发明内容
针对现有技术的不足,本发明的发明人进行了广泛深入的研究,由此完成本发明。
本发明的一个目的是提供一种用于构建PKHD1基因突变的测序文库的方法。
本发明的另一个目的是提供一种用于构建PKHD1基因突变的测序文库的试剂盒。
为实现上述目的,本发明利用PCR反应在产物两端各引入一段寡核苷酸序列,这两段寡核苷酸序列分别与illumina公司的D5接头引物(D5adaptor)序列和N7接头引物(N7adaptor)序列相同,通过PCR产物两端引入的寡核苷酸序列,PCR产物可以直接作为测序文库应用于illumina公司的Nextseq500/550,Hiseq 2000/2500/3000、Miseq等测序仪。
本发明在产物两端引入寡核苷酸序列的同时,结合了多重PCR的扩增策略,可以同时实现对各样本的PKHD1基因的一个或多个特定外显子进行扩增,直接得到样本的PKHD1基因的一个或多个特定外显子的测序文库。
本发明在样品的PCR产物两端分别引入可区分的D5接头引物序列和N7接头引物序列,其中D5接头引物和N7接头引物中包含的标签(index)信息可以用作后续区分不同样品的标签序列。
本发明中,所述D5接头引物序列由5’端通用的测序引物序列、标签序列(即,i5,见下文粗体部分)和3’端通用的测序引物序列串联连接组成,以及所述N7接头引物序列由5’端通用的测序引物序列、标签序列(即,i7,见下文粗体部分)和3’端通用的测序引物序列串联连接组成。
本发明中,利用PCR反应在产物两端各引入一段寡核苷酸序列,所述两段寡核苷酸序列分别与D5接头引物序列和N7接头引物序列相同,其中,所述D5接头引物序列选自:
D501
(AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT)(SEQ ID NO:1)、
D502
(AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT)(SEQ ID NO:2)、
D503
(AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT)(SEQ ID NO:3)、
D504
(AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT)(SEQ ID NO:4)、
D505
(AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT)(SEQ ID NO:5)、
D506
(AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT)(SEQ ID NO:6)、
D507
(AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT)(SEQ ID NO:7)和
D508
(AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT)(SEQ ID NO:8)中,以及
所述N7接头引物序列选自:
N701
(CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCT)(SEQ ID NO:9)、
N702
(CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCT)(SEQ ID NO:10)、
N703
(CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCT)(SEQ ID NO:11)、
N704
(CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCT)(SEQ ID NO:12)、
N705
(CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCT)(SEQ ID NO:13)、
N706
(CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCT)(SEQ ID NO:14)、
N707
(CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCT)(SEQ ID NO:15)、
N708
(CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCT)(SEQ ID NO:16)、
N709
(CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCT)(SEQ ID NO:17)、
N710
(CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCT)(SEQ ID NO:18)、
N711
(CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCT)(SEQ ID NO:19)和
N712
(CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCT)(SEQ ID NO:20)中。
因此,一方面,本发明提供了一种构建PKHD1基因突变的测序文库的方法,包括以下步骤:
第一轮扩增:采用包括由与选自上述D5接头引物序列和N7接头引物序列中一者的3’端通用的测序引物序列的全部或部分(即,ACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT(SEQID NO:21)和GTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCT(SEQ ID NO:22)中的一者的全部序列或其3`端开始13个以上连续脱氧核糖核苷酸构成的序列,例如,CCTACACGACGCTCTTCCGATCT(SEQ ID NO:23))相同的序列和PKHD1基因各个外显子的正向特异性扩增引物序列串联连接组成的第一轮正向扩增引物以及由与选自D5接头引物序列和N7接头引物序列中另一者的3’端通用的测序引物序列的全部或部分(即,ACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT(SEQID NO:21)和GTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCT(SEQ ID NO:22)中的另一者的全部序列或其3`端开始13个以上连续脱氧核糖核苷酸构成的序列,例如,TTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCT(SEQ ID NO:24))相同的序列和PKHD1基因各个外显子的反向特异性扩增引物序列串联连接组成的第一轮反向扩增引物的第一轮扩增引物的组合对各样本的PKHD1基因的一个或多个外显子进行扩增,此时多重扩增起作用的是每个外显子的特异性扩增引物序列,扩增的结果致使每个扩增产物片段的两端都加上了所述通用的测序引物序列的部分或全部,其中,所述D5接头引物序列选自SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:8中,所述N7接头引物序列选自SEQ ID NO:9~SEQ ID NO:20中;
消化引物:用单链消化酶消化第一轮扩增产物中剩余的引物和引物二聚体;
第二轮扩增:以第一轮扩增的产物为模板,采用由与选自所述D5接头引物序列和N7接头引物序列中一者相同的第二轮正向扩增引物以及与选自D5接头引物序列和N7接头引物序列中另一者相同的第二轮反向扩增引物组成的第二轮扩增引物的组合(即,D5接头引物序列和N7接头引物序列的组合),此时扩增起作用的是所述通用的测序引物序列,扩增的结果致使最后的扩增产物又都加上了可区分各样本的对应于D5接头引物序列和N7接头引物序列的标签序列,其中,所述D5接头引物序列选自SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:8中,所述N7接头引物序列选自SEQ ID NO:9~SEQ ID NO:20中;
纯化回收所有DNA条带,优选使用纯化磁珠筛选回收目标区域范围之间的所有DNA条带;
测序:回收的产物进行定量后,将不同标签的产物按照测序数据量要求混合后进行上机测序;
分析:基于每个样本的标签序列,将获得的测序结果与样本一一对应,以及根据每个基因的引物序列,将序列对应到样本的每个基因上。
本发明中,优选地,所述PKHD1基因的外显子可以包括选自PKHD1基因1-67号外显子中的一个或多个。
本发明的构建PKHD1基因突变的测序文库的方法中,优选地,所述第一轮扩增引物的组合包括选自SEQ ID NO:25~SEQ ID NO:230中的一对或多对,优选所述第一轮扩增引物的组合包括SEQ ID NO:25~SEQ ID NO:230,更优选所述第一轮扩增引物的组合由SEQID NO:25~SEQ ID NO:230组成。
本发明中,优选地,所述样本的数量可为96个以下(8种D5接头引物和12种N7接头引物进行一一组合)。
该文库可以直接应用于illumina公司的Nextseq500/550,Hiseq 2000/2500/3000、Miseq等测序仪进行上机测序。同时,经过第二轮扩增,产物里引入了illumina公司通用的D5接头引物序列和N7接头引物序列,可以直接用于测序文库进行高通量测序。
另一方面,本发明提供了一种构建PKHD1基因突变的测序文库的试剂盒,所述试剂盒包括:
第一轮扩增引物的组合:根据待测的PKHD1基因设计对应的扩增引物,根据所用测序仪和测序方法适用的产物大小范围设计PCR产物长度,在正向扩增引物和反向扩增引物的5`端分别加上一段与D5接头引物序列和N7接头引物序列的通用的测序引物序列的全部或部分相同的序列,组成第一轮扩增引物组合,其中,所述第一轮正向扩增引物由与选自上述D5接头引物序列和N7接头引物序列中一者的3’端通用的测序引物序列的全部或部分(即,ACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT(SEQ ID NO:21)和GTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCT(SEQ ID NO:22)中的另一者的全部序列或其3`端开始13个以上连续脱氧核糖核苷酸构成的序列,例如CCTACACGACGCTCTTCCGATCT(SEQ IDNO:23))相同的序列和PKHD1基因的各外显子的正向特异性扩增引物序列串联连接组成,以及所述第一轮反向扩增引物由与选自D5接头引物序列和N7接头引物序列中另一者的3’端通用的测序引物序列的全部或部分(即,ACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT(SEQ IDNO:21)和GTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCT(SEQ ID NO:22)中的另一者的全部序列或其3`端开始13个以上连续脱氧核糖核苷酸构成的序列,例如,TTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCT(SEQ ID NO:24))相同的序列和PKHD1基因的各外显子的反向特异性扩增引物序列串联连接组成,其中,所述D5接头引物序列选自D501-D508(SEQ IDNO:1~SEQ ID NO:8)中,所述N7接头引物序列选自N701-N712(SEQ ID NO:9~SEQ ID NO:20)中;
本发明的通用的测序引物序列illumina公司的高通量测序通用的测序引物序列,分别对应D5接头引物和N7接头引物上的3’端通用的测序引物序列;
第二轮扩增引物的组合:由与选自所述D5接头引物序列和N7接头引物序列中一者相同的第二轮正向扩增引物以及与选自D5接头引物序列和N7接头引物序列中另一者相同的第二轮反向扩增引物组成(即,D5接头引物序列和N7接头引物序列的组合)。
