Docker-образ включающий в себя актуальные версии программ и библиотек:
- samtools + htslib + libdeflate;
- bcftools;
- vcftools;
Перейдя в директорию с докер-файлом, выполняем следующие команды
docker build -t biotech_docker .
Проверка сборки
docker images
Запуск образа в интерактивном режиме
docker run -it biotech_docker bash
Опционально можно использовать флаг --rm
для удаления контейнера по завершению процесса