8000 GitHub - neelravi/data-management: A data management plan for computational chemists/physicists and material scientists for a FAIR storage of raw data
[go: up one dir, main page]
More Web Proxy on the site http://driver.im/
Skip to content

neelravi/data-management

Folders and files

NameName
Last commit message
Last commit date

Latest commit

 

History

21 Commits
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Repository files navigation

Data Management Plan for computational research

Author: Dr. Ravindra Shinde

License: MIT License

Documentation Website: Website

This repository contains a template for a data management plan for computational research. The data management plan is a document that outlines how data will be managed during a research project and after it is completed. It is a living document that should be updated as the project progresses and as new data management needs arise.

This DMP follows the FAIR principles for data management: data should be Findable, Accessible, Interoperable, and Reusable. The DMP is organized into the following sections:

Organization of the data

This section describes how data will be organized during the project. It includes information about the data structure, file formats, and naming conventions.

TODO:

  • Automatic generation of docx and pdf files from selection of funding agency and the archival repository.

Data structure

Data will be organized into the following directories:

/home/user/
├── audios
│   ├── dataA
│   │   ├── annotations
│   │   ├── features
│   │   ├── processed
│   │   └── raw
│   └── README.md
├── authoring
│   ├── book-chapters
│   │   └── README.md
│   ├── books
│   │   └── README.md
│   ├── dissertation
│   │   ├── final_dissertation.pdf
│   │   ├── README.md
│   │   ├── references
│   │   └── source
│   ├── manuscripts
│   │   ├── README.md
│   │   ├── references
│   │   ├── title-A
│   │   ├── title-B
│   │   └── title-C
│   ├── papers
│   │   ├── 001-YYYY-Journal-Title
│   │   ├── 002-YYYY-Journal-Title
│   │   ├── 003-YYYY-Journal-Title
│   │   └── README.md
│   ├── presentations
│   │   └── README.md
│   ├── proposals
│   │   └── README.md
│   ├── README.md
│   ├── reports
│   │   └── README.md
│   ├── teaching
│   │   └── README.md
│   ├── thesis
│   │   ├── final_thesis.pdf
│   │   ├── README.md
│   │   ├── references
│   │   └── source
│   └── tutorials
│       ├── blogs
│       ├── HandsOnVASP
│       ├── QuantumEspresso
│       └── README.md
├── calculations
│   ├── collaborations
│   │   ├── Amsterdam
│   │   │   ├── 000000-silicon -> ../../materials/000000-silicon/
│   │   │   └── 000001-CdGeSb2 -> ../../materials/000001-CdGeSb2/
│   │   ├── Berkeley
│   │   │   ├── 000001-C13H18O2 -> ../../molecules/000001-C13H18O2/
│   │   │   └── 000001-CdGeSb2 -> ../../materials/000001-CdGeSb2/
│   │   ├── Oxford
│   │   │   ├── 000000-caffeine -> ../../molecules/000000-caffeine/
│   │   │   └── 000001-CdGeSb2 -> ../../materials/000001-CdGeSb2/
│   │   └── README.md
│   ├── grants
│   │   ├── Horizon-Europe
│   │   │   ├── 000000-silicon -> ../../materials/000000-silicon/
│   │   │   └── 000001-CdGeSb2 -> ../../materials/000001-CdGeSb2/
│   │   ├── Marie-Curie
│   │   │   ├── 000000-caffeine -> ../../molecules/000000-caffeine/
│   │   │   └── 000001-CdGeSb2 -> ../../materials/000001-CdGeSb2/
│   │   ├── NWO
│   │   │   ├── 000001-C13H18O2 -> ../../molecules/000001-C13H18O2/
│   │   │   └── 000001-CdGeSb2 -> ../../materials/000001-CdGeSb2/
│   │   └── README.md
│   ├── materials
│   │   ├── 000000-silicon
│   │   │   ├── 00-relaxation
│   │   │   │   └── README.md
│   │   │   ├── 01-DFT
│   │   │   │   └── README.md
│   │   │   ├── 02-HSE
│   │   │   │   └── README.md