第二轮扩增引物的组合是根据样本的数量使用不同的D5接头引物和N7接头引物序列的标签序列组合(标签序列是D5接头引物和N7接头引物序列中的一段序列(即,[i5]和[i7]))以使各样本可区分,采用由与选自所述D5接头引物序列和N7接头引物序列中一者相同的第二轮正向扩增引物以及与选自D5接头引物序列和N7接头引物序列中另一者相同的第二轮反向扩增引物组成的第二轮扩增引物的组合(即,D5接头引物序列和N7接头引物序列的组合),其中,所述D5接头引物序列选自D501-D508(SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:8)中,所述N7接头引物序列选自N701-N712(SEQ ID NO:9~SEQ ID NO:20)中,其中,所述第二轮扩增引物的组合包括选自由D501~D508(SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:8)中之一和N701~N712(SEQ ID NO:9~SEQ ID NO:20)之一组成的标签引物序列的一对或多对,以使各样本可区分。
本发明的构建PKHD1基因突变的测序文库的试剂盒中,优选地,所述第一轮扩增引物的组合包括选自SEQ ID NO:25~SEQ ID NO:230中的一对或多对,优选所述第一轮扩增引物的组合包括SEQ ID NO:25~SEQ ID NO:230,更优选所述第一轮扩增引物的组合由SEQID NO:25~SEQ ID NO:230组成。
本发明中,优选地,所述试剂盒进一步包括DNA聚合酶,所采用的酶均为高保真DNA聚合酶,由此减少扩增带来的DNA突变率。
本发明中,优选地,所述试剂盒进一步包括单链消化酶,所用的单链消化酶为核酸外切酶I(Exonuclease I),该酶为单链特异性3’→5’核酸外切酶,不分解双链DNA及RNA。
本发明中,优选地,NGS技术将显著提高PKHD1基因突变的检测效率、灵敏度及特异性。
本发明中,更优选地,本发明提供了一种构建包括PKHD1基因外显子区域的测序文库的试剂盒,其中,所述PKHD1外显子区域可以包括选自下列67个外显子区域的一个或多个外显子区域(优选地,可以包括下列67个外显子区域;更优选地,可以由下列67个外显子区域组成),所述试剂盒包括:
第一轮扩增引物组合:包括选自下表中的引物的一对或多对,优选地,包括下表中的引物,更优选地,由下表中的引物组成,
本发明中,上述外显子为本领域公知的,其序列信息例如来自GenBank,PKHD1NM138694。
第二轮扩增引物的组合,其包括选自由D501~D508(SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:8)中之一和N701~N712(SEQ ID NO:9~SEQ ID NO:20)之一组成的标签引物序列的一对或多对,以使各样本可区分:
本发明具有如下有益效果:
本发明通过优化多重PCR反应的循环数,使第一轮多重PCR反应只进行线性扩增,最大限度的减少多重引物之间的扩增效率差别,通过第二轮扩增时通用引物的平行扩增,使多重扩增产物中PKHD1基因的各外显子的相关产物量尽量接近,提高了测序数据的有效性。
在本发明中,第一轮扩增采用的是高通量测序通用的测序引物序列+PKHD1基因各个外显子的特定引物组成的扩增引物组合的混合物,这时候多重扩增起作用的是每个外显子的特定序列,每个外显子的前面都加上了通用的测序引物序列。第二轮扩增引物采用的是高通量测序的接头序列+标签序列+通用的测序序列,这时候扩增起作用的是通用的测序序列,最后的产物前面又都加上了可区分的标签序列,同时,产物可以直接作为测序文库进行高通量测序(illumina公司的Nextseq500/550,Hiseq 2000/2500/3000、Miseq等)。通过以上合理的引物设计和PCR策略,在PCR产物的5`末端直接添加D5接头引物和N7接头引物序列。通过对每个样本都引入可区分的标签序列,使样本在第二代高通量测序技术检测时,每个样本的测序结果都可以通过其独特的标签序列找回,可以应用于同时检测大量样本的多个不同基因位点,大大降低了测序成本。
实施例1
导致常染色体隐性遗传多囊肾病的基因PKHD1的67个外显子测序,共15例,即15例正常人基因组DNA样本。
1)引物设计:
针对PKHD1基因的67个外显子设计相应的扩增引物,相关参数:Tm值58.0℃-62.0℃,GC值40.0%-60.0%,引物大小22±3bp。在正向扩增引物和反向扩增引物的5`端分别加上一段与D5接头引物和N7接头引物的3’端高通量测序通用的测序引物序列相同的序列,所设计的引物如下,其中下划线是引入的高通量测序通用的测序引物序列(即,SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:24):
在本实施例中,第二轮扩增的引物选择时,根据15个样本采用15对标签序列组合,在第二轮扩增时对每个样本的各个目的片段都加上可以区分的标签序列,所设计的引物如下,其中下划线是引入的通用的测序序列(即,第一轮的通用序列,第二轮扩增时候这个序列起到扩增引物的作用):
表1:15个样本对应15对标签的列表
|
D504 |
D505 |
D506 |
D507 |
D508 |
N703 |
1# |
4# |
7# |
10# |
13# |
N704 |
2# |
5# |
8# |
11# |
14# |
N705 |
3# |
6# |
9# |
12# |
15# |
2)第一轮扩增:
每对引物单独调试合格后,将103对引物分别稀释到100μM,然后等量混合,PCR体系:4.4μL 5x PCR buffer,2μL混合引物,1.5μL taq(5U/μL),2.5μL模板DNA(5ng/μL),ddH2O补充到22μL。PCR反应按下述条件进行:模板DNA变性95℃保持15min。PCR反应循环条件:
以下进行20个循环:
第1步:95℃进行30秒;
第2步:60℃进行4分钟;
20个循环完成后,72℃保持10min,最后保持在4℃。
3)消化引物
第一轮扩增产物采用Takara Exonuclease I对第一轮扩增产物进行消化残留引物,酶切体系:Exonuclease I(50U/μL)0.5μL,PCR产物20μL,
酶切反应按下述条件进行:37℃,30min;
4)纯化回收:0.6-0.9x磁珠进行筛选200-400bp之间的片段(减少了第二轮扩增的非特异扩增)
5)第二轮扩增
通过标签引物上下游分别配对组成15对可区分的标签组合,在第二轮PCR扩增时对15个样本分别加上可识别的标签序列,样本两端标签组合见表2,PCR体系:HiFiHS(kk2602)2X mix 25μL,0.75μL正向扩增引物,0.75μL反向扩增引物,5-10μL消化引物后筛选的PCR产物(消化后筛选的pcr产物所加量为80-120ng之间),ddH2O补充到50μL。PCR反应按下述条件进行:模板DNA变性98℃保持45s。PCR反应循环条件:
以下进行8个循环:
第1步:98℃进行15s;
第2步:60℃进行30s;
第3步:72℃进行30s;
13个循环完成后,72℃保持1min,最后保持在4℃。
表2样本两端标签组合表
|
D504 |
D505 |
D506 |
D507 |
D508 |
N703 |
1# |
4# |
7# |
10# |
13# |
N704 |
2# |
5# |
8# |
11# |
14# |
N705 |
3# |
6# |
9# |
12# |
15# |
6)回收:回收350bp-450bp范围之间的所有DNA条带;
7)测序:回收的产物进行定量后,将不同标签的产物按照测序数据量要求混合后进行上机测序(Nextseq500,PE150);
8)分析:Illumina Nextseq500产物的测序结果是一系列DNA序列,通过查找测序结果中15个样本各自可区分的标签序列,将获得的测序结果首先与样本一一对应,然后根据每个外显子各自的引物序列,再将序列对应到样本的各个目标区域上。15个样本的每个外显子都能够在测序结果中找到对应的数据,每个样本对应的reads数(序列条数)如下表3所示,每个外显子序列对应的序列条数如下表4所示(仅列出1#样本的数据)。
表3每个样本对应的序列条数和GC_数
表4PKHD1外显子区域目标序列对应的序列条数(以1号样本为例)
表3表明通过上述方法,成功构建了应用于测序的文库,并且每个文库都能对应的获得相应的测序序列证明通过高通量测序技术对PKHD1基因突变检测是成功的。
表4以其中一个样品为例,列举了多重扩增中103对引物的序列数,表明多重扩增的有效性进一步说明针对PKHD1基因67个外显子设计的引物都可用。
<110> 大连晶泰生物技术有限公司
<120> 构建PKHD1基因突变的测序文库的方法和试剂盒及其用途
<130> DI16-1142-XC37
<160> 230
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 70
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> D501
<400> 1
aatgatacgg cgaccaccga gatctacact agatcgcaca ctctttccct acacgacgct 60
cttccgatct 70
<210> 2
<211> 70
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> D502
<400> 2
aatgatacgg cgaccaccga gatctacacc tctctataca ctctttccct acacgacgct 60
cttccgatct 70
<210> 3
<211> 70
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> D503
<400> 3
aatgatacgg cgaccaccga gatctacact atcctctaca ctctttccct acacgacgct 60
cttccgatct 70
<210> 4
<211> 70
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> D504
<400> 4
aatgatacgg cgaccaccga gatctacaca gagtagaaca ctctttccct acacgacgct 60
cttccgatct 70
<210> 5
<211> 70
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> D505
<400> 5
aatgatacgg cgaccaccga gatctacacg taaggagaca ctctttccct acacgacgct 60
cttccgatct 70
<210> 6
<211> 70
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> D506
<400> 6
aatgatacgg cgaccaccga gatctacaca ctgcataaca ctctttccct acacgacgct 60
cttccgatct 70
<210> 7
<211> 70
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> D507
<400> 7
aatgatacgg cgaccaccga gatctacaca aggagtaaca ctctttccct acacgacgct 60
cttccgatct 70
<210> 8
<211> 70
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> D508
<400> 8
aatgatacgg cgaccaccga gatctacacc taagcctaca ctctttccct acacgacgct 60
cttccgatct 70
<210> 9
<211> 66
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> N701
<400> 9
caagcagaag acggcatacg agattaaggc gagtgactgg agttcagacg tgtgctcttc 60
cgatct 66
<210> 10
<211> 66
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> N702
<400> 10
