CN111194306A - 用于制备kdm1a抑制剂的方法和过程 - Google Patents
用于制备kdm1a抑制剂的方法和过程 Download PDFInfo
- Publication number
- CN111194306A CN111194306A CN201780059523.5A CN201780059523A CN111194306A CN 111194306 A CN111194306 A CN 111194306A CN 201780059523 A CN201780059523 A CN 201780059523A CN 111194306 A CN111194306 A CN 111194306A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- compound
- mixture
- volumes
- formula
- stirred
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
- A61P35/02—Antineoplastic agents specific for leukemia
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J21/00—Catalysts comprising the elements, oxides, or hydroxides of magnesium, boron, aluminium, carbon, silicon, titanium, zirconium, or hafnium
- B01J21/18—Carbon
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J23/00—Catalysts comprising metals or metal oxides or hydroxides, not provided for in group B01J21/00
- B01J23/38—Catalysts comprising metals or metal oxides or hydroxides, not provided for in group B01J21/00 of noble metals
- B01J23/40—Catalysts comprising metals or metal oxides or hydroxides, not provided for in group B01J21/00 of noble metals of the platinum group metals
- B01J23/44—Palladium
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
- C07D249/00—Heterocyclic compounds containing five-membered rings having three nitrogen atoms as the only ring hetero atoms
- C07D249/02—Heterocyclic compounds containing five-membered rings having three nitrogen atoms as the only ring hetero atoms not condensed with other rings
- C07D249/04—1,2,3-Triazoles; Hydrogenated 1,2,3-triazoles
- C07D249/06—1,2,3-Triazoles; Hydrogenated 1,2,3-triazoles with aryl radicals directly attached to ring atoms
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07B—GENERAL METHODS OF ORGANIC CHEMISTRY; APPARATUS THEREFOR
- C07B2200/00—Indexing scheme relating to specific properties of organic compounds
- C07B2200/13—Crystalline forms, e.g. polymorphs
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Materials Engineering (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Public Health (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Oncology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Organic Low-Molecular-Weight Compounds And Preparation Thereof (AREA)
- Hydrogenated Pyridines (AREA)
- Plural Heterocyclic Compounds (AREA)
- Heterocyclic Carbon Compounds Containing A Hetero Ring Having Nitrogen And Oxygen As The Only Ring Hetero Atoms (AREA)
Abstract
本披露提供了用于合成被取代的2‑芳基环丙胺和2‑杂芳基环丙胺及相关化合物的方法。还提供了用于将硫酯还原成醛的方法,以及用于对环丙胺进行还原胺化的方法。
Description
本申请要求2016年8月16日提交的美国临时申请号62/375,728的权益,其全部内容以其全文通过引用特此并入(就像写在本文中一样)。
对酶KDM1A(也称为赖氨酸特异性脱甲基酶1、LSD1、含有含黄素胺氧化酶结构域的蛋白质、AOF2、BRAF35-HDAC复合蛋白BHC110、FAD结合蛋白BRAF35-HDAC复合物)进行抑制可以改变细胞中的基因表达,这足以恢复细胞的正常生理功能或者作为一个整体的组织、器官或患者的正常生理功能。这可以通过以下两种方式来实现:增强病理上沉默的一种或多种基因的转录,例如,在一些癌细胞和遗传性疾病中就是这种情况;或者减少参与病理状态的一种或多种基因的转录。因此,抑制KDM1A将可用于治疗如癌症和遗传性疾病(如威尔逊氏病(Wilson disease)、心肌病和血红蛋白病)的疾病。
KDM1A的新型强效抑制剂已经例如在WO 2014/164,867、WO 2015/021128和PCT/US2016/17809中描述过。化合物N-[2S)-1-(4-(甲基)哌嗪-1-基)-5-[[(1R,2S)-2-(4-氟苯基)-环丙基]氨基]-1-氧代戊烷-2-基]-4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰胺及相关化合物已经在PCT/US 2016/17809中被描述为KDM1A的很有市场开发前景的抑制剂,该申请的内容特此通过援引并入。因此,需要用于合成N-[2S)-1-(4-(甲基)哌嗪-1-基)-5-[[(1R,2S)-2-(4-氟苯基)-环丙基]氨基]-1-氧代戊烷-2-基]-4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰胺及相关化合物、且适合于大规模合成的新方法和改进方法。
在一个实施例中,本发明提供了用于制备式IV化合物的方法:
或其盐、多晶型物或溶剂化物,其中:
n为1或2;
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被
介于0个与3个之间的R6基团取代;
R3为被卤素、氰基或杂芳基取代的苯基;
R4为氢;
R5选自芳基和杂芳基,其中任一者都可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;
每个R6为氢、羟基、烷基、环烷基、杂环烷基、氰基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、CONHR7和CONR7R8;并且
R7和R8独立地选自氢和低级烷基;或者
R7和R8可以合在一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被低级烷基取代;
该方法包括使式II化合物:
或其盐;其中:
R5选自芳基和杂芳基,其中任一者都可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;
其中R6如上所定义;
与式III化合物:
或其盐;其中:
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;并且
R3为被卤素、氰基或杂芳基取代的苯基;
其中R6如上所定义;
在还原胺化反应条件下反应。
在一些实施例中,式III化合物与式III(a-d)化合物平衡地存在,这些化合物描绘如下:
本领域的技术人员将会知道,形成诸如式III(a-d)的环状结构对于官能化脂族醛是极其常见的,并且醛结构与式III(a-d)之间很快实现平衡。式III和III(a-d)的相对比例高度依赖于诸如分子结构、溶剂组成、pH和离子强度等因素。由于式III的醛具有相对高的反应性,与同替代性的式III(a-d)的快速平衡相结合,所以可能存在式III(a-d)不会干扰式III化合物的反应性,如本文所披露的。
在一些实施例中,式IV化合物为化合物7:
N-[2S)-1-(4-(甲基)哌嗪-1-基)-5-[[(1R,2S)-2-(4-氟苯基)-环丙基]氨基]-1-氧代戊烷-2-基]-4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰胺
在一些实施例中,式II化合物为化合物9:
在一些实施例中,式III化合物为化合物6:
在一些实施例中,还原胺化条件包括在硼氢化物还原剂的存在下使式II化合物与式III化合物反应。在一些实施例中,硼氢化物还原剂为NaBH4。在一些实施例中,还原胺化在包含醇的共溶剂混合物中进行。在一些实施例中,共溶剂混合物包含甲醇和四氢呋喃。
还提供了用于制备式III化合物的方法,该方法包括将式I硫酯还原:
其中:
n为1或2;
m为0至12;
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;并且
R3为被卤素、氰基或杂芳基取代的苯基;
其中R6如上所定义;
以提供式III的醛。
在一些实施例中,式I化合物为化合物5。
在一些实施例中,将式I硫酯化合物还原利用了硅烷还原剂。在一些实施例中,硅烷还原剂为三乙基硅烷。在一些实施例中,该还原还包括钯碳。
还提供了用于由式I硫酯的酸盐(指定为I*HX)制备式III化合物的方法,该方法包括:1)游离碱步骤,该游离碱步骤包括让盐I*HX与碱反应,以形成对应的游离碱I,以及2)还原步骤,该还原步骤包括用于将式I硫酯还原以提供式III化合物的方法,如本文所披露的。
其中:
m为0至12;
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;
R3为被卤素、氰基或杂芳基取代的苯基;并且
其中R6如上所定义。
在一些实施例中,还原步骤还利用了Pd基催化剂。在一些实施例中,Pd基催化剂为Pd(0)催化剂。在一些实施例中,Pd(0)催化剂为钯碳。在一些实施例中,钯碳为蛋壳型催化剂。在一些实施例中,Pd基催化剂为Pd(II)催化剂。
在一些实施例中,式I*HX化合物为化合物5*HCl。
还提供了用于制备式I硫酯的方法,该方法包括使用适当的偶联剂,使式V羧酸化合物与式VI硫醇化合物反应:
其中:
n为1或2;
m为0至12;
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;并且
R3为被卤素、氰基或杂芳基取代的苯基;
其中R6如上所定义。
在一些实施例中,用于化合物反应的偶联剂为1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺盐酸盐(EDC)或其盐。在一些实施例中,式V化合物与式VI化合物之间的反应还包括4-二甲基氨基吡啶(DMAP)。在一些实施例中,DMAP以催化量存在。
在一些实施例中,式VI中的m为11。
还提供了用于制备式I硫酯的酸盐的方法,该方法包括:1)硫酯形成步骤,该硫酯形成步骤包括如本文所披露的用于合成式I硫酯的方法,以及2)盐形成步骤,该盐形成步骤包括与酸HX反应,以形成对应的式I盐(指定为I*HX):
其中:
n为1或2;
m为0至12;
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;
R3为被卤素、氰基或杂芳基取代的苯基;并且
其中R6如上所定义。
还提供了用于由谷氨酸制备其中n为1的式V化合物(式XII化合物)的方法,该方法包括以下步骤:
a.使受保护的谷氨酸酯VII与适当的杂环VIII反应,以提供式IX化合物:
其中:
P为一价氮保护基团;
Rx为烷基基团;并且
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;
其中R6如上所定义;
b.从式IX化合物的谷氨酸氨基基团除去保护基团,以提供式X化合物:
其中:
P为一价氮保护基团;
Rx为烷基基团;并且
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;
其中R6如上所定义;
c.使式X化合物与适当的取代苯甲酸反应,以提供式XI化合物:
其中:
Rx为烷基基团;并且
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;并且
R3为被卤素、氰基或杂芳基取代的苯基;
其中R6如上所定义;
以及
d.将式XI化合物的酯基团转变为羧酸,以提供式XII化合物:
其中:
Rx为烷基基团;并且
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;并且
R3为被卤素、氰基或杂芳基取代的苯基;
其中R6如上所定义。
还提供了用于由谷氨酸制备其中n为1的式IV化合物(式XVI化合物)的方法,该方法包括以下步骤:
a.使受保护的谷氨酸酯VII与适当的杂环VIII反应,以提供式IX化合物:
其中:
P为一价氮保护基团;
Rx为烷基基团;并且
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;
其中R6如上所定义;
b.从式IX化合物的谷氨酸氨基基团除去保护基团,以提供式X化合物:
其中:
P为一价氮保护基团;
Rx为烷基基团;并且
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;
其中R6如上所定义;
c.使式X化合物与适当的取代苯甲酸反应,以提供式XI化合物:
其中:
Rx为烷基基团;并且
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;并且
R3为被卤素、氰基或杂芳基取代的苯基;
其中R6如上所定义;
d.将式XI化合物的酯基团转变为羧酸,以提供式XII化合物:
其中:
Rx为烷基基团;并且
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;并且
R3为被卤素、氰基或杂芳基取代的苯基;
其中R6如上所定义;
e.将式XII化合物转变为式XIII化合物,其包括1)硫酯形成步骤,和2)盐形成步骤:
其中:
m为0至12;
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;
R3为被卤素、氰基或杂芳基取代的苯基;并且
其中R6如上所定义;
f.将式XIII化合物转变为式XIV化合物,其包括:1)游离碱步骤,该游离碱步骤包括让盐XIII与碱反应,和2)还原步骤:
其中:
m为0至12;
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;
R3为被卤素、氰基或杂芳基取代的苯基;并且
其中R6如上所定义;
g.通过在还原胺化条件下与式II化合物反应,将式XIV化合物转变为式XV化合物:
其中:
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;并且
R3为被卤素、氰基或杂芳基取代的苯基;
R5选自芳基和杂芳基,其中任一者都可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;
其中R6如上所定义;
以及
h.通过与酸化合物HX反应,将式XV化合物转变为式XVI化合物:
其中:
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;并且
R3为被卤素、氰基或杂芳基取代的苯基;
R5选自芳基和杂芳基,其中任一者都可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;
其中R6如上所定义。
具体实施方式
缩写与定义
为了有助于对本披露的理解,如本文所用的大量术语和缩写定义如下:
当介绍本披露或其一个或多个优选实施例的要素时,冠词“一个/一种”、“该”和“所述”旨在表示存在这些要素中的一个或多个。术语“包括”、“包含”和“具有”旨在有包含性,意指可以存在除所列要素之外的另外的要素。
当术语“和/或”在两个或更多个项目的清单中使用时,意指所列出项目中的任何一项可以单独采用,或与所列出项目中的任何一项或多项组合采用。例如,表述“A和/或B”旨在意指A和B中的任一者或两者,即,单独的A、单独的B,或者A与B组合。表述“A、B和/或C”旨在意指单独的A、单独的B、单独的C、A与B组合、A与C组合、B与C组合,或者A、B与C组合。
如本文所用的术语“约”当指代可测量的值诸如化合物的量、剂量、时间、温度等时,意在涵盖指定量的20%、10%、5%、1%、0.5%或甚至0.1%的变化。
当披露数值范围,以及使用符号“从n1......至n2”或“介于n1......与n2之间”时,其中n1和n2是数字,则除非另外指明,否则该符号旨在包括这些数字本身以及它们之间的范围。该范围可以是在这些端值之间的完整或连续范围,并且包括这些端值。举例来说,范围“从2个至6个碳原子”旨在包括两个、三个、四个、五个以及六个碳原子,因为碳原子是以整数单位出现的。举例来说,将范围“从1μM至3μM(微摩尔)”(旨在包括1μM、3μM,以及这两者之间的所有数)与许多有效数字(例如,1.255μM、2.1μM、2.9999μM等)进行比较。当n在“0个碳原子”的上下文中被设定为0时,旨在表示化学键或无。
如本文所用的术语“烷基磺酰基”意指如本文所定义的通过磺酰基基团(如本文所定义)附加到母体分子部分上的烷基基团。烷基磺酰基的代表性实例包括但不限于甲磺酰基和乙磺酰基。
如本文所用的术语“烷基磺酰基烷基”意指如本文所定义的通过烷基基团(如本文所定义)附加到母体分子部分上的烷基磺酰基基团。烷基磺酰基烷基的代表性实例包括但不限于甲基磺酰基甲基和乙基磺酰基甲基。
如本文单独或组合使用的,术语“酰基”是指附接到烯基、烷基、芳基、环烷基、杂芳基、杂环或任何其他部分上的羰基,其中附接到羰基上的原子是碳。“乙酰基”基团是指-C(O)CH3基团。“烷基羰基”或“烷酰基”基团是指通过羰基基团附接到母体分子部分上的烷基基团。此类基团的实例包括甲基羰基和乙基羰基。酰基基团的实例包括甲酰基、烷酰基和芳酰基。
如本文单独或组合使用的,术语“烯基”是指具有一个或多个双键且含有从2个至20个碳原子的直链或支链烃基。在某些实施例中,所述烯基将包含从2个至6个碳原子。术语“亚烯基”是指附接在两个或更多个位置的碳-碳双键系统,诸如亚乙烯基[(-CH=CH-),(-C::C-)]。合适的烯基基团的实例包括乙烯基、丙烯基、2-甲基丙烯基、1,4-丁二烯基等。除非另外指明,否则术语“烯基”可以包括“亚烯基”基团。
如本文单独或组合使用的,术语“烷氧基”是指烷基醚基团,其中术语烷基如下所定义。合适的烷基醚基团的实例包括甲氧基、乙氧基、正丙氧基、异丙氧基、正丁氧基、异丁氧基、仲丁氧基、叔丁氧基等。
