BR112016000163B1 - DOUBLE HELIX OLIGO RNA STRUCTURE, NANOPARTICLES, PHARMACEUTICAL COMPOSITION AND FREEZE DRIED FORMULATION - Google Patents
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Abstract
siRNA ESPECÍFICO DE GENE RELACIONADO À DOENÇA RESPIRATÓRIA, ESTRUTURA DE OLIGO RNA DE DUPLA-HÉLICE OLIGO CONTENDO O siRNA, COMPOSIÇÃO CONTENDO OS MESMOS PARA PREVENIR OU TRATAR DOENÇA RESPIRATÓRIA, refere-se a um siRNA específico de gene relacionado com doenças respiratórias, particularmente, a um siRNA específico de gene com fibrose pulmonar idiopática e doença pulmonar obstrutiva crônica (DPOC), e uma estrutura de oligo RNA de dupla hélice altamente eficiente contendo os mesmos, em que a estrutura de oligo RNA de dupla hélice tem uma estrutura em que materiais hidrofílicos e hidrofóbicos são unidos em ambas as extremidades do RNA dupla hélice (siRNA) usando uma ligação covalente simples ou uma ligação covalente mediada por ligante para ser efetivamente transferida em uma célula, e pode ser convertida em nanopartículas pela interação hidrofóbica da estrutura de oligo RNA de dupla hélice em uma solução. É desejável que o siRNA contido na estrutura do oligo RNA de dupla hélice seja um siRNA específico a um CTGF, Cyr61, ou Plekho1, que são genes relacionados com doenças respiratórias, particularmente fibrose pulmonar idiopática e DPOC. Além disso, a presente invenção refere-se a um método para produzir a estrutura de oligo RNA de dupla hélice e uma (...).GENE-SPECIFIC siRNA RELATED TO RESPIRATORY DISEASE, DOUBLE-HELICEL OLIGO RNA STRUCTURE OLIGO CONTAINING THE siRNA, COMPOSITION CONTAINING THE SAME TO PREVENT OR TREAT RESPIRATORY DISEASE, refers to a gene-specific siRNA related to respiratory diseases, particularly, a gene-specific siRNA with idiopathic pulmonary fibrosis and chronic obstructive pulmonary disease (COPD), and a highly efficient double-stranded RNA oligo structure containing the same, wherein the double-stranded RNA oligo structure has a structure in which hydrophilic materials and hydrophobic are attached at both ends of double helix RNA (siRNA) using a single covalent bond or a ligand-mediated covalent bond to be effectively transferred into a cell, and can be converted into nanoparticles by the hydrophobic interaction of the oligo RNA structure of double helix in a solution. It is desirable that the siRNA contained in the structure of the double-stranded RNA oligo is an siRNA specific to a CTGF, Cyr61, or Plekho1, which are genes related to respiratory diseases, particularly idiopathic pulmonary fibrosis and COPD. Furthermore, the present invention relates to a method for producing the double helix RNA oligo structure and a (...).
Description
[001] A presente invenção refere-se a um siRNA específico de gene relacionado à doença respiratória e a uma estrutura elevada eficiente que compreende o oligo RNA de dupla hélice (estrutura de oligo RNA dupla hélice) contendo o siRNA. A estrutura do oligo RNA dupla hélice tem uma estrutura em que um material hidrofílico e um material hidrofóbico são conjugados a ambas as extremidades de RNA de dupla hélice (siRNA), usando uma ligação covalente simples ou uma ligação covalente mediada por ligante de modo a ser efetivamente liberado nas células, em que a estrutura pode ser convertida em uma forma de nanopartícula por interações hidrofóbicas das estruturas do oligo RNA de dupla hélice em uma solução aquosa. O siRNA incluído na estrutura de oligo RNA de dupla hélice é preferencialmente um siRNA específico para CTGF, Cyr61, ou Plekho1 (doravante, referido como um siRNA específico de CTGF, Cyr61 ou Plekho1), que é um gene relacionado com doenças respiratórias, particularmente, a fibrose pulmonar idiopática e a doença pulmonar obstrutiva crônica (DPOC).[001] The present invention relates to a respiratory disease-related gene-specific siRNA and a highly efficient structure comprising double-stranded RNA oligo (double-stranded RNA oligo structure) containing the siRNA. The double helix RNA oligo structure has a structure in which a hydrophilic material and a hydrophobic material are conjugated to both ends of double helix RNA (siRNA), using a single covalent bond or a ligand-mediated covalent bond so as to be effectively released into cells, where the structure can be converted into a nanoparticle form by hydrophobic interactions of double-stranded RNA oligo structures in an aqueous solution. The siRNA included in the double-stranded RNA oligo structure is preferably an siRNA specific for CTGF, Cyr61, or Plekho1 (hereinafter referred to as a CTGF, Cyr61, or Plekho1-specific siRNA), which is a gene related to respiratory diseases, particularly, idiopathic pulmonary fibrosis and chronic obstructive pulmonary disease (COPD).
[002] Além disso, a presente invenção refere-se a um método para produzir a estrutura de oligo RNA de dupla hélice e uma composição farmacêutica contendo a estrutura do oligo RNA de dupla hélice para prevenir ou tratar doenças respiratórias, particularmente, fibrose pulmonar idiopática e DPOC.[002] Furthermore, the present invention relates to a method for producing the double-stranded RNA oligo structure and a pharmaceutical composition containing the double-stranded RNA oligo structure for preventing or treating respiratory diseases, particularly idiopathic pulmonary fibrosis. and COPD.
[003] Tecnologias para inibir a expressão do gene são ferramentas importantes no desenvolvimento de um agente terapêutico e validação de alvo para tratamento de doenças. Entre as tecnologias, desde quando um papel de um RNA de interferência (doravante referido como ‘RNAi’) foi encontrado, verificou-se que o RNA de interferência atua em um mRNA específico de sequência em vários tipos de células de mamíferos (Silence of the transcripts: RNA interference in medicine. J. Mol. Med. (2005) 83: 764-773). Quando um RNA de fita dupla de cadeia longa é liberado em uma célula, o RNA de fita dupla liberado é convertido em um pequeno RNA de interferência (doravante referido como ‘siRNA’) que é processado para 21 a 23 pares de bases (bp) por endonuclease Dicer. siRNA é ligado a um complexo de silenciamento induzido por RNA (RISC), pelo qual uma fita guia (antissenso) reconhece e decompõe um mRNA alvo para inibir de forma específica de sequência a expressão de um gene alvo (NUCLEIC-ACID THERAPEUTICS: BASIC PRINCIPLES AND RECENT APPLICATIONS. Nature Reviews Drug Discovery. 2002. 1, 503-514).[003] Technologies to inhibit gene expression are important tools in the development of a therapeutic agent and target validation for disease treatment. Among the technologies, since when a role of an interfering RNA (hereinafter referred to as 'RNAi') was found, it was found that the interfering RNA acts on a sequence-specific mRNA in various types of mammalian cells (Silence of the transcripts: RNA interference in medicine. When a long-chain double-stranded RNA is released into a cell, the released double-stranded RNA is converted into a small interfering RNA (hereinafter referred to as 'siRNA') that is processed to 21 to 23 base pairs (bp) by Dicer endonuclease. siRNA is linked to an RNA-induced silencing complex (RISC), whereby a guide (antisense) strand recognizes and cleave a target mRNA to sequence-specifically inhibit the expression of a target gene (NUCLEIC-ACID THERAPEUTICS: BASIC PRINCIPLES AND RECENT APPLICATIONS. Nature Reviews Drug Discovery. 2002. 1, 503-514).
[004] Bertrand et al, constatou que, em comparação com um oligonucleotídeo antissenso (ASO) sobre o mesmo gene alvo, siRNA tem um efeito de inibir significativamente a expressão de RNAm in vitro e in vivo, e o efeito correspondente é mantido por um longo tempo (Comparison of antisense oligonucleotides and siRNAs in cell culture and in vivo. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2002. 296: 1000-1004). Além disso, uma vez que siRNA é acoplado de forma complementar a um mRNA alvo para regular de forma específica de sequência a expressão do gene alvo, um mecanismo do siRNA tem uma vantagem em que um alvo a ser aplicável pode ser notavelmente aumentado em comparação com os produtos medicinais baseados em anticorpo existentes ou produtos farmacêuticos químicos (pequenas drogas moleculares) (Progress Towards in vivo Use of siRNAs. MOLECULAR THERAPY. 2006 13(4):664-670).[004] Bertrand et al, found that, compared with an antisense oligonucleotide (ASO) on the same target gene, siRNA has an effect of significantly inhibiting mRNA expression in vitro and in vivo, and the corresponding effect is maintained for a long time (Comparison of antisense oligonucleotides and siRNAs in cell culture and in vivo. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2002. 296: 1000-1004). Furthermore, since siRNA is complementary coupled to a target mRNA to sequence-specifically regulate the expression of the target gene, an siRNA mechanism has an advantage in that a target to be applicable can be remarkably enhanced compared to existing antibody-based medicinal products or chemical pharmaceuticals (small molecular drugs) (Progress Towards in vivo Use of siRNAs. MOLECULAR THERAPY. 2006 13(4):664-670).
[005] Para desenvolver o siRNA como um agente terapêutico mesmo com excelente efeito e faixa variadamente utilizável do siRNA, o siRNA precisa ser efetivamente liberado a uma célula alvo com estabilidade melhorada e uma liberação mais eficiente de célula do siRNA (Harnessing In vivo siRNA Delivery for Drug Discovery and Therapeutic Development. Drug Discov. Today. 2006 Jan; 11(1- 2):67-73.[005] To develop siRNA as a therapeutic agent even with excellent effect and varied usable range of siRNA, the siRNA needs to be effectively delivered to a target cell with improved stability and more efficient cell release of the siRNA (Harnessing In vivo siRNA Delivery for Drug Discovery and Therapeutic Development. Drug Discov.
[006] A fim de resolver os problemas, a investigação sobre a modificação de alguns nucleotídeos ou estrutura de siRNA para ter uma resistência de liase de ácido nucleico, ou usar transportadores como vetores virais, os lipossomas ou nanopartículas, etc. para melhorar a estabilidade in vivo, foram tentados ativamente.[006] In order to solve the problems, research into modifying some nucleotides or structure of siRNA to have a nucleic acid lyase resistance, or using carriers such as viral vectors, liposomes or nanoparticles, etc. to improve in vivo stability have been actively attempted.
[007] Sist emas de liberação usando vetores virais como adenovírus, retrovírus, etc., têm alta eficácia de transfecção, e também têm alta imunogenicidade e oncogenicidade. Enquanto isso, um sistema de liberação não viral incluindo nanopartículas tem uma baixa de eficiência liberação de célula em comparação com o sistema de liberação viral, mas tem uma alta estabilidade in vivo e é possível de ser liberado de forma específica para o alvo, tem efeito de liberação altamente melhorado como a absorção, a internalização , etc, de oligonucleotídeo RNAi em células ou tecidos, e raramente tem citotoxicidade e estimulação imune, de forma que o sistema de liberação não viral é atualmente avaliado como um método de liberação viável em comparação com os sistemas de liberação virais (Nonviral delivery of synthetic siRNA s in vivo. J Clin Invest. 2007 December 3; 117(12): 3623-3632).[007] Delivery systems using viral vectors such as adenovirus, retrovirus, etc., have high transfection efficacy, and also have high immunogenicity and oncogenicity. Meanwhile, a non-viral delivery system including nanoparticles has a low cell release efficiency compared to the viral delivery system, but has a high stability in vivo and is possible to be released in a target-specific manner. highly improved delivery system such as uptake, internalization, etc. of RNAi oligonucleotide into cells or tissues, and rarely has cytotoxicity and immune stimulation, so that the non-viral delivery system is currently evaluated as a viable delivery method compared to viral delivery systems (Nonviral delivery of synthetic siRNA s in vivo. J Clin Invest. 2007 December 3; 117(12): 3623-3632).
[008] Em um método usando um nanotransportador em sistemas de liberação não virais, vários polímeros como lipossomas, compósitos de polímeros catiônicos, etc., são usados para formar as nanopartículas, e um siRNA é compatível com as nanopartículas, ou seja, nanotransportador, para ser liberado para as células. Entre os métodos usando nanotransportadores, um método usando nanopartículas poliméricas, micela de polímero, lipoplex, ou semelhantes, é usado principalmente, em que o lipoplex consiste em lipídios catiônicos para interagir com lipídios aniônicos do endossomo de uma célula, provocando assim um efeito de desestabilização do endossomo para liberar o siRNA em uma célula (Proc. Natl. Acad. Sci. 15; 93(21):11493-8, 1996).[008] In a method using a nanocarrier in non-viral delivery systems, various polymers such as liposomes, cationic polymer composites, etc., are used to form the nanoparticles, and an siRNA is compatible with the nanoparticles, i.e., nanocarrier, to be released into cells. Among the methods using nanocarriers, a method using polymeric nanoparticles, polymer micelle, lipoplex, or the like is mainly used, in which the lipoplex consists of cationic lipids to interact with anionic lipids of the endosome of a cell, thereby causing a destabilization effect. from the endosome to release the siRNA into a cell (Proc. Natl. Acad. Sci. 15; 93(21):11493-8, 1996).
[009] Além disso, sabe-se que materiais químicos, etc., estão conectados para porções de extremidade de uma fita de passageiro (senso) de siRNA para fornecer características farmacocinéticas promovidas, de forma que alta eficácia pode ser induzida in vivo (Nature 11; 432(7014):173-8, 2004). Aqui, a estabilidade do siRNA pode variar dependendo de propriedades dos materiais químicos ligados às extremidades da fita de siRNA senso (passageiro) ou antissenso (guia). Por exemplo, um siRNA para que um composto de polímero como polietileno glicol (PEG) seja conjugado, interage com um grupo fosfato aniônico de siRNA na presença de materiais catiônicos para formar um complexo, assim sendo um transportador tendo uma estabilidade melhorada siRNA (J. Control Release 129(2):107-16, 2008). Em particular, micela consistindo em complexos de polímero tem um tamanho extremamente pequeno, distribuição significativamente uniforme, e é de forma espontânea, sendo assim fácil de gerenciar a qualidade da formulação e da reprodutibilidade segura, em comparação com outros sistemas usados como um veículo de liberação de droga, como microesfera, nanopartícula, etc.[009] Furthermore, it is known that chemical materials, etc., are attached to end portions of an siRNA passenger (sense) strand to provide promoted pharmacokinetic characteristics, so that high efficacy can be induced in vivo (Nature 11; 432(7014):173-8, 2004). Here, the stability of the siRNA can vary depending on properties of the chemical materials attached to the ends of the sense (passenger) or antisense (guide) siRNA strand. For example, an siRNA to which a polymer compound such as polyethylene glycol (PEG) is conjugated interacts with an anionic phosphate group of siRNA in the presence of cationic materials to form a complex, thus being a carrier having improved siRNA stability (J. Control Release 129(2):107-16, 2008). In particular, micelle consisting of polymer complexes has an extremely small size, significantly uniform distribution, and is spontaneously formed, thus being easy to manage formulation quality and safe reproducibility, compared to other systems used as a delivery vehicle. of drug, such as microsphere, nanoparticle, etc.
[010] Além disso, a fim de melhorar a eficiência de liberação intracelular de siRNA, a tecnologia de utilização de um conjugado de siRNA na qual o material hidrofílico que é um polímero biocompatível (por exemplo, polietileno glicol (PEG)) é conjugado com o siRNA por uma ligação covalente simples ou uma ligação covalente mediada por ligante, para dessa forma garantir a estabilidade de siRNA e ter permeabilidade da membrana celular eficaz, foi desenvolvida (ver Publicação de Patente Coreana No. 883471). No entanto, a modificação química do siRNA e a conjugação com o polietileno glicol (PEG) (PEGuilação) ainda tem desvantagens de que a estabilidade in vivo é lenta e a liberação em um órgão alvo não é suave. A fim de resolver as desvantagens, uma estrutura de oligo RNA de dupla hélice com um material hidrofílico e um material hidrofóbico são ligados para oligonucleotídeos, em particular, RNA de dupla hélice como siRNA, foi desenvolvida, em que a estrutura de oligo RNA de dupla hélice forma uma nanopartícula automontada chamada uma micela automontada inibitória RNA (SAMiRNA™) por uma interação hidrofóbica de um material hidrofóbico (ver Publicação de Patente Coreana No. 1224828), a tecnologia SAMiRNA™ tem uma vantagem em que nanopartículas homogêneas tendo um tamanho significativamente pequeno são capazes de serem obtidas em comparação com as tecnologias de liberação existentes.[010] Furthermore, in order to improve the intracellular delivery efficiency of siRNA, the technology of using an siRNA conjugate in which the hydrophilic material that is a biocompatible polymer (e.g., polyethylene glycol (PEG)) is conjugated with siRNA by a single covalent bond or a ligand-mediated covalent bond, to thereby ensure the stability of siRNA and have effective cell membrane permeability, has been developed (see Korean Patent Publication No. 883471). However, chemical modification of siRNA and conjugation with polyethylene glycol (PEG) (PEGylation) still has disadvantages that in vivo stability is slow and release into a target organ is not smooth. In order to solve the disadvantages, a double-stranded RNA oligo structure with a hydrophilic material and a hydrophobic material are linked to oligonucleotides, in particular, double-stranded RNA such as siRNA, was developed, in which the double-stranded RNA oligo structure helix forms a self-assembled nanoparticle called a self-assembled inhibitory RNA micelle (SAMiRNA™) by a hydrophobic interaction of a hydrophobic material (see Korean Patent Publication No. 1224828), SAMiRNA™ technology has an advantage in that homogeneous nanoparticles having a significantly small size are capable of being obtained in comparison with existing release technologies.
[011] Como um exemplo específico da tecnologia SAMiRNA™, PEG (polietileno glicol) é usado como um material hidrofílico, em que PEG é polímero sintético, que é usado para aumentar a solubilidade de produtos farmacêuticos, particularmente proteína, e para controlar a farmacocinética. PEG é um material polidisperso, um polímero em um lote é composto da soma do diferente número de monômeros, um peso molecular é mostrado na curva gaussiana, e valores de polidispersividade (Mw/Mn) expressam o grau de homogeneidade de um material. Ou seja, quando PEG tem um baixo peso molecular (3 a 5 kDa), o valor de polidisperso é cerca de 1,01, e quando PEG tem um alto peso molecular (20 kDa), o valor de polidisperso é cerca de 1,2, que é alto, assim como o peso molecular é maior, a homogeneidade do material é relativamente baixa (F. M. Veronese. Peptide and protein PEGylation: a review of problems and solutions. Biomaterials (2001) 22:405-417). Nesse sentido, quando o PEG é combinado com produtos farmacêuticos, a característica polidispersa da PEG é refletida sobre o conjugado, de forma que não é fácil realizar a verificação do material único, e, por conseguinte, produção de materiais tendo um valor polidisperso baixo através de síntese de PEG e melhoria de processos de purificação está sobre uma tendência crescente, mas ainda tem problemas devido à característica polidispersa do material, particularmente quando o PEG é combinado a um material tendo um peso molecular pequeno, é difícil confirmar se a combinação é facilmente realizada, etc. (Francesco M. Veronese and Gianfranco Pasut. PEGylation, successful approach to drug delivery. DRUG DISCOVERY TODAY (2005) 10(21):1451-1458).[011] As a specific example of SAMiRNA™ technology, PEG (polyethylene glycol) is used as a hydrophilic material, where PEG is a synthetic polymer, which is used to increase the solubility of pharmaceuticals, particularly protein, and to control pharmacokinetics . PEG is a polydisperse material, a polymer in a batch is composed of the sum of different numbers of monomers, a molecular weight is shown on the Gaussian curve, and polydispersity values (Mw/Mn) express the degree of homogeneity of a material. That is, when PEG has a low molecular weight (3 to 5 kDa), the polydisperse value is about 1.01, and when PEG has a high molecular weight (20 kDa), the polydisperse value is about 1. 2, which is high, as well as the molecular weight is higher, the homogeneity of the material is relatively low (F. M. Veronese. Peptide and protein PEGylation: a review of problems and solutions. Biomaterials (2001) 22:405-417). In this sense, when PEG is combined with pharmaceutical products, the polydisperse characteristic of PEG is reflected on the conjugate, so that it is not easy to perform single material verification, and therefore produce materials having a low polydispersity value through PEG synthesis and improvement of purification processes is on an increasing trend, but it still has problems due to the polydisperse characteristic of the material, particularly when PEG is combined with a material having a small molecular weight, it is difficult to confirm whether the combination is easily carried out, etc. (Francesco M. Veronese and Gianfranco Pasut. PEGylation, successful approach to drug delivery. DRUG DISCOVERY TODAY (2005) 10(21):1451-1458).
[012] Nesse sentido, recentemente, como uma tecnologia melhorada de SAMiRNA™, que são as nanopartículas automontadas existentes, uma tecnologia de uma nova forma de transportador tendo um tamanho significativamente pequeno em comparação com o SAMiRNA™ existente e polidispersividade notavelmente melhorada foi desenvolvida bloqueando o material hidrofílico da estrutura de RNA de dupla hélice configurando SAMiRNA™ como uma unidade de base incluindo 1 a 15 monômeros uniformes tendo um peso molecular predeterminado e um ligante conforme necessário, e usando o número apropriado de materiais hidrofílicos bloqueados conforme necessário.[012] In this regard, recently, as an improved technology of SAMiRNA™, which are existing self-assembled nanoparticles, a technology of a new form of carrier having a significantly small size compared to existing SAMiRNA™ and remarkably improved polydispersity has been developed by blocking the hydrophilic material of the double helix RNA structure by configuring SAMiRNA™ as a base unit including 1 to 15 uniform monomers having a predetermined molecular weight and a linker as needed, and using the appropriate number of blocked hydrophilic materials as needed.
[013] Entretanto, uma vez que biofármacos agem especificamente para uma sequência de gene alvo ou uma estrutura de proteína a fim de avaliar a eficácia e segurança em um modelo substituto não clínico, um material agindo com o mesmo mecanismo dos biofármacos correspondentes em humanos é adicionalmente necessário mesmo na espécie do modelo substituto. Portanto, para evitar a dificuldade em adicionalmente encontrar o material, incluindo o mesmo mecanismo de humano, um material agindo com o mesmo mecanismo tanto em humanos (alvo de tratamento) quanto em camundongo (o modelo substituto não clínico) é necessário para ser desenvolvido.[013] However, since biopharmaceuticals act specifically to a target gene sequence or protein structure in order to evaluate efficacy and safety in a non-clinical surrogate model, a material acting with the same mechanism as the corresponding biopharmaceuticals in humans is additionally necessary even in the species of the substitute model. Therefore, to avoid the difficulty in additionally finding the material including the same mechanism as in human, a material acting with the same mechanism in both human (treatment target) and mouse (the non-clinical surrogate model) is necessary to be developed.
[014] Fibrose Pulmonar Idiopática (doravante abreviada como IPF) é uma doença em que células inflamatórias crônicas penetram em uma parede de uma parede alveolar (alvéolo pulmonar) para tornar o pulmão duro, causando graves mudanças estruturais no tecido pulmonar, de forma que a função pulmonar é gradualmente reduzida para induzir a morte. No entanto, um tratamento eficaz da mesma não existe ainda, e a Fibrose Pulmonar Idiopática é geralmente diagnosticada quando os sintomas aparecem no final, e tem prognóstico extremamente ruim já que um tempo de sobrevida mediana é de apenas cerca de três a cinco anos. É relatado que a frequência de incidência em países estrangeiros é cerca de 3-5 pessoas por 100.000, e sabe-se que a incidência é geralmente alta depois dos 50 anos, e os homens têm uma incidência duas vezes maior do que as mulheres.[014] Idiopathic Pulmonary Fibrosis (hereinafter abbreviated as IPF) is a disease in which chronic inflammatory cells penetrate a wall of an alveolar wall (pulmonary alveolus) to make the lung hard, causing severe structural changes in the lung tissue, so that the Lung function is gradually reduced to induce death. However, an effective treatment for it does not yet exist, and Idiopathic Pulmonary Fibrosis is usually diagnosed when symptoms appear late, and has an extremely poor prognosis as a median survival time is only about three to five years. It is reported that the incidence frequency in foreign countries is about 3-5 people per 100,000, and it is known that the incidence is generally high after the age of 50, and men have an incidence twice as high as women.
[015] A causa da IPF não foi claramente identificada ainda, e é relatado apenas que essa alta frequência é mostrada em fumantes, antidepressivos, inalação pulmonar crônica devido ao refluxo gastroesofágico, pó de metal, pó de madeira, inalação de solvente, etc., esses são considerados como fatores de risco relacionados com a ocorrência de IPF. No entanto, fatores causais definitivos não podem ser encontrados na maioria dos pacientes.[015] The cause of IPF has not been clearly identified yet, and it is only reported that this high frequency is shown in smokers, antidepressants, chronic pulmonary inhalation due to gastroesophageal reflux, metal dust, wood dust, solvent inhalation, etc. , these are considered risk factors related to the occurrence of IPF. However, definitive causal factors cannot be found in most patients.
[016] Sabe-se que IPF é continuamente piorado sem tratamento, e cerca de 50% dos pacientes morrem dentro de 3-5 anos, e quando um pulmão é completamente endurecido por fibrose à medida que a doença progride, não há melhoria apesar de qualquer tratamento, e consequentemente, prevê-se que um tratamento precoce aumenta a eficácia. Como o agente terapêutico usado atualmente, um método de terapia de combinação usando esteroides e azatioprina ou ciclofosfamida é conhecido, mas é difícil dizer que existem efeitos especiais, e as tentativas de vários inibidores de fibrose em experimentos com animais e pequeno grupo de pacientes que falharam em provar efeitos claros. Em particular, não há nenhum tratamento eficaz em pacientes com IPF no estágio final, além do transplante de pulmão. Portanto, o desenvolvimento do agente terapêutico mais eficaz contra IPF é desesperadamente necessário.[016] It is known that IPF is continually worsened without treatment, and about 50% of patients die within 3-5 years, and when a lung is completely hardened by fibrosis as the disease progresses, there is no improvement despite any treatment, and consequently, early treatment is expected to increase efficacy. As the currently used therapeutic agent, a combination therapy method using steroids and azathioprine or cyclophosphamide is known, but it is difficult to say that there are special effects, and the attempts of various fibrosis inhibitors in animal experiments and small group of patients have failed in proving clear effects. In particular, there is no effective treatment in patients with end-stage IPF other than lung transplantation. Therefore, the development of the most effective therapeutic agent against IPF is desperately needed.
[017] Ent retanto, DPOC, uma das doenças de pulmão representantes juntamente com asma, é diferente da asma em que é acompanhada por obstrução irreversível das vias aéreas, e é uma doença respiratória que é acompanhada por uma resposta inflamatória anormal do pulmão causada por infecções repetidas, partículas nocivas, entrada de gás ou tabagismo, e é não é totalmente reversível, mas mostra limitação de fluxo de ar com progressão crescente (Pauwels et al, Am J Respir Crit Care Med, 163:12561276, 2001). DPOC é uma doença causada por alterações patológicas dos bronquíolos e parênquima pulmonar por inflamação de parênquima das vias aéreas e pulmão, e é caracterizada por bronquiolite obstrutiva e enfisema (destruição do parênquima pulmonar). Tipos de DPOC incluem bronquite obstrutiva crônica, bronquiolite crônica e enfisema. Em DPOC, o número de neutrófilos é aumentado, e secreção de citocinas como GM-CSF, TNF-α, IL-8, e MIP-2 é aumentada. Além disso, inflamação das vias aéreas, uma parede muscular espessada, e fechamento dos brônquios devido à secreção de muco aumentada também são mostrados. Quando o brônquio está fechado, alvéolos são expandidos e danificados, de forma que a capacidade de troca de oxigênio e dióxido de carbono é danificada para aumentar a insuficiência respiratória.[017] However, COPD, one of the representative lung diseases along with asthma, is different from asthma in that it is accompanied by irreversible airway obstruction, and is a respiratory disease that is accompanied by an abnormal inflammatory response of the lung caused by repeated infections, harmful particles, gas entry or smoking, and is not fully reversible, but shows airflow limitation with increasing progression (Pauwels et al, Am J Respir Crit Care Med, 163:12561276, 2001). COPD is a disease caused by pathological changes in the bronchioles and lung parenchyma due to inflammation of the airway and lung parenchyma, and is characterized by obstructive bronchiolitis and emphysema (destruction of the lung parenchyma). Types of COPD include chronic obstructive bronchitis, chronic bronchiolitis, and emphysema. In COPD, the number of neutrophils is increased, and secretion of cytokines such as GM-CSF, TNF-α, IL-8, and MIP-2 is increased. Additionally, inflammation of the airways, a thickened muscle wall, and closure of the bronchi due to increased mucus secretion are also shown. When the bronchus is closed, alveoli are expanded and damaged, so that the exchange capacity of oxygen and carbon dioxide is damaged to increase respiratory failure.
[018] A gravidade da DPOC está surgindo ao redor do mundo, uma vez que está previsto que DPOC está classificada como 6a em 1990 entre as causas de morte devido a doenças, mas irá ficar classificada em terceiro lugar em 2020, e é a única doença na qual a incidência é maior em 10 doenças. DPOC tem uma alta taxa de prevalência, causa um distúrbio respiratório, e requer uma grande quantidade de custos médicos diretos necessários para o diagnóstico e tratamento da DPOC, e uma quantidade significativa de despesas indiretas como perdas devido à dispneia e licença de ausência ou perda devido à morte prematura, que é um problema social e econômico no mundo (Chronic obstructive pulmonary disease (DPOC) treatment guidelines 2005. Chronic obstructive airway disease Clinical Research Center. p.30-31).[018] The severity of COPD is emerging around the world, as it is predicted that COPD was ranked 6th in 1990 among the causes of death due to diseases, but will be ranked third in 2020, and is the only disease in which the incidence is highest in 10 diseases. COPD has a high prevalence rate, causes a respiratory disorder, and requires a large amount of direct medical costs necessary for the diagnosis and treatment of COPD, and a significant amount of indirect expenses such as losses due to dyspnea and leave of absence or loss due to premature death, which is a social and economic problem worldwide (Chronic obstructive pulmonary disease (COPD) treatment guidelines 2005. Chronic obstructive airway disease Clinical Research Center. p.30-31).