caagcagaag acggcatacg agatcgtact aggtgactgg agttcagacg tgtgctcttc 60
cgatct 66
<210> 11
<211> 66
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> N703
<400> 11
caagcagaag acggcatacg agataggcag aagtgactgg agttcagacg tgtgctcttc 60
cgatct 66
<210> 12
<211> 66
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> N704
<400> 12
caagcagaag acggcatacg agattcctga gcgtgactgg agttcagacg tgtgctcttc 60
cgatct 66
<210> 13
<211> 66
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> N705
<400> 13
caagcagaag acggcatacg agatggactc ctgtgactgg agttcagacg tgtgctcttc 60
cgatct 66
<210> 14
<211> 66
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> N706
<400> 14
caagcagaag acggcatacg agattaggca tggtgactgg agttcagacg tgtgctcttc 60
cgatct 66
<210> 15
<211> 66
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> N707
<400> 15
caagcagaag acggcatacg agatctctct acgtgactgg agttcagacg tgtgctcttc 60
cgatct 66
<210> 16
<211> 66
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> N708
<400> 16
caagcagaag acggcatacg agatcagaga gggtgactgg agttcagacg tgtgctcttc 60
cgatct 66
<210> 17
<211> 66
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> N709
<400> 17
caagcagaag acggcatacg agatgctacg ctgtgactgg agttcagacg tgtgctcttc 60
cgatct 66
<210> 18
<211> 66
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> N710
<400> 18
caagcagaag acggcatacg agatcgaggc tggtgactgg agttcagacg tgtgctcttc 60
cgatct 66
<210> 19
<211> 66
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> N711
<400> 19
caagcagaag acggcatacg agataagagg cagtgactgg agttcagacg tgtgctcttc 60
cgatct 66
<210> 20
<211> 66
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> N712
<400> 20
caagcagaag acggcatacg agatgtagag gagtgactgg agttcagacg tgtgctcttc 60
cgatct 66
<210> 21
<211> 33
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> D5接头引物序列的3'端通用的测序引物序列
<400> 21
acactctttc cctacacgac gctcttccga tct 33
<210> 22
<211> 34
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> N7接头引物序列的3'端通用的测序引物序列
<400> 22
gtgactggag ttcagacgtg tgctcttccg atct 34
<210> 23
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> D5接头引物序列的3'端通用的测序引物序列的部分
<400> 23
cctacacgac gctcttccga tct 23
<210> 24
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> N7接头引物序列的3'端通用的测序引物序列的部分
<400> 24
ttcagacgtg tgctcttccg atct 24
<210> 25
<211> 48
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon1-F
<400> 25
cctacacgac gctcttccga tctacctttt ttttctgttt ctgtctcc 48
<210> 26
<211> 52
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon2_1-F
<400> 26
cctacacgac gctcttccga tctttaaacc caaaagcaaa taccttaaca cc 52
<210> 27
<211> 47
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon2_2-F
<400> 27
cctacacgac gctcttccga tctacacatt ctactgacct gccaaaa 47
<210> 28
<211> 44
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon3-F
<400> 28
cctacacgac gctcttccga tctcccttca ggcccacttt taca 44
<210> 29
<211> 50
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon4-F
<400> 29
cctacacgac gctcttccga tctagataag caaaaatccc tcatcctgtc 50
<210> 30
<211> 49
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon5-F
<400> 30
cctacacgac gctcttccga tctctggctc atttacaatt tgcctttca 49
<210> 31
<211> 56
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon6-F
<400> 31
cctacacgac gctcttccga tctgaagaag ttaaattttc ccactcataa aaacca 56
<210> 32
<211> 52
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon7_1-F
<400> 32
cctacacgac gctcttccga tctccagttg caattacatt aacaaagttt gc 52
<210> 33
<211> 53
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon7_2-F
<400> 33
cctacacgac gctcttccga tctaacaaac acacacttac ctatcaatgt act 53
<210> 34
<211> 46
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon8-F
<400> 34
cctacacgac gctcttccga tcttgtgttg tatccatgtg gacgaa 46
<210> 35
<211> 51
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon9-F
<400> 35
cctacacgac gctcttccga tctttatcct catgagaacc aatcttgcaa t 51
<210> 36
<211> 56
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon10-F
<400> 36
cctacacgac gctcttccga tcttccgtca taaaaagata aagaaagtaa gcaaga 56
<210> 37
<211> 49
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon11-F
<400> 37
cctacacgac gctcttccga tctgggtgtt aatggtcatc aagaaatgg 49
<210> 38
<211> 44
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon12-F
<400> 38
cctacacgac gctcttccga tctcttcctc ctgcatccct catg 44
<210> 39
<211> 48
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon13-F
<400> 39
cctacacgac gctcttccga tctgctcact gagtaagcca gtcaaata 48
<210> 40
<211> 47
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon14-F
<400> 40
cctacacgac gctcttccga tcttccttat ctgtctccta gcctcac 47
<210> 41
<211> 52
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon15-F
<400> 41
cctacacgac gctcttccga tctacatgag agccttaact ttgattcttt ct 52
<210> 42
<211> 47
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon16_1-F
<400> 42
cctacacgac gctcttccga tcttgaatct ggacaccaat cctcatc 47
<210> 43
<211> 48
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon16_2-F
<400> 43
cctacacgac gctcttccga tctcagcaag gttataatga cccctcag 48
<210> 44
<211> 46
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon17-F
<400> 44
cctacacgac gctcttccga tctttgaaga agtctcccac cagatg 46
<210> 45
<211> 51
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon18-F
<400> 45
cctacacgac gctcttccga tcttgatgaa aaagacaatc agaatgaagc c 51
<210> 46
<211> 48
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon19-F
