的方法。可替代地，所述hsCRP水平可通过另一种方法测量，例如通过另一种批准的伴随诊断试剂盒，其值可根据通过Tina定量法测量的值进行校准。
每个当地实验室都会根据该实验室计算正常最大CRP的规则(即基于该实验室的参考标准)采用异常(高)CRP或hsCRP的临界值。医生通常会从当地实验室订购CRP测试，并且当地实验室使用特定实验室用来计算正常CRP的规则(即根据其参考标准)来确定CRP或hsCRP值并报告正常或异常(低或高)CRP。因此，可由进行测试的当地实验室确定患者的C反应蛋白(hsCRP)水平是否高于正常水平。
有可能的是，IL-1β抗体或其片段，例如卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗，在治疗和/或预防MDS方面是有效的，尤其是当所述患者具有高于正常水平的hsCRP时。与卡那吉努单抗一样，格沃吉珠单抗特异性结合IL-1β。与卡那吉努单抗直接抑制IL-1β与其受体的结合不同，格沃吉珠单抗是一种变构抑制剂。它不抑制IL-1β与其受体结合，但阻止受体被IL-1β激活。与卡那吉努单抗一样，在一些基于炎症的适应症中对格沃吉珠单抗进行了测试，并被证明可有效地减轻炎症，例如，通过降低这些患者的hsCRP水平。此外，从可用的IC50值来看，格沃吉珠单抗似乎是比卡那吉努单抗更有效的IL-1β抑制剂。
此外，本发明提供了有效剂量范围，在该剂量范围内，hsCRP水平可降低至一定阈值，低于所述阈值，更多具有MDS患者可成为应答者，或者低于所述阈值，同一患者可从本发明药物的巨大治疗效应中受益更多，且副作用可忽略或可耐受。
一方面，本发明提供了高敏感性C反应蛋白(hsCRP)或CRP，用作用IL-1β抑制剂(例如IL-1β结合抗体或其功能片段)治疗MDS中的生物标志物。因此，hsCRP水平可能与确定具有确诊或未确诊的癌症或有患癌症风险的患者是否应使用IL-1β结合抗体或其功能片段治疗相关。在一个实施例中，如在施用IL-1β结合抗体或其功能片段之前评估，如果hsCRP的水平等于或高于约2.5mg/L、或等于或高于约4.5mg/L、或等于或高于约7.5mg/L、或等于或高于约9.5mg/L，则患者有资格进行治疗和/或预防。
在一个实施例中，本发明提供一种IL-1β结合抗体或其功能片段(适当地是卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)用于治疗患者中的MDS的用途，所述患者优选地在首次施用所述IL-1β结合抗体或其功能片段之前具有等于或高于约2.2mg/L、等于或高于约4.2mg/L、等于或高于约6.2mg/L等于或高于约10.2mg/L的高敏感性C反应蛋白(hsCRP)水平。优选地，所述患者具有等于或高于约4.2mg/L的hsCRP水平。优选地，所述患者具有等于或高于约6.2mg/L的hsCRP水平。优选地，所述患者具有等于或高于约10mg/L的hsCRP水平。优选地，所述患者具有等于或高于约20mg/L的hsCRP水平。
一方面，本发明提供了一种IL-1β结合抗体或其功能片段，用于治疗患者中MDS，其中与在先的治疗相比，治疗的功效与所述患者中hsCRP的降低有关。在一个实施例中，本发明提供一种用于治疗MDS的IL-1β结合抗体或其功能片段，其中在首次施用适当剂量(优选地根据本发明的给药方案)的所述IL-1β结合抗体或其功能片段后约6个月或优选约3个月，所述患者的hsCRP水平降低至低于约5.2mg/L，优选降低至低于约3.2mg/L，优选降低至低于约2.2mg/L。
在一方面，本发明提供了用于治疗患者的MDS的IL-1β结合抗体或其功能片段(例如，卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)，其中与刚好在首次施用IL-1β结合抗体或其功能片段(卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)之前的hsCRP水平相比，在首次施用适当剂量(优选地根据本发明的给药方案)的所述IL-1β结合抗体或其功能片段后约6个月或优选地约3个月，所述患者的hsCRP水平降低至少约20％、约20％-34％、约35％或至少约50％或至少约60％。进一步优选地，在根据本发明的剂量方案首次施用本发明的药物后，所述患者的hsCRP水平降低至少约35％、或至少约50％或至少约60％。
一方面，本发明提供了IL-6，用作用IL-1β抑制剂(例如IL-1β结合抗体或其功能片段)治疗MDS中的生物标志物。因此，IL-6水平可能与确定具有确诊或未确诊的癌症或有患癌症风险的患者是否应使用IL-1β结合抗体或其功能片段治疗相关。在一个实施例中，如在施用IL-1β结合抗体或其功能片段之前评估，如果IL-6的水平等于或高于约1.9pg/ml、高于约2pg/ml、高于约2.2pg/ml、高于2.5pg/ml、高于约2.7pg/ml、高于约3pg/ml、高于约3.5pg/ml，则患者有资格进行治疗和/或预防。优选地，患者的IL-6水平等于或高于约2.5mg/L。
一方面，本发明提供了一种IL-1β结合抗体或其功能片段，用于治疗患者中MDS，其中与在先的治疗相比，治疗的功效与所述患者中IL-6的降低有关。在一个实施例中，本发明提供一种用于治疗癌症(例如具有至少部分炎症基础的癌症)的IL-1β结合抗体或其功能片段，其中在首次施用适当剂量(优选地根据本发明的给药方案)的所述IL-1β结合抗体或其功能片段后约6个月或优选约3个月，所述患者的IL-6水平降低至低于约2.2pg/ml，优选降低至低于约2pg/ml，优选降低至低于约1.9pg/ml。
在一方面，本发明提供了用于治疗患者的MDS的IL-1β结合抗体或其功能片段(例如，卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)，其中与刚好在首次施用之前的IL-6水平相比，在首次施用适当剂量(优选地根据本发明的给药方案)的所述IL-1β结合抗体或其功能片段(例如，卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)后约6个月或优选地约3个月，所述患者的IL-6水平降低至少约20％、约20-34％、约35％或至少约50％或至少约60％。进一步优选地，在根据本发明的剂量方案首次施用本发明的药物后，所述患者的IL-6水平降低至少约35％、或至少约50％或至少约60％。
hsCRP水平的降低和IL-6水平的降低可以单独使用或组合使用，以表明治疗效果或作为预后指标。
血管生成的抑制
在一个方面，本发明提供一种IL-1β结合抗体或其功能片段，适当地是卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗，用于在需要其的患者中治疗MDS，其中在所述患者中施用治疗量以抑制血管生成。不希望被理论所束缚，假设IL-1β途径的抑制可导致血管生成的抑制或减少，血管生成是肿瘤生长和肿瘤转移的关键事件。因此，在临床情境中，可以通过肿瘤缩小、无肿瘤生长(疾病稳定)，预防转移或延迟转移来测量对血管生成的抑制或减少。
贯穿本申请公开的所有用途，包括但不限于剂量和施用方案、组合、施用途径和生物标志物，均可用于抑制或减少血管生成的方面。在一个实施例中，卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗与一种或多种抗癌治疗剂组合使用。在一个实施例中，一种或多种化疗剂是抗Wnt抑制剂，优选万替妥单抗。在一个实施例中，一种或多种治疗剂是VEGF抑制剂，优选贝伐单抗或雷姆赛卢单抗。
转移的抑制
不希望被理论所束缚，假设IL-1β途径的抑制可导致肿瘤转移的抑制或减少。迄今为止，尚无有关卡那吉努单抗对转移的影响的报道。实例1中显示的数据表明，与转移部位相比，IL-1β在原发部位激活了不同的促转移机制：乳腺癌细胞内源性产生IL-1β促进上皮向间质转化(EMT)、侵袭、迁移和器官特异性归巢。一旦肿瘤细胞到达骨环境，肿瘤细胞与成骨细胞或骨髓细胞之间的接触增加所有三种细胞类型的IL-1β分泌。这些高浓度的IL-1β通过刺激扩散的肿瘤细胞向明显转移的生长而引起骨转移微环境的增殖。这些抗转移过程可通过施用抗IL-1β治疗(如卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)来抑制。
因此，用IL-1β结合抗体靶向IL-1β代表了一种针对预防处于进展转移风险中的癌症患者的新的治疗方法，所述方法是通过防止新转移的肿瘤从已建立的肿瘤中播种，并使已经扩散到骨骼中的肿瘤细胞保持休眠状态。所描述的模型旨在研究骨转移，尽管数据显示IL-1β表达与骨归巢之间有很强的联系，但它并未排除IL-1β参与向其他部位转移的情况。
因此，一方面，本发明提供了IL-1β结合抗体或其功能片段，适当地是卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗，用于在患者中治疗MDS，其中施用治疗量以抑制所述患者中的转移。
贯穿本申请公开的所有用途，包括但不限于剂量和给药方案、组合、施用途径和生物标志物，均可用于转移抑制的实施例。
预防
一方面，本发明提供了一种IL-1β结合抗体或其功能片段(适当地是卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)在预防患者中的癌症(例如具有至少部分炎症基础的癌症)中的用途。如本文所用，术语“预防(prevent，preventing或prevention)”是指预防或延迟否则会具有高患癌症风险的受试者中癌症的发生。如本文所用，术语“预防(prevent，preventing或prevention)”也是指预防或延迟患有在前MDS的受试者中的继发性急性髓性白血病(AML)的发生。MDS经常进展为继发性AML。
如本文所用，术语“预防(prevent，preventing或prevention)”也是指预防或延迟患有先前不同癌症的受试者中与治疗相关的MDS的发生。MDS是一种针对较早的不同癌症的罕见但公认的化疗并发症。这也称为与治疗相关的MDS。与治疗有关的MDS的发生率与密集治疗方案(通常将高剂量化疗和放疗组合使用)的使用以及在例如头颈癌、肺癌、乳腺癌和结肠癌以及黑色素瘤中辅助化放疗的使用有关。环境污染、工业化学物质和致癌物也可能是诱发因素，连同原发癌的类型、化疗方案的强度和宿主特征。
如本文所用，术语“预防(prevent，preventing或prevention)”还表示预防或延迟先前的可能性不明的克隆性造血(CHIP)、意义不明的克隆性血细胞减少(CCUS)或意义不明的特发性细胞减少(ICUS)后MDS的发生。可能性不明的克隆性造血(CHIP)的特征是：存在至少一种临床相关且在MDS(或其他骨髓瘤)中发现的体细胞突变；没有持续的血细胞减少；和/或排除MDS和所有其他造血肿瘤(和其他疾病)作为潜在的病因。意义不明的特发性细胞减少(ICUS)的特征是：一个或多个系中的相关血细胞减少持续至少约6个月；任何其他疾病不能解释；和/或不符合骨髓瘤的诊断标准。意义不明的克隆性血细胞减少(CCUS)的特征是：在骨髓瘤患者中另外发现在骨髓或外周血细胞中检测出的一个或多个体细胞突变，其中等位基因负担≥约2％；一个或多个外周血细胞系中持续性血细胞减少(≥约4个月)；不符合骨髓瘤的诊断标准；和/或排除所有其他导致血细胞减少和分子异常的原因。
在无法解释的血细胞减少的背景下，对来自患者外周血细胞的DNA进行体细胞突变分析(例如NGS)具有诊断价值，这可可鉴定CHIP或CCUS。克隆性造血(CH)是具有获得性体细胞突变的相关髓样细胞群体。CH是MDS和白血病的特征，但也在没有可检测到的血液恶性肿瘤的个体中发现。为了排除任何浸润性肿瘤，CHIP和CCUS也需要进行彻底的骨髓分析。如果检测到一个或多个体细胞突变而没有持续性血细胞减少，则将其称为CHIP；如果存在持续性(≥4个月)的血细胞减少，则将这种情况称为CCUS。患有CHIP的个体发生血液恶性肿瘤的风险大约增加10倍，其中风险随着克隆大小的增加而增加，并且估计的总体风险每年约为0.5％至1％。从CHIP或CCUS转变为明显的恶性肿瘤通常需要依次获得多个突变。
获得的体细胞突变和遗传异常可能通过选择性激活骨髓中的促炎细胞因子应答而导致MDS克隆的繁殖(De Mooij Charlotte等人Blood[血液]2017；129:3155-3164和Carey Alyssa等人,Cell Rep[细胞通讯]2017；18:3204-3218)。因此，在早期阶段靶向关键的先天免疫途径可以预防或延迟疾病进展。
富含IL-1β的环境可能会增加干细胞生态位中的选择性压力，并支持白血病干细胞相比于非白血病干细胞的选择和扩增(De Mooij Charlotte等人Blood[血液]2017；129:3155-3164和Carey Alyssa等人,Cell Rep[细胞通讯]2017；18:3204-3218)。因此，治疗性靶向过度活跃的IL-1β信号传导可增强正常的造血功能，同时抑制前/白血病克隆。
目前，由于没有可用的证据表明任何治疗可用于预防MDS的发作，因此没有对CHIP个体进行因果治疗。因此，如果CHIP个体发展为MDS，怎会对他们进行观察。
CANTOS试验显示，向CHIP患者施用IL-1β结合抗体具有很高的益处，并显示CHIP患者的无法解释的贫血频率降低。因此，本发明的一个实施例是通过施用治疗有效量的IL-1β结合抗体或其功能片段，例如卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗，来预防具有前兆状态的个体进展成MDS。
不希望受到理论的束缚，假设慢性炎症(无论是局部炎症还是全身性炎症，特别是局部炎症)都会产生促进肿瘤生长和扩散的免疫抑制性微环境。IL-1β结合抗体或其功能片段减少了慢性炎症，特别是IL-1β介导的慢性炎症，从而预防或延迟了另外患有局部或全身性慢性炎症的受试者中癌症的发生。
确定局部或全身性慢性炎症的一种方法是通过测量C反应蛋白(hsCRP)的水平。在一个实施例中，本发明提供了一种IL-1β结合抗体或其功能片段(适当地是卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)，用于在受试者中预防癌症(例如具有至少部分炎症基础的癌症)，如在施用所述IL-1β结合抗体或其功能片段之前评估，所述受试者的高敏感性C反应蛋白(hsCRP)等于或高于约2mg/L、等于或高于约3mg/L、等于或高于约4.2、等于或高于约6.5mg/L、等于或高于约8.5mg/L、或高于约11mg/L。
在预防情境中，可能将IL-1β结合抗体或其功能片段作为单一疗法施用。
在预防情境中，每次治疗的IL-1β结合抗体或其功能片段的剂量可能与治疗情境中的剂量不同，但很可能小于治疗情境中的剂量。预防剂量可能最多是治疗剂量的约一半，优选约一半。预防剂量之间的间隔可能与治疗剂量之间的间隔不同，但很可能更长。所述间隔很可能是两倍或三倍。每次治疗的剂量很可能与治疗情境中的剂量相同，但施用间隔会延长。这是优选的，因为较长的施用间隔提供了便利，因此具有更高的依从性。很可能的是以下两者：每次治疗的剂量减少并且施用间隔延长。
在一个优选的实施例中，卡那吉努单抗以每月、约每隔一个月或约每季度约100mg至约400mg、优选约200mg的剂量优选地皮下施用，或以每月、约每隔一个月或约每季度约100mg的剂量优选地皮下施用。在另一个实施例中，所述IL-1β结合抗体是格沃吉珠单抗或其功能片段。在一个优选的实施例中，格沃吉珠单抗以约15mg至约60mg的剂量施用。在一个优选的实施例中，约每月、约每隔一个月或每季度施用格沃吉珠单抗。在一个优选的实施例中，吉沃单抗以每月、约每隔一个月或约每季度约15mg的剂量施用。在一个优选的实施例中，吉沃单抗以每月、约每隔一个月或约每季度约30mg的剂量施用。在一个实施例中，格沃吉珠单抗皮下施用。在一个实施例中，格沃吉珠单抗静脉内施用。在一个实施例中，卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗通过自动注射器施用。
在一个实施例中，在预防情境中与不接受本发明的治疗的患者相比，在接受根据本发明的预防治疗的患者中患癌风险降低至少约30％、优选至少约50％、优选至少约60％。
新辅助
术语新辅助治疗通常被理解为手术前的放疗或化疗。新辅助疗法的目的通常是减小肿瘤的大小，以便更容易或更彻底地切除肿瘤。由于MDS是液体肿瘤，因此无法在MDS中进行手术肿瘤切除，因此从传统意义上讲，新辅助治疗不适用于MDS。然而，使用另一种类型的手术来治疗MDS，即造血细胞移植。从这个意义上讲，在造血细胞移植之前，可以在MDS中应用新辅助治疗。特别地，由于患者经常不得不等待合适的供体，因此可以在该等待时间内使用新辅助治疗。
慢性炎症和IL-1β与对新辅助治疗的不良组织学应答以及罹患癌症的风险有关(Delitto等人,BMC cancer[BMC癌症].2015’15:783)。不希望受到理论的束缚，通过减少炎症，IL-1β结合抗体或其功能片段有助于改善癌症治疗效果，特别是在引起疾病改善方面与化疗作用协同。
一方面，本发明提供了IL-1β结合抗体或其功能片段，适当地是卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗，用于单独或优选与放疗组合或与一种或多种治疗剂组合来治疗造血细胞移植之前的癌症。在一个实施例中，一种或多种治疗剂是在该癌症适应症的新辅助情境中的SoC治疗。在一个实施例中，一种或多种治疗剂是检查点抑制剂，其优选选自由以下组成的组：纳武单抗、兰洛利珠单抗、阿特利珠单抗、阿伐单抗、杜鲁伐单抗和斯巴达珠单抗(spartalizumab)，优选的兰洛利珠单抗或纳武单抗。在一个实施例中，一种或多种治疗剂是化疗剂。在一个实施例中，一种或多种治疗剂是化疗剂，其中所述化疗剂不是用于靶向疗法的药剂。
一线治疗
在一个实施例中，本发明提供一种IL-1β抗体或其功能片段(适当地是卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)，用于MDS的一线治疗。术语“一线治疗”是指在患者对一种或多种其他治疗剂的初始治疗产生抗药性之前，向所述患者给予IL-1β抗体或其功能片段。优选地，一种或多种其他治疗剂是基于铂的单一疗法或联合疗法、靶向疗法(例如酪氨酸抑制剂疗法)、检查点抑制剂疗法或其任意组合。作为一线治疗，IL-1β抗体或其功能片段(例如卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)可以作为单一疗法或优选与一种或多种治疗剂(例如检查点抑制剂，特别是PD-1或PD-L1抑制剂，优选兰洛利珠单抗)组合地，与或不与一种或多种小分子化疗剂组合地施用给患者。在作为一线治疗的一个实施例中，可以将IL-1β抗体或其功能片段(例如卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)与用于MDS的护理疗法标准组合地施用给患者。优选将卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗作为一线治疗施用，直至疾病进展。
二线治疗
在一个实施例中，本发明提供一种IL-1β抗体或其功能片段(适当地是卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)，用于MDS的二线或三线治疗。术语“二线或三线治疗”是指将IL-1β抗体或其功能片段施用给患者，所述患者具有在一种或多种其他治疗剂使用中或使用后的癌症进展，尤其是具有在针对所述癌症的FDA批准的一线疗法中或之后的癌症进展。优选地，一种或多种其他治疗剂是化疗剂，例如基于铂的单一疗法药剂或组合疗法药剂、靶向疗法药剂(例如酪氨酸抑制剂疗法药剂)、检查点抑制剂或其任意组合。作为二线或三线治疗，可以将IL-1β抗体或其功能片段作为单一疗法或优选与一种或多种治疗剂组合施用给患者，包括继续用相同的一种或多种治疗剂的早期治疗。优选将卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗作为二线/三线治疗施用，直至疾病进展。