[019] Drogas terapêuticas existentes não foram confirmadas para reduzir o alívio na função pulmonar em longo prazo, que é uma característica da DPOC. Por conseguinte, o tratamento com droga na DPOC tem um objetivo principal de reduzir os sintomas ou complicações. Entre as drogas terapêuticas, um broncodilatador é uma droga alopática de DPOC típica, e uma droga anti- inflamatória ou corticosteroide é geralmente prescrita, mas o efeito não é significativo, a faixa de aplicação é estreita, e há grande preocupação com efeitos colaterais. Como outras drogas, sabe-se que apenas a vacina influenza reduz sintomas graves e morte em cerca de 50% em pacientes com DPOC (chronic obstructive pulmonary disease (DPOC) treatment guidelines 2005. Chronic obstructive airway disease Clinical Research Center. p.52-58).[019] Existing therapeutic drugs have not been confirmed to reduce the long-term relief in lung function, which is a hallmark of COPD. Therefore, drug treatment in COPD has a primary objective of reducing symptoms or complications. Among therapeutic drugs, a bronchodilator is a typical allopathic COPD drug, and an anti-inflammatory drug or corticosteroid is generally prescribed, but the effect is not significant, the application range is narrow, and there is great concern about side effects. Like other drugs, only the influenza vaccine is known to reduce severe symptoms and death by around 50% in patients with COPD (chronic obstructive pulmonary disease (COPD) treatment guidelines 2005. Chronic obstructive airway disease Clinical Research Center. p.52- 58).
[020] Entretanto, muitos fatores genéticos são estimados como aumentando (ou diminuindo) o risco de DPOC individual. Um fator de risco genético que foi demonstrado até agora é uma deficiência genética de α1-antitripsina. O tabagismo significativamente aumenta o risco de DPOC, mas a ocorrência do enfisema panlobular e redução da função pulmonar que rapidamente progride em uma idade jovem são mostrados nos fumantes e não fumantes tendo deficiência genética significativa. Apesar de outros genes confirmados como relacionados com a patogênese da DPOC, não existe, no entanto, além de α1-antitripsina, tentativa para identificar biomarcadores da doença a serem utilizados para o diagnóstico através da investigação em estados anormais celulares, moleculares e genéticos que são basicamente mostrados em pacientes com DPOC ou tentativa para encontrar um novo método de tratamento está sendo progredida (P.J. Barnes and R.A. Stockely. DPOC: current therapeutic interventions and future approaches. EUR Respir J. (2005) 25:1084-1106). Em particular, a pesquisa sobre o diagnóstico de DPOC e seleção de alvo para tratamento através de métodos como microarranjo de gene, proteômica, etc., é ativamente conduzida, e análises de fatores genéticos para a obtenção da sensibilidade de COPS (susceptibilidade) e as causas da piora dos sintomas de DPOC induzidos pelo tabagismo foram principalmente realizados (Castaldi et al. The DPOC genetic association compendium. Human Molecular Genetics, 2010, Vol. 19, No. 3 526-534).[020] However, many genetic factors are estimated to increase (or decrease) an individual's risk of COPD. One genetic risk factor that has been demonstrated thus far is a genetic α1-antitrypsin deficiency. Smoking significantly increases the risk of COPD, but the occurrence of panlobular emphysema and reduced lung function that rapidly progresses at a young age are shown in both smokers and non-smokers to have significant genetic deficiency. Despite other genes confirmed to be related to the pathogenesis of COPD, there is, however, other than α1-antitrypsin, an attempt to identify biomarkers of the disease to be used for diagnosis through investigation into abnormal cellular, molecular and genetic states that are basically shown in patients with COPD or attempt to find a new treatment method is being progressed (P.J. Barnes and R.A. Stockely. COPD: current therapeutic interventions and future approaches. EUR Respir J. (2005) 25:1084-1106). In particular, research on COPD diagnosis and target selection for treatment through methods such as gene microarray, proteomics, etc., is actively conducted, and analyzes of genetic factors for obtaining COPS sensitivity (susceptibility) and the Causes of smoking-induced worsening of COPD symptoms have mainly been realized (Castaldi et al. The COPD genetic association compendium. Human Molecular Genetics, 2010, Vol. 19, No. 3 526-534).
[021] CTGF (fator de crescimento de tecido conjuntivo; CCN2), que é uma das proteínas matricelular incluídas na família CCN, é conhecido por ser uma citocina de secreção envolvida em vários processos biológicos, como adesão celular, migração, proliferação e angiogênese, reparação de ferida, etc. A superexpressão de CTGF é considerada como sendo a principal causa dos sintomas como esclerodermia, doenças fibróticas, e formação de cicatriz (Brigstock DR. Connective tissue growth factor (CCN2, CTGF) and organ fibrosis: lessons from transgenic animals. J Cell Commun Signal (2010) 4 (1): 1-4). Em particular, em relação à fibrose, CTGF é conhecido por causar fibrose sustentada em conjunto com TGF-β (Fator de crescimento de transformação-e) ou para promover a produção de ECM (matriz extracelular) sob uma condição na qual a formação das fibras é causada, e recentemente, é conhecido por ser capaz de tratar distúrbios oculares ou distrofia muscular causada pela expressão anormal de CTGF pelo tratamento de amostras ou materiais que impedem a expressão de CTGF ou inibem a ação do mesmo, mas relevância com uma doença respiratória não foi sugerida (Patente U.S. No. 7.622.454 e Publicação de Pedido de Patente U.S. No. 20120164151).[021] CTGF (connective tissue growth factor; CCN2), which is one of the matricellular proteins included in the CCN family, is known to be a secretory cytokine involved in various biological processes, such as cell adhesion, migration, proliferation and angiogenesis, wound repair, etc. Overexpression of CTGF is considered to be the main cause of symptoms such as scleroderma, fibrotic diseases, and scar formation (Brigstock DR. Connective tissue growth factor (CCN2, CTGF) and organ fibrosis: lessons from transgenic animals. J Cell Commun Signal ( 2010) 4 (1): 1-4). In particular, in relation to fibrosis, CTGF is known to cause sustained fibrosis in conjunction with TGF-β (Transforming growth factor-e) or to promote ECM (extracellular matrix) production under a condition in which the formation of fibers is caused by, and recently, is known to be able to treat ocular disorders or muscular dystrophy caused by abnormal expression of CTGF by treating samples or materials that prevent the expression of CTGF or inhibit the action of it, but relevance with a respiratory disease is not has been suggested (U.S. Patent No. 7,622,454 and U.S. Patent Application Publication No. 20120164151).
[022] CYR61 (indutor angiogênico rico em cisteína 61) é uma proteína de sinalização relacionada à matriz extracelular (ECM) incluída na família CCN, que é conhecida para controlar diversas atividades celulares como adesão celular, migração, proliferação, diferenciação, apoptose, etc. O CYR61 purificado promove a ligação e a disseminação de células endoteliais de uma maneira semelhante à fibronectina, e não tem atividade mitogênica, mas age para reforçar um efeito mitógeno de um fator de crescimento fibroblástico (MARIA L. KIREEVA et al. Cyr61, a Product of a Growth Factor-Inducible Immediate-Early Gene, Promotes Cell Proliferation, Migration, and Adhesion. MOLECULAR AND CELLULAR BIOLOGY, Apr. 1996, p. 1326-1334).[022] CYR61 (cysteine-rich angiogenic inducer 61) is an extracellular matrix (ECM)-related signaling protein included in the CCN family, which is known to control diverse cellular activities such as cell adhesion, migration, proliferation, differentiation, apoptosis, etc. . Purified CYR61 promotes endothelial cell binding and spreading in a manner similar to fibronectin, and has no mitogenic activity, but acts to reinforce a mitogenic effect of a fibroblast growth factor (MARIA L. KIREEVA et al. Cyr61, a Product of a Growth Factor-Inducible Immediate-Early Gene, Promotes Cell Proliferation, Migration, and Adhesion. MOLECULAR AND CELLULAR BIOLOGY, Apr. 1996, p.
[023] É relatado que Plekho1 (membro da família O de domínio de homologia de plecstrina 1) está presente em uma membrana plasmática ou núcleo, atua como um regulador não enzimático da proteína quinase CK2α1 (Caseína quinase 2, alfa 1), e está envolvido na apoptose através da inibição da ação de AP-1 através da parte C-terminal produzida quando sendo decomposta por Caspase 3 (Denis G. Bosc et al. Identification and Characterization of CKIP-1, a Novel Pleckstrin Homology Domaincontaining Protein That Interacts with Protein Kinase CK2. The Journal of Biological Chemistry(2000) 275, 14295-14306; Lingqiang Zhang et al. Role for the pleckstrin homology domain containing protein CKIP-1 in AP-1 regulation and apoptosis. The EMBO Journal (2005) 24, 766-778).[023] It is reported that Plekho1 (a member of the pleckstrin homology domain O family 1) is present in a plasma membrane or nucleus, acts as a non-enzymatic regulator of the protein kinase CK2α1 (Casein kinase 2, alpha 1), and is involved in apoptosis through the inhibition of AP-1 action through the C-terminal part produced when being broken down by Caspase 3 (Denis G. Bosc et al. Identification and Characterization of CKIP-1, a Novel Pleckstrin Homology Domaincontaining Protein That Interacts with Protein Kinase CK2. The Journal of Biological Chemistry (2000) 275, 14295-14306; Lingqiang Zhang et al. The EMBO Journal (2005) 24, 766-778).
[024] O pedido de patente US2008108583, intitulado Treatment or prevention of oto-pathologies by inhibition of pro-apoptotic genes refere-se a um ou mais inibidores, em particular siRNAs, que regulam negativamente a expressão de genes pró-apoptóticos humanos. A invenção também se refere a uma composição farmacêutica compreendendo o composto, ou um vetor capaz de expressar o composto, e um veículo farmaceuticamente aceitável. A presente invenção também contempla um método de tratamento ou prevenção da incidência da deficiência auditiva (ou prejuízo do equilíbrio), particularmente deficiência auditiva associada à morte celular das células ciliadas do ouvido interno ou das células ciliadas do ouvido externo, compreendendo administrar ao paciente a composição numa dose terapeuticamente eficaz.[024] Patent application US2008108583, entitled Treatment or prevention of oto-pathologies by inhibition of pro-apoptotic genes refers to one or more inhibitors, in particular siRNAs, which negatively regulate the expression of human pro-apoptotic genes. The invention also relates to a pharmaceutical composition comprising the compound, or a vector capable of expressing the compound, and a pharmaceutically acceptable carrier. The present invention also contemplates a method of treating or preventing the incidence of hearing impairment (or impairment of balance), particularly hearing impairment associated with cell death of inner ear hair cells or outer ear hair cells, comprising administering to the patient the composition at a therapeutically effective dose.
[025] A publicação WO2011119887, com o título RNA Interference in Dermal and Fibrotic Indications refere-se a construções de RNAi com melhores características de captação de tecidos e células e métodos de uso desses compostos em aplicações dérmicas e fibróticas. Nela é descrita a entrega eficiente in vivo de moléculas de sd-rxRNA à pele e o uso de tais moléculas para silenciar genes. Esta classe de moléculas de RNAi tem eficácia superior in vitro e in vivo do que as moléculas de RNAi descritas anteriormente. As moléculas associadas à invenção têm amplo potencial como terapêutica para distúrbios ou condições associadas a pele e fibrose comprometidas. Aspectos da invenção referem-se a ácidos ribonucleicos de fita dupla (dsRNAs), incluindo uma fita senso e uma fita anti-senso, em que a fita anti-senso é complementar a pelo menos 12 nucleotídeos contíguos de uma sequência selecionada das sequências relacionadas nesse documento, e em que o dsRNA é um sd-rxRNA.[025] Publication WO2011119887, entitled RNA Interference in Dermal and Fibrotic Indications refers to RNAi constructs with improved tissue and cell uptake characteristics and methods of using these compounds in dermal and fibrotic applications. It describes the efficient in vivo delivery of sd-rxRNA molecules to the skin and the use of such molecules to silence genes. This class of RNAi molecules has superior efficacy in vitro and in vivo than previously described RNAi molecules. The molecules associated with the invention have broad potential as therapeutics for disorders or conditions associated with compromised skin and fibrosis. Aspects of the invention relate to double-stranded ribonucleic acids (dsRNAs), including a sense strand and an antisense strand, wherein the antisense strand is complementary to at least 12 contiguous nucleotides of a sequence selected from the sequences listed therein. document, and in which the dsRNA is an sd-rxRNA.
[026] O pedido US2013096288, intitulado siRNA Conjugate and Preparation Method Thereof e seu equivalente da mesma família KR20100123214 revelam um conjugado siRNA-polímero e um método para a preparação do mesmo, e mais especificamente, a um conjugado híbrido formado pela ligação covalente do siRNA, e a um composto polimérico para melhorar a estabilidade in vivo do siRNA, e a um método de preparação do híbrido conjugado. O conjugado da invenção pode melhorar a estabilidade in vivo do siRNA, conseguindo assim uma entrega eficiente de siRNA terapêutico nas células e exibindo a atividade do siRNA mesmo com uma concentração relativamente baixa. Portanto, o conjugado pode vantajosamente ser usado não apenas como uma ferramenta de tratamento de siRNA para cânceres e outras doenças infecciosas, mas também como um novo tipo de sistema de entrega de siRNA.[026] Application US2013096288, entitled siRNA Conjugate and Preparation Method Thereof and its equivalent from the same family KR20100123214 disclose an siRNA-polymer conjugate and a method for preparing the same, and more specifically, a hybrid conjugate formed by the covalent bond of the siRNA , and a polymeric compound to improve the in vivo stability of siRNA, and a method for preparing the conjugated hybrid. The conjugate of the invention can improve the in vivo stability of siRNA, thereby achieving efficient delivery of therapeutic siRNA into cells and exhibiting siRNA activity even at a relatively low concentration. Therefore, the conjugate can advantageously be used not only as an siRNA treatment tool for cancers and other infectious diseases, but also as a new type of siRNA delivery system.
[027] O pedido US2008015114, intitulado siRNA Targeting Connective Tissue Growth Factor (CTGF) diz respeito ao silenciamento genético específico de sequência eficiente, possibilitado através do uso da tecnologia siRNA. Ao selecionar siRNAs específicos por design racional, pode-se maximizar a geração de um reagente eficaz de silenciamento de genes, bem como métodos para silenciar genes. Métodos, composições e kits gerados através do design racional de siRNAs são divulgados, incluindo aqueles direcionados ao CTGF.[027] Application US2008015114, entitled siRNA Targeting Connective Tissue Growth Factor (CTGF) concerns efficient sequence-specific gene silencing, made possible through the use of siRNA technology. By selecting specific siRNAs by rational design, one can maximize the generation of an effective gene silencing reagent as well as methods for silencing genes. Methods, compositions and kits generated through the rational design of siRNAs are disclosed, including those targeting CTGF.
[028] A patente CN101287835, intitulada siRNA-Hydrophilic Polymer Conjugates for Intracellular Delivery of siRNA and Method Thereof revela conjugados híbridos formados por ligação covalente de moléculas de siRNA (pequeno RNA interferente) a polímeros hidrofílicos para melhorar a estabilidade das moléculas de siRNA eficazes para terapia gênica in vivo e micelas complexas de polieletrólitos formadas por interações iônicas entre os conjugados e compostos catiônicos multifuncionais. Os conjugados de polímero siRNA-hidrofílico e as micelas do complexo polieletrólito delas derivadas podem ser vantajosamente usadas para melhorar a estabilidade das moléculas de siRNA in vivo. Consequentemente, a entrega de moléculas de siRNA para aplicações terapêuticas nas células pode ser facilitada, e o siRNA ainda está ativo, mesmo que uma dose reduzida do siRNA seja usada.[028] Patent CN101287835, entitled siRNA-Hydrophilic Polymer Conjugates for Intracellular Delivery of siRNA and Method Thereof discloses hybrid conjugates formed by covalently linking siRNA (small interfering RNA) molecules to hydrophilic polymers to improve the stability of siRNA molecules effective for in vivo gene therapy and complex polyelectrolyte micelles formed by ionic interactions between conjugates and multifunctional cationic compounds. Hydrophilic siRNA-polymer conjugates and polyelectrolyte complex micelles derived therefrom can be advantageously used to improve the stability of siRNA molecules in vivo. Consequently, the delivery of siRNA molecules for therapeutic applications into cells can be facilitated, and the siRNA is still active even if a reduced dose of the siRNA is used.
[029] A publicação WO2013089522, intitulada Novel Oligonucleotide Conjugates and Use Thereof, revela uma estrutura oligo-RNA de dupla hélice, na qual ligantes específicos de alvo estão ligados à estrutura oligo-RNA de dupla hélice, onde estão covalentemente ligados compostos de alto peso molecular, que podem ser vantajosamente utilizados no tratamento de doenças , especificamente, do câncer.. A presente invenção também fornece um método para preparar a estrutura de RNA e uma tecnologia de entrega de oligo-RNA de hélice dupla de alvo específico através da referida estrutura. Nanopartículas constituídas pela estrutura de oligo-RNA de hélice dupla à qual os ligantes estão ligados podem fornecer eficientemente oligo- RNA de hélice dupla a um alvo e, portanto, podem exibir uma atividade da estrutura de oligo-RNA de hélice dupla em uma célula-alvo, mesmo com uma administração de dupla hélice oligo- RNA de concentração relativamente baixa. As nanopartículas podem impedir a entrega de oligo-RNA de hélice dupla inespecífica a outros órgãos e células e, portanto, podem ser utilizadas de forma vantajosa não apenas como uma ferramenta para o oligo-RNA de hélice dupla para o tratamento de várias doenças, especificamente câncer, mas também como um novo tipo de sistema de entrega de oligo-RNA de dupla hélice. A presente invenção também se refere a conjugados híbridos nos quais um material hidrofílico e um material hidrofóbico estão conectados a ambas as extremidades do oligonucleotídeo antisense (ASO) através de uma ligação covalente, de modo a obter estabilidade in vivo do ASO, e a um método para preparar o híbrido conjugados, e nanopartículas constituídas pelos conjugados. Os conjugados da invenção podem melhorar a estabilidade in vivo de ASO e, portanto, podem fornecer ASO eficientemente para tratamento.[029] Publication WO2013089522, entitled Novel Oligonucleotide Conjugates and Use Thereof, discloses a double-stranded oligo-RNA structure, in which target-specific ligands are linked to the double-stranded oligo-RNA structure, where high-weight compounds are covalently linked molecular, which can be advantageously used in the treatment of diseases, specifically, cancer. The present invention also provides a method for preparing the RNA structure and a technology for delivering target-specific double-stranded RNA oligo-RNA through said structure. . Nanoparticles constituted by the double-stranded oligo-RNA structure to which ligands are attached can efficiently deliver double-stranded oligo-RNA to a target and therefore can exhibit an activity of the double-stranded oligo-RNA structure in a cell. target, even with administration of relatively low concentration double-stranded oligo-RNA. Nanoparticles can prevent the delivery of nonspecific double-stranded oligo-RNA to other organs and cells, and therefore can be advantageously used not only as a tool for double-stranded oligo-RNA for the treatment of various diseases, specifically cancer, but also as a new type of double-stranded oligo-RNA delivery system. The present invention also relates to hybrid conjugates in which a hydrophilic material and a hydrophobic material are connected to both ends of the antisense oligonucleotide (ASO) through a covalent bond, so as to obtain in vivo stability of the ASO, and to a method to prepare the hybrid conjugates, and nanoparticles made up of the conjugates. The conjugates of the invention can improve the in vivo stability of ASO and therefore can efficiently deliver ASO for treatment.
[030] O artigo Chemical Modification and Clinical Application of siRNA, de Sun Liping et al., (Chemistry of Life 25 (4): Pages 339 - 342), discute a modificação química apropriada para pemitir a aplicação do siRNA in vivo. Vários métodos de modificação química comumente usados incluem modificação do esqueleto fosfato, modificação da ribose e modificação da base. É discutida a tecnolgia da transformação de in vitro para in vivo, possibilitando as aplicações clínicas no tratamento de doenças virais, tumores e genéticas.[030] The article Chemical Modification and Clinical Application of siRNA, by Sun Liping et al., (Chemistry of Life 25 (4): Pages 339 - 342), discusses the appropriate chemical modification to allow the application of siRNA in vivo. Several commonly used chemical modification methods include phosphate backbone modification, ribose modification, and base modification. The technology of transformation from in vitro to in vivo is discussed, enabling clinical applications in the treatment of viral, tumor and genetic diseases.
[031] O artigo Effects of CTGF gene silencing on the proliferation and myofibroblast differentiation of human lung fibroblasts, de Liu Xiaojing, (Sheng Wu Yi Xue Gong Cheng Xue Za Zhi 25 (2): 407 — 412), apresenta um plasmídeo que expressa o RNA de pequena interferência do CTGF (siRNA) (CTGF-siRNA) que foi construído e transfectado de maneira estável na linha celular de fibroblastos do pulmão humano, MRC-5. Clones estáveis com silenciamento do gene CTGF (CTGF-siRNA / MRC-5) foram estabelecidos com sucesso pelo rastreamento G418 e confirmados ainda por PCR quantitativo em tempo real e Western blot. A proliferação celular foi investigada por análise da curva de crescimento, e o tempo de duplicação celular das células CTGF- siRNA / MRC-5 foi marcadamente maior que o das células controle (P <0,05). Comparado com as células de controle, a expressão da actina do músculo alfa-liso (alfa-SMA), o marcador da diferenciação dos miofibroblastos, diminuiu nas células CTGF- siRNA / MRC-5. Além disso, a deposição de proteínas da matriz extracelular (ECM) (como colágeno tipo I e fibronectina) em células CTGF-siRNA / MRC-5 também foi diminuída. Os dados resultantes sugerem que o CTGF pode desempenhar um papel importante na diferenciação de fibroblasto pulmonar em miofibroblasto, e que o siRNA direcionado ao gene CTGF pode fornecer uma nova estratégia para a terapia gênica da fibrose pulmonar.[031] The article Effects of CTGF gene silencing on the proliferation and myofibroblast differentiation of human lung fibroblasts, by Liu Xiaojing, (Sheng Wu Yi Xue Gong Cheng Xue Za Zhi 25 (2): 407 — 412), presents a plasmid that expresses the CTGF small interfering RNA (siRNA) (CTGF-siRNA) that was constructed and stably transfected into the human lung fibroblast cell line, MRC-5. Stable clones with CTGF gene silencing (CTGF-siRNA/MRC-5) were successfully established by G418 screening and further confirmed by real-time quantitative PCR and Western blot. Cell proliferation was investigated by growth curve analysis, and the cell doubling time of CTGF-siRNA/MRC-5 cells was markedly longer than that of control cells (P < 0.05). Compared with control cells, the expression of alpha-smooth muscle actin (alpha-SMA), the marker of myofibroblast differentiation, was decreased in CTGF-siRNA/MRC-5 cells. Furthermore, the deposition of extracellular matrix (ECM) proteins (such as type I collagen and fibronectin) in CTGF-siRNA/MRC-5 cells was also decreased. The resulting data suggest that CTGF may play an important role in the differentiation of lung fibroblast into myofibroblast, and that siRNA targeting the CTGF gene may provide a new strategy for gene therapy of pulmonary fibrosis.
[032] Como descrito acima, a prevalência das doenças respiratórias, particularmente, fibrose pulmonar idiopática e DPOC aumentou, mas agentes terapêuticos sendo capazes de basicamente prevenir e tratar a fibrose pulmonar idiopática e DPOC ainda não existe. Portanto, a demanda para o agente terapêutico para a fibrose pulmonar idiopática e DPOC mostrando alto nível de prevenção e efeitos do tratamento sem efeitos colaterais é significativamente amplamente presente no mercado.[032] As described above, the prevalence of respiratory diseases, particularly idiopathic pulmonary fibrosis and COPD has increased, but therapeutic agents being able to basically prevent and treat idiopathic pulmonary fibrosis and COPD do not yet exist. Therefore, the demand for the therapeutic agent for idiopathic pulmonary fibrosis and COPD showing high level of prevention and treatment effects without side effects is significantly widely present in the market.
[033] Um objetivo da presente invenção é fornecer um novo siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1 (doravante, referido como um siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1), capaz de inibir a expressão dos mesmos em uma eficiência significativamente alta, uma estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo o siRNA, e um método para produzir a estrutura de oligo RNA de dupla hélice.[033] An object of the present invention is to provide a new siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1 (hereinafter referred to as an siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1), capable of inhibiting their expression at a significantly high efficiency, a double-stranded RNA oligo structure containing the siRNA, and a method for producing the double-stranded RNA oligo structure.
[034] Outro objetivo da presente invenção é fornecer uma composição farmacêutica incluindo o siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1 ou a estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo o siRNA como um componente eficaz, para a prevenção ou tratamento de doenças respiratórias, particularmente, fibrose pulmonar idiopática e DPOC.[034] Another object of the present invention is to provide a pharmaceutical composition including the siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1 or the double-stranded RNA oligo structure containing the siRNA as an effective component, for the prevention or treatment of respiratory diseases, particularly , idiopathic pulmonary fibrosis and COPD.
[035] Outro objetivo da presente invenção é fornecer um método para prevenir ou tratar doenças respiratórias, particularmente, fibrose pulmonar idiopática e DPOC usando o siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1 ou a estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo o siRNA.[035] Another object of the present invention is to provide a method for preventing or treating respiratory diseases, particularly idiopathic pulmonary fibrosis and COPD using siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1 or the double-stranded RNA oligo structure containing the siRNA.
[036] A FIG. 1 é um diagrama esquemático de uma nanopartícula formada de uma estrutura de polímero oligo de dupla hélice de acordo com a presente invenção.[036] FIG. 1 is a schematic diagram of a nanoparticle formed from a double helix oligo polymer structure in accordance with the present invention.
[037] A FIG. 2 é um gráfico mostrando uma quantidade de inibição da expressão do gene alvo, confirmada após a transformação de uma linhagem de célula de fibroblasto humano com siRNA tendo sequência de ID SEQ NOs: 1 a 10, 101 a 110, e 201 a 210 como uma fita senso de acordo com a presente invenção.[037] FIG. 2 is a graph showing an amount of inhibition of target gene expression confirmed after transformation of a human fibroblast cell line with siRNA having sequence ID SEQ NOs: 1 to 10, 101 to 110, and 201 to 210 as an sense tape according to the present invention.
[038] A: Gráfico mostrando a quantidade de expressão de CTGF para tratamento de 5 ou 20 nM de siRNA tendo sequência de ID SEQ NOs: 1 a 10 como uma fita senso.[038] A: Graph showing the amount of CTGF expression for treatment with 5 or 20 nM siRNA having sequence ID SEQ NOs: 1 to 10 as a sense strand.
[039] B: Gráfico mostrando a quantidade de expressão de Cyr61 para tratamento de 5 ou 20 nM de siRNA tendo sequência de ID SEQ NOs: 101 a 110 como uma fita senso.[039] B: Graph showing the amount of Cyr61 expression for treatment with 5 or 20 nM siRNA having sequence ID SEQ NOs: 101 to 110 as a sense strand.
[040] C: Gráfico mostrando a quantidade de expressão de Plekho1 para tratamento de 5 ou 20 nM de siRNA tendo sequência de ID SEQ NOs: 201 a 210 como uma fita senso.[040] C: Graph showing the amount of Plekho1 expression for treatment with 5 or 20 nM siRNA having sequence ID SEQ NOs: 201 to 210 as a sense strand.
[041] A FIG. 3 é um gráfico mostrando uma quantidade de inibição da expressão do gene alvo, confirmada após a transformação de uma célula de linhagem de fibroblasto humano com siRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 1, 3, 4, 8, 9, 10, 102, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 204, 206, 207, 208, 209 ou 210 como a fita senso de acordo com a presente invenção.[041] FIG. 3 is a graph showing an amount of inhibition of target gene expression confirmed after transformation of a human fibroblast lineage cell with siRNA having sequence ID SEQ NO: 1, 3, 4, 8, 9, 10, 102, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 204, 206, 207, 208, 209 or 210 as the sense tape according to the present invention.
[042] A: Gráfico mostrando a quantidade de expressão de CTGF de acordo com tratamento de 0,2 ou 1 nM de siRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 1, 3, 4, 8, 9 ou 10 como uma fita senso.[042] A: Graph showing the amount of CTGF expression according to treatment of 0.2 or 1 nM siRNA having sequence ID SEQ NO: 1, 3, 4, 8, 9 or 10 as a sense strand.
[043] B: Gráfico mostrando a quantidade de expressão de Cyr61 de acordo com tratamento de 0,2 ou 1 nM de siRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 102, 104, 105, 106, 107, 108 ou 109 como uma fita senso.[043] B: Graph showing the amount of Cyr61 expression according to treatment of 0.2 or 1 nM siRNA having sequence ID SEQ NO: 102, 104, 105, 106, 107, 108 or 109 as a sense strand .
[044] C: Gráfico mostrando a quantidade de expressão de Plekho1 de acordo com tratamento de 0,2 ou 1 nM de siRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 204, 206, 207, 208, 209, ou 210 como uma fita senso.[044] C: Graph showing the amount of Plekho1 expression according to treatment of 0.2 or 1 nM siRNA having sequence ID SEQ NO: 204, 206, 207, 208, 209, or 210 as a sense strand.
[045] A FIG. 4 é um gráfico mostrando uma quantidade de inibição da expressão do gene alvo, confirmada após a transformação de uma linhagem de célula de câncer de pulmão humano com siRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 35, 42, 59, 602, 603, 604, 124, 153, 166, 187, 197, 212, 218, 221 ou 223 como uma fita senso de acordo com a presente invenção.[045] FIG. 4 is a graph showing an amount of inhibition of target gene expression confirmed after transformation of a human lung cancer cell line with siRNA having sequence ID SEQ NO: 35, 42, 59, 602, 603, 604, 124, 153, 166, 187, 197, 212, 218, 221 or 223 as a sense tape according to the present invention.
[046] A: Gráfico mostrando a quantidade de expressão de CTGF de acordo com tratamento de 0,04, 0,2 ou 1 nM de siRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 35, 42, 59, 602, 603 ou 604 como uma fita senso.[046] A: Graph showing the amount of CTGF expression according to treatment of 0.04, 0.2 or 1 nM siRNA having sequence ID SEQ NO: 35, 42, 59, 602, 603 or 604 as a sense tape.
[047] B: Gráfico mostrando a quantidade de expressão de Cyr61 de acordo com tratamento de 0,5, 1 ou 5 nM de siRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 124, 153, 166, 187 ou 197 como uma fita senso.[047] B: Graph showing the amount of Cyr61 expression according to treatment of 0.5, 1 or 5 nM siRNA having sequence ID SEQ NO: 124, 153, 166, 187 or 197 as a sense strand.
[048] C: Gráfico mostrando a quantidade de expressão de Plekho1 de acordo com tratamento de 0,5, 1 ou 5 nM de siRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 212, 218, 221 ou 223 como uma fita senso.[048] C: Graph showing the amount of Plekho1 expression according to treatment with 0.5, 1 or 5 nM siRNA having sequence ID SEQ NO: 212, 218, 221 or 223 as a sense strand.