│   │   │   ├── 03-post-DFT
│   │   │   │   └── README.md
│   │   │   ├── common
│   │   │   │   └── README.md
│   │   │   └── README.md
│   │   ├── 000001-CdGeSb2
│   │   │   ├── 00-relaxation
│   │   │   │   └── README.md
│   │   │   ├── 01-DFT
│   │   │   │   └── README.md
│   │   │   ├── 02-HSE
│   │   │   │   └── README.md
│   │   │   ├── 03-post-DFT
│   │   │   │   └── README.md
│   │   │   ├── common
│   │   │   │   └── README.md
│   │   │   └── README.md
│   │   └── README.md
│   ├── molecules
│   │   ├── 000000-caffeine
│   │   │   ├── 00-HF
│   │   │   │   └── README.md
│   │   │   ├── 01-optimization
│   │   │   │   └── README.md
│   │   │   ├── 02-VMC
│   │   │   │   └── README.md
│   │   │   ├── 03-DMC
│   │   │   │   └── README.md
│   │   │   ├── common
│   │   │   │   └── README.md
│   │   │   └── README.md
│   │   ├── 000001-C13H18O2
│   │   │   ├── 00-HF
│   │   │   │   └── README.md
│   │   │   ├── 01-optimization
│   │   │   │   └── README.md
│   │   │   ├── 02-VMC
│   │   │   │   └── README.md
│   │   │   ├── 03-DMC
│   │   │   │   └── README.md
│   │   │   ├── common
│   │   │   │   └── README.md
│   │   │   └── README.md
│   │   └── README.md
│   ├── projects
│   │   ├── andrea-zen -> ../molecules/000001-C13H18O2
│   │   ├── fugaku-2024 -> ../molecules/000000-caffeine
│   │   └── README.md
│   └── README.md
├── codes
│   ├── devel
│   │   ├── champ
│   │   │   ├── 2.3.0
│   │   │   └── git
│   │   ├── quantum-espresso
│   │   │   ├── 7.3.1
│   │   │   └── git
│   │   └── README.md
│   ├── libraries
│   │   ├── hdf5
│   │   │   └── v1.14.2
│   │   ├── qmckl
│   │   │   └── v1.0.0
│   │   ├── README.md
│   │   └── trexio
│   │       └── v2.5.0
│   ├── packages
│   │   ├── berkeleyGW
│   │   ├── quantum-espresso
│   │   │   ├── 7.3.1
│   │   │   └── git
│   │   ├── README.md
│   │   └── vasp
│   │       └── 6.4.0
│   ├── README.md
│   ├── scripts
│   │   ├── python
│   │   │   ├── analysis
│   │   │   └── visualization
│   │   ├── README.md
│   │   └── shell
│   │       ├── compilation
│   │       └── slurm
│   └── tools
│       ├── cmake
│       ├── ninja
│       └── README.md
├── containers
│   ├── qmckl-intel-latest
│   ├── README.md
│   └── trexio-gnu-latest
├── datasets
│   ├── 4TU
│   │   ├── dataset-4tu-paper-001
│   │   │   └── README.md
│   │   └── dataset-4tu-paper-002
│   │       └── README.md
│   ├── materials-cloud
│   │   └── dataset-materials-cloud-paper-005
│   │       └── README.md
│   ├── README.md
│   └── zenodo
│       ├── dataset-zenodo-paper-003
│       │   └── README.md
│       └── dataset-zenodo-paper-004
│           └── README.md
├── editing
│   ├── book-chapters
│   │   └── README.md
│   ├── books
│   │   └── README.md
│   ├── journals
│   │   ├── 001-YYYY-Journal-Title
│   │   ├── 002-YYYY-Journal-Title
│   │   └── README.md
│   └── README.md
├── environments
│   └── README.md
├── graphics
├── README.md
├── reviewing
│   ├── book-chapters
│   │   └── README.md
│   ├── books
│   │   └── README.md
│   ├── dissertation
│   │   ├── final_dissertation.pdf
│   │   ├── README.md
│   │   ├── references
│   │   └── source
│   ├── grants
│   │   └── README.md
│   ├── papers
│   │   ├── 001-YYYY-Journal-Title
│   │   ├── 002-YYYY-Journal-Title
│   │   ├── 003-YYYY-Journal-Title
│   │   └── README.md
│   ├── README.md
│   ├── reports
│   │   └── README.md
│   └─â
5E50
”€ thesis
│       ├── final_thesis.pdf
│       ├── README.md
│       ├── references
│       └── source
└── Videos
    └── README.md

About

A data management plan for computational chemists/physicists and material scientists for a FAIR storage of raw data

Topics

Resources

Stars

Watchers

Forks

Packages

No packages published

Contributors 2

  •  
  •  
0