如本文单独或组合使用的,术语“烷基”是指含有从1个至20个碳原子的直链或支链烷基基团。在某些实施例中,所述烷基将包含从1个至10个碳原子。在另外的实施例中,所述烷基将包含从1个至6个碳原子。烷基基团可以如本文限定的那样任选地进行取代。烷基基团的实例包括甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、戊基、异戊基、己基、辛基、壬基等。如本文单独或组合使用的,术语“亚烷基”是指衍生自附接在两个或更多个位置处的直链或支链饱和烃的饱和脂肪族基团,诸如亚甲基(-CH2-)。除非另外指明,否则术语“烷基”可以包括“亚烷基”基团。
如本文单独或组合使用的,术语“烷基氨基”是指通过氨基基团附接到母体分子部分上的烷基基团。合适的烷基氨基基团可以是单烷基化或二烷基化的形成基团,诸如N-甲基氨基、N-乙基氨基、N,N-二甲基氨基、N,N-乙基甲基氨基等。
如本文单独或组合使用的,术语“次烷基”是指这样的烯基基团:其中碳-碳双键的一个碳原子属于该烯基基团所附接的部分。
如本文单独或组合使用的,术语“烷硫基”是指烷基硫醚(R-S-)基团,其中术语烷基如上所定义,并且其中硫可以是单氧化或双氧化的。合适的烷基硫醚基团的实例包括甲硫基、乙硫基、正丙硫基、异丙硫基、正丁硫基、异丁硫基、仲丁硫基、叔丁硫基、甲磺酰基、乙亚磺酰基等。
如本文单独或组合使用的,术语“炔基”是指具有一个或多个三键并含有从2个至20个碳原子的直链或支链烃基。在某些实施例中,所述炔基包含从2个至6个碳原子。在另外的实施例中,所述炔基包含从2个至4个碳原子。术语“亚炔基”是指附接在两个位置处的碳-碳三键,诸如亚乙炔基(-C≡C-)。炔基基团的实例包括乙炔基、丙炔基、羟基丙炔基、丁炔-1-基、丁炔-2-基、戊炔-1-基、3-甲基丁炔-1-基、己炔-2-基等。除非另外指明,否则术语“炔基”可以包括“亚炔基”基团。
如本文单独或组合使用的,术语“酰胺基”和“氨甲酰基”是指如下所述通过羰基基团附接到母体分子部分上的氨基基团,或反之亦然。如本文单独或组合使用的,术语“C-酰胺基”是指-C(=O)-NR2基团,其中R如本文所定义。如本文单独或组合使用的,术语“N-酰胺基”是指RC(=O)NH-基团,其中R如本文所定义。如本文单独或组合使用的,术语“酰基氨基”包括通过氨基基团附接到母体部分上的酰基基团。“酰基氨基”基团的实例为乙酰基氨基(CH3C(O)NH-)。
如本文单独或组合使用的,术语“氨基”是指-NRR’,其中R和R’独立地选自氢、烷基、羟基烷基、酰基、杂烷基、芳基、环烷基、杂芳基和杂环烷基,这些基团中的任何基团本身可以任选地被取代。此外,R和R’可以结合形成杂环烷基,这两个基团中的任一者可以任选地被取代。
如本文单独或组合使用的,术语“氨基酸”是指-NHCHRC(O)O-基团,该基团可以附接到母体分子部分上,以产生N-末端或C-末端氨基酸,其中R独立地选自氢、烷基、芳基、杂芳基、杂环烷基、氨基烷基、酰胺基、酰胺基烷基、羧基、羧基烷基、胍烷基、羟基、硫醇基和硫代烷基,这些基团中的任何基团本身可以任选地被取代。如本文单独或组合使用的,术语C-末端是指这样的母体分子部分:该部分在氨基基团处结合至氨基酸,以给出如本文所述的酰胺,伴有未结合的羧基基团,从而产生末端羧基基团,或对应的羧酸根阴离子。如本文单独或组合使用的,术语N-末端是指这样的母体分子部分:该部分在羧基基团处结合至氨基酸,以给出如本文所述的酯,伴有未结合的氨基基团,从而产生末端仲胺,或对应的铵阳离子。换句话讲,C-末端是指-NHCHRC(O)OH或-NHCHRC(O)O-,N-末端则是指H2NCHRC(O)O-或H3N+CHRC(O)O-。
如本文单独或组合使用的,术语“芳基”意指含有一个、两个或三个环的碳环芳香族系统,其中此类多环的环系统稠合在一起。术语“芳基”包括芳香族基团,诸如苯基、萘基、蒽基和菲基。
如本文单独或组合使用的,术语“芳基烯基”或“芳烯基”是指通过烯基基团附接到母体分子部分上的芳基基团。
如本文单独或组合使用的,术语“芳基烷氧基”或“芳烷氧基”是指通过烷氧基基团附接到母体分子部分上的芳基基团。
如本文单独或组合使用的,术语“芳基烷基”或“芳烷基”是指通过烷基基团附接到母体分子部分上的芳基基团。
如本文单独或组合使用的,术语“芳基炔基”或“芳炔基”是指通过炔基基团附接到母体分子部分上的芳基基团。
如本文单独或组合使用的,术语“芳基烷酰基”或“芳烷酰基”或“芳酰基”是指衍生自芳基取代的链烷羧酸的酰基基团,诸如苯甲酰基、萘甲酰基、苯基乙酰基、3-苯基丙酰基(氢肉桂酰基)、4-苯基丁酰基、(2-萘基)乙酰基、4-氯氢肉桂酰基等。
如本文单独或组合使用的,术语芳氧基是指通过氧基附接到母体分子部分上的芳基基团。
如本文单独或组合使用的,术语“苯并”是指衍生自苯的二价基团C6H4=。实例包括苯并噻吩和苯并咪唑。
如本文所用的术语“联苯基”是指连接在每个环上的一个碳位点处的两个苯基基团。
如本文单独或组合使用的,术语“氨基甲酸酯”是指氨基甲酸的酯(-NHCOO-),它可以从氮端或酸端附接到母体分子部分上,并且可以如本文所定义的任选地被取代。
如本文单独或组合使用的,术语“O-氨甲酰基”是指-OC(O)NRR’基团,其中R和R’如本文所定义。
如本文单独或组合使用的,术语“N-氨甲酰基”是指ROC(O)NR’-基团,其中R和R’如本文所定义。
如本文所用的术语“羰基”,在单独使用时包括甲酰基[-C(O)H],在组合使用时为-C(O)-基团。
如本文所用,术语“羧基”是指-C(O)OH或对应的“羧酸根”阴离子,如在羧酸盐中的那种。“O-羧基”基团是指RC(O)O-基团,其中R如本文所定义。“C-羧基”基团是指-C(O)OR基团,其中R如本文所定义。
如本文单独或组合使用的,术语“氰基”是指-CN。
如本文单独或组合使用的,术语“环烷基”或替代性地“碳环”是指饱和或部分饱和的单环、二环或三环的烷基基团,其中每个环部分都含有从3个至12个碳原子环成员,并且可以任选地为如本文所定义的任选地被取代的苯并稠合环系统。在某些实施例中,所述环烷基将包含从5个至7个碳原子。此类环烷基基团的实例包括环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环庚基、四氢萘基、茚满基、八氢萘基、2,3-二氢-1H-茚基、金刚烷基等。如本文所用,“二环的”和“三环的”旨在包括两种稠合环系统,诸如十氢萘、八氢萘以及多环的(多中心的)饱和或部分不饱和类型。一般来讲,后一种类型的异构体通过以下各项来例示:二环[1,1,1]戊烷、樟脑、金刚烷和二环[3,2,1]辛烷。
如本文单独或组合使用的,术语“酯”是指对在碳原子处连接的两个部分进行桥接的羧基基团。
如本文单独或组合使用的,术语“醚”是指对在碳原子处连接的两个部分进行桥接的氧基基团。
如本文单独或组合使用的,术语“卤代醇”是指其中一个碳原子具有卤素取代基、另一个碳原子具有羟基取代基(典型地在相邻碳上)的化合物或官能团。
如本文单独或组合使用的,术语“胍”是指-NHC(=NH)NH2,或对应的胍盐阳离子。
如本文单独或组合使用的,术语“卤基”或“卤素”是指氟、氯、溴或碘。
如本文单独或组合使用的,术语“卤代烷氧基”是指通过氧原子附接到母体分子部分上的卤代烷基基团。
如本文单独或组合使用的,术语“卤代烷基”是指具有如上所定义的含义的烷基基团,其中一个或多个氢原子被卤素替代。明确地包括单卤代烷基、双卤代烷基和多卤代烷基这些基团。举个例子,单卤代烷基基团可以在该基团内具有碘、溴、氯或氟原子。二卤代烷基基团和多卤代烷基基团可以具有两个或更多个相同的卤原子或不同卤代基团的组合。卤代烷基基团的实例包括氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、氯甲基、二氯甲基、三氯甲基、五氟乙基、七氟丙基、二氟氯甲基、二氯氟甲基、二氟乙基、二氟丙基、二氯乙基和二氯丙基。“卤代亚烷基”是指附接在两个或更多个位置处的卤代烷基基团。实例包括氟亚甲基(-CFH-)、二氟亚甲基(-CF2-)、氯亚甲基(-CHCl-)等。
如本文单独或组合使用的,术语“杂烷基”是指稳定的直链或支链烃基、或环状烃基、或它们的组合,为完全饱和的或含有从1个至3个不饱和度,由规定数量的碳原子以及从1个至3个选自O、N和S的杂原子组成,并且其中氮原子和硫原子可以任选地氧化,氮杂原子可以任选地季铵化。一个或多个杂原子O、N和S可以放置在杂烷基基团的任意内部位置。多达两个杂原子可以是连续的,诸如-CH2-NH-OCH3。
如本文单独或组合使用的,术语“杂芳基”是指3元至7元不饱和的杂单环,或稠合的单环、二环或三环的环系统,其中这些稠环中的至少一个为芳香族的,所述“杂芳基”含有至少一个选自O、S和N的原子。在某些实施例中,所述杂芳基将包含从5个至7个碳原子。所述术语还包括稠合的多环基团,其中将杂环与芳基环稠合,其中将杂芳基环与其他杂芳基环稠合,其中将杂芳基环与杂环烷基环稠合,或其中将杂芳基环与环烷基环稠合。杂芳基基团的实例包括吡咯基、吡咯啉基、咪唑基、吡唑基、吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、三唑基、吡喃基、呋喃基、噻吩基、噁唑基、异噁唑基、噁二唑基、噻唑基、噻二唑基、异噻唑基、吲哚基、异吲哚基、吲嗪基、苯并咪唑基、喹啉基、异喹啉基、喹喔啉基、喹唑啉基、吲唑基、苯并三唑基、苯并间二氧杂环戊烯、苯并吡喃基、苯并噁唑基、苯并噁二唑基、苯并噻唑基、苯并噻二唑基、苯并呋喃基、苯并噻吩基、色酮基、香豆素基、苯并吡喃基、四氢喹啉基、四唑并哒嗪基、四氢异喹啉基、噻吩并吡啶基、呋喃并吡啶基、吡咯并吡啶基、氮杂基、二氮杂基、苯并氮杂基等。示例性三环杂环基团包括咔唑基、苯并吲哚基、菲咯啉基、二苯并呋喃基、吖啶基、菲啶基、咕吨基等。
如本文单独使用或作为另一个基团的一部分使用的术语“杂芳基烷基”是指具有杂芳基取代基的如上所定义的烷基基团。
如本文单独或组合使用的,术语“杂环烷基”和可互换的“杂环”各自是指含有至少一个杂原子作为环成员的饱和、部分不饱和或完全不饱和的单环、二环或三环杂环基团,其中每个所述杂原子都可以独立地选自氮、氧和硫。在某些实施例中,所述杂环烷基将包含从1个至4个杂原子作为环成员。在另外的实施例中,所述杂环烷基将包含从1个至2个杂原子作为环成员。在某些实施例中,所述杂环烷基将在每个环中包含从3个至8个环成员。在另外的实施例中,所述杂环烷基将在每个环中包含从3个至7个环成员。在还有一些另外的实施例中,所述杂环烷基将在每个环中包含从5个至6个环成员。“杂环烷基”和“杂环”旨在包括砜、亚砜、具有叔氮环成员的N-氧化物,以及碳环稠合环系统和苯并稠合环系统;此外,这两个术语还包括如下系统,其中杂环与如本文所定义的芳基基团或另外的杂环基团稠合。杂环基团的实例包括氮丙啶基、氮杂环丁烷基、1,3-苯并间二氧杂环戊基、二氢异吲哚基、二氢异喹啉基、二氢噌啉基、二氢苯并二噁英基、二氢[1,3]噁唑并[4,5-b]吡啶基、苯并噻唑基、二氢吲哚基、二氢吡啶基、1,3-二噁烷基、1,4-二噁烷基、1,3-二氧戊环基、咪唑烷基、异二氢吲哚基、吗啉基、噁唑烷基、异噁唑烷基、哌啶基、哌嗪基、甲基哌嗪基、N-甲基哌嗪基、吡咯烷基、吡唑烷基、四氢呋喃基、四氢吡啶基、硫代吗啉基、噻唑烷基、二氮杂环庚烷基,等等。除非明确地禁止,否则可以任选地对杂环基团进行取代。
如本文单独或组合使用的,术语“肼基”是指由单键接合的两个氨基基团,即-N-N-。
如本文单独或组合使用的,术语“羟基”是指-OH。
如本文单独或组合使用的,术语“羟基烷基”是指通过烷基基团附接到母体分子部分上的羟基基团。
如本文单独或组合使用的,术语“异羟肟酸”是指-C(=O)NHOH,其中母体分子部分借助于碳原子附接到异羟肟酸基团。
如本文单独或组合使用的,术语“亚氨基”是指=N-。
如本文单独或组合使用的,术语“亚氨基羟基”是指=N(OH)和=N-O-。
短语“在主链中”是指起始于基团到具有本文所披露的化学式中任一项的化合物的附接点的碳原子的最长连续链或邻链。
术语“异氰酸基”是指-NCO基团。
术语“异硫氰酸基”是指-NCS基团。
短语“原子的线性链”是指原子的最长直链,这些原子独立地选自碳、氮、氧和硫。
如本文单独或组合使用的,在没有另外明确定义的情况下,术语“低级”意指含有从1个至6个碳原子,并且包括6个碳原子。
如本文单独或组合使用的,术语“低级芳基”意指可以如所提供的那样任选地被取代的苯基或萘基。
如本文单独或组合使用的,术语“低级杂芳基”意指1)包含五个或六个环成员的单环杂芳基,其中介于一个与四个之间的所述成员可以是选自O、S和N的杂原子,或2)二环杂芳基,其中每个稠环都包含五个或六个环成员,这些环成员之间包含一个至四个选自O、S和N的杂原子。
如本文单独或组合使用的,术语“低级环烷基”意指具有介于三个与六个之间的环成员的单环环烷基。低级环烷基可以是不饱和的。低级环烷基的实例包括环丙基、环丁基、环戊基和环己基。
如本文单独或组合使用的,术语“低级杂环烷基”意指具有介于三个与六个之间的环成员的单环杂环烷基,其中介于一个与四个之间的环成员可以是选自O、S和N的杂原子。低级杂环烷基的实例包括吡咯烷基、咪唑烷基、吡唑烷基、哌啶基、哌嗪基和吗啉基。低级杂环烷基可以是不饱和的。
如本文单独或组合使用的,术语“低级氨基”是指-NRR’,其中R和R’独立地选自氢、低级烷基和低级杂烷基,其中任一者都可以任选地被取代。此外,低级氨基基团的R和R’可以结合形成五元或六元杂环烷基,其中任一者都可以任选地被取代。
如本文单独或组合使用的,术语“巯基”是指RS-基团,其中R如本文所定义。
如本文单独或组合使用的,术语“硝基”是指-NO2。
如本文单独或组合使用的,术语“氧基”或“氧杂”是指-O-。
如本文单独或组合使用的,术语“氧代”是指=O。
术语“全卤代烷氧基”是指烷氧基基团,其中所有的氢原子都被卤素原子替代。
如本文单独或组合使用的,术语“全卤代烷基”是指其中所有的氢原子都被卤素原子替代的烷基基团。
如本文单独或组合使用的,术语“膦酸酯”是指-P(=O)(OR)2基团,其中R选自烷基和芳基。如本文单独或组合使用的,术语“膦酸”是指-P(=O)(OH)2基团。
如本文单独或组合使用的,术语“磷酰胺”是指-P(=O)(NR)3基团,其中R如本文所定义。
如本文单独或组合使用的,术语“磺酸酯”、“磺酸”和“磺酸基的”是指-SO3H基团,其作为磺酸的阴离子以盐形式使用。
如本文单独或组合使用的,术语“硫烷基”是指-S-。
如本文单独或组合使用的,术语“亚磺酰基”是指
-S(O)-。
如本文单独或组合使用的,术语“磺酰基”是指-S(O)2-。
术语“N-磺酰胺基”是指RS(=O)2NR’-基团,其中R和R’如本文所定义。
术语“S-磺酰胺基”是指-S(=O)2NRR’基团,其中R和R’如本文所定义。
如本文单独或组合使用的,术语“硫杂”和“硫代”是指-S-基团或其中氧被硫替代的醚。硫代基团的氧化衍生物(即亚磺酰基和磺酰基)被包括在硫杂和硫代的定义中。
如本文单独或组合使用的,术语“硫醇”是指-SH基团。
如本文所用的术语“硫代羰基”,在单独使用时包括硫代甲酰基-C(S)H,在组合使用时为-C(S)-基团。
术语“N-硫代氨甲酰基”是指ROC(S)NR’-基团,其中R和R’如本文所定义。
术语“O-硫代氨甲酰基”是指-OC(S)NRR’基团,其中R和R’如本文所定义。
术语“硫氰酸基”是指-CNS基团。
术语“三卤甲氧基”是指X3CO-基团,其中X为卤素。
本文的任何定义都可以与任何其他定义结合使用,来描述复合结构基团。按照惯例,任何此类定义的尾随元素是附接到母体部分上的元素。例如,复合基团烷基酰胺基表示通过酰胺基基团附接到母体分子上的烷基基团,并且术语烷氧基烷基表示通过烷基基团附接到母体分子上的烷氧基基团。
当基团被定义为“无”时,意指所述基团是不存在的。类似地,当可以选自一组整数或一个整数范围的诸如“n”的指定被指定为0时,则其指定的组要么不存在(如果在末端位置),要么缩合形成键(如果落在两个其他组之间)。
术语“任选地被取代的”意指前述基团可以被取代或不被取代。如果被取代,则“任选地被取代的”基团的取代基可以包括但不限于独立地选自下列多组或具体指定的一系列多组(单独的或组合的)的一种或多种取代基:低级烷基、低级烯基、低级炔基、低级酰基、低级杂烷基、低级杂环烷基、低级卤代烷基、低级卤烯基、低级卤炔基、低级全卤代烷基、低级全卤烷氧基、低级环烷基、苯基、芳基、芳氧基、低级烷氧基、低级卤代烷氧基、氧代基、低级酰氧基、羰基、羧基、低级烷基羰基、低级羧酸酯、低级甲酰胺基、氰基、氢、卤素、羟基、氨基、低级烷基氨基、芳基氨基、酰胺基、硝基、硫醇、低级烷硫基、低级卤代烷硫基、低级全卤烷硫基、芳硫基、磺酸酯、磺酸、三取代的甲硅烷基、N3、SH、SCH3、C(O)CH3、CO2CH3、CO2H、吡啶基、噻吩、呋喃基、低级氨基甲酸酯、以及低级脲。可以将两个取代基接合在一起,以形成稠合的五元、六元或七元的由零个至三个杂原子组成的碳环或杂环,例如形成亚甲基二氧基或亚乙基二氧基。任选地被取代的基团可以是未取代的(例如,-CH2CH3)、完全取代的(例如,-CF2CF3)、单取代的(例如,-CH2CH2F)或以完全取代与单取代之间的一定水平取代(例如,-CH2CF3)。在叙述取代基而未定性为取代的情况下,涵盖取代形式和未取代形式这两者。在取代基被定性为“取代的”情况下,明确地意指取代形式。此外,针对具体部分的不同组的任选取代基可以按需进行定义;在这些情况下,任选的取代将如定义的那样,通常紧跟着短语“任选地被......取代”。
除非另有定义,否则术语R或术语R’(独自出现并且没有数字指定的情况下)是指选自以下各项的部分:氢、烷基、环烷基、杂烷基、芳基、杂芳基以及杂环烷基,其中任一者都可以任选地被取代。应当理解,此类R基团和R’基团如本文所定义的任选地被取代。无论R基团是否具有数字指定,都应当理解,每个R基团(包括R、R’和Rn,其中n=(1、2、3、...n))、每个取代基以及每个术语就从组的选择而论都独立于所有其他项。如果任何变量、取代基或术语(例如,芳基、杂环、R等)在化学式或通用结构中出现不止一次,那么在每次出现时其定义应当独立于在所有其他出现时的定义。本领域的技术人员将进一步认识到,某些基团可以附接到母体分子上,或者可以在从如所写的任一端的元素的链中占据位置。因此,仅以举例的方式,诸如-C(O)N(R)-等不对称基团可以在碳或氮处附接到母体部分上。
不对称中心存在于本文所披露的化合物中。这些中心根据Cahn-Ingold-Prelog优先权规则由符号“R”或“S”指定,具体取决于手性碳原子周围的取代基的构型。应当理解,本发明涵盖所有立体化学异构体形式,包括非对映异构体、对映异构体和差向异构体形式,连同d-异构体和1-异构体,以及它们的混合物。化合物的单独立体异构体可以用含有手性中心的可商购获得的起始材料合成制备,或者通过制备对映异构体产物的混合物,然后分离(诸如转化成非对映异构体的混合物),然后是分离或重结晶、层析技术、在手性层析柱上直接分离对映异构体,或本领域已知的任何其他适当方法来制备。特定立体化学的起始化合物是可商购获得的,或者可以通过本领域已知的技术来制备和拆分。此外,本文所披露的化合物可以作为几何异构体存在。本发明包括所有顺式、反式、同式、逆式、异侧(E)和同侧(Z)异构体,以及它们的适当混合物。此外,化合物可以按互变异构体存在;本发明提供了所有互变异构的同分异构体。此外,本文所披露的化合物可以按非溶剂化物的形式以及与药学上可接受的溶剂诸如水、乙醇等的溶剂化物的形式存在。一般来讲,将溶剂化形式视为等效于非溶剂化形式。
术语“键”是指当由所述键接合的原子被认为是较大子结构的一部分时两个原子或两个部分之间的共价连接。键可以是单键、双键或三键,除非另外指明。在分子图中的两个原子之间的虚线指示在那个位置处可以存在、也可以不存在另外的键。
如本文所用,术语“疾病”旨在大体与术语“障碍”和“病症”(如在医学症状中)同义并且可与之互换使用,因为所有这些都反映了人体或动物体或其中一部分的、损伤正常功能并且使人类或动物的寿命期限缩短或生活质量下降的异常状况,典型地表现为区别体征和症状。
本文所披露的化合物可以作为治疗上可接受的盐存在。本发明包括以上以盐形式列出的化合物,所述盐形式包括酸加成盐。合适的盐包括用有机酸和无机酸这两者形成的那些盐。此类酸加成盐通常将是药学上可接受的。然而,药学上不可接受的盐在所考虑的化合物的制备和纯化中可以是有效用的。也可以形成碱加成盐,这类盐也是药学上可接受的。有关盐的制备和选择的更完整讨论,请参阅Pharmaceutical Salts:Properties,Selection,and Use[可药用盐:特性、选择与用途](Stahl,P.Heinrich.Wiley-VCHA,瑞士苏黎世(Zurich,Switzerland),2002年)。
