フラッシュファイルシステム（英語: flash file system）は、フラッシュメモリを使用した記憶装置にファイルを格納するためのファイルシステムである。 フラッシュファイルシステムは一般的なファイルシステムと密接に関連があるが、フラッシュメモリの性質と特性に合わせて最適化されており（ライトアンプリフィケーションの回避など）、特定のオペレーティングシステムの中で使用されている。