继续治疗
在一方面，本发明还提供了一种IL-1β结合抗体或其功能片段(适当地是格沃吉珠单抗或卡那吉努单抗)，用于治疗MDS，其中所述IL-1β结合抗体或其功能片段在多于一个治疗线中被施用给患者。
不希望受到理论的束缚，假设与化疗剂或靶向疗法药剂直接杀死或抑制癌细胞并因此选择抗性细胞不同，本发明的药物作用于肿瘤微环境并且似乎不导致抗药性。此外，与化疗剂或检查点抑制剂不同，IL-1β结合抗体或其功能片段(例如格沃吉珠单抗或卡那吉努单抗)的不希望的副作用要少得多。患者不太可能发展为不耐受，因此可以在癌症治疗过程中继续接受本发明的药物治疗并继续消除或减少IL-1β介导的炎症的益处。
在一个实施例中，本发明的药物(适当地是卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)可以在同一患者的癌症的2线、3线或所有治疗线中使用。治疗线通常包括但不限于新辅助治疗、辅助治疗、一线治疗、2线治疗、3线治疗和进一步的治疗线。患者通常在疾病进展后或对当前治疗产生抗药性后改变治疗线。在一个实施例中，在患者对当前治疗产生抗性之后继续本发明的药物。在一个实施例中，本发明的药物继续至下一治疗线。在一个实施例中，本发明的药物在疾病进展后继续。在一个实施例中，继续进行本发明的药物直至死亡或姑息治疗。
在一个实施例中，本发明提供了本发明的药物(适当地是卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)，用于在患者中重新治疗MDS，其中在先前的治疗中用本发明的相同药物治疗了所述患者。在一个实施例中，先前的治疗是新辅助治疗。在一个实施例中，先前的治疗是辅助治疗。在一个实施例中，先前的治疗是一线治疗。在一个实施例中，先前的治疗是二线治疗。
组合
一方面，本发明提供了一种IL-1β结合抗体或其功能片段(适当地是卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)，用于与放疗组合地，或与一种或多种治疗剂(例如化疗剂或例如检查点抑制剂)组合地，或与放疗和一种或多种治疗剂组合地在有需要的患者中治疗MDS。
不受理论的束缚，据信典型的癌症发展需要两个步骤。首先，基因改变导致细胞生长和增殖不再受调节。其次，异常的肿瘤细胞逃避了免疫系统的监视。炎症在第二步中起重要作用。因此，控制炎症可以在早期或较早期停止癌症的发展。因此，预期阻断IL-1β途径以减少炎症将具有一般益处，特别是在标准护理的基础上改善治疗功效，这通常主要是直接抑制恶性细胞的生长和增殖。在一个实施例中，一种或多种治疗剂(例如化疗剂)是所述癌症(特别是具有至少部分炎症基础的癌症)的标准护理剂。
检查点抑制剂通过不同于IL-1β抑制剂的机制抑制免疫系统。因此，将IL-1β抑制剂，特别是IL-1β结合抗体或其功能片段添加至标准检查点抑制剂将进一步激活免疫应答，特别是在肿瘤微环境中。
在一个实施例中，一种或多种治疗剂是纳武单抗。
在一个实施例中，一种或多种治疗剂是兰洛利珠单抗。
在一个实施例中，一种或多种治疗剂是纳武单抗和艾匹利木单抗。
在一个实施例中，一种或多种化疗剂是卡博替尼或其药学上可接受的盐。
在一个实施例中，一种或多种治疗剂是阿特利珠单抗加贝伐单抗。
在一个实施例中，一种或多种治疗剂是贝伐单抗。
在一个实施例中，一种或多种治疗剂是次甲基化剂(HMA)。
在一个实施例中，一种或多种治疗剂是阿扎胞苷(AzaC)。
在一个实施例中，一种或多种治疗剂是地西他滨。在一个实施例中，一种或多种治疗剂是来那度胺。
在一个实施例中，一种或多种治疗剂是用于强烈诱导作为急性髓性白血病的标准的化疗的药剂，包括阿糖胞苷(ara-C)；蒽环类药物，如柔红霉素(道诺霉素)或伊达比星；氟达拉滨(Fludara)；克拉屈滨；和/或依托泊苷。
在一个实施例中，一种或多种治疗剂是米哚妥林。
在一个实施例中，一种或多种治疗剂是奥-吉妥珠单抗(gemtuzumabozogamicin)。
治疗剂是细胞毒性和/或细胞抑制药(分别杀死恶性细胞或抑制其增殖的药物)以及检查点抑制剂。化疗剂可以是例如小分子剂、生物剂(例如抗体，细胞和基因疗法、癌症疫苗)、激素或其他天然或合成的肽或多肽。众所周知的化疗剂包括但不限于铂剂(例如顺铂、卡铂、奥沙利铂、奈达铂、三铂、脂铂、赛特铂、吡铂)，抗代谢物(例如甲氨蝶呤、5-氟尿嘧啶、吉西他滨、培美曲塞，有丝分裂抑制剂(例如紫杉醇、白蛋白结合紫杉醇、多西他赛、泰索帝，docecad)，烷基化剂(例如环磷酰胺、盐酸氯乙胺、异环磷酰胺、美法仑、噻替帕)，长春花生物碱(例如长春花碱、长春新碱、长春地辛、长春瑞滨)，拓扑异构酶抑制剂(例如依托泊苷、替尼泊苷、托泊替康、伊立替康、喜树碱，阿霉素)，抗肿瘤抗生素(例如丝裂霉素C)和/或激素调节剂(例如阿那曲唑、他莫昔芬)。用于化疗的抗癌剂的实例包括环磷酰胺
Figure BDA0003119995180000341
甲氨蝶呤、5-氟尿嘧啶(5-FU)、阿霉素
Figure BDA0003119995180000342
泼尼松、他莫昔芬
Figure BDA0003119995180000343
紫杉醇
Figure BDA0003119995180000344
白蛋白结合剂紫杉醇(nab-紫杉醇、
Figure BDA0003119995180000345
)、四氢叶酸、噻替派
Figure BDA0003119995180000346
阿那曲唑
Figure BDA0003119995180000347
多西他赛
Figure BDA0003119995180000348
长春瑞滨
Figure BDA0003119995180000349
吉西他滨
Figure BDA00031199951800003410
异环磷酰胺
Figure BDA00031199951800003411
培美曲塞
Figure BDA00031199951800003412
托泊替康、美法仑
Figure BDA00031199951800003413
顺铂
Figure BDA00031199951800003414
卡铂
Figure BDA00031199951800003415
奥沙利铂
Figure BDA00031199951800003416
尼达铂
Figure BDA00031199951800003417
三铂、脂铂
Figure BDA00031199951800003418
赛特铂、吡铂、卡莫司汀(BCNU；
Figure BDA00031199951800003419
)、甲氨蝶呤
Figure BDA00031199951800003420
依达曲沙、丝裂霉素C
Figure BDA00031199951800003421
米托蒽醌
Figure BDA00031199951800003422
长春新碱
Figure BDA00031199951800003423
长春花碱
Figure BDA00031199951800003424
长春瑞滨(Navelbine)
Figure BDA00031199951800003425
长春地辛
Figure BDA00031199951800003426
芬维A胺、托泊替康、伊立替康
Figure BDA00031199951800003427
9-氨基喜树碱[9-AC]、比安唑、洛索蒽醌、依托泊苷、和替尼泊苷。
在一个实施例中，IL-1β结合抗体或其功能片段(例如，卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)的优选组合伴侣是有丝分裂抑制剂，优选多西他赛。在一个实施例中，卡那吉努单抗的优选组合伴侣是有丝分裂抑制剂，优选多西他赛。在一个实施例中，格沃吉珠单抗的优选组合伴侣是有丝分裂抑制剂，优选多西他赛。
在一个实施例中，IL-1β结合抗体或其功能片段(例如，卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)的优选组合伴侣是铂试剂，优选顺铂。在一个实施例中，卡那吉努单抗的优选组合伴侣是铂试剂，优选顺铂。在一个实施例中，格沃吉珠单抗的优选组合伴侣是铂试剂，优选顺铂。在一个实施例中，一种或多种化疗剂是基于铂的双联化疗(PT-DC)。
化疗可包括单一抗癌剂(药物)的施用或抗癌剂(药物)的组合的施用，例如，以下之一，通常施用以下的组合：卡铂和他克唑(taxol)；吉西他滨和顺铂；吉西他滨和长春瑞滨；吉西他滨和紫杉醇；顺铂和长春瑞滨；顺铂和吉西他滨；顺铂和紫杉醇(Taxol)；顺铂和多西他赛(Taxotere)；顺铂和依托泊苷；顺铂和培美曲塞；卡铂和长春瑞滨；卡铂和吉西他滨；卡铂和紫杉醇(Taxol)；卡铂和多西他赛(Taxotere)；卡铂和依托泊苷；卡铂和培美曲塞。在一个实施例中，一种或多种化疗剂是基于铂的双联化疗(PT-DC)。
另一类化疗剂是抑制剂，尤其是酪氨酸激酶抑制剂，其特异性靶向生长促进受体，尤其是VEGF-R、EGFR、PFGF-R和ALK或其信号转导途径的下游成员，其突变或过量产生在该部位导致或促成肿瘤的癌变(靶向疗法)。由美国食品药品监督管理局(FDA)批准用于肺癌靶向治疗的靶向治疗药物的实例包括但不限于贝伐单抗
Figure BDA0003119995180000351
克唑替尼
Figure BDA0003119995180000352
厄洛替尼
Figure BDA0003119995180000353
吉非替尼
Figure BDA0003119995180000354
阿法替尼双马来酸酯
Figure BDA0003119995180000355
赛立替尼(LDK378/ZykadiaTM)，依维莫司
Figure BDA0003119995180000356
雷姆赛卢单抗
Figure BDA0003119995180000357
奥西替尼(TagrissoTM)、奈妥珠单抗(PortrazzaTM)、伊乐替尼
Figure BDA0003119995180000358
阿特利珠单抗(TecentriqTM)、布利替尼(AlunbrigTM)、曲美替尼
Figure BDA0003119995180000359
达拉非尼
Figure BDA00031199951800003510
舒尼替尼
Figure BDA00031199951800003511
和西妥昔单抗
Figure BDA00031199951800003512
在一个实施例中，一种或多种有待与IL-1β结合抗体或其片段(适当地是卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)组合的治疗剂是检查点抑制剂。在另一个实施例中，所述检查点抑制剂是纳武单抗。在一个实施例中，所述检查点抑制剂是兰洛利珠单抗。在另一个实施例中，所述检查点抑制剂是阿特利珠单抗。在另一个实施例中，所述检查点抑制剂是PDR-001(斯巴达珠单抗)。在一个实施例中，所述检查点抑制剂是度伐鲁单抗(durvalumab)。在一个实施例中，所述检查点抑制剂是阿维鲁单抗(avelumab)。针对免疫检查点的免疫疗法，也称为检查点抑制剂，目前正在成为癌症治疗中的关键药剂。所述免疫检查点抑制剂可是受体抑制剂或配体抑制剂。抑制靶的实例包括但不限于共抑制分子(例如，PD-1抑制剂(例如抗PD-1抗体分子)，PD-L1抑制剂(例如，抗PD-L1抗体分子)，PD-L2抑制剂(例如，抗PD-L2抗体分子)，LAG-3抑制剂(例如，抗LAG-3抗体分子)，TIM-3抑制剂(例如，抗TIM-3抗体分子)，共刺激分子的激活剂(例如，GITR激动剂(例如抗GITR抗体分子))，细胞因子(IL-15与可溶形式的IL-15受体α(IL-15Ra)复合)，细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白4的抑制剂(例如抗CTLA-4抗体分子)或其任何组合。
在一个优选的实施例中，检查点抑制剂是MBG453(诺华公司)。
PD-1抑制剂
在本发明的一方面，IL-1β抑制剂或其功能片段与PD-1抑制剂一起施用。在一个一些实施例中，所述PD-1抑制剂选自PDR001(斯巴达珠单抗)(诺华公司)、纳武单抗(百时美施贵宝公司)、兰洛利珠单抗(默克公司(Merck&Co))、匹地利珠单抗(CureTech公司)、MEDI0680(英商梅迪缪思有限公司(Medimmune))、REGN2810(再生元公司(Regeneron))、TSR-042(Tesaro公司)、PF-06801591(辉瑞制药公司(Pfizer))、BGB-A317(百济神州公司(Beigene))、BGB-108(百济神州公司)、INCSHR1210(因赛特公司(Incyte))、或AMP-224(Amplimmune公司)。
在一个实施例中，所述PD-1抑制剂是抗PD-1抗体。在一个实施例中，所述PD-1抑制剂是抗PD-1抗体分子，如题为“PD-1的抗体分子及其用途”的2015年7月30日公布的US2015/0210769(将其通过引用以其全文并入)中所述的。
在一个实施例中，所述抗PD-1抗体分子包含：含有SEQ ID NO:506的氨基酸序列的VH和含有SEQ ID NO:520的氨基酸序列的VL。在一个实施例中，所述抗PD-1抗体分子包含：含有SEQ ID NO:506的氨基酸序列的VH和含有SEQ ID NO:516的氨基酸序列的VL。
表1.示例性抗PD-1抗体分子的氨基酸和核苷酸序列
Figure BDA0003119995180000371
在一个实施例中，抗PD-1抗体是斯巴达珠单抗。
在一个实施例中，抗PD-1抗体是纳武单抗。
在一个实施例中，抗PD-1抗体分子是兰洛利珠单抗。
在一个实施例中，抗PD-1抗体分子是匹地利珠单抗。
在一个实施例中，所述抗PD-1抗体分子是MEDI0680(英商梅迪缪思有限公司)，也称为AMP-514。MEDI0680和其他抗PD-1抗体披露于US 9,205,148和WO 2012/145493(将其通过引用以其全文并入)中。其他示例性的抗PD-1分子包括REGN2810(再生元公司)、PF-06801591(辉瑞制药公司)、BGB-A317/BGB-108(百济神州公司)、INCSHR1210(因赛特公司)和TSR-042(Tesaro公司)。
其他已知的抗PD-1抗体包括描述于例如以下中的那些：WO 2015/112800、WO2016/092419、WO 2015/085847、WO 2014/179664、WO 2014/194302、WO 2014/209804、WO2015/200119、US 8,735,553、US 7,488,802、US 8,927,697、US 8,993,731、和US 9,102,727(将其通过引用以其全文并入)。
在一个实施例中，抗PD-1抗体是与本文所述的抗PD-1抗体之一竞争与PD-1上的相同表位结合和/或结合PD-1上的相同表位的抗体。
在一个实施例中，PD-1抑制剂是例如如US 8,907,053(将其通过引用以其全文并入)中所述的抑制PD-1信号传导途径的肽。在一个实施例中，PD-1抑制剂是免疫粘附素(例如包含融合到恒定区(例如免疫球蛋白序列的Fc区)的PD-L1或PD-L2的细胞外或PD-1结合部分的免疫粘附素)。在一个实施例中，PD-1抑制剂是AMP-224(B7-DCIg(安普利公司(Amplimmun))，例如，披露于WO 2010/027827和WO 2011/066342(将其通过引用以其全文并入)中。
PD-L1抑制剂
在本发明的一方面，IL-1β抑制剂或其功能片段与PD-L1抑制剂一起施用。在一些实施例中，所述PD-L1抑制剂选自FAZ053(诺华公司)；阿特利珠单抗(基因泰克公司/罗氏公司)；阿维鲁单抗(默克雪兰诺公司(Merck Serono)和辉瑞制药公司)；度伐鲁单抗(英商梅迪缪思有限公司/阿斯利康公司)；或BMS-936559(百时美施贵宝)。
在一个实施例中，所述PD-L1抑制剂是抗PD-L1抗体分子。在一个实施例中，所述PD-L1抑制剂是抗PD-L1抗体分子，如题为“PD-L1的抗体分子及其用途”的2016年4月21日公开的US 2016/0108123(将其通过引用以其全文并入)中所披露的。
在一个实施例中，所述抗PD-L1抗体分子包含：含有SEQ ID NO:606的氨基酸序列的VH和含有SEQ ID NO:616的氨基酸序列的VL。在一个实施例中，所述抗PD-L1抗体分子包含：含有SEQ ID NO:620的氨基酸序列的VH和含有SEQ ID NO:624的氨基酸序列的VL。
表2.示例性抗PD-L1抗体分子的氨基酸和核苷酸序列
Figure BDA0003119995180000391
在一个实施例中，所述抗PD-L1抗体分子是阿特利珠单抗(基因泰克公司/罗氏公司)，也称为MPDL3280A、RG7446、RO5541267、YW243.55.S70、或TECENTRIQTM。阿特利珠单抗和其他抗PD-L1抗体在US 8,217,149中披露，这些抗体通过引用以其全文并入。
在一个实施例中，所述抗PD-L1抗体分子是阿维鲁单抗(默克雪兰诺公司和辉瑞公司)，也称为MSB0010718C。阿维鲁单抗和其他抗PD-L1抗体披露于WO 2013/079174(将其通过引用以其全文并入)中。
在一个实施例中，所述抗PD-L1抗体分子是度伐鲁单抗(英商梅迪缪思有限公司/阿斯利康公司)，也称为MEDI4736。度伐鲁单抗和其他抗PD-L1抗体披露于US 8,779,108(将其通过引用以其全文并入)中。
在一个实施例中，所述抗PD-L1抗体分子是BMS-936559(百时美施贵宝公司)，也称为MDX-1105或12A4。BMS-936559和其他抗PD-L1抗体披露于US 7,943,743和WO 2015/081158(将其通过引用以其全文并入)中。
其他已知的抗PD-L1抗体包括描述于例如以下中的那些：WO 2015/181342、WO2014/100079、WO 2016/000619、WO 2014/022758、WO 2014/055897、WO 2015/061668、WO2013/079174、WO 2012/145493、WO 2015/112805、WO 2015/109124、WO 2015/195163、US 8,168,179、US 8,552,154、US 8,460,927、和US 9,175,082(将其通过引用以其全文并入)。
在一个实施例中，所述抗PD-L1抗体是与本文所述的抗PD-L1抗体之一竞争与PD-L1上的相同表位结合和/或结合至PD-L1上的相同表位的抗体。
LAG-3抑制剂
在本发明的一方面，IL-1β抑制剂或其功能片段与LAG-3抑制剂一起施用。在一些实施例中，所述LAG-3抑制剂选自LAG525(诺华公司)、BMS-986016(百时美施贵宝公司、TSR-033(Tesaro公司)、IMP731或GSK2831781和IMP761(普瑞马生物医药公司(Prima BioMed))。
在一个实施例中，所述LAG-3抑制剂是抗LAG-3抗体分子。在一个实施例中，所述LAG-3抑制剂是抗LAG-3抗体分子，如题为“LAG-3的抗体分子及其用途”的2015年9月17日公开的US 2015/0259420(将其通过引用以其全文并入)中所披露的。