如本文所用,术语“治疗上可接受的盐”表示本文所披露的化合物的盐或两性离子形式,它们是水溶性的或油溶性的或可分散的,并且是如本文所定义的治疗上可接受的。这些盐可以在化合物最后的分离和纯化期间制备,或通过使游离碱形式的适当化合物与合适的酸反应而单独制备。代表性酸加成盐包括乙酸盐、己二酸盐、海藻酸盐、L-抗坏血酸盐、天冬氨酸盐、苯甲酸盐、苯磺酸盐(苯磺酸盐)、重硫酸盐、丁酸盐、樟脑酸盐、樟脑磺酸盐、柠檬酸盐、二葡萄糖酸盐、甲酸盐、延胡索酸盐、龙胆酸盐、戊二酸盐、甘油磷酸盐、乙醇酸盐、半硫酸盐、庚酸盐、己酸盐、马尿酸盐、盐酸盐、氢溴酸盐、氢碘酸盐、2-羟乙磺酸盐(羟乙基磺酸盐)、乳酸盐、马来酸盐、丙二酸盐、DL-扁桃酸盐、均三甲苯磺酸盐、甲磺酸盐、萘磺酸盐、烟酸盐、2-萘磺酸盐、草酸盐、双羟萘酸盐、果胶盐、过硫酸盐、3-苯丙酸盐、磷酸盐、苦味酸盐、匹伐酸盐、丙酸盐、焦谷氨酸盐、琥珀酸盐、磺酸盐、酒石酸盐、L-酒石酸盐、三氯乙酸盐、三氟乙酸盐、磷酸盐、谷氨酸盐、碳酸氢盐、对-甲苯磺酸盐(p-托西酸盐)和十一烷酸盐。另外,可以将本文所披露的化合物中的碱性基团用甲基、乙基、丙基和丁基的氯化物、溴化物和碘化物;二甲基、二乙基、二丁基和二戊基的硫酸酯;癸基、月桂基、豆蔻基和甾醇基的氯化物、溴化物和碘化物;以及苯甲基和苯乙基的溴化物进行季铵化。可以采用以形成治疗上可接受的加成盐的酸的实例包括无机酸(诸如盐酸、氢溴酸、硫酸和磷酸)以及有机酸(诸如草酸、马来酸、琥珀酸和柠檬酸)。盐还可以通过这些化合物与碱金属或碱土金属离子的配位而形成。因此,本发明设想了本文所披露化合物的钠盐、钾盐、镁盐和钙盐等。
碱加成盐可以在化合物最后的分离和纯化期间,通过让羧基基团与合适的碱(诸如金属阳离子的氢氧化物、碳酸盐或碳酸氢盐)反应,或者与氨或者有机伯、仲或叔胺反应而制备。治疗上可接受的盐的阳离子包括锂、钠、钾、钙、镁、和铝,以及无毒季胺阳离子如铵、四甲铵、四乙铵、甲胺、二甲胺、三甲胺、三乙胺、二乙胺、乙胺、三丁胺、吡啶、N,N-二甲基苯胺、N-甲基哌啶、N-甲基吗啉、二环己胺、普鲁卡因、二苄胺、N,N-二苄基苯乙胺、1-二苯羟甲胺和N,N’-二苄基乙二胺。可用于形成碱加成盐的其他代表性有机胺包括乙二胺、乙醇胺、二乙醇胺、哌啶和哌嗪。
化合物的盐可以通过使适当的游离碱形式的化合物与适当的酸反应来制备。
本文所披露的化合物可以按多晶型物和其他不同的固体形式(如溶剂化物、水合物等)存在。化合物可以是盐或游离碱或酸的多晶型物、溶剂化物或水合物。
本披露提供了用于合成N-[2S)-1-(4-(甲基)哌嗪-1-基)-5-[[(1R,2S)-2-(4-氟苯基)-环丙基]氨基]-1-氧代戊烷-2-基]-4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰胺及相关化合物的方法。
在一个实施例中,本发明提供了用于制备式IV化合物的方法:
或其盐、多晶型物或溶剂化物,其中:
n为1或2;
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;
R3为被卤素、氰基或杂芳基取代的苯基;
R4为氢;
R5选自芳基和杂芳基,其中任一者都可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;
每个R6为氢、羟基、烷基、环烷基、杂环烷基、氰基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、CONHR7和CONR7R8;并且
R7和R8独立地选自氢和低级烷基;或者
R7和R8可以合在一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被低级烷基取代;
该方法包括使式II化合物:
或其盐;其中:
R5选自芳基和杂芳基,其中任一者都可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;
其中R6如上所定义;
与式III化合物:
或其盐;其中:
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;并且
R3为被卤素、氰基或杂芳基取代的苯基;
其中R6如上所定义;
在还原胺化反应条件下反应。
在某些实施例中,n为1。
在某些实施例中,R1和R2合在一起形成含氮杂环烷基,该含氮杂环烷基可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代。
在某些实施例中,该含氮杂环烷基选自:
在某些实施例中,该含氮杂环烷基为:
在某些实施例中,该含氮杂环烷基任选地被介于0个与3个之间的选自烷基和氧代的R6基团取代。
在某些实施例中,R5为苯基,该苯基可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代。
在某些实施例中,R5为:
其中R6b选自卤素和烷氧基。
在某些实施例中,R6b选自氟代和甲氧基。
在某些实施例中,R6b为氟代。
在某些实施例中,R3为被杂芳基取代的苯基。
在某些实施例中,R3为被选自由以下项组成的组的杂芳基取代的苯基:
在某些实施例中,R3为被
在某些实施例中,式IV化合物为化合物7:
在某些实施例中,式II化合物为化合物9:
在某些实施例中,式III化合物为化合物6:
可以用于本发明的还原胺化条件是有机合成领域的技术人员已知的。作为非限制性实例,可以在以下文献中找到此类反应条件的实例:M.Taibakhsh,R.Hosseinzadeh,H.Alinezhad,S.Ghahari,A.Heydari,S.Khaksar,Synthesis[合成],2011,490-496;A.F.Abdel-Magid,K.G.Carson,B.D.Harris,C.A.Maryanoff,R.D.Shah,J.Org.Chem.[有机化学期刊],1996,61,3849-3862;以及O.S.Nayal,V.Bhatt,S.Sharma,N.Kumar,J.Org.Chem.[有机化学期刊],2015,80,5912-5918。在某些实施例中,还原胺化条件包括在硼氢化物还原剂的存在下使式II化合物与式III化合物反应。在某些实施例中,硼氢化物还原剂为NaBH4。在某些实施例中,硼氢化物还原剂为NaBH(OAc)3。
在某些实施例中,还原胺化在选自低级原醇(lower carbinol)、2,2,2-三氟乙醇、二氯甲烷、四氢呋喃和乙腈的溶剂中进行。
在某些实施例中,还原胺化在包含低级原醇的溶剂中进行。
在某些实施例中,低级原醇为甲醇。
在某些实施例中,低级原醇为共溶剂混合物的一部分。
在某些实施例中,共溶剂混合物包含甲醇和四氢呋喃。在一些实施例中,共溶剂混合物由甲醇和四氢呋喃的2∶1(体积∶体积)混合物组成。
在某些实施例中,将NaBH4添加到化合物6和化合物9在甲醇和四氢呋喃的混合物中的已冷却到-5℃±5℃的混合物中。
在某些实施例中,将NaBH4添加到化合物6和化合物9在甲醇和四氢呋喃的混合物中的已冷却到-10℃±5℃的混合物中。
在一些实施例中,使用相对于化合物6至多1.1当量的化合物9。
在一些实施例中,使用相对于化合物6至多1.0当量的化合物9。
在某些实施例中,分批添加NaBH4,同时将反应混合物的温度维持在低于22℃。
在某些实施例中,至少分5批,两批之间至少间隔15分钟添加NaBH4。
在某些实施例中,在完成分批添加NaBH4之后,在20℃±5℃下搅拌反应混合物。
在某些实施例中,将反应混合物在20℃±5℃下搅拌至少1小时。
在某些实施例中,将反应混合物在20℃±5℃下搅拌至少3小时。
在某些实施例中,还原胺化还包括以下步骤:
1)搅拌反应混合物,直到通过HPLC分析确定化合物7以至少75%的面积百分比存在为止;
2)添加饱和NH4Cl,将反应混合物淬灭;以及
3)浓缩所得混合物。
在某些实施例中,还原胺化还包括以下步骤:
1)在水相与IPAc相之间分配产物;
2)添加NaOH,将水相的pH调节到9至10;
3)分离IPAc相;
4)用IPAc萃取水相;以及
5)从合并的IPAc相中获得化合物7。
在某些实施例中,用于测定还原胺化反应混合物中的化合物7的面积百分比的HPLC方法是如本文所披露的测试方法TM.04762。
还提供了用于制备式III化合物的方法,该方法包括将式I硫酯还原:
其中:
n为1或2;
m为0至12;
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;并且
R3为被卤素、氰基或杂芳基取代的苯基;
其中R6如上所定义;
以提供式III的醛。
在某些实施例中,n为1。
在某些实施例中,m为11。
在某些实施例中,R1和R2合在一起形成含氮杂环烷基,该含氮杂环烷基可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代。
在某些实施例中,该含氮杂环烷基选自:
在某些实施例中,该含氮杂环烷基为:
在某些实施例中,该含氮杂环烷基任选地被介于0个与3个之间的选自烷基和氧代的R6基团取代。
在某些实施例中,R3为被杂芳基取代的苯基。
在某些实施例中,R3为被选自由以下项组成的组的杂芳基取代的苯基:
在某些实施例中,R3为被
在一些实施例中,式I化合物为化合物5。
可以在本发明中用于将式I硫酯还原为式III醛的还原条件是有机合成领域的技术人员已知的。作为非限制性实例,可以在以下文献中找到此类反应条件的实例:T.Fukuyma,H.Tokuyama,Aldrichimica Acta[奥尔德里奇化学公司杂志],2004,37,87。
在一些实施例中,将式I硫酯化合物还原利用了硅烷还原剂。在一些实施例中,硅烷还原剂为三乙基硅烷。在一些实施例中,使用相对于式I硫酯为4.0当量的三乙基硅烷。
在一些实施例中,该还原还包括钯碳。在某些实施例中,还原可以如Fukuyama等人:H.Tokuyama,S.Yokoshima,S.-C.Lin,L.Li,T.Fukuyama,Synthesis[合成],2002,1121-1123所述进行。
在一些实施例中,还原还包括Pd(0)催化剂。在一些实施例中,Pd(0)催化剂为钯碳。在一些实施例中,钯碳是无水的。在一些实施例中,使用相对于式I硫酯为约2.5重量%的钯碳催化剂。在一些实施例中,使用相对于式I硫酯为约5重量%的钯碳催化剂。在一些实施例中,使用相对于式I硫酯为约7.5重量%的钯碳催化剂。在一些实施例中,使用相对于式I硫酯为约10重量%的钯碳催化剂。
在一些实施例中,钯碳为蛋壳型催化剂。在一些实施例中,钯碳为未还原的蛋壳型催化剂。在一些实施例中,钯碳为完全还原的蛋壳型催化剂。在一些实施例中,使用相对于式I硫酯为约5重量%的蛋壳型催化剂。在一些实施例中,使用相对于式I硫酯为约10重量%的蛋壳型催化剂。
在一些实施例中,还原还包括Pd(II)催化剂。在一些实施例中,Pd(II)催化剂为Pd(OH)2。在一些实施例中,Pd(II)催化剂为Pd(OAc)2。
在某些实施例中,将式I硫酯化合物还原在选自冰醋酸、四氢呋喃、二氯甲烷和丙酮的溶剂中进行。在某些实施例中,将式I硫酯化合物还原在冰醋酸和四氢呋喃的共溶剂混合物中进行。
在一些实施例中,还原步骤还利用了冰醋酸。在一些实施例中,使用相对于I*HX至少0.5当量的冰醋酸。在一些实施例中,使用相对于I*HX至少1.0当量的冰醋酸。在一些实施例中,使用相对于I*HX至少1.1当量的冰醋酸。在一些实施例中,使用相对于I*HX至少1.2当量的冰醋酸。
在某些实施例中,将式I硫酯化合物还原包括将三乙基硅烷添加到化合物5和钯碳在四氢呋喃和冰醋酸中的混合物中。
在某些实施例中,将式I硫酯化合物还原包括将三乙基硅烷添加到化合物5和钯碳在四氢呋喃和冰醋酸中的混合物中,其中所述混合物已冷却到5℃±5℃。
在某些实施例中,经至少30分钟添加三乙基硅烷。
在某些实施例中,将式I硫酯化合物还原还包括在添加三乙基硅烷后,经约1.5小时让反应混合物升温至约20℃。
在某些实施例中,将式I硫酯化合物还原还包括在15℃±5℃下将反应混合物搅拌至少3小时。
在某些实施例中,将式I硫酯化合物还原还包括以下步骤:
1)搅拌反应混合物,直到通过HPLC分析确定化合物5以小于5%的面积百分比存在为止;
2)过滤并浓缩所得的混合物。
在某些实施例中,用于测定反应混合物中的化合物5的面积百分比的HPLC方法是如本文所披露的测试方法TM.04760。
在一些实施例中,III作为固体获得。在一些实施例中,固体III是从包含以下各项中的一种或多种的溶剂获得的:EtOAc、MTBE和庚烷。在一些实施例中,固体III是从由EtOAc、MTBE和庚烷组成的溶剂获得的。在一些实施例中,固体III是通过将III的EtOAc溶液添加到MTBE和庚烷的混合物中而获得的。在一些实施例中,固体III是通过将III的EtOAc溶液添加到MTBE和庚烷的1∶1(体积∶体积)混合物中而获得的。
还提供了用于由式I硫酯的酸盐(指定为I*HX)制备式III化合物的方法,该方法包括:1)游离碱步骤,该游离碱步骤包括让盐I*HX与碱反应,以形成对应的游离碱I,以及2)还原步骤,该还原步骤包括用于将式I硫酯还原以提供式III化合物的方法,如本文所披露的。
在一些实施例中,游离碱步骤在包含MTBE和H2O的溶剂混合物中进行。在一些实施例中,Na2CO3用于游离碱步骤。在一些实施例中,游离碱I作为固体获得。在一些实施例中,游离碱I是通过向游离碱I在MTBE和H2O中的溶液添加正庚烷,而作为固体获得的。在一些实施例中,用正庚烷洗涤固体游离碱I。
在一些实施例中,式I*HX化合物为化合物5*HCl。
还提供了用于制备式I硫酯的方法,该方法包括使用适当的偶联剂,使式V羧酸化合物与式VI硫醇化合物反应:
其中:
n为1或2;
m为0至12;
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;并且
R3为被卤素、氰基或杂芳基取代的苯基;
其中R6如上所定义。
在某些实施例中,R1和R2合在一起形成含氮杂环烷基,该含氮杂环烷基可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代。
在某些实施例中,该含氮杂环烷基选自:
在某些实施例中,该含氮杂环烷基为:
在某些实施例中,该含氮杂环烷基任选地被介于0个与3个之间的选自烷基和氧代的R6基团取代。
在某些实施例中,R3为被杂芳基取代的苯基。
在某些实施例中,R3为被选自由以下项组成的组的杂芳基取代的苯基:
在某些实施例中,R3为被
在某些实施例中,n为1。
在某些实施例中,m为11。
用于使羧酸根基团与胺、醇和硫醇缩合以提供酰胺、酯和硫酯的偶联剂是有机合成领域的技术人员所熟知的。实例可以在下列文献中找到:Montalbetti和Falque,Tetrahedron[四面体],2005,61,10827-10852;T.M.Vishwanatha,M.Samarasimhareddy,V.V.Sureshbabu,Synlett[合成有机化学快报],2012,23,89-92;B.Neises,W.Steglich,Angew.Chem.Int.Ed.[应用化学国际版],1978,17,522-524,以及别的地方找到。
在某些实施例中,用于化合物反应的偶联剂为1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺(EDCI)或其盐。在一些实施例中,偶联剂为EDCI的盐酸盐。在一些实施例中,使用相对于V至多1.5当量的EDCI。在一些实施例中,使用相对于V至多1.2当量的EDCI。在一些实施例中,使用相对于V至多1.1当量的EDCI。
在一些实施例中,式V化合物与式VI化合物之间的反应还包括4-二甲基氨基吡啶(DMAP)。在一些实施例中,DMAP以催化量存在。在一些实施例中,使用相对于V至多0.2当量的DMAP。在一些实施例中,使用相对于V至多0.1当量的DMAP。在一些实施例中,使用相对于V至多0.05当量的DMAP。
在一些实施例中,式V化合物与式VI化合物之间的反应在卤代脂族溶剂中进行。在一些实施例中,该反应在DCM中进行。
还提供了用于制备式I硫酯的酸盐的方法,该方法包括:1)硫酯形成步骤,该硫酯形成步骤包括如本文所披露的用于合成式I硫酯的方法,以及2)盐形成步骤,该盐形成步骤包括与酸HX反应,以形成对应的式I盐(指定为I*HX):
在某些实施例中,硫酯形成步骤之后直接进行盐形成步骤。在某些实施例中,在硫酯形成步骤中形成的式I硫酯在不分离式I硫酯的情况下直接进行到盐形成步骤。
在一些实施例中,硫酯形成步骤在溶液中进行。在一些实施例中,硫酯形成步骤在DCM溶液中进行。在一些实施例中,在盐形成步骤之前减小溶液的体积。
在一些实施例中,盐形成步骤在包含以下各项中的一种或多种的溶剂中进行:乙醇和乙腈。在一些实施例中,盐形成步骤在由乙醇和乙腈组成的溶剂中进行。
在一些实施例中,含氮杂环烷基或杂芳基环包含碱性氮。
在一些实施例中,含氮杂环烷基或杂芳基环为哌啶,该哌啶可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代。
在一些实施例中,式VI中的m为11。
在一些实施例中,酸HX为无机酸。
在一些实施例中,无机酸为HCl。在一些实施例中,将无机酸作为乙醇溶液添加到反应混合物中。
在一些实施例中,I*HX为固体。
在一些实施例中,通过过滤从反应混合物获得I*HX。在一些实施例中,用乙腈洗涤固体I*HX。
还提供了用于由谷氨酸制备其中n为1的式V化合物(式XII化合物)的方法,该方法包括以下步骤:
a.使受保护的谷氨酸酯VII与适当的杂环VIII反应,以提供式IX化合物:
其中:
P为一价氮保护基团;
Rx为烷基基团;并且
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;
其中R6如上所定义;
b.从式IX化合物的谷氨酸氨基基团除去保护基团,以提供式X化合物:
c.使式X化合物与适当的取代苯甲酸反应,以提供式XI化合物:
其中:
R3为被卤素、氰基或杂芳基取代的苯基;
以及
d.将式XI化合物的酯基团转变为羧酸,以提供式XII化合物:
在某些实施例中,Rx为甲基。
在本发明中适合用作P的一价氮保护基团是有机合成领域的技术人员所熟知的,在例如T.W.Green,P.G.M.Wuts,Protective Groups in Organic Synthesis[有机合成中的保护基团],Wiley-Interscience,New York,1999,第503至507页、第518至525页、第531至537页、第550至558页、第564至566页、第579至580页、第583至584页、第586至590页、第604至607页、第736至747页中以及别的地方有所描述。在某些实施例中,P为叔丁氧基羰基(Boc)。
在某些实施例中,R1和R2合在一起形成含氮杂环烷基,该含氮杂环烷基可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代。
在某些实施例中,该含氮杂环烷基选自:
在某些实施例中,该含氮杂环烷基为:
在某些实施例中,该含氮杂环烷基任选地被介于0个与3个之间的选自烷基和氧代的R6基团取代。
在某些实施例中,R3为被杂芳基取代的苯基。
在某些实施例中,R3为被选自由以下项组成的组的杂芳基取代的苯基:
在某些实施例中,R3为被
在某些实施例中,式VII羧酸与式VIII杂环的反应通过首先在溶剂中用4-甲基吗啉和新戊酰氯处理式VII化合物来进行。
在某些实施例中,4-甲基吗啉和新戊酰氯以相对于式VII化合物等摩尔的量存在。
在某些实施例中,溶剂为IPA。在某些实施例中,以相对于式VII化合物为10倍体积的量使用IPA。
在某些实施例中,将式VII化合物、新戊酰氯和4-甲基吗啉的混合物置于IPA中在-5℃至5℃下搅拌2小时,然后添加式VIII杂环。在某些实施例中,将式VII化合物、新戊酰氯、4-甲基吗啉和式VIII杂环在IPA中的混合物在0℃至5℃下搅拌1小时,然后用5%NaHCO3水性溶液淬灭。
可以使用适合于特定保护基团的反应条件来除去氮保护基团。这些条件是有机合成领域的技术人员已知的,并且可以例如在来自本文先前引用的Green等人的引用页中找到。
在某些实施例中,从式IX化合物除去氮保护基团在酸性条件下进行。在某些实施例中,酸性条件包括将1.5M HCl的乙酸乙酯(EtOAc)溶液添加到式IX化合物的EtOAc溶液中。
