1. 南京医科大学第一附属医院神经内科：该科室是国家卫健委临床医师培训基地，江苏省临床重点专科，并且是“癫痫中心”。拥有先进的设备和技术，专门开设癫痫等亚专业，为患者提供全面精准的诊断和治疗。

2. 南京鼓楼医院神经内科：该科室为国家临床重点专科，设有癫痫与发作性疾病亚专业，拥有最新的癫痫诊疗设备和诊断治疗技术，对难治性癫痫的治愈率较高。

3. 东南大学附属中大医院神经内科：作为江苏省神经病学研究中心的共建单位，该科室在癫痫等神经变性病的规范化诊治和长期随访方面具有丰富的经验和技术优势。

4. 南京癫痫病医院（南京市鼓楼区热河南路207号）：这是一家南京市医管直属的专家型中医医院，集临床、教学、科研、预防、保健、康复为一体，专门治疗癫痫等神经性疾病。

5. 南京癫痫病医院（江苏省南京市六合区延安路28号）：这是一家民营的癫痫病专科医院，遵循“以患者为中心”的服务理念，提供专业的癫痫病诊断和治疗服务，并获得了患者的好评。

南京有多家治疗癫痫病的专科医院或科室，这些医院不仅拥有先进的诊疗技术和设备，还积累了丰富的临床经验。患者可以根据自己的实际情况选择合适的医院进行治疗