在一个实施例中，所述抗LAG-3抗体分子包含：含有SEQ ID NO:706的氨基酸序列的VH和含有SEQ ID NO:718的氨基酸序列的VL。在一个实施例中，所述抗LAG-3抗体分子包含：含有SEQ ID NO:724的氨基酸序列的VH和含有SEQ ID NO:730的氨基酸序列的VL。
表3.示例性抗LAG-3抗体分子的氨基酸和核苷酸序列
Figure BDA0003119995180000401
Figure BDA0003119995180000411
在一个实施例中，所述抗LAG-3抗体分子是BMS-986016(百时美施贵宝公司)，也称为BMS986016。BMS-986016和其他抗LAG-3抗体披露于WO 2015/116539和US 9,505,839(将其通过引用以其全文并入)中。在一个实施例中，抗LAG-3抗体分子包含以下中的一种或多种：BMS-986016的CDR序列(或总体上全部CDR序列)、重链或轻链可变区序列、或重链或轻链序列，例如，如表4中所披露的。
在一个实施例中，所述抗LAG-3抗体分子是IMP731或GSK2831781(GSK公司和普瑞马生物医药公司)。IMP731和其他抗LAG-3抗体披露于WO 2008/132601和US 9,244,059(将其通过引用以其全文并入)中。在一个实施例中，抗LAG-3抗体分子包含以下的一种或多种：IMP731的CDR序列(或总体上全部CDR序列)、重链或轻链可变区序列、或重链或轻链序列，例如，在表4中所披露的。
其他已知的抗LAG-3抗体包括在例如WO 2008/132601、WO 2010/019570、WO 2014/140180、WO 2015/116539、WO 2015/200119、WO 2016/028672、US 9,244,059、US 9,505,839(将其通过引用以其全文并入)中描述的那些。
在一个实施例中，所述抗LAG-3抗体是与本文所述的抗LAG-3抗体之一竞争与LAG-3上的相同表位结合和/或结合至LAG-3上的相同表位的抗体。
在一个实施例中，所述抗LAG-3抑制剂是可溶性LAG-3蛋白，例如，IMP321(普瑞马生物医药公司)，例如，如WO 2009/044273(将其通过引用以其全文并入)中所披露的。
表4.示例性抗LAG-3抗体分子的氨基酸序列
Figure BDA0003119995180000412
Figure BDA0003119995180000421
TIM-3抑制剂
鉴于TIM-3在固有免疫和适应性免疫中的免疫调节作用，以及其在AML和MDS中在白血病干细胞上的表达，TIM-3抑制剂不仅可以帮助恢复抗肿瘤免疫应答，也可以直接靶向MDS干细胞。结果，TIM-3抑制剂在低风险MDS中可能具有直接和间接的疾病缓解活性，而IL-1β阻断可能会增强这种活性，IL-1β阻断是针对促炎途径的疗法。
示例性TIM-3抑制剂
在某些实施例中，本文所述的组合包含抗TIM3抗体分子。在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子，如题为“TIM-3的抗体分子及其用途”的2015年8月6日公开的US 2015/0218274(将其通过引用以其全文并入)中所披露的。
在一个实施例中，抗TIM-3抗体分子包含来自重链和轻链可变区的至少一个、两个、三个、四个、五个、或六个互补决定区(CDR)(或总体上全部CDR)，所述重链和轻链可变区包含表5(例如，来自表5中披露的ABTIM3-hum11、或ABTIM3-hum03的重链和轻链可变区序列)中所示的氨基酸序列、或由表5中所示的核苷酸序列编码的氨基酸序列。在一些实施例中，CDR根据卡巴特定义(例如，如表5中所列出的)。在一些实施例中，这些CDR根据乔西亚定义(例如，如表5中所列出的)。在一个实施例中，相对于表5中所示的氨基酸序列，或由表5中所示的核苷酸序列编码的氨基酸序列，CDR中的一个或多个(或总体上全部CDR)具有一个、两个、三个、四个、五个、六个或更多个变化，例如氨基酸取代(例如，保守氨基酸取代)或缺失。
在一个实施例中，抗TIM-3抗体分子包含：含有SEQ ID NO:801的VHCDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:802的VHCDR2氨基酸序列、和SEQ ID NO:803的VHCDR3氨基酸序列的重链可变区(VH)；以及含有SEQ ID NO:810的VLCDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:811的VLCDR2氨基酸序列、和SEQ ID NO:812的VLCDR3氨基酸序列的轻链可变区(VL)，各自披露于表5中。在一个实施例中，抗TIM-3抗体分子包含：含有SEQ ID NO:801的VHCDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:820的VHCDR2氨基酸序列、和SEQ ID NO:803的VHCDR3氨基酸序列的重链可变区(VH)；以及含有SEQ ID NO:810的VLCDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:811的VLCDR2氨基酸序列、和SEQ IDNO:812的VLCDR3氨基酸序列的轻链可变区(VL)，各自披露于表5中。
在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子包含：含有SEQ ID NO:806的氨基酸序列、或与SEQ ID NO:806具有至少85％、90％、95％、或99％、或更高同一性的氨基酸序列的VH。在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子包含：含有SEQ ID NO:816的氨基酸序列、或与SEQID NO:816具有至少85％、90％、95％、或99％、或更高同一性的氨基酸序列的VL。在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子包含：含有SEQ ID NO:822的氨基酸序列、或与SEQ ID NO:822具有至少85％、90％、95％、或99％、或更高同一性的氨基酸序列的VH。在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子包含：含有SEQ ID NO:826的氨基酸序列、或与SEQ ID NO:826具有至少85％、90％、95％、或99％、或更高同一性的氨基酸序列的VL。在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子包含：含有SEQ ID NO:806的氨基酸序列的VH和含有SEQ ID NO:816的氨基酸序列的VL。在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子包含：含有SEQ ID NO:822的氨基酸序列的VH和含有SEQ ID NO:826的氨基酸序列的VL。
在一个实施例中，抗体分子包含：由SEQ ID NO:807的核苷酸序列、或与SEQ IDNO:807具有至少85％、90％、95％、或99％、或更高同一性的核苷酸序列编码的VH。在一个实施例中，抗体分子包含：由SEQ ID NO:817的核苷酸序列、或与SEQ ID NO:817具有至少85％、90％、95％、或99％、或更高同一性的核苷酸序列编码的VL。在一个实施例中，抗体分子包含：由SEQ ID NO:823的核苷酸序列、或与SEQ ID NO:823具有至少85％、90％、95％、或99％、或更高同一性的核苷酸序列编码的VH。在一个实施例中，抗体分子包含：由SEQ IDNO:827的核苷酸序列、或与SEQ ID NO:827具有至少85％、90％、95％、或99％、或更高同一性的核苷酸序列编码的VL。在一个实施例中，抗体分子包含由SEQ ID NO:807的核苷酸序列编码的VH和由SEQ ID NO:817的核苷酸序列编码的VL。在一个实施例中，抗体分子包含由SEQ ID NO:823的核苷酸序列编码的VH和由SEQ ID NO:827的核苷酸序列编码的VL。
在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子包含：含有SEQ ID NO:808的氨基酸序列、或与SEQ ID NO:808具有至少85％、90％、95％、或99％、或更高同一性的氨基酸序列的重链。在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子包含：含有SEQ ID NO:818的氨基酸序列、或与SEQ ID NO:818具有至少85％、90％、95％、或99％、或更高同一性的氨基酸序列的轻链。在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子包含：含有SEQ ID NO:824的氨基酸序列、或与SEQ IDNO:824具有至少85％、90％、95％、或99％、或更高同一性的氨基酸序列的重链。在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子包含：含有SEQ ID NO:828的氨基酸序列、或与SEQ ID NO:828具有至少85％、90％、95％、或99％、或更高同一性的氨基酸序列的轻链。在一个实施例中，抗TIM-3抗体分子包含：含有SEQ ID NO:808的氨基酸序列的重链和含有SEQ ID NO:818的氨基酸序列的轻链。在一个实施例中，抗TIM-3抗体分子包含：含有SEQ ID NO:824的氨基酸序列的重链和含有SEQ ID NO:828的氨基酸序列的轻链。
在一个实施例中，抗体分子包含：由SEQ ID NO:809的核苷酸序列、或与SEQ IDNO:809具有至少85％、90％、95％、或99％、或更高同一性的核苷酸序列编码的重链。在一个实施例中，抗体分子包含：由SEQ ID NO:819的核苷酸序列、或与SEQ ID NO:819具有至少85％、90％、95％、或99％、或更高同一性的核苷酸序列编码的轻链。在一个实施例中，抗体分子包含：由SEQ ID NO:825的核苷酸序列、或与SEQ ID NO:825具有至少85％、90％、95％、或99％、或更高同一性的核苷酸序列编码的重链。在一个实施例中，抗体分子包含：由SEQID NO:829的核苷酸序列、或与SEQ ID NO:829具有至少85％、90％、95％、或99％、或更高同一性的核苷酸序列编码的轻链。在一个实施例中，抗体分子包含：由SEQ ID NO:809的核苷酸序列编码的重链和由SEQ ID NO:819的核苷酸序列编码的轻链。在一个实施例中，抗体分子包含：由SEQ ID NO:825的核苷酸序列编码的重链和由SEQ ID NO:829的核苷酸序列编码的轻链。
本文所述的抗体分子可以通过载体、宿主细胞、和在US2015/0218274(将其通过引用以其全文并入)中描述的方法制得。
表5.示例性抗TIM-3抗体分子的氨基酸和核苷酸序列
Figure BDA0003119995180000451
Figure BDA0003119995180000461
Figure BDA0003119995180000471
Figure BDA0003119995180000481
Figure BDA0003119995180000491
在一个实施例中，抗TIM-3抗体分子包含至少一个或两个重链可变结构域(任选地包含恒定区)、至少一个或两个轻链可变结构域(任选地包含恒定区)、或二者，其包含ABTIM3、ABTIM3-hum01、ABTIM3-hum02、ABTIM3-hum03、ABTIM3-hum04、ABTIM3-hum05、ABTIM3-hum06、ABTIM3-hum07、ABTIM3-hum08、ABTIM3-hum09、ABTIM3-hum10、ABTIM3-hum11、ABTIM3-hum12、ABTIM3-hum13、ABTIM3-hum14、ABTIM3-hum15、ABTIM3-hum16、ABTIM3-hum17、ABTIM3-hum18、ABTIM3-hum19、ABTIM3-hum20、ABTIM3-hum21、ABTIM3-hum22、ABTIM3-hum23的氨基酸序列；或如US 2015/0218274的表1-4中所述的；或者由表1-4中的核苷酸序列编码；或与前述序列中任一项基本上相同(例如具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高同一性)的序列。抗TIM-3抗体分子任选地包含来自如US2015/0218274中所示的重链、轻链或二者的前导序列；或与其基本上相同的序列。
在又另一个实施例中，抗TIM-3抗体分子包含来自本文中所述的抗体(例如，选自ABTIM3、ABTIM3-hum01、ABTIM3-hum02、ABTIM3-hum03、ABTIM3-hum04、ABTIM3-hum05、ABTIM3-hum06、ABTIM3-hum07、ABTIM3-hum08、ABTIM3-hum09、ABTIM3-hum10、ABTIM3-hum11、ABTIM3-hum12、ABTIM3-hum13、ABTIM3-hum14、ABTIM3-hum15、ABTIM3-hum16、ABTIM3-hum17、ABTIM3-hum18、ABTIM3-hum19、ABTIM3-hum20、ABTIM3-hum21、ABTIM3-hum22、ABTIM3-hum23中的任一个的抗体)的重链可变区和/或轻链可变区的至少一个、两个或三个互补决定区(CDR)；或如US 2015/0218274的表1-4中所述的；或者由表1-4中的核苷酸序列编码；或与前述序列中任一项基本上相同(例如具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％、98％、99％或更高同一性)的序列。
在又另一个实施例中，抗TIM-3抗体分子包含来自重链可变区的至少一个、两个或三个CDR(或总体上全部CDR)，所述重链可变区包含如US 2015/0218274的表1-4中所示的氨基酸序列或由表1-4中所示的核苷酸序列编码的氨基酸序列。在一个实施例中，相对于表1-4中所示的氨基酸序列或由表1-4中所示的核苷酸序列编码的氨基酸序列，CDR中的一个或多个(或总体上全部CDR)具有一个、两个、三个、四个、五个、六个或更多个变化，例如氨基酸取代或缺失。
在又另一个实施例中，抗TIM-3抗体分子包含来自轻链可变区的至少一个、两个或三个CDR(或总体上全部CDR)，所述轻链可变区包含如US 2015/0218274的表1-4中所示的氨基酸序列或由表1-4中所示的核苷酸序列编码的氨基酸序列。在一个实施例中，相对于表1-4中所示的氨基酸序列或由表1-4中所示的核苷酸序列编码的氨基酸序列，CDR中的一个或多个(或总体上全部CDR)具有一个、两个、三个、四个、五个、六个或更多个变化，例如氨基酸取代或缺失。在某些实施例中，抗TIM-3抗体分子包含轻链CDR中的取代，例如轻链的CDR1、CDR2和/或CDR3中的一个或多个取代。
在另一个实施例中，抗TIM-3抗体分子包含来自重链和轻链可变区的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个CDR(或总体上全部CDR)，所述重链和轻链可变区包含US 2015/0218274的表1-4中所示的氨基酸序列，或由表1-4中所示的核苷酸序列编码。在一个实施例中，相对于表1-4中所示的氨基酸序列或由表1-4中所示的核苷酸序列编码的氨基酸序列，CDR中的一个或多个(或总体上全部CDR)具有一个、两个、三个、四个、五个、六个或更多个变化，例如氨基酸取代或缺失。
在另一个实施例中，抗TIM3抗体分子是MBG453。不受理论的束缚，通常认为MBG453是高亲和力的、配体阻断性、人源化的抗TIM-3IgG4抗体，其可以阻断TIM-3与磷脂酰丝氨酸(PtdSer)的结合。从历史上看，MBG453通常被误称为MGB453。
其他示例性TIM-3抑制剂
在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子是TSR-022(安奈普泰斯生物有限公司(AnaptysBio)/泰萨罗公司)。在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子包含以下中的一种或多种：TSR-022的CDR序列(或总体上全部CDR序列)、重链或轻链可变区序列、或重链或轻链序列。在一个实施例中，抗TIM-3抗体分子包含以下中的一种或多种：APE5137、或APE5121的CDR序列(或总体上全部CDR序列)、重链或轻链可变区序列、或重链或轻链序列，例如，如表6中所披露的。APE5137、APE5121和其他抗TIM-3抗体披露于WO 2016/161270(将其通过引用以其全文并入)中。
在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子是抗体克隆F38-2E2。在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子包含以下中的一种或多种：F38-2E2的CDR序列(或总体上全部CDR序列)、重链可变区序列和/或轻链可变区序列、或重链序列和/或轻链序列。
在一个实施例中，抗TIM-3抗体分子是LY3321367(礼来制药公司(Eli Lilly))。在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子包含以下中的一种或多种：LY3321367的CDR序列(或总体上全部CDR序列)、重链可变区序列和/或轻链可变区序列、或重链序列和/或轻链序列。
在一个实施例中，抗TIM-3抗体分子是Sym023(Symphogen公司)。在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子包含以下中的一种或多种：Sym023的CDR序列(或总体上全部CDR序列)、重链可变区序列和/或轻链可变区序列、或重链序列和/或轻链序列。
在一个实施例中，抗TIM-3抗体分子是BGB-A425(百济神州公司(Beigene))。在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子包含以下中的一种或多种：BGB-A425的CDR序列(或总体上全部CDR序列)、重链可变区序列和/或轻链可变区序列、或重链序列和/或轻链序列。
在一个实施例中，抗TIM-3抗体分子是INCAGN-2390(艾吉纳斯公司/因赛特公司(Agenus/Incyte))。在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子包含以下中的一种或多种：INCAGN-2390的CDR序列(或总体上全部CDR序列)、重链可变区序列和/或轻链可变区序列、或重链序列和/或轻链序列。
在一个实施例中，抗TIM-3抗体分子是MBS-986258(BMS/五柱公司(BMS/FivePrime))。在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子包含以下中的一种或多种：MBS-986258的CDR序列(或总体上全部CDR序列)、重链可变区序列和/或轻链可变区序列、或重链序列和/或轻链序列。
在一个实施例中，抗TIM-3抗体分子是RO-7121661(罗氏公司(Roche))。在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子包含以下中的一种或多种：RO-7121661的CDR序列(或总体上全部CDR序列)、重链可变区序列和/或轻链可变区序列、或重链序列和/或轻链序列。