在某些实施例中,将式IX化合物的EtOAc溶液冷却到0℃至5℃,然后添加1.5M HCl的乙酸乙酯(EtOAc)溶液。在某些实施例中,在添加HCl溶液之后将反应混合物搅拌至少12小时。在某些实施例中,使HCl气体通过反应混合物,以完成对氮保护基团的去除。
在某些实施例中,从式IX化合物除去氮保护基团在包含以下各项中的一种或多种的溶剂中进行:环丁砜和二氧六环。在某些实施例中,溶剂包含环丁砜和二氧六环这两者。在某些实施例中,式X化合物作为固体获得。在某些实施例中,式X固体化合物是通过将该化合物的溶液添加到一定量的甲基叔丁基醚(MTBE)中而获得的。在某些实施例中,用MTBE洗涤式X化合物。
用于使羧酸根基团与胺、醇和硫醇缩合以提供酰胺、酯和硫酯的偶联剂是有机合成领域的技术人员所熟知的,如前所述。合适的试剂和方法的实例可以例如在本文先前引用的参考文献书目中找到。此类偶联剂和条件可以用于将被取代的苯甲酸与式X化合物偶联,以提供式XI化合物。
在某些实施例中,式X化合物与被取代的苯甲酸的反应是使用1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺盐酸盐(EDC)连同羟基苯并三唑(HOBt)一起进行的。
在某些实施例中,用于提供式XI化合物的偶联反应在作为溶剂的THF中进行。在某些实施例中,使用相对于式X化合物13倍体积的THF。
在某些实施例中,用于提供式XI化合物的偶联反应在作为溶剂的DCM中进行。在某些实施例中,使用相对于式X化合物25倍体积的DCM。
在某些实施例中,将4-甲基吗啉添加到式X化合物的THF溶液中,然后添加被取代的苯甲酸、EDC和HOBt。
在某些实施例中,将4-甲基吗啉添加到式X化合物的THF溶液中,并将所得溶液冷却到低于10℃,然后添加被取代的苯甲酸。在某些实施例中,将该溶液在低于10℃下搅拌约30分钟。在某些实施例中,在添加4-甲基吗啉和被取代的苯甲酸并搅拌之后,在低于10℃下将EDC和HOBt添加到经搅拌的溶液中。
在某些实施例中,将EDC、HOBt、被取代的苯甲酸和式X化合物的混合物在10℃至20℃下搅拌至少15小时。
在某些实施例中,将式XI化合物分离包括以下步骤:
a.用乙酸乙酯稀释反应混合物;
b.添加足量6M NaOH水性溶液,将pH调节到9至10;
C.添加0.5w/w的氯化钠;
d.分离各相,用EtOAc萃取水层;以及
e.干燥并浓缩合并的有机层。
在某些实施例中,将式XI化合物分离包括以下步骤:
a.添加足量的10重量%Na2CO3水性溶液,将pH调节到9至10;
b.添加NaCl水性溶液;
c.添加IPAc;
d.添加正庚烷;
e.除去形成的固体;以及
f.用正庚烷洗涤固体。
水解式XI化合物的Rx酯部分以提供式XII羧酸根可以通过用于水解酯的如有机合成领域的技术人员所熟知的标准方法来进行。
在某些实施例中,水解式XI化合物以提供式XII化合物是在碱性条件下进行的。
在某些实施例中,水解式XI化合物是在包含低级原醇的溶剂中进行的。在一些实施例中,低级原醇为甲醇。在一些实施例中,用于水解的溶剂包含甲醇和THF。
在某些实施例中,水解式XI化合物包括将1M NaOH水性溶液添加到式XI化合物在THF和甲醇中的已冷却到-10℃的溶液中。
在一些实施例中,THF和甲醇各自以相对于式XI化合物为约2.2倍体积的量存在。
在一些实施例中,将1M NaOH水性溶液添加到式XI化合物的THF和甲醇溶液中,同时保持温度低于10℃。在一些实施例中,在添加1M NaOH之后,将反应混合物在低于10℃的温度下搅拌约6小时。
在某些实施例中,将式XII化合物分离包括以下步骤:
a.用庚烷稀释反应混合物;
c.将水相搅拌30分钟;
d.过滤水相,用THF洗涤滤饼;以及
e.浓缩滤液,得到式XII化合物。
在某些实施例中,水解式XI化合物以提供式XII化合物是在基本上无水的条件下进行的。
在某些实施例中,水解式XI化合物以提供式XII化合物是用Me3SiOK完成的。
在某些实施例中,水解式XI化合物以提供式XII化合物是在四氢呋喃中进行的。
在某些实施例中,式XII化合物作为固体获得。在某些实施例中,式XII化合物是从包含以下各项中的一种或多种的溶剂获得的:MeOH和CH3CN。在某些实施例中,式XII化合物是从由MeOH和CH3CN组成的溶剂获得的。在某些实施例中,式XII化合物是从由MeOH和CH3CN的1∶2(体积∶体积)混合物组成的溶剂获得的。
还提供了用于制备N-[2S)-1-(4-(甲基)哌嗪-1-基)-5-[[(1R,2S)-2-(4-氟苯基)-环丙基]氨基]-1-氧代戊烷-2-基]-4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰胺(化合物7)的双甲苯磺酸盐(化合物8)的方法,该方法包括:
将对甲苯磺酸水合物的THF溶液添加到经搅拌的化合物7的THF和IPA溶液中。
在某些实施例中,反应混合物的温度为25℃±5℃。
在某些实施例中,将相对于化合物7为2.5当量的对甲苯磺酸水合物添加到化合物7的THF和IPA溶液中。
在某些实施例中,THF和IPA合并的总体积为约12倍体积。
在某些实施例中,将化合物7与对甲苯磺酸水合物在THF和IPA中的混合物搅拌至少15小时。
在某些实施例中,用于制备N-[2S)-1-(4-(甲基)哌嗪-1-基)-5-[[(1R,2S)-2-(4-氟苯基)-环丙基]氨基]-1-氧代戊烷-2-基]-4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰胺(化合物7)的双甲苯磺酸盐(化合物8)的方法还包括以下步骤:
a.过滤反应混合物;以及
b.用IPA洗涤滤饼;以及
c.将滤饼在35℃±5℃下真空干燥至少15小时。
在某些实施例中,使用约4倍体积的IPA来洗涤滤饼。
在某些实施例中,用于制备N-[2S)-1-(4-(甲基)哌嗪-1-基)-5-[[(1R,2S)-2-(4-氟苯基)-环丙基]氨基]-1-氧代戊烷-2-基]-4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰胺(化合物7)的双甲苯磺酸盐(化合物8)的方法还包括从甲醇中重结晶滤饼。
在某些实施例中,使用相对于滤饼介于约10倍体积与约20倍体积之间的甲醇来进行重结晶。
在某些实施例中,用于制备N-[2S)-1-(4-(甲基)哌嗪-1-基)-5-[[(1R,2S)-2-(4-氟苯基)-环丙基]氨基]-1-氧代戊烷-2-基]-4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰胺(化合物7)的双甲苯磺酸盐(化合物8)的方法还包括从甲醇和乙酸乙酯的混合物中重结晶滤饼的步骤。
在某些实施例中,使用相对于滤饼约5倍体积的甲醇和约5倍体积的乙酸乙酯来进行重结晶。
在某些实施例中,将滤饼在甲醇和乙酸酯中的混合物加热到50℃±5℃并搅拌至少3小时。
某些实施例还包括将混合物冷却到25℃±5℃,并且在过滤之前搅拌至少3小时。
还提供了用于由谷氨酸制备其中n为1的式IV化合物(式XVI化合物)的方法,该方法包括以下步骤:
a.使受保护的谷氨酸酯VII与适当的杂环VIII反应,以提供式IX化合物:
其中:
P为一价氮保护基团;
Rx为烷基基团;并且
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;
其中R6如上所定义;
b.从式IX化合物的谷氨酸氨基基团除去保护基团,以提供式X化合物:
其中:
P为一价氮保护基团;
Rx为烷基基团;并且
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;
其中R6如上所定义;
c.使式X化合物与适当的取代苯甲酸反应,以提供式XI化合物:
其中:
Rx为烷基基团;并且
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;并且
R3为被卤素、氰基或杂芳基取代的苯基;
其中R6如上所定义;
d.将式XI化合物的酯基团转变为羧酸,以提供式XII化合物:
其中:
Rx为烷基基团;并且
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;并且
R3为被卤素、氰基或杂芳基取代的苯基;
其中R6如上所定义;
e.将式XII化合物转变为式XIII化合物,其包括1)硫酯形成步骤,该硫酯形成步骤包括与式VI化合物反应,和2)盐形成步骤,该盐形成步骤包括与HX反应:
其中:
m为0至12;
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;
R3为被卤素、氰基或杂芳基取代的苯基;并且
其中R6如上所定义;
f.将式XIII化合物转变为式XIV化合物,其包括:1)游离碱步骤,该游离碱步骤包括让盐XIII与碱反应,和2)还原步骤:
其中:
m为0至12;
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;
R3为被卤素、氰基或杂芳基取代的苯基;并且
其中R6如上所定义;
g.通过在还原胺化条件下与式II化合物反应,将式XIV化合物转变为式XV化合物:
其中:
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;并且
R3为被卤素、氰基或杂芳基取代的苯基;
R5选自芳基和杂芳基,其中任一者都可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;
其中R6如上所定义;
以及
h.通过与酸化合物HX反应,将式XV化合物转变为式XVI化合物:
其中:
R1和R2连同它们所附接的氮一起形成含氮杂环烷基或杂芳基环,该含氮杂环烷基或杂芳基环可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;并且
R3为被卤素、氰基或杂芳基取代的苯基;
R5选自芳基和杂芳基,其中任一者都可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代;
其中R6如上所定义。
在某些实施例中,Rx为甲基。
在某些实施例中,一价氮保护基团为氨基甲酸酯保护基团。
在某些实施例中,氨基甲酸酯保护基团选自Boc、CBz和Fmoc。
在某些实施例中,氨基甲酸酯保护基团为Boc。
在某些实施例中,R1和R2合在一起形成含氮杂环烷基,该含氮杂环烷基可以任选地被介于0个与3个之间的R6基团取代。
在某些实施例中,该含氮杂环烷基选自:
在某些实施例中,该含氮杂环烷基为:
在某些实施例中,该含氮杂环烷基任选地被介于0个与3个之间的选自烷基和氧代的R6基团取代。
在某些实施例中,R3为被杂芳基取代的苯基。
在某些实施例中,R3为被选自由以下项组成的组的杂芳基取代的苯基:
在某些实施例中,R3为被
在某些实施例中,式VII羧酸与式VIII杂环的反应通过首先在溶剂中用4-甲基吗啉和新戊酰氯处理式VII化合物来进行。
在某些实施例中,4-甲基吗啉和新戊酰氯以相对于式VII化合物等摩尔的量存在。
在某些实施例中,溶剂为IPA。在某些实施例中,以相对于式VII化合物为10倍体积的量使用IPA。
可以使用适合于特定保护基团的反应条件来除去氮保护基团。这些条件是有机合成领域的技术人员已知的,并且可以例如在来自本文先前引用的Green等人的引用页中找到。
在某些实施例中,从式IX化合物除去氮保护基团在酸性条件下进行。在某些实施例中,酸性条件包括将1.5M HCl的乙酸乙酯(EtOAc)溶液添加到式IX化合物的EtOAc溶液中。
在某些实施例中,从式IX化合物除去氮保护基团在包含以下各项中的一种或多种的溶剂中进行:环丁砜和二氧六环。在某些实施例中,溶剂包含环丁砜和二氧六环这两者。在某些实施例中,式X化合物作为固体获得。在某些实施例中,式X固体化合物是通过将该化合物的溶液添加到一定量的甲基叔丁基醚(MTBE)中而获得的。在某些实施例中,用MTBE洗涤式X化合物。
在某些实施例中,式X化合物与被取代的苯甲酸的反应是使用1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺盐酸盐(EDC)连同羟基苯并三唑(HOBt)一起进行的。
在某些实施例中,用于提供式XI化合物的偶联反应在作为溶剂的THF中进行。在某些实施例中,使用相对于式X化合物13倍体积的THF。
在某些实施例中,用于提供式XI化合物的偶联反应在作为溶剂的DCM中进行。在某些实施例中,使用相对于式X化合物25倍体积的DCM。
在某些实施例中,将4-甲基吗啉添加到式X化合物的THF溶液中,然后添加被取代的苯甲酸、EDC和HOBt。
在某些实施例中,将4-甲基吗啉添加到式X化合物的THF溶液中,并将所得溶液冷却到低于10℃,然后添加被取代的苯甲酸。在某些实施例中,将该溶液在低于10℃下搅拌约30分钟。在某些实施例中,在添加4-甲基吗啉和被取代的苯甲酸并搅拌之后,在低于10℃下将EDC和HOBt添加到经搅拌的溶液中。
在某些实施例中,将EDC、HOBt、被取代的苯甲酸和式X化合物的混合物在10℃至20℃下搅拌至少15小时。
在某些实施例中,将式XI化合物分离包括以下步骤:
a.添加足量的10重量%Na2CO3水性溶液,将pH调节到9至10;
b.添加NaCl水性溶液;
c.添加IPAc;
d.添加正庚烷;
e.除去形成的固体;以及
f.用正庚烷洗涤固体。
水解式XI化合物的Rx酯部分以提供式XII羧酸根可以通过用于水解酯的如有机合成领域的技术人员所熟知的标准方法来进行。
在某些实施例中,水解式XI化合物以提供式XII化合物是在碱性条件下进行的。
在某些实施例中,水解式XI化合物以提供式XII化合物是在基本上无水的条件下进行的。
在某些实施例中,水解式XI化合物以提供式XII化合物是用Me3SiOK完成的。
在某些实施例中,水解式XI化合物以提供式XII化合物是在四氢呋喃中进行的。
在某些实施例中,式XII化合物作为固体获得。在某些实施例中,式XII化合物是从包含以下各项中的一种或多种的溶剂获得的:MeOH和CH3CN。在某些实施例中,式XII化合物是从由MeOH和CH3CN组成的溶剂获得的。在某些实施例中,式XII化合物是从由MeOH和CH3CN的1∶2(体积∶体积)混合物组成的溶剂获得的。
在某些实施例中,用于式XII化合物反应的偶联剂为1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺(EDCI)或其盐。在一些实施例中,偶联剂为EDCI的盐酸盐。在一些实施例中,使用相对于XII至多1.5当量的EDCI。在一些实施例中,使用相对于XII至多1.2当量的EDCI。在一些实施例中,使用相对于XII至多1.1当量的EDCI。
在一些实施例中,式XII化合物与式VI化合物之间的反应还包括4-二甲基氨基吡啶(DMAP)。在一些实施例中,DMAP以催化量存在。在一些实施例中,使用相对于V至多0.2当量的DMAP。在一些实施例中,使用相对于V至多0.1当量的DMAP。在一些实施例中,使用相对于V至多0.05当量的DMAP。
在一些实施例中,式XII化合物与式VI化合物之间的反应在卤代脂族溶剂中进行。在一些实施例中,该反应在DCM中进行。
在一些实施例中,游离碱步骤在包含MTBE和H2O的溶剂混合物中进行。在一些实施例中,Na2CO3用于游离碱步骤。在一些实施例中,游离碱XIII作为固体获得。在一些实施例中,游离碱XIII是通过向游离碱I在MTBE和H2O中的溶液添加正庚烷,而作为固体获得的。在一些实施例中,用正庚烷洗涤固体游离碱XIII。
在一些实施例中,将式XIII硫酯化合物还原利用了硅烷还原剂。在一些实施例中,硅烷还原剂为三乙基硅烷。在一些实施例中,使用相对于式I硫酯为4.0当量的三乙基硅烷。
在一些实施例中,该还原还包括钯碳。在某些实施例中,还原可以如Fukuyama等人:H.Tokuyama,S.Yokoshima,S.-C.Lin,L.Li、T.Fukuyama,Synthesis[合成],2002,1121-1123所述进行。
在一些实施例中,还原还包括Pd(0)催化剂。在一些实施例中,Pd(0)催化剂为钯碳。在一些实施例中,钯碳是无水的。在一些实施例中,使用相对于式XIII硫酯为约2.5重量%的钯碳催化剂。在一些实施例中,使用相对于式XIII硫酯为约5重量%的钯碳催化剂。在一些实施例中,使用相对于式XIII硫酯为约7.5重量%的钯碳催化剂。在一些实施例中,使用相对于式XIII硫酯为约10重量%的钯碳催化剂。
在一些实施例中,钯碳为蛋壳型催化剂。在一些实施例中,钯碳为未还原的蛋壳型催化剂。在一些实施例中,钯碳为完全还原的蛋壳型催化剂。在一些实施例中,使用相对于式I硫酯为约5重量%的蛋壳型催化剂。在一些实施例中,使用相对于式I硫酯为约10重量%的蛋壳型催化剂。
在一些实施例中,还原还包括Pd(II)催化剂。在一些实施例中,Pd(II)催化剂为Pd(OH)2。在一些实施例中,Pd(II)催化剂为Pd(OAc)2。
在某些实施例中,将式XIII硫酯化合物还原在选自冰醋酸、四氢呋喃、二氯甲烷和丙酮的溶剂中进行。在某些实施例中,将式XIII硫酯化合物还原在冰醋酸和四氢呋喃的共溶剂混合物中进行。
在一些实施例中,还原步骤还利用了冰醋酸。在一些实施例中,使用相对于XIII至少0.5当量的冰醋酸。在一些实施例中,使用相对于XIII至少1.0当量的冰醋酸。在一些实施例中,使用相对于XIII至少1.1当量的冰醋酸。在一些实施例中,使用相对于XIII至少1.2当量的冰醋酸。
在某些实施例中,将式XIII硫酯化合物还原包括将三乙基硅烷添加到式XIII硫酯化合物和钯碳在四氢呋喃和冰醋酸中的混合物中。
在某些实施例中,将式XIII硫酯化合物还原包括将三乙基硅烷添加到式XIII硫酯化合物和钯碳在四氢呋喃和冰醋酸中的混合物中,其中所述混合物已冷却到5℃±5℃。
在某些实施例中,经至少30分钟添加三乙基硅烷。
在某些实施例中,将式XIII硫酯化合物还原还包括在添加三乙基硅烷后,经约1.5小时让反应混合物升温至约20℃。
在某些实施例中,将式XIII硫酯化合物还原还包括在15℃±5℃下将反应混合物搅拌至少3小时。
在某些实施例中,将式XIII硫酯化合物还原还包括以下步骤:
1)搅拌反应混合物,直到通过HPLC分析确定式XIII硫酯化合物以小于5%的面积百分比存在为止;
2)过滤并浓缩所得的混合物。
在一些实施例中,式XIV化合物作为固体获得。在一些实施例中,式XIV固体化合物是从包含以下各项中的一种或多种的溶剂获得的:EtOAc、MTBE和庚烷。在一些实施例中,式XIV固体化合物是从由EtOAc、MTBE和庚烷组成的溶剂获得的。在一些实施例中,式XIV固体化合物是通过将式XIV化合物的EtOAc溶液添加到MTBE和庚烷的混合物中而获得的。在一些实施例中,式XIV固体化合物是通过将式XIV化合物的EtOAc溶液添加到MTBE和庚烷的1∶1(体积∶体积)混合物中而获得的。
在某些实施例中,还原胺化在选自低级原醇、2,2,2-三氟乙醇、二氯甲烷、四氢呋喃和乙腈的溶剂中进行。
在某些实施例中,还原胺化在包含低级原醇的溶剂中进行。
在某些实施例中,低级原醇为甲醇。
在某些实施例中,低级原醇为共溶剂混合物的一部分。
在某些实施例中,共溶剂混合物包含甲醇和四氢呋喃。在一些实施例中,共溶剂混合物由甲醇和四氢呋喃的2∶1(体积∶体积)混合物组成。
在某些实施例中,将NaBH4添加到式XIV化合物和式II化合物在甲醇和四氢呋喃的混合物中的已冷却到-5℃±5℃的混合物中。
在某些实施例中,将NaBH4添加到式XIV化合物和式II化合物在甲醇和四氢呋喃的混合物中的已冷却到-10℃±5℃的混合物中。
在一些实施例中,使用相对于式XIV化合物至多1.1当量的式II化合物。
在一些实施例中,使用相对于式XIV化合物至多1.0当量的式II化合物。
在某些实施例中,分批添加NaBH4,同时将反应混合物的温度维持在低于22℃。
在某些实施例中,至少分5批,两批之间至少间隔15分钟添加NaBH4。
在某些实施例中,在完成分批添加NaBH4之后,在20℃±5℃下搅拌反应混合物。
在某些实施例中,将反应混合物在20℃±5℃下搅拌至少1小时。
在某些实施例中,将反应混合物在20℃±5℃下搅拌至少3小时。
在某些实施例中,还原胺化还包括以下步骤:
1)搅拌反应混合物,直到通过HPLC分析确定化合物7以至少75%的面积百分比存在为止;
2)添加饱和NH4Cl,将反应混合物淬灭;以及
3)浓缩所得混合物。
在某些实施例中,还原胺化还包括以下步骤:
1)在水相与IPAc相之间分配产物;
2)添加NaOH,将水相的pH调节到9至10;
3)分离IPAc相;
4)用IPAc萃取水相;以及
5)从合并的IPAc相中获得化合物7。