[049] A FIG. 5 é um gráfico mostrando uma quantidade de inibição da expressão do gene alvo, confirmada após a transformação de uma linhagem de célula de câncer de pulmão humano com SAMiRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 42, 59, ou 602 como uma fita senso de acordo com a presente invenção.[049] FIG. 5 is a graph showing an amount of inhibition of target gene expression confirmed after transformation of a human lung cancer cell line with SAMiRNA having sequence SEQ ID NO: 42, 59, or 602 as a sense strand accordingly. with the present invention.
[050] A FIG. 6 é um gráfico mostrando uma quantidade de inibição da expressão do gene alvo, confirmada após a transformação de uma linhagem de célula de fibroblasto de camundongo com siRNA tendo sequência de ID SEQ NOs: 301 a 330, 401 a 430, 501 a 530 como uma fita senso de acordo com a presente invenção.[050] FIG. 6 is a graph showing an amount of inhibition of target gene expression confirmed after transformation of a mouse fibroblast cell line with siRNA having sequence ID SEQ NOs: 301 to 330, 401 to 430, 501 to 530 as a sense tape according to the present invention.
[051] A: Gráfico mostrando a quantidade de expressão de CTGF de acordo com tratamento de 20 nM de siRNA tendo sequência de ID SEQ NOs: 301 a 330 como uma fita senso.[051] A: Graph showing the amount of CTGF expression according to 20 nM siRNA treatment having sequence ID SEQ NOs: 301 to 330 as a sense strand.
[052] B: Gráfico mostrando a quantidade de expressão de Cyr61 de acordo com tratamento de 20 nM de siRNA tendo sequência de ID SEQ NOs: 401 a 430 como uma fita senso.[052] B: Graph showing the amount of Cyr61 expression according to 20 nM siRNA treatment having sequence ID SEQ NOs: 401 to 430 as a sense strand.
[053] C: Gráfico mostrando a quantidade de expressão de Plekho1 de acordo com tratamento de 20 nM de siRNA tendo sequência de ID SEQ NOs: 501 a 530 como uma fita senso.[053] C: Graph showing the amount of Plekho1 expression according to treatment with 20 nM siRNA having sequence ID SEQ NOs: 501 to 530 as a sense strand.
[054] A FIG. 7 é um gráfico mostrando uma quantidade de inibição da expressão do gene alvo, confirmada após a transformação de uma linhagem de célula de fibroblasto de camundongo com siRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 404 a 406, 408 a 410, 414 a 418, 420 a 422, 424, 427, 429, 430, 503 a 509, 514 a 517, 519, 521 a 526 ou 528 como uma fita senso de acordo com a presente invenção.[054] FIG. 7 is a graph showing an amount of inhibition of target gene expression confirmed after transformation of a mouse fibroblast cell line with siRNA having sequence ID SEQ NO: 404 to 406, 408 to 410, 414 to 418, 420 to 422, 424, 427, 429, 430, 503 to 509, 514 to 517, 519, 521 to 526 or 528 as a sense tape according to the present invention.
[055] A: Gráfico mostrando a quantidade de expressão de Cyr61 de acordo com tratamento de 5 nM de siRNA tendo sequência de ID SEQ NOs: 404 a 406, 408 a 410, 414 a 418, 420 a 422, 424, 427, 429, ou 430 como uma fita senso.[055] A: Graph showing the amount of Cyr61 expression according to 5 nM siRNA treatment having sequence ID SEQ NOs: 404 to 406, 408 to 410, 414 to 418, 420 to 422, 424, 427, 429 , or 430 as a sense tape.
[056] B: Gráfico mostrando a quantidade de expressão de Plekho1 de acordo com tratamento de 5 nM de siRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 503 a 509, 514 a 517, 519, 521 a 526 ou 528 como uma fita senso.[056] B: Graph showing the amount of Plekho1 expression according to treatment of 5 nM siRNA having sequence ID SEQ NO: 503 to 509, 514 to 517, 519, 521 to 526 or 528 as a sense strand.
[057] A FIG. 8 é um gráfico mostrando uma quantidade de inibição da expressão do gene alvo, confirmada após a transformação de uma linhagem de célula de fibroblasto de camundongo com siRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 301, 303, 307, 323, 410, 422, 424, 507, 515 ou 525 como uma fita senso de acordo com a presente invenção.[057] FIG. 8 is a graph showing an amount of inhibition of target gene expression confirmed after transformation of a mouse fibroblast cell line with siRNA having sequence SEQ ID NO: 301, 303, 307, 323, 410, 422, 424 , 507, 515 or 525 as a sense tape according to the present invention.
[058] A: Gráfico mostrando a quantidade de expressão de CTGF de acordo com tratamento de 0,2, 1 ou 5 nM de siRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 301, 303, 307 ou 323 como uma fita senso.[058] A: Graph showing the amount of CTGF expression according to treatment of 0.2, 1 or 5 nM siRNA having sequence ID SEQ NO: 301, 303, 307 or 323 as a sense strand.
[059] B: Gráfico mostrando a quantidade de expressão de Cyr61 de acordo com tratamento de 0,2, 1 ou 5 nM de siRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 410, 422 ou 424 como uma fita senso.[059] B: Graph showing the amount of Cyr61 expression according to treatment of 0.2, 1 or 5 nM siRNA having sequence ID SEQ NO: 410, 422 or 424 as a sense strand.
[060] C: Gráfico mostrando a quantidade de expressão de Plekho1 de acordo com tratamento de 0,2, 1 ou 5 nM de siRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 507, 515 ou 525 como uma fita senso.[060] C: Graph showing the amount of Plekho1 expression according to treatment of 0.2, 1 or 5 nM siRNA having sequence ID SEQ NO: 507, 515 or 525 as a sense strand.
[061] A FIG. 9 é um gráfico mostrando uma quantidade de inibição da expressão do gene alvo, confirmada após a transformação de uma linhagem de célula de fibroblasto de camundongo com siRNA tendo uma ID SEQ NO: 4, 5, 6, 8, 9, 102, 104, 105, 107, 108, 109, 202, 204, 206 to 209, 307, 424 ou 525 como a fita senso de acordo com a presente invenção.[061] FIG. 9 is a graph showing an amount of inhibition of target gene expression confirmed after transforming a mouse fibroblast cell line with siRNA having a SEQ ID NO: 4, 5, 6, 8, 9, 102, 104, 105, 107, 108, 109, 202, 204, 206 to 209, 307, 424 or 525 as the sense tape according to the present invention.
[062] A: Gráfico mostrando a quantidade de expressão de CTGF de acordo com tratamento de 5 nM de siRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 4, 5, 6, 8, 9 ou 307 como uma fita senso.[062] A: Graph showing the amount of CTGF expression according to treatment of 5 nM siRNA having sequence ID SEQ NO: 4, 5, 6, 8, 9 or 307 as a sense strand.
[063] B: Gráfico mostrando a quantidade de expressão de Cyr61 de acordo com tratamento de 5 nM de siRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 102, 104, 105, 107, 108, 109 ou 424 como uma fita senso.[063] B: Graph showing the amount of Cyr61 expression according to 5 nM siRNA treatment having sequence ID SEQ NO: 102, 104, 105, 107, 108, 109 or 424 as a sense strand.
[064] C: Gráfico mostrando a quantidade de expressão de Plekho1 de acordo com tratamento de 5 nM de siRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 202, 204, 206 to 209 ou 525 como uma fita senso.[064] C: Graph showing the amount of Plekho1 expression according to treatment of 5 nM siRNA having sequence ID SEQ NO: 202, 204, 206 to 209 or 525 as a sense strand.
[065] A FIG. 10 é um gráfico mostrando uma quantidade de inibição da expressão do gene alvo, confirmada após a transformação de uma linhagem de célula de fibroblasto de camundongo com siRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 6, 8, 102, 104, 105, 204, 207, 208, 307, 424 ou 525 como a fita senso de acordo com a presente invenção.[065] FIG. 10 is a graph showing an amount of inhibition of target gene expression confirmed after transformation of a mouse fibroblast cell line with siRNA having sequence ID SEQ NO: 6, 8, 102, 104, 105, 204, 207 , 208, 307, 424 or 525 as the sense tape according to the present invention.
[066] A: Gráfico mostrando a quantidade de expressão de CTGF de acordo com tratamento de 5 ou 20 nM de siRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 6, 8 ou 307 como uma fita senso.[066] A: Graph showing the amount of CTGF expression according to treatment with 5 or 20 nM siRNA having sequence ID SEQ NO: 6, 8 or 307 as a sense strand.
[067] B: Gráfico mostrando a quantidade de expressão de Cyr61 de acordo com tratamento de 5 ou 20 nM de siRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 102, 104, 105 ou 424 como uma fita senso.[067] B: Graph showing the amount of Cyr61 expression according to treatment with 5 or 20 nM siRNA having sequence ID SEQ NO: 102, 104, 105 or 424 as a sense strand.
[068] C: Gráfico mostrando a quantidade de expressão de Plekho1 de acordo com tratamento de 5 ou 20 nM de siRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 204, 207, 208 ou 525 como uma fita senso.[068] C: Graph showing the amount of Plekho1 expression according to treatment with 5 or 20 nM siRNA having sequence ID SEQ NO: 204, 207, 208 or 525 as a sense strand.
[069] Para alcançar os objetivos anteriores, a presente invenção fornece um siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1 (gene relacionado às doenças respiratórias) que consiste em primeiro oligonucleotídeo que é uma fita senso incluindo qualquer uma sequência selecionada do grupo que consiste em ID SEQ NOs: 1 a 600 e 602 a 604 e um segundo oligonucleotídeo que é uma fita antissenso incluindo uma sequência complementar para a mesma.[069] To achieve the above objectives, the present invention provides an siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1 (gene related to respiratory diseases) consisting of the first oligonucleotide which is a sense strand including any sequence selected from the group consisting of ID SEQ NOs: 1 to 600 and 602 to 604 and a second oligonucleotide which is an antisense strand including a complementary sequence thereto.
[070] O siRNA na presente invenção inclui todos os materiais tendo uma ação geral de RNAi (RNA de interferência), e por conseguinte, é óbvio para um especialista na técnica que siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1 inclui shRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1, etc.[070] The siRNA in the present invention includes all materials having a general RNAi action (RNA interference), and therefore, it is obvious to one skilled in the art that siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1 includes shRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1, etc.
[071] ID SEQ NOs: 1 a 100, ou 602 a 604 são sequências de fita senso de siRNA específico para CTGF (Homo sapiens), ID SEQ NOs: 101 a 200 são sequências de fita senso de siRNA específico para Cyr61 (Homo sapiens), ID SEQ NOs: 201 a 300 são sequências de fita senso de siRNA específico para Plekho1 (Homo sapiens), ID SEQ NOs: 301 a 400 são sequências de fita senso de siRNA específico para CTGF (Mus musculus), ID SEQ NOs: 401 a 500 são sequências de fita senso de siRNA específico para Cyr61 (Mus musculus), e ID SEQ NOs: 501 a 600 são sequências de fita senso de siRNA específico para Plekho1 (Mus musculus).[071] SEQ ID NOs: 1 to 100, or 602 to 604 are siRNA sense strand sequences specific for CTGF (Homo sapiens), SEQ ID NOs: 101 to 200 are siRNA sense strand sequences specific to Cyr61 (Homo sapiens ), SEQ ID NOs: 201 to 300 are siRNA sense strand sequences specific for Plekho1 (Homo sapiens), SEQ ID NOs: 301 to 400 are siRNA sense strand sequences specific to CTGF (Mus musculus), SEQ ID NOs: 401 to 500 are siRNA sense strand sequences specific for Cyr61 (Mus musculus), and SEQ ID NOs: 501 to 600 are siRNA sense strand sequences specific to Plekho1 (Mus musculus).
[072] O siRNA de acordo com a presente invenção é preferencialmente siRNA específico para CTGF incluindo qualquer uma sequência selecionada do grupo que consiste em ID SEQ NOs: 1 a 10, 35, 42, 59, 602, 603, 604, 301 a 303, 305 a 307, 309, 317, 323 e 329, como uma fita senso,[072] The siRNA according to the present invention is preferably siRNA specific for CTGF including any sequence selected from the group consisting of ID SEQ NOs: 1 to 10, 35, 42, 59, 602, 603, 604, 301 to 303 , 305 to 307, 309, 317, 323 and 329, like a sense tape,
[073] siRNA específico para Cyr61 incluindo qualquer uma sequência selecionada do grupo que consiste em ID SEQ NOs: 101 a 110, 124, 153, 166, 187, 197, 409, 410, 415, 417, 418, 420, 422, 424, 427 e 429, como uma fita senso, ou[073] Cyr61-specific siRNA including any sequence selected from the group consisting of ID SEQ NOs: 101 to 110, 124, 153, 166, 187, 197, 409, 410, 415, 417, 418, 420, 422, 424 , 427 and 429, like a sense tape, or
[074] siRNA específico para Plekho1 incluindo qualquer uma sequência selecionada do grupo que consiste em ID SEQ NOs: 201 a 210, 212, 218, 221, 223, 504 a 507, 514, 515 e 522 a 525, como uma fita senso.[074] siRNA specific for Plekho1 including any sequence selected from the group consisting of ID SEQ NOs: 201 to 210, 212, 218, 221, 223, 504 to 507, 514, 515 and 522 to 525, as a sense strand.
[075] Mais preferencialmente, o siRNA de acordo com a presente invenção é siRNA específico para CTGF incluindo qualquer uma sequência selecionada do grupo que consiste em ID SEQ NOs: 4, 5, 8, 9, 35, 42, 59, 601, 602, 604, 301, 303, 307 e 323, como uma fita senso,[075] More preferably, the siRNA according to the present invention is CTGF-specific siRNA including any sequence selected from the group consisting of ID SEQ NOs: 4, 5, 8, 9, 35, 42, 59, 601, 602 , 604, 301, 303, 307 and 323, like a sense tape,
[076] siRNA específico para Cyr61 incluindo qualquer uma sequência selecionada do grupo que consiste em ID SEQ NOs: 102, 104, 107, 108, 124, 153, 166, 187, 197, 410, 422 e 424, como uma fita senso, ou[076] siRNA specific for Cyr61 including any sequence selected from the group consisting of ID SEQ NOs: 102, 104, 107, 108, 124, 153, 166, 187, 197, 410, 422 and 424, as a sense strand, or
[077] siRNA específico para Plekho1 incluindo qualquer uma sequência selecionada do grupo que consiste em ID SEQ NOs: 206 a 209, 212, 218, 221, 223, 507, 515 e 525, como uma fita senso.[077] siRNA specific for Plekho1 including any sequence selected from the group consisting of ID SEQ NOs: 206 to 209, 212, 218, 221, 223, 507, 515 and 525, as a sense strand.
[078] Mais preferencialmente, o siRNA de acordo com a presente invenção é siRNA específico para CTGF incluindo qualquer uma sequência selecionada do grupo que consiste em ID SEQ NO: 42, 59, 602 e 323, como uma fita senso,[078] More preferably, the siRNA according to the present invention is CTGF-specific siRNA including any sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 42, 59, 602 and 323, as a sense strand,
[079] siRNA específico para Cyr61 incluindo qualquer uma sequência selecionada do grupo que consiste em ID SEQ NO: 124, 153, 187, 197 e 424, como uma fita senso, ou siRNA específico para Plekho1 incluindo qualquer uma sequência selecionada do grupo que consiste em ID SEQ NO: 212, 218, 221, 223 e 525, como uma fita senso.[079] siRNA specific for Cyr61 including any sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 124, 153, 187, 197 and 424, such as a sense strand, or siRNA specific for Plekho1 including any sequence selected from the group consisting in ID SEQ NO: 212, 218, 221, 223 and 525, as a sense tape.
[080] Em particular, foi confirmado que alguns dos siRNA específicos para CTGF, Cyr61 ou Plekho1 humanos de acordo com a presente invenção são capazes de simultaneamente inibir a expressão de CTGF, Cyr61 ou Plekho1 de camundongo.[080] In particular, it was confirmed that some of the siRNA specific for human CTGF, Cyr61 or Plekho1 according to the present invention are capable of simultaneously inhibiting the expression of mouse CTGF, Cyr61 or Plekho1.
[081] O siRNA capaz de simultaneamente inibir a expressão de CTGF, Cyr61 ou Plekho1 de humano e camundongo preferencialmente inclui uma fita senso de siRNA específico para CTGF de acordo com ID SEQ NO: 6 ou 8, uma fita senso de siRNA específico para Cyr61 de acordo com ID SEQ NO: 102, 104 ou 105, ou uma fita senso de siRNA específico para Plekho1 de acordo com ID SEQ NO: 204, 207 ou 208.[081] The siRNA capable of simultaneously inhibiting the expression of human and mouse CTGF, Cyr61 or Plekho1 preferably includes a sense strand of siRNA specific for CTGF according to SEQ ID NO: 6 or 8, a sense strand of siRNA specific for Cyr61 according to SEQ ID NO: 102, 104 or 105, or a sense strand of Plekho1-specific siRNA according to SEQ ID NO: 204, 207 or 208.
[082] Mais preferencialmente, o siRNA inclui uma fita senso de siRNA específico para CTGF de acordo com ID SEQ NO: 6, uma fita senso de siRNA específico para Cyr61 de acordo com ID SEQ NO: 102, ou uma fita senso de siRNA específico para Plekho1 de acordo com ID SEQ NO: 207.[082] More preferably, the siRNA includes a CTGF-specific siRNA sense strand according to SEQ ID NO: 6, a Cyr61-specific siRNA sense strand according to SEQ ID NO: 102, or a specific siRNA sense strand for Plekho1 according to SEQ ID NO: 207.
[083] A fita senso ou a fita antissenso do siRNA de acordo com a presente invenção preferencialmente tem de 19 a 31 nucleotídeos, e o siRNA inclui uma fita senso incluindo qualquer uma sequência selecionada de ID SEQ NOs: 1 a 604 e uma fita antissenso complementar à mesma.[083] The sense strand or antisense strand of the siRNA according to the present invention preferably has 19 to 31 nucleotides, and the siRNA includes a sense strand including any sequence selected from SEQ ID NOs: 1 to 604 and an antisense strand complementary to it.
[084] Uma vez que o siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1 de acordo com a presente invenção tem uma sequência de base projetada para ser capaz de ser complementarmente ligada ao mRNA que codifica o gene correspondente, a expressão do gene correspondente é capaz de ser efetivamente inibida. Além disso, o siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1 de acordo com a presente invenção pode incluir saliência que é uma estrutura incluindo um ou dois ou mais nucleotídeos não emparelhados na extremidade 3’ do siRNA, e pode incluir várias modificações do siRNA para fornecer a resistência de liase para o ácido nucleico, e para diminuir a resposta imune não específica para melhorar a estabilidade in vivo. A modificação de primeiro oligonucleotídeo ou o segundo oligonucleotídeo configurando o siRNA pode ser uma ou mais combinações selecionadas a partir da modificação em que o grupo -OH no carbono 2’ em uma estrutura de açúcar em um ou mais nucleotídeos é substituído com -CH3(metil), -OCH3 (metoxi), -NH2, -F(flúor), -O-2-metoxietil, -O-propil, -O- 2-metiltioetil, -O-3-aminopropil, -O-3-dimetilaminopropil, -O-N- metilacetamido ou - O-dimetilamidooxietil; modificação na qual oxigênio em uma estrutura de açúcar em nucleotídeos é substituída com enxofre; e modificação de fosforotioato ou boranofofato, ligações de fosfonato de metil de ligações de nucleotídeos, ou pode ser modificação para ácido nucleico de peptídeo (PNA), modificação para ácido nucleico bloqueado (LNA), ou modificação para ácido nucleico desbloqueado (UNA) (Ann. Rev. Med. 55, 61-65 2004; US 5.660.985; US 5.958.691; US 6.531.584; US 5.808.023; US 6.326.358; US 6.175.001; Bioorg. Med. Chem. Lett. 14:1139-1143, 2003; RNA, 9:1034-1048, 2003; Nucleic Acid Res. 31:589-595, 2003; Nucleic Acids Research, 38(17) 5761-5773, 2010; Nucleic Acids Research, 39(5) 1823-1832, 2011).[084] Since the siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1 according to the present invention has a base sequence designed to be capable of being complementary linked to the mRNA encoding the corresponding gene, expression of the corresponding gene is capable of be effectively inhibited. Furthermore, the siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1 according to the present invention may include overhang which is a structure including one or two or more unpaired nucleotides at the 3' end of the siRNA, and may include various modifications of the siRNA to provide lyase resistance to the nucleic acid, and to decrease non-specific immune response to improve in vivo stability. The modification of the first oligonucleotide or the second oligonucleotide configuring the siRNA may be one or more combinations selected from the modification in which the -OH group at the 2' carbon in a sugar backbone in one or more nucleotides is replaced with -CH3(methyl ), -OCH3 (methoxy), -NH2, -F(fluorine), -O-2-methoxyethyl, -O-propyl, -O- 2-methylthioethyl, -O-3-aminopropyl, -O-3-dimethylaminopropyl, -O-N-methylacetamido or -O-dimethylamidooxyethyl; modification in which oxygen in a sugar backbone in nucleotides is replaced with sulfur; and modification of phosphorothioate or boranophophate, methyl phosphonate linkages of nucleotide linkages, or may be modification to peptide nucleic acid (PNA), modification to locked nucleic acid (LNA), or modification to unlocked nucleic acid (UNA) (Ann . Rev. Med. 55, 61-65 2004; 14:1139-1143, 2003; Nucleic Acids Research, 38(17) 5761-5773, 2010; 5) 1823-1832, 2011).
[085] O siRNA específico para CTGF, Cyr61 e/ou Plekho1 de acordo com a presente invenção pode inibir a expressão do gene correspondente, e pode notavelmente inibir a expressão da proteína correspondente.[085] The siRNA specific for CTGF, Cyr61 and/or Plekho1 according to the present invention can inhibit the expression of the corresponding gene, and can notably inhibit the expression of the corresponding protein.
[086] A presente invenção fornece também um conjugado no qual um material hidrofílico e um material hidrofóbico são conjugados para ambas as extremidades de siRNA, para liberação in vivo eficaz para melhorar a estabilidade dos siRNA específicos para genes relacionados às doenças respiratórias, particularmente, o siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1.[086] The present invention also provides a conjugate in which a hydrophilic material and a hydrophobic material are conjugated to both ends of siRNA, for effective in vivo release to improve the stability of siRNA specific to genes related to respiratory diseases, particularly, the siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1.
[087] No conjugado siRNA em que um material hidrofílico e um material hidrofóbico são ligados para o siRNA, uma nanopartícula automontada é formada por uma interação hidrofóbica do material hidrofóbico (ver Publicação de Patente Coreana No. 1224828), em que a nanopartícula automontada tem vantagens na eficiência de liberação interna e estabilidade in vivo são significativamente excelentes, e a uniformidade de um tamanho de partícula é excelente, de forma que o controle de qualidade (QC) é facilmente realizado, segundo o qual um processo para a produção de drogas é fácil.[087] In the siRNA conjugate in which a hydrophilic material and a hydrophobic material are linked to the siRNA, a self-assembled nanoparticle is formed by a hydrophobic interaction of the hydrophobic material (see Korean Patent Publication No. 1224828), in which the self-assembled nanoparticle has advantages in internal release efficiency and in vivo stability are significantly excellent, and the uniformity of a particle size is excellent, so that quality control (QC) is easily carried out, according to which a process for producing drugs is easy.
[088] Em uma modalidade preferencial, uma estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo o siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1 de acordo com a presente invenção preferencialmente tem uma estrutura representada pela seguinte Fórmula Estrutural (1): Fórmula Estrutural 1 A-X-R-Y-B[088] In a preferred embodiment, a double-stranded oligo RNA structure containing the siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1 according to the present invention preferably has a structure represented by the following Structural Formula (1): Structural Formula 1 A-X-R-Y-B
[089] Na Fórmula Estrutural (1), A é um material hidrofílico, B é um material hidrofóbico, X e Y são cada um independentemente uma ligação covalente simples ou uma ligação covalente mediada por ligante e R é siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1.[089] In Structural Formula (1), A is a hydrophilic material, B is a hydrophobic material, X and Y are each independently a single covalent bond or a ligand-mediated covalent bond, and R is siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1.
[090] Mais preferencialmente, uma estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo o siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1 de acordo com a presente invenção tem uma estrutura representada pela seguinte Fórmula Estrutural (2): Fórmula Estrutural 2 A-X-S-Y-B AS[090] More preferably, a double-stranded oligo RNA structure containing the siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1 according to the present invention has a structure represented by the following Structural Formula (2): Structural Formula 2 A-X-S-Y-B AS
[091] Na Fórmula Estrutural (2), A, B, X e Y são os mesmos dos definidos na Fórmula Estrutural (1), S é uma fita senso do siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1, e AS é uma fita antissenso de siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1.[091] In Structural Formula (2), A, B, X and Y are the same as those defined in Structural Formula (1), S is a sense strand of the siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1, and AS is an antisense strand of siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1.
[092] Mais preferencialmente, uma estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo o siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1 de acordo com a presente invenção tem uma estrutura representada pela seguinte Fórmula Estrutural (3) ou (4): Fórmula Estrutural 3 A-X-5’ S 3’-Y-B AS Fórmula Estrutural 4 A-X-3’ S 5’-Y-B AS[092] More preferably, a double-stranded RNA oligo structure containing the siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1 according to the present invention has a structure represented by the following Structural Formula (3) or (4): Structural Formula 3 A-X -5' S 3'-Y-B AS Structural Formula 4 A-X-3' S 5'-Y-B AS
[093] Nas Fórmulas Estruturais (3) e (4), A, B, S, AS, X e Y são os mesmos dos definidos na Fórmula Estrutural (1) e 5’ e 3’ significam extremidade 5’ e extremidade 3’ da fita senso do siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1.[093] In Structural Formulas (3) and (4), A, B, S, AS, X and Y are the same as those defined in Structural Formula (1) and 5' and 3' mean 5' end and 3' end of the sense strand of siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1.
[094] É óbvio para um especialista na técnica que nas Fórmulas Estruturais (1) a (4), de um a três grupos fosfato podem ser ligados à extremidade 5’ da fita antissenso da estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo o siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1, e shRNA é capaz de ser usado em vez de usar siRNA.[094] It is obvious to one skilled in the art that in Structural Formulas (1) to (4), one to three phosphate groups can be attached to the 5' end of the antisense strand of the double-stranded oligo RNA structure containing the specific siRNA. for CTGF, Cyr61 or Plekho1, and shRNA is able to be used instead of using siRNA.
[095] O material hidrofílico nas Fórmulas Estruturais (1) a (4) é preferencialmente um material de polímero catiônico ou não iônico tendo um peso molecular de 200 a 10.000, mais preferencialmente, um material de polímero não iônico tendo um peso molecular de 1.000 a 2.000. Por exemplo, compostos de polímero hidrofílico não iônicos como polietileno glicol, polivinil pirrolidona, polioxazolina, etc., são preferencialmente usados como o material de polímero hidrofílico, mas a presente invenção não é necessariamente limitada aos mesmos.[095] The hydrophilic material in Structural Formulas (1) to (4) is preferably a cationic or nonionic polymer material having a molecular weight of 200 to 10,000, more preferably, a nonionic polymer material having a molecular weight of 1,000 to 2,000. For example, non-ionic hydrophilic polymer compounds such as polyethylene glycol, polyvinyl pyrrolidone, polyoxazoline, etc., are preferably used as the hydrophilic polymer material, but the present invention is not necessarily limited thereto.
[096] Em particular, o material hidrofílico (A) nas Fórmulas Estruturais (1) a (4) pode ser utilizado em uma forma de bloco de material hidrofílico representada pela seguinte Fórmula Estrutural (5) ou (6), e utilizando um número apropriado (n na Fórmula Estrutural (5) ou (6)) de blocos de material hidrofílico conforme necessário, os problemas decorrentes da polidispersividade que podem ocorrer em caso de utilização de um material de polímero sintético geral, etc., podem ser em grande parte melhorados. Fórmula Estrutural 5 (A’m-J)n Fórmula Estrutural 6 (J-A’m)n[096] In particular, the hydrophilic material (A) in Structural Formulas (1) to (4) can be used in a block form of hydrophilic material represented by the following Structural Formula (5) or (6), and using a number appropriate (n in Structural Formula (5) or (6)) of blocks of hydrophilic material as required, problems arising from polydispersity that may occur in case of using a general synthetic polymer material, etc., may be largely improved. Structural Formula 5 (A’m-J)n Structural Formula 6 (J-A’m)n
[097] Na Fórmula Estrutural (5), A’ é um monômero de material hidrofílico, J é um ligante para ligar monômeros de material hidrofílico (a soma é m) entre esses ou um ligante para ligar monômeros de material hidrofílico (a soma é m) para siRNA, m é um número inteiro de 1 a 15, n é um inteiro de 1 a 10, e a unidade de repetição representada por (A’m-J) ou (J-A’m) corresponde a uma unidade de base do bloco de material hidrofílico.[097] In Structural Formula (5), A' is a monomer of hydrophilic material, J is a ligand to link monomers of hydrophilic material (the sum is m) between them or a ligand to link monomers of hydrophilic material (the sum is m) for siRNA, m is an integer from 1 to 15, n is an integer from 1 to 10, and the repeat unit represented by (A'm-J) or (J-A'm) corresponds to a unit base block of hydrophilic material.
[098] Quando o bloco de material hidrofílico é representado pela Fórmula Estrutural (5) ou (6), a estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo o siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1 de acordo com a presente invenção tem uma estrutura representada pela seguinte Fórmula Estrutural (7) ou (8): Fórmula Estrutural 7 (A’m-J)n-X-R-Y-B Fórmula Estrutural 8 (J-A’m)n-X-R-Y-B[098] When the block of hydrophilic material is represented by Structural Formula (5) or (6), the double-stranded RNA oligo structure containing the siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1 according to the present invention has a structure represented by the following Structural Formula (7) or (8): Structural Formula 7 (A'm-J)n-X-R-Y-B Structural Formula 8 (J-A'm)n-X-R-Y-B
[099] Nas Fórmulas Estruturais (7) e (8), X, R, Y e B são os mesmos dos definidos na Fórmula Estrutural (1) e A’, J, m e n são os mesmos dos definidos nas Fórmulas Estruturais (5) e (6).[099] In Structural Formulas (7) and (8), X, R, Y and B are the same as those defined in Structural Formula (1) and A', J, m and n are the same as those defined in Structural Formulas (5) and (6).
[0100] Nas Fórmulas Estruturais (5) e (6), o monômero de material hidrofílico A’ é usável sem limitação desde que atenda aos objetivos da presente invenção entre os monômeros do polímero hidrofílico não iônico. O monômero de material hidrofílico A’ é preferencialmente um monômero selecionado a partir dos seguintes compostos (1) a (3) mostrados na Tabela 1, mais preferencialmente, um monômero do composto (1), e G no composto (1) pode ser preferencialmente selecionado de CH2, O, S e NH.[0100] In Structural Formulas (5) and (6), the hydrophilic material monomer A' is usable without limitation as long as it meets the objectives of the present invention among the non-ionic hydrophilic polymer monomers. The hydrophilic material monomer A' is preferably a monomer selected from the following compounds (1) to (3) shown in Table 1, more preferably a monomer of the compound (1), and G in the compound (1) may preferably be selected from CH2, O, S and NH.
[0101] Em particular, entre os monômeros de material hidrofílico, o monômero do Composto (1) pode ter vários grupos funcionais introduzidos nos mesmos e boa afinidade in vivo, e induzir uma pequena resposta imune, tendo assim excelente biocompatibilidade, e, além disso, pode aumentar a estabilidade in vivo do oligonucleotídeo incluído na estrutura de Fórmula Estrutural (7) ou (8) e pode aumentar a eficiência de liberação, que é consideravelmente adequada para a produção da estrutura de acordo com a presente invenção. [Tabela 1] Estrutura do monômero de material hidrofílico na presente invenção [0101] In particular, among the monomers of hydrophilic material, the monomer of Compound (1) can have several functional groups introduced into them and good affinity in vivo, and induce a small immune response, thus having excellent biocompatibility, and, in addition , can increase the in vivo stability of the oligonucleotide included in the structure of Structural Formula (7) or (8) and can increase the release efficiency, which is considerably suitable for producing the structure according to the present invention. [Table 1] Structure of the hydrophilic material monomer in the present invention
[0102] Em particular, o material hidrofílico em fórmulas estruturais 5 a 8 preferencialmente tem peso molecular total de 1.000 a 2.000. Portanto, por exemplo, quando hexaetileno glicol representado pelo Composto (1), ou seja, G é O, e m é 6, é usado nas Fórmulas Estruturais (7) e (8), um peso molecular de espaçador de hexaetileno glicol é 344, de forma que o número de repetição (n) é preferencial para ser de 3 a 5. Em particular, a unidade de repetição do grupo hidrofílico, ou seja, o bloco de material hidrofílico, representado por (A’m-J) ou (J-A’m)n nas Fórmulas Estruturais (5) e (6), é capaz de ser usada em um número apropriado representado por n, conforme necessário. A que é o monômero de material hidrofílico e J que é o ligante incluído em cada bloco de material hidrofílico podem ser independentemente iguais entre si ou podem ser diferentes entre si. Ou seja, quando 3 blocos de material hidrofílico são utilizados (n = 3), o monômero de material hidrofílico do composto (1) é usado no primeiro bloco, o monômero de material hidrofílico do composto (2) é usado no segundo bloco, o monômero de material hidrofílico do composto (3) é usado no terceiro bloco, etc. Ou seja, diferentes monômeros de material hidrofílico para todos os blocos de material hidrofílico podem ser usados, e qualquer monômero de material hidrofílico selecionado a partir dos monômeros de material hidrofílico de compostos (1) a (3) pode também ser utilizado igualmente em todos os blocos de material hidrofílico. Da mesma forma, ligantes mediando a combinação do monômero de material hidrofílico podem também ser iguais entre si e diferentes entre si para todos os blocos de material hidrofílico. Além disso, m que é o número de monômeros de material hidrofílico pode ser igual entre si ou diferente entre si entre todos os blocos de material hidrofílico. Ou seja, 3 monômeros de material hidrofílico (m=3) são ligados no primeiro bloco de material hidrofílico, 5 monômeros de material hidrofílico (m=5) estão ligados no segundo de bloco material hidrofílico, 4 monômeros de material hidrofílico (m=4) são ligados no terceiro bloco de material hidrofílico, etc. Ou seja, monômeros de material hidrofílico cada um tendo diferentes números ou cada um tendo o mesmo número podem ser utilizados em blocos de material hidrofílico.[0102] In particular, the hydrophilic material in structural formulas 5 to 8 preferably has a total molecular weight of 1,000 to 2,000. Therefore, for example, when hexaethylene glycol represented by Compound (1), that is, G is O, and m is 6, is used in Structural Formulas (7) and (8), a molecular weight of hexaethylene glycol spacer is 344, so that the repeat number (n) is preferred to be from 3 to 5. In particular, the repeating unit of the hydrophilic group, i.e. the block of hydrophilic material, represented by (A'm-J) or ( J-A'm)n in Structural Formulas (5) and (6), is capable of being used in an appropriate number represented by n, as needed. A which is the monomer of hydrophilic material and J which is the ligand included in each block of hydrophilic material may be independently equal to each other or may be different from each other. That is, when 3 blocks of hydrophilic material are used (n = 3), the hydrophilic material monomer of compound (1) is used in the first block, the hydrophilic material monomer of compound (2) is used in the second block, the hydrophilic material monomer of compound (3) is used in the third block, etc. That is, different hydrophilic material monomers for all hydrophilic material blocks can be used, and any hydrophilic material monomer selected from the hydrophilic material monomers of compounds (1) to (3) can also be used equally in all blocks of hydrophilic material. Likewise, ligands mediating the combination of hydrophilic material monomer can also be the same and different from each other for all blocks of hydrophilic material. Furthermore, m, which is the number of monomers of hydrophilic material, can be equal to each other or different from each other among all blocks of hydrophilic material. That is, 3 monomers of hydrophilic material (m=3) are linked to the first block of hydrophilic material, 5 monomers of hydrophilic material (m=5) are linked to the second block of hydrophilic material, 4 monomers of hydrophilic material (m=4 ) are attached to the third block of hydrophilic material, etc. That is, monomers of hydrophilic material each having different numbers or each having the same number can be used in blocks of hydrophilic material.
[0103] Além disso, na presente invenção, o ligante (J) é preferencialmente selecionado do grupo que consiste em PO3-, SO3 e CO2, mas a presente invenção não é limitada aos mesmos. É óbvio para um especialista na técnica que qualquer ligante pode ser utilizado dependendo do monômero de material hidrofílico usado, etc., desde que satisfaça os objetivos da presente invenção.[0103] Furthermore, in the present invention, the ligand (J) is preferably selected from the group consisting of PO3-, SO3 and CO2, but the present invention is not limited to them. It is obvious to one skilled in the art that any binder can be used depending on the monomer of hydrophilic material used, etc., as long as it satisfies the objectives of the present invention.
[0104] O material hidrofóbico (B) nas Fórmulas Estruturais (1) a (4), (7) e (8) serve para formar uma nanopartícula formada das estruturas de oligonucleotídeo de acordo com Fórmulas Estruturais (1) a (4), (7) e (8) através de interação hidrofóbica. O material hidrofóbico preferencialmente tem um peso molecular de 250 a 1.000 e pode incluir um derivado de esteroide, um derivado de glicerida, éter de glicerol, polipropileno glicol, hidrocarboneto saturado ou insaturado C12 a C50, diacilfosfatidilcolina, ácidos graxos, fosfolipídios, lipopoliamina, etc., mas a presente invenção não é limitada aos mesmos. É óbvio para um especialista na técnica que qualquer material hidrofóbico pode ser utilizado, desde que satisfaça os objetivos da presente invenção.[0104] The hydrophobic material (B) in Structural Formulas (1) to (4), (7) and (8) serves to form a nanoparticle formed from the oligonucleotide structures according to Structural Formulas (1) to (4), (7) and (8) through hydrophobic interaction. The hydrophobic material preferably has a molecular weight of 250 to 1,000 and may include a steroid derivative, a glyceride derivative, glycerol ether, polypropylene glycol, C12 to C50 saturated or unsaturated hydrocarbon, diacylphosphatidylcholine, fatty acids, phospholipids, lipopolyamine, etc. ., but the present invention is not limited thereto. It is obvious to one skilled in the art that any hydrophobic material can be used, as long as it satisfies the objectives of the present invention.
[0105] O derivado de esteroide pode ser selecionado do grupo que consiste em colesterol, colestanol, ácido cólico, formato de colesterol, formato de colestanil, e ccolesteril amina, e o derivado glicerídico pode ser selecionado de mono, di e triglicerídeos, etc. em que o ácido graxo do glicerídeo é preferencial de ser ácido graxo saturado ou insaturado C12 a C50.[0105] The steroid derivative can be selected from the group consisting of cholesterol, cholestanol, cholic acid, cholesterol formate, cholestanyl formate, and cholesteryl amine, and the glyceride derivative can be selected from mono, di and triglycerides, etc. wherein the fatty acid of the glyceride is preferably saturated or unsaturated fatty acid C12 to C50.
[0106] Em particular, entre os materiais hidrofóbicos, hidrocarbonetos saturados ou insaturados ou colesterol é preferencial uma vez que é capaz de facilmente ser ligado em uma etapa sintética da estrutura do oligonucleotídeo de acordo com a presente invenção, e hidrocarboneto C24, particularmente, tetradocosano, incluindo uma ligação dissulfeto é mais preferencial.[0106] In particular, among hydrophobic materials, saturated or unsaturated hydrocarbons or cholesterol is preferred since it is capable of easily being linked in a synthetic step of the oligonucleotide structure according to the present invention, and C24 hydrocarbon, particularly, tetradocosane , including a disulfide bond is more preferred.
[0107] O material hidrofóbico é ligado à extremidade distal do material hidrofílico, e não importa se o material hidrofóbico é ligado a qualquer posição da fita senso ou fita antissenso do siRNA.[0107] The hydrophobic material is attached to the distal end of the hydrophilic material, and it does not matter whether the hydrophobic material is attached to any position of the sense strand or antisense strand of the siRNA.
[0108] O material hidrofílico ou o material hidrofóbico em Fórmulas Estruturais (1) a (4), (7) e (8) de acordo com a presente invenção é ligado ao siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1 por uma ligação covalente simples ou uma ligação covalente mediada por ligante (X ou Y). Além disso, o ligante mediando a ligação covalente é covalentemente ligado ao material hidrofílico ou o material hidrofóbico na extremidade do siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1, e não é particularmente limitado, desde que a ligação que é possível de ser decomposta em um ambiente específico seja fornecida conforme necessário. Portanto, qualquer composto para a ligação para ativar o siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1 e/ou o material hidrofílico (ou o material hidrofóbico) na produção da estrutura de oligo RNA de dupla hélice de acordo com a presente invenção pode ser usado como o ligante. A ligação covalente pode ser qualquer uma de uma ligação não degradável ou uma ligação degradável. Aqui, exemplos da ligação não degradável podem incluir uma ligação de amida ou uma ligação de fosforilação, e exemplos da ligação degradável podem incluir uma ligação dissulfeto, uma ligação degradável por ácido, uma ligação de éster, uma ligação de anidrido, uma ligação biodegradável ou uma ligação enzimaticamente degradável e afins, mas a presente invenção não é limitada a essas.[0108] The hydrophilic material or the hydrophobic material in Structural Formulas (1) to (4), (7) and (8) according to the present invention is linked to the siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1 by a single covalent bond or a ligand-mediated covalent bond (X or Y). Furthermore, the linker mediating the covalent linkage is covalently linked to the hydrophilic material or the hydrophobic material at the end of the siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1, and is not particularly limited as long as the linkage that is possible to be cleaved in an environment specific information is provided as needed. Therefore, any compound for binding to activate the siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1 and/or the hydrophilic material (or the hydrophobic material) in producing the double helix RNA oligo structure according to the present invention can be used as the binder. The covalent bond can be either a non-degradable bond or a degradable bond. Here, examples of the non-degradable bond may include an amide bond or a phosphorylation bond, and examples of the degradable bond may include a disulfide bond, an acid-degradable bond, an ester bond, an anhydride bond, a biodegradable bond or an enzymatically degradable bond and the like, but the present invention is not limited to these.
[0109] Além disso, qualquer siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1 representado por R (ou S e AS) nas Fórmulas Estruturais (1) a (4), (7), e (8) é usável sem limitação, desde que o siRNA seja capaz de ser ligado especificamente para CTGF, Cyr61 ou Plekho1. Preferencialmente, o siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1 consiste em uma fita senso incluindo qualquer uma sequência selecionada de ID SEQ NOs: 1 a 600 e 602 a 604 e uma fita antissenso incluindo uma sequência complementar para a mesma.[0109] Furthermore, any siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1 represented by R (or S and AS) in Structural Formulas (1) to (4), (7), and (8) is usable without limitation, provided that the siRNA is capable of being specifically bound to CTGF, Cyr61 or Plekho1. Preferably, the siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1 consists of a sense strand including any sequence selected from SEQ ID NOs: 1 to 600 and 602 to 604 and an antisense strand including a complementary sequence thereto.
[0110] Em particular, o siRNA incluído nas Fórmulas Estruturais (1) a (4), (7) e (8) de acordo com a presente invenção é preferencialmente siRNA específico para CTGF incluindo qualquer uma sequência selecionada do grupo que consiste em ID SEQ NOs: 1 a 10, 35, 42, 59, 602 a 604 ou 301 a 303, 305 a 307, 309, 317, 323 e 329, como uma fita senso,[0110] In particular, the siRNA included in Structural Formulas (1) to (4), (7) and (8) according to the present invention is preferably CTGF-specific siRNA including any sequence selected from the group consisting of ID SEQ NOs: 1 to 10, 35, 42, 59, 602 to 604 or 301 to 303, 305 to 307, 309, 317, 323 and 329, as a sense tape,
[0111] siRNA específico para Cyr61 incluindo qualquer uma sequência selecionada do grupo que consiste em ID SEQ NOs: 101 a 110, 124, 153, 166, 187, 197, 409, 410, 415, 417, 418, 420, 422, 424, 427 e 429, como uma fita senso, ou[0111] siRNA specific for Cyr61 including any sequence selected from the group consisting of ID SEQ NOs: 101 to 110, 124, 153, 166, 187, 197, 409, 410, 415, 417, 418, 420, 422, 424 , 427 and 429, like a sense tape, or
[0112] siRNA específico para Plekho1 incluindo qualquer uma sequência selecionada do grupo que consiste em ID SEQ NOs: 201 a 210, 212, 218, 221, 223, 504 a 507, 514, 515 e 522 a 525, como uma fita senso.[0112] siRNA specific for Plekho1 including any sequence selected from the group consisting of ID SEQ NOs: 201 to 210, 212, 218, 221, 223, 504 to 507, 514, 515 and 522 to 525, as a sense strand.
[0113] Mais preferencialmente, o siRNA de acordo com a presente invenção é siRNA específico para CTGF incluindo qualquer uma sequência selecionada do grupo que consiste em ID SEQ NOs: 4, 5, 8, 9, 35, 42, 59, 602, 603, 604, 301, 303, 307 e 323, como uma fita senso,[0113] More preferably, the siRNA according to the present invention is CTGF-specific siRNA including any sequence selected from the group consisting of ID SEQ NOs: 4, 5, 8, 9, 35, 42, 59, 602, 603 , 604, 301, 303, 307 and 323, like a sense tape,
[0114] siRNA específico para Cyr61 incluindo qualquer uma sequência selecionada do grupo que consiste em ID SEQ NOs: 102, 104, 107, 108, 124, 153, 166, 187, 197, 410, 422 e 424, como uma fita senso, ou[0114] siRNA specific for Cyr61 including any sequence selected from the group consisting of ID SEQ NOs: 102, 104, 107, 108, 124, 153, 166, 187, 197, 410, 422 and 424, as a sense strand, or
[0115] siRNA específico para Plekho1 incluindo qualquer uma sequência selecionada do grupo que consiste em ID SEQ NOs: 206 a 209, 212, 218, 221, 223, 507, 515 e 525, como uma fita senso.[0115] siRNA specific for Plekho1 including any sequence selected from the group consisting of ID SEQ NOs: 206 to 209, 212, 218, 221, 223, 507, 515 and 525, as a sense strand.
[0116] Mais preferencialmente, o siRNA de acordo com a presente invenção é siRNA específico para CTGF incluindo qualquer uma sequência de ID SEQ NO: 42, 59, 602 ou 323, como uma fita senso,[0116] More preferably, the siRNA according to the present invention is siRNA specific for CTGF including any sequence of SEQ ID NO: 42, 59, 602 or 323, as a sense strand,
[0117] siRNA específico para Cry61 incluindo qualquer uma sequência de ID SEQ NO: 124, 153, 187, 197 ou 424, como uma fita senso, ou[0117] siRNA specific for Cry61 including any sequence of SEQ ID NO: 124, 153, 187, 197 or 424, as a sense strand, or
[0118] siRNA específico para Plekho1 incluindo qualquer uma sequência de ID SEQ NO: 212, 218, 221, 223 ou 525, como uma fita senso.[0118] siRNA specific for Plekho1 including any sequence of SEQ ID NO: 212, 218, 221, 223 or 525, as a sense strand.
[0119] Além disso, siRNA incluindo fita senso de siRNA específico para CTGF humano e de camundongo de acordo com ID SEQ NO: 6 ou 8, siRNA incluindo fita senso de siRNA específico para Cyr61 humano e de camundongo de acordo com ID SEQ NO: 102, 104 ou 105, e siRNA incluindo fita senso de siRNA específico para Plekho1 humano e de camundongo de acordo com ID SEQ NO: 204, 207 ou 208, são particularmente preferenciais, que é porque o siRNA tendo a sequência como a fita senso tem um efeito de simultaneamente inibir a expressão do CTGF, Cyr61 ou Plekho1 de humano ou de camundongo, de forma que siRNA incluindo fita senso de siRNA específico para CTGF de humano e camundongo de acordo com ID SEQ NO: 6, siRNA incluindo fita senso de siRNA específico para Cyr61 humano e de camundongo de acordo com ID SEQ NO: 102, e siRNA incluindo fita senso de siRNA específico para Plekho1 humano e de camundongo de acordo com ID SEQ NO: 207 são os mais preferenciais.[0119] In addition, siRNA including sense strand of siRNA specific for human and mouse CTGF according to SEQ ID NO: 6 or 8, siRNA including sense strand of siRNA specific for human and mouse Cyr61 according to SEQ ID NO: 102, 104 or 105, and siRNA including sense strand of siRNA specific for human and mouse Plekho1 according to SEQ ID NO: 204, 207 or 208, are particularly preferred, which is because the siRNA having the sequence as the sense strand has an effect of simultaneously inhibiting the expression of human or mouse CTGF, Cyr61 or Plekho1, such that siRNA including sense strand siRNA specific for human and mouse CTGF according to SEQ ID NO: 6, siRNA including sense strand siRNA specific for human and mouse Cyr61 according to SEQ ID NO: 102, and siRNA including sense strand siRNA specific for human and mouse Plekho1 according to SEQ ID NO: 207 are most preferred.
[0120] Na estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo o siRNA para CTGF, Cyr61 ou Plekho1 de acordo com a presente invenção, um grupo amina ou um grupo de polihistidina pode ser adicionalmente introduzido em uma porção da extremidade distal ligada com o siRNA do material hidrofílico na estrutura.[0120] In the double-stranded RNA oligo structure containing the siRNA for CTGF, Cyr61 or Plekho1 according to the present invention, an amine group or a polyhistidine group can be additionally introduced into a portion of the distal end linked with the siRNA of the hydrophilic material in the structure.
[0121] Isto torna mais fácil realizar a introdução intercelular e escapar do endossomo da estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo o siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1 de acordo com a presente invenção, e a possibilidade de introdução de um grupo amina e usando um grupo polihistidina para realizar facilmente a introdução intercelular e o escape do endossomo dos transportadores como ponto Quântico, Dendrímeros, lipossomas, etc., e o efeito dos mesmos, foi relatada.[0121] This makes it easier to carry out the intercellular introduction and escape from the endosome of the double-stranded oligo RNA structure containing the siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1 according to the present invention, and the possibility of introducing an amino group and using a polyhistidine group to easily realize the intercellular introduction and endosome escape of transporters such as Quantum dot, Dendrimers, liposomes, etc., and the effect thereof, has been reported.
[0122] Especificamente, sabe-se que o grupo amina primária expresso na extremidade ou do lado de fora do transportador é protonado em pH in vivo para formar um conjugado com um gene carregado negativamente por uma interação eletrostática, e o escape do endossomo é facilmente realizado devido a aminas terciárias internas tendo um efeito tampão a um pH baixo do endossomo depois de ser introduzido dentro das células, sendo assim capaz de proteger o transportador de decomposição do lisossoma (liberação de gene e inibição da expressão usando um material híbrido baseado em polímero. Polymer Sci. Technol., Vol. 23, No.3, pp254-259).[0122] Specifically, it is known that the primary amine group expressed at the end or outside of the transporter is protonated at pH in vivo to form a conjugate with a negatively charged gene by an electrostatic interaction, and escape from the endosome is easily accomplished due to internal tertiary amines having a buffering effect at the low pH of the endosome after being introduced into the cells, thus being able to protect the transporter from lysosomal breakdown (gene release and inhibition of expression using a polymer-based hybrid material . Polymer Sci. Technol., Vol. 23, No.3, pp254-259).
[0123] Além disso, sabe-se que histidina que é um dos aminoácidos não essenciais, tem um anel imidazol (pKa3 6,04) em um resíduo (-R) para aumentar a capacidade do tampão no endossomo e o lisossomo, de forma que a expressão de histidina pode ser usada para aumentar uma eficiência de escape do endossomo em transportadores de gene não virais incluindo lipossoma (Novel histidine-conjugated galactosylated cationic liposomes for efficient hepatocyte selective gene transfer in human hepatoma HepG2 cells. J. Controlled Release 118, pp262-270).[0123] Furthermore, it is known that histidine, which is one of the non-essential amino acids, has an imidazole ring (pKa3 6.04) at a residue (-R) to increase the buffering capacity in the endosome and lysosome, so that histidine expression can be used to increase endosome escape efficiency in non-viral gene transporters including liposomes (Novel histidine-conjugated galactosylated cationic liposomes for efficient hepatocyte selective gene transfer in human hepatoma HepG2 cells. J. Controlled Release 118, pp262-270).
[0124] O grupo amina ou o grupo polihistidina pode estar ligado ao material hidrofílico ou o bloco de material hidrofílico através de pelo menos um ligante.[0124] The amine group or the polyhistidine group can be linked to the hydrophilic material or the hydrophilic material block through at least one linker.
[0125] Quando o grupo amina ou o grupo polihistidina é introduzido no material hidrofílico da estrutura de oligo RNA de dupla hélice representada pela Fórmula Estrutural (1), a estrutura do oligo RNA de dupla hélice pode ter uma estrutura representada pela Fórmula Estrutural (9) abaixo: Fórmula Estrutural 9 P-J1-J2-A-X-R-Y-B[0125] When the amine group or polyhistidine group is introduced into the hydrophilic material of the double helix RNA oligo structure represented by Structural Formula (1), the double helix RNA oligo structure can have a structure represented by Structural Formula (9 ) below: Structural Formula 9 P-J1-J2-A-X-R-Y-B
[0126] Na Fórmula Estrutural (9), A, B, R, X e Y são os mesmos dos definidos na Fórmula Estrutural (1),[0126] In Structural Formula (9), A, B, R, X and Y are the same as those defined in Structural Formula (1),
[0127] P é um grupo amina ou um grupo polihistidina.[0127] P is an amine group or a polyhistidine group.
[0128] J1 e J2 são ligantes e podem ser cada um independentemente selecionado de uma ligação covalente simples, PO3-, SO3, CO2, C2-12 alquil, alquenil, e alquinil, mas a presente invenção não é limitada aos mesmos. É óbvio para um especialista na técnica que qualquer ligante pode ser utilizado com J1 e J2, desde que satisfaça os objetivos da presente invenção dependendo do material hidrofílico usado.[0128] J1 and J2 are ligands and can each be independently selected from a simple covalent bond, PO3-, SO3, CO2, C2-12 alkyl, alkenyl, and alkynyl, but the present invention is not limited to them. It is obvious to one skilled in the art that any ligand can be used with J1 and J2, as long as it satisfies the objectives of the present invention depending on the hydrophilic material used.
[0129] Preferencialmente, quando o grupo amina é introduzido, J2 é preferencialmente uma ligação covalente simples ou PO3- e J1 é preferencialmente C6 alquil, mas a presente invenção não é limitada aos mesmos.[0129] Preferably, when the amine group is introduced, J2 is preferably a single covalent bond or PO3- and J1 is preferably C6 alkyl, but the present invention is not limited to the same.
[0130] Além disso, quando o grupo polihistidina é introduzido, na Fórmula Estrutural (9), J2 é preferencialmente uma ligação covalente simples ou PO3-, e J1 é preferencialmente o seguinte Composto (4), mas a presente invenção não é limitada aos mesmos.Composto 4 [0130] Furthermore, when the polyhistidine group is introduced, in Structural Formula (9), J2 is preferably a single covalent bond or PO3-, and J1 is preferably the following Compound (4), but the present invention is not limited to the same.Compound 4
[0131] Além disso, quando o material hidrofílico da estrutura de oligo RNA de dupla hélice representado pela Fórmula Estrutural (9) é um bloco de material hidrofílico representado pela Fórmula Estrutural (5) ou (6), e o grupo amina ou o grupo polihistidina é introduzido, a estrutura de oligo RNA de dupla hélice pode ser representada pela Fórmula Estrutural (10) ou (11): Fórmula Estrutural 10 P-J1-J2-(A’m-J)n-X-R-Y-B Fórmula Estrutural 11 P-J1-J2-(J-A’m)n-X-R-Y-B[0131] Furthermore, when the hydrophilic material of the double helix RNA oligo structure represented by Structural Formula (9) is a block of hydrophilic material represented by Structural Formula (5) or (6), and the amine group or the polyhistidine is introduced, the double helix RNA oligo structure can be represented by Structural Formula (10) or (11): Structural Formula 10 P-J1-J2-(A'm-J)n-X-R-Y-B Structural Formula 11 P-J1- J2-(J-A'm)n-X-R-Y-B
[0132] Em Fórmulas Estruturais (10) e (11), X, R, Y, B, A’, J, m e n são os mesmos dos definidos na Fórmula Estrutural (5) ou (6), e P, J1 e J2 são os mesmos dos definidos na Fórmula Estrutural (9).[0132] In Structural Formulas (10) and (11), X, R, Y, B, A', J, m and n are the same as those defined in Structural Formula (5) or (6), and P, J1 and J2 are the same as those defined in Structural Formula (9).
[0133] Em particular, nas Fórmulas Estruturais (10) e (11), o material hidrofílico é preferencialmente ligado à extremidade 3’ da fita senso do siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1, e neste caso, Fórmulas Estruturais (9) a (11) podem ser representadas pelas seguintes Fórmulas Estruturais (12) a (14): Fórmula Estrutural 12 P-J1-J2-A-X-3’S 5’-Y-B AS Fórmula Estrutural 13 P-J1-J2-(A’m-J)n-X-3’S 5’-Y-B AS Fórmula Estrutural 14 P-J1-J2-(J-A’m)n-X-3’S 5’-Y-B AS[0133] In particular, in Structural Formulas (10) and (11), the hydrophilic material is preferentially linked to the 3' end of the sense strand of the siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1, and in this case, Structural Formulas (9) a (11) can be represented by the following Structural Formulas (12) to (14): Structural Formula 12 P-J1-J2-A-X-3'S 5'-Y-B AS Structural Formula 13 P-J1-J2-(A'm-J )n-X-3'S 5'-Y-B AS Structural Formula 14 P-J1-J2-(J-A'm)n-X-3'S 5'-Y-B AS
[0134] Nas Fórmulas Estruturais (12) e (14), X, R, Y, B, A, A’ J, m, n, P, J1 e J2 são os mesmos dos definidos nas Fórmulas Estruturais (9) a (11), e 5’ e 3’ significam extremidade 5’ e extremidade 3’ da fita senso do siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1.[0134] In Structural Formulas (12) and (14), X, R, Y, B, A, A' J, m, n, P, J1 and J2 are the same as those defined in Structural Formulas (9) to ( 11), and 5' and 3' mean the 5' end and 3' end of the sense strand of the siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1.
[0135] O grupo amina que pode ser introduzido na presente invenção pode ser grupos de amina primária a terciária, e o grupo de amina primária é particularmente preferencial. O grupo de amina introduzido pode estar presente como um sal de amina. Por exemplo, o sal do grupo de amina primária pode estar presente em uma forma de NH3+.[0135] The amine group that can be introduced in the present invention can be primary to tertiary amine groups, and the primary amine group is particularly preferred. The introduced amine group may be present as an amine salt. For example, the salt of the primary amine group may be present in an NH3+ form.
[0136] Além disso, o grupo de polihistidina que pode ser introduzido na presente invenção preferencialmente inclui de 3 a 10 histidinas, mais preferencialmente, 5 a 8 histidinas e mais preferencialmente, 6 histidinas. Além de histidina, pelo menos uma cisteína pode ser adicionalmente incluída.[0136] Furthermore, the polyhistidine group that can be introduced in the present invention preferably includes from 3 to 10 histidines, more preferably, 5 to 8 histidines and most preferably, 6 histidines. In addition to histidine, at least one cysteine can be additionally included.
[0137] Entretanto, quando uma fração alvo é fornecida na estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo o siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1 de acordo com a presente invenção e as nanopartículas formadas da mesma, a liberação para a célula alvo é efetivamente promovida para conseguir a liberação para a célula alvo, mesmo em uma concentração relativamente baixa de dosagem, mostrando assim uma função de alto controle para a expressão do gene alvo, e desse modo impedindo liberação não específica de siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1 em outros órgãos e células.[0137] However, when a target moiety is provided in the double-stranded RNA oligo structure containing the siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1 according to the present invention and nanoparticles formed therefrom, delivery to the target cell is effectively promoted to achieve release to the target cell, even at a relatively low dosage concentration, thus showing a high control function for target gene expression, and thereby preventing non-specific release of siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1 in other organs and cells.
[0138] Nesse sentido, a presente invenção fornece uma estrutura de oligo RNA de dupla hélice em que um ligante (L), particularmente, um ligante especificamente ligado a um receptor que promove a internalização da célula alvo através de endocitose mediada por receptores (RME), é adicionalmente ligado à estrutura de acordo com as Fórmulas Estruturais (1) a (4), (7) e (8). Por exemplo, a forma em que o ligante é ligado à estrutura de oligo RNA de dupla hélice de acordo com a Fórmula Estrutural (1), tem uma estrutura representada pela seguinte Fórmula Estrutural (15): Fórmula Estrutural 15 (Li-Z)-A-X-R-Y-B[0138] In this sense, the present invention provides a double-stranded RNA oligo structure in which a ligand (L), particularly a ligand specifically bound to a receptor that promotes internalization of the target cell through receptor-mediated endocytosis (RME ), is additionally attached to the structure according to Structural Formulas (1) to (4), (7) and (8). For example, the form in which the linker is attached to the double-stranded RNA oligo structure according to Structural Formula (1), has a structure represented by the following Structural Formula (15): Structural Formula 15 (Li-Z)- A-X-R-Y-B
[0139] Na Fórmula Estrutural (15), A, B, X e Y são os mesmos dos definidos na Fórmula Estrutural (1), L é um ligante especificamente ligado a um receptor que promove a internalização da célula alvo através de endocitose mediada por receptores (RME), e i representa um número inteiro de 1 a 5, preferencialmente, um número inteiro de 1 a 3.[0139] In Structural Formula (15), A, B, X and Y are the same as those defined in Structural Formula (1), L is a ligand specifically bound to a receptor that promotes internalization of the target cell through receivers (RME), and i represents an integer from 1 to 5, preferably an integer from 1 to 3.