在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子是LY-3415244(礼来制药公司(EliLilly))。在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子包含以下中的一种或多种：LY-3415244的CDR序列(或总体上全部CDR序列)、重链可变区序列和/或轻链可变区序列、或重链序列和/或轻链序列。
其他已知的抗TIM-3抗体包括例如在WO 2016/111947、WO2016/071448、WO 2016/144803、US 8,552,156、US 8,841,418、和US9,163,087(将其通过引用以其全文并入)中描述的那些。
在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体是与本文所述的抗TIM-3抗体之一竞争与TIM-3上的相同表位结合和/或结合至TIM-3上的相同表位的抗体。
表6.其他示例性抗TIM-3抗体分子的氨基酸序列
Figure BDA0003119995180000521
Figure BDA0003119995180000531
在本发明的一方面，将用于治疗有需要的患者的MDS的IL-1β结合抗体或其功能片段(适当地是卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)与TIM-3抑制剂组合施用。在一些实施例中，所述TIM-3抑制剂是MBG453(诺华公司)或TSR-022(泰萨罗公司(Tesaro))。在一个优选的实施例中，TIM-3抑制剂是MBG453(诺华公司)。
如果MBG453与卡那吉努单抗组合每4周施用，那么MBG453的合适剂量为约每4周约800mg，而卡那吉努单抗的合适剂量为约每4周约250mg。根据群体PK分析，卡那吉努单抗的250mg Q4W给药方案可产生与200mg Q3W方案(所述方案已在其他肿瘤学适应症中进行了测试)相当的PK。如果MBG453与卡那吉努单抗组合每3周施用，那么MBG453的合适剂量为约每3周约600mg，而卡那吉努单抗的合适剂量为约每3周约200mg。因此，当MBG453与卡那吉努单抗组合施用时，约每4周(Q4W)约800mg MBG453，约每3周(Q3W)约600mg MBG453和约每2周(Q2W)约400mg MBG453的剂量也是合适的。
在一个实施例中，本发明提供了一种IL-1β结合抗体或其功能片段(适当地是卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)，用于与MBG453组合地在有需要的患者中治疗MDS中的贫血，适当地是低风险MDS中的贫血。
在CANTOS试验中，贫血得以减轻。
在一个实施例中，将用于治疗有需要的患者中的MDS的IL-1β结合抗体或其功能片段(适当地是卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)与MBG453组合施用给患有低风险MDS的患者，所述低风险MDS具有贫血、血小板减少或中性粒细胞减少，被主治医师认为需要治疗，并且对其没有标准的护理治疗选择。
在一个实施例中，向患者施用约Q4W约250mg卡那基单抗与约Q4W 800mg MBG453组合，所述患者具有确诊的IPSS-R定义的极低、低或中等风险的骨髓增生异常综合征(MDS)，伴随以下中的一个或多个：
·复发的、难治疗的或不耐受ESA的贫血，并且被主治医师认为需要治疗
·EPO水平约≥500mU/mL的ESA初试的贫血，并且被主治医师认为需要治疗
·血小板减少，其适合IWG的应答评估，并且被主治医师认为需要治疗
·适合IWG的应答评估的中性粒细胞减少，其是复发的、难治疗的或不耐受生长因子，并且被主治医师认为需要治疗
在一个实施例中，所述TIM-3抑制剂是抗TIM-3抗体分子。在一个实施例中，所述TIM-3抑制剂是抗TIM-3抗体分子，如题为“TIM-3的抗体分子及其用途”的2015年8月6日公开的US 2015/0218274(将其通过引用以其全文并入)中所披露的。
在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子包含：含有SEQ ID NO:806的氨基酸序列的VH和含有SEQ ID NO:816的氨基酸序列的VL。在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子包含：含有SEQ ID NO:822的氨基酸序列的VH和含有SEQ ID NO:826的氨基酸序列的VL。
本文所述的抗体分子可以通过载体、宿主细胞、和在US 2015/0218274(将其通过引用以其全文并入)中描述的方法制得。
在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子是TSR-022(安奈普泰斯生物有限公司(AnaptysBio)/泰萨罗公司)。在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子包含以下中的一种或多种：TSR-022的CDR序列(或总体上全部CDR序列)、重链或轻链可变区序列、或重链或轻链序列。在一个实施例中，抗TIM-3抗体分子包含以下中的一种或多种：APE5137、或APE5121的CDR序列(或总体上全部CDR序列)、重链或轻链可变区序列、或重链或轻链序列，例如，如表6中所披露的。APE5137、APE5121和其他抗TIM-3抗体披露于WO 2016/161270(将其通过引用以其全文并入)中。
在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子是抗体克隆F38-2E2。在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体分子包含以下中的一种或多种：F38-2E2的CDR序列(或总体上全部CDR序列)、重链或轻链可变区序列、或重链或轻链序列。
其他已知的抗TIM-3抗体包括例如在WO 2016/111947、WO 2016/071448、WO 2016/144803、US 8,552,156、US 8,841,418、和US 9,163,087(将其通过引用以其全文并入)中描述的那些。
在一个实施例中，所述抗TIM-3抗体是与本文所述的抗TIM-3抗体之一竞争与TIM-3上的相同表位结合和/或结合至TIM-3上的相同表位的抗体。
GITR激动剂
在本发明的一方面，IL-1β抑制剂或其功能片段与GITR激动剂一起施用。在一些实施例中，GITR激动剂是GWN323(诺华公司(NVS))、BMS-986156、MK-4166或MK-1248(默克公司(Merck))、TRX518(利普治疗公司(Leap Therapeutics))、INCAGN1876(因赛特公司(Incyte)/艾吉纳斯公司(Agenus))、AMG 228(美商安进公司(Amgen))或INBRX-110(印希彼公司(Inhibrx))。
在一个实施例中，所述GITR激动剂是抗GITR抗体分子。在一个实施例中，所述GITR激动剂是抗GITR抗体分子，如题为“Compositions and Methods of Use for AugmentedImmune Response and Cancer Therapy[用于增强免疫反应和癌症治疗的组合物和方法]”的2016年4月14日公布的WO 2016/057846(将其通过引用以其全文并入)中所述的。
在一个实施例中，所述抗GITR抗体分子包含：含有SEQ ID NO:901的氨基酸序列的VH和含有SEQ ID NO:902的氨基酸序列的VL。
表7：示例性抗GITR抗体分子的氨基酸和核苷酸序列
Figure BDA0003119995180000551
Figure BDA0003119995180000561
在一个实施例中，所述抗GITR抗体分子是BMS-986156(百时美施贵宝公司(Bristol-Myers Squibb))，也称为BMS 986156或BMS986156。BMS-986156和其他抗GITR抗体披露于例如US 9,228,016和WO2016/196792(将其通过引用以其全文并入)中。在一个实施例中，抗GITR抗体分子包含以下的一种或多种：BMS-986156的CDR序列(或总体上全部CDR序列)、重链或轻链可变区序列、或重链或轻链序列，例如，在表8中所披露的。
在一个实施例中，所述抗GITR抗体分子是MK-4166或MK-1248(默克公司)。MK-4166、MK-1248、和其他抗GITR抗体披露于例如，US 8,709,424、WO 2011/028683、WO 2015/026684、和Mahne等人,Cancer Res.[癌症研究]2017；77(5):1108-1118(将其通过引用以其全文并入)中。
在一个实施例中，所述抗GITR抗体分子是TRX518(利普治疗公司)。TRX518和其他抗GITR抗体披露于例如US 7,812,135、US 8,388,967、US 9,028,823、WO 2006/105021，以及Ponte J等人,(2010)Clinical Immunology[临床免疫学]；135:S96中，这些申请通过引用以其全文并入。
在一个实施例中，所述抗GITR抗体分子是INCAGN1876(因赛特公司/艾吉纳斯公司)。INCAGN1876和其他抗GITR抗体披露于例如US 2015/0368349和WO 2015/184099(将其通过引用以其全文并入)中。
在一个实施例中，所述抗GITR抗体分子是AMG 228(美商安进公司)。AMG 228和其他抗GITR
抗体披露于例如US 9,464,139和WO 2015/031667(将其通过引用以其全文并入)中。
在一个实施例中，所述抗GITR抗体分子是INBRX-110(印希彼公司)。INBRX-110和其他抗GITR抗体披露于例如US 2017/0022284和WO 2017/015623(将其通过引用以其全文并入)中。
在一个实施例中，所述GITR激动剂(例如，融合蛋白)是MEDI 1873(英商梅迪缪思有限公司(MedImmune))，也称为MEDI1873。MEDI1873和其他GITR激动剂披露于例如US2017/0073386、WO 2017/025610，以及Ross等人,Cancer Res[癌症研究]2016；76(14增刊):摘要nr 561(将其通过引用以其全文并入)中。在一个实施例中，所述GITR激动剂包含MEDI1873的IgG Fc结构域、功能性多聚化结构域、和糖皮质激素诱导的TNF受体配体(GITRL)的受体结合结构域中的一种或多种。
另外的已知GITR激动剂(例如，抗GITR抗体)包括例如在WO 2016/054638(将其通过引用以其全文并入)中描述的那些。
在一个实施例中，所述抗GITR抗体是与本文所述的抗GITR抗体之一竞争与GITR上的相同表位结合和/或结合至GITR上的相同表位的抗体。
在一个实施例中，所述GITR激动剂是活化GITR信号传导途径的肽。在一个实施例中，所述GITR激动剂是与恒定区(例如，免疫球蛋白序列的Fc区)融合的免疫黏附素结合片段(例如，包含GITRL的细胞外或GITR的结合部分的免疫黏附素结合片段)。
表8：示例性抗GITR抗体分子的氨基酸序列
Figure BDA0003119995180000571
IL15/IL-15Ra复合物
在本发明的一方面，IL-1β抑制剂或其功能片段与IL-15/IL-15Ra复合物一起施用。在一些实施例中，IL-15/IL-15Ra复合物选自NIZ985(诺华公司)、ATL-803(亚拉斯托公司(Altor))或CYP0150(Cytune公司)。
在一个实施例中，IL-15/IL-15Ra复合物包含人IL-15与可溶形式的人IL-15Ra复合。该复合物可以包含共价或非共价连接至IL-15Ra的可溶性形式的IL-15。在具体的实施例中，人IL-15非共价地与可溶形式的IL-15Ra结合。在具体的实施例中，组合物的人IL-15包含表9中SEQ ID NO:1001的氨基酸序列，并且可溶形式的人IL-15Ra包含表9中的SEQ IDNO:1002的氨基酸序列，如在WO 2014/066527中的描述，通过引用以其全文并入。本文所述的这些分子可以通过运载体、宿主细胞、和在WO 2007/084342中描述的方法制得，该申请通过引用以其全文并入。
表9.示例性IL-15/IL-15Ra复合物的氨基酸和核苷酸序列
Figure BDA0003119995180000581
在一个实施例中，所述IL-15/IL-15Ra复合物是ALT-803(IL-15/IL-15Ra Fc融合蛋白(IL-15N72D:IL-15RaSu/Fc可溶性复合物))。ALT-803披露在WO 2008/143794中，通过引用以其全文并入。在一个实施例中，IL-15/IL-15Ra Fc融合蛋白包含如表10中所披露的序列。
在一个实施例中，所述IL-15/IL-15Ra复合物包含与IL-15Ra的sushi结构域融合的IL-15(CYP0150，赛腾制药)。IL-15Ra的sushi结构域是指在IL-15Ra的信号肽之后的第一半胱氨酸残基处开始并且在所述信号肽之后的第四个半胱氨酸残基处结束的结构域。与IL-15Ra的sushi结构域融合的IL-15的复合物披露在WO 2007/04606和WO 2012/175222中，这些申请通过引用以其全文并入。在一个实施例中，IL-15/IL-15Ra sushi结构域融合物包含如在表10中所披露的序列。
表10.其他示例性IL-15/IL-15Ra复合物的氨基酸序列
Figure BDA0003119995180000582
Figure BDA0003119995180000591
CTLA-4抑制剂
在本发明的一方面，IL-1β抑制剂或其功能片段与CTLA-4抑制剂一起施用。在一些实施例中，CTLA-4抑制剂是抗CTLA-4抗体或其片段。示例性的抗CTLA-4抗体包括曲美木单抗(Tremelimumab)(以前成为替利木单抗(ticilimumab)，CP-675,206)；和艾匹利木单抗(MDX-010，
Figure BDA0003119995180000592
)。
在一个实施例中，本发明提供一种IL-1β抗体或其功能片段(例如，卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)，用于治疗具有至少部分炎性基础的癌症，例如肺癌，特别是NSCLC，其中所述IL-1β抗体或其功能片段与一种或多种化疗剂组合施用，其中所述一种或多种化疗剂是检查点抑制剂，优选选自由以下组成的组：纳武单抗、兰洛利珠单抗、阿特利珠单抗、阿维鲁单抗、度伐鲁单抗、PDR-001(斯巴达珠单抗)和艾匹利木单抗。在一个实施例中，一种或多种化疗剂是PD-1或PD-L-1抑制剂，其优选地选自由以下组成的组：纳武单抗、兰洛利珠单抗、阿特利珠单抗、阿维鲁单抗、杜鲁伐单抗、PDR-001(斯巴达珠单抗)，进一步优选地是兰洛利珠单抗。在另一个实施例中，IL-1β抗体或其功能片段与PD-1或PD-L1抑制剂同时施用。
在一个实施例中，患者的癌症具有高PD-L1表达。通常，高PD-L1表达被定义为等于或大于约50％的肿瘤比例评分(TPS)，如由FDA批准的测试确定的。
在一个实施例中，所述患者患有具有高PD-L1表达[肿瘤比例评分(TPS)≥50％]的肿瘤，如通过FDA批准的测试所确定的那样，具有或不具有EGFR或ALK基因组肿瘤异常。在一个实施例中，所述患者患有通过FDA批准的测试确定的具有PD-L1表达(TPS≥1％)的肿瘤。
术语“与……组合”应理解为随后或同时施用两种或多种药物。可替代地，术语“与……组合”应理解为以预期在患者体内大部分时间段上药物的有效治疗浓度重叠的方式施用两种或更多种药物。本发明的药物和一种或多种组合伴侣(例如另一种药物，也称为“治疗剂”或“共用药剂”)可以在同一时间独立地施用或在时间间隔内分开地施用，特别是在这些时间间隔允许组合配偶体显示协作(例如协同)效应的情况下)。如本文所使用的术语“共同施用”或“组合施用”或“组合使用”或“组合施用”等意在涵盖将所选择的组合配偶体施用至有需要的单个受试者(例如患者)，并且旨在包括其中药剂不一定通过相同的施用途径施用或同时施用的治疗方案。在没有特定时间限制的情况下同时、并行或顺序地将药物作为单独的实体施用给患者，其中这种施用在患者体内提供了两种化合物的治疗有效水平，并且治疗方案将提供药物组合在治疗本文所述的病症或障碍中的有益作用。后者也适用于混合物疗法，例如三种或更多种活性成分的施用。
施用、配制品和装置
卡那吉努单抗可以静脉内施用或优选地皮下施用。除非在其中指定了施用途径的实施例中，否则两种施用途径均适用于本申请公开的每个卡那吉努单抗相关实施例。
格沃吉珠单抗可以皮下施用或优选地静脉内施用。除非在其中指定了施用途径的实施例中，否则两种施用途径均适用于本申请公开的每个格沃吉珠单抗相关实施例。
卡那吉努单抗可以制备为用于重构冻干形式的药物。在一个实施例中，卡那吉努单抗以用于重构的冻干形式提供，每瓶含有至少约200mg药物，在一瓶中优选地不多于约250mg、优选地不多于约225mg。
在一方面，本发明提供了用于在有需要的患者中治疗和/或预防癌症的卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗，所述治疗和/或预防包括将治疗有效量施用于患者，其中所述癌症具有至少部分炎症基础，并且其中卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗通过预充式注射器或自动注射器施用。优选地，预充式注射器或自动注射器包含全部量的治疗有效量的药物。优选地，预充式注射器或自动注射器包含约200mg的卡那吉努单抗。
功效与安全性
由于其良好的安全性谱，可将卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗长期施用于患者，从而提供和维持抑制IL-1β介导的炎症的益处。此外，由于其抗癌作用，无论是单一疗法还是与一种或多种治疗剂组合使用，与不进行本发明的治疗的情况相比均可延长患者的生命，包括但不限于延长DFS、PFS、OS的持续时间，降低危险风险。如本申请中所使用的，术语“本发明的治疗”是指根据本申请所教导的根据给药方案施用的本发明的药物，其适当地是卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗。优选地，以大约每3周或大约每月约200mg卡那吉努单抗的剂量施用，优选地持续至少约6个月、优选地至少约12个月、优选地至少约24个月、优选地多至约2年、优选地多至约3年，来实现临床功效。优选地，以大约每3周或大约每月约30mg-120mg格沃吉珠单抗的剂量施用，优选地持续至少约6个月、优选地至少约12个月、优选地至少约24个月、优选地多至约2年、优选地多至约3年，来实现结果。在一个实施例中，本发明的治疗是单独治疗。在一个实施例中，将本发明的治疗添加在SoC治疗之上以用于癌症适应症。尽管SoC治疗随时间发展，但是这里使用的SoC治疗应理解为不包括本发明的药物。
因此，在一方面，本发明提供了IL-1β结合抗体或其功能片段(适当地是卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)，用于治疗患者的MDS，其中将治疗有效量的IL-1β结合抗体或其功能片段施用于患者持续至少约6个月、优选地至少约12个月、优选地至少约24个月。
