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PEPWHEEL, una herramienta de EMBOSS, analizando la estructura proteica de una hélice alfa proteica. EMBOSS es una suite bioinformática de tipo open source creada por EMBnet que es empleada fundamentalmente en biología molecular y genética . EMBOSS es un acrónimo procedente del inglés «E uropean M olecular B iology O pen S oftware S uite».[ 1] ácidos nucleicos y proteínas . Si bien se ejecuta en la línea de comandos , existen GUIs que facilitan su manipulación bajo un entorno gráfico.
Aplicaciones de EMBOSS [ editar ]
Grupo
Descripción
Acd
Utilidades para archivos Acd
Alignment consensus
Obtiene secuencias consenso
Alignment differences
Encuentra diferencias entre secuencias
Alignment dot plots
Comparaciones de secuencias tipo dot blot
Alignment global
Alineamiento de secuencias global
Alignment local
Alineamiento de secuencias local
Alignment multiple
Alineamiento de secuencias múltiple
Display
Muestra secuencias
Edit
Edita secuencias
Enzyme kinetics
Calcula parámetros de cinética enzimática
Feature tables
Herramientas de anotación
HMM
Análisis de modelo oculto de Márkov
Information
Ayuda general e información
Menus
Interfaz de menús
Nucleic 2d structure
Estructura secundaria de ácidos nucleicos
Nucleic codon usage
Uso de codones
Nucleic composition
Composición de nucleótidos de un ácido nucleico
Nucleic CpG islands
Detección de islas Cpg
Nucleic gene finding
Predicción de genes
Nucleic motifs
Búsqueda de motivos en ácidos nucleicos
Nucleic mutation
Mutación de ácidos nucleicos
Nucleic primers
Predicción de cebadores
Nucleic profiles
Generación de perfiles de ácidos nucleicos
Nucleic repeats
Detección de repeticiones en ácidos nucleicos
Nucleic restriction
Análisis de restricción
Nucleic RNA folding
Análisis del plegamiento de ARN
Nucleic transcription
Predicción de promotores, terminadores y factor de transcripción
Nucleic translation
Traducción de secuencias
Phylogeny consensus
Métodos de filogenia por consenso
Phylogeny continuous characters
Métodos de filogenia por carácter continuo
Phylogeny discrete characters
Métodos de filogenia por carácter discreto
Phylogeny distance matrix
Métodos de filogenia por distancia
Phylogeny gene frequencies
Métodos de filogenia por frecuencia génica
Phylogeny molecular sequence
Análisis de secuencias y filogenia
Phylogeny tree drawing
Dibujo de árboles filogenéticos
Protein 2d structure
Estructura secundaria de las proteínas
Protein 3d structure
Estructura terciaria de las proteínas
Protein composition
Composición de secuencias proteicas
Protein motifs
Búsqueda de motivos proteicos
Protein mutation
Mutación de proteínas
Protein profiles
Búsqueda en perfiles de proteínas
Test
Herramientas de prueba, no para uso general
Utils database creation
Instalación de bases de datos
Utils database indexing
Indexado de bases de datos
Utils misc
Utilidades varias
Datos: Q690201