[0140] O ligante na Fórmula Estrutural (15) pode ser preferencialmente escolhido do grupo que consiste em um anticorpo ou aptâmero específico de receptor de alvo, peptídeo que tem propriedades de RME para promover a internalização da célula de forma específica para célula alvo; ou folato (geralmente, folato e ácido fólico são usados de forma intersetorial, e o folato na presente invenção significa folato em estado natural ou em um estado ativado em um corpo humano), produtos químicos como açúcar, carboidratos, etc., incluindo hexoaminas como N-acetil galactosamina (NAG), etc., glicose, manose, mas a presente invenção não é limitada aos mesmos.[0140] The ligand in Structural Formula (15) can be preferably chosen from the group consisting of a target receptor-specific antibody or aptamer, peptide that has RME properties to promote cell internalization in a target cell-specific manner; or folate (generally, folate and folic acid are used interchangeably, and folate in the present invention means folate in a natural state or in an activated state in a human body), chemicals such as sugar, carbohydrates, etc., including hexoamines such as N-acetyl galactosamine (NAG), etc., glucose, mannose, but the present invention is not limited to the same.
[0141] Além disso, o material hidrofílico A na Fórmula Estrutural (15) pode ser utilizado sob a forma do bloco de material hidrofílico representado pelas Fórmulas Estruturais (5) e (6).[0141] Furthermore, the hydrophilic material A in Structural Formula (15) can be used in the form of the block of hydrophilic material represented by Structural Formulas (5) and (6).
[0142] A presente invenção também fornece um método para produzir a estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo o siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1.[0142] The present invention also provides a method for producing the double-stranded RNA oligo structure containing siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1.
[0143] O método para produzir a estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo o siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1 de acordo com a presente invenção pode incluir as seguintes etapas:[0143] The method for producing the double-stranded RNA oligo structure containing the siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1 according to the present invention may include the following steps:
[0144] (1) ligar um material hidrofílico baseado em um suporte sólido;[0144] (1) attaching a hydrophilic material based on a solid support;
[0145] (2) sinteti zar uma fita simples de RNA baseada no suporte sólido contendo o material hidrofílico ligado ao mesmo;[0145] (2) synthesize a single strand of RNA based on the solid support containing the hydrophilic material linked to it;
[0146] (3) ligar covalentemente um material hidrofóbico para extremidade 5’ da fita simples de RNA;[0146] (3) covalently attach a hydrophobic material to the 5' end of the single-stranded RNA;
[0147] (4) sinteti zar uma fita simples de RNA tendo uma sequência complementar a uma sequência da fita simples de RNA;[0147] (4) synthesizing a single-stranded RNA having a sequence complementary to a sequence of the single-stranded RNA;
[0148] (5) separar e purificar uma estrutura de RNA-polímero e a fita simples de RNA do suporte sólido quando a síntese da fita simples de RNA é concluída; e[0148] (5) separating and purifying an RNA-polymer structure and the single-stranded RNA from the solid support when the synthesis of the single-stranded RNA is completed; It is
[0149] (6) produzir a estrutura de oligo RNA de dupla hélice pelo anelamento da estrutura de RNA-polímero e uma fita simples de RNA tendo uma sequência complementar à mesma.[0149] (6) produce the double helix RNA oligo structure by annealing the RNA-polymer structure and a single strand of RNA having a sequence complementary to it.
[0150] O suporte sólido na presente invenção é preferencialmente um vidro de poro controlado (CPG), mas a presente invenção não é limitada aos mesmos, mas pode ser poliestireno, papel celulose, sílica gel, etc. No CPG, um diâmetro é preferencialmente 40 a 180 μm, e um tamanho de poro preferencialmente é 500 a 3000Â.[0150] The solid support in the present invention is preferably a controlled pore glass (CPG), but the present invention is not limited to the same, but can be polystyrene, cellulose paper, silica gel, etc. In CPG, a diameter is preferably 40 to 180 μm, and a pore size is preferably 500 to 3000Å.
[0151] Após a etapa (5) acima, quando a produção é concluída, pode se confirmada se a estrutura de RNA-polímero purificada e a fita simples de RNA purificado são produzidas como a estrutura de RNA-polímero desejada e a fita simples de RNA desejado medindo pesos moleculares por espectrômetro de massa MALDI-TOF. No método de produção, a Etapa (4) que é uma etapa de sintetizar a fita simples de RNA tendo uma sequência complementar a uma sequência da fita simples de RNA sintetizada na Etapa (2) pode ser realizada antes da Etapa (1) ou pode ser realizada durante qualquer etapa de uma das Etapas (1) a (5).[0151] After step (5) above, when production is completed, it can be confirmed whether the purified RNA-polymer structure and the purified single-stranded RNA are produced as the desired RNA-polymer structure and single-stranded RNA. Desired RNA measuring molecular weights by MALDI-TOF mass spectrometer. In the production method, Step (4) which is a step of synthesizing single-stranded RNA having a sequence complementary to a sequence of single-stranded RNA synthesized in Step (2) may be performed before Step (1) or may be performed during any stage of one of Steps (1) to (5).
[0152] Além disso, a fita simples de RNA tendo uma sequência complementar para a fita simples de RNA sintetizada na Etapa (2) pode conter um grupo fosfato ligado à extremidade 5’ da mesma.[0152] Furthermore, the single-stranded RNA having a complementary sequence to the single-stranded RNA synthesized in Step (2) may contain a phosphate group attached to the 5' end thereof.
[0153] Entretanto, a presente invenção também fornece um método para produzir a estrutura de oligo RNA de dupla hélice em que um ligante é adicionalmente ligado à estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo o siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1.[0153] However, the present invention also provides a method for producing the double-stranded RNA oligo structure in which a linker is additionally linked to the double-stranded RNA oligo structure containing the siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1.
[0154] O método para produzir a estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo o siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1 ligado ao ligante de acordo com a presente invenção pode incluir as seguintes etapas:[0154] The method for producing the double-stranded RNA oligo structure containing the siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1 bound to the ligand according to the present invention may include the following steps:
[0155] (1) ligar um material hidrofílico a um suporte sólido contendo um grupo funcional ligado ao mesmo;[0155] (1) attaching a hydrophilic material to a solid support containing a functional group attached thereto;
[0156] (2) sinteti zar uma fita simples de RNA baseada no suporte sólido contendo um grupo funcional-material hidrofílico ligado ao mesmo;[0156] (2) synthesize a single strand of RNA based on the solid support containing a functional group-hydrophilic material attached to it;
[0157] (3) ligar covalentemente um material hidrofílico para extremidade 5’ da fita simples de RNA;[0157] (3) covalently attach a hydrophilic material to the 5' end of the RNA single strand;
[0158] (4) sinteti zar uma fita simples de RNA tendo uma sequência complementar a uma sequência da fita simples de RNA;[0158] (4) synthesizing a single-stranded RNA having a sequence complementary to a sequence of the single-stranded RNA;
[0159] (5) separar uma estrutura de grupo funcional-RNA-polímero e a fita simples de RNA tendo a sequência complementar do suporte sólido quando a síntese da fita simples de RNA é concluída;[0159] (5) separating a functional group-RNA-polymer structure and the single-stranded RNA having the complementary sequence from the solid support when the synthesis of the single-stranded RNA is completed;
[0160] (6) produzir uma estrutura de fita simples de ligante-RNA- polímero ligando um ligante a uma extremidade do material hidrofílico usando o grupo funcional; e[0160] (6) produce a single-stranded linker-RNA-polymer structure by attaching a linker to one end of the hydrophilic material using the functional group; It is
[0161] (7) produzi r a estrutura de ligante-oligo RNA de dupla hélice pelo anelamento da estrutura de ligante-RNA-polímero e uma fita simples de RNA tendo uma sequência complementar à mesma.[0161] (7) produce the double helix RNA linker-oligo structure by annealing the linker-RNA-polymer structure and a single strand of RNA having a sequence complementary to it.
[0162] Depois da etapa (6) acima, quando a produção for concluída, se a estrutura de ligante-oligo RNA de dupla hélice e a fita simples de RNA desejada tendo uma sequência complementar à mesma serão preparadas ou não, pode ser confirmado separando e purificando a estrutura de ligante-RNA-polímero e a fita simples de RNA tendo uma sequência complementar à mesma, e medindo os pesos moleculares por espectrômetro de massa MALDI-TOF. A estrutura de ligante-oligo RNA de dupla hélice pode ser produzida pelo anelamento da estrutura de ligante-RNA-polímero e uma fita simples de RNA tendo uma sequência complementar à mesma. No método de produção, a Etapa (4) que é uma etapa de sintetizar a fita simples de RNA tendo uma sequência complementar a uma sequência da fita simples de RNA sintetizada na Etapa (3), é um processo de síntese independente, e pode ser realizado antes da Etapa (1) ou pode ser realizado durante qualquer etapa de uma das Etapas (1) a (6).[0162] After step (6) above, when production is completed, whether the double helix RNA linker-oligo structure and the desired single-stranded RNA having a sequence complementary to it will be prepared or not can be confirmed by separating and purifying the linker-RNA-polymer structure and the single-stranded RNA having a sequence complementary to it, and measuring the molecular weights by MALDI-TOF mass spectrometer. The double helix RNA linker-oligo structure can be produced by annealing the RNA linker-polymer structure and a single strand of RNA having a sequence complementary to it. In the production method, Step (4), which is a step of synthesizing single-stranded RNA having a sequence complementary to a sequence of single-stranded RNA synthesized in Step (3), is an independent synthesis process, and can be carried out before Step (1) or may be carried out during any step of one of Steps (1) to (6).
[0163] A presente invenção também fornece uma nanopartícula incluindo a estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo o siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1.[0163] The present invention also provides a nanoparticle including double-stranded oligo RNA structure containing siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1.
[0164] Conforme descrito acima, a estrutura de oligo RNA de dupla-hélice contendo o siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1 é estrutura anfipática contendo ambos os materiais hidrofóbicos e materiais hidrofílicos, em que os materiais hidrofílicos têm afinidade por meio de uma interação como uma ligação de hidrogênio, etc., com moléculas de água presentes no corpo para ficar voltado para fora, e os materiais hidrofóbicos estão voltados para dentro através de uma interação hidrofóbica entre os mesmos, formando assim uma nanopartícula termodinamicamente estável. Ou seja, os materiais hidrofóbicos são posicionados no centro da nanopartícula, e os materiais hidrofílicos são posicionados na direção de fora do siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1 para formar nanopartículas protegendo o siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1. Essas nanopartículas formadas melhoram a liberação intracelular de siRNA específico para CTGF, Cyr61, e/ou Plekho1 e melhoram o efeito de siRNA.[0164] As described above, the double-stranded RNA oligo structure containing the siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1 is an amphipathic structure containing both hydrophobic materials and hydrophilic materials, in which the hydrophilic materials have affinity through an interaction such as a hydrogen bond, etc., with water molecules present in the body to face outward, and the hydrophobic materials face inward through a hydrophobic interaction between them, thus forming a thermodynamically stable nanoparticle. That is, hydrophobic materials are positioned in the center of the nanoparticle, and hydrophilic materials are positioned toward the outside of the siRNA specific for CTGF, Cyr61, or Plekho1 to form nanoparticles protecting the siRNA specific for CTGF, Cyr61, or Plekho1. These formed nanoparticles enhance the intracellular release of siRNA specific for CTGF, Cyr61, and/or Plekho1 and improve the effect of siRNA.
[0165] As nanopartículas de acordo com a presente invenção podem ser formadas de apenas a estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo siRNAs cada uma tendo a mesma sequência uma da outra, ou pode ser formada da estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo siRNAs, cada um tendo sequência diferente, em que é interpretado na presente invenção que os siRNAs cada um tendo sequência diferente inclui siRNA tendo genes alvo diferentes, por exemplo, siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1, ou siRNA tendo a mesma especificidade de gene de alvo, mas tendo sequência diferente.[0165] The nanoparticles according to the present invention can be formed from just the double-stranded RNA oligo structure containing siRNAs each having the same sequence as each other, or can be formed from the double-stranded RNA oligo structure containing siRNAs , each having a different sequence, wherein it is interpreted in the present invention that siRNAs each having a different sequence include siRNA having different target genes, for example, siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1, or siRNA having the same target gene specificity. target, but having a different sequence.
[0166] Além disso, a estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo outro siRNA específico de gene relacionado com doenças respiratórias além de siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1 também pode ser incluída nas nanopartículas de acordo com a presente invenção.[0166] Furthermore, the double-stranded RNA oligo structure containing other respiratory disease-related gene-specific siRNA in addition to siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1 can also be included in the nanoparticles according to the present invention.
[0167] Além disso, a presente invenção fornece uma composição para prevenir ou tratar doenças respiratórias, particularmente, fibrose pulmonar idiopática e DPOC, incluindo: o siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1, a estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo o siRNA, e/ou as nanopartículas formadas da estrutura de oligo RNA de dupla hélice.[0167] Furthermore, the present invention provides a composition for preventing or treating respiratory diseases, particularly idiopathic pulmonary fibrosis and COPD, including: the siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1, the double-stranded RNA oligo structure containing the siRNA , and/or the nanoparticles formed from the double helix RNA oligo structure.
[0168] A composição incluindo o siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1 de acordo com a presente invenção, a estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo o siRNA, e/ou a nanopartícula formadas da estrutura de oligo RNA de dupla hélice como componentes eficazes, inibe a remodelação da artéria pulmonar e remodelação das vias respiratórias, de forma que o siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1 ou a composição contendo o siRNA tem efeito de prevenir ou tratar as doenças respiratórias.[0168] The composition including the siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1 according to the present invention, the double-stranded RNA oligo structure containing the siRNA, and/or the nanoparticle formed from the double-stranded RNA oligo structure as components effective, inhibits pulmonary artery remodeling and airway remodeling, so that the siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1 or the composition containing the siRNA has the effect of preventing or treating respiratory diseases.
[0169] Em particular, a composição para prevenir ou tratar doenças respiratórias, incluindo a estrutura de oligo RNA de dupla hélice de acordo com a presente invenção pode incluir:[0169] In particular, the composition for preventing or treating respiratory diseases, including the double-stranded RNA oligo structure according to the present invention may include:
[0170] uma estrutura de oligo RNA de dupla hélice incluindo um siRNA específico para CTGF que inclui uma fita senso incluindo qualquer uma sequência selecionada do grupo que consiste em ID SEQ NOs: 1 a 100 ou 602 a 604 e 301 a 400, preferencialmente, qualquer uma sequência selecionada do grupo que consiste em ID SEQ NOs: 1 a 10, 35, 42, 59, 602 a 604, 301 a 303, 305 a 307, 309, 317, 323 e 329, mais preferencialmente, qualquer uma sequência selecionada do grupo que consiste em ID SEQ NOs: 4, 5, 8, 9, 35, 42, 59, 602 a 604, 301, 303, 307 e 323, mais preferencialmente, qualquer uma sequência de ID SEQ NO: 42, 59, 602 ou 323, e uma fita antissenso incluindo uma sequência complementar para a mesma;[0170] a double-stranded oligo RNA structure including a CTGF-specific siRNA that includes a sense strand including any one sequence selected from the group consisting of ID SEQ NOs: 1 to 100 or 602 to 604 and 301 to 400, preferably, any sequence selected from the group consisting of ID SEQ NOs: 1 to 10, 35, 42, 59, 602 to 604, 301 to 303, 305 to 307, 309, 317, 323 and 329, more preferably, any sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 4, 5, 8, 9, 35, 42, 59, 602 to 604, 301, 303, 307 and 323, more preferably, any sequence of SEQ ID NO: 42, 59, 602 or 323, and an antisense strand including a complementary sequence thereto;
[0171] uma estrutura de oligo RNA de dupla hélice incluindo um siRNA específico para Cyr61 que inclui uma fita senso incluindo qualquer uma sequência selecionada do grupo que consiste em ID SEQ NOs: 101 a 200, e 401 a 500, preferencialmente, qualquer uma sequência selecionada do grupo que consiste em ID SEQ NOs: 101 a 110, 124, 153, 166, 187, 197, 409, 410, 415, 417, 418, 420, 422, 424, 427 e 429, mais preferencialmente, qualquer uma sequência selecionada do grupo que consiste em ID SEQ NOs: 102, 104, 107, 108, 124, 153, 166, 187, 197, 410, 422 e 424, mais preferencialmente, qualquer uma sequência de ID SEQ NO: 124, 153, 187, 197 ou 424, e uma fita antissenso incluindo uma sequência complementar para a mesma; ou[0171] a double-stranded oligo RNA structure including an siRNA specific for Cyr61 that includes a sense strand including any one sequence selected from the group consisting of ID SEQ NOs: 101 to 200, and 401 to 500, preferably any sequence selected from the group consisting of ID SEQ NOs: 101 to 110, 124, 153, 166, 187, 197, 409, 410, 415, 417, 418, 420, 422, 424, 427 and 429, more preferably, any sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 102, 104, 107, 108, 124, 153, 166, 187, 197, 410, 422 and 424, more preferably, any sequence of SEQ ID NO: 124, 153, 187 , 197 or 424, and an antisense strand including a complementary sequence thereto; or
[0172] uma estrutura de oligo RNA de dupla hélice incluindo um siRNA específico para Plekho1 que inclui uma fita senso incluindo qualquer uma sequência selecionada do grupo que consiste em ID SEQ NOs: 201 a 300, e 501 a 600, preferencialmente, qualquer uma sequência selecionada do grupo que consiste em ID SEQ NOs: 201 a 210, 212, 218, 221, 223, 504 a 507, 514, 515 e 522 a 525, mais preferencialmente, qualquer uma sequência selecionada do grupo que consiste em ID SEQ NOs: 206 to 209, 212, 218, 221, 223, 507, 515, e 525, mais preferencialmente, qualquer uma sequência de ID SEQ NO: 212, 218, 221, 223 ou 525, e uma fita antissenso incluindo uma sequência complementar para a mesma.[0172] a double-stranded oligo RNA structure including an siRNA specific for Plekho1 that includes a sense strand including any one sequence selected from the group consisting of ID SEQ NOs: 201 to 300, and 501 to 600, preferably any one sequence selected from the group consisting of ID SEQ NOs: 201 to 210, 212, 218, 221, 223, 504 to 507, 514, 515 and 522 to 525, more preferably, any sequence selected from the group consisting of ID SEQ NOs: 206 to 209, 212, 218, 221, 223, 507, 515, and 525, more preferably, any sequence of SEQ ID NO: 212, 218, 221, 223 or 525, and an antisense strand including a sequence complementary to the same.
[0173] Além disso, a composição para prevenir ou tratar doenças respiratórias, incluindo a estrutura de oligo RNA de dupla hélice de acordo com a presente invenção pode incluir: uma estrutura de oligo RNA de dupla hélice incluindo um siRNA específico para CTGF que inclui uma fita senso de siRNA específico para CTGF humano e de camundongo de acordo com a sequência de ID SEQ NO: 6 ou 8, preferencialmente, ID SEQ NO: 6, e uma fita antissenso incluindo uma sequência complementar para a mesma;[0173] Furthermore, the composition for preventing or treating respiratory diseases, including the double-stranded RNA oligo structure according to the present invention may include: a double-stranded RNA oligo structure including a CTGF-specific siRNA that includes a sense strand of siRNA specific for human and mouse CTGF according to the sequence of SEQ ID NO: 6 or 8, preferably, SEQ ID NO: 6, and an antisense strand including a complementary sequence thereto;
[0174] uma estrutura de oligo RNA de dupla hélice incluindo um siRNA específico para Cyr61 que inclui uma fita senso de siRNA específico para Cyr61 humano e de camundongo de acordo com a sequência de ID SEQ NO: 102, 104 e 105, preferencialmente, ID SEQ NO: 102 e uma fita antissenso incluindo uma sequência complementar para a mesma; ou[0174] a double-stranded oligo RNA structure including an siRNA specific for Cyr61 that includes a sense strand of siRNA specific for human and mouse Cyr61 according to the sequence of ID SEQ NO: 102, 104 and 105, preferably ID SEQ NO: 102 and an antisense strand including a complementary sequence thereto; or
[0175] uma estrutura de oligo RNA de dupla hélice incluindo um siRNA específico para Plekho1 que inclui uma fita senso de siRNA específico para Plekho1 humano e de camundongo de acordo com a sequência de ID SEQ NO: 204, 207 e 208, preferencialmente, ID SEQ NO: 207 e uma fita antissenso incluindo uma sequência complementar para a mesma.[0175] a double-stranded oligo RNA structure including a siRNA specific for Plekho1 that includes a sense strand of siRNA specific for human and mouse Plekho1 according to the sequence of ID SEQ NO: 204, 207 and 208, preferably ID SEQ NO: 207 and an antisense strand including a complementary sequence thereto.
[0176] Além disso, uma estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo o siRNA específico para CTGF, uma estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo o siRNA específico para Cyr61, e/ou uma estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo o siRNA específico para Plekho1 pode ser misturado e incluído na composição, e adicionalmente, siRNA específico para outro gene relacionado às doenças respiratórias além de CTGF, Cry61 ou Plekho1 ou uma estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo o outro siRNA específico para gene relacionado às doenças respiratórias pode também ser incluído na composição de acordo com a presente invenção.[0176] Additionally, a double-stranded RNA oligo structure containing the CTGF-specific siRNA, a double-stranded RNA oligo structure containing the Cyr61-specific siRNA, and/or a double-stranded RNA oligo structure containing the siRNA specific for Plekho1 can be mixed and included in the composition, and additionally, siRNA specific for another respiratory disease-related gene other than CTGF, Cry61 or Plekho1 or a double-stranded RNA oligo structure containing the other siRNA specific for respiratory disease-related gene may also be included in the composition according to the present invention.
[0177] No momento do uso de uma composição para prevenir ou tratar de doenças respiratórias adicionalmente incluindo a estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo o outro siRNA específico de gene relacionado às doenças respiratórias juntamente com o siRNA específico para CTGF, Cyr61, e/ou Plekho1, ou a estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo o siRNA específico para CTGF, Cyr61, e/ou Plekho1, um efeito sinérgico como o de uma terapia de combinação pode ser obtido.[0177] At the time of use of a composition for preventing or treating respiratory diseases additionally including the double-stranded RNA oligo structure containing the other gene-specific siRNA related to respiratory diseases together with the siRNA specific for CTGF, Cyr61, and/or or Plekho1, or the double-stranded RNA oligo structure containing the siRNA specific for CTGF, Cyr61, and/or Plekho1, a synergistic effect like that of a combination therapy can be obtained.
[0178] Exemplos de doenças respiratórias capazes de serem prevenidas ou tratadas pela composição da presente invenção incluem fibrose pulmonar idiopática, asma, doença pulmonar obstrutiva crônica (DPOC), bronquite aguda ou crônica, rinite alérgica, tosse e catarro, infecção do trato respiratório inferior aguda, bronquite, e bronquiolite, infecção aguda do trato respiratório superior, faringite, amigdalite, laringite, etc., mas a presente invenção não é limitada aos mesmos.[0178] Examples of respiratory diseases capable of being prevented or treated by the composition of the present invention include idiopathic pulmonary fibrosis, asthma, chronic obstructive pulmonary disease (COPD), acute or chronic bronchitis, allergic rhinitis, cough and phlegm, lower respiratory tract infection acute, bronchitis, and bronchiolitis, acute upper respiratory tract infection, pharyngitis, tonsillitis, laryngitis, etc., but the present invention is not limited to the same.
[0179] Além disso, as nanopartículas incluídas na composição para prevenir ou tratar as doenças respiratórias, incluindo as nanopartículas formadas da estrutura de oligo RNA de dupla hélice de acordo com a presente invenção podem puramente consistir em apenas qualquer uma estrutura selecionada da estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo o siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1, ou podem ser configurada em uma forma em que dois ou mais tipos de estruturas de oligo RNA de dupla hélice incluindo o siRNA específico para CTGF, Cyr61, ou Plekho1 são misturadas entre si.[0179] Furthermore, nanoparticles included in the composition for preventing or treating respiratory diseases, including nanoparticles formed from the double-stranded RNA oligo structure according to the present invention may purely consist of just any one structure selected from the oligo structure. double-stranded RNA containing the siRNA specific for CTGF, Cyr61, or Plekho1, or can be configured in a form in which two or more types of double-stranded RNA oligo structures including the siRNA specific for CTGF, Cyr61, or Plekho1 are mixed together. yes.
[0180] A composição da presente invenção pode ser preparada adicionalmente incluindo pelo menos um transportador farmaceuticamente aceitável além dos componentes eficazes. O transportador farmaceuticamente aceitável é necessário para ser compatível com os componentes eficazes da presente invenção, e pode ser usado através da mistura de um ou mais componentes selecionados de solução salina, água esterilizada, solução de Ringer, solução salina tamponada, solução de dextrose, solução de maltodextrina, glicerol e etanol, e outros aditivos convencionais como antioxidante, tampão, fungistat e afins, podem ser adicionados aos mesmos conforme necessário. Além disso, a composição pode ser preparada como uma formulação para injeção, como uma solução aquosa, suspensão, emulsão e afins, adicionando diluente, dispersante, tensoativo, aglutinante e lubrificante aos mesmos. Em particular, é preferencial fornecer a composição preparada como uma formulação liofilizada. Para preparar a formulação liofilizada, qualquer método que geralmente é conhecido no campo técnico da presente invenção pode ser utilizado, em que um estabilizador para liofilização pode ser adicionado à mesma. Além disso, métodos apropriados na técnica ou um método divulgado em Remington’s pharmaceutical Science, Mack Publishing Company, or Easton PA pode ser preferencialmente utilizado para formulação dependendo de cada doença ou componente.[0180] The composition of the present invention can be prepared by additionally including at least one pharmaceutically acceptable carrier in addition to the effective components. The pharmaceutically acceptable carrier is required to be compatible with the effective components of the present invention, and can be used by mixing one or more components selected from saline, sterile water, Ringer's solution, buffered saline, dextrose solution, of maltodextrin, glycerol and ethanol, and other conventional additives such as antioxidant, buffer, fungistat and the like, can be added thereto as necessary. Furthermore, the composition can be prepared as an injection formulation, such as an aqueous solution, suspension, emulsion and the like, by adding diluent, dispersant, surfactant, binder and lubricant thereto. In particular, it is preferred to provide the prepared composition as a lyophilized formulation. To prepare the lyophilized formulation, any method that is generally known in the technical field of the present invention can be used, in which a stabilizer for lyophilization can be added thereto. Furthermore, appropriate methods in the art or a method disclosed in Remington's pharmaceutical Science, Mack Publishing Company, or Easton PA may preferably be used for formulation depending on each disease or component.
[0181] O método de dosagem e administração dos componentes eficazes, etc, incluídos na composição farmacêutica da presente invenção pode ser determinado com base nos sintomas do paciente geral e gravidade da doença e por especialistas na técnica. Além disso, a composição pode ser formulada com vários tipos como pó, comprimido, cápsula, solução, injeção, pomada, xarope, e afins e pode ser fornecida como uma unidade de dose ou um recipiente de dose múltipla, por exemplo, uma ampola selada, garrafa e afins.[0181] The method of dosing and administering the effective components, etc., included in the pharmaceutical composition of the present invention can be determined based on the patient's general symptoms and severity of the disease and by those skilled in the art. Furthermore, the composition may be formulated with various types such as powder, tablet, capsule, solution, injection, ointment, syrup, and the like and may be provided as a unit dose or a multiple dose container, e.g., a sealed ampoule. , bottle and the like.
[0182] A composição farmacêutica da presente invenção pode ser administrada por via oral ou por via parenteral. Exemplos de uma via de administração da composição farmacêutica de acordo com a presente invenção podem incluir administração oral, intravenosa, intramuscular, intra-arterial, intramedular, intradural, intracardíaca, transdérmica, subcutânea, intraperitoneal, intestinal, sublingual ou tópica, mas a presente invenção não é limitada à mesma. Particularmente, a via de administração também pode incluir administração no pulmão através da infusão de gotejamento em órgãos respiratórios para tratamento de doenças respiratórias. A quantidade de administração da composição pode ter várias faixas dependendo do peso, idade, gênero, condição de saúde, dieta, tempo de administração, método, taxa de excreção, gravidade da doença, e afins, de um paciente, e pode ser facilmente determinado por uma especialista em geral na técnica. Além disso, a composição da presente invenção pode ser formulada em uma forma farmacêutica apropriada usando tecnologias conhecidas para administração clínica.[0182] The pharmaceutical composition of the present invention can be administered orally or parenterally. Examples of a route of administration of the pharmaceutical composition according to the present invention may include oral, intravenous, intramuscular, intra-arterial, intramedullary, intradural, intracardiac, transdermal, subcutaneous, intraperitoneal, intestinal, sublingual or topical administration, but the present invention is not limited to it. Particularly, the route of administration may also include administration into the lung through drip infusion into respiratory organs for treating respiratory diseases. The administration amount of the composition may have various ranges depending on a patient's weight, age, gender, health condition, diet, administration time, method, excretion rate, disease severity, and the like, and can be easily determined. by a general expert in the art. Furthermore, the composition of the present invention can be formulated into an appropriate pharmaceutical form using known technologies for clinical administration.
[0183] Além disso, a presente invenção fornece um método para prevenir ou tratar doenças respiratórias, particularmente, fibrose pulmonar idiopática e DPOC, incluindo: administrar a estrutura de oligo RNA de dupla hélice de acordo com a presente invenção e as nanopartículas incluindo a estrutura de oligo RNA de dupla hélice a um paciente que requer esse tratamento.[0183] Furthermore, the present invention provides a method for preventing or treating respiratory diseases, particularly idiopathic pulmonary fibrosis and COPD, including: administering the double-stranded RNA oligo structure according to the present invention and the nanoparticles including the structure of double-stranded RNA oligo to a patient requiring this treatment.
[0184] Adiante, a presente invenção será descrita em detalhes com referência aos Exemplos a seguir. Estes exemplos são apenas para exemplificar a presente invenção, e será óbvio para os especialistas na técnica que o escopo da presente invenção não é interpretado no sentido de limitar-se a estes exemplos.[0184] Below, the present invention will be described in detail with reference to the following Examples. These examples are only to exemplify the present invention, and it will be obvious to those skilled in the art that the scope of the present invention is not construed to be limited to these examples.