在某些实施例中,酸化合物HX为无机酸。
在某些实施例中,酸化合物HX为芳烃磺酸。
在某些实施例中,芳烃磺酸为对甲苯磺酸。
在某些实施例中,式XV化合物的反应在25℃±5℃下进行。
在某些实施例中,将相对于式XV化合物为2.5当量的对甲苯磺酸水合物添加到式XV化合物的THF和IPA溶液中。
在某些实施例中,THF和IPA合并的总体积为约12倍体积。
在某些实施例中,将式XV化合物与对甲苯磺酸水合物在THF和IPA中的混合物搅拌至少15小时。
在某些实施例中,用于制备式XVI化合物的方法还包括以下步骤:
a.过滤反应混合物;以及
b.用IPA洗涤滤饼;以及
c.将滤饼在35℃±5℃下真空干燥至少15小时。
在某些实施例中,使用约4倍体积的IPA来洗涤滤饼。
在某些实施例中,用于制备式XVI化合物的方法还包括从甲醇中重结晶滤饼。
在某些实施例中,使用相对于滤饼介于约10倍体积与约20倍体积之间的甲醇来进行重结晶。
在某些实施例中,用于制备式XVI化合物的方法还包括从甲醇和乙酸乙酯的混合物中重结晶滤饼的步骤。
在某些实施例中,使用相对于滤饼约5倍体积的甲醇和约5倍体积的乙酸乙酯来进行重结晶。
在某些实施例中,将滤饼在甲醇和乙酸酯中的混合物加热到50℃±5℃并搅拌至少3小时。
某些实施例还包括将混合物冷却到25℃±5℃,并且在过滤之前搅拌至少3小时。
用于制备化合物的一般合成方法
以下发明内容通过以下实例进一步展示。
在以下实例和整个披露内容中,可以使用以下缩写:MeCN=乙腈;DCM=二氯甲烷;DMAP=4-二甲氨基吡啶;EDCI=1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺;EtOAc=乙酸乙酯;EtOH=乙醇;H2O=水;IPA=异丙醇;IPAc=乙酸异丙酯;MeOH=甲醇;MTBE=甲基叔丁基醚;NMM=N-甲基吗啉=4-甲基吗啉;STAB=三乙酰氧基硼氢化钠;THF=四氢呋喃;1H-NMR=质子核磁共振;HPLC=高效液相色谱;UPLC=超高效液相色谱。可以使用其他缩写,这些缩写对于本领域技术人员来说将是熟悉的。
实例1:制备呈游离碱的(1R,2S)-2-(4-氟苯基)环丙烷-1-胺(9)
为12L玻璃圆底烧瓶配备N2排出阀。向烧瓶中装入DCM(2510mL)、(1R,2S)-2-(4-氟苯基)环丙烷-1-胺盐酸盐(505.00g)和2NNaOH溶液(NaOH,224.10g;纯化水,2810mL)。将烧瓶内容物搅拌15分钟,确认溶解。使各层分离,用DCM(1280mL)萃取水相。合并的有机相表现为不透明液体,将其转移到旋转蒸发器的球泡中,在低于40℃下和真空下浓缩成残余物。在25℃±5℃下真空干燥球泡,得到化合物9(413g,101%),为橙色油状物。
实例2:合成N-[(2S)-1-(4-(甲基)哌嗪-1-基)-5-[[(1R,2S)-2-(4-氟苯基)-环丙基]氨基]-1-氧代戊烷-2-基]-4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰胺(7)及其双甲苯磺酸盐(8)
方案1.合成5。
步骤1:合成(4S)-4-[[(1,1-二甲基乙氧基)羰基]氨基]-5-(4-甲基哌嗪-1-基)-5-氧代戊酸甲酯(1)
在N2气氛下,伴随搅拌使Boc-Glu(OMe)-OH(1900g)在IPAc(10倍体积)中的溶液冷却到-5℃至5℃。将温度保持在-5℃至5℃的同时,添加NMM(801.2g;1.1当量)和新戊酰氯(920.7g;1.05当量),在该温度下将所得的混合物搅拌2小时。将温度保持介于-5℃至5℃之间的同时,添加4-甲基哌嗪(1.05当量),在-0℃至5℃下将所得的混合物搅拌1小时。然后通过添加5%NaHCO3淬灭反应,用IPAc萃取水层三次,每次都使用2倍体积的IPAc萃取。合并有机相,用盐水洗涤后置于Na2SO4上方干燥。得到化合物1,为黄色油状物,1.91kg,收率76%。
步骤2:合成(4S)-4-氨基-5-(4-甲基哌嗪-1-基)-5-氧代戊酸甲酯盐酸盐(2)
在搅拌下将化合物1(1.91kg)在EtOAc(EtOAc;5倍体积)中的溶液冷却到0℃至5℃,然后在将温度保持介于0℃至5℃之间的同时,用1.05当量的1.5M HCl在20L EtOAc中的溶液处理。将所得的混合物在0℃至5℃下搅拌12小时,然后使HCl气体通过该混合物3小时。将所得的混合物再搅拌19小时,然后通过过滤,用EtOAc洗涤滤饼(2×4L),将合并的有机相在20℃至30℃下真空浓缩,得到化合物2(1.3kg;收率74%),为白色固体。
步骤3:合成(4S)-4-[4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰基氨基]-5-(4-甲基哌嗪-1-基)-5-氧代戊酸甲酯(3)
在N2气氛下,伴随搅拌将4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酸(101,597.8g;1.0当量)溶解在THF(7.8L;13倍体积)和水(1.38L;2.3倍体积)中。添加NMM(1119.5g;3.5当量),在搅拌下溶解,然后将反应冷却到低于10℃。将反应混合物的温度保持在10℃或低于10℃的同时,添加化合物2(1200g;1.2当量),并且将所得的混合物在低于10℃下搅拌30分钟。向反应混合物中添加HOBt(470.0g;1.1当量)和EDCI(666.8g;1.1当量),同时将温度维持在低于10℃,然后将所得的混合物在10℃至20℃下搅拌24小时。然后添加EtOAc(7.8L;13倍体积),之后添加6M NaOH(2.16L),以将pH调节到介于9与10之间。然后将固体NaCl(300g;0.5w/w)添加到反应混合物中。分离各层,用另外的水稀释水层,然后用EtOAc萃取(3.6L,5×6倍体积)。用盐水(3.72L,6.2倍体积)洗涤合并的有机相,置于Na2SO4上方干燥之后真空浓缩。用MTBE(2×10倍体积)洗涤残余物,然后过滤。取滤饼在35℃至40℃下真空干燥,得到820g化合物3,收率67.9%。
步骤4:合成(4S)-4-[4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰基氨基]-5-(4-甲基哌嗪-1-基)-5-氧代戊酸(4)
在N2气氛下,伴随搅拌将化合物3(1214g;1.0当量)添加到MeOH(2.64L;2.2倍体积)和THF(2.64L;2.2倍体积)的混合物中。将所得的悬浮液冷却到-10℃,添加3.13L(1.07当量)1MNaOH溶液,同时保持温度低于10℃。将所得的混合物在低于10℃下搅拌6小时,然后添加庚烷(7.2L;6倍体积)。将所得的混合物搅拌至少30分钟,然后使其静置至少30分钟。分离各相,将水相转移到另一个反应贮器中。添加 IR120(1100g;0.95w/w)珠粒,以将pH调节到6.3。将混合物搅拌30分钟之后,过滤反应混合物,用THF(2.4L;2倍体积)洗涤滤饼。在35℃±5℃下将滤液真空浓缩到2倍至3倍体积。向残余物中加入THF(2L;1.7倍体积),然后在35℃±5℃下真空浓缩。再将该过程重复5次。将粗制的油状物溶解于MeOH(2.4L×2)中,然后浓缩。在25℃±5℃下将粗制的物质再次溶解于MeOH(2.4L)和MTBE(12L;10倍体积)中,搅拌过夜。然后过滤混合物并用2.4L MTBE洗涤,将滤饼置于45℃下真空干燥。将获得的固体用DCM(DCM;3.6L;3倍体积)浆化,在25℃±5℃下搅拌5小时,然后过滤,用MTBE(2.4L;2倍体积)洗涤滤饼。取滤饼在35℃至45℃下真空干燥,得到950g(81%)化合物4,为白色固体。
步骤5:合成(4S)-4-[4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰基氨基]-5-(4-甲基哌嗪-1-基)-5-氧代戊烷硫代酸十二烷基酯(5)
在N2气氛下,伴随搅拌将化合物4(926g;1.0当量)添加到9.3L(10倍体积)DCM中。用水-冰浴将所得的悬浮液冷却到0℃至5℃,然后在0℃至5℃下添加HS(CH2)11Me(561.66g,1.2当量),之后添加DMAP(14.13g,0.05当量)。分批添加EDC盐酸盐(531.97g;1.2当量),同时将温度保持在0℃至5℃。将所得的混合物在0℃至5℃下搅拌1小时,然后在10℃至20℃下搅拌14小时。接下来,添加纯化水(1.852L;2倍体积)并继续搅拌1小时。分离各层,用DCM(1.85L×2)萃取水相。合并有机层,用盐水(2.8L)洗涤,置于Na2SO4上方干燥之后,利用10倍重量的硅胶施加于硅胶色谱柱上。使用DCM/MeOH,利用从100∶0至20∶1的DCM/MeOH洗脱梯度将产物洗脱,总共使用了约80倍体积的洗脱液。合并含有纯产物的级分并浓缩,得到化合物5,为黄色浆状物。在30℃至40℃下将粗制的浆状物溶解于MTBE(2.8L;3倍体积)中,添加正庚烷(19.6L;21倍体积),然后将所得的混合物冷却到15℃至25℃。在该温度下利用机械搅拌将混合物搅拌16小时,然后过滤,用2.8L(3倍体积)庚烷洗涤滤饼。取滤饼真空干燥,得到1164g(82.5%)化合物5,为白色固体。
方案2.由5合成7与8。
步骤6:合成(4S)-4-[4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰基氨基]-5-(4-甲基哌嗪-1-基)-5-氧代戊醛(6)
为50L带夹套的玻璃反应器配备热控制单元和N2排出阀,然后装入THF(9L)与化合物5(900.06g)。搅拌内容物,直到观察到溶液为止。然后将钯碳(湿润度50%,140.00g)装入反应器中,并将批料温度调节到5℃±5℃。在1分钟内向该批料中添加冰醋酸(140mL),然后在77分钟内添加三乙基硅烷(1240mL)。在5℃±5℃下搅拌1小时期间,观察到13℃的放热效应,批料温度在约15分钟内从6℃升至19℃。放热效应逐渐平息,批料温度恢复到5℃±5℃。然后在86分钟内将批料温度斜升到20℃。通过HPLC(TM.04760)监测反应进度,直到化合物5的面积百分比小于5%为止。
将反应物通过垫和在DCM(0.5L)中浆化的松散(353g)过滤,得到约3cm的滤饼高度。用DCM(3×2L)洗涤反应器,然后使用洗涤液冲洗滤饼。过滤得到滤液,置于旋转蒸发器上在低于40℃下真空浓缩成残余物。总浓缩时间为3小时48分钟。向旋转蒸发器的球泡中装入正庚烷(6L),使球泡在没有加热也没有抽真空的情况下旋转11小时。此后,轻轻倒出上清液。将残余物溶解在EtOAc(1800mL)中,然后添加正庚烷(6L)。将所得的悬浮液旋转3小时,然后轻轻倒出上清液。取残余物在低于30℃下,在32分钟内溶解在THF(6L)中。在低于40℃下,在20分钟内将所得的溶液浓缩至4倍体积(3650mL)。此后,对批料取样进行定量HPLC分析(TM.04761),得到浓度为154.95mg/mL的化合物6,将该批料储存在2℃至8℃下,用于步骤7。
步骤7:合成N-[2S)-1-(4-(甲基)哌嗪-1-基)-5-[[(1R,2S)-2-(4-氟苯基)-环丙基]氨基]-1-氧代戊烷-2-基]-4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰胺(7)
使用THF(2L)作为冲洗液,向50L反应器中装入化合物6的THF(3.650L)溶液。使用MeOH(5L)作为冲洗液,将化合物9(288g)的MeOH(3L)溶液添加到反应器中,将该批料搅拌2小时。此后,将批料温度冷却到-5℃±5℃。分10批添加NaBH4(56.00g),两批之间至少间隔15分钟,同时将批料温度维持在低于22℃。添加完成之后,将批料温度调节到20℃±5℃,并将所得的溶液搅拌18小时。对批料进行取样用于UPLC分析(TM.04762),得到83.8%的化合物7。将反应冷却到10℃±5℃,然后用低于25℃的NH4Cl(421.01g)纯水(890mL)溶液淬灭。将批料过滤,在低于40℃下浓缩至7倍体积。总浓缩时间为2小时7分钟。用IPAc(11L)稀释浓缩的溶液,然后在低于25℃下用2N NaOH溶液(NaOH,136.30g;纯化水,1700mL)处理。使各层分离,用IPAc(2L)萃取水相。用纯化水(1L)洗涤合并的有机层,过滤之后用IPAc(2×2L)冲洗反应器。将滤液在2小时30分钟内浓缩到2倍体积,然后用IPA(2×3L)交换溶剂。使用IPA(2×2L)将批料转移到反应器中。将THF(4L)装入反应器,对批料取样进行UPLC分析(TM.04762),测得化合物7的浓度为59.18mg/mL,化合物9为13.12%。将夹套温度调节到5℃±5℃,保留批料用于步骤8。
步骤8:合成N-[2S)-1-(4-(甲基)哌嗪-1-基)-5-[[(1R,2S)-2-(4-氟苯基)-环丙基]氨基]-1-氧代戊烷-2-基]-4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰胺的双甲苯磺酸盐(8)
将来自步骤7的批料的批料温度调节到20℃±5℃,然后向批料溶液中加入 AK树脂(843.79g)。在取样进行UPLC分析(TM.04762)之前,将反应器的内容物搅拌17小时,得到3.27%的化合物9(规格:相对于化合物7,化合物9≤2重量%)。将批料再搅拌24小时,然后第二次取样用于UPLC分析(TM.04762),得到0.91%的化合物9。滤出树脂,用预过滤的IPA(3L)冲洗。清洗反应器,确保没有固体残留,然后用预过滤的THF(10L)冲洗。经由在线过滤器将批料溶液返回反应器,然后用预过滤的THF(1070mL)冲洗管线。将温度调节到25℃±5℃,然后添加预过滤的TsOH·H2O溶液(TsOH·H2O,488.51g;THF,710mL)。用预过滤的THF(530mL)冲洗管线,将批料搅拌25小时21分钟。然后过滤批料,用预过滤的IPA(2×1060mL)冲洗。将滤饼在N2下调理42小时。此后,对滤饼取样用于UPLC分析(TM.04762,TM.04780)。
将滤饼转移到两个干燥托盘中,在35℃±5℃下真空干燥约255小时,以达到恒重。将批料再干燥72.5小时,然后进行MeOH重结晶。用预过滤的MeOH(7L)冲洗50L反应器,然后向该反应器中装入批料(770g)和预过滤的MeOH(12L)。将批料温度设定为65℃,回流在64℃下实现。批料在回流下搅拌30分钟之后仍然观察到固体。添加另外的预过滤MeOH(1540mL),以实现溶解。然后在2小时8分钟内将批料温度冷却到20℃±5℃,并将内容物搅拌17.5小时。此后,过滤批料,并用预过滤的MeOH将滤饼洗涤两次(1060mL和1070mL)。将滤饼在35℃±5℃下真空干燥约25.5小时,以达到恒重。得到578g(收率43%)化合物8,为白色固体。
HPLC方法
测试方法TM.04760、TM.04761和TM.04780
仪器条件:
表1
时间(分钟) | %A | %B |
0.0 | 95 | 5 |
10 | 65 | 35 |
15 | 5 | 95 |
20 | 5 | 95 |
20.1 | 95 | 5 |
25 | 95 | 5 |
测试方法TM.04762
仪器条件:
表2
时间(分钟) | %A | %B |
0.0 | 95 | 5 |
3 | 95 | 5 |
13 | 80 | 20 |
21 | 80 | 20 |
25 | 20 | 80 |
30 | 20 | 80 |
30.1 | 95 | 5 |
35 | 95 | 5 |
实例3:替代性合成N-[2S)-1-(4-(甲基)哌嗪-1-基)-5-[[(1R,2S)-2-(4-氟苯基)-环丙基]氨基]-1-氧代戊烷-2-基]-4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰胺(7)及其双甲苯磺酸盐(8)
方案3.合成5a。
步骤1:合成(4S)-4-[[(1,1-二甲基乙氧基)羰基]氨基]-5-(4-甲基哌嗪-1-基)-5-氧代戊酸甲酯(1)
在N2气氛下,伴随搅拌使Boc-Glu(OMe)-OH(35kg)在IPAc(311.5kg,10倍体积)中的溶液冷却到0℃至10℃。添加NMM(15.05kg;1.1当量)和新戊酰氯(16.8kg;1.05当量),同时将温度保持在0℃至10℃,在该温度下将所得的混合物搅拌1小时,此后让混合物升温到15℃至25℃。在该温度下将混合物搅拌3小时。抽取用于分析的样品显示,起始材料此时已经耗尽。然后通过添加5%NaHCO3(175L,5倍体积)淬灭反应,用IPAc(155.75kg,5倍体积×2)萃取水层。合并有机相,用25重量%的NaCl水性溶液(175L,5倍体积)洗涤,并且真空浓缩到约5倍体积。添加IPAc(311.5kg,10倍体积),并且将混合物真空浓缩到约5倍体积。抽取用于KF分析的样品显示H2O小于0.1%。然后用二氧六环(360.5kg,10倍体积)稀释残余物,在真空下浓缩到约5倍体积,得到42.55kg化合物1,为173.0L二氧六环中的粗制溶液。
步骤2:合成(4S)-4-氨基-5-(4-甲基哌嗪-1-基)-5-氧代戊酸甲酯盐酸盐(2)
在20℃至30℃下,将来自前一步骤的化合物1(42.55kg)在二氧六环中的溶液与环丁砜(375.3kg,7倍体积)和4M HCl的二氧六环(161.7kg,5.0当量)溶液混合。在25℃至30℃下将混合物搅拌5小时。抽取用于分析的样品显示,此时剩余2%的化合物1。然后在25℃±5℃下添加MTBE(377.8kg,12.0倍体积),将混合物搅拌1小时,然后离心。在N2下用MTBE(62.98kg,2.0倍体积)洗涤滤饼,得到三批化合物2(合并总重量:178.35kg,产物校正质量:31.3kg)。
步骤3:合成(4S)-4-[4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰基氨基]-5-(4-甲基哌嗪-1-基)-5-氧代戊酸甲酯(3)
在0℃至10℃下,将来自前一步骤的溶液(178.25kg;产物校正质量为31.3kg)和THF(171.81kg,13倍体积)与NMM(27.77kg,3.5当量)混合,然后与H2O(34.16kg,2.3倍体积)混合。在该温度下将混合物搅拌3小时,然后添加4-(1H-1,2,3)-三唑-1-基)苯甲酸(101,14.85kg,1.0当量)、HOBt(11.73kg,1.1当量)和EDCI(18.12kg,1.2当量)。在环境温度(20℃至30℃)下将混合物搅拌4小时。抽取用于分析的样品显示,此时剩余1.6%的101。然后将混合物用148.5kg(10倍体积)H2O稀释,通过添加NaOH(6M,59.4L,4.0倍体积)将pH调节到10至11。然后添加IPAc(132.17kg,10倍体积)和NaCl(58.4kg,4.0w/w),将混合物搅拌3小时。分离各层,用IPAc(10倍体积×4)萃取水层,用盐水(74.25L,5.0倍体积)洗涤合并的有机层,真空浓缩到约10倍体积。在40℃至50℃下向残余物中添加正庚烷(50.49kg,5倍体积),然后在该温度下将混合物搅拌2小时,接着冷却到5℃至15℃,再搅拌2小时。过滤除去所形成的固体,在35℃至45℃下真空干燥,得到化合物3(25.33kg;P:97.4%,55.4%),为浅黄色固体。
步骤4:合成(4S)-4-[4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰基氨基]-5-(4-甲基哌嗪-1-基)-5-氧代戊酸(4)
在反应器中,在20℃至30℃下将化合物3(21.0kg,1.0当量)、THF(186.9kg,10倍体积)和Me3SiOK(7.77kg,1.2当量)混合。在20℃至30℃下将混合物搅拌8.0小时。此时抽取用于分析的样品显示,化合物3已经耗尽。将庚烷(142.8kg,10倍体积)装入反应贮器,并将混合物搅拌12小时。轻轻倒出上清液,留下黄色油状物。然后添加H2O(21.0kg,1倍体积)和THF(161.5kg,10倍体积),在20℃至25℃下将混合物搅拌30分钟,然后添加IR120,以将pH调节到6.4。将混合物搅拌30分钟,过滤除去已形成的固体,然后用MeOH(82.95kg,5倍体积)冲洗。将合并的滤液浓缩到4倍至5倍体积。添加MeOH(82.95kg,5倍体积)和CH3CN(163.8kg,10倍体积),得到黄色溶液。将溶液浓缩到4倍至5倍体积。重复添加MeOH(82.95kg,5倍体积)和CH3CN(163.8kg,10倍体积)、之后浓缩到4倍至5倍体积的过程,直到针对样品的KF分析显示剩余的H2O小于1.0%为止。然后执行GC分析,以发现溶液中的MeOH/CH3CN比率。通过添加或蒸发调节MeOH的量,直到MeOH的总体积为2.0倍体积为止。将温度调节到30℃±5℃,在该温度下将溶液搅拌至少0.5小时。在该温度下将CH3CN(245.7kg,15倍体积)缓缓添加到溶液中,并将混合物搅拌至少2小时。然后将混合物冷却到15℃±5℃。通过过滤收集已经形成的固体,用CH3CN(40.95kg,2.5倍体积)洗涤,然后在45℃下真空干燥60小时,得到化合物4(5.63kg,P:96.1%,KF:1.5%,手性HPLC纯度:99.4%),为白色固体。
