Este repositorio documenta el proyecto de investigación "Métodos Estadísticos Aplicados a la Detección de Marcadores Taxonómicos Asociados a Cáncer Gástrico" que tiene como objetivo buscar diferencias en la composición de microbiota entre grupos cáncer y no cáncer. Se utilizó secuenciación de 16S rRNA y análisis bioinformáticos para caracterizar las comunidades microbianas presentes en las muestras cáncer y no cáncer. En este repositorio encontrarás los scripts de preprocesamiento, transformación y análisis de los datos. Se utilizaron las herramientas R y Python.
Orden para ejecutar los archivos: librerias.R -> lectura_secuencias.R -> taxonomia.R -> normalizaciones.R -> composicion_taxonomica -> diversidad_alfa.R -> diversidad_beta_y_L2FC-> analisis_estadistico.ipynb -> CAN_NetAna.ipynb