[0185] Exemplo 1. Projeto da sequência alvo de CTGF, Cyr61 ou Plekho1 e produção de siRNA[0185] Example 1. Design of the CTGF, Cyr61 or Plekho1 target sequence and siRNA production
[0186] 604 tipos de sequências alvo (fitas senso) capazes de serem ligadas à sequência de mRNA do gene CTGF (Homo sapiens) (NM_001901), sequência de mRNA do gene Cyr61 (Homo sapiens) (NM_001554), sequência de mRNA do gene Plekho1 (Homo sapiens) (NM_016274), sequência de mRNA do gene CTGF (Mus musculus) (NM_010217), sequência de mRNA do gene Cyr61 (Mus musculus) (NM_010516), ou sequência de mRNA do gene Plekho1 (Mus musculus) (NM_023320) foram projetados, e siRNAs de fitas antissenso tendo sequências complementares para as sequências alvo foram produzidos.[0186] 604 types of target sequences (sense strands) capable of being linked to the mRNA sequence of the CTGF gene (Homo sapiens) (NM_001901), mRNA sequence of the Cyr61 gene (Homo sapiens) (NM_001554), mRNA sequence of the gene Plekho1 (Homo sapiens) (NM_016274), CTGF gene (Mus musculus) mRNA sequence (NM_010217), Cyr61 gene (Mus musculus) mRNA sequence (NM_010516), or Plekho1 gene (Mus musculus) mRNA sequence (NM_023320 ) were designed, and antisense stranded siRNAs having sequences complementary to the target sequences were produced.
[0187] Pr imeiro, um programa de projeto de gene (Turbo si-Designer) desenvolvido por Bioneer Co., foi usado para projetar a sequência alvo para a qual o siRNA é capaz de ser ligado de sequências de mRNA de genes correspondentes. O siRNA para os genes relacionados com doença respiratória de acordo com a presente invenção tem uma estrutura de fita dupla incluindo uma fita senso que consiste em 19 nucleotídeos e uma fita antissenso complementar à mesma. Além disso, siCONT (tendo sequência de ID SEQ NO: 601 como uma fita senso) que é siRNA tendo uma sequência em que a expressão de qualquer gene não é inibida, foi produzido. O siRNA foi produzido por ligação fosfodiéster formando uma estrutura de RNA usando β-cianoetil fosforamidite (Nucleic Acids Research, 12:4539-4557, 1984). Especificamente, um produto de reação incluindo RNA tendo um comprimento desejado foi obtido pela repetição de uma série de processos de desbloqueio, acoplamento, oxidação e proteção, sobre um suporte sólido ao qual o nucleotídeo está ligado, usando sintetizador de RNA (384 Synthesizer, BIONEER, Korea). RNA do produto de reação foi separado e purificado por HPLC LC918 (Japan Analytical Industry, Japan) equipado com coluna Daisogel C18 (Daiso, Japan), e foi confirmado se o RNA purificado atende ou não à sequência alvo pelo espectrômetro de massa MALDI-TOF (Shimadzu, Japan). Então, o siRNA de dupla hélice desejado (ID SEQ NOs: 1 a 604) foi produzido pela ligação da fita senso de RNA para fita antissenso de RNA.[0187] First, a gene design program (Turbo si-Designer) developed by Bioneer Co., was used to design the target sequence to which the siRNA is capable of being ligated from corresponding gene mRNA sequences. The siRNA for respiratory disease-related genes according to the present invention has a double-stranded structure including a sense strand consisting of 19 nucleotides and an antisense strand complementary thereto. Furthermore, siCONT (having sequence of SEQ ID NO: 601 as a sense strand) which is siRNA having a sequence in which the expression of any gene is not inhibited, was produced. siRNA was produced by phosphodiester linkage forming an RNA structure using β-cyanoethyl phosphoramidite (Nucleic Acids Research, 12:4539-4557, 1984). Specifically, a reaction product including RNA having a desired length was obtained by repeating a series of unblocking, coupling, oxidation and protection processes, on a solid support to which the nucleotide is attached, using RNA synthesizer (384 Synthesizer, BIONEER , Korea). RNA from the reaction product was separated and purified by HPLC LC918 (Japan Analytical Industry, Japan) equipped with a Daisogel C18 column (Daiso, Japan), and it was confirmed whether or not the purified RNA meets the target sequence by MALDI-TOF mass spectrometer (Shimadzu, Japan). Then, the desired double-stranded siRNA (SEQ ID NOs: 1 to 604) was produced by ligating the sense strand of RNA to the antisense strand of RNA.
[0188] Exemplo 2. Produção da estrutura de oligo RNA de dupla hélice (PEG-SAMiRNA).[0188] Example 2. Production of double-stranded oligo RNA (PEG-SAMiRNA) structure.
[0189] A estrutura de oligo RNA de dupla hélice (PEG-SAMiRNA) produzida na presente invenção tem uma estrutura representada pela seguinte Fórmula Estrutural (16): Fórmula Estrutural 16 C24-5’-S-3’-PEG AS[0189] The double-stranded oligo RNA (PEG-SAMiRNA) structure produced in the present invention has a structure represented by the following Structural Formula (16): Structural Formula 16 C24-5'-S-3'-PEG AS
[0190] Na Fórmula Estrutural (16), S é uma fita senso de siRNA; AS é uma fita antissenso de siRNA; PEG é um material hidrofílico, ou seja, polietileno glicol; C24 é um material hidrofóbico e tetradocosano incluindo uma ligação dissulfeto; e 5’ e 3’ significam direções da extremidade de oligo RNA de dupla hélice.[0190] In Structural Formula (16), S is a sense strand of siRNA; AS is an antisense strand of siRNA; PEG is a hydrophilic material, that is, polyethylene glycol; C24 is a hydrophobic tetradocosane material including a disulfide bond; and 5' and 3' mean double-stranded oligo RNA end directions.
[0191] A fita senso de siRNA da Fórmula Estrutural (16) foi produzida sintetizando uma estrutura de oligo RNA de dupla hélice-material hidrofílico de uma fita senso em que polietileno glicol é ligado à extremidade 3’ pelo método acima descrito no qual fosfodiéster se liga formando uma estrutura de RNA estão ligados usando β-cianoetil fosforamidite, com base em 3’ polietileno glicol (PEG, Mn=2.000)-CPG produzido no Exemplo 1 da Publicação Aberta de Patente Coreana Korean No. 10-2012-0119212, como suporte, e ligando tetradocosano incluindo uma ligação dissulfeto para a extremidade 5’, produzindo assim uma fita senso de uma estrutura de RNA-polímero desejada. Para uma fita antissenso na qual o anelamento é realizado com a fita senso, a fita antissenso tendo uma sequência complementar para a fita senso foi produzida pela reação acima descrita.[0191] The siRNA sense strand of Structural Formula (16) was produced by synthesizing a double helix RNA oligo structure-hydrophilic material of a sense strand in which polyethylene glycol is attached to the 3' end by the method described above in which phosphodiester is alloy forming an RNA structure are linked using β-cyanoethyl phosphoramidite, based on 3' polyethylene glycol (PEG, Mn=2,000)-CPG produced in Example 1 of Korean Patent Open Publication No. 10-2012-0119212, as support, and tetradocosane ligand including a disulfide bond to the 5' end, thereby producing a sense strand of a desired RNA-polymer structure. For an antisense strand in which annealing is performed with the sense strand, the antisense strand having a sequence complementary to the sense strand was produced by the reaction described above.
[0192] Quando a síntese foi concluída, a fita única de RNA e a estrutura de RNA-polímero sintetizada por tratamento de 28%(v/v) amônia em banho de água a 60°C foi separada de CPG e frações de proteção foram retiradas da mesma por uma reação de desproteção, respectivamente. A fita única de RNA e a estrutura de RNA- polímero da qual as frações de proteção foram removidas foram tratadas com N-metilpirrolidona, trietilamina e trietilaminatrihidrofluoreto em uma razão de volume de 10:3:4 em estufa a 70°C, para remover 2' TBDMS(tert-butildimetilsilil).[0192] When the synthesis was completed, the single-stranded RNA and the RNA-polymer structure synthesized by treatment of 28% (v/v) ammonia in a water bath at 60°C were separated from CPG and protection fractions were removed from it by a deprotection reaction, respectively. The single-stranded RNA and the RNA-polymer backbone from which the protective moieties were removed were treated with N-methylpyrrolidone, triethylamine and triethylaminetrihydrofluoride in a volume ratio of 10:3:4 in an oven at 70°C to remove 2' TBDMS(tert-butyldimethylsilyl).
[0193] RNA do produto de reação foi separado e purificado por HPLC LC918 (Japan Analytical Industry, Japan) equipado com coluna Daisogel C18 (Daiso, Japan), e foi confirmado se o RNA purificado atende ou não à sequência alvo pelo espectrômetro de massa MALDI-TOF (Shimadzu, Japan). Então, para produzir cada estrutura de oligo RNA de dupla hélice, a fita senso e fita antissenso cada uma que tendo a mesma quantidade foram misturadas entre si, colocadas em 1X tampão de anelamento (30mM HEPES, 100 mM acetato de potássio, 2mM acetato de magnésio, pH 7,0 ~ 7,5), e reagiu em um banho de água de temperatura constante a 90°C por 3 minutos, e reagiu novamente em 37°C , produzindo, assim, cada estrutura de oligo RNA de dupla hélice incluindo siRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 42, 59, 602, 124, 153, 187, 197, 212, 218, 221, 223, 323, 424, 525 ou 601 como a fita senso (doravante referido como SAMiRNALP-hCTGF, SAMiRNALP- hCyr, SAMiRNALP-hPlek, SAMiRNALP-mCTGF, SAMiRNALP-mCyr, e SAMiRNALP-mPlek SAMiRNALP-CONT, respectivamente). Foi confirmado que a estrutura de oligo RNA de dupla hélice produzida foi anelada por eletroforese.[0193] RNA from the reaction product was separated and purified by HPLC LC918 (Japan Analytical Industry, Japan) equipped with a Daisogel C18 column (Daiso, Japan), and it was confirmed whether or not the purified RNA meets the target sequence by mass spectrometer MALDI-TOF (Shimadzu, Japan). Then, to produce each double-stranded RNA oligo structure, the sense strand and antisense strand each having the same amount were mixed together, placed in 1X annealing buffer (30mM HEPES, 100mM potassium acetate, 2mM potassium acetate). magnesium, pH 7.0 ~ 7.5), and reacted in a constant temperature water bath at 90°C for 3 minutes, and reacted again at 37°C, thus producing each double-stranded RNA oligo structure including siRNA having sequence ID SEQ NO: 42, 59, 602, 124, 153, 187, 197, 212, 218, 221, 223, 323, 424, 525 or 601 as the sense strand (hereinafter referred to as SAMiRNALP-hCTGF, SAMiRNALP-hCyr, SAMiRNALP-hPlek, SAMiRNALP-mCTGF, SAMiRNALP-mCyr, and SAMiRNALP-mPlek SAMiRNALP-CONT, respectively). It was confirmed that the double-stranded RNA oligo structure produced was annealed by electrophoresis.
[0194] Exemplo 3. Produção de estrutura de oligo RNA de dupla hélice melhorada (Mono-HEG-SAMiRNA).[0194] Example 3. Production of improved double-stranded oligo RNA structure (Mono-HEG-SAMiRNA).
[0195] A estrutura de oligo RNA de dupla hélice melhorada produzida na presente invenção é obtida usando [PO3--hexaetileno glicol]4 (doravante referido como ‘Mono-HEG-SAMiRNA’, ver Fórmula Estrutural (17)) que é o bloco de material hidrofílico em vez de usar PEG que é o material hidrofílico, e a seguinte Fórmula Estrutural (17). Fórmula Estrutural 17 C24-5’-S-3’-[(Hexa Etileno Glicol)-PO3-]4 AS[0195] The improved double-stranded oligo RNA structure produced in the present invention is obtained using [PO3--hexaethylene glycol]4 (hereinafter referred to as 'Mono-HEG-SAMiRNA', see Structural Formula (17)) which is the building block of hydrophilic material instead of using PEG which is the hydrophilic material, and the following Structural Formula (17). Structural Formula 17 C24-5’-S-3’-[(Hexa Ethylene Glycol)-PO3-]4 AS
[0196] Na Fórmula Estrutural (17), S é uma fita senso de siRNA; AS é uma fita antissenso de siRNA; [Hexa Etileno Glicol]4 é um monômero de material hidrofílico; C24 é um material hidrofóbico e tetradocosano incluindo uma ligação dissulfeto; e 5 ‘e 3’ significam direções da extremidade de fita senso de oligo RNA de dupla hélice.[0196] In Structural Formula (17), S is a sense strand of siRNA; AS is an antisense siRNA strand; [Hexa Ethylene Glycol]4 is a hydrophilic material monomer; C24 is a hydrophobic tetradocosane material including a disulfide bond; and 5' and 3' mean sense strand end directions of double helix RNA oligo.
[0197] A estrutura da Mono-HEG SAMiRNA de acordo com a Fórmula Estrutural (17) pode ser representada pela seguinte Fórmula Estrutural (18): [0197] The structure of Mono-HEG SAMiRNA according to Structural Formula (17) can be represented by the following Structural Formula (18):
[0198] RNA do produto de reação foi separado e purificado por HPLC LC918 (Japan Analytical Industry, Japan) equipado com coluna Daisogel C18 (Daiso, Japan), e foi confirmado se o RNA purificado atende ou não à sequência alvo pelo espectrômetro de massa MALDI-TOF (Shimadzu, Japan). Então, para produzir cada estrutura de oligo RNA de dupla hélice, a fita senso e fita antissenso cada uma tendo a mesma quantidade foram misturadas entre si, colocadas em 1X tampão de anelamento (30 mM HEPES, 100 mM acetato de potássio, 2 mM acetato de magnésio, pH 7,0 ~ 7,5), e reagiu em um banho de água de temperatura constante a 90°C por 3 minutos, e reagiu novamente em 37°C , produzindo, assim, cada estrutura de oligo RNA de dupla hélice incluindo siRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 42, 59, 602, 124, 153, 187, 197, 212, 218, 221, 223, 323, 424, 525 ou 601 como a fita senso (doravante referido como Mono-HEG-SAMiRNALP-hCTGF, Mono-HEG-SAMiRNALP-hCyr, Mono-HEG-SAMiRNALP-hPlek, Mono-HEG-SAMiRNALP-mCTGF, Mono-HEG- SAMiRNALP-mCyr, Mono-HEG-SAMiRNALP-mPlek, e Mono-HEG-SAMiRNALP- CONT, respectivamente). Foi confirmado que a estrutura de oligo RNA de dupla hélice produzida foi anelada por eletroforese.[0198] RNA from the reaction product was separated and purified by HPLC LC918 (Japan Analytical Industry, Japan) equipped with a Daisogel C18 column (Daiso, Japan), and it was confirmed whether or not the purified RNA meets the target sequence by mass spectrometer MALDI-TOF (Shimadzu, Japan). Then, to produce each double-stranded RNA oligo structure, the sense strand and antisense strand each having the same amount were mixed together, placed in 1X annealing buffer (30 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 2 mM acetate magnesium, pH 7.0 ~ 7.5), and reacted in a constant temperature water bath at 90°C for 3 minutes, and reacted again at 37°C, thus producing each double-stranded RNA oligo structure helix including siRNA having sequence of SEQ ID NO: 42, 59, 602, 124, 153, 187, 197, 212, 218, 221, 223, 323, 424, 525 or 601 as the sense strand (hereinafter referred to as Mono-HEG -SAMiRNALP-hCTGF, Mono-HEG-SAMiRNALP-hCyr, Mono-HEG-SAMiRNALP-hPlek, Mono-HEG-SAMiRNALP-mCTGF, Mono-HEG-SAMiRNALP-mCyr, Mono-HEG-SAMiRNALP-mPlek, and Mono-HEG- SAMiRNALP- CONT, respectively). It was confirmed that the double-stranded RNA oligo structure produced was annealed by electrophoresis.
[0199] Exemplo 4. Produção de nanopartículas formadas de estrutura de oligo RNA de dupla hélice melhorada (Mono-HEG- SAMiRNA) e medição do tamanho da mesma[0199] Example 4. Production of nanoparticles formed from improved double helix oligo RNA structure (Mono-HEG-SAMiRNA) and measurement of their size
[0200] A estrutura de oligo RNA de dupla hélice (Mono-HEG- SAMiRNA) produzida pelo Exemplo 3 forma uma nanopartícula, ou seja, micela por uma interação hidrofóbica entre os materiais hidrofóbicos ligados à extremidade do oligo RNA de dupla hélice (FIG. 1).[0200] The double helix RNA oligo structure (Mono-HEG-SAMiRNA) produced by Example 3 forms a nanoparticle, that is, micelle by a hydrophobic interaction between the hydrophobic materials linked to the end of the double helix RNA oligo (FIG. 1).
[0201] Foi confirmado que as nanopartículas (SAMiRNA) formadas de Mono-SAMiRNA-HEG correspondente foram formadas através da análise de PDI (índice de polidispersividade) das nanopartículas formadas de Mono-HEG-SAMiRNA-hCTGF, Mono-HEG-SAMiRNA-hCyr, Mono- HEG-SAMiRNA-hPlek, Mono-HEG-SAMiRNA-mCTGF, Mono-HEG-SAMiRNA- mCyr, Mono-HEG-SAMiRNA-mPlek e Mono-HEG-SAMiRNA-CONT.[0201] It was confirmed that the corresponding Mono-SAMiRNA-HEG nanoparticles (SAMiRNA) were formed by analyzing the PDI (polydispersity index) of the nanoparticles formed from Mono-HEG-SAMiRNA-hCTGF, Mono-HEG-SAMiRNA-hCyr , Mono-HEG-SAMiRNA-hPlek, Mono-HEG-SAMiRNA-mCTGF, Mono-HEG-SAMiRNA- mCyr, Mono-HEG-SAMiRNA-mPlek and Mono-HEG-SAMiRNA-CONT.
[0202] Exemplo 4-1. Produção de nanopartículas[0202] Example 4-1. Nanoparticle production
[0203] O Mono-HEG-SAMiRNA-hCTGF foi dissolvido em 1,5 mL DPBS (Solução Salina Tamponada com Fosfato de Dulbecco) em uma concentração de 50 μg/mL, a mistura obtida foi liofilizada em condição de -75°C e 5mTorr por 48 horas para produzir pó de nanopartículas, e o pó de nanopartículas foi dissolvido em DPBS que é um solvente para a produção de nanopartículas homogeneizadas. As nanopartículas formadas de Mono-HEG-SAMiRNA- hCyr, Mono-HEG-SAMiRNA-hPlek, Mono-HEG-SAMiRNA-mCTGF, Mono-HEG- SAMiRNA-mCyr, Mono-HEG-SAMiRNA-mPlek, e Mono-HEG-SAMiRNA-CONT foram produzidas pelo mesmo método.[0203] Mono-HEG-SAMiRNA-hCTGF was dissolved in 1.5 mL DPBS (Dulbecco's Phosphate Buffered Saline Solution) at a concentration of 50 μg/mL, the mixture obtained was lyophilized at -75°C and 5mTorr for 48 hours to produce nanoparticle powder, and the nanoparticle powder was dissolved in DPBS which is a solvent for producing homogenized nanoparticles. Nanoparticles formed from Mono-HEG-SAMiRNA-hCyr, Mono-HEG-SAMiRNA-hPlek, Mono-HEG-SAMiRNA-mCTGF, Mono-HEG-SAMiRNA-mCyr, Mono-HEG-SAMiRNA-mPlek, and Mono-HEG-SAMiRNA -CONT were produced by the same method.
[0204] Exemplo 4-2. Medição do tamanho e índice de polidispersividade (PDI) de nanopartículas[0204] Example 4-2. Measurement of size and polydispersity index (PDI) of nanoparticles
[0205] Um tamanho da nanopartícula foi medido pela medição do potencial zeta. Um tamanho das nanopartículas homogeneizadas produzidas pelo Exemplo 4-1 foi medido pela medição do potencial zeta (Nano-ZS, MALVERN, England), sob condições em que um índice de refração do material é 1,459, um índice de absorção é 0,001, uma temperatura de um solvente: DPBS é 25°C e a viscosidade correspondente e índice de refração são 1,0200 e 1,335, respectivamente. Uma vez que a medição foi realizada por uma medição de tamanho incluindo repetição 15 vezes e então repetindo 6 vezes.[0205] A nanoparticle size was measured by measuring the zeta potential. The size of the homogenized nanoparticles produced by Example 4-1 was measured by measuring the zeta potential (Nano-ZS, MALVERN, England), under conditions in which a refractive index of the material is 1.459, an absorption index is 0.001, a temperature of a solvent: DPBS is 25°C and the corresponding viscosity and refractive index are 1.0200 and 1.335, respectively. Once the measurement was carried out by a size measurement including repeating 15 times and then repeating 6 times.
[0206] Como o valor PDI é reduzido, as partículas correspondentes se tornam uniformemente distribuídas, e assim, poderia ser apreciado que as nanopartículas da presente invenção têm um tamanho significativamente uniforme.[0206] As the PDI value is reduced, the corresponding particles become uniformly distributed, and thus, it could be appreciated that the nanoparticles of the present invention have a significantly uniform size.
[0207] Exemplo 5. Confirmação da inibição da expressão do gene alvo usando siRNA específico de gene alvo para o humano em linhagem de célula de fibroblasto humano (MRC-5).[0207] Example 5. Confirmation of inhibition of target gene expression using human target gene-specific siRNA in human fibroblast cell line (MRC-5).
[0208] O fibroblasto humano (MRC-5) que é uma linhagem de célula de fibroblasto foi transformado por siRNAs tendo sequências de ID SEQ NOs: 1 a 10, 101 a 110, 201 a 210 e 601 produzidas pelo Exemplo 1 como a fita senso, e o aspecto da expressão do gene alvo foi analisado em linhagem de célula de fibroblasto transformada (MRC-5).[0208] Human fibroblast (MRC-5) which is a fibroblast cell line was transformed by siRNAs having sequences of SEQ ID NOs: 1 to 10, 101 to 110, 201 to 210 and 601 produced by Example 1 as the strand sense, and the expression aspect of the target gene was analyzed in a transformed fibroblast cell line (MRC-5).
[0209] Exemplo 5-1. Cultura da linhagem de célula de fibroblasto humano[0209] Example 5-1. Human fibroblast cell line culture
[0210] Uma linhagem de célula de fibroblasto humano (MRC-5) obtida do banco de linhagem Korean Cell (KCLB) foi cultivada em meio de cultura RPMI-1640 (GIBCO/Invitrogen, USA, 10% (v/v) soro fetal bovino, penicilina 100 unidades/ml e 100 μg/mL de estreptomicina) sob condição de 37°C e 5%(v/v) CO2.[0210] A human fibroblast cell line (MRC-5) obtained from the Korean Cell line bank (KCLB) was cultured in RPMI-1640 culture medium (GIBCO/Invitrogen, USA, 10% (v/v) fetal serum bovine, penicillin 100 units/ml and 100 μg/mL streptomycin) under conditions of 37°C and 5%(v/v) CO2.
[0211] Exemplo 5-2. Transfecção de siRNA alvo em linhagem de célula de fibroblasto humano[0211] Example 5-2. Transfection of targeted siRNA into human fibroblast cell line
[0212] 1,8x105 linhagens de célula de fibroblasto (MRC-5) cultivadas pelo Exemplo 5-1 foram cultivadas em meio RPMI 1640 por 18 horas na placa de 6 poços sob condição de 37°C e 5 %(v/v) CO2, e o meio foi removido, e 500 μl de meio Opti-MEM (GIBCO, USA) para cada poço foram dispensados.[0212] 1.8x105 fibroblast cell lines (MRC-5) cultured by Example 5-1 were cultivated in RPMI 1640 medium for 18 hours in the 6-well plate under condition of 37°C and 5% (v/v) CO2, and the medium was removed, and 500 μl of Opti-MEM medium (GIBCO, USA) for each well was dispensed.
[0213] Enquanto isso, 3,5 μl de Lipofectamine™ RNAi Max (Invitrogen, USA) foram misturados com 246,5 μl de meio Opti-MEM para preparar uma solução mista, e a solução mista foi reagida em temperatura ambiente por 5 minutos. Soluções de siRNA cada uma tendo uma concentração final de 5 ou 20 nM foram preparadas pela adição de 5 ou 20 μl de siRNAs (1 pmole/μl) tendo sequências de ID SEQ NOs: 1 a 10, 101 a 110, 201 a 210 e 601 pelo Exemplo 1, como fita senso, a 230 μl do meio Opti-MEM. A mistura Lipofectamine™ RNAi Max e a solução de siRNA foram misturadas e reagidas em temperatura ambiente por 15 minutos, desse modo preparando uma solução para transfecção.[0213] Meanwhile, 3.5 μl of Lipofectamine™ RNAi Max (Invitrogen, USA) was mixed with 246.5 μl of Opti-MEM medium to prepare a mixed solution, and the mixed solution was reacted at room temperature for 5 minutes . siRNA solutions each having a final concentration of 5 or 20 nM were prepared by adding 5 or 20 μl of siRNAs (1 pmole/μl) having sequences from SEQ ID NOs: 1 to 10, 101 to 110, 201 to 210, and 601 by Example 1, as sense tape, in 230 μl of Opti-MEM medium. The Lipofectamine™ RNAi Max mixture and siRNA solution were mixed and reacted at room temperature for 15 minutes, thereby preparing a solution for transfection.
[0214] Em seguida, 500 μl de cada solução de transfecção foram dispensados em cada poço da linhagem de célula de tumor contendo Opti-MEM dispensado aqui, e cultivado por 6 horas, e o meio Opti-MEM foi removido. Aqui, 1 ml de meio de cultura RPMI 1640 foi dispensado no mesmo e cultivado sob condição de 37°C e 5%(v/v) CO2 por 24 horas.[0214] Then, 500 μl of each transfection solution was dispensed into each well of the tumor cell line containing Opti-MEM dispensed here, and cultured for 6 hours, and the Opti-MEM medium was removed. Here, 1 ml of RPMI 1640 culture medium was dispensed into it and cultivated under the condition of 37°C and 5%(v/v) CO2 for 24 hours.
[0215] Exemplo 5-3. Análise quantitativa do mRNA do gene alvo[0215] Example 5-3. Quantitative analysis of target gene mRNA
[0216] cDNA foi produzido pela extração do RNA total da linhagem de célula transfectada pelo Exemplo 5-2, e uma quantidade de expressão de mRNA do gene alvo foi submetida à quantificação relativa por PCR em tempo real.[0216] cDNA was produced by extracting total RNA from the cell line transfected by Example 5-2, and an amount of target gene mRNA expression was subjected to relative quantification by real-time PCR.
[0217] Exemplo 5-3-1. Separação do RNA da célula transfectada e produção de cDNA[0217] Example 5-3-1. Separation of RNA from the transfected cell and production of cDNA
[0218] O RNA total foi extraído da linhagem de célula transfectada do Exemplo 5-2 pelo kit de extração de RNA (kit de extração de RNA total AccuPrep Cell, BIONEER, Korea), e o RNA extraído foi usado para produzir cDNA por transcriptase reversa de RNA (AccuPower CycleScript RT Premix/dT20, Bioneer, Korea) de acordo com o seguinte método. Especificamente, 1 μg do RNA extraído por cada tubo foi adicionado para AccuPower CycleScript RT Premix/dT20(Bioneer, Korea) contido em 0,25 μl tubo Eppendorf, e água destilada tratada com DEPC (dietil pirocarbonato) foi adicionada a fim de ter um volume total de 20 μl. Um processo de hibridização de RNA e iniciadores em 30°C por 1 minuto por um amplificador de gene (MyGenie™ 96 Gradient Thermal Block, BIONEER, Korea) e um processo para produzir cDNA em 52°C por 4 minutos foram repetidos 6 vezes, e então, uma reação de amplificação foi completada inativando a enzima em 90°C por 5 minutos.[0218] Total RNA was extracted from the transfected cell line of Example 5-2 by the RNA extraction kit (AccuPrep Cell total RNA extraction kit, BIONEER, Korea), and the extracted RNA was used to produce cDNA by transcriptase reverse RNA (AccuPower CycleScript RT Premix/dT20, Bioneer, Korea) according to the following method. Specifically, 1 μg of the extracted RNA per tube was added to AccuPower CycleScript RT Premix/dT20(Bioneer, Korea) contained in 0.25 μl Eppendorf tube, and distilled water treated with DEPC (diethyl pyrocarbonate) was added in order to have a total volume of 20 μl. A process of hybridizing RNA and primers at 30°C for 1 minute by a gene amplifier (MyGenie™ 96 Gradient Thermal Block, BIONEER, Korea) and a process for producing cDNA at 52°C for 4 minutes were repeated 6 times, and then, an amplification reaction was completed by inactivating the enzyme at 90°C for 5 minutes.