<400> 46
cctacacgac gctcttccga tctccagaga gcaataccaa tacctacc 48
<210> 47
<211> 46
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon20-F
<400> 47
cctacacgac gctcttccga tctactgtcc ccaaaacagt gaatcc 46
<210> 48
<211> 48
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon21-F
<400> 48
cctacacgac gctcttccga tctgcttgtg gaggagagag aatttgat 48
<210> 49
<211> 46
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon22-F
<400> 49
cctacacgac gctcttccga tctaaggcca acaagcattc ttagga 46
<210> 50
<211> 46
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon23-F
<400> 50
cctacacgac gctcttccga tctggatgtt gttcccttgg gaatgt 46
<210> 51
<211> 44
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon24-F
<400> 51
cctacacgac gctcttccga tctgcagcaa atccatgcca ctag 44
<210> 52
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon25-F
<400> 52
cctacacgac gctcttccga tctcacttag ggtggcccat tca 43
<210> 53
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon26-F
<400> 53
cctacacgac gctcttccga tctatcacca gctacatggc ctcta 45
<210> 54
<211> 46
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon27_1-F
<400> 54
cctacacgac gctcttccga tctagagggt ctcaccaaca tcaaga 46
<210> 55
<211> 50
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon27_2-F
<400> 55
cctacacgac gctcttccga tctagtaaac aaaagacagt gagtcacagt 50
<210> 56
<211> 50
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon28-F
<400> 56
cctacacgac gctcttccga tcttatatta acagtggtca ctcacccaga 50
<210> 57
<211> 50
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon29-F
<400> 57
cctacacgac gctcttccga tctttgattg ccctttttat aggaccaatg 50
<210> 58
<211> 54
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon30-F
<400> 58
cctacacgac gctcttccga tctccatcaa acaaatccaa aattaatgca agtg 54
<210> 59
<211> 49
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon31-F
<400> 59
cctacacgac gctcttccga tcttctctga cctcactggc aaattaatc 49
<210> 60
<211> 44
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon32_1-F
<400> 60
cctacacgac gctcttccga tcttgtggtt accagagaca ccca 44
<210> 61
<211> 46
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon32_2-F
<400> 61
cctacacgac gctcttccga tctttccaga agtgaaagga gctacc 46
<210> 62
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon32_3-F
<400> 62
cctacacgac gctcttccga tctccctaat cagcacagtg gtcag 45
<210> 63
<211> 44
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon32_4-F
<400> 63
cctacacgac gctcttccga tctcattccc tgtgggaaca atgc 44
<210> 64
<211> 48
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon32_5-F
<400> 64
cctacacgac gctcttccga tctccagaac aagcataccc atttcttg 48
<210> 65
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon32_6-F
<400> 65
cctacacgac gctcttccga tctaattgct ggagcaccac aga 43
<210> 66
<211> 44
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon32_7-F
<400> 66
cctacacgac gctcttccga tctaggctaa cctggcagag aatg 44
<210> 67
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon32_8-F
<400> 67
cctacacgac gctcttccga tctgctcgcc tccgttaagt tca 43
<210> 68
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon32_9-F
<400> 68
cctacacgac gctcttccga tctttgtgat ttctccttgc atggc 45
<210> 69
<211> 49
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon33_1-F
<400> 69
cctacacgac gctcttccga tcttaacagg tggcctcaga ttctaacta 49
<210> 70
<211> 44
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon33_2-F
<400> 70
cctacacgac gctcttccga tcttgtagca ttagccagga ctcg 44
<210> 71
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon34_1-F
<400> 71
cctacacgac gctcttccga tctctgccca atgatctggc aca 43
<210> 72
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon34_2-F
<400> 72
cctacacgac gctcttccga tctctgccca atgatctggc aca 43
<210> 73
<211> 49
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon35_1-F
<400> 73
cctacacgac gctcttccga tctagcgttt ccgtatctca gtaatcttg 49
<210> 74
<211> 55
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon35_2-F
<400> 74
cctacacgac gctcttccga tctaactatg aattcagata ttgtgcatta gacca 55
<210> 75
<211> 46
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon36_1-F
<400> 75
cctacacgac gctcttccga tcttgagtcc aaagaaaggc ctttca 46
<210> 76
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon36_2-F
<400> 76
cctacacgac gctcttccga tctatgcttg tgttagtgtc cagca 45
<210> 77
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon37_1-F
<400> 77
cctacacgac gctcttccga tctgatcaat tgcctcactc accgt 45
<210> 78
<211> 46
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon37_2-F
<400> 78
cctacacgac gctcttccga tctagcaaac aattgggaac ggtagt 46
<210> 79
<211> 56
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon38_1-F
<400> 79
cctacacgac gctcttccga tctttgtcaa aatgtctacc attatttaag cagaag 56
<210> 80
<211> 48
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon38_2-F
<400> 80
cctacacgac gctcttccga tctagtgaca atctcttcca tcggtttg 48
<210> 81
<211> 50
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon39-F
<400> 81
cctacacgac gctcttccga tcttgctcat tagactttcc aacaaaacac 50
<210> 82
<211> 51
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon40-F
<400> 82
cctacacgac gctcttccga tctagaaaga aacatgagaa agtcctaggt c 51
<210> 83
<211> 50
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon41-F
<400> 83
cctacacgac gctcttccga tctgtgtcct acacaagaat gcagaaattc 50
<210> 84
<211> 56
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon42-F
