[go: up one dir, main page]
More Web Proxy on the site http://driver.im/

CN116008559A - Mcm6作为emzl远处复发的病理预后标记物的应用 - Google Patents

Mcm6作为emzl远处复发的病理预后标记物的应用 Download PDF

Info

Publication number
CN116008559A
CN116008559A CN202211579996.7A CN202211579996A CN116008559A CN 116008559 A CN116008559 A CN 116008559A CN 202211579996 A CN202211579996 A CN 202211579996A CN 116008559 A CN116008559 A CN 116008559A
Authority
CN
China
Prior art keywords
mcm6
lymphoma
prognosis
detecting
emzl
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CN202211579996.7A
Other languages
English (en)
Inventor
周一雄
贾仁兵
朱田雨
石嘉豪
周晓雯
贾若冰
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Ninth Peoples Hospital Shanghai Jiaotong University School of Medicine
Original Assignee
Ninth Peoples Hospital Shanghai Jiaotong University School of Medicine
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Ninth Peoples Hospital Shanghai Jiaotong University School of Medicine filed Critical Ninth Peoples Hospital Shanghai Jiaotong University School of Medicine
Priority to CN202211579996.7A priority Critical patent/CN116008559A/zh
Publication of CN116008559A publication Critical patent/CN116008559A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Images

Classifications

    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02ATECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/30Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change

Landscapes

  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)

Abstract

本发明涉及MCM6作为EMZL远处复发的病理预后标记物的应用,属于生物医药技术领域。通过本发明提供了一种用于获得结外边缘区淋巴瘤预后信息的方法,通过检测MCM6表达量预测结外边缘区淋巴瘤的预后信息。提供了一种检测MCM6的试剂在制备结外边缘区淋巴瘤预后诊断试剂盒中的应用。提供了一种用于结外边缘区淋巴瘤预后的诊断试剂盒,用于预测结外边缘区淋巴瘤是否远处复发。本发明通过蛋白组学测序数据筛选获得能够预测EMZL患者远处复发的病理预后生物标志物MCM6,MCM6是EMZL远处复发的特异高表达蛋白,可作为EMZL预后的病理标志物,用于指导患者的风险分层和治疗决策。