[0219] Exemplo 5-3-2. Análise quantitativa relativa do mRNA do gene alvo[0219] Example 5-3-2. Relative quantitative analysis of target gene mRNA
[0220] Uma quantidade relativa do mRNA do gene relacionado com doença respiratória foi quantificada pelo método seguinte através de PCR em tempo real tendo o cDNA produzido pelo Exemplo 5-3-1, como um modelo. cDNA produzido pelo Exemplo 5-3-1 foi diluído 5 vezes com água destilada em cada poço da placa de 96 poços. Então, 3 μl do cDNA diluído, 25 μl de 2 x GreenStar™ PCR Master Mix (BIONEER, Korea), 19 μl de água destilada, e 3μ^' de iniciadores de qPCR (Tabela 2; F e R cada um tendo 10 pmole/μl; BIONEER, Korea) foram adicionados aos mesmos para preparar cada solução mista. Enquanto isso, RPL13A (proteína ribossômica L13a) que é um gene housekeeping (doravante referido como gene HK) foi determinado como um gene padrão para normalizar a quantidade de expressão do mRNA do gene alvo. A reação a seguir foi feita em uma placa de 96 poços contendo a mistura Exicycler™96 Real-Time Quantitative Thermal Block (BIONEER, Korea). Após a reação em 95°C por 15 minutos para ativar a enzima e remover uma estrutura secundária do cDNA, quatro processos, incluindo um processo de desnaturação em 94°C por 30 segundos, um processo de anelamento em 58°C por 30 segundos, um processo de extensão em 72°C por 30 segundos, e um processo de varredura de SYBR green foram repetidos 42 vezes, e extensão final foi realizada em 72°C por 3 minutos. Em seguida, a temperatura foi mantida em 55°C por 1 minuto, e uma curva de fusão foi analisada de 55°C até 95°C. Depois de o PCR ser concluído, para o valor Ct (ciclo limite) para cada um do gene alvo obtido, valores de Ct do gene alvo corrigido pelo gene GAPDH foram calculados, e então a diferença (ΔCt) foi obtida usando um grupo de teste tratado com siRNA (ID SEQ NO: 601, siCONT) tendo uma sequência de controle prevenindo a inibição da expressão do gene, como um grupo de controle.[0220] A relative amount of respiratory disease-related gene mRNA was quantified by the following method through real-time PCR with the cDNA produced by Example 5-3-1 as a template. cDNA produced by Example 5-3-1 was diluted 5-fold with distilled water in each well of the 96-well plate. Then, 3 μl of the diluted cDNA, 25 μl of 2 x GreenStar™ PCR Master Mix (BIONEER, Korea), 19 μl of distilled water, and 3μ^' of qPCR primers (Table 2; F and R each having 10 pmole /μl; BIONEER, Korea) were added to them to prepare each mixed solution. Meanwhile, RPL13A (ribosomal protein L13a) which is a housekeeping gene (hereinafter referred to as HK gene) was determined as a standard gene to normalize the expression amount of target gene mRNA. The following reaction was performed in a 96-well plate containing Exicycler™96 Real-Time Quantitative Thermal Block mixture (BIONEER, Korea). After the reaction at 95°C for 15 minutes to activate the enzyme and remove a secondary structure from the cDNA, four processes, including a denaturation process at 94°C for 30 seconds, an annealing process at 58°C for 30 seconds, an extension process at 72°C for 30 seconds, and a SYBR green scanning process were repeated 42 times, and final extension was performed at 72°C for 3 minutes. Then, the temperature was maintained at 55°C for 1 minute, and a melting curve was analyzed from 55°C to 95°C. After the PCR was completed, for the Ct value (threshold cycle) for each of the target gene obtained, Ct values of the target gene corrected by the GAPDH gene were calculated, and then the difference (ΔCt) was obtained using a test group treated with siRNA (SEQ ID NO: 601, siCONT) having a control sequence preventing inhibition of gene expression, as a control group.
[0221] A quantidade de expressão do gene alvo da célula tratada com o siRNA específico para CTGF (Homo sapiens) (tendo sequência de ID SEQ NOs: 1 a 10 como a fita senso) foi quantificada relativamente usando o valor ΔCt e fórmula de cálculo 2 (-ΔCt)x 100 (FIG. 2A). Além disso, a quantidade de expressão do gene alvo da célula tratada com o siRNA específico para Cyr61 (Homo sapiens) (tendo sequência de ID SEQ NOs: 101 a 110 como a fita senso) foi relativamente quantificada (FIG. 2B), e a quantidade de expressão do gene alvo da célula tratada com o siRNA específico para Plekho1 (Homo sapiens) (tendo sequência de ID SEQ NOs: 201 a 210 como a fita senso) foi relativamente quantificada (FIG. 2C). Como resultado, pode ser confirmado que os vários tipos de siRNA da presente invenção mostraram alto nível de inibição da expressão do gene alvo. Além disso, a fim de selecionar siRNA com alta eficiência, siRNAs tendo sequências de ID SEQ NOs: 1, 3, 4, 8, 9, 10, 102, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 204, 206, 207, 208, 209 e 210, em que a quantidade de expressão de mRNA para cada gene na concentração de 5 nM é significativamente diminuída, como fita senso, foram selecionados.[0221] The amount of expression of the target gene of the cell treated with the siRNA specific for CTGF (Homo sapiens) (having sequence ID SEQ NOs: 1 to 10 as the sense strand) was relatively quantified using the ΔCt value and calculation formula 2 (-ΔCt)x 100 (FIG. 2A). Furthermore, the amount of target gene expression of the cell treated with the Cyr61 (Homo sapiens)-specific siRNA (having sequence ID SEQ NOs: 101 to 110 as the sense strand) was relatively quantified (FIG. 2B), and the The amount of expression of the target gene of the cell treated with the siRNA specific for Plekho1 (Homo sapiens) (having sequence ID SEQ NOs: 201 to 210 as the sense strand) was relatively quantified (FIG. 2C). As a result, it can be confirmed that the various types of siRNA of the present invention showed high level of inhibition of target gene expression. Furthermore, in order to select siRNA with high efficiency, siRNAs having ID sequences SEQ NOs: 1, 3, 4, 8, 9, 10, 102, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 204, 206, 207, 208, 209 and 210, in which the amount of mRNA expression for each gene at a concentration of 5 nM is significantly decreased, as sense strand, were selected.
[0222] Tabela 2 sequências de iniciador de qPCR (m, Mus musculus; h, Homo sapiens. F, iniciador direto; R - iniciador reverso) [0222] Table 2 qPCR primer sequences (m, Mus musculus; h, Homo sapiens. F, forward primer; R - reverse primer)
[0223] Exemplo 6. Seleção de siRNA específico para gene alvo para humanos com alta eficiência em linhagem de célula de fibroblasto humano (MRC-5)[0223] Example 6. Selection of human target gene-specific siRNA with high efficiency in human fibroblast cell line (MRC-5)
[0224] A linhagem de célula de fibroblasto humano (MRC-5) foi transformada usando siRNAs tendo sequências de ID SEQ NOs: 1, 3, 4, 8, 9, 10, 102, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 204, 206, 207, 208, 209, 210 e 601 selecionadas pelo Exemplo 5-3-2, como a fita senso, e o aspecto da expressão do gene alvo foi analisado na linhagem de célula de fibroblasto transformado (MRC-5) para selecionar siRNA com alta eficiência.[0224] The human fibroblast cell line (MRC-5) was transformed using siRNAs having sequences from SEQ ID NOs: 1, 3, 4, 8, 9, 10, 102, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 204, 206, 207, 208, 209, 210 and 601 selected by Example 5-3-2, as the sense strand, and the target gene expression aspect was analyzed in the transformed fibroblast cell line (MRC-5 ) to select siRNA with high efficiency.
[0225] Exemplo 6-1. Cultura da linhagem de célula de fibroblasto humano[0225] Example 6-1. Human fibroblast cell line culture
[0226] A linhagem de célula de fibroblasto humano (MRC-5) obtida do banco de linhagem Korean Cell (KCLB, Korea) foi cultivada sob a mesma condição do Exemplo 5-1.[0226] The human fibroblast cell line (MRC-5) obtained from the Korean Cell lineage bank (KCLB, Korea) was cultured under the same condition as Example 5-1.
[0227] Exemplo 6-2. Transfecção de siRNA alvo em linhagem de célula de fibroblasto humano[0227] Example 6-2. Transfection of targeted siRNA into human fibroblast cell line
[0228] 1,8x105 linhagens de célula de fibroblasto (MRC-5) cultivadas pelo Exemplo 6-1 foram cultivadas em meio RPMI 1640 por 18 horas na placa de 6 poços sob condição de 37°C e 5 %(v/v) CO2, e o meio foi removido, e 500 μl de meio Opti-MEM (GIBCO, USA) para cada poço foram dispensados.[0228] 1.8x105 fibroblast cell lines (MRC-5) cultivated by Example 6-1 were cultivated in RPMI 1640 medium for 18 hours in the 6-well plate under condition of 37°C and 5% (v/v) CO2, and the medium was removed, and 500 μl of Opti-MEM medium (GIBCO, USA) for each well was dispensed.
[0229] Enquanto isso, 3,5 μl de Lipofectamine™ RNAi Max (Invitrogen, USA) foram misturados com 246,5 μl de meio Opti-MEM para preparar uma solução mista, e a solução mista foi reagida em temperatura ambiente por 5 minutos. Soluções de siRNA cada uma tendo uma concentração final de 0,2 ou 1 nM foram preparadas pela adição de 0,2 ou 1 μl de siRNAs (1 pmole/μl) tendo sequências de ID SEQ NOs: 1, 3, 4, 8, 9, 10, 102, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 204, 206, 207, 208, 209, 210 e 601 pelo Exemplo 1, como a fita senso, a 230 μl do meio Opti-MEM. A mistura Lipofectamine™ RNAi Max e a solução de siRNA foram misturadas e reagidas em temperatura ambiente por 15 minutos, desse modo preparando uma solução para transfecção.[0229] Meanwhile, 3.5 μl of Lipofectamine™ RNAi Max (Invitrogen, USA) was mixed with 246.5 μl of Opti-MEM medium to prepare a mixed solution, and the mixed solution was reacted at room temperature for 5 minutes . siRNA solutions each having a final concentration of 0.2 or 1 nM were prepared by adding 0.2 or 1 μl of siRNAs (1 pmole/μl) having sequences of SEQ ID NOs: 1, 3, 4, 8, 9, 10, 102, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 204, 206, 207, 208, 209, 210 and 601 by Example 1, as the sense tape, at 230 μl of Opti-MEM medium. The Lipofectamine™ RNAi Max mixture and siRNA solution were mixed and reacted at room temperature for 15 minutes, thereby preparing a solution for transfection.
[0230] Em seguida, 500 μl de cada solução de transfecção foram dispensados em cada poço da linhagem de célula de tumor contendo Opti-MEM dispensado aqui, e cultivado por 6 horas, e o meio Opti-MEM foi removido. Aqui, 1 ml de meio de cultura RPMI 1640 foi dispensado no mesmo e cultivado sob condição de 37°C e 5%(v/v) CO2 por 24 horas.[0230] Then, 500 μl of each transfection solution was dispensed into each well of the tumor cell line containing Opti-MEM dispensed here, and cultured for 6 hours, and the Opti-MEM medium was removed. Here, 1 ml of RPMI 1640 culture medium was dispensed into it and cultivated under the condition of 37°C and 5%(v/v) CO2 for 24 hours.
[0231] Exemplo 6-3. Análise quantitativa do mRNA do gene alvo[0231] Example 6-3. Quantitative analysis of target gene mRNA
[0232] cDNA foi produzido pela extração do RNA total da linhagem de célula transfectada pelo Exemplo 6-2 através do mesmo método do Exemplo 4-3, e uma quantidade de expressão de mRNA do gene alvo foi submetida à quantificação relativa por PCR em tempo real. A quantidade de inibição da expressão do gene alvo de acordo com o tratamento de siRNA de baixa concentração foi observada para confirmar claramente cada eficácia de siRNA, e foi confirmado que siRNAs tendo sequência de ID SEQ NOs: 8, 107 e 206 da fita senso mostraram um nível relativamente alto de inibição para a expressão do gene alvo mesmo em concentrações significativamente mais baixas (FIG. 3).[0232] cDNA was produced by extracting total RNA from the cell line transfected by Example 6-2 through the same method as Example 4-3, and an amount of mRNA expression of the target gene was subjected to relative quantification by time-lapse PCR real. The amount of inhibition of target gene expression according to low-concentration siRNA treatment was observed to clearly confirm each siRNA efficacy, and it was confirmed that siRNAs having SEQ ID sequence NOs: 8, 107 and 206 of the sense strand showed a relatively high level of inhibition for target gene expression even at significantly lower concentrations (FIG. 3).
[0233] Exemplo 7. Confirmação da inibição da expressão do gene alvo usando siRNA específico de gene alvo para o humano em linhagem de célula de câncer de pulmão humano (A549).[0233] Example 7. Confirmation of inhibition of target gene expression using human target gene-specific siRNA in human lung cancer cell line (A549).
[0234] A linhagem de célula de câncer de pulmão humano (A549) que é uma linhagem de célula de tumor de pulmão foi transformada por siRNAs tendo sequências de ID SEQ NOs: 35, 42, 59, 602, 603, 604, 124, 153, 166, 187, 197, 212, 218, 221, 223 e 601 produzido pelo Exemplo 1 como a fita senso, e o aspecto da expressão do gene alvo foi analisado na linhagem de célula de câncer de pulmão transformada (A549).[0234] The human lung cancer cell line (A549) which is a lung tumor cell line was transformed by siRNAs having sequences of SEQ ID NOs: 35, 42, 59, 602, 603, 604, 124, 153, 166, 187, 197, 212, 218, 221, 223 and 601 produced by Example 1 as the sense strand, and the expression aspect of the target gene was analyzed in the transformed lung cancer cell line (A549).
[0235] Exemplo 7-1. Cultura da linhagem de célula de câncer de pulmão humano[0235] Example 7-1. Human lung cancer cell line culture
[0236] Uma linhagem de célula de câncer de pulmão humano (A549) obtida de American Type Culture Collection (ATCC) foi cultivada em meio de cultura DMEM (GIBCO/Invitrogen, USA, 10% (v/v) soro fetal bovino, penicilina 100 unidades/ml e 100 μg/mL de estreptomicina) sob condição de 37°C e 5%(v/v) CO2.[0236] A human lung cancer cell line (A549) obtained from American Type Culture Collection (ATCC) was cultured in DMEM culture medium (GIBCO/Invitrogen, USA, 10% (v/v) fetal bovine serum, penicillin 100 units/ml and 100 μg/mL streptomycin) under conditions of 37°C and 5%(v/v) CO2.
[0237] Exemplo 7-2. Transfecção de siRNA alvo em linhagem de célula de câncer de pulmão humano[0237] Example 7-2. Transfection of targeted siRNA into human lung cancer cell line
[0238] 1,2x105 linhagens de célula de câncer de pulmão (A549) cultivadas pelo Exemplo 7-1 foram cultivadas em meio DMEM 1640 por 18 horas na placa de 6 poços sob condição de 37°C e 5 %(v/v) CO2, e o meio foi removido, e 500 μl de meio Opti-MEM (GIBCO, USA) para cada poço foram dispensados.[0238] 1.2x105 lung cancer cell lines (A549) cultured by Example 7-1 were cultivated in DMEM 1640 medium for 18 hours in the 6-well plate under condition of 37°C and 5% (v/v) CO2, and the medium was removed, and 500 μl of Opti-MEM medium (GIBCO, USA) for each well was dispensed.
[0239] Enquanto isso, 3,5 μl de Lipofectamine™ RNAi Max (Invitrogen, USA) foram misturados com 246,5 μl de meio Opti-MEM para preparar uma solução mista, e a solução mista foi reagida em temperatura ambiente por 5 minutos. Soluções de siRNA cada uma tendo uma concentração final de 5nM, 1nM, 0,5nM, 0,2nM ou 0,04nM foram preparadas pela adição de 1 μl de siRNAs (1 pmole/μl) tendo sequências de ID SEQ NOs: 35, 42, 59, 602, 603, 604, 124, 153, 166, 187, 197, 212, 218, 221 e 223 pelo Exemplo 1, como fita senso, a 230 μl do meio Opti-MEM. A mistura Lipofectamine™ RNAi Max e a solução de siRNA foram misturadas e reagidas em temperatura ambiente por 15 minutos, desse modo preparando uma solução para transfecção.[0239] Meanwhile, 3.5 μl of Lipofectamine™ RNAi Max (Invitrogen, USA) was mixed with 246.5 μl of Opti-MEM medium to prepare a mixed solution, and the mixed solution was reacted at room temperature for 5 minutes . siRNA solutions each having a final concentration of 5nM, 1nM, 0.5nM, 0.2nM or 0.04nM were prepared by adding 1 μl of siRNAs (1 pmole/μl) having sequences of SEQ ID NOs: 35, 42 , 59, 602, 603, 604, 124, 153, 166, 187, 197, 212, 218, 221 and 223 by Example 1, as sense tape, at 230 μl of Opti-MEM medium. The Lipofectamine™ RNAi Max mixture and siRNA solution were mixed and reacted at room temperature for 15 minutes, thereby preparing a solution for transfection.
[0240] Em seguida, 500 μl de cada solução de transfecção foram dispensados em cada poço da linhagem de célula de tumor contendo Opti-MEM dispensado aqui, e cultivado por 6 horas, e o meio Opti-MEM foi removido. Aqui, 1 ml de meio de cultura RPMI 1640 foi dispensado no mesmo e cultivado sob condição de 37°C e 5%(v/v) CO2 por 24 horas.[0240] Then, 500 μl of each transfection solution was dispensed into each well of the tumor cell line containing Opti-MEM dispensed here, and cultured for 6 hours, and the Opti-MEM medium was removed. Here, 1 ml of RPMI 1640 culture medium was dispensed into it and cultured under the condition of 37°C and 5%(v/v) CO2 for 24 hours.
[0241] Exemplo 7-3. Análise quantitativa do mRNA do gene alvo[0241] Example 7-3. Quantitative analysis of target gene mRNA
[0242] cDNA foi produzido pela extração do RNA total da linhagem de célula transfectada pelo Exemplo 7-2, e uma quantidade de expressão de mRNA do gene alvo foi submetida à quantificação relativa por PCR em tempo real.[0242] cDNA was produced by extracting total RNA from the cell line transfected by Example 7-2, and an amount of target gene mRNA expression was subjected to relative quantification by real-time PCR.
[0243] Exemplo 7-3-1. Separação do RNA da célula transfectada e produção de cDNA[0243] Example 7-3-1. Separation of RNA from the transfected cell and production of cDNA
[0244] O RNA total foi extraído da linhagem de célula transfectada do Exemplo 5-2 pelo kit de extração de RNA (kit de extração de RNA total AccuPrep Cell, BIONEER, Korea), e o RNA extraído foi usado para produzir cDNA por transcriptase reversa de RNA (AccuPower CycleScript RT Premix/dT20, Bioneer, Korea) de acordo com o seguinte método. Especificamente, 1 μg do RNA extraído por cada tubo foi adicionado para AccuPower CycleScript RT Premix/dT20(Bioneer, Korea) contido em 0,25 μl tubo Eppendorf, e água destilada tratada com DEPC (dietil pirocarbonato) foi adicionada a fim de ter um volume total de 20 μl. Um processo de hibridização de RNA e iniciadores em 30°C por 1 minuto por um amplificador de gene (MyGenie™ 96 Gradient Thermal Block, BIONEER, Korea) e um processo para produzir cDNA em 52°C por 4 minutos foram repetidos 6 vezes, e então, uma reação de amplificação foi completada inativando a enzima em 90°C por 5 minutos.[0244] Total RNA was extracted from the transfected cell line of Example 5-2 by the RNA extraction kit (AccuPrep Cell total RNA extraction kit, BIONEER, Korea), and the extracted RNA was used to produce cDNA by transcriptase reverse RNA (AccuPower CycleScript RT Premix/dT20, Bioneer, Korea) according to the following method. Specifically, 1 μg of the extracted RNA per tube was added to AccuPower CycleScript RT Premix/dT20(Bioneer, Korea) contained in 0.25 μl Eppendorf tube, and distilled water treated with DEPC (diethyl pyrocarbonate) was added in order to have a total volume of 20 μl. A process of hybridizing RNA and primers at 30°C for 1 minute by a gene amplifier (MyGenie™ 96 Gradient Thermal Block, BIONEER, Korea) and a process for producing cDNA at 52°C for 4 minutes were repeated 6 times, and then, an amplification reaction was completed by inactivating the enzyme at 90°C for 5 minutes.
[0245] Exemplo 7-3-2. Análise quantitativa relativa do mRNA do gene alvo[0245] Example 7-3-2. Relative quantitative analysis of target gene mRNA
[0246] Uma quantidade relativa do mRNA do gene relacionado com doença respiratória foi quantificada pelo método seguinte através de PCR em tempo real tendo o cDNA produzido pelo Exemplo 7-3-1 como um modelo. cDNA produzido pelo Exemplo 6-3-1 foi diluído 5 vezes com água destilada em cada poço da placa de 96 poços. Então, 3 μl do cDNA diluído, 25 μl de 2 x GreenStar™ PCR Master Mix (BIONEER, Korea), 19 μl de água destilada, e 3 μl de iniciadores de qPCR (Tabela 2; F e R cada um tendo 10 pmole/μl; BIONEER, Korea) foram adicionados aos mesmos para preparar cada solução mista. Enquanto isso, RPL13A (proteína ribossômica L13a) que é um gene housekeeping (doravante referido como gene HK) foi determinado como um gene padrão para normalizar a quantidade de expressão do mRNA do gene alvo. A reação a seguir foi feita em uma placa de 96 poços contendo a mistura Exicycler™96 Real-Time Quantitative Thermal Block (BIONEER, Korea). Após a reação em 95°C por 15 minutos para ativar a enzima e remover uma estrutura secundária do cDNA, quatro processos, incluindo um processo de desnaturação em 94°C por 30 segundos, um processo de anelamento em 58°C por 30 segundos, um processo de extensão em 72°C por 30 segundos, e um processo de varredura de SYBR green foram repetidos 42 vezes, e extensão final foi realizada em 72°C por 3 minutos. Em seguida, a temperatura foi mantida em 55°C por 1 minuto, e uma curva de fusão foi analisada de 55°C até 95°C. Depois de o PCR ser concluído, para o valor Ct (ciclo limite) para cada um do gene alvo obtido, valores de Ct do gene alvo corrigido pelo gene GAPDH foram calculados, e então a diferença (ΔCt) foi obtida usando um grupo de teste tratado com siRNA (ID SEQ NO: 601, siCONT) tendo uma sequência de controle prevenindo a inibição da expressão do gene, como um grupo de controle.[0246] A relative amount of respiratory disease-related gene mRNA was quantified by the following method via real-time PCR with the cDNA produced by Example 7-3-1 as a template. cDNA produced by Example 6-3-1 was diluted 5-fold with distilled water in each well of the 96-well plate. Then, 3 μl of the diluted cDNA, 25 μl of 2 x GreenStar™ PCR Master Mix (BIONEER, Korea), 19 μl of distilled water, and 3 μl of qPCR primers (Table 2; F and R each having 10 pmole/ μl; BIONEER, Korea) were added to them to prepare each mixed solution. Meanwhile, RPL13A (ribosomal protein L13a) which is a housekeeping gene (hereinafter referred to as HK gene) was determined as a standard gene to normalize the expression amount of target gene mRNA. The following reaction was performed in a 96-well plate containing Exicycler™96 Real-Time Quantitative Thermal Block mixture (BIONEER, Korea). After the reaction at 95°C for 15 minutes to activate the enzyme and remove a secondary structure from the cDNA, four processes, including a denaturation process at 94°C for 30 seconds, an annealing process at 58°C for 30 seconds, an extension process at 72°C for 30 seconds, and a SYBR green scanning process were repeated 42 times, and final extension was performed at 72°C for 3 minutes. Then, the temperature was maintained at 55°C for 1 minute, and a melting curve was analyzed from 55°C to 95°C. After the PCR was completed, for the Ct value (threshold cycle) for each of the target gene obtained, Ct values of the target gene corrected by the GAPDH gene were calculated, and then the difference (ΔCt) was obtained using a test group treated with siRNA (SEQ ID NO: 601, siCONT) having a control sequence preventing inhibition of gene expression, as a control group.
[0247] A quantidade de expressão do gene alvo da célula tratada com o siRNA específico para CTGF (Homo sapiens) (tendo sequência de ID SEQ NOs: 132, 42, 59, 602, 603, 604 como a fita senso) foi quantificada relativamente usando o valor ΔCt e fórmula de cálculo 2 (-ΔCt) x 100 (FIG. 4A). Além disso, a quantidade de expressão do gene alvo da célula tratada com o siRNA específico para Cyr61 (Homo sapiens) (tendo sequência de ID SEQ NOs: 124, 153, 166, 187, e 197 como a fita senso) foi relativamente quantificada (FIG. 4B), e a quantidade de expressão do gene alvo da célula tratada com o siRNA específico para Plekho1 (Homo sapiens) (tendo sequência de ID SEQ NOs: 212, 218, 221, e 223 como a fita senso) foi relativamente quantificada (FIG. 4C).[0247] The amount of expression of the target gene of the cell treated with the siRNA specific for CTGF (Homo sapiens) (having sequence ID SEQ NOs: 132, 42, 59, 602, 603, 604 as the sense strand) was quantified relatively using the ΔCt value and calculation formula 2 (-ΔCt) x 100 (FIG. 4A). Furthermore, the amount of target gene expression from the cell treated with the Cyr61 (Homo sapiens)-specific siRNA (having sequence ID SEQ NOs: 124, 153, 166, 187, and 197 as the sense strand) was relatively quantified ( FIG. 4B), and the amount of target gene expression of the cell treated with the siRNA specific for Plekho1 (Homo sapiens) (having sequence ID SEQ NOs: 212, 218, 221, and 223 as the sense strand) was relatively quantified. (FIG. 4C).
[0248] Como resultado, pode ser confirmado que os vários tipos de siRNA da presente invenção mostraram alto nível de inibição da expressão do gene alvo. Além disso, a fim de selecionar siRNA com alta eficiência, siRNAs tendo sequências de ID SEQ NOs: 42, 59, 602, 124, 153, 187, 197, 212, 218, 221 e 223, em que a quantidade de expressão de mRNA para cada gene na concentração de 5 nM é significativamente diminuída, como fita senso, foram selecionados.[0248] As a result, it can be confirmed that the various types of siRNA of the present invention showed high level of inhibition of target gene expression. Furthermore, in order to select siRNA with high efficiency, siRNAs having sequences ID SEQ NOs: 42, 59, 602, 124, 153, 187, 197, 212, 218, 221 and 223, wherein the amount of mRNA expression for each gene at 5 nM concentration is significantly decreased, such as sense strand, were selected.
[0249] Exemplo 8. Inibição da expressão do gene alvo em linhagem de célula de câncer de pulmão humano (A549) por nanopartículas (SAMiRNA), formada de estrutura de polímero oligo de dupla hélice[0249] Example 8. Inhibition of target gene expression in human lung cancer cell line (A549) by nanoparticles (SAMiRNA), formed from double helix oligo polymer structure
[0250] Linhagem de célula de câncer de pulmão humano (A549) foi transformada usando as nanopartículas formadas de SAMiRNA LP incluindo siRNA tendo sequências de ID SEQ NOs: 42, 59, 602, 124, 153, 187, 197, 212, 218, 221 e 223 selecionado pelo Exemplo 7-3-2 como a fita senso, e o aspecto da expressão do gene alvo foi analisado na linhagem de célula de câncer de pulmão transformada (A549).[0250] Human lung cancer cell line (A549) was transformed using nanoparticles formed from SAMiRNA LP including siRNA having sequences of SEQ ID NOs: 42, 59, 602, 124, 153, 187, 197, 212, 218, 221 and 223 selected by Example 7-3-2 as the sense strand, and the expression aspect of the target gene was analyzed in the transformed lung cancer cell line (A549).
[0251] Exemplo 8-1. Cultura da linhagem de célula de câncer de pulmão humano[0251] Example 8-1. Human lung cancer cell line culture
[0252] Linhagem de célula de câncer de pulmão humano (A549) obtida de American Type Culture Collection (ATCC) foi cultivada sob a mesma condição como Exemplo 7-1.[0252] Human lung cancer cell line (A549) obtained from American Type Culture Collection (ATCC) was cultured under the same condition as Example 7-1.
[0253] Exemplo 8-2. Transfecção de SAMiRNA alvo em linhagem de célula de câncer de pulmão humano[0253] Example 8-2. Transfection of targeted SAMiRNA into human lung cancer cell line
[0254] 1,2x105 linhagens de célula de câncer de pulmão (A549) cultivadas pelo Exemplo 8-1 foram cultivadas em meio RPMI 1640 por 18 horas em placa de 12 poços sob condição de 37°C e 5 %(v/v) CO2, e o meio foi removido, e a mesma quantidade de meio Opti-MEM (GIBCO, USA) para cada poço foi dispensada. 100 μl de meio Opti-MEM e SAMiRNALP e monoSAMiRNALP produzidos pelo Exemplo 4-2 foram adicionados a DPBS em uma concentração de 50 μg, a mistura obtida foi liofilizada em -75°C e condição de 5mTorr por 48 horas pelo mesmo método do Exemplo 5-1 para produzir nanopartículas homogeneizadas. Em seguida, cada poço da linhagem de células de tumor em que o Opti-MEM é dispensado foi tratado com uma solução de transfecção em uma concentração de 200 nM, e cultivado em 37°C e 5%(v/v) CO2 para o total de 48 horas.[0254] 1.2x105 lung cancer cell lines (A549) cultured by Example 8-1 were cultivated in RPMI 1640 medium for 18 hours in a 12-well plate under condition of 37°C and 5% (v/v) CO2, and the medium was removed, and the same amount of Opti-MEM medium (GIBCO, USA) for each well was dispensed. 100 μl of Opti-MEM medium and SAMiRNALP and monoSAMiRNALP produced by Example 4-2 were added to DPBS at a concentration of 50 μg, the obtained mixture was lyophilized at -75°C and 5mTorr condition for 48 hours by the same method as in Example 5-1 to produce homogenized nanoparticles. Next, each well of the tumor cell line into which Opti-MEM is dispensed was treated with a transfection solution at a concentration of 200 nM, and cultured at 37°C and 5%(v/v) CO2 to the total of 48 hours.
[0255] Exemplo 8-3. Análise quantitativa relativa do mRNA do gene alvo[0255] Example 8-3. Relative quantitative analysis of target gene mRNA
[0256] cDNA foi produzido pela extração do RNA total da linhagem de célula transfectada pelo Exemplo 8-2 através do mesmo método do Exemplo 6-3, e uma quantidade de expressão de mRNA do gene alvo foi submetida à quantificação relativa por PCR em tempo real. A quantidade de inibição da expressão do gene alvo de acordo com o tratamento de siRNA de baixa concentração foi observada para confirmar claramente cada eficácia de siRNA, e foi confirmado que siRNAs tendo sequência de ID SEQ NOs: 42, 59 e 602 da fita senso mostraram um nível relativamente alto de inibição para a expressão do gene alvo mesmo em concentrações significativamente mais baixas (FIG. 5).[0256] cDNA was produced by extracting total RNA from the cell line transfected by Example 8-2 through the same method as Example 6-3, and an amount of mRNA expression of the target gene was subjected to relative quantification by time-lapse PCR real. The amount of inhibition of target gene expression according to low-concentration siRNA treatment was observed to clearly confirm each siRNA efficacy, and it was confirmed that siRNAs having SEQ ID sequence NOs: 42, 59 and 602 of the sense strand showed a relatively high level of inhibition for target gene expression even at significantly lower concentrations (FIG. 5).
[0257] Exemplo 9. Confirmação da inibição da expressão do gene alvo usando siRNA específico de gene alvo para camundongo em linhagem de célula de fibroblasto de camundongo (NIH3T3).[0257] Example 9. Confirmation of inhibition of target gene expression using mouse target gene-specific siRNA in mouse fibroblast cell line (NIH3T3).