在一方面，本发明提供了IL-1β结合抗体或其功能片段(适当地是卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)，用于治疗患者的MDS，其中优选地与未接受本发明的治疗相比，所述患者癌症死亡的危险风险降低至少约10％、至少约20％、至少约30％、至少约40％或至少约50％。
贯穿本申请使用的术语“未接受本发明的治疗”包括根本未接受任何药物的患者和仅接受当时被视为SoC的治疗而未接受本发明药物的患者。如本领域技术人员将理解的，临床功效通常不在接受或未接受本发明的治疗的同一患者内进行检测，而是在治疗组和安慰剂组的临床试验情境中进行检测。
在一个实施例中，患者的总生存期(OS，定义为从随机化日期到任何原因导致的死亡日期的时间)与未接受本发明的治疗相比延长了至少约一个月、至少约3个月、至少约6个月、至少约12个月。在一个实施例中，在辅助治疗情境中，OS延长至少约12个月、优选地至少约24个月。在一个实施例中，在一线治疗情境中，OS延长至少约4个月、优选地至少约6个月、或至少约12个月。在一个实施例中，在二/三线治疗情境中，OS延长至少约一个月、至少约3个月、或优选地至少约6个月。
在一个实施例中，在辅助治疗情境下，接受本发明的治疗的患者的总生存期为至少约2年、至少约3年、至少约5年、至少约8年或至少约10年。在一个实施例中，在一线治疗情境中，接受本发明的治疗的患者的总生存期为至少约6个月、至少约一年、或至少约3年。在一个实施例中，在二/三线治疗情境中，接受本发明的治疗的患者的总生存期为至少约3个月、至少约6个月、或至少约一年。
在一个实施例中，接受本发明治疗的患者的无进展生存期(PFS)优选地与未接受本发明的治疗相比，延长至少约一个月、至少约2个月、至少约3个月、至少约6个月、或至少约12个月。在一个实施例中，在一线治疗情境中，PFS延长至少约6个月，优选地至少约12个月。在一个实施例中，在二线治疗情境中，PFS延长至少约一个月、至少约3个月、或至少约6个月。
在一个实施例中，接受本发明的治疗的患者具有至少约3个月、至少约6个月、至少约12个月或至少约24个月的无进展生存期。
通常在比较治疗组和安慰剂组的临床试验中可以证明临床功效，其包括但不限于DFS、PFS、HR降低、OS。在安慰剂组中，患者根本不接受任何药物或接受SoC治疗。在治疗组中，患者接受本发明的药物作为单一疗法或将其添加到SoC治疗。可替代地，在安慰剂组中，患者接受SoC治疗，并且在治疗组中，患者接受本发明的药物。
即使将临床结果(例如DFS的持续时间或癌症死亡率的HR降低)描述为基于临床试验的统计分析的数字，但本领域的普通技术人员将很容易把这些统计数据外推至如所要求保护的针对个体患者的治疗，因为预期在接受本发明的治疗的部分个体患者中，本发明的药物会达到相似的临床结果，例如在大约95％的患者中，此时临床试验显示出统计学显著性(p≤0.05)；或例如在大约50％的患者中，此时临床试验提供了平均值，例如平均PFS约为24个月。IL-1β阻断可能会在抵抗感染时影响患者的免疫系统。因此，一方面，本发明提供了IL-1β结合抗体或其功能片段(适当地是卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)，用于治疗和/或预防癌症(例如具有至少部分炎症基础的癌症)，其中由于本发明的治疗，患者不具有发生严重感染的高风险。在以下情况下，由于本发明的治疗，患者将有发生严重感染的高风险，但其不限于这些情况：(a)患者患有需要医疗干预的活动性感染。术语“需要医疗干预的活动性感染”理解为患者当前正在服用或已经服用或刚完成了服用少于约一个月或少于约两周的任何抗病毒药和/或任何抗菌药；(b)患者患有潜伏性结核病和/或有结核病史。
为了控制IL-1β阻断对免疫系统的抑制作用，应注意不要将IL-1β结合抗体或其功能片段与TNF抑制剂伴随施用。优选地，TNF抑制剂选自以下组，该组由以下组成：
Figure BDA0003119995180000641
(依那西普(etanercept))、
Figure BDA0003119995180000642
(阿达木单抗(adalimumab))、
Figure BDA0003119995180000643
(英夫利昔单抗(infliximab))、
Figure BDA0003119995180000644
(戈利木单抗(golimumab))和
Figure BDA0003119995180000645
(赛妥珠单抗(certolizumab pegol))。还应注意，IL-1β结合抗体或其功能片段不与另一种IL-1阻断剂同时施用，其中优选地，所述IL-1阻断剂选自以下组，该组由以下组成：
Figure BDA0003119995180000646
(阿那白滞素(anakinra))和
Figure BDA0003119995180000647
(列洛西普(rilonacept))。此外，在癌症的治疗/预防中仅施用一种IL-1β结合抗体或其功能片段。例如，卡那吉努单抗不与格沃吉珠单抗组合施用。
当将卡那吉努单抗施用于患者时，可能某些患者会产生抗卡那吉努单抗抗体(抗药物抗体，ADA)，出于安全性和功效的原因，需要对其进行监测。在一方面，本发明提供了卡那吉努单抗，用于治疗和/或预防癌症(例如具有至少部分炎症基础的癌症)，其中患者发展ADA的可能性小于约1％、小于约0.7％、小于约0.5％、小于约0.4％。在一个实施例中，通过实例10中所述的方法检测抗体。在一个实施例中，自卡那吉努单抗的第一次施用后约3个月、约6个月或约12个月时进行抗体检测。
有待根据本发明治疗的癌症
在一方面，本发明提供单独的或与一种或多种治疗剂组合的IL-1β结合抗体或其功能片段(适当地是格沃吉珠单抗或适当地是卡那吉努单抗)，用于治疗癌症(例如具有至少部分炎症基础的癌症)，其中所述癌症包括骨髓增生异常综合征(MDS)(适当地是低风险MDS)，或者其中所述癌症包括其他骨髓瘤例如慢性髓单核细胞白血病(CMML)、骨髓增生性肿瘤(MPN)和多发性骨髓瘤(MM)。
在一方面，本发明提供单独的或与一种或多种治疗剂组合的IL-1β结合抗体或其功能片段(适当地是格沃吉珠单抗或适当地是卡那吉努单抗)，用于治疗骨髓增生异常综合征(MDS)(适当地是低风险MDS)。在一个实施例中，本发明提供单独的或与一种或多种治疗剂组合的IL-1β结合抗体或其功能片段(适当地是格沃吉珠单抗或适当地是卡那吉努单抗)，用于治疗骨髓增生异常综合征(MDS)中的贫血(适当地是低风险MDS中的贫血)。
骨髓增生异常综合征(MDS)是一组以外周血细胞生成受损(血细胞减少)以及最常见的细胞增生、异常表现的骨髓为特征的癌症。MDS是造血干细胞的疾病。它们的特征在于分化和成熟失调，并且在于骨髓基质变化。已设置诊断标准以诊断MDS：2个分类系统(法美英(French-American-British)[FAB]和世界卫生组织(World Health Organization)[WHO])和若干预后评分系统，最常见的是国际预后评分系统(International PrognosticScoring System，IPSS)(Nimer,Blood[血液],2008,Germing等人,Dtsch Arztebl Int.[德国国际医学杂志]2013)。还有IPSS的修订版本，称为针对骨髓增生异常综合征的修订后的国际预后评分系统(Revised International Prognostic Scoring System，IPSS-R)。其由MDS预后国际工作组(International Working Group for Prognosis in MDS，IWG)开发。其可以通过在https://www.mds-foundation.org/ipss-r-calculator/上的IPSS-R计算器来使用。
IWG还定义了应答标准，以对用于临床决策的应答评估以及跨研究的临床试验数据的比较进行标准化。这些应答标准之一是血液学改善的血红蛋白(HI-E)。所述应答标准最近被修订(Platzbecker等人,Blood[血液](20 19)133(10):1020-1030)。输注依赖性和血红蛋白水平是HI-E应答的参数。
WHO目前对骨髓增生异常综合征(MDS)进行了分类，如下表所示。
表11：WHO骨髓增生异常综合征分类(Brunning等人和Orazi等人.在:WHOclassification of tumours of haematopoietic and lymphoid tissues[WHO造血和淋巴组织肿瘤分类],2008年)
Figure BDA0003119995180000661
根据对患者风险的评估、贫血症水平以及del(5q)染色体或细胞遗传学异常的存在，术语“骨髓增生异常综合症”或“MDS”包括三组患者：“不具有del(5q)染色体/细胞遗传学异常且Epo<500mU/mL的低风险患者”、“不具有del(5q)染色体/细胞遗传学异常且Epo>500mU/mL的低风险患者”、和“高风险患者”。使用国际预后评分系统(IPSS和修订后的IPSS-R)和/或WHO预后评分系统(WPSS)对患者风险水平进行量化。低风险定义为：IPSS低、中等-1；IPSS-R极低、低、中等；或WPSS极低、低、中等。较高风险定义为：IPSS中等-2、高；IPSS-R中等、高、极高；或WPSS高、极高。可以使用额外的遗传生物标志物鉴定处于低风险类别的患者，其将从通常仅对高风险患者进行的治疗中受益。
在一个实施例中，MDS患者是输注依赖性的。
在一个实施例中，MDS患者患有贫血症。
由于慢性炎症与MDS的发展有牵连(Barreyro等人,Blood[血液].2018年,Basiorka等人,Blood[血液].2016；128(25):2960-2975,Yin等人,Life Sci.[生命科学].2016；165:109-112)，本发明的药物(优选地为卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)可以与低风险患者组的当前标准治疗组合，而与他们在显示初期的背景染色体/细胞遗传学特征或Epo水平无关。
由于IL-1β与抑制促红细胞生成素的表达有直接牵连(Cluzeau等人,Haematologica[血液学].2017；102(12):2015-2020)，本发明的药物(优选地为卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)在低Epo的患者中可能是有用的疗法。
在一个实施例中，本发明提供了本发明的药物(优选地为卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)，用于治疗MDS，其中本发明的药物与一种或多种治疗剂组合施用。
在一个实施例中，所述一种或多种治疗剂选自以下：红细胞生成刺激剂(ESA)，包括红细胞生成素、依泊汀α、依泊汀β、依泊汀Ω、依泊汀δ、依泊汀ζ、依泊汀θ、达依泊汀α，甲氧基聚乙二醇-依泊汀β；粒细胞集落刺激因子(G-CSF)；来那度胺；阿扎胞苷(AzaC)；地西他滨；血小板生成素受体激动剂(TPO)，包括阿伐琼珀(avatrombopag)、艾曲泊帕(eltrombopag)、卢舒琼珀(lusutrombopag)、promegapoietin、罗米司亭、血小板生成素；以及适合于强化诱导化疗的化疗剂。在一个实施例中，一种或多种化疗剂是阿培利司(alpelisib)。阿培利司以每天约300mg的治疗有效量施用。在一个实施例中，一种或多种化疗剂是艾曲泊帕。艾曲泊帕以每天约75mg的治疗有效量施用。
根据患者的状况，可以从以上列表中选择一种、两种或三种治疗剂与本发明的药物组合。
在一个实施例中，一种或多种治疗剂是用于MDS的标准治疗(SoC)剂。在一个优选的实施例中，一种或多种治疗剂是AzaC。在一个优选的实施例中，治疗性的一种或多种治疗剂是地西他滨。在一个实施例中，一种或多种治疗剂是来那度胺。在一个实施例中，一种或多种治疗剂是具有或不具有G-CSF的ESA。
在一个实施例中，一种或多种治疗剂是HDM2-p53相互作用抑制剂，例如(S)-5-(5-氯-1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-3-基)-6-(4-氯-苯基)-2-(2,4-二甲氧基-嘧啶-5-基)-1-异丙基-5,6-二氢-1H-吡咯[3,4-d]咪唑-4-酮(HDM201，WO 2013/111105，实例102)或其药学上可接受的非共价衍生物(包括盐、溶剂化物、水合物、复合物、共晶体)，优选为琥珀酸衍生物例如琥珀酸共晶体(例如，晶型B，根据WO 2013/111105，第392页中的方法D制备)。
Figure BDA0003119995180000681
在一个实施例中，本发明的药物与免疫抑制疗法或造血细胞移植组合用于MDS治疗。
在一个实施例中，本发明的药物与一种或多种治疗剂组合，进一步与免疫抑制疗法或造血细胞移植组合用于MDS治疗。可以使用具有或不具有环孢霉素的抗胸腺细胞球蛋白(ATG)进行免疫抑制疗法。
在患者等待合适的造血细胞移植供体的同时，卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗可以与强化诱导化疗相组合用于符合条件进行强化诱导化疗的患者，或作为那些不符合条件进行强化诱导化疗的患者中AzaC或地西他滨的潜在组合伴侣。
在一个实施例中，本发明的药物(优选地为卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)与MBG453组合使用。
在一个实施例中，本发明的药物(优选地为卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)与卢司帕特普(luspatercept)组合使用。
在一个实施例中，本发明的药物(优选地为卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)单独用于或优选地与一种或多种治疗剂组合用于MDS的一线治疗。在一个实施例中，一种或多种治疗剂是用作一线治疗的治疗剂，其选自以下：ESA，包括红细胞生成素、依泊汀α、依泊汀β、依泊汀Ω、依泊汀δ、依泊汀ζ、依泊汀θ、达依泊汀α、甲氧基聚乙二醇-依泊汀β；G-CSF；AzaC；地西他滨；或来那度胺。在一个实施例中，一种或多种治疗剂是具有或不具有G-CSF的ESA。在一个实施例中，一种或多种治疗剂是AzaC、地西他滨或来那度胺。在一个实施例中，代替一种或多种治疗剂或除一种或多种治疗剂之外另外地给予免疫抑制疗法或造血细胞移植。
优选地，本发明的药物与一种或多种具有SoC药物的治疗剂组合使用，所述SoC药物被批准作为MDS的一线治疗，所述SoC药物是例如具有或不具有G-CSF的ESA(包括红细胞生成素、依泊汀α、依泊汀β、依泊汀Ω、依泊汀δ、依泊汀ζ、依泊汀θ、达依泊汀α、甲氧基聚乙二醇-依泊汀β)、或AzaC、地西他滨或来那度胺。
在一个实施例中，本发明的药物(优选地为卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)单独用于或优选地与一种或多种治疗剂组合用于MDS的二或三线治疗。在一个实施例中，一种或多种治疗剂是具有或不具有G-CSF的ESA+来那度胺。在一个实施例中，一种或多种治疗剂是TPO。
在一个实施例中，本发明的药物(优选地为卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)用作在使用以下各项之后的MDS的二线治疗：ESA(包括红细胞生成素、依泊汀α、依泊汀β、依泊汀Ω、依泊汀δ、依泊汀ζ、依泊汀θ、达贝泊汀α、甲氧基聚乙二醇-依泊汀β)；G-CSF；AzaC；地西他滨；来那度胺；或卢司帕特普。
在一个实施例中，本发明的药物(优选地为卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗)用作在使用卢司帕特普治疗之后的MDS的二线治疗。
贯穿本申请公开的所有用途，包括但不限于剂量和给药方案、组合、施用途径和生物标志物，均可用于治疗MDS。
在说明书中，词语“一个”和“一种”通常在说明书中被定义为“至少一个”或“一个或多个”。
术语“患者”是指人患者。
以下实例展示了上述发明；然而，这些实例并不旨在以任何方式限制本发明的范围。
实例
以下实例用于帮助理解本发明，但并不旨在且也不应解释为以任何方式限制其范围。
实例1
肿瘤来源的IL-1β诱导不同的促肿瘤转移机制
材料和方法
细胞培养
人乳腺癌MDA-MB-231-Luc2-TdTomato(卡利珀生命科学公司(Calliper LifeSciences)英国曼彻斯特)，MDA-MB-231(亲本)MCF7，T47D(欧洲权威细胞培养物保藏中心(ECACC))，MDA-MB-231-IV(Nutter等人，2014)以及骨髓HS5(ECACC)和人原代成骨细胞OB1在DMEM+10％FCS(Gibco，英杰公司(Invitrogen)，佩斯利(Paisley)，英国)中培养。所有细胞系均在5％C02的潮湿培养箱中培养，并以>20的低传代率使用。
肿瘤细胞转染
使用从感受态大肠杆菌(其已经用含有带有C端GFP标签的人IL1B或IL1R1(分别为登录号NM_000576和NM_0008777.2)的ORF质粒(定向基因技术公司(OriGene TechnologiesInc.)，罗克维尔市，马里兰州)转导)纯化的质粒DNA稳定转染人MDA-MB-231、MCF 7和T47D细胞以过表达基因IL1B或IL1R1。使用PureLinkTMHiPure质粒小量制备试剂盒(赛默飞世尔公司(ThemoFisher))进行质粒DNA纯化，并通过UV光谱对DNA进行定量，然后借助Lipofectamine II(赛默飞世尔公司)将其引入人细胞。用从没有IL-1B或IL-1R1编码序列的相同质粒分离的DNA转染对照细胞。
体外研究
在有或没有添加0-5ng/ml重组IL-1β(R&D系统公司，威斯巴登，德国)+/-50μM IL-1Ra(安进公司(Amgen)，英国剑桥)的条件下进行了体外研究。
将细胞转移到含有10％或1％FCS的新鲜培养基中。通过使用1/400mm2血细胞计数器(Hawkley，Lancing UK)每24小时手动细胞计数监测细胞增殖120小时，或者使用Xcelligence RTCA DP仪器(爱思生物科技公司(Acea Biosciences,Inc))经72小时监测细胞增殖。使用具有或不具有基底膜(20％Matrigel；英杰公司)的孔径为8μm的6mm透明孔平板(康宁公司(Corning Inc))评估肿瘤细胞的侵袭。在DMEM+1％FCS中，将肿瘤细胞以2.5x105(对于亲本和MDA-MB-231衍生物)以及5x 105(对于T47D)的密度接种到内室中，并且将补充有5％FCS的5x 105OB1成骨细胞添加到外室中。接种后24小时和48小时，将细胞从膜的顶表面移出，并通过苏木精和曙红(H&E)对已侵入孔中的细胞进行染色，然后在Leica DM7900光学显微镜上成像并手动计数。
通过分析伤口闭合来研究细胞的迁移：将细胞接种到6孔组织培养板(Costar；康宁公司)中的0.2％明胶上，一旦汇合，添加10μg/ml丝裂霉素C以抑制细胞增殖，并在单层上划痕50μm。使用CTR7000倒置显微镜和LAS-AF v2.1.1软件(莱卡应用套件；莱卡微系统公司(Leica Microsystems)，韦茨拉尔，德国)在24小时和48小时测量伤口闭合的百分比。使用Xcelligence RTCA DP仪器和RCTA软件(爱思生物科技公司)重复所有增殖、侵袭和迁移实验。
对于与人骨进行共培养研究，将5x 105MDA-MB-231或T47D细胞接种到组织培养塑料上或0.5cm3人骨盘中24小时。除去培养基，并通过ELISA分析IL-1β的浓度。为了与HS5或OB1细胞共培养，将1x 105MDA-MB-231或T47D细胞与2x 105HS5或OB1细胞一起在塑料上培养。24小时后通过FACS分选细胞，计数并裂解以分析IL-1β浓度。每24小时收集细胞、分选并计数，共120小时。
动物
在十周龄的雌性NOD SCID小鼠中进行了使用人骨移植物的实验。在IL-1β/IL-1R1过表达骨归巢实验中，使用了6至8周龄的雌性BALB/c裸鼠。为了研究IL-1β对骨微环境的影响，使用了10周龄的雌性C57BL/6小鼠(查尔斯河(Charles River)，肯特，英国)或IL-1R1-/-小鼠(Abdulaal等人，2016)。将小鼠维持在12h:12h的明/暗循环中，自由进食和饮水。根据英国谢菲尔德大学的项目许可40/3531，在英国内政部批准的情况下进行了实验。
患者同意并准备骨盘
在参加本研究之前，所有患者均提供了书面知情同意书。根据英国谢菲尔德大学肌肉骨骼生物库的HTA许可12182收集人体骨样品。使用带有精密金刚石晶圆锯片(标乐公司(Buehler))的Isomat 4000精密锯(标乐公司)，从接受髋关节置换手术的女性患者的股骨头制备小梁骨核。随后，使用骨环锯术切割直径为5mm的盘，然后将其储存在室温下的无菌PBS中。
体内研究
为了模拟人乳腺癌向人骨植入物的转移，在异氟烷麻醉下，将两个人骨盘皮下植入10周龄的雌性NOD SCID小鼠(n＝10/组)中。小鼠接受了0.003mg的vetgessic注射，并且在植入骨后将Septrin添加到饮用水中1周。将小鼠放置4周，然后在两个后乳腺脂肪垫中注射在20％Martigel/79％PBS/1％甲苯蓝中的1x 105MDA-MB-231Luc2-TdTomato、MCF7 Luc2或T47D Luc2细胞。皮下注射30mg/ml D-荧光素(英杰公司)后，每周使用IVIS(Luminol公司)系统(卡利普生命科学公司(Caliper Life Sciences))监测原发性肿瘤的生长和转移的发展。实验结束后，切除乳腺肿瘤、循环肿瘤细胞、血清和骨转移瘤。如前所述(Nutter等人，2014；Ottewell等人，2014a)，通过实时PCR对RNA进行处理以进行下游分析，然后将细胞裂解液用于蛋白质分析，并用整个组织进行组织学检查。
为了在NOD SCID小鼠中进行治疗研究，从注射肿瘤细胞后7天开始，施用安慰剂(对照)、1mg/kg IL-1Ra(阿那白滞素
Figure BDA0003119995180000731
)(每天)或10mg/kg卡那吉努单抗(每14天皮下)。在BALB/c小鼠和C57BL/6小鼠中，每天施用1mg/kg IL-1Ra持续21或31天，或者作为单一皮下注射施用10mg/kg卡那吉努单抗。随后切除肿瘤细胞、血清和骨以进行下游分析。
将5x 105MDA-MB-231GFP(对照)，MDA-MB-231-IV，MDA-MB-231-IL-1B阳性或MDA-MB-231-IL-1R1阳性细胞注射进入6至8周龄雌性BALB/c裸鼠(n＝12/组)的侧尾静脉后，研究了骨转移。每周在活体动物中通过GFP成像监测骨和肺中的肿瘤生长。注射肿瘤细胞后28天拣选小鼠，此时切除后肢、肺和血清，并进行微型计算机断层扫描成像(μCT)、骨周转标志物和循环细胞因子的组织学和ELISA分析(Holen等人，2016)。
循环肿瘤细胞的分离
将全血以10,000g离心5分钟，然后移出血清进行ELISA分析。将细胞沉淀重悬于5ml FSM裂解溶液(西格玛奥德里奇公司(Sigma-Aldrich)，普尔(Pool)，英国)中以裂解红细胞。将剩余的细胞重新沉淀，在PBS中洗涤3次，并重新悬浮在PBS/10％FCS的溶液中。收集每组10只小鼠的样品，然后使用具有来自Coherent公司I-90C持久氩离子的470nM激光线(Coherent公司，圣克拉拉，加利福尼亚州)的MoFlow高效细胞分选仪(贝克曼库尔特公司(Beckman Coulter)，英国剑桥)分离TdTomato阳性肿瘤细胞。用555LP二向色长通和580/30nm带通滤光片检测TdTomato荧光。使用Summit 4.3软件进行细胞的采集和分析。分选后，立即将细胞置于RNA保护细胞试剂(Ambion公司，佩斯利(Paisley)，伦弗鲁(Renfrew)，英国)中，并在-80℃下保存，然后提取RNA。为了计数循环肿瘤细胞的数量，使用561nm激光和YL1-A滤光片(585/16发射滤光片)检测TdTomato荧光。使用Attune NxT软件进行细胞的采集和分析。
微型计算机断层扫描成像
使用配备有X射线管(电压49kV；电流200uA)和0.5-mm铝过滤器的Skyscan 1172X射线计算机μCT扫描仪(Skyscan公司，Aartselar，比利时)进行微型计算机断层扫描(μCT)分析。像素大小设置为5.86μm，如先前所述(Ottewell等人，2008a；Ottewell等人，2008b)从胫骨近端顶部开始扫描。
骨组织学和肿瘤体积的测量
如前所述(Ottewell等人，2008a)使用莱卡RMRB立式显微镜和Osteomeasure软件(Osteometrics,Inc.，Decauter，美国)和计算机图像分析系统，在每只小鼠的三个非串行、H&E染色、5μm的脱钙胫骨组织学切片上测量骨肿瘤区域。
蛋白质印迹
使用哺乳动物细胞裂解试剂盒(西格玛奥德里奇公司，普尔(Poole)，英国)提取蛋白质。在4％-15％的预制聚丙烯酰胺凝胶(BioRad，沃特福德，英国)上运行30μg蛋白，然后将其转移到Immobilon硝化纤维素膜(Millipore公司)上。将非特异性结合用1％酪蛋白阻断(载体实验室公司(Vector Laboratories))，然后在4℃与兔抗人N-钙粘蛋白(D4R1H)单克隆抗体(1:1000稀释)、E-钙粘蛋白(24E10)(1:500稀释)或γ-连环蛋白(2303)(1:500稀释)(细胞信号转导公司(Cell signalling))或小鼠单克隆GAPDH(ab8245)(1:1000稀释)(AbCam公司，英国剑桥)孵育16小时。二抗为抗兔或抗小鼠辣根过氧化物酶(HRP；1:15,000)，并使用Supersignal化学发光检测试剂盒(Pierce)检测HRP。使用Quantity Once软件(伯乐公司(BioRad))进行条带定量，并以GAPDH标准化。
基因分析
使用RNeasy试剂盒(凯杰公司(Qiagen))提取总RNA，并使用Superscript III(英杰公司(Invitrogen AB))反转录为cDNA。IL-1B(Hs02786624)、IL-1R1(Hs00174097)、CASP(半胱天冬酶1)(Hs00354836)、IL1RN(Hs00893626)、JUP(交联斑珠蛋白/γ-连环蛋白)(Hs00984034)、N-钙粘蛋白(Hs01566408)和E-钙粘蛋白(Hs1013933)的相对mRNA表达与管家基因甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH；Hs02786624)进行比较，并使用ABI 7900PCR系统(珀金埃尔默公司(Perkin Elmer)，福斯特城，加利福尼亚州)和Taqman通用预混液(赛默飞世尔公司，英国)进行评估。通过将CT值插入Data Assist V3.01软件(应用生物系统公司(Applied Biosystems))中来分析治疗组之间基因表达的倍数变化，并且仅分析CT值≤25的基因的基因表达变化。
乳腺癌患者肿瘤中IL-1β和IL-1R1的评估
在组织微阵列(TMA)上评估了IL-1β和IL-1R1的表达，TMA包含从AZURE临床试验包括的1,300名患者获得的原发性乳腺肿瘤核心(Coleman等人，2011)。从没有转移迹象的患有II期和III期乳腺癌的患者中取得样品并预处理。随后，患者随机接受添加或不添加唑来膦酸的标准辅助疗法10年(Coleman等人，2011)。对TMA进行IL-1β(ab2105，1:200稀释，Abcam公司)和IL-1R1(ab59995，1:25稀释，Abcam公司)染色，并在组织病理学家的指导下对肿瘤细胞或相关间质中的IL-1β/IL-1R1进行盲评。然后将肿瘤或间质IL-1β或IL-1R1与疾病复发(任何部位)或特别是在骨内的疾病复发(+/-其他部位)联系起来。
IL-1β途径在人乳腺癌向人骨转移的过程中被上调。
利用自发性人乳腺癌转移至人骨植入物的小鼠模型来研究IL-1β途径在转移的不同阶段如何变化。使用此模型，与IL-1β途径相关的基因的表达水平在三阴性(MDA-MB-231)和雌激素受体阳性(ER+ve)(T47D)乳腺癌细胞中杂转移过程的每个阶段都逐步增加：与IL-1β信号传导途径相关的基因(IL-1B、IL-1R1、CASP(胱天蛋白酶1)和IL-1Ra)在体外在MDA-MB-231和T47D细胞中均以非常低的水平表达，并且这些基因的表达在体内未转移的相同细胞的原发性乳腺肿瘤中没有改变(图1a)。
与未转移的乳腺肿瘤相比，IL-1B、IL-1R1和CASP在随后转移至人骨的乳腺肿瘤中均显著增加(两种细胞系的p<0.01)，从而如针对激活的17kD IL-1β的ELISA所示激活了IL-1β信号传导(图1b；图2)。与转移性乳腺肿瘤相比，循环肿瘤细胞中的IL-1B基因表达增加(两种细胞系的p<0.01)并且在从人骨转移中分离出的肿瘤细胞中，与其相应的乳腺肿瘤相比，IL-1B(p<0.001)、IL-1R1(p<0.01)、CASP(p<0.001)和IL-1Ra(p<0.01)进一步增加，导致IL-1β蛋白进一步激活(图1；图2)。这些数据表明IL-1β信号传导既可以促进从原发部位开始转移，也可以促进骨中乳腺癌转移的发展。
肿瘤来源的IL-1β促进EMT和乳腺癌转移。
与未转移的肿瘤相比，在转移至骨的原发性肿瘤中，与肿瘤细胞粘附和上皮向间充质转化(EMT)相关的基因的表达水平发生了显著变化(图1c)。产生IL-1β过表达的细胞(MDA-MB-231-IL-1B+，T47D-IL-1B+和MCF7-IL-1B+)以研究肿瘤来源的IL-1β是否负责诱导EMT和向骨转移。所有IL-1β+细胞系均表现出EMT增加，表现出从上皮到间充质表型的形态变化(图3a)，以及E-钙粘蛋白和JUP(交联斑珠蛋白/γ-连环蛋白)的表达减少，N-钙粘蛋白基因和蛋白质的表达增加(图3b)。伤口闭合(MDA-MB-231-IL-1β+中p<0.0001(图3d)；p<0.001MCF7-IL-1β+和T47D-IL-1β+)并且与各自的对照组相比，具有增加的IL-1β信号传导的肿瘤细胞中通过基质胶向成骨细胞的迁移和侵袭增加(MDA-MB-231-IL-1β+(图3c)p<0.0001；MCF7-IL-1β+和T47D-IL-1β+p<0.001)。与非转移性乳腺癌细胞相比，在ER阳性和ER阴性乳腺癌细胞(这些细胞在体内自发转移到人骨植入物内)中IL-1β产生增加(图1)。在AZURE研究(Coleman等人，2011年)招募的II期和III期乳腺癌患者(这些患者在10年的时间段上经历癌症复发)的原发性肿瘤样品中发现了IL-1β与转移之间的相同联系。AZURE患者原发性肿瘤中的IL-1β表达与骨中的复发和任何部位复发均相关，表明这种细胞因子的存在通常可能在转移中起作用。与此相符的是，对乳腺癌细胞进行人为过表达IL-1β的基因操纵可以增加体外乳腺癌细胞的迁移和侵袭能力(图3)。
IL-1β信号传导的抑制减少了人骨骼的自发转移。
由于肿瘤来源的IL-1β似乎通过诱导EMT促进转移的发生，因此研究了用IL-1Ra(阿那白滞素)或人抗IL-1β结合抗体(卡那吉努单抗)抑制IL-1β信号传导对自发转移至人骨植入物的影响：IL-1Ra和卡那吉努单抗均可减少向人骨的转移：在10只对照小鼠中有7只在人骨植入物中检测到转移，但在用IL-1Ra治疗的10只小鼠中只有4只、在用卡那吉努单抗治疗的10只小鼠中有1只。IL-1Ra和卡那吉努单抗治疗组的骨转移也比对照组少(图4a)。用卡那吉努单抗或IL-1Ra治疗的小鼠循环中检测到的细胞数量明显低于安慰剂治疗组中检测到的细胞数量：分别用卡那吉努单抗和阿那白滞素处理的小鼠的全血中计数了仅3个肿瘤细胞/ml，相比之下，用安慰剂处理的小鼠的血液中计数108个肿瘤细胞/ml(图4b)，这表明IL-1信号传导的抑制可预防肿瘤细胞从原发部位脱落进入循环。因此，用抗IL-1β抗体卡那吉努单抗抑制IL-1β信号传导或抑制IL-1R1减少了脱落进入循环的乳腺癌细胞数量并减少了人骨植入物中的转移(图4)。
肿瘤来源的IL-1B促进乳腺癌细胞的归巢和定殖。
将乳腺癌细胞注射到小鼠的尾静脉中通常会导致肺转移，这是因为肿瘤细胞被困在了肺毛细血管中。先前已经显示，静脉内注射后优先归巢于骨微环境的乳腺癌细胞表达高水平的IL-1β，表明该细胞因子可能参与了乳腺癌细胞向骨的组织特异性归巢。在本研究中，与对照组细胞(12％)(p<0.001)细胞相比，向BALB/c裸鼠静脉注射MDA-MB-231-IL-1β+细胞导致发生骨转移的动物数量显著增加(75％)(图5a)。与对照细胞相比，MDA-MB-231-IL-1β+肿瘤引起小鼠骨中明显更大的溶骨性病变发展(p＝0.03；图5b)，并且与对照细胞相比，注射MDA-MB-231-IL-1β+细胞的小鼠中有肺转移减少的趋势(p＝0.16；图5c)。这些数据表明内源性IL-1β可以促进肿瘤细胞归巢至骨环境并在该部位的转移的发展。
肿瘤细胞与骨细胞的相互作用进一步诱导IL-1B并促进明显转移的发展。
从人乳腺癌转移至人骨植入物的小鼠模型进行的基因分析数据表明，与在原发部位或循环中的转移性细胞相比，当乳腺癌细胞在骨环境中生长时，IL-1β途径会进一步增加(图1a)。因此，研究了当肿瘤细胞与骨细胞接触时IL-1β的产生如何变化，以及IL-1β如何改变骨微环境以影响肿瘤的生长(图6)。将人乳腺癌细胞培养到全人骨段中48小时会导致IL-1β向培养基的分泌增加(对于MDA-MB-231和T47D细胞，p<0.0001；图6a)。与人HS5骨髓细胞的共培养表明，源自癌细胞(p<0.001)和骨髓细胞(p<0.001)的IL-1β浓度增加，其中源自肿瘤细胞的IL-1β增加约1000倍，并且来自HS5细胞的IL-1B增加约100倍(图6b)。
即使在过表达IL-1R1的细胞中，外源IL-1β也不增加肿瘤细胞的增殖。相反，IL-1β刺激骨髓细胞、成骨细胞和血管的增殖，进而诱导了肿瘤细胞的增殖(图6)。因此，表达高浓度IL-1β的肿瘤细胞的到来刺激转移性微环境组分的扩展，并且表达IL-1β的肿瘤细胞与成骨细胞/血管之间的接触驱动骨的肿瘤定殖。研究了外源性IL-1β以及来自肿瘤细胞的IL-1β对肿瘤细胞、成骨细胞、骨髓细胞和CD34+血管增殖的影响：HS5骨髓或OB1原代成骨细胞与乳腺癌细胞的共培养导致所有细胞类型的增殖增加(对于HS5、MDA-MB-231或T47D，P<0.001，图6c)(对于OB1、MDA-MB-231或T47D，P<0.001，图6)。肿瘤细胞、原代人骨样品、骨髓细胞或成骨细胞之间的直接接触促进IL-1β从肿瘤和骨细胞中的释放(图6)。此外，施用IL-1β增加HS5或OB1细胞的增殖，但不能增加乳腺癌细胞的增殖(图7a-7c)，这表明肿瘤细胞与骨细胞的相互作用促进IL-1β的产生，从而可以驱动微环境的扩展并刺激明显转移的形成。
还发现IL-1β信号传导对骨微血管有深远影响：通过敲除IL-1R1来防止骨中的IL-1β信号传导，用IL-1Ra药理阻断IL-1R或通过施用抗IL-1β结合抗体卡那吉努单抗降低IL-1β的循环浓度可减少肿瘤定殖的小梁骨中CD34+血管的平均长度(对于IL-1Ra和卡那吉努单抗治疗的小鼠，p<0.01)(图7c)。这些发现被内啡肽染色所证实，当IL-1β信号被破坏时，其显示出骨中减少的血管数目以及血管长度。ELISA对内皮素1和VEGF的分析表明，与对照相比，IL-1R1-/-小鼠(p<0.001内皮素1；p<0.001VEGF)和用IL-1R拮抗剂(p<0.01内皮素1；p<0.01VEGF)或卡那吉努单抗(p<0.01内皮素1；p<0.001VEGF)处理的小鼠的骨髓中的这些内皮细胞标志物的浓度都降低(图8)。这些数据表明，与肿瘤细胞-骨细胞相关的IL-1β增加和肿瘤细胞中高水平的IL-1β也可促进血管生成，进一步刺激转移。
肿瘤来源的IL-1β预测患者材料中骨和其他器官的未来乳腺癌复发
为了建立临床研究结果的相关性，研究了患者样品中IL-1β及其受体IL-1R1之间的相关性。对来自II/III期乳腺癌且无转移迹象的约1300个原发肿瘤样品(来自AZURE研究(Coleman等人，2011))进行了IL-1R1或活性形式的IL-1β(17kD)染色，对这些分子在肿瘤细胞和与肿瘤相关的间质中的表达分别进行活检。活检后对患者进行了10年的随访，并使用多变量Cox模型评估了IL-1β/IL-1R1表达与远处复发或骨复发之间的相关性。肿瘤细胞中的IL-1β与任何部位的远处复发(p＝0.0016)、仅在骨中复发(p＝0.017)或在任何时间在骨中复发(p＝0.0387)强烈相关(图9)。与在肿瘤细胞中没有IL-1β的患者相比，在肿瘤细胞中具有IL-1β且在肿瘤相关间质中具有IL-1R1的患者更有可能在未来发生远处复发(p＝0.042)，提示肿瘤来源的IL-1β不仅可以直接促进转移，而且还可以与基质中的IL-1R1相互作用以促进这一过程。因此，IL-1β是一种新型生物标志物，可用于预测乳腺癌复发的风险。
实例2
模拟针对肺癌患者的卡那吉努单抗PK谱和hsCRP谱。
基于来自CANTOS研究的数据，生成了一个模型来表征卡那吉努单抗药代动力学(PK)和hsCRP之间的关系。
本研究使用以下方法：使用一阶条件估计和交互方法进行模型构建。该模型将时间分辨hsCRP的对数描述为：
y(tij)＝y0，i+yeff(tij)
其中y0，i是稳态值并且yeff(tij)表示治疗效果，并且取决于全身暴露量。用Emax型模型描述治疗效果，
Figure BDA0003119995180000811
其中，Emax，i是高暴露量时的最大可能应答，IC50i是获得最大应答的一半时的浓度。
各个参数Emax，i和y0，i以及IC50i的对数估计为典型值之和、协变量效应covpar*covi和受试者变异性之间的正态分布。术语协变量效应covpar是指被估计的协变量效应参数，并且covi是受试者协变量i的值。基于eta图相比于协变量的检查来选择要包括的协变量。残余误差被描述为比例项和相加项的组合。
基线hsCRP的对数作为所有三个参数(Emax，i、Y0，i和IC50i)的协变量包括在内。模型中没有其他协变量。所有参数的估计精度都很高。基线hsCRP的对数对稳态值的影响小于1(等于0.67)。这表明基线hsCRP不能很好地衡量稳态值，并且稳态值暴露出相对于基线平均值的回归。基线hsCRP的对数对IC50和Emax的影响均为阴性。因此，在基线时具有高hsCRP的患者预期具有低IC50和大的最大降低。通常，模型诊断程序确认该模型很好地描述了可用的hsCRP数据。
然后将该模型用于模拟预期的hsCRP应答，以选择肺癌患者群体中的不同给药方案。自举方法(bootstrapping)应用于构建具有预期入选/排除标准的群体，这些标准代表潜在的肺癌患者群体。研究了仅通过基线hsCRP分布描述的三种不同的肺癌患者群体：所有CANTOS患者(情境1)，确诊的肺癌患者(情境2)和晚期肺癌患者(情境3)。
假设模型的群体参数和患者之间的变异性在所有三种情境下都相同。在整个CANTOS群体中观察到的hsCRP的PK/PD关系被假设为可代表肺癌患者。