Description

MCM6作为EMZL远处复发的病理预后标记物的应用
技术领域
本发明涉及MCM6作为EMZL远处复发的病理预后标记物的应用,属于生物医药技术领域。
背景技术
结外边缘区淋巴瘤(EMZL)对放疗反应良好,有较高的总体生存率,但疾病远处复发是EMZL治疗中的关键问题。远处复发相关的临床风险因素需要临床医生结合病史、临床症状体征和影像学特征进行综合判断,具有一定主观性。病理学特征较临床特征具有更强的客观性。目前,临床使用Ki-67 IHC染色阳性细胞比例作为EMZL不良预后参考,但并无相关研究验证其在EMZL中的有效性;所以,EMZL缺乏疾病特定的预后相关病理学标志物;本技术领域亟需解决如何更有效地进行EMZL远处复发预后判断的技术问题。
发明内容
本发明的目的是为解决如何更有效地进行EMZL远处复发预后判断的技术问题。
为达到解决上述问题的目的,本发明所采取的技术方案是提供一种用于获得结外边缘区淋巴瘤预后信息的方法,包括通过检测MCM6表达量预测结外边缘区淋巴瘤的预后信息。
优选地,所述预后信息为预测结外边缘区淋巴瘤是否远处复发。
本发明提供一种检测MCM6的试剂在制备结外边缘区淋巴瘤预后诊断试剂盒中的应用。
优选地,所述应用中的预后为预测结外边缘区淋巴瘤是否远处复发。
本发明提供一种用于结外边缘区淋巴瘤预后的诊断试剂盒,所述试剂盒中包括检测MCM6的试剂。
优选地,所述诊断试剂盒用于预测结外边缘区淋巴瘤是否远处复发。
本发明提供一种检测系统,包括数据处理装置和检测MCM6的物质;所述数据处理装置包括数据输入模块、数据记录模块、数据比较模块和结论输出模块;所述数据输入模块被配置为输入待测样品MCM6的表达量值;所述数据记录模块被配置为存储待测样品MCM6的表达量值和判断阈值;所述数据比较模块被配置为接收所述数据输入模块发送的所述待测样品MCM6的表达量值,并从所述数据记录模块中调用所述判断阈值并与所述待测样品MCM6的表达量值进行比较;所述结论输出模块被配置为接收由所述数据比较模块发送的比较结果,并根据预定判定条件对比较结果进行判定;确定被检测者结外边缘区淋巴瘤是否远处复发。
优选地,所述检测MCM6的物质包括检测MCM6的表达量值的试剂和/或仪器。
相比现有技术,本发明具有如下有益效果:
本发明通过蛋白组学测序数据筛选获得能够预测EMZL患者远处复发的病理生物标志物MCM6,MCM6是EMZL远处复发的特异高表达蛋白,可作为EMZL预后判断的病理标志物,用于指导患者的风险分层和治疗决策。
附图说明
图1为MCM6筛选流程图和差异基因表达散点图;
图2为H评分比较MCM6与Ki-67在远处复发组的相对表达量。
图3为MCM6与Ki-67远处复发预测能力比较相关结果图。
具体实施方式
为使本发明更明显易懂,兹以优选实施例,并配合附图作详细说明如下:
如图1-3所示;本发明提供一种用于获得结外边缘区淋巴瘤预后信息的方法,方法为通过检测MCM6表达量预测结外边缘区淋巴瘤的预后信息;预后信息为预测结外边缘区淋巴瘤是否远处复发。
本发明提供一种检测MCM6的试剂在制备结外边缘区淋巴瘤预后诊断试剂盒中的应用;应用中的预后为预测结外边缘区淋巴瘤是否远处复发。
本发明提供一种用于结外边缘区淋巴瘤预后的诊断试剂盒,试剂盒中包括检测MCM6的试剂;诊断试剂盒用于预测结外边缘区淋巴瘤是否远处复发。
本发明提供一种检测系统,包括数据处理装置和检测MCM6的物质;数据处理装置包括数据输入模块、数据记录模块、数据比较模块和结论输出模块;数据输入模块被配置为输入待测样品MCM6的表达量值;数据记录模块被配置为存储待测样品MCM6的表达量值和判断阈值;数据比较模块被配置为接收数据输入模块发送的待测样品MCM6的表达量值,并从数据记录模块中调用判断阈值并与待测样品MCM6的表达量值进行比较;结论输出模块被配置为接收由数据比较模块发送的比较结果,并根据预定判定条件对比较结果进行判定;确定被检测者结外边缘区淋巴瘤是否远处复发。检测MCM6的物质包括检测MCM6的表达量值的试剂和/或仪器。
实施例
一、获得EMZLs特定的预后相关病理学标志物MCM6:
选取27个EMZLs样本的TMT标记的定量蛋白质组数据进行分析,其中包括6例远处复发和21例对照患者。通过联合limma差异基因分析和单变量Cox回归分析,筛选出MCM6为具有潜在预后价值的蛋白(如图1所示)。图1中A图为筛选出MCM6流程图,B图为差异基因表达散点图。
二.比较MCM6与Ki-67作为EMZLs特定的预后相关病理学标志物的远处复发预测能力:
2.1使用H评分比较:
选取44名临床特征配对的患者,包括11名远处复发与33名无远处复发的EMZL患者,利用石蜡包埋切片进行免疫组织化学(IHC)染色验证候选基因的预后价值,并选择Ki-67作为阳性对照标志物。IHC染色的代表图像见图2中A图。远处复发组MCM6的总体H评分显著高于对照组(无复发组)(P=0.0006)。但两组(远处复发组和无复发组)在Ki-67的表达上没有显著差异(如图2中B图)。提示MCM6具有潜在远处复发预测能力。
2.2MCM6与Ki-67作为EMZLs特定的预后相关病理学标志物的远处复发预测能力比较:
使用时间依赖性的ROC曲线分析比较各候选基因在不同随访期间的预后价值。与Ki-67相比,MCM6对无远处复发生存期(DRFS)有更强的预测能力(如图3中A图)。
如图3中B图,MCM6的1年、3年、5年的ROC曲线下面积(AUC值)分别为0.735、0.699、0.757,均高于Ki-67(0.487、0.532、0.592)。
以标记物H评分中位数为分界值,将患者分为两组。KM生存曲线显示,MCM6的高表达与较短的DRFS显著相关,而Ki-67的表达则与DRFS无显著相关性(log rank p=0.017,log rank p=0.18;如图3中C图)。这表明MCM6相比于Ki-67可以更好地预测远处复发。
多因素Cox回归分析证明MCM6是远处复发的独立危险因素(HR,6.86;95%CI:1.32-35.79;P=0.02;表1)。
表1.远处复发Cox回归风险模型
Figure BDA0003990443820000041
以上结果证明MCM6是EMZL远处复发的特异高表达蛋白,可作为EMZL预后的病理标志物。
本发明使用蛋白组学测序数据筛选能够预测EMZL患者远处复发的病理预后生物标志物MCM6,可用于指导患者的风险分层和治疗决策。
以上所述,仅为本发明的较佳实施例,并非对本发明任何形式上和实质上的限制,应当指出,对于本技术领域的普通技术人员,在不脱离本发明的前提下,还将可以做出若干改进和补充,这些改进和补充也应视为本发明的保护范围。凡熟悉本专业的技术人员,在不脱离本发明的精神和范围的情况下,当可利用以上所揭示的技术内容而做出的些许更动、修饰与演变的等同变化,均为本发明的等效实施例;同时,凡依据本发明的实质技术对上述实施例所作的任何等同变化的更动、修饰与演变,均仍属于本发明的技术方案的范围内。

Claims (8)

