La saison 2020-2021 du Pau FC est la première année de l'équipe première en championnat de France de football de Ligue 2 depuis son retour dans le monde professionnel. Après avoir terminé à la 1re place du National, à la suite de l'interruption de la saison, le club se retrouve donc engagé en Ligue 2 et en Coupe de France. L'équipe est entraînée pour la première année par Didier Tholot.