目的估计数是在第3个月末hsCRP低于临界点的可能性，该临界点可能为2mg/L或1.8mg/L。CANTOS研究第3个月末时hsCRP水平的中值为1.8mg/L。基线hsCRP＞2mg/L是入选标准之一，因此值得探讨第3个月末hsCRP水平是否低于2mg/L。
针对CANTOS PK数据，建立了具有一阶吸收和消除的单室模型。该模型表示为常微分方程，RxODE用于在给定各个PK参数的情况下模拟卡那吉努单抗的浓度时程。目的皮下卡那吉努单抗剂量方案为300mg Q12W，200mg Q3W和300mg Q4W。暴露量度(包括不同选定时间段内的Cmin、Cmax、AUC以及稳态下的平均浓度Cave)衍生自模拟的浓度时间曲线。
情境1中的模拟基于以下信息：
使用RxODE模拟的单独卡那吉努单抗暴露
PD参数(其是y0，i、Emax，i和IC50i的组分)：典型值(THETA(3)、THETA(5)、THETA(6))、covpars(THETA(4)、THETA(7)、THETA(8))，和受试者间变异性(ETA(1)、ETA(2)、ETA(3))
来自所有10,059名CANTOS研究患者的基线hsCRP(基线hsCRP：平均值6.18mg/L，平均值标准误差(SEM)＝0.10mg/L)
首先通过从正态分布(其中根据群体PK/PD模型估算固定均值和标准差)中随机对1000个THETA(3)-(8)采样来生成目标估计量的预测间隔；然后针对每个THETA(3)-(8)组，自举2000PK暴露，PD参数ETA(1)-(3)和所有CANTOS患者的基线hsCRP。1000个估计值的2.5％、50％和97.5％百分位数被报告为点估计量和95％预测间隔。
情境2中的模拟基于以下信息：
使用RxODE模拟的单独卡那吉努单抗PK暴露
PD参数THETA(3)-(8)和ETA(1)-(3)
116个确诊为肺癌的CANTOS患者的基线hsCRP(基线hsCRP：平均值＝9.75mg/L，SEM＝1.14mg/L)
首先通过从正态分布(其中根据群体PKPD模型估算固定均值和标准差)中随机对1000个THETA(3)-(8)采样来生成目标估计量的预测间隔；然后针对每个THETA(3)-(8)组，从所有CANTOS患者自举2000PK暴露、PD参数ETA(1)-(3)，并从116个已确诊肺癌的CANTOS患者自举2000基线hsCRP。1000个估计值的2.5％、50％和97.5％百分位数被报告为点估计量和95％预测间隔。
在情境3中，以与情境2类似的方式获得了点估计量和95％预测间隔。唯一的区别是从晚期肺癌群体自举2000个基线hsCRP值。在晚期肺癌群体中，没有单独的基线hsCRP数据公开。晚期肺癌的可用群体水平估计值为23.94mg/L的基线hsCRP平均值，其中SEM为1.93mg/L[Vaguliene 2011]。使用此估计值，使用加性常数将平均值调整为23.94mg/L，从116个确诊肺癌的CANTOS患者衍生晚期肺癌群体。
与模型一致，模拟的卡那吉努单抗PK是线性的。图10a中显示了以6个月的自然对数标度绘制的浓度时间谱的中值和95％预测间隔。
在图10b和10c中报告了在临界点为1.8mg/L和2mg/L mhsCRP的情况下，第3个月hsCRP应答的受试者比例的1000个估计值的中值和95％预测间隔。从模拟数据来看，就第3个月的降低的hsCRP而言，200mg Q3W和300mg Q4W的表现相似，并且优于300mg Q12W(CANTOS中的最高剂量方案)。从情境1到情境3，针对更严重的肺癌患者，假设基线hsCRP水平较高，导致第3个月hsCRP低于临界点的可能性较小。图10d显示了针对三种不同剂量时hsCRP浓度中值随时间变化的情况，并且图10e显示了单一剂量后相对于基线hsCRP的减少百分比。
实例3
PDR001加卡那吉努单抗治疗增加结肠直肠肿瘤中的效应中性粒细胞。
RNA测序用于深入了解卡那吉努单抗(ACZ885)在癌症中的作用机理。CPDR001X2102和CPDR001X2103临床试验评估了斯巴达珠单抗(PDR001)结合其他疗法的安全性、耐受性和药效学。对于每位患者，在治疗之前以及治疗的第3周期都进行了肿瘤活检。简而言之，通过RNA提取、核糖体RNA消耗、文库构建和测序来处理样品。通过STAR将序列读数与hg19参考基因组和Refseq参考转录组对齐，通过HTSeq汇编基因水平计数，并通过edgeR使用M值的修整均值进行样品水平归一化。
图11显示了在用PDR001+卡那吉努单抗(ACZ885)治疗的结肠直肠肿瘤中平均增加但是在用PDR001+依维莫司(RAD001)治疗的结肠直肠肿瘤中没有平均增加的21个基因。用PDR001+卡那吉努单抗治疗增加IL1B及其受体IL1R2的RNA水平。该观察结果表明应答于IL-1β蛋白阻断，肿瘤的中靶补偿性反馈以增加IL1B RNA水平。
值得注意的是，PDR001+卡那吉努单抗情况下的中性粒细胞特异性基因增加，包括FCGR3B、CXCR2、FFAR2、OSM和G0S2(图11中的方框所示)。FCGR3B基因是CD16蛋白的中性粒细胞特异性同工型。由FCGR3B编码的蛋白质在应答于免疫复合物的反应性氧种类的分泌中起关键作用，这与效应中性粒细胞的功能一致(Fossati G 2002Arthritis Rheum[关节炎与风湿病]46：1351)。结合CXCR2的趋化因子将中性粒细胞从骨髓中转移出并且进入周围部位。另外，在用PDR001+卡那吉努单抗治疗时观察到CCL3 RNA增加。CCL3是中性粒细胞的化学引诱剂(Reichel CA 2012Blood[血液]120：880)。
总之，使用RNA-seq数据进行的这种成分贡献分析表明，PDR001+卡那吉努单抗治疗增加结肠直肠肿瘤中的效应中性粒细胞，而PDR001+依维莫司治疗情况下则未观察到这种增加。
实例4
卡那吉努单抗(ACZ885)与斯巴达珠单抗(PDR001)联合治疗癌症的功效。
患者5002-004是一名56岁的男性，最初患有IIC期、微卫星稳定、中度分化的升结肠腺癌(MSS-CRC)，于2012年六月被诊断并接受在先方案治疗。
在先治疗方案包括：
亚叶酸/5-氟尿嘧啶/奥沙利铂，在辅助情况下
卡培他滨化学放疗(转移情况)
5-氟尿嘧啶/贝伐单抗/亚叶酸/伊立替康
三氟尿苷和替吡拉西
伊立替康
奥沙利铂/5-氟尿嘧啶
5-氟尿嘧啶/贝伐单抗/四氢叶酸
5-氟尿嘧啶
在研究开始时，患者患有广泛的转移性疾病，包括多处肝和双侧肺转移，以及食管旁食管淋巴结、腹膜后和腹膜疾病。
该患者用每四周PDR001 400mg(Q4W)加每八周100mg(Q8W)ACZ885治疗。患者在治疗6个月后病情稳定，然后病情明显减轻，并在10个月时确认RECIST对治疗有部分应答。患者随后发展为进行性疾病，并且剂量增加至300mg，然后增加至600mg。
实例5
选择针对癌症患者的格沃吉珠单抗剂量的计算。
基于CANTOS试验揭示的临床有效剂量结合格沃吉珠单抗的可用PK数据，选择格沃吉珠单抗治疗具有至少部分炎症性基础的癌症的剂量，考虑以下因素
与卡那吉努单抗(约42±3.4pM的IC50)相比，格沃吉珠单抗(约2-5pM的IC50)表现出约10倍更高的病毒效价。0.3mg/kg(约20mg)Q4W的格沃吉珠单抗最高剂量表明2型糖尿病患者中hsCRP的降低可将hsCRP降低高达45％(见图12a)。
接下来，使用药理学模型探索hsCRP暴露-应答关系，并将临床数据外推至更高范围。由于临床数据显示hsCRP浓度与格沃吉珠单抗浓度(均在对数空间中)之间呈线性相关，因此使用了线性模型。结果示于图12b中。基于该模拟，在10000ng/mL和25000ng/mL之间的格沃吉珠单抗浓度是最佳的，因为hsCRP在此范围内大大降低，而当格沃吉珠单抗浓度高于15000ng/mL时，仅有减少的获益。但是，由于hsCRP已在该范围内显著降低，因此预计在4000ng/mL至10000ng/mL之间的格沃吉珠单抗浓度是有效的。
临床数据表明，在皮下施用后，格沃吉珠单抗的药代动力学遵循具有一级吸收的线性二室模型。皮下施用时，格沃吉珠单抗的生物利用度约为56％。针对每四周100mg(参见图12c)和每四周200mg(参见图12d)进行多剂量格沃吉珠单抗(SC)模拟。模拟表明，每四周给予100mg格沃吉珠单抗的谷浓度约为10700ng/mL。格沃吉珠单抗的半衰期约为35天。每四周给予200mg格沃吉珠单抗的谷浓度约为21500ng/mL。
实例6
关于抗IL-1β治疗效果的临床前数据。
卡那吉努单抗是一种抗IL-1β的人IgG1抗体，由于它不会与小鼠IL-1β交叉反应，因此无法在癌症小鼠模型中直接进行评估。已经开发了小鼠替代抗IL-1β抗体，并将其用于评估阻断IL-1β在癌症小鼠模型中的作用。替代抗体的同种型是IgG2a，与人IgG1密切相关。
在结肠癌的MC38小鼠模型中，在一个剂量的抗IL-1β抗体后即可看到肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)的调节(图13a-13c)。将MC38肿瘤皮下植入C57BL/6小鼠的侧腹，当肿瘤在100-150mm3之间时，用一个剂量的同种型抗体或抗IL-1β抗体治疗小鼠。然后在该剂量五天后收获肿瘤并进行处理以获得免疫细胞的单细胞悬浮液。然后将细胞离体染色并通过流式细胞仪分析。单一剂量的IL-1β阻断抗体后，浸润肿瘤的CD4+T细胞增加，而CD8+T细胞也略有增加(图13a)。CD8+T细胞的增加很小，但可能暗示了在肿瘤微环境中更为活跃的免疫应答，联合治疗可能会增强这种免疫应答。CD4+T细胞可进一步细分为FoxP3+调节性T细胞(Treg)，并且在阻断IL-1β后该亚群减少(图13b)。在髓样细胞群中，IL-1β的阻断导致中性粒细胞和巨噬细胞M2亚群TAM2减少(图13c)。中性粒细胞和M2巨噬细胞均可以抑制其他免疫细胞，例如激活的T细胞(Pillay等人，2013；Hao等人，2013；Oishi等人2016)。两者合计，IL-1β阻断后MC38肿瘤微环境中Treg、中性粒细胞和M2巨噬细胞的减少表明肿瘤微环境变得免疫抑制性减弱。
在肺癌的LL2小鼠模型中，在一个剂量的抗IL-1β抗体后，可以看到微环境免疫抑制性减弱的相似趋势(图13d-13f)。将LL2肿瘤皮下植入C57BL/6小鼠的侧腹，当肿瘤在100-150mm3之间时，用一个剂量的同种型抗体或抗-IL-1β抗体治疗小鼠。然后在该剂量五天后收获肿瘤并进行处理以获得免疫细胞的单细胞悬浮液。然后将细胞离体染色并通过流式细胞仪分析。如通过FoxP3和Helios的表达评估，Treg群体减少(图13d)。FoxP3和Helios均被用作调节性T细胞的标志物，而它们可定义Treg的不同亚群(Thornton等人，2016)。与MC38模型相似，IL-1β阻断后中性粒细胞和M2巨噬细胞(TAM2)均减少(图13e)。除此之外，在该模型中，还评估了抗体治疗后骨髓来源的抑制细胞(MDSC)群体的变化。抗IL-1β治疗后，发现粒细胞或多形核(PMN)MDSC数量减少(图13f)。MDSC是髓样来源的混合细胞群体，可以通过多种机制(包括精氨酸酶产生，活性氧种类(ROS)和一氧化氮(NO)释放)主动抑制T细胞应答(Kumar等人，2016；Umansky等人，2016)。同样，IL-1β阻断后LL2模型中Treg、中性粒细胞、M2巨噬细胞和PMN MDSC的减少表明肿瘤微环境变得免疫抑制性减弱。
一个剂量的小鼠替代抗IL-1β抗体后，4T1三阴性乳腺癌模型中的TIL也显示出微环境免疫抑制性减弱的趋势(图13g-13j)。将4T1肿瘤皮下植入Balb/c小鼠侧腹，当肿瘤在100-150mm3之间时，用同种型抗体或抗IL-1β抗体治疗小鼠。然后在该剂量五天后收获肿瘤并进行处理以获得免疫细胞的单细胞悬浮液。然后将细胞离体染色并通过流式细胞仪分析。单一剂量的抗IL-1β抗体后，CD4+T细胞减少(图13g)，而在CD4+T细胞群体中，FoxP3+Treg减少(图13h)。此外，在治疗荷瘤小鼠后，TAM2和中性粒细胞数量均减少(图13i)。所有这些数据再次证明，在4T1乳腺癌小鼠模型中IL-1β的阻断会导致免疫抑制性减弱的微环境。除此之外，在该模型中，还对抗体治疗后的MDSC群体进行了评估。抗IL-1β治疗后，粒细胞(PMN)MDSC和单核MDSC均减少(图13j)。这些发现与Treg、M2巨噬细胞和中性粒细胞群体的变化相结合，描述了4T1肿瘤模型中免疫抑制性肿瘤微环境的减少。
尽管这些数据来自结肠癌、肺癌和乳腺癌模型，但可以将数据外推到其他类型的癌症。即使这些模型与相同类型的人癌症不完全相关，但MC38模型尤其是超突变/MSI(微卫星不稳定)结肠直肠癌(CRC)的良好替代模型。根据MC38细胞系的转录组学特征，该细胞系中的四个驱动子突变对应于人CRC中的已知热点，尽管它们位于不同的位置(Efremova等人，2018)。尽管这不能使MC38小鼠模型与人CRC相同，但这确实意味着MC38可能是人MSICRC的相关模型。通常，由于小鼠相比于人在癌症起源方面的遗传差异，小鼠模型并不总是与人中相同类型的癌症相关。但是，在检查浸润的免疫细胞时，癌症的类型并不总是很重要，因为免疫细胞更加重要。在这种情况下，由于三种不同的小鼠模型显示出肿瘤抑制性微环境的相似减少，因此阻断IL-1β似乎导致了抑制性减弱的肿瘤微环境。与多种同基因小鼠肿瘤模型中的同种型对照相比，多种细胞类型(Treg，TAM，中性粒细胞)免疫抑制变化的程度有所降低，这是在癌症小鼠模型中IL-1β阻断的新发现。尽管以前已经发现抑制细胞的减少，但是每种模型中的多种细胞类型是一个新颖的发现。此外，在IL-1β的下游可以看到4T1和路易斯肺癌(LL2)模型中MDSC群体的变化，但是在LL2模型中发现IL-1β的阻断可以导致MDSC的减少对这项研究和卡那吉努单抗的小鼠替代品的是一个新发现(Elkabets等人，2010)。
即使这些模型与相同类型的人癌症不完全相关，但MC38模型尤其是超突变/MSI(微卫星不稳定)结肠直肠癌(CRC)的良好替代模型。根据MC38细胞系的转录组学特征，该细胞系中的四个驱动子突变对应于人CRC中的已知热点，尽管它们位于不同的位置(Efremova等人，2018)。尽管这不能使MC38小鼠模型与人CRC相同，但这确实意味着MC38可能是人MSICRC的相关模型(Efremova M,等人Nature Communications[自然通讯]2018；9:32)
实例7
卡那吉努单抗与抗PD-1(兰洛利珠单抗)组合治疗癌症的功效的临床前数据。
设计了一项初步研究，以评估卡那吉努单抗作为单一疗法或与抗PD-1(兰洛利珠单抗)组合使用对肿瘤生长和肿瘤微环境的影响。通过将人肺癌细胞系H358(KRAS突变体)皮下注射到BLT小鼠异种移植模型中来创建人NSCLC异种移植模型。
如图14所示，H358(KRAS突变体)模型是一个生长非常快速并且具有侵袭性的模型。在该模型中，卡那吉努单抗和兰洛利珠单抗的组合治疗(以紫色显示)导致比卡那吉努单抗单一药剂组(以红色显示)和兰洛利珠单抗单一药剂治疗(以绿色显示)更大的减小，与载体组相比，观察到的肿瘤平均体积减小了50％。
实例8
卡那吉努单抗与多西他赛组合治疗癌症的临床前数据。
在侵袭性肺部模型(LL2)中抗IL-1β与多西他赛组合使用的研究中，观察到单独使用抗IL-1β以及单独使用多西他赛的适度功效。与单独使用组或对照组相比，所述组合使用组的功效增强(图15A)。首次剂量后5天在PD时间点单独或组合使用抗IL-1β可以观察到免疫抑制细胞的减少，特别是在IL-1β抑制后肿瘤中的调节性T细胞和抑制性小鼠骨髓细胞(包括嗜中性粒细胞、单核细胞和MDSC)中(图15B-E)。这些数据支持所提出的IL-1β抑制作用机制可以在体内得到证实，并且还观察到了抗IL-1β单一疗法的一些功效。
实例9
用01BSUR和多西他赛治疗4T1肿瘤导致肿瘤微环境的改变。
在右胁皮下植入4T1肿瘤的雌性Balb/c小鼠，在肿瘤植入后的8天和15天，当肿瘤达到约100mm3时，用同种型抗体、多西他赛、01BSUR或多西他赛与01BSUR的组合进行治疗。01BSUR是小鼠替代抗体，因为卡那吉努单抗不与鼠IL-1β发生交叉反应。01BSUR属于小鼠IgG2a子类，与卡那吉努单抗所属的人IgG1子类相对应。首次剂量后5天，收获肿瘤并分析浸润免疫细胞群的变化。在第二剂量后4天，在所述研究结束时再次进行此操作。
肿瘤负荷
与载体/同种型对照相比，在01BSUR抗IL-1β单独治疗组中观察到肿瘤生长略有减慢。在单一药剂多西他赛组中这种延迟增加。组合组显示出与多西他赛单独组相似的生长减慢(图16)。
单一剂量多西他赛和01BSUR后4T1肿瘤的TIL分析—髓细胞图
单独使用多西他赛或与01BSUR组合使用进行单一治疗后，4T1肿瘤中的中性粒细胞减少。与多西他赛单一药剂组相比，所述组合组显示出中性粒细胞数量更大的减少。单一药剂01BSUR导致4T1肿瘤中的中性粒细胞略有增加，尽管与对照组相比这不是显著变化。与载体/同种型组相比，每种处理均导致单核细胞减少。与多西他赛单独组相比，单一药剂01BSUR治疗导致单核细胞更大的减少。此外，与对照组相比，所述组合显示出单核细胞甚至更大的减少(P＝0.0481)(图17)。在粒细胞和单核细胞髓源性抑制细胞(MDSC)中观察到与粒细胞和单核细胞相似的趋势。单独使用多西他赛和与01BSUR组合使用都会降低粒细胞MDSC。所有治疗均导致单核细胞MDSC降低，与任一单一药剂相比，所述组合导致更大的降低(图18)。
第二剂量多西他赛和01BSUR后的4T1肿瘤的TIL分析
第二剂量多西他赛和01BSUR后四天，分析4T1肿瘤的免疫细胞浸润。确定表达TIM-3的CD4+和CD8+T细胞的百分比。与对照组相比，单独使用多西他赛不引起表达TIM-3的细胞的变化，而单独使用01BSUR或与多西他赛组合使用治疗后，表达TIM-3的细胞减少。与对照组相比，对于CD4+T细胞，所述组合组似乎显示出比单一药剂01BSUR组中的表达TIM-3的细胞的略微更大的减少(P＝0.0063)(图19)。在细胞的Treg亚组中观察到相似的趋势，与对照相比，所述组合组显示出表达TIM-3的细胞的最大水平的减少(P＝0.0064)(图20)。
结论与讨论
已经显示，阻断IL-1β是改变自身免疫病炎性微环境的有效方法。ACZ885(卡那吉努单抗)在治疗一些炎性自身免疫病(例如CAPS(Cryopyrin蛋白相关的周期性综合征))方面非常有效。由于许多肿瘤具有炎性微环境，正在研究阻断IL-1β以确定其单独或与药剂(所述药剂可阻断PD-1/PD-L1轴)或标准护理化疗剂(例如多西他赛)组合使用对肿瘤微环境的影响。通过临床前实验和CANTOS试验表明，IL-1β的阻断可对肿瘤的生长和发展产生影响。但是，CANTOS试验(动脉粥样硬化试验)，在患者的预防性情况中对此进行评估，所述患者在登记时没有已知的或可检测出的癌症。患有已建立的肿瘤或转移瘤的患者对IL-1β阻断可能具有不同的应答水平。
这些研究01BSUR(一种ACZ885的小鼠替代物)与多西他赛组合的初步结果表明，在LL2和4T1肿瘤模型中，这种组合可能对肿瘤的生长产生影响。
本文描述的研究仅在单一治疗(1D2和01BSUR组合)后或每一治疗两个剂量(01BSUR和多西他赛)后检查TIL。总体趋势暗示，在LL2和4T1肿瘤中的TME的抑制性质发生了变化。
尽管这些肿瘤的TME中的总体CD4+和CD8+T细胞没有一致的变化，但这些肿瘤中的Treg却有减少的趋势。另外，所述Treg典型地也显示出表达TIM-3的细胞的百分比降低。表达TIM-3的Treg可能比不表达TIM-3的Treg更有效地抑制T细胞[Sakuishi，2013]。在一些所述的研究中，所有T细胞上的TIM-3总体下降。尽管目前尚不清楚这些物质对这些细胞的影响，但TIM-3是一个检验点，并且这些细胞可能比表达TIM-3的T细胞活化程度更高。但是，需要进一步的工作来理解这些变化，因为观察到的一些T细胞变化可能暗示一种疗效不如对照组的疗法。