1.一种用于获得结外边缘区淋巴瘤预后信息的方法,其特征在于,包括通过检测MCM6表达量预测结外边缘区淋巴瘤的预后信息。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述预后信息为预测结外边缘区淋巴瘤是否远处复发。
3.一种检测MCM6的试剂在制备结外边缘区淋巴瘤预后诊断试剂盒中的应用。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述预后为预测结外边缘区淋巴瘤是否远处复发。
5.一种用于结外边缘区淋巴瘤预后的诊断试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中包括检测MCM6的试剂。
6.根据权利要求5所述的一种用于结外边缘区淋巴瘤预后的诊断试剂盒,其特征在于,所述预后为预测结外边缘区淋巴瘤是否远处复发。
7.一种检测系统,其特征在于,包括数据处理装置和检测MCM6的物质;所述数据处理装置包括数据输入模块、数据记录模块、数据比较模块和结论输出模块;所述数据输入模块被配置为输入待测样品MCM6的表达量值;所述数据记录模块被配置为存储待测样品MCM6的表达量值和判断阈值;所述数据比较模块被配置为接收所述数据输入模块发送的所述待测样品MCM6的表达量值,并从所述数据记录模块中调用所述判断阈值并与所述待测样品MCM6的表达量值进行比较;所述结论输出模块被配置为接收由所述数据比较模块发送的比较结果,并根据预定判定条件对比较结果进行判定;确定被检测者结外边缘区淋巴瘤是否远处复发。
8.根据权利要求7所述的系统,其特征在于:所述检测MCM6的物质包括检测MCM6的表达量值的试剂和/或仪器。
CN202211579996.7A 2022-12-09 2022-12-09 Mcm6作为emzl远处复发的病理预后标记物的应用 Pending CN116008559A (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN202211579996.7A CN116008559A (zh) 2022-12-09 2022-12-09 Mcm6作为emzl远处复发的病理预后标记物的应用

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN202211579996.7A CN116008559A (zh) 2022-12-09 2022-12-09 Mcm6作为emzl远处复发的病理预后标记物的应用

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN116008559A true CN116008559A (zh) 2023-04-25

Family

ID=86036363

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN202211579996.7A Pending CN116008559A (zh) 2022-12-09 2022-12-09 Mcm6作为emzl远处复发的病理预后标记物的应用

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN116008559A (zh)

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Keren et al. A structured tumor-immune microenvironment in triple negative breast cancer revealed by multiplexed ion beam imaging
Asplund et al. Antibodies for profiling the human proteome—The H uman P rotein A tlas as a resource for cancer research
Ram et al. Pixelwise H-score: a novel digital image analysis-based metric to quantify membrane biomarker expression from immunohistochemistry images
Bai et al. An open-source, automated tumor-infiltrating lymphocyte algorithm for prognosis in triple-negative breast cancer
Holten-Rossing et al. Optimizing HER2 assessment in breast cancer: application of automated image analysis
Schettini et al. A perspective on the development and lack of interchangeability of the breast cancer intrinsic subtypes
JP2014521925A (ja) 細胞におけるバイオマーカーの発現の積率による解析
Touati et al. CD68-positive tumor-associated macrophages predict unfavorable treatment outcomes in classical Hodgkin lymphoma in correlation with interim fluorodeoxyglucose-positron emission tomography assessment
CN114740202A (zh) 与前列腺癌的诊断有关的组合物和方法
JP2017207516A (ja) 末梢循環腫瘍細胞単位の悪性度の検出方法及びそのキット
Geradts et al. The oncotype DX recurrence score is correlated with a composite index including routinely reported pathobiologic features
KR20180018514A (ko) 전립선암의 적극적 감시를 위한 조성물 및 방법
US10444235B2 (en) Systems and methods for treating, diagnosing and predicting the response to therapy of breast cancer
Harmon et al. High throughput assessment of biomarkers in tissue microarrays using artificial intelligence: PTEN loss as a proof-of-principle in multi-center prostate cancer cohorts
CN112946276B (zh) I期肺腺癌患者术后复发风险预测系统及其应用
Gustavson et al. Tissue microarrays: leaping the gap between research and clinical adoption
CN116008559A (zh) Mcm6作为emzl远处复发的病理预后标记物的应用
Gruver et al. Proteomic characterisations of ulcerative colitis endoscopic biopsies associate with clinically relevant histological measurements of disease severity
Yi et al. Quantile Index Biomarkers Based on Single-Cell Expression Data
RU2763839C1 (ru) Способ многофакторного прогноза рака молочной железы
CN113496768A (zh) 基于病理组织的二联综合肿瘤分析系统和应用
Woolfson et al. The application of CD antigen proteomics to pharmacogenomics
CN118067997B (zh) 基于肿瘤三级淋巴结构的胃癌预后标志物及其应用
Su et al. Multiplex immunohistochemistry and high-throughput image analysis for evaluation of spatial tumor immune cell markers in human breast cancer
CN111537424B (zh) 基于外周血细胞评估脊髓胶质瘤患者预后性的系统

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination