ジョナサン・ストークス（Jonathan Stokes、1755年 - 1831年4月30日）は、イギリスの医師、博物学者である。ジギタリス（ゴマノハグサ科）の臨床試験で薬効を研究したウィリアム・ウィザリングの協力者として知られる。