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CN110628740A - 一类模拟dot1l多肽的拟肽类小分子化合物的制备方法和用途 - Google Patents

一类模拟dot1l多肽的拟肽类小分子化合物的制备方法和用途 Download PDF

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CN110628740A
CN110628740A CN201810683152.4A CN201810683152A CN110628740A CN 110628740 A CN110628740 A CN 110628740A CN 201810683152 A CN201810683152 A CN 201810683152A CN 110628740 A CN110628740 A CN 110628740A
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CN
China
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compound
carbonyl
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CN201810683152.4A
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孙海鹰
杜蕾
姚爱红
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China Pharmaceutical University
Original Assignee
China Pharmaceutical University
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Abstract

本发明涉及一类模拟DOT1L多肽的拟肽类化合物的制备方法以及它们的医疗用途,特别是作为阻断MLL融合蛋白与甲基转移酶DOT1L之间相互作用的MLL融合蛋白抑制剂在治疗癌症方面的用途。

Description

一类模拟DOT1L多肽的拟肽类小分子化合物的制备方法和 用途
技术领域
本发明涉及一类模拟DOT1L多肽的拟肽类小分子化合物及它们的制备方法。本发明进一步涉及这类拟肽类化合物作为阻断MLL融合蛋白与甲基转移酶DOT1L间相互作用的小分子化合物在治疗癌症方面的医疗用途。
背景技术
在人类急性白血病中,大约5-10%的成年白血病患者和70%的婴儿白血病患者带有因染色体带11q23易位而产生的融合基因,其中大部分是由混合系白血病基因MLL与其它基因融合产生(Nat.Rev.Cancer.,2007,7,823-833.)。另外,由于采用拓扑异构酶II抑制剂治疗而诱发的白血病患者也经常带有MLL融合基因(Leukemia,2001,15,987-989.)。带有MLL融合基因的白血病患者的预后通常非常不理想。正常的MLL基因解码一种在胚胎发育和造血作用中有重要功能的蛋白MLL1。MLL1是一种甲基转移酶,可以特异性的催化组蛋白H3中Lys4(H3K4)的单、双和三甲基化。MLL1本身的催化能力很弱,但当MLL1与WDR5、RbBP5和ASH2L形成蛋白复合物后催化能力会显著增强(Nature,2016,530,447-452)。通过催化H3K4的甲基化及与多种转录调控蛋白的相互作用,MLL1可以保持下游基因,如Hox、Meis-1等基因的正常表达(Differentiation,2003,71,461-476.)。Hox基因的正常表达对胚胎发育和血细胞分化有关键作用,但有些Hox基因,如HoxA9的持续表达则是带有MLL重排基因的白血病的重要特征,而且在白血病的产生及发展中起着重要作用(Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.,2005,102,8603-8608.)。染色体易位可以导致MLL基因与多种伙伴基因形成融合基因,目前已发现了超过70种由MLL融合基因表达的MLL融合蛋白,这些融合蛋白主要是由MLL1氮端的肽链与其它蛋白融合(Mol.Cell.,2010,38,853-863)。因为不含MLL1碳端的SET结构域,这些融合蛋白不具备甲基转移酶的活性,但却具有融合伙伴的部分功能,其中很多可以促进Hox基因的持续表达。MLL融合蛋白中的很多都已被证实与急性淋巴性白血病(ALL)和急性骨髓性白血病(AML)有关,其中一些已被动物实验证明可直接诱发ALL和AML(Blood,2003,102,262-268.)。染色体的易位通常只发生在一条MLL等位基因上,因此MLL白血病细胞中会同时存在野生型的MLL1和MLL融合蛋白(Mol.Cell.,2010,38,853-863),而且最近的研究表明野生型的MLL1的存在是MLL融合蛋白促进下游基因持续表达的功能所必须的。尽管MLL融合蛋白已发现的有超过70种,但其中最主要的是MLL-AF9、MLL-ENL、MLL-AF4、MLL-AF10和MLL-ELL等五种细胞核转录因子蛋白,大约80%左右的MLL白血病与这五种融合蛋白有关(Nat.Rev.Cancer,2007,7,823-33.)。
近年来的生物学研究表明MLL融合蛋白促进Hox和Meis-1等基因的表达主要通过两种机制进行,一是与一些RNA聚合酶II相关的延伸因子相互作用,构成一种被称之为超级延伸复合物的大分子复合物,并通过RNA聚合酶II促使MLL1所调控的Hox基因异常表达;二是利用MLL的融合伙伴招募另一种甲基转移酶DOT1L并促使受MLL1调控的基因位点处的H3K79异常的高度甲基化,而H3K79的甲基化是转录活跃的标志之一(Cancer Cell,2008,14,355-368)。DOT1L是目前为止被发现的唯一一个催化组蛋白H3中Lys79(H3K79)甲基化的甲基转移酶,其特点是它不含其它甲基转移酶中特有的SET结构域。最近,一类以EPZ-5676为代表的小分子DOT1L抑制剂已被报道(Cancer Cell,2011,20,53-65.)。EPZ-5676是甲基供体S-腺苷甲硫氨酸(SAM)的竞争性小分子抑制剂,对DOT1L很高的选择性,并可以有效抑制H3K79的甲基化。EPZ-5676可以有效抑制由MLL融合蛋白诱发的白血病细胞的生长,而对不含MLL融合蛋白的细胞系没有影响,表明其在癌细胞中的作用机制与MLL融合蛋白密切相关。目前EPZ-5676已经进入I期临床研究。生物学研究表明,DOT1L可以直接或间接地与多个主要的MLL融合伙伴相互作用,其中MLL-AF9和MLL-ENL可以直接与DOT1L结合(CancerCell,2008,14,355-368.)。敲低ENL或敲除DOT1L均会降低位于HoxA9基因位点的H3K79的甲基化,并抑制带有MLL融合基因的白血病细胞的生长(Epigenomics,2011,3,667-670.)。阻断MLL融合蛋白与DOT1L的相互作用,可以在不改变细胞中整体的H3K79甲基化水平的情况下抑制血细胞的癌变(Blood,2011,117,4759-4768.),因此,阻断MLL融合蛋白对DOT1L的招募是一种新的治疗带有MLL重排基因的白血病的潜在方法,并且有可能可以克服因完全抑制DOT1L的活性而导致的副作用。抑制MLL融合蛋白与DOT1L相互作用的小分子化合物不仅可以作为研究MLL融合蛋白作用机制的工具,并且有可能从中发展出新型的治疗MLL白血病的药物。
最近,Kuntimaddi等人利用核磁共振技术研究了AF9与DOT1L的结合(CellReports,2015,11,808-820)。他们通过15N-1H HSQC发现AF9中的一个结构域(氨基酸序列499-568)可以跟DOT1L中的三个不同位置的多肽片段结合,其中片段1与AF9的结合较弱,而片段2和3与AF9的结合较强。片段2和3中与AF9结合最重要的7肽片段几乎完全相同,在片段1中同样有一个多肽片段具有与这个7肽类似的氨基酸组成,因此这三个片段很可能是以类似的构像与AF9中的同一个区域结合。他们利用NMR解析了片段3与AF9所形成的复合物的三维结构,并根据结构信息,设计了两种定点突变的MLL-AF9融合蛋白。这些突变的蛋白不能与DOT1L有效结合,但是可以同野生型的融合蛋白竞争与受MLL融合蛋白调控的基因位点的结合,因此可以抑制野生型融合蛋白对DOT1L的招募。在小鼠骨髓c-kit细胞中表达这些定点突变的MLL融合蛋白可以明显抑制受MLL融合蛋白调控的基因位点处H3K79的双甲基化和三甲基化,并抑制Hoxa9和Meis-1等基因的表达。另外,在一项独立的研究中,密西根大学Nikolovska-Coleska的研究组同样发现含DOT1L中的氨基酸残基865-874的十肽(位于片段2中)可以与AF9和ENL结合,并能有效阻断DOT1L与MLL-AF9/ENL的结合(J.Biol.Chem.,2013,288,30585-30596.)。以上研究进一步证明阻断MLL-AF9融合蛋白与DOT1L的相互作用有可能是一种新的治疗白血病的方法。
本发明中我们以从DOT1L的片段2和3中截取的能够与MLL融合蛋白结合并阻断MLL融合蛋白与DOT1L相互作用的7肽为模板,设计并合成了一类将用于治疗MLL白血病的阻断MLL融合蛋白与甲基转移酶DOT1L相互作用的拟肽类小分子化合物。
发明内容
本发明中的化合物优选式I的结构:
其中X和Y分别为1-3个取代或非取代的亚甲基,其中一个或多个亚甲基可以被氧、硫或NR所替换,NR中N为氮原子,R为氢原子、非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫所替换;R1-R9为1~20碳的非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫或NR所替换,NR中N为氮原子,R为氢原子、非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫所替换;R3和R4可以相互连接成为环状结构;R6和R7可以相互连接为环状结构;A为连接结构,可以选自非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫或NR所替换,NR中N为氮原子,R为氢原子、非取代或取代的烷基、非取代或取代的环烷基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫所替换。以上描述中的取代基选自卤素原子、硝基、亚硝基、腈基、非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫或NR1R2所替换,NR1R2中N为氮原子,R1和R2为氢原子、非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫所替换。