将来自前一步骤的滤液在40℃±5℃下真空浓缩到1倍至2倍体积。添加MeOH(20L,4.0倍体积),在15±℃下将混合物搅拌至少0.5小时。添加HCl(33重量%)的乙醇溶液,将pH调节到6.0至6.4。在15±℃下将混合物搅拌至少0.5小时。在40℃±5℃下将混合物真空蒸发到1倍至2倍体积。添加CH3CN(16L,4.0倍体积),在15±℃下将混合物搅拌至少0.5小时。添加另外的CH3CN(24L,6.0倍体积),在15℃±5℃下将混合物搅拌至少8小时。通过布氏漏斗过滤除去所形成的固体,用CH3CN(8L,2.0倍体积)洗涤,然后在40℃±5℃下真空干燥至少15小时,得到化合物4(5.9kg,P:97.4%)。
步骤5(a):合成(4S)-4-[4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰基氨基]-5-(4-甲基哌嗪-1-基)-5-氧代戊烷硫代酸十二烷基酯盐酸盐(5a)
在N2气氛下,伴随搅拌将化合物4(3.00kg;1.0当量)添加到45L(15倍体积)DCM中。将所得的悬浮液冷却到0℃至5℃,然后在0℃至5℃下添加HS(CH2)11Me(1.82kg,1.2当量),之后添加DMAP(46g,0.05当量)。分批添加EDC盐酸盐(1.73kg;1.2当量),同时将温度保持在0℃至5℃。将所得的混合物在0℃至5℃下搅拌1小时,然后升温到10℃至20℃。在该温度下将混合物搅拌至少4小时。每3.0小时±0.2小时抽取样品用于HPLC分析,直到化合物4的曲线下面积小于总面积的3.0%为止。此时,在搅拌下添加纯化水(15L;5.0倍体积),同时将温度维持在15℃±5℃。在该温度下继续搅拌至少1小时。分离各层,用DCM(15L,5.0倍体积)萃取水相。用盐水(5.0kg,溶剂为15L纯化水,5.0倍体积)洗涤合并的有机层,在40℃±5℃下真空蒸发到1倍至2倍体积。添加EtOH(24L,8.0倍体积),在40℃±5℃下将混合物真空蒸发到1倍至2倍体积。将EtOH(15L,5.0倍体积)和反应贮器在40℃±5℃下旋转至少0.5小时。在搅拌下添加EtOH(30L,10.0倍体积)。在25℃±5℃下滴加HCl(33重量%,994g,1.2当量)的乙醇溶液。在25℃±5℃下将混合物搅拌至少3小时。通过布氏漏斗过滤收集所形成的固体,用EtOH(6L,2.0倍体积)洗涤,然后在40℃±5℃下真空干燥至少15小时,得到化合物5a(4.20kg,纯度:93.4%,LOD:2.54%)。
方案4.由5a合成7与8。
步骤5(b):合成(4S)-4-[4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰基氨基]-5-(4-甲基哌嗪-1-基)-5-氧代戊烷硫代酸十二烷基酯(5)
在搅拌下将化合物5a(4.10kg,计算量为4.0kg)添加到MTBE(40L,10.0倍体积)中。在20℃±5℃下添加Na2CO3(2.05kg,溶剂为20L纯化H2O),在20℃±5℃下将混合物搅拌至少4小时。分离各层,用NaCl(6.67kg,溶剂为20L纯化水,每次洗涤使用5.0倍体积)将有机相洗涤2次,然后在35℃±5℃下真空浓缩到1倍至2倍体积。添加MTBE(4L,1.0倍体积),在35℃±5℃下将反应贮器旋转至少0.5小时。伴随搅拌添加正庚烷(8L,4.0倍体积),将混合物升温到40℃±5℃。在该温度下添加另外的正庚烷(60L,15.0倍体积),然后在该温度下将混合物搅拌1.0小时。然后将混合物冷却到0℃±5℃,并在该温度下搅拌至少3小时。然后将混合物升温到15℃±5℃,并在该温度下搅拌至少2小时。通过布氏漏斗过滤除去所得的固体,用正庚烷(8L,2.0倍体积)洗涤,然后在40℃±5℃下真空干燥至少15小时。取出样品用于KF分析,并继续干燥直到KF≤5%。
步骤6:合成(4S)-4-[4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰基氨基]-5-(4-甲基哌嗪-1-基)-5-氧代戊醛(6)
通过抽空至P≤0.08MPa吹扫反应贮器,之后添加N2,以达到大气压力。重复该循环共3次。添加THF(60.08kg,9.0倍体积),之后添加化合物5(7.50kg,1.0当量)。然后添加无水Pd/C(188g,2.5重量%)的THF(6.68kg,1.0倍体积)溶液。将反应贮器冷却到5℃±5℃。然后在该温度下添加冰醋酸(AcOH)(1.13kg,1.5当量),之后添加Et3SiH(6.00kg,4.0当量)。在5℃至20℃下将混合物搅拌至少1小时,然后在15℃±5℃下搅拌3小时±0.2小时。每3小时±0.2小时抽取样品用于HPLC分析,使反应继续进行,直到化合物5的曲线下面积≤总面积的5.0%为止。然后将反应混合物通过已经用THF(20.03kg,3.0倍体积)冲洗的(6.00kg)垫过滤。过滤之后,用THF(33.38kg,5.0倍体积)冲洗过滤垫。让合并的滤液通过微孔过滤器,然后在25℃±5℃下真空浓缩到2倍至3倍体积。添加EtOAc(67.50kg,10.0倍体积),在25℃±5℃下将混合物真空浓缩到2倍至3倍体积。添加另外的EtOAc(67.50kg,10.0倍体积),在25℃±5℃下再次将混合物真空浓缩到2倍至3倍体积。用EtOAc(3.38kg,0.5倍体积)冲洗反应贮器,合并EtOAc层,然后滴加到MTBE(55.50kg,10.0倍体积)和正庚烷(51.00kg,10.0倍体积)的混合物中。在15℃±5℃下将混合物搅拌至少2小时,然后冷却到0℃±5℃,并搅拌至少2小时。通过离心收集所形成的固体,用正庚烷(10.20kg,2.0倍体积)洗涤,然后在20℃±5℃下真空干燥至少6小时,得到化合物6(纯度88.3%,测定法:84.6%,质量:4.76kg,通过测定法校正的质量:4.03kg,收率:81.7%)。
步骤7:合成N-[2S)-1-(4-(甲基)哌嗪-1-基)-5-[[(1R,2S)-2-(4-氟苯基)-环丙基]氨基]-1-氧代戊烷-2-基]-4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰胺(7)
通过抽空至P≤0.08MPa吹扫反应贮器,之后添加N2,以达到大气压力。重复该循环共3次。在20℃±5℃下添加MeOH(43.13kg,14.0倍体积)和化合物9(1.52kg,1.0当量)。在该温度下通过微孔过滤器添加化合物6(4.61kg,测定法:84.6%,1.0当量)在THF(24.30kg,7.0倍体积)中的溶液,将混合物搅拌2小时±0.2小时。然后将反应混合物冷却到-10℃±0.5℃。至少分5批添加NaBH4(390g,1.0当量),两批之间至少间隔15分钟,同时维持该温度。在该温度下将混合物再搅拌2.0小时±0.2小时,然后在1小时内升温到20℃±5℃,并在该温度下搅拌1.0小时±0.2小时。抽取样品用于HPLC分析,如果产物的曲线下面积小于总面积的75%,则再添加39gNaBH4。在20℃±5℃下将混合物搅拌至少8小时,然后冷却到0℃±5℃。将NH4Cl(2.57kg)在纯化H2O(7.80kg,2.0倍体积)中的溶液添加到反应混合物中,同时将温度维持在低于10℃。然后在10℃至25℃下将混合物搅拌0.5小时,接着在35℃±5℃下真空浓缩到3倍至4倍体积。然后添加IPAc(67.86kg,20.0倍体积),将混合物冷却到10℃±0.5℃,在该温度下添加2N NaOH溶液,以将pH调节到9至10。让混合物升温到20℃±5℃,然后在该温度下搅拌至少0.5小时。分离各层,用IPAc(33.93kg,10.0倍体积)萃取水相。合并有机层,用NaCl溶液洗涤(NaCl为7.02kg,溶剂为19.50kg纯化水,5.0倍体积,重复总计2次洗涤)。在35℃±5℃下将有机相真空浓缩到3倍至4倍体积。将THF(34.71kg,10.0倍体积)添加到反应贮器中,在35℃±5℃下将混合物真空浓缩到3倍至4倍体积。将IPA(30.81kg,10.0倍体积)添加到反应贮器中,在35℃±5℃下将混合物真空浓缩到3倍至4倍体积。将IPA(15.41kg,5.0倍体积)添加到反应容器中,在35℃±5℃下将混合物搅拌至少0.5小时,得到化合物7的溶液(纯度:80.0%,测定法:12.4%,质量:34.86kg,通过测定法校正的质量:4.32kg,收率:82.0%)。
步骤8:合成N-[2S)-1-(4-(甲基)哌嗪-1-基)-5-[[(1R,2S)-2-(4-氟苯基)-环丙基]氨基]-1-氧代戊烷-2-基]-4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰胺的双甲苯磺酸盐(8)
向THF(29.19kg,8.0倍体积)和IPA(12.96kg,4.0倍体积)的混合物中添加化合物7(33.06kg,测定法:12.4%,1.0当量)的IPA溶液。将混合物搅拌至少10分钟。首先抽空到P≤0.08MPa,然后引入N2以达到1.0Atm,由此吹扫反应器。重复该吹扫循环共3次。然后通过0.2μM微孔过滤器将化合物7的溶液添加到反应器中。在25℃±5℃下,通过0.2μM微孔过滤器,伴随搅拌添加TsOH(3.75kg,2.5当量)在THF(14.60kg,4.0倍体积)中的溶液。在该温度下将混合物搅拌至少15小时。通过离心除去所形成的固体,用IPA(12.96kg,4.0倍体积)洗涤,然后在35℃±5℃下真空干燥至少15小时。
通过抽空至P≤0.08MPa吹扫反应贮器,之后添加N2,以达到大气压力。重复该循环共3次。在N2气氛下,通过0.2μM微孔过滤器将MeOH(24.89kg,5.0倍体积)和EtOAc(28.35kg,5.0倍体积)引入贮器中。然后在搅拌下将固体产物添加到反应器中,将混合物升温到50℃±5℃,并在该温度下搅拌至少3小时。然后将混合物冷却到25℃±5℃,并在该温度下搅拌至少3小时。经由离心除去固体,用EtOAc(11.34kg,2.0倍体积)洗涤,然后用HPLC分析。如果产物的面积百分比小于98.0%或单一杂质的面积百分比大于0.5%,则重复EtOAc浆化过程。
通过抽空至P≤0.08MPa吹扫反应贮器,之后添加N2,以达到大气压力。重复该循环共3次。在N2气氛下,通过0.2μM微孔过滤器将正庚烷(42.84kg,10.0倍体积)引入贮器中。然后在搅拌下将固体产物添加到反应器中,在25℃±5℃下将混合物搅拌至少3小时。经由离心除去固体,用正庚烷(12.85kg,3.0倍体积)洗涤,然后在35±C下真空干燥至少15小时,得到产物(5.38kg,78.9%)。
实例4:替代性合成(4S)-4-[4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰基氨基]-5-(4-甲基哌嗪-1-基)-5-氧代戊烷硫代酸十二烷基酯盐酸盐
步骤1:合或(4S)-4-[[(1,1-二甲基乙氧基)羰基]氨基]-5-(4-甲基哌嗪-1-基)-5-氧代戊酸甲酯(1)
通过抽空吹扫反应贮器,之后引入N2。将吹扫过程重复3次。在整个过程中维持N2气氛。添加IPAc(204.85kg,10倍体积,8.90w/w),开始搅拌。抽取用于KF分析的样品报告H2O等于0.04%。将Boc-Glu(OMe)-OH(22.98kg,1.00当量)装入贮器,然后将贮器冷却到5℃±5℃,维持该温度。然后滴加N-甲基吗啉(9.88kg,1.10当量),之后滴加新戊酰氯(11.14kg,1.05当量)。将混合物搅拌不短于1小时,然后添加N-甲基哌嗪(9.20kg,1.05当量),并将混合物搅拌不短于1小时。然后使贮器升温到20℃±5℃,继续搅拌不短于3小时。抽取样品用于HPLC分析(每2小时±0.2小时重新取样),使反应继续进行,直到Boc-Glu(OMe)-OH的面积百分比≤2%为止。
添加NaHCO3水性溶液(5重量%,5.0倍体积),将反应淬灭。继续搅拌不短于0.5小时,然后停止搅拌,让内容物静置不短于0.5小时。分离各相,用IPAc(2×102.70kg,2×5.0倍体积,4.45w/w)萃取水相,搅拌不短于0.5小时,之后针对每次萃取静置不短于0.5小时。用NaCl水性溶液(25重量%,2×5.0倍体积)洗涤合并的有机层,浓缩到4倍至5倍体积,其间将温度保持为≤50℃。然后添加IPAc(204.80kg,10.0倍体积,8.90w/w),在P≤0.08MPa下将体积浓缩到4倍至5倍体积,其间将温度保持为≤50℃。
抽取样品用于KF分析。重复添加IPAc和共沸过程,直到KF分析报告H2O≤0.1%为止。然后添加二氧六环(236.95kg,10倍体积,10.30w/w),在P≤0.08MPa下将体积浓缩到4倍至5倍体积,其间将温度保持为≤50℃。抽取用于HPLC分析的样品报告纯度等于95.7%。将溶液放入反应器中储存在N2和25℃下,并直接用于下一步。
步骤2:合成(4S)-4-氨基-5-(4-甲基哌嗪-1-基)-5-氧代戊酸甲酯盐酸盐
通过抽空至不超过0.08Mpa,然后引入N2,来用N2吹扫反应器。将吹扫过程重复3次。在整个过程中维持N2气氛。然后添加化合物1(28.9kg,溶于二氧六环中,1.0当量)的二氧六环溶液,搅拌该混合物。接着将环丁砜(254.9kg,7倍体积,8.82w/w)添加到反应器中。将反应器温度调节到25℃±5℃,并在整个过程中维持该温度。添加HCl/二氧六环(4M,5.0当量,109.80kg),将混合物搅拌不短于3小时。每2小时±0.2小时抽取样品用于HPLC分析。继续搅拌,直到化合物1的面积百分比≤2%为止。
向第二反应器中装入MTBE(385.40kg,18倍体积,13.32w/w),在25℃±5℃下伴随搅拌将第一反应器的内容物引入第二反应器中。继续搅拌不短于1小时,然后通过离心除去形成的固体,并用MTBE(162.00kg,7.5倍体积,5.55w/w)洗涤。吸湿滤饼的HPLC分析报告纯度等于95.3%。然后在N2下伴随搅拌将滤饼添加到MTBE(320.95kg,15倍体积,11.10w/w)中。将温度调节到25℃±5℃,并将混合物搅拌不短于4小时。然后通过离心除去滤饼,并用MTBE(80.60kg,3.75倍体积,2.79w/w)洗涤。
滤饼的HPLC分析报告纯度等于95.3%。滤饼的GC分析报告MTBE=43.9%,1,4-二氧六环=5.1%,环丁砜=8.2%。将产品(粗重=87.9kg)在N2下包装在内部的聚乙烯(LDPE)袋中,该聚乙烯袋封装在热密封复合LDPE外袋内并用扎线带密封。
步骤3:合成(4S)-4-[4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰基氨基]-5-(4-甲基哌嗪-1-基)-5-氧代戊酸甲酯(3)
通过抽空至不超过0.08Mpa,然后引入N2,来用N2吹扫反应器。将吹扫过程重复3次。在整个过程中维持N2气氛。将DCM(316.55kg,25倍体积,33.25w/w)装入反应器中,开始搅拌。然后添加化合物2(粗重:75.03kg,1.3当量),将混合物冷却到5℃±5℃,并维持该温度。然后添加N-甲基吗啉(18.64kg,3.50当量),之后分批添加EDCI(11.60kg,1.20当量)。然后添加HOBT(0.68kg,0.10当量),之后添加化合物9(9.60kg,1.00当量)。搅拌混合物不短于0.5小时,然后将混合物升温到25℃±5℃,继续搅拌不短于3小时。每2小时±0.2小时抽取样品用于HPLC分析,使反应继续进行,直到化合物9的面积百分比≤5%为止。
然后将反应混合物冷却到5℃±5℃,滴加Na2CO3溶液(10重量%,20.0倍体积),以将pH调节到9至10。然后将混合物升温到25℃±5℃,在25℃±5℃下继续搅拌不短于2小时。然后在25℃±5℃下将NaCl水性溶液(10重量%,10.0倍体积)添加到反应器中,继续搅拌不短于0.5小时。停止搅拌,让混合物静置不短于0.5小时。
用NaCl水性溶液(15重量%,10.0倍体积)洗涤有机相。将混合物搅拌不短于0.5小时,然后停止搅拌,让混合物静置不短于0.5小时,接着分离各层。在不高于40℃下将有机层浓缩到9倍至10倍体积。然后将IPAc(126.80kg,15.0倍体积)添加到反应器中,在不高于45℃下将体积减小到9倍至10倍体积。然后将另外的IPAc(126.80kg,15.0倍体积)添加到反应器中,在不高于45℃下将体积减小到9倍至10倍体积。GC分析报告DCM≤3.0%。
将混合物升温到45℃±5℃。将正庚烷(100.35kg,15.0倍体积,10.20w/w)缓缓添加到反应器中,将混合物搅拌不短于1小时,然后冷却到20℃±5℃并搅拌不短于2小时。离心除去形成的固体,并用正庚烷(16.45kg,2.5倍体积,1.70w/w)洗涤。HPLC分析报告化合物3的纯度≥96.0%。将固体置于真空烘箱中,在40℃±5℃下干燥不短于12小时。继续干燥,直到抽取用于LOD分析的样品报告LOD≤3%为止。产物的HPLC分析报告化合物3=96.3%,测定法:94.1%,校正重量:18.16kg,收率:86.4%。最终产品包装在用扎线带密封的双层LDPE塑料袋中,并在室温下储存在密闭容器中。
步骤4:合成(4S)-4-[4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰基氨基]-5-(4-甲基哌嗪-1-基)-5-氧代戊酸(4)
通过抽空至不超过0.08Mpa,然后引入N2,来用N2吹扫反应器。将吹扫过程重复3次。在整个过程中维持N2气氛。添加THF(160.75kg,10倍体积,8.9w/w),开始搅拌。然后将化合物3(18kg校正重量,1.0当量)添加到反应器中,并将温度调节到25℃±5℃。分批添加TMSOK(7.25kg,1.3当量),将混合物搅拌不短于8小时。每2小时±0.2小时抽取样品用于HPLC分析,使反应继续进行,直到化合物3的面积百分比≤3%为止。然后在25℃±5℃下将MeOH(142.10kg,10倍体积,7.90w/w)添加到反应器中,将内容物搅拌不短于1小时。将混合物冷却到5℃±5℃。缓缓添加HCl/MeOH,以将pH调节到5.4至5.8。将混合物搅拌不短于2小时,同时将pH维持在5.4至5.8。离心除去固体,用MeOH(35.30kg,5倍体积,3.95w/w)洗涤。将滤液与反应溶液合并,在不高于40℃下浓缩到4倍至5倍体积。添加MeOH(141.85kg,10倍体积,7.90w/w),在不高于40℃下将混合物浓缩到4倍至5倍体积。添加CH3CN(210.80kg,15倍体积,11.70w/w),在不高于40℃下将混合物浓缩到4倍至5倍体积。在25℃±5℃下将另外的CH3CN(70.95kg,5倍体积,3.90w/w)添加到反应器中。将化合物4的晶种引入反应器中,然后将混合物搅拌不短于0.5小时。将另外的CH3CN(210.70kg,15倍体积,11.70w/w)缓缓添加到反应器中,然后在25℃±5℃下将混合物搅拌不短于2小时。将混合物冷却到5℃±5℃并搅拌不短于2小时。每2小时±0.2小时抽取样品用于HPLC分析,直到上清液中的化合物4的浓度≤7.0mg/mL为止。离心除去固体,用CH3CN(42.1kg,3倍体积,2.34w/w)洗涤。
产物的HPLC分析报告化合物4的面积百分比≥95.0%。产物的手性HPLC分析报告IMG-7289-4的面积百分比>98.0%。(HPLC纯度:97.7%;手性HPLC纯度:100%)
将滤饼置于真空烘箱中,在40℃±5℃下干燥不短于12小时。继续干燥,直到抽取用于KF和LOD的样品报告LOD=8.2%并且KF=1.8%为止。产物的HPLC分析报告化合物4的面积百分比≥95.0%。(HPLC纯度:97.7%,测定法:86.6%)。将产物(重量:15.35kg)在N2下包装在双层LDPE塑料袋中,该塑料袋位于纤维桶内并用扎线带密封,然后储存在2℃至8℃下。
