mkdir /var/run/mastodon ; chown mastodon /var/run/mastodon としておいて、
rc スクリプトを /usr/local/etc/rc.d に配置して
/etc/rc.conf に以下のように記述すると他のサービスと同じように扱えるようになる（はず
mastodon_user="mastodon"
mastodon_base="/opt/mastodon"
mastodon_bundle_cmd="/home/mastodon/.rbenv/shims/bundle"
mastodon_stream_enable="YES"
mastodon_worker_enable="YES"
mastodon_web_enable="YES"