本发明中的化合物还优选式II的结构:
其中X和Y分别为1-3个取代或非取代的亚甲基,其中一个或多个亚甲基可以被氧、硫或NR所替换,NR中N为氮原子,R为氢原子、非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫所替换;R1-R10为1~20碳的非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫或NR所替换,NR中N为氮原子,R为氢原子、非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫所替换;R4和R5可以相互连接成为环状结构;R7和R8可以相互连接为环状结构;A为连接结构,可以选自非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫或NR所替换,NR中N为氮原子,R为氢原子、非取代或取代的烷基、非取代或取代的环烷基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫所替换。以上描述中的取代基选自卤素原子、硝基、亚硝基、腈基、非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫或NR1R2所替换,NR1R2中N为氮原子,R1和R2为氢原子、非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫所替换。
本发明中的化合物还优选式III的结构:
其中Ar为带有至少一个取代基的单环或多环芳基或芳杂环;X和Y分别为0-3个取代或非取代的亚甲基,其中一个或多个亚甲基可以被氧、硫或NR所替换,NR中N为氮原子,R为氢原子、非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫所替换;R1-R10为1~20碳的非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫或NR所替换,NR中N为氮原子,R为氢原子、非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫所替换;R2和R3可以相互连接成为环状结构;R5和R6可以相互连接为环状结构;A为连接结构,可以选自非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫或NR所替换,NR中N为氮原子,R为氢原子、非取代或取代的烷基、非取代或取代的环烷基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫所替换。以上描述中的取代基选自卤素原子、硝基、亚硝基、腈基、非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫或NR1R2所替换,NR1R2中N为氮原子,R1和R2为氢原子、非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫所替换。
本发明提供了如式I所示拟肽类化合物的制备方法,如下反应式:
具体包括以下步骤:
(1)化合物1与Boc保护氨基酸缩合,然后酸性条件下脱Boc保护制得化合物2;
(2)化合物2与Boc保护氨基酸缩合,然后酸性条件下脱Boc保护制得化合物3;
(3)化合物3与Boc保护氨基酸缩合,然后酸性条件下脱Boc保护制得化合物4;
(4)化合物4与酸缩合制得化合物I。
本发明的优选式I代表的化合物选自包含下列各化合物的结构类型:
在研究二肽模拟物双环衍生物的合成过程中,本发明按照下述路线制备式(12)的化合物:
具体包括以下步骤:
(1)L-N-Boc焦谷氨酸甲酯通过三步反应得到化合物6;
(2)化合物6中的甲酯转换为苄酯得到化合物7;
(3)化合物7脱Boc保护与丙烯酰氯反应得到化合物8;
(4)化合物8通过RCM反应关环得到化合物9;
(5)化合物9溴代得到化合物10;
(6)化合物10通过偶联得到化合物11;
(7)化合物11通过氢化还原双键和苄酯得到化合物12。
在研究二肽模拟物双环衍生物的合成过程中,本发明按照下述路线制备式(16)的化合物:
具体包括以下步骤:
(1)化合物13通过与D-N-Cbz氨基酸缩合后再臭氧化得到化合物14;
(2)化合物14氢化关环得到化合物15;
(3)化合物15乙酰化得到化合物16。
具体实施方式
下面通过实施例具体说明本发明的内容。在本发明中,以下所述的实施例是为了更好的阐述本发明,并不是用来限制本发明的范围。
实施例1二肽模拟物双环衍生物式(12)的合成
1-(叔丁基)-2-甲基-(2S,5R)-5-烯丙基吡咯烷-1,2-二羧酸酯的制备:
将L-N-Boc-焦谷氨酸甲酯(10.0g,41.11mmol,1.0eq)溶于无水THF(100mL)中,氮气保护,-78℃下缓慢滴加DIBAH(1.5M in toluene)(54.81mL,82.22mmol,2.0eq),-78℃反应3-5h。TLC监测反应完全后,加入饱和酒石酸钾钠水溶液淬灭反应。反应液用水稀释,EA萃取三次。合并有机相,有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩得无色油状物,无需纯化直接用于下一步反应。将上述无色油状物溶于甲醇(100mL)中,加入催化量的对甲苯磺酸,室温反应过夜。TLC监测反应完全后,旋除溶剂,加入饱和碳酸氢钠水溶液中和反应,反应液用水稀释,EA萃取三次。合并有机相,有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(PE∶EA=10∶1)得无色油状物1-(叔丁基)-2-甲基-(2S)-5-甲氧基吡咯烷-1,2-二羧酸酯(9.60g,收率90.0%)。
将上述油状物溶于无水乙醚(100mL)中,氮气保护,-78℃下依次缓慢滴加烯丙基三甲基硅烷(8.46g,74.04mmol,2.0eq)和三氟化硼乙醚(5.78g,40.72mmol,1.1eq),反应液缓慢升至室温反应3h。TLC监测反应完全后,加入饱和碳酸氢钠水溶液中和反应,反应液用水稀释,EA萃取三次。合并有机相,有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(PE∶EA=15∶1)得无色油状物1-(叔丁基)-2-甲基-(2S,5R)-5-烯丙基吡咯烷-1,2-二羧酸酯(8.07g,收率80.9%)。1H-NMR(300MHz,CDCl3)δ5.86(m,1H),5.13(m,1H),5.07(m,1H),4.22(m,1H),3.51(s,3H),2.82-2.67(m,1H),2.40-2.30(m,2H),2.18-2.13(m,2H),1.41(s,9H);ESI-MS m/z calc’d for C14H23NO4[M+Na]+291.2,found 291.3.
2-苄基1-(叔丁基)(2S,5R)-5-烯丙基吡咯烷-1,2-二羧酸酯的制备;
将(2S,5R)-5-烯丙基-1-(叔丁氧基羰基)吡咯烷-2-羧酸、无水碳酸钾(8.28g,59.92mmol,2.0eq)溶于无水DMF中,缓慢滴加溴化苄(5.64g,32.96mmol,1.1eq),室温反应2h。TLC监测反应完全后,反应液用水稀释,EA萃取三次。合并有机相,有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(PE∶EA=10∶1)得2-苄基1-(叔丁基)(2S,5R)-5-烯丙基吡咯烷-1,2-二羧酸酯(9.31g,收率90.0%)。ESI-MS m/zcalc’d forC20H27NO4[M+Na]+368.2,found 368.4.
(2S,5R)-1-丙烯酰基-5-烯丙基吡咯烷-2-羧酸苄酯的制备:
将2-苄基1-(叔丁基)(2S,5R)-5-烯丙基吡咯烷-1,2-二羧酸酯溶于盐酸乙酸乙酯中,室温反应1h。TLC监测反应完全后减压浓缩,得到以氨基盐酸盐形式存在的产物,可不经纯化直接用于下一步反应,产率近100%。将脱除Boc保护的胺(5.00g,14.47mmol,1.0eq)溶于DCM中,加入丙烯酰氯(1.44g,15.92mmol,1.1eq),0℃下缓慢滴加DIPEA(3.74g,28.95mmol,2.0eq),室温反应2h。TLC监测反应完全后,反应液用水稀释,EA萃取三次。合并有机相,有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(PE∶EA=4∶1)得无色油状物(4.00g,收率92.4%)。1H-NMR(300MHz,CDCl3)δ7.42-7.30(m,5H),6.55-6.18(m,2H),5.89-5.68(m,2H),5.22(s,2H),5.18-4.99(m,2H),4.59(m,1H),4.10(m,1H),2.61-2.10(m,3H),2.11-1.88(m,3H);ESI-MS m/z calc’d for C18H21NO2[M+Na]+322.2,found 322.4.
(3S,8aS)-5-氧代-1,2,3,5,8,8a-六氢吲嗪-3-甲酸苄酯的制备:
将(2S,5R)-1-丙烯酰基-5-烯丙基吡咯烷-2-羧酸苄酯(4.00g,13.36mmol,1.0eq)溶于无水甲苯中(400mL),氮气保护条件下加入催化量的Grubbs二代催化剂,回流反应24h。TLC监测反应完全后,浓缩反应液,硅胶柱层析分离(PE∶EA=2∶1)得无色油状物(3.09g,收率85.1%)。ESI-MS m/z calc’d for C16H17NO3[M+Na]+294.1,found 294.3.
(3S,8aS)-6-溴-5-氧代-1,2,3,5,8,8a-六氢吲嗪-3-甲酸苄酯的制备:
将(3S,8aS)-5-氧代-1,2,3,5,8,8a-六氢吲嗪-3-甲酸苄酯(3.09g,11.39mmol,1.0eq)溶于DCM中(100mL),0℃下缓慢滴加液溴(2.18g,14.67mmol,1.2eq)的DCM溶液(0.5M),室温反应3h。TLC监测反应完全后,将反应液移至冰浴中,缓慢滴加DIPEA(2.94g,22.78mmol,2.0eq),室温反应过夜。TLC监测反应完全后,浓缩反应液,硅胶柱层析分离(PE∶EA=2∶1)得白色固体(3.53g,收率88.5%)。1H-NMR(300MHz,CDCl3)δ7.35-7.22(m,5H),6.95(m,1H),5.34(s,2H),4.57(m,1H),3.90(m,1H),2.58-2.34(m,2H),2.27-2.03(m,3H),1.85(m,1H);ESI-MS m/z calc’d for C16H16BrNO3[M+Na]+373.2,found 373.2.