步骤5(a):合成(4S)-4-[4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰基氨基]-5-(4-甲基哌嗪-1-基)-5-氧代戊烷硫代酸十二烷基酯盐酸盐(5a)
通过抽空至不超过0.08Mpa,然后引入N2,来用N2吹扫反应器。将吹扫过程重复3次。在整个过程中维持N2气氛。将DCM(276.00kg,15倍体积,19.95w/w)装入反应器中,开始搅拌。将化合物4(13.2kg校正重量,1.0当量)添加到反应器中。将混合物冷却到5℃±5℃。添加1-十二烷硫醇(8.10kg,1.20当量),之后添加DMAP(198g,0.05当量),接着添加EDCI(7.71kg,1.20当量)。将混合物搅拌不短于1小时,然后升温到20℃±5℃。每2小时±0.2小时抽取样品用于HPLC分析,使反应继续进行,直到化合物4的面积百分比≤3%为止。然后添加软水(66.50kg,5倍体积,5.0w/w),将混合物搅拌不短于0.5小时,然后停止搅拌,使其静置不短于0.5小时。分离各层,用DCM(89.15kg,5倍体积,6.65w/w)萃取水相。将混合物搅拌不短于0.5小时,然后停止搅拌,让混合物静置不短于0.5小时,接着分离各层。用NaCl水性溶液(25重量%,5倍体积)洗涤合并的有机层。将混合物搅拌不短于0.5小时,然后停止搅拌,让混合物静置至少0.5小时。分离各层,再次用NaCl(25重量%,5倍体积)洗涤有机相。将混合物搅拌不短于0.5小时,然后停止搅拌,让混合物静置至少0.5小时。在不高于40℃下将有机层真空浓缩到6倍至7倍体积,然后添加EtOH(161.45kg,15倍体积,11.58w/w)。在不高于50℃下将体积在真空下减小到6倍至7倍体积,然后在20℃±5℃下添加另外的EtOH(65.60kg,6.3倍体积,4.98w/w)和CH3CN(282.65kg,26.7倍体积,20.83w/w)。在20℃±5℃下将混合物搅拌不短于1小时,然后冷却到10℃±5℃。
然后在10℃±5℃下将HCl/EtOH(5.07kg,28.9重量%(通过滴定确定),1.20当量)滴加到反应器中,接着在10℃±5℃下将混合物搅拌不短于12小时。通过离心除去形成的固体,用CH3CN(30.50kg,3倍体积,2.34w/w)洗涤。HPLC分析报告化合物5的面积百分比≥95.0%。(HPLC纯度:99.3%)。将产物置于真空烘箱中,在45℃±5℃下干燥不短于12小时。每5小时±0.2小时抽取样品用于LOD分析,继续干燥,直到LOD≤5.0%、最终LOD=3%为止。HPLC分析报告化合物5的纯度≥95.0%(HPLC纯度:99.1%,测定法:94.9%)。将产品转移到双层低密度聚乙烯(LDPE)袋中,该聚乙烯袋位于纤维桶内并用扎线带密封,称重并储存在低于-20℃下。
实例5:探索合成N-[(2S)-1-(4-(甲基)哌嗪-1-基)-5-[[(1R,2S)-2-(4-氟苯基)-环丙基]氨基]-1-氧代戊烷-2-基]-4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰胺及其双甲苯磺酸盐的步骤
探索步骤2:除去Boc保护基团。
探索反应条件。
结论:二氧六环中的反应提供了优异的收率,并且避免水解成羧酸。
探索溶剂。
结论:使用环丁砜作为溶剂获得了极佳的收率,并且所得产物具有有用的物理特性。
探索环丁砜体积。
反应在25℃至30℃下,在指定的溶剂中进行。
结论:使用7倍体积的环丁砜避免了形成不希望的油状物。
探索再现性。
反应在25℃至30℃下进行。
结论:所选择的溶剂系统在产物收率方面给出了可接受的再现性。探索碱性条件下的产品稳定性。
结论:
1)当碱性水性溶液中pH>10时,化合物3不稳定。
2)化合物3在pH=9至10的弱碱性水性溶液中相对稳定
3)化合物3在K2CO3的存在下相对不稳定。
探索步骤3:形成酰胺。
探索产品溶解度。
结论:化合物3在DCM、THF或MeOH中具有良好的溶解度。
探索反应和后处理的溶剂选择。
反应在20℃至25℃下进行,使用NMM(3.5当量)/HOBT(0.1当量)、EDC.HCl(1.2当量)。
结论:由于收率高,并且避免了繁琐的后处理,所以关于反应条件和后处理这两者使用DCM提供了有利的结果。
探索步骤4:甲酯水解。
探索反应条件。
结论:使用Me3SiOK进行酯水解在非水性条件下有良好的表现。
探索反应条件。
结论:THF中的反应比MeOH中的更快。
探索对用于从产物中除水的溶剂的选择。
在20℃至30℃下,让化合物3(2.0g)与Me3SiOK(1.2当量)在THF(10.0倍体积)中反应14小时。添加正庚烷(10.0倍体积),然后除去上清液。接着添加THF(10.0倍体积)和H2O(1.0倍体积),用将pH调节到6.0至6.4。过滤混合物,将滤液浓缩到4倍至5倍体积,于是混合物分配到上部无色相和下部橙色相中。
结论:使用混合的MeOH/CH3CN系统可用于除水。
探索4在各种溶剂中的溶解度。
结论:产品4在MeOH中显示出高稳定性;在其他测试溶剂中的溶解度较低。
探索产物重结晶。
结论:种晶和温度控制是结晶过程的关键参数。
探索步骤5(a):与硫醇偶联,加上形成盐酸盐。
探索反应条件。
使用DMAP(0.05当量)进行反应;后处理:在20℃至30℃下添加1当量的HCl/EtOH
结论:形成HCl盐以高收率形成了产物,该产物纯度高,并且具有有用的物理特性。
探索用于过滤的溶剂。
实验在15℃至25℃下进行20h。
结论:ACN和EtOH/ACN溶剂系统提供了有益的过滤性能。
探索步骤6:Pd催化的还原。
探索化合物5的还原时序和还原温度
后处理步骤得到5g淡黄色固体,收率为77%。
探索对Pd催化剂的选择。
溶剂:THF(10倍体积)/HOAC(1.5当量)。还原剂:Et3SiH(5.0当量)。
结论:使用湿Pd/C在反应完成之前易受反应停滞的影响。在使用来自同一本地供应商的新一批湿Pd/C的情况下,反应未完成。与湿Pd/C相比,用无水Pd/C进行的反应更令人满意。
进一步探索对Pd催化剂的选择。
溶剂:THF(10倍体积)/HOAC(1.5当量)。还原剂:Et3SiH(4.0当量)。反应在10℃至20℃下进行。
结论:使用各种Pd催化剂时的再现性不是最佳的。
进一步探索对Pd催化剂的选择。
还原剂:Et3SiH(4.0当量)
使用Pd(OAc)2作为催化剂进行探索
还原剂:Et3SiH(4.0当量)。
结论:观察到转化为产物;杂质水平比使用Pd/C催化剂时高。
探索乙酸含量的变化。
还原剂:Et3SiH(4.0当量)。催化剂:无水Pd/C(7.5重量%)。反应在10℃至20℃下进行。
结论:需要存在至少1.0当量的HOAc来减少杂质的量。
进一步探索对起始材料的选择。
用于这些试验的起始材料5是在没有纯化为盐酸盐5a的中间步骤的情况下获得的。溶剂:THF(10倍体积)/HOAc(1.5当量)。反应在10℃至20℃下进行。
上述结果显示转化为醛6的转化率低,证明了将化合物5纯化为其HCl盐5a的重要性。
进一步探索对起始材料的选择。
让在没有纯化为HCl盐的中间步骤的情况下获得的5替代性来源经受替代性的纯化方法。探索了转化为醛6的转化率。溶剂:THF(10倍体积)/HOAc(1.5当量)。还原剂:Et3SiH(4.0当量)。反应在10℃至20℃下进行。
结论:使用通过炭吸附纯化的材料以较小规模(10g)反应进展良好;然而,较大规模(50g)的反应却停滞不前。这些结果证实,优选的是包括将5纯化为其HCl盐的步骤。
探索含水量。
溶剂:THF(10倍体积)/HOAc(1.5当量)/水(如所指出的那样)。还原剂:Et3SiH(4.0当量)。反应在10℃至20℃下进行,定期抽取等分试样进行分析。
结论:实验结果表明,高含水量导致反应速度缓慢。
探索反应进度。
溶剂:THF(10倍体积)/HOAc(1.5当量)。还原剂:Et3SiH(4.0当量)。反应在0℃至5℃下进行,定期抽取等分试样进行分析。
结论:使用2.5重量%的催化剂时形成的杂质最少,且时间短于8小时。
探索对Pd催化剂的选择
溶剂:THF(10倍体积)/HOAc(1.5当量)。还原剂:Et3SiH(4.0当量)。反应在0℃至5℃下进行。
结论:使用完全还原的Pd(0)催化剂时反应速度更快。
探索硅烷量
溶剂:THF(10倍体积)/HOAc(1.5当量)。催化剂:无水Pd/C(7.5重量%)
结论:使用超过3当量的Et3SiH时反应表现最佳。
探索Pd催化剂负载量。
溶剂:THF(10倍体积)/HOAc(1.5当量)。还原剂:Et3SiH(4.0当量)。
进一步探索Pd催化剂负载量。
溶剂:THF(10倍体积)/HOAc(1.5当量)。还原剂:Et3SiH(4.0当量)。
结论:使用4.0重量%或5.0重量%的催化剂时,反应物几乎完全转化为产物。在延长的反应时间内观察到产物减少和杂质增加,这是应当避免的。
探索反应规模放大。
溶剂:THF(10倍体积)/HOAc(1.5当量)。还原剂:Et3SiH(4.0当量)。
反应在100g规模下的表现令人满意。
验证更大规模的反应。
溶剂:THF(10倍体积)/HOAc(1.5当量)。催化剂:Pd/C(4.0重量%)。还原剂:Et3SiH(4.0当量)。温度-5℃至10℃。
结论:反应是高度可重复的。通过仔细控制反应时间,能够以低杂质水平实现高水平转化。
探索重现性。
溶剂:THF(10倍体积)/HOAc(1.5当量)。还原剂:Et3SiH(4.0当量)。催化剂:无水Pd/C(2.5重量%)
结论:所选择条件的重现性极佳。
探索步骤7:还原胺化。
探索各种还原剂。
结论:使用NaBH4获得了最佳表现。
探索反应的化学计量。
溶剂:THF(7倍体积)/MeOH(14倍体积)。还原剂:NaBH4(1.0当量)
结论:可以在不损失产物收率或纯度的情况下实现将化合物9还原为1.0当量。
探索再现性。
溶剂:MeOH(14.0倍体积)/THF(7.0倍体积)。
结论:所选择条件的重现性极佳。
进一步探索再现性。
溶剂:MeOH(14.0倍体积)/THF(7.0倍体积)。
结论:所选择条件在较大规模上的重现性极佳。
探索步骤8:形成甲苯磺酸盐
探索用于甲苯磺酸盐重结晶的溶剂和体积比。
检查再现性。
溶剂:
结论:所选择条件的重现性极佳。
进一步检查再现性。
溶剂:IPA(12倍体积)/THF(4倍体积)
结论:所选择条件的重现性极佳。
其他实施例
提供以上列出的详细描述是为了帮助本领域的技术人员实践本披露。然而,本文描述和要求权利的本披露的范围并不受本文所披露的具体实施例的限制,因为这些实施例旨在阐明本披露的若干方面。任何等效的实施例都旨在处于本披露的范围之内。事实上,除了本文示出并描述的那些,本披露的各种修改从前述说明书对于本领域技术人员来说也将变得清楚,这并不偏离本发明的实质和范围。此类修改也旨在落入所附权利要求的范围之内。
Claims (61)
2.如权利要求1所述的方法,其中所述还原胺化条件包括使化合物9与化合物6在硼氢化物还原剂的存在下反应。
3.如权利要求2所述的方法,其中所述硼氢化物还原剂为NaBH4。
4.如权利要求3所述的方法,其中所述反应在包含低级原醇的溶剂中进行。
5.如权利要求4所述的方法,其中所述低级原醇为甲醇。
6.如权利要求4所述的方法,其中所述低级原醇为共溶剂混合物的一部分。
7.如权利要求6所述的方法,其中所述共溶剂混合物包含甲醇和四氢呋喃。
8.如权利要求7所述的方法,其中将NaBH4添加到化合物6和化合物9在甲醇和四氢呋喃的混合物中的已冷却到-5℃±5℃的混合物中。
9.如权利要求8所述的方法,其中分批添加所述NaBH4,同时将反应混合物的温度维持在低于22℃。
10.如权利要求9所述的方法,其中至少分5批,两批之间至少间隔15分钟添加所述NaBH4。
11.如权利要求9所述的方法,所述方法还包括在完成分批添加NaBH4之后,在20℃±5℃下搅拌所述反应混合物。
12.如权利要求11所述的方法,其中将所述反应混合物在20℃±5℃下搅拌至少1小时。
13.如权利要求12所述的方法,其中将所述反应混合物在20℃±5℃下搅拌至少3小时。
14.如权利要求13所述的方法,所述方法还包括以下步骤:
a)搅拌所述反应混合物,直到通过HPLC分析确定化合物7以至少75%的面积百分比存在为止;
b)通过添加饱和氯化铵,将所述反应混合物淬灭;以及
c)过滤并浓缩所得的混合物。
15.如权利要求7所述的方法,其中将NaBH4添加到化合物6和化合物9在甲醇和四氢呋喃的混合物中的已冷却到-10℃±0.5℃的混合物中。
16.如权利要求15所述的方法,其中分批添加所述NaBH4,同时将反应混合物的温度维持在-10℃±0.5℃。
17.如权利要求16所述的方法,其中至少分5批,两批之间至少间隔15分钟添加所述NaBH4。
18.如权利要求17所述的方法,所述方法还包括在完成分批添加NaBH4之后,在20℃±5℃下搅拌所述反应混合物。
19.如权利要求18所述的方法,其中将所述反应混合物在20℃±5℃下搅拌至少1小时。
20.如权利要求19所述的方法,其中将所述反应混合物在20℃±5℃下搅拌至少3小时。
21.如权利要求20所述的方法,所述方法还包括以下步骤:
a)通过添加饱和氯化铵,将所述反应混合物淬灭;以及
b)过滤并浓缩所得的混合物。
23.如权利要求22所述的方法,其中所述硅烷还原剂为三乙基硅烷。
24.如权利要求22所述的方法,所述方法还包括钯碳。
25.如权利要求22所述的方法,其中所述反应在包含冰醋酸的溶剂中进行。
26.如权利要求25所述的方法,其中所述反应在包含冰醋酸和四氢呋喃的溶剂混合物中进行。
27.如权利要求26所述的方法,所述方法包括将三乙基硅烷添加到化合物5和钯碳在四氢呋喃和冰醋酸中的混合物中。
28.如权利要求27所述的方法,所述方法包括将三乙基硅烷添加到化合物5和钯碳在四氢呋喃和冰醋酸中的混合物中,其中所述混合物已冷却到5℃±5℃。
29.如权利要求28所述的方法,其中所述三乙基硅烷经至少30分钟添加。
30.如权利要求29所述的方法,所述方法还包括在添加三乙基硅烷后,经约1.5小时让反应混合物升温至约20℃。
31.如权利要求30所述的方法,所述方法还包括以下步骤:
a)搅拌所述反应混合物,直到通过HPLC分析确定化合物5以小于5%的面积百分比存在为止;
b)过滤并浓缩所得的混合物。
33.如权利要求32所述的方法,其中反应混合物的温度为25℃±5℃。
34.如权利要求32所述的方法,其中将相对于化合物7为2.5当量的对甲苯磺酸水合物添加到所述化合物7的THF和IPA溶液中。
35.如权利要求32所述的方法,其中THF和IPA合并的总体积为约12倍体积。
36.如权利要求32至35中任一项所述的方法,其中将化合物7与对甲苯磺酸水合物在THF和IPA中的混合物搅拌至少15小时。
37.如权利要求32所述的方法,所述方法还包括以下步骤:
a)过滤反应混合物;以及
b)用IPA洗涤滤饼;以及
c)将所述滤饼在35℃±5℃下真空干燥至少15小时。
38.如权利要求37所述的方法,其中使用约4倍体积的IPA来洗涤所述滤饼。
39.如权利要求37所述的方法,所述方法还包括从甲醇中重结晶所述滤饼的步骤。
40.如权利要求39所述的方法,其中使用相对于所述滤饼介于约10倍体积与约20倍体积之间的甲醇来进行所述重结晶。
41.如权利要求37所述的方法,所述方法还包括从甲醇和乙酸乙酯的混合物中重结晶所述滤饼的步骤。
42.如权利要求41所述的方法,其中使用相对于所述滤饼约5倍体积的甲醇和约5倍体积的乙酸乙酯来进行所述重结晶。
43.如权利要求42所述的方法,其中将所述滤饼在甲醇和乙酸酯中的混合物加热到50℃±5℃并搅拌至少3小时。
44.如权利要求43所述的方法,所述方法还包括将所述混合物冷却到25℃±5℃,并且在过滤之前搅拌至少3小时。
45.如权利要求44所述的方法,其中THF和IPA合并的总体积为约16倍体积。
46.如权利要求37所述的方法,所述方法还包括以下步骤:
d)将所述滤饼与MeOH和EtOAc的混合物混合;
e)搅拌所得的混合物;
f)过滤除去反应产物;以及
g)用EtOAc洗涤所述滤饼。
47.如权利要求46所述的方法,其中使用相对于所述滤饼为5倍体积的MeOH来进行搅拌。
48.如权利要求47所述的方法,其中使用相对于所述滤饼为5倍体积的EtOAc来进行搅拌。
49.如权利要求48所述的方法,其中将所述滤饼用甲醇搅拌至少3小时。
50.如权利要求49所述的方法,其中将所述滤饼在50℃±5℃下用甲醇搅拌至少3小时。
51.如权利要求50所述的方法,其中将所述滤饼在50℃±5℃下用甲醇搅拌至少3小时,并且在25℃±5℃下用甲醇搅拌至少3小时。
52.如权利要求51所述的方法,所述方法还包括以下步骤:
h)将所述滤饼与庚烷混合;
i)搅拌所得的混合物;
j)过滤除去反应产物;以及
k)用庚烷洗涤所述滤饼;以及
l)在真空下干燥所述滤饼。
53.如权利要求52所述的方法,其中使用相对于所述滤饼为10倍体积的庚烷来进行搅拌。
54.如权利要求53所述的方法,其中将所述滤饼用庚烷搅拌至少3小时。
56.如权利要求55所述的方法,其中所述羧酸偶联剂为碳二亚胺。
57.如权利要求56所述的方法,其中所述碳二亚胺为EDCI。
58.如权利要求57所述的方法,其中使用相对于化合物4为1.2当量的十二烷硫醇。
59.如权利要求58所述的方法,其中所述碱为DMAP。
60.如权利要求58所述的方法,其中所述盐酸溶解在乙醇溶液中。
61.如权利要求59所述的方法,其中获得呈固体的5a。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201662375728P | 2016-08-16 | 2016-08-16 | |
US62/375,728 | 2016-08-16 | ||
PCT/US2017/047208 WO2018035259A1 (en) | 2016-08-16 | 2017-08-16 | Methods and processes for the preparation of kdm1a inhibitors |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN111194306A true CN111194306A (zh) | 2020-05-22 |
CN111194306B CN111194306B (zh) | 2023-05-16 |
Family
ID=61197124
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201780059523.5A Active CN111194306B (zh) | 2016-08-16 | 2017-08-16 | 用于制备kdm1a抑制剂的方法和过程 |
Country Status (3)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US11390590B2 (zh) |
CN (1) | CN111194306B (zh) |
WO (1) | WO2018035259A1 (zh) |
Families Citing this family (10)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
AU2014306149B2 (en) | 2013-08-06 | 2019-09-19 | Imago Biosciences Inc. | KDM1A inhibitors for the treatment of disease |
JP6727216B2 (ja) | 2015-02-12 | 2020-07-22 | イマーゴ バイオサイエンシーズ インコーポレイテッド | 疾患の治療のためのkdm1a阻害剤 |
CN111194306B (zh) | 2016-08-16 | 2023-05-16 | 伊美格生物科学公司 | 用于制备kdm1a抑制剂的方法和过程 |
AU2019265022B2 (en) * | 2018-05-11 | 2024-08-15 | Imago Biosciences, Inc. | KDM1A inhibitors for the treatment of disease |
CN109704995B (zh) * | 2019-01-25 | 2024-01-23 | 吉林凯莱英制药有限公司 | 福山还原反应用连续化装置及连续化福山还原方法 |
WO2022072811A1 (en) * | 2020-10-01 | 2022-04-07 | Imago Biosciences, Inc. | Pharmaceutical formulations for treating diseases mediated by kdm1a |
