Uređivanje RNK
Uređivanje RNK je biološki proces u RNK.[1][2]
Proces se odvija na razini molekula.[1] U ovim molekulskim procesima uključeni su posttranskripcijska promjena nukleotida molekule RNK na kodirajuću DNK. Zbog toga su obično neophodni da bi se uspostavila biološka funkcija molekula.
Kod eukariota, proces se odvija u tjelešcima koja sadrže kodirajuću DNK. Stanična tjelešca u kojima se zbiva su:[1]
- kod životinja u jezgri i mitohondrijima
- kod biljaka i životinja u mitohondrijima
- kod kopnenih biljaka u plastidima
Kod virusa zabilježen je kod određenih skupina RNK virusa poput virusa ebole, hepatitisa delta, virusa newcastle i dr.[1]
Kod prokariota proces nije bio dosad razmatran. Tek ga novija istraživanja spominju kod arheja.[1]
Pojam uređivanja RNK ne obuhvaća izrezivanje introna, ni stavljanje kape na 5'-kraj niti dodavanje višestrukih adenozina 3'-kraja mRNK.[1]
Uređivanju RNK podliježu ove skupine molekula RNK:[1]
- RNK koje kodiraju bjelančevine (mRNK oblikuje kod bjelančevinama)
- RNK koje ne kodiraju bjelančevine (ne oblikuju kod bjelančevinama):
Mehanizmi kodiranja variraju prema vrstama. Obuhvaćamo ih u dvjema glavnim skupinama. Kriteriji su:[1]
- opisivanje kranjeg rezultata uređivanja
- supstitucije, pri čemu se ne mijenja broj nukleotida. Zamjenjuje se postojeći nukleotid drugim procesom deaminacije. Većina deaminacija je u pravcu C→U i A→I. Manjinske deaminacije su U→C, G→A i U→A.
- delecije/insercije, pri čemu se mijenja broj nukleotida. Tomu prethodi pucanje ili stvaranje fosfodiesterske veze. Iz ovog slučaja dolazi najproučavaniji primjer, zbog kojeg je proces i nazvan uređivanjem RNK. To je posttranskripcijska insercija, a rjeđe delecija uridina kod mitohondrijske mRNK praživotinja razreda kinetoplastida.
Skupine organizama imaju svaka svoj mehanizam koji se rijetko sreće kod drugih skupina. Zato se kaže da uređivanje RNK ima mjesnu filogenetičku raspodjelu. Iz te činjenice slijedi zaključak da sustav uređivanja nema zajedničkog pretka, nego su ga svaka razvojna crta razvila svoj mehanizam te je proces evolucijski mlađi.[1]
- središnji kompleks za uređivanje RNK (RECC, 20S editosom)
- mjesto uređivanja RNK
- neuređena mRNK
- pre-mRNK
- gRNK
- raspad mRNK besmislenim putem (Nonsense-mediated mRNA decay - NMD)
- nadzorni mehanizam mRNK
- supstitucijska uređivanja RNK u jezgri kod sisavaca
- Uređivanje RNK kod praživotinja
- Uređivanje RNK kod biljaka
- Uređivanje RNK kod virusa
- Alternativno izrezivanje
- Izrezivanje RNK
- Preskakanje egzona[3]
- konstitutivno izrezivanje nezrele mRNK[4]
- kod izrezivanja (splicing code)[4]
- ↑ a b c d e f g h i Digitalni repozitorij PMF Zagreb Arhivirana inačica izvorne stranice od 13. travnja 2017. (Wayback Machine) Tihana Marić: Uređivanje RNA, Zagreb, 2015., str. 4
- ↑ Medicinska biologija[neaktivna poveznica]
- ↑ Mišićne distrofije (PDF). Inačica izvorne stranice (PDF) arhivirana 24. kolovoza 2016. Pristupljeno 19. siječnja 2018. journal zahtijeva
|journal=(pomoć) - ↑ a b Repozitorij Središnje medicinske knjižnice Medicinskog fakulteta u Zagrebu Arhivirana inačica izvorne stranice od 13. travnja 2017. (Wayback Machine) Mario Ćuk: Utjecaj nedostatne aktivnosti S-adenozilhomocistein hidrolaze na metilaciju proteina, Zagreb, Medicinski fakultet u Zagrebu, 2013., str. 20 (pristupljeno 12. travnja 2017.)
- Analiza kodirajućih regija u genomu Arhivirana inačica izvorne stranice od 13. travnja 2017. (Wayback Machine)