5-氧代-6-苯基八氢吲哚嗪-3-羧酸的制备:
将(3S,8aS)-6-溴-5-氧代-1,2,3,5,8,8a-六氢吲嗪-3-甲酸苄酯(0.10g,0.29mmol,1.0eq)溶于1,4-二氧六环(4mL)和水(1mL)的混合溶液中,再加入四(三苯基膦)钯(17mg,14.28μmol,0.05eq),苯硼酸(38mg,0.31mmol,1.0eq),碳酸铯(0.19g,0.57mmol,2.0eq),氮气保护条件下,100℃反应12h。TLC监测反应完全后冷却至室温,反应液用水稀释,EA萃取三次。合并有机相,有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(PE∶EA=2∶1)得白色固体约85mg,收率85.9%。1H-NMR(300MHz,CDCl3)δ7.54-7.38(m,7H),7.39-7.25(m,3H),6.73(m,1H),5.34(s,2H),4.60(m,1H),3.92(m,1H),2.72-2.08(m,5H),2.04-1.85(m,1H);ESI-MS m/z calc’d for C22H21NO3[M+Na]+370.2,found370.4.将上述白色固体溶于甲醇中,加入10%钯碳(10mg),通入氢气室温反应2h。TLC监测反应完全后,硅藻土过滤,滤液浓缩得5-氧代-6-苯基八氢吲哚嗪-3-羧酸(收率约100%)。
5-氧代-6-(邻甲苯基)八氢吲哚嗪-3-羧酸的制备:
将(3S,8aS)-6-溴-5-氧代-1,2,3,5,8,8a-六氢吲嗪-3-甲酸苄酯(0.10g,0.29mmol,1.0eq)溶于1,4-二氧六环(4mL)和水(1mL)的混合溶液中,再加入四(三苯基膦)钯(17mg,14.28μmol,0.05eq),邻甲基苯硼酸(43mg,0.31mmol,1.0eq),碳酸铯(0.19g,0.57mmol,2.0eq)。氮气保护条件下,100℃反应12h。TLC监测反应完全后冷却至室温,反应液用水稀释,EA萃取三次。合并有机相,有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(PE∶EA=2∶1)得白色固体约55mg,收率53.4%。1H-NMR(300MHz,CDCl3)δ7.45-7.32(m,5H),7.30-7.05(m,4H),6.50(m,1H),5.35(s,2H),4.60(m,1H),3.99(m,1H),2.71-2.26(m,3H),2.23(s,3H),2.14(m,1H),2.03-1.70(m,2H);ESI-MS m/z calc’d forC23H23NO3[M+Na]+384.2,found 384.4.将上述白色固体溶于甲醇中,加入10%钯碳(10mg),通入氢气室温反应2h。TLC监测反应完全后,硅藻土过滤,滤液浓缩得5-氧代-6-(邻甲苯基)八氢吲哚嗪-3-羧酸(收率约100%)。
5-氧代-6-(间甲苯基)八氢吲哚嗪-3-羧酸的制备:
将(3S,8aS)-6-溴-5-氧代-1,2,3,5,8,8a-六氢吲嗪-3-甲酸苄酯(0.10g,0.29mmol,1.0eq)溶于1,4-二氧六环(4mL)和水(1mL)的混合溶液中,再加入四(三苯基膦)钯(17mg,14.28μmol,0.05eq),间甲基苯硼酸(43mg,0.31mmol,1.0eq),碳酸铯(0.19g,0.57mmol,2.0eq)。氮气保护条件下,100℃反应12h。TLC监测反应完全后冷却至室温,反应液用水稀释,EA萃取三次。合并有机相,有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(PE∶EA=2∶1)得白色固体约80mg,收率77.7%。1H-NMR(300MHz,CDCl3)δ7.54-7.38(m,5H),7.35-7.22(m,3H),7.12(m,1H),6.72(m,1H),5.30(s,2H),4.63(m,1H),3.93(m,1H),2.73-2.41(m,2H),2.36(s,3H),2.33-2.07(m,3H),1.94(m,1H);ESI-MS m/zcalc’d for C23H23NO3[M+Na]+384.2,found 384.4.将上述白色固体溶于甲醇中,加入10%钯碳(10mg),通入氢气室温反应2h。TLC监测反应完全后,硅藻土过滤,滤液浓缩得5-氧代-6-(间甲苯基)八氢吲哚嗪-3-羧酸(收率约100%)。
5-氧代-6-(对甲苯基)八氢吲哚嗪-3-羧酸的制备:
将(3S,8aS)-6-溴-5-氧代-1,2,3,5,8,8a-六氢吲嗪-3-甲酸苄酯(0.10g,0.29mmol,1.0eq)溶于1,4-二氧六环(4mL)和水(1mL)的混合溶液中,再加入四(三苯基膦)钯(17mg,14.28μmol,0.05eq),对甲基苯硼酸(43mg,0.31mmol,1.0eq),碳酸铯(0.19g,0.57mmol,2.0eq)。氮气保护条件下,100℃反应12h。TLC监测反应完全后冷却至室温,反应液用水稀释,EA萃取三次。合并有机相,有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(PE∶EA=2∶1)得白色固体约100mg,收率97.1%。1H-NMR(300MHz,CDCl3)δ7.55-7.40(m,5H),7.44-7.32(m,2H),7.21-7.10(m,2H),6.70(m,1H),5.33(s,2H),4.61(m,1H),3.91(m,1H),2.71-2.40(m,2H),2.35(s,3H),2.28-2.09(m,2H),2.03-1.64(m,2H);ESI-MS m/z calc’d for C23H23NO3[M+Na]+384.2,found 384.4.将上述白色固体溶于甲醇中,加入10%钯碳(10mg),通入氢气室温反应2h。TLC监测反应完全后,硅藻土过滤,滤液浓缩得5-氧代-6-(对甲苯基)八氢吲哚嗪-3-羧酸(收率约100%)。
6-异丙基-5-氧代八氢吲哚嗪-3-羧酸的制备:
将(3S,8aS)-6-溴-5-氧代-1,2,3,5,8,8a-六氢吲嗪-3-甲酸苄酯(0.10g,0.29mmol,1.0eq)溶于无水THF(4mL)中,再加入三(二亚苄基丙酮)二钯(13mg,14.28μmol,0.05eq),异丙烯基三氟硼酸钾(59mg,0.40mmol,1.4eq),氟化钾(0.55g,0.94mmol,3.3eq)和三叔丁基膦(57μl,0.1M in hexane,0.02eq)。氮气保护条件下,50℃反应24h。TLC监测反应完全后冷却至室温,反应液用水稀释,EA萃取三次。合并有机相,有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(PE∶EA=3∶1)得白色固体约65mg,收率73.1%。1H-NMR(300MHz,CDCl3)δ7.56-7.42(m,5H),6.31(m,1H),5.39(s,2H),5.49(m,1H),5.09(m,1H),4.54(m,1H),3.81(m,1H),2.60-2.29(m,2H),2.13(s,3H),1.91-1.60(m,4H);ESI-MS m/zcalc’d for C19H21NO3[M+Na]+334.1,found 334.3.将上述白色固体溶于甲醇中,加入10%钯碳(10mg),通入氢气室温反应2h。TLC监测反应完全后,硅藻土过滤,滤液浓缩得6-异丙基-5-氧代八氢吲哚嗪-3-羧酸(收率约100%)。
6-(4-甲基戊基)-5-氧代八氢吲哚嗪-3-羧酸的制备:
将(3S,8aS)-6-溴-5-氧代-1,2,3,5,8,8a-六氢吲嗪-3-甲酸苄酯(0.10g,0.29mmol,1.0eq)溶于无水THF(4mL)中,再加入二氯二三苯基膦钯(10mg,14.28μmol,0.05eq),4-甲基戊炔(22mg,0.40mmol,1.4eq),碘化亚铜(6mg,28.55μmol,0.1eq),三乙胺(56mg,0.57mmol,2.0eq),氮气保护条件下,110℃反应24h。TLC监测反应完全后冷却至室温,反应液用水稀释,EA萃取三次。合并有机相,有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(PE∶EA=3∶1)得无色油状物约60mg,收率62.5%。1H-NMR(300MHz,CDCl3)δ7.52-7.38(m,5H),6.79(m,1H),5.30(s,2H),4.57(m,1H),3.81(m,1H),2.64-2.40(m,2H),2.23-2.02(m,4H),1.91-1.79(m,3H),1.01-0.97(m,6H);ESI-MS m/zcalc’d for C22H25NO3[M+Na]+374.2,found 374.4.将上述无色油状物溶于甲醇中,加入10%钯碳(10mg),通入氢气室温反应2h。TLC监测反应完全后,硅藻土过滤,滤液浓缩得6-(4-甲基戊基)-5-氧代八氢吲哚嗪-3-羧酸(收率约100%)。
实施例2二肽模拟物双环衍生物式(16)的合成
(2S,5R)-1-((R)-2-(((苄氧基)羰基)氨基)-2-苯基乙酰基)-5-(2-氧代乙基)吡咯烷-2-羧酸苄酯的制备:
将(2S,5R)-5-烯丙基吡咯烷-2-羧酸苄酯(0.5g,2.04mmol,1.0eq)和D-N-Cbz-苯甘氨酸(0.64g,2.24mmol,1.1eq),EDC(0.43g,2.24mmol,1.1eq)和HOBT(0.41g,3.06mmol,1.5eq)溶于DCM(20mL)中,室温搅拌30min,0℃下缓慢滴加DIPEA(0.53g,4.08mmol,2.0eq),室温反应过夜。TLC监测反应完全后,反应液用DCM稀释,有机相依次用1 N HCl水溶液,饱和碳酸氢钠水溶液和饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(PE∶EA=4∶1)得无色油状物(2S,5R)-5-烯丙基-1-((R)-2-(((苄氧基)羰基)氨基)-2-苯基乙酰基)吡咯烷-2-甲酸苄酯。将上述无色油状物溶于DCM中,-78℃下通入臭氧反应1h,TLC监测反应完全后,加入1mL三乙胺淬灭反应,反应液浓缩,硅胶柱层析分离(PE∶EA=2∶1)得无色油状物(0.71g,两步总收率67.5%)。ESI-MS m/z calc’d for C30H30N206[M+Na]+537.2,found537.6.
(2S,5R)-1-(((苄氧基)羰基)-D-缬氨酰基)-5-(2-氧代乙基)吡咯烷-2-甲酸苄酯的制备:
将(2S,5R)-5-烯丙基吡咯烷-2-羧酸苄酯(0.5g,2.04mmol,1.0eq)和D-N-Cbz-缬氨酸(0.56g,2.24mmol,1.1eq),EDC(0.43g,2.24mmol,1.1eq)和HOBT(0.41g,3.06mmol,1.5eq)溶于DCM(20mL)中,室温搅拌30min,0℃下缓慢滴加DIPEA(0.53g,4.08mmol,2.0eq),室温反应过夜。TLC监测反应完全后,反应液用DCM稀释,有机相依次用1 N HCl水溶液,饱和碳酸氢钠水溶液和饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(PE∶EA=4∶1)得无色油状物(2S,5R)-5-烯丙基-1-(((苄氧基)羰基)-D-缬氨酰基)吡咯烷-2-羧酸苄酯。将上述无色油状物溶于DCM中,-78℃下通入臭氧反应1h,TLC监测反应完全后,加入1mL三乙胺淬灭反应,反应液浓缩,硅胶柱层析分离(PE∶EA=2∶1)得无色油状物40b(0.44g,两步收率44.9%)。ESI-MS m/z calc’d for C27H32N2O5[M+Na]+503.2,found 503.5.
(2S,5R)-1-((R)-2-(((苄氧基)羰基)氨基)-2-环戊基乙酰基)-5-(2-氧代乙基)吡咯烷-2-甲酸苄酯的制备:
将(2S,5R)-5-烯丙基吡咯烷-2-羧酸苄酯(0.5g,2.04mmol,1.0eq)和D-N-Cbz-环戊基甘氨酸(0.62g,2.24mmol,1.1eq),EDC(0.43g,2.24mmol,1.1eq)和HOBT(0.41g,3.06mmol,1.5eq)溶于DCM(20mL)中,室温搅拌30min,0℃下缓慢滴加DIPEA(0.53g,4.08mmol,2.0eq),室温反应过夜。TLC监测反应完全后,反应液用DCM稀释,有机相依次用1N HCl水溶液,饱和碳酸氢钠水溶液和饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(PE∶EA=4∶1)得无色油状物(2S,5R)-5-烯丙基-1-((R)-2-(((苄氧基)羰基)氨基)-2-环戊基乙酰基)吡咯烷-2-羧酸苄酯。将上述无色油状物溶于DCM中,-78℃下通入臭氧反应1h,TLC监测反应完全后,加入1mL三乙胺淬灭反应,反应液浓缩,硅胶柱层析分离(PE∶EA=2∶1)得无色油状物(0.52g,两步收率50.6%)。ESI-MS m/z calc’d for C29H34N2O6[M+Na]+529.2,found 529.6.