尽管T细胞构成了这些肿瘤中免疫细胞浸润的一部分，但大部分浸润细胞是髓样细胞。还分析了这些细胞的变化，并且IL-1β阻断始终导致肿瘤中的中性粒细胞和粒细胞MDSC的数量减少。这些通常伴有减少的单核细胞和单核细胞MDSC；但是，这些群的变异性更大。中性粒细胞既产生IL-1β又对IL-1β产生应答，而MDSC的生成通常取决于IL-1β，并且这两个细胞亚群都可以抑制其它免疫细胞的功能。中性粒细胞和MDSC的减少与Treg的减少相结合可能意味着在IL-1β阻断后，所述肿瘤微环境的免疫抑制作用减弱。更低的抑制性TME可能导致更好的抗肿瘤免疫应答，尤其是在检验点阻断的情况下。
这些数据加在一起显示，同时阻断IL-1β和PD-1/PD-L1轴可能导致更具免疫活性的肿瘤微环境，或者将IL-1β阻断与化疗组合可能具有类似的影响。
实例10
确定对IL-1β抗体的免疫原性/致敏性
在CANTOS试验期间，在基线、12个月、24个月和研究随访结束时收集用于免疫原性评估的血液样品。使用桥连免疫原性电化学发光免疫测定(ECLIA)分析免疫原性。样品用乙酸预处理，并在含有标记的药物(生物素化的ACZ885和磺基-TAG(钌)标记的ACZ885)的缓冲液中中和。抗卡那吉努单抗抗体(抗药物抗体)通过生物素化和磺基-TAG标记形式的ACZ885的组合捕获。随后通过在Mesoscale Discovery链霉亲和素(MSD)板上捕获复合物通过电化学发光来检测复合物的形成。
治疗时产生的抗卡那吉努单抗抗体(抗药物抗体)在所有治疗组的低和类似比例的患者中都检测到(在卡那吉努单抗300mg、150mg和安慰剂组中分别为0.3％、0.4％和0.5％)，并且不与免疫原性相关的AE或改变的hsCRP应答相关。
实例11
来自CANTOS试验的患有胃食管癌、结直肠癌和胰腺癌的患者的生物标志物分析被分组为GI组。患有膀胱癌、肾细胞癌和前列腺癌的患者被分组为GU组。在所述组内，将患者根据其基线IL-6或CRP水平进一步分为中值以上组和中值以下组。至癌症事件的时间的平均值和中值如下表所示进行计算。
似乎有这样一种趋势，即CRP和IL-6水平低于中值的患者组通常有更长的时间发展为癌症。根据IL-6分析，这种趋势似乎比CRP更强，可能是由于IL-6直接位于IL-1b的下游，在该处CTP远离IL-1b信号传导，因此可能也受到其它因素的影响。
表12
Figure BDA0003119995180000931
表13
Figure BDA0003119995180000941
实例12
Figure BDA0003119995180000942
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Figure BDA0003119995180000981
实例13
在突发性贫血中的卡那吉努单抗-CANTOS试验
在随机化的10,061名参与者中，基线贫血(女性的血红蛋白低于12g/dL，男性的血红蛋白低于13g/dL)在417名女性和899名男性中存在，而4名参与者没有基线血红蛋白的测量。因此，该分析包括8,741名CANTOS参与者。在随机化和试验期间(基线，随机化后3、6、9、12、18、24、30、36、42、48、54和60个月)，从卡那吉努单抗组和安慰剂组的所有试验参与者中获取血液样品。所有样品均接受了标准的血液学评估，包括血红蛋白、血细胞比容、红细胞计数、差异性白细胞计数和血小板计数。随访的CBC允许评估突发性贫血，其前瞻性定义为试验登记时，具有正常血红蛋白的个体中男性的血红蛋白<13g/dl，女性的血红蛋白<12g/dl。
使用针对分类变量的卡方分析，比较安慰剂组或积极治疗组之间可能导致贫血的基线临床特征分布(例如年龄、肾功能、hsCRP、饮酒、糖尿病和高血压)。对于连续变量，对于多组比较进行Kruskal-Wallis检验，对于安慰剂组与有效治疗组之间的两组比较进行Wilcoxon秩和检验。基于预先指定的方案，指数心肌梗死后按时间分层的单变量和调整的Cox比例危险模型和试验部分被用于评估与分配给安慰剂的组相比，三个卡那吉努单抗组(50mg、150mg和300mg)的易发性贫血的相对危险度。在这些组中计算了趋势检验的P值。与卡那吉努单抗剂量成比例的0、1、3和6得分用于趋势分析。构建Kaplan-Meier曲线以直观地评估组之间的任何差异。对于CANTOS方案中针对试验性主要心血管终点预先指定的并行治疗应答分析，进行了类似的分析，以确定单个参与者在单一剂量安慰剂或卡那吉努单抗后所达到的抗炎应答强度是否与易发性贫血相关。根据hsCRP水平在三个月时低于2mg/L(强应答者)或者在三个月时高于2mg/L(弱应答者)，该分析将卡那吉努单抗治疗的参与者分为两组。该时间点对应于卡那吉努单抗第二剂量之前、首次剂量之后的谷值。进行了其它亚组分析，以评估与贫血和慢性炎症相关的因素，包括年龄和肾脏功能。所有分析均按意向进行治疗。所有p值都是双向的，并且所有置信区间均以95％的水平计算。
在基线时无贫血的8,741名CANTOS参与者每3个月随机地接受皮下施用的安慰剂或50mg、150mg或300mg的卡那吉努单抗。根据基线hsCRP的评估(表1)，这些组具有非常匹配的基线临床特征，包括那些易患贫血的特征，例如年龄、肾脏功能和潜在的炎症。与在基线时无贫血的参与者相比，患有贫血的参与者(未纳入二次分析的参与者)年龄显著更大，更有可能是女性，并且具有更高的合并症负担(更高的高血压和2型糖尿病的发生率))、降低的GFR和更高水平的hsCRP(表1)。
表1.没有基线贫血的和针对基线贫血排除的试验参与者的基线临床特征
Figure BDA0003119995180001001
连续数据报告为中值(IQR)，二分数据报告为n(％)。注意到基线时组间的显著性。hsCRP＝高敏感性C反应蛋白。GFR＝肾小球滤过率。
对于基线时有贫血的参与者与基线时没有贫血的参与者的比较，*P<0.05。
hsCRP的基线水平与易发性贫血有关。具体来说，在hsCRP水平最低(<3.1mg/L)、中等和最高(>5.45mg/L)滴度的那些中，每100人年的贫血发生率分别为5.63、6.55和7.91(跨三分位数的P趋势<0.0001)。
与安慰剂相比，分配给任何剂量的卡那吉努单抗的参与者与安慰剂相比(HR＝0.84，95％CI 0.77-0.93，p<0.0001)在整个过程中(图21)易发性贫血在统计学上显著降低(男性的血红蛋白<13g/dL，女性的<12g/dL)。降低与剂量无关：对于50mg组(N＝1907)，与安慰剂相比，易发性贫血的危险比为0.83(95％CI 0.73-0.94，P＝0.004)。对于150mg组(N＝1987)，与安慰剂相比，易发性贫血的危险比为0.84(95％CI 0.74-0.95，P＝0.006)。对于300mg组(N＝1941)，与安慰剂相比，易发性贫血的危险比为0.85(95％CI 0.75-0.96，P＝0.008)。每100人年的贫血发生率在安慰剂组中是7.49，在50mg组中是6.17，在150mg组中是6.33，在300mg组中是6.34，在卡那吉努单抗的所有活性剂量中均是6.28(对于活性剂量组与安慰剂相比的趋势，p＝0.014)。对卡那吉努单抗组合剂量与安慰剂的比较分析表明，在首次剂量的卡那吉努单抗后在治疗中hsCRP水平低于2mg/L的那些患者中，易发性贫血的发生率显著降低(HR＝0.78，95％CI 0.70-0.87，p<0.0001)。相比之下，治疗中hsCRP≥2mg/L的个体的易发性贫血发生率与安慰剂组相似(HR1.01，95％CI 0.91-1.13，p＝0.82)。具体而言，在开始卡那吉努单抗后三个月hsCRP<2mg/L的那些中，与安慰剂相比，针对贫血HR对于50mg组是0.67(95％CI 0.56-0.81，p<0.0001)，对于150mg组是0.78(95％CI 0.67-0.91，p＝0.002)，对于300mg组是0.76(95％CI 0.65-0.88，p<0.0001)。相比之下，三个月时hsCRP≥2mg/L的受试者与安慰剂相比针对贫血的HR对于50mg组是0.97(95％CI 0.84-1.13,p＝0.699)，对于150mg组是0.89(95％CI 0.76-1.05,p＝0.171)，并且对于300mg组是1.05(95％CI 0.88-1.25,p＝0.570)。值得注意的是，相比65岁以下的患者(HR＝0.88，95％CI0.78-1.00，p＝0.056)，卡那吉努单抗在65岁以上的患者(HR＝0.78，95％CI 0.68-0.89，p<0.0001)中减少易发性贫血的作用更大(图22)。具体而言，在65岁或年龄更大的参与者中，与安慰剂相比，与卡那吉努单抗相关的针对贫血的HR对于50mg组是0.80(95％CI 0.66-0.96,p＝0.017)，对于150mg组是0.73(95％CI0.61-0.88,p＝0.001)，并且对于300mg组是0.80(95％CI 0.67-0.96,p＝0.018)(表2)。
表2.在三个月时通过高敏感性CRP分层的易发性贫血的风险。a
Figure BDA0003119995180001021
a发生率是每100人年(有事件的参与者数量)。将针对趋势的p值和针对所有剂量的组合的p值与安慰剂进行比较。CI代表置信区间，hsCRP代表高敏感性C反应蛋白。
还可以预料，与eGFR大于或等于60ml/min/1.73m2的参与者相比，eGFR小于60mL/min/1.73m2的参与者的贫血发生率更高。贫血的发生率在eGFR小于60mL/min/1.73m2的参与者中对于安慰剂和所有剂量的卡那吉努单抗分别为14.55和11.24/100人年并且在eGFR大于或等于60mL/min/1.73m2的参与者中对于安慰剂和所有剂量的卡那吉努单抗为6.43和5.47/100人年(表3)。对于eGFR小于60mL/min/1.73m2的参与者和对于eGFR大于或等于60mL/min/1.73m2的那些，所有剂量的卡那吉努单抗和安慰剂相比，卡那吉努单抗治疗与易发性贫血的显著降低相关。对于卡那吉努单抗的所有组，与安慰剂相比，针对贫血的HR对于eGFR小于60mL/min/1.73m2的参与者是0.78(95％CI 0.65-0.94，p＝0.009)，以及是0.85(95％CI 0.77-0.95，p＝0.005)(表3)。
表3.通过基线eGFR分层的易发性贫血的风险a
Figure BDA0003119995180001031
a发生率是每100人年(有事件的参与者数量)。将针对趋势的p值和针对所有剂量的组合的p值与安慰剂进行比较。CI代表置信区间。
这些数据对于使用IL-1β结合抗体(例如卡那吉努单抗)作为辅助疗法治疗贫血(如炎症性贫血)具有实际意义。
Figure IDA0003119995230000011
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Claims (53)

1.一种IL-1β结合抗体或其功能片段，所述IL-1β结合抗体或其功能片段用于在患者中治疗和/或预防骨髓增生异常综合征(MDS)中使用。
2.一种IL-1β结合抗体或其功能片段，所述IL-1β结合抗体或其功能片段用于在患者中预防由在前MDS引起的继发性急性髓性白血病(AML)中使用。
3.用于根据权利要求1或2所述使用的IL-1β结合抗体或其功能片段，其中MDS至少具有部分炎症基础。
4.一种IL-1β结合抗体或其功能片段，所述IL-1β结合抗体或其功能片段用于在患者中治疗MDS中使用，其中所述IL-1β结合抗体或其功能片段以每次治疗约30mg至约200mg的剂量或约30mg至约300mg的剂量施用。
5.根据前述权利要求中任一项所述的用途，其中在首次施用所述IL-1β结合抗体或其功能片段之前，所述患者具有等于或大于约2mg/L的高敏感性C反应蛋白(hsCRP)。
6.根据前述权利要求中任一项所述的用途，其中在首次施用所述IL-1β结合抗体或其功能片段之前，所述患者具有等于或大于约4mg/L或等于或大于约10mg/L的高敏感性C反应蛋白(hsCRP)。
7.根据前述权利要求中任一项所述的用途，其中在首次施用所述IL-1β结合抗体或其功能片段后至少约3个月评估的所述患者的高敏感性C反应蛋白(hsCRP)水平已降至低于约5mg/L、约3.5mg/L、约2.3mg/L，优选降低至低于约2mg/L，优选降低至低于约1.8mg/L。
8.根据前述权利要求中任一项所述的用途，其中与基线相比，在首次施用所述IL-1β结合抗体或其功能片段后至少约3个月评估的所述患者的高敏感性C反应蛋白(hsCRP)水平降低至少约20％。
9.根据前述权利要求中任一项所述的用途，其中与基线相比，在首次施用所述IL-1β结合抗体或其功能片段后至少约3个月评估的所述患者的白细胞介素-6(IL-6)水平降低至少约20％。
10.根据前述权利要求中任一项所述的用途，其中所述用途包括约每三周或约每四周(每月)施用所述IL-1β结合抗体或其功能片段。
11.根据前述权利要求中任一项所述的用途，其中所述IL-1β结合抗体是卡那吉努单抗。
12.根据前述权利要求中任一项所述的用途，所述用途包括每次治疗向所述患者施用约200mg、约250mg或约300mg的卡那吉努单抗。
13.根据权利要求11-12中任一项所述的用途，其中卡那吉努单抗约每三周施用。
14.根据权利要求11-12中任一项所述的用途，其中卡那吉努单抗约每四周(每月)施用。
15.根据权利要求11-14中任一项所述的用途，其中卡那吉努单抗皮下施用。
16.卡那吉努单抗，其用于在需要其的患者中治疗MDS，其中所述用途包括约每三周或约每四周皮下施用约200mg剂量的卡那吉努单抗，或约每三周或约每四周皮下施用约250mg剂量的卡那吉努单抗。
17.根据权利要求1-10中任一项所述的用途，其中所述IL-1β结合抗体是格沃吉珠单抗。
18.根据权利要求17所述的用途，其中所述用途包括每次治疗向所述患者施用约30mg至约120mg格沃吉珠单抗。
19.根据权利要求17所述的用途，所述用途包括每次治疗向所述患者施用约30mg的格沃吉珠单抗。
20.根据权利要求17所述的用途，所述用途包括每次治疗向所述患者施用约60mg的格沃吉珠单抗。
21.根据权利要求17所述的用途，所述用途包括每次治疗向所述患者施用约120mg的格沃吉珠单抗。
22.根据权利要求17-21中任一项所述的用途，其中格沃吉珠单抗约每三周施用。
23.根据权利要求17-21中任一项所述的用途，其中格沃吉珠单抗约每四周(每月)施用。
24.根据权利要求17-23中任一项所述的用途，其中格沃吉珠单抗皮下施用。
25.根据权利要求17-23中任一项所述的用途，其中格沃吉珠单抗静脉内施用。
26.格沃吉珠单抗，用于在患者中治疗MDS，其中所述用途包括约每四周(每月)静脉内施用约30mg至约120mg剂量的格沃吉珠单抗。
27.根据前述权利要求中任一项所述的用途，其中所述IL-1β结合抗体或其功能片段与一种或多种治疗剂，例如化疗剂组合施用，其中优选地，所述IL-1β结合抗体或其功能片段是卡那吉努单抗或格沃吉珠单抗。
28.根据权利要求27所述的用途，其中所述一种或多种治疗剂，例如化疗剂是MDS的标准护理剂。
29.根据权利要求27-28中任一项所述的用途，其中所述一种或多种治疗剂选自由以下组成的组：红细胞生成刺激剂(ESA)，包括红细胞生成素、依泊汀α、依泊汀β、依泊汀Ω、依泊汀δ、依泊汀ζ、依泊汀θ、达依泊汀α，甲氧基聚乙二醇-依泊汀β；粒细胞集落刺激因子(G-CSF)；来那度胺；阿扎胞苷(AzaC)；地西他滨；阿培利司；或血小板生成素受体激动剂(TPO)，包括阿伐琼珀、艾曲泊帕、卢舒琼珀、promegapoietin、罗米司亭、和血小板生成素。
30.根据权利要求27-28中任一项所述的用途，其中所述一种或多种治疗剂是PD-1抑制剂或PD-L1抑制剂，所述PD-1抑制剂或PD-L1抑制剂优选选自由以下组成的组：纳武单抗、兰洛利珠单抗、阿特利珠单抗、度伐鲁单抗、阿维鲁单抗和斯巴达珠单抗(PDR-001)。
31.根据前述权利要求中任一项所述的用途，其中所述IL-1β结合抗体或其功能片段单独地或优选组合地施用，作为MDS的一线、二线或三线治疗。
32.一种IL-1β结合抗体或其功能片段，所述IL-1β结合抗体或其功能片段用于预防患者的MDS，其中所述患者的高敏感性C反应蛋白(hsCRP)水平等于或大于约2mg/L，或等于或大于约4mg/L。
33.根据权利要求32所述的用途，其中所述IL-1β结合抗体或其功能片段是卡那吉努单抗或其功能片段或格沃吉珠单抗或其功能片段。
34.根据前述权利要求中任一项所述的用途，其中约每3周或约每4周向所述患者施用治疗有效量的IL-1β结合抗体或其功能片段，持续至少约13个月。
35.根据前述权利要求中任一项所述的用途，其中所述患者的癌症死亡率的危险比降低至少约10％。
36.根据前述权利要求中任一项所述的用途，其中所述患者具有至少3个月的无进展生存期(PFS)。
37.根据前述权利要求中任一项所述的用途，其中所述患者的PFS比标准护理治疗至少长约3个月无进展生存期(PFS)。
38.根据前述权利要求中任一项所述的用途，其中所述患者具有至少3个月的总生存期(OS)。
39.根据前述权利要求中任一项所述的用途，其中所述患者的总生存期(OS)比标准护理治疗长至少3个月。
40.根据前述权利要求中任一项所述的用途，其中所述患者没有发生严重感染的高风险。
41.根据前述权利要求中任一项所述的用途，其中所述IL-1β结合抗体或其功能片段不与TNF抑制剂组合施用。
42.根据前述权利要求中任一项所述的用途，其中所述患者具有至少约3个月的无病生存期(DFS)。
43.根据前述权利要求中任一项所述的用途，其中所述IL-1β结合抗体或其功能片段是卡那吉努单抗，其中患者产生抗卡那吉努单抗抗体的可能性小于约1％。
44.根据前述权利要求中任一项所述的用途，其中使用自动注射器将治疗有效量的IL-1β结合抗体或其功能片段施用给所述患者。
45.一种药物组合物，所述药物组合物包含治疗有效量的IL-1β结合抗体或其功能片段，例如卡那吉努单抗，例如格沃吉珠单抗，所述药物组合物装载在自动注射器中，其中约200mg或250mg的卡那吉努单抗装载在自动注射器中。
46.一种在有需要的受试者中治疗MDS的方法，所述方法包括向所述受试者施用治疗有效量的IL-1β结合抗体或其功能片段与治疗有效量的TIM-3结合抗体或其功能片段组合。
47.根据权利要求46所述的方法，其中所述MDS是低风险的MDS。
48.根据权利要求46或47中任一项所述的方法，其中所述IL-1β结合抗体或其功能片段是卡那吉努单抗或其功能片段或格沃吉珠单抗或其功能片段。
49.根据权利要求46至48中任一项所述的方法，其中所述TIM-3结合抗体是MBG453或其功能片段。
50.根据权利要求46至49中任一项所述的方法，其中所述IL-1β结合抗体或其功能片段是卡那吉努单抗或其功能片段，并且TIM-3抗体是MBG453或其功能片段。
51.根据权利要求50所述的方法，其中卡那吉努单抗或其功能片段以约每3周约200mg，或约每4周约250mg给药，并且MBG453或其功能片段以约每3周约600mg，或约每4周约800mg给药。
52.一种在有需要的患者中治疗IPSS-R定义的低风险MDS的方法，所述方法包括施用每3周200mg剂量的卡那吉努单抗与每3周600mg剂量的MBG453组合，或施用每4周250mg剂量的卡那吉努单抗与每4周800mg剂量的MBG453组合。
53.一种IL-1β结合抗体或其功能片段，所述IL-1β结合抗体或其功能片段用于在个体中预防因在前的可能性不明的克隆性造血(CHIP)引起的骨髓增生异常综合征(MDS)。
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