保科 正純（ほしな まさずみ、延宝5年（1677年） - 元文2年5月28日（1737年6月24日））は、江戸時代中期から後期の江戸幕府旗本寄合席。飯野藩主家分家の旗本保科家の第3代当主。諱は正純。幼名は傅次郎。通称は宮内、内記、甚四郎。官位は従五位下・淡路守。養父は保科正静、実父は（丹波守）、実母は（大隅守）の女。正室は保科正静養女（沼間清氏の娘）。子は保科正勝、娘（大久保教房妻）、保科正倫、など3男2女。国目付や山田奉行を勤める。石高は上野国群馬郡・吾妻郡のうち2500石。