(2S,5R)-1-((R)-2-(((苄氧基)羰基)氨基)-2-环己基乙酰基)-5-(2-氧代乙基)吡咯烷-2-甲酸苄酯的制备:
将(2S,5R)-5-烯丙基吡咯烷-2-羧酸苄酯(0.5g,2.04mmol,1.0eq)、D-N-Cbz-环己基甘氨酸(0.65g,2.24mmol,1.1eq),EDC(0.43g,2.24mmol,1.1eq)和HOBT(0.41g,3.06mmol,1.5eq)溶于DCM(20mL)中,室温搅拌30min,0℃下缓慢滴加DIPEA(0.53g,4.08mmol,2.0eq),室温反应过夜。TLC监测反应完全后,反应液用DCM稀释,有机相依次用1N HCl水溶液,饱和碳酸氢钠水溶液和饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(PE∶EA=4∶1)得无色油状物(2S,5R)-5-烯丙基-1-((R)-2-(((苄氧基)羰基)氨基)-2-环己基乙酰基)吡咯烷-2-羧酸苄酯。将上述无色油状物溶于DCM中,-78℃下通入臭氧反应1h,TLC监测反应完全后,加入1mL三乙胺淬灭反应,反应液浓缩,硅胶柱层析分离(PE∶EA=2∶1)得无色油状物(0.62g,两步收率58.5%)。ESI-MS m/z calc’d for C30H36N2O6[M+Na]+543.3,found 543.3.
(4R,7S,9aS)-3-乙酰基-4-苯-5-氧代-1H-吡咯并[1,2-d][1,4]二氮杂-7-甲酸的制备:
将(2S,5R)-1-((R)-2-(((苄氧基)羰基)氨基)-2-苯基乙酰基)-5-(2-氧代乙基)吡咯烷-2-羧酸苄酯(0.71g,1.38mmol,1.0eq)溶于甲醇中,加入10%钯碳(70mg),通入氢气室温反应过夜。TLC监测反应完全后,硅藻土过滤,滤液浓缩得(4R,7S,9aS)-4-苯基-5-氧代-1H-吡咯并[1,2-d][1,4]二氮杂-7-甲酸(收率约100%)。将其溶于DCM中,加入乙酰氯(0.13g,1.66mmol,1.2eq),0℃下缓慢滴加DIPEA(0.53g,4.14mmol,3.0eq),室温反应2h。TLC监测反应完全后,反应液用1 N HCl水溶液调pH为酸性,DCM萃取三次。合并有机相,有机相用水、饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(DCM∶MeOH=10∶1)得无色油状物(0.30g,收率67.1%)。1H-NMR(300MHz,CDCl3)δ12.22(s,1H),7.42-7.27(m,5H),4.64(m,1H),4.53(m,1H),4.14(m,1H),3.33(m,1H),3.04(m,1H),2.34(s,3H),2.32-2.14(m,2H),2.12-1.95(m,2H),1.91-1.70(m,2H);ESI-MS m/z calc’d for C17H20N2O4[M+Na]+339.1,found 339.4.
(4R,7S,9aS)-3-乙酰基-4-异丙基-5-氧代-1H-吡咯并[1,2-d][1,4]二氮杂-7-甲酸的制备:
将(2S,5R)-1-(((苄氧基)羰基)-D-缬氨酰基)-5-(2-氧代乙基)吡咯烷-2-甲酸苄酯(0.44g,0.92mmol,1.0eq)溶于甲醇中,加入10%钯碳(40mg),通入氢气室温反应过夜。TLC监测反应完全后,硅藻土过滤,滤液浓缩得(4R,7S,9aS)-3-乙酰基-4-异丙基-5-氧代-1H-吡咯并[1,2-d][1,4]二氮杂-7-甲酸(收率约100%)。将其溶于DCM中,加入乙酰氯(86mg,1.10mmol,1.2eq),0℃下缓慢滴加DIPEA(0.35g,2.75mmol,3.0eq),室温反应2h。TLC监测反应完全后,反应液用1 N HCl水溶液调pH为酸性,DCM萃取三次。合并有机相,有机相用水、饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(DCM∶MeOH=10∶1)得无色油状物(0.14g,收率54.3%)。1H-NMR(300MHz,CDCl3)δ12.22(s,1H),4.60(m,1H),3.93(m,1H),3.40(m,1H),2.91-2.78(m,2H),2.30(s,3H),2.28-1.98(m,4H),1.87-1.65(m,3H),0.98(d,J=4.5Hz,3H),0.96(d,J=4.5Hz,3H);ESI-MS m/z calc’d for C14H22N2O4[M+Na]+305.2,found 305.3.
(4R,7S,9aS)-3-乙酰基-4-环戊基-5-氧代-1H-吡咯并[1,2-d][1,4]二氮杂-7-甲酸的制备:
将(2S,5R)-1-((R)-2-(((苄氧基)羰基)氨基)-2-环戊基乙酰基)-5-(2-氧代乙基)吡咯烷-2-甲酸苄酯(0.52g,1.03mmol,1.0eq)溶于甲醇中,加入10%钯碳(50mg),通入氢气室温反应过夜。TLC监测反应完全后,硅藻土过滤,滤液浓缩得(4R,7S,9aS)-3-乙酰基-4-环戊基-5-氧代-1H-吡咯并[1,2-d][1,4]二氮杂-7-甲酸(收率约100%)。将其溶于DCM中,加入乙酰氯(97mg,1.23mmol,1.2eq),0℃下缓慢滴加DIPEA(0.40g,3.08mmol,3.0eq),室温反应2h。TLC监测反应完全后,反应液用1 N HCl水溶液调pH为酸性,DCM萃取三次。合并有机相,有机相用水、饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(DCM∶MeOH=10∶1)得无色油状物(0.18g,收率57.6%)。1H-NMR(300MHz,CDCl3)δ12.23(s,1H),4.69(m,1H),4.02(m,1H),3.50(m,lH),2.88(m,1H),2.82(m,1H),2.29-2.18(m,4H),2.17-1.98(m,3H),1.87-1.69(m,3H),1.67-1.50(m,6H),1.49-1.28(m,2H);ESI-MS m/z calc’dfor C16H24N2O4[M+Na]+331.2,found 331.4.
(4R,7S,9aS)-3-乙酰基-4-环己基-5-氧代-1H-吡咯并[1,2-d][1,4]二氮杂-7-甲酸的制备:
将(2S,5R)-1-((R)-2-(((苄氧基)羰基)氨基)-2-环己基乙酰基)-5-(2-氧代乙基)吡咯烷-2-甲酸苄酯(0.62g,1.19mmol,1.0eq)溶于甲醇中,加入10%钯碳(60mg),通入氢气室温反应过夜。TLC监测反应完全后,硅藻土过滤,滤液浓缩得(4R,7S,9aS)-3-乙酰基-4-环己基-5-氧代-lH-吡咯并[1,2-d][1,4]二氮杂-7-甲酸(收率约100%)。将其溶于DCM中,加入乙酰氯(112mg,1.43mmol,1.2eq),0℃下缓慢滴加DIPEA(0.46g,3.57mmol,3.0eq),室温反应2h。TLC监测反应完全后,反应液用1 N HCl水溶液调pH为酸性,DCM萃取三次。合并有机相,有机相用水、饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(DCM∶MeOH=10∶1)得无色油状物(0.20g,收率52.1%)。ESI-MS m/z calc’d for C17H26N2O4[M+Na]+345.2,found 345.4.
实施例3关键中间体的合成
((S)-3-(((S)-1-(((S)-1-(1H-苯并[d]咪唑基)乙基)氨基)-3-环戊基-1-氧代丙烷基)-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-甲基丁酰氨基)-3-氧代丙基)甲基氨基甲酸苄酯叔丁酯的制备:
将(((S)-3-(((S)-1-(((S)-1-(1H-苯并[d]咪唑基)乙基)氨基)-3-环戊基-1-氧代丙-1-醇吡啶-2-基)氨基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-氧代丙基)甲基氨基甲酸苄酯叔丁酯(0.67g,1.06mmol,1.Oeq)溶于盐酸甲醇中,室温反应1h。TLC监测反应完全后减压浓缩,得到以氨基盐酸盐形式存在的产物,可不经纯化直接用于下一步反应,产率近100%。将脱除Boc保护的胺和L-N-Boc-缬氨酸(0.23g,1.06mmol,1.0eq),HATU(0.48g,1.27mmol,1.2eq)溶于DMF(20mL)中,室温搅拌30min,0℃下缓慢滴加DIPEA(0.27g,2.11mmol,2.0eq),室温反应3h。TLC监测反应完全后,反应液用水稀释,EA萃取三次,有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(DCM∶MeOH=20∶1)得((S)-3-(((S)-1-(((S)-1-(1H-苯并[d]咪唑基)乙基)氨基)-3-环戊基-1-氧代丙烷基)-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-甲基丁酰氨基)-3-氧代丙基)甲基氨基甲酸苄酯叔丁酯(0.60g,两步收率77.9%)。1H-NMR(300MHz,CDCl3)δ8.47(brd,J=4.3Hz,1H),7.61-7.54(m,3H),7.45-7.31(m,7H),7.26-7.15(m 2H),5.44(m,1H),5.25(m,1H),5.10(m,1H),4.93(m,1H),4.49(m,1H),4.39(m,1H),3.90(m,1H),3.69(m,1H),3.54(m,1H),3.00(s,3H),2.06-1.77(m,6H),1.74(d,J=7.1Hz,3H),1.71-1.58(m,3H),1.53(s,9H),1.26-1.05(m,3H),0.93-0.70(m,6H);ESI-MS m/z calc’d for C39H55N7O7[M+Na]+756.4,found 756.6.