<400> 84
cctacacgac gctcttccga tctatgcaca ataaacttaa gagacctaac attttg 56
<210> 85
<211> 50
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon43-F
<400> 85
cctacacgac gctcttccga tctcacccct gattgagaaa gaactttatg 50
<210> 86
<211> 44
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon44-F
<400> 86
cctacacgac gctcttccga tctgcccaaa gtgctctcat tgtg 44
<210> 87
<211> 44
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon45_1-F
<400> 87
cctacacgac gctcttccga tctaaaaagc ttacctgggc acca 44
<210> 88
<211> 50
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon45_2-F
<400> 88
cctacacgac gctcttccga tctagaaaat gacctaaccc tggattagtg 50
<210> 89
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon46-F
<400> 89
cctacacgac gctcttccga tctgggccca gcacatgtaa ttttg 45
<210> 90
<211> 56
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon47-F
<400> 90
cctacacgac gctcttccga tctgccttat ttatcatctg ttctgtctat tcaaat 56
<210> 91
<211> 51
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon48_1-F
<400> 91
cctacacgac gctcttccga tctatgattc agcagctgtc aaaattattc c 51
<210> 92
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon48_2-F
<400> 92
cctacacgac gctcttccga tctacccgac caaagcttga attga 45
<210> 93
<211> 47
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon49_1-F
<400> 93
cctacacgac gctcttccga tctttgcaat gagtaggtct cttggtc 47
<210> 94
<211> 56
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon49_2-F
<400> 94
cctacacgac gctcttccga tctagcttat attcatctgg ccaaaatact attgaa 56
<210> 95
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon50_1-F
<400> 95
cctacacgac gctcttccga tctccataac acacagctgt ccctt 45
<210> 96
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon50_2-F
<400> 96
cctacacgac gctcttccga tctggttctg acctggtgat ggaag 45
<210> 97
<211> 52
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon51-F
<400> 97
cctacacgac gctcttccga tctaacagta tgacaaggtg gaatttgtag aa 52
<210> 98
<211> 44
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon52-F
<400> 98
cctacacgac gctcttccga tctgggttca gcctgtctgt gatt 44
<210> 99
<211> 51
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon53-F
<400> 99
cctacacgac gctcttccga tctagcccct tctcacagaa tataattctc a 51
<210> 100
<211> 47
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon54-F
<400> 100
cctacacgac gctcttccga tctacaagca cacaatacac acacatg 47
<210> 101
<211> 53
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon55-F
<400> 101
cctacacgac gctcttccga tcttcatatt gtaacaaaat ctcaagcaga agc 53
<210> 102
<211> 48
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon56-F
<400> 102
cctacacgac gctcttccga tctaggttac caaacatggt cttcctag 48
<210> 103
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon57-F
<400> 103
cctacacgac gctcttccga tcttgtccca gatgaatagg ctcca 45
<210> 104
<211> 49
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon58_1-F
<400> 104
cctacacgac gctcttccga tctccactga tttggttctg aggtgaata 49
<210> 105
<211> 48
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon58_2-F
<400> 105
cctacacgac gctcttccga tctaccattg tggctatcaa tactcagc 48
<210> 106
<211> 52
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon58_3-F
<400> 106
cctacacgac gctcttccga tctgcagaaa atacatacac tactgccaaa ag 52
<210> 107
<211> 46
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon58_4-F
<400> 107
cctacacgac gctcttccga tctggcctga ccctctaaat ctatgc 46
<210> 108
<211> 47
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon58_5-F
<400> 108
cctacacgac gctcttccga tctacattgt cagaccaaag cagttca 47
<210> 109
<211> 56
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon59_6-F
<400> 109
cctacacgac gctcttccga tctttaatgt accttaccat tctaagattc atttct 56
<210> 110
<211> 53
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon59_7-F
<400> 110
cctacacgac gctcttccga tctttatctt ttatctttag catcctggtc ctc 53
<210> 111
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon60-F
<400> 111
cctacacgac gctcttccga tctacaagca cccttgcctc tac 43
<210> 112
<211> 47
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon61_1-F
<400> 112
cctacacgac gctcttccga tctctgttgg cgaatcacca atttcaa 47
<210> 113
<211> 50
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon61_2-F
<400> 113
cctacacgac gctcttccga tctaatcagc cctcatttgg atgtgaatat 50
<210> 114
<211> 46
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon61_3-F
<400> 114
cctacacgac gctcttccga tctaagcgca aaacttgagg agtttg 46
<210> 115
<211> 48
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon61_4-F
<400> 115
cctacacgac gctcttccga tcttcctctc cttgtaggac aacataca 48
<210> 116
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon61_5-F
<400> 116
cctacacgac gctcttccga tcttgtcagc aatggccttt aaggt 45
<210> 117
<211> 51
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon61_6-F
<400> 117
cctacacgac gctcttccga tctaactgga tataacttct gaattgccca a 51
<210> 118
<211> 53
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon61_7-F
<400> 118
cctacacgac gctcttccga tctgaaacag tgtcttaaca agtctttcca ttt 53
<210> 119
<211> 49
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon62-F
<400> 119
cctacacgac gctcttccga tctaaaagat aggctgaatg ctacatgct 49
<210> 120
<211> 52
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon63-F
<400> 120
cctacacgac gctcttccga tctaacattt tctgtgcaga taaagtggta ac 52
<210> 121
<211> 56
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon64-F
<400> 121
cctacacgac gctcttccga tctgaataaa agcacactgt ataaaattac ctggag 56
<210> 122
<211> 54
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon65_1-F
<400> 122
cctacacgac gctcttccga tcttttagag aagctcacaa aaatttgtct ttgg 54
<210> 123
<211> 46
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon65_2-F
<400> 123
cctacacgac gctcttccga tctgatgatg gtcgacttct ccttcc 46
<210> 124
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon66-F
<400> 124
cctacacgac gctcttccga tctaggctca gaccatccac agt 43
<210> 125
<211> 47
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon67_1-F
<400> 125
cctacacgac gctcttccga tctctctctt cttagttgtc ccagcag 47
<210> 126
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon67_2-F
<400> 126
cctacacgac gctcttccga tctgcttact cagccgactt tgc 43
<210> 127
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon67_3-F
<400> 127
cctacacgac gctcttccga tcttgtgatg ccagtagtac cagga 45
<210> 128
<211> 48
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon1-R
<400> 128
ttcagacgtg tgctcttccg atcttcatta aacttaccca tggtcagg 48
<210> 129
<211> 48
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon2_1-R
<400> 129
ttcagacgtg tgctcttccg atctcctggc tgatctctct gatgagta 48
<210> 130
<211> 51
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon2_2-R
<400> 130
ttcagacgtg tgctcttccg atcttcctta atttcccagg tttcagaaca g 51
<210> 131
<211> 53
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon3-R
<400> 131
ttcagacgtg tgctcttccg atctttgctt aaaatattgc agaaggtagt ggt 53
<210> 132
<211> 50
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon4-R
<400> 132
ttcagacgtg tgctcttccg atctgtcctg tgtcaatgac aattctatgc 50
<210> 133
<211> 44
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon5-R
<400> 133
ttcagacgtg tgctcttccg atctcaagtg ggctgctagc tttg 44
<210> 134
<211> 48
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon6-R
<400> 134
ttcagacgtg tgctcttccg atctaccttc aagtaatgct gtctgagg 48
<210> 135
<211> 54
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon7_1-R
<400> 135
ttcagacgtg tgctcttccg atctggatta tcactggaag attggaaact tttg 54
<210> 136
<211> 51
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon7_2-R
<400> 136
ttcagacgtg tgctcttccg atctagtatt aattttctgg gccatgacct g 51
<210> 137
<211> 48
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon8-R
<400> 137
ttcagacgtg tgctcttccg atctgccatg tttcctctga gttttgtg 48
<210> 138
<211> 52
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon9-R
<400> 138
ttcagacgtg tgctcttccg atcttggttt tcttttgctt tctactttcc tg 52
<210> 139
<211> 52
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon10-R
<400> 139
ttcagacgtg tgctcttccg atcttgatat tggagtcttt gggcttatga aa 52
<210> 140
<211> 53
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon11-R
<400> 140
ttcagacgtg tgctcttccg atctcaatag aggttagttc ccaatcttcc ttt 53
<210> 141
<211> 56
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon12-R
<400> 141
ttcagacgtg tgctcttccg atcttctagg tcatattctg gtctatattt ggaagc 56
<210> 142
<211> 57
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon13-R
<400> 142
ttcagacgtg tgctcttccg atctcacaca cacacataca taaatttctt taattcg 57
<210> 143
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon14-R
<400> 143
ttcagacgtg tgctcttccg atctaaggtg cgccctgtaa tgt 43
<210> 144
<211> 46
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon15-R
<400> 144
ttcagacgtg tgctcttccg atctagggca gtcatttgtt ggttca 46
<210> 145
<211> 48
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon16_1-R
<400> 145
ttcagacgtg tgctcttccg atcttgtttg agaaagagat gcctggaa 48
<210> 146
<211> 46
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon16_2-R
<400> 146
ttcagacgtg tgctcttccg atctaagcag agcatcatgg gatagc 46
<210> 147
<211> 49
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon17-R
<400> 147
ttcagacgtg tgctcttccg atcttgatgc tgtgttcctc agagatttc 49
<210> 148
<211> 46
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon18-R
<400> 148
ttcagacgtg tgctcttccg atcttgtctc tagtcagcca atccct 46
<210> 149
<211> 49
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon19-R
<400> 149
ttcagacgtg tgctcttccg atctcacatg tagggaagct ctgtctttt 49
<210> 150
<211> 52
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon20-R
<400> 150
ttcagacgtg tgctcttccg atctgactcc tcactacgta ttgtttgaat ga 52
<210> 151
<211> 44
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon21-R
<400> 151
ttcagacgtg tgctcttccg atctgctcta accggagagg actg 44
<210> 152
<211> 50
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon22-R
<400> 152
ttcagacgtg tgctcttccg atctcacaca gcaagtctac catcttaagt 50
<210> 153
<211> 46
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon23-R
<400> 153
ttcagacgtg tgctcttccg atctatcctt cagacaaggt cctcct 46
<210> 154
<211> 55
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon24-R
<400> 154
ttcagacgtg tgctcttccg atctggtgga ttaattagtg tctgtgtttt ctgta 55
<210> 155
<211> 53
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon25-R
<400> 155
ttcagacgtg tgctcttccg atcttagctg tctgattatc tgaaacacaa tgt 53
<210> 156
<211> 48
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon26-R
<400> 156
ttcagacgtg tgctcttccg atctagcttg ggagcacttc acatatac 48
<210> 157
<211> 55
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon27_1-R
<400> 157
ttcagacgtg tgctcttccg atctagaggt ctctcaaatg aagtaatatc actga 55
<210> 158
<211> 49
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon27_2-R
<400> 158
ttcagacgtg tgctcttccg atcttgtcag acagatttgc tacctgttg 49
<210> 159
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon28-R
<400> 159
ttcagacgtg tgctcttccg atcttgtctg cctgtatggt tggtg 45
<210> 160
<211> 49
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon29-R
<400> 160
ttcagacgtg tgctcttccg atctagttct cttcccttaa gtcagtcct 49
<210> 161
<211> 48
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon30-R
<400> 161
ttcagacgtg tgctcttccg atctccacat gtcagaggct attggatt 48
<210> 162
<211> 51
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon31-R
<400> 162
ttcagacgtg tgctcttccg atctacagtt tgctcttctc ctcaaaatac a 51
<210> 163
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon32_1-R
<400> 163
ttcagacgtg tgctcttccg atctcctgac ggtgaacatc ggt 43
<210> 164
<211> 53
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon32_2-R
<400> 164
ttcagacgtg tgctcttccg atctggagct gcaaacattg acatttttat agg 53
<210> 165
<211> 53
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon32_3-R
<400> 165
ttcagacgtg tgctcttccg atctggtcct tttacttgtg tgattttgag ttt 53
<210> 166
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon32_4-R
<400> 166
ttcagacgtg tgctcttccg atctccagga ccccactacc tgt 43
<210> 167
<211> 46
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon32_5-R
<400> 167
ttcagacgtg tgctcttccg atctcatgga tgccttgtcc acaaac 46
<210> 168
<211> 44
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon32_6-R
<400> 168
ttcagacgtg tgctcttccg atcttgtatg aagcggcagc aaca 44
<210> 169
<211> 46
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon32_7-R
<400> 169
ttcagacgtg tgctcttccg atctagtacg tcagaagcag atggga 46
<210> 170
<211> 49
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon32_8-R
<400> 170
ttcagacgtg tgctcttccg atcttttcac taacacatgc cctaccttc 49
<210> 171
<211> 44
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon32_9-R
<400> 171
ttcagacgtg tgctcttccg atctggtact tgtgggcaat cggt 44
<210> 172
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon33_1-R
<400> 172
ttcagacgtg tgctcttccg atctggaatg tctcagctgc tgtgt 45
<210> 173
<211> 48
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon33_2-R
<400> 173
ttcagacgtg tgctcttccg atctgcggat tctgaggatg tgaaaaga 48
<210> 174
<211> 51
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon34_1-R
<400> 174
ttcagacgtg tgctcttccg atctgttctc tctgtggttc tttcctaatg g 51
<210> 175
<211> 48
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon34_2-R
<400> 175
ttcagacgtg tgctcttccg atctcctcta catttgcgag gaaagttc 48
<210> 176
<211> 56
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon35_1-R
<400> 176
ttcagacgtg tgctcttccg atctaagcta atggcttgca atgattaata agagta 56
<210> 177
<211> 44
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon35_2-R
<400> 177
ttcagacgtg tgctcttccg atctgagtgt gagacgccca atca 44
<210> 178
<211> 46
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon36_1-R
<400> 178
ttcagacgtg tgctcttccg atctgacaac gtcacagtgg agaatg 46
<210> 179
<211> 47
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon36_2-R
<400> 179
ttcagacgtg tgctcttccg atctccgccc aaaaacaatg aatgaac 47
<210> 180
<211> 48
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon37_1-R
<400> 180
ttcagacgtg tgctcttccg atctcaggga ctgacaattt tccctttg 48
<210> 181
<211> 44
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon37_2-R
<400> 181
ttcagacgtg tgctcttccg atctcctggc tgtgaggaat ggaa 44
<210> 182
<211> 49
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon38_1-R
<400> 182
ttcagacgtg tgctcttccg atctaagttg tcatcatcag tggaacagg 49
<210> 183
<211> 52
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon38_2-R
<400> 183
ttcagacgtg tgctcttccg atcttgggat tctttggcta aataacatca ca 52
<210> 184
<211> 51
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon39-R
<400> 184
ttcagacgtg tgctcttccg atctgtgatg tcctcagttc tatcatcctc t 51
<210> 185
<211> 53
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon40-R
<400> 185
ttcagacgtg tgctcttccg atctacatgc tttaggttct ctggacttta ttt 53
<210> 186
<211> 54
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon41-R
<400> 186
ttcagacgtg tgctcttccg atctcaacag aatctcagga gccatatcta attt 54
<210> 187
<211> 47
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon42-R
<400> 187
ttcagacgtg tgctcttccg atctcacacc caaagaagta gtgttgc 47
<210> 188
<211> 50
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon43-R
<400> 188
ttcagacgtg tgctcttccg atctgaatca agggtgttga gttgagtaca 50
<210> 189
<211> 49
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon44-R
<400> 189
ttcagacgtg tgctcttccg atctaacaag agtctttctt tccagcaac 49
<210> 190
<211> 56
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon45_1-R
<400> 190
ttcagacgtg tgctcttccg atctccatct accttcattc tccctaatac attact 56
<210> 191
<211> 47
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon45_2-R
<400> 191
ttcagacgtg tgctcttccg atctctgttc cagagcttca cagtttg 47
<210> 192
<211> 44
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon46-R
<400> 192
ttcagacgtg tgctcttccg atctagctac aggaagtccg caag 44
<210> 193
<211> 54
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon47-R
<400> 193
ttcagacgtg tgctcttccg atcttgtgtc cagttttctt attttgcttt catc 54
<210> 194
<211> 50
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon48_1-R
<400> 194
ttcagacgtg tgctcttccg atcttcttgc ttctatggaa accctttcag 50
<210> 195
<211> 55
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon48_2-R
<400> 195
ttcagacgtg tgctcttccg atctgccatt gtgtaataat ctttctgttt tccaa 55
<210> 196
<211> 56
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon49_1-R
<400> 196
ttcagacgtg tgctcttccg atctaattga tgaaagagga atgtattgga ttcaga 56
<210> 197
<211> 44
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon49_2-R
<400> 197
ttcagacgtg tgctcttccg atctctaacc ctcgtggctg gatg 44
<210> 198
<211> 42
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon50_1-R
<400> 198
ttcagacgtg tgctcttccg atctgggagt cgagtgggtc tg 42
<210> 199
<211> 44
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon50_2-R
<400> 199
ttcagacgtg tgctcttccg atctgttgtt ttggcagggt ggtg 44
<210> 200
<211> 58
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon51-R
<400> 200
ttcagacgtg tgctcttccg atctctgttt tgaaaattta ggcaactaga atttagca 58
<210> 201
<211> 49
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon52-R
<400> 201
ttcagacgtg tgctcttccg atctggaggt gaaaatacca ctagcatcc 49
<210> 202
<211> 56
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon53-R
<400> 202
ttcagacgtg tgctcttccg atctaacacg taattcttgt ttttgtgaca tatctg 56
<210> 203
<211> 56
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon54-R
<400> 203
ttcagacgtg tgctcttccg atctgcaatt tctccctctc tttcttttaa tttcaa 56
<210> 204
<211> 51
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon55-R
<400> 204
ttcagacgtg tgctcttccg atcttggaat gacttttact tacctggctt t 51
<210> 205
<211> 50
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon56-R
<400> 205
ttcagacgtg tgctcttccg atcttagatg atttgtgctg cactgttagt 50
<210> 206
<211> 52
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon57-R
<400> 206
ttcagacgtg tgctcttccg atctccagct agtgattttt gaaacaggtt tt 52
<210> 207
<211> 53
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon58_1-R
<400> 207
ttcagacgtg tgctcttccg atcttggaga tagagaacat tactctggta gac 53
<210> 208
<211> 48
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon58_2-R
<400> 208
ttcagacgtg tgctcttccg atctatccaa gaggaggtcg aattggta 48
<210> 209
<211> 44
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon58_3-R
<400> 209
ttcagacgtg tgctcttccg atcttttcac atccgaggcc acaa 44
<210> 210
<211> 50
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon58_4-R
<400> 210
ttcagacgtg tgctcttccg atctggaaag tacctgatga catgcatttg 50
<210> 211
<211> 57
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon58_5-R
<400> 211
ttcagacgtg tgctcttccg atctgagtac ttttaaatga caatattgtg tttggca 57
<210> 212
<211> 48
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon59_6-R
<400> 212
ttcagacgtg tgctcttccg atctagagaa cagtggaatt atgcaccc 48
<210> 213
<211> 53
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon59_7-R
<400> 213
ttcagacgtg tgctcttccg atctatcctg gatagcttta actaacttag ggt 53
<210> 214
<211> 54
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon60-R
<400> 214
ttcagacgtg tgctcttccg atctttcttc ttgctgctta tcatgaaatg aaag 54
<210> 215
<211> 50
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon61_1-R
<400> 215
ttcagacgtg tgctcttccg atctaaatca ggtttattca cgagatgcct 50
<210> 216
<211> 50
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon61_2-R
<400> 216
ttcagacgtg tgctcttccg atctcccaat gactgtggaa actatctcaa 50
<210> 217
<211> 52
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon61_3-R
<400> 217
ttcagacgtg tgctcttccg atctctgacc aagtggtcct aattcttgat ag 52
<210> 218
<211> 47
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon61_4-R
<400> 218
ttcagacgtg tgctcttccg atctccatca ggcaaatcac caaagtc 47
<210> 219
<211> 53
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon61_5-R
<400> 219
ttcagacgtg tgctcttccg atctatctat tggtgccaac tatttcaaca tca 53
<210> 220
<211> 51
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon61_6-R
<400> 220
ttcagacgtg tgctcttccg atctagttat agatgatggc aagagtgatg g 51
<210> 221
<211> 51
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon61_7-R
<400> 221
ttcagacgtg tgctcttccg atctgggtat tttcatttgg atgcaatgtg g 51
<210> 222
<211> 52
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon62-R
<400> 222
ttcagacgtg tgctcttccg atcttggaaa attgctacca tagggatatg tg 52
<210> 223
<211> 57
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon63-R
<400> 223
ttcagacgtg tgctcttccg atcttccatc ttttctaact tcacaaaatt ctcttct 57
<210> 224
<211> 50
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon64-R
<400> 224
ttcagacgtg tgctcttccg atctccttta ttgtccaaat gtctgccttc 50
<210> 225
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon65_1-R
<400> 225
ttcagacgtg tgctcttccg atctccattt gctgtcttgc ctgtg 45
<210> 226
<211> 57
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon65_2-R
<400> 226
ttcagacgtg tgctcttccg atcttgttat tgttggaatc ttgtgattct ctagaaa 57
<210> 227
<211> 47
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon66-R
<400> 227
ttcagacgtg tgctcttccg atctcctaaa tgctgatggt cccactt 47
<210> 228
<211> 48
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon67_1-R
<400> 228
ttcagacgtg tgctcttccg atcttatgcc cagacttcag acaagaga 48
<210> 229
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon67_2-R
<400> 229
ttcagacgtg tgctcttccg atctaggaaa gttagccgcc acatt 45
<210> 230
<211> 54
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PKHD1_exon67_3-R
<400> 230
ttcagacgtg tgctcttccg atctttgtca gaaatgctaa gtatgcaaaa tgtg 54