[0258] O fibroblasto de camundongo (NIH3T3) que é uma linhagem de célula de fibroblasto foi transformado por siRNAs tendo sequências de ID SEQ NOs: 301 a 330, 401 a 430, 501 a 530 e 601 produzidas pelo Exemplo 1 como a fita senso, e o aspecto da expressão do gene alvo foi analisado em linhagem de célula de fibroblasto transformada (NIH3T3).[0258] Mouse fibroblast (NIH3T3) which is a fibroblast cell line was transformed by siRNAs having sequences of SEQ ID NOs: 301 to 330, 401 to 430, 501 to 530 and 601 produced by Example 1 as the sense strand , and the expression aspect of the target gene was analyzed in transformed fibroblast cell line (NIH3T3).
[0259] Exemplo 9-1. Cultura da linhagem de célula de fibroblasto de camundongo[0259] Example 9-1. Mouse fibroblast cell line culture
[0260] Uma linhagem de célula de fibroblasto de camundongo (NIH3T3) obtida de American Type Culture Collection (ATCC) foi cultivada em meio de cultura RPMI-1640 (GIBCO/Invitrogen, USA, 10% (v/v) soro fetal bovino, penicilina 100 unidades/ml e 100 μg/mL de estreptomicina) sob condição de 37°C e 5%(v/v) CO2.[0260] A mouse fibroblast cell line (NIH3T3) obtained from American Type Culture Collection (ATCC) was cultured in RPMI-1640 culture medium (GIBCO/Invitrogen, USA, 10% (v/v) fetal bovine serum, penicillin 100 units/ml and 100 μg/mL streptomycin) under conditions of 37°C and 5%(v/v) CO2.
[0261] Exemplo 9-2. Transfecção de siRNA alvo em linhagem de células de fibroblasto de camundongo[0261] Example 9-2. Transfection of targeted siRNA into mouse fibroblast cell line
[0262] 1x105 linhagens de célula de fibroblasto (NIH3T3) cultivadas pelo Exemplo 9-1 foram cultivadas em meio RPMI 1640 por 18 horas na placa de 12 poços sob condição de 37°C e 5 %(v/v) CO2, e o meio foi removido, e 500 μl de meio Opti-MEM (GIBCO, USA) para cada poço foram dispensados.[0262] 1x105 fibroblast cell lines (NIH3T3) cultivated by Example 9-1 were cultivated in RPMI 1640 medium for 18 hours in the 12-well plate under condition of 37°C and 5% (v/v) CO2, and the Medium was removed, and 500 μl of Opti-MEM medium (GIBCO, USA) to each well was dispensed.
[0263] Enquanto isso, 1,5 μl de Lipofectamine™ RNAi Max (Invitrogen, USA) foram misturados com 248,5 μl de meio Opti-MEM para preparar uma solução mista, e a solução mista foi reagida em temperatura ambiente por 5 minutos. 5 ou 20 μl de siRNAs (1 pmole/μl) tendo sequências de ID SEQ NOs: 301 a 330, 401 a 430, 501 a 530 e 601 produzida pelo Exemplo 1, como fita senso, foram adicionados a 230 μl do meio Opti-MEM, assim preparando soluções de siRNA cada uma tendo uma concentração final de 5 ou 20 nM. A mistura Lipofectamine™ RNAi Max e a solução de siRNA foram misturadas e reagidas em temperatura ambiente por 20 minutos, desse modo preparando uma solução para transfecção.[0263] Meanwhile, 1.5 μl of Lipofectamine™ RNAi Max (Invitrogen, USA) was mixed with 248.5 μl of Opti-MEM medium to prepare a mixed solution, and the mixed solution was reacted at room temperature for 5 minutes . 5 or 20 μl of siRNAs (1 pmole/μl) having sequences of ID SEQ NOs: 301 to 330, 401 to 430, 501 to 530 and 601 produced by Example 1, as sense strand, were added to 230 μl of Opti-medium. MEM, thus preparing siRNA solutions each having a final concentration of 5 or 20 nM. The Lipofectamine™ RNAi Max mixture and siRNA solution were mixed and reacted at room temperature for 20 minutes, thereby preparing a solution for transfection.
[0264] Em seguida, 500 μl de cada solução de transfecção foram dispensados em cada poço da linhagem de célula de tumor contendo Opti-MEM dispensado aqui, e cultivado por 6 horas, e o meio Opti-MEM foi removido. Aqui, 1 ml de meio de cultura RPMI 1640 foi dispensado no mesmo e cultivado sob condição de 37°C e 5%(v/v) CO2 por 24 horas.[0264] Then, 500 μl of each transfection solution was dispensed into each well of the tumor cell line containing Opti-MEM dispensed here, and cultured for 6 hours, and the Opti-MEM medium was removed. Here, 1 ml of RPMI 1640 culture medium was dispensed into it and cultivated under the condition of 37°C and 5%(v/v) CO2 for 24 hours.
[0265] Exemplo 9-3. Análise quantitativa do mRNA do gene alvo[0265] Example 9-3. Quantitative analysis of target gene mRNA
[0266] cDNA foi produzido pela extração do RNA total da linhagem de célula transfectada pelo Exemplo 9-2 através do mesmo método do Exemplo 5-3, e uma quantidade de expressão de mRNA do gene alvo foi submetida à quantificação relativa por PCR em tempo real.[0266] cDNA was produced by extracting total RNA from the cell line transfected by Example 9-2 through the same method as Example 5-3, and an amount of mRNA expression of the target gene was subjected to relative quantification by time-lapse PCR real.
[0267] A quantidade de expressão do gene alvo da célula tratada com o siRNA específico para CTGF (Mus musculus) (tendo sequência de ID SEQ NOs: 301 a 330 como a fita senso) foi relativamente quantificada (FIG. 6A). Além disso, a quantidade de expressão do gene alvo da célula tratada com o siRNA específico para Cyr61 (Mus musculus) (tendo sequência de ID SEQ NOs: 401 a 430 como a fita senso) foi relativamente quantificada (FIG. 6B), e a quantidade de expressão do gene alvo da célula tratada com o siRNA específico para Plekho1 (Mus musculus) (tendo sequência de ID SEQ NOs: 501 a 530 como a fita senso) foi relativamente quantificada (FIG. 6C).[0267] The amount of expression of the target gene of the cell treated with the siRNA specific for CTGF (Mus musculus) (having sequence ID SEQ NOs: 301 to 330 as the sense strand) was relatively quantified (FIG. 6A). Furthermore, the amount of expression of the target gene of the cell treated with the Cyr61 (Mus musculus)-specific siRNA (having sequence ID SEQ NOs: 401 to 430 as the sense strand) was relatively quantified (FIG. 6B), and the The amount of expression of the target gene of the cell treated with the siRNA specific for Plekho1 (Mus musculus) (having sequence ID SEQ NOs: 501 to 530 as the sense strand) was relatively quantified (FIG. 6C).
[0268] Como resultado, pode ser confirmado que os vários tipos de siRNA da presente invenção mostraram alto nível de inibição da expressão do gene alvo. Além disso, a fim de selecionar siRNA com alta eficiência, siRNAs tendo sequências de ID SEQ NOs: 301, 302, 303, 305, 306, 307, 309, 317, 323 ou 329 em que quantidade de expressão de mRNA para CTGF (Mus musculus) na concentração de 20 nM é significativamente diminuída, como a fita senso, foram selecionados, siRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 409, 410, 415, 417, 418, 420, 422, 424, 427 ou 429 em que quantidade de expressão de mRNA para Cyr61 (Mus musculus) na concentração de 20 nM é significativamente diminuída, como a fita senso, foram selecionados, e siRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 504, 505, 506, 507, 514, 515, 522, 523, 524 ou 525 em que a quantidade de expressão de RNAm para Plekho1 (Mus musculus) na concentração de 20 nM é significativamente diminuída, como fita senso, foi selecionada.[0268] As a result, it can be confirmed that the various types of siRNA of the present invention showed high level of inhibition of target gene expression. Furthermore, in order to select siRNA with high efficiency, siRNAs having sequences of ID SEQ NOs: 301, 302, 303, 305, 306, 307, 309, 317, 323 or 329 in which amount of mRNA expression for CTGF (Mus musculus) at a concentration of 20 nM is significantly decreased, like the sense strand, siRNA having sequence ID SEQ NO: 409, 410, 415, 417, 418, 420, 422, 424, 427 or 429 in which amount of mRNA expression for Cyr61 (Mus musculus) at a concentration of 20 nM is significantly decreased, as the sense strand, were selected, and siRNA having sequence ID SEQ NO: 504, 505, 506, 507, 514, 515, 522, 523 , 524 or 525 in which the amount of mRNA expression for Plekho1 (Mus musculus) at a concentration of 20 nM is significantly decreased, as sense strand, was selected.
[0269] Além disso, a fim de selecionar siRNA com eficiência mais preferencial, siRNAs tendo sequências de ID SEQ NO: 301, 303, 307 ou 323 em que a quantidade de expressão de mRNA para CTGF (Mus musculus) na concentração de 5 nM é significativamente diminuída, como a fita senso, foram selecionados, siRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 410, 422, ou 424 em que a quantidade de expressão de mRNA para Cyr61 (Mus musculus) na concentração de 5 nM é significativamente diminuída, como a fita senso, foram selecionados, e siRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 507, 515, ou 525 em que a quantidade de expressão de RNAm para Plekho1 (Mus musculus) na concentração de 5 nM é significativamente diminuída, como fita senso, foi selecionada (FIG. 7).[0269] Furthermore, in order to select siRNA with more preferential efficiency, siRNAs having sequences of SEQ ID NO: 301, 303, 307 or 323 in which the amount of mRNA expression for CTGF (Mus musculus) at a concentration of 5 nM is significantly decreased, such as the sense strand, siRNA having sequence ID SEQ NO: 410, 422, or 424 were selected in which the amount of mRNA expression for Cyr61 (Mus musculus) at a concentration of 5 nM is significantly decreased, as the sense strand, were selected, and siRNA having sequence ID SEQ NO: 507, 515, or 525 in which the amount of mRNA expression for Plekho1 (Mus musculus) at a concentration of 5 nM is significantly decreased, as the sense strand, was selected (FIG. 7).
[0270] Exemplo 10. Seleção de siRNA específico para gene alvo para camundongo com alta eficiência em linhagem de célula de fibroblasto de camundongo (NIH3T3)[0270] Example 10. Selection of mouse target gene-specific siRNA with high efficiency in mouse fibroblast cell line (NIH3T3)
[0271] O aspecto da expressão do gene alvo foi analisado em linhagem de célula de fibroblasto de camundongo (NIH3T3) usando siRNAs tendo sequências de ID SEQ NOs: 301, 303, 307, 323, 410, 422, 424, 507, 515, 525 e 601 selecionado pelo Exemplo 9-3, como a fita senso, para selecionar siRNA com alta eficiência.[0271] The target gene expression aspect was analyzed in mouse fibroblast cell line (NIH3T3) using siRNAs having sequences of SEQ ID NOs: 301, 303, 307, 323, 410, 422, 424, 507, 515, 525 and 601 selected by Example 9-3, as the sense strand, to select siRNA with high efficiency.
[0272] Exemplo 10-1. Cultura da linhagem de célula de fibroblasto de camundongo[0272] Example 10-1. Mouse fibroblast cell line culture
[0273] Linhagem de célula de fibroblasto de camundongo (NIH3T3) obtida de American Type Culture Collection (ATCC) foi cultivada sob a mesma condição do Exemplo 9-1.[0273] Mouse fibroblast cell line (NIH3T3) obtained from American Type Culture Collection (ATCC) was cultured under the same condition as Example 9-1.
[0274] Exemplo 10-2. Transfecção de siRNA alvo em linhagem de células de fibroblasto de camundongo[0274] Example 10-2. Transfection of targeted siRNA into mouse fibroblast cell line
[0275] 1x105 linhagens de célula de fibroblasto (NIH3T3) cultivadas pelo Exemplo 10-1 foram cultivadas em meio RPMI 1640 por 18 horas na placa de 12 poços sob condição de 37°C e 5 %(v/v) CO2, e o meio foi removido, e 500 μl de meio Opti-MEM (GIBCO, USA) para cada poço foram dispensados.[0275] 1x105 fibroblast cell lines (NIH3T3) cultivated by Example 10-1 were cultivated in RPMI 1640 medium for 18 hours in the 12-well plate under condition of 37°C and 5% (v/v) CO2, and the Medium was removed, and 500 μl of Opti-MEM medium (GIBCO, USA) to each well was dispensed.
[0276] Enquanto isso, 1,5 μl de Lipofectamine™ RNAi Max (Invitrogen, USA) foram misturados com 248,5 μl de meio Opti-MEM para preparar uma solução mista, e a solução mista foi reagida em temperatura ambiente por 5 minutos. 0,2, 1 ou 5 μl de siRNAs (1 pmole/μl) tendo sequências de ID SEQ NOs: 301, 303, 307, 323, 410, 422, 424, 507, 515, 525 e 601 produzida pelo Exemplo 1, como fita senso, foram adicionados a 230 μl do meio Opti-MEM, assim preparando soluções de siRNA cada uma tendo uma concentração final de 0,2, 1 ou 5 nM. A mistura Lipofectamine™ RNAi Max e a solução de siRNA foram misturadas e reagidas em temperatura ambiente por 20 minutos, desse modo preparando uma solução para transfecção.[0276] Meanwhile, 1.5 μl of Lipofectamine™ RNAi Max (Invitrogen, USA) was mixed with 248.5 μl of Opti-MEM medium to prepare a mixed solution, and the mixed solution was reacted at room temperature for 5 minutes . 0.2, 1 or 5 μl of siRNAs (1 pmole/μl) having sequences of ID SEQ NOs: 301, 303, 307, 323, 410, 422, 424, 507, 515, 525 and 601 produced by Example 1, as sense strand, were added to 230 μl of Opti-MEM medium, thus preparing siRNA solutions each having a final concentration of 0.2, 1 or 5 nM. The Lipofectamine™ RNAi Max mixture and siRNA solution were mixed and reacted at room temperature for 20 minutes, thereby preparing a solution for transfection.
[0277] Em seguida, 500 μl de cada solução de transfecção foram dispensados em cada poço da linhagem de célula de tumor contendo Opti-MEM dispensado aqui, e cultivado por 6 horas, e o meio Opti-MEM foi removido. Aqui, 1 ml de meio de cultura RPMI 1640 foi dispensado no mesmo e cultivado sob condição de 37°C e 5%(v/v) CO2 por 24 horas.[0277] Then, 500 μl of each transfection solution was dispensed into each well of the tumor cell line containing Opti-MEM dispensed here, and cultured for 6 hours, and the Opti-MEM medium was removed. Here, 1 ml of RPMI 1640 culture medium was dispensed into it and cultured under the condition of 37°C and 5%(v/v) CO2 for 24 hours.
[0278] Exemplo 10-3. Análise quantitativa do mRNA do gene alvo[0278] Example 10-3. Quantitative analysis of target gene mRNA
[0279] cDNA foi produzido pela extração do RNA total da linhagem de célula transfectada pelo Exemplo 10-2 através do mesmo método do Exemplo 5-3, e uma quantidade de expressão de mRNA do gene alvo foi submetida à quantificação relativa por PCR em tempo real. A quantidade de expressão do gene alvo da célula tratada com o siRNA específico para CTGF (Mus musculus) (tendo sequência de ID SEQ NOs: 301, 303, 307, e 323 como a fita senso) foi relativamente quantificada (FIG. 8A). Além disso, a quantidade de expressão do gene alvo da célula tratada com o siRNA específico para Cyr61 (Mus musculus) (tendo sequência de ID SEQ NOs: 410, 422 e 424, como a fita senso) foi relativamente quantificada (FIG. 8B), e a quantidade de expressão do gene alvo da célula tratada com o siRNA específico para Plekho1 (Mus musculus) (tendo sequência de ID SEQ NOs: 507, 515, e 525 como a fita senso) foi relativamente quantificada (FIG. 8C).[0279] cDNA was produced by extracting total RNA from the cell line transfected by Example 10-2 through the same method as Example 5-3, and an amount of mRNA expression of the target gene was subjected to relative quantification by time-lapse PCR real. The amount of target gene expression of the cell treated with the CTGF (Mus musculus)-specific siRNA (having sequence ID SEQ NOs: 301, 303, 307, and 323 as the sense strand) was relatively quantified (FIG. 8A). Furthermore, the amount of target gene expression of the cell treated with the Cyr61 (Mus musculus)-specific siRNA (having sequence ID SEQ NOs: 410, 422 and 424, as the sense strand) was relatively quantified (FIG. 8B). , and the amount of expression of the target gene of the cell treated with the siRNA specific for Plekho1 (Mus musculus) (having sequence ID SEQ NOs: 507, 515, and 525 as the sense strand) was relatively quantified (FIG. 8C).
[0280] Como resultado, foi confirmado que cada siRNA específico de gene alvo inibe a expressão do gene alvo de forma dependente de concentração, e foi confirmado que siRNAs tendo sequências de ID SEQ NOs: 307, 424 e 525 da fita senso mostraram um nível relativamente alto de inibição para a expressão do gene alvo mesmo em concentrações significativamente mais baixas, para selecionar siRNA com alta eficiência.[0280] As a result, it was confirmed that each target gene-specific siRNA inhibits the expression of the target gene in a concentration-dependent manner, and it was confirmed that siRNAs having sequences of ID SEQ NOs: 307, 424 and 525 of the sense strand showed a level relatively high inhibition for target gene expression even at significantly lower concentrations, to select siRNA with high efficiency.
[0281] Exemplo 11. Confirmação da inibição da expressão do gene alvo usando siRNA específico de gene alvo para humano em linhagem de célula de fibroblasto de camundongo (NIH3T3).[0281] Example 11. Confirmation of inhibition of target gene expression using human target gene-specific siRNA in mouse fibroblast cell line (NIH3T3).
[0282] Uma vez que biofármacos têm sítios de ação específicos de espécie como estrutura de proteína ou sequência de gene, a identidade da droga de tratamento é significativamente importante para garantir a eficiência no desenvolvimento biofarmacêutico de novas drogas. A homologia de sequência de gene entre o siRNA específico de gene do alvo para o humano e o siRNA específico de gene alvo para camundongo projetada no Exemplo 1 foi analisada para selecionar sequências de siRNA que podem confirmar o efeito de inibição da expressão de gene alvo na célula de fibroblasto de camundongo.[0282] Since biopharmaceuticals have species-specific sites of action such as protein structure or gene sequence, the identity of the treatment drug is significantly important to ensure efficiency in the biopharmaceutical development of new drugs. The gene sequence homology between the human target gene-specific siRNA and the mouse target gene-specific siRNA designed in Example 1 was analyzed to select siRNA sequences that can confirm the effect of inhibiting target gene expression on mouse fibroblast cell.
[0283] As sequências de siRNA selecionadas são siRNAs tendo sequências de ID SEQ NOs: 4, 5, 6, 8, 9, 102, 104, 105, 107, 108, 109, 202, 204, 206, 207, 208 e 209, como a fita senso, que são os siRNAs específicos de gene alvo para o humano produzido pelo Exemplo 1, siRNAs tendo sequências de ID SEQ NOs: 307, 424 e 525, como fita senso, que são os siRNAs específicos de gene alvo para camundongo, e siRNA tendo sequência de ID SEQ NO: 601, como fita senso, que é um grupo de controle. O aspecto da expressão do gene alvo foi analisado em linhagem de célula de fibroblasto de camundongo (NIH3T3) usando estes siRNAs selecionados, e a eficácia dos mesmos foi confirmada na célula do camundongo de siRNA projetado com base no gene humano.[0283] The selected siRNA sequences are siRNAs having sequences of ID SEQ NOs: 4, 5, 6, 8, 9, 102, 104, 105, 107, 108, 109, 202, 204, 206, 207, 208 and 209 , such as the sense strand, which are the human target gene-specific siRNAs produced by Example 1, siRNAs having sequences of SEQ ID NOs: 307, 424 and 525, such as the sense strand, which are the mouse target gene-specific siRNAs , and siRNA having sequence ID SEQ NO: 601, as sense strand, which is a control group. The target gene expression aspect was analyzed in mouse fibroblast cell line (NIH3T3) using these selected siRNAs, and their efficacy was confirmed in the mouse cell of siRNA designed based on the human gene.
[0284] Exemplo 11-1. Cultura da linhagem de célula de fibroblasto de camundongo[0284] Example 11-1. Mouse fibroblast cell line culture
[0285] Linhagem de célula de fibroblasto de camundongo (NIH3T3) obtida de American Type Culture Collection (ATCC) foi cultivada sob a mesma condição do Exemplo 9-1.[0285] Mouse fibroblast cell line (NIH3T3) obtained from American Type Culture Collection (ATCC) was cultured under the same condition as Example 9-1.
[0286] Exemplo 11-2. Transfecção de siRNA alvo em linhagem de células de fibroblasto de camundongo[0286] Example 11-2. Transfection of targeted siRNA into mouse fibroblast cell line
[0287] 1,8x105 linhagens de célula de fibroblasto (NIH3T3) cultivadas pelo Exemplo 11-1 foram cultivadas em meio RPMI 1640 por 18 horas na placa de 6 poços sob condição de 37°C e 5 %(v/v) CO2, e o meio foi removido, e 500 μl de meio Opti-MEM (GIBCO, USA) para cada poço foram dispensados.[0287] 1.8x105 fibroblast cell lines (NIH3T3) cultivated by Example 11-1 were cultivated in RPMI 1640 medium for 18 hours in the 6-well plate under condition of 37°C and 5% (v/v) CO2, and the medium was removed, and 500 μl of Opti-MEM medium (GIBCO, USA) to each well was dispensed.
[0288] Enquanto isso, 3,5 μl de Lipofectamine™ RNAi Max (Invitrogen, USA) foram misturados com 246,5 μl de meio Opti-MEM para preparar uma solução mista, e a solução mista foi reagida em temperatura ambiente por 5 minutos. Soluções de siRNA cada uma tendo uma concentração final de 5 ou 20 nM foram preparadas pela adição de 5 ou 20 μl de siRNAs (1 pmole/μl) tendo sequências de ID SEQ NOs: 4, 5, 6, 8, 9, 102, 104, 105, 107, 108, 109, 202, 204, 206, 207, 208, 209, 307, 424, 525 e 601 produzido pelo Exemplo 1, como fita senso, a 230^ do meio Opti- MEM. A mistura Lipofectamine™ RNAi Max e a solução de siRNA foram misturadas e reagidas em temperatura ambiente por 15 minutos, desse modo preparando uma solução para transfecção.[0288] Meanwhile, 3.5 μl of Lipofectamine™ RNAi Max (Invitrogen, USA) was mixed with 246.5 μl of Opti-MEM medium to prepare a mixed solution, and the mixed solution was reacted at room temperature for 5 minutes . siRNA solutions each having a final concentration of 5 or 20 nM were prepared by adding 5 or 20 μl of siRNAs (1 pmole/μl) having sequences of SEQ ID NOs: 4, 5, 6, 8, 9, 102, 104, 105, 107, 108, 109, 202, 204, 206, 207, 208, 209, 307, 424, 525 and 601 produced by Example 1, as sense tape, at 230% of Opti-MEM medium. The Lipofectamine™ RNAi Max mixture and siRNA solution were mixed and reacted at room temperature for 15 minutes, thereby preparing a solution for transfection.
[0289] Em seguida, 500 μl de cada solução de transfecção foram dispensados em cada poço da linhagem de célula de tumor contendo Opti-MEM dispensado aqui, e cultivado por 6 horas, e o meio Opti-MEM foi removido. Aqui, 1 ml de meio de cultura RPMI 1640 foi dispensado no mesmo e cultivado sob condição de 37°C e 5%(v/v) CO2 por 24 horas.[0289] Then, 500 μl of each transfection solution was dispensed into each well of the tumor cell line containing Opti-MEM dispensed here, and cultured for 6 hours, and the Opti-MEM medium was removed. Here, 1 ml of RPMI 1640 culture medium was dispensed into it and cultivated under the condition of 37°C and 5%(v/v) CO2 for 24 hours.
[0290] Exemplo 11-3. Análise quantitativa do mRNA do gene alvo[0290] Example 11-3. Quantitative analysis of target gene mRNA
[0291] cDNA foi produzido pela extração do RNA total da linhagem de célula transfectada pelo Exemplo 11-2 através do mesmo método do Exemplo 5-3, e uma quantidade de expressão de mRNA do gene alvo foi submetida à quantificação relativa por PCR em tempo real. A quantidade de expressão do gene alvo da célula tratada com o siRNA específico para CTGF (Mus musculus) (ID SEQ NO: 307) ou tratado com o siRNA específico para CTGF(Homo sapiens) (ID SEQ NO: 4, 5, 6, 8 ou 9) foi relativamente quantificada (FIG. 9A). A quantidade de expressão do gene alvo da célula tratada com o siRNA específico para Cyr61 (Mus musculus) (tendo uma sequência de ID SEQ NO: 424 como a fita senso) ou tratado com siRNA específico para Cyr61 (Homo sapiens) (tendo uma sequência de ID SEQ NO: 102, 104, 105, 107, 108 ou 109 como a fita senso) foi relativamente quantificada (FIG. 9B), e a quantidade de expressão do gene alvo da célula tratada com o siRNA específico para Plekho1 (Mus musculus) (tendo sequência de ID SEQ NO: 525 como a fita senso) ou tratado com siRNA específico para Plekho1 (Homo sapiens) (tendo uma sequência de ID SEQ NO: 202, 204, 206, 207, 208 ou 209 como a fita senso) foi relativamente quantificada (FIG. 9C).[0291] cDNA was produced by extracting total RNA from the cell line transfected by Example 11-2 through the same method as Example 5-3, and an amount of target gene mRNA expression was subjected to relative quantification by time-lapse PCR real. The amount of target gene expression of the cell treated with the siRNA specific for CTGF (Mus musculus) (SEQ ID NO: 307) or treated with the siRNA specific for CTGF (Homo sapiens) (SEQ ID NO: 4, 5, 6, 8 or 9) was relatively quantified (FIG. 9A). The amount of target gene expression from the cell treated with Cyr61-specific siRNA (Mus musculus) (having a sequence of SEQ ID NO: 424 as the sense strand) or treated with Cyr61-specific siRNA (Homo sapiens) (having a sequence of SEQ ID NO: 102, 104, 105, 107, 108 or 109 as the sense strand) was relatively quantified (FIG. 9B), and the amount of target gene expression of the cell treated with the siRNA specific for Plekho1 (Mus musculus ) (having a sequence of SEQ ID NO: 525 as the sense strand) or treated with siRNA specific for Plekho1 (Homo sapiens) (having a sequence of SEQ ID NO: 202, 204, 206, 207, 208 or 209 as the sense strand ) was relatively quantified (FIG. 9C).
[0292] Como resultado, foi confirmado que cada siRNA específico de gene alvo para humano inibe a expressão do gene alvo de acordo com a homologia de sequência, e foi confirmado que siRNAs tendo sequências de ID SEQ NOs: 6, 8, 102, 104, 105, 204, 207 e 208 como a fita senso mostrou um nível relativamente alto de inibição para a expressão do gene alvo em 20nM e entre esses, IC50(concentração de inibição 50%) foi menor que 20nM em siRNAs tendo sequências de ID SEQ NOs: 6, 102 e 207 mesmo em linhagens de células de camundongo. Portanto, foi confirmado que o nível relativamente alto de inibição para a expressão do gene alvo foi mantido mesmo em baixa concentração, ou seja, estes siRNAs tiveram alta eficiência (FIG. 10).[0292] As a result, it was confirmed that each human target gene-specific siRNA inhibits the expression of the target gene according to sequence homology, and it was confirmed that siRNAs having sequences of ID SEQ NOs: 6, 8, 102, 104 , 105, 204, 207 and 208 as the sense strand showed a relatively high level of inhibition for target gene expression at 20nM and among these, IC50(inhibition concentration 50%) was less than 20nM in siRNAs having SEQ ID sequences NOs: 6, 102 and 207 even in mouse cell lines. Therefore, it was confirmed that the relatively high level of inhibition for target gene expression was maintained even at low concentration, that is, these siRNAs had high efficiency (FIG. 10).
[0293] O siRNA específico para CTGF, Cyr61 ou Plekho1 de acordo com a presente invenção, a estrutura de oligo RNA de dupla hélice contendo o siRNA, e a composição farmacêutica contendo a estrutura de oligo RNA de dupla hélice para tratamento, são capazes de inibir a expressão de CTGF, Cyr61 ou Plekho1 em uma alta eficiência sem efeitos colaterais para fornecer efeitos de tratamento para doenças respiratórias, particularmente, fibrose pulmonar idiopática e doença pulmonar obstrutiva crônica (DPOC), que podem ser significativamente utilmente utilizados no tratamento de doenças respiratórias, em que não há nenhum agente terapêutico apropriado neste momento, particularmente, fibrose pulmonar idiopática e doença pulmonar obstrutiva crônica (DPOC).[0293] The siRNA specific for CTGF, Cyr61 or Plekho1 according to the present invention, the double-stranded RNA oligo structure containing the siRNA, and the pharmaceutical composition containing the double-stranded RNA oligo structure for treatment, are capable of inhibit the expression of CTGF, Cyr61 or Plekho1 at a high efficiency without side effects to provide treatment effects for respiratory diseases, particularly, idiopathic pulmonary fibrosis and chronic obstructive pulmonary disease (COPD), which can be significantly usefully used in the treatment of respiratory diseases , in which there is no appropriate therapeutic agent at this time, particularly idiopathic pulmonary fibrosis and chronic obstructive pulmonary disease (COPD).
[0294] A partir do exposto, será entendido pelos especialistas na técnica à qual a presente invenção pertence que a presente invenção pode ser realizada em outras modalidades concretas sem alterar o espírito técnico ou característica essencial da mesma. A este respeito, deve ser entendido que os exemplos acima mencionados são ilustrativos em todos os aspectos, mas não limitados. O escopo da presente invenção deve ser interpretado no sentido de incluir o significado e escopo das reivindicações anexas, e todas as alterações e formas modificadas que são derivadas do conceito equivalente dos mesmos, em vez da descrição detalhada.[0294] From the foregoing, it will be understood by those skilled in the art to which the present invention belongs that the present invention can be carried out in other concrete embodiments without altering the technical spirit or essential characteristic thereof. In this regard, it should be understood that the above-mentioned examples are illustrative in all respects, but not limited. The scope of the present invention is to be construed to include the meaning and scope of the appended claims, and all changes and modified forms which are derived from the equivalent concept thereof, rather than the detailed description.
Claims (12)
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
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KR10-2013-0079311 | 2013-07-05 | ||
KR20130079311 | 2013-07-05 | ||
PCT/KR2014/006033 WO2015002513A2 (en) | 2013-07-05 | 2014-07-04 | Respiratory disease-related gene specific sirna, double-helical oligo rna structure containing sirna, compositon containing same for preventing or treating respiratory disease |
Publications (2)
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BR112016000163A2 BR112016000163A2 (en) | 2017-11-28 |
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