((S)-3-(((S)-1-(((S)-1-(1H-苯并[d]咪唑基)乙基)氨基)-3-环戊基-1-氧代丙烷基)-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-甲基丁酰氨基)-3-氧代丙基)氨基甲酸苄酯叔丁酯的制备:
将((S)-3-(((S)-3-环戊基-1-氧代-1-(((S)-1-(4-苯基-1H-苯并[d]咪唑基)乙基)氨基)丙基)氨基)-3-氧代丙烷-1,2-二基)二氨基甲酸苄酯叔丁酯(0.50g,0.80mmol,1.0eq)溶于盐酸甲醇中,室温反应1h。TLC监测反应完全后减压浓缩,得到以氨基盐酸盐形式存在的产物,可不经纯化直接用于下一步反应,产率近100%。将脱除Boc保护的胺和L-N-Boc-缬氨酸(0.18g,0.80mmol,1.0eq),HATU(0.37g,0.97mmol,1.2eq)溶于DMF(20mL)中,室温搅拌30min,0℃下缓慢滴加DIPEA(0.21g,1.61mmol,2.0eq),室温反应3h。TLC监测反应完全后,反应液用水稀释,EA萃取三次,有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(DCM∶MeOH=20∶1)得((S)-3-(((S)-1-(((S)-1-(1H-苯并[d]咪唑基)乙基)氨基)-3-环戊基-1-氧代丙烷基)-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-甲基丁酰氨基)-3-氧代丙基)氨基甲酸苄酯叔丁酯(0.62g,两步收率76.4%)。1H-NMR(300MHz,CDCl3)δ8.31(brs,1H),7.90(brd,J=7.1Hz,1H),7.81(brd,J=6.9Hz,1H),7.79-7.70(m,2H),7.65-7.53(m,3H),7.48-7.48(m,3H),7.38-7.29(m,6H),5.8l(m,1H),5.48(m,1H),5.26-4.93(m,3H),4.39(m,1H),4.22(m,1H),3.72(m,lH),3.50(m,2H),2.07-1.71(m,4H),1.66(d,J=7.1Hz,3H),1.62-1.50(m,2H),1.47(s,9H),1.42-1.23(m,3H),1.14-1.05(m,3H),0.95-0.89(m,6H);ESI-MS m/z calc’d for C44H57N7O7[M+Na]+819.0,found 818.9.
((S)-3-(((S)-1-(((S)-1-(4-苯基-1H-苯并[d]咪唑基)乙基)氨基)-3-环戊基-1-氧代丙烷基)-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-甲基丁酰氨基)-3-氧代丙基)氨基甲酸苄酯叔丁酯的制备:
将((S)-3-(((S)-3-环戊基-1-氧代-1-(((S)-1-(1H-苯并[d]咪唑基)乙基)氨基)丙基)氨基)-3-氧代丙烷-1,2-二基)二氨基甲酸苄酯叔丁酯(0.50g,0.72mmol,1.0eq)溶于盐酸甲醇中,室温反应1h。TLC监测反应完全后减压浓缩,得到以氨基盐酸盐形式存在的产物,可不经纯化直接用于下一步反应,产率近100%。将脱除Boc保护的胺和L-N-Boc-缬氨酸(0.16g,0.72mmol,1.0eq),HATU(0.33g,0.86mmol,1.2eq)溶于DMF(20mL)中,室温搅拌30min,0℃下缓慢滴加DIPEA(0.18g,1.44mmol,2.0eq),室温反应3h。TLC监测反应完全后,反应液用水稀释,EA萃取三次,有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(DCM∶MeOH=20∶1)得((S)-3-(((S)-1-(((S)-1-(4-苯基-1H-苯并[d]咪唑基)乙基)氨基)-3-环戊基-1-氧代丙烷基)-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-甲基丁酰氨基)-3-氧代丙基)氨基甲酸苄酯叔丁酯(0.59g,两步收率82.9%)。1H-NMR(300MHz,CDCl3)δ8.49(brs,1H),7.91(brd,J=7.3Hz,1H),7.79(brd,J=7.1Hz,1H),7.68-7.62(m,2H),7.36-7.30(m,8H),6.05(m,1H),5.60-5.48(m,2H),5.34(m,1H),4.47-4.35(m,2H),3.76-3.61(m,4H),2.04(m,1H),1.94-1.84(m,2H),1.79(d,J=7.1Hz,3H),1.77-1.69(m,3H),1.65-1.54(m,3H),1.50(s,9H),1.47-1.41(m,3H),0.97-0.90(m,6H);ESI-MS m/z calc’dfor C38H53N7O7[M+Na]+742.4,found 742.9.
实施例4终产物的合成
((3S,6S,8aS)-5-氧代-6-苯基八氢吲嗪-3-羰基)-L-缬氨酰-3-氨基丙氨酰-环戊基丙氨酰-(S)-2-(4-苯基-1H-苯并[d]咪唑基)乙酰胺的制备:
将((S)-3-(((S)-1-(((S)-1-(4-苯基-1H-苯并[d]咪唑基)乙基)氨基)-3-环戊基-1-氧代丙烷基)-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-甲基丁酰氨基)-3-氧代丙基)氨基甲酸苄酯(80mg,100μmol,1.0eq),(3S,6S,8aS)-5-氧代-6-苯基八氢吲嗪-3-甲酸(29mg,110μmol,1.1eq)和HATU(46mg,120μmol,1.2eq)溶于DMF(10mL)中,室温搅拌30min,0℃下缓慢滴加DIPEA(39mg,300μmol,3.0eq),室温反应3h。TLC监测反应完全后,反应液用水稀释,EA萃取三次,有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(EA)得Cbz保护的(3S,6S,8aS)-5-氧代-6-苯基八氢吲嗪终产物。钯碳催化氢化脱Cbz保护(61.3mg,收率76.3%),经由半制备型高效液相分离纯化(洗脱梯度从60%A液和40%的B液到30%A液和70%的B液),冷冻干燥得((3S,6S,8aS)-5-氧代-6-苯基八氢吲嗪-3-羰基)-L-缬氨酰-3-氨基丙氨酰-环戊基丙氨酰-(S)-2-(4-苯基-1H-苯并[d]咪唑基)乙酰胺(纯度高于95%)。1H-NMR(300MHz,CD3OD)δ7.77(m,1H),7.71-7.51(m,7H),7.38-7.34(m,2H),7.31-7.20(m,3H),5.31(m,1H),4.76(m,1H),4.55(d,J=9.0Hz,1H),4.43(m,1H),3.95(d,J=7.0Hz,1H),3.78-3.64(m,2H),3.37(m,1H),3.21(m,1H),2.35-2.02(m,5H),1.98-1.89(m,2H),1.84-1.73(m,8H),1.70-1.59(m,3H),1.95-1.48(m,2H),1.31(m,1H),1.26-1.10(m,2H),1.05-0.96(m,6H);ESI-MS m/z calc’d for C46H58N8O5[M+Na]+825.4,found 825.9.
((3S,6S,8aS)-5-氧代-6-邻甲基苯基八氢吲嗪-3-羰基)-L-缬氨酰-3-氨基丙氨酰-环戊基丙氨酰-(S)-2-(4-苯基-1H-苯并[d]咪唑基)乙酰胺的制备:
将((S)-3-(((S)-1-(((S)-1-(4-苯基-1H-苯并[d]咪唑基)乙基)氨基)-3-环戊基-1-氧代丙烷基)-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-甲基丁酰氨基)-3-氧代丙基)氨基甲酸苄酯(80mg,100μmol,1.0eq),(3S,6S,8aS)-5-氧代-6-邻甲苯基八氢吲嗪-3-甲酸(30mg,110μmol,1.1eq)和HATU(46mg,120μmol,1.2eq)溶于DMF(10mL)中,室温搅拌30min,0℃下缓慢滴加DIPEA(39mg,300μmol,3.0eq),室温反应3h。TLC监测反应完全后,反应液用水稀释,EA萃取三次,有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(EA)得Cbz保护的(3S,6S,8aS)-5-氧代-6-邻甲苯基八氢吲嗪终产物。钯碳催化氢化脱Cbz保护(58.5mg,收率71.6%),经由半制备型高效液相分离纯化(洗脱梯度从60%A液和40%的B液到30%A液和70%的B液),冷冻干燥得((3S,6S,8aS)-5-氧代-6-邻甲基苯基八氢吲嗪-3-羰基)-L-缬氨酰-3-氨基丙氨酰-环戊基丙氨酰-(S)-2-(4-苯基-1H-苯并[d]咪唑基)乙酰胺(纯度高于95%)。1H-NMR(300MHz,CD3OD)δ7.77(m,1H),7.71-7.50(m,7H),7.38(m,1H),7.21-7.04(m,3H),5.31(m,1H),4.78(m,1H),4.56(d,J=9.0Hz,1H),4.43(m,1H),3.98-3.91(m,2H),3.69(m,1H),3.39(m,1H),3.22(m,1H),2.35(s,3H),2.27-2.03(m,5H),2.01-1.86(m,2H),1.82-1.74(m,8H),1.69-1.62(m,3H),1.57-1.49(m,2H),1.38-1.08(m,3H),1.05-0.96(m,6H);ESI-MS m/z calc’d for C47H60N8O5[M+Na]+839.4,found 839.9.
((3S,6S,8aS)-5-氧代-6-间甲基苯基八氢吲嗪-3-羰基)-L-缬氨酰-3-氨基丙氨酰-环戊基丙氨酰-(S)-2-(4-苯基-1H-苯并[d]咪唑基)乙酰胺的制备:
将((S)-3-(((S)-1-(((S)-1-(4-苯基-IH-苯并[d]咪唑基)乙基)氨基)-3-环戊基-1-氧代丙烷基)-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-甲基丁酰氨基)-3-氧代丙基)氨基甲酸苄酯(80mg,100μmol,1.0eq),(3S,6S,8aS)-5-氧代-6-间甲苯基八氢吲嗪-3-甲酸(30mg,110μmol,1.1eq)和HATU(46mg,120μmol,1.2eq)溶于DMF(10mL)中,室温搅拌30min,0℃下缓慢滴加DIPEA(39mg,300μmol,3.0eq),室温反应3h。TLC监测反应完全后,反应液用水稀释,EA萃取三次,有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(EA)得Cbz保护的(3S,6S,8aS)-5-氧代-6-间甲苯基八氢吲嗪终产物。钯碳催化氢化脱Cbz保护(62.7mg,收率76.7%),经由半制备型高效液相分离纯化(洗脱梯度从60%A液和40%的B液到30%A液和70%的B液),冷冻干燥得((3S,6S,8aS)-5-氧代-6-间甲基苯基八氢吲嗪-3-羰基)-L-缬氨酰-3-氨基丙氨酰-环戊基丙氨酰-(S)-2-(4-苯基-1H-苯并[d]咪唑基)乙酰胺(纯度高于95%)。1H-NMR(300MHz,CD3OD)δ7.76(m,1H),7.71-7.66(m,2H),7.64-7.51(m,5H),7.17-7.13(m,3H),7.03(m,1H),5.30(m,1H),4.77(m,1H),4.55(d,J=9.0Hz,1H),4.43(m,1H),3.98(m,1H),3.75-3.65(m,2H),3.37(m,1H),3.20(m,1H),2.33(s,3H),2.30-2.00(m,5H),1.95-1.72(m,11H),1.69-1.45(m,5H),1.24-1.08(m,2H),1.05-0.97(m,6H);ESI-MS m/z calc’d for C47H60N8O5[M+Na]+839.4,found 839.9.