CA3231846A1 (en) | 2021-04-08 | 2022-10-13 | Tamara Maes | Combinations of lsd1 inhibitors for treating myeloid cancers |
WO2023217784A1 (en) | 2022-05-09 | 2023-11-16 | Oryzon Genomics, S.A. | Methods of treating nf1-mutant tumors using lsd1 inhibitors |
WO2023217758A1 (en) | 2022-05-09 | 2023-11-16 | Oryzon Genomics, S.A. | Methods of treating malignant peripheral nerve sheath tumor (mpnst) using lsd1 inhibitors |
WO2024110649A1 (en) | 2022-11-24 | 2024-05-30 | Oryzon Genomics, S.A. | Combinations of lsd1 inhibitors and menin inhibitors for treating cancer |
Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2013022047A1 (ja) * | 2011-08-09 | 2013-02-14 | 武田薬品工業株式会社 | シクロプロパンアミン化合物 |
WO2015021128A1 (en) * | 2013-08-06 | 2015-02-12 | Imago Biosciences Inc. | Kdm1a inhibitors for the treatment of disease |
US20150225401A1 (en) * | 2014-02-13 | 2015-08-13 | Incyte Corporation | Cyclopropylamines as lsd1 inhibitors |
WO2016130952A1 (en) * | 2015-02-12 | 2016-08-18 | Imago Biosciences, Inc. | Kdm1a inhibitors for the treatment of disease |
Family Cites Families (36)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CA2581523A1 (en) | 2004-09-24 | 2006-04-06 | Idenix (Cayman) Limited | Methods and compositions for treating flaviviruses, pestiviruses and hepacivirus |
CA2676173A1 (en) | 2007-02-16 | 2008-08-28 | Amgen Inc. | Nitrogen-containing heterocyclyl ketones and their use as c-met inhibitors |
PL2170848T3 (pl) | 2007-06-27 | 2015-02-27 | Astrazeneca Ab | Pochodne pirazynonu i ich zastosowanie w leczeniu chorób płuc |
KR101586503B1 (ko) | 2007-09-13 | 2016-01-18 | 코덱시스, 인코포레이티드 | 아세토페논의 환원을 위한 케토리덕타제 폴리펩티드 |
WO2009046153A1 (en) | 2007-10-01 | 2009-04-09 | Codexis, Inc. | Ketoreductase polypeptides for the production of azetidinone |
WO2010025287A2 (en) | 2008-08-27 | 2010-03-04 | Codexis, Inc. | Ketoreductase polypeptides for the production of 3-aryl-3-hydroxypropanamine from a 3-aryl-3-ketopropanamine |
WO2010043721A1 (en) | 2008-10-17 | 2010-04-22 | Oryzon Genomics, S.A. | Oxidase inhibitors and their use |
EP2177502A1 (en) | 2008-10-17 | 2010-04-21 | Oryzon Genomics, S.A. | Compounds and their use |
JPWO2010143582A1 (ja) | 2009-06-11 | 2012-11-22 | 公立大学法人名古屋市立大学 | フェニルシクロプロピルアミン誘導体及びlsd1阻害剤 |
US8859555B2 (en) | 2009-09-25 | 2014-10-14 | Oryzon Genomics S.A. | Lysine Specific Demethylase-1 inhibitors and their use |
WO2011042217A1 (en) | 2009-10-09 | 2011-04-14 | Oryzon Genomics S.A. | Substituted heteroaryl- and aryl- cyclopropylamine acetamides and their use |
MX2012012111A (es) | 2010-04-19 | 2013-05-30 | Oryzon Genomics Sa | Inhibidores de demetilasa-1 especifica de lisina y su uso. |
AU2011244478B2 (en) | 2010-04-20 | 2014-07-17 | Fondazione IEO-CCM | Tranylcypromine derivatives as inhibitors of histone demethylase LSD1 and/or LSD2 |
CA2806008C (en) | 2010-07-29 | 2019-07-09 | Oryzon Genomics S.A. | Arylcyclopropylamine based demethylase inhibitors of lsd1 and their medical use |
US9006449B2 (en) | 2010-07-29 | 2015-04-14 | Oryzon Genomics, S.A. | Cyclopropylamine derivatives useful as LSD1 inhibitors |
US9527805B2 (en) | 2010-09-10 | 2016-12-27 | Robert A. Casero | Small molecules as epigenetic modulators of lysine-specific demethylase 1 and methods of treating disorders |
WO2012047852A2 (en) | 2010-10-07 | 2012-04-12 | The J. David Gladstone Institutes | Compositions and methods for modulating immunodeficiency virus transcription |
WO2012045883A1 (en) | 2010-10-08 | 2012-04-12 | Oryzon Genomics S.A. | Cyclopropylamine inhibitors of oxidases |
WO2012071469A2 (en) | 2010-11-23 | 2012-05-31 | Nevada Cancer Institute | Histone demethylase inhibitors and uses thereof for treatment o f cancer |
EP2712316A1 (en) | 2011-02-08 | 2014-04-02 | Oryzon Genomics, S.A. | Lysine demethylase inhibitors for myeloproliferative or lymphoproliferative diseases or disorders |
EP3981395A1 (en) | 2011-02-08 | 2022-04-13 | Oryzon Genomics, S.A. | Lysine demethylase inhibitors for myeloproliferative disorders |
CA2831143C (en) | 2011-03-25 | 2019-05-21 | Glaxosmithkline Intellectual Property Development Limited | Cyclopropylamines as lsd1 inhibitors |
CN103958474B (zh) | 2011-10-20 | 2017-03-08 | 奥莱松基因组股份有限公司 | 作为lsd1抑制剂的(杂)芳基环丙基胺化合物 |
KR102139537B1 (ko) | 2011-10-20 | 2020-07-31 | 오리존 지노믹스 에스.에이. | Lsd1 억제제로서 (헤테로)아릴 사이클로프로필아민 화합물 |
EP2927212A4 (en) | 2012-11-28 | 2016-06-08 | Univ Kyoto | LSD1-SELECTIVE HEMMER WITH LYSINE STRUCTURE |
EP2740474A1 (en) | 2012-12-05 | 2014-06-11 | Instituto Europeo di Oncologia S.r.l. | Cyclopropylamine derivatives useful as inhibitors of histone demethylases kdm1a |
WO2014164867A1 (en) | 2013-03-11 | 2014-10-09 | Imago Biosciences | Kdm1a inhibitors for the treatment of disease |
CN105555365A (zh) | 2013-06-25 | 2016-05-04 | 堪培拉大学 | 用于调控癌症干细胞的方法和组合物 |
CN106536725A (zh) | 2014-04-22 | 2017-03-22 | C-乐克塔股份有限公司 | 酮还原酶 |
ES2812626T3 (es) | 2014-06-27 | 2021-03-17 | Celgene Quanticel Res Inc | Inhibidores de la desmetilasa 1 específica de lisina |
US20190070172A1 (en) | 2015-11-05 | 2019-03-07 | Imago Biosciences, Inc. | Lysine-specific histone demethylase as a novel therapeutic target in myeloproliferative neoplasms |
WO2017116558A1 (en) | 2015-12-29 | 2017-07-06 | Mirati Therapeutics, Inc. | Lsd1 inhibitors |
CN109153636B (zh) | 2016-05-09 | 2021-10-22 | 朱比连特埃皮科尔有限责任公司 | 作为双重lsd1/hdac抑制剂的环丙基-酰胺化合物 |
CN111194306B (zh) | 2016-08-16 | 2023-05-16 | 伊美格生物科学公司 | 用于制备kdm1a抑制剂的方法和过程 |
WO2018035249A1 (en) | 2016-08-16 | 2018-02-22 | Imago Biosciences, Inc. | Compositions and methods for producing stereoisomerically pure aminocyclopropanes |
AU2019265022B2 (en) | 2018-05-11 | 2024-08-15 | Imago Biosciences, Inc. | KDM1A inhibitors for the treatment of disease |
-
2017
- 2017-08-16 CN CN201780059523.5A patent/CN111194306B/zh active Active
- 2017-08-16 WO PCT/US2017/047208 patent/WO2018035259A1/en active Application Filing
- 2017-08-16 US US16/326,495 patent/US11390590B2/en active Active
-
2022
- 2022-06-15 US US17/807,061 patent/US20230104647A1/en not_active Abandoned
Patent Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2013022047A1 (ja) * | 2011-08-09 | 2013-02-14 | 武田薬品工業株式会社 | シクロプロパンアミン化合物 |
WO2015021128A1 (en) * | 2013-08-06 | 2015-02-12 | Imago Biosciences Inc. | Kdm1a inhibitors for the treatment of disease |
US20150225401A1 (en) * | 2014-02-13 | 2015-08-13 | Incyte Corporation | Cyclopropylamines as lsd1 inhibitors |
WO2016130952A1 (en) * | 2015-02-12 | 2016-08-18 | Imago Biosciences, Inc. | Kdm1a inhibitors for the treatment of disease |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN111194306B (zh) | 2023-05-16 |
WO2018035259A1 (en) | 2018-02-22 |
US20210139437A1 (en) | 2021-05-13 |
US20230104647A1 (en) | 2023-04-06 |
US11390590B2 (en) | 2022-07-19 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN111194306A (zh) | 用于制备kdm1a抑制剂的方法和过程 | |
CA2976350C (en) | Kdm1a inhibitors for the treatment of disease | |
EP3030323B1 (en) | Kdm1a inhibitors for the treatment of disease | |
EP3551610B1 (en) | Bicyclo[1.1.1]pentane inhibitors of dual leucine zipper (dlk) kinase for the treatment of disease | |
JP5232861B2 (ja) | 新規ブラジキニンb1 アンタゴニスト | |
CN112341457A (zh) | Kras突变蛋白抑制剂 | |
EP3686196B1 (en) | Polycyclic compound acting as ido inhibitor and/or ido-hdac dual inhibitor | |
CN109153675A (zh) | 细胞周期蛋白依赖性激酶9(cdk9)通过cdk9抑制剂与e3连接酶配体的缀合的降解及使用方法 | |
WO2008067219A2 (en) | Quinazolinone modulators of tgr5 | |
EP1959967A2 (en) | Inhibitors of histone deacetylase for the treatment of disease | |
EP4048662A1 (en) | Bicyclo[1.1.1]pentane inhibitors of dual leucine zipper (dlk) kinase for the treatment of disease | |
WO2020178574A1 (en) | Synthesis of bicycle toxin conjugates, and intermediates thereof | |
CN118679150A (zh) | Cdk2抑制剂及其制备方法和用途 | |
Biasotti et al. | Synthesis of photoactivable inhibitors of osteoclast vacuolar ATPase | |
US20080293942A1 (en) | Methods of Preparing 2-Imidazol-1-Yl-4-Methyl-6-Pyrrolidin-2-Yl-Pyrimidine and 4-(1-Alkylpyrrolidin-2-Yl)-2-(1H-Imidazol-1-Yl)-6-Methylpyrimidine Derivatives | |
CA2929283C (en) | Intermediates and methods for synthesizing calicheamicin derivatives | |
US20190382396A1 (en) | Salts of bicyclo[1.1.1]pentane inhibitors of dual leucine zipper (dlk) kinase for the treatment of disease | |
WO2019120198A1 (zh) | 一类喹啉衍生物 | |
WO2006064351A2 (en) | N-pyrrolidin-3-yl-amide derivatives as serotonin and noradrenalin re-uptake inhibitors | |
EP1828121A2 (en) | N-pyrrolidin-3-yl-amide derivatives as serotonin and noradrenalin re-uptake inhibitors | |
JP2023510947A (ja) | Hdac分解剤 | |
US20090239929A1 (en) | N-Pyrrolidin-3-YL-Amide Derivatives As Serotonin and Noradrenalin Re-Uptake Inhibitors | |
EP1817281A1 (en) | N- [(3s)- pyrrolidin-3-yl]- benzamide derivatives as monoamine re-uptake inhibitors |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
GR01 | Patent grant | ||
GR01 | Patent grant |