((3S,6S,8aS)-5-氧代-6-对甲基苯基八氢吲嗪-3-羰基)-L-缬氨酰-3-氨基丙氨酰-环戊基丙氨酰-(S)-2-(4-苯基-1H-苯并[d]咪唑基)乙酰胺的制备:
将((S)-3-(((S)-1-(((S)-1-(4-苯基-1H-苯并[d]咪唑基)乙基)氨基)-3-环戊基-1-氧代丙烷基)-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-甲基丁酰氨基)-3-氧代丙基)氨基甲酸苄酯(80mg,100μmol,1.0eq),(3S,6S,8aS)-5-氧代-6-对甲苯基八氢吲嗪-3-甲酸(30mg,110μmol,1.1eq)和HATU(46mg,120μmol,1.2eq)溶于DMF(10mL)中,室温搅拌30min,0℃下缓慢滴加DIPEA(39mg,300μmol,3.0eq),室温反应3h。TLC监测反应完全后,反应液用水稀释,EA萃取三次,有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(EA)得Cbz保护的(3S,6S,8aS)-5-氧代-6-对甲苯基八氢吲嗪终产物。钯碳催化氢化脱Cbz保护(65.0mg,收率79.6%),经由半制备型高效液相分离纯化(洗脱梯度从60%A液和40%的B液到30%A液和70%的B液),冷冻干燥得((3S,6S,8aS)-5-氧代-6-对甲基苯基八氢吲嗪-3-羰基)-L-缬氨酰-3-氨基丙氨酰-环戊基丙氨酰-(S)-2-(4-苯基-1H-苯并[d]咪唑基)乙酰胺(纯度高于95%)。1H-NMR(300MHz,CD3OD)δ7.76(m,1H),7.71-7.66(m,2H),7.64-7.50(m,5H),7.25-7.2l(m,2H),7.12-7.07(m,2H),5.31(m,1H),4.76(m,1H),4.54(d,J=9.0Hz,1H),4.43(m,1H),3.95(d,J=7.0Hz,lH),3.75-3.64(m,2H),3.36(m,1H),3.21(m,1H),2.30(s,3H),2.29-2.02(m,5H),1.99-1.71(m,11H),1.69-1.46(m,5H),1.23-1.11(m,2H),1.05-0.97(m,6H);ESI-MS m/z calc’d for C47H60N8O5[M+Na]+839.4,found 839.8.
((3S,6S,8aS)-6-异丙基-5-氧代八氢吲哚嗪-3-羰基)-L-缬氨酰-3-氨基丙氨酰-环戊基丙氨酰-(S)-2-(4-苯基-1H-苯并[d]咪唑基)乙酰胺的制备:
将((S)-3-(((S)-1-(((S)-1-(4-苯基-1H-苯并[d]咪唑基)乙基)氨基)-3-环戊基-1-氧代丙烷基)-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-甲基丁酰氨基)-3-氧代丙基)氨基甲酸苄酯(80mg,100μmol,1.0eq),(3S,6S,8aS)-6-异丙基-5-氧代八氢吲哚嗪-3-甲酸(25mg,110μmol,1.1eq)和HATU(46mg,120μmol,1.2eq)溶于DMF(10mL)中,室温搅拌30min,0℃下缓慢滴加DIPEA(39mg,300μmol,3.0eq),室温反应3h。TLC监测反应完全后,反应液用水稀释,EA萃取三次,有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(EA)得Cbz保护的(3S,6S,8aS)-6-异丙基-5-氧代八氢吲哚嗪终产物。钯碳催化氢化脱Cbz保护(57.2mg,收率74.4%),经由半制备型高效液相分离纯化(洗脱梯度从60%A液和40%的B液到30%A液和70%的B液),冷冻干燥得((3S,6S,8aS)-6-异丙基-5-氧代八氢吲哚嗪-3-羰基)-L-缬氨酰-3-氨基丙氨酰-环戊基丙氨酰-(S)-2-(4-苯基-1H-苯并[d]咪唑基)乙酰胺(纯度高于95%)。1H-NMR(300MHz,CD3OD)δ7.76-7.67(m,3H),7.65-7.50(m,5H),5.30(m,1H),4.78(m,1H),4.50(m,1H),4.42(m,1H),3.94(d,J=7.1Hz,1H),3.62(m,1H),3.36(m,1H),3.18(m,1H),2.39(m,1H),2.24(m,1H),2.12-2.04(m,5H),1.89-1.74(m,10H),1.69-1.61(m,3H),1.56-1.44(m,3H),1.24-1.11(m,2H),1.08-0.82(m,12H);ESI-MS m/zcalc’d for C43H60N8O5[M+Na]+791.4,found 791.7.
((3S,6S,8aS)-6-(4-甲基戊基)-5-氧代八氢吲哚嗪-3-羰基)-L-缬氨酰-3-氨基丙氨酰-环戊基丙氨酰-(S)-2-(4-苯基-1H-苯并[d]咪唑基)乙酰胺的制备:
将((S)-3-(((S)-1-(((S)-1-(4-苯基-1H-苯并[d]咪唑基)乙基)氨基)-3-环戊基-1-氧代丙烷基)-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-甲基丁酰氨基)-3-氧代丙基)氨基甲酸苄酯(80mg,100μmol,1.0eq),((3S,6S,8aS)-6-(4-甲基戊基)-5-氧代八氢吲哚嗪-3-甲酸(29mg,110μmol,1.1eq)和HATU(46mg,120μmol,1.2eq)溶于DMF(10mL)中,室温搅拌30min,0℃下缓慢滴加DIPEA(39mg,300μmol,3.0eq),室温反应3h。TLC监测反应完全后,反应液用水稀释,EA萃取三次,有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(EA)得Cbz保护的(3S,6S,8aS)-6-(4-甲基戊基)-5-氧代八氢吲哚嗪终产物。钯碳催化氢化脱Cbz保护(57.2mg,收率74.4%),经由半制备型高效液相分离纯化(洗脱梯度从60%A液和40%的B液到30%A液和70%的B液),冷冻干燥得((3S,6S,8aS)-6-(4-甲基戊基)-5-氧代八氢吲哚嗪-3-羰基)-L-缬氨酰-3-氨基丙氨酰-环戊基丙氨酰-(S)-2-(4-苯基-1H-苯并[d]咪唑基)乙酰胺(纯度高于95%)。1H-NMR(300MHz,CD3OD)δ7.75-7.70(m,2H),7.65(m,1H),7.59-7.53(m,2H),7.52-7.43(m,3H),5.28(m,1H),4.81-4.73(m,2H),4.52-4.36(m,2H),3.96(d,J=7.0Hz,1H),3.56(m,1H),3.15(m,1H),2.28(m,1H),2.14-2.00(m,6H),1.84-1.73(m,6H),1.71(d,J=7.1Hz,3H),1.67-1.54(m,5H),1.53-1.36(m,6H),1.24-1.11(m,4H),1.06-0.98(m,6H),0.92-0.89(m,6H);ESI-MS m/zcalc’d for C44H66N8O5[M+Na]+833.5,found 833.6.
((3S,6S,8aS)-5-氧代-6-苯基八氢吲嗪-3-羰基)-L-缬氨酰-3-甲基氨基丙氨酰-环戊基丙氨酰-(S)-2-(1H-苯并[d]咪唑基)乙酰胺的制备:
将((S)-3-(((S)-1-(((S)-1-(4-苯基-1H-苯并[d]咪唑基)乙基)氨基)-3-环戊基-1-氧代丙烷基)-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-甲基丁酰氨基)-3-氧代丙基)氨基甲酸苄酯(80mg,100μmol,1.0eq),(3S,6S,8aS)-5-氧代-6-苯基八氢吲嗪-3-甲酸(29mg,110μmol,1.1eq)和HATU(46mg,120μmol,1.2eq)溶于DMF(10mL)中,室温搅拌30min,0℃下缓慢滴加DIPEA(39mg,300μmol,3.0eq),室温反应3h。TLC监测反应完全后,反应液用水稀释,EA萃取三次,有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(EA)得Cbz保护的(3S,6S,8aS)-5-氧代-6-苯基八氢吲嗪终产物。钯碳催化氢化脱Cbz保护(53.9mg,收率72.7%),经由半制备型高效液相分离纯化(洗脱梯度从60%A液和40%的B液到30%A液和70%的B液),冷冻干燥得((3S,6S,8aS)-5-氧代-6-苯基八氢吲嗪-3-羰基)-L-缬氨酰-3-甲基氨基丙氨酰-环戊基丙氨酰-(S)-2-(1H-苯并[d]咪唑基)乙酰胺(纯度高于95%)。1H-NMR(300MHz,CD3OD)δ7.76-7.72(m,2H),7.56-7.51(m,2H),7.36-7.22(m,5H),5.34(m,1H),4.82(m,1H),4.54(m,1H),4.43(m,1H),3.94(d,J=7.0Hz,1H),3.76-3.71(m,2H),3.44(m,1H),3.27(m,1H),2.73(s,3H),2.36-1.93(m,7H),1.88-1.73(m,8H),1.70-1.57(m,3H),1.57-1.46(m,2H),1.32(m,1H),1.24-1.09(m,2H),1.05-0.97(m,6H);ESI-MSm/z calc’d for C41H56N8O4[M+Na]+763.4,found 763.9.
((3S,6S,8aS)-5-氧代-6-邻甲基苯基八氢吲嗪-3-羰基)-L-缬氨酰-3-甲基氨基丙氨酰-环戊基丙氨酰-(S)-2-(1H-苯并[d]咪唑基)乙酰胺的制备:
将((S)-3-(((S)-l-(((S)-1-(1H-苯并[d]咪唑基)乙基)氨基)-3-环戊基-1-氧代丙烷基)-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-甲基丁酰氨基)-3-氧代丙基)甲基氨基甲酸苄酯(73mg,100μmol,1.0eq),(3S,6S,8aS)-5-氧代-6-邻甲苯基八氢吲嗪-3-甲酸(30mg,110μmol,1.1eq)和HATU(46mg,120μmol,1.2eq)溶于DMF(10mL)中,室温搅拌30min,0℃下缓慢滴加DIPEA(39mg,300μmol,3.0eq),室温反应3h。TLC监测反应完全后,反应液用水稀释,EA萃取三次,有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(EA)得Cbz保护的(3S,6S,8aS)-5-氧代-6-邻甲苯基八氢吲嗪终产物。钯碳催化氢化脱Cbz保护(53.7mg,收率71.1%),经由半制备型高效液相分离纯化(洗脱梯度从60%A液和40%的B液到30%A液和70%的B液),冷冻干燥得((3S,6S,8aS)-5-氧代-6-邻甲基苯基八氢吲嗪-3-羰基)-L-缬氨酰-3-甲基氨基丙氨酰-环戊基丙氨酰-(S)-2-(1H-苯并[d]咪唑基)乙酰胺(纯度高于95%)。1H-NMR(300MHz,CD3OD)δ7.80-7.77(m,2H),7.61-7.56(m,2H),7.36(m,1H),7.21-7.05(m,3H),5.31(m,1H),4.80(m,1H),4.55(m,1H),4.43(m,1H),3.95(m,1H),3.74-3.67(m,2H),3.44(m,1H),3.25(m,1H),2.74(s,3H),2.33(s,3H),2.05-2.19(m,5H),2.01-1.90(m,2H),1.88-1.74(m,8H),1.69-1.49(m,5H),1.31(m,1H),1.23-1.09(m,2H),1.05-0.96(m,6H);ESI-MS m/z calc’d for C42H58N8O5[M+Na]+777.4,found 777.5.
((3S,6S,8aS)-5-氧代-6-间甲基苯基八氢吲嗪-3-羰基)-L-缬氨酰-3-甲基氨基丙氨酰-环戊基丙氨酰-(S)-2-(1H-苯并[d]咪唑基)乙酰胺的制备:
将((S)-3-(((S)-1-(((S)-1-(1H-苯并[d]咪唑基)乙基)氨基)-3-环戊基-1-氧代丙烷基)-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-甲基丁酰氨基)-3-氧代丙基)甲基氨基甲酸苄酯(73mg,100μmol,1.0eq),(3S,6S,8aS)-5-氧代-6-间甲苯基八氢吲嗪-3-甲酸(30mg,110μmol,1.1eq)和HATU(46mg,120μmol,1.2eq)溶于DMF(10mL)中,室温搅拌30min,0℃下缓慢滴加DIPEA(39mg,300μmol,3.0eq),室温反应3h。TLC监测反应完全后,反应液用水稀释,EA萃取三次,有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(EA)得Cbz保护的(3S,6S,8aS)-5-氧代-6-间甲苯基八氢吲嗪终产物。钯碳催化氢化脱Cbz保护(58.7mg,收率77.7%),经由半制备型高效液相分离纯化(洗脱梯度从60%A液和40%的B液到30%A液和70%的B液),冷冻干燥得((3S,6S,8aS)-5-氧代-6-间甲基苯基八氢吲嗪-3-羰基)-L-缬氨酰-3-甲基氨基丙氨酰-环戊基丙氨酰-(S)-2-(1H-苯并[d]咪唑基)乙酰胺(纯度高于95%)。1H-NMR(300MHz,CD3OD)δ7.79-7.76(m,2H),7.60-7.57(m,2H),7.17-7.13(m,3H),7.04(m,1H),5.35(m,1H),4.85(m,1H),4.55(m,1H),4.43(m,1H),3.97(d,J=7.0Hz,1H),3.74-3.67(m,2H),3.44(m,1H),3.27(m,1H),2.74(s,3H),2.33(s,3H),2.05-2.19(m,4H),2.01-1.90(m,2H),1.88-1.72(m,10H),1.68-1.58(m,3H),1.55-1.46(m,2H),1.23-1.09(m,2H),1.04-0.98(m,6H);ESI-MS m/z calc’d for C42H58N8O5[M+Na]+777.4,found777.5.
((3S,6S,8aS)-5-氧代-6-对甲基苯基八氢吲嗪-3-羰基)-L-缬氨酰-3-甲基氨基丙氨酰-环戊基丙氨酰-(S)-2-(1H-苯并[d]咪唑基)乙酰胺的制备:
将((S)-3-(((S)-1-(((S)-1-(1H-苯并[d]咪唑基)乙基)氨基)-3-环戊基-1-氧代丙烷基)-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-甲基丁酰氨基)-3-氧代丙基)甲基氨基甲酸苄酯(73mg,100μmol,1.0eq),(3S,6S,8aS)-5-氧代-6-对甲苯基八氢吲嗪-3-甲酸(30mg,110μmol,1.1eq)和HATU(46mg,120μmol,1.2eq)溶于DMF(10mL)中,室温搅拌30min,0℃下缓慢滴加DIPEA(39mg,300μmol,3.0eq),室温反应3h。TLC监测反应完全后,反应液用水稀释,EA萃取三次,有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(EA)得Cbz保护的(3S,6S,8aS)-5-氧代-6-对甲苯基八氢吲嗪终产物。钯碳催化氢化脱Cbz保护(59.6mg,收率78.9%),经由半制备型高效液相分离纯化(洗脱梯度从60%A液和40%的B液到30%A液和70%的B液),冷冻干燥得((3S,6S,8aS)-5-氧代-6-对甲基苯基八氢吲嗪-3-羰基)-L-缬氨酰-3-甲基氨基丙氨酰-环戊基丙氨酰-(S)-2-(1H-苯并[d]咪唑基)乙酰胺(纯度高于95%)。1H-NMR(300MHz,CD3OD)δ7.81-7.78(m,2H),7.62-7.59(m,2H),7.29-7.21(m,2H),7.14-7.09(m,2H),5.35(m,1H),4.80(m,1H),4.53(m,1H),4.42(m,1H),4.11(m,1H),3.72-3.65(m,3H),3.47(m,1H),2.94(s,3H),2.31(s,3H),2.19-2.03(m,3H),2.03-1.87(m,4H),1.87-1.72(m,8H),1.69-1.49(m,5H),1.36(m,1H),1.23-1.22(m,2H),1.08-0.94(m,6H);ESI-MS m/z calc’d for C42H58N8O5[M+Na]+777.4,found 777.9.
((4R,7S)-3-乙酰基-5-氧代-4-苯基八氢-1H-吡咯并[1,2-d][1,4]二氮杂-7-羰基)-L-缬氨酰-3-氨基丙氨酰-环戊基丙氨酰-(S)-2-(1H-苯并[d]咪唑基)乙酰胺的制备:
将((S)-3-(((S)-1-(((S)-1-(1H-苯并[d]咪唑基)乙基)氨基)-3-环戊基-1-氧代丙烷基)-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-甲基丁酰氨基)-3-氧代丙基)氨基甲酸苄酯(72mg,100μmol,1.0eq),(4R,7S)-3-乙酰基-5-氧代-4-苯基八氢-1H-吡咯并[1,2-d][1,4]二氮杂-7-甲酸(35mg,110μmol,1.1eq)和HATU(46mg,120μmol,1.2eq)溶于DMF(10mL)中,室温搅拌30min,0℃下缓慢滴加DIPEA(39mg,300μmol,3.0eq),室温反应3h。TLC监测反应完全后,反应液用水稀释,EA萃取三次,有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(DCM∶MeOH=20∶1)得Cbz保护的(4R,7S)-3-乙酰基-5-氧代-4-苯基八氢-1H-吡咯并[1,2-d][1,4]二氮杂终产物。钯碳催化氢化脱Cbz保护(60.0mg,收率76.5%),经由半制备型高效液相分离纯化(洗脱梯度从60%A液和40%的B液到30%A液和70%的B液),冷冻干燥得((4R,7S)-3-乙酰基-5-氧代-4-苯基八氢-1H-吡咯并[1,2-d][1,4]二氮杂-7-羰基)-L-缬氨酰-3-氨基丙氨酰-环戊基丙氨酰-(S)-2-(1H-苯并[d]咪唑基)乙酰胺(纯度高于95%)。1H-NMR(300MHz,CD3OD)δ7.80-7.75(m,2H),7.62-7.56(m,2H),7.39-7.31(m,5H),5.36(m,1H),4.73-4.39(m,4H),4.06-3.76(m,3H),3.38(m,1H),3.31-3.13(m,2H),2.34(s,3H),2.28-2.03(m,5H),1.87-1.71(m,10H),1.67-1.49(m,4H),1.24-1.08(m,2H),1.05-0.95(m,6H);ESI-MS m/z calc’d for C42H57N9O6[M+Na]+806.4,found 806.5.
((4R,7S)-3-乙酰基-5-氧代-4-异丙基八氢-1H-吡咯并[1,2-d][1,4]二氮杂-7-羰基)-L-缬氨酰-3-氨基丙氨酰-环戊基丙氨酰-(S)-2-(1H-苯并[d]咪唑基)乙酰胺的制备:
将((S)-3-(((S)-1-(((S)-1-(1H-苯并[d]咪唑基)乙基)氨基)-3-环戊基-1-氧代丙烷基)-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-甲基丁酰氨基)-3-氧代丙基)氨基甲酸苄酯(72mg,100μmol,1.0eq),(4R,7S)-3-乙酰基-5-氧代-4-异丙基八氢-1H-吡咯并[1,2-d][1,4]二氮杂-7-甲酸(31mg,110μmol,1.1eq)和HATU(46mg,120μmol,1.2eq)溶于DMF(10mL)中,室温搅拌30min,0℃下缓慢滴加DIPEA(39mg,300μmol,3.0eq),室温反应3h。TLC监测反应完全后,反应液用水稀释,EA萃取三次,有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(DCM∶MeOH=20∶1)得Cbz保护的(4R,7S)-3-乙酰基-5-氧代-4-异丙基八氢-1H-吡咯并[1,2-d][1,4]二氮杂终产物。钯碳催化氢化脱Cbz保护(54.6mg,收率72.8%),经由半制备型高效液相分离纯化(洗脱梯度从60%A液和40%的B液到30%A液和70%的B液),冷冻干燥得((4R,7S)-3-乙酰基-5-氧代-4-异丙基八氢-1H-吡咯并[1,2-d][1,4]二氮杂-7-羰基)-L-缬氨酰-3-氨基丙氨酰-环戊基丙氨酰-(S)-2-(1H-苯并[d]咪唑基)乙酰胺(纯度高于95%)。1H-NMR(300MHz,CD3OD)δ7.79-7.75(m,2H),7.60-7.55(m,2H),5.37(m,1H),4.70(m,1H),4.55-4.35(m,2H),4.22(m,1H),4.00(m,1H),3.70-3.35(m,5H),2.20(s,3H),2.19-2.02(m,4H),1.85-1.77(m,10H),1.69-1.58(m,2H),1.54-1.47(m,2H),1.40-1.27(m,2H),1.23-1.09(m,2H),1.11-0.84(m,12H);ESI-MS m/z calc’d forC39H59N9O6[M+Na]+772.4,found 772.9.
((4R,7S)-3-乙酰基-5-氧代-4-环戊基八氢-1H-吡咯并[1,2-d][1,4]二氮杂-7-羰基)-L-缬氨酰-3-氨基丙氨酰-环戊基丙氨酰-(S)-2-(1H-苯并[d]咪唑基)乙酰胺的制备:
将((S)-3-(((S)-1-(((S)-1-(1H-苯并[d]咪唑基)乙基)氨基)-3-环戊基-1-氧代丙烷基)-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-甲基丁酰氨基)-3-氧代丙基)氨基甲酸苄酯(72mg,100μmol,1.0eq),(4R,7S)-3-乙酰基-5-氧代-4-环戊基八氢-1H-吡咯并[1,2-d][1,4]二氮杂-7-甲酸(34mg,110μmol,1.1eq)和HATU(46mg,120μmol,1.2eq)溶于DMF(10mL)中,室温搅拌30min,0℃下缓慢滴加DIPEA(39mg,300μmol,3.0eq),室温反应3h。TLC监测反应完全后,反应液用水稀释,EA萃取三次,有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(DCM∶MeOH=20∶1)得Cbz保护的(4R,7S)-3-乙酰基-5-氧代-4-环戊基八氢-1H-吡咯并[1,2-d][1,4]二氮杂终产物。钯碳催化氢化脱Cbz保护(57.4mg,收率74.0%),经由半制备型高效液相分离纯化(洗脱梯度从60%A液和40%的B液到30%A液和70%的B液),冷冻干燥得((4R,7S)-3-乙酰基-5-氧代-4-环戊基八氢-1H-吡咯并[1,2-d][1,4]二氮杂-7-羰基)-L-缬氨酰-3-氨基丙氨酰-环戊基丙氨酰-(S)-2-(1H-苯并[d]咪唑基)乙酰胺(纯度高于95%)。1H-NMR(300MHz,CD3OD)δ7.79-7.76(m,2H),7.60-7.57(m,2H),5.38(m,1H),4.69(m,1H),4.55-4.29(m,3H),4.22(m,1H),4.02(m,1H),3.73(dm,1H),3.61-3.39(m,2H),3.02(m,1H),2.40(m,1H),2.30-2.03(m,7H),1.99-1.71(m,12H),1.71-1.49(m,9H),1.32(m,1H),1.24-1.07(m,3H),1.07-0.91(m,6H);ESI-MSm/z calc’d forC41H61N9O6[M+Na]+798.5,found 798.9.
((4R,7S)-3-乙酰基-5-氧代-4-环己基八氢-1H-吡咯并[1,2-d][1,4]二氮杂-7-羰基)-L-缬氨酰-3-氨基丙氨酰-环戊基丙氨酰-(S)-2-(1H-苯并[d]咪唑基)乙酰胺的制备:
将((S)-3-(((S)-1-(((S)-1-(1H-苯并[d]咪唑基)乙基)氨基)-3-环戊基-1-氧代丙烷基)-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-甲基丁酰氨基)-3-氧代丙基)氨基甲酸苄酯(72mg,100μmo1,1.0eq),(4R,7S)-3-乙酰基-5-氧代-4-环己基八氢-1H-吡咯并[1,2-d][1,4]二氮杂-7-甲酸(35mg,110μmol,1.1eq)和HATU(46mg,120μmol,1.2eq)溶于DMF(10mL)中,室温搅拌30min,0℃下缓慢滴加DIPEA(39mg,300μmol,3.0eq),室温反应3h。TLC监测反应完全后,反应液用水稀释,EA萃取三次,有机相用饱和NaCl水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,硅胶柱层析分离(DCM∶MeOH=20∶1)得Cbz保护的(4R,7S)-3-乙酰基-5-氧代-4-环己基八氢-1H-吡咯并[1,2-d][1,4]二氮杂终产物。钯碳催化氢化脱Cbz保护(59.6mg,收率75.5%),经由半制备型高效液相分离纯化(洗脱梯度从60%A液和40%的B液到30%A液和70%的B液),冷冻干燥得((4R,7S)-3-乙酰基-5-氧代-4-环己基八氢-1H-吡咯并[1,2-d][1,4]二氮杂-7-羰基)-L-缬氨酰-3-氨基丙氨酰-环戊基丙氨酰-(S)-2-(1H-苯并[d]咪唑基)乙酰胺(纯度高于95%)。1H-NMR(300MHz,CD3OD)δ7.81-7.77(m,2H),7.62-7.58(m,2H),5.39(m,1H),4.75(m,1H),4.57-4.28(m,3H),4.19(m,1H),3.98(m,1H),3.67(m,1H),3.54-3.37(m,3H),2.19(s,3H),2.18-2.00(m,5H),1.98-1.46(m,21H),1.34-1.09(m,6H),1.06-0.94(m,6H);ESI-MSm/z calc’d for C42H63N9O6[M+Na]+798.5,found 798.9.

Claims (7)

1.本发明中的化合物优选式I的结构:
其中X和Y分别为1-3个取代或非取代的亚甲基,其中一个或多个亚甲基可以被氧、硫或NR所替换,NR中N为氮原子,R为氢原子、非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫所替换;R1-R9为1~20碳的非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫或NR所替换,NR中N为氮原子,R为氢原子、非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫所替换;R3和R4可以相互连接成为环状结构;R6和R7可以相互连接为环状结构;A为连接结构,可以选自非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫或NR所替换,NR中N为氮原子,R为氢原子、非取代或取代的烷基、非取代或取代的环烷基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫所替换。以上描述中的取代基选自卤素原子、硝基、亚硝基、腈基、非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫或NR1R2所替换,NR1R2中N为氮原子,R1和R2为氢原子、非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫所替换。
2.本发明中的化合物还优选式II的结构:
其中X和Y分别为1-3个取代或非取代的亚甲基,其中一个或多个亚甲基可以被氧、硫或NR所替换,NR中N为氮原子,R为氢原子、非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫所替换;R1-R10为1~20碳的非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫或NR所替换,NR中N为氮原子,R为氢原子、非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫所替换;R4和R5可以相互连接成为环状结构;R7和R8可以相互连接为环状结构;A为连接结构,可以选自非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫或NR所替换,NR中N为氮原子,R为氢原子、非取代或取代的烷基、非取代或取代的环烷基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫所替换。以上描述中的取代基选自卤素原子、硝基、亚硝基、腈基、非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫或NR1R2所替换,NR1R2中N为氮原子,R1和R2为氢原子、非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫所替换。
3.本发明中的化合物还优选式III的结构:
其中Ar为带有至少一个取代基的单环或多环芳基或芳杂环;X和Y分别为0-3个取代或非取代的亚甲基,其中一个或多个亚甲基可以被氧、硫或NR所替换,NR中N为氮原子,R为氢原子、非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫所替换;R1-R10为1~20碳的非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫或NR所替换,NR中N为氮原子,R为氢原子、非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫所替换;R2和R3可以相互连接成为环状结构;R5和R6可以相互连接为环状结构;A为连接结构,可以选自非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫或NR所替换,NR中N为氮原子,R为氢原子、非取代或取代的烷基、非取代或取代的环烷基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫所替换。以上描述中的取代基选自卤素原子、硝基、亚硝基、腈基、非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫或NR1R2所替换,NR1R2中N为氮原子,R1和R2为氢原子、非取代或取代的烃基、非取代或取代的环状烃基、取代或非取代的单环或多环芳基、芳香性的杂环或各种取代的芳香性的杂环,其中一个或多个亚甲基可以被羰基、酰胺基、硫代酰胺基、磺酰胺基、氧、硫所替换。
4.本发明提供了如式I所示拟肽类化合物的制备方法,如下反应式:
具体包括以下步骤:
(1)化合物1与Boc保护氨基酸缩合,然后酸性条件下脱Boc保护制得化合物2;
(2)化合物2与Boc保护氨基酸缩合,然后酸性条件下脱Boc保护制得化合物3;
(3)化合物3与Boc保护氨基酸缩合,然后酸性条件下脱Boc保护制得化合物4;
(4)化合物4与酸缩合制得化合物I。
5.本发明的优选式I代表的化合物选自包含下列各化合物的结构类型:
6.在研究二肽模拟物双环衍生物的合成过程中,本发明按照下述路线制备式(12)的化合物:
具体包括以下步骤:
(1)L-N-Boc焦谷氨酸甲酯通过三步反应得到化合物6;
(2)化合物6中的甲酯转换为苄酯得到化合物7;
(3)化合物7脱Boc保护与丙烯酰氯反应得到化合物8;
(4)化合物8通过RCM反应关环得到化合物9;
(5)化合物9溴代得到化合物10;
(6)化合物10通过偶联得到化合物11;
(7)化合物11通过氢化还原双键和苄酯得到化合物12。
7.在研究二肽模拟物双环衍生物的合成过程中,本发明按照下述路线制备式(16)的化合物:
具体包括以下步骤:
(1)化合物13通过与D-N-Cbz氨基酸缩合后再臭氧化得到化合物14;
(2)化合物14氢化关环得到化合物15;
(3)化合物15乙